| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ |||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 15 [R] COG0457 FOG: TPR repeat ----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-||||||| 8 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 6 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family) ---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 6 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes ---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|--- 6 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase |||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins |-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 6 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components --||---------||-|||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||| 6 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains --|----------------|---|-----------------------------------|------ 6 [S] COG5563 Predicted integral membrane proteins containing uncharacterized repeats |||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases -----------------|--|-|||||||-||-||||-||--|||||-||||---|||-||||--- 5 [E] COG4166 ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 4 [C] COG0022 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control ---|||||---||||-||||--||--|----|||||||-||||||||-||---------------- 4 [H] COG0095 Lipoate-protein ligase A --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|--- 4 [G] COG0205 6-phosphofructokinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A) --|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||--- 4 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component -|-----------||----|-|||-|-||-||||||||-|--|||||||||||||---|||||--- 4 [L] COG0507 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member ||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---||||||| 4 [E] COG0531 Amino acid transporters |------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||| 4 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit --||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|----- 4 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family |-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific |||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 4 [L] COG0582 Integrase ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||--- 4 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components -------------|||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase ----------------|||||||||||||-|||||||||---|||||||||||||||||||||||| 4 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases |-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 4 [O] COG0719 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases --|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||--- 4 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2 ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein -----------------|||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 4 [R] COG0795 Predicted permeases |-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-|| 4 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin -------------|||------||--|---------------|||||-||||-||-|||------- 4 [E] COG0814 Amino acid permeases --|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-||||||||||||| 4 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain ----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases ||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||------- 4 [HR] COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 4 [C] COG1071 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, alpha subunit --||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||-- 4 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily --|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-||||||||||||| 4 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 4 [G] COG1109 Phosphomannomutase --|---||------------|||||-|-----|||-||----|||-|-||||-||-|||-||---- 4 [E] COG1115 Na+/alanine symporter |-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 4 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 4 [NU] COG1157 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||--- 4 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components ||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---||||||| 4 [R] COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I --||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-|||| 4 [C] COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters -----------------||||||||--||-|---||||----------||---------||--|-- 4 [T] COG1366 Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor) ----------------|----|||-||||-||--||||-------|--||||-------------- 4 [M] COG1388 FOG: LysM repeat |-||---------|||--||--||||--------|-||----||-----|------------|--- 4 [C] COG1413 FOG: HEAT repeat ----------------|---|-||------------------|||||-||--|--|--|---||-- 4 [NU] COG1450 Type II secretory pathway, component PulD --------------------|-|||||---||||||||-||||||||-||||-|||---|||||-- 4 [GT] COG1762 Phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain (Ntr-type) ----------------||||||||||-|||||||-|||------------------|||------- 4 [R] COG1837 Predicted RNA-binding protein (contains KH domain) -||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||-- 4 [U] COG2095 Multiple antibiotic transporter --------------------|-||------------|--------||--|---||---|------- 4 [S] COG2849 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------|------||----------------------------|-----------|| 4 [C] COG3202 ATP/ADP translocase -------------|||------||------------------------------------------ 4 [B] COG5531 SWIB-domain-containing proteins implicated in chromatin remodeling -|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes -------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-||||||||||||| 3 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH --|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||-- 3 [F] COG0775 Nucleoside phosphorylase --||----|-|-|----|--||||-||-------|-|-----|||||-||||-||----||||--- 3 [S] COG1738 Uncharacterized conserved protein ----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----||| 3 [M] COG1792 Cell shape-determining protein ---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--|||||||||||||| 3 [C] COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit ||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||-- 2 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||| 2 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase -------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0021 Transketolase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation) -|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase ||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--|||||||| 2 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases ||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 2 