| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ --||-|-----|------||-|---------------|----|------------|----|----- 37 [L] COG3385 FOG: Transposase and inactivated derivatives --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 17 [NT] COG0840 Methyl-accepting chemotaxis protein ||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 16 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases |||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---||||||| 15 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins |||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||-- 14 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators |-||----|-----|-||||-|||-||||||----|||----|||||-||--|--|--||||||-- 14 [T] COG2202 FOG: PAS/PAC domain ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 13 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily |-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 13 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase |-|||||||-||||||-------------------------------------------------- 13 [LO] COG1474 Cdc6-related protein, AAA superfamily ATPase ---|||--|-||------------------------------------------------------ 13 [R] COG3413 Predicted DNA binding protein ||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--|||||||||||||| 12 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning |||||||||||||--------|----|||-|-----||----|||||-||||-|||---|||||-- 12 [K] COG1522 Transcriptional regulators |-|||||||-|||----|-|||----||||||||||||----|||||-|------|------||-- 12 [K] COG1695 Predicted transcriptional regulators |||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 11 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 11 [K] COG2101 TATA-box binding protein (TBP), component of TFIID and TFIIIB |-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-|||| 10 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase -|||||||-|||----||||-|---|-||-------------|||-|-----|---||-------- 10 [L] COG0675 Transposase and inactivated derivatives ||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 9 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis ||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||---- 9 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component |||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 9 [L] COG0582 Integrase ||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|--- 8 [P] COG0306 Phosphate/sulphate permeases ||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 8 [M] COG0438 Glycosyltransferase |||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 8 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases ||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 8 [O] COG0492 Thioredoxin reductase |||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 8 [R] COG0517 FOG: CBS domain |-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 8 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 8 [K] COG1405 Transcription initiation factor TFIIIB, Brf1 subunit/Transcription initiation factor TFIIB ---|||---|||-----|---|------------|-------|||||-||--|--|--|||||--- 8 [R] COG2391 Predicted transporter component --||--------------||---------------------------------------||||--- 8 [C] COG3794 Plastocyanin ||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 7 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases |-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 7 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes |||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 7 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins |-||--|||----|||-|||-|--||-||-|----|||----|||||-|||||--|||||||||-- 7 [T] COG0784 FOG: CheY-like receiver --|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 7 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) ||||||--|||------------------------------------------------------- 7 [R] COG3269 Predicted RNA-binding protein, contains TRAM domain ||||||||||||||||--||-|----||||------||-----------|-----|--|||-|--- 6 [O] COG0464 ATPases of the AAA+ class -||||||||--||----------------------------------------------------- 6 [N] COG1681 Archaeal flagellins ---|||--|-||||-----|||----|||||---|-||----|||||-||---|||---|||||-- 6 [I] COG1960 Acyl-CoA dehydrogenases |-||----|-----|-||||-|-----||||---|-||----|||---||-----|---|||||-- 6 [T] COG2203 FOG: GAF domain --||-|---------------|----------||---------|||-------------||||--- 6 [L] COG3436 Transposase and inactivated derivatives |||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---||||||| 5 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein) ||||||||||------||||||--||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 5 [D] COG0206 Cell division GTPase ||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-|||||||||||||| 5 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component ||||||||||-|||||-------------------------------------------------- 5 [L] COG1599 Single-stranded DNA-binding replication protein A (RPA), large (70 kD) subunit and related ssDNA-binding proteins -|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-||||||||||||| 5 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins ---|--||----|-------|----|----|---|-||-------||-|-||-||-|||------- 5 [C] COG1757 Na+/H+ antiporter --||||---------------------||-------------|-----|----|||---||-|--- 5 [L] COG3039 Transposase and inactivated derivatives, IS5 family -|||----||-|------------------------------------------------------ 5 [K] COG3355 Predicted transcriptional regulator ---|||||---||||-||||--||--|----|||||||-||||||||-||---------------- 4 [H] COG0095 Lipoate-protein ligase A ||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||--- 4 [C] COG0247 Fe-S oxidoreductase ||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||-- 4 [O] COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation |||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase ||||||||||||||--||||---------------------------------------||-|--- 4 [T] COG0467 RecA-superfamily ATPases implicated in signal transduction ||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 4 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump |-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 4 [R] COG0546 Predicted phosphatases -|||--|||||-|---||||||--|||||-||||||||||||------|----------------- 4 [R] COG0618 Exopolyphosphatase-related proteins ---|---------||||-||-|||--|---------------||||||||||-|||---||||||| 4 [C] COG0633 Ferredoxin |||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||-- 4 [C] COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins) ---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||-- 4 [C] COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases) |-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---||||||| 4 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins |||||||||||||---||||-|---|||||||||||-||-|||||||-||--|--|---|||||-- 4 [P] COG0704 Phosphate uptake regulator |||||||||||||---||||-|---||||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 4 [R] COG0714 MoxR-like ATPases |||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [R] COG0730 Predicted permeases -|||||----|----------|---||---|-----|-|----||-|---|---|-|||----|-- 4 [V] COG1002 Type II restriction enzyme, methylase subunits ||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-| 4 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases --||||--|-------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 4 [C] COG1271 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1 --||------------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 4 [C] COG1294 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2 |||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----||||||| 4 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases |||||||||||||----|---||||-||||||||||||----|||-|-----|---------|--- 4 [K] COG1321 Mn-dependent transcriptional regulator --||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||-- 4 [L] COG1943 Transposase and inactivated derivatives --||||--|-||----|---|-------------|-|----------------------------- 4 [S] COG2210 Uncharacterized conserved protein ---|--|--|--|---|----|---|-------|||||---------------------||||--- 4 [E] COG2309 Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T) ---|---------||----|---------------------------------------------- 4 [R] COG5524 Bacteriorhodopsin |||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||-- 3 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases ||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||---- 3 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components ||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-||||||| 3 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase |-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 3 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II --|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|-- 3 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase |-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 3 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases ||||--||||------||||------|||||---|||-|||||||-|--|--|--|---||||--- 3 [S] COG0392 Predicted integral membrane protein |||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||-- 3 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases --|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||--- 3 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase |||||||||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0498 Threonine synthase |||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||-- 3 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family ||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---||||||| 3 [E] COG0531 Amino acid transporters --||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||--- 3 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components -||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||-- 3 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component ||||----|--||---||||-|--------|------|----|||||-||||-|||---------- 3 [R] COG0613 Predicted metal-dependent phosphoesterases (PHP family) -||||||||-|||---------------------------------------|---||-||||||| 3 [NU] COG0630 Type IV secretory pathway, VirB11 components, and related ATPases involved in archaeal flagella biosynthesis ||||-||||-|||----|||-|----|||-----||||----|||-|-||---------|||--|| 3 [CP] COG0651 Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit |||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--|||||||||||||| 3 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel |-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily ---|---------||-|-||-|----|----|--||||----|||||-|||-|--|---|||||-- 3 [MG] COG0702 Predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerases -|||--|||-------|---|-|||-|------|||||----------|-||-||-|||------- 3 [R] COG0733 Na+-dependent transporters of the SNF family --|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||--- 3 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component ||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||-- 3 [R] COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily) ---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---||||||| 3 [I] COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase --|||||||-||||||---|||--|-|||||-||||------|||||-|----------------- 3 [KL] COG1061 DNA or RNA helicases of superfamily II --|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||-- 3 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases |||||||||||||--|||--|----------||||||||-||------------------------ 3 [R] COG1078 HD superfamily phosphohydrolases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 3 [G] COG1109 Phosphomannomutase -||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||-- 3 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||--- 3 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components ||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|-- 3 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases |||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||-- 3 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon) |-|||||||--||----|||-|----|||||||---||----|||||--|--||||---||-||-- 3 [M] COG1209 dTDP-glucose pyrophosphorylase --||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-| 3 [O] COG1225 Peroxiredoxin ||||-------||-----||-|----|||-----||-|-----------------|------||-- 3 [Q] COG1233 Phytoene dehydrogenase and related proteins --||---------||-|||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains |||||||||||||--------|--------------|----------------------------- 3 [K] COG1378 Predicted transcriptional regulators ||||---||----------|-|--------||||||||-----------|-------------|-- 3 [K] COG1476 Predicted transcriptional regulators |--|-------|-||---||-|----|||-----|-|---------------||||---|||||-- 3 [I] COG1562 Phytoene/squalene synthetase --|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--||||||||||||| 3 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase --||--|||--------|------|-----|----|||----------|-------|||------- 3 [NT] COG1776 Chemotaxis protein CheC, inhibitor of MCP methylation |-||||-|||-||----||--|--------|||----------------|------------||-- 3 [S] COG2013 Uncharacterized conserved protein ---|----|--|-||-----||----||||----|-|-----|--||-||-----|---|||||-- 3 [I] COG2030 Acyl dehydratase ---|---------|-----|------||||------|-----|||-|--|---------||||--- 3 [S] COG2135 Uncharacterized conserved protein ||||----||||------||-|----|||-----|-||-----------------|---------- 3 [S] COG2138 Uncharacterized conserved protein |-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||-- 3 [P] COG2217 Cation transport ATPase ||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--| 