Here is a list of all file members with links to the files they belong to:

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• __DECLARE_INSTANCE() : _hashtable.c
• __DFL_TMPL_PARAM : stlp_defs.hpp
• __hash_map__ : _hash_map.h
• __hash_multimap__ : _hash_map.h
• __hash_multiset__ : _hash_set.h
• __hash_set__ : _hash_set.h
• __HI : miscmath.c
• __HIp : miscmath.c
• __inline__ : bzlib_private.h
• __iterator__ : _hashtable.c
• __less() : stlp_defs.hpp
• __LO : miscmath.c
• __LOp : miscmath.c
• __lower_bound : stlp_defs.hpp
• __MAX : selection_model.cpp
• __MIN : selection_model.cpp
• __PRIME_LIST_BODY : _hashtable.c
• __reference__ : _hashtable.c
• __REINTERPRET_CAST : stlp_defs.hpp
• __sfree() : blast_util.c, blast_def.h
• __size_type__ : _hashtable.c
• __STATIC_CAST : stlp_defs.hpp
• __stl_alloc_create() : stlp_defs.hpp
• __stl_alloc_rebind() : stlp_defs.hpp
• __stl_hash_string() : stlp_defs.hpp, _hash_fun.h
• __stl_num_primes : _hashtable.h
• __T : odbc_utils.hpp
• __TRIVIAL_CONSTRUCTOR : stlp_defs.hpp
• __TRIVIAL_DESTRUCTOR : stlp_defs.hpp
• __TRIVIAL_STUFF : stlp_defs.hpp
• __vector__ : stlp_defs.hpp
• __WORKAROUND_RENAME : _hash_set.h, _hash_map.h, stlp_defs.hpp
• _ALNMGR_ASSERT : alnexception.hpp
• _ASSERT : ncbidbg.hpp, test_assert_impl.h
• _bcp_add_fixed_columns() : bcp.c
• _bcp_add_variable_columns() : bcp.c
• _bcp_build_bulk_insert_stmt() : bcp.c
• _bcp_check_eof() : bcp.c
• _bcp_clear_storage() : dblib.h
• _bcp_exec_in() : bcp.c
• _bcp_exec_out() : bcp.c
• _bcp_fgets() : bcp.c
• _bcp_free_columns() : bcp.c
• _bcp_free_storage() : bcp.c
• _bcp_get_col_data() : bcp.c
• _bcp_get_prog_data() : dblib.h
• _bcp_get_term_var() : bcp.c
• _bcp_measure_terminated_field() : bcp.c
• _bcp_read_hostfile() : bcp.c
• _bcp_readfmt_colinfo() : bcp.c
• _bcp_send_bcp_record() : bcp.c
• _bcp_send_colmetadata() : bcp.c
• _bcp_start_copy_in() : bcp.c
• _bcp_start_new_batch() : bcp.c
• _BlastSeqSrcImpl_GetCopyFnPtr() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetDataStructure() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetDeleteFnPtr() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetGetAvgSeqLen() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetGetIsProt() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetGetMaxSeqLen() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetGetName() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetGetNumSeqs() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetGetNumSeqsStats() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetGetSeqLen() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetGetSequence() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetGetTotLen() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetGetTotLenStats() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetInitErrorStr() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetIterNext() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetNewFnPtr() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetReleaseSequence() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetResetChunkIterator() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_GetSetNumberOfThreads() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetCopyFnPtr() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetDataStructure() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetDeleteFnPtr() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetGetAvgSeqLen() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetGetIsProt() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetGetMaxSeqLen() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetGetName() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetGetNumSeqs() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetGetNumSeqsStats() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetGetSeqLen() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetGetSequence() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetGetTotLen() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetGetTotLenStats() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetInitErrorStr() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetIterNext() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetNewFnPtr() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetReleaseSequence() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetResetChunkIterator() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _BlastSeqSrcImpl_SetSetNumberOfThreads() : blast_seqsrc.c, blast_seqsrc_impl.h
• _blk5_send_blob_columns() : blk.c
• _blk_add_fixed_columns() : blk.c
• _blk_add_variable_columns() : blk.c
• _blk_build_bcp_record() : blk.c
• _blk_build_bulk_insert_stmt() : blk.c
• _blk_clean_desc() : blk.c
• _blk_get_col_data() : blk.c
• _blk_is_binded() : blk.c
• _blk_read_column_defaults() : blk.c
• _blk_rowxfer_in() : blk.c
• _blk_rowxfer_out() : blk.c
• _blk_send_blob_columns() : blk.c
• _blk_send_colmetadata() : blk.c
• _blk_start_new_batch() : blk.c
• _CHECK : tse_handle.cpp
• _convert_char() : dblib.h
• _convert_intn() : dblib.h
• _CS_CANCEL_NOCANCEL : ctlib.h
• _CS_CANCEL_PENDING : ctlib.h
• _CS_COMMAND_BUILDING : ctlib.h
• _CS_COMMAND_IDLE : ctlib.h
• _CS_COMMAND_READY : ctlib.h
• _CS_COMMAND_SENT : ctlib.h
• _CS_CURS_TYPE_REQUESTED : ctlib.h
• _CS_CURS_TYPE_SENT : ctlib.h
• _CS_CURS_TYPE_UNACTIONED : ctlib.h
• _cs_datatype_length() : cs.c
• _CS_ERRHAND_CB : ctlib.h
• _CS_ERRHAND_INLINE : ctlib.h
• _cs_get_layer() : cs.c
• _cs_get_msgstr() : cs.c
• _cs_get_origin() : cs.c
• _cs_get_user_api_layer_error() : cs.c
• _CS_RES_CMD_DONE : ctlib.h
• _CS_RES_CMD_SUCCEED : ctlib.h
• _CS_RES_DESCRIBE_RESULT : ctlib.h
• _CS_RES_END_RESULTS : ctlib.h
• _CS_RES_INIT : ctlib.h
• _CS_RES_NONE : ctlib.h
• _CS_RES_RESULTSET_EMPTY : ctlib.h
• _CS_RES_RESULTSET_ROWS : ctlib.h
• _CS_RES_STATUS : ctlib.h
• _csclient_msg() : ct.c, cs.c
• _ct_allocate_dynamic() : ct.c
• _ct_bind_data() : ct.c, ctlib.h
• _ct_cancel_cleanup() : ct.c
• _ct_cmd_drop() : ct.c
• _ct_deallocate_dynamic() : ct.c
• _ct_diag_clearmsg() : ct.c, ctlib.h
• _ct_fetch_cursor() : ct.c
• _ct_fetchable_results() : ct.c
• _ct_fill_param() : ct.c
• _ct_get_client_type() : ct.c, ctlib.h
• _ct_get_layer() : ct.c
• _ct_get_msgstr() : ct.c
• _ct_get_origin() : ct.c
• _ct_get_server_type() : ct.c, ctlib.h
• _ct_get_user_api_layer_error() : ct.c
• _ct_handle_client_message() : ctutil.c, ctlib.h
• _ct_handle_server_message() : ctutil.c, ctlib.h
• _ct_initialise_cmd() : ct.c
• _ct_locate_dynamic() : ct.c
• _ct_process_return_status() : ct.c
• _ctclient_msg() : ct.c, ctlib.h
• _db_get_server_type() : dblib.c
• _DB_GETCOLINFO : dblib.c
• _DB_RES_INIT : dblib.h
• _DB_RES_NEXT_RESULT : dblib.h
• _DB_RES_NO_MORE_RESULTS : dblib.h
• _DB_RES_RESULTSET_EMPTY : dblib.h
• _DB_RES_RESULTSET_ROWS : dblib.h
• _DB_RES_SUCCEED : dblib.h
• _dblib_client_msg() : dblib.c, dblib.h
• _dblib_err_handler : dblib.c, dblib.h
• _dblib_handle_err_message() : dbutil.c, dblib.h
• _dblib_handle_info_message() : dbutil.c, dblib.h
• _dblib_msg_handler : dblib.c, dblib.h
• _dblib_setTDS_version() : dbutil.c, dblib.h
• _dbnullable() : dblib.c
• _dbprdate() : dblib.c
• _DEBUG_ARG : ncbidbg.hpp
• _DEBUG_CODE : ncbidbg.hpp
• _default_gamma_coef : ncbi_math.c
• _dist_code : trees.h, trees.c, deflate.h
• _EPSIPurgeFsmState : blast_psi_priv.c
• _FILE_OFFSET_BITS : spewG.c
• _focus_callback() : table_test.cpp
• _get_printable_size() : dblib.c
• _GNU_SOURCE : ncbiconf_xcode.h
• _handleBothAlignedSameResidueNoX() : blast_psi_priv.c
• _handleEitherAlignedEitherX() : blast_psi_priv.c
• _handleEitherAlignedNeitherX() : blast_psi_priv.c
• _handleNeitherAligned() : blast_psi_priv.c
• _HEAP_ALIGN : ncbi_heapmgr.c
• _HEAP_ALIGNMENT : ncbi_heapmgr.c
• _HEAP_ALIGNSHIFT : ncbi_heapmgr.c
• _iconv_close() : iconv.c
• _IMPALAScaleMatrix() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _length_code : trees.h, trees.c, deflate.h
• _mcrypt_decrypt() : des.h
• _PATH_DEVNULL : vasprintf.c
• _PATH_TTY : readpassphrase.c
• _pcre_default_tables : pcre_internal.h, pcre_chartables.c
• _pcre_is_newline() : pcre_newline.c, pcre_internal.h
• _pcre_OP_lengths : pcre_tables.c, pcre_internal.h, pcretest.c
• _pcre_ord2utf8() : pcre_ord2utf8.c, pcre_internal.h
• _pcre_try_flipped() : pcre_try_flipped.c, pcre_internal.h
• _pcre_ucd_records : pcre_ucd.c, pcre_internal.h
• _pcre_ucd_stage1 : pcre_ucd.c, pcre_internal.h
• _pcre_ucd_stage2 : pcre_ucd.c, pcre_internal.h
• _pcre_ucp_gentype : pcre_internal.h, pcretest.c
• _pcre_utf8_table1 : pcre_internal.h, pcretest.c
• _pcre_utf8_table1_size : pcre_internal.h, pcretest.c
• _pcre_utf8_table2 : pcre_internal.h, pcretest.c
• _pcre_utf8_table3 : pcre_internal.h, pcretest.c
• _pcre_utf8_table4 : pcre_internal.h, pcretest.c
• _pcre_utt : pcre_internal.h, pcretest.c
• _pcre_utt_names : pcre_internal.h, pcretest.c
• _pcre_utt_size : pcre_internal.h, pcretest.c
• _pcre_valid_utf8() : pcre_valid_utf8.c, pcre_internal.h
• _pcre_was_newline() : pcre_newline.c, pcre_internal.h
• _pcre_xclass() : pcre_xclass.c, pcre_internal.h
• _PHIBlastFindHitsShort() : pattern_priv.h, pattern.c
• _PHIGetRightOneBits() : pattern_priv.h, pattern.c
• _PHIPatternWordsBitwiseAnd() : pattern_priv.h, pattern.c
• _PHIPatternWordsBitwiseOr() : pattern_priv.h, pattern.c
• _PHIPatternWordsLeftShift() : pattern_priv.h, pattern.c
• _PSIAlignedBlockFree() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIAlignedBlockNew() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIAllocateMatrix() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSICalculateInformationContentFromFreqRatios() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSICalculateInformationContentFromScoreMatrix() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSICalculateMatchWeights() : blast_psi_priv.c
• _PSICalculateNormalizedSequenceWeights() : blast_psi_priv.c
• _PSICheckSequenceWeights() : blast_psi_priv.c
• _PSIComputeAlignedRegionLengths() : blast_psi_priv.c
• _PSIComputeAlignmentBlocks() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIComputeFreqRatios() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIComputePositionExtents() : blast_psi_priv.c
• _PSIComputeScoreProbabilities() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIComputeSequenceWeights() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIConvertFreqRatiosToPSSM() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSICopyMatrix_double() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSICopyMatrix_int() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSICreateAndScalePssmFromFrequencyRatios() : blast_psi.c
• _PSIDeallocateMatrix() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIGetAlignedSequencesForPosition() : blast_psi_priv.c
• _PSIGetLeftExtents() : blast_psi_priv.c
• _PSIGetRightExtents() : blast_psi_priv.c
• _PSIInternalPssmDataFree() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIInternalPssmDataNew() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIMatrixFrequencyRatiosFree() : matrix_freq_ratios.h, matrix_freq_ratios.c
• _PSIMatrixFrequencyRatiosNew() : matrix_freq_ratios.h, matrix_freq_ratios.c
• _PSIMsaFree() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIMsaNew() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIPackedMsaFree() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIPackedMsaGetNumberOfAlignedSeqs() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIPackedMsaNew() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIPurgeAlignedRegion() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIPurgeBiasedSegments() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIResetAlignmentTraits() : blast_psi_priv.c
• _PSISaveDiagnostics() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIScaleMatrix() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSISequenceLengthWithoutX() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSISequenceWeightsFree() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSISequenceWeightsNew() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSISpreadGapWeights() : blast_psi_priv.c
• _PSIStructureGroupCustomization() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIUpdateLambdaK() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIUpdatePositionCounts() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIValidateMSA() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _PSIValidateMSA_StructureGroup() : blast_psi_priv.h, blast_psi_priv.c
• _rowxfer_in_init() : blk.c
• _SEQALIGN_ASSERT : seqalign_exception.hpp
• _set_null_value() : dblib.c
• _SQLAllocConnect() : odbc.c
• _SQLAllocDesc() : odbc.c
• _SQLAllocEnv() : odbc.c
• _SQLAllocStmt() : odbc.c
• _SQLBindParameter() : odbc.c
• _SQLColAttribute() : odbc.c
• _SQLExecute() : odbc.c
• _SQLFetch() : odbc.c
• _SQLFreeConnect() : odbc.c
• _SQLFreeDesc() : odbc.c
• _SQLFreeEnv() : odbc.c
• _SQLFreeStmt() : odbc.c
• _SQLGetConnectAttr() : odbc.c
• _SQLGetDiagRec() : error.c
• _SQLGetStmtAttr() : odbc.c
• _SQLRowCount() : odbc.c, tdsodbc.h
• _SQLSetConnectAttr() : odbc.c
• _SQLSetStmtAttr() : odbc.c
• _SQLTransact() : odbc.c
• _Stl_prime_type : _hashtable.h
• _STLP_BEGIN_NAMESPACE : stlp_defs.hpp
• _STLP_CALL : stlp_defs.hpp
• _STLP_CONVERT_ALLOCATOR : stlp_defs.hpp
• _STLP_DEBUG_UNINITIALIZED : stlp_defs.hpp
• _STLP_DEFAULT_ALLOCATOR_SELECT : stlp_defs.hpp
• _STLP_DEFAULT_PAIR_ALLOCATOR_SELECT : stlp_defs.hpp
• _STLP_DEFINE_ARROW_OPERATOR : stlp_defs.hpp
• _STLP_END_NAMESPACE : stlp_defs.hpp
• _STLP_FIX_LITERAL_BUG : stlp_defs.hpp
• _STLP_FORCE_ALLOCATORS : stlp_defs.hpp
• _STLP_HASHTABLE : _hash_map.h
• _STLP_INTERNAL_ALGOBASE_H : stlp_defs.hpp
• _STLP_INTERNAL_FUNCTION_H : stlp_defs.hpp
• _STLP_INTERNAL_ITERATOR_H : stlp_defs.hpp
• _STLP_INTERNAL_VECTOR_H : stlp_defs.hpp
• _STLP_KEY_PAIR : _hash_map.h
• _STLP_LINK_TIME_INSTANTIATION : stlp_defs.hpp
• _STLP_NO_CLASS_PARTIAL_SPECIALIZATION : stlp_defs.hpp
• _STLP_PLACEMENT_NEW : stlp_defs.hpp
• _STLP_SELECT1ST : stlp_defs.hpp
• _STLP_SHRED_BYTE : stlp_defs.hpp
• _STLP_STATIC_TEMPLATE_DATA : stlp_defs.hpp
• _STLP_STD : stlp_defs.hpp
• _STLP_TEMPLATE : stlp_defs.hpp
• _STLP_TEMPLATE_CONTAINER : _hashtable.h, _hash_set.h, _hash_map.h
• _STLP_TEMPLATE_HEADER : _hashtable.h, _hash_set.h, _hash_map.h
• _STLP_TEMPLATE_NULL : stlp_defs.hpp
• _STLP_TRY : stlp_defs.hpp
• _STLP_TYPENAME_ON_RETURN_TYPE : stlp_defs.hpp
• _STLP_UNWIND : stlp_defs.hpp
• _STLP_USE_EXCEPTIONS : stlp_defs.hpp
• _STLP_USE_SEPARATE_RELOPS_NAMESPACE : stlp_defs.hpp
• _STR : tar.cpp
• _SWAP : cuSort.cpp
• _T : odbc_utils.hpp
• _T_FLUSH : readpassphrase.c
• _tds_cursor_fetch : tds.h
• _tds_cursor_operation : tds.h
• _TDS_STATE : tds.h
• _tds_token_name() : token.c
• _tr_align() : trees.c
• _tr_flush_block() : trees.c
• _tr_init() : trees.c
• _tr_stored_block() : trees.c
• _tr_tally() : trees.c
• _tr_tally_dist : deflate.h
• _tr_tally_lit : deflate.h
• _TRACE : objostrasnb.cpp, objostr.cpp, objlist.cpp, objistr.cpp, objcopy.cpp, ncbidbg.hpp
• _TRACE_EX : ncbidbg.hpp
• _TRACE_TSE_LOCK : tse_handle.cpp, scope_info.cpp
• _TRACE_X : ncbidbg.hpp
• _TRACE_XX : ncbidbg.hpp
• _TROUBLE : ncbidbg.hpp, test_assert_impl.h
• _VERIFY : ncbidbg.hpp
• _vsortCBQuickM : cuSort.cpp
• _WIN32_WINNT : ncbiconf_msvc.h

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