(order) Aquificales - 1 genome Functional categories Fun All J A K L B D Y V T M N Z W U O C G E F H I P Q R S COGs 1,088 131 1 39 76 1 14 -  7 28 75 36 -  -  41 57 81 44 98 49 82 36 52 15 136 84 proteins 1,396 143 1 49 86 2 17 -  9 61 113 45 -  -  55 75 126 52 121 53 93 50 68 27 189 98 Distribution of COGs by number of proteins proteins 1 2 3 4 5 6 7 8 9 11 COGs 878 165 27 4 7 1 2 2 1 1

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|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  7 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases
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|-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  5 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase
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--|-----||------|--|----------|-----------|||-|---------|||-------  3 [C] COG0374 Ni,Fe-hydrogenase I large subunit
--||---||-|||---|-------------------------|||||-||||---|--|-|-|---  3 [C] COG0437 Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1
|||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  3 [I] COG0439 Biotin carboxylase
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-------------||-||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain
||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  3 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases
|||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  3 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein
|||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----||||||||||||||||||||||||  3 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase
|-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  3 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase
-|||||||-|||----||||-|---|-||-------------|||-|-----|---||--------  3 [L] COG0675 Transposase and inactivated derivatives
----------------||||----||----||||-|||----||||||||||||||||||||||||  3 [M] COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains)
-------------|||||||||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  3 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase
----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||---||--  3 [M] COG0859 ADP-heptose:LPS heptosyltransferase
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  3 [C] COG1005 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)
--||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--||||||||||||||  3 [CP] COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit
--|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  3 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases)
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  3 [G] COG1109 Phosphomannomutase
|-|---||||||----||||-|-----||||----|||-----------||||--|---||-||--  3 [E] COG1305 Transglutaminase-like enzymes, putative cysteine proteases
--|-----|-------|--|----------|-----------|||-|---------|||-------  3 [C] COG1740 Ni,Fe-hydrogenase I small subunit
---|------|-|||-|----|--------------||----------||--||||--||||||||  3 [R] COG1999 Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC, involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems
|||-----||-|----|-||--------------------------------------|-------  3 [C] COG2048 Heterodisulfide reductase, subunit B
----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||--  3 [NU] COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG
----------------|---|-||||-----------|----|||||-||-|||||||||||||||  3 [T] COG2204 Response regulator containing CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains
--||||-----|----|-------|---------------------|------||------|----  3 [S] COG3439 Uncharacterized conserved protein
||-|||-|-||-|||-|-|||------|||-----|-|----------------------------  2 [P] COG0003 Oxyanion-translocating ATPase
|||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control
-|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||--  2 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC
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||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  2 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0048 Ribosomal protein S12
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0049 Ribosomal protein S7
---------|---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0073 EMAP domain
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  2 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit
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||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase
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||||--|||||||||||-||-|------------|-||----------||---|||---|||||--  2 [BQ] COG0123 Deacetylases, including yeast histone deacetylase and acetoin utilization protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease
-------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase
---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-|||  2 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit
||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--||||||  2 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases
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--|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase
|-||||--|-|||||||-||-|-----||--|--||||----|||||-||-||--||-||||||--  2 [I] COG0365 Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases
|-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||--  2 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase
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|-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||--  2 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase
--|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||--  2 [G] COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase
|||---|||||||-|-||||-|-----||-|-----||----|||-|-||---------||-----  2 [S] COG0432 Uncharacterized conserved protein
|||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--|||||||||||  2 [O] COG0450 Peroxiredoxin
||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  2 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)
||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis
||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-||  2 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  2 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily
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|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain
||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0492 Thioredoxin reductase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0498 Threonine synthase
||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase
|||||||||-|||||||-||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases
|------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||  2 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit
|||-||||||-|-||-||--|---|-|||-||-|-|||----|||||-||---|||---|----||  2 [HC] COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase
--------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [J] COG0566 rRNA methylases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)
|||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0582 Integrase
||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  2 [K] COG0583 Transcriptional regulator
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--||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) 
|||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase
|-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-||||  2 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase
----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--|||||||||||  2 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases
|||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----||||||||||||||||||||||||  2 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class)
-------------|||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase
-|||--|||||-|---||||||--|||||-||||||||||||------|-----------------  2 [R] COG0618 Exopolyphosphatase-related proteins
-----|-------||-|-||-|||--||||||||||||||||-------|--|--||--|--|---  2 [T] COG0631 Serine/threonine protein phosphatase
----------------|||||||||||||-|||||||||---||||||||||||||||||||||||  2 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases
|||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||--  2 [C] COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins)
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7
|||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--||||||||||||||  2 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel
|||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||-------  2 [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit
|-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  2 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily
--|-------------|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b
--||||------|---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0713 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)
|||||||||||||---||||-|---||||||---||||----|||||-||--|--|---|||||--  2 [R] COG0714 MoxR-like ATPases
||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase
--||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--||||||||||||||  2 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein
----------------|||||||||||||||-----------||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
|||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [R] COG0730 Predicted permeases
--|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||--  2 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins
--|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [O] COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  2 [Q] COG0767 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein
----||----------||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein
----------------|-||----||----|-----------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0797 Lipoproteins
|-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-||  2 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin
|-|------|------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG0811 Biopolymer transport proteins
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase
----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||--  2 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0838 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 3 (chain A)
--||||--|--||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0839 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J)
--|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump
---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  2 [C] COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1
----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases
----------------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG0848 Biopolymer transport protein
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG1007 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N)
--||||----------|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG1008 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)
|||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||-------  2 [C] COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit
|||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||--  2 [C] COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit
||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||-------  2 [HR] COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes
----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease
-|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||---  2 [R] COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases
|||||||||||||||||-||-|----------------------------------------|---  2 [R] COG1100 GTPase SAR1 and related small G proteins
--|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-|||||||||||||  2 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes
|-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  2 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components