3 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold ||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 3 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid ---|--||-------------------||------------------------------------- 3 [S] COG2253 Uncharacterized conserved protein ---|---||-|-----|-||-------|-------------------------------------- 3 [R] COG2402 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain --||---|------|------------||-------------|||||--|||-------|||||-- 3 [P] COG3119 Arylsulfatase A and related enzymes --||||--|--------------------------------------------------------- 3 [S] COG3430 Uncharacterized protein conserved in archaea |-|||--------------|||--------||-----|--------|------|||----|||--- 3 [R] COG3467 Predicted flavin-nucleotide-binding protein --||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||-- 3 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components ---|---------------------------|---|-|-------||-||---------------- 3 [R] COG3979 Uncharacterized protein contain chitin-binding domain type 3 ---|---------------------------------------------|----------|----- 3 [K] COG4190 Predicted transcriptional regulator --|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||--- 3 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component --||----|--------------------------------------------------------- 3 [O] COG4745 Predicted membrane-bound mannosyltransferase ---|||--||-||----|||||----||||||--||||----|||||--|-----|---|||||-- 3 [MR] COG4948 L-alanine-DL-glutamate epimerase and related enzymes of enolase superfamily ---|--||-------------------||------------------------------------- 3 [K] COG5340 Predicted transcriptional regulator ||-|||-|-||-|||-|-|||------|||-----|-|---------------------------- 2 [P] COG0003 Oxyanion-translocating ATPase |||||||||||||||-||||-------||||-||-|||----|--||--|--|------||-|--- 2 [F] COG0005 Purine nucleoside phosphorylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase |||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||--- 2 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase --||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0031 Cysteine synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0051 Ribosomal protein S10 |||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 2 [G] COG0061 Predicted sugar kinase ||||--||||--||----||-------||--|---|-|----||||--|-|---------|||--- 2 [E] COG0076 Glutamate decarboxylase and related PLP-dependent proteins |||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit ||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-| 2 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) ||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase |-||--|||---||||--|--|-----||-|-----||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 2 [L] COG0122 3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I --||||||--|||||----|-|----|||||---|-||----|||||-|||----|---||||--- 2 [E] COG0160 4-aminobutyrate aminotransferase and related aminotransferases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase |-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 2 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component -|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation --||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---||||||| 2 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family) |||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 2 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes |||||||||||||---|-||-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [H] COG0303 Molybdopterin biosynthesis enzyme |||||||||||||---|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 2 [O] COG0309 Hydrogenase maturation factor |||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs ||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1) |-||||--|-|||||||-||-|-----||--|--||||----|||||-||-||--||-||||||-- 2 [I] COG0365 Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases |||||||||||||-|--|||----------||||-|||----|||||-------------|----- 2 [C] COG0371 Glycerol dehydrogenase and related enzymes |||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-||||||||||||||| 2 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases --||---------||---||||----|||-|----|||----|||-|-||-|---|---|||||-- 2 [R] COG0384 Predicted epimerase, PhzC/PhzF homolog ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--||||---|||||-- 2 [E] COG0404 Glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase) |-||-------|-|----||------|-----|-||------||||||||----|----|--||-- 2 [L] COG0415 Deoxyribodipyrimidine photolyase ||||||||||||||||---|----------------------|||||-||---------------- 2 [L] COG0417 DNA polymerase elongation subunit (family B) ||||--||--||||||||-|-|---||||------|------|||-|--|---|||--|-|----- 2 [P] COG0428 Predicted divalent heavy-metal cations transporter |||||||||||||---||||-|-----||---|----|----||||---|-|---|---|||||-- 2 [R] COG0433 Predicted ATPase ||-|--||||------||-|----||-||||-----||----------||-----||||------- 2 [D] COG0455 ATPases involved in chromosome partitioning ||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 2 [R] COG0456 Acetyltransferases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family) |||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||-- 2 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function ||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||--- 2 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II ||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain ||||||||||||-||-|||-----||-----------|----|||||-|--|--------|----- 2 [P] COG0530 Ca2+/Na+ antiporter |||||||||||||---||||-|-----||-||--|-||-----------|-----|----|-|--- 2 [R] COG0535 Predicted Fe-S oxidoreductases |||||||||-|||||||-||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase --||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|----- 2 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family |-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||-- 2 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component ||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 2 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component ---|||-----|-|||--|--|---|||||-|||||||----|||||-|||||--|---||||--- 2 [C] COG0578 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 2 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component |-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-|| 2 [ER] COG0591 Na+/proline symporter |-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [P] COG0605 Superoxide dismutase -||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component --||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases ||||||||||||||||-----------|||------------------------------------ 2 [O] COG0638 20S proteasome, alpha and beta subunits ---|--|||--||||-||--|-----|||--|||||||----|||||--|--------|||||||| 2 [G] COG0647 Predicted sugar phosphatases of the HAD superfamily ---|||||--||||||-||-------||||||||||||----|||||--|-----|---|||||-- 2 [R] COG0656 Aldo/keto reductases, related to diketogulonate reductase ||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-||||||| 2 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 2 [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit ---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 2 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein -||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||-- 2 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase ---|----|----||---||--||----------||||----|||||||||||---|||||||||| 2 [O] COG0694 Thioredoxin-like proteins and domains |||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-||||||||||||||||| 2 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 2 [O] COG0719 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component ||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase |--|----|----||-|||--|--|-|---|||-||||-|--|||||-|-||---|||-||-|--- 2 [F] COG0737 5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases |||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1 --||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC --||--|||--------|||----||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 2 [NT] COG0835 Chemotaxis signal transduction protein --||||--|--||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 2 [C] COG0839 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J) ---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 2 [C] COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1 -|||---||--|----|-||------|||---|---||----|||||-||-||--|--|||||||| 2 [M] COG1004 Predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 2 [H] COG1010 Precorrin-3B methylase |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 2 [C] COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit |||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||-- 2 [C] COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit ||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||------- 2 [HR] COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 2 [C] COG1071 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, alpha subunit ||||--||||-------------------------------------------------------- 2 [L] COG1107 Archaea-specific RecJ-like exonuclease, contains DnaJ-type Zn finger domain |||||-||||-|-||||||-|------||||---|---|||||||-|--|--|---|--------| 2 [L] COG1112 Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 2 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component ||||--|||||||----|||||--|-||||||||||||||||-||-|-|-|----|---|||---- 2 [P] COG1122 ABC-type cobalt transport system, ATPase component ||||----|||||---|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component |--|---||-|-|----|||-------||-||||||||---------------------------- 2 [C] COG1141 Ferredoxin ---|--||--|-|-----||||--|-|------|---|----|||||-||||-|||--|||||--- 2 [P] COG1178 ABC-type Fe3+ transport system, permease component -||||||||-|-|||--|------------------------------------------------ 2 [J] COG1184 Translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family |||||||||||||||||-------------------------|----------------||----- 2 [R] COG1204 Superfamily II helicase ||||--||||-|||||-------------------------------------------------- 2 [O] COG1222 ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit ||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||-- 2 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III ||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 2 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes ---|||--|-|||-------||-----||||---|-||----|||||-||-----|---||||||| 2 [I] COG1250 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase |-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||-- 2 [R] COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease ---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---||||||| 2 [K] COG1278 Cold shock proteins |||||||||-||-||-------------------------------------------|------- 2 [R] COG1287 Uncharacterized membrane protein, required for N-linked glycosylation ---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--|||||||||||||| 2 [C] COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex |-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 2 [K] COG1309 Transcriptional regulator |-|||||||||||||||-||-|-----||--------------||||--|-----|---------- 2 [R] COG1310 Predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily |-||||--|-|||---|--|-|||---||-|-----|------------------------||--- 2 [O] COG1331 Highly conserved protein containing a thioredoxin domain --|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||-- 2 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase -||||||||-||-----|------------------------------------------------ 2 [M] COG1361 S-layer domain ||-|-----||||----|||-------||------|-|---------------------|||||-- 2 [R] COG1402 Uncharacterized protein, putative amidase --||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|--- 2 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases |||||||||||||----------------------------------------------|||||-- 2 [R] COG1407 Predicted ICC-like phosphoesterases |-||---------|||--||--||||--------|-||----||-----|------------|--- 2 [C] COG1413 FOG: HEAT repeat ||||||||||-------------------------------------------------------- 2 [S] COG1422 Predicted membrane protein ||||--||||------|-||-|--|-|---------------------||----|-||||||||-- 2 [S] COG1432 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||||------------------------------------------------- 2 [J] COG1503 Peptide chain release factor 1 (eRF1) ---|||||--|||||---|-||------------|-||-----------|--|------|---|-| 2 [E] COG1506 Dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases ||||--|||--------|---|---|-|||------|-----|||||-||--|--|-------||| 2 [S] COG1520 FOG: WD40-like repeat |||||||||||||--------------||----------------------------------|-- 2 [R] COG1545 Predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon |||||||||-||||||-------------------------------------------------- 2 [K] COG1594 DNA-directed RNA polymerase, subunit M/Transcription elongation factor TFIIS ---|||----|||--------|||--|-------||||----||||||||||-|||||||||||-- 2 [I] COG1607 Acyl-CoA hydrolase ---|--------|||-|-||-|----||||----||||-----------|--|--|---||||||| 2 [O] COG1612 Uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly ---|----|-||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 2 [C] COG1622 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2 ||-|--||-||||------|------||||------------------------------------ 2 [L] COG1637 Predicted nuclease of the RecB family |||||||||||||---------------------||||---------------------------- 2 [R] COG1646 Predicted