Here is a list of all file members with links to the files they belong to:

- p -

• P1 : miscmath.c
• P2 : miscmath.c
• P3 : miscmath.c
• p32i : des.c
• P4 : miscmath.c
• P5 : miscmath.c
• P_lambda_table : unified_pvalues.c
• pa0 : miscmath.c
• pa1 : miscmath.c
• pa2 : miscmath.c
• pa3 : miscmath.c
• pa4 : miscmath.c
• pa5 : miscmath.c
• pa6 : miscmath.c
• PACKAGE : config.h
• PACKAGE_BUGREPORT : config.h
• PACKAGE_NAME : config.h
• PACKAGE_STRING : config.h
• PACKAGE_TARNAME : config.h
• PACKAGE_VERSION : config.h
• PackAsUserObject() : uoconv.cpp, uoconv.hpp
• PackedSeqLocToMaskedQueryRegions() : blast_aux.hpp
• pad() : bzip2.c
• PairsToString() : cuCdAnnotation.cpp
• PairTreeBackTraceNode() : tree_algo.hpp
• PairTreeTraceNode() : tree_algo.hpp
• PAM250_bg : matrix_frequency_data.c
• PAM250_FREQRATIOS : matrix_freq_ratios.c
• PAM250_JOINT_PROBS : matrix_frequency_data.c
• pam250_prefs : blast_stat.c
• pam250_values : blast_stat.c
• PAM250_VALUES_MAX : blast_stat.c
• PAM250NAME : cuScoringMatrix.hpp
• PAM250SIZE : cuScoringMatrix.hpp
• PAM30_bg : matrix_frequency_data.c
• PAM30_FREQRATIOS : matrix_freq_ratios.c
• PAM30_JOINT_PROBS : matrix_frequency_data.c
• pam30_prefs : blast_stat.c
• pam30_values : blast_stat.c
• PAM30_VALUES_MAX : blast_stat.c
• PAM30NAME : cuScoringMatrix.hpp
• PAM30SIZE : cuScoringMatrix.hpp
• PAM70_bg : matrix_frequency_data.c
• PAM70_FREQRATIOS : matrix_freq_ratios.c
• PAM70_JOINT_PROBS : matrix_frequency_data.c
• pam70_prefs : blast_stat.c
• pam70_values : blast_stat.c
• PAM70_VALUES_MAX : blast_stat.c
• PAM70NAME : cuScoringMatrix.hpp
• PAM70SIZE : cuScoringMatrix.hpp
• panic() : bzip2.c
• parallel_popcnt_32() : bmfunc.h
• param_clear() : rpc.c, ct.c
• param_info_alloc() : rpc.c
• param_row_alloc() : rpc.c
• paraminfoalloc() : ct.c
• paramrowalloc() : ct.c
• PARAMS : seq_masker_ostat_opt.cpp, seq_masker_ostat_bin.cpp
• parent_ : node.cpp
• PARENT_DIR : fileutil.cpp
• parent_map : read_blast_result.hpp
• ParentDir() : proj_utils.hpp, proj_utils.cpp
• parse_const_param() : native.c, tdsodbc.h
• parse_prepared_query() : prepare_query.c, tdsodbc.h
• parse_server() : connectparams.c
• parse_server_name_for_port() : config.c
• ParseAttributes() : gnomon_model.cpp, asn1.cpp
• ParseLex() : cleanup_utils.cpp
• PARSER_CONST_E : muParserTest.cpp, muParser.cpp
• PARSER_CONST_PI : muParserTest.cpp, muParser.cpp
• PARSER_THROWCHECK : muParserTest.cpp
• ParseRange() : util.hpp, util.cpp
• ParseSequenceRange() : blast_input_aux.cpp, blast_input_aux.hpp
• ParseTypeString() : blastdb_aux.hpp, blastdb_aux.cpp
