(order) Thermoproteales - 1 genome Functional categories Fun All J A K L B D Y V T M N Z W U O C G E F H I P Q R S COGs 1,016 141 2 52 51 2 4 -  9 16 17 2 -  -  13 42 85 47 111 47 80 23 53 11 160 115 proteins 1,561 157 2 93 82 3 8 -  22 31 42 6 -  -  21 71 154 88 174 52 99 46 85 27 323 158 Distribution of COGs by number of proteins proteins 1 2 3 4 5 6 7 8 10 11 13 14 15 20 COGs 762 146 52 21 11 9 5 2 1 2 2 1 1 1

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|||---|||||||---||------------|---|-----------|---|--------||----| 20 [R] COG1708 Predicted nucleotidyltransferases
|||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 15 [R] COG0517 FOG: CBS domain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 14 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily
|||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||-- 13 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators
-|----|||||||----|------------------------------------------------ 13 [S] COG2250 Uncharacterized conserved protein related to C-terminal domain of eukaryotic chaperone, SACSIN
||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 11 [M] COG0438 Glycosyltransferase
||||||||||||||--||||---------------------------------------||-|--- 11 [T] COG0467 RecA-superfamily ATPases implicated in signal transduction
|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 10 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases
|-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  8 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily
|||----||-|-----|-----------------|-||----------------------------  8 [S] COG2445 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-|||||||  7 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase
||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||---  7 [C] COG0247 Fe-S oxidoreductase
|||||||||||||---||||-|-----||---|----|----||||---|-|---|---|||||--  7 [R] COG0433 Predicted ATPase
|-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||--  7 [R] COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease
|||---||--||-----||||------------------------|------------|-------  7 [R] COG1672 Predicted ATPase (AAA+ superfamily)
||-||||||||||---|-||-|----|||-------||----|||||-||||---|||||||||--  6 [C] COG0243 Anaerobic dehydrogenases, typically selenocysteine-containing
|||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||--  6 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases
||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  6 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis
|-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  6 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes
|||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||--  6 [C] COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit
|-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||--  6 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component
|||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||--  6 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon)
|||||||||||||--------|----|||-|-----||----|||||-||||-|||---|||||--  6 [K] COG1522 Transcriptional regulators
|||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||---  6 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components
|-||||--|-|||||||-||-|-----||--|--||||----|||||-||-||--||-||||||--  5 [I] COG0365 Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases
||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||--  5 [O] COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation
||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  5 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases
|||||||||||||---||||-|-----||-||--|-||-----------|-----|----|-|---  5 [R] COG0535 Predicted Fe-S oxidoreductases
|||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||--  5 [C] COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins)
|||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||-------  5 [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit
-|||||||-|||----||||-|---|-||-------------|||-|-----|---||--------  5 [L] COG0675 Transposase and inactivated derivatives
|||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||-------  5 [C] COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit
--|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  5 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases)
|||||||||||||--------------||----------------------------------|--  5 [R] COG1545 Predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon
--||||-||-||----|-||-|-----||-----||||----|||||-||||---|||||||||--  5 [H] COG1977 Molybdopterin converting factor, small subunit
-|||--|||-|||-----||-|---------------|--||||||||||||||||---|||||--  4 [HJ] COG0189 Glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)
-|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||---  4 [E] COG0410 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component
-|------|-|||----|||||-----------|--------|||||--|-----|--|||||---  4 [E] COG0411 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component
--||---||-|||---|-------------------------|||||-||||---|--|-|-|---  4 [C] COG0437 Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1
||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||--  4 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
-||||||||-|||---------------------------------------|---||-|||||||  4 [NU] COG0630 Type IV secretory pathway, VirB11 components, and related ATPases involved in archaeal flagella biosynthesis
---|||||--||||||-||-------||||||||||||----|||||--|-----|---|||||--  4 [R] COG0656 Aldo/keto reductases, related to diketogulonate reductase
--|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||--  4 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating)
-|-|----|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||---  4 [E] COG0683 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component
|||||||||||||---||||-|---||||||---||||----|||||-||--|--|---|||||--  4 [R] COG0714 MoxR-like ATPases
|||-|||||||||----|||||-----||-||-----|----|||-|-||------------|---  4 [C] COG1032 Fe-S oxidoreductase
--|-||----|||||---||------||||-||||-||----|||-|--|--|||||||||||---  4 [R] COG1064 Zn-dependent alcohol dehydrogenases
|||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|---  4 [C] COG1145 Ferredoxin
||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--||||||||||||||  4 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning
|||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||--  4 [K] COG1846 Transcriptional regulators
---|||--|-||||-----|||----|||||---|-||----|||||-||---|||---|||||--  4 [I] COG1960 Acyl-CoA dehydrogenases
--||||--|-||----|---|-------------|-|-----------------------------  4 [S] COG2210 Uncharacterized conserved protein
|||-----|||-------------------|---------------|-------------------  4 [C] COG2221 Dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha and beta subunits
-||-|||||-|-|-----------------|-----------|||---------------------  4 [C] COG2414 Aldehyde:ferredoxin oxidoreductase
-||||||||-|||------|-------||--------------||||-----|--|---||-||--  4 [K] COG3609 Predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain
------|---||------||-------||-------------------------------|-----  4 [R] COG4113 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain
||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||--  3 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase
||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||-------------  3 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases
|||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---|||||||  3 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein)
|||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  3 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase
|||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||--  3 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases
--||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||--  3 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases
|||||||||||||---|-||-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||--  3 [H] COG0303 Molybdopterin biosynthesis enzyme
|-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--||||||||  3 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II
|-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-|||||||||||||||  3 [C] COG0372 Citrate synthase
||||||||||||||||---|----------------------|||||-||----------------  3 [L] COG0417 DNA polymerase elongation subunit (family B)
||||--||--||||||||-|-|---||||------|------|||-|--|---|||--|-|-----  3 [P] COG0428 Predicted divalent heavy-metal cations transporter
|||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  3 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
|||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-|  3 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases
|||||||||||||||||||||||||-||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication
|||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||--  3 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function
|||||||||-|||||||-||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases
-|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||---  3 [E] COG0559 Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease components
|||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---|||||||  3 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins
--|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||---  3 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components
||||||||||||||||-----------|||------------------------------------  3 [O] COG0638 20S proteasome, alpha and beta subunits
|||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--||||||||||||||  3 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel
|||||||||||||---||||-|---|||||||||||-||-|||||||-||--|--|---|||||--  3 [P] COG0704 Phosphate uptake regulator
|||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||--  3 [R] COG0730 Predicted permeases
|-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||--  3 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component
||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||--  3 [R] COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily)
---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---|||||||  3 [I] COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase
-|||||||||||-------|----------------------|||||-||---||-----|-|---  3 [C] COG1042 Acyl-CoA synthetase (NDP forming)
||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-||||||||||||||||||  3 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit
||||----|||||---|||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component
--|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||---  3 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|---||||---  3 [G] COG1175 ABC-type sugar transport systems, permease components
|||-|||||||||---||--|------||-||||||------|||||-||||---|----------  3 [O] COG1180 Pyruvate-formate lyase-activating enzyme
|-|-||||||||-||||-||------|---|||-||||----|||||--|-----|---|||||-|  3 [M] COG1215 Glycosyltransferases, probably involved in cell wall biogenesis
-||-|||||-|||----|-|-|---|--|-||||||||----|||||-||-|---|----|-|---  3 [C] COG1254 Acylphosphatases
-||-|-||--||-----|--|------||----|-|--------------|-----|||---|--|  3 [R] COG1373 Predicted ATPase (AAA+ superfamily)
--||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|---  3 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases
||||||||||||||||--------------------------------------------------  3 [K] COG1405 Transcription initiation factor TFIIIB, Brf1 subunit/Transcription initiation factor TFIIB
-||-||||--||----|-||----|-----------------------------------------  3 [G] COG1449 Alpha-amylase/alpha-mannosidase
|||---|||-|||---||-||-----------|----|----------------------------  3 [L] COG1468 RecB family exonuclease
---|||||--|||||---|-||------------|-||-----------|--|------|---|-|  3 [E] COG1506 Dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases
-|---||---||----|-------------------------------------------------  3 [L] COG1517 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
-||-|-|||||||----||-|------||-|-----||-----------|-----|---|||||-|  3 [L] COG1533 DNA repair photolyase
---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-||||||||||||||||||  3 [O] COG1651 Protein-disulfide isomerase
||----|||-||------------------------------------------------------  3 [S] COG1673 Uncharacterized protein conserved in archaea
|-|||||||-|||----|-|||----||||||||||||----|||||-|------|------||--  3 [K] COG1695 Predicted transcriptional regulators
