| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ ||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 15 [M] COG0438 Glycosyltransferase --|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||--- 12 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component --|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||--- 11 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||--- 11 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||--- 11 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components --|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||--- 11 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 10 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily -|||||||-|||----||||-|---|-||-------------|||-|-----|---||-------- 9 [L] COG0675 Transposase and inactivated derivatives ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|---||||--- 9 [G] COG1175 ABC-type sugar transport systems, permease components ----------------||||-|--|-|||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 9 [T] COG2199 FOG: GGDEF domain ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||-||||||||-||-||--|---||||--- 8 [G] COG0395 ABC-type sugar transport system, permease component |||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 8 [R] COG0517 FOG: CBS domain |-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 8 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 8 [NT] COG0840 Methyl-accepting chemotaxis protein |-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||-- 8 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component |-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 8 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component ---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||-- 8 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase |||-|||||||||----|||||-----||-||-----|----|||-|-||------------|--- 7 [C] COG1032 Fe-S oxidoreductase --||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 7 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components ----------------||-|-|--||----|------|----------||-----|---|--|--- 7 [T] COG2206 HD-GYP domain |||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases --|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) -----------------|--||----|||-||||||||-|--|||||-|||||--|---|||||-- 6 [K] COG1609 Transcriptional regulators ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||----|||||-||-||--|---||||--- 6 [G] COG1653 ABC-type sugar transport system, periplasmic component --|-||----|--||--|||-|----|||-||||||||-|--|||||-||-----|---||-||-- 5 [G] COG0366 Glycosidases |||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 5 [R] COG0457 FOG: TPR repeat |||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||-- 5 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family |-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||-- 5 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins |-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily |||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|--- 5 [C] COG1145 Ferredoxin -----------------|------------|----|||----|||||-|----------||-|--- 5 [G] COG1486 Alpha-galactosidases/6-phospho-beta-glucosidases, family 4 of glycosyl hydrolases |||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||-- 4 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases ||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases |||-----|--|-----|||----------|-----------|||||---||--------|----- 4 [R] COG0641 Arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase) |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 4 [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit ----------------||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain |||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [C] COG0778 Nitroreductase |-||--|||----|||-|||-|--||-||-|----|||----|||||-|||||--|||||||||-- 4 [T] COG0784 FOG: CheY-like receiver --------|---|||--|||----|||||-||-|||||----|||||--|||---|---||||--- 4 [G] COG1070 Sugar (pentulose and hexulose) kinases |-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---||||||| 4 [C] COG1905 NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit |||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--|||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs ||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis ||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-|| 3 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase |||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase ||||--|||||||||--|--|---|----|||||||||-||||||||-||---------------- 3 [R] COG0622 Predicted phosphoesterase |||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||-- 3 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators ||||-||||-|||----|||-|----|||-----||||----|||-|-||---------|||--|| 3 [CP] COG0651 Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit ---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||-- 3 [C] COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases) |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 3 [O] COG0719 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component --|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||-- 3 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins ||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||-- 3 [R] COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily) |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 3 [C] COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit |||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||-- 3 [C] COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit --|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||-- 3 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases |||---||||-|-----|||------|||||-|-||||----|||||--|-----|---|||||-- 3 [G] COG1082 Sugar phosphate isomerases/epimerases |||||-||||-|-||||||-|------||||---|---|||||||-|--|--|---|--------| 3 [L] COG1112 Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits ||||----|||||---|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component ||||||-|||||-----|||-|----|||||-----------|||-|-||--|--||||||||||| 3 [C] COG1146 Ferredoxin ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 3 [N] COG1344 Flagellin and related hook-associated proteins ||||--|||||-|----|-|||--------||||||||||--|||-|--|----------|----- 3 [G] COG1363 Cellulase M and related proteins -----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---||||||| 3 [G] COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases |-|---||---|----||------------|-----||---------------------||||--- 3 [S] COG1633 Uncharacterized conserved protein |||---|||||||---||------------|---|-----------|---|--------||----| 3 [R] COG1708 Predicted nucleotidyltransferases |-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---||||||| 3 [C] COG1894 NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit --||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||-- 3 [L] COG1943 Transposase and inactivated derivatives --|---||----|---||-----------------|---------|-------------------- 3 [G] COG2152 Predicted glycosylase ----|-||--|||----|---|---------|||||||----|||||-|----------|------ 3 [G] COG2182 Maltose-binding periplasmic proteins/domains |-||----|-----|-||||-|||-||||||----|||----|||||-||--|--|--||||||-- 3 [T] COG2202 FOG: PAS/PAC domain -----------------|---|--------|-----||---------------------------- 3 [S] COG2359 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------|-----|-------------|||---|----||||------|------||----- 3 [G] COG3250 Beta-galactosidase/beta-glucuronidase -----------------|||-|--|-----|-----------------||--|------------- 3 [KT] COG3437 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HD-GYP domain |||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||--- 3 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components -------------|||-|------------|----------------------------------- 3 [R] COG4624 Iron only hydrogenase large subunit, C-terminal domain |||||||||||||||-||||-------||||-||-|||----|--||--|--|------||-|--- 2 [F] COG0005 Purine nucleoside phosphorylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases |||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control ||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit |||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 2 [E] COG0069 Glutamate synthase domain 2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0073 EMAP domain |||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||-- 2 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases |||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 2 [H] COG0171 NAD synthase -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|--- 2 [G] COG0205 6-phosphofructokinase ||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--|||||| 2 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases --|----------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein --||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-||||||||| 2 [C] COG0280 Phosphotransacetylase ||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|--- 2 [P] COG0306 Phosphate/sulphate permeases |||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||-- 2 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs ----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||-- 2 [S] COG0344 Predicted membrane protein |||||||||||||-|--|||----------||||-|||----|||||-------------|----- 2 [C] COG0371 Glycerol dehydrogenase and related enzymes ||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----|| 2 [M] COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase -----||----|-||--|||-------||--|||-|-|----|----------------------- 2 [G] COG0383 Alpha-mannosidase |-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||-- 2 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase ||||--||||------||||------|||||---|||-|||||||-|--|--|--|---||||--- 2 [S] COG0392 Predicted integral membrane protein |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 2 [O] COG0396 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, ATPase component ||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||-- 2 [M] COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis ||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||-- 2 [O] COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation |||---|||-------|||||---------|-----------|||-|--|-----|---------- 2 [C] COG0426 Uncharacterized flavoproteins |||---|||||||-|-||||-|-----||-|-----||----|||-|-||---------||----- 2 [S] COG0432 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase -----------------|||||||--||||||-|--||----|||||-|-||-------||-|--- 2 [G] COG0448 ADP-glucose pyrophosphorylase ||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases |||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 2 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases) ||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning ||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0492 Thioredoxin reductase --|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--|||||||| 2 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases ||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain |||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0527 Aspartokinases ||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 2 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump |||||||||||||---||||-|-----||-||--|-||-----------|-----|----|-|--- 2 [R] COG0535 Predicted Fe-S oxidoreductases |------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||| 2 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit |||-||||||-|-||-||--|---|-|||-||-|-|||----|||||-||---|||---|----|| 2 [HC] COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases ---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||-- 2 [C] COG0554 Glycerol kinase |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific ||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 2 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component |||-||--||-|-||--||--|----|||--|---|||-------|---||-||||---|||||-- 2 [S] COG0599 Uncharacterized homolog of gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit -||-----||-------|||||||--|---|--||-||----||||---|||---|---|||||-- 2 [P] COG0600 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component -||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||-- 2 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component ||||----|--||---||||-|--------|------|----|||||-||||-|||---------- 2 [R] COG0613 Predicted metal-dependent phosphoesterases (PHP family) -||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component -|||--|||||-|---||||||--|||||-||||||||||||------|----------------- 2 [R] COG0618 Exopolyphosphatase-related proteins -|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases ||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0628 Predicted permease -|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||-- 2 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases ---|||||--||||||-||-------||||||||||||----|||||--|-----|---|||||-- 2 [R] COG0656 Aldo/keto reductases, related to diketogulonate reductase ||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--|||||||| 2 [R] COG0679 Predicted permeases |||||||||||||---||||-|---|||||||||||-||-|||||||-||--|--|---|||||-- 2 [P] COG0704 Phosphate uptake regulator -||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||-- 