• ParseVersionString() : version.cpp, version.hpp
• partitionSizes() : inputs.cpp, fastme.cpp
• PASS_PARAMS : command_processor.hpp
• PassException() : context.cpp
• Path() : fileutil.hpp, fileutil.cpp
• PATH_MAX : ncbifile.hpp
• PATH_SEP : bzip2.c
• pathToFiles() : asniotest.cpp
• pattern_count : pcregrep.c
• pattern_filename : pcregrep.c
• pattern_list : pcregrep.c
• PATTERN_QUERY_MASK : blast_program.h
• pbuffer : pcretest.c
• pc1 : des.c
• pc2 : des.c
• PCase : ncbistr.hpp
• PCase_CStr : ncbistr.hpp
• pchars() : pcretest.c
• PCompare() : obj_convert.cpp, convert_graph.cpp
• PCompartmentRanker() : compart.cpp
• pcre : pcre.h
• PCRE_ANCHORED : pcre.h
• PCRE_AUTO_CALLOUT : pcre.h
• PCRE_BSR_ANYCRLF : pcre.h
• PCRE_BSR_UNICODE : pcre.h
• pcre_callout : pcre_globals.c, pcre.h
• PCRE_CASELESS : pcre.h
• pcre_compile() : pcre_compile.c, pcre.h
• pcre_compile2() : pcre_compile.c, pcre.h
• pcre_config() : pcre_config.c, pcre.h
• PCRE_CONFIG_BSR : pcre.h
• PCRE_CONFIG_LINK_SIZE : pcre.h
• PCRE_CONFIG_MATCH_LIMIT : pcre.h
• PCRE_CONFIG_MATCH_LIMIT_RECURSION : pcre.h
• PCRE_CONFIG_NEWLINE : pcre.h
• PCRE_CONFIG_POSIX_MALLOC_THRESHOLD : pcre.h
• PCRE_CONFIG_STACKRECURSE : pcre.h
• PCRE_CONFIG_UNICODE_PROPERTIES : pcre.h
• PCRE_CONFIG_UTF8 : pcre.h
• pcre_copy_named_substring() : pcre_get.c, pcre.h
• pcre_copy_substring() : pcre_get.c, pcre.h
• PCRE_DATE : pcre.h
• PCRE_DECLARE_INTEGER_PARSER : pcrecpparg.h
• pcre_dfa_exec() : pcre_dfa_exec.c, pcre.h
• PCRE_DFA_RESTART : pcre.h
• PCRE_DFA_SHORTEST : pcre.h
• PCRE_DOLLAR_ENDONLY : pcre.h
• PCRE_DOTALL : pcre.h
• PCRE_DUPNAMES : pcre.h
• PCRE_ERROR_BADCOUNT : pcre.h
• PCRE_ERROR_BADMAGIC : pcre.h
• PCRE_ERROR_BADNEWLINE : pcre.h
• PCRE_ERROR_BADOPTION : pcre.h
• PCRE_ERROR_BADPARTIAL : pcre.h
• PCRE_ERROR_BADUTF8 : pcre.h
• PCRE_ERROR_BADUTF8_OFFSET : pcre.h
• PCRE_ERROR_CALLOUT : pcre.h
• PCRE_ERROR_DFA_RECURSE : pcre.h
• PCRE_ERROR_DFA_UCOND : pcre.h
• PCRE_ERROR_DFA_UITEM : pcre.h
• PCRE_ERROR_DFA_UMLIMIT : pcre.h
• PCRE_ERROR_DFA_WSSIZE : pcre.h
• PCRE_ERROR_INTERNAL : pcre.h
• PCRE_ERROR_MATCHLIMIT : pcre.h
• PCRE_ERROR_NOMATCH : pcre.h
• PCRE_ERROR_NOMEMORY : pcre.h
• PCRE_ERROR_NOSUBSTRING : pcre.h
• PCRE_ERROR_NULL : pcre.h
• PCRE_ERROR_NULLWSLIMIT : pcre.h
• PCRE_ERROR_PARTIAL : pcre.h
• PCRE_ERROR_RECURSIONLIMIT : pcre.h
• PCRE_ERROR_UNKNOWN_NODE : pcre.h
• PCRE_ERROR_UNKNOWN_OPCODE : pcre.h
• pcre_exec() : pcre_exec.c, pcre.h
• PCRE_EXP_DECL : pcre_internal.h, pcre.h
• PCRE_EXP_DEFN : pcre_internal.h
• PCRE_EXTENDED : pcre.h