|-||||||||||||||--------------------------------------------------  3 [K] COG1958 Small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) homolog
---|--|||-|||-----||-------||-|----|||----|||--------------||-|---  3 [K] COG2002 Regulators of stationary/sporulation gene expression
-||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||--  3 [U] COG2095 Multiple antibiotic transporter
--|-|||||-|||-----------------------------------------------------  3 [S] COG2512 Uncharacterized membrane-associated protein/domain
--||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||--  3 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components
-|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||---  3 [E] COG4177 ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component
----------||-------|----------------------------------------------  3 [O] COG5550 Predicted aspartyl protease
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  2 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  2 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases
||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--||||||||  2 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters
|||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  2 [G] COG0061 Predicted sugar kinase
||||||||||||||--||||-|--------||--|-||--------|-||------||-||-||--  2 [E] COG0075 Serine-pyruvate aminotransferase/archaeal aspartate aminotransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit
---|||--|-|||||-|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  2 [O] COG0109 Polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)
||--|-||--||-|----||-------||-------------|||||-||||-|||---||||---  2 [R] COG0121 Predicted glutamine amidotransferase
||||--|||||||||||-||-|------------|-||----------||---|||---|||||--  2 [BQ] COG0123 Deacetylases, including yeast histone deacetylase and acetoin utilization protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase
-|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||--  2 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [E] COG0174 Glutamine synthetase
-||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||--  2 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0195 Transcription elongation factor
||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||--  2 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase
|||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||--  2 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs
|||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs
--|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|--  2 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase
|||---|||||-----||||-|--------||--||------|||||-||--|--||||----|--  2 [P] COG0370 Fe2+ transport system protein B
|||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-|||||||||||||||  2 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases
|-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||--  2 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||-||||||||-||-||--|---||||---  2 [G] COG0395 ABC-type sugar transport system, permease component
||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||----------------  2 [L] COG0419 ATPase involved in DNA repair
--|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||---  2 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component
||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases
||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||--  2 [R] COG0456 Acetyltransferases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family)
||||||||||||||||--||-|----||||------||-----------|-----|--|||-|---  2 [O] COG0464 ATPases of the AAA+ class
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit
||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0492 Thioredoxin reductase
||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||--  2 [R] COG0496 Predicted acid phosphatase
---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|---  2 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase
|||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||--  2 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family
||||||||||||-||-|||-----||-----------|----|||||-|--|--------|-----  2 [P] COG0530 Ca2+/Na+ antiporter
|||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--||||||||||||||  2 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog)
||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease
-||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||--  2 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component
|||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----||||||||||||||||||||||||  2 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class)
||||--|||||||||--|--|---|----|||||||||-||||||||-||----------------  2 [R] COG0622 Predicted phosphoesterase
-|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7
-||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||--  2 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase
-||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||--  2 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid)
|||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||--  2 [O] COG0719 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component
-|||--|||-||------||-|---------||---------|||||-||--|--||||-|-|---  2 [R] COG0727 Predicted Fe-S-cluster oxidoreductase
--|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||---  2 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component
|||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [C] COG0778 Nitroreductase
|-|---|||-|-|---||||||--|-||||--||--||------------||----||-||||---  2 [O] COG0785 Cytochrome c biogenesis protein
--|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||||  2 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain
---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  2 [C] COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1
------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|--  2 [K] COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family
--|-|||||-|-|---|-----------------|-||-----------|-----|----|-|---  2 [O] COG1030 Membrane-bound serine protease (ClpP class)
|||---|||||||---|-||-|----||||||-|-|||-------|--||-----|---|||||-|  2 [F] COG1051 ADP-ribose pyrophosphatase
----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||--  2 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases
|||||||||-|||-----|--|-----||--|----------|||||---||---|----------  2 [H] COG1056 Nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase
||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||-------  2 [HR] COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes
--|||||||-||||||---|||--|-|||||-||||------|||||-|-----------------  2 [KL] COG1061 DNA or RNA helicases of superfamily II
---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||---  2 [R] COG1079 Uncharacterized ABC-type transport system, permease component
--||--||--||-|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components
|--|---||-|-|----|||-------||-||||||||----------------------------  2 [C] COG1141 Ferredoxin
|||-||||||||----||--------------------------------------||--------  2 [C] COG1144 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, delta subunit
||||||-|||||-----|||-|----|||||-----------|||-|-||--|--|||||||||||  2 [C] COG1146 Ferredoxin
----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||--  2 [KE] COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs
---|--||--|-|-----||||--|-|------|---|----|||||-||||-|||--|||||---  2 [P] COG1178 ABC-type Fe3+ transport system, permease component
||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|--  2 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases
|||||||||||||------|------|||-------------|||----|-----|---|||||--  2 [R] COG1201 Lhr-like helicases
|||---|||-|||---||--|-----------|----|----|||||----|--------------  2 [R] COG1203 Predicted helicases
--||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-|  2 [O] COG1225 Peroxiredoxin
||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||--  2 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III
-||||||-|-||||||--||-|--------------------------||-----|---||-||--  2 [J] COG1236 Predicted exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing
||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  2 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes
|-|-||--|||||----||--|----|---------||----|||||-|||||--|--||||||--  2 [E] COG1280 Putative threonine efflux protein
----------|||--------|--||-||-------||----|||----|-----|---||-|---  2 [C] COG1319 Aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, middle subunit CoxM/CutM homologs
||||--|||||||-----------------------------------------------------  2 [J] COG1325 Predicted exosome subunit
-|----|||||||||---------------------------------------------------  2 [R] COG1341 Predicted GTPase or GTP-binding protein
|||--|--||||-----|-||------||---|----|----------------------------  2 [L] COG1343 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
|-|-|||||-|||---||------------------------------------------------  2 [R] COG1350 Predicted alternative tryptophan synthase beta-subunit (paralog of TrpB)
||||--|||||-|----|-|||--------||||||||||--|||-|--|----------|-----  2 [G] COG1363 Cellulase M and related proteins
|||-|||||||------|------------|-----------------|-----------------  2 [S] COG1433 Uncharacterized conserved protein
|||-|||-|||||---||-||------||---|--|-|----|||||----|--|---|-------  2 [L] COG1518 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
----------|||---|----|--|--||-------||----|||----|-----|---||-||--  2 [C] COG1529 Aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, large subunit CoxL/CutL homologs
--|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--|||||||||||||  2 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase
||-|--||-||||----|||||----|||||-----------|||||-||-||------|||||--  2 [OU] COG1585 Membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity
-|--|||||-|||---||------------|-----||----||||||-|--|--|----------  2 [E] COG1586 S-adenosylmethionine decarboxylase
||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||---  2 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase
|||||||||-||||||--------------------------------------------------  2 [K] COG1594 DNA-directed RNA polymerase, subunit M/Transcription elongation factor TFIIS
|-|||||||||||-----------------------------------------------------  2 [S] COG1602 Uncharacterized conserved protein
---|----|-||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  2 [C] COG1622 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2
||||||||||||||||--------------------------------------------------  2 [J] COG1632 Ribosomal protein L15E
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||----|||||-||-||--|---||||---  2 [G] COG1653 ABC-type sugar transport system, periplasmic component
||||||||||||||||--------------------------------------------------  2 [J] COG1676 tRNA splicing endonuclease
----------||-||---||-|||--|||||------|--------------|-------------  2 [T] COG1716 FOG: FHA domain
||||--|||||||----|------------------------|||||-||||-||-------||--  2 [S] COG1720 Uncharacterized conserved protein
---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-|||||||-------|-----|---||||---  2 [R] COG1744 Uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein
|||---||||||------------------------------------------------------  2 [R] COG1759 ATP-utilizing enzymes of ATP-grasp superfamily (probably carboligases)
--|-|||||-|||---||-|-|------------||||----|||||-||-|---|---||-||--  2 [S] COG1801 Uncharacterized conserved protein
||--|||||||||||--|---||---|----|-----------------|------------||--  2 [S] COG1814 Uncharacterized membrane protein
||----||||||||----------------------------------------------------  2 [R] COG1818 Predicted RNA-binding protein, contains THUMP domain
--||------|-|-----|||-----|-----|||--|-----||||-||||||||--|||||---  2 [P] COG1840 ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component
-|----|||-|||--------|-----||-------------------------------|-----  2 [R] COG1848 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain
|-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---|||||||  2 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family
-|||||--|-|-------------------|-----|------------------|----------  2 [P] COG1910 Periplasmic molybdate-binding protein/domain
|||||||||||||-----------------------------------------------------  2 [R] COG1938 Archaeal enzymes of ATP-grasp superfamily
||||--||-||||----|------------------------------------------------  2 [S] COG1992 Uncharacterized conserved protein
---|------|-|||-|----|--------------||----------||--||||--||||||||  2 [R] COG1999 Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC, involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems
|-|-----||||------------------------------|||||--|||---|--|||-||--  2 [R] COG2005 N-terminal domain of molybdenum-binding protein
---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||--  2 [C] COG2025 Electron transfer flavoprotein, alpha subunit
||------||||----|--------------------------------|----------------  2 [R] COG2044 Predicted peroxiredoxins
|||||||||||||-------------||--|--------------|---|-|---|---||-||--  2 [NU] COG2064 Flp pilus assembly protein TadC
|||||||||||||||-||------------|-----------------------------------  2 [S] COG2078 Uncharacterized conserved protein
----------|||--------|--||-||-------||----|||----|-----|---||-||--  2 [C] COG2080 Aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, small subunit CoxS/CutS homologs
|-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||--  2 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases
---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||--  2 [C] COG2086 Electron transfer flavoprotein, beta subunit
---||||||-|||-------||----||||-----|||--------|--|-----|---|||||--  2 [S] COG2096 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  2 [R] COG2102 Predicted ATPases of PP-loop superfamily
--||||----||--|---||-|----||------|-||----|||||--|--|--|---||-||--  2 [PR] COG2146 Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenases
||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--|  2 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold
--|||||||-|||||----|----|||--------------------------||||||-------  2 [R] COG2236 Predicted phosphoribosyltransferases
-|----||--|-|----|------------------------------------------------  2 [S] COG2245 Predicted membrane protein
-|----|||-|||-----------------------------------------------------  2 [L] COG2254 Predicted HD superfamily hydrolase, possibly a nuclease
------||--|-|----|------------|--|--------|||||---|---------------  2 [G] COG2407 L-fucose isomerase and related proteins
------|||||-|-----------------------------------------------------  2 [S] COG2411 Uncharacterized conserved protein
-||------||||-----------------------------|||||-|-----------------  2 [R] COG2425 Uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain
----||--|-|||---------------------|||-----------------------------  2 [S] COG2427 Uncharacterized conserved protein
----||----|||------|------|||------|||----|||-|-||--||||----|-||--  2 [G] COG2513 PEP phosphonomutase and related enzymes
--||--|||-|||-----------------------------------------------------  2 [R] COG2522 Predicted transcriptional regulator
---|------|||-----------|----|-||---------|||||-|-||--------------  2 [F] COG2820 Uridine phosphorylase
-||------||||-------------|---||-|-|-----------------||-----------  2 [S] COG2848 Uncharacterized conserved protein
|--|------|||||-|--|-|----||||-------|----|||||-||-----|---|||||--  2 [P] COG2897 Rhodanese-related sulfurtransferase
----||--|-|||---|--------------------|-----------|------------||--  2 [I] COG3255 Putative sterol carrier protein
--------|-||------------------------------|||-|---||--------------  2 [P] COG3301 Formate-dependent nitrite reductase, membrane component
---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||---  2 [R] COG3845 ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase components
|-|-|||||-||------------------|------------------------|------||--  2 [C] COG4231 Indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha and beta subunits
----------|||-----||------||||------------------------------------  2 [S] COG4243 Predicted membrane protein
--------|-|||-----------------------------------------------------  2 [S] COG4343 Uncharacterized protein conserved in archaea
---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||---  2 [R] COG4603 ABC-type uncharacterized transport system, permease component
--|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||---  2 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component
----|--|--|-------------------------------------------------------  2 [G] COG4945 Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase
------|-|-|-------|-------|---------|-----------------------------  2 [S] COG5428 Uncharacterized conserved small protein
----------|||-----------------------------------------------------  2 [S] COG5493 Uncharacterized conserved protein containing a coiled-coil domain
--------|-|--------|-------||-------------------------------------  2 [S] COG5551 Uncharacterized conserved protein
||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||--  1 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||--  1 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase
||-|||-|-||-|||-|-|||------|||-----|-|----------------------------  1 [P] COG0003 Oxyanion-translocating ATPase
|||||||||||||||-||||-------||||-||-|||----|--||--|--|------||-|---  1 [F] COG0005 Purine nucleoside phosphorylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---|||||||  1 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5)
|||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||---  1 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family
||-||||||||--|--|||-------|||-|--||-||----------------------------  1 [S] COG0011 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase
---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---|||||||  1 [C] COG0022 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit
|||||||||||||||---||----------------------|||||-||||--------------  1 [J] COG0023 Translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1) and related proteins
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase
---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||--  1 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase)
|||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase]
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)
--||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0031 Cysteine synthase
|--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||--  1 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase
||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--||||||||  1 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||--  1 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||--  1 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  1 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0048 Ribosomal protein S12
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0049 Ribosomal protein S7
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0051 Ribosomal protein S10
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase
-||---||--||-|--|-||||||--|||-||||--||----|||||-||||-------||-|---  1 [G] COG0058 Glucan phosphorylase
|||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||-||||-|----|||||-----------|||||-||--|--|||||||||--  1 [S] COG0062 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||--  1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase
||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit
|||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit
|||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||--  1 [E] COG0067 Glutamate synthase domain 1
|||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||--  1 [E] COG0069 Glutamate synthase domain 2
|||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||--  1 [E] COG0070 Glutamate synthase domain 3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0073 EMAP domain
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  1 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit
||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||--  1 [E] COG0077 Prephenate dehydratase
|||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0082 Chorismate synthase
-|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||-------  1 [E] COG0083 Homoserine kinase
|||---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0084 Mg-dependent DNase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11
|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase
|||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase
||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-|  1 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)
|||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||--  1 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase
--||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG0114 Fumarase
||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase
-|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||----------  1 [L] COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase
||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||--  1 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0125 Thymidylate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase
|||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--||||||||  1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase
||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase
||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase
||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase
-||--|--|||||||-|-||-------|-------|-|------------------||-|||||--  1 [EQ] COG0145 N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit
-||--|---||||||-|-||-------|----------------------------||-|||||--  1 [EQ] COG0146 N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0148 Enolase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase
------|---|--||--|--|---|-|||-||-|--||----|||||-|-||--------------  1 [G] COG0153 Galactokinase
||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---|||||||||||||  1 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases
--------|-||-||-|-||-|----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||--  1 [P] COG0155 Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)
||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||--  1 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain
--||||||--|||||----|-|----|||||---|-||----|||||-|||----|---||||---  1 [E] COG0160 4-aminobutyrate aminotransferase and related aminotransferases
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  1 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase
||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0164 Ribonuclease HII
||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase
-|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase
|||-|||||||--||||-||----||--------------------------------------||  1 [I] COG0170 Dolichol kinase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||--  1 [H] COG0171 NAD synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease
|||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||--  1 [Q] COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-|||||||||||||||  1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase
|||-|||||||||||-|||||---------------|------------|--|-------|-|---  1 [J] COG0182 Predicted translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17
--||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||  1 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY
||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit
|-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit
|--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase
|||||||||||||||--|--||----|||||--|||||------------||--------------  1 [H] COG0214 Pyridoxine biosynthesis enzyme
--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A)
||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--||||||  1 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10
|||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0250 Transcription antiterminator
---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family
|||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|----  1 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)
|-||------||-||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain
|||---|||||||-----------------|-|||-|--||-|||-|-|-||--------------  1 [G] COG0269 3-hexulose-6-phosphate synthase and related proteins
|--|||----|-|---||||-|--|-|||||||||||||||||||||-|-||-------||-|---  1 [F] COG0274 Deoxyribose-phosphate aldolase
--|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [C] COG0281 Malic enzyme
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase
|--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG0288 Carbonic anhydrase
|||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes
---|------|-|||--|---|---|-||||||||||||||||||||-|-||-------||-||--  1 [F] COG0295 Cytidine deaminase
-|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|---  1 [G] COG0297 Glycogen synthase
--||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN
|||||||||||||----|------|-----|||||||||||||||||-||||--------------  1 [H] COG0301 Thiamine biosynthesis ATP pyrophosphatase