-|----|||||||---||------------------------------------------------  2 [L] COG1110 Reverse gyrase
|||||-||||-|-||||||-|------||||---|---|||||||-|--|--|---|--------|  2 [L] COG1112 Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  2 [Q] COG1127 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component
||||----|||||---|||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component
|||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)
|||-||||||||----||--------------------------------------||--------  2 [C] COG1144 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, delta subunit
|||-----||-|----|-------------------------------------------------  2 [C] COG1150 Heterodisulfide reductase, subunit C
--|-------------|||||----||||||||||||||||||||||-||||||||------|---  2 [R] COG1162 Predicted GTPases
----------------||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases
||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--||||||||||||||  2 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning
|-|-||||||||-||||-||------|---|||-||||----|||||--|-----|---|||||-|  2 [M] COG1215 Glycosyltransferases, probably involved in cell wall biogenesis
--||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-|  2 [O] COG1225 Peroxiredoxin
||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-||||||||||||||  2 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component
--||---------||-|||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains
-|----|||||-|---||------------------------------------------------  2 [K] COG1318 Predicted transcriptional regulators
|-------||-|----||-------------------|----------------------------  2 [L] COG1336 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily)
----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||--  2 [N] COG1344 Flagellin and related hook-associated proteins
-||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||--  2 [S] COG1354 Uncharacterized conserved protein
|||-|||||||||||-||--------------------------------------------|---  2 [R] COG1355 Predicted dioxygenase
----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||--  2 [N] COG1360 Flagellar motor protein
--||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|---  2 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases
---|------------||---|----|||-------||----|||||-||||---|--||||||--  2 [K] COG1414 Transcriptional regulator
||||--||||------|-||-|--|-|---------------------||----|-||||||||--  2 [S] COG1432 Uncharacterized conserved protein
----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||--  2 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  2 [Q] COG1463 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, periplasmic component
||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--||||||||||||||  2 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators
-||-------------||--||--|-----------||----|||||-|-|||------||-||--  2 [E] COG1509 Lysine 2,3-aminomutase
----------------||--|----|----|----|||----|||||-||||||||---|||||--  2 [S] COG1561 Uncharacterized stress-induced protein
|||--||||-------||------------------------------------------------  2 [L] COG1583 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily)
----------------||||----------------------|||-|-||-|||||--||||||--  2 [M] COG1596 Periplasmic protein involved in polysaccharide export
--|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||--  2 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein
---|----|-||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  2 [C] COG1622 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2
---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-||||||||||||||||||  2 [O] COG1651 Protein-disulfide isomerase
----------------|-----||||----|-----||----||||||||||||||--||||||||  2 [T] COG1734 DnaK suppressor protein
-||-||||-|-||---||---|----|||-|----|-|--|||||||-||---|||---||-||--  2 [O] COG1765 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation
--|-|||||-|||---||-|-|------------||||----|||||-||-|---|---||-||--  2 [S] COG1801 Uncharacterized conserved protein
--||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components
||||||||--||----|||||-----||--|||--|||-------||--|-----||||||||---  2 [S] COG1917 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  2 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis
-||---||-|------||---------||--------------------------------|-|--  2 [S] COG1993 Uncharacterized conserved protein
--|----------||-|----|-----||||-----|-----|||||-|--|-|||----||-|--  2 [P] COG2032 Cu/Zn superoxide dismutase
||------||||----|--------------------------------|----------------  2 [R] COG2044 Predicted peroxiredoxins
----------------|---|---------------------|||||-|||||||-||-|||||--  2 [I] COG2067 Long-chain fatty acid transport protein
----------------||--------------------------------------||--------  2 [O] COG2143 Thioredoxin-related protein
|-||----|-----|-||||-|-----||||---|-||----|||---||-----|---|||||--  2 [T] COG2203 FOG: GAF domain
|-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||--  2 [P] COG2217 Cation transport ATPase
----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||--  2 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB
----------------||||||--------|-----------|||||-||--||||----------  2 [NU] COG2805 Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT
-|--------------|---|---------------------||||||-|||-||||||---||--  2 [M] COG2870 ADP-heptose synthase, bifunctional sugar kinase/adenylyltransferase
|--|------|||||-|--|-|----||||-------|----|||||-||-----|---|||||--  2 [P] COG2897 Rhodanese-related sulfurtransferase
|-||-----|--|---|--------------------------------|-----|----|-|---  2 [S] COG3174 Predicted membrane protein
----||--|-|||---|--------------------|-----------|------------||--  2 [I] COG3255 Putative sterol carrier protein
--||||||-|||----|-||----------------------------------------------  2 [S] COG3431 Predicted membrane protein
----------------|-------------------|-----------|-----------------  2 [T] COG3434 Predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains
----------------|-------|-----------------|||-|-||-----|----|-|---  2 [KT] COG3604 Transcriptional regulator containing GAF, AAA-type ATPase, and DNA binding domains
----------------|-||----------------------|||-|--|-----|||--|--|--  2 [P] COG3696 Putative silver efflux pump
--|-------------|---||--||----|-----------||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG4591 ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component
----------------|-||-|-----------------------------------------|--  2 [S] COG4636 Uncharacterized protein conserved in cyanobacteria
----------------|--------------------------------|-----|----------  2 [C] COG4654 Cytochrome c551/c552
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  2 [N] COG4786 Flagellar basal body rod protein
--|--------|----|-------------------------------------------------  2 [S] COG4831 Uncharacterized conserved protein
----------------|-------------------------|||||-||||||||----------  2 [NU] COG4969 Tfp pilus assembly protein, major pilin PilA
|||---|-|-------||--|---|-------|-------------|-||-|------|-------  2 [C] COG5016 Pyruvate/oxaloacetate carboxyltransferase
||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||--  1 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||--  1 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase
|||-||--||-|-||-||||-|----|||-||--|||||---|||||--|--||||---|||||--  1 [P] COG0004 Ammonia permease
|||||||||||||||-||||-------||||-||-|||----|--||--|--|------||-|---  1 [F] COG0005 Purine nucleoside phosphorylase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase
||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||--  1 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---|||||||  1 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5)
||-||||||||--|--|||-------|||-|--||-||----------------------------  1 [S] COG0011 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase
--|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||--  1 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase
-------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0021 Transketolase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase
---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||--  1 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase)
|||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase]
---|--||---|----|-|||------||||----|||----|||||-||--||||---||-||--  1 [H] COG0029 Aspartate oxidase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)
--||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0031 Cysteine synthase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase
|--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||--  1 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase
-|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||--  1 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase
||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  1 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||--  1 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0051 Ribosomal protein S10
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2
||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--||||||||  1 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase
-||---||--||-|--|-||||||--|||-||||--||----|||||-||||-------||-|---  1 [G] COG0058 Glucan phosphorylase
|||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [G] COG0061 Predicted sugar kinase
|||||||||||||||-||||-|----|||||-----------|||||-||--|--|||||||||--  1 [S] COG0062 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||--  1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase
||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---|||||||||||||  1 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog)
||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit
|||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit
|||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||--  1 [E] COG0067 Glutamate synthase domain 1
|||---||||------|-||----------|-----------|||-|---------|||-------  1 [O] COG0068 Hydrogenase maturation factor
|||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||--  1 [E] COG0069 Glutamate synthase domain 2
|||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||--  1 [E] COG0070 Glutamate synthase domain 3
|||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---|||||||  1 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit
||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||--  1 [E] COG0077 Prephenate dehydratase
|||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase
|||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0082 Chorismate synthase
-|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||-------  1 [E] COG0083 Homoserine kinase
|||---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0084 Mg-dependent DNase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11
|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase
|||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase
---|||--|-|||||-|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  1 [O] COG0109 Polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)
|||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||--  1 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase
-------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0125 Thymidylate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase
|||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--||||||||  1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase
-|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||--  1 [H] COG0132 Dethiobiotin synthetase
||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase
||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase
||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase
--||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful)
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase
||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase
-||--|--|||||||-|-||-------|-------|-|------------------||-|||||--  1 [EQ] COG0145 N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit
-||--|---||||||-|-||-------|----------------------------||-|||||--  1 [EQ] COG0146 N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0148 Enolase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase
||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---|||||||||||||  1 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases
--------|-||-||-|-||-|----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||--  1 [P] COG0155 Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)
-|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes
||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||--  1 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain
-|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  1 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase
||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0164 Ribonuclease HII
||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase
-|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase
||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||----  1 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase
|||-|||||||--||||-||----||--------------------------------------||  1 [I] COG0170 Dolichol kinase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||--  1 [H] COG0171 NAD synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [E] COG0174 Glutamine synthetase
-|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||--  1 [G] COG0176 Transaldolase
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-|||||||||||||||  1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase
|||-|||||||||||-|||||---------------|------------|--|-------|-|---  1 [J] COG0182 Predicted translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit
--||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||  1 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase
-------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||--  1 [G] COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase
-------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase
-------------|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0194 Guanylate kinase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0195 Transcription elongation factor
-------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0196 FAD synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY
||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0203 Ribosomal protein L17
-------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|---  1 [G] COG0205 6-phosphofructokinase
||||||||||------||||||--||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [D] COG0206 Cell division GTPase
|-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0211 Ribosomal protein L27
|--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase
--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0216 Protein chain release factor A
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein
-|||--||||---|--||--|---------||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0218 Predicted GTPase
-------------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase
|-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-|||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component
-------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0227 Ribosomal protein L28
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0228 Ribosomal protein S16
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0230 Ribosomal protein L34
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0233 Ribosome recycling factor
--|----------||-||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10)
--|----------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0238 Ribosomal protein S18
-|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation
|-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10
----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||--  1 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase
--|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-||||||||||||||||||  1 [FP] COG0248 Exopolyphosphatase
--||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---|||||||  1 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family)
|||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0250 Transcription antiterminator
---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family
||------||------|||||-||--|||||---||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0254 Ribosomal protein L31
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0257 Ribosomal protein L36
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)
------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-||||||||||||  1 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0261 Ribosomal protein L21
--|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||--  1 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts
|-||------||-||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0267 Ribosomal protein L33
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0268 Ribosomal protein S20
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II)
|--|||----|-|---||||-|--|-|||||||||||||||||||||-|-||-------||-|---  1 [F] COG0274 Deoxyribose-phosphate aldolase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis
----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase)
--||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||--  1 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases
-|--||----------|-|-|------||-|-----------||||||||||-||-|||---|---  1 [G] COG0279 Phosphoheptose isomerase
---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---|||||||  1 [F] COG0283 Cytidylate kinase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase
||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase
|||-----||------||||--||--|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3)
-------------|--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0291 Ribosomal protein L35
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0292 Ribosomal protein L20
|||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes
--|--------|-|--|-||||||--|||----|--|-----|||||-||||---|---||-|---  1 [G] COG0296 1,4-alpha-glucan branching enzyme
-|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|---  1 [G] COG0297 Glycogen synthase
--||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN
----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--|||||||||||  1 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I
|||||||||||||---|-||-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0303 Molybdopterin biosynthesis enzyme
-------------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0305 Replicative DNA helicase
---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain
|||||||||||||---|-||----------|-----------|||-|---------|||-------  1 [O] COG0309 Hydrogenase maturation factor
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0313 Predicted methyltransferases
|||||||||-|||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0314 Molybdopterin converting factor, large subunit
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0315 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme
--|----------||-|-||-|----||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  1 [S] COG0316 Uncharacterized conserved protein
----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-|  1 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase
---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  1 [H] COG0320 Lipoate synthase
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex
--||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---|||||||  1 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase)
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase
--|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold
|||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase
----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0333 Ribosomal protein L32
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0335 Ribosomal protein L19
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase
||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD
|||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase
----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||--  1 [S] COG0344 Predicted membrane protein
|-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase
||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-|  1 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase
|||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase
----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
-------------||-|-||-|----||||------------||||||||||||||---|||||||  1 [R] COG0354 Predicted aminomethyltransferase related to GcvT
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit)
--|----------|--|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a
----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type)
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0359 Ribosomal protein L9
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0360 Ribosomal protein S6
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1)
-------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||--  1 [G] COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase
|||---|||||-----||||-|--------||--||------|||||-||--|--||||----|--  1 [P] COG0370 Fe2+ transport system protein B
|-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [C] COG0372 Citrate synthase
||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||-------  1 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase
|||---||||------|-||-|--------------------|||-|---------|||-------  1 [R] COG0375 Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases
|||-----||----|-|-||||----|||-----|--||---|||||--||----||||||||---  1 [OK] COG0378 Ni2+-binding GTPase involved in regulation of expression and maturation of urease and hydrogenase
||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||--  1 [H] COG0379 Quinolinate synthase
|||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases
--|----------|--|-||------|--|----|-||----|||||--|---|||---|||||--  1 [R] COG0385 Predicted Na+-dependent transporter
-||-------------||||-------||-----|-|-----|||-|--------|----------  1 [R] COG0390 ABC-type uncharacterized transport system, permease component
||||----||---|--||||-|----||||||||||||----|||||-|--|--------------  1 [S] COG0391 Uncharacterized conserved protein
||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||--  1 [M] COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis
|||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||--  1 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||--  1 [E] COG0403 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), N-terminal domain
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--||||---|||||--  1 [E] COG0404 Glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)
--|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase
|||---||||------|-||----------|-----------|||-|---------|||-------  1 [O] COG0409 Hydrogenase maturation factor
--|-|------|-||-|-||-------|||------|-----|||||--|-----|---||-||--  1 [Q] COG0412 Dienelactone hydrolase and related enzymes
---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||--  1 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase
-------------||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||--  1 [H] COG0414 Panthothenate synthetase
----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||--  1 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme
||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||----------------  1 [L] COG0419 ATPase involved in DNA repair
||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|-----  1 [L] COG0420 DNA repair exonuclease
-|--|||||||||||-||---|----|---|--|--||----||||||-|--||||||----|---  1 [E] COG0421 Spermidine synthase
||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||--  1 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC
--|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation
||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||--  1 [O] COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation
|||---|||-------|||||---------|-----------|||-|--|-----|----------  1 [C] COG0426 Uncharacterized flavoproteins
||||--||--||||||||-|-|---||||------|------|||-|--|---|||--|-|-----  1 [P] COG0428 Predicted divalent heavy-metal cations transporter
||||--|||||||||||--|----------------------|||-|--|-----|----------  1 [A] COG0430 RNA 3'-terminal phosphate cyclase
|||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||--  1 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0443 Molecular chaperone
--|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||---  1 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division
||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains
|||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase
|||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-|  1 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases
||-|--||||------||-|----||-||||-----||----------||-----||||-------  1 [D] COG0455 ATPases involved in chromosome partitioning
||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||--  1 [R] COG0456 Acetyltransferases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family)
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase
|||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|  1 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases
--|----------||-||--||||||----|-----||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type
||||||||||||||--||||---------------------------------------||-|---  1 [T] COG0467 RecA-superfamily ATPases implicated in signal transduction
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase
|||||||||||||||||||||||||-||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication
||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||----  1 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters
|||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||||  1 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase
|||-|--------||||-|||-----||||||||-||||||||||||--|----------|||---  1 [P] COG0474 Cation transport ATPase
|-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA
||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--||||||||  1 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0486 Predicted GTPase
||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning
--------|-------|----|-----||||||---|-----------------------------  1 [P] COG0490 Putative regulatory, ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels
--|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||||  1 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases
|-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes
||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||--  1 [R] COG0496 Predicted acid phosphatase
----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair
|||||||||||||||-||||------||||-------------------|--|--|---|||||--  1 [H] COG0499 S-adenosylhomocysteine hydrolase
|||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||--  1 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function
|||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||--  1 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase)
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  1 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II
|||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||  1 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases
---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|---  1 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit
|||||||||||||---|--|-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0521 Molybdopterin biosynthesis enzymes
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins
--|----------||-|-||||----|||-----|-||----|||||-||--||||||-|||||--  1 [R] COG0523 Putative GTPases (G3E family)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0527 Aspartokinases
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0528 Uridylate kinase
-------||---|||-|-|--|-----||-|-----||----||||||||--|--|--|-||||--  1 [P] COG0529 Adenylylsulfate kinase and related kinases
||||||||||||-||-|||-----||-----------|----|||||-|--|--------|-----  1 [P] COG0530 Ca2+/Na+ antiporter
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity
||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||--  1 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump
|||||||||||||---||||-|-----||-||--|-||-----------|-----|----|-|---  1 [R] COG0535 Predicted Fe-S oxidoreductases
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0536 Predicted GTPase
---|||--|-|||||-||||-|-----||--|--||||----|||||--|-|---|||-|||||--  1 [C] COG0538 Isocitrate dehydrogenases
-------------||-||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0539 Ribosomal protein S1
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||--  1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)
|-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||--  1 [R] COG0546 Predicted phosphatases
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-|  1 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0550 Topoisomerase IA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase
---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||--  1 [C] COG0554 Glycerol kinase
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex
---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [K] COG0557 Exoribonuclease R
--||--|||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases
-------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific
||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||----  1 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||--  1 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component
|||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--||||||||||||||  1 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component
|||||||||||||||||----|--------------------|||||-||||----|||-------  1 [S] COG0585 Uncharacterized conserved protein
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit
--|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---|||||||  1 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog)
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase
-||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-|  1 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters
--|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||---  1 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components
||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes
--||||----||-||-|--|-|----||||-|--||||----|||||-||-||--|---|||||--  1 [CR] COG0604 NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductases
|-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [P] COG0605 Superoxide dismutase
|--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-|  1 [O] COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity
||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease
|||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|--  1 [H] COG0611 Thiamine monophosphate kinase
||||----|--||---||||-|--------|------|----|||||-||||-|||----------  1 [R] COG0613 Predicted metal-dependent phosphoesterases (PHP family)
|||||||||||||||||--------------|--|||----------------------------|  1 [MI] COG0615 Cytidylyltransferase
|||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||--  1 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent)
----------------|-||-|||---|||-|--||||----|||-||-|||-|||||||||||||  1 [I] COG0623 Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH)
-|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases
||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0628 Predicted permease
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein
---|---------||||-||-|||--|---------------||||||||||-|||---|||||||  1 [C] COG0633 Ferredoxin
----------------||--||----||||||-|||||||||||||||||||||||---|||||--  1 [F] COG0634 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase
||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K
|||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||--  1 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators
---|------------|-||-|-----||--------------------|----------|-||--  1 [R] COG0645 Predicted kinase
---|--|||--||||-||--|-----|||--|||||||----|||||--|--------||||||||  1 [G] COG0647 Predicted sugar phosphatases of the HAD superfamily
||||||||--||||||||----||---||||---|||||||||||||||-----------------  1 [L] COG0648 Endonuclease IV
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)
|||-----||-|-||-|---||-----||||--|||||----||-||-||--|--|---|||-|-|  1 [R] COG0655 Multimeric flavodoxin WrbA
----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-|  1 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein
--|----------||||-||--||--||||-|---|||----|||-|-||-|---|||-||-|---  1 [P] COG0659 Sulfate permease and related transporters (MFS superfamily)
|||---||||------|||||------||-------||----|||||-||--||||||-|||||--  1 [G] COG0662 Mannose-6-phosphate isomerase
|||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--||||||||  1 [R] COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily
-------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases
--|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating)
---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||--  1 [C] COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases)
----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase
||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-|||||||  1 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase
|-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||--  1 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins
||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--||||||||  1 [R] COG0679 Predicted permeases
|||---||||-|----|-||----------|-----------|||-|---------|||-------  1 [C] COG0680 Ni,Fe-hydrogenase maturation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0681 Signal peptidase I
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase
--|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase
|---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---|||||||  1 [J] COG0689 RNase PH
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0691 tmRNA-binding protein
-||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||--  1 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase
----------------|||-|-----|||||-|||||||||||--||----|----|||-|||-||  1 [G] COG0698 Ribose 5-phosphate isomerase RpiB
|||-----||------||||-------||-|-||-|||----|||-------------|-------  1 [R] COG0701 Predicted permeases
---|---------||-|-||-|----|----|--||||----|||||-|||-|--|---|||||--  1 [MG] COG0702 Predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerases
--|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0703 Shikimate kinase
|||||||||||||---||||-|---|||||||||||-||-|||||||-||--|--|---|||||--  1 [P] COG0704 Phosphate uptake regulator
-||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||--  1 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC
--|------|-|----||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase
-|-------|||----|-------------------------|||||--|||------|-|-----  1 [E] COG0709 Selenophosphate synthase
||||||-|||||-||-|-----||-------||||||-----|||-|------||-----------  1 [E] COG0710 3-dehydroquinate dehydratase
-------------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein)
|||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-|||||||||||||||||  1 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase
||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---|||||||||||||  1 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [P] COG0725 ABC-type molybdate transport system, periplasmic component
----------------|---|---------------------|||||-||||||||---|||||--  1 [M] COG0729 Outer membrane protein
-|||--|||-------|---|-|||-|------|||||----------|-||-||-|||-------  1 [R] COG0733 Na+-dependent transporters of the SNF family
-------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||  1 [I] COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)
|--|----|----||-|||--|--|-|---|||-||||-|--|||||-|-||---|||-||-|---  1 [F] COG0737 5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases
----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|--  1 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase
----------------||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain
|||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||--  1 [H] COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A
--|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||---  1 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component
-------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit
-------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-|||||||  1 [F] COG0756 dUTPase
----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-|  1 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake
----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||-  1 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein
----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||--  1 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0763 Lipid A disaccharide synthetase
----------------||||||||------||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase
|||------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase
----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit
|||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [C] COG0778 Nitroreductase
----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------|-|---||||-------------||-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0781 Transcription termination factor
|-|---|||-|-|---||||||--|-||||--||--||------------||----||-||||---  1 [O] COG0785 Cytochrome c biogenesis protein
--------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0787 Alanine racemase
---|------------|-||-|----|||-------||----|||-|-|||||--|||||||-|--  1 [F] COG0788 Formyltetrahydrofolate hydrolase
--|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators
----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||--  1 [L] COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase
----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0793 Periplasmic protease
|||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation
----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||--  1 [M] COG0796 Glutamate racemase
----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [S] COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase
----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase
--||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC
----------------||||||--||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing
----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II
----------------||||||---|----||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase)
----------------|--||---------------------|||||-||||||||||||||||--  1 [M] COG0810 Periplasmic protein TonB, links inner and outer membranes
----------------||||-|||||||||------------|||||-||||-|||||||||||||  1 [M] COG0815 Apolipoprotein N-acyltransferase
----------------||||||||--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis)
----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||--  1 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis
--||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||  1 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation
|-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [R] COG0824 Predicted thioesterase
----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit
|||------|-|----|--|||--------||||||||----|||||-||||-|||||||||----  1 [O] COG0826 Collagenase and related proteases
----------------|-||--||||----|||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0828 Ribosomal protein S21
--||--|||-------||||-|--------|-----------|||||-||--|---||-|||||-|  1 [M] COG0836 Mannose-1-phosphate guanylyltransferase
------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|--  1 [K] COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family
---------|------||--||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [D] COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division
----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||---  1 [D] COG0850 Septum formation inhibitor
----------------||||-|----|||||---||||----|||||--|--||||||||--||--  1 [H] COG0853 Aspartate 1-decarboxylase
----------------|-||----------------------|||||-||--||||||||||||--  1 [H] COG0854 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A
----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||--  1 [M] COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||--  1 [E] COG1003 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), C-terminal domain
-|||---||--|----|-||------|||---|---||----|||||-||-||--|--||||||||  1 [M] COG1004 Predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase
||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-|  1 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases
-------------||-|----|----|-------|-||----|||||-||--|--|--|-|-----  1 [C] COG1017 Hemoglobin-like flavoprotein
---|----|-|-|||||-|||---||||||---------------|--||||--------------  1 [I] COG1022 Long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)
---|------------|----|-----||--|----||---------------------|--|---  1 [G] COG1023 Predicted 6-phosphogluconate dehydrogenase
---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---|||||||  1 [I] COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase
--|-|||||-|-|---|-----------------|-||-----------|-----|----|-|---  1 [O] COG1030 Membrane-bound serine protease (ClpP class)
----------------||||-|-----||-|-----------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG1034 NADH dehydrogenase/NADH:ubiquinone oxidoreductase 75 kD subunit (chain G)
----------------|-----||-------||||||-||||------------------------  1 [L] COG1039 Ribonuclease HIII
----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase
--||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---|||||||  1 [C] COG1048 Aconitase A
|||---|||||||---|-||-|----||||||-|-|||-------|--||-----|---|||||-|  1 [F] COG1051 ADP-ribose pyrophosphatase
----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||--  1 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases
||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit
-------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||--  1 [H] COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase
-|--||--|--|----||--|---------------------------------------------  1 [L] COG1059 Thermostable 8-oxoguanine DNA glycosylase
|---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----|||  1 [D] COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis
|||||||||||||--|||--|----------||||||||-||------------------------  1 [R] COG1078 HD superfamily phosphohydrolases
|------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||--  1 [M] COG1087 UDP-glucose 4-epimerase
|-|-----|-------|-||-------||-|-----------|||-|-||--|---||-|-|||--  1 [M] COG1089 GDP-D-mannose dehydratase
|-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-||||  1 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component
|-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  1 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component
--||--||--||-|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components
--|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-||||||  1 [GM] COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component
----------------||||||||||----------------|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component
|||-----||-|----||------------------------------------------------  1 [C] COG1148 Heterodisulfide reductase, subunit A and related polyferredoxins
----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||--  1 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1157 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase
----------------||--|||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG1158 Transcription termination factor
----------------||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG1159 GTPase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG1160 Predicted GTPases
--|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||---  1 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components
|||-|||||||||---||--|------||-||||||------|||||-||||---|----------  1 [O] COG1180 Pyruvate-formate lyase-activating enzyme
--|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)
-------------||-|||||||||||||||||-||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG1186 Protein chain release factor B
--|-----|-------|||||----|||||||||-|||||----------------||||||||||  1 [J] COG1189 Predicted rRNA methylase
--|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||-----  1 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II)
----------------||||--|||--||-|---||||----|||||-||-----||||-------  1 [K] COG1191 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit
|-||--||--------||||||---|----||||||||------------------|||-------  1 [L] COG1193 Mismatch repair ATPase (MutS family)
-||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||--  1 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase
||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|--  1 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases
----------------||||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [LK] COG1200 RecG-like helicase
|||---|||-|||---||--|-----------|----|----|||||----|--------------  1 [R] COG1203 Predicted helicases
|||||||||||||||||-------------------------|----------------||-----  1 [R] COG1204 Superfamily II helicase
----------------||||||---------|||||||---------------------|||||--  1 [J] COG1206 NAD(FAD)-utilizing enzyme possibly involved in translation
----------------||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains)
|||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||--  1 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon)
|||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||--  1 [M] COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase
------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||--  1 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1212 CMP-2-keto-3-deoxyoctulosonic acid synthetase
|-----|||---|---|---|----------------------------|--------|----|--  1 [M] COG1213 Predicted sugar nucleotidyltransferases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone
-------------||-|-||--||--||||------------|||||||||||-----||||||||  1 [P] COG1218 3'-Phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase
-------------|--||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit
----------------||-------|--------||||----|||||||||||--|||||||||||  1 [O] COG1220 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), ATPase subunit
--|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||--  1 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component
--||--|-|-|--||-|----|||--||||----||||-------|---------|-------|--  1 [H] COG1232 Protoporphyrinogen oxidase
||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---|||||||  1 [R] COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I
-||------|------|-------------------------|||||-||||||||--||||||||  1 [S] COG1238 Predicted membrane protein
-|-------|------||--|---------|||-||||----|||||-|-----------------  1 [R] COG1242 Predicted Fe-S oxidoreductase
--||------------|----|-----|||------||----||||||||-|-|||----------  1 [E] COG1246 N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferases
||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  1 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes
--|-------------|----------||-|---|-||----|||||--|-----|---||-||--  1 [C] COG1251 NAD(P)H-nitrite reductase
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [N] COG1256 Flagellar hook-associated protein
--||----|-|||---||||--||--||||------------------------------------  1 [S] COG1259 Uncharacterized conserved protein
|-|---|||-||||--||--------||||------------------------------|-----  1 [I] COG1260 Myo-inositol-1-phosphate synthase
----------------||------------------------||||||||-----|||||||||--  1 [NO] COG1261 Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein
|-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||--  1 [R] COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease
|||---||-||-|---|---|-----------|--|||----|||||-||||-||||||-----||  1 [I] COG1267 Phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins
--||||--|-------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--||||||||  1 [C] COG1271 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1
----------------|----|-------------|||----|||||--------|----|-|---  1 [P] COG1276 Putative copper export protein
---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---|||||||  1 [K] COG1278 Cold shock proteins
----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||--  1 [O] COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family
----------------|-||||--|--||-||-|-|||----|||||--|||---|---|||----  1 [S] COG1285 Uncharacterized membrane protein
---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--||||||||||||||  1 [C] COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex
----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||--  1 [N] COG1291 Flagellar motor component
--||------------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--||||||||  1 [C] COG1294 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2
--|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1 [S] COG1295 Predicted membrane protein
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1298 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhA
--||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-||||  1 [C] COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters
|-|||||||||||||||-||-|-----||--------------||||--|-----|----------  1 [R] COG1310 Predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily
|||---|||||-|---||------------|-----------------------------------  1 [R] COG1313 Uncharacterized Fe-S protein PflX, homolog of pyruvate formate lyase activating proteins
----------------|-|||||||||||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG
|-|-|||||||-|--|||-|-|-|------------------|||||-----|--|--------||  1 [P] COG1324 Uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations
|-||||--|-|||---|--|-|||---||-|-----|------------------------||---  1 [O] COG1331 Highly conserved protein containing a thioredoxin domain
----------------|-||------||||------||---------------|||----------  1 [O] COG1333 ResB protein required for cytochrome c biosynthesis
----------------||------------|-----||----------||------|||-------  1 [N] COG1334 Uncharacterized flagellar protein FlaG
--|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||--  1 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1338 Flagellar biosynthesis pathway, component FliP
----------------||------||----|----|||----|||||-||-----||||-------  1 [N] COG1345 Flagellar capping protein
----------------||--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---||||---  1 [KG] COG1349 Transcriptional regulators of sugar metabolism
|-|-|||||-|||---||------------------------------------------------  1 [R] COG1350 Predicted alternative tryptophan synthase beta-subunit (paralog of TrpB)
---|||||--|||---||||--|||||||||-------------------------|||-----||  1 [F] COG1351 Predicted alternative thymidylate synthase
|||--||-||||----||---------||--------|----------------------------  1 [R] COG1353 Predicted hydrolase of the HD superfamily (permuted catalytic motifs)
|||-----||---||-||||-|----||||||--||||-----------|---|||---|||||--  1 [E] COG1364 N-acetylglutamate synthase (N-acetylornithine aminotransferase)
--------|-------||-------------------|----------------------------  1 [L] COG1367 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily)
|||||||||||||---||---------||-------------------------------------  1 [S] COG1371 Uncharacterized conserved protein
-|--||||-|--||--|-||-|-----|||------|-----------------------------  1 [L] COG1372 Intein/homing endonuclease
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1377 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhB
----------------||||||--||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  1 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|||-||||||---||-||--||-----||-||--||||----|||||-|-----------|-----  1 [ER] COG1387 Histidinol phosphatase and related hydrolases of the PHP family
----------------|----|||-||||-||--||||-------|--||||--------------  1 [M] COG1388 FOG: LysM repeat
----------------|---------||||------------|||||-||||-|||---|||||--  1 [OT] COG1391 Glutamine synthetase adenylyltransferase
|-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||||  1 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators
-||-----|-------|--|-|--------|--|--------|||-|---------------|---  1 [O] COG1397 ADP-ribosylglycohydrolase
----------------||||-|----||||||||||||----|||||-||||||||----------  1 [R] COG1399 Predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein
|-|---|---||----|-|--|-----------|--|-----|--|----------|||-------  1 [V] COG1401 GTPase subunit of restriction endonuclease
|-|-------|-----|--|-|||--||||||---|||----|------------||||-|-|---  1 [R] COG1408 Predicted phosphohydrolases
|-|---|||||-|||-|-||--||--||||||--|||-----|||||-||||---|---|||||--  1 [R] COG1409 Predicted phosphohydrolases
|--|||--|-------|----|---------------------------------|------|---  1 [S] COG1416 Uncharacterized conserved protein
||||||||||------||--||--||----|||||||||-|||||-|---------|||||-----  1 [R] COG1418 Predicted HD superfamily hydrolase
----------------||------||----|----|||----------||-----||||-------  1 [N] COG1419 Flagellar GTP-binding protein
|||---||||--|---|-------------------------------------------------  1 [L] COG1423 ATP-dependent DNA ligase, homolog of eukaryotic ligase III
-|--------------|-----------------|-|-----------------------------  1 [H] COG1424 Pimeloyl-CoA synthetase
----||--|-|-|---|----|||-------------|------------------|||-------  1 [R] COG1427 Predicted periplasmic solute-binding protein
-|------||------|-------------------------------------------------  1 [J] COG1431 Uncharacterized protein containing piwi/argonaute domain
----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---|||||||  1 [S] COG1434 Uncharacterized conserved protein
-||-||||--||----|-||----|-----------------------------------------  1 [G] COG1449 Alpha-amylase/alpha-mannosidase
----------------|---|-||------------------|||||-||--|--|--|---||--  1 [NU] COG1450 Type II secretory pathway, component PulD
||||--|||-------|---||----|---|-------||--|||||-||--||||||||||||-|  1 [R] COG1451 Predicted metal-dependent hydrolase
----------------|-------||----------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1452 Organic solvent tolerance protein OstA
|-|||||||--||||-||--|-----|---||-|||||----|||||-||-|---|---||||---  1 [C] COG1454 Alcohol dehydrogenase, class IV
|||---||||--|---|-------------------------------------------------  1 [R] COG1458 Predicted DNA-binding protein containing PIN domain
----------------|-||-|--------------------|||||--|---|||-------|--  1 [M] COG1462 Uncharacterized protein involved in formation of curli polymers
||||----||------|-------------------------------------------------  1 [E] COG1465 Predicted alternative 3-dehydroquinate synthase
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit
|||---|||-|||---||-||-----------|----|----------------------------  1 [L] COG1468 RecB family exonuclease
--|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||--  1 [H] COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis
--|-------------|----------||-|||||||||---||||||-------|---||-|---  1 [L] COG1484 DNA replication protein
--|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||---  1 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase
|---||--|-|||---||||----------|------|----|||||-||||-------|||-|--  1 [R] COG1489 DNA-binding protein, stimulates sugar fermentation
-------------||-||--||----|||-||||||||----|||||-||||-|||----------  1 [J] COG1490 D-Tyr-tRNAtyr deacylase
----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--||||||||  1 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein
|||||||||||||||||-------------------------------------------------  1 [J] COG1503 Peptide chain release factor 1 (eRF1)
----------------||--------||||------------------------------------  1 [S] COG1507 Uncharacterized conserved protein
----------------|-----||||----|----|||----|||||-||--||||||||||||--  1 [K] COG1508 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma54 homolog
----------------|-||----------------------|||----|-----|----------  1 [P] COG1513 Cyanate lyase
|||-|||||||||---||-|-|----|---|---|-||----|||||--|-----|---|||||--  1 [J] COG1514 2'-5' RNA ligase
---||||||||||-|-||-|-|--------|-----|-----|||||-----|-------------  1 [L] COG1515 Deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V)
----------------||------||----|----|||----|||||-||-----||||-------  1 [NUO] COG1516 Flagellin-specific chaperone FliS
-|---||---||----|-------------------------------------------------  1 [L] COG1517 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
|||-|||-|||||---||-||------||---|--|-|----|||||----|--|---|-------  1 [L] COG1518 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1519 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase
----------------||||||--||-||||----|||-|---------|--|||||||----|--  1 [K] COG1521 Putative transcriptional regulator, homolog of Bvg accessory factor
||-|--||-|---||-|--|------|-------|-|--|||-------|||-||---|||||---  1 [L] COG1525 Micrococcal nuclease (thermonuclease) homologs
----------|||---|----|--|--||-------||----|||----|-----|---||-||--  1 [C] COG1529 Aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, large subunit CoxL/CutL homologs
---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---|||||||  1 [J] COG1530 Ribonucleases G and E
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [N] COG1536 Flagellar motor switch protein
-|-------|------||------------------------------------------------  1 [S] COG1542 Uncharacterized conserved protein
----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||||  1 [J] COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1)
---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||--  1 [R] COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced)
---|||----|||---|-||-|------------|-||----------------------------  1 [S] COG1547 Uncharacterized conserved protein
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [N] COG1558 Flagellar basal body rod protein
----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein
----------------|-||--------------------------------||||||||||||||  1 [S] COG1565 Uncharacterized conserved protein
----------------|-----------------|-|-----|||||-|||--|||---|||||||  1 [V] COG1566 Multidrug resistance efflux pump
-|----|||-------|-------------------------------------------------  1 [R] COG1568 Predicted methyltransferases
--|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--|||||||||||||  1 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase
--||||||----|---||--||-----||------|||--------|--|-----|---|||||--  1 [R] COG1574 Predicted metal-dependent hydrolase with the TIM-barrel fold
|||---|||||-----||------------------------------------------------  1 [S] COG1578 Uncharacterized conserved protein
----------------|----|||||||-||-------------------------|||-------  1 [R] COG1579 Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding
----------------||------||----|-----||----|||||-||-----||||-------  1 [N] COG1580 Flagellar basal body-associated protein
-|--|||||-|||---||------------|-----||----||||||-|--|--|----------  1 [E] COG1586 S-adenosylmethionine decarboxylase
||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||---  1 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase
--------||-|----||-------------------|----------------------------  1 [L] COG1604 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily)
||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG1605 Chorismate mutase
---|--------|||-|-||-|----||||----||||-----------|--|--|---|||||||  1 [O] COG1612 Uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly
|||-|||||||||---||------------------------------------------------  1 [F] COG1618 Predicted nucleotide kinase
-|||--||||------|-||-|||||----||||||||-|||------------------------  1 [S] COG1624 Uncharacterized conserved protein