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0048 Ribosomal protein S12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0049 Ribosomal protein S7 ---------|---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0051 Ribosomal protein S10 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0052 Ribosomal protein S2 ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase -||---||--||-|--|-||||||--|||-||||--||----|||||-||||-------||-|--- 2 [G] COG0058 Glucan phosphorylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase ||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---||||||||||||| 2 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0073 EMAP domain ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0080 Ribosomal protein L11 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0081 Ribosomal protein L1 ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0082 Chorismate synthase |||---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0084 Mg-dependent DNase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0087 Ribosomal protein L3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0088 Ribosomal protein L4 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0089 Ribosomal protein L23 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0090 Ribosomal protein L2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0091 Ribosomal protein L22 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0092 Ribosomal protein S3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0093 Ribosomal protein L14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0094 Ribosomal protein L5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0096 Ribosomal protein S8 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0098 Ribosomal protein S5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0099 Ribosomal protein S13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0100 Ribosomal protein S11 |||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0102 Ribosomal protein L13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0103 Ribosomal protein S9 |||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase ||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-| 2 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||||| 2 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase --||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [C] COG0114 Fumarase -------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase ||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||-- 2 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0125 Thymidylate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--|||||||| 2 [J] COG0130 Pseudouridine synthase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase -|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0148 Enolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase ||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---||||||||||||| 2 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 2 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0164 Ribonuclease HII -|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase -|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||-- 2 [G] COG0176 Transaldolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-||||||||||||||| 2 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0185 Ribosomal protein S19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0186 Ribosomal protein S17 --||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||| 2 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase -------------|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0194 Guanylate kinase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0195 Transcription elongation factor -------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0196 FAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0198 Ribosomal protein L24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0199 Ribosomal protein S14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0200 Ribosomal protein L15 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0203 Ribosomal protein L17 ---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-||| 2 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit |-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0211 Ribosomal protein L27 |--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-|||||||||||||||||| 2 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase --|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0216 Protein chain release factor A -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein ------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||-- 2 [J] COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class) -------------||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase |-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase -------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0227 Ribosomal protein L28 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0228 Ribosomal protein S16 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0230 Ribosomal protein L34 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0233 Ribosome recycling factor --|----------||-||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10) --|----------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0238 Ribosomal protein S18 |-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 2 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0244 Ribosomal protein L10 ----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||-- 2 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase --||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---||||||| 2 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family) |||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0250 Transcription antiterminator ||------||------|||||-||--|||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0254 Ribosomal protein L31 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0255 Ribosomal protein L29 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0256 Ribosomal protein L18 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0257 Ribosomal protein L36 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) ------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-|||||||||||| 2 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0261 Ribosomal protein L21 --|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-| 2 [H] COG0262 Dihydrofolate reductase --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts |-||------||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0267 Ribosomal protein L33 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0268 Ribosomal protein S20 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis ----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase) ---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---||||||| 2 [F] COG0283 Cytidylate kinase |||-----||------||||--||--|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3) -------------|--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0291 Ribosomal protein L35 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0292 Ribosomal protein L20 |||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 2 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes --|--------|-|--|-||||||--|||----|--|-----|||||-||||---|---||-|--- 2 [G] COG0296 1,4-alpha-glucan branching enzyme -|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|--- 2 [G] COG0297 Glycogen synthase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0305 Replicative DNA helicase ||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|--- 2 [P] COG0306 Phosphate/sulphate permeases ---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0313 Predicted methyltransferases |-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase ---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 2 [H] COG0320 Lipoate synthase |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex --||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---||||||| 2 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase) -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase ||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||------- 2 [S] COG0327 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase ----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0333 Ribosomal protein L32 --|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|-- 2 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0335 Ribosomal protein L19 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase ----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase ||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD |||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase ||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-| 2 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase ----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type) --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0359 Ribosomal protein L9 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0360 Ribosomal protein S6 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1) -------------|||-|||--||||||||-|-||||-----|||||||-||-||----||||--- 2 [G] COG0362 6-phosphogluconate dehydrogenase -------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||-- 2 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase -------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||-- 2 [G] COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase -------------|||--||--||----------|-||----||||||||--|||----|-|-|-- 2 [P] COG0369 Sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein) ||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||------- 2 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase |||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-||||||||||||||| 2 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 2 [O] COG0396 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, ATPase component -------------||---||-|||-------|--||||----|||----|--|------||||-|| 2 [R] COG0400 Predicted esterase --|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 2 [H] COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase ----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||-- 2 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme --|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-||||||||||||||| 2 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation |||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase |||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [I] COG0439 Biotin carboxylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0443 Molecular chaperone -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division -----------------|||||||--||||||-|--||----|||||-|-||-------||-|--- 2 [G] COG0448 ADP-glucose pyrophosphorylase ||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains |||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--||||||||||| 2 [O] COG0450 Peroxiredoxin |||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 2 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases --|----------||-||--||||||----|-----|||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase -|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||-- 2 [G] COG0469 Pyruvate kinase |||||||||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication ||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||---- 2 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters ||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-|| 2 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 2 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA -------------||-||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0486 Predicted GTPase -------------|||--||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains ||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0492 Thioredoxin reductase |-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase ||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||-- 2 [R] COG0496 Predicted acid phosphatase ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase) ---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||-- 2 [E] COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding) |||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein ||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase |||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [R] COG0517 FOG: CBS domain |-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||-- 2 [E] COG0520 Selenocysteine lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0527 Aspartokinases |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0528 Uridylate kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0536 Predicted GTPase |||||||||-|||||||-||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases -------------||-||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0539 Ribosomal protein S1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor) -------------||---||-||||-|---------------||||||||||||||-------|-- 2 [O] COG0545 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0550 Topoisomerase IA |||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||------- 2 [L] COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex ---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [K] COG0557 Exoribonuclease R |-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|--- 2 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily --||--|||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases --------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [J] COG0566 rRNA methylases -------------||------|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 2 [C] COG0567 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, and related enzymes ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein) ||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 2 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit --|----------||-----|-||||||||||||||------||||||--||||||----||||-- 2 [G] COG0588 Phosphoglycerate mutase 1 --|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---||||||| 2 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog) -----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0594 RNase P protein component ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase -||-----||-------|||||||--|---|--||-||----||||---|||---|---|||||-- 2 [P] COG0600 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component |-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [P] COG0605 Superoxide dismutase ||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease |||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----|||||||||||||||||||||||| 2 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class) |||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||-- 2 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent) |||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase ----------------|-||-|||---|||-|--||||----|||-||-|||-||||||||||||| 2 [I] COG0623 Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein -----|-------||-|-||-|||--||||||||||||||||-------|--|--||--|--|--- 2 [T] COG0631 Serine/threonine protein phosphatase -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit ---|---------||||-||-|||--|---------------||||||||||-|||---||||||| 2 [C] COG0633 Ferredoxin ||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K --|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 2 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase |-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase ||||||||--||||||||----||---||||---|||||||||||||||----------------- 2 [L] COG0648 Endonuclease IV ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase) ----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-| 2 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein --|----------||||-||--||--||||-|---|||----|||-|-||-|---|||-||-|--- 2 [P] COG0659 Sulfate permease and related transporters (MFS superfamily) -------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases --|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating) ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0681 Signal peptidase I ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase ||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-|| 2 [I] COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0691 tmRNA-binding protein -------------|||----||||-|||||-||||||||||||||||||||||||||||||----- 2 [L] COG0692 Uracil DNA glycosylase ---|----|----||---||--||----------||||----|||||||||||---|||||||||| 2 [O] COG0694 Thioredoxin-like proteins and domains --|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0703 Shikimate kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC --|------|-|----||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase ||||||-|||||-||-|-----||-------||||||-----|||-|------||----------- 2 [E] COG0710 3-dehydroquinate dehydratase -||-----||---||--|||||||--|---|--||-||----||||--||||---|---|||||-- 2 [P] COG0715 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components |||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-||||||||||||||||| 2 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase -----------------|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---||||||||||||| 2 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit --|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||-- 2 [G] COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase ----------------|||||||||||||||-----------|||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor -|||--|||-------|---|-|||-|------|||||----------|-||-||-|||------- 2 [R] COG0733 Na+-dependent transporters of the SNF family -------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||| 2 [I] COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase) -----------------|||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase ----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|-- 2 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase ----------------||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains |||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1 ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit -------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-||||||| 2 [F] COG0756 dUTPase ----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||- 2 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 2 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein -----------------||||-||||||||||||||||----|||||-||||---||||||-||-- 2 [S] COG0762 Predicted integral membrane protein ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0763 Lipid A disaccharide synthetase ----------------||||||||------||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 2 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase |||------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase ----||----------||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0781 Transcription termination factor -----------------|---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0782 Transcription elongation factor ------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [M] COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins) ----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0793 Periplasmic protease |||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation ----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [S] COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 2 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 2 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase ----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II |-|------|------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG0811 Biopolymer transport proteins ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase ----------------||||-|||||||||------------|||||-||||-||||||||||||| 2 [M] COG0815 Apolipoprotein N-acyltransferase ----------------||||||||--|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis) -----------------||||||||-||||------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 2 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis --||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||| 2 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation --|-----|---------||--||------------------|||||-|||||--||||||||||| 2 [U] COG0823 Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit ----------------|-||--||||----|||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0828 Ribosomal protein S21 ----------------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG0848 Biopolymer transport protein ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A ----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [M] COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase -------------|||------||------------------|||||-||---------------- 2 [O] COG1025 Secreted/periplasmic