----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--|||||||||||  1 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I
||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|---  1 [P] COG0306 Phosphate/sulphate permeases
--|-||----||-|||--||-|----||||-|||--------|||||-||||||||---|||||--  1 [E] COG0308 Aminopeptidase N
|||||||||||||---|-||----------|-----------|||-|---------|||-------  1 [O] COG0309 Hydrogenase maturation factor
|||||||||||||||--|---|----|||||--|||||------------||--------------  1 [H] COG0311 Predicted glutamine amidotransferase involved in pyridoxine biosynthesis
|||||||||-|||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0314 Molybdopterin converting factor, large subunit
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0315 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme
---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  1 [H] COG0320 Lipoate synthase
----------|--||---||-|----||||------------||||||||||||||---|||||||  1 [H] COG0321 Lipoate-protein ligase B
---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0328 Ribonuclease HI
|||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase
----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase
|||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase
|-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase
||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-|  1 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase
|||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1)
--|-||----|--||--|||-|----|||-||||||||-|--|||||-||-----|---||-||--  1 [G] COG0366 Glycosidases
|||||||||||-||||----------||||||---|||----|||||-||--|-------|-|---  1 [E] COG0367 Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)
|||||||||||||-----||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||---  1 [H] COG0368 Cobalamin-5-phosphate synthase
|||||||||||||-|--|||----------||||-|||----|||||-------------|-----  1 [C] COG0371 Glycerol dehydrogenase and related enzymes
||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||-------  1 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases
||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||--  1 [H] COG0379 Quinolinate synthase
|---||----|--|||--|-------||||------------|||-|--------|----|-|---  1 [G] COG0380 Trehalose-6-phosphate synthase
|||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||--  1 [O] COG0396 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, ATPase component
||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||--  1 [M] COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis
|||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||--  1 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases
----||----||||||--||||----|||-----|-||----|||-|-||--||||||-||-||--  1 [E] COG0405 Gamma-glutamyltransferase
---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||--  1 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase
||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|-----  1 [L] COG0420 DNA repair exonuclease
-|--|||||||||||-||---|----|---|--|--||----||||||-|--||||||----|---  1 [E] COG0421 Spermidine synthase
||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||--  1 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC
||||||||||||||||-----|--|||||||---|---||||------------------------  1 [J] COG0423 Glycyl-tRNA synthetase (class II)
||||--|||||||||||--|----------------------|||-|--|-----|----------  1 [A] COG0430 RNA 3'-terminal phosphate cyclase
|||---|||||||-|-||||-|-----||-|-----||----|||-|-||---------||-----  1 [S] COG0432 Uncharacterized conserved protein
-|-|--|||||-|-----||----------------------|---|------------|--|---  1 [R] COG0434 Predicted TIM-barrel enzyme
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase
||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains
|||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--|||||||||||  1 [O] COG0450 Peroxiredoxin
|||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  1 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase
|||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|  1 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase
-|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||--  1 [G] COG0469 Pyruvate kinase
||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||----  1 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters
||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-||  1 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase
|||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||||  1 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase
|||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-||||||||||||||  1 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components
|-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2
-|||--||||||||||--------------------------------------------------  1 [T] COG0478 RIO-like serine/threonine protein kinase fused to N-terminal HTH domain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases)
||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--||||||||  1 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family
||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning
--|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||||  1 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0498 Threonine synthase
|||||||||||||||-||||------||||-------------------|--|--|---|||||--  1 [H] COG0499 S-adenosylhomocysteine hydrolase
||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||---  1 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase)
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  1 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit
---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  1 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit
|||||||||||||---|--|-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0521 Molybdopterin biosynthesis enzymes
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase
|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0527 Aspartokinases
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0528 Uridylate kinase
||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---|||||||  1 [E] COG0531 Amino acid transporters
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity
---|||--|-|||||-||||-|-----||--|--||||----|||||--|-|---|||-|||||--  1 [C] COG0538 Isocitrate dehydrogenases
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||--  1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-|  1 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase
---|||||--|-|-----|------------||||-----|-|||-|--||---------|-----  1 [E] COG0549 Carbamate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0550 Topoisomerase IA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase
||||||||||||------||-|-----||-|------|----|||||-||||||||---|||||--  1 [O] COG0555 ABC-type sulfate transport system, permease component
|-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase
|||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase
|-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|---  1 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily
||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||----  1 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||--  1 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component
---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||--  1 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
|||||||||||||||||----|--------------------|||||-||||----|||-------  1 [S] COG0585 Uncharacterized conserved protein
--||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) 
-||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-|  1 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters
||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes
|||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase
--||||----||-||-|--|-|----||||-|--||||----|||||-||-||--|---|||||--  1 [CR] COG0604 NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductases
|-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [P] COG0605 Superoxide dismutase
|-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-||||  1 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase
-||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||--  1 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component
|||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|--  1 [H] COG0611 Thiamine monophosphate kinase
----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--|||||||||||  1 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases
|||||||||||||||||--------------|--|||----------------------------|  1 [MI] COG0615 Cytidylyltransferase
-|||--|||||-|---||||||--|||||-||||||||||||------|-----------------  1 [R] COG0618 Exopolyphosphatase-related proteins
|||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||--  1 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent)
|||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase
--||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases
--|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||--  1 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase
-|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||--  1 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases
||||||||--||||||||----||---||||---|||||||||||||||-----------------  1 [L] COG0648 Endonuclease IV
||||-||||-|||----|||-|----|||-----||||----|||-|-||---------|||--||  1 [CP] COG0651 Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit
----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-||||  1 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat
---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||--  1 [C] COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases)
|-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||--  1 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins
||----||--|------|------------|---|-------|||||-||-||--|---||-|---  1 [M] COG0677 UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0681 Signal peptidase I
--|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase
---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||--  1 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein
|---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---|||||||  1 [J] COG0689 RNase PH
-|-------|||----|-------------------------|||||--|||------|-|-----  1 [E] COG0709 Selenophosphate synthase
||||||-|||||-||-|-----||-------||||||-----|||-|------||-----------  1 [E] COG0710 3-dehydroquinate dehydratase
|||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-|||||||||||||||||  1 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase
||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase
--||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--||||||||||||||  1 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [P] COG0725 ABC-type molybdate transport system, periplasmic component
|||||||||||||||--||||---------|-------------------------|||-------  1 [C] COG0731 Fe-S oxidoreductases
--|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins
|||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||--  1 [H] COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1
--|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [O] COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  1 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component
----------|-|---||||-------------||-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I
----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0793 Periplasmic protease
|||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation
|-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-||  1 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin
--||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC
----||||--|||||----|------|----|-|||||------------||----|||--|----  1 [K] COG0819 Putative transcription activator
|-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [R] COG0824 Predicted thioesterase
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0838 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 3 (chain A)
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit
||||--|||||||-----------------|----|||----|||-|---------||---|-|--  1 [K] COG0864 Predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain and a metal-binding domain
-|||||----|----------|---||---|-----|-|----||-|---|---|-|||----|--  1 [V] COG1002 Type II restriction enzyme, methylase subunits
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG1005 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG1007 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N)
--||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--||||||||||||||  1 [CP] COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit
||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG1010 Precorrin-3B methylase
||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-|  1 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases
|||||||||||--||---------------------------------------------------  1 [R] COG1019 Predicted nucleotidyltransferase
---|----|-|-|||||-|||---||||||---------------|--||||--------------  1 [I] COG1022 Long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)
-|||--|||||-|----|------------------------------------------------  1 [C] COG1031 Uncharacterized Fe-S oxidoreductase
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [L] COG1041 Predicted DNA modification methylase
|||||||||||||-------||--|-----------------|||||-|||||||||||-------  1 [O] COG1047 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2
--||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---|||||||  1 [C] COG1048 Aconitase A
----|||||-|||----||||-||---|||----||||----||||--||---|||--||--|---  1 [P] COG1055 Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases
---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||--  1 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA
---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---|||||||  1 [C] COG1071 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, alpha subunit
|||||||||||||--|||--|----------||||||||-||------------------------  1 [R] COG1078 HD superfamily phosphohydrolases
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1084 Predicted GTPase
--|---|-|-|--||--|--------||--||----------|||||-|-||--------------  1 [C] COG1085 Galactose-1-phosphate uridylyltransferase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1093 Translation initiation factor 2, alpha subunit (eIF-2alpha)
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1094 Predicted RNA-binding protein (contains KH domains)
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1095 DNA-directed RNA polymerase, subunit E'
|-|-|||||||||||---------------------------------------------------  1 [J] COG1096 Predicted RNA-binding protein (consists of S1 domain and a Zn-ribbon domain)
|-|-||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1097 RNA-binding protein Rrp4 and related proteins (contain S1 domain and KH domain)
|||||||||||||||||-||-|----------------------------------------|---  1 [R] COG1100 GTPase SAR1 and related small G proteins
|||||||||||||-----------||----------------------------------------  1 [F] COG1102 Cytidylate kinase
|-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  1 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [G] COG1109 Phosphomannomutase
-|----|||||||---||------------------------------------------------  1 [L] COG1110 Reverse gyrase
-||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||--  1 [P] COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component
|-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  1 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component
||||--|||||||----|||||--|-||||||||||||||||-||-|-|-|----|---|||----  1 [P] COG1122 ABC-type cobalt transport system, ATPase component
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  1 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component
--|-----|-|-|--------|--------------------|||||-|||||------|||||||  1 [O] COG1138 Cytochrome c biogenesis factor
|--|||--|-|||-------||---------|----||----|||------|-||||||-------  1 [C] COG1139 Uncharacterized conserved protein containing a ferredoxin-like domain
----------|-|-------------|||-----|-|-----|||-|--|-----|-----|----  1 [C] COG1140 Nitrate reductase beta subunit
|||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1 [C] COG1155 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit A
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1 [C] COG1156 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit B
-||---||-|||||||-||||----|----||||||||||||------|----||-----------  1 [R] COG1161 Predicted GTPases
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1163 Predicted GTPase
---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [E] COG1171 Threonine dehydratase
---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||--  1 [E] COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I
---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||--  1 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II
-||||||||-|-|||--|------------------------------------------------  1 [J] COG1184 Translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family
--|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||-----  1 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II)
|--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase
----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------|||||||  1 [L] COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)
|||||||||||||||||-------------------------|----------------||-----  1 [R] COG1204 Superfamily II helicase
|||---||||||-||----|-|----|||-------||-----||---------------|-----  1 [R] COG1205 Distinct helicase family with a unique C-terminal domain including a metal-binding cysteine cluster
------||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1224 DNA helicase TIP49, TBP-interacting protein
--|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||--  1 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component
--||--|-|-|--||-|----|||--||||----||||-------|---------|-------|--  1 [H] COG1232 Protoporphyrinogen oxidase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [L] COG1241 Predicted ATPase involved in replication control, Cdc46/Mcm family
||||||||||||-|||-|--|---------|-----------------------------------  1 [KB] COG1243 Histone acetyltransferase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1245 Predicted ATPase, RNase L inhibitor (RLI) homolog
--|-------|-|-----||-|----|---||-|||||----|||-|-||-----|---|||||--  1 [M] COG1247 Sortase and related acyltransferases
---|||--|-|||-------||-----||||---|-||----|||||-||-----|---|||||||  1 [I] COG1250 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase
||||||||||||||||---------|-----|||||------------|-----------------  1 [I] COG1257 Hydroxymethylglutaryl-CoA reductase
|||||||||||||--|--------------------------------------------------  1 [J] COG1258 Predicted pseudouridylate synthase
--||----|-|||---||||--||--||||------------------------------------  1 [S] COG1259 Uncharacterized conserved protein
|-|---|||-||||--||--------||||------------------------------|-----  1 [I] COG1260 Myo-inositol-1-phosphate synthase
|||---||-||-|---|---|-----------|--|||----|||||-||||-||||||-----||  1 [I] COG1267 Phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1 [C] COG1269 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit I
|||||||||||||-----||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---||||---  1 [H] COG1270 Cobalamin biosynthesis protein CobD/CbiB
|||||||||-||-||-------------------------------------------|-------  1 [R] COG1287 Uncharacterized membrane protein, required for N-linked glycosylation
---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--||||||||||||||  1 [C] COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex
||||||||||||||||-|||||---|----||||||||------------------|||-------  1 [K] COG1293 Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP
|||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----|||||||  1 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases
|-|---||||||----||||-|-----||||----|||-----------||||--|---||-||--  1 [E] COG1305 Transglutaminase-like enzymes, putative cysteine proteases
|||||||||||-||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1308 Transcription factor homologous to NACalpha-BTF3
|-|||||||||||||||-||-|-----||--------------||||--|-----|----------  1 [R] COG1310 Predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily
|||---|||||-|---||------------|-----------------------------------  1 [R] COG1313 Uncharacterized Fe-S protein PflX, homolog of pyruvate formate lyase activating proteins
-|----|||||-|---||------------------------------------------------  1 [K] COG1318 Predicted transcriptional regulators
|||||||||||||----|---||||-||||||||||||----|||-|-----|---------|---  1 [K] COG1321 Mn-dependent transcriptional regulator
|-|-|||||||-|--|||-|-|-|------------------|||||-----|--|--------||  1 [P] COG1324 Uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations
|-||||--|-|||---|--|-|||---||-|-----|------------------------||---  1 [O] COG1331 Highly conserved protein containing a thioredoxin domain
--|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||--  1 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase
|||--||--|||-----|-|-------||-------------------------------------  1 [L] COG1337 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily)
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [KH] COG1339 Transcriptional regulator of a riboflavin/FAD biosynthetic operon
|-|||||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1340 Uncharacterized archaeal coiled-coil protein
---|||||--|||---||||--|||||||||-------------------------|||-----||  1 [F] COG1351 Predicted alternative thymidylate synthase
|||--||-||||----||---------||--------|----------------------------  1 [R] COG1353 Predicted hydrolase of the HD superfamily (permuted catalytic motifs)
|||-|||||||||||-||--------------------------------------------|---  1 [R] COG1355 Predicted dioxygenase
||||||||||||||||-|--|---------||||||||----------------------------  1 [J] COG1358 Ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a)
-||||||||-||-----|------------------------------------------------  1 [M] COG1361 S-layer domain
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [O] COG1370 Prefoldin, molecular chaperone implicated in de novo protein folding, alpha subunit
|||||||||||||---||---------||-------------------------------------  1 [S] COG1371 Uncharacterized conserved protein
|||||||||||||--------|--------------|-----------------------------  1 [K] COG1378 Predicted transcriptional regulators
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [O] COG1382 Prefoldin, chaperonin cofactor
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1383 Ribosomal protein S17E
||||--|||||||-----------------------------------------------------  1 [L] COG1389 DNA topoisomerase VI, subunit B
|||||||||||-||||----||||||----------------------------------------  1 [C] COG1390 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit E
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1 [C] COG1394 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit D
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [K] COG1395 Predicted transcriptional regulator
|-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||||  1 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [U] COG1400 Signal recognition particle 19 kDa protein
|-|---|---||----|-|--|-----------|--|-----|--|----------|||-------  1 [V] COG1401 GTPase subunit of restriction endonuclease
||-|-----||||----|||-------||------|-|---------------------|||||--  1 [R] COG1402 Uncharacterized protein, putative amidase
|||||||||||||----------------------------------------------|||||--  1 [R] COG1407 Predicted ICC-like phosphoesterases
|-|-------|-----|--|-|||--||||||---|||----|------------||||-|-|---  1 [R] COG1408 Predicted phosphohydrolases
|-|---|||||-|||-|-||--||--||||||--|||-----|||||-||||---|---|||||--  1 [R] COG1409 Predicted phosphohydrolases
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1412 Uncharacterized proteins of PilT N-term./Vapc superfamily
|---|||||||||-----------------------------------------------|-|---  1 [S] COG1415 Uncharacterized conserved protein
----||--|-|-|---|----|||-------------|------------------|||-------  1 [R] COG1427 Predicted periplasmic solute-binding protein
||-|--||-||------|||----||--------------------------|--|---|||||--  1 [S] COG1430 Uncharacterized conserved protein
---||-----|----|-|---|---|----|||||||||||||||||-|-||-------||-|---  1 [F] COG1435 Thymidine kinase
||||||||||||||||----||--|--------|--------------------------------  1 [C] COG1436 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit F
||||--|||||||------------|----|--------------|---------|----------  1 [F] COG1437 Adenylate cyclase, class 2 (thermophilic)
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1439 Predicted nucleic acid-binding protein, consists of a PIN domain and a Zn-ribbon module
---|--||||||||||--------------------------|||||-|-||--------------  1 [R] COG1444 Predicted P-loop ATPase fused to an acetyltransferase
---|||||--||--|---||----------------------|||-|-|------|---|---|--  1 [E] COG1446 Asparaginase
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1460 DNA-directed RNA polymerase, subunit F
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [L] COG1467 Eukaryotic-type DNA primase, catalytic (small) subunit