• PCRE_EXTRA : pcre.h
• PCRE_EXTRA_CALLOUT_DATA : pcre.h
• PCRE_EXTRA_MATCH_LIMIT : pcre.h
• PCRE_EXTRA_MATCH_LIMIT_RECURSION : pcre.h
• PCRE_EXTRA_STUDY_DATA : pcre.h
• PCRE_EXTRA_TABLES : pcre.h
• PCRE_FIRSTLINE : pcre.h
• PCRE_FIRSTSET : pcre_internal.h
• pcre_free : pcre_globals.c, pcre.h
• pcre_free_substring() : pcre_get.c, pcre.h
• pcre_free_substring_list() : pcre_get.c, pcre.h
• pcre_fullinfo() : pcre_fullinfo.c, pcre.h
• pcre_get_named_substring() : pcre_get.c, pcre.h
• pcre_get_stringnumber() : pcre_get.c, pcre.h
• pcre_get_stringtable_entries() : pcre_get.c, pcre.h
• pcre_get_substring() : pcre_get.c, pcre.h
• pcre_get_substring_list() : pcre_get.c, pcre.h
• PCRE_HASCRORLF : pcre_internal.h
• PCRE_IMS : pcre_internal.h
• pcre_info() : pcre_info.c, pcre.h
• PCRE_INFO_BACKREFMAX : pcre.h
• PCRE_INFO_CAPTURECOUNT : pcre.h
• PCRE_INFO_DEFAULT_TABLES : pcre.h
• PCRE_INFO_FIRSTBYTE : pcre.h
• PCRE_INFO_FIRSTCHAR : pcre.h
• PCRE_INFO_FIRSTTABLE : pcre.h
• PCRE_INFO_HASCRORLF : pcre.h
• PCRE_INFO_JCHANGED : pcre.h
• PCRE_INFO_LASTLITERAL : pcre.h
• PCRE_INFO_NAMECOUNT : pcre.h
• PCRE_INFO_NAMEENTRYSIZE : pcre.h
• PCRE_INFO_NAMETABLE : pcre.h
• PCRE_INFO_OKPARTIAL : pcre.h
• PCRE_INFO_OPTIONS : pcre.h
• PCRE_INFO_SIZE : pcre.h
• PCRE_INFO_STUDYSIZE : pcre.h
• PCRE_IS_SET : pcrecpp.h
• PCRE_JAVASCRIPT_COMPAT : pcre.h
• PCRE_JCHANGED : pcre_internal.h
• PCRE_MAJOR : pcre.h
• PCRE_MAKE_PARSER : pcrecpparg.h
• pcre_maketables() : pcre_maketables.c, pcre.h
• pcre_malloc : pcre_globals.c, pcre.h
• pcre_memmove() : pcre_internal.h
• PCRE_MINOR : pcre.h
• PCRE_MULTILINE : pcre.h
• PCRE_NEWLINE_ANY : pcre.h
• PCRE_NEWLINE_ANYCRLF : pcre.h
• PCRE_NEWLINE_BITS : pcre_internal.h
• PCRE_NEWLINE_CR : pcre.h
• PCRE_NEWLINE_CRLF : pcre.h
• PCRE_NEWLINE_LF : pcre.h
• PCRE_NO_AUTO_CAPTURE : pcre.h
• PCRE_NO_START_OPTIMISE : pcre.h
• PCRE_NO_START_OPTIMIZE : pcre.h
• PCRE_NO_UTF8_CHECK : pcre.h
• PCRE_NOPARTIAL : pcre_internal.h
• PCRE_NOTBOL : pcre.h
• PCRE_NOTEMPTY : pcre.h
• PCRE_NOTEOL : pcre.h
• PCRE_PARTIAL : pcre.h
• PCRE_PRERELEASE : pcre.h
• pcre_refcount() : pcre_refcount.c, pcre.h
• PCRE_REQCHSET : pcre_internal.h
• PCRE_SET_OR_CLEAR : pcrecpp.h
• PCRE_SPTR : pcre_internal.h, pcre.h
• pcre_stack_free : pcre_globals.c, pcre.h
• pcre_stack_malloc : pcre_globals.c, pcre.h
• PCRE_STARTLINE : pcre_internal.h
• PCRE_STATIC : pcre.h
• pcre_study() : pcre_study.c, pcre.h
• PCRE_STUDY_MAPPED : pcre_internal.h
• PCRE_UNGREEDY : pcre.h
• PCRE_UTF8 : pcre.h
• pcre_version() : pcre_version.c, pcre.h
• PCRECPP_EXP_DECL : pcrecpp_internal.h