----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG1629 Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport
|-|---||---|----||------------|-----||---------------------||||---  1 [S] COG1633 Uncharacterized conserved protein
----------------||--|---------|||-|---------------|||||-|||-----||  1 [S] COG1636 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------|-----|-||||||-||||--|||--------|||||-||||---|----------  1 [G] COG1640 4-alpha-glucanotransferase
||||||--|||-|||-|---|------||-|---||||----||||||||--|||----|||||--  1 [H] COG1648 Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain)
----|||||||||---||------|--||--------------------------|----------  1 [S] COG1656 Uncharacterized conserved protein
|||-|||||-------|---|----|----|||||||||-||------------------------  1 [L] COG1658 Small primase-like proteins (Toprim domain)
----------------||---------||-------------------------------------  1 [S] COG1659 Uncharacterized protein, linocin/CFP29 homolog
--|--------|----|-|-----------------------||||-----|--------------  1 [L] COG1662 Transposase and inactivated derivatives, IS1 family
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1663 Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1677 Flagellar hook-basal body protein
--|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-||||||  1 [GM] COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component
|-|-------------||--|---------|----|||--------|-||-----|---||-|---  1 [S] COG1683 Uncharacterized conserved protein
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1684 Flagellar biosynthesis pathway, component FliR
|||---|||-|||---||------------------------------------------------  1 [L] COG1688 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily)
|||||||||||||--|||-|-|----|||-|------|----|||-|--|-----|----------  1 [S] COG1690 Uncharacterized conserved protein
----------------|---||---|--------||||||||-----------------|||||--  1 [S] COG1692 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-|  1 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase
|-----|---------|-------------------------------------------------  1 [S] COG1700 Uncharacterized conserved protein
---------||-|---||||-|----||||-|||||||----|||||-||-|||||---|||||--  1 [T] COG1702 Phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase
----------------||-------|----------------||||||||-----|||||||||--  1 [N] COG1706 Flagellar basal-body P-ring protein
|||---|||||||---||------------|---|-----------|---|--------||----|  1 [R] COG1708 Predicted nucleotidyltransferases
|||------|------|-|-----------------------------------------------  1 [R] COG1719 Predicted hydrocarbon binding protein (contains V4R domain)
--|||||||-|-|---||||-|---|-|||-----|||----------||-----|---|||||--  1 [R] COG1721 Uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)
----------------|-------------------------|||||-||--||||---|||||||  1 [S] COG1729 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|||||||||||||||-|-------------------------------------------------  1 [O] COG1730 Predicted prefoldin, molecular chaperone implicated in de novo protein folding
----------------|-------||----|----|------||||||||-----|||||||||--  1 [N] COG1749 Flagellar hook protein FlgE
-------------||||||-|---|--|||-|----||----|||-|-||--||||---|||||||  1 [R] COG1752 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily
||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega
|||||-|||||||---|-----------------||||----|||||-|-||---|--|||||---  1 [H] COG1763 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1766 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway lipoprotein
--------|-------||------------------------------------------------  1 [L] COG1769 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily)
-------------|||||--||--|-----||--||||----------------------------  1 [S] COG1774 Uncharacterized homolog of PSP1
--|-------------|---|---------------------|||||-|||||||||||-------  1 [R] COG1778 Low specificity phosphatase (HAD superfamily)
-------------||-|--|----------------|------------|--|-------------  1 [S] COG1791 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain
----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----|||  1 [M] COG1792 Cell shape-determining protein
|||||||||||||||||----------||-------||----------|||--||---|||-||--  1 [L] COG1793 ATP-dependent DNA ligase
|-|-||-------||-|----|------------||||----------------------------  1 [L] COG1796 DNA polymerase IV (family X)
|||||||||||||---|---------------|---------------------------------  1 [E] COG1812 Archaeal S-adenosylmethionine synthetase
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [N] COG1815 Flagellar basal body protein
----------------||||-|||||||||----||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc)
||||||||||||----||||-|----||||-|--||||--------------------|-||||--  1 [F] COG1828 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, PurS component
||||--||||-||---|--|--||------------------|||||----|-------||-|---  1 [G] COG1830 DhnA-type fructose-1,6-bisphosphate aldolase and related enzymes
---|||||--|||---||---|---------|||-|||----|||||--------|--|||-|---  1 [R] COG1832 Predicted CoA-binding protein
----------------||||||||||-|||||||-|||------------------|||-------  1 [R] COG1837 Predicted RNA-binding protein (contains KH domain)
|||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||---  1 [C] COG1838 Tartrate dehydratase beta subunit/Fumarate hydratase class I, C-terminal domain
||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----||||||  1 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E
--|-------------|-||-|----|||-|----|||----|||||-||------------||--  1 [KT] COG1842 Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [N] COG1843 Flagellar hook capping protein
---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  1 [C] COG1845 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3
-|----||--------|-------------------------------------------------  1 [S] COG1851 Uncharacterized conserved protein
|-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---|||||||  1 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family
------||---|----||------------------------------------------------  1 [S] COG1856 Uncharacterized homolog of biotin synthetase
|||---|||-|||---|---|---------------------------------------------  1 [L] COG1857 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
--|-------------|----|--------------------|||||-||-|---|||||--|---  1 [P] COG1858 Cytochrome c peroxidase
----------------||--|-||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG1862 Preprotein translocase subunit YajC
|||||||||||||||||-------------------------------------------------  1 [J] COG1867 N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase
----------------||------||----|----|||----||||||||-----||||||||---  1 [N] COG1868 Flagellar motor switch protein
|-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--|  1 [R] COG1881 Phospholipid-binding protein
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1886 Flagellar motor switch/type III secretory pathway protein
---|--|||-|-|||-|--|------|||-|||-||||----|||||-||-----|------||--  1 [H] COG1893 Ketopantoate reductase
|-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---|||||||  1 [C] COG1894 NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit
|-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---|||||||  1 [C] COG1905 NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit
-|||--|||||||---||-|-------------|||-------||-----------||--------  1 [S] COG1912 Uncharacterized conserved protein
-|-|--|||||||---|-------------------------------------------------  1 [R] COG1913 Predicted Zn-dependent proteases
||--|----|------|-------------------------|||||--|||----|||||-|---  1 [E] COG1921 Selenocysteine synthase [seryl-tRNASer selenium transferase]
-|--------------||------------|---||||----|||||-||||||||----||||--  1 [R] COG1923 Uncharacterized host factor I protein
|||-----||------||--|---------||---|------|||---------------------  1 [I] COG1924 Activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase (HSP70-class ATPase domain)
--|-||----------|--|-------||--------------------------|||--|-|---  1 [R] COG1926 Predicted phosphoribosyltransferases
----------------|-||----------------------|||||-||||||||||||||||--  1 [S] COG1934 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||--  1 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase
----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||--  1 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase
|||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||---  1 [C] COG1951 Tartrate dehydratase alpha subunit/Fumarate hydratase class I, N-terminal domain
----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator
--|----|--|-|---|---|-----|||-||----||----|||||-||||-||||||-------  1 [T] COG1966 Carbon starvation protein, predicted membrane protein
|--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||--  1 [V] COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein
----------------|-------------------------|||-|---------|||-------  1 [C] COG1969 Ni,Fe-hydrogenase I cytochrome b subunit
--||||-||-||----|-||-|-----||-----||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG1977 Molybdopterin converting factor, small subunit
----------------||------------|-----|-----------------------------  1 [S] COG1978 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||--|||||||||---|-------------------------------------------------  1 [G] COG1980 Archaeal fructose 1,6-bisphosphatase
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1987 Flagellar biosynthesis pathway, component FliQ
||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||--  1 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases
||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||--  1 [R] COG1994 Zn-dependent proteases
----------------|-|||----------------|----|||||-||-|||||||||||||--  1 [H] COG1995 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein
--|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--|  1 [L] COG2003 DNA repair proteins
||------||------|----|-----||------------------------||-----------  1 [R] COG2018 Uncharacterized distant relative of homeotic protein bithoraxoid
----------------|-||||----|||||-----||----|||||-||--||||--||||||--  1 [H] COG2022 Uncharacterized enzyme of thiazole biosynthesis
--||||--|-|||---|--|-|----|||-------|-----|||||--|-|---|--||||||--  1 [R] COG2041 Sulfite oxidase and related enzymes
-------||-|||||-|-||-|--------------||--------------------|-------  1 [P] COG2046 ATP sulfurylase (sulfate adenylyltransferase)
--|||||||-||--|-|----|----|||--|||||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [Q] COG2050 Uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism
--------|-|||---|-||------||||------------|||||-|||||--|--||||||--  1 [T] COG2062 Phosphohistidine phosphatase SixA
----------------||------------------------||||||||-----|||||||||--  1 [N] COG2063 Flagellar basal body L-ring protein
--------|----|--||-|||----|||-||||||||-----------|--||||||||||-|--  1 [R] COG2070 Dioxygenases related to 2-nitropropane dioxygenase
----------------|---------|||-||-|||||-|--|||||-||||---||||-------  1 [O] COG2077 Peroxiredoxin
|||||||||||||||-||------------|-----------------------------------  1 [S] COG2078 Uncharacterized conserved protein
|-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||--  1 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases
-||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||--  1 [U] COG2095 Multiple antibiotic transporter
|-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||--  1 [H] COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis
----||--|-|||---|----|||-------------|------------------|||-------  1 [R] COG2107 Predicted periplasmic solute-binding protein
--|-||||||||||--||--||-----||---|-||------|||-|--|-----|------|---  1 [R] COG2110 Predicted phosphatase homologous to the C-terminal domain of histone macroH2A1
-|----|||-|||---|-------------------------------------------------  1 [T] COG2112 Predicted Ser/Thr protein kinase