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1471 Ribosomal protein S4E
|-|||||||-||||||--------------------------------------------------  1 [LO] COG1474 Cdc6-related protein, AAA superfamily ATPase
||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--||||||||||||||  1 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators
-||---|||-||------||-|-----||-----------------|---|-|--|---||-||-|  1 [R] COG1487 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain
--|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||---  1 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase
|---||--|-|||---||||----------|------|----|||||-||||-------|||-|--  1 [R] COG1489 DNA-binding protein, stimulates sugar fermentation
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [J] COG1491 Predicted RNA-binding protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1498 Protein implicated in ribosomal biogenesis, Nop56p homolog
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1499 NMD protein affecting ribosome stability and mRNA decay
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1500 Predicted exosome subunit
----||----||-||--|-|----------||-|-|-|----|||||--------|---|---|--  1 [G] COG1501 Alpha-glucosidases, family 31 of glycosyl hydrolases
----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-|||||||  1 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes
|||||||||||||||||-------------------------------------------------  1 [J] COG1503 Peptide chain release factor 1 (eRF1)
|||-|||||||||---||-|-|----|---|---|-||----|||||--|-----|---|||||--  1 [J] COG1514 2'-5' RNA ligase
---||||||||||-|-||-|-|--------|-----|-----|||||-----|-------------  1 [L] COG1515 Deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V)
|||-||--|-||--------------|||-----||||----|||||-||||---|--||||||--  1 [C] COG1526 Uncharacterized protein required for formate dehydrogenase activity
|||||||||||--|||----||----------||--------------------------------  1 [C] COG1527 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit C
---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---|||||||  1 [J] COG1530 Ribonucleases G and E
||-----||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1531 Uncharacterized protein conserved in archaea
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1537 Predicted RNA-binding proteins
---|||----|||---|-||-|------------|-||----------------------------  1 [S] COG1547 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1552 Ribosomal protein L40E
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1571 Predicted DNA-binding protein containing a Zn-ribbon domain
||||--||||||||||---------|-----|||||------------------------------  1 [I] COG1577 Mevalonate kinase
|||---|||||-----||------------------------------------------------  1 [S] COG1578 Uncharacterized conserved protein
||--|||||||||-----------------------------------------------------  1 [K] COG1581 Archaeal DNA-binding protein
-|----|||||||||---------------------------------------------------  1 [S] COG1590 Uncharacterized conserved protein
||-|--|||||||-----------------------------------------------------  1 [L] COG1591 Holliday junction resolvase - archaeal type
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1601 Translation initiation factor 2, beta subunit (eIF-2beta)/eIF-5 N-terminal domain
||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG1605 Chorismate mutase
---|||----|||--------|||--|-------||||----||||||||||-|||||||||||--  1 [I] COG1607 Acyl-CoA hydrolase
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1608 Predicted archaeal kinase
--|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||--  1 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein
|||-|||||||||---||------------------------------------------------  1 [F] COG1618 Predicted nucleotide kinase
|||||||||||||--------|--------------------------------------------  1 [S] COG1628 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1631 Ribosomal protein L44E
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1634 Uncharacterized Rossmann fold enzyme
||||--|||||||||--|------------------------------------------------  1 [H] COG1635 Flavoprotein involved in thiazole biosynthesis
||-|--||-||||------|------||||------------------------------------  1 [L] COG1637 Predicted nuclease of the RecB family
----------|-----|-||||||-||||--|||--------|||||-||||---|----------  1 [G] COG1640 4-alpha-glucanotransferase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1644 DNA-directed RNA polymerase, subunit N (RpoN/RPB10)
-|||--|||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1645 Uncharacterized Zn-finger containing protein
|||||||||||||---------------------||||----------------------------  1 [R] COG1646 Predicted phosphate-binding enzymes, TIM-barrel fold
||||||--|||-|||-|---|------||-|---||||----||||||||--|||----|||||--  1 [H] COG1648 Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain)
-||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1650 Uncharacterized protein conserved in archaea
----|||||||||---||------|--||--------------------------|----------  1 [S] COG1656 Uncharacterized conserved protein
||||--|||-|||----|---|--------||-|||||--------------|----------|--  1 [CP] COG1668 ABC-type Na+ efflux pump, permease component
||||--||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1675 Transcription initiation factor IIE, alpha subunit
|||---|||||-|------------------------------------|---------||-|---  1 [S] COG1679 Uncharacterized conserved protein
--|---||--|-|-----||-|----||||||||||||----|||||--|--|--|---|||||||  1 [V] COG1680 Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins
||||||-||||||-----------------------------------------------------  1 [EH] COG1685 Archaeal shikimate kinase
|||---|||-|||---||------------------------------------------------  1 [L] COG1688 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily)
|||||||||||||--|||-|-|----|||-|------|----|||-|--|-----|----------  1 [S] COG1690 Uncharacterized conserved protein
--|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-|  1 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase
||||--||||||||||--------------------------------------------------  1 [L] COG1697 DNA topoisomerase VI, subunit A
||||--|||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1701 Uncharacterized protein conserved in archaea
---------||-|---||||-|----||||-|||||||----|||||-||-|||||---|||||--  1 [T] COG1702 Phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase
-||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [K] COG1709 Predicted transcriptional regulator
|||-----|||------|-------------------------------|-----|----------  1 [R] COG1712 Predicted dinucleotide-utilizing enzyme
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1717 Ribosomal protein L32E
||||||||||||||||-----|-----------------------|---|----------------  1 [TD] COG1718 Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control
--|||||||-|-|---||||-|---|-|||-----|||----------||-----|---|||||--  1 [R] COG1721 Uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1727 Ribosomal protein L18E
|||||||||||||||-|-------------------------------------------------  1 [O] COG1730 Predicted prefoldin, molecular chaperone implicated in de novo protein folding
|||-----|||||-----------------------------------------------------  1 [H] COG1731 Archaeal riboflavin synthase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1736 Diphthamide synthase subunit DPH2
--||----|-|-|----|--||||-||-------|-|-----|||||-||||-||----||||---  1 [S] COG1738 Uncharacterized conserved protein
--|-||----|-------||------|||-|-----------|||||-||-|---|---|||||--  1 [R] COG1741 Pirin-related protein
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [J] COG1746 tRNA nucleotidyltransferase (CCA-adding enzyme)
----|||-|-|-|||---||-|-----------|---|----------|--|----|||||||---  1 [E] COG1748 Saccharopine dehydrogenase and related proteins
-||---|||-|||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1750 Archaeal serine proteases
-|--||||||||||||--------------------------------------------------  1 [S] COG1756 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1761 DNA-directed RNA polymerase, subunit L
|||||-|||||||---|-----------------||||----|||||-|-||---|--|||||---  1 [H] COG1763 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein
|||-|||||||||||---------------------------------------------------  1 [R] COG1779 C4-type Zn-finger protein
|||||||||||||----|------------|-----------|||||||----||-----------  1 [F] COG1781 Aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1782 Predicted metal-dependent RNase, consists of a metallo-beta-lactamase domain and an RNA-binding KH domain
|||---|||||-|------------------------------------|---------||-|---  1 [S] COG1786 Uncharacterized conserved protein
|||||||||||||||||----------||-------||----------|||--||---|||-||--  1 [L] COG1793 ATP-dependent DNA ligase
||||||--||||------||||-----||-|----|-|--------|--|-----|---||||---  1 [H] COG1797 Cobyrinic acid a,c-diamide synthase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1798 Diphthamide biosynthesis methyltransferase
-----|--|-||---------|-----||-------------|||-|--|-----|---|||||--  1 [C] COG1804 Predicted acyl-CoA transferases/carnitine dehydratase
|||||||||||||---|---------------|---------------------------------  1 [E] COG1812 Archaeal S-adenosylmethionine synthetase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1813 Predicted transcription factor, homolog of eukaryotic MBF1
|||---||--|-------------------------------------------------------  1 [S] COG1817 Uncharacterized protein conserved in archaea
--||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components
||||||||||||----||||-|----||||-|--||||--------------------|-||||--  1 [F] COG1828 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, PurS component
||||--|||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1829 Predicted archaeal kinase (sugar kinase superfamily)
|||||||||||-|-----------------------------------------------------  1 [R] COG1831 Predicted metal-dependent hydrolase (urease superfamily)
---|||||--|||---||---|---------|||-|||----|||||--------|--|||-|---  1 [R] COG1832 Predicted CoA-binding protein
||||-|||||||-----|------------------------------------------------  1 [S] COG1833 Uncharacterized conserved protein
|||||||||-|-------||-----------------|----------------------------  1 [S] COG1836 Predicted membrane protein
|||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||---  1 [C] COG1838 Tartrate dehydratase beta subunit/Fumarate hydratase class I, C-terminal domain
|---|||||-|||----|---------||--------------------------|----------  1 [S] COG1839 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----||||||  1 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E
---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  1 [C] COG1845 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1849 Uncharacterized protein conserved in archaea
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1855 ATPase (PilT family)
|||---|||-|||---|---|---------------------------------------------  1 [L] COG1857 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
--|-|||||||-|||-----||--------------------|||----|---------|------  1 [J] COG1859 RNA:NAD 2'-phosphotransferase
|||||||-|-|-------------------------------------------------------  1 [S] COG1860 Uncharacterized protein conserved in archaea
-||||||||||||-----------------------||----------------------------  1 [S] COG1865 Uncharacterized conserved protein
|||||||||||||||||-------------------------------------------------  1 [J] COG1867 N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase
|---||----|--|||----------||||------------|||-|--------|------|---  1 [G] COG1877 Trehalose-6-phosphatase
||||||-||-||-----|||------|||-----|--|-----------|||---|---||-|---  1 [R] COG1878 Predicted metal-dependent hydrolase
||--|||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1888 Uncharacterized protein conserved in archaea
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1889 Fibrillarin-like rRNA methylase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1890 Ribosomal protein S3AE
|-||--||||||------------------------------------------------------  1 [S] COG1892 Uncharacterized protein conserved in archaea
---|--|||-|-|||-|--|------|||-|||-||||----|||||-||-----|------||--  1 [H] COG1893 Ketopantoate reductase
---|--|||||||||------|------------||------|||||-||-|----||||||||--  1 [R] COG1896 Predicted hydrolases of HD superfamily
||||||||||||||||---|-------------------------------------------|--  1 [O] COG1899 Deoxyhypusine synthase
-|||--|||||-|-----------------------------------|-----------------  1 [S] COG1901 Uncharacterized conserved protein