• PCRECPP_EXP_DEFN : pcrecpp_internal.h
• pcregrep() : pcregrep.c
• PCREPOSIX_EXP_DECL : pcreposix.h
• PCREPOSIX_EXP_DEFN : pcreposix.h
• pcretables : pcregrep.c
• PDB_General_RegisterModuleClasses() : PDB_General_module.cpp, PDB_General_module.hpp
• PDBBLOCK_HAS_COMPOUND : sequence_macros.hpp
• PDBBLOCK_HAS_SOURCE : sequence_macros.hpp
• pdfbrk() : pdf_object.hpp
• pdfeol() : pdf_object_writer.hpp
• PdfUnitsToInches() : print_utils.hpp
• PdfUnitsToMm() : print_utils.hpp
• PDiag() : em.cpp
• PENDING_ROW_START : cuCdCore.hpp
• percent_tolerance() : floating_point_comparison.hpp
• PeriodicTable : periodic_table.hpp, periodic_table.cpp
• perminit_fp() : des.c
• perminit_ip() : des.c
• permInverse() : NNI.cpp, heap.cpp, bNNI.cpp
• permute_fp() : des.c
• permute_ip() : des.c
• PH_MAX : prot_prop.cpp
• PH_MIN : prot_prop.cpp
• phaseOrderStrings : InterfaceGUI.cpp
• PHI_ASCII_SIZE : pattern.h
• PHI_BITS_PACKED_PER_WORD : pattern.h
• PHI_BUF_SIZE : pattern.h
• PHI_MAX_HIT : pattern.h
• PHI_MAX_PATTERN_LENGTH : pattern.h
• PHI_MAX_WORD_SIZE : pattern.h
• PHI_MAX_WORDS_IN_PATTERN : pattern.h
• PHIBlast_HSPResultsSplit() : blast_hits.c, blast_hits.h
• PhiBlastGetEffectiveNumberOfPatterns() : blast_hits.c, blast_hits.h
• PhiBlastResults2SeqAlign_OMF() : blast_seqalign.cpp
• PHIBlastScanSubject() : phi_lookup.c, phi_lookup.h
• PHIBlastWordFinder() : phi_extend.c, phi_extend.h
• PHIGappedAlignmentWithTraceback() : phi_gapalign.c, phi_gapalign.h
• PHIGetGappedScore() : phi_gapalign.c, phi_gapalign.h
• PHIGetPatternOccurrences() : pattern.c, pattern.h
• PHYLO_EDGE_COLOR : phylo_tree_node.cpp
• PHYLO_FEAT_DIST : phylo_tree_node.cpp
• PHYLO_FEAT_LABEL : wx_label_edit_dlg.cpp, phylo_tree_node.cpp
• PHYLO_FEAT_SEQID : phylo_tree_node.cpp
• PHYLO_FEAT_SEQTITLE : phylo_tree_node.cpp
• PHYLO_LABEL_BGCOLOR : phylo_tree_node.cpp
• PHYLO_LABEL_COLOR : phylo_tree_node.cpp
• PHYLO_LABEL_TGCOLOR : phylo_tree_node.cpp
• PHYLO_NODE_COLLAPSED : phylo_tree_node.cpp
• PHYLO_NODE_COLOR : phylo_tree_node.cpp
• PHYLO_NODE_SHAPE : phylo_tree_node.cpp
• PHYLO_NODE_SIZE : phylo_tree_node.cpp
• PHYLO_RC_LOAD_COLOR : phylo_tree_scheme.cpp
• PHYLO_RC_LOAD_INT : phylo_tree_scheme.cpp
• PHYLO_RC_LOAD_STRING : phylo_tree_scheme.cpp
• PHYLO_RC_SAVE_COLOR : phylo_tree_scheme.cpp
• PHYLO_RC_SAVE_INT : phylo_tree_scheme.cpp
• PHYLO_RC_SAVE_STRING : phylo_tree_scheme.cpp
• PHYLO_TREE_TEMPLATE : phylo_tree_cgi.cpp
• pi : math.hpp
• PI : opengl_renderer.cpp, compo_mode_condition.c
• pickBufSize : opengl_renderer.cpp
• PIN : odbc.c
