(order) Rickettsiales - 2 genomes Functional categories Fun All J A K L B D Y V T M N Z W U O C G E F H I P Q R S COGs 738 123 -  26 62 -  14 -  11 13 69 4 -  -  33 44 67 16 31 20 30 32 28 10 87 65 proteins 1,653 256 -  61 133 -  32 -  32 38 162 6 -  -  80 110 159 65 102 39 59 74 92 34 228 119 Distribution of COGs by number of proteins proteins 1 2 3 4 5 6 7 8 10 12 36 COGs 73 576 17 46 12 7 1 2 2 1 1

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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 36 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily
|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 12 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases
---------------|------||----------------------------|-----------|| 10 [C] COG3202 ATP/ADP translocase
----------------------------------------------------|------||||||| 10 [U] COG3704 Type IV secretory pathway, VirB6 components
--|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  8 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump
--||--||--||-|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  8 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components
|-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  7 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--||||||||||||||||||||||||  6 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs
||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  6 [M] COG0438 Glycosyltransferase
||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  6 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis
||||-||||-|||----|||-|----|||-----||||----|||-|-||---------|||--||  6 [CP] COG0651 Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit
----||----------||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  6 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein
----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-||||||||||||||||||  6 [M] COG0845 Membrane-fusion protein
--|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  6 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases)
|-||------||-||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  5 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain
----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-|  5 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases
|||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-|||||||||||||||  5 [R] COG0457 FOG: TPR repeat
-------------|||--||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  5 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains
----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-||||  5 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat
----------------||||||--||||||||--||||----||||||||||||||||||||||||  5 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases
----------------||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  5 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain
-||-|-||--||-----|--|------||----|-|--------------|-----|||---|--|  5 [R] COG1373 Predicted ATPase (AAA+ superfamily)
|-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||||  5 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators
------||-----------|-|----|||------------------------||-------||||  5 [E] COG1505 Serine proteases of the peptidase family S9A
--|-----------------|---------------------|||-|--------|---------|  5 [S] COG4804 Uncharacterized conserved protein
-------------||------------------------------|---------|---|||||||  5 [O] COG5265 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease and ATPase components
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit
-------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  4 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase
---|---------||---||----------------------||||||||||||||---|||||||  4 [T] COG0271 Stress-induced morphogen (activity unknown)
--||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-|||||||||  4 [C] COG0280 Phosphotransacetylase
--|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-||  4 [C] COG0282 Acetate kinase
--|----------||-|-||-|----||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  4 [S] COG0316 Uncharacterized conserved protein
-------------|----||------|||||-----------|||||-|||||------|||||||  4 [J] COG0349 Ribonuclease D
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [O] COG0443 Molecular chaperone
||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-||  4 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase
||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [O] COG0492 Thioredoxin reductase
---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  4 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes
|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins
||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---|||||||  4 [E] COG0531 Amino acid transporters
-------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)
|-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-||  4 [ER] COG0591 Na+/proline symporter
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation
--||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-||||||||||||||||||  4 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) 
|||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----||||||||||||||||||||||||  4 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class)
|||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----||||||||||||||||||||||||  4 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase
||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--||||||||  4 [R] COG0679 Predicted permeases
|-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-||||||||||||||||||  4 [L] COG0708 Exonuclease III
--|-------------|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b
----------------||||----||----||||-|||----||||||||||||||||||||||||  4 [M] COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains)
-------------|||||||||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  4 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  4 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  4 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein
-----------------|||||||||----------------|||||-||||||||||||||||||  4 [R] COG0795 Predicted permeases
---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---|||||||  4 [I] COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase
--|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-|||||||||||||  4 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes
||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--||||||||||||||  4 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning
||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  4 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes
----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||||  4 [MU] COG1538 Outer membrane protein
---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-||||||||||||||||||  4 [O] COG1651 Protein-disulfide isomerase
---|------|-|||-|----|--------------||----------||--||||--||||||||  4 [R] COG1999 Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC, involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems
--------|---------|--------|||------------------||-----|---||-||||  4 [I] COG3243 Poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase
------------------||-------|-|------------|||||-||||-|||---|||||||  4 [C] COG3288 NAD/NADP transhydrogenase alpha subunit
---|--------------------------|--------|------|-----|--|||-|||||||  4 [U] COG3451 Type IV secretory pathway, VirB4 components
--------------------|----------|-|----------------|-------------||  4 [M] COG3475 LPS biosynthesis protein
----------------------------------------------------|--|||-|||||||  4 [U] COG3504 Type IV secretory pathway, VirB9 components
------------------------------------------|||||---||-||----|||||||  4 [M] COG3637 Opacity protein and related surface antigens
----------------------------------------------------|---||-||||-||  4 [U] COG3736 Type IV secretory pathway, component VirB8
--------------------|------------------------------|-||---------||  4 [R] COG4797 Predicted regulatory domain of a methyltransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--||||||||  3 [J] COG0130 Pseudouridine synthase
||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-|||||||  3 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase
|||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  3 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes
||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-|  3 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase
|-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  3 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes
|--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-|  3 [O] COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity
|-||||-----|-||---||-------||||------|----|||||-||-|||||---|||||||  3 [R] COG0661 Predicted unusual protein kinase
|||||-||||-|-||||||-|------||||---|---|||||||-|--|--|---|--------|  3 [L] COG1112 Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits
---|||--|-|||-------||-----||||---|-||----|||||-||-----|---|||||||  3 [I] COG1250 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase
--||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-||||  3 [C] COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters
--||--------------||-|--|-|||-||---|||----|||||--|-|-------||-||||  3 [S] COG1357 Uncharacterized low-complexity proteins
---------------------------------|--|-----|||-|---||----||--|---||  3 [M] COG1442 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins, LPS:glycosyltransferases
----||------------||||--|-----||-|-|||-|--|||-|-||---|||--------||  3 [V] COG1619 Uncharacterized proteins, homologs of microcin C7 resistance protein MccF
----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||||  3 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator
--------------|-----|------|||||||-|------|||----|--------||||||||  3 [R] COG2071 Predicted glutamine amidotransferases
-----------------|-|||--------------------|||||--|-||--|---||-||||  3 [R] COG2373 Large extracellular alpha-helical protein
-------------------------------------------------------|---||-||||  3 [I] COG4553 Poly-beta-hydroxyalkanoate depolymerase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---|||||||  2 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase
---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---|||||||  2 [C] COG0022 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control
||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--||||||||  2 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases
||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  2 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  2 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0048 Ribosomal protein S12
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0049 Ribosomal protein S7
---------|---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2 [J] COG0051 Ribosomal protein S10
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0052 Ribosomal protein S2
||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--||||||||  2 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  2 [G] COG0061 Predicted sugar kinase
||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---|||||||||||||  2 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog)
|||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---|||||||  2 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0073 EMAP domain
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  2 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0080 Ribosomal protein L11
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0081 Ribosomal protein L1
|||---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0084 Mg-dependent DNase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0087 Ribosomal protein L3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0088 Ribosomal protein L4
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0089 Ribosomal protein L23
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0090 Ribosomal protein L2
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0091 Ribosomal protein L22
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0092 Ribosomal protein S3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0093 Ribosomal protein L14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0094 Ribosomal protein L5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0096 Ribosomal protein S8
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0098 Ribosomal protein S5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0099 Ribosomal protein S13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0100 Ribosomal protein S11
|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0102 Ribosomal protein L13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0103 Ribosomal protein S9
|||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase
---|||--|-|||||-|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  2 [O] COG0109 Polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||||  2 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase
--||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [C] COG0114 Fumarase
||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [F] COG0125 Thymidylate kinase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||||  2 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase
||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---|||||||||||||  2 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases
-|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  2 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase
||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0164 Ribonuclease HII
|||-|||||||--||||-||----||--------------------------------------||  2 [I] COG0170 Dolichol kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [E] COG0174 Glutamine synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-|||||||||||||||  2 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0185 Ribosomal protein S19
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2 [J] COG0186 Ribosomal protein S17
--||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||  2 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase
-------------|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [F] COG0194 Guanylate kinase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0195 Transcription elongation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0198 Ribosomal protein L24
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0199 Ribosomal protein S14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0200 Ribosomal protein L15
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY
||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0203 Ribosomal protein L17
||||||||||------||||||--||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  2 [D] COG0206 Cell division GTPase
---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-|||  2 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit
|-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  2 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0211 Ribosomal protein L27
|--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-||||||||||||||||||  2 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase
--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0216 Protein chain release factor A
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein
-|||--||||---|--||--|---------||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0218 Predicted GTPase
-------------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase
|-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-|||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit
-------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2 [J] COG0227 Ribosomal protein L28
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0228 Ribosomal protein S16
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2 [J] COG0230 Ribosomal protein L34
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A)
------------------|--|----||||-----|------|||||-||||---|---|||||||  2 [F] COG0232 dGTP triphosphohydrolase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0233 Ribosome recycling factor
--|----------||-||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10)
||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--||||||  2 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases
--|----------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  2 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2 [J] COG0238 Ribosomal protein S18
|-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  2 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0244 Ribosomal protein L10
--|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-||||||||||||||||||  2 [FP] COG0248 Exopolyphosphatase
--||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---|||||||  2 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family)
|||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0250 Transcription antiterminator