2 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid) |||||||||||||---||||-|---||||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 2 [R] COG0714 MoxR-like ATPases -||-----||---||--|||||||--|---|--||-||----||||--||||---|---|||||-- 2 [P] COG0715 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components ----------------||||||--||||||||--||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases ----------------||||----||----||||-|||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains) -------------|||||||||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2 ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein ----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||-- 2 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme --|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-||||||||||||| 2 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain --||--|||--------|||----||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 2 [NT] COG0835 Chemotaxis signal transduction protein ---------|------||--||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [D] COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division ||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--|| 2 [P] COG1006 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit -|||--||||-------|------||-----------|-----------|--------|------- 2 [R] COG1033 Predicted exporters of the RND superfamily ----------------||||-|-----||-|-----------||||||-|--|||||||||||||| 2 [C] COG1034 NADH dehydrogenase/NADH:ubiquinone oxidoreductase 75 kD subunit (chain G) ----|||||-|||----||||-||---|||----||||----||||--||---|||--||--|--- 2 [P] COG1055 Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases |---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----||| 2 [D] COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis --|---|-|-|--||--|--------||--||----------|||||-|-||-------------- 2 [C] COG1085 Galactose-1-phosphate uridylyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 2 [G] COG1109 Phosphomannomutase -||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||-- 2 [P] COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component -||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||-- 2 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components ||||--|||||||----|||||--|-||||||||||||||||-||-|-|-|----|---|||---- 2 [P] COG1122 ABC-type cobalt transport system, ATPase component -----------------|--|---|||----|----||-|--|||||-||||---|---|||||-- 2 [G] COG1129 ABC-type sugar transport system, ATPase component |||---||||-------|------------------------------------------------ 2 [C] COG1149 MinD superfamily P-loop ATPase containing an inserted ferredoxin domain ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG1160 Predicted GTPases -||---||-|||||||-||||----|----||||||||||||------|----||----------- 2 [R] COG1161 Predicted GTPases -----------------|--|-----|--|-|----||----|||||-||||---|---|||||-- 2 [G] COG1172 Ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport systems, permease components |||-|||||||||---||--|------||-||||||------|||||-||||---|---------- 2 [O] COG1180 Pyruvate-formate lyase-activating enzyme --||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-| 2 [O] COG1225 Peroxiredoxin -|------|----|||-|--||--------|||||||-----------|----------------- 2 [C] COG1227 Inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase |-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||-- 2 [R] COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease ---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---||||||| 2 [K] COG1278 Cold shock proteins -----------------|--||||------||||||||---------------------------- 2 [S] COG1302 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|--||----|||-||||||||||||-------|---------------- 2 [S] COG1307 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 2 [K] COG1309 Transcriptional regulator |||---|||||-|---||------------|----------------------------------- 2 [R] COG1313 Uncharacterized Fe-S protein PflX, homolog of pyruvate formate lyase activating proteins |||||||||||||----|---||||-||||||||||||----|||-|-----|---------|--- 2 [K] COG1321 Mn-dependent transcriptional regulator |||--||-||||----||---------||--------|---------------------------- 2 [R] COG1353 Predicted hydrolase of the HD superfamily (permuted catalytic motifs) -----------------||||||||--||-|---||||----------||---------||--|-- 2 [T] COG1366 Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor) -||-|-||--||-----|--|------||----|-|--------------|-----|||---|--| 2 [R] COG1373 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) |||---|||--|-----|---|||------|---|||-----------||||---|---||-|--- 2 [P] COG1392 Phosphate transport regulator (distant homolog of PhoU) |-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---||||||| 2 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators |||-|||||||------|------------|-----------------|----------------- 2 [S] COG1433 Uncharacterized conserved protein |-|||||||--||||-||--|-----|---||-|||||----|||||-||-|---|---||||--- 2 [C] COG1454 Alcohol dehydrogenase, class IV ||||--|||--------|---|---|-|||------|-----|||||-||--|--|-------||| 2 [S] COG1520 FOG: WD40-like repeat ----|||||--|-|||-|-|------|---|----|-|-----------|--|-----|-|-||-- 2 [R] COG1524 Uncharacterized proteins of the AP superfamily ||----|----------|||--------------------------------------------|| 2 [P] COG1563 Predicted subunit of the Multisubunit Na+/H+ antiporter -----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||-- 2 [K] COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog |-|||---|--------|||-------------|--------||||--------|--|--|-||-| 2 [S] COG1598 Uncharacterized conserved protein |||-----||-------|||----------|----------------------------------- 2 [R] COG1606 ATP-utilizing enzymes of the PP-loop superfamily ----|||||||||---||------|--||--------------------------|---------- 2 [S] COG1656 Uncharacterized conserved protein --|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-| 2 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase |-|||||||-|||----|-|||----||||||||||||----|||||-|------|------||-- 2 [K] COG1695 Predicted transcriptional regulators -----------------|--------|---||||||||-|--|||||-||||-|||---|||||-- 2 [K] COG1737 Transcriptional regulators --||----|-|-|----|--||||-||-------|-|-----|||||-||||-||----||||--- 2 [S] COG1738 Uncharacterized conserved protein --||--|||--------|------|-----|----|||----------|-------|||------- 2 [NT] COG1776 Chemotaxis protein CheC, inhibitor of MCP methylation |||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||--- 2 [C] COG1838 Tartrate dehydratase beta subunit/Fumarate hydratase class I, C-terminal domain |||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||-- 2 [K] COG1846 Transcriptional regulators |-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---||||||| 2 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family ------||---------|------------|--|--||-------|------|-------|--|-- 2 [G] COG1874 Beta-galactosidase --|--------------|--|---|-|--|||----||----|||||-||||---|---|||||-- 2 [G] COG1879 ABC-type sugar transport system, periplasmic component ||||||||--||----|||||-----||--|||--|||-------||--|-----||||||||--- 2 [S] COG1917 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain -----------------|--|---------|---||||----|||--------------------- 2 [K] COG1954 Glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (mRNA-binding) ----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator -|---------------|||||---||---------||-|--------||-----|---||-||-- 2 [P] COG2059 Chromate transport protein ChrA ||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--|| 2 [P] COG2111 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhB subunit -----------------|||-|||---||-|---||||---------------------------- 2 [T] COG2172 Anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase) ||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--| 2 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold -----------------|---|--------||||||||---------------------------- 2 [R] COG2344 AT-rich DNA-binding protein ------||--|-|----|------------|--|--------|||||---|--------------- 2 [G] COG2407 L-fucose isomerase and related proteins -------||--------|--|---------||-|---|---------------------------- 2 [S] COG2461 Uncharacterized conserved protein --||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||---- 2 [P] COG2608 Copper chaperone ------||-----||--|-|----------|-----||--------------|--|---------- 2 [G] COG2730 Endoglucanase -----------------|---|--------|----||----------------------------- 2 [C] COG3426 Butyrate kinase -----------------|---------------|--||---------------------|--|--- 2 [Q] COG3458 Acetyl esterase (deacetylase) -----------------|-|----------|------|---------------------|---|-- 2 [G] COG3693 Beta-1,4-xylanase ----|--|--||-----|---|---------|||||||-|--|||||-|----------------- 2 [G] COG3833 ABC-type maltose transport systems, permease component -----------------|||------|||-------------||||---|-----|---|||||-- 2 [PR] COG4638 Phenylpropionate dioxygenase and related ring-hydroxylating dioxygenases, large terminal subunit ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 2 [N] COG4786 Flagellar basal body rod protein ----------------||||----------------------|||||-||||||||---------- 2 [U] COG4796 Type II secretory pathway, component HofQ -|---------------|-|-|----|-------------------|------------|------ 2 [R] COG4928 Predicted P-loop ATPase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase |||-||--||-|-||-||||-|----|||-||--|||||---|||||--|--||||---|||||-- 1 [P] COG0004 Ammonia permease |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5) ||-||||||||--|--|||-------|||-|--||-||---------------------------- 1 [S] COG0011 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase -------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0021 Transketolase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase ---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase) |||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase] |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation) --||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0031 Cysteine synthase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase |--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase -|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase ||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--|||||||| 1 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||-- 1 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase ||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||-- 1 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0048 Ribosomal protein S12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0049 Ribosomal protein S7 ---------|---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0051 Ribosomal protein S10 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2 ||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--|||||||| 1 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase |||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [G] COG0061 Predicted sugar kinase |||||||||||||||-||||-|----|||||-----------|||||-||--|--|||||||||-- 1 [S] COG0062 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||-- 1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase ||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---||||||||||||| 1 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog) |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0067 Glutamate synthase domain 1 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0070 Glutamate synthase domain 3 |||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---||||||| 1 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit ||||||||||||||--||||-|--------||--|-||--------|-||------||-||-||-- 1 [E] COG0075 Serine-pyruvate aminotransferase/archaeal aspartate aminotransferase ||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0077 Prephenate dehydratase |||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase |||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1 ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0082 Chorismate synthase -|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||------- 1 [E] COG0083 Homoserine kinase |||---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0084 Mg-dependent DNase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5 ---|||||---||||-||||--||--|----|||||||-||||||||-||---------------- 1 [H] COG0095 Lipoate-protein ligase A |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11 |||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9 ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase ||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-| 1 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase ||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase -------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0125 Thymidylate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase |||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--|||||||| 1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase ||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase ||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase --||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful) ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase ||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase -|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0148 Enolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase ------|---|--||--|--|---|-|||-||-|--||----|||||-|-||-------------- 1 [G] COG0153 Galactokinase ||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---||||||||||||| 1 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases ||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||-- 1 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase ||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0164 Ribonuclease HII ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase -|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase ||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||---- 1 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [E] COG0174 Glutamine synthetase -|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [G] COG0176 Transaldolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase |||-|||||||||||-|||||---------------|------------|--|-------|-|--- 1 [J] COG0182 Predicted translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17 --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit --||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||| 1 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase -------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||-- 1 [G] COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase -------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase -------------|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0194 Guanylate kinase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0195 Transcription elongation factor -------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0196 FAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0203 Ribosomal protein L17 -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase ||||||||||------||||||--||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0206 Cell division GTPase |-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0211 Ribosomal protein L27 -||---|||--------|---|-----||-||-||||||||||||-|-|------|---||-|--- 1 [F] COG0213 Thymidine phosphorylase |||||||||||||||--|--||----|||||--|||||------------||-------------- 1 [H] COG0214 Pyridoxine biosynthesis enzyme --|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0216 Protein chain release factor A -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein -|||--||||---|--||--|---------|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0218 Predicted GTPase -------------||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 1 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component -------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0227 Ribosomal protein L28 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0228 Ribosomal protein S16 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0230 Ribosomal protein L34 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0233 Ribosome recycling factor --|----------||-||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10) ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0238 Ribosomal protein S18 -|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation |-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10 ----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase -------------|---|--------|---||-||-||-||-||||||||-|---|---|||||-- 1 [G] COG0246 Mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenases --|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-|||||||||||||||||| 1 [FP] COG0248 Exopolyphosphatase --||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family) |||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0250 Transcription antiterminator ---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family ||------||------|||||-||--|||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0254 Ribosomal protein L31 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0257 Ribosomal protein L36 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0261 Ribosomal protein L21 --|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-| 1 [H] COG0262 Dihydrofolate reductase --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts |-||------||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0267 Ribosomal protein L33 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0268 Ribosomal protein S20 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II) |--|||----|-|---||||-|--|-|||||||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 1 [F] COG0274 Deoxyribose-phosphate aldolase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis --|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0281 Malic enzyme --|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-|| 1 [C] COG0282 Acetate kinase ---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---||||||| 1 [F] COG0283 Cytidylate kinase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase ---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase ||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase |||-----||------||||--||--|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3) -------------|--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0291 Ribosomal protein L35 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0292 Ribosomal protein L20 |||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes ---|------|-|||--|---|---|-||||||||||||||||||||-|-||-------||-||-- 1 [F] COG0295 Cytidine deaminase -|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|--- 1 [G] COG0297 Glycogen synthase --||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN |||||||||||||----|------|-----|||||||||||||||||-||||-------------- 1 [H] COG0301 Thiamine biosynthesis ATP pyrophosphatase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0305 Replicative DNA helicase ---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain |||||||||||||||--|---|----|||||--|||||------------||-------------- 1 [H] COG0311 Predicted glutamine amidotransferase involved in pyridoxine biosynthesis ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0313 Predicted methyltransferases ----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-| 1 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex --||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase) -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase --|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold |||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0333 Ribosomal protein L32 --|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|-- 1 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0335 Ribosomal protein L19 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase ----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase ||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD |||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase |-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase |||-----||------||||-|----|||-||---||-----|||||-||||||||---|||||-- 1 [E] COG0347 Nitrogen regulatory protein PII ||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-| 1 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase |||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit) --|----------|--|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type) --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0359 Ribosomal protein L9 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0360 Ribosomal protein S6 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1) -------------|||-|||--||||||||-|-||||-----|||||||-||-||----||||--- 1 [G] COG0362 6-phosphogluconate dehydrogenase -------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase -------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase |||---|||||-----||||-|--------||--||------|||||-||--|--||||----|-- 1 [P] COG0370 Fe2+ transport system protein B |-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [C] COG0372 Citrate synthase --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases ||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||-- 1 [H] COG0379 Quinolinate synthase -||-------------||||-------||-----|-|-----|||-|--------|---------- 1 [R] COG0390 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ||||----||---|--||||-|----||||||||||||----|||||-|--|-------------- 1 [S] COG0391 Uncharacterized conserved protein |||||||||--|-----|||-------|||-|---|-|----|||-|-|--|-----------|-- 1 [S] COG0393 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||-- 1 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG0403 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), N-terminal domain ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--||||---|||||-- 1 [E] COG0404 Glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase) --|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||-- 1 [G] COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG0410 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component -|------|-|||----|||||-----------|--------|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG0411 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component ---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase -------------||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0414 Panthothenate synthetase ----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||-- 1 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme ||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||---------------- 1 [L] COG0419 ATPase involved in DNA repair ||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|----- 1 [L] COG0420 DNA repair exonuclease -|--|||||||||||-||---|----|---|--|--||----||||||-|--||||||----|--- 1 [E] COG0421 Spermidine synthase ||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||-- 1 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC --|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation ||||--||--||||||||-|-|---||||------|------|||-|--|---|||--|-|----- 1 [P] COG0428 Predicted divalent heavy-metal cations transporter |||||||||||||---||||-|-----||---|----|----||||---|-|---|---|||||-- 1 [R] COG0433 Predicted ATPase |||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||-- 1 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0443 Molecular chaperone -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division ||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains |||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--||||||||||| 1 [O] COG0450 Peroxiredoxin |||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase ||-|--||||------||-|----||-||||-----||----------||-----||||------- 1 [D] COG0455 ATPases involved in chromosome partitioning ||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 1 [R] COG0456 Acetyltransferases ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ) ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family) |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase |||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| 1 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases --|----------||-||--||||||----|-----|||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type ||||||||||||||--||||---------------------------------------||-|--- 1 [T] COG0467 RecA-superfamily ATPases implicated in signal transduction |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase -|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||-- 1 [G] COG0469 Pyruvate kinase |||||||||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication |||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--|||||||| 1 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA -------------||-||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain ||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--|||||||| 1 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0486 Predicted GTPase |-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase ||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||-- 1 [R] COG0496 Predicted acid phosphatase |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0498 Threonine synthase |||||||||||||||-||||------||||-------------------|--|--|---|||||-- 1 [H] COG0499 S-adenosylhomocysteine hydrolase |||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 1 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes ||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||--- 1 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase) ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit ---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||-- 1 [E] COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding) |||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit |-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||-- 1 [E] COG0520 Selenocysteine lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0528 Uridylate kinase ||||||||||||-||-|||-----||-----------|----|||||-|--|--------|----- 1 [P] COG0530 Ca2+/Na+ antiporter |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0536 Predicted GTPase ---|||--|-|||||-||||-|-----||--|--||||----|||||--|-|---|||-|||||-- 1 [C] COG0538 Isocitrate dehydrogenases -------------||-||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0539 Ribosomal protein S1 |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor) ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-| 1 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0550 Topoisomerase IA |||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||------- 1 [L] COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase --||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|----- 1 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family ---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [K] COG0557 Exoribonuclease R |-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG0559 Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease components |-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|--- 1 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily --||--|||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases --------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [J] COG0566 rRNA methylases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32) ||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||---- 1 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease ---|---------||--|||-|-|||----|||||||||-|||||||-|-||-------------- 1 [F] COG0572 Uridine kinase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||-- 1 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component |||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--|||||||||||||| 1 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein) ----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||-- 1 [R] COG0579 Predicted dehydrogenase |-------|--|-|||-||-||---|----||||||||-|||||||||-||||--|---|||||-- 1 [G] COG0580 Glycerol uptake facilitator and related permeases (Major Intrinsic Protein Family) ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 1 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component |||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0582 Integrase ---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||-- 1 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog) ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation -----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0594 RNase P protein component ||||--||-|-------|||||----||||||||||||||||--------------|||||||||| 1 [R] COG0595 Predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase -||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-| 1 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters |--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-| 1 [O] COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity ||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease ----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--||||||||||| 1 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases |||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class) -------------|||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase ||||--||||-||----|||||----||||||||||||||||-||-|---|--------|||---- 1 [P] COG0619 ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters |||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||-- 1 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent) --||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit ----------------||--||----||||||-|||||||||||||||||||||||---|||||-- 1 [F] COG0634 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase ----------------|||||||||||||-|||||||||---|||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases ||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K --|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 1 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 1 [NT] COG0643 Chemotaxis protein histidine kinase and related kinases |||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||-- 1 [C] COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins) -----------------|||||----|||||---||||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG0646 Methionine synthase I (cobalamin-dependent), methyltransferase domain ---|--|||--||||-||--|-----|||--|||||||----|||||--|--------|||||||| 1 [G] COG0647 Predicted sugar phosphatases of the HAD superfamily ||||||||--||||||||----||---||||---|||||||||||||||----------------- 1 [L] COG0648 Endonuclease IV --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7 |||--|||-|-|-----|---------||-------------|||-|------------------- 1 [C] COG0650 Formate hydrogenlyase subunit 4 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase) --|--|--|--|-||--|||-|--|-|||||||-||-|----|||||-||--|--|---||-||-- 1 [I] COG0657 Esterase/lipase ----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-| 1 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein |||---||||------|||||------||-------||----|||||-||--||||||-|||||-- 1 [G] COG0662 Mannose-6-phosphate isomerase -------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases |||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--|||||||||||||| 1 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel ----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase --------|---|||--||||---|---------|||-----||||---|-|-||---|--|--|| 1 [P] COG0672 High-affinity Fe2+/Pb2+ permease ||----||--|------|------------|---|-------|||||-||-||--|---||-|--- 1 [M] COG0677 UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0681 Signal peptidase I ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase -|-|----|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG0683 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component --|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase ---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 1 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0691 tmRNA-binding protein |-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---||||||| 1 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins ----------------|||-|-----|||||-|||||||||||--||----|----|||-|||-|| 1 [G] COG0698 Ribose 5-phosphate isomerase RpiB |||-----||------||||-------||-|-||-|||----|||-------------|------- 1 [R] COG0701 Predicted permeases --|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0703 Shikimate kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC --|------|-|----||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase --|-------------|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b -------------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein) -----------------|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase ||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---||||||||||||| 1 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit --|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||-- 1 [G] COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase ----------------|||||||||||||||-----------|||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor |||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [R] COG0730 Predicted permeases |||||||||||||||--||||---------|-------------------------|||------- 1 [C] COG0731 Fe-S oxidoreductases -------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||| 1 [I] COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase) |--|----|----||-|||--|--|-|---|||-||||-|--|||||-|-||---|||-||-|--- 1 [F] COG0737 5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases -----------------|||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase ----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|-- 1 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase -----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein) -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains |||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1 ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit -----------------|||||----|||||-----||-------|-||||||--|||||||||-- 1 [E] COG0757 3-dehydroquinate dehydratase II ----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-| 1 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake ----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||- 1 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein -----------------||||-||||||||||||||||----|||||-||||---||||||-||-- 1 [S] COG0762 Predicted integral membrane protein ----------------||||||||------||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 1 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase |||------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase --|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||-- 1 [F] COG0775 Nucleoside phosphorylase ----||----------||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein ----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------|-|---||||-------------||-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0781 Transcription termination factor -----------------|---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0782 Transcription elongation factor |-|---|||-|-|---||||||--|-||||--||--||------------||----||-||||--- 1 [O] COG0785 Cytochrome c biogenesis protein ----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||-- 1 [L] COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase ----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0793 Periplasmic protease -----------------|||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0795 Predicted permeases |-|---|-|----|---|||------|||-|----||--------------|--|----|------ 1 [P] COG0798 Arsenite efflux pump ACR3 and related permeases ----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein -----------------|||----|-----||||--||----|||||-||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0800 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase |-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-|| 1 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin ----------------||||||--||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing ----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II ----------------||||||---|----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase ----------------||||-|||||||||------------|||||-||||-||||||||||||| 1 [M] COG0815 Apolipoprotein N-acyltransferase ----------------||||||||--|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis) -----------------||||||||-||||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit -----------------|||-|--------||||||||----|||||-|||||||||||||||--- 1 [M] COG0818 Diacylglycerol kinase ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis --||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||| 1 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation --||--|||-------||||-|--------|-----------|||||-||--|---||-|||||-| 1 [M] COG0836 Mannose-1-phosphate guanylyltransferase --|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump ----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0845 Membrane-fusion protein ------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|-- 1 [K] COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family ----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases ----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||--- 1 [D] COG0850 Septum formation inhibitor --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit ----------------||||-|----|||||---||||----|||||--|--||||||||--||-- 1 [H] COG0853 Aspartate 1-decarboxylase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A -|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||-- 1 [L] COG0863 DNA modification methylase ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG1003 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), C-terminal domain -----------------|---|--------||||||||-|--|||||||-------||-||-|--- 1 [G] COG1015 Phosphopentomutase ----||-----------|-|------|---|-----||----|||||-||||-||-||||-|---- 1 [E] COG1027 Aspartate ammonia-lyase -|||--|||||-|----|------------------------------------------------ 1 [C] COG1031 Uncharacterized Fe-S oxidoreductase ----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases --||----------|--|||------||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [E] COG1045 Serine acetyltransferase ||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit -------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase ---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||-- 1 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA -|--||--|--|----||--|--------------------------------------------- 1 [L] COG1059 Thermostable 8-oxoguanine DNA glycosylase ||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||------- 1 [HR] COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes ----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease ||||||||||-------|------|-----|-----||----|||||-||||-------------- 1 [O] COG1067 Predicted ATP-dependent protease --||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||-- 1 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily |||||||||||||--|||--|----------||||||||-||------------------------ 1 [R] COG1078 HD superfamily phosphohydrolases ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG1079 Uncharacterized ABC-type transport system, permease component -|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-|||||| 1 [MG] COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases -|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||--- 1 [R] COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases -----------------|---|--------||||||||---------------------------- 1 [J] COG1098 Predicted RNA binding protein (contains ribosomal protein S1 domain) --|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-||||||||||||| 1 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes -----------------|--||---||||-||||||||--|||||||-||||---|---------- 1 [G] COG1105 Fructose-1-phosphate kinase and related fructose-6-phosphate kinase (PfkB) |-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 1 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components -|----|||||||---||------------------------------------------------ 1 [L] COG1110 Reverse gyrase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 1 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component |-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 1 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 1 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component ----------------||||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component |--|---||-|-|----|||-------||-||||||||---------------------------- 1 [C] COG1141 Ferredoxin |||---||||-------|||----------------------|||||------------------- 1 [C] COG1142 Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2 |||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I) |||-||||||||----||--------------------------------------||-------- 1 [C] COG1144 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, delta subunit |||-----||-|----||------------------------------------------------ 1 [C] COG1148 Heterodisulfide reductase, subunit A and related polyferredoxins |||----|||-------|--|---------|-----------|||||------------------- 1 [C] COG1151 6Fe-6S prismane cluster-containing protein ----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||-- 1 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1157 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase ----------------||--|||||||||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG1158 Transcription termination factor ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1159 GTPase --|-------------|||||----||||||||||||||||||||||-||||||||------|--- 1 [R] COG1162 Predicted GTPases --||-------------|--||||||-----|||||||||||------|-------||||||||-- 1 [E] COG1164 Oligoendopeptidase F ----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||-- 1 [KE] COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs ---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [E] COG1171 Threonine dehydratase ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 1 [E] COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II --|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes -||||||||-|-|||--|------------------------------------------------ 1 [J] COG1184 Translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase) -------------||-|||||||||||||||||-||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1186 Protein chain release factor B ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases -----------------|--|-----|---||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 1 [J] COG1188 Ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit (S4 paralog) --|-----|-------|||||----|||||||||-|||||----------------|||||||||| 1 [J] COG1189 Predicted rRNA methylase --|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||----- 1 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II) ----------------||||--|||--||-|---||||----|||||-||-----||||------- 1 [K] COG1191 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit |-||--||--------||||||---|----||||||||------------------|||------- 1 [L] COG1193 Mismatch repair ATPase (MutS family) -||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||-- 1 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases -----------------|||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase ----------------||||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [LK] COG1200 RecG-like helicase |||---|||-|||---||--|-----------|----|----|||||----|-------------- 1 [R] COG1203 Predicted helicases ----------------||||||---------|||||||---------------------|||||-- 1 [J] COG1206 NAD(FAD)-utilizing enzyme possibly involved in translation ----------------||||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains) |-|||||||--||----|||-|----|||||||---||----|||||--|--||||---||-||-- 1 [M] COG1209 dTDP-glucose pyrophosphorylase ------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit ----------------||-------|--------||||----|||||||||||--||||||||||| 1 [O] COG1220 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), ATPase subunit -----------------|||----------|----||-----|||||-||-----|---------- 1 [KT] COG1221 Transcriptional regulators containing an AAA-type ATPase domain and a DNA-binding domain ||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-|||||||||||||| 1 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component |--||||-|--|-|---|--||-----||-|-|-|-||-------||-||-----|---|||||-- 1 [Q] COG1228 Imidazolonepropionase and related amidohydrolases --|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||-- 1 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component ||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||-- 1 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III |||---||||-------|------------|---------------|------------------- 1 [R] COG1237 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily II -|-------|------||--|---------|||-||||----|||||-|----------------- 1 [R] COG1242 Predicted Fe-S oxidoreductase ||||||||||||-|||-|--|---------|----------------------------------- 1 [KB] COG1243 Histone acetyltransferase ||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 1 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes --||---------||-|||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains -||-|||||-|||----|-|-|---|--|-||||||||----|||||-||-|---|----|-|--- 1 [C] COG1254 Acylphosphatases ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1256 Flagellar hook-associated protein --||----|-|||---||||--||--||||------------------------------------ 1 [S] COG1259 Uncharacterized conserved protein |-|---|||-||||--||--------||||------------------------------|----- 1 [I] COG1260 Myo-inositol-1-phosphate synthase ----------------||------------------------||||||||-----|||||||||-- 1 [NO] COG1261 Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein |-||--|||--------||||||-|-|---||||||||---------------------||||-|| 1 [R] COG1268 Uncharacterized conserved protein --|||||||--||----|||-|--||----|---|||||||--------|-----|----||---- 1 [R] COG1277 ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component |-|-||--|||||----||--|----|---------||----|||||-|||||--|--||||||-- 1 [E] COG1280 Putative threonine efflux protein ----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family ---------|-------|--|-||-|----||||||||||||------|----------|||---- 1 [S] COG1284 Uncharacterized conserved protein ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 1 [N] COG1291 Flagellar motor component ||||||||||||||||-|||||---|----||||||||------------------|||------- 1 [K] COG1293 Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1298 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhA |-|---||||||----||||-|-----||||----|||-----------||||--|---||-||-- 1 [E] COG1305 Transglutaminase-like enzymes, putative cysteine proteases ----||-----------|------------||----||----|||||---|--------||||--- 1 [G] COG1312 D-mannonate dehydratase -----------------|------||----|------|----------|----------------- 1 [L] COG1315 Predicted polymerase, most proteins contain PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain -----------------|||-|--||||||||||||||---------------------------- 1 [K] COG1316 Transcriptional regulator -----------------|----||||----|-----||----||||||||-----||||---|--- 1 [NU] COG1317 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein -|----|||||-|---||------------------------------------------------ 1 [K] COG1318 Predicted transcriptional regulators ||||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|| 1 [P] COG1320 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhG subunit ||-------|-------|--|---------||||||||-|-------------------------- 1 [R] COG1323 Predicted nucleotidyltransferase |-|-|||||||-|--|||-|-|-|------------------|||||-----|--|--------|| 1 [P] COG1324 Uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations -----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [K] COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains |||---||-|-------|--|---------||||||------|||||-||||---|---------- 1 [F] COG1328 Oxygen-sensitive ribonucleoside-triphosphate reductase |||--||----------|---------||------------------------------------- 1 [L] COG1332 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily) ----------------||------------|-----||----------||------|||------- 1 [N] COG1334 Uncharacterized flagellar protein FlaG --|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||-- 1 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase |-------||-|----||-------------------|---------------------------- 1 [L] COG1336 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily) |||--||--|||-----|-|-------||------------------------------------- 1 [L] COG1337 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily) ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1338 Flagellar biosynthesis pathway, component FliP |||--|--||||-----|-||------||---|----|---------------------------- 1 [L] COG1343 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----||||------- 1 [N] COG1345 Flagellar capping protein ----------------||--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---||||--- 1 [KG] COG1349 Transcriptional regulators of sugar metabolism |-|-|||||-|||---||------------------------------------------------ 1 [R] COG1350 Predicted alternative tryptophan synthase beta-subunit (paralog of TrpB) ---|||||--|||---||||--|||||||||-------------------------|||-----|| 1 [F] COG1351 Predicted alternative thymidylate synthase --||--|||--------|-|----||----|----|||----|||||-||-----|--|||-||-- 1 [NT] COG1352 Methylase of chemotaxis methyl-accepting proteins -||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [S] COG1354 Uncharacterized conserved protein |||-|||||||||||-||--------------------------------------------|--- 1 [R] COG1355 Predicted dioxygenase ||||||||||||||||-|--|---------||||||||---------------------------- 1 [J] COG1358 Ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a) ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 1 [N] COG1360 Flagellar motor protein -||||||||-||-----|------------------------------------------------ 1 [M] COG1361 S-layer domain -------------||--|--|----||||||------------------|---------------- 1 [E] COG1362 Aspartyl aminopeptidase |||-----||---||-||||-|----||||||--||||-----------|---|||---|||||-- 1 [E] COG1364 N-acetylglutamate synthase (N-acetylornithine aminotransferase) --------|-------||-------------------|---------------------------- 1 [L] COG1367 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily) -----------------|------------|||-|||-----|||-|-||||-||-|||||-|--- 1 [M] COG1368 Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily |||||||||||||---||---------||------------------------------------- 1 [S] COG1371 Uncharacterized conserved protein -----------------|||------|||||-----||----|||-|-||---|||---||||--- 1 [S] COG1376 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1377 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhB ----------------||||||--||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-|||||--------|||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [K] COG1386 Predicted transcriptional regulator containing the HTH domain |||-||||||---||-||--||-----||-||--||||----|||||-|-----------|----- 1 [ER] COG1387 Histidinol phosphatase and related hydrolases of the PHP family ----------------||||-|----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [R] COG1399 Predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein ||-|-----||||----|||-------||------|-|---------------------|||||-- 1 [R] COG1402 Uncharacterized protein, putative amidase -----------------|------||----|------|----------|----------------- 1 [N] COG1406 Predicted inhibitor of MCP methylation, homolog of CheC -----------------|||-|----|||||------|----|||||-|||-|--|---|||||-- 1 [E] COG1410 Methionine synthase I, cobalamin-binding domain ---|------------||---|----|||-------||----|||||-||||---|--||||||-- 1 [K] COG1414 Transcriptional regulator ||||||||||------||--||--||----|||||||||-|||||-|---------|||||----- 1 [R] COG1418 Predicted HD superfamily hydrolase ----------------||------||----|----|||----------||-----||||------- 1 [N] COG1419 Flagellar GTP-binding protein -----------------||||-||--||||||||||||||||----------|--|||||||||-- 1 [K] COG1420 Transcriptional regulator of heat shock gene ||---||--|-------|------------------------------------------------ 1 [L] COG1421 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair -----------------|-|--||||-----|||||||----|||||-|||||--|--------|| 1 [S] COG1426 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||-|--||-||------|||----||--------------------------|--|---|||||-- 1 [S] COG1430 Uncharacterized conserved protein ----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---||||||| 1 [S] COG1434 Uncharacterized conserved protein ---||-----|----|-|---|---|----|||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 1 [F] COG1435 Thymidine kinase -----------------|---|-|--||||||||||||----|||||-|-||-------------- 1 [K] COG1438 Arginine repressor |-|--------------|||----------|----------------------------------- 1 [R] COG1453 Predicted oxidoreductases of the aldo/keto reductase family ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||-- 1 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF -----------------|--||----|||-||||||||||||------------------------ 