Zn-dependent peptidases, insulinase-like -------------||------|||||----|----------------------------------- 2 [R] COG1026 Predicted Zn-dependent peptidases, insulinase-like --|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) ----------------|-----||-------||||||-||||------------------------ 2 [L] COG1039 Ribonuclease HIII ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase ||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit ------------------||-|||--|----||||||-----||||||||--|--|---||||||| 2 [R] COG1054 Predicted sulfurtransferase ----|||||-|||----||||-||---|||----||||----||||--||---|||--||--|--- 2 [P] COG1055 Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases ----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease --------------------|-||||-||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains) |---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----||| 2 [D] COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis --------------------||||-||---||||||||-|||||||||||||||||------||-- 2 [G] COG1080 Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria) -|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||--- 2 [R] COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases --------------------|-|||-|---|-|||-|-----|||||-||||-------------- 2 [E] COG1114 Branched-chain amino acid permeases -||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||-- 2 [P] COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component --|--|--------------|-||--------|-|--|||--|||||------------||||--- 2 [EP] COG1124 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 2 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component --||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components ||||----|||||---|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component ----------------||||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [R] COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component ----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||-- 2 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 2 [C] COG1155 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit A ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 2 [C] COG1156 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit B ----------------||--|||||||||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG1158 Transcription termination factor ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG1160 Predicted GTPases --||-------------|--||||||-----|||||||||||------|-------||||||||-- 2 [E] COG1164 Oligoendopeptidase F --|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes ||||----||---||-----|-||-|-||||-----||-----------|--|||||||||||-|| 2 [I] COG1183 Phosphatidylserine synthase -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase) -------------||-|||||||||||||||||-||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG1186 Protein chain release factor B ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases --|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||----- 2 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II) ----------------||||--|||--||-|---||||----|||||-||-----||||------- 2 [K] COG1191 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit ||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--|||||||||||||| 2 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning |--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase -----------------|||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase ------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||-- 2 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG1212 CMP-2-keto-3-deoxyoctulosonic acid synthetase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone -------------||-|-||--||--||||------------|||||||||||-----|||||||| 2 [P] COG1218 3'-Phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit --||--|-|-|--||-|----|||--||||----||||-------|---------|-------|-- 2 [H] COG1232 Protoporphyrinogen oxidase ||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||-- 2 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III ||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 2 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes --||----|-|||---||||--||--||||------------------------------------ 2 [S] COG1259 Uncharacterized conserved protein --|-----------|---||--||---||-------||----------||-|||||---|||||-- 2 [S] COG1262 Uncharacterized conserved protein |-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||-- 2 [R] COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 2 [C] COG1269 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit I --||||--|-------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 2 [C] COG1271 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1 ----||||---|----------|||-||||-------------------------|---------- 2 [C] COG1274 Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP) ---------|-------|--|-||-|----||||||||||||------|----------|||---- 2 [S] COG1284 Uncharacterized conserved protein --||------------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 2 [C] COG1294 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2 --|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 2 [S] COG1295 Predicted membrane protein ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 2 [NU] COG1298 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhA -----------------|--||||------||||||||---------------------------- 2 [S] COG1302 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|-|||||||||||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG -----------------|----||||----|-----||----||||||||-----||||---|--- 2 [NU] COG1317 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein |||||||||||||----|---||||-||||||||||||----|||-|-----|---------|--- 2 [K] COG1321 Mn-dependent transcriptional regulator ----------------------||-------|||-----|--|||||-||||||||---||||||| 2 [S] COG1322 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 2 [K] COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains ----------------------||-|-||-------------|||||||||||||----------- 2 [L] COG1330 Exonuclease V gamma subunit |-||||--|-|||---|--|-|||---||-|-----|------------------------||--- 2 [O] COG1331 Highly conserved protein containing a thioredoxin domain ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 2 [NU] COG1338 Flagellar biosynthesis pathway, component FliP ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 2 [C] COG1347 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrD ---|||||--|||---||||--|||||||||-------------------------|||-----|| 2 [F] COG1351 Predicted alternative thymidylate synthase ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 2 [NU] COG1377 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhB ------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---||||||| 2 [L] COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) |||||||||||-||||----||||||---------------------------------------- 2 [C] COG1390 