||------||------|||||-||--|||||---||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0254 Ribosomal protein L31
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0255 Ribosomal protein L29
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0256 Ribosomal protein L18
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2 [J] COG0257 Ribosomal protein L36
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)
------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-||||||||||||  2 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0261 Ribosomal protein L21
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2 [J] COG0267 Ribosomal protein L33
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0268 Ribosomal protein S20
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II)
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis
----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase)
---|---------|||--||----------------------||||||||||||||---|||||||  2 [O] COG0278 Glutaredoxin-related protein
--|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--||||||||  2 [C] COG0281 Malic enzyme
---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---|||||||  2 [F] COG0283 Cytidylate kinase
---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase
|||-----||------||||--||--|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3)
-------------|--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0291 Ribosomal protein L35
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0292 Ribosomal protein L20
||||||--||---|||--------||----------------||||||||||||||---|||||||  2 [J] COG0293 23S rRNA methylase
----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--|||||||||||  2 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I
-------------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0305 Replicative DNA helicase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0313 Predicted methyltransferases
|-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--||||||||  2 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase
---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  2 [H] COG0320 Lipoate synthase
----------|--||---||-|----||||------------||||||||||||||---|||||||  2 [H] COG0321 Lipoate-protein ligase B
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex
--||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---|||||||  2 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase)
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase
-------------|||--|||---|||||||----|||----|||||||||||--||||-|-|-||  2 [O] COG0326 Molecular chaperone, HSP90 family
---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0328 Ribonuclease HI
|||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase
----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0333 Ribosomal protein L32
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0335 Ribosomal protein L19
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase
||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD
|||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase
----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
-------------||-|-||-|----||||------------||||||||||||||---|||||||  2 [R] COG0354 Predicted aminomethyltransferase related to GcvT
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit)
--|----------|--|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a
----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type)
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0359 Ribosomal protein L9
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2 [J] COG0360 Ribosomal protein S6
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1)
|-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-|||||||||||||||  2 [C] COG0372 Citrate synthase
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases
||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----||  2 [M] COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase
|||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-|||||||||||||||  2 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases
-------------||---||-|||-------|--||||----|||----|--|------||||-||  2 [R] COG0400 Predicted esterase
--|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  2 [H] COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase
-------------||---||----------------------|||||-||--|--|---|||||||  2 [H] COG0408 Coproporphyrinogen III oxidase
--|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-|||||||||||||||  2 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation
|||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division
|||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--|||||||||||  2 [O] COG0450 Peroxiredoxin
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family)
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|  2 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases
--|----------||-||--||||||----|-----||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase
|||||||||||||||||||||||||-||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication
|||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||||  2 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase
|||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-||||||||||||||  2 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA
-------------||-||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain
||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--||||||||  2 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0486 Predicted GTPase
||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning
--|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||||  2 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase
----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  2 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase)
|||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||  2 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases
|||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG0517 FOG: CBS domain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0527 Aspartokinases
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [F] COG0528 Uridylate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0536 Predicted GTPase
|||||||||-|||||||-||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases
-------------||-||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0539 Ribosomal protein S1
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase
|------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||  2 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit
|||-||||||-|-||-||--|---|-|||-||-|-|||----|||||-||---|||---|----||  2 [HC] COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0550 Topoisomerase IA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex
|-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase
--||--|||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases
--------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [J] COG0566 rRNA methylases
-------------||------|||--||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  2 [C] COG0567 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, and related enzymes
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease
|||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--||||||||||||||  2 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)
|||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0582 Integrase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit
|||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---|||||||  2 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins
--|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---|||||||  2 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog)
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2 [J] COG0594 RNase P protein component
||||--||-|-------|||||----||||||||||||||||--------------||||||||||  2 [R] COG0595 Predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase
||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes
|||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase
|-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [P] COG0605 Superoxide dismutase
|-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-||||  2 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase
||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease
----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--|||||||||||  2 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases
-------------|||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase
----------------|-||-|||---|||-|--||||----|||-||-|||-|||||||||||||  2 [I] COG0623 Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH)
-|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases
-------------||---||------------||--------|||||-||||||||---|||||||  2 [O] COG0625 Glutathione S-transferase
||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0628 Predicted permease
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein
-||||||||-|||---------------------------------------|---||-|||||||  2 [NU] COG0630 Type IV secretory pathway, VirB11 components, and related ATPases involved in archaeal flagella biosynthesis
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit
---|---------||||-||-|||--|---------------||||||||||-|||---|||||||  2 [C] COG0633 Ferredoxin
----------------|||||||||||||-|||||||||---||||||||||||||||||||||||  2 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases
||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K
---|--|||--||||-||--|-----|||--|||||||----|||||--|--------||||||||  2 [G] COG0647 Predicted sugar phosphatases of the HAD superfamily
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)
-------------||---||-|----|||-----|-||----|||||-||-|||||---|||||||  2 [HC] COG0654 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases
|||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--||||||||  2 [R] COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily
|||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--||||||||||||||  2 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel
-------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-|||||||||||||  2 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH
||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-|||||||  2 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase
--------|---|||--||||---|---------|||-----||||---|-|-||---|--|--||  2 [P] COG0672 High-affinity Fe2+/Pb2+ permease
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG0681 Signal peptidase I
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase
||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-||  2 [I] COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase
|---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---|||||||  2 [J] COG0689 RNase PH
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0691 tmRNA-binding protein
---|----|----||---||--||----------||||----|||||||||||---||||||||||  2 [O] COG0694 Thioredoxin-like proteins and domains
|-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---|||||||  2 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins
|-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  2 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily
----------------|||-|-----|||||-|||||||||||--||----|----|||-|||-||  2 [G] COG0698 Ribose 5-phosphate isomerase RpiB
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC
--|------|-|----||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase
-------------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein)
--||||------|---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0713 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)
|||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-|||||||||||||||||  2 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase
-----------------|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase
||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---|||||||||||||  2 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit
--||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--||||||||||||||  2 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein
----------------|||||||||||||||-----------||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
-------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||  2 [I] COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases
-----------------|||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase
-------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit
--|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [O] COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component
-------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-|||||||  2 [F] COG0756 dUTPase
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0763 Lipid A disaccharide synthetase
----------------||||||||------||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  2 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  2 [Q] COG0767 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase
|||------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase
----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------|-|---||||-------------||-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0781 Transcription termination factor
-----------------|---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0782 Transcription elongation factor
---|--------------||||--|||----|||||||-|--|||||-|||||--|||||-|-|||  2 [P] COG0783 DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)
--------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0787 Alanine racemase
--|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators
----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0793 Periplasmic protease
|||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation
----------------|-||----||----|-----------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0797 Lipoproteins
----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [S] COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  2 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase
----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase
|-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-||  2 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin
--||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC
----------------||||||--||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing
----------------||||||---|----||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase)
|-|------|------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG0811 Biopolymer transport proteins
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase
----------------||||-|||||||||------------|||||-||||-|||||||||||||  2 [M] COG0815 Apolipoprotein N-acyltransferase
----------------||||||||--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis)
-----------------||||||||-||||------------|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit
--||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||  2 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation
--|-----|---------||--||------------------|||||-|||||--|||||||||||  2 [U] COG0823 Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system
----------------|-||--||||----|||||||||-||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0828 Ribosomal protein S21
--|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||||  2 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain
--||--|||-------||||-|--------|-----------|||||-||--|---||-|||||-|  2 [M] COG0836 Mannose-1-phosphate guanylyltransferase
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0838 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 3 (chain A)
--||||--|--||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0839 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J)
---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  2 [C] COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1
----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases
----------------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG0848 Biopolymer transport protein
---------|------||--||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [D] COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A
------------------||-|----|||-|---||||----||||||||||||||||||||||||  2 [P] COG0861 Membrane protein TerC, possibly involved in tellurium resistance
-|||---||--|----|-||------|||---|---||----|||||-||-||--|--||||||||  2 [M] COG1004 Predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG1005 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)
||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--||  2 [P] COG1006 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG1007 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N)
--||||----------|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG1008 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)
--||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--||||||||||||||  2 [CP] COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit
----------------||||-|-----||-|-----------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG1034 NADH dehydrogenase/NADH:ubiquinone oxidoreductase 75 kD subunit (chain G)
----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  2 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase
--||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---|||||||  2 [C] COG1048 Aconitase A
||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit
------------------||-|||--|----||||||-----||||||||--|--|---|||||||  2 [R] COG1054 Predicted sulfurtransferase
----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease
---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---|||||||  2 [C] COG1071 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, alpha subunit
--------------------|-||||-||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains)
-------------|||--|-----------------------||||||||||-|||--||||||||  2 [O] COG1076 DnaJ-domain-containing proteins 1
|---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----|||  2 [D] COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis
-|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-||||||  2 [MG] COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases
|-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-||||  2 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase
--------------------|-----|-----||--------------||-----|---||||-||  2 [R] COG1101 ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component
|-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  2 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  2 [G] COG1109 Phosphomannomutase
|-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  2 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  2 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  2 [Q] COG1127 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component
--|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-||||||  2 [GM] COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component
||||----|||||---|||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component
----------------||||||||||----------------|||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component
--|-----|-|-|--------|--------------------|||||-|||||------|||||||  2 [O] COG1138 Cytochrome c biogenesis factor
|||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)
||||||-|||||-----|||-|----|||||-----------|||-|-||--|--|||||||||||  2 [C] COG1146 Ferredoxin
----------------||--|||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG1158 Transcription termination factor
----------------||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG1159 GTPase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG1160 Predicted GTPases
---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--||||||||  2 [E] COG1171 Threonine dehydratase
--|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes
||||----||---||-----|-||-|-||||-----||-----------|--|||||||||||-||  2 [I] COG1183 Phosphatidylserine synthase
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)
-------------||-|||||||||||||||||-||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG1186 Protein chain release factor B
----------------||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases
--|-----|-------|||||----|||||||||-|||||----------------||||||||||  2 [J] COG1189 Predicted rRNA methylase
----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------|||||||  2 [L] COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)
-----------------|||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase
----------------||||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [LK] COG1200 RecG-like helicase
----------------||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains)
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1212 CMP-2-keto-3-deoxyoctulosonic acid synthetase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone
------------------||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [T] COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response
-------------||-|-||--||--||||------------|||||||||||-----||||||||  2 [P] COG1218 3'-Phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase
-------------|--||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit
----------------||-------|--------||||----|||||||||||--|||||||||||  2 [O] COG1220 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), ATPase subunit
||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-||||||||||||||  2 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component
||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---|||||||  2 [R] COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I
-||------|------|-------------------------|||||-||||||||--||||||||  2 [S] COG1238 Predicted membrane protein
--||---------||-|||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains
|||---||-||-|---|---|-----------|--|||----|||||-||||-||||||-----||  2 [I] COG1267 Phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins
|-||--|||--------||||||-|-|---||||||||---------------------||||-||  2 [R] COG1268 Uncharacterized conserved protein
--||||--|-------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--||||||||  2 [C] COG1271 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1
---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---|||||||  2 [K] COG1278 Cold shock proteins
------------------||-------|||------------|||||-||||-|||---|||||||  2 [C] COG1282 NAD/NADP transhydrogenase beta subunit
------------------------||-----|||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG1286 Uncharacterized membrane protein, required for colicin V production
---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--||||||||||||||  2 [C] COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex
--||------------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--||||||||  2 [C] COG1294 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2
--|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  2 [S] COG1295 Predicted membrane protein
|||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----|||||||  2 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases
----------------|-|||||||||||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG
||||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--||  2 [P] COG1320 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhG subunit
----------------------||-------|||-----|--|||||-||||||||---|||||||  2 [S] COG1322 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|-|-|||||||-|--|||-|-|-|------------------|||||-----|--|--------||  2 [P] COG1324 Uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations
---------------------|--||||||------||---------------------|||||||  2 [K] COG1329 Transcriptional regulators, similar to M. xanthus CarD
---|||||--|||---||||--|||||||||-------------------------|||-----||  2 [F] COG1351 Predicted alternative thymidylate synthase
------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---|||||||  2 [L] COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
||||||||||--|-----------||-----------------------------------|||||  2 [J] COG1384 Lysyl-tRNA synthetase (class I)
----------------||||||--||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  2 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------||---||-----------------------------|-----|--------||  2 [I] COG1398 Fatty-acid desaturase
-----------------|-|--||||-----|||||||----|||||-|||||--|--------||  2 [S] COG1426 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---|||||||  2 [S] COG1434 Uncharacterized conserved protein
----------------|-------||----------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1452 Organic solvent tolerance protein OstA
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  2 [Q] COG1463 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, periplasmic component
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit
-----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---|||||||  2 [G] COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases
||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--||||||||||||||  2 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators
-------------||------|-----||-------------|||||-||--||||---|||||||  2 [R] COG1485 Predicted ATPase
-||---|||-||------||-|-----||-----------------|---|-|--|---||-||-|  2 [R] COG1487 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain
---------------------|||------------||----|||||-||||||||||||||||||  2 [O] COG1495 Disulfide bond formation protein DsbB
----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--||||||||  2 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein
----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-|||||||  2 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1519 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase
||||--|||--------|---|---|-|||------|-----|||||-||--|--|-------|||  2 [S] COG1520 FOG: WD40-like repeat
---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---|||||||  2 [J] COG1530 Ribonucleases G and E
----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||||  2 [J] COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1)
----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein
--------------------|-||--||||------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1560 Lauroyl/myristoyl acyltransferase
||----|----------|||--------------------------------------------||  2 [P] COG1563 Predicted subunit of the Multisubunit Na+/H+ antiporter
----------------|-||--------------------------------||||||||||||||  2 [S] COG1565 Uncharacterized conserved protein
----------------|-----------------|-|-----|||||-|||--|||---|||||||  2 [V] COG1566 Multidrug resistance efflux pump
-----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit
--|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--|||||||||||||  2 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase
------------------||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||---|||||||  2 [M] COG1589 Cell division septal protein
---|--------|||-|-||-|----||||----||||-----------|--|--|---|||||||  2 [O] COG1612 Uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly
---|----|-||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  2 [C] COG1622 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2
----------------||--|---------|||-|---------------|||||-|||-----||  2 [S] COG1636 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1663 Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase
-|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-|||||||||||||  2 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins
-------------------|-||||||||||||||||||---|||||-||||||||||||||||||  2 [D] COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins
---------------------|||--||||------------|||||-||||||||---|||||||  2 [K] COG1678 Putative transcriptional regulator
--|---||--|-|-----||-|----||||||||||||----|||||--|--|--|---|||||||  2 [V] COG1680 Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins
--|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-||||||  2 [GM] COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component
--------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---|||||||  2 [M] COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase
|--------|--------||-------||||----|||----------|||--|||||||||||||  2 [S] COG1714 Predicted membrane protein/domain
-----------------|-|||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG1722 Exonuclease VII small subunit
-------------|||---|--||----------------------------------------||  2 [S] COG1723 Uncharacterized conserved protein
----------------|-------------------------|||||-||--||||---|||||||  2 [S] COG1729 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|-----||||----|-----||----||||||||||||||--||||||||  2 [T] COG1734 DnaK suppressor protein
-------------||||||-|---|--|||-|----||----|||-|-||--||||---|||||||  2 [R] COG1752 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily
------------------||-|---|||||----------------------|------|||||||  2 [R] COG1754 Uncharacterized C-terminal domain of topoisomerase IA
||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega
-------------------|------||||---|--------|||||-||--|------|||||||  2 [E] COG1770 Protease II
--------|--|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-|  2 [I] COG1788 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit
----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----|||  2 [M] COG1792 Cell shape-determining protein
---------------------|------------||||----|||||-||--||||---|||||||  2 [S] COG1806 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------||||-|||||||||----||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc)
--||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components
||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----||||||  2 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E
---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  2 [C] COG1845 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3
|-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---|||||||  2 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family
----------------||--|-||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG1862 Preprotein translocase subunit YajC
||||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--||  2 [P] COG1863 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit
|||----|||--|------|--||----|-------------|||||-|--|-------|--||||  2 [S] COG1872 Uncharacterized conserved protein
|-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---|||||||  2 [C] COG1894 NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit
|-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---|||||||  2 [C] COG1905 NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit
-|----------------------------------------||||||||||||||---|||||||  2 [U] COG1952 Preprotein translocase subunit SecB
-------------|||--------------------------||||||||||-|||--------||  2 [P] COG1965 Protein implicated in iron transport, frataxin homolog
------------------||-----------------------------|--||||||||||||||  2 [S] COG1981 Predicted membrane protein
---------------------|--|-|||||---|||||||||||||--|||||||----|--|||  2 [S] COG2001 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--|  2 [L] COG2003 DNA repair proteins
---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--||||||||||||||  2 [C] COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit
------------|--|-----|-|-|-||||---|||------------|---------||-|-||  2 [L] COG2094 3-methyladenine DNA glycosylase
||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--||  2 [P] COG2111 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhB subunit
----------------|---|-----------------------------------|||--|||||  2 [S] COG2121 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----||--|---|--------|-----|||------------|||||-||--||||---|||||||  2 [C] COG2142 Succinate dehydrogenase, hydrophobic anchor subunit
---|-------------|||-------||----||-------|||-|-|----------|-----|  2 [D] COG2161 Antitoxin of toxin-antitoxin stability system
---------------------------||--|---|||----|||||-||-----|---|||||-|  2 [F] COG2169 Adenosine deaminase
---------|-------|--------||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG2171 Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase
------------------------------------------|||||-|||||||-||||||--||  2 [R] COG2194 Predicted membrane-associated, metal-dependent hydrolase
----------------|-||-|---||||||----|||----|||||-||--|--|---|||||||  2 [T] COG2200 FOG: EAL domain
----------------|---|-||||-----------|----|||||-||-|||||||||||||||  2 [T] COG2204 Response regulator containing CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains
--|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  2 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis
-------------||---||-|--------------------|||||-||-|||||---|||||||  2 [H] COG2227 2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4-benzoquinol methylase
|----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----|||||||  2 [P] COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit
----------------------||-------||-|-|-----|||||-||||------|-----||  2 [G] COG2271 Sugar phosphate permease
--|------------------|--------------------|||||-|||||------|||||||  2 [O] COG2332 Cytochrome c-type biogenesis protein CcmE
---|----|---|-----|--|---------------|----------||-|--------||--||  2 [R] COG2358 TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component
------------------||--------------|-|------------|-----|--||--|--|  2 [V] COG2602 Beta-lactamase class D
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits
---------------------|--------|-----------|||||-||||-|||----|---||  2 [R] COG2823 Predicted periplasmic or secreted lipoprotein
----------------||---|||||----------------|||||-||||-|||-------|||  2 [M] COG2825 Outer membrane protein
-|||----|-------|----|--||----|-----||----|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG2834 Outer membrane lipoprotein-sorting protein