phosphate-binding enzymes, TIM-barrel fold ||||--|||-|||----|---|--------||-|||||--------------|----------|-- 2 [CP] COG1668 ABC-type Na+ efflux pump, permease component ||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||-- 2 [K] COG1733 Predicted transcriptional regulators ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-|||||||-------|-----|---||||--- 2 [R] COG1744 Uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein ||||----||-------------------------------------------------------- 2 [R] COG1745 Predicted metal-binding protein |||||-|||||||---|-----------------||||----|||||-|-||---|--|||||--- 2 [H] COG1763 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [K] COG1813 Predicted transcription factor, homolog of eukaryotic MBF1 |-||--||||--|----------------------------------------------------- 2 [P] COG1824 Permease, similar to cation transporters ||||--||||-||---|--|--||------------------|||||----|-------||-|--- 2 [G] COG1830 DhnA-type fructose-1,6-bisphosphate aldolase and related enzymes ||||||||||--------------------|-----||---------------------------- 2 [S] COG1873 Uncharacterized conserved protein ---||||||--||--------|----||||-------|----|||----------|---|||||-- 2 [I] COG1884 Methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit -|||--||||-------------------------------------------------------- 2 [S] COG1885 Uncharacterized protein conserved in archaea ||||--|||--------------------------------------------------------- 2 [S] COG1967 Predicted membrane protein ||||--||-||||----|------------------------------------------------ 2 [S] COG1992 Uncharacterized conserved protein ||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||-- 2 [R] COG1994 Zn-dependent proteases ||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--|| 2 [P] COG2111 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhB subunit ||||----||-|-------|-|----||||--||||||-|--|||||--|--|--|---|||||-- 2 [C] COG2141 Coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases ---|-------------|||-------||----||-------|||-|-|----------|-----| 2 [D] COG2161 Antitoxin of toxin-antitoxin stability system ---||||||--||-------||----||||-------|----|||----------|---|||||-- 2 [I] COG2185 Methylmalonyl-CoA mutase, C-terminal domain/subunit (cobalamin-binding) ---|---------|||-|||-|--||----|---------|||||-|-||--|||-||||||||-- 2 [O] COG2214 DnaJ-class molecular chaperone |-||--||||---||-|--|-------||-|-----||----|||-|-||--|----------|-- 2 [R] COG2234 Predicted aminopeptidases -||||||||-|||----------------------------------------------------- 2 [S] COG2237 Predicted membrane protein ---||||||||||-----||------||||||-||||-----|---|--|-----|------||-- 2 [S] COG2246 Predicted membrane protein -|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 2 [R] COG2262 GTPases ---|------------|----|------------||||---------------------------- 2 [S] COG2322 Predicted membrane protein |-||||--|||||||-----------|-------|----------|---|-----|---||||--- 2 [E] COG2423 Predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin homolog ||-|------|||----------------------------------------------------- 2 [S] COG2429 Uncharacterized conserved protein -|||--|||--------------------------------------------------------- 2 [S] COG2469 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [R] COG2520 Predicted methyltransferase --||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||---- 2 [P] COG2608 Copper chaperone ---|--------------------------|-----||----|||||-||----------|-|--- 2 [T] COG2766 Putative Ser protein kinase ---|------|||-----------|----|-||---------|||||-|-||-------------- 2 [F] COG2820 Uridine phosphorylase -|||----|-------|----|--||----|-----||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG2834 Outer membrane lipoprotein-sorting protein ||||----|--------------------------------------------------------- 2 [S] COG2881 Uncharacterized protein conserved in archaea |--|------|||||-|--|-|----||||-------|----|||||-||-----|---|||||-- 2 [P] COG2897 Rhodanese-related sulfurtransferase -|-|----|-------|---------|-------||---------|------|--------|||-- 2 [L] COG3316 Transposase and inactivated derivatives ---|---------|---------------------|-|--------|-|----------------- 2 [G] COG3325 Chitinase ---|------|||------------------------|-----------|---------------- 2 [S] COG3342 Uncharacterized conserved protein -|-|||||---------------------------------------------------------- 2 [N] COG3351 Putative archaeal flagellar protein D/E -|-|||||---------------------------------------------------------- 2 [N] COG3354 Putative archaeal flagellar protein G --|||||||-||-------|---------------------------------------------- 2 [S] COG3372 Uncharacterized conserved protein --|||||||--------------------------------------------------------- 2 [S] COG3390 Uncharacterized protein conserved in archaea -|-|-------------|-|------|--------------------------------------- 2 [S] COG3472 Uncharacterized conserved protein -||||||||-|||------|-------||--------------||||-----|--|---||-||-- 2 [K] COG3609 Predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain --||-----------------|-----||-------|------------|---------|--||-- 2 [R] COG3631 Ketosteroid isomerase-related protein ---|----------------------------------------------|--||----------- 2 [L] COG3676 Transposase and inactivated derivatives --||--||---|------|-----------|-----------|||||--------|---------- 2 [L] COG3677 Transposase and inactivated derivatives ---|--||--|----------|--|-----------------|||||-|-||-||----||||--- 2 [H] COG4143 ABC-type thiamine transport system, periplasmic component ---|---------||---||||----|||--|-|||------|||-|-||||||||||||||---- 2 [R] COG4221 Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity ---|---------------|--------------|--|-------|---------|----|----- 2 [Q] COG4264 Siderophore synthetase component ---|--|||--|-||--|--||----||||------||-----------|-----|---||||||| 2 [I] COG4799 Acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta) ||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||-- 1 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase ||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||-- 1 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5) ||-||||||||--|--|||-------|||-|--||-||---------------------------- 1 [S] COG0011 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit ||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||------------- 1 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 1 [C] COG0022 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit |||||||||||||||---||----------------------|||||-||||-------------- 1 [J] COG0023 Translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1) and related proteins ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase ||||||-|||---|||--||-|----|||--|-||||-----|||||-||-||------|--|--- 1 [P] COG0025 NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters ---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase) ---|--||---|----|-|||------||||----|||----|||||-||--||||---||-||-- 1 [H] COG0029 Aspartate oxidase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation) ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase |--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control -|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||-- 1 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC ||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--|||||||| 1 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||-- 1 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase ||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||-- 1 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0048 Ribosomal protein S12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0049 Ribosomal protein S7 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2 ||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--|||||||| 1 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||-|----|||||-----------|||||-||--|--|||||||||-- 1 [S] COG0062 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||-- 1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase ||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---||||||||||||| 1 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog) ||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0073 EMAP domain ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit ||||||||||||||--||||-|--------||--|-||--------|-||------||-||-||-- 1 [E] COG0075 Serine-pyruvate aminotransferase/archaeal aspartate aminotransferase ||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0077 Prephenate dehydratase |||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1 ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0082 Chorismate synthase -|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||------- 1 [E] COG0083 Homoserine kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11 |||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9 ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase |||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase ---|||--|-|||||-|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 1 [O] COG0109 Polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor) ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase --||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0114 Fumarase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase ||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||-- 1 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase ||||--|||||||||||-||-|------------|-||----------||---|||---|||||-- 1 [BQ] COG0123 Deacetylases, including yeast histone deacetylase and acetoin utilization protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0125 Thymidylate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--|||||||| 1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase ||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase ||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase --||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful) ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase ||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase -|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0148 Enolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase ||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---||||||||||||| 1 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases ||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||-- 1 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase ---|---------||---||----------------------|||||-||||-||||||-||-|-- 1 [G] COG0158 Fructose-1,6-bisphosphatase ||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0164 Ribonuclease HII ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase -|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0171 NAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [E] COG0174 Glutamine synthetase -||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 1 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit |||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 1 [Q] COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway) ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-||||||||||||||| 1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17 --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit -|||--|||-|||-----||-|---------------|--||||||||||||||||---|||||-- 1 [HJ] COG0189 Glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase) --||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||| 1 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0195 Transcription elongation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit ---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-||| 1 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases |--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase |||||||||||||||--|--||----|||||--|||||------------||-------------- 1 [H] COG0214 Pyridoxine biosynthesis enzyme --|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase -|||--||||---|--||--|---------|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0218 Predicted GTPase |-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase |-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 1 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase |-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||-- 1 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A) ||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--|||||| 1 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase ||-||||||||||---|-||-|----|||-------||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [C] COG0243 Anaerobic dehydrogenases, typically selenocysteine-containing |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10 |||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0250 Transcription antiterminator ---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family |||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|---- 1 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) |-||------||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain ---|---------||---||----------------------||||||||||||||---||||||| 1 [T] COG0271 Stress-induced morphogen (activity unknown) |--|||----|-|---||||-|--|-|||||||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 1 [F] COG0274 Deoxyribose-phosphate aldolase --||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases ---|---------|||--||----------------------||||||||||||||---||||||| 1 [O] COG0278 Glutaredoxin-related protein --||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-||||||||| 1 [C] COG0280 Phosphotransacetylase --|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0281 Malic enzyme |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase ---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase ||||---||----------|-------||--|||||--|||-|||-|-|||||||||||-||-|-| 1 [V] COG0286 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit ||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase |--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG0288 Carbonic anhydrase ||||||--||---|||--------||----------------||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG0293 23S rRNA methylase ---|------|-|||--|---|---|-||||||||||||||||||||-|-||-------||-||-- 1 [F] COG0295 Cytidine deaminase --||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN |||||||||||||----|------|-----|||||||||||||||||-||||-------------- 1 [H] COG0301 Thiamine biosynthesis ATP pyrophosphatase ---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain ||||----||--------||----------|----|----------|---|----------|---- 1 [P] COG0310 ABC-type Co2+ transport system, permease component |||||||||||||||--|---|----|||||--|||||------------||-------------- 1 [H] COG0311 Predicted glutamine amidotransferase involved in pyridoxine biosynthesis |||||||||-|||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0314 Molybdopterin converting factor, large subunit |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0315 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme ---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 1 [H] COG0320 Lipoate synthase |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex --||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase) ||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||------- 1 [S] COG0327 Uncharacterized conserved protein ---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0328 Ribonuclease HI |||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD |||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase ||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-| 1 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase |||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type) |||||||||||-||||----------||||||---|||----|||||-||--|-------|-|--- 1 [E] COG0367 Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing) |||||||||||||-----||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||--- 1 [H] COG0368 Cobalamin-5-phosphate synthase |-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [C] COG0372 Citrate synthase ||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||------- 1 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase --||----|----|----|--------||--------|----|||||-|---|--|---||-||-- 1 [P] COG0376 Catalase (peroxidase I) --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases ||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||-- 1 [H] COG0379 Quinolinate synthase ||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----|| 1 [M] COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase |-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||-- 1 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase --||-------|-||---|||-----|||-|||||||||||||||||-||-|-|||---|||||-- 1 [L] COG0389 Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair ||||----||---|--||||-|----||||||||||||----|||||-|--|-------------- 1 [S] COG0391 Uncharacterized conserved protein |||||||||--|-----|||-------|||-|---|-|----|||-|-|--|-----------|-- 1 [S] COG0393 Uncharacterized conserved protein |-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||-- 1 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||-||||||||-||-||--|---||||--- 1 [G] COG0395 ABC-type sugar transport system, permease component |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 1 [O] COG0396 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, ATPase component --||---------||---||------|||-||||||||----|||---|-----------|--|-- 1 [S] COG0398 Uncharacterized conserved protein ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG0403 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), N-terminal domain ---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase ||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||---------------- 1 [L] COG0419 ATPase involved in DNA repair ||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|----- 1 [L] COG0420 DNA repair exonuclease ||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||-- 1 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC ||||||||||||||||-----|--|||||||---|---||||------------------------ 1 [J] COG0423 Glycyl-tRNA synthetase (class II) ---|----|----||---|-|-----|---------------|||||--|---------|-|-|-- 1 [C] COG0427 Acetyl-CoA hydrolase ||||--|||||||||||--|----------------------|||-|--|-----|---------- 1 [A] COG0430 RNA 3'-terminal phosphate cyclase ---|---------||---||-|----|||--|||||||--|||||||-||-|-|||---||-||-- 1 [R] COG0431 Predicted flavoprotein -|-|--|||||-|-----||----------------------|---|------------|--|--- 1 [R] COG0434 Predicted TIM-barrel enzyme ---|---------||---||------|---------------|||-|-||---------||||--- 1 [O] COG0435 Predicted glutathione S-transferase --||---||-|||---|-------------------------|||||-||||---|--|-|-|--- 1 [C] COG0437 Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0443 Molecular chaperone |||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases ---|----|---------||------||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 1 [H] COG0447 Dihydroxynaphthoic acid synthase ||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains |||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase |||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [R] COG0457 FOG: TPR repeat ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ) |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase |||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| 1 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase -|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||-- 1 [G] COG0469 Pyruvate kinase ||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||---- 1 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters |-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2 -|||--||||||||||-------------------------------------------------- 1 [T] COG0478 RIO-like serine/threonine protein kinase fused to N-terminal HTH domain ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases) ||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--|||||||| 1 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain ||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase ||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||-- 1 [R] COG0496 Predicted acid phosphatase |||||||||||||||-||||------||||-------------------|--|--|---|||||-- 1 [H] COG0499 S-adenosylhomocysteine hydrolase ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase) ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit ---|---------||---||-|----|||-----|-||----|||||--|-|-|||||||||||-- 1 [E] COG0506 Proline dehydrogenase ---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 1 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes ---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||-- 1 [E] COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding) ---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|--- 1 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit |-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||-- 1 [E] COG0520 Selenocysteine lyase |||||||||||||---|--|-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0521 Molybdopterin biosynthesis enzymes |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0527 Aspartokinases |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0528 Uridylate kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity ---|||--|-|||||-||||-|-----||--|--||||----|||||--|-|---|||-|||||-- 1 [C] COG0538 Isocitrate dehydrogenases |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase ---|||||--|-|-----|------------||||-----|-|||-|--||---------|----- 1 [E] COG0549 Carbamate kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0550 Topoisomerase IA |||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||------- 1 [L] COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase ---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||-- 1 [C] COG0554 Glycerol kinase ||||||||||||------||-|-----||-|------|----|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG0555 ABC-type sulfate transport system, permease component |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex ---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [K] COG0557 Exoribonuclease R |||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase |-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|--- 1 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily --||--|||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases ||||||--||-||-----||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-| 1 [J] COG0565 rRNA methylase ---|---------||--|||-|-|||----|||||||||-|||||||-|-||-------------- 1 [F] COG0572 Uridine kinase |||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--|||||||||||||| 1 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein) ---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||-- 1 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase |||||||||||||||||----|--------------------|||||-||||----|||------- 1 [S] COG0585 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog) ||||--||-|-------|||||----||||||||||||||||--------------|||||||||| 1 [R] COG0595 Predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily ||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes |||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase --||||----||-||-|--|-|----||||-|--||||----|||||-||-||--|---|||||-- 1 [CR] COG0604 NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductases ||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease ||||---||----------|-----------||-||--|||-------||||||--|||-||-|-| 1 [V] COG0610 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases |||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|-- 1 [H] COG0611 Thiamine monophosphate kinase |||||||||||||||||--------------|--|||----------------------------| 1 [MI] COG0615 Cytidylyltransferase |||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class) ||||--||||-||----|||||----||||||||||||||||-||-|---|--------|||---- 1 [P] COG0619 ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters |||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||-- 1 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent) |||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase ||||--|||||||||--|--|---|----|||||||||-||||||||-||---------------- 1 [R] COG0622 Predicted phosphoesterase ||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0628 Predicted permease ||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K -|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||-- 1 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 1 [NT] COG0643 Chemotaxis protein histidine kinase and related kinases ---|------------|-||-|-----||--------------------|----------|-||-- 1 [R] COG0645 Predicted kinase ||||||||--||||||||----||---||||---|||||||||||||||----------------- 1 [L] COG0648 Endonuclease IV --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7 |-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family |-||||-----|-||---||-------||||------|----|||||-||-|||||---||||||| 1 [R] COG0661 Predicted unusual protein kinase --|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating) |-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||-- 1 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0681 Signal peptidase I -|-|----|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG0683 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component ||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-|| 1 [I] COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase --||-----------|--||----------|---|||||||||||||-||------||||------ 1 [G] COG0696 Phosphoglyceromutase -||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||-- 1 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid) ||||||-|||||-||-|-----||-------||||||-----|||-|------||----------- 1 [E] COG0710 3-dehydroquinate dehydratase --||||------|---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0713 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K) ||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---||||||||||||| 1 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit --||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--|||||||||||||| 1 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [P] COG0725 ABC-type molybdate transport system, periplasmic component -|||--|||-||------||-|---------||---------|||||-||--|--||||-|-|--- 1 [R] COG0727 Predicted Fe-S-cluster oxidoreductase |||||||||||||||--||||---------|-------------------------|||------- 1 [C] COG0731 Fe-S oxidoreductases ||||-|-||----------|-------||--|||||--|||||||-|-|||||---|||-||-|-| 1 [V] COG0732 Restriction endonuclease S subunits |||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||-- 1 [H] COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A |||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [C] COG0778 Nitroreductase ---|--------------||||--|||----|||||||-|--|||||-|||||--|||||-|-||| 1 [P] COG0783 DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant) ---|------------|-||-|----|||-------||----|||-|-|||||--|||||||-|-- 1 [F] COG0788 Formyltetrahydrofolate hydrolase |-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-|| 1 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin --||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||| 1 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation |-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [R] COG0824 Predicted thioesterase --||--|||-------||||-|--------|-----------|||||-||--|---||-|||||-| 1 [M] COG0836 Mannose-1-phosphate guanylyltransferase --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0838 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 3 (chain A) |-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||-- 1 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit ||||||--|--------------------------------------------------------- 1 [F] COG0856 Orotate phosphoribosyltransferase homologs ---|----|---------||-|-----||-------------||||||||||-||-|||------- 1 [R] COG0857 BioD-like N-terminal domain of phosphotransacetylase -|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||-- 1 [L] COG0863 DNA modification methylase ||||--|||||||-----------------|----|||----|||-|---------||---|-|-- 1 [K] COG0864 Predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain and a metal-binding domain ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG1003 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), C-terminal domain --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1005 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 1 (chain H) ||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--|| 1 [P] COG1006 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1007 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N) --||||----------|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1008 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M) --||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--|||||||||||||| 1 [CP] COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit ---|---------||-----||----|||-----|-||----||||||||--||||---|||||-- 1 [C] COG1018 Flavodoxin reductases (ferredoxin-NADPH reductases) family 1 |||||||||||--||--------------------------------------------------- 1 [R] COG1019 Predicted nucleotidyltransferase ---|----|-|-|||||-|||---||||||---------------|--||||-------------- 1 [I] COG1022 Long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming) ---|------------|----|-----||--|----||---------------------|--|--- 1 [G] COG1023 Predicted 6-phosphogluconate dehydrogenase -|||--|||||-|----|------------------------------------------------ 1 [C] COG1031 Uncharacterized Fe-S oxidoreductase -|||--||||-------|------||-----------|-----------|--------|------- 1 [R] COG1033 Predicted exporters of the RND superfamily |||||||||||||||--------------------------------------------------- 1 [L] COG1041 Predicted DNA modification methylase -|||||||||||-------|----------------------|||||-||---||-----|-|--- 1 [C] COG1042 Acyl-CoA synthetase (NDP forming) --||----------|--|||------||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [E] COG1045 Serine acetyltransferase |||||||||||||-------||--|-----------------|||||-|||||||||||------- 1 [O] COG1047 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2 --||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---||||||| 1 [C] COG1048 Aconitase A ||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit |||||||||-|||-----|--|-----||--|----------|||||---||---|---------- 1 [H] COG1056 Nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase ---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||-- 1 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA ||||||||||-------|------|-----|-----||----|||||-||||-------------- 1 [O] COG1067 Predicted ATP-dependent protease --||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||-- 1 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG1079 Uncharacterized ABC-type transport system, permease component ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1084 Predicted GTPase |-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-|||| 1 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1093 Translation initiation factor 2, alpha subunit (eIF-2alpha) ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1094 Predicted RNA-binding protein (contains KH domains) ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1095 DNA-directed RNA polymerase, subunit E' |||||||||||||||||-||-|----------------------------------------|--- 1 [R] COG1100 GTPase SAR1 and related small G proteins |||||||||||||-----------||---------------------------------------- 1 [F] COG1102 Cytidylate kinase |-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 1 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components ||||||||||---||--------------------------------------------------- 1 [L] COG1111 ERCC4-like helicases |-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 1 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component --||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components |--|||--|-|||-------||---------|----||----|||------|-||||||------- 1 [C] COG1139 Uncharacterized conserved protein containing a ferredoxin-like domain |||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I) ||||||-|||||-----|||-|----|||||-----------|||-|-||--|--||||||||||| 1 [C] COG1146 Ferredoxin ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1155 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit A ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1156 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit B ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1163 Predicted GTPase --||-------------|--||||||-----|||||||||||------|-------||||||||-- 1 [E] COG1164 Oligoendopeptidase F ---|--------------||------||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 1 [H] COG1165 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase ---|--------------||------||||-|--|||-----|||||-||||---------|---- 1 [HQ] COG1169 Isochorismate synthase ---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [E] COG1171 Threonine dehydratase ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|---||||--- 1 [G] COG1175 ABC-type sugar transport systems, permease components ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 1 [E] COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II ||||----||---||-----|-||-|-||||-----||-----------|--|||||||||||-|| 1 [I] COG1183 Phosphatidylserine synthase |-||--||--------||||||---|----||||||||------------------|||------- 1 [L] COG1193 Mismatch repair ATPase (MutS family) |--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase -||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||-- 1 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases |||||||||||||------|------|||-------------|||----|-----|---|||||-- 1 [R] COG1201 Lhr-like helicases ||||--||-|-------------------------------------------------------- 1 [R] COG1202 Superfamily II helicase, archaea-specific |--||||-|--|-|---|--||-----||-|-|-|-||-------||-||-----|---|||||-- 1 [Q] COG1228 Imidazolonepropionase and related amidohydrolases --||--|-|-|--||-|----|||--||||----||||-------|---------|-------|-- 1 [H] COG1232 Protoporphyrinogen oxidase ||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---||||||| 1 [R] COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I -||||||-|-||||||--||-|--------------------------||-----|---||-||-- 1 [J] COG1236 Predicted exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing ||||||--||--------||-|----|||--------------------|-----|---------- 1 [H] COG1239 Mg-chelatase subunit ChlI ||||||---|--------||------|||--------------------|-----|---------- 1 [H] COG1240 Mg-chelatase subunit ChlD ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [L] COG1241 Predicted ATPase involved in replication control, Cdc46/Mcm family ||||||||||||-|||-|--|---------|----------------------------------- 1 [KB] COG1243 Histone acetyltransferase ||||||||||--------------------|----------------------------------- 1 [R] COG1244 Predicted Fe-S oxidoreductase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1245 Predicted ATPase, RNase L inhibitor (RLI) homolog --||------------|----|-----|||------||----||||||||-|-|||---------- 1 [E] COG1246 N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferases ---|-------|-||---||-|----||||-|--||||----|||||-|||----|---||||--- 1 [C] COG1252 NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit ||-|--|||--------------------------------------------------------- 1 [S] COG1255 Uncharacterized protein conserved in archaea ||||||||||||||||---------|-----|||||------------|----------------- 1 [I] COG1257 Hydroxymethylglutaryl-CoA reductase |||||||||||||--|-------------------------------------------------- 1 [J] COG1258 Predicted pseudouridylate synthase --||----|-|||---||||--||--||||------------------------------------ 1 [S] COG1259 Uncharacterized conserved protein |-||--|||--------||||||-|-|---||||||||---------------------||||-|| 1 [R] COG1268 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1269 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit I |||||||||||||-----||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---||||--- 1 [H] COG1270 Cobalamin biosynthesis protein CobD/CbiB --|||||||--||----|||-|--||----|---|||||||--------|-----|----||---- 1 [R] COG1277 ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component ---|--------------------|-|||-----||||----|||||-||||-||-----|----- 1 [M] COG1292 Choline-glycine betaine transporter ||||||||||||||||-|||||---|----||||||||------------------|||------- 1 [K] COG1293 Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP ---|--|------|-------------||--------------------||-||||--|----|-- 1 [S] COG1297 Predicted membrane protein --||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-|||| 1 [C] COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters ||||||||||-||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1303 Uncharacterized protein conserved in archaea |||||||||||-||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1308 Transcription factor homologous to NACalpha-BTF3 ||||||||||---|||-------------------------------------------------- 1 [L] COG1311 Archaeal DNA polymerase II, small subunit/DNA polymerase delta, subunit B ||||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|| 1 [P] COG1320 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhG subunit ||||--|||||||----------------------------------------------------- 1 [J] COG1325 Predicted exosome subunit ||||--||||-------------------------------------------------------- 1 [R] COG1326 Uncharacterized archaeal Zn-finger protein |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [KH] COG1339 Transcriptional regulator of a riboflavin/FAD biosynthetic operon |-|||||||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1340 Uncharacterized archaeal coiled-coil protein ---|||||--|||---||||--|||||||||-------------------------|||-----|| 1 [F] COG1351 Predicted alternative thymidylate synthase --||--|||--------|-|----||----|----|||----|||||-||-----|--|||-||-- 1 [NT] COG1352 Methylase of chemotaxis methyl-accepting proteins -||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [S] COG1354 Uncharacterized conserved protein ||-|--||---------------------------------------------------------- 1 [S] COG1356 Uncharacterized protein conserved in archaea --||--------------||-|--|-|||-||---|||----|||||--|-|-------||-|||| 1 [S] COG1357 Uncharacterized low-complexity proteins ||||||||||||||||-|--|---------||||||||---------------------------- 1 [J] COG1358 Ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a) --||--------------|-||----|||-||-|-||-----|||||-||-|-|||---||-||-- 1 [S] COG1359 Uncharacterized conserved protein ||||--|||||-|----|-|||--------||||||||||--|||-|--|----------|----- 1 [G] COG1363 Cellulase M and related proteins ||||--||||-||||--------------------------------------------------- 1 [J] COG1369 RNase P/RNase MRP subunit POP5 |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [O] COG1370 Prefoldin, molecular chaperone implicated in de novo protein folding, alpha subunit |||||||||||||---||---------||------------------------------------- 1 [S] COG1371 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||--------------------------------------------------- 1 [O] COG1382 Prefoldin, chaperonin cofactor ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1383 Ribosomal protein S17E ||||||||||--|-----------||-----------------------------------||||| 1 [J] COG1384 Lysyl-tRNA synthetase (class I) ||||--|||||||----------------------------------------------------- 1 [L] COG1389 DNA topoisomerase VI, subunit B |||||||||||-||||----||||||---------------------------------------- 1 [C] COG1390 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit E ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1394 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit D |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [K] COG1395 Predicted transcriptional regulator ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [U] COG1400 Signal recognition particle 19 kDa protein ---|--------------||-|-----||||||-|||-----|||---|---|--|---|||||-- 1 [V] COG1403 Restriction endonuclease ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1412 Uncharacterized proteins of PilT N-term./Vapc superfamily ---|------------||---|----|||-------||----|||||-||||---|--||||||-- 1 [K] COG1414 Transcriptional regulator |--|||--|-------|----|---------------------------------|------|--- 1 [S] COG1416 Uncharacterized conserved protein ||||||||||------||--||--||----|||||||||-|||||-|---------|||||----- 1 [R] COG1418 Predicted HD superfamily hydrolase ||||-----|--------||-------||--------------------|-----|---||||--- 1 [H] COG1429 Cobalamin biosynthesis protein CobN and related Mg-chelatases ||-|--||-||------|||----||--------------------------|--|---|||||-- 1 [S] COG1430 Uncharacterized conserved protein ---||-----|----|-|---|---|----|||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 1 [F] COG1435 Thymidine kinase ||||||||||||||||----||--|--------|-------------------------------- 1 [C] COG1436 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit F ||||--|||||||------------|----|--------------|---------|---------- 1 [F] COG1437 Adenylate cyclase, class 2 (thermophilic) ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1439 Predicted nucleic acid-binding protein, consists of a PIN domain and a Zn-ribbon module ---|---------|||----------|||-------------|||-|------------------- 1 [I] COG1443 Isopentenyldiphosphate isomerase ---|--||||||||||--------------------------|||||-|-||-------------- 1 [R] COG1444 Predicted P-loop ATPase fused to an acetyltransferase ---|||||--||--|---||----------------------|||-|-|------|---|---|-- 1 [E] COG1446 Asparaginase ||||--|||-------|---||----|---|-------||--|||||-||--||||||||||||-| 1 [R] COG1451 Predicted metal-dependent hydrolase |-|||||||--||||-||--|-----|---||-|||||----|||||-||-|---|---||||--- 1 [C] COG1454 Alcohol dehydrogenase, class IV |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1460 DNA-directed RNA polymerase, subunit F ||||----||------|------------------------------------------------- 1 [E] COG1465 Predicted alternative 3-dehydroquinate synthase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [L] COG1467 Eukaryotic-type DNA primase, catalytic (small) subunit ||||||||||--|----|----------------|-||-----------|--||||---------- 1 [S] COG1469 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1471 Ribosomal protein S4E --||||||---|-----|||||----|||-||-|||||----|||----|||---|--||||||-- 1 [R] COG1473 Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase ||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--|||||||||||||| 1 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators ||||----||------------||---|||--|--------------------------------- 1 [S] COG1478 Uncharacterized conserved protein -|||--|----------|-||-----|---|----|--||---|||--|--|--|-|||------- 1 [S] COG1479 Uncharacterized conserved protein --|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||--- 1 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [J] COG1491 Predicted RNA-binding protein ||||||--||-|------||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---|||||-- 1 [H] COG1492 Cobyric acid synthase ||||||--||-------------------------------------------------------- 1 [K] COG1497 Predicted transcriptional regulator ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1498 Protein implicated in ribosomal biogenesis, Nop56p homolog ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1499 NMD protein affecting ribosome stability and mRNA decay ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1500 Predicted exosome subunit ---||||||||||-|-||-|-|--------|-----|-----|||||-----|------------- 1 [L] COG1515 Deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V) ||-|--||-|---||-|--|------|-------|-|--|||-------|||-||---|||||--- 1 [L] COG1525 Micrococcal nuclease (thermonuclease) homologs |||||||||||--|||----||----------||-------------------------------- 1 [C] COG1527 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit C ---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG1530 Ribonucleases G and E ||||--||||-||-------|---------||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [J] COG1534 Predicted RNA-binding protein containing KH domain, possibly ribosomal protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1537 Predicted RNA-binding proteins ---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||-- 1 [R] COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced) ---|||----|||---|-||-|------------|-||---------------------------- 1 [S] COG1547 Uncharacterized conserved protein ||||||||||-|------------------------------------------------------ 1 [J] COG1549 Queuine tRNA-ribosyltransferases, contain PUA domain ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1552 Ribosomal protein L40E ---|----|-----------||---------|----||----|||------|-||||||------- 1 [S] COG1556 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [R] COG1571 Predicted DNA-binding protein containing a Zn-ribbon domain --||||||----|---||--||-----||------|||--------|--|-----|---|||||-- 1 [R] COG1574 Predicted metal-dependent hydrolase with the TIM-barrel fold ---|-------------||||-----||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 1 [H] COG1575 1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase ||||--||||||||||---------|-----|||||------------------------------ 1 [I] COG1577 Mevalonate kinase ||-|--||-||||----|||||----|||||-----------|||||-||-||------|||||-- 1 [OU] COG1585 Membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity ||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||--- 1 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase ||||||||||--|----------------------------------------------------- 1 [J] COG1588 RNase P/RNase MRP subunit p29 ||-|--|||||||----------------------------------------------------- 1 [L] COG1591 Holliday junction resolvase - archaeal type |-|||---|--------|||-------------|--------||||--------|--|--|-||-| 1 [S] COG1598 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1601 Translation initiation factor 2, beta subunit (eIF-2beta)/eIF-5 N-terminal domain |-|||||||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1602 Uncharacterized conserved protein ||||--||||-||||--------------------------------------------------- 1 [J] COG1603 RNase P/RNase MRP subunit p30 ||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG1605 Chorismate mutase |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [R] COG1608 Predicted archaeal kinase ---|----||-|---------|---|--------|-||----|||-|-||||-||||||--|---- 1 [C] COG1620 L-lactate permease -|||--||||------|-||-|||||----||||||||-|||------------------------ 1 [S] COG1624 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||--------|-------------------------------------------- 1 [S] COG1628 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1631 Ribosomal protein L44E ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1632 Ribosomal protein L15E |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [R] COG1634 Uncharacterized Rossmann fold enzyme ||||--|||||||||--|------------------------------------------------ 1 [H] COG1635 Flavoprotein involved in thiazole biosynthesis ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1644 DNA-directed RNA polymerase, subunit N (RpoN/RPB10) -|||--|||||||----------------------------------------------------- 1 [R] COG1645 Uncharacterized Zn-finger containing protein ||||||--|||-|||-|---|------||-|---||||----||||||||--|||----|||||-- 1 [H] COG1648 Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain) -||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1650 Uncharacterized protein conserved in archaea ---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG1651 Protein-disulfide isomerase ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||----|||||-||-||--|---||||--- 1 [G] COG1653 ABC-type sugar transport system, periplasmic component --||---||------------|--------||||||||----|||||-|||||------------- 1 [K] COG1654 Biotin operon repressor |-||||||||--|---------------------|--------||-|-|----------||-|--- 1 [R] COG1661 Predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif ||||--||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1675 Transcription initiation factor IIE, alpha subunit ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1676 tRNA splicing endonuclease ||||||-||||||----------------------------------------------------- 1 [EH] COG1685 Archaeal shikimate kinase |||||||||||||--|||-|-|----|||-|------|----|||-|--|-----|---------- 1 [S] COG1690 Uncharacterized conserved protein ||||--||||||||||-------------------------------------------------- 1 [L] COG1697 DNA topoisomerase VI, subunit A ||||--|||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1701 Uncharacterized protein conserved in archaea ---||||||--||--------|----||||-------|----|||----------|-------|-- 1 [E] COG1703 Putative periplasmic protein kinase ArgK and related GTPases of G3E family -||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [K] COG1709 Predicted transcriptional regulator |-|||||||--------------------------------------------------------- 1 [S] COG1711 Uncharacterized protein conserved in archaea |-||---------------|-|-----||-------------|---|------------------- 1 [V] COG1715 Restriction endonuclease ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1717 Ribosomal protein L32E ||||||||||||||||-----|-----------------------|---|---------------- 1 [TD] COG1718 Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control ||||--|||||||----|------------------------|||||-||||-||-------||-- 1 [S] COG1720 Uncharacterized conserved protein --|||||||-|-|---||||-|---|-|||-----|||----------||-----|---|||||-- 1 [R] COG1721 Uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain) ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1727 Ribosomal protein L18E |||||||||||||||-|------------------------------------------------- 1 [O] COG1730 Predicted prefoldin, molecular chaperone implicated in de novo protein folding ---|----|----------|||-----||-|||||||-----|||-|--|-----|||-||||--- 1 [M] COG1732 Periplasmic glycine betaine/choline-binding (lipo)protein of an ABC-type transport system (osmoprotectant binding protein) ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1736 Diphthamide synthase subunit DPH2 --||----|-|-|----|--||||-||-------|-|-----|||||-||||-||----||||--- 1 [S] COG1738 Uncharacterized conserved protein --||---------||--|--||---||---||||||||||--|||-|-||||-|||||||||---- 1 [S] COG1739 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [J] COG1746 tRNA nucleotidyltransferase (CCA-adding enzyme) ||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1761 DNA-directed RNA polymerase, subunit L |-|||||||--------------------------------------------------------- 1 [K] COG1777 Predicted transcriptional regulators |||||||||||||----|------------|-----------|||||||----||----------- 1 [F] COG1781 Aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [R] COG1782 Predicted metal-dependent RNase, consists of a metallo-beta-lactamase domain and an RNA-binding KH domain ||||--||||-------------------------------------------------------- 1 [S] COG1784 Predicted membrane protein --||---|-----||--|-|-|----|-------|-||----||||---|--|--|-----|---- 1 [P] COG1785 Alkaline phosphatase |||||||||||||||||----------||-------||----------|||--||---|||-||-- 1 [L] COG1793 ATP-dependent DNA ligase ||||||--||||------||||-----||-|----|-|--------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG1797 Cobyrinic acid a,c-diamide synthase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1798 Diphthamide biosynthesis methyltransferase -|||----|---|-----||-------------|-------------------------------- 1 [S] COG1808 Predicted membrane protein |||||||||||||---|---------------|--------------------------------- 1 [E] COG1812 Archaeal S-adenosylmethionine synthetase --||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components ||||||||||||----||||-|----||||-|--||||--------------------|-||||-- 1 [F] COG1828 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, PurS component ||||--|||||||----------------------------------------------------- 1 [R] COG1829 Predicted archaeal kinase (sugar kinase superfamily) |||||||||||-|----------------------------------------------------- 1 [R] COG1831 Predicted metal-dependent hydrolase (urease superfamily) ---|||||--|||---||---|---------|||-|||----|||||--------|--|||-|--- 1 [R] COG1832 Predicted CoA-binding protein ||||-|||||||-----|------------------------------------------------ 1 [S] COG1833 Uncharacterized conserved protein |||||||||-|-------||-----------------|---------------------------- 1 [S] COG1836 Predicted membrane protein --||------|-|-----|||-----|-----|||--|-----||||-||||||||--|||||--- 1 [P] COG1840 ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component ||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----|||||| 1 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E ---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 1 [C] COG1845 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3 |||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||-- 1 [K] COG1846 Transcriptional regulators |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1849 Uncharacterized protein conserved in archaea |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [R] COG1855 ATPase (PilT family) |||||||-|-|------------------------------------------------------- 1 [S] COG1860 Uncharacterized protein conserved in archaea ||||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|| 1 [P] COG1863 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit -||||||||||||-----------------------||---------------------------- 1 [S] COG1865 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||||------------------------------------------------- 1 [J] COG1867 N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase --||--|||--------|-------|----|-----||----------||-----|---||--|-- 1 [NT] COG1871 Chemotaxis protein; stimulates methylation of MCP proteins ||||||-||-||-----|||------|||-----|--|-----------|||---|---||-|--- 1 [R] COG1878 Predicted metal-dependent hydrolase |-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--| 1 [R] COG1881 Phospholipid-binding protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1889 Fibrillarin-like rRNA methylase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1890 Ribosomal protein S3AE |-||--||||||------------------------------------------------------ 1 [S] COG1892 Uncharacterized protein conserved in archaea ---|--|||-|-|||-|--|------|||-|||-||||----|||||-||-----|------||-- 1 [H] COG1893 Ketopantoate reductase ---|--|||||||||------|------------||------|||||-||-|----||||||||-- 1 [R] COG1896 Predicted hydrolases of HD superfamily ||||||||||||||||---|-------------------------------------------|-- 1 [O] COG1899 Deoxyhypusine synthase -|||--|||||-|-----------------------------------|----------------- 1 [S] COG1901 Uncharacterized conserved protein --||||--|--|-||--|-|||----|||-|||-||||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 1 [C] COG1902 NADH:flavin oxidoreductases, Old Yellow Enzyme family -|||||--|-|-------------------|-----|------------------|---------- 1 [P] COG1910 Periplasmic molybdate-binding protein/domain -|||--|||||||---||-|-------------|||-------||-----------||-------- 1 [S] COG1912 Uncharacterized conserved protein -|-|--|||||||---|------------------------------------------------- 1 [R] COG1913 Predicted Zn-dependent proteases ||||--||||--------------||--------------------------|------------- 1 [S] COG1916 Uncharacterized homolog of PrgY (pheromone shutdown protein) ||||||||--||----|||||-----||--|||--|||-------||--|-----||||||||--- 1 [S] COG1917 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain ||||----||-----------------|||------------------------------------ 1 [S] COG1920 Uncharacterized conserved protein ||||----|----------|---------------|----------|------------------- 1 [P] COG1930 ABC-type cobalt transport system, periplasmic component ||||--|||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1931 Uncharacterized protein conserved in archaea ||||||||||-------------------------------------------------------- 1 [L] COG1933 Archaeal DNA polymerase II, large subunit ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [F] COG1936 Predicted nucleotide kinase (related to CMP and AMP kinases) |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [R] COG1938 Archaeal enzymes of ATP-grasp superfamily ---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||-- 1 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase ||||-----|-----------------||-------------|||||--|||-------||-|--- 1 [S] COG1944 Uncharacterized conserved protein ||||||||||------------||------------------------------------------ 1 [S] COG1945 Uncharacterized conserved protein ||||--||||||||||-------------------------------------------------- 1 [L] COG1948 ERCC4-type nuclease -||||||||--||----------------------------------------------------- 1 [NU] COG1955 Archaeal flagella assembly protein J ---|||-------|---|------------||||||||----|||||-||-||||-------||-- 1 [T] COG1956 GAF domain-containing protein |-||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1958 Small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) homolog ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1976 Translation initiation factor 6 (eIF-6) --||||-||-||----|-||-|-----||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG1977 Molybdopterin converting factor, small subunit ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis ||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 1 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases ||||||||||||||||----------|--------------------------------------- 1 [S] COG1990 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||---------------|----------------------------------- 1 [K] COG1996 DNA-directed RNA polymerase, subunit RPC10 (contains C4-type Zn-finger) ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1997 Ribosomal protein L37AE/L43A |||||||||||||||--------------------------------------------------- 1 [J] COG1998 Ribosomal protein S27AE ---|------|-|||-|----|--------------||----------||--||||--|||||||| 1 [R] COG1999 Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC, involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems ---|--|||-|||-----||-------||-|----|||----|||--------------||-|--- 1 [K] COG2002 Regulators of stationary/sporulation gene expression ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2004 Ribosomal protein S24E ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2007 Ribosomal protein S8E ---|---------||--|-|||--------|---||-|----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2008 Threonine aldolase ---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--|||||||||||||| 1 [C] COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG2012 DNA-directed RNA polymerase, subunit H, RpoH/RPB5 ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2016 Predicted RNA-binding protein (contains PUA domain) |-||---------||------|----||||----||-------------|||||||------||-- 1 [E] COG2021 Homoserine acetyltransferase ||||||||||-|||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2023 RNase P subunit RPR2 ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 1 [C] COG2025 Electron transfer flavoprotein, alpha subunit |--|-------------|--|---|||-----|||--|----------|----------------- 1 [S] COG2035 Predicted membrane protein ||||--||||---|||-------------------------------------------------- 1 [B] COG2036 Histones H3 and H4 |||||||||||||-----||||----|||||------|----|||-|-||-----|---|||||-- 1 [H] COG2038 NaMN:DMB phosphoribosyltransferase --||||--|-|||---|--|-|----|||-------|-----|||||--|-|---|--||||||-- 1 [R] COG2041 Sulfite oxidase and related enzymes ||||||---|-|-|||-------------------------------------------------- 1 [S] COG2042 Uncharacterized conserved protein ||||||||||-------------------------------------------------------- 1 [R] COG2047 Uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily) --|||||||-||--|-|----|----|||--|||||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [Q] COG2050 Uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2051 Ribosomal protein S27E ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2053 Ribosomal protein S28E/S33 ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2058 Ribosomal protein L12E/L44/L45/RPP1/RPP2 ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||-- 1 [P] COG2060 K+-transporting ATPase, A chain |||||||||||||-------------||--|--------------|---|-|---|---||-||-- 1 [NU] COG2064 Flp pilus assembly protein TadC ||-|||--||||------|||---------|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2073 Cobalamin biosynthesis protein CbiG ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2075 Ribosomal protein L24E --||---------------|-|-----|||||---|||----|||||-||---||---||||||-- 1 [P] COG2076 Membrane transporters of cations and cationic drugs |||||||||||||||-||------------|----------------------------------- 1 [S] COG2078 Uncharacterized conserved protein ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2082 Precorrin isomerase ||||----||---------|------|----|--------------------|--|---||-|--- 1 [R] COG2085 Predicted dinucleotide-binding enzymes ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 1 [C] COG2086 Electron transfer flavoprotein, beta subunit ||-|--|||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG2090 Uncharacterized protein conserved in archaea |||||||||||||||--------------------------------------------------- 1 [J] COG2092 Translation elongation factor EF-1beta |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [K] COG2093 DNA-directed RNA polymerase, subunit E'' ---||||||-|||-------||----||||-----|||--------|--|-----|---|||||-- 1 [S] COG2096 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2097 Ribosomal protein L31E ||||||--||-------------------------------------------------------- 1 [S] COG2098 Uncharacterized protein conserved in archaea ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG2102 Predicted ATPases of PP-loop superfamily |-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||-- 1 [H] COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis |--|--|||||||||--------------------------------------------------- 1 [S] COG2106 Uncharacterized conserved protein -|||--|||||||-----------------|----------------------------------- 1 [R] COG2108 Uncharacterized conserved protein related to pyruvate formate-lyase activating enzyme --||||||--|------|||||-----||-------------|||||-||-----|---||||--- 1 [H] COG2109 ATP:corrinoid adenosyltransferase ||||--||---------------------------------------------------------- 1 [J] COG2117 Predicted subunit of tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain |||||||||||||||--------------------------------------------------- 1 [R] COG2118 DNA-binding protein ---|---------||---||-------||-------------------||-----|-------|-- 1 [S] COG2119 Predicted membrane protein ---|---------||---||-|----|||||-----||-----------|--|--|--||||||-- 1 [Q] COG2124 Cytochrome P450 ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2125 Ribosomal protein S6E (S10) ||||||||||-|||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2126 Ribosomal protein L37E ---|---------||----|--------------|-|-----|||-|--|-----|------||-- 1 [R] COG2130 Putative NADP-dependent oxidoreductases ---|------|--||-|--|------|||-------||----|||||--|||||||--||||||-- 1 [Q] COG2132 Putative multicopper oxidases ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2139 Ribosomal protein L21E --||||----||--|---||-|----||------|-||----|||||--|--|--|---||-||-- 1 [PR] COG2146 Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenases ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2147 Ribosomal protein L19E ---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||-- 1 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis |-|||||||--------------------------------------------------------- 1 [R] COG2150 Predicted regulator of amino acid metabolism, contains ACT domain ---|------||-||-|-||------||||------------------||--|--|----||||-- 1 [H] COG2154 Pterin-4a-carbinolamine dehydratase ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||-- 1 [P] COG2156 K+-transporting ATPase, c chain ---|--||-|-||-----|-------|||-|---||-----------------------||-||-- 1 [R] COG2159 Predicted metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold ||||||||||-|||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2167 Ribosomal protein L39E ---|--------------||------|||-------------|||-|--|-----|---------- 1 [S] COG2170 Uncharacterized conserved protein --||--|||--------|-|----||----|-----||----|||||-||--|--|--|||-||-- 1 [NT] COG2201 Chemotaxis response regulator containing a CheY-like receiver domain and a methylesterase domain |-||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|- 1 [P] COG2212 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|--|||-||-- 1 [P] COG2216 High-affinity K+ transport system, ATPase chain B ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [L] COG2219 Eukaryotic-type DNA primase, large subunit ---|||-----|-------------|-||--|||||----|-----|-||----------|-|--- 1 [E] COG2235 Arginine deiminase --|||||||-|||||----|----|||--------------------------||||||------- 1 [R] COG2236 Predicted phosphoribosyltransferases ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2238 Ribosomal protein S19E (S16A) ||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2241 Precorrin-6B methylase 1 ||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|---------||||--- 1 [H] COG2242 Precorrin-6B methylase 2 ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2243 Precorrin-2 methylase -|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|-- 1 [R] COG2252 Permeases ---|-------|-||----|-|----||||----|-||----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [S] COG2259 Predicted membrane protein |||||||||||||||--------------------------------------------------- 1 [J] COG2260 Predicted Zn-ribbon RNA-binding protein |||||||||||||--|-------------------------------------------------- 1 [J] COG2263 Predicted RNA methylase |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [H] COG2266 GTP:adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase ---|-------||-------||----|||--||---------|||||-|||----|---|||||-- 1 [G] COG2301 Citrate lyase beta subunit ||-|-----|---------|-|-----|||----|-------||||---|-----|--||||||-- 1 [E] COG2303 Choline dehydrogenase and related flavoproteins ---|-----------------|----|---------||----|||||-----|----------|-- 1 [S] COG2311 Predicted membrane protein ---|-----------------|-----||-------||----------------------|--|-- 1 [R] COG2312 Erythromycin esterase homolog ---|--||--|||-------||-------------|||-------|--|-------------|--| 1 [E] COG2317 Zn-dependent carboxypeptidase --||-----------------|-----|||------||----------||---------------- 1 [S] COG2320 Uncharacterized conserved protein |--|--------------||-|-------------------------------------------- 1 [S] COG2324 Predicted membrane protein ---|||-----||--------|----||||----||||-----------|-----|---||||--- 1 [R] COG2329 Conserved protein involved in polyketide biosynthesis related to monooxygenase ---|---------------|-|--------||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [R] COG2333 Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily) ---|--||-----------|-|----|-----||||||---------------------------- 1 [S] COG2339 Predicted membrane protein ---|----|---|-----|--|---------------|----------||-|--------||--|| 1 [R] COG2358 TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component --||-------||-------|---------------|-------------------|||------- 1 [R] COG2404 Predicted phosphohydrolase (DHH superfamily) --||||||||-||----------------------------------------------------- 1 [S] COG2412 Uncharacterized conserved protein |-||--|||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG2433 Uncharacterized conserved protein ||||||||||--||||-------------------------------------------------- 1 [U] COG2443 Preprotein translocase subunit Sss1 ||||||||||-------------------------------------------------------- 1 [S] COG2450 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [J] COG2511 Archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit E (contains GAD domain) ||||--|||||||-|--|------------------------|||||-||--||||||||||||-- 1 [O] COG2518 Protein-L-isoaspartate carboxylmethyltransferase ||-||||||||||||-||--------||||------------------------------------ 1 [J] COG2519 tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase and related methyltransferases --||--|||-|||----------------------------------------------------- 1 [R] COG2522 Predicted transcriptional regulator ||||----|-|||----------------------------------------------------- 1 [K] COG2524 Predicted transcriptional regulator, contains C-terminal CBS domains ---|--------------------------|-----||----|||||-||----------|-|--- 1 [S] COG2718 Uncharacterized conserved protein ---|--------------------------|-----||----|||||-||----------|-|--- 1 [S] COG2719 Uncharacterized conserved protein ---|-------|---------|----|---|---||||----------|---|--|---|||||-- 1 [Q] COG2761 Predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis |||||||||------------|-------------------------------------------- 1 [C] COG2811 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit H ---|----------------|----------|||||||----|||||-||---||-----||||-- 1 [L] COG2827 Predicted endonuclease containing a URI domain --||------|||-------------||||------------|||||-||-|||||----||||-- 1 [S] COG2835 Uncharacterized conserved protein ---|---------------|----------|-----------------||---||||||------- 1 [S] COG2836 Uncharacterized conserved protein ---|------||---------|----|----||---||----|||||-||||---|--||||||-- 1 [S] COG2860 Predicted membrane protein --||---------||--|---|----|||-||---|-|-----------|-|---|--|||||--- 1 [E] COG2873 O-acetylhomoserine sulfhydrylase -||||||||--||----------------------------------------------------- 1 [NU] COG2874 Predicted ATPases involved in biogenesis of archaeal flagella ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2875 Precorrin-4 methylase ---|--|||-|-|-----||---------------------------------------------- 1 [S] COG2886 Uncharacterized small protein |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [J] COG2888 Predicted Zn-ribbon RNA-binding protein with a function in translation |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG2896 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme ---|---------------||-||-------------|-----------|--||||---||-|--- 1 [S] COG2928 Uncharacterized conserved protein ---|----|----------------------------------------|--||||---||||||| 1 [R] COG2945 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily --||--------------||-------||--------|----|||||-|---|------|||||-- 1 [S] COG2968 Uncharacterized conserved protein ---|----------------|-----|---------------|||||-|-||-------------- 1 [R] COG2985 Predicted permease ---|||--------------||----------|-|-||-------||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2986 Histidine ammonia-lyase ---|||--------------||----------|-|-||-------|--||-----|---|||||-- 1 [E] COG2987 Urocanate hydratase --||----------------------||-------|||----|||||-||-|-||----||||--- 1 [R] COG3030 Protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid ---|--------|-------|---------------------|||---|--|-------------- 1 [E] COG3033 Tryptophanase |--|--------------|-----------------------------|----------|---|-- 1 [R] COG3046 Uncharacterized protein related to deoxyribodipyrimidine photolyase ---|--------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [E] COG3075 Anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase --||-----------------|-----||--|---|||-----------|-----|---||-||-| 1 [R] COG3173 Predicted aminoglycoside phosphotransferase |-||-----|--|---|--------------------------------|-----|----|-|--- 1 [S] COG3174 Predicted membrane protein --||------------|--||-----|-----|-||-------|||---|-|-|||||-||-|--| 1 [S] COG3177 Uncharacterized conserved protein ---||||||--||------------------------------------|---------------- 1 [S] COG3199 Uncharacterized conserved protein ---|--------------------------------------------||---|---------|-- 1 [S] COG3205 Predicted membrane protein ---|---------------|----------------------|||||-||---------||-||-- 1 [R] COG3217 Uncharacterized Fe-S protein ---|------|--------||-----|||--|--|--|----||||--||---------||-||-- 1 [P] COG3221 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, periplasmic component ||||----||-------------------------------------------------------- 1 [H] COG3252 Methenyltetrahydromethanopterin cyclohydrolase ---|||-----||--------|----||||----||||---------------------------- 1 [S] COG3253 Uncharacterized conserved protein ---|-----------|--|--------|||-------------------|-----------|---- 1 [S] COG3268 Uncharacterized conserved protein |-||--||||--|----------------------------------------------------- 1 [S] COG3273 Uncharacterized conserved protein |||||||||||-||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG3277 RNA-binding protein involved in rRNA processing -|-|------|-|--------|-------------------------------------------- 1 [S] COG3294 Uncharacterized conserved protein ---|--------------||-------||------------------------------------- 1 [S] COG3349 Uncharacterized conserved protein -|-|||||---------------------------------------------------------- 1 [N] COG3352 Putative archaeal flagellar protein C -|-|||-|---------------------------------------------------------- 1 [N] COG3353 Putative archaeal flagellar protein F |--|||--||||------------------------------------------------------ 1 [S] COG3356 Predicted membrane protein ---|---|||||------------------------------------------------------ 1 [K] COG3357 Predicted transcriptional regulator containing an HTH domain fused to a Zn-ribbon ---|-----------------|----|-------------------------|------------- 1 [S] COG3358 Uncharacterized conserved protein |-||--------------------------|-----||---------------------------- 1 [L] COG3359 Predicted exonuclease ---|-----------------------||--------------------|-----|----|----- 1 [S] COG3360 Uncharacterized conserved protein ---|-----------------------||-------|----------------------------- 1 [S] COG3361 Uncharacterized conserved protein ||-|-----|-------------------------------------------------------- 1 [F] COG3363 Archaeal IMP cyclohydrolase |-||----||-------------------------------------------------------- 1 [R] COG3364 Zn-ribbon containing protein |-||----||-------------------------------------------------------- 1 [S] COG3365 Uncharacterized protein conserved in archaea -|||----||-------------------------------------------------------- 1 [S] COG3366 Uncharacterized protein conserved in archaea |--|||---|-------|-|----------------------------------------|----- 1 [S] COG3367 Uncharacterized conserved protein ---|-------|-------|------|||--||--|-------|||------|--|---------- 1 [R] COG3378 Predicted ATPase ---|---|---||----------------------------------------------------- 1 [S] COG3379 Uncharacterized conserved protein ---|--------------||-----------------------------|-----|---------- 1 [R] COG3380 Predicted NAD/FAD-dependent oxidoreductase ---|-------|------------------------------|||||-|-||---|---------- 1 [R] COG3381 Uncharacterized component of anaerobic dehydrogenases --||||--||-------------------------------------------------------- 1 [S] COG3388 Uncharacterized protein conserved in archaea --||||--|--------------------------------------------------------- 1 [S] COG3389 Uncharacterized protein conserved in archaea -|||----|--------------------------------------------------------- 1 [S] COG3398 Uncharacterized protein conserved in archaea ---|----------------------||------||||---------------------------- 1 [S] COG3402 Uncharacterized conserved protein ---|-----------------|--------------|----------------------------- 1 [S] COG3403 Uncharacterized conserved protein ---|||-----|-|||---------|-----|||||------------------------------ 1 [I] COG3407 Mevalonate pyrophosphate decarboxylase ---|------------||||-|---------------|-----------------|---------- 1 [C] COG3411 Ferredoxin ---|----|--|-------|-|---------------|----------------------|-|--- 1 [L] COG3415 Transposase and inactivated derivatives ||||||||||||||||---------|-----||||||--------|-----------------|-- 1 [I] COG3425 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase ---|||----|||--------|-----||--------------------------|----|||--- 1 [S] COG3427 Uncharacterized conserved protein ---|----------------------|||-----||||---------------------------- 1 [S] COG3428 Predicted membrane protein --||||||-|||----|-||---------------------------------------------- 1 [S] COG3431 Predicted membrane protein --||||-----|----|-------|---------------------|------||------|---- 1 [S] COG3439 Uncharacterized conserved protein ---|--------------------------|--------|------|-----|--|||-||||||| 1 [U] COG3451 Type IV secretory pathway, VirB4 components ---|||-----------|------------------------------------------------ 1 [S] COG3462 Predicted membrane protein ---|----------|----|-----------------|-------|---|-----|----|-|--- 1 [Q] COG3486 Lysine/ornithine N-monooxygenase ---|----|----||--------------------------------------------------- 1 [R] COG3582 Predicted nucleic acid binding protein containing the AN1-type Zn-finger |--|-----|--------------------------------------||---------||||--- 1 [R] COG3608 Predicted deacylase --||||--|--------------------------------------------------------- 1 [S] COG3612 Uncharacterized protein conserved in archaea --|||||||--------------------------------------------------------- 1 [K] COG3620 Predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains ---|---------------||-----|----|--|--|-|--||||---|---------||-||-- 1 [P] COG3638 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component ---|------|--------||-----|----|--|--|-|||||||---|---------||-||-- 1 [P] COG3639 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [T] COG3642 Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase ---|----|----------------------|||||||---------------------------- 1 [S] COG3679 Uncharacterized conserved protein ---|-------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG3743 Uncharacterized conserved protein ---|---------------------------------------||-----------------|--- 1 [E] COG3799 Methylaspartate ammonia-lyase ||-|-------------------------------------------------------------- 1 [S] COG3815 Predicted membrane protein |||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||--- 1 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components ---|---------|-------|---------------------------|-----|------|--- 1 [E] COG3844 Kynureninase ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG3845 ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase components ---|--------------||--------------||||---------------------------- 1 [T] COG3848 Phosphohistidine swiveling domain ---|||---||-|----------------------------------------------------- 1 [U] COG4023 Preprotein translocase subunit Sec61beta --||----||-------------------------------------------------------- 1 [R] COG4031 Predicted metal-binding protein --||--||-|-------------------------------------------------------- 1 [S] COG4044 Uncharacterized protein conserved in archaea --||----||-------------------------------------------------------- 1 [S] COG4083 Predicted membrane protein --||--------|-|-|-||||----||||||||||||-----------|---||-------|--- 1 [R] COG4122 Predicted O-methyltransferase ---|--------------||---------------------------------------------- 1 [T] COG4250 Predicted sensor protein/domain ---|---------------|------|----------|---------------------------- 1 [S] COG4276 Uncharacterized conserved protein ---|------------------------------||||---------------------------- 1 [S] COG4347 Predicted membrane protein ---|-------------------------------------------------------|---|-- 1 [S] COG4538 Uncharacterized conserved protein ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG4603 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ---|----|---|--------|---------------|----------||-|--------||---- 1 [R] COG4666 TRAP-type uncharacterized transport system, fused permease components ---||-----|-|-------|-------------||-|----|||-|--------|----|||--- 1 [I] COG4670 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase ---|----|-------|--|---------------------------------------||----- 1 [S] COG4711 Predicted membrane protein --||---------------|-|--------------------------|--------------|-- 1 [S] COG4715 Uncharacterized conserved protein ---|----|----------------------------|-----------|-|-------------- 1 [S] COG4729 Uncharacterized conserved protein ||||-------------------------------------------------------------- 1 [S] COG4746 Uncharacterized protein conserved in archaea --||----|--------------------------------------------------------- 1 [S] COG4749 Uncharacterized protein conserved in archaea ---|----------------------||||-------------------|-----|---||||||| 1 [I] COG4770 Acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit --||----||-------------------------------------------------------- 1 [R] COG4801 Predicted acyltransferase ---|----------------|----------------------||--------------------- 1 [E] COG4865 Glutamate mutase epsilon subunit --||----|--------------------------------------------------------- 1 [S] COG4885 Uncharacterized protein conserved in archaea --||-------------------------------|--------------------------|--- 1 [S] COG4983 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG5256 Translation elongation factor EF-1alpha (GTPase) ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG5257 Translation initiation factor 2, gamma subunit (eIF-2gamma; GTPase) |--|----|-||------------------------------------------------------ 1 [R] COG5258 GTPase ---|----------------------||||------------------------------------ 1 [S] COG5282 Uncharacterized conserved protein --||----|--------------------------------------------------------- 1 [S] COG5427 Uncharacterized membrane protein ---|----|---------------------------------|||-|------------------- 1 [C] COG5557 Polysulphide reductase --||-------------|---|--------|----|-|-----------------|---------- 1 [S] COG5652 Predicted integral membrane protein