|||-||--||||------|||---------|----|----------|--|-----|---|-|----  1 [H] COG1903 Cobalamin biosynthesis protein CbiD
------|||-|------|------------------------------------------------  1 [S] COG1906 Uncharacterized conserved protein
|||-|||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1909 Uncharacterized protein conserved in archaea
|||---||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1911 Ribosomal protein L30E
-|||--|||||||---||-|-------------|||-------||-----------||--------  1 [S] COG1912 Uncharacterized conserved protein
-|-|--|||||||---|-------------------------------------------------  1 [R] COG1913 Predicted Zn-dependent proteases
||||||||--||----|||||-----||--|||--|||-------||--|-----||||||||---  1 [S] COG1917 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain
||||--|||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1931 Uncharacterized protein conserved in archaea
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [F] COG1936 Predicted nucleotide kinase (related to CMP and AMP kinases)
---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||--  1 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase
||||--||||||||||--------------------------------------------------  1 [L] COG1948 ERCC4-type nuclease
|||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||---  1 [C] COG1951 Tartrate dehydratase alpha subunit/Fumarate hydratase class I, N-terminal domain
-----||---|-------||-|----|||-|-||||||----|||||-||--|--|---|||||--  1 [L] COG1961 Site-specific recombinases, DNA invertase Pin homologs
|||-|||||||||--------------||-------------------------------------  1 [R] COG1964 Predicted Fe-S oxidoreductases
--|----|--|-|---|---|-----|||-||----||----|||||-||||-||||||-------  1 [T] COG1966 Carbon starvation protein, predicted membrane protein
|--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||--  1 [V] COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein
----------|||--------|-----||-------||----|||----|-----|---|||||--  1 [O] COG1975 Xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1976 Translation initiation factor 6 (eIF-6)
||--|||||||||---|-------------------------------------------------  1 [G] COG1980 Archaeal fructose 1,6-bisphosphatase
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis
||--||--|||||------------------------|----|||||-|-----------------  1 [S] COG1986 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||----------|---------------------------------------  1 [S] COG1990 Uncharacterized conserved protein
||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||--  1 [R] COG1994 Zn-dependent proteases
|||||||||||||||---------------|-----------------------------------  1 [K] COG1996 DNA-directed RNA polymerase, subunit RPC10 (contains C4-type Zn-finger)
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1997 Ribosomal protein L37AE/L43A
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [J] COG1998 Ribosomal protein S27AE
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2004 Ribosomal protein S24E
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2007 Ribosomal protein S8E
---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--||||||||||||||  1 [C] COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG2012 DNA-directed RNA polymerase, subunit H, RpoH/RPB5
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2016 Predicted RNA-binding protein (contains PUA domain)
||--||||-||||------------------------------------------------|----  1 [F] COG2019 Archaeal adenylate kinase
|||||||||||||-----||||----|||||------|----|||-|-||-----|---|||||--  1 [H] COG2038 NaMN:DMB phosphoribosyltransferase
--||||--|-|||---|--|-|----|||-------|-----|||||--|-|---|--||||||--  1 [R] COG2041 Sulfite oxidase and related enzymes
-------||-|||||-|-||-|--------------||--------------------|-------  1 [P] COG2046 ATP sulfurylase (sulfate adenylyltransferase)
--|||||||-||--|-|----|----|||--|||||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [Q] COG2050 Uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2051 Ribosomal protein S27E
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2053 Ribosomal protein S28E/S33
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2058 Ribosomal protein L12E/L44/L45/RPP1/RPP2
--------|-|||---|-||------||||------------|||||-|||||--|--||||||--  1 [T] COG2062 Phosphohistidine phosphatase SixA
|--------||||--------|-----||-------||----|||----------|---||-||--  1 [R] COG2068 Uncharacterized MobA-related protein
||-|||--||||------|||---------|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG2073 Cobalamin biosynthesis protein CbiG
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2075 Ribosomal protein L24E
|---||----||||------------|||-------||----|||-|--|-----|---||-|---  1 [R] COG2079 Uncharacterized protein involved in propionate catabolism
||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG2082 Precorrin isomerase
||-|--|||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2090 Uncharacterized protein conserved in archaea
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [J] COG2092 Translation elongation factor EF-1beta
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [K] COG2093 DNA-directed RNA polymerase, subunit E''
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2097 Ribosomal protein L31E
-|----|||||-|-----------------------------------------------------  1 [R] COG2100 Predicted Fe-S oxidoreductase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG2101 TATA-box binding protein (TBP), component of TFIID and TFIIIB
-||---|---||------||-|--------------||----|||||-||-----|----------  1 [S] COG2105 Uncharacterized conserved protein
|--|--|||||||||---------------------------------------------------  1 [S] COG2106 Uncharacterized conserved protein
----||--|-|||---|----|||-------------|------------------|||-------  1 [R] COG2107 Predicted periplasmic solute-binding protein
-|||--|||||||-----------------|-----------------------------------  1 [R] COG2108 Uncharacterized conserved protein related to pyruvate formate-lyase activating enzyme
--||||||--|------|||||-----||-------------|||||-||-----|---||||---  1 [H] COG2109 ATP:corrinoid adenosyltransferase
--|-||||||||||--||--||-----||---|-||------|||-|--|-----|------|---  1 [R] COG2110 Predicted phosphatase homologous to the C-terminal domain of histone macroH2A1
-|----|||-|||---|-------------------------------------------------  1 [T] COG2112 Predicted Ser/Thr protein kinase
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [R] COG2118 DNA-binding protein
|-|-||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2123 RNase PH-related exoribonuclease
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2125 Ribosomal protein S6E (S10)
|||---|||||||---|-------------------------------------------|-----  1 [R] COG2129 Predicted phosphoesterases, related to the Icc protein
---|------|--||-|--|------|||-------||----|||||--|||||||--||||||--  1 [Q] COG2132 Putative multicopper oxidases
----------|-------||-|---|-|||-------|----|||-|--|--|--|---||-||--  1 [G] COG2133 Glucose/sorbosone dehydrogenases
|||---||||||||||--------------------------------------------------  1 [JA] COG2136 Predicted exosome subunit/U3 small nucleolar ribonucleoprotein (snoRNP) component, contains IMP4 domain
||||----||||------||-|----|||-----|-||-----------------|----------  1 [S] COG2138 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2139 Ribosomal protein L21E
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2147 Ribosomal protein L19E
|||-||||-||||----|---|----||||-|||||||----|---------|--|---|||||--  1 [R] COG2151 Predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme
---|------||-||-|-||------||||------------------||--|--|----||||--  1 [H] COG2154 Pterin-4a-carbinolamine dehydratase
|||---||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2157 Ribosomal protein L20A (L18A)
||----||-|||||||--------------|------|----------------------------  1 [J] COG2163 Ribosomal protein L14E/L6E/L27E
||----||-|||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2174 Ribosomal protein L34E
-||---|||||||-|---------------------------------------------------  1 [J] COG2178 Predicted RNA-binding protein of the translin family
--------|-|-|-------------|||-----|-|-----|||-|--|-----|-----|----  1 [C] COG2180 Nitrate reductase delta subunit
--------|-|---------------|||-----|-|-----|||-|--|-----|-----|----  1 [C] COG2181 Nitrate reductase gamma subunit
----|-||--|||----|---|---------|||||||----|||||-|----------|------  1 [G] COG2182 Maltose-binding periplasmic proteins/domains
|-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||--  1 [P] COG2217 Cation transport ATPase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [L] COG2219 Eukaryotic-type DNA primase, large subunit
----------||-|-------|----||||-------|----|||||-||-----|---|||||--  1 [C] COG2225 Malate synthase
--|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis
-||||||||-|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2237 Predicted membrane protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2238 Ribosomal protein S19E (S16A)
||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG2241 Precorrin-6B methylase 1
||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|---------||||---  1 [H] COG2242 Precorrin-6B methylase 2
||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG2243 Precorrin-2 methylase
---||||||||||-----||------||||||-||||-----|---|--|-----|------||--  1 [S] COG2246 Predicted membrane protein
-|----|||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG2248 Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [J] COG2260 Predicted Zn-ribbon RNA-binding protein
-|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||--  1 [R] COG2262 GTPases
|||||||||||||--|--------------------------------------------------  1 [J] COG2263 Predicted RNA methylase
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [H] COG2266 GTP:adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase
---|--||--|||-------||-------------|||-------|--|-------------|--|  1 [E] COG2317 Zn-dependent carboxypeptidase
------||--|||-|------|||-----------|-|-----------|-----|---|||||--  1 [E] COG2355 Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase homolog
----||--|-|||-----||-|---------------------------|-----|-----|-|--  1 [R] COG2366 Protein related to penicillin acylase
--------|-||---------|--------------||-------||--|-|--------------  1 [Q] COG2368 Aromatic ring hydroxylase
----||||--|||----|---|---------------------------|-----|---||||---  1 [G] COG2379 Putative glycerate kinase
---|||---|||-----|---|------------|-------|||||-||--|--|--|||||---  1 [R] COG2391 Predicted transporter component
---|---||-|-----|-||-------|--------------------------------------  1 [R] COG2402 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain
|-----||-||-|-----|-----------------------------------------------  1 [R] COG2403 Predicted GTPase
|-|-------|||----|------------------------------------------------  1 [R] COG2406 Protein distantly related to bacterial ferritins
----||----|||--------|----|||||---|||-----------------------------  1 [R] COG2409 Predicted drug exporters of the RND superfamily
|-------|||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2410 Uncharacterized conserved protein
------|||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2419 Uncharacterized conserved protein
|-||||--|||||||-----------|-------|----------|---|-----|---||||---  1 [E] COG2423 Predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin homolog
||-|------|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2429 Uncharacterized conserved protein
--|---|||-|-|-----------------------------------------------------  1 [S] COG2430 Uncharacterized conserved protein
------||--|||-------|---------------------|||||-|-||-||-----------  1 [S] COG2431 Predicted membrane protein
|-||--|||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2433 Uncharacterized conserved protein
----||----|||----|--|---------------------|||-|-------------|-|---  1 [C] COG2440 Ferredoxin-like protein
-||---||--||-||----|-|----|---------------||||--||----------------  1 [T] COG2453 Predicted protein-tyrosine phosphatase
--|---||||||-----||-|---------||-----|----------|--------------|--  1 [R] COG2509 Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [J] COG2511 Archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit E (contains GAD domain)
----------|-|--------|----|-----||||||---------------------||||---  1 [R] COG2514 Predicted ring-cleavage extradiol dioxygenase
||||--|||||||-|--|------------------------|||||-||--||||||||||||--  1 [O] COG2518 Protein-L-isoaspartate carboxylmethyltransferase
||-||||||||||||-||--------||||------------------------------------  1 [J] COG2519 tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase and related methyltransferases