----------|-----|----|----|---------------------||-|-|||--||||||||  2 [S] COG2847 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------------------|||||-||||||||--|----|||  2 [M] COG2853 Surface lipoprotein
------------------------------------------|||||-||||||||--|----|||  2 [Q] COG2854 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, auxiliary component
-------------||-|-------------------||----------||--||||||||||||||  2 [C] COG2857 Cytochrome c1
-------------||---------------------------|||||-||-|||||---|||||||  2 [I] COG2867 Oligoketide cyclase/lipid transport protein
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG2877 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (KDO) 8-phosphate synthase
----------------|--||-||||-||-------------||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG2885 Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins
--|---------|-----------|-||||-------------------------|||||||||||  2 [L] COG2887 RecB family exonuclease
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors
-------------||------------|||------------------||--|------|||||||  2 [E] COG2902 NAD-specific glutamate dehydrogenase
------------------------------------------|||||-|||||--|--------||  2 [S] COG2904 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||---|||||||  2 [J] COG2913 Small protein A (tmRNA-binding)
------------------------------------------||||||||||-|||----||||||  2 [D] COG2917 Intracellular septation protein A
------------------------||||||-|||||||----||||||||||||||---|||||||  2 [D] COG2919 Septum formation initiator
------------------------------------------|||||-||||||||---|||||||  2 [L] COG2927 DNA polymerase III, chi subunit
-------------||---------------------------|||||-||||||||---|||||||  2 [S] COG2938 Uncharacterized conserved protein
-------------||----------------------------------|--|--|-------|||  2 [H] COG2941 Ubiquinone biosynthesis protein COQ7
---|----|----------------------------------------|--||||---|||||||  2 [R] COG2945 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily
----------------------------------------------------|--|||-|||||||  2 [U] COG2948 Type IV secretory pathway, VirB10 components
------------------------------------------|||||-||---|||----|||-||  2 [M] COG2982 Uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis
----------------|---|-||--|-----||--------------||-----|---||||-||  2 [R] COG2984 ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component
------------------------------------------|||||-|-||----|||-||||-|  2 [P] COG3004 Na+/H+ antiporter
--------------------|---------------------|||||-||||||||---|||||-|  2 [V] COG3023 Negative regulator of beta-lactamase expression
-----------------------|------|---||||----|||||-|||||||----|||||||  2 [S] COG3027 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||-||--|---|-|||||  2 [M] COG3047 Outer membrane protein W
-------------||----------------------------------|-----|---|||||||  2 [O] COG3175 Cytochrome oxidase assembly factor
-----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-|||||||  2 [M] COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes
-------------||-----------||||-------------------|-----|---|||||||  2 [S] COG3346 Uncharacterized conserved protein
-------------||--------------------------------------------|||||||  2 [C] COG3474 Cytochrome c2
--------------------------|------------------|---|-----|---|||||||  2 [Q] COG3485 Protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit
----------------|---|--------------------------------------|||||||  2 [S] COG3494 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|----------|---------------|-----|--|||-||-|-||  2 [U] COG3505 Type IV secretory pathway, VirD4 components
-------------------------------------------------|---------|||||||  2 [R] COG3577 Predicted aspartyl protease
-------------------|----------------|-----------|---------------||  2 [R] COG3621 Patatin
----------------------------------------------------|-------|--|||  2 [M] COG3660 Predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerase
-----------------------------------------------------|||-------|||  2 [S] COG3671 Predicted membrane protein
-----------------|||-----|-----------|-----------|--------||||||||  2 [T] COG3706 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain
-----------------------------------------------------------|||||||  2 [S] COG3750 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------------------------------------------------|||||||  2 [C] COG3761 NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit
-----------------------------------------------------------|||||||  2 [S] COG3807 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------------------------------------------------|||||||  2 [S] COG3814 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------------------------------------------------|||||||  2 [S] COG3820 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------------------------------------------------|||||||  2 [S] COG3827 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------------------------------------------|--|---||-||||  2 [U] COG3838 Type IV secretory pathway, VirB2 components (pilins)
----------------|-------------------------||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG4105 DNA uptake lipoprotein
------------------||-------||------------------------|------|----|  2 [D] COG4118 Antitoxin of toxin-antitoxin stability system
--------------------|-----|-----||--------------||-----|---||||-||  2 [R] COG4120 ABC-type uncharacterized transport system, permease component
------------------------------------------|||||-|||||------|||||||  2 [O] COG4133 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, ATPase component
------------------------------------------------||-----|---|||||||  2 [S] COG4395 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------------------------------|---||||-||  2 [M] COG4520 Surface antigen
----------------------------------|-------|||||-||||---|----||||||  2 [P] COG4536 Putative Mg2+ and Co2+ transporter CorB
--|-------------|---||--||----|-----------||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG4591 ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component
----------------|----------------------------|---|---------||-||||  2 [R] COG4618 ABC-type protease/lipase transport system, ATPase and permease components
-----------------------------------------------------------|||||||  2 [S] COG4765 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---|----------------------||||-------------------|-----|---|||||||  2 [I] COG4770 Acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit
-------------||-||||||||||----------------||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87
---|--|||--|-||--|--||----||||------||-----------|-----|---|||||||  2 [I] COG4799 Acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)
--------------------|---|-|||||---||||----|||||-||||||||---|||||||  2 [L] COG4974 Site-specific recombinase XerD
----------------|------------------------------------|||---|||||||  2 [T] COG5000 Signal transduction histidine kinase involved in nitrogen fixation and metabolism regulation
----------------|-------||----------------|||||-||||||||---|||||||  2 [M] COG5009 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein
------------------|--------------------------------------------|-|  2 [S] COG5304 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------------------------------------------------|||||||  2 [S] COG5336 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|---------------------------------||---------||  2 [S] COG5346 Predicted membrane protein
-----------------------------------------------------------|||||||  2 [S] COG5375 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------||-------|--------||||----|||||||||||--|||||||||||  2 [O] COG5405 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), peptidase subunit
-----------------------------------|-|--------------|------------|  2 [S] COG5410 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------------------------|---|-----|---|--|--|  2 [S] COG5430 Uncharacterized secreted protein
-----------------------------------------------------------||||-||  2 [S] COG5462 Predicted secreted (periplasmic) protein
----------------------------------------------------|-------||||||  2 [S] COG5508 Uncharacterized conserved small protein
-------------||------------------------------------------------|||  2 [S] COG5590 Uncharacterized conserved protein
-----------------------------------------------------------||-|-||  2 [N] COG5622 Protein required for attachment to host cells