----------------|---|-----------------------------------|||--|||||  1 [S] COG2121 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|||---|||||||---|-------------------------------------------|-----  1 [R] COG2129 Predicted phosphoesterases, related to the Icc protein
---|------|--||-|--|------|||-------||----|||||--|||||||--||||||--  1 [Q] COG2132 Putative multicopper oxidases
----------------|-||------|||-------------|||-|-------------------  1 [S] COG2149 Predicted membrane protein
--|---||----|---||-----------------|---------|--------------------  1 [G] COG2152 Predicted glycosylase
---|------||-||-|-||------||||------------------||--|--|----||||--  1 [H] COG2154 Pterin-4a-carbinolamine dehydratase
----------------|-||-------||--------------------|------------||--  1 [S] COG2187 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------||-|-|--||----|------|----------||-----|---|--|---  1 [T] COG2206 HD-GYP domain
--||||--|-||----|---|-------------|-|-----------------------------  1 [S] COG2210 Uncharacterized conserved protein
----------------|---------||||----|-||----|||-|--|-----|----||-|--  1 [P] COG2223 Nitrate/nitrite transporter
--|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis
||-------|---||-|----|-----||------------------------||-----------  1 [R] COG2229 Predicted GTPase
--|-------------|----|----|||||-----------|||||-||-----|||||||||--  1 [M] COG2230 Cyclopropane fatty acid synthase and related methyltransferases
|||-||-----|----||----------------||--------------------|||-------  1 [L] COG2231 Uncharacterized protein related to Endonuclease III
|-||--||||---||-|--|-------||-|-----||----|||-|-||--|----------|--  1 [R] COG2234 Predicted aminopeptidases
-|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||--  1 [R] COG2262 GTPases
----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase
------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase
----------------|-------|-----------------|||||||-|||------||-||--  1 [J] COG2269 Truncated, possibly inactive, lysyl-tRNA synthetase (class II)
-------------||-|---------|||||----|||---------------------|||||--  1 [R] COG2270 Permeases of the major facilitator superfamily
---|--|--|--|---|----|---|-------|||||---------------------||||---  1 [E] COG2309 Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)
---|------------|----|------------||||----------------------------  1 [S] COG2322 Predicted membrane protein
----------------|-||-|---------------------------|-----|---|--|---  1 [O] COG2370 Hydrogenase/urease accessory protein
----------------||---|--------------------------------------------  1 [S] COG2380 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-------------|-||-|--------------------------------------------  1 [R] COG2389 Uncharacterized metal-binding protein
---|---||-|-----|-||-------|--------------------------------------  1 [R] COG2402 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain
|||----||-|-----|-----------------|-||----------------------------  1 [S] COG2445 Uncharacterized conserved protein
--|---||---|----|||-----------------------------------------------  1 [R] COG2516 Biotin synthase-related enzyme
||-||||||||||||-||--------||||------------------------------------  1 [J] COG2519 tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase and related methyltransferases
----------------|-||----------|------------------|---|||--||||||--  1 [R] COG2607 Predicted ATPase (AAA+ superfamily)
--||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||----  1 [P] COG2608 Copper chaperone
-|--------------|-------------|-----------------||-----|--|-------  1 [P] COG2703 Hemerythrin
----------------||------------|-----||----|||||-||-----|----------  1 [KNU] COG2747 Negative regulator of flagellin synthesis (anti-sigma28 factor)
--|-----|-------|-||-|--------------|-----------||-----|---||-|---  1 [T] COG2770 FOG: HAMP domain
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits
----------------||---|||||----------------|||||-||||-|||-------|||  1 [M] COG2825 Outer membrane protein
-|||----|-------|----|--||----|-----||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG2834 Outer membrane lipoprotein-sorting protein
----------|-----|----|----|---------------------||-|-|||--||||||||  1 [S] COG2847 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------||-|-------------------||----------||--||||||||||||||  1 [C] COG2857 Cytochrome c1
--|-------------|----|--------------------|||-||||||---|||||---|--  1 [S] COG2862 Predicted membrane protein
--|-----|-------|-------------------------|||||-||||---|--|-|-----  1 [C] COG2864 Cytochrome b subunit of formate dehydrogenase
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG2877 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (KDO) 8-phosphate synthase
----------------|--||-||||-||-------------||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG2885 Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors
----------------||||||--------|----|||----||||||||--||||||-||||---  1 [D] COG2894 Septum formation inhibitor-activating ATPase
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG2896 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme
--------|-------|---------|----------|----------||----------------  1 [T] COG2905 Predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains
----------------|-||-------------------------|--||--||||---||-||--  1 [Q] COG2931 RTX toxins and related Ca2+-binding proteins
----------------|---------------------------------------|||-------  1 [S] COG2952 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|---|-||--|-----||--------------||-----|---||||-||  1 [R] COG2984 ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component
----------------|-----------------|-|-----------|-----------------  1 [S] COG3002 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|-------------------------------||--------|-------  1 [S] COG3016 Uncharacterized iron-regulated protein
----------|-----|-------------------------------||-|------|-|-----  1 [R] COG3019 Predicted metal-binding protein
----------------|---|-----|-----||--------|||||-||||-|||--|----|-|  1 [S] COG3022 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|-------------------------|-----|-----------------  1 [U] COG3031 Type II secretory pathway, component PulC
----------------|-------------------------|||||-||------|||||||---  1 [S] COG3034 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|-------------------------|||||--|||--------|-----  1 [O] COG3058 Uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation
--||------------|--||-----|-----|-||-------|||---|-|-|||||-||-|--|  1 [S] COG3177 Uncharacterized conserved protein
----------------||||----------------------|||-|-||-||--|---|||||--  1 [M] COG3206 Uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis
-||-||---|-|----|-------------------------|||-|--|||------|-|-----  1 [J] COG3276 Selenocysteine-specific translation elongation factor
----------------|-------------------------|||||---||----------|---  1 [R] COG3302 DMSO reductase anchor subunit
-|-|----|-------|---------|-------||---------|------|--------|||--  1 [L] COG3316 Transposase and inactivated derivatives
----------------|-------------------||------------------||||||||--  1 [S] COG3334 Uncharacterized conserved protein
--------|-------|--------------------|----------------------------  1 [L] COG3337 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
----------------|---------------------------------------|||-------  1 [S] COG3400 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|--------------------|----|||-|------------|------  1 [G] COG3405 Endoglucanase Y
---|------------||||-|---------------|-----------------|----------  1 [C] COG3411 Ferredoxin
----------------|---|--------------------------------------|||||||  1 [S] COG3494 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------||--|---------||---|------------------------------  1 [S] COG3580 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------||--|---------||---|------------------------------  1 [S] COG3581 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|---------------|-------------------|---------|---  1 [L] COG3598 RecA-family ATPase
|||-|||||||||---||---|--------------------------------------------  1 [G] COG3635 Predicted phosphoglycerate mutase, AP superfamily
----------------|-||-|--------||---|||-----------|---|||---|||||--  1 [E] COG3705 ATP phosphoribosyltransferase involved in histidine biosynthesis
----------------|-------------|----|||----|||-|--|-----|----------  1 [KT] COG3829 Transcriptional regulator containing PAS, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains
|||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||---  1 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components
----------------|----|--------|------------------|-----|----------  1 [S] COG3868 Uncharacterized conserved protein
----------------|-------------------------||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG4105 DNA uptake lipoprotein
||--------------|-||-|---|----------------|||||-||||---|--|||--|--  1 [S] COG4121 Uncharacterized conserved protein
--||--------|-|-|-||||----||||||||||||-----------|---||-------|---  1 [R] COG4122 Predicted O-methyltransferase
----------------||--|---------||||||||||--|||||-|-||----||||||||--  1 [R] COG4123 Predicted O-methyltransferase
--------|-------|--|-|----|---------||----|||||-||--|--|----------  1 [R] COG4147 Predicted symporter
--|---------|---|-||------|||-----||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [P] COG4149 ABC-type molybdate transport system, permease component
-|--------------|---------|---------------------------------|-----  1 [R] COG4186 Predicted phosphoesterase or phosphohydrolase
-------------||-|--------------------------------|--|-------------  1 [C] COG4229 Predicted enolase-phosphatase
----------------|-||-----------------------------|----------|-|---  1 [S] COG4244 Predicted membrane protein
----------------|---------|||--------------------------|----------  1 [R] COG4262 Predicted spermidine synthase with an N-terminal membrane domain
----------|||---|-------------------------------------------------  1 [S] COG4353 Uncharacterized conserved protein
----------------|--------------||-|||-----|||---------------------  1 [L] COG4570 Holliday junction resolvase
--|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||---  1 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component
----------------|----------------------------|---|---------||-||||  1 [R] COG4618 ABC-type protease/lipase transport system, ATPase and permease components
---|----|-------|--|---------------------------------------||-----  1 [S] COG4711 Predicted membrane protein
----------------||--|---------------------------------------------  1 [S] COG4752 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------||-||||||||||----------------||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87
----------------|-||----------------------|||||-||--|--|-----|||--  1 [R] COG4783 Putative Zn-dependent protease, contains TPR repeats
----------------||||----------------------|||||-||||||||----------  1 [U] COG4796 Type II secretory pathway, component HofQ
----------||----|-------------------------------------------------  1 [S] COG4911 Uncharacterized conserved protein
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||--  1 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase
----------------|------------------------------------|||---|||||||  1 [T] COG5000 Signal transduction histidine kinase involved in nitrogen fixation and metabolism regulation
----------------|-------||----------------|||||-||||||||---|||||||  1 [M] COG5009 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein
----------------||-------|--------||||----|||||||||||--|||||||||||  1 [O] COG5405 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), peptidase subunit
----------------|--------------------------------------|----|-----  1 [S] COG5501 Predicted secreted protein
----------------|--|----------------------------------------|-|---  1 [S] COG5502 Uncharacterized conserved protein
----------------|-------------------------------------------|----|  1 [R] COG5611 Predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain