| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 24 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily -|||--|----------|-||-----|---|----|--||---|||--|--|--|-|||------- 23 [S] COG1479 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 18 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases -------------|||-----|--------------------|||||-||||-|||||||||||-- 18 [R] COG0790 FOG: TPR repeat, SEL1 subfamily --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 18 [NT] COG0840 Methyl-accepting chemotaxis protein |-||--|||----|||-|||-|--||-||-|----|||----|||||-|||||--|||||||||-- 16 [T] COG0784 FOG: CheY-like receiver ----------------||||||--||||||||--||||----|||||||||||||||||||||||| 15 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases ----------------||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 13 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain |-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||-- 12 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase |-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 12 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 12 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component -|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||-- 12 [L] COG0863 DNA modification methylase ------------------------|-----|-------------------------|||------- 12 [S] COG2604 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 11 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis |||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 11 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins ||||-|-||----------|-------||--|||||--|||||||-|-|||||---|||-||-|-| 11 [V] COG0732 Restriction endonuclease S subunits ----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-|||||||||||||||||| 11 [M] COG0845 Membrane-fusion protein ----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||---||-- 11 [M] COG0859 ADP-heptose:LPS heptosyltransferase ----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||-- 11 [P] COG1629 Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport ||||---||----------|-------||--|||||--|||-|||-|-|||||||||||-||-|-| 10 [V] COG0286 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit -------------|||--||-|-----||-----|-||----|||----|-----||||------- 10 [R] COG0699 Predicted GTPases (dynamin-related) --||--|||--------|||----||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 10 [NT] COG0835 Chemotaxis signal transduction protein --|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 10 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 10 [N] COG1344 Flagellin and related hook-associated proteins ---------------------------------|--|-----|||-|---||----||--|---|| 10 [M] COG1442 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins, LPS:glycosyltransferases ||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||--- 9 [C] COG0247 Fe-S oxidoreductase -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 9 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific |||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----|||||||||||||||||||||||| 9 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase -------------|||||||||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 9 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase |-|------|------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 9 [U] COG0811 Biopolymer transport proteins ----------------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 9 [U] COG0848 Biopolymer transport protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 8 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control ||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 8 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases ||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 8 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase |||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--|||||||||||||| 8 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel ||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-||||||| 8 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase --|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-||||||||||||| 8 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain --||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 8 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components ||||----|||||---|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 8 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component ||||--||||------|-||-|--|-|---------------------||----|-||||||||-- 8 [S] COG1432 Uncharacterized conserved protein --||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||-- 8 [L] COG1943 Transposase and inactivated derivatives -----|--|-----------|-----|------|-|--||------|---|||-|-||-|--|--- 8 [L] COG2189 Adenine specific DNA methylase Mod |-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||-- 8 [P] COG2217 Cation transport ATPase ---|--------------------------|--------|------|-----|--|||-||||||| 8 [U] COG3451 Type IV secretory pathway, VirB4 components --|----------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 7 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein |||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 7 [R] COG0457 FOG: TPR repeat ||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 7 [O] COG0492 Thioredoxin reductase |||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 7 [R] COG0517 FOG: CBS domain |||||||||-|||||||-||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 7 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases |||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 7 [L] COG0582 Integrase ----||-----|------||-|--||||||||--||||----|||||||||||||||||--|||-- 7 [S] COG0586 Uncharacterized membrane-associated protein ----------------|||||||||||||-|||||||||---|||||||||||||||||||||||| 7 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases -|||||||-|||----||||-|---|-||-------------|||-|-----|---||-------- 7 [L] COG0675 Transposase and inactivated derivatives -|||--|||-------|---|-|||-|------|||||----------|-||-||-|||------- 7 [R] COG0733 Na+-dependent transporters of the SNF family ----------------|--||---------------------|||||-||||||||||||||||-- 7 [M] COG0810 Periplasmic protein TonB, links inner and outer membranes |-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||-- 7 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component ||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||------- 7 [HR] COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes ----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||||||||| 7 [MU] COG1538 Outer membrane protein ----------------------------------------------------|--|||-||||||| 7 [U] COG3504 Type IV secretory pathway, VirB9 components --------------------|------|||--------------------------||-------- 7 [N] COG5651 PPE-repeat proteins |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases |||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 6 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [R] COG0073 EMAP domain ||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 6 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases ||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||-- 6 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase --||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||-- 6 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases ||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||-- 6 [M] COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis |||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase ||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [M] COG0438 Glycosyltransferase |||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 6 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases |||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-|||||||||||||| 6 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components -------------||-||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain |-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes ||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 6 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump |------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||| 6 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [L] COG0550 Topoisomerase IA ||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease ||||---||----------|-----------||-||--|||-------||||||--|||-||-|-| 6 [V] COG0610 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases ----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--||||||||||| 6 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 6 [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit ---|----|----||---||--||----------||||----|||||||||||---|||||||||| 6 [O] COG0694 Thioredoxin-like proteins and domains --|-------------|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b |||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||-- 6 [R] COG0730 Predicted permeases ----------------||||----||----||||-|||----|||||||||||||||||||||||| 6 [M] COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2 ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein -----------------|||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 6 [R] COG0795 Predicted permeases ----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 6 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II -|-------------------------|||||||||||------------|-----||-|--|--- 6 [L] COG0827 Adenine-specific DNA methylase -|||||----|----------|---||---|-----|-|----||-|---|---|-|||----|-- 6 [V] COG1002 Type II restriction enzyme, methylase subunits |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 6 [C] COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit |||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||-- 6 [C] COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 6 [G] COG1109 Phosphomannomutase |||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|--- 6 [C] COG1145 Ferredoxin --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 6 [P] COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen |--------|--------||-------||||----|||----------|||--||||||||||||| 6 [S] COG1714 Predicted membrane protein/domain ----------------|-------||----|----|------||||||||-----|||||||||-- 6 [N] COG1749 Flagellar hook protein FlgE --||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 6 [NU] COG1886 Flagellar motor switch/type III secretory pathway protein ---------------------------------------------|----||-||-||-|-||--| 6 [M] COG3306 Glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis ----------------------------------------------------|---||-||||-|| 6 [U] COG3736 Type IV secretory pathway, component VirB8 ------------------||----------------------|||-|---------||-------- 6 [S] COG4735 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|------|------||--|--|-- 6 [P] COG4772 Outer membrane receptor for Fe3+-dicitrate ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 6 [N] COG4786 Flagellar basal body rod protein ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 5 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase ||-||||||||||---|-||-|----|||-------||----|||||-||||---|||||||||-- 5 [C] COG0243 Anaerobic dehydrogenases, typically selenocysteine-containing |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) |||-----||----|-|-||||----|||-----|--||---|||||--||----||||||||--- 5 [OK] COG0378 Ni2+-binding GTPase involved in regulation of expression and maturation of urease and hydrogenase ||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-|| 5 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase |||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||-- 5 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function |||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||-- 5 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase -||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||-- 5 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component |-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily -|||--|||-||------||-|---------||---------|||||-||--|--||||-|-|--- 5 [R] COG0727 Predicted Fe-S-cluster oxidoreductase -------------||------|----|-------||||----|||||-||||-||||||||||--- 5 [P] COG0753 Catalase |||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 5 [C] COG0778 Nitroreductase ||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-| 5 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 5 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component ||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--|||||||||||||| 5 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning ||||--|||-------|---||----|---|-------||--|||||-||--||||||||||||-| 5 [R] COG1451 Predicted metal-dependent hydrolase ---|----||-|---------|---|--------|-||----|||-|-||||-||||||--|---- 5 [C] COG1620 L-lactate permease -------------------|-||||||||||||||||||---|||||-|||||||||||||||||| 5 [D] COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins -----------------|------||----|-----||------------------|||------- 5 [S] COG1699 Uncharacterized protein conserved in bacteria -||-----------------|---|-----|-----|----------------|--|||----|-- 5 [M] COG2089 Sialic acid synthase ------------------------------------------|||||-|||||||-||||||--|| 5 [R] COG2194 Predicted membrane-associated, metal-dependent hydrolase ---|---------|||-|||-|--||----|---------|||||-|-||--|||-||||||||-- 5 [O] COG2214 DnaJ-class molecular chaperone ----------------|--||-||||-||-------------|||||||||||||||||||||||| 5 [M] COG2885 Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins ----------------------------------------------------|--|||-||||||| 5 [U] COG2948 Type IV secretory pathway, VirB10 components ---------------------------------|------------------|--|||-|--|--- 5 [U] COG3843 Type IV secretory pathway, VirD2 components (relaxase) ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase -|--||-------|||--|-|------||-|-----------|||||||||||||||||---||-- 4 [E] COG0241 Histidinol phosphatase and related phosphatases --|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-|||||||||||||||||| 4 [FP] COG0248 Exopolyphosphatase ---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family -|--||----------|-|-|------||-|-----------||||||||||-||-|||---|--- 4 [G] COG0279 Phosphoheptose isomerase ----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--||||||||||| 4 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I |||||||||||||---|-||-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 4 [H] COG0303 Molybdopterin biosynthesis enzyme |||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase ----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III -||-||--||-|------||----------|-----------|||-|-||||-|||||||||||-- 4 [C] COG0348 Polyferredoxin --|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase |||---||||------|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 4 [O] COG0409 Hydrogenase maturation factor |||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [I] COG0439 Biotin carboxylase ||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||---- 4 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit -------------|||--||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 4 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains ||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II |-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 4 [R] COG0546 Predicted phosphatases |||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||------- 4 [L] COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I -||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-| 4 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters -||||||||-|||---------------------------------------|---||-||||||| 4 [NU] COG0630 Type IV secretory pathway, VirB11 components, and related ATPases involved in archaeal flagella biosynthesis |-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||-- 4 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins ||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-|| 4 [I] COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase --|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||-- 4 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins |||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1 --|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators ------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [M] COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins) --|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump ||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit --|-||----|||||---||------||||-||||-||----|||-|--|--|||||||||||--- 4 [R] COG1064 Zn-dependent alcohol dehydrogenases --|---------------|-------------------------------||-|--|-|------- 4 [M] COG1083 CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase -|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-|||||| 4 [MG] COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases |-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 4 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 4 [NU] COG1338 Flagellar biosynthesis pathway, component FliP ----------------|-------||----------------|||||-|||||||||||||||||| 4 [M] COG1452 Organic solvent tolerance protein OstA ---------------------|||------------||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [O] COG1495 Disulfide bond formation protein DsbB ----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-||||||| 4 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes -----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit --|-----|-------|--|----------|-----------|||-|---------|||------- 4 [C] COG1740 Ni,Fe-hydrogenase I small subunit --|-------------|----|--------------------|||||-||-|---|||||--|--- 4 [P] COG1858 Cytochrome c peroxidase |-------|----------|------|----|||||||----||||------|||||||||-||-- 4 [R] COG1942 Uncharacterized protein, 4-oxalocrotonate tautomerase homolog --||---------------|-|-----|||||---|||----|||||-||---||---||||||-- 4 [P] COG2076 Membrane transporters of cations and cationic drugs |-||----|-----|-||||-|||-||||||----|||----|||||-||--|--|--||||||-- 4 [T] COG2202 FOG: PAS/PAC domain ------------------------------|-----------|||||-|-||----|||------- 4 [R] COG2704 Anaerobic C4-dicarboxylate transporter ------------------------------------------|||||-|-||----|||-||||-| 4 [P] COG3004 Na+/H+ antiporter ------------------------------------------------|-------|||------- 4 [S] COG3018 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-------------|--------|||-|-|-|-|---||-|------ 4 [S] COG3041 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------------------------||-|||------- 4 [L] COG3298 Predicted 3'-5' exonuclease related to the exonuclease domain of PolB ----------------|-||----------------------|||-|--|-----|||--|--|-- 4 [P] COG3696 Putative silver efflux pump ----------------------------------------------------|--|||-|--|--- 4 [U] COG3846 Type IV secretory pathway, TrbL components --------------------------|||------|--------------------||-------- 4 [R] COG4889 Predicted helicase ||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||-- 3 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase -------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 3 [G] COG0021 Transketolase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation) --||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0031 Cysteine synthase -|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 3 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase ||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 3 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||-- 3 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0048 Ribosomal protein S12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0049 Ribosomal protein S7 ---------|---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0051 Ribosomal protein S10 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0052 Ribosomal protein S2 ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit |||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 3 [G] COG0061 Predicted sugar kinase |||||||||||||||-||||-|----|||||-----------|||||-||--|--|||||||||-- 3 [S] COG0062 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||-- 3 [G] COG0063 Predicted sugar kinase ||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---||||||||||||| 3 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog) |||---||||------|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 3 [O] COG0068 Hydrogenase maturation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit |||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 3 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0080 Ribosomal protein L11 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0081 Ribosomal protein L1 ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0082 Chorismate synthase -|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||------- 3 [E] COG0083 Homoserine kinase |||---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0084 Mg-dependent DNase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0087 Ribosomal protein L3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0088 Ribosomal protein L4 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0089 Ribosomal protein L23 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0090 Ribosomal protein L2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0091 Ribosomal protein L22 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0092 Ribosomal protein S3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0093 Ribosomal protein L14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0094 Ribosomal protein L5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0096 Ribosomal protein S8 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0098 Ribosomal protein S5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0099 Ribosomal protein S13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0100 Ribosomal protein S11 |||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0102 Ribosomal protein L13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0103 Ribosomal protein S9 ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase |||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase |||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||-- 3 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 3 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||||| 3 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase --||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [C] COG0114 Fumarase -------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [F] COG0125 Thymidylate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 3 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase |||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase -|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 3 [H] COG0132 Dethiobiotin synthetase ||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase ||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 3 [G] COG0148 Enolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 3 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase ||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---||||||||||||| 3 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases -|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes ---|---------||---||----------------------|||||-||||-||||||-||-|-- 3 [G] COG0158 Fructose-1,6-bisphosphatase ||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain -|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 3 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0164 Ribonuclease HII -|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 3 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 3 [H] COG0171 NAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [E] COG0174 Glutamine synthetase -|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||-- 3 [G] COG0176 Transaldolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-||||||||||||||| 3 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0185 Ribosomal protein S19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0186 Ribosomal protein S17 --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit --||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||| 3 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase -------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||-- 3 [G] COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase -------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase -------------|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [F] COG0194 Guanylate kinase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0195 Transcription elongation factor -------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG0196 FAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0198 Ribosomal protein L24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0199 Ribosomal protein S14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0200 Ribosomal protein L15 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0203 Ribosomal protein L17 ||||||||||------||||||--||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 3 [D] COG0206 Cell division GTPase ---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-||| 3 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit |-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 3 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0211 Ribosomal protein L27 |--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-|||||||||||||||||| 3 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase --|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0216 Protein chain release factor A -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein -|||--||||---|--||--|---------|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0218 Predicted GTPase -------------||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase |-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-||||||||||||||||||||||||||||| 3 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit |-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 3 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase -------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0227 Ribosomal protein L28 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0228 Ribosomal protein S16 |-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||-- 3 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0230 Ribosomal protein L34 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0233 Ribosome recycling factor --|----------||-||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10) ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 3 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0238 Ribosomal protein S18 -|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation |-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 3 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0244 Ribosomal protein L10 ----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||-- 3 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase |||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0250 Transcription antiterminator |||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|---- 3 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D ||------||------|||||-||--|||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0254 Ribosomal protein L31 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0255 Ribosomal protein L29 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0256 Ribosomal protein L18 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0257 Ribosomal protein L36 ------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-|||||||||||| 3 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0261 Ribosomal protein L21 --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts |-||------||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0267 Ribosomal protein L33 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0268 Ribosomal protein S20 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis ----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase) --|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-|| 3 [C] COG0282 Acetate kinase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase ---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase ||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase |--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [P] COG0288 Carbonic anhydrase |||-----||------||||--||--|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3) -------------|--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0291 Ribosomal protein L35 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0292 Ribosomal protein L20 |||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 3 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes |||---||||--------||----------|-----------|||-|---|-----|||------- 3 [O] COG0298 Hydrogenase maturation factor -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0305 Replicative DNA helicase ||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|--- 3 [P] COG0306 Phosphate/sulphate permeases ---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain |||||||||||||---|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 3 [O] COG0309 Hydrogenase maturation factor ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0313 Predicted methyltransferases |||||||||-|||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 3 [H] COG0314 Molybdopterin converting factor, large subunit |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 3 [H] COG0315 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme ----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-| 3 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase --|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold -------------|||--|||---|||||||----|||----|||||||||||--||||-|-|-|| 3 [O] COG0326 Molecular chaperone, HSP90 family ||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||------- 3 [S] COG0327 Uncharacterized conserved protein ---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0328 Ribonuclease HI |||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--|||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0333 Ribosomal protein L32 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0335 Ribosomal protein L19 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase ----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase ||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 3 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 3 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD |||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase ----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||-- 3 [S] COG0344 Predicted membrane protein |-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase ||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-| 3 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase |||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase ----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit) --|----------|--|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type) --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0359 Ribosomal protein L9 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0360 Ribosomal protein S6 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1) |||---|||||-----||||-|--------||--||------|||||-||--|--||||----|-- 3 [P] COG0370 Fe2+ transport system protein B |-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-||||||||||||||| 3 [C] COG0372 Citrate synthase ||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||------- 3 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase --|-----||------|--|----------|-----------|||-|---------|||------- 3 [C] COG0374 Ni,Fe-hydrogenase I large subunit |||---||||------|-||-|--------------------|||-|---------|||------- 3 [R] COG0375 Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression) --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 3 [C] COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases |||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-||||||||||||||| 3 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases |||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||-- 3 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases --|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 3 [H] COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase ---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 3 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase -------------||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 3 [H] COG0414 Panthothenate synthetase ----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||-- 3 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme -------------||---|-----------------------||||||||---||||||||----- 3 [F] COG0418 Dihydroorotase --|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-||||||||||||||| 3 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0443 Molecular chaperone --|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||--- 3 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division ||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains |||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--||||||||||| 3 [O] COG0450 Peroxiredoxin |||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase ||-|--||||------||-|----||-||||-----||----------||-----||||------- 3 [D] COG0455 ATPases involved in chromosome partitioning ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 3 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ) ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family) |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase |||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| 3 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase --|----------||-||--||||||----|-----|||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase |||||||||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication |-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0486 Predicted GTPase ||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase ||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||-- 3 [R] COG0496 Predicted acid phosphatase ----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0498 Threonine synthase |||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 3 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes ||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||--- 3 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 3 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase) ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 3 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit ---|---------||---||-|----|||-----|-||----|||||--|-|-|||||||||||-- 3 [E] COG0506 Proline dehydrogenase |||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit |-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||-- 3 [E] COG0520 Selenocysteine lyase |||||||||||||---|--|-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 3 [H] COG0521 Molybdopterin biosynthesis enzymes |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [E] COG0527 Aspartokinases |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [F] COG0528 Uridylate kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0536 Predicted GTPase -------------||-||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0539 Ribosomal protein S1 |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||-- 3 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor) ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex ---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 3 [K] COG0557 Exoribonuclease R |-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase --||--|||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases --------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [J] COG0566 rRNA methylases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease |||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--|||||||||||||| 3 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein) ||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 3 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component ----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||-- 3 [R] COG0579 Predicted dehydrogenase |||||||||||||||||----|--------------------|||||-||||----|||------- 3 [S] COG0585 Uncharacterized conserved protein ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit |-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-|| 3 [ER] COG0591 Na+/proline symporter |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog) ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation -----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0594 RNase P protein component ||||--||-|-------|||||----||||||||||||||||--------------|||||||||| 3 [R] COG0595 Predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily --||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||--- 3 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components ||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes |||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase |-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [P] COG0605 Superoxide dismutase |--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-| 3 [O] COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity |-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-|||| 3 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase -||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||-- 3 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component |||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----|||||||||||||||||||||||| 3 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class) -------------|||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase ----------------|-||-|||---|||-|--||||----|||-||-|||-||||||||||||| 3 [I] COG0623 Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH) -|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases --||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases ||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0628 Predicted permease -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit ||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 3 [NT] COG0643 Chemotaxis protein histidine kinase and related kinases --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 3 [C] COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7 |-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase) ----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-| 3 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein --|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating) ----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase -------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-||||||||||||| 3 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH |||---||||-|----|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 3 [C] COG0680 Ni,Fe-hydrogenase maturation factor ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 3 [U] COG0681 Signal peptidase I ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0691 tmRNA-binding protein -------------|||----||||-|||||-||||||||||||||||||||||||||||||----- 3 [L] COG0692 Uracil DNA glycosylase --||-----------|--||----------|---|||||||||||||-||------||||------ 3 [G] COG0696 Phosphoglyceromutase ----------------|||-|-----|||||-|||||||||||--||----|----|||-|||-|| 3 [G] COG0698 Ribose 5-phosphate isomerase RpiB --|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0703 Shikimate kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC --|------|-|----||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase |-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0708 Exonuclease III -------------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein) --||||------|---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 3 [C] COG0713 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K) |||-----||---||---|||---|-----||||-||-----|||||||||||--||||------- 3 [C] COG0716 Flavodoxins |||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-||||||||||||||||| 3 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase -----------------|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase ||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---||||||||||||| 3 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit --||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--|||||||||||||| 3 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 3 [P] COG0725 ABC-type molybdate transport system, periplasmic component ----------------|||||||||||||||-----------|||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor |||||||||||||||--||||---------|-------------------------|||------- 3 [C] COG0731 Fe-S oxidoreductases -------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||| 3 [I] COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase) -------------|----------------------|-----|||-|---|-|||-|||--|-|-- 3 [G] COG0738 Fucose permease ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases -----------------|||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase ----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|-- 3 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase -----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [M] COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein) |||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||-- 3 [H] COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A --|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||--- 3 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component ------------------||----------------------------||||----|||||-|--- 3 [P] COG0748 Putative heme iron utilization protein -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit ------------------|-----------------------|||||---|-----||||---|-- 3 [E] COG0754 Glutathionylspermidine synthase --|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [O] COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component -----------------|||||----|||||-----||-------|-||||||--|||||||||-- 3 [E] COG0757 3-dehydroquinate dehydratase II ----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-| 3 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake ----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||- 3 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 3 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein -----------------||||-||||||||||||||||----|||||-||||---||||||-||-- 3 [S] COG0762 Predicted integral membrane protein ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0763 Lipid A disaccharide synthetase ----------------||||||||------||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [Q] COG0767 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase |||------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase --|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||-- 3 [F] COG0775 Nucleoside phosphorylase ----||----------||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit ----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------|-|---||||-------------||-||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [R] COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0781 Transcription termination factor -----------------|---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0782 Transcription elongation factor ---|--------------||||--|||----|||||||-|--|||||-|||||--|||||-|-||| 3 [P] COG0783 DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant) --------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0787 Alanine racemase ---|------------|-||-|----|||-------||----|||-|-|||||--|||||||-|-- 3 [F] COG0788 Formyltetrahydrofolate hydrolase ----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||-- 3 [L] COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase ----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0793 Periplasmic protease |||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation ----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 3 [M] COG0796 Glutamate racemase ----------------|-||----||----|-----------|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0797 Lipoproteins ----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [S] COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 3 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 3 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase --||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC ----------------||||||--||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing ----------------||||||---|----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase -------------|||------||--|---------------|||||-||||-||-|||------- 3 [E] COG0814 Amino acid permeases ----------------||||-|||||||||------------|||||-||||-||||||||||||| 3 [M] COG0815 Apolipoprotein N-acyltransferase ----------------||||||||--|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis) -----------------||||||||-||||------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit -----------------|||-|--------||||||||----|||||-|||||||||||||||--- 3 [M] COG0818 Diacylglycerol kinase ----||||--|||||----|------|----|-|||||------------||----|||--|---- 3 [K] COG0819 Putative transcription activator ----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||-- 3 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 3 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis --||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||| 3 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation --|-----|---------||--||------------------|||||-|||||--||||||||||| 3 [U] COG0823 Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system |-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [R] COG0824 Predicted thioesterase ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit |||------|-|----|--|||--------||||||||----|||||-||||-|||||||||---- 3 [O] COG0826 Collagenase and related proteases ----------------|-||--||||----|||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0828 Ribosomal protein S21 --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 3 [C] COG0838 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 3 (chain A) --||||--|--||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 3 [C] COG0839 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J) ------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|-- 3 [K] COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family ----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases ---------|------||--||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [D] COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 3 [C] COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit ----------------||||-|----|||||---||||----|||||--|--||||||||--||-- 3 [H] COG0853 Aspartate 1-decarboxylase ----------------|-||----------------------|||||-||--||||||||||||-- 3 [H] COG0854 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein --|---------------||-|-----||||------|----|||||-||--||||||||||||-- 3 [P] COG0855 Polyphosphate kinase ---|----|---------||-|-----||-------------||||||||||-||-|||------- 3 [R] COG0857 BioD-like N-terminal domain of phosphotransacetylase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A ----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [M] COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase ------------------||-|----|||-|---||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [P] COG0861 Membrane protein TerC, possibly involved in tellurium resistance --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 3 [C] COG1005 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 1 (chain H) --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 3 [C] COG1007 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N) --||||----------|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 3 [C] COG1008 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M) --||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--|||||||||||||| 3 [CP] COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit ----||-----------|-|------|---|-----||----|||||-||||-||-||||-|---- 3 [E] COG1027 Aspartate ammonia-lyase ----------------||||-|-----||-|-----------||||||-|--|||||||||||||| 3 [C] COG1034 NADH dehydrogenase/NADH:ubiquinone oxidoreductase 75 kD subunit (chain G) ----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 3 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase --||----------|--|||------||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 3 [E] COG1045 Serine acetyltransferase |||||||||||||-------||--|-----------------|||||-|||||||||||------- 3 [O] COG1047 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2 ------------------||----------------------|||||-||-|||||||||------ 3 [C] COG1049 Aconitase B ----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||-- 3 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases -------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 3 [H] COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase ----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease --------------------|-||||-||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains) |---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----||| 3 [D] COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis |------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||-- 3 [M] COG1087 UDP-glucose 4-epimerase --|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-||||||||||||| 3 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes -|----||---|-------||-----------------------------------||-------- 3 [R] COG1106 Predicted ATPases --|---||------------|||||-|-----|||-||----|||-|-||||-||-|||-||---- 3 [E] COG1115 Na+/alanine symporter ------------------||-------||--------|----|||||-||--||||||||||||-- 3 [P] COG1118 ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component -||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||-- 3 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [Q] COG1127 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component ------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [P] COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component ----------------||||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [R] COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component |--|||--|-|||-------||---------|----||----|||------|-||||||------- 3 [C] COG1139 Uncharacterized conserved protein containing a ferredoxin-like domain |||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 3 [C] COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I) ||||||-|||||-----|||-|----|||||-----------|||-|-||--|--||||||||||| 3 [C] COG1146 Ferredoxin ----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||-- 3 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [NU] COG1157 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase ----------------||--|||||||||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG1158 Transcription termination factor ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG1159 GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG1160 Predicted GTPases --||-------------|--||||||-----|||||||||||------|-------||||||||-- 3 [E] COG1164 Oligoendopeptidase F ------------------||-|--------------------|||||-||-||||-|||------- 3 [E] COG1166 Arginine decarboxylase (spermidine biosynthesis) --------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|-----|||-||||--- 3 [E] COG1174 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, permease component -------------||-----|---------|---|-||----|||||-|||||||||||------- 3 [H] COG1179 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 1 --|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes ||||----||---||-----|-||-|-||||-----||-----------|--|||||||||||-|| 3 [I] COG1183 Phosphatidylserine synthase -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase) -------------||-|||||||||||||||||-||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG1186 Protein chain release factor B ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases -----------------|--|-----|---||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 3 [J] COG1188 Ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit (S4 paralog) --|-----|-------|||||----|||||||||-|||||----------------|||||||||| 3 [J] COG1189 Predicted rRNA methylase --|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||----- 3 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II) ----------------||||--|||--||-|---||||----|||||-||-----||||------- 3 [K] COG1191 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit |-||--||--------||||||---|----||||||||------------------|||------- 3 [L] COG1193 Mismatch repair ATPase (MutS family) |--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase -----------------|||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase ----------------||||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [LK] COG1200 RecG-like helicase ----------------||||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains) |||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||-- 3 [M] COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase ------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||-- 3 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG1212 CMP-2-keto-3-deoxyoctulosonic acid synthetase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone ------------------||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [T] COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit ----------------||-------|--------||||----|||||||||||--||||||||||| 3 [O] COG1220 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), ATPase subunit --||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-| 3 [O] COG1225 Peroxiredoxin ||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-|||||||||||||| 3 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component --||---------||-|||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [N] COG1256 Flagellar hook-associated protein ----------------||------------------------||||||||-----|||||||||-- 3 [NO] COG1261 Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein |||---||-||-|---|---|-----------|--|||----|||||-||||-||||||-----|| 3 [I] COG1267 Phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins ------------------------||-----|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [R] COG1286 Uncharacterized membrane protein, required for colicin V production ---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--|||||||||||||| 3 [C] COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 3 [N] COG1291 Flagellar motor component ||||||||||||||||-|||||---|----||||||||------------------|||------- 3 [K] COG1293 Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP --|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 3 [S] COG1295 Predicted membrane protein ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [NU] COG1298 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhA ----------------|-|||||||||||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||| 3 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG -----------------|----||||----|-----||----||||||||-----||||---|--- 3 [NU] COG1317 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein ----------------||------------|-----||----------||------|||------- 3 [N] COG1334 Uncharacterized flagellar protein FlaG ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----||||------- 3 [N] COG1345 Flagellar capping protein ---|||||--|||---||||--|||||||||-------------------------|||-----|| 3 [F] COG1351 Predicted alternative thymidylate synthase ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 3 [N] COG1360 Flagellar motor protein -----------------|------------|||-|||-----|||-|-||||-||-|||||-|--- 3 [M] COG1368 Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily -||-|-||--||-----|--|------||----|-|--------------|-----|||---|--| 3 [R] COG1373 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [NU] COG1377 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhB ----------------||||||--||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 3 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-|---|---||----|-|--|-----------|--|-----|--|----------|||------- 3 [V] COG1401 GTPase subunit of restriction endonuclease |-|-------|-----|--|-|||--||||||---|||----|------------||||-|-|--- 3 [R] COG1408 Predicted phosphohydrolases ||||||||||------||--||--||----|||||||||-|||||-|---------|||||----- 3 [R] COG1418 Predicted HD superfamily hydrolase ----------------||------||----|----|||----------||-----||||------- 3 [N] COG1419 Flagellar GTP-binding protein -----------------||||-||--||||||||||||||||----------|--|||||||||-- 3 [K] COG1420 Transcriptional regulator of heat shock gene ----||--|-|-|---|----|||-------------|------------------|||------- 3 [R] COG1427 Predicted periplasmic solute-binding protein ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [Q] COG1463 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, periplasmic component ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit ||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--|||||||||||||| 3 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators ----------------|-----||||----|----|||----|||||-||--||||||||||||-- 3 [K] COG1508 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma54 homolog ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----||||------- 3 [NUO] COG1516 Flagellin-specific chaperone FliS ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG1519 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase ----------------||||||--||-||||----|||-|---------|--|||||||----|-- 3 [K] COG1521 Putative transcriptional regulator, homolog of Bvg accessory factor |-|-----|------|-|--------|||-|---|--||---|||||-|-||----|||------- 3 [P] COG1528 Ferritin-like protein ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [N] COG1536 Flagellar motor switch protein -------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase ---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||-- 3 [R] COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced) -----------------|------||----|-----||----|||||||||||---|||------- 3 [T] COG1551 Carbon storage regulator (could also regulate swarming and quorum sensing) ---|----|-----------||---------|----||----|||------|-||||||------- 3 [S] COG1556 Uncharacterized conserved protein ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [N] COG1558 Flagellar basal body rod protein ----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [R] COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein --------------------|-||--||||------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG1560 Lauroyl/myristoyl acyltransferase ----------------|-||--------------------------------|||||||||||||| 3 [S] COG1565 Uncharacterized conserved protein --|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--||||||||||||| 3 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase -----------------|--||--------||||||||||--|||||-||||||||||||||||-- 3 [S] COG1576 Uncharacterized conserved protein ----------------|----|||||||-||-------------------------|||------- 3 [R] COG1579 Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding ----------------||------||----|-----||----|||||-||-----||||------- 3 [N] COG1580 Flagellar basal body-associated protein ||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||--- 3 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase ||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG1605 Chorismate mutase ---|||----|||--------|||--|-------||||----||||||||||-|||||||||||-- 3 [I] COG1607 Acyl-CoA hydrolase ----------------||--|---------|||-|---------------|||||-|||-----|| 3 [S] COG1636 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-|||||||||||||||||| 3 [O] COG1651 Protein-disulfide isomerase ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG1663 Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase ----------------------||||----|-----|--------|--||--|--||||----|-- 3 [M] COG1664 Integral membrane protein CcmA involved in cell shape determination -|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-||||||||||||| 3 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [NU] COG1677 Flagellar hook-basal body protein ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [NU] COG1684 Flagellar biosynthesis pathway, component FliR ----------------||-------|----------------||||||||-----|||||||||-- 3 [N] COG1706 Flagellar basal-body P-ring protein -----------------|-|||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG1722 Exonuclease VII small subunit --||---------||--|--||---||---||||||||||--|||-|-||||-|||||||||---- 3 [S] COG1739 Uncharacterized conserved protein ----|||-|-|-|||---||-|-----------|---|----------|--|----|||||||--- 3 [E] COG1748 Saccharopine dehydrogenase and related proteins ---|--||----|-------|----|----|---|-||-------||-|-||-||-|||------- 3 [C] COG1757 Na+/H+ antiporter ||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega --------------------||----||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 3 [E] COG1760 L-serine deaminase ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [NU] COG1766 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway lipoprotein --||--|||--------|------|-----|----|||----------|-------|||------- 3 [NT] COG1776 Chemotaxis protein CheC, inhibitor of MCP methylation --|-------------|---|---------------------|||||-|||||||||||------- 3 [R] COG1778 Low specificity phosphatase (HAD superfamily) ----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----||| 3 [M] COG1792 Cell shape-determining protein ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [N] COG1815 Flagellar basal body protein ----------------||||-|||||||||----||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc) ----------------||||||||||-|||||||-|||------------------|||------- 3 [R] COG1837 Predicted RNA-binding protein (contains KH domain) ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [N] COG1843 Flagellar hook capping protein ---------------------|---|----||||||||----|||||-|-||-||-|||------- 3 [T] COG1854 LuxS protein involved in autoinducer AI2 synthesis ----------------||--|-||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [U] COG1862 Preprotein translocase subunit YajC --|----------||----||----|--------------------|--|-----||||----|-- 3 [F] COG1864 DNA/RNA endonuclease G, NUC1 ----------------||------||----|----|||----||||||||-----||||||||--- 3 [N] COG1868 Flagellar motor switch protein ---|--|||||||||------|------------||------|||||-||-|----||||||||-- 3 [R] COG1896 Predicted hydrolases of HD superfamily ||||||||--||----|||||-----||--|||--|||-------||--|-----||||||||--- 3 [S] COG1917 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain ||--|----|------|-------------------------|||||--|||----|||||-|--- 3 [E] COG1921 Selenocysteine synthase [seryl-tRNASer selenium transferase] ----------------|-||----------------------|||||-||||||||||||||||-- 3 [S] COG1934 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||-- 3 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase --|----|--|-|---|---|-----|||-||----||----|||||-||||-||||||------- 3 [T] COG1966 Carbon starvation protein, predicted membrane protein ----------------|-------------------------|||-|---------|||------- 3 [C] COG1969 Ni,Fe-hydrogenase I cytochrome b subunit --||||-||-||----|-||-|-----||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 3 [H] COG1977 Molybdopterin converting factor, small subunit ------------------||-----------------------------|--|||||||||||||| 3 [S] COG1981 Predicted membrane protein ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [NU] COG1987 Flagellar biosynthesis pathway, component FliQ ----------------|-|||----------------|----|||||-||-|||||||||||||-- 3 [H] COG1995 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein ---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--|||||||||||||| 3 [C] COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit --|-----|---------||-|----||||------||----------||---|||||||||||-- 3 [C] COG2010 Cytochrome c, mono- and diheme variants --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [P] COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component --|||||||-||--|-|----|----|||--|||||||----|||||-||||---|||||||||-- 3 [Q] COG2050 Uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism --------------------|-------------|-||----------||||-||-|||------- 3 [R] COG2056 Predicted permease ----------------||------------------------||||||||-----|||||||||-- 3 [N] COG2063 Flagellar basal body L-ring protein --------|----|--||-|||----|||-||||||||-----------|--||||||||||-|-- 3 [R] COG2070 Dioxygenases related to 2-nitropropane dioxygenase ----------------|---------|||-||-|||||-|--|||||-||||---||||------- 3 [O] COG2077 Peroxiredoxin ----||--|-|||---|----|||-------------|------------------|||------- 3 [R] COG2107 Predicted periplasmic solute-binding protein ----------------|---|-----------------------------------|||--||||| 3 [S] COG2121 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|----|||||-----------|||||-||--||||||||||||-- 3 [S] COG2127 Uncharacterized conserved protein ---------|-------|--------||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [E] COG2171 Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase ----------------|---|-||||-----------|----|||||-||-||||||||||||||| 3 [T] COG2204 Response regulator containing CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains --|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 3 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis --|-------------|----|----|||||-----------|||||-||-----|||||||||-- 3 [M] COG2230 Cyclopropane fatty acid synthase and related methyltransferases |||-||-----|----||----------------||--------------------|||------- 3 [L] COG2231 Uncharacterized protein related to Endonuclease III --|||||||-|||||----|----|||--------------------------||||||------- 3 [R] COG2236 Predicted phosphoribosyltransferases --|-----------|-----|---------|----||||---|||||-||||-||||||-|-||-- 3 [R] COG2249 Putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B) -|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|-- 3 [R] COG2252 Permeases -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit -------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 3 [L] COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase -----------------|------|-----|-----||-----------|------|||----|-- 3 [S] COG2257 Uncharacterized homolog of the cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB ----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase ----||---------------|----|||-----||------|||||-||--|||||||||-||-- 3 [S] COG2353 Uncharacterized conserved protein --||-------||-------|---------------|-------------------|||------- 3 [R] COG2404 Predicted phosphohydrolase (DHH superfamily) ||||--|||||||-|--|------------------------|||||-||--||||||||||||-- 3 [O] COG2518 Protein-L-isoaspartate carboxylmethyltransferase -|--------------|-------------|-----------------||-----|--|------- 3 [P] COG2703 Hemerythrin -------------------|||----||||||||||||||----------------||||||||-- 3 [K] COG2740 Predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination -------------------|-|--------|----||---------------------|-|-|--- 3 [V] COG2746 Aminoglycoside N3'-acetyltransferase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits --------------------------|||--|--||||----|||||--||||--||||||-|--- 3 [G] COG2814 Arabinose efflux permease --------------------------|----|||-|------|||||-||||-|||||||||||-- 3 [P] COG2824 Uncharacterized Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism ------------------------------------------|||||----|-||-|||------- 3 [M] COG2829 Outer membrane phospholipase A -|||----|-------|----|--||----|-----||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG2834 Outer membrane lipoprotein-sorting protein ---|---------------|----------|-----------------||---||||||------- 3 [S] COG2836 