• PIPE_CreateConnector() : ncbi_pipe_connector.cpp, ncbi_pipe_connector.hpp
• PIR_General_RegisterModuleClasses() : PIR_General_module.cpp, PIR_General_module.hpp
• PixDistanceSquare() : hit_clustering.cpp
• pKaC : prot_prop.cpp
• pKaN : prot_prop.cpp
• pKaSide : prot_prop.cpp
• plainColor() : cav_alndisplay.cpp
• PLoWord() : em.cpp
• PMODULEENTRY32 : ncbi_stack_win32.cpp
• PNocase : ncbistr.hpp
• PNocase_Conditional : ncbistr.hpp
• PNocase_Conditional_CStr : ncbistr.hpp
• PNocase_CStr : ncbistr.hpp
• PO_FIXED_STRINGS : pcregrep.c
• PO_LINE_MATCH : pcregrep.c
• PO_WORD_MATCH : pcregrep.c
• PODBC_VS_ARGS : sqlext.h
• point1 : project_tree_view.cpp
• POLLABLE : ncbi_socket.h
• POLLABLE_FromLSOCK() : ncbi_socket.c, ncbi_socket.h
• POLLABLE_FromSOCK() : ncbi_socket.c, ncbi_socket.h
• POLLABLE_FromTRIGGER() : ncbi_socket.c, ncbi_socket.h
• POLLABLE_Poll() : ncbi_socket.c, ncbi_socket.h
• POLLABLE_ToLSOCK() : ncbi_socket.c, ncbi_socket.h
• POLLABLE_ToSOCK() : ncbi_socket.c, ncbi_socket.h
• POLLABLE_ToTRIGGER() : ncbi_socket.c, ncbi_socket.h
• POLYGAMMA_ORDER_MAX : ncbi_math.h
• pool_allocate() : stress.cpp
• pool_allocate2() : stress.cpp
• pool_free() : stress.cpp
• POOL_SIZE : stress.cpp
• PopDiagPostPrefix() : ncbidiag.cpp, ncbidiag.hpp
• PopFrontEventHandler() : wx_utils.cpp, wx_utils.hpp
• popHeap() : NNI.cpp, heap.cpp, bNNI.cpp
• Pos : deflate.h
• pos : seq_map_switch.cpp
• POS_ISO1 : iconv.c
• POS_UCS2BE : iconv.c
• POS_UCS2LE : iconv.c
• POS_UTF8 : iconv.c
• Posf : deflate.h
• POSIT_CHAR : Info.cpp
• posix_class_maps : pcre_compile.c
• POSIX_MALLOC_THRESHOLD : config.h
• posix_name_lengths : pcre_compile.c
• posix_names : pcre_compile.c
• PostEvent() : events_unit_test.cpp
• PostRedrawEntity() : show_hide_manager.cpp
• pp0 : miscmath.c
• pp1 : miscmath.c
• pp2 : miscmath.c
• pp3 : miscmath.c
• pp4 : miscmath.c
• pProgressFunction : cuDistmat.hpp
• pqdownheap() : trees.c
• pqremove : trees.c
• prADD_SUB : muParserDef.h
• prCMP : muParserDef.h
• PRE_NORMAL_ROW : tdsodbc.h
• Precede() : gnomon_model.hpp
• prefix : pcregrep.c
• prefsDir : cn3d_tools.cpp
• prepare_call() : native.c, tdsodbc.h
• prepare_new_block() : bzlib.c
• prepared_rpc() : prepare_query.c
• PreSearchFn : blast_dbindex.cpp
• PRESET_DICT : zutil.h
• prev_ : node.cpp
• PREV_JOB_WAS_EXCLUSIVE : grid_thread_context.cpp
• previous_line() : pcregrep.c
• prevPSSMWeight : sequence_viewer_window.cpp
• PRF_General_RegisterModuleClasses() : PRF_General_module.cpp, PRF_General_module.hpp
• prime() : expr.cpp
• prINFIX : muParserDef.h
• print_bc() : bmdbg.h
