| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ --|----------|||-|||||--------------------------|----------|||||-- 107 [R] COG2319 FOG: WD40 repeat ---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|--- 104 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 67 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily -------------|||--||----|-----------------------|-------||-------- 49 [R] COG0724 RNA-binding proteins (RRM domain) |||||||||||||||||-||-|----------------------------------------|--- 26 [R] COG1100 GTPase SAR1 and related small G proteins |||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 25 [R] COG0457 FOG: TPR repeat |||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||| 24 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases |||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 23 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases --||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|----- 20 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family --|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 20 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) ---|---------|||-|||-|--||----|---------|||||-|-||--|||-||||||||-- 17 [O] COG2214 DnaJ-class molecular chaperone |-||||||||||||||-------------------------------------------------- 15 [K] COG1958 Small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) homolog ||||||||||||||||-----------|||------------------------------------ 14 [O] COG0638 20S proteasome, alpha and beta subunits -------------|||-------------------------------------------------- 14 [O] COG5078 Ubiquitin-protein ligase |||-|--------||||-|||-----||||||||-||||||||||||--|----------|||--- 13 [P] COG0474 Cation transport ATPase ----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-|||| 13 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat -------------|||-------------------------------------------------- 13 [R] COG5210 GTPase-activating protein ||||||||||||||||--||-|----||||------||-----------|-----|--|||-|--- 12 [O] COG0464 ATPases of the AAA+ class |||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 12 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins -------------||---------------||--|||-----|||||--|-----|||-------- 12 [E] COG0833 Amino acid transporters -------------|||-------------------------------------------------- 12 [R] COG5048 FOG: Zn-finger --|-||----|--||--|||-|----|||-||||||||-|--|||||-||-----|---||-||-- 11 [G] COG0366 Glycosidases -|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||-- 11 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases ||||--||||---|||-------------------------------------------------- 11 [B] COG2036 Histones H3 and H4 -------------|||-------------------------------------------------- 10 [Z] COG5059 Kinesin-like protein -------------|||-------------------------------------------------- 10 [Z] COG5277 Actin and related proteins ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 9 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family) |||||||||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 9 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication ||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---||||||| 9 [E] COG0531 Amino acid transporters |-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 9 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family -------------|||-----|--|||---------------|||||-||||||||---|||||-- 9 [L] COG1643 HrpA-like helicases --|-||--|----||---||||----|||--|||||-|||--|||||-|||--|||---|||||-- 9 [L] COG2801 Transposase and inactivated derivatives -------------|||-------------------------------------------------- 9 [TDBLU] COG5032 Phosphatidylinositol kinase and protein kinases of the PI-3 kinase family -------------|||-------------------------------------------------- 9 [O] COG5272 Ubiquitin |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 8 [O] COG0443 Molecular chaperone |||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 8 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases --||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-|||||||||||||||||| 8 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) --|----------|||------||----------------------------|--|------|--- 8 [R] COG2940 Proteins containing SET domain -------------|||-------------------------------------------------- 8 [BK] COG5076 Transcription factor involved in chromatin remodeling, contains bromodomain -------------|||---|---------------------------------------------- 8 [TZDR] COG5126 Ca2+-binding protein (EF-Hand superfamily) --|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||-- 7 [G] COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase |-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 7 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2 -----|-------||-|-||-|||--||||||||||||||||-------|--|--||--|--|--- 7 [T] COG0631 Serine/threonine protein phosphatase ---|||||--||||||-||-------||||||||||||----|||||--|-----|---|||||-- 7 [R] COG0656 Aldo/keto reductases, related to diketogulonate reductase ---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||-- 7 [C] COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases) ||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-| 7 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases -------------||----|------||||-||||||-----|||||-||-----|--||-||--- 7 [Q] COG1020 Non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins --||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 7 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 7 [L] COG1241 Predicted ATPase involved in replication control, Cdc46/Mcm family --|----------|||---|----------|-|--|------|||||--|-----|---------- 7 [S] COG4886 Leucine-rich repeat (LRR) protein -------------|||-------------------------------------------------- 7 [DZ] COG5019 Septin family protein -------------|||-------------------------------------------------- 7 [O] COG5021 Ubiquitin-protein ligase -------------|||-------------------------------------------------- 7 [J] COG5099 RNA-binding protein of the Puf family, translational repressor -------------|||-------------------------------------------------- 7 [UR] COG5391 Phox homology (PX) domain protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases) |-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes |||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [R] COG0517 FOG: CBS domain --||||----||-||-|--|-|----||||-|--||||----|||||-||-||--|---|||||-- 6 [CR] COG0604 NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductases -||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||-- 6 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase |-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily -------------|||-----|--------------------|||||-||||-|||||||||||-- 6 [R] COG0790 FOG: TPR repeat, SEL1 subfamily |||||-||||-|-||||||-|------||||---|---|||||||-|--|--|---|--------| 6 [L] COG1112 Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits -||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||-- 6 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases ||||--||||-|||||-------------------------------------------------- 6 [O] COG1222 ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit -|--|-|||----||-----------|||--||||-------|||-|-|-||-|------------ 6 [P] COG1275 Tellurite resistance protein and related permeases ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 6 [J] COG2058 Ribosomal protein L12E/L44/L45/RPP1/RPP2 -------------|||-------------------------------------------------- 6 [G] COG5020 Mannosyltransferase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 6 [J] COG5256 Translation elongation factor EF-1alpha (GTPase) -------------|||-------------------------------------------------- 6 [L] COG5260 DNA polymerase sigma -------------|||-------------------------------------------------- 6 [CI] COG5274 Cytochrome b involved in lipid metabolism -------------|||-------------------------------------------------- 6 [U] COG5347 GTPase-activating protein that regulates ARFs (ADP-ribosylation factors), involved in ARF-mediated vesicular transport |||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||--- 5 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family --||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---||||||| 5 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family) -------------|||--||--||----------|-||----||||||||--|||----|-|-|-- 5 [P] COG0369 Sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein) |---||----|--|||--|-------||||------------|||-|--------|----|-|--- 5 [G] COG0380 Trehalose-6-phosphate synthase |-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||-- 5 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase -------------|||--||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 5 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains ---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 5 [K] COG0557 Exoribonuclease R -------------||---||------------||--------|||||-||||||||---||||||| 5 [O] COG0625 Glutathione S-transferase --|--|--|--|-||--|||-|--|-|||||||-||-|----|||||-||--|--|---||-||-- 5 [I] COG0657 Esterase/lipase --|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||-- 5 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating) |-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||-- 5 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins -------------|||--||-|-----||-----|-||----|||----|-----||||------- 5 [R] COG0699 Predicted GTPases (dynamin-related) |-||--|||----|||-|||-|--||-||-|----|||----|||||-|||||--|||||||||-- 5 [T] COG0784 FOG: CheY-like receiver -||---||-|||||||-||||----|----||||||||||||------|----||----------- 5 [R] COG1161 Predicted GTPases |-|||||||||||||||-||-|-----||--------------||||--|-----|---------- 5 [R] COG1310 Predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily ||||||||||||||||-|--|---------||||||||---------------------------- 5 [J] COG1358 Ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a) -------------||||||-|---|--|||-|----||----|||-|-||--||||---||||||| 5 [R] COG1752 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily -------------|||-------------------------------------------------- 5 [Z] COG5022 Myosin heavy chain -------------|||-------------------------------------------------- 5 [D] COG5024 Cyclin -------------|||-------------------------------------------------- 5 [R] COG5084 Cleavage and polyadenylation specificity factor (CPSF) Clipper subunit and related makorin family Zn-finger proteins -------------|||-------------------------------------------------- 5 [R] COG5273 Uncharacterized protein containing DHHC-type Zn finger -------------|||------------------------------------------------|- 5 [R] COG5307 SEC7 domain proteins -------------|||-------------------------------------------------- 5 [DKL] COG5333 Cdk activating kinase (CAK)/RNA polymerase II transcription initiation/nucleotide excision repair factor TFIIH/TFIIK, cyclin H subunit ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase |--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||-- 4 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase ||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase |||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 4 [G] COG0061 Predicted sugar kinase |||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0102 Ribosomal protein L13 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase -|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 4 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase ||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--|||||| 4 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase ||||||||||||||||---|----------------------|||||-||---------------- 4 [L] COG0417 DNA polymerase elongation subunit (family B) ||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [M] COG0438 Glycosyltransferase ||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases ||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 4 [R] COG0456 Acetyltransferases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase |||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--|||||||| 4 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins |||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||-- 4 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family |-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase --|----------||||-||--||--||||-|---|||----|||-|-||-|---|||-||-|--- 4 [P] COG0659 Sulfate permease and related transporters (MFS superfamily) |-||||-----|-||---||-------||||------|----|||||-||-|||||---||||||| 4 [R] COG0661 Predicted unusual protein kinase -||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||-- 4 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid) |-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||-- 4 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component ----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases ----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||-- 4 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 4 [G] COG1109 Phosphomannomutase |||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||-- 4 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon) --||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|--- 4 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases ----|||||--|-|||-|-|------|---|----|-|-----------|--|-----|-|-||-- 4 [R] COG1524 Uncharacterized proteins of the AP superfamily |||||||||-||||||-------------------------------------------------- 4 [K] COG1594 DNA-directed RNA polymerase, subunit M/Transcription elongation factor TFIIS ||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----|||||| 4 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E |---||----|--|||----------||||------------|||-|--------|------|--- 4 [G] COG1877 Trehalose-6-phosphatase ||----||-|||||||--------------|------|---------------------------- 4 [J] COG2163 Ribosomal protein L14E/L6E/L27E -||---||--||-||----|-|----|---------------||||--||---------------- 4 [T] COG2453 Predicted protein-tyrosine phosphatase -------------||---||-------||-------------------||-----|---||-||-- 4 [I] COG3000 Sterol desaturase --|----------||------------|||||--|-----------|------------------- 4 [GHR] COG3961 Pyruvate decarboxylase and related thiamine pyrophosphate-requiring enzymes -------------|||--||------||||------------------------------------ 4 [L] COG4581 Superfamily II RNA helicase -------------|||-------------------------------------------------- 4 [Z] COG5023 Tubulin -------------|||-------------------------------------------------- 4 [K] COG5025 Transcription factor of the Forkhead/HNF3 family -------------|||-------------------------------------------------- 4 [OU] COG5082 Arginine methyltransferase-interacting protein, contains RING Zn-finger -------------|||-------------------------------------------------- 4 [U] COG5096 Vesicle coat complex, various subunits -------------|||-------------------------------------------------- 4 [U] COG5158 Proteins involved in synaptic transmission and general secretion, Sec1 family -------------|||-------------------------------------------------- 4 [K] COG5190 TFIIF-interacting CTD phosphatases, including NLI-interacting factor -------------|||-------------------------------------------------- 4 [T] COG5329 Phosphoinositide polyphosphatase (Sac family) |||-||--||-|-||-||||-|----|||-||--|||||---|||||--|--||||---|||||-- 3 [P] COG0004 Ammonia permease |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor ||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||------------- 3 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases ||||||-|||---|||--||-|----|||--|-||||-----|||||-||-||------|--|--- 3 [P] COG0025 NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0048 Ribosomal protein S12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0049 Ribosomal protein S7 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0052 Ribosomal protein S2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0080 Ribosomal protein L11 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0087 Ribosomal protein L3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0088 Ribosomal protein L4 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0090 Ribosomal protein L2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0091 Ribosomal protein L22 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0093 Ribosomal protein L14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0094 Ribosomal protein L5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0096 Ribosomal protein S8 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0099 Ribosomal protein S13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0100 Ribosomal protein S11 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0103 Ribosomal protein S9 ||||--|||||||||||-||-|------------|-||----------||---|||---|||||-- 3 [BQ] COG0123 Deacetylases, including yeast histone deacetylase and acetoin utilization protein ||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---||||||||||||| 3 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases -|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0185 Ribosomal protein S19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0186 Ribosomal protein S17 --||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||| 3 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0200 Ribosomal protein L15 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0244 Ribosomal protein L10 ---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family |-||------||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain ---|---------||---||----------------------||||||||||||||---||||||| 3 [T] COG0271 Stress-induced morphogen (activity unknown) ||||||--||---|||--------||----------------||||||||||||||---||||||| 3 [J] COG0293 23S rRNA methylase -|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|--- 3 [G] COG0297 Glycogen synthase |-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 3 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II |||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--|||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs |||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase -------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||-- 3 [G] COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| 3 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases ---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 3 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes |-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||-- 3 [E] COG0520 Selenocysteine lyase ||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 3 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump -------------||---||-||||-|---------------||||||||||||||-------|-- 3 [O] COG0545 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 1 |-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|--- 3 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease ---|---------||--|||-|-|||----|||||||||-|||||||-|-||-------------- 3 [F] COG0572 Uridine kinase --|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---||||||| 3 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases |-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [P] COG0605 Superoxide dismutase |-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-|||| 3 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase ----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--||||||||||| 3 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases -|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases --||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases ||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K ||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-||||||| 3 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 3 [U] COG0681 Signal peptidase I ||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-|| 3 [I] COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase |---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---||||||| 3 [J] COG0689 RNase PH |-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---||||||| 3 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC |--|----|----||-|||--|--|-|---|||-||||-|--|||||-|-||---|||-||-|--- 3 [F] COG0737 5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases ------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|-- 3 [K] COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family ||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||-- 3 [R] COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily) --||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---||||||| 3 [C] COG1048 Aconitase A |-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 3 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component ----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||-- 3 [KE] COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs -||||||||-|-|||--|------------------------------------------------ 3 [J] COG1184 Translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family -||||||-|-||||||--||-|--------------------------||-----|---||-||-- 3 [J] COG1236 Predicted exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 3 [J] COG1471 Ribosomal protein S4E ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 3 [J] COG1498 Protein implicated in ribosomal biogenesis, Nop56p homolog ----||----||-||--|-|----------||-|-|-|----|||||--------|---|---|-- 3 [G] COG1501 Alpha-glucosidases, family 31 of glycosyl hydrolases ---|||||--|||||---|-||------------|-||-----------|--|------|---|-| 3 [E] COG1506 Dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 3 [K] COG1761 DNA-directed RNA polymerase, subunit L |||||||||||||||||----------||-------||----------|||--||---|||-||-- 3 [L] COG1793 ATP-dependent DNA ligase -------------||----|----|--|-|||----------|||-|-||-----|---||-||-- 3 [F] COG1816 Adenosine deaminase --||||--|--|-||--|-|||----|||-|||-||||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 3 [C] COG1902 NADH:flavin oxidoreductases, Old Yellow Enzyme family -------------|||--||------||||------------------------------------ 3 [O] COG1928 Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase -----------||||---------------------|-----|||||--|-----|----||||-- 3 [FH] COG1953 Cytosine/uracil/thiamine/allantoin permeases -----------|-||----|-|----|||-----|--|----|||-|--|-|---|--||||||-- 3 [F] COG1957 Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 3 [J] COG2007 Ribosomal protein S8E ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 3 [J] COG2075 Ribosomal protein L24E |-|-||||||||||||-------------------------------------------------- 3 [J] COG2123 RNase PH-related exoribonuclease |-||----|-----|-||||-|||-||||||----|||----|||||-||--|--|--||||||-- 3 [T] COG2202 FOG: PAS/PAC domain ------||-----||--|-|----------|-----||--------------|--|---------- 3 [G] COG2730 Endoglucanase -------------||------|------------------------------|--|-------|-- 3 [E] COG2939 Carboxypeptidase C (cathepsin A) -------------||-----|---------------------------|--|---|---|------ 3 [M] COG3774 Mannosyltransferase OCH1 and related enzymes -------------|||------||-|--------|------------------------------- 3 [G] COG4284 UDP-glucose pyrophosphorylase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 3 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase -------------|||-------------------------------------------------- 3 [O] COG5029 Prenyltransferase, beta subunit -------------|||-------------------------------------------------- 3 [U] COG5030 Clathrin adaptor complex, small subunit -------------|||-------------------------------------------------- 3 [R] COG5038 Ca2+-dependent lipid-binding protein, contains C2 domain -------------|||-------------------------------------------------- 3 [U] COG5043 Vacuolar protein sorting-associated protein -------------|||-------------------------------------------------- 3 [K] COG5068 Regulator of arginine metabolism and related MADS box-containing transcription factors -------------|||-------------------------------------------------- 3 [U] COG5101 Nuclear transport receptor CRM1/MSN5 (importin beta superfamily) -------------|||-------------------------------------------------- 3 [U] COG5143 Synaptobrevin/VAMP-like protein -------------|||-------------------------------------------------- 3 [KAD] COG5147 Myb superfamily proteins, including transcription factors and mRNA splicing factors -------------|||--------------|----------------------------------- 3 [DZ] COG5184 Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins -------------|||-------------------------------------------------- 3 [B] COG5262 Histone H2A -------------|||-------------------------------------------------- 3 [O] COG5264 Vacuolar transporter chaperone -------------||------------------------------|---------|---||||||| 3 [O] COG5265 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease and ATPase components -------------|||-------------------------------------------------- 3 [T] COG5409 EXS domain-containing protein -------------|||-------------------------------------------------- 3 [T] COG5411 Phosphatidylinositol 5-phosphate phosphatase -----------||||--------------------------------------------------- 3 [N] COG5491 Conserved protein implicated in secretion -------------|||-------------------------------------------------- 3 [O] COG5574 RING-finger-containing E3 ubiquitin ligase -------------|||-------------------------------------------------- 3 [S] COG5594 Uncharacterized integral membrane protein -------------|||-------------------------------------------------- 3 [O] COG5596 Mitochondrial import inner membrane translocase, subunit TIM22 -------------||---------------------------------------------|----- 3 [M] COG5597 Alpha-N-acetylglucosamine transferase -------------|||-------------------------------------------------- 3 [T] COG5599 Protein tyrosine phosphatase -------------|||-------------------------------------------------- 3 [B] COG5602 Histone deacetylase complex, SIN3 component -------------|||-------------------------------------------------- 3 [K] COG5641 GATA Zn-finger-containing transcription factor -------------|||-------------------------------------------------- 3 [O] COG5647 Cullin, a subunit of E3 ubiquitin ligase -------------|||-------------------------------------------------- 3 [B] COG5648 Chromatin-associated proteins containing the HMG domain -------------|||-------------------------------------------------- 3 [D] COG5657 CAS/CSE protein involved in chromosome segregation |||||||||||||||-||||-------||||-||-|||----|--||--|--|------||-|--- 2 [F] COG0005 Purine nucleoside phosphorylase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase |||||||||||||||---||----------------------|||||-||||-------------- 2 [J] COG0023 Translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1) and related proteins |||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase] --||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0031 Cysteine synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control -|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||-- 2 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC ||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--|||||||| 2 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0051 Ribosomal protein S10 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase |||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---||||||| 2 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0081 Ribosomal protein L1 |||---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0084 Mg-dependent DNase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0089 Ribosomal protein L23 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0098 Ribosomal protein S5 ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase ||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase |||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases |-||--|||---||||--|--|-----||-|-----||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 2 [L] COG0122 3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--|||||||| 2 [J] COG0130 Pseudouridine synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase -||--|--|||||||-|-||-------|-------|-|------------------||-|||||-- 2 [EQ] COG0145 N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit -||--|---||||||-|-||-------|----------------------------||-|||||-- 2 [EQ] COG0146 N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I --||||||--|||||----|-|----|||||---|-||----|||||-|||----|---||||--- 2 [E] COG0160 4-aminobutyrate aminotransferase and related aminotransferases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase ||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||---- 2 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components |||-|||||||--||||-||----||--------------------------------------|| 2 [I] COG0170 Dolichol kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase -||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 2 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0198 Ribosomal protein L24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0199 Ribosomal protein S14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein |-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A) |-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 2 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase |||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|---- 2 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0256 Ribosomal protein L18 --||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases ---|---------|||--||----------------------||||||||||||||---||||||| 2 [O] COG0278 Glutaredoxin-related protein --|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [C] COG0281 Malic enzyme ---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase --|-||----||-|||--||-|----||||-|||--------|||||-||||||||---|||||-- 2 [E] COG0308 Aminopeptidase N --|----------||-|-||-|----||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 2 [S] COG0316 Uncharacterized conserved protein ---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 2 [H] COG0320 Lipoate synthase --||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---||||||| 2 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase) |||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase |||||||||||-||||----------||||||---|||----|||||-||--|-------|-|--- 2 [E] COG0367 Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing) |-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-||||||||||||||| 2 [C] COG0372 Citrate synthase -------------||---||-|----||||------|-----|||||------------||-|--- 2 [P] COG0387 Ca2+/H+ antiporter --||-------|-||---|||-----|||-|||||||||||||||||-||-|-|||---|||||-- 2 [L] COG0389 Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair -------------||---||-|||-------|--||||----|||----|--|------||||-|| 2 [R] COG0400 Predicted esterase -------------||---||----------------------|||-|--|---------|------ 2 [S] COG0401 Uncharacterized homolog of Blt101 |||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||-- 2 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases ----||----||||||--||||----|||-----|-||----|||-|-||--||||||-||-||-- 2 [E] COG0405 Gamma-glutamyltransferase --|-|------|-||-|-||-------|||------|-----|||||--|-----|---||-||-- 2 [Q] COG0412 Dienelactone hydrolase and related enzymes ||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||---------------- 2 [L] COG0419 ATPase involved in DNA repair ||||--||--||||||||-|-|---||||------|------|||-|--|---|||--|-|----- 2 [P] COG0428 Predicted divalent heavy-metal cations transporter |||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||-- 2 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases |||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--||||||||||| 2 [O] COG0450 Peroxiredoxin |||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 2 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ) ||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis ||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning ||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases --|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--|||||||| 2 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||-- 2 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 2 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II --|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||-- 2 [L] COG0514 Superfamily II DNA helicase ||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity |||||||||-|||||||-||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases |------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||| 2 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit |||-||||||-|-||-||--|---|-|||-||-|-|||----|||||-||---|||---|----|| 2 [HC] COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases |-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase --||--|||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases ---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||-- 2 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase |||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---||||||| 2 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins |-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-|| 2 [ER] COG0591 Na+/proline symporter -||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-| 2 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters |||||||||||||||||--------------|--|||----------------------------| 2 [MI] COG0615 Cytidylyltransferase -------------|||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase --|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 2 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase ---|--|||--||||-||--|-----|||--|||||||----|||||--|--------|||||||| 2 [G] COG0647 Predicted sugar phosphatases of the HAD superfamily -------------||---||-|----|||-----|-||----|||||-||-|||||---||||||| 2 [HC] COG0654 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases -------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases |||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--|||||||||||||| 2 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 2 [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit --|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase ---|---------||-|-||-|----|----|--||||----|||||-|||-|--|---|||||-- 2 [MG] COG0702 Predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerases -------------||----|-|----|----|-|--------||||||||||||||------||-- 2 [E] COG0722 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase --------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0787 Alanine racemase ----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II -------------|||------||--|---------------|||||-||||-||-|||------- 2 [E] COG0814 Amino acid permeases ----||||--|||||----|------|----|-|||||------------||----|||--|---- 2 [K] COG0819 Putative transcription activator ---|----|-|-|||||-|||---||||||---------------|--||||-------------- 2 [I] COG1022 Long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming) -------------||------|||||----|----------------------------------- 2 [R] COG1026 Predicted Zn-dependent peptidases, insulinase-like ||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit --|||||||-||||||---|||--|-|||||-||||------|||||-|----------------- 2 [KL] COG1061 DNA or RNA helicases of superfamily II -----------|-||---||------||||-------|----|||||--||--|||---|||||-- 2 [C] COG1062 Zn-dependent alcohol dehydrogenases, class III --|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||-- 2 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases |------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||-- 2 [M] COG1087 UDP-glucose 4-epimerase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [R] COG1094 Predicted RNA-binding protein (contains KH domains) ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [K] COG1095 DNA-directed RNA polymerase, subunit E' |-|-||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG1097 RNA-binding protein Rrp4 and related proteins (contain S1 domain and KH domain) ||||||||||---||--------------------------------------------------- 2 [L] COG1111 ERCC4-like helicases ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [R] COG1163 Predicted GTPase ---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [E] COG1171 Threonine dehydratase --|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||----- 2 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II) ||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|-- 2 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases |||||||||||||||||-------------------------|----------------||----- 2 [R] COG1204 Superfamily II helicase |-|-||||||||-||||-||------|---|||-||||----|||||--|-----|---|||||-| 2 [M] COG1215 Glycosyltransferases, probably involved in cell wall biogenesis ------||||||||||-------------------------------------------------- 2 [K] COG1224 DNA helicase TIP49, TBP-interacting protein --|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||-- 2 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component ||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||-- 2 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III ||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 2 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes ---|-------|-||---||-|----||||-|--||||----|||||-|||----|---||||--- 2 [C] COG1252 NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit -------------|||----||--|||||-||||||||----|||||-||--|||----|||||-- 2 [R] COG1272 Predicted membrane protein, hemolysin III homolog ||||||||||||||||-|||||---|----||||||||------------------|||------- 2 [K] COG1293 Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP |||||||||||||||--------------------------------------------------- 2 [O] COG1382 Prefoldin, chaperonin cofactor ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG1383 Ribosomal protein S17E ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [K] COG1405 Transcription initiation factor TFIIIB, Brf1 subunit/Transcription initiation factor TFIIB ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [R] COG1412 Uncharacterized proteins of PilT N-term./Vapc superfamily -------------||-----|-||------------------|||||-||||||||----|-|--- 2 [E] COG1448 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase |-|||||||-||||||-------------------------------------------------- 2 [LO] COG1474 Cdc6-related protein, AAA superfamily ATPase ----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-||||||| 2 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes ||-|--||-|---||-|--|------|-------|-|--|||-------|||-||---|||||--- 2 [L] COG1525 Micrococcal nuclease (thermonuclease) homologs ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG1552 Ribosomal protein L40E ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG1601 Translation initiation factor 2, beta subunit (eIF-2beta)/eIF-5 N-terminal domain -------------||--|--------|---|-|||-||-----||---|--|---|---|------ 2 [G] COG1621 Beta-fructosidases (levanase/invertase) ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG1632 Ribosomal protein L15E ||||||--|||-|||-|---|------||-|---||||----||||||||--|||----|||||-- 2 [H] COG1648 Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain) --|------|---||---||----------------|----------------------------- 2 [I] COG1657 Squalene cyclase -|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-||||||||||||| 2 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins ||||--||||||||||-------------------------------------------------- 2 [K] COG1675 Transcription initiation factor IIE, alpha subunit -------------||----||---|-----|||||||------------|---||-|-|-|----- 2 [M] COG1696 Predicted membrane protein involved in D-alanine export ----------||-||---||-|||--|||||------|--------------|------------- 2 [T] COG1716 FOG: FHA domain ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG1717 Ribosomal protein L32E -------------|||---|--||----------------------------------------|| 2 [S] COG1723 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG1736 Diphthamide synthase subunit DPH2 --||---------||--|--||---||---||||||||||--|||-|-||||-|||||||||---- 2 [S] COG1739 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG1890 Ribosomal protein S3AE |||---||||||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG1911 Ribosomal protein L30E ||||--||||||||||-------------------------------------------------- 2 [L] COG1948 ERCC4-type nuclease ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG1997 Ribosomal protein L37AE/L43A |||||||||||||||--------------------------------------------------- 2 [J] COG1998 Ribosomal protein S27AE ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG2004 Ribosomal protein S24E |-||---------||------|----||||----||-------------|||||||------||-- 2 [E] COG2021 Homoserine acetyltransferase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG2053 Ribosomal protein S28E/S33 ---|---------||---||-------||-------------------||-----|-------|-- 2 [S] COG2119 Predicted membrane protein ---|---------||---||-|----|||||-----||-----------|--|--|--||||||-- 2 [Q] COG2124 Cytochrome P450 ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG2125 Ribosomal protein S6E (S10) |||---||||||||||-------------------------------------------------- 2 [JA] COG2136 Predicted exosome subunit/U3 small nucleolar ribonucleoprotein (snoRNP) component, contains IMP4 domain ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG2139 Ribosomal protein L21E ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG2147 Ribosomal protein L19E |||---||||||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG2157 Ribosomal protein L20A (L18A) ||----||-|||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG2174 Ribosomal protein L34E |-||----|-----|-||||-|-----||||---|-||----|||---||-----|---|||||-- 2 [T] COG2203 FOG: GAF domain |-||--||||---||-|--|-------||-|-----||----|||-|-||--|----------|-- 2 [R] COG2234 Predicted aminopeptidases ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG2238 Ribosomal protein S19E (S16A) -------------||------|---||---|-|---------|||||--|||-------|||||-- 2 [H] COG2240 Pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase -------------||--|---------||-|-----||---------------------||-||-- 2 [G] COG2273 Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase ------||--|||-|------|||-----------|-|-----------|-----|---|||||-- 2 [E] COG2355 Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase homolog -------------||-----||---------|--||-|----||||-----|-------||||--- 2 [G] COG2376 Dihydroxyacetone kinase ------||-|--||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG2451 Ribosomal protein L35AE/L33A --||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||---- 2 [P] COG2608 Copper chaperone ----||-------||--|--|---------||||||--|---------|----||-----|-|--- 2 [F] COG2759 Formyltetrahydrofolate synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors |--|------|||||-|--|-|----||||-------|----|||||-||-----|---|||||-- 2 [P] COG2897 Rhodanese-related sulfurtransferase |------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|------- 2 [S] COG2966 Uncharacterized conserved protein --------------|----|------||||------------|||-|-||--|--|---|||||-- 2 [L] COG3145 Alkylated DNA repair protein -------------||----|-------|||----|--------------|---------|------ 2 [Q] COG3320 Putative dehydrogenase domain of multifunctional non-ribosomal peptide synthetases and related enzymes -||-||-----|-||----|------|||-|------------------------|---|--||-- 2 [G] COG3387 Glucoamylase and related glycosyl hydrolases --------------|------------------------------|---|-----|--|---||-- 2 [R] COG3491 Isopenicillin N synthase and related dioxygenases |------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|------- 2 [S] COG3610 Uncharacterized conserved protein --------------|----||--------||-|---------------------------|-|--- 2 [R] COG3899 Predicted ATPase ------|------||--------------------------------------------||-|--- 2 [E] COG4126 Hydantoin racemase ----------||-|||-------------------------------------------------- 2 [J] COG4830 Ribosomal protein S26 ----------||||||-------------------------------------------------- 2 [J] COG4901 Ribosomal protein S25 -------------|||--------|----------------------------------------- 2 [G] COG5026 Hexokinase -------------|||-------------------------------------------------- 2 [B] COG5027 Histone acetyltransferase (MYST family) -------------|||-------------------------------------------------- 2 [U] COG5028 Vesicle coat complex COPII, subunit SEC24/subunit SFB2/subunit SFB3 -------------|||-------------------------------------------------- 2 [K] COG5033 Transcription initiation factor IIF, auxiliary subunit -------------|||-------------------------------------------------- 2 [B] COG5034 Chromatin remodeling protein, contains PhD zinc finger -------------|||-------------------------------------------------- 2 [DKT] COG5035 Cell cycle control protein -------------|||-------------------------------------------------- 2 [P] COG5036 SPX domain-containing protein involved in vacuolar polyphosphate accumulation -------------|||-------------------------------------------------- 2 [TG] COG5037 Gluconate transport-inducing protein -------------|||-------------------------------------------------- 2 [T] COG5040 14-3-3 family protein -------------|||-------------------------------------------------- 2 [TDK] COG5041 Casein kinase II, beta subunit -------------|||-------------------------------------------------- 2 [O] COG5044 RAB proteins geranylgeranyltransferase component A (RAB escort protein) -------------|||-------------------------------------------------- 2 [J] COG5045 Ribosomal protein S10E -------------|||-------------------------------------------------- 2 [U] COG5047 Vesicle coat complex COPII, subunit SEC23 -------------|||-------------------------------------------------- 2 [LDA] COG5049 5'-3' exonuclease -------------|||-------------------------------------------------- 2 [J] COG5051 Ribosomal protein L36E -------------|||-------------------------------------------------- 2 [U] COG5052 Protein involved in membrane traffic -------------|||-------------------------------------------------- 2 [J] COG5053 Translation initiation factor 4E (eIF-4E) -------------|||-------------------------------------------------- 2 [O] COG5054 Mitochondrial sulfhydryl oxidase involved in the biogenesis of cytosolic Fe/S proteins -------------|||-------------------------------------------------- 2 [L] COG5055 Recombination DNA repair protein (RAD52 pathway) -------------|||-------------------------------------------------- 2 [I] COG5056 Acyl-CoA cholesterol acyltransferase -------------|||-------------------------------------------------- 2 [DT] COG5057 Phosphotyrosyl phosphatase activator -------------|||-------------------------------------------------- 2 [U] COG5058 Protein transporter of the TRAM (translocating chain-associating membrane) superfamily, longevity assurance factor -------------|||-------------------------------------------------- 2 [OU] COG5061 Oxidoreductin, endoplasmic reticulum membrane-associated protein involved in disulfide bond formation -------------|||-------------------------------------------------- 2 [U] COG5064 Karyopherin (importin) alpha -------------|||-------------------------------------------------- 2 [P] COG5065 Protein involved in inorganic phosphate transport -------------|||-------------------------------------------------- 2 [U] COG5066 VAMP-associated protein involved in inositol metabolism -------------|||-------------------------------------------------- 2 [LD] COG5067 Protein kinase essential for the initiation of DNA replication -------------|||-------------------------------------------------- 2 [Z] COG5069 Ca2+-binding actin-bundling protein fimbrin/plastin (EF-Hand superfamily) -------------|||-------------------------------------------------- 2 [O] COG5071 26S proteasome regulatory complex component -------------|||-------------------------------------------------- 2 [U] COG5073 Vacuolar import and degradation protein -------------|||-------------------------------------------------- 2 [O] COG5077 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase -------------|||-------------------------------------------------- 2 [UD] COG5079 Nuclear protein export factor -------------|||-------------------------------------------------- 2 [U] COG5080 Rab GTPase interacting factor, Golgi membrane protein -------------|||-------------------------------------------------- 2 [O] COG5160 Protease, Ulp1 family -------------|||-------------------------------------------------- 2 [K] COG5169 Heat shock transcription factor -------------|||-------------------------------------------------- 2 [OJ] COG5193 La protein, small RNA-binding pol III transcript stabilizing protein and related La-motif-containing proteins involved in translation -------------|||-------------------------------------------------- 2 [OD] COG5194 Component of SCF ubiquitin ligase and anaphase-promoting complex -------------|||-------------------------------------------------- 2 [A] COG5239 mRNA deadenylase, exonuclease subunit and related nucleases -------------|||-------------------------------------------------- 2 [T] COG5253 Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase -------------|||-------------------------------------------------- 2 [BK] COG5259 RSC chromatin remodeling complex subunit RSC8 -------------|||-------------------------------------------------- 2 [DT] COG5261 Protein involved in regulation of cellular morphogenesis/cytokinesis -------------|||-------------------------------------------------- 2 [U] COG5325 t-SNARE complex subunit, syntaxin -------------|||-------------------------------------------------- 2 [R] COG5354 Uncharacterized protein, contains Trp-Asp (WD) repeat -------------|||-------------------------------------------------- 2 [R] COG5366 Protein involved in propagation of M2 dsRNA satellite of L-A virus -------------|||-------------------------------------------------- 2 [GO] COG5371 Golgi nucleoside diphosphatase -------------|||-------------------------------------------------- 2 [T] COG5408 SPX domain-containing protein -------------|||-------------------------------------------------- 2 [T] COG5422 RhoGEF, Guanine nucleotide exchange factor for Rho/Rac/Cdc42-like GTPases -------------||----------------------|---------------------------- 2 [M] COG5498 Predicted glycosyl hydrolase -------------|||------||------------------------------------------ 2 [B] COG5531 SWIB-domain-containing proteins implicated in chromatin remodeling -------------|||-------------------------------------------------- 2 [L] COG5535 DNA repair protein RAD4 -------------|||-------------------------------------------------- 2 [O] COG5536 Protein prenyltransferase, alpha subunit -------------|||-------------------------------------------------- 2 [D] COG5537 Cohesin -------------|||-------------------------------------------------- 2 [O] COG5539 Predicted cysteine protease (OTU family) -------------|||-------------------------------------------------- 2 [O] COG5540 RING-finger-containing ubiquitin ligase -------------|||-------------------------------------------------- 2 [O] COG5560 Ubiquitin C-terminal hydrolase -------------|||-------------------------------------------------- 2 [K] COG5576 Homeodomain-containing transcription factor -------------|||-------------------------------------------------- 2 [L] COG5600 Transcription-associated recombination protein -------------|||-------------------------------------------------- 2 [S] COG5604 Uncharacterized conserved protein ||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||-- 1 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase ||-|||-|-||-|||-|-|||------|||-----|-|---------------------------- 1 [P] COG0003 Oxyanion-translocating ATPase ||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||-- 1 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase |||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase -------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0021 Transketolase ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 1 [C] COG0022 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit ---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation) -------------||---|--|----|||-------------|||||-|----------|||||-- 1 [G] COG0033 Phosphoglucomutase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase -|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||-- 1 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||-- 1 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain ---------|---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors ||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--|||||||| 1 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit |||||||||||||||-||||-|----|||||-----------|||||-||--|--|||||||||-- 1 [S] COG0062 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||-- 1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase ||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---||||||||||||| 1 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog) ||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit |||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0067 Glutamate synthase domain 1 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0069 Glutamate synthase domain 2 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0070 Glutamate synthase domain 3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0073 EMAP domain ||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0077 Prephenate dehydratase |||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase |||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0082 Chorismate synthase -|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||------- 1 [E] COG0083 Homoserine kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3 ---|||||---||||-||||--||--|----|||||||-||||||||-||---------------- 1 [H] COG0095 Lipoate-protein ligase A ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase |||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase ---|||--|-|||||-|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 1 [O] COG0109 Polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor) ||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-| 1 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) |||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||-- 1 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase --||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0114 Fumarase -------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase ||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||-- 1 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0125 Thymidylate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase |||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase ||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase ||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase --||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful) ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase ||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0148 Enolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase ------|---|--||--|--|---|-|||-||-|--||----|||||-|-||-------------- 1 [G] COG0153 Galactokinase --------|-||-||-|-||-|----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 1 [P] COG0155 Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein) ---|---------||---||----------------------|||||-||||-||||||-||-|-- 1 [G] COG0158 Fructose-1,6-bisphosphatase ||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain -|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0164 Ribonuclease HII -|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0171 NAD synthase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [E] COG0174 Glutamine synthetase -|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [G] COG0176 Transaldolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease |||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 1 [Q] COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway) ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-||||||||||||||| 1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase |||-|||||||||||-|||||---------------|------------|--|-------|-|--- 1 [J] COG0182 Predicted translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family ||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-||||||| 1 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit -------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||-- 1 [G] COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase -------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase -------------|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0194 Guanylate kinase -------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0196 FAD synthase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0203 Ribosomal protein L17 -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|--- 1 [G] COG0205 6-phosphofructokinase |||-----||---|||----||----||||||||||||-|||||||||||||||||---|||||-- 1 [F] COG0207 Thymidylate synthase ---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-||| 1 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit |-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0211 Ribosomal protein L27 |--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase |||||||||||||||--|--||----|||||--|||||------------||-------------- 1 [H] COG0214 Pyridoxine biosynthesis enzyme --|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0216 Protein chain release factor A -------------||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit |-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 1 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase -------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0227 Ribosomal protein L28 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0228 Ribosomal protein S16 |-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||-- 1 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0230 Ribosomal protein L34 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0233 Ribosome recycling factor --|----------||-||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10) --|----------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0238 Ribosomal protein S18 -|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation -|--||-------|||--|-|------||-|-----------|||||||||||||||||---||-- 1 [E] COG0241 Histidinol phosphatase and related phosphatases |||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0250 Transcription antiterminator |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0257 Ribosomal protein L36 -------------||---||-|-----|||------------|||||-|||-||||---|||||-- 1 [H] COG0259 Pyridoxamine-phosphate oxidase ------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-|||||||||||| 1 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase --|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-| 1 [H] COG0262 Dihydrofolate reductase --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0267 Ribosomal protein L33 ||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||-- 1 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase ----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase) |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase ||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase |--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG0288 Carbonic anhydrase |||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes ---|------|-|||--|---|---|-||||||||||||||||||||-|-||-------||-||-- 1 [F] COG0295 Cytidine deaminase --||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN --|----|---|-|||---||-----||||||||||||-----------|-|---|---||-||-- 1 [R] COG0300 Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities ----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--||||||||||| 1 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I ---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain |||||||||||||||--|---|----|||||--|||||------------||-------------- 1 [H] COG0311 Predicted glutamine amidotransferase involved in pyridoxine biosynthesis ----------|--||---||-|----||||------------||||||||||||||---||||||| 1 [H] COG0321 Lipoate-protein ligase B -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase --|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold -------------|||--|||---|||||||----|||----|||||||||||--||||-|-|-|| 1 [O] COG0326 Molecular chaperone, HSP90 family ||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||------- 1 [S] COG0327 Uncharacterized conserved protein ---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0328 Ribonuclease HI -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0333 Ribosomal protein L32 --|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|-- 1 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0335 Ribosomal protein L19 ----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase -------------||---||-|----|---------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [E] COG0339 Zn-dependent oligopeptidases ||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase |-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase |-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases --|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase -------------||-|-||-|----||||------------||||||||||||||---||||||| 1 [R] COG0354 Predicted aminomethyltransferase related to GcvT --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit) --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0359 Ribosomal protein L9 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0360 Ribosomal protein S6 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1) -------------|||-|||--||||||||-|-||||-----|||||||-||-||----||||--- 1 [G] COG0362 6-phosphogluconate dehydrogenase -------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase |-||||--|-|||||||-||-|-----||--|--||||----|||||-||-||--||-||||||-- 1 [I] COG0365 Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases |||||||||||||-|--|||----------||||-|||----|||||-------------|----- 1 [C] COG0371 Glycerol dehydrogenase and related enzymes |||-----||----|-|-||||----|||-----|--||---|||||--||----||||||||--- 1 [OK] COG0378 Ni2+-binding GTPase involved in regulation of expression and maturation of urease and hydrogenase |||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases -----||----|-||--|||-------||--|||-|-|----|----------------------- 1 [G] COG0383 Alpha-mannosidase --||---------||---||||----|||-|----|||----|||-|-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG0384 Predicted epimerase, PhzC/PhzF homolog -------------|||--|-|-----|---|||||||||---|||||--|--||||-------|-- 1 [O] COG0386 Glutathione peroxidase |-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||-- 1 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase -------------||---||------|----------|----|||-|-||--|--|---||--|-- 1 [S] COG0397 Uncharacterized conserved protein --||---------||---||------|||-||||||||----|||---|-----------|--|-- 1 [S] COG0398 Uncharacterized conserved protein ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG0403 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), N-terminal domain ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--||||---|||||-- 1 [E] COG0404 Glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase) --|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase -------------||---||----------------------|||||-||--|--|---||||||| 1 [H] COG0408 Coproporphyrinogen III oxidase ---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase -------------||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0414 Panthothenate synthetase -------------||---|-----------------------||||||||---||||||||----- 1 [F] COG0418 Dihydroorotase ||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|----- 1 [L] COG0420 DNA repair exonuclease -|--|||||||||||-||---|----|---|--|--||----||||||-|--||||||----|--- 1 [E] COG0421 Spermidine synthase ||||||||||||||||-----|--|||||||---|---||||------------------------ 1 [J] COG0423 Glycyl-tRNA synthetase (class II) --|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation ---|----|----||---|-|-----|---------------|||||--|---------|-|-|-- 1 [C] COG0427 Acetyl-CoA hydrolase ||||--|||||||||||--|----------------------|||-|--|-----|---------- 1 [A] COG0430 RNA 3'-terminal phosphate cyclase ---|---------||---||-|----|||--|||||||--|||||||-||-|-|||---||-||-- 1 [R] COG0431 Predicted flavoprotein |||---|||||||-|-||||-|-----||-|-----||----|||-|-||---------||----- 1 [S] COG0432 Uncharacterized conserved protein ---|---------||---||------|---------------|||-|-||---------||||--- 1 [O] COG0435 Predicted glutathione S-transferase |||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0439 Biotin carboxylase |||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||-- 1 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division ||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase |||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase --|----------||-||--||||||----|-----|||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type -|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||-- 1 [G] COG0469 Pyruvate kinase ||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||---- 1 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters ||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-|| 1 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase |||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-|||||||||||||| 1 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components -|||--||||||||||-------------------------------------------------- 1 [T] COG0478 RIO-like serine/threonine protein kinase fused to N-terminal HTH domain ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA -------------||-||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0486 Predicted GTPase |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0498 Threonine synthase |||||||||||||||-||||------||||-------------------|--|--|---|||||-- 1 [H] COG0499 S-adenosylhomocysteine hydrolase |||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 1 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes ||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||--- 1 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase) ---|---------||---||-|----|||-----|-||----|||||--|-|-|||||||||||-- 1 [E] COG0506 Proline dehydrogenase -|-----------||----|-|||-|-||-||||||||-|--|||||||||||||---|||||--- 1 [L] COG0507 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member ---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||-- 1 [E] COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding) -------------||-----|---|------|||||||-||||||||-|-|-----------|--- 1 [M] COG0510 Predicted choline kinase involved in LPS biosynthesis |||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit --|----------||-|-||||----|||-----|-||----|||||-||--||||||-|||||-- 1 [R] COG0523 Putative GTPases (G3E family) |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0527 Aspartokinases -------||---|||-|-|--|-----||-|-----||----||||||||--|--|--|-||||-- 1 [P] COG0529 Adenylylsulfate kinase and related kinases ||||||||||||-||-|||-----||-----------|----|||||-|--|--------|----- 1 [P] COG0530 Ca2+/Na+ antiporter -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0536 Predicted GTPase ---|||--|-|||||-||||-|-----||--|--||||----|||||--|-|---|||-|||||-- 1 [C] COG0538 Isocitrate dehydrogenases -------------||-||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0539 Ribosomal protein S1 |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-| 1 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0550 Topoisomerase IA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase |||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific --------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [J] COG0566 rRNA methylases -------------||------|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 1 [C] COG0567 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, and related enzymes |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein) ---|||-----|-|||--|--|---|||||-|||||||----|||||-|||||--|---||||--- 1 [C] COG0578 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase |-------|--|-|||-||-||---|----||||||||-|||||||||-||||--|---|||||-- 1 [G] COG0580 Glycerol uptake facilitator and related permeases (Major Intrinsic Protein Family) |||||||||||||||||----|--------------------|||||-||||----|||------- 1 [S] COG0585 Uncharacterized conserved protein --|----------||-----|-||||||||||||||------||||||--||||||----||||-- 1 [G] COG0588 Phosphoglycerate mutase 1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog) |||-||--||-|-||--||--|----|||--|---|||-------|---||-||||---|||||-- 1 [S] COG0599 Uncharacterized homolog of gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit |||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||-- 1 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent) ||||--|||||||||--|--|---|----|||||||||-||||||||-||---------------- 1 [R] COG0622 Predicted phosphoesterase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein ---|---------||||-||-|||--|---------------||||||||||-|||---||||||| 1 [C] COG0633 Ferredoxin |||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||-- 1 [C] COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins) ||||||||--||||||||----||---||||---|||||||||||||||----------------- 1 [L] COG0648 Endonuclease IV |||-----||-|-||-|---||-----||||--|||||----||-||-||--|--|---|||-|-| 1 [R] COG0655 Multimeric flavodoxin WrbA -------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-||||||||||||| 1 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH --------|---|||--||||---|---------|||-----||||---|-|-||---|--|--|| 1 [P] COG0672 High-affinity Fe2+/Pb2+ permease -------------||---||-------------------------|--|-||-|||---|||||-- 1 [O] COG0678 Peroxiredoxin ||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--|||||||| 1 [R] COG0679 Predicted permeases -------------|||----||||-|||||-||||||||||||||||||||||||||||||----- 1 [L] COG0692 Uracil DNA glycosylase ---|----|----||---||--||----------||||----|||||||||||---|||||||||| 1 [O] COG0694 Thioredoxin-like proteins and domains --|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0703 Shikimate kinase |-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0708 Exonuclease III ||||||-|||||-||-|-----||-------||||||-----|||-|------||----------- 1 [E] COG0710 3-dehydroquinate dehydratase -------------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein) -||-----||---||--|||||||--|---|--||-||----||||--||||---|---|||||-- 1 [P] COG0715 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components |||-----||---||---|||---|-----||||-||-----|||||||||||--||||------- 1 [C] COG0716 Flavodoxins --||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--|||||||||||||| 1 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein --|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||-- 1 [G] COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase |||||||||||||||--||||---------|-------------------------|||------- 1 [C] COG0731 Fe-S oxidoreductases -------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||| 1 [I] COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase) -------------||------|----|-------||||----|||||-||||-||||||||||--- 1 [P] COG0753 Catalase -------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-||||||| 1 [F] COG0756 dUTPase -------------|||||||||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||-||||--- 1 [E] COG0804 Urea amidohydrolase (urease) alpha subunit --||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||| 1 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation --------------|---||-|----|-------|--||----||----||----|||-||||--- 1 [O] COG0829 Urease accessory protein UreH --------------|---||-|----|||-----|--||----|||---||----|||-||||--- 1 [O] COG0830 Urease accessory protein UreF --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||-||||--- 1 [E] COG0831 Urea amidohydrolase (urease) gamma subunit --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||--|||--- 1 [E] COG0832 Urea amidohydrolase (urease) beta subunit ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG1003 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), C-terminal domain |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 1 [C] COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit -------------||-|----|----|-------|-||----|||||-||--|--|--|-|----- 1 [C] COG1017 Hemoglobin-like flavoprotein ---|---------||-----||----|||-----|-||----||||||||--||||---|||||-- 1 [C] COG1018 Flavodoxin reductases (ferredoxin-NADPH reductases) family 1 |||||||||||--||--------------------------------------------------- 1 [R] COG1019 Predicted nucleotidyltransferase ---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---||||||| 1 [I] COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase -------------|||------||------------------|||||-||---------------- 1 [O] COG1025 Secreted/periplasmic Zn-dependent peptidases, insulinase-like -------------||-----------|||-||--||||---------------------||||--- 1 [C] COG1038 Pyruvate carboxylase |||||||||||||||--------------------------------------------------- 1 [L] COG1041 Predicted DNA modification methylase --||----------|--|||------||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [E] COG1045 Serine acetyltransferase -------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase --|-||----|||||---||------||||-||||-||----|||-|--|--|||||||||||--- 1 [R] COG1064 Zn-dependent alcohol dehydrogenases --------|---|||--|||----|||||-||-|||||----|||||--|||---|---||||--- 1 [G] COG1070 Sugar (pentulose and hexulose) kinases ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 1 [C] COG1071 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, alpha subunit -----|-------||-----------||||-|||-|||----|||||-|-||-------||||--- 1 [H] COG1072 Panthothenate kinase --||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||-- 1 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily --------|----||---||-|----|---|---|-||-|--------||--|--|---------- 1 [R] COG1075 Predicted acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold -------------|||--|-----------------------||||||||||-|||--|||||||| 1 [O] COG1076 DnaJ-domain-containing proteins 1 ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1084 Predicted GTPase --|---|-|-|--||--|--------||--||----------|||||-|-||-------------- 1 [C] COG1085 Galactose-1-phosphate uridylyltransferase |-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||-- 1 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1093 Translation initiation factor 2, alpha subunit (eIF-2alpha) |-|-|||||||||||--------------------------------------------------- 1 [J] COG1096 Predicted RNA-binding protein (consists of S1 domain and a Zn-ribbon domain) --|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-||||||||||||| 1 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes --|----------||------|----||||-|--||||----|||||----|-------------- 1 [P] COG1119 ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1155 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit A ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1156 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit B -------------||-----|---------|---|-||----|||||-|||||||||||------- 1 [H] COG1179 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 1 ||||----||---||-----|-||-|-||||-----||-----------|--|||||||||||-|| 1 [I] COG1183 Phosphatidylserine synthase -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase) -------------||-|||||||||||||||||-||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1186 Protein chain release factor B |--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase |||---||||||-||----|-|----|||-------||-----||---------------|----- 1 [R] COG1205 Distinct helicase family with a unique C-terminal domain including a metal-binding cysteine cluster -------------||-|-||--||--||||------------|||||||||||-----|||||||| 1 [P] COG1218 3'-Phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase --||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [O] COG1225 Peroxiredoxin -|------|----|||-|--||--------|||||||-----------|----------------- 1 [C] COG1227 Inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase --||--|-|-|--||-|----|||--||||----||||-------|---------|-------|-- 1 [H] COG1232 Protoporphyrinogen oxidase ||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---||||||| 1 [R] COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I ||||||||||||-|||-|--|---------|----------------------------------- 1 [KB] COG1243 Histone acetyltransferase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1245 Predicted ATPase, RNase L inhibitor (RLI) homolog --||---------||-|||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains ||||||||||||||||---------|-----|||||------------|----------------- 1 [I] COG1257 Hydroxymethylglutaryl-CoA reductase --|-----------|---||--||---||-------||----------||-|||||---|||||-- 1 [S] COG1262 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1269 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit I |||||||||-||-||-------------------------------------------|------- 1 [R] COG1287 Uncharacterized membrane protein, required for N-linked glycosylation |||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----||||||| 1 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases |||||||||||-||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1308 Transcription factor homologous to NACalpha-BTF3 ||||||||||---|||-------------------------------------------------- 1 [L] COG1311 Archaeal DNA polymerase II, small subunit/DNA polymerase delta, subunit B --|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||-- 1 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase -|----|||||||||--------------------------------------------------- 1 [R] COG1341 Predicted GTPase or GTP-binding protein |||-|||||||||||-||--------------------------------------------|--- 1 [R] COG1355 Predicted dioxygenase -------------||--|--|----||||||------------------|---------------- 1 [E] COG1362 Aspartyl aminopeptidase |||-----||---||-||||-|----||||||--||||-----------|---|||---|||||-- 1 [E] COG1364 N-acetylglutamate synthase (N-acetylornithine aminotransferase) ||||--||||-||||--------------------------------------------------- 1 [J] COG1369 RNase P/RNase MRP subunit POP5 -|----||||--||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1374 Protein involved in ribosomal biogenesis, contains PUA domain |||-||||||---||-||--||-----||-||--||||----|||||-|-----------|----- 1 [ER] COG1387 Histidinol phosphatase and related hydrolases of the PHP family |||||||||||-||||----||||||---------------------------------------- 1 [C] COG1390 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit E ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1394 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit D -------------||---||-----------------------------|-----|--------|| 1 [I] COG1398 Fatty-acid desaturase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [U] COG1400 Signal recognition particle 19 kDa protein |-|---|||||-|||-|-||--||--||||||--|||-----|||||-||||---|---|||||-- 