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG2520 Predicted methyltransferase
-|----||-||-|---------------------------------------|-------------  1 [R] COG2521 Predicted archaeal methyltransferase
||||----|-|||-----------------------------------------------------  1 [K] COG2524 Predicted transcriptional regulator, contains C-terminal CBS domains
----------|-|------||-----||-|-||||||-----|||||-||||-|||---|||||--  1 [S] COG2606 Uncharacterized conserved protein
----||||--||--------------|---||||||||----|||||-|----------||--|--  1 [G] COG2723 Beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/beta-galactosidase
---------||-------||-|----||||||--||||----|||||-||-----|---|||||--  1 [K] COG2771 DNA-binding HTH domain-containing proteins
--||------|||-------------||||------------|||||-||-|||||----||||--  1 [S] COG2835 Uncharacterized conserved protein
----------|-----|----|----|---------------------||-|-|||--||||||||  1 [S] COG2847 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---|------||---------|----|----||---||----|||||-||||---|--||||||--  1 [S] COG2860 Predicted membrane protein
--|-||||--||||---|--||--------|------|----------||-----|---||||---  1 [R] COG2872 Predicted metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase HxxxH domain
||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG2875 Precorrin-4 methylase
----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------  1 [E] COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase
---|--|||-|-|-----||----------------------------------------------  1 [S] COG2886 Uncharacterized small protein
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [J] COG2888 Predicted Zn-ribbon RNA-binding protein with a function in translation
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG2896 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme
--------|-|-------------------------------||||||||||--------------  1 [P] COG2920 Dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), gamma subunit
|---------|-------------------------------------|------|--|-------  1 [H] COG2998 ABC-type tungstate transport system, permease component
----------|-----|-------------------------------||-|------|-|-----  1 [R] COG3019 Predicted metal-binding protein
----------||------|----------------|------|---|--|-----|---|-|||--  1 [R] COG3193 Uncharacterized protein, possibly involved in utilization of glycolate and propanediol
---|------|--------||-----|||--|--|--|----||||--||---------||-||--  1 [P] COG3221 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, periplasmic component
----------||------|------------------------------|---|||---|||----  1 [P] COG3256 Nitric oxide reductase large subunit
||||||--|||-------------------------------------------------------  1 [R] COG3269 Predicted RNA-binding protein, contains TRAM domain
|||||||||||-||||--------------------------------------------------  1 [J] COG3277 RNA-binding protein involved in rRNA processing
-|----||-||-|-----------------------------------------------------  1 [S] COG3286 Uncharacterized protein conserved in archaea
-|-|------|-|--------|--------------------------------------------  1 [S] COG3294 Uncharacterized conserved protein
---|------|||------------------------|-----------|----------------  1 [S] COG3342 Uncharacterized conserved protein
--|-||----|------|-|-------------------------|-----|------|-------  1 [S] COG3350 Uncharacterized conserved protein
|--|||--||||------------------------------------------------------  1 [S] COG3356 Predicted membrane protein
---|---|||||------------------------------------------------------  1 [K] COG3357 Predicted transcriptional regulator containing an HTH domain fused to a Zn-ribbon
----||--|-|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG3370 Uncharacterized protein conserved in archaea
----||||--|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG3371 Predicted membrane protein
--|||||||-||-------|----------------------------------------------  1 [S] COG3372 Uncharacterized conserved protein
----||--|-||-----|------------------------------------------------  1 [S] COG3374 Predicted membrane protein
---------||||-----------------|||---||--------|--|-----|------|---  1 [S] COG3382 Uncharacterized conserved protein
---|||--|-||------------------------------------------------------  1 [R] COG3413 Predicted DNA binding protein
----------|--------------------------------------|---|||----||----  1 [P] COG3420 Nitrous oxidase accessory protein
||||||||||||||||---------|-----||||||--------|-----------------|--  1 [I] COG3425 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase
---|||----|||--------|-----||--------------------------|----|||---  1 [S] COG3427 Uncharacterized conserved protein
--||||||-|||----|-||----------------------------------------------  1 [S] COG3431 Predicted membrane protein
-||-||--|-|||-----------------------------------------------------  1 [K] COG3432 Predicted transcriptional regulator
----------|--------|----------|-----||-----||-|--|----------------  1 [P] COG3546 Mn-containing catalase
|||-|||||||||---||---|--------------------------------------------  1 [G] COG3635 Predicted phosphoglycerate mutase, AP superfamily
---|------|--------||-----|----|--|--|-|||||||---|---------||-||--  1 [P] COG3639 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [T] COG3642 Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase
--|-------|------|--|--------------------------------------|||||--  1 [C] COG3808 Inorganic pyrophosphatase
----------|-----------------------------------------------|---||--  1 [S] COG3809 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-||-----|||---------------||||||-|-|-------------|---||-----------  1 [T] COG3830 ACT domain-containing protein
----|--|--||-----|---|---------|||||||-|--|||||-|-----------------  1 [G] COG3833 ABC-type maltose transport systems, permease component
------||--|||-----------------------------------------------------  1 [R] COG3889 Predicted solute binding protein
----------|||-----------------|-----------------|-----------------  1 [S] COG3945 Uncharacterized conserved protein
-|--||-|--|||----|--|------------|-----------||------------||-|---  1 [G] COG3958 Transketolase, C-terminal subunit
-|--||-|--|||----|--|------------|-----------||------------||-|---  1 [G] COG3959 Transketolase, N-terminal subunit
---------||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG4006 Uncharacterized protein conserved in archaea
---|||---||-|-----------------------------------------------------  1 [U] COG4023 Preprotein translocase subunit Sec61beta
--------|||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG4034 Uncharacterized protein conserved in archaea
|--------||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG4046 Uncharacterized protein conserved in archaea
------||-||-|-----------------------------------------------------  1 [S] COG4047 Uncharacterized protein conserved in archaea
-|-------||||-----------------------------------------------------  1 [L] COG4080 RecB-family nuclease
--|-----||||------------------------------------------------------  1 [S] COG4089 Predicted membrane protein
---|--||--|----------|--|-----------------|||||-|-||-||----||||---  1 [H] COG4143 ABC-type thiamine transport system, periplasmic component
--------|-|--------------------------------------------|----|-|---  1 [S] COG4274 Uncharacterized conserved protein
------||--|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG4345 Uncharacterized protein conserved in archaea
------||--|||-----------------------------------------------------  1 [O] COG4346 Predicted membrane-bound dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase
----------||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG4352 Ribosomal protein L13E
----------|||---|-------------------------------------------------  1 [S] COG4353 Uncharacterized conserved protein
|---------|-------------------------------------|------|--|-------  1 [H] COG4662 ABC-type tungstate transport system, periplasmic component
---||-----|-|-------|-------------||-|----|||-|--------|----|||---  1 [I] COG4670 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase
----------|-|--------------------||-------------------------------  1 [S] COG4732 Predicted membrane protein
--|-||----|------|------------------------------------------------  1 [F] COG4741 Predicted secreted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase
----||----||----------------------------------------|--|----------  1 [S] COG4754 Uncharacterized conserved protein
----------|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG4755 Uncharacterized protein conserved in archaea
--------|-|-|-----------------------------------------------------  1 [R] COG4756 Predicted cation transporter
--|-------|--------|----------------------------------------------  1 [O] COG4826 Serine protease inhibitor
----------||-|||--------------------------------------------------  1 [J] COG4830 Ribosomal protein S26
----||----|-|-----------------------------------------------------  1 [S] COG4847 Uncharacterized protein conserved in archaea
----------|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG4879 Uncharacterized protein conserved in archaea
-|------|-|-------------------------------------------------------  1 [R] COG4880 Secreted protein containing C-terminal beta-propeller domain distantly related to WD-40 repeats
--------|-|-|-----------------------------------------------------  1 [S] COG4881 Predicted membrane protein
----------|||-----------------------------------------------------  1 [R] COG4882 Predicted aminopeptidase, Iap family
----------||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG4888 Uncharacterized Zn ribbon-containing protein
----------|||-----------------------------------------------------  1 [R] COG4900 Predicted metallopeptidase
----------||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG4901 Ribosomal protein S25
--------|-|-|-----------------------------------------------------  1 [S] COG4904 Uncharacterized protein conserved in archaea
----------||----|-------------------------------------------------  1 [S] COG4911 Uncharacterized conserved protein
----------|||-----------------------------------------------------  1 [R] COG4914 Predicted nucleotidyltransferase
----------|||-----------------------------------------------------  1 [J] COG4919 Ribosomal protein S30
----------|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG4920 Predicted membrane protein
--|-------|-----------------------------------|-------------------  1 [O] COG4930 Predicted ATP-dependent Lon-type protease
---------||-|-------------------------|----------------------|----  1 [S] COG4933 Uncharacterized conserved protein
----------|------------------------|------------|-----------------  1 [S] COG4938 Uncharacterized conserved protein
----||----||------------------------------------------------------  1 [S] COG4946 Uncharacterized protein related to the periplasmic component of the Tol biopolymer transport system
|-|-------|--------|------|---|-----||----------------------------  1 [KT] COG4978 Transcriptional regulator, effector-binding domain/component
----||----||----------------------------------------|--|----------  1 [P] COG4986 ABC-type anion transport system, duplicated permease component
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||--  1 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase
----------|||-----------------------------------------------------  1 [R] COG4996 Predicted phosphatase
---------||-|-----------------------------------------------------  1 [L] COG4998 Predicted endonuclease (RecB family)
----------|-|-------------|||-----|-|-----|||-|--|-----|-----|----  1 [C] COG5013 Nitrate reductase alpha subunit
---------||------|------------------------------------------------  1 [R] COG5014 Predicted Fe-S oxidoreductase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG5256 Translation elongation factor EF-1alpha (GTPase)
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG5257 Translation initiation factor 2, gamma subunit (eIF-2gamma; GTPase)
|--|----|-||------------------------------------------------------  1 [R] COG5258 GTPase
-||---||-||-------------------------------------------------------  1 [J] COG5270 PUA domain (predicted RNA-binding domain)
----------|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG5399 Uncharacterized protein conserved in archaea
--|-------|-|-----------------------------------------------------  1 [S] COG5483 Uncharacterized conserved protein
----------|||-----------------------------------------------------  1 [O] COG5494 Predicted thioredoxin/glutaredoxin
------|||-|-|-----------------------------------------------------  1 [K] COG5625 Predicted transcription regulator containing HTH domain