• print_blocks_count() : bmdbg.h
• print_gap() : stress.cpp
• PRINT_INT8_CHUNK : strbuffer.cpp, ncbistr.cpp
• PRINT_INT8_CHUNK_SIZE : strbuffer.cpp, ncbistr.cpp
• print_mv() : stress.cpp
• print_stat() : bmdbg.h
• PRINT_TMP_STR : html.cpp
• Printable() : ncbistre.cpp, ncbistre.hpp
• printASN() : gnomon_model.cpp
• PrintASNNewLine() : srcutil.hpp, srcutil.cpp
• PrintBinary() : bmdbg.h
• PrintBits32() : bmdbg.h
• PrintBLOB_Table() : demo4.cpp
• PrintContext() : print.cpp, print.hpp
• PrintCorDef() : thrdatd.c, thrddecl.h
• PrintDemoDB() : demo4.cpp
• PrintDGap() : bmdbg.h
• PrintDGapGamma() : bmdbg.h
• PrintDistanceMatrix() : bmdbg.h
• printDoubleTable() : gme.cpp
• printed_range() : shortcuts.cpp, read_blast_result.hpp
• printed_ranges() : shortcuts.cpp, read_blast_result.hpp
• printf2string() : utility.cpp
• PrintFldMtf() : thrdatd.c, thrddecl.h
• PrintFormattedSeqAlign() : blast_test_util.hpp, blast_test_util.cpp
• PrintGammaCode() : bmdbg.h
• PrintGap() : bmdbg.h
• PrintGapLevels() : stress.cpp
• printGFF3() : gnomon_model.cpp
• PRINTHEX : pcretest.c
• printMatrix() : bNNI.cpp
• PrintModularDTDModuleReference() : module.cpp
• printMsa() : cuPssmMaker.cpp
• PrintNode() : phy_node.cpp, bio_tree.cpp, phy_node.hpp, bio_tree.hpp
• PrintPhoneBook() : demo1.cpp
• PrintPhoneBookRecord() : demo2.cpp
• PrintQrySeq() : thrdatd.c, thrddecl.h
• PrintRas() : glprint.cpp, glprint.hpp
• PrintRecord() : demo3.cpp, demo2.cpp, demo1.cpp
• PrintResults() : srsearch_app.cpp
• PrintSeqMtf() : thrdatd.c, thrddecl.h
• PrintSequence() : blast_test_util.hpp, blast_test_util.cpp
• PrintSet() : bitset_debug.hpp
• PrintStrings() : postscript_defs.hpp
• PrintTextAsn1Object : blast_test_util.hpp
• PrintThdTbl() : thrdatd.c, thrddecl.h
• PrintTMatrix() : bmdbg.h
• PrintVec() : glprint.cpp, glprint.hpp
• prLOGIC : muParserDef.h
• prMUL_DIV : muParserDef.h
• PRO_TRUE_ALPHABET_SIZE : blast_posit.h
• PROCESS_IF_COMMAND_IS : command_processor.hpp
• process_options : pcregrep.c
• PROCESS_RESULTS : tds.h
• PROCESS_ROWS : tds.h
• ProcessStream() : agp_renumber.cpp
• ProductToSource() : sequence.cpp, sequence.hpp
• prog : minigzip.c
• progName : bzip2recover.c, bzip2.c
• progNameReally : bzip2.c
• PROGRAM_NAME : remote_app_dispatcher.cpp, ns_submit_remote_job.cpp
• PROGRAM_VERSION : remote_app_dispatcher.cpp, ns_submit_remote_job.cpp
• programDir : cn3d_tools.cpp
• ProgramNameToEnum() : blast_aux.cpp, blast_types.hpp
• PROGRESS_MAX : alignment_manager.cpp
• PROGRESS_PRINT : stress.cpp
• PROGRESS_RESOLUTION : cn3d_png.cpp
• ProgressAsInt() : Interface.cpp
• progressMeter : cn3d_png.cpp
• projectionType : opengl_renderer.cpp
• PromoteCdregion() : promote.cpp, promote.hpp
• PromoteFeatures() : promote.cpp, promote.hpp
• PromoteIfDifferent() : msvc_prj_utils.hpp, msvc_prj_utils.cpp
• PromotePub() : promote.cpp, promote.hpp
• PromoteRna() : promote.cpp, promote.hpp
• Prosite2Regex() : sequence_set.cpp, cuUtils.cpp, cuUtils.hpp
• PROT_HAS_ACTIVITY : sequence_macros.hpp
• PROT_HAS_DBXREF : sequence_macros.hpp
• PROT_HAS_ECNUMBER : sequence_macros.hpp
• PROT_HAS_NAME : sequence_macros.hpp
• PROT_INFO_PAIR : SeqFeatData.cpp
• PROTEIN_QUERY_MASK : blast_program.h
• PROTEIN_SUBJECT_MASK : blast_program.h
• ProteinAbbrevData : cleanup_utils.cpp
• PROTON_MASS : pepxml.cpp
• PROTREF_HAS_ACTIVITY : sequence_macros.hpp
• PROTREF_HAS_DBXREF : sequence_macros.hpp
• PROTREF_HAS_ECNUMBER : sequence_macros.hpp
• PROTREF_HAS_NAME : sequence_macros.hpp
• prPOSTFIX : muParserDef.h
• prPOW : muParserDef.h
• PSEND : pcre_exec.c, pcre_dfa_exec.c, pcre_compile.c
• PSEQ : PSeq.hpp
• PSEUDO_MAX : blast_psi_priv.c
• PSI_INCLUSION_ETHRESH : blast_options.h
• PSI_PSEUDO_COUNT_CONST : blast_options.h
• PSI_SUCCESS : blast_psi_priv.h
• PsiBlastAddAncillaryPssmData() : psiblast_aux_priv.cpp
• PsiBlastComputePssmFromAlignment() : psiblast.hpp
• PsiBlastComputePssmScores() : psiblast_aux_priv.cpp
• PSIBlastOptionsFree() : blast_options.c, blast_options.h
• PSIBlastOptionsNew() : blast_options.c, blast_options.h
• PSIBlastOptionsValidate() : blast_options.c, blast_options.h
• PsiBlastSetupScoreBlock() : psiblast_aux_priv.cpp
• PSICreatePssm() : blast_psi.c, blast_psi.h
• PSICreatePssmFromFrequencyRatios() : blast_psi.c, blast_psi.h
• PSICreatePssmWithDiagnostics() : blast_psi.c, blast_psi.h
• PSIDiagnosticsRequestFree() : blast_psi.c, blast_psi.h
• PSIDiagnosticsRequestNew() : blast_psi.c, blast_psi.h
• PSIDiagnosticsRequestNewEx() : blast_psi.c, blast_psi.h
• PSIDiagnosticsResponseFree() : blast_psi.c, blast_psi.h
• PSIDiagnosticsResponseNew() : blast_psi.c, blast_psi.h
• PSIERR_BADPARAM : blast_psi_priv.h
• PSIERR_BADSEQWEIGHTS : blast_psi_priv.h
• PSIERR_COLUMNOFGAPS : blast_psi_priv.h
• PSIERR_ENDINGGAP : blast_psi_priv.h
• PSIERR_GAPINQUERY : blast_psi_priv.h
• PSIERR_NOALIGNEDSEQS : blast_psi_priv.h
• PSIERR_NOFREQRATIOS : blast_psi_priv.h
• PSIERR_OUTOFMEM : blast_psi_priv.h
• PSIERR_POSITIVEAVGSCORE : blast_psi_priv.h
• PSIERR_STARTINGGAP : blast_psi_priv.h
• PSIERR_UNALIGNEDCOLUMN : blast_psi_priv.h
• PSIERR_UNKNOWN : blast_psi_priv.h
• PSIMatrixFree() : blast_psi.c, blast_psi.h