1 [R] COG1461 Predicted kinase related to dihydroxyacetone kinase ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit |||---|||-|||---||-||-----------|----|---------------------------- 1 [L] COG1468 RecB family exonuclease ||||||||||--|----|----------------|-||-----------|--||||---------- 1 [S] COG1469 Uncharacterized conserved protein --||||||---|-----|||||----|||-||-|||||----|||----|||---|--||||||-- 1 [R] COG1473 Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase --|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||-- 1 [H] COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis -|||--|----------|-||-----|---|----|--||---|||--|--|--|-|||------- 1 [S] COG1479 Uncharacterized conserved protein -----------------||||--||-----|----|||---------------------------- 1 [R] COG1480 Predicted membrane-associated HD superfamily hydrolase -----------------|--|-----||||||||||||||||------------------------ 1 [S] COG1481 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------|----||--|---|---|||||||||||||-|--|||||-|--|-------------- 1 [G] COG1482 Phosphomannose isomerase ------||||--|----|------------------------------------------|----- 1 [R] COG1483 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) --|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||--- 1 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase |---||--|-|||---||||----------|------|----|||||-||||-------|||-|-- 1 [R] COG1489 DNA-binding protein, stimulates sugar fermentation -------------||-||--||----|||-||||||||----|||||-||||-|||---------- 1 [J] COG1490 D-Tyr-tRNAtyr deacylase ----||----||-||--|-|----------||-|-|-|----|||||--------|---|---|-- 1 [G] COG1501 Alpha-glucosidases, family 31 of glycosyl hydrolases ----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-||||||| 1 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes ----------------||--------||||------------------------------------ 1 [S] COG1507 Uncharacterized conserved protein -||-------------||--||--|-----------||----|||||-|-|||------||-||-- 1 [E] COG1509 Lysine 2,3-aminomutase -----------------|||----|------|----||----|||----|-|---|-----|||-- 1 [R] COG1512 Beta-propeller domains of methanol dehydrogenase type |||-|||||||||---||-|-|----|---|---|-||----|||||--|-----|---|||||-- 1 [J] COG1514 2'-5' RNA ligase ---||||||||||-|-||-|-|--------|-----|-----|||||-----|------------- 1 [L] COG1515 Deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V) ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----||||------- 1 [NUO] COG1516 Flagellin-specific chaperone FliS |||-|||-|||||---||-||------||---|--|-|----|||||----|--|---|------- 1 [L] COG1518 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair ----------------||||||--||-||||----|||-|---------|--|||||||----|-- 1 [K] COG1521 Putative transcriptional regulator, homolog of Bvg accessory factor --|--------|-----||-||||--|||-|-||--||-|--|||||-||||---|---||-|--- 1 [G] COG1523 Type II secretory pathway, pullulanase PulA and related glycosidases |-|-----|------|-|--------|||-|---|--||---|||||-|-||----|||------- 1 [P] COG1528 Ferritin-like protein ---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG1530 Ribonucleases G and E -||-|-|||||||----||-|------||-|-----||-----------|-----|---|||||-| 1 [L] COG1533 DNA repair photolyase -----------------|------------------|-----|||-|-||-----------|---- 1 [Q] COG1535 Isochorismate hydrolase ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1536 Flagellar motor switch protein -|-------|------||------------------------------------------------ 1 [S] COG1542 Uncharacterized conserved protein ----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---||||||| 1 [J] COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1) ---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||-- 1 [R] COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced) -----------------|---|-----||||----|||---------------------------- 1 [S] COG1550 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|------||----|-----||----|||||||||||---|||------- 1 [T] COG1551 Carbon storage regulator (could also regulate swarming and quorum sensing) |||------|-------|------------------------||||||||||-------------- 1 [P] COG1553 Uncharacterized conserved protein involved in intracellular sulfur reduction --|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|------- 1 [L] COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1558 Flagellar basal body rod protein ----------------||--|----|----|----|||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [S] COG1561 Uncharacterized stress-induced protein -------------||--|--||--|-----|||||||-------------------||-||||--- 1 [H] COG1564 Thiamine pyrophosphokinase |||--||----------|---------||------------------------------------- 1 [L] COG1567 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily) -----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit --|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--||||||||||||| 1 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase --||||||----|---||--||-----||------|||--------|--|-----|---|||||-- 1 [R] COG1574 Predicted metal-dependent hydrolase with the TIM-barrel fold ---|-------------||||-----||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 1 [H] COG1575 1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase -----------------|--||--------||||||||||--|||||-||||||||||||||||-- 1 [S] COG1576 Uncharacterized conserved protein |||---|||||-----||------------------------------------------------ 1 [S] COG1578 Uncharacterized conserved protein ----------------||------||----|-----||----|||||-||-----||||------- 1 [N] COG1580 Flagellar basal body-associated protein -----------------|------||----|-----||---------------------------- 1 [N] COG1582 Uncharacterized protein, possibly involved in motility |||--||||-------||------------------------------------------------ 1 [L] COG1583 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily) ||-|--||-||||----|||||----|||||-----------|||||-||-||------|||||-- 1 [OU] COG1585 Membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity -|--|||||-|||---||------------|-----||----||||||-|--|--|---------- 1 [E] COG1586 S-adenosylmethionine decarboxylase |||----|||-|-----|-||---------|-----|---------------------|------- 1 [C] COG1592 Rubrerythrin -----------------|--|---|-|----------|----|--||-||||-------||--|-- 1 [G] COG1593 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component ----------------||||----------------------|||-|-||-|||||--||||||-- 1 [M] COG1596 Periplasmic protein involved in polysaccharide export ----|--------||--|||-|----|||-||||||||----|||||--|---------||-||-- 1 [IR] COG1597 Sphingosine kinase and enzymes related to eukaryotic diacylglycerol kinase --------||-|----||-------------------|---------------------------- 1 [L] COG1604 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily) ||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG1605 Chorismate mutase -------------|---|--------|||-|----|||----------||--||||--|||||--- 1 [S] COG1610 Uncharacterized conserved protein --|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||-- 1 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein |||-|||||||||---||------------------------------------------------ 1 [F] COG1618 Predicted nucleotide kinase -------------||--|--------|---|-|||-||-----||---|--|---|---|------ 1 [G] COG1621 Beta-fructosidases (levanase/invertase) -----------------|--|-----|||-|-----||---------------------------- 1 [R] COG1623 Predicted nucleic-acid-binding protein (contains the HHH domain) ||||--|||||||||--|------------------------------------------------ 1 [H] COG1635 Flavoprotein involved in thiazole biosynthesis ----------------||--|---------|||-|---------------|||||-|||-----|| 1 [S] COG1636 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------||-|---|-|---------||----|--||-||||---|---||-||-- 1 [G] COG1638 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, periplasmic component -----------------|------|-----------------------||--------|------- 1 [T] COG1639 Predicted signal transduction protein |||-----||-------|||------|---|----------------------------------- 1 [S] COG1641 Uncharacterized conserved protein -----------------|------|---------||||---------------------------- 1 [R] COG1647 Esterase/lipase -----------------|------||----|----------------------------------- 1 [S] COG1655 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||---------||------------------------------------- 1 [S] COG1659 Uncharacterized protein, linocin/CFP29 homolog ||||--|||-|||----|---|--------||-|||||--------------|----------|-- 1 [CP] COG1668 ABC-type Na+ efflux pump, permease component -||-----|--------||--|-------------------------------|-----|---|-- 1 [R] COG1669 Predicted nucleotidyltransferases -|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-||||||||||||| 1 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins |||---||--||-----||||------------------------|------------|------- 1 [R] COG1672 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1677 Flagellar hook-basal body protein |-|-------------||--|---------|----|||--------|-||-----|---||-|--- 1 [S] COG1683 Uncharacterized conserved protein ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1684 Flagellar biosynthesis pathway, component FliR |||---|||-|||---||------------------------------------------------ 1 [L] COG1688 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily) |||||||||||||--|||-|-|----|||-|------|----|||-|--|-----|---------- 1 [S] COG1690 Uncharacterized conserved protein |||-----||-------|||------|---|----------------------------------- 1 [R] COG1691 NCAIR mutase (PurE)-related proteins -----------------|------||----|-----||------------------|||------- 1 [S] COG1699 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------||-|---||||-|----||||-|||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [T] COG1702 Phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase -||--------------|--|---|-------||-|--||---|||---|-|---|---|||||-- 1 [S] COG1704 Uncharacterized conserved protein -----------------|-------------||-|||-----|||||-||-----|-----|---- 1 [NU] COG1705 Muramidase (flagellum-specific) ----------------||-------|----------------||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1706 Flagellar basal-body P-ring protein |||-----|||------|-------------------------------|-----|---------- 1 [R] COG1712 Predicted dinucleotide-utilizing enzyme -----------------||-||--|-----||||||||||||------------------------ 1 [H] COG1713 Predicted HD superfamily hydrolase involved in NAD metabolism ||||--|||||||----|------------------------|||||-||||-||-------||-- 1 [S] COG1720 Uncharacterized conserved protein --|||||||-|-|---||||-|---|-|||-----|||----------||-----|---|||||-- 1 [R] COG1721 Uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain) -----------------|-|||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG1722 Exonuclease VII small subunit --|--------------|||-------------------------|-----------|--|-||-- 1 [N] COG1724 Predicted periplasmic or secreted lipoprotein ----|------|-----|||------|||-|-||||||---------------------------- 1 [K] COG1725 Predicted transcriptional regulators -----------------|------||----|-----||---------------------------- 1 [S] COG1728 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||---------||--|--||---||---||||||||||--|||-|-||||-|||||||||---- 1 [S] COG1739 Uncharacterized conserved protein ------||||--|----|------------------------------------------|----- 1 [L] COG1743 Adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-|||||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG1744 Uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein |||-----|--------|------------------------------------------------ 1 [S] COG1751 Uncharacterized conserved protein -------------||||||-|---|--|||-|----||----|||-|-||--||||---||||||| 1 [R] COG1752 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily ||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega -||-||||-|-||---||---|----|||-|----|-|--|||||||-||---|||---||-||-- 1 [O] COG1765 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1766 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway lipoprotein --------|-------||------------------------------------------------ 1 [L] COG1769 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily) ||-----||--------||||---|--||-|-----------|||-|--|--||||-------|-- 1 [C] COG1773 Rubredoxin -------------|||||--||--|-----||--||||---------------------------- 1 [S] COG1774 Uncharacterized homolog of PSP1 |||||||||||||----|------------|-----------|||||||----||----------- 1 [F] COG1781 Aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit --||---|-----||--|-|-|----|-------|-||----||||---|--|--|-----|---- 1 [P] COG1785 Alkaline phosphatase -----------------||--|---------------|------------------||-------- 1 [V] COG1787 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase and Mrr-like restriction enzymes --|-|||||-|||---||-|-|------------||||----|||||-||-|---|---||-||-- 1 [S] COG1801 Uncharacterized conserved protein ----|------|-----|--||----|||-|||-||||----|||||-||---|||---|||||-- 1 [K] COG1802 Transcriptional regulators -----------------||------|----|----|||----|||||-|-||---|---|||---- 1 [G] COG1803 Methylglyoxal synthase --------|--------|--||--------|----|||----|||-|------------------- 1 [R] COG1811 Uncharacterized membrane protein, possible Na+ channel or pump ||--|||||||||||--|---||---|----|-----------------|------------||-- 1 [S] COG1814 Uncharacterized membrane protein ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1815 Flagellar basal body protein -----------|-----|-|||---||||-||||||||-|--|||||-|||||------|||||-- 1 [G] COG1820 N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase ----------------||||-|||||||||----||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc) |--------|-------|--|---------|-||-|||---------------------------- 1 [R] COG1827 Predicted small molecule binding protein (contains 3H domain) ||||||||||||----||||-|----||||-|--||||--------------------|-||||-- 1 [F] COG1828 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, PurS component ---|||||--|||---||---|---------|||-|||----|||||--------|--|||-|--- 1 [R] COG1832 Predicted CoA-binding protein ||||-|||||||-----|------------------------------------------------ 1 [S] COG1833 Uncharacterized conserved protein ----------------||||||||||-|||||||-|||------------------|||------- 1 [R] COG1837 Predicted RNA-binding protein (contains KH domain) |---|||||-|||----|---------||--------------------------|---------- 1 [S] COG1839 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----|||||| 1 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1843 Flagellar hook capping protein -----------------|||||--||-|||||||-|||---------------------------- 1 [R] COG1847 Predicted RNA-binding protein ------||---|----||------------------------------------------------ 1 [S] COG1856 Uncharacterized homolog of biotin synthetase ----------------||--|-||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG1862 Preprotein translocase subunit YajC ||||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|| 1 [P] COG1863 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit ----------------||------||----|----|||----||||||||-----||||||||--- 1 [N] COG1868 Flagellar motor switch protein -----------------|--------|----|--|-||-|--|||||-|-||-------------- 1 [G] COG1869 ABC-type ribose transport system, auxiliary component --||--|||--------|-------|----|-----||----------||-----|---||--|-- 1 [NT] COG1871 Chemotaxis protein; stimulates methylation of MCP proteins -----------------|----||--||||------||----------||--|--|---------- 1 [T] COG1875 Predicted ATPase related to phosphate starvation-inducible protein PhoH ||||||-||-||-----|||------|||-----|--|-----------|||---|---||-|--- 1 [R] COG1878 Predicted metal-dependent hydrolase ------|||--------|--|---|-------|-------------|-|--|-------------- 1 [C] COG1883 Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1886 Flagellar motor switch/type III secretory pathway protein -||---|-|--------|------------------------------------------------ 1 [S] COG1895 Uncharacterized conserved protein related to C-terminal domain of eukaryotic chaperone, SACSIN -----------------|------------||-|--||----|||||-|---------||||---- 1 [E] COG1897 Homoserine trans-succinylase --||||--|--|-||--|-|||----|||-|||-||||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 1 [C] COG1902 NADH:flavin oxidoreductases, Old Yellow Enzyme family -----------------|--------|---||----||----|||||-------------||||-- 1 [G] COG1904 Glucuronate isomerase ------|||-|------|------------------------------------------------ 1 [S] COG1906 Uncharacterized conserved protein -|||--|||||||---||-|-------------|||-------||-----------||-------- 1 [S] COG1912 Uncharacterized conserved protein |||----|||-------||--|--------||--||------|||||-||--|--|-||----|-- 1 [P] COG1918 Fe2+ transport system protein A -----------------|||-|--|-----|---|||-----|||||-|---|------|-|||-- 1 [M] COG1922 Teichoic acid biosynthesis proteins -|--------------||------------|---||||----|||||-||||||||----||||-- 1 [R] COG1923 Uncharacterized host factor I protein |||-----||------||--|---------||---|------|||--------------------- 1 [I] COG1924 Activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase (HSP70-class ATPase domain) -----------------||||---------||||||||---------------------------- 1 [S] COG1939 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase |||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||--- 1 [C] COG1951 Tartrate dehydratase alpha subunit/Fumarate hydratase class I, N-terminal domain ---|||-------|---|------------||||||||----|||||-||-||||-------||-- 1 [T] COG1956 GAF domain-containing protein -----------------|||-|--||-----|---|||---------------------------- 1 [S] COG1963 Uncharacterized protein conserved in bacteria |--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||-- 1 [V] COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein -----------------|||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|---|||||-- 1 [KT] COG1974 SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidases) ----------------||------------|-----|----------------------------- 1 [S] COG1978 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|-||---------|----|||----|||||-|--|-------------- 1 [C] COG1979 Uncharacterized oxidoreductases, Fe-dependent alcohol dehydrogenase family --|---||---------|--------|---||||-|||----|||||-|----------------- 1 [KT] COG1983 Putative stress-responsive transcriptional regulator ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1987 Flagellar biosynthesis pathway, component FliQ ||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 1 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases ||||--||-||||----|------------------------------------------------ 1 [S] COG1992 Uncharacterized conserved protein -||---||-|------||---------||--------------------------------|-|-- 1 [S] COG1993 Uncharacterized conserved protein ||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||-- 1 [R] COG1994 Zn-dependent proteases ||-------|-------|------------------------------------------------ 1 [R] COG2000 Predicted Fe-S protein --|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--| 1 [L] COG2003 DNA repair proteins |-|-----|--------|||---------------------------------------------- 1 [S] COG2006 Uncharacterized conserved protein ---|---------||--|-|||--------|---||-|----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2008 Threonine aldolase |-||||-|||-||----||--|--------|||----------------|------------||-- 1 [S] COG2013 Uncharacterized conserved protein ----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||-- 1 [G] COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 1 [C] COG2025 Electron transfer flavoprotein, alpha subunit |||---|||--------|------|-----|----------------------------------- 1 [C] COG2033 Desulfoferrodoxin |--|-------------|--|---|||-----|||--|----------|----------------- 1 [S] COG2035 Predicted membrane protein ||--||---|-------|||-|--------|-----|------------------|---------- 1 [HR] COG2045 Phosphosulfolactate phosphohydrolase and related enzymes -----------------|||----------|-----||---------------------------- 1 [S] COG2052 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||------------------------||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG2063 Flagellar basal body L-ring protein --------|----|--||-|||----|||-||||||||-----------|--||||||||||-|-- 1 [R] COG2070 Dioxygenases related to 2-nitropropane dioxygenase |||||||||||||||-||------------|----------------------------------- 1 [S] COG2078 Uncharacterized conserved protein ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 1 [C] COG2086 Electron transfer flavoprotein, beta subunit --||||||--|------|||||-----||-------------|||||-||-----|---||||--- 1 [H] COG2109 ATP:corrinoid adenosyltransferase --|-||||||||||--||--||-----||---|-||------|||-|--|-----|------|--- 1 [R] COG2110 Predicted phosphatase homologous to the C-terminal domain of histone macroH2A1 -----------------|-------------|----||----|||||---|--------||||--- 1 [G] COG2115 Xylose isomerase --|-||||||---||--|--||--|-----||||||||-|--------|----------------- 1 [F] COG2131 Deoxycytidylate deaminase -----------------|--||--|-||||||||||||----|||||-||||-|||---|------ 1 [R] COG2137 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||--------------------------------------||-------- 1 [O] COG2143 Thioredoxin-related protein ---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||-- 1 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis |||-||||-||||----|---|----||||-|||||||----|---------|--|---|||||-- 1 [R] COG2151 Predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme -----------------|------------|-----||----|||||-------------|----- 1 [G] COG2160 L-arabinose isomerase ---|-------------|||-------||----||-------|||-|-|----------|-----| 1 [D] COG2161 Antitoxin of toxin-antitoxin stability system |-------|--------|------------------------------------------------ 1 [S] COG2164 Uncharacterized conserved protein ----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||-- 1 [NU] COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG |----------------|------------------------||||||||||-------------- 1 [P] COG2168 Uncharacterized conserved protein involved in oxidation of intracellular sulfur ---------|-------|--------||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG2171 Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase -----------------|--|---------||||||||||||------------------------ 1 [L] COG2176 DNA polymerase III, alpha subunit (gram-positive type) -----------------|||-|---------|||||||---------------------------- 1 [R] COG2179 Predicted hydrolase of the HAD superfamily --||--|||--------|-|----||----|-----||----|||||-||--|--|--|||-||-- 1 [NT] COG2201 Chemotaxis response regulator containing a CheY-like receiver domain and a methylesterase domain |-||----|-----|-||||-|-----||||---|-||----|||---||-----|---|||||-- 1 [T] COG2203 FOG: GAF domain -----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [K] COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins -----------------||||-|||--||-|---||||----------||----------|-|--- 1 [TK] COG2208 Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit |-||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|- 1 [P] COG2212 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit ---|---------|||-|||-|--||----|---------|||||-|-||--|||-||||||||-- 1 [O] COG2214 DnaJ-class molecular chaperone |-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||-- 1 [P] COG2217 Cation transport ATPase |-----||-|-------|--||--------|-||-||-----|||||--|--|------|||||-- 1 [M] COG2222 Predicted phosphosugar isomerases --|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis |||-||-----|----||----------------||--------------------|||------- 1 [L] COG2231 Uncharacterized protein related to Endonuclease III -------|------|--|--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---|||---- 1 [F] COG2233 Xanthine/uracil permeases |----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----||||||| 1 [P] COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain) ||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid -|----||--|-|----|------------------------------------------------ 1 [S] COG2245 Predicted membrane protein -|----|||||||----|------------------------------------------------ 1 [S] COG2250 Uncharacterized conserved protein related to C-terminal domain of eukaryotic chaperone, SACSIN ------||---------|||------||||------------------------------------ 1 [R] COG2251 Predicted nuclease (RecB family) -|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|-- 1 [R] COG2252 Permeases -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit -------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 1 [L] COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase -----------------|------|-----|-----||-----------|------|||----|-- 1 [S] COG2257 Uncharacterized homolog of the cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB -|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [R] COG2262 GTPases ----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase ------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase -------||----||--|-|||----||||||--||||----|||||-||||---|---|||||-- 1 [I] COG2267 Lysophospholipase -------------||--|---------||-|-----||---------------------||-||-- 1 [G] COG2273 Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase --------------|--|---|------------||------|||--------------||-|--- 1 [Q] COG2313 Uncharacterized enzyme involved in pigment biosynthesis --------|--------|---|-------------------------------------------- 1 [R] COG2316 Predicted hydrolase (HD superfamily) --|----------|||-|||||--------------------------|----------|||||-- 1 [R] COG2319 FOG: WD40 repeat |----------------|||-|--------|-----------|||-|------------|-|---- 1 [S] COG2327 Uncharacterized conserved protein -----------------|---|-----|||-------------------------|---------- 1 [S] COG2331 Uncharacterized protein conserved in bacteria -|-------|-------|--||---------------------------------|---------- 1 [G] COG2342 Predicted extracellular endo alpha-1,4 polygalactosaminidase or related polysaccharide hydrolase -----------------|-|||--------------------|||||--|-||--|---||-|||| 1 [R] COG2373 Large extracellular alpha-helical protein ----||||--|||----|---|---------------------------|-----|---||||--- 1 [G] COG2379 Putative glycerate kinase ----------------||---|-------------------------------------------- 1 [S] COG2380 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|||---|||-----|---|------------|-------|||||-||--|--|--|||||--- 1 [R] COG2391 Predicted transporter component |-|-------|||----|------------------------------------------------ 1 [R] COG2406 Protein distantly related to bacterial ferritins ------||---||-|--|-|---------------|-|----------------------|--|-- 1 [C] COG2421 Predicted acetamidase/formamidase ----||----|||----|--|---------------------|||-|-------------|-|--- 1 [C] COG2440 Ferredoxin-like protein --|---||||||-----||-|---------||-----|----------|--------------|-- 1 [R] COG2509 Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases ------||------|--|-|----------------------|||||-|------|--|---||-- 1 [E] COG2515 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase --|---||---|----|||----------------------------------------------- 1 [R] COG2516 Biotin synthase-related enzyme ||||--|||||||-|--|------------------------|||||-||--||||||||||||-- 1 [O] COG2518 Protein-L-isoaspartate carboxylmethyltransferase ||-||||||||||||-||--------||||------------------------------------ 1 [J] COG2519 tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase and related methyltransferases -----------------|---|--------|---||||---------------------------- 1 [R] COG2738 Predicted Zn-dependent protease ----------------||------------|-----||----|||||-||-----|---------- 1 [KNU] COG2747 Negative regulator of flagellin synthesis (anti-sigma28 factor) ----||-------||--|--|---------||||||--|---------|----||-----|-|--- 1 [F] COG2759 Formyltetrahydrofolate synthetase |-|-----|--------|------------|----------------------------------- 1 [R] COG2768 Uncharacterized Fe-S center protein ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 1 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB ----------------||||||--------|-----------|||||-||--||||---------- 1 [NU] COG2805 Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits -|----||-|-|-----|---|---------|||||||----||||||||||-------|||||-- 1 [J] COG2813 16S RNA G1207 methylase RsmC -----------------|--||--||||||||||||||---------------------------- 1 [S] COG2815 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||---|||||----------------|||||-||||-|||-------||| 1 [M] COG2825 Outer membrane protein --|-||||--||||---|--||--------|------|----------||-----|---||||--- 1 [R] COG2872 Predicted metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase HxxxH domain --||---------||--|---|----|||-||---|-|-----------|-|---|--|||||--- 1 [E] COG2873 O-acetylhomoserine sulfhydrylase ----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------ 1 [E] COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase --|--------------|--|---------------------||||||||||||||---------- 1 [C] COG2878 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB -----------------|------|-----|-----||----||||||||-----|---------- 1 [NUO] COG2882 Flagellar biosynthesis chaperone |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors ----------------||||||--------|----|||----||||||||--||||||-||||--- 1 [D] COG2894 Septum formation inhibitor-activating ATPase -----------------|------------------------|||||-|||||||||||||-||-- 1 [S] COG2908 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-|--------------|------------------------||||||||||-------------- 1 [P] COG2923 Uncharacterized protein involved in the oxidation of intracellular sulfur -------------||--|----------------------------------|--|---------- 1 [S] COG2930 Uncharacterized conserved protein ----||-----|-----|-|-|--------|-----------------|-----------|||--- 1 [G] COG2971 Predicted N-acetylglucosamine kinase -----------------|--|---------------------|||||-||||-------------- 1 [T] COG3086 Positive regulator of sigma E activity -----------------|------------|-----||----||||||||-----|---------- 1 [N] COG3144 Flagellar hook-length control protein ----------------||||----------------------|||-|-||-||--|---|||||-- 1 [M] COG3206 Uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis -----------------|------------------------|||----|-----|---------- 1 [S] COG3234 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-||||||| 1 [M] COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes -----------------|||----------|------|---------------------------- 1 [S] COG3330 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------||--|------------|------|---------------------------- 1 [R] COG3341 Predicted double-stranded RNA/RNA-DNA hybrid binding protein -----------------|---------------|---|-------|--|----------------- 1 [G] COG3345 Alpha-galactosidase --|-||----|------|-|-------------------------|-----|------|------- 1 [S] COG3350 Uncharacterized conserved protein |--|||---|-------|-|----------------------------------------|----- 1 [S] COG3367 Uncharacterized conserved protein ----||--|-||-----|------------------------------------------------ 1 [S] COG3374 Predicted membrane protein ----||-----------|--||--------|-|--------------------------------- 1 [E] COG3404 Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase ---|------------||||-|---------------|-----------------|---------- 1 [C] COG3411 Ferredoxin -----------------|-|--------------------------|--|---------||-|--- 1 [R] COG3450 Predicted enzyme of the cupin superfamily -----------------|----------------|--|----|---|---------------|--- 1 [E] COG3457 Predicted amino acid racemase -----------------|------------|----|---------|--|----------||||--- 1 [G] COG3459 Cellobiose phosphorylase ----||-----------|--------------------------------------------|--- 1 [S] COG3461 Uncharacterized conserved protein ---|||-----------|------------------------------------------------ 1 [S] COG3462 Predicted membrane protein -|-|-------------|-|------|--------------------------------------- 1 [S] COG3472 Uncharacterized conserved protein -----------------|-------------------|-----||-|------------||-||-- 1 [S] COG3533 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|------------|-----||---------------------||-||-- 1 [G] COG3534 Alpha-L-arabinofuranosidase ----------------||--|---------||---|------------------------------ 1 [S] COG3580 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||--|---------||---|------------------------------ 1 [S] COG3581 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|---|--------||---|||---------------------------- 1 [S] COG3584 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------||---------|------------|||||||----------------------------- 1 [S] COG3601 Predicted membrane protein -----------------|--|------||---|--------------------------||-|--- 1 [T] COG3629 DNA-binding transcriptional activator of the SARP family |||-|||||||||---||---|-------------------------------------------- 1 [G] COG3635 Predicted phosphoglycerate mutase, AP superfamily ----||-----------|--|-----------|--------------------------------- 1 [E] COG3643 Glutamate formiminotransferase -----------------|--------------|----|---------------------------- 1 [L] COG3649 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair -----------------|-------------------|-------------------------|-- 1 [G] COG3661 Alpha-glucuronidase -----------|-----|---------------|------------------|----------|-- 1 [G] COG3669 Alpha-L-fucosidase -----------------|||-----|-----------|-----------|--------|||||||| 1 [T] COG3706 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain --|-------|------|--|--------------------------------------|||||-- 1 [C] COG3808 Inorganic pyrophosphatase --|--------------|--------|||-|---||||-----------|-----|---||-||-- 1 [S] COG3832 Uncharacterized conserved protein --||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG3845 ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase components -------|---------|--|---------|----------------------------------- 1 [S] COG3862 Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs -----------------|---|--------|----------------------------------- 1 [S] COG3864 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|------------|-----||---------------------------- 1 [G] COG3866 Pectate lyase -----------------|------------|-----||-------|-------------------- 1 [G] COG3867 Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase -----------------|--|---------|----|||---------------------------- 1 [R] COG3872 Predicted metal-dependent enzyme --|-----|--------|------------|----------------------------------- 1 [S] COG3875 Uncharacterized conserved protein -----------------|---|--------|----------------------------------- 1 [S] COG3877 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|------------||||||||---------------------------- 1 [S] COG3906 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----|-----|-----|---------------------------------------------|-- 1 [G] COG3934 Endo-beta-mannanase -|--||-|--|||----|--|------------|-----------||------------||-|--- 1 [G] COG3958 Transketolase, C-terminal subunit -|--||-|--|||----|--|------------|-----------||------------||-|--- 1 [G] COG3959 Transketolase, N-terminal subunit -----------------|---------------------------|-----|--------|----- 1 [R] COG4099 Predicted peptidase -----------------|----------------|-|----------------------------- 1 [R] COG4112 Predicted phosphoesterase (MutT family) ----------------||--|---------||||||||||--|||||-|-||----||||||||-- 1 [R] COG4123 Predicted O-methyltransferase -----------------|--|-|||||||-||-||||-||--|||||-||||---|||-||||--- 1 [E] COG4166 ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG4177 ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component ----||-----------|------------|----|------------------------------ 1 [S] COG4198 Uncharacterized conserved protein -----------------|--|---------|------------------|-----|---------- 1 [S] COG4267 Predicted membrane protein -----------------|----------------------------|-----|--|---------- 1 [R] COG4287 PhoPQ-activated pathogenicity-related protein -----------------|-|----------------------------------------|----- 1 [S] COG4288 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|---------------------------|-------------||----- 1 [S] COG4289 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|---|--|-----|-----|---------------|------------- 1 [CP] COG4555 ABC-type Na+ transport system, ATPase component ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG4603 ABC-type uncharacterized transport system, permease component --|--------------|--|---||---------|------||||||||||-------------- 1 [C] COG4656 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC --|--------------|--|---------------------||||||||||-------------- 1 [C] COG4657 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfA --|--------------|--|---|-----------------||||||||||-------------- 1 [C] COG4658 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfD --|--------------|--|---------------------||||||||||-------------- 1 [C] COG4659 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfG --|--------------|--|---------------------||||||||||-------------- 1 [C] COG4660 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfE --|-||----|------|------------------------------------------------ 1 [F] COG4741 Predicted secreted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase ----------------||--|--------------------------------------------- 1 [S] COG4752 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|--|---|------|---|------------------------------ 1 [S] COG4769 Predicted membrane protein -------------||-||||||||||----------------|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87 ---|--|||--|-||--|--||----||||------||-----------|-----|---||||||| 1 [I] COG4799 Acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta) -----------------|-----------------|----------|------------------- 1 [Q] COG4869 Propanediol utilization protein -----------------|--|---------|----------------------------------- 1 [S] COG4878 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|--------------|--------------------------------------------|--- 1 [S] COG4923 Uncharacterized conserved protein ---|||--||-||----|||||----||||||--||||----|||||--|-----|---|||||-- 1 [MR] COG4948 L-alanine-DL-glutamate epimerase and related enzymes of enolase superfamily -----------------|-----------------------------------------||-|--- 1 [M] COG4952 Predicted sugar isomerase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase -----------------|||----------|----------------------------------- 1 [S] COG5011 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------||------|------------------------------------------------ 1 [R] COG5014 Predicted Fe-S oxidoreductase |||---|-|-------||--|---|-------|-------------|-||-|------|------- 1 [C] COG5016 Pyruvate/oxaloacetate carboxyltransferase --|--------------|---------------------------|-------------------- 1 [S] COG5276 Uncharacterized conserved protein -----------------|--|----------|---|------------------------------ 1 [S] COG5341 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||-------|--------||||----|||||||||||--||||||||||| 1 [O] COG5405 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), peptidase subunit -------------|---|------------|------------------------|---|---|-- 1 [M] COG5434 Endopolygalacturonase -----------------|---------|||-------------------------|---------- 1 [S] COG5495 Uncharacterized conserved protein --|--------||----|--||----|-----|--------------------------------- 1 [R] COG5496 Predicted thioesterase -----------------|||-|----||||------------------------------------ 1 [R] COG5512 Zn-ribbon-containing, possibly RNA-binding protein and truncated derivatives -----------------|------------|-----||----|||||--|---------------- 1 [M] COG5581 Predicted glycosyltransferase --||-------------|---|--------|----|-|-----------------|---------- 1 [S] COG5652 Predicted integral membrane protein