||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-|  1 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)
--|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-|  1 [H] COG0262 Dihydrofolate reductase
------------------||-|----||||-||||||||||||||||-||||||||---|||||-|  1 [L] COG0266 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase
||||---||----------|-------||--|||||--|||-|||-|-|||||||||||-||-|-|  1 [V] COG0286 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit
-|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------|  1 [L] COG0338 Site-specific DNA methylase
|||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-|  1 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-|  1 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase
||||||--||-||-----||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-|  1 [J] COG0565 rRNA methylase
-||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-|  1 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters
||||---||----------|-----------||-||--|||-------||||||--|||-||-|-|  1 [V] COG0610 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases
|||||||||||||||||--------------|--|||----------------------------|  1 [MI] COG0615 Cytidylyltransferase
|||-----||-|-||-|---||-----||||--|||||----||-||-||--|--|---|||-|-|  1 [R] COG0655 Multimeric flavodoxin WrbA
----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-|  1 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein
||||-|-||----------|-------||--|||||--|||||||-|-|||||---|||-||-|-|  1 [V] COG0732 Restriction endonuclease S subunits
----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-|  1 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake
----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||-  1 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein
||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-|  1 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases
|||---|||||||---|-||-|----||||||-|-|||-------|--||-----|---|||||-|  1 [F] COG1051 ADP-ribose pyrophosphatase
|-|-||||||||-||||-||------|---|||-||||----|||||--|-----|---|||||-|  1 [M] COG1215 Glycosyltransferases, probably involved in cell wall biogenesis
--||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-|  1 [O] COG1225 Peroxiredoxin
--------------------|-----|||-|---|-||----|||||-||-|---|||-|-|---|  1 [R] COG1279 Lysine efflux permease
||||--|||-------|---||----|---|-------||--|||||-||--||||||||||||-|  1 [R] COG1451 Predicted metal-dependent hydrolase
---|||||--|||||---|-||------------|-||-----------|--|------|---|-|  1 [E] COG1506 Dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases
-||-|-|||||||----||-|------||-|-----||-----------|-----|---|||||-|  1 [L] COG1533 DNA repair photolyase
|-|||---|--------|||-------------|--------||||--------|--|--|-||-|  1 [S] COG1598 Uncharacterized conserved protein
--|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-|  1 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase
|||---|||||||---||------------|---|-----------|---|--------||----|  1 [R] COG1708 Predicted nucleotidyltransferases
--|----------------|||----||||-||||||------||-|--||-||||---|||||-|  1 [I] COG1835 Predicted acyltransferases
|-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--|  1 [R] COG1881 Phospholipid-binding protein
-----------|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-|  1 [I] COG2057 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit
--|-------------------||------|-----||----------------------|-|-|-  1 [S] COG2155 Uncharacterized conserved protein
|-||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|-  1 [P] COG2212 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit
||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--|  1 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold
---|--||--|||-------||-------------|||-------|--|-------------|--|  1 [E] COG2317 Zn-dependent carboxypeptidase
-------------------|-|-----||-|---||||----|||-------|||----|||---|  1 [T] COG2337 Growth inhibitor
-------------------|----------------------|||-|-|---||||---||----|  1 [K] COG2944 Predicted transcriptional regulator
------------------------------------------|||||-||||||||---|||||-|  1 [R] COG2961 Protein involved in catabolism of external DNA
----------------|---|-----|-----||--------|||||-||||-|||--|----|-|  1 [S] COG3022 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------|-----------------------|||||-||-||-||---|||||-|  1 [C] COG3038 Cytochrome B561
------------------------------|--|||------|||||-||||-|-|----|-||-|  1 [K] COG3070 Regulator of competence-specific genes
--------------------|-----------||--------|||||-|-|-|------||----|  1 [L] COG3077 DNA-damage-inducible protein J
------------------|--|--------------------|||||--|--|--|---||-|--|  1 [NU] COG3121 P pilus assembly protein, chaperone PapD
--||-----------------|-----||--|---|||-----------|-----|---||-||-|  1 [R] COG3173 Predicted aminoglycoside phosphotransferase
--||------------|--||-----|-----|-||-------|||---|-|-|||||-||-|--|  1 [S] COG3177 Uncharacterized conserved protein
------------------|-----------------------|||||--|--|--|---|--|--|  1 [NU] COG3188 P pilus assembly protein, porin PapC
-------------------------------|----------|||||-|------|--------|-  1 [S] COG3274 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------------------------|----||-||-||-|-||--|  1 [M] COG3306 Glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis
----------------------------------------------------|------|||||-|  1 [U] COG3702 Type IV secretory pathway, VirB3 components
-------------------|----------|-----------|||||-----|--|------||-|  1 [R] COG3772 Phage-related lysozyme (muraminidase)
-----------|------||---------------------------------|||-------|-|  1 [R] COG3975 Predicted protease with the C-terminal PDZ domain
-|-----------------|-------------|----||-------------------------|  1 [S] COG4095 Uncharacterized conserved protein
-------------------|-------||----||------------------------|-----|  1 [S] COG4115 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|-|---------------------||-------|--|----|----|  1 [S] COG4226 Uncharacterized protein encoded in hypervariable junctions of pilus gene clusters
-------------||-------||-----------------------------------------|  1 [S] COG4285 Uncharacterized conserved protein
---------------------|-----------------------------------------|-|  1 [S] COG4374 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------------------------------------------||||---|||-|-|  1 [S] COG4391 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------------|-------------------------|-|  1 [G] COG4421 Capsular polysaccharide biosynthesis protein
-------------------|----------------------|||-|------------------|  1 [R] COG4572 Putative cation transport regulator
------------------------------------------|||||--|---------------|  1 [R] COG4574 Serine protease inhibitor ecotin
--|-----------------|-----|----|---|------------------------|-|--|  1 [L] COG4912 Predicted DNA alkylation repair enzyme
-------------------||---------------------|||-|----||------||-||-|  1 [M] COG4953 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC
--|-----------------|---------|----------------------------------|  1 [S] COG4997 Uncharacterized conserved protein
-------------|||------------------------------------------------|-  1 [R] COG5307 SEC7 domain proteins
-----------------------------------------------------------||||--|  1 [R] COG5342 Invasion protein B, involved in pathogenesis
--|--------------------------------|--------------------------|--|  1 [R] COG5362 Phage-related terminase
----|------|----------||-------------------------|----------|----|  1 [H] COG5424 Pyrroloquinoline quinone (Coenzyme PQQ) biosynthesis protein C
-----------------------------------------------------------|-|-|-|  1 [S] COG5448 Uncharacterized conserved protein
-----------------------------------------------------------|-|-|-|  1 [S] COG5449 Uncharacterized conserved protein
------------------||----------------------|||||------------------|  1 [S] COG5464 Uncharacterized conserved protein
-------------------------------------------|--|--------|-----|-|-|  1 [S] COG5510 Predicted small secreted protein
------------------------------------------------|-||-------------|  1 [R] COG5595 Zn-ribbon-containing, possibly nucleic-acid-binding protein
----------------|-------------------------------------------|----|  1 [R] COG5611 Predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain
-------------------------------------|-------------------------|-|  1 [R] COG5628 Predicted acetyltransferase