• PSIMatrixNew() : blast_psi.c, blast_psi.h
• PSIMsaFree() : blast_psi.c, blast_psi.h
• PSIMsaNew() : blast_psi.c, blast_psi.h
• PSSM_QUERY_MASK : blast_program.h
• PSSM_SUBJECT_MASK : blast_program.h
• PssmScoreUsage : ColumnScorer.hpp
• PSSTART : pcre_exec.c, pcre_dfa_exec.c, pcre_compile.c
• pstring : pcreposix.c
• pszASN : text_panel.cpp
• pszFastA : text_panel.cpp
• pszFlatFile : text_panel.cpp
• pszXML : text_panel.cpp
• PT_ANY : pcre_internal.h
• PT_GC : pcre_internal.h
• PT_LAMP : pcre_internal.h
• PT_PC : pcre_internal.h
• PT_SC : pcre_internal.h
• PTB_ERROR : ptb_err_codes.hpp
• PTB_ERROR_EX : ptb_err_codes.hpp
• PTB_INFO : ptb_err_codes.hpp
• PTB_INFO_EX : ptb_err_codes.hpp
• PTB_TRACE : ptb_err_codes.hpp
• PTB_TRACE_EX : ptb_err_codes.hpp
• PTB_WARNING : ptb_err_codes.hpp
• PTB_WARNING_EX : ptb_err_codes.hpp
• PTHROW : cn3d_pssm.cpp, su_pssm.cpp
• PTR : sqltypes.h
• PTR_ALIGNED_TO_SELF_SIZE : seqdbgeneral.hpp
• PUB_HAS_AUTHOR : sequence_macros.hpp
• PUB_ON_PUBDESC_Get : sequence_macros.hpp
• PUB_ON_PUBDESC_Set : sequence_macros.hpp
• PUB_ON_PUBDESC_Test : sequence_macros.hpp
• PUB_ON_PUBDESC_Type : sequence_macros.hpp
• PUB_ON_PUBEQUIV_Get : sequence_macros.hpp
• PUB_ON_PUBEQUIV_Set : sequence_macros.hpp
• PUB_ON_PUBEQUIV_Test : sequence_macros.hpp
• PUB_ON_PUBEQUIV_Type : sequence_macros.hpp
• PUBDESC_HAS_PUB : sequence_macros.hpp
• PUBLIC_COMPILE_OPTIONS : pcre_internal.h
• PUBLIC_DFA_EXEC_OPTIONS : pcre_internal.h
• PUBLIC_EXEC_OPTIONS : pcre_internal.h
• PUBLIC_STUDY_OPTIONS : pcre_internal.h
• PULL : infback.c
• PULLBYTE : inflate.c, infback.c
• PUP : inffast.c
• PurgeConsensusSequences() : cuCD.cpp, cuCD.hpp
• PurgeEvidence() : cuCdAnnotation.cpp
• PurgeNonAlpha() : cuSeqAnnotFromFasta.cpp
• push_back() : Entrez2_id_list.cpp
• PushDiagPostPrefix() : ncbidiag.cpp, ncbidiag.hpp
• PushFrontEventHandler() : wx_utils.cpp, wx_utils.hpp
• pushHeap() : NNI.cpp, heap.cpp, bNNI.cpp
• PushInDel() : gnomon_seq.cpp
• PUT2 : pcre_internal.h
• PUT2INC : pcre_internal.h
• put_byte : deflate.h
• put_short : trees.c
• PUTINC : pcre_internal.h
• PutInt4LE() : resource_info.cpp
• putLong() : gzio.c
• putShortMSB() : deflate.c
• PV_ARRAY_BTS : blast_lookup.h
• PV_ARRAY_BYTES : blast_lookup.h
• PV_ARRAY_MASK : blast_lookup.h
• PV_ARRAY_TYPE : blast_lookup.h
• PV_SET : blast_lookup.h
• PV_TEST : blast_lookup.h
• py_ssize_t : pythonpp_object.hpp
• PYDBAPI_MODINIT_FUNC : python_ncbi_dbapi.cpp
• python_ncbi_dbapi_methods : python_ncbi_dbapi.cpp

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