1 [R] COG1409 Predicted phosphohydrolases |-||---------|||--||--||||--------|-||----||-----|------------|--- 1 [C] COG1413 FOG: HEAT repeat ||||||||||||||||----||--|--------|-------------------------------- 1 [C] COG1436 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit F ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1439 Predicted nucleic acid-binding protein, consists of a PIN domain and a Zn-ribbon module ---|---------|||----------|||-------------|||-|------------------- 1 [I] COG1443 Isopentenyldiphosphate isomerase ---|--||||||||||--------------------------|||||-|-||-------------- 1 [R] COG1444 Predicted P-loop ATPase fused to an acetyltransferase ---|||||--||--|---||----------------------|||-|-|------|---|---|-- 1 [E] COG1446 Asparaginase |-|||||||--||||-||--|-----|---||-|||||----|||||-||-|---|---||||--- 1 [C] COG1454 Alcohol dehydrogenase, class IV ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [L] COG1467 Eukaryotic-type DNA primase, catalytic (small) subunit -----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---||||||| 1 [G] COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases --------|----||--|---|---|||||||||||||-|--|||||-|--|-------------- 1 [G] COG1482 Phosphomannose isomerase -------------||------|-----||-------------|||||-||--||||---||||||| 1 [R] COG1485 Predicted ATPase --|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||--- 1 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase -------------||-||--||----|||-||||||||----|||||-||||-|||---------- 1 [J] COG1490 D-Tyr-tRNAtyr deacylase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1499 NMD protein affecting ribosome stability and mRNA decay ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1500 Predicted exosome subunit |||||||||||||||||------------------------------------------------- 1 [J] COG1503 Peptide chain release factor 1 (eRF1) ---||||||||||-|-||-|-|--------|-----|-----|||||-----|------------- 1 [L] COG1515 Deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V) |||||||||||--|||----||----------||-------------------------------- 1 [C] COG1527 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit C ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1537 Predicted RNA-binding proteins -------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase |--|-------|-||---||-|----|||-----|-|---------------||||---|||||-- 1 [I] COG1562 Phytoene/squalene synthetase -------------||--|--||--|-----|||||||-------------------||-||||--- 1 [H] COG1564 Thiamine pyrophosphokinase ||||--||||||||||---------|-----|||||------------------------------ 1 [I] COG1577 Mevalonate kinase |-|-||-----|-||---------------------------|||||-|--|-------------- 1 [S] COG1584 Predicted membrane protein ||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||--- 1 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase -|----|||||||||--------------------------------------------------- 1 [S] COG1590 Uncharacterized conserved protein ----|--------||--|||-|----|||-||||||||----|||||--|---------||-||-- 1 [IR] COG1597 Sphingosine kinase and enzymes related to eukaryotic diacylglycerol kinase ||||||||||-|||||-------------------------------------------------- 1 [L] COG1599 Single-stranded DNA-binding replication protein A (RPA), large (70 kD) subunit and related ssDNA-binding proteins ||||--||||-||||--------------------------------------------------- 1 [J] COG1603 RNase P/RNase MRP subunit p30 ||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG1605 Chorismate mutase ---|--------|||-|-||-|----||||----||||-----------|--|--|---||||||| 1 [O] COG1612 Uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly -------------|||---|----||----------------|||-|--|-----|---------- 1 [G] COG1626 Neutral trehalase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1631 Ribosomal protein L44E ||||--|||||||||--|------------------------------------------------ 1 [H] COG1635 Flavoprotein involved in thiazole biosynthesis ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1644 DNA-directed RNA polymerase, subunit N (RpoN/RPB10) ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1676 tRNA splicing endonuclease ||||--||||||||||-------------------------------------------------- 1 [L] COG1697 DNA topoisomerase VI, subunit A ||||||||||||||||-----|-----------------------|---|---------------- 1 [TD] COG1718 Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1727 Ribosomal protein L18E |||||||||||||||-|------------------------------------------------- 1 [O] COG1730 Predicted prefoldin, molecular chaperone implicated in de novo protein folding ----|||-|-|-|||---||-|-----------|---|----------|--|----|||||||--- 1 [E] COG1748 Saccharopine dehydrogenase and related proteins -|--||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [S] COG1756 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega -------------|||||--||--|-----||--||||---------------------------- 1 [S] COG1774 Uncharacterized homolog of PSP1 |||-|||||||||||--------------------------------------------------- 1 [R] COG1779 C4-type Zn-finger protein --||---|-----||--|-|-|----|-------|-||----||||---|--|--|-----|---- 1 [P] COG1785 Alkaline phosphatase -------------||-|--|----------------|------------|--|------------- 1 [S] COG1791 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain |-|-||-------||-|----|------------||||---------------------------- 1 [L] COG1796 DNA polymerase IV (family X) ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1798 Diphthamide biosynthesis methyltransferase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1813 Predicted transcription factor, homolog of eukaryotic MBF1 ||--|||||||||||--|---||---|----|-----------------|------------||-- 1 [S] COG1814 Uncharacterized membrane protein |-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---||||||| 1 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family --|-|||||||-|||-----||--------------------|||----|---------|------ 1 [J] COG1859 RNA:NAD 2'-phosphotransferase --|----------||----||----|--------------------|--|-----||||----|-- 1 [F] COG1864 DNA/RNA endonuclease G, NUC1 |||||||||||||||||------------------------------------------------- 1 [J] COG1867 N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1889 Fibrillarin-like rRNA methylase ---|--|||-|-|||-|--|------|||-|||-||||----|||||-||-----|------||-- 1 [H] COG1893 Ketopantoate reductase |-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---||||||| 1 [C] COG1894 NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit ---|--|||||||||------|------------||------|||||-||-|----||||||||-- 1 [R] COG1896 Predicted hydrolases of HD superfamily ||||||||||||||||---|-------------------------------------------|-- 1 [O] COG1899 Deoxyhypusine synthase |-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---||||||| 1 [C] COG1905 NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit ----||-----|-||----|||----||||||-|||||----|||||--|||||||---||||--- 1 [P] COG1914 Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family --|----------||----|------||||-|---|||----||||||||||||||--||||||-- 1 [HE] COG1932 Phosphoserine aminotransferase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [F] COG1936 Predicted nucleotide kinase (related to CMP and AMP kinases) -------------||-----------||||------------||||||||||||||---------- 1 [A] COG1949 Oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease) -------------|||--------------------------||||||||||-|||--------|| 1 [P] COG1965 Protein implicated in iron transport, frataxin homolog ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1976 Translation initiation factor 6 (eIF-6) ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis ||||||||||||||||----------|--------------------------------------- 1 [S] COG1990 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||---------------|----------------------------------- 1 [K] COG1996 DNA-directed RNA polymerase, subunit RPC10 (contains C4-type Zn-finger) ---|------|-|||-|----|--------------||----------||--||||--|||||||| 1 [R] COG1999 Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC, involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems ---|---------||--|-|||--------|---||-|----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2008 Threonine aldolase ---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--|||||||||||||| 1 [C] COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG2012 DNA-directed RNA polymerase, subunit H, RpoH/RPB5 ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2016 Predicted RNA-binding protein (contains PUA domain) ----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||-- 1 [G] COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes --|---|||---||||--||-------||-|-----------------|-||---|----|||--- 1 [O] COG2020 Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase ||||||||||-|||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2023 RNase P subunit RPR2 ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 1 [C] COG2025 Electron transfer flavoprotein, alpha subunit ---|----|--|-||-----||----||||----|-|-----|--||-||-----|---|||||-- 1 [I] COG2030 Acyl dehydratase --|----------||-|----|-----||||-----|-----|||||-|--|-|||----||-|-- 1 [P] COG2032 Cu/Zn superoxide dismutase -------------||---|--------||||-----|-----|----------------|--|--- 1 [E] COG2040 Homocysteine/selenocysteine methylase (S-methylmethionine-dependent) ||||||---|-|-|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG2042 Uncharacterized conserved protein -------||-|||||-|-||-|--------------||--------------------|------- 1 [P] COG2046 ATP sulfurylase (sulfate adenylyltransferase) --|||||||-||--|-|----|----|||--|||||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [Q] COG2050 Uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2051 Ribosomal protein S27E --------------|-----|------|||||||-|------|||----|--------|||||||| 1 [R] COG2071 Predicted glutamine amidotransferases -------------||---|--|----||||------||-----------|-----|---||-||-- 1 [P] COG2072 Predicted flavoprotein involved in K+ transport |||||||||||||||-||------------|----------------------------------- 1 [S] COG2078 Uncharacterized conserved protein ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 1 [C] COG2086 Electron transfer flavoprotein, beta subunit -------------||---||----------|---|-||----|||-|---|||--|---------- 1 [H] COG2091 Phosphopantetheinyl transferase |||||||||||||||--------------------------------------------------- 1 [J] COG2092 Translation elongation factor EF-1beta ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2097 Ribosomal protein L31E ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG2101 TATA-box binding protein (TBP), component of TFIID and TFIIIB ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG2102 Predicted ATPases of PP-loop superfamily |--|--|||||||||--------------------------------------------------- 1 [S] COG2106 Uncharacterized conserved protein --|----------|||--||----|-||||-------------------|---------||-||-- 1 [T] COG2114 Adenylate cyclase, family 3 (some proteins contain HAMP domain) |||||||||||||||--------------------------------------------------- 1 [R] COG2118 DNA-binding protein --|---||-|-|-|||-----|----||||----|-||----|--|-------------||||--- 1 [S] COG2120 Uncharacterized proteins, LmbE homologs ||||||||||-|||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2126 Ribosomal protein L37E ---|---------||----|--------------|-|-----|||-|--|-----|------||-- 1 [R] COG2130 Putative NADP-dependent oxidoreductases --|-||||||---||--|--||--|-----||||||||-|--------|----------------- 1 [F] COG2131 Deoxycytidylate deaminase ---|------|--||-|--|------|||-------||----|||||--|||||||--||||||-- 1 [Q] COG2132 Putative multicopper oxidases --|---|||----||-----------|---||-|||||----|||-|---||----||-|------ 1 [H] COG2145 Hydroxyethylthiazole kinase, sugar kinase family --||||----||--|---||-|----||------|-||----|||||--|--|--|---||-||-- 1 [PR] COG2146 Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenases --------------|---|-------|||--|-----|----|||-|-||-----------|---- 1 [R] COG2153 Predicted acyltransferase ---|------||-||-|-||------||||------------------||--|--|----||||-- 1 [H] COG2154 Pterin-4a-carbinolamine dehydratase ||||||||||-|||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2167 Ribosomal protein L39E -------------||------------|||------------||||--||-----|------|--- 1 [Q] COG2175 Probable taurine catabolism dioxygenase -||---|||||||-|--------------------------------------------------- 1 [J] COG2178 Predicted RNA-binding protein of the translin family -------------|||---||---|-|---|||||||||---|||||-||||||||---||||--- 1 [K] COG2183 Transcriptional accessory protein -------------||---||----------------------|||||-||||----------|--- 1 [T] COG2198 FOG: HPt domain |-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||-- 1 [P] COG2217 Cation transport ATPase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [L] COG2219 Eukaryotic-type DNA primase, large subunit -----------|-||------|----||||-------|----|||||-||-----|---|||||-- 1 [C] COG2224 Isocitrate lyase --|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis -------------||---||-|--------------------|||||-||-|||||---||||||| 1 [H] COG2227 2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4-benzoquinol methylase ||-------|---||-|----|-----||------------------------||----------- 1 [R] COG2229 Predicted GTPase -------|------|--|--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---|||---- 1 [F] COG2233 Xanthine/uracil permeases --|||||||-|||||----|----|||--------------------------||||||------- 1 [R] COG2236 Predicted phosphoribosyltransferases --|-----------|-----|---------|----||||---|||||-||||-||||||-|-||-- 1 [R] COG2249 Putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B) -|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|-- 1 [R] COG2252 Permeases -------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 1 [L] COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase ---|-------|-||----|-|----||||----|-||----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [S] COG2259 Predicted membrane protein |||||||||||||||--------------------------------------------------- 1 [J] COG2260 Predicted Zn-ribbon RNA-binding protein ------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase -------||----||--|-|||----||||||--||||----|||||-||||---|---|||||-- 1 [I] COG2267 Lysophospholipase -------------||-|---------|||||----|||---------------------|||||-- 1 [R] COG2270 Permeases of the major facilitator superfamily --------------|------|----|||-|---|-|---------|--------|-------|-- 1 [I] COG2272 Carboxylesterase type B --------------|--|---|------------||------|||--------------||-|--- 1 [Q] COG2313 Uncharacterized enzyme involved in pigment biosynthesis --|----------||---||-|-----||------------------------------||-||-- 1 [M] COG2335 Secreted and surface protein containing fasciclin-like repeats --------------|------|--------------||----|||-|--|-----|--||||||-- 1 [R] COG2351 Transthyretin-like protein --------------|----|-|------------||||----|||||-||||-------|||||-- 1 [S] COG2363 Uncharacterized small membrane protein -------------||------|-----||--|---|---------|---|-----|---|---|-- 1 [T] COG2365 Protein tyrosine/serine phosphatase ------||---||-|--|-|---------------|-|----------------------|--|-- 1 [C] COG2421 Predicted acetamidase/formamidase |-||||--|||||||-----------|-------|----------|---|-----|---||||--- 1 [E] COG2423 Predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin homolog ||||||||||--||||-------------------------------------------------- 1 [U] COG2443 Preprotein translocase subunit Sss1 ------||------|--|-|----------------------|||||-|------|--|---||-- 1 [E] COG2515 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase ||||--|||||||-|--|------------------------|||||-||--||||||||||||-- 1 [O] COG2518 Protein-L-isoaspartate carboxylmethyltransferase ||-||||||||||||-||--------||||------------------------------------ 1 [J] COG2519 tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase and related methyltransferases ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG2520 Predicted methyltransferase --------------|---------------||-||||-----||||||-|-----|---------- 1 [G] COG2706 3-carboxymuconate cyclase -----------|-||---||-------|||||||-|||----|||||-||-|-|||--||||||-- 1 [E] COG2755 Lysophospholipase L1 and related esterases --------------|---||-|-----||-------------------||-----|---|||||-- 1 [R] COG2802 Uncharacterized protein, similar to the N-terminal domain of Lon protease --|----------||------|----|||-|-----------|||||-||||-------|||||-- 1 [L] COG2816 NTP pyrophosphohydrolases containing a Zn-finger, probably nucleic-acid-binding -------------||-|-------------------||----------||--|||||||||||||| 1 [C] COG2857 Cytochrome c1 --|----------||---|-----------------||----|||||--|---|||-------|-- 1 [E] COG2866 Predicted carboxypeptidase -------------||---------------------------|||||-||-|||||---||||||| 1 [I] COG2867 Oligoketide cyclase/lipid transport protein --||---------||--|---|----|||-||---|-|-----------|-|---|--|||||--- 1 [E] COG2873 O-acetylhomoserine sulfhydrylase -------------||------------|||------------------||--|------||||||| 1 [E] COG2902 NAD-specific glutamate dehydrogenase -------------||--|----------------------------------|--|---------- 1 [S] COG2930 Uncharacterized conserved protein -------------||---------------------------------||--|--|--||||||-- 1 [O] COG2935 Putative arginyl-tRNA:protein arginylyltransferase -------------||---------------------------|||||-||||||||---||||||| 1 [S] COG2938 Uncharacterized conserved protein -------------||----------------------------------|--|--|-------||| 1 [H] COG2941 Ubiquinone biosynthesis protein COQ7 --------------|---||-|---------------------------|--|--|---||||--- 1 [S] COG2947 Uncharacterized conserved protein -------------|||----------|---||--|||-----|||||-|---|||--------|-- 1 [E] COG3104 Dipeptide/tripeptide permease --||---|------|------------||-------------|||||--|||-------|||||-- 1 [P] COG3119 Arylsulfatase A and related enzymes --------------|---------------------------|||||-||---------------- 1 [R] COG3129 Predicted SAM-dependent methyltransferase -------------||----------------------------------|-----|---||||||| 1 [O] COG3175 Cytochrome oxidase assembly factor -------------||---------------------------|||-|--|---------||||--- 1 [F] COG3194 Ureidoglycolate hydrolase -------------||----|-|----|---------------|||||-||-|-|||---||-|--- 1 [G] COG3265 Gluconate kinase |||||||||||-||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG3277 RNA-binding protein involved in rRNA processing -------------||--|------------|------|---------------------------- 1 [R] COG3341 Predicted double-stranded RNA/RNA-DNA hybrid binding protein -------------||-----------||||-------------------|-----|---||||||| 1 [S] COG3346 Uncharacterized conserved protein ----|------|--|------------||-----|----------||--------|||-------- 1 [P] COG3376 High-affinity nickel permease --|-|------|--|---------------|-----------|||||--|-|---|-------|-- 1 [S] COG3384 Uncharacterized conserved protein ---|||-----|-|||---------|-----|||||------------------------------ 1 [I] COG3407 Mevalonate pyrophosphate decarboxylase ||||||||||||||||---------|-----||||||--------|-----------------|-- 1 [I] COG3425 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase -------------||--------------------------------------------||||||| 1 [C] COG3474 Cytochrome c2 --|-----|-----|---||----------||----|----------------------||----- 1 [T] COG3476 Tryptophan-rich sensory protein (mitochondrial benzodiazepine receptor homolog) ---|----------|----|-----------------|-------|---|-----|----|-|--- 1 [Q] COG3486 Lysine/ornithine N-monooxygenase --------------|----------------|||-|-|--------------|------------- 1 [S] COG3538 Uncharacterized conserved protein -------------||------|---------------------------|---------||-|--- 1 [L] COG3569 Topoisomerase IB ---|----|----||--------------------------------------------------- 1 [R] COG3582 Predicted nucleic acid binding protein containing the AN1-type Zn-finger --|-----------|----------|-----|------|----------|-----|---|--||-- 1 [F] COG3613 Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase -------------||-----|-----|||--------------------|-----|---|||||-- 1 [E] COG3616 Predicted amino acid aldolase or racemase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [T] COG3642 Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase --------------|------|--------------||---------------------------- 1 [Q] COG3648 Uricase (urate oxidase) --|-----------|------|--------------------|||-|----|-|||--|----|-- 1 [L] COG3663 G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase --------------|------|--------------|----------------------||--|-- 1 [S] COG3665 Uncharacterized conserved protein --------------|------|----|||--|---|------|||||-||---------------- 1 [L] COG3695 Predicted methylated DNA-protein cysteine methyltransferase -------------||---------------------|-----|||----------|---|||||-- 1 [P] COG3703 Uncharacterized protein involved in cation transport -----------|--|----|-|--------------------|-------------------|--- 1 [Q] COG3733 Cu2+-containing amine oxidase -------------|||--||----------------------------||-------------|-- 1 [O] COG3751 Predicted proline hydroxylase --------------|------------||--|---|-----------------------|--||-- 1 [S] COG3752 Predicted membrane protein -------------||----------------------------------|-----------|-|-- 1 [S] COG3777 Uncharacterized conserved protein --------------|-------------------------------|--|-----|---|||||-- 1 [S] COG3791 Uncharacterized conserved protein -----------|-||----------|---------------------------------------- 1 [I] COG3890 Phosphomevalonate kinase -------------||----------------------------------|---------|||||-- 1 [R] COG3897 Predicted methyltransferase --------------|---||----------||-----------------|----------|||--- 1 [G] COG3957 Phosphoketolase |-|------|---||--------------------------------------------------- 1 [S] COG4021 Uncharacterized conserved protein -|-------|---||--------------------------------------------------- 1 [F] COG4088 Predicted nucleotide kinase --||--------|-|-|-||||----||||||||||||-----------|---||-------|--- 1 [R] COG4122 Predicted O-methyltransferase ---|---------||---||||----|||--|-|||------|||-|-||||||||||||||---- 1 [R] COG4221 Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity -------------||-|--------------------------------|--|------------- 1 [C] COG4229 Predicted enolase-phosphatase -------------||----|-------------------------------------------|-- 1 [R] COG4240 Predicted kinase -------------||----------------------------------|-----|----|----- 1 [F] COG4266 Allantoicase -------------||------|---------------------------------|---------- 1 [I] COG4281 Acyl-CoA-binding protein -------------||------|--------------------------------------|----- 1 [G] COG4282 Protein involved in beta-1,3-glucan synthesis -------------||-------||-----------------------------------------| 1 [S] COG4285 Uncharacterized conserved protein -------------|||------||-----------------------------------|------ 1 [S] COG4286 Uncharacterized conserved protein related to MYG1 family --------------|----|-|--------------||---------------------------- 1 [L] COG4294 UV damage repair endonuclease --------------|---||-------||--------------------------|---------- 1 [S] COG4301 Uncharacterized conserved protein --------------|-----------|---------|------------|---------|------ 1 [S] COG4336 Uncharacterized conserved protein ----------||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG4352 Ribosomal protein L13E -------------||-----------------|||------------------------------- 1 [S] COG4357 Uncharacterized conserved protein -------------||---------------|-----|----------------------------- 1 [E] COG4359 Uncharacterized conserved protein, possibly involved in methylthioadenosine recycling -------------||----------------------------------|-----|---------- 1 [S] COG4539 Predicted membrane protein -------------||---||||----------||-------------------------------- 1 [R] COG4586 ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component -------------|||-|------------|----------------------------------- 1 [R] COG4624 Iron only hydrogenase large subunit, C-terminal domain -------------||------------------------------|--------------|||--- 1 [S] COG4702 Uncharacterized conserved protein -------------||-||||||||||----------------|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87 ---|--|||--|-||--|--||----||||------||-----------|-----|---||||||| 1 [I] COG4799 Acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta) -------------||------|----|--------------------------------------- 1 [S] COG4850 Uncharacterized conserved protein ----------||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG4888 Uncharacterized Zn ribbon-containing protein --|----------||----|----------------------------|----------------- 1 [O] COG4935 Regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertases and other proteases -------------||-----------||||------------------------------------ 1 [I] COG4981 Enoyl reductase domain of yeast-type FAS1 -------------||-----------||||------------------------------------ 1 [I] COG4982 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase --|----------||----|---------------------------------------------- 1 [S] COG5017 Uncharacterized conserved protein --------------|---------------------|------------|---------------- 1 [R] COG5018 Inhibitor of the KinA pathway to sporulation, predicted exonuclease -------------||----|---------------------------------------------- 1 [H] COG5031 Uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis --------------|----|----------------|----------------------------- 1 [GM] COG5039 Exopolysaccharide biosynthesis protein --------------|----------------------------------------|-----|-|-- 1 [F] COG5042 Purine nucleoside permease -------------|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5046 Protein involved in Mod5 protein sorting -------------|||--------|----------------------------------------- 1 [I] COG5050 sn-1,2-diacylglycerol ethanolamine- and cholinephosphotranferases -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5062 Uncharacterized membrane protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5063 CCCH-type Zn-finger protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [GOU] COG5070 Nucleotide-sugar transporter -------------|||-------------------------------------------------- 1 [D] COG5072 Serine/threonine kinase of the haspin family -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5074 t-SNARE complex subunit, syntaxin -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5075 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5081 Predicted membrane protein -------------|||--------------|----------------------------------- 1 [R] COG5083 Uncharacterized protein involved in plasmid maintenance -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5085 Predicted membrane protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5086 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5087 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5088 Rad5p-binding protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5090 Transcription initiation factor IIF, small subunit (RAP30) -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5091 Suppressor of G2 allele of skp1 and related proteins -------------|||-------------------------------------------------- 1 [I] COG5092 N-myristoyl transferase -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5093 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5094 Transcription initiation factor TFIID, subunit TAF9 (also component of histone acetyltransferase SAGA) -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5095 Transcription initiation factor TFIID, subunit TAF6 (also component of histone acetyltransferase SAGA) -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5097 RNA polymerase II transcriptional regulation mediator -------------|||-------------------------------------------------- 1 [BD] COG5098 Chromosome condensation complex Condensin, subunit D2 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5100 Nuclear pore protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5102 Membrane protein involved in ER to Golgi transport -------------|||-------------------------------------------------- 1 [DK] COG5103 Cell division control protein, negative regulator of transcription -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5104 Splicing factor -------------|||-------------------------------------------------- 1 [D] COG5105 Mitotic inducer, protein phosphatase -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5106 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5107 Pre-mRNA 3'-end processing (cleavage and polyadenylation) factor -------------||--------------------------------------------|------ 1 [K] COG5108 Mitochondrial DNA-directed RNA polymerase -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5109 Uncharacterized conserved protein, contains RING Zn-finger -------------|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5110 26S proteasome regulatory complex component -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5111 DNA-directed RNA polymerase III, subunit C34 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5112 U1-like Zn-finger-containing protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5113 Ubiquitin fusion degradation protein 2 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [B] COG5114 Histone acetyltransferase complex SAGA/ADA, subunit ADA2 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5116 26S proteasome regulatory complex component -------------|||-------------------------------------------------- 1 [JU] COG5117 Protein involved in the nuclear export of pre-ribosomes -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5118 Transcription initiation factor TFIIIB, Bdp1 subunit -------------||----|---------------------------------------------- 1 [R] COG5119 Uncharacterized protein, contains ParB-like nuclease domain -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5120 Membrane protein involved in Golgi transport -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5122 Transport protein particle (TRAPP) complex subunit -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5123 Transcription initiation factor IIA, gamma subunit -------------|||-------------------------------------------------- 1 [DR] COG5124 Protein predicted to be involved in meiotic recombination -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5125 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [C] COG5127 Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit C -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5128 Transport protein particle (TRAPP) complex subunit -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5129 Nuclear protein with HMG-like acidic region -------------|||-------------------------------------------------- 1 [UT] COG5130 Prenylated rab acceptor 1 and related proteins -----------|-|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5131 Ubiquitin-like protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [KD] COG5132 Cell cycle control protein, G10 family -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5133 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5134 Uncharacterized conserved protein -------------||----|---------------------------------------------- 1 [S] COG5135 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5136 U1 snRNP-specific protein C -------------|||-------------------------------------------------- 1 [KB] COG5137 Histone chaperone involved in gene silencing -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5138 