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit E |||---|||--|-----|---|||------|---|||-----------||||---|---||-|--- 2 [P] COG1392 Phosphate transport regulator (distant homolog of PhoU) ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 2 [C] COG1394 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit D |-|-------|-----|--|-|||--||||||---|||----|------------||||-|-|--- 2 [R] COG1408 Predicted phosphohydrolases |-|---|||||-|||-|-||--||--||||||--|||-----|||||-||||---|---|||||-- 2 [R] COG1409 Predicted phosphohydrolases -----------------||||-||--||||||||||||||||----------|--|||||||||-- 2 [K] COG1420 Transcriptional regulator of heat shock gene -----------------|-|--||||-----|||||||----|||||-|||||--|--------|| 2 [S] COG1426 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----||--|-|-|---|----|||-------------|------------------|||------- 2 [R] COG1427 Predicted periplasmic solute-binding protein -------------||-----|-||------------------|||||-||||||||----|-|--- 2 [E] COG1448 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||-- 2 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit ||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--|||||||||||||| 2 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators --|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||-- 2 [H] COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis ||||----||------------||---|||--|--------------------------------- 2 [S] COG1478 Uncharacterized conserved protein ---------------------|||------------||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [O] COG1495 Disulfide bond formation protein DsbB ----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein ----------------|-----||||----|----|||----|||||-||--||||||||||||-- 2 [K] COG1508 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma54 homolog ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG1519 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase --|--------|-----||-||||--|||-|-||--||-|--|||||-||||---|---||-|--- 2 [G] COG1523 Type II secretory pathway, pullulanase PulA and related glycosidases ---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---||||||| 2 [J] COG1530 Ribonucleases G and E ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 2 [N] COG1536 Flagellar motor switch protein -------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase --------------------|-||--||||------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG1560 Lauroyl/myristoyl acyltransferase -----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit ----------------|----|||||||-||-------------------------|||------- 2 [R] COG1579 Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding ||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||--- 2 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase ---|||----|||--------|||--|-------||||----||||||||||-|||||||||||-- 2 [I] COG1607 Acyl-CoA hydrolase --|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||-- 2 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein -|||--||||------|-||-|||||----||||||||-|||------------------------ 2 [S] COG1624 Uncharacterized conserved protein ----------|-----|-||||||-||||--|||--------|||||-||||---|---------- 2 [G] COG1640 4-alpha-glucanotransferase ---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-|||||||||||||||||| 2 [O] COG1651 Protein-disulfide isomerase ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG1663 Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase ----------------------||||----|-----|--------|--||--|--||||----|-- 2 [M] COG1664 Integral membrane protein CcmA involved in cell shape determination -------------------|-||||||||||||||||||---|||||-|||||||||||||||||| 2 [D] COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins ---------------------|||--||||------------|||||-||||||||---||||||| 2 [K] COG1678 Putative transcriptional regulator --------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 2 [M] COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase --|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-| 2 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase ----------||-||---||-|||--|||||------|--------------|------------- 2 [T] COG1716 FOG: FHA domain -------------|||---|--||----------------------------------------|| 2 [S] COG1723 Uncharacterized conserved protein ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 2 [C] COG1726 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrA ----------------|-----||||----|-----||----||||||||||||||--|||||||| 2 [T] COG1734 DnaK suppressor protein ----------------------||||---------------------------------------- 2 [S] COG1747 Uncharacterized N-terminal domain of the transcription elongation factor GreA ---------------------|||------|----------------------------------- 2 [R] COG1768 Predicted phosphohydrolase ------------------||--||---------------------|--||||-||-------|--- 2 [C] COG1805 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrB ----------------||||-|||||||||----||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc) ||||--||||-||---|--|--||------------------|||||----|-------||-|--- 2 [G] COG1830 DhnA-type fructose-1,6-bisphosphate aldolase and related enzymes ----------------||--|-||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG1862 Preprotein translocase subunit YajC |||----|||--|------|--||----|-------------|||||-|--|-------|--|||| 2 [S] COG1872 Uncharacterized conserved protein -----------------|----||--||||------||----------||--|--|---------- 2 [T] COG1875 Predicted ATPase related to phosphate starvation-inducible protein PhoH |-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--| 2 [R] COG1881 Phospholipid-binding protein ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 2 [NU] COG1886 Flagellar motor switch/type III secretory pathway protein --------------------|||||||---||||||||||||||||||||||||||---|||||-- 2 [G] COG1925 Phosphotransferase system, HPr-related proteins ||||||||||------------||------------------------------------------ 2 [S] COG1945 Uncharacterized conserved protein ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis ----||--|-|||---|----|||-------------|------------------|||------- 2 [R] COG2107 Predicted periplasmic solute-binding protein --|-------------------||------|-----||----------------------|-|-|- 2 [S] COG2155 Uncharacterized conserved protein ----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||-- 2 [NU] COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG ------------------||-|||---||-------------|||||-|||||------|||||-- 2 [R] COG2166 SufE protein probably involved in Fe-S center assembly -----------------|||-|||---||-|---||||---------------------------- 2 [T] COG2172 Anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase) |-||----|-----|-||||-|||-||||||----|||----|||||-||--|--|--||||||-- 2 [T] COG2202 FOG: PAS/PAC domain ----------------|---|-||||-----------|----|||||-||-||||||||||||||| 2 [T] COG2204 Response regulator containing CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains -----------------||||-|||--||-|---||||----------||----------|-|--- 2 [TK] COG2208 Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 2 [C] COG2209 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrE |-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||-- 2 [P] COG2217 Cation transport ATPase --|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 2 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis |----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----||||||| 2 [P] COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain) -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit -|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 2 [R] COG2262 GTPases ------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase ----------------------||-------||-|-|-----|||||-||||------|-----|| 2 [G] COG2271 Sugar phosphate permease ------||--|||-|------|||-----------|-|-----------|-----|---|||||-- 2 [E] COG2355 Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase homolog ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 2 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits ----------------||---|||||----------------|||||-||||-|||-------||| 2 [M] COG2825 Outer membrane protein ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 2 [C] COG2869 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrC ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 2 [C] COG2871 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF ----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------ 2 [E] COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG2877 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (KDO) 8-phosphate synthase ----------------|--||-||||-||-------------|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG2885 Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors -------------------|--||------------------|||||||||||--|-------|-- 2 [S] COG2912 Uncharacterized conserved protein ---|---------------||-||-------------|-----------|--||||---||-|--- 2 [S] COG2928 Uncharacterized conserved protein --|----------|||------||----------------------------|--|------|--- 2 [R] COG2940 Proteins containing SET domain ----------------|---|-||--|-----||--------------||-----|---||||-|| 2 [R] COG2984 ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component ----------------------||------------||----||||||||-----|---------- 2 [N] COG3190 Flagellar biogenesis protein ----------------------||------------|-----|||-|-||---||----------- 2 [R] COG3318 Predicted metal-binding protein related to the C-terminal domain of SecA ----------------------||------|---||||---------------------------- 2 [E] COG3869 Arginine kinase ----------------------||------|-----||---------------------------- 2 [S] COG3876 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------||------|---||||---------------------------- 2 [S] COG3880 Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs ----------------------||----------------------------|------|--|--- 2 [S] COG3952 Predicted membrane protein ----------------------||------------------|||||-||||||||--|----|-- 2 [OC] COG4232 Thiol:disulfide interchange protein ----------------------||----------------------|------------|||||-- 2 [OC] COG4233 Uncharacterized protein predicted to be involved in C-type cytochrome biogenesis -------------|||------||-|--------|------------------------------- 2 [G] COG4284 UDP-glucose pyrophosphorylase -------------||-------||-----------------------------------------| 2 [S] COG4285 Uncharacterized conserved protein -------------|||------||-----------------------------------|------ 2 [S] COG4286 Uncharacterized conserved protein related to MYG1 family --|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||--- 2 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component ----------------------||-------------------||||--|-----|------|--- 2 [U] COG4669 Type III secretory pathway, lipoprotein EscJ -------------||-||||||||||----------------|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87 ----------------------||-------------------||||--|-----|------|--- 2 [U] COG4789 Type III secretory pathway, component EscV ----------------------||-------------------||||--|-----|------|--- 2 [U] COG4791 Type III secretory pathway, component EscT ----------------------||-------------------||||--|-----|------|--- 2 [U] COG4794 Type III secretory pathway, component EscS ----|------|----------||-------------------------|----------|----| 2 [H] COG5424 Pyrroloquinoline quinone (Coenzyme PQQ) biosynthesis protein C ----------------------||-----------------------------------|||||-- 2 [S] COG5465 Uncharacterized conserved protein -|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 1 [H] COG0132 Dethiobiotin synthetase ||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain ||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase ||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain -|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase |||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase |||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 1 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit |||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase ---|---------||--|||-|-|||----|||||||||-|||||||-|-||-------------- 1 [F] COG0572 Uridine kinase |-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-|| 1 [ER] COG0591 Na+/proline symporter -|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases ------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component ----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------||||||| 1 [L] COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway) |-||--|||--------||||||-|-|---||||||||---------------------||||-|| 1 [R] COG1268 Uncharacterized conserved protein |-|-|||||||-|--|||-|-|-|------------------|||||-----|--|--------|| 1 [P] COG1324 Uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations -----------------|---|-|--||||||||||||----|||||-|-||-------------- 1 [K] COG1438 Arginine repressor --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen -----------------||||--||-----|----|||---------------------------- 1 [R] COG1480 Predicted membrane-associated HD superfamily hydrolase ----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---||||||| 1 [J] COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1) ||--|||||||||||--|---||---|----|-----------------|------------||-- 1 [S] COG1814 Uncharacterized membrane protein ----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component ------------|--|-----|-|-|-||||---|||------------|---------||-|-|| 1 [L] COG2094 3-methyladenine DNA glycosylase ----------------------|-------------------|||||-|-|||------------- 1 [K] COG2973 Trp operon repressor -----------------------|------|---||||----|||||-|||||||----||||||| 1 [S] COG3027 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------|------------------------||-----|------||-- 1 [E] COG3186 Phenylalanine-4-hydroxylase