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5139 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5140 Ubiquitin fusion-degradation protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5141 PHD zinc finger-containing protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [L] COG5142 Oxidation resistance protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [KL] COG5144 RNA polymerase II transcription initiation/nucleotide excision repair factor TFIIH, subunit TFB2 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [L] COG5145 DNA excision repair protein -------------||-------------------|------------------------------- 1 [H] COG5146 Pantothenate kinase, acetyl-CoA regulated -------------|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5148 26S proteasome regulatory complex, subunit RPN10/PSMD4 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5149 Transcription initiation factor IIA, large chain -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5150 Class 2 transcription repressor NC2, beta subunit (Dr1) -------------|||-------------------------------------------------- 1 [KL] COG5151 RNA polymerase II transcription initiation/nucleotide excision repair factor TFIIH, subunit SSL1 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5152 Uncharacterized conserved protein, contains RING and CCCH-type Zn-fingers -------------|||-------------------------------------------------- 1 [UI] COG5153 Putative lipase essential for disintegration of autophagic bodies inside the vacuole -------------|||-------------------------------------------------- 1 [J] COG5154 RNA-binding protein required for 60S ribosomal subunit biogenesis -------------|||-------------------------------------------------- 1 [DO] COG5155 Separase, a protease involved in sister chromatid separation -------------|||-------------------------------------------------- 1 [DO] COG5156 Anaphase-promoting complex (APC), subunit 10 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5157 RNA polymerase II assessory factor -------------|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5159 26S proteasome regulatory complex component -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5161 Pre-mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5162 Transcription initiation factor TFIID, subunit TAF10 (also component of histone acetyltransferase SAGA) -------------|||-------------------------------------------------- 1 [J] COG5163 Protein required for biogenesis of the 60S ribosomal subunit -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5164 Transcription elongation factor -------------|||-------------------------------------------------- 1 [KLB] COG5165 Nucleosome-binding factor SPN, POB3 subunit -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5166 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5167 Protein involved in vacuole import and degradation -------------|||-------------------------------------------------- 1 [T] COG5170 Serine/threonine protein phosphatase 2A, regulatory subunit -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5171 Ran GTPase-activating protein (Ran-binding protein) -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5173 Exocyst complex subunit SEC6 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5174 Transcription initiation factor IIE, beta subunit -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5175 Transcriptional repressor -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5176 Splicing factor (branch point binding protein) -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5177 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5178 U5 snRNP spliceosome subunit -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5179 Transcription initiation factor TFIID, subunit TAF1 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5180 Protein interacting with poly(A)-binding protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5181 U2 snRNP spliceosome subunit -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5182 Splicing factor 3b, subunit 2 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5183 Protein involved in mRNA turnover and stability -------------|||-------------------------------------------------- 1 [D] COG5185 Protein involved in chromosome segregation, interacts with SMC proteins -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5186 Poly(A) polymerase -------------|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5187 26S proteasome regulatory complex component, contains PCI domain -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5188 Splicing factor 3a, subunit 3 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [KD] COG5189 Putative transcriptional repressor regulating G2/M transition -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5191 Uncharacterized conserved protein, contains HAT (Half-A-TPR) repeat -------------|||-------------------------------------------------- 1 [J] COG5192 GTP-binding protein required for 40S ribosome biogenesis -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5195 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5196 ER lumen protein retaining receptor -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5197 Predicted membrane protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5198 Protein tyrosine phosphatase-like protein (contains Pro instead of catalytic Arg) -------------|||-------------------------------------------------- 1 [Z] COG5199 Calponin -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5200 U1 snRNP component, mediates U1 snRNP association with cap-binding complex -------------|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5201 SCF ubiquitin ligase, SKP1 component -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5202 Predicted membrane protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5204 Transcription elongation factor SPT4 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5206 Glycosylphosphatidylinositol transamidase (GPIT), subunit GPI8 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5207 Isopeptidase T -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5208 CCAAT-binding factor, subunit C -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5209 Uncharacterized protein involved in cell differentiation/sexual development -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5211 RNA polymerase II-interacting protein involved in transcription start site selection -------------||------------------------------|-------------------- 1 [T] COG5212 Low-affinity cAMP phosphodiesterase -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5213 Polyadenylation factor I complex, subunit FIP1 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [L] COG5214 DNA polymerase alpha-primase complex, polymerase-associated subunit B -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5215 Karyopherin (importin) beta -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5216 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [DZ] COG5217 Microtubule-binding protein involved in cell cycle control -------------|||-------------------------------------------------- 1 [BD] COG5218 Chromosome condensation complex Condensin, subunit G -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5219 Uncharacterized conserved protein, contains RING Zn-finger -------------|||-------------------------------------------------- 1 [DKL] COG5220 Cdk activating kinase (CAK)/RNA polymerase II transcription initiation/nucleotide excision repair factor TFIIH, subunit TFB3 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5221 Dopey and related predicted leucine zipper transcription factors -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5222 Uncharacterized conserved protein, contains RING Zn-finger -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5223 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5224 CCAAT-binding factor, subunit B -------------|||-------------------------------------------------- 1 [J] COG5225 Uncharacterized protein involved in ribosome biogenesis -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5226 mRNA capping enzyme, guanylyltransferase (alpha) subunit -------------|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5227 Ubiquitin-like protein (sentrin) -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5228 mRNA deadenylase subunit -------------|||-------------------------------------------------- 1 [BD] COG5229 Chromosome condensation complex Condensin, subunit H -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5230 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [C] COG5231 Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit H -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5232 Preprotein translocase subunit Sec62 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5233 Peripheral Golgi membrane protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [OZ] COG5234 Beta-tubulin folding cofactor D -------------|||-------------------------------------------------- 1 [L] COG5235 Single-stranded DNA-binding replication protein A (RPA), medium (30 kD) subunit -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5236 Uncharacterized conserved protein, contains RING Zn-finger -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5237 Predicted membrane protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [TA] COG5238 Ran GTPase-activating protein (RanGAP) involved in mRNA processing and transport -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5240 Vesicle coat complex COPI, gamma subunit -------------|||-------------------------------------------------- 1 [L] COG5241 Nucleotide excision repair endonuclease NEF1, RAD10 subunit -------------|||-------------------------------------------------- 1 [KL] COG5242 RNA polymerase II transcription initiation/nucleotide excision repair factor TFIIH, subunit TFB4 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5243 HRD ubiquitin ligase complex, ER membrane component -------------|||-------------------------------------------------- 1 [D] COG5244 Dynactin complex subunit involved in mitotic spindle partitioning in anaphase B -------------|||-------------------------------------------------- 1 [Z] COG5245 Dynein, heavy chain -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5246 Splicing factor 3a, subunit 2 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5247 Class 2 transcription repressor NC2, alpha subunit (DRAP1 homolog) -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5248 Transcription initiation factor TFIID, subunit TAF13 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5249 Golgi protein involved in Golgi-to-ER retrieval -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5250 RNA polymerase II, fourth largest subunit -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5251 Transcription initiation factor TFIID, subunit TAF11 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5252 Uncharacterized conserved protein, contains CCCH-type Zn-finger protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5254 Predicted membrane protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG5257 Translation initiation factor 2, gamma subunit (eIF-2gamma; GTPase) -------------|||-------------------------------------------------- 1 [JO] COG5269 Ribosome-associated chaperone zuotin -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5271 AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5275 BRCT domain type II -------------||---|-----------|-|--------------------------------- 1 [D] COG5279 Uncharacterized protein involved in cytokinesis, contains TGc (transglutaminase/protease-like) domain -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5290 IkappaB kinase complex, IKAP component -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5291 Predicted membrane protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5296 Transcription factor involved in TATA site selection and in elongation by RNA polymerase II -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5308 Nuclear pore complex subunit -------------||----------------------------------|---------------- 1 [G] COG5309 Exo-beta-1,3-glucanase -------------||-----|--------------------------------------------- 1 [S] COG5324 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5369 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5374 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [J] COG5384 U3 small nucleolar ribonucleoprotein component -------------||--------------------------------------------|||-|-- 1 [O] COG5387 Chaperone required for the assembly of the mitochondrial F1-ATPase -------------|||-------------------------------------------------- 1 [KLB] COG5406 Nucleosome binding factor SPN, SPT16 subunit -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5407 Preprotein translocase subunit Sec63 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5414 TATA-binding protein-associated factor -------------|||-------------------------------------------------- 1 [R] COG5415 Predicted integral membrane metal-binding protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [T] COG5432 RING-finger-containing E3 ubiquitin ligase -------------||----------------------------------------------||--- 1 [J] COG5459 Predicted rRNA methylase -------------||----------------------------------|---------||-|--- 1 [S] COG5478 Predicted small integral membrane protein ---|---------||----|---------------------------------------------- 1 [R] COG5524 Bacteriorhodopsin -------------|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5533 Ubiquitin C-terminal hydrolase -------------|||-------------------------------------------------- 1 [U] COG5538 Preprotein translocase subunit Sec66 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5541 Vesicle coat complex COPI, zeta subunit -------------|||---|----------|----------------------------------- 1 [S] COG5542 Predicted integral membrane protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5543 Uncharacterized conserved protein -------------||----|---------------------------------------------- 1 [S] COG5548 Small integral membrane protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [L] COG5575 Origin recognition complex, subunit 2 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5580 Activator of HSP90 ATPase -------------||------------------------------------------------||| 1 [S] COG5590 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [J] COG5593 Nucleic-acid-binding protein possibly involved in ribosomal biogenesis -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5601 General negative regulator of transcription subunit -------------|||-------------------------------------------------- 1 [N] COG5603 Subunit of TRAPP, an ER-Golgi tethering complex -------------|||-------------------------------------------------- 1 [A] COG5623 Pre-mRNA cleavage and polyadenylation factor IA/II complex, subunit CLP1 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5624 Transcription initiation factor TFIID, subunit TAF12 (also component of histone acetyltransferase SAGA) -------------|||-------------------------------------------------- 1 [L] COG5627 DNA repair protein MMS21 -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5629 Predicted metal-binding protein -------------||-------------------------------------|------------- 1 [E] COG5630 Acetylglutamate synthase -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5636 Uncharacterized conserved protein, contains Zn-ribbon-like motif -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5638 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG5644 Uncharacterized conserved protein -------------|||-------------------------------------------------- 1 [O] COG5656 Importin, protein involved in nuclear import -------------|||-------------------------------------------------- 1 [K] COG5665 CCR4-NOT transcriptional regulation complex, NOT5 subunit