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||----|-|-||-|||--|---- 3 [S] COG2841 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------||-|-------------------||----------||--|||||||||||||| 3 [C] COG2857 Cytochrome c1 --|-------------|----|--------------------|||-||||||---|||||---|-- 3 [S] COG2862 Predicted membrane protein ---------------------|-----------------------|--||-|-||||||-|----- 3 [C] COG2863 Cytochrome c553 -|--------------|---|---------------------||||||-|||-||||||---||-- 3 [M] COG2870 ADP-heptose synthase, bifunctional sugar kinase/adenylyltransferase ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG2877 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (KDO) 8-phosphate synthase --|---------|-----------|-||||-------------------------||||||||||| 3 [L] COG2887 RecB family exonuclease |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 3 [H] COG2896 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme -----------------|------------------------|||||-|||||||||||||-||-- 3 [S] COG2908 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|---------------------------------------|||------- 3 [S] COG2952 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|---------|-|-----------|---|--|---|||----|-- 3 [E] COG2957 Peptidylarginine deiminase and related enzymes -------------------------------------------------|--|--||||------- 3 [S] COG2958 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------------||---|||||||||||-- 3 [C] COG2993 Cbb3-type cytochrome oxidase, cytochrome c subunit ------------------------------------------------|-------|||------- 3 [S] COG3014 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|-------------------------|||||-||------|||||||--- 3 [S] COG3034 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||------------|--||-----|-----|-||-------|||---|-|-|||||-||-|--| 3 [S] COG3177 Uncharacterized conserved protein --|---------------|-||----|---------------|||||-||-----||||||||--- 3 [O] COG3187 Heat shock protein ------------------------------------------------||---||||||-|-||-- 3 [P] COG3197 Uncharacterized protein, possibly involved in nitrogen fixation --------------------------||||-------------------|------||||||||-- 3 [E] COG3200 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase ------------------------------------------------||---|||||||||||-- 3 [O] COG3278 Cbb3-type cytochrome oxidase, subunit 1 --------------------------------------------------|-||--||-------- 3 [S] COG3309 Uncharacterized virulence-associated protein D ----------------|-------------------||------------------||||||||-- 3 [S] COG3334 Uncharacterized conserved protein --------------------|----------------|------------------|||------- 3 [L] COG3392 Adenine-specific DNA methylase -----------------------------------------------------||-|||------- 3 [S] COG3399 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|---------------------------------------|||------- 3 [S] COG3400 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------||------------------|||------- 3 [R] COG3401 Fibronectin type 3 domain-containing protein ------------------------------------------|||||||-------|||------- 3 [R] COG3417 Collagen-binding surface adhesin SpaP (antigen I/II family) -------------------|----------|---------------|-----|--|||-||-|-|| 3 [U] COG3505 Type IV secretory pathway, VirD4 components --------------------|-------------------------|----|-||-||-------- 3 [V] COG3587 Restriction endonuclease -------------------------------------------------------|||||||||-- 3 [L] COG3893 Inactivated superfamily I helicase ----------------|-------------------------|||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG4105 DNA uptake lipoprotein ----------------||--|---------||||||||||--|||||-|-||----||||||||-- 3 [R] COG4123 Predicted O-methyltransferase --|---------|---|-||------|||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 3 [P] COG4149 ABC-type molybdate transport system, permease component ---|---------||---||||----|||--|-|||------|||-|-||||||||||||||---- 3 [R] COG4221 Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity --------------------------------||----|-||--------------|||---|--- 3 [S] COG4487 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-------------|---||--||----|-----------|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG4591 ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component --|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||--- 3 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component ------------------------------------------------|-----|||||-|-||-- 3 [O] COG4736 Cbb3-type cytochrome oxidase, subunit 3 -------------||-||||||||||----------------|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87 -------------------------------|||||||------------------|||------- 3 [U] COG4940 Competence protein ComGF ----------------||-------|--------||||----|||||||||||--||||||||||| 3 [O] COG5405 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), peptidase subunit |||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||--- 2 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family ||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--|||||||| 2 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases ||||||||||||||--||||-|--------||--|-||--------|-||------||-||-||-- 2 [E] COG0075 Serine-pyruvate aminotransferase/archaeal aspartate aminotransferase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase ||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-| 2 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase -||--|--|||||||-|-||-------|-------|-|------------------||-|||||-- 2 [EQ] COG0145 N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit -||--|---||||||-|-||-------|----------------------------||-|||||-- 2 [EQ] COG0146 N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit ||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||-- 2 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase ||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-||||||| 2 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase ||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--|||||| 2 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases --||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-||||||||| 2 [C] COG0280 Phosphotransacetylase --|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|-- 2 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase -|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------| 2 [L] COG0338 Site-specific DNA methylase -------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||-- 2 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase -------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||-- 2 [G] COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase |-||||--|-|||||||-||-|-----||--|--||||----|||||-||-||--||-||||||-- 2 [I] COG0365 Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases ||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||-- 2 [H] COG0379 Quinolinate synthase ||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----|| 2 [M] COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase ----||----||||||--||||----|||-----|-||----|||-|-||--||||||-||-||-- 2 [E] COG0405 Gamma-glutamyltransferase -|--|||||||||||-||---|----|---|--|--||----||||||-|--||||||----|--- 2 [E] COG0421 Spermidine synthase ||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||-- 2 [O] COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation |||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||| 2 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases --|----------||-|-||||----|||-----|-||----|||||-||--||||||-|||||-- 2 [R] COG0523 Putative GTPases (G3E family) ---|||--|-|||||-||||-|-----||--|--||||----|||||--|-|---|||-|||||-- 2 [C] COG0538 Isocitrate dehydrogenases --|----------||||-||--||--||||-|---|||----|||-|-||-|---|||-||-|--- 2 [P] COG0659 Sulfate permease and related transporters (MFS superfamily) |||---||||------|||||------||-------||----|||||-||--||||||-|||||-- 2 [G] COG0662 Mannose-6-phosphate isomerase ----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-|||| 2 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat -|-|----|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 2 [E] COG0683 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component ------------------||-|-----|||-|--||||----------|-------||--|-||-- 2 [E] COG0686 Alanine dehydrogenase -------------|||--||----|-----------------------|-------||-------- 2 [R] COG0724 RNA-binding proteins (RRM domain) --|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||-- 2 [G] COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase |--|----|----||-|||--|--|-|---|||-||||-|--|||||-|-||---|||-||-|--- 2 [F] COG0737 5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases -------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-||||||| 2 [F] COG0756 dUTPase |-|---|||-|-|---||||||--|-||||--||--||------------||----||-||||--- 2 [O] COG0785 Cytochrome c biogenesis protein ------------------|-|-----|-------|-------|||||-|||--||-||-------- 2 [E] COG0786 Na+/glutamate symporter -----------------|||----|-----||||--||----|||||-||||||||||-|||||-- 2 [G] COG0800 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||-||||--- 2 [E] COG0804 Urea amidohydrolase (urease) alpha subunit -----------|--------||--|------||||||-|||||||||||-||----||----|--- 2 [F] COG0813 Purine-nucleoside phosphorylase --------------|---||-|----|-------|--||----||----||----|||-||||--- 2 [O] COG0829 Urease accessory protein UreH --------------|---||-|----|||-----|--||----|||---||----|||-||||--- 2 [O] COG0830 Urease accessory protein UreF --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||-||||--- 2 [E] COG0831 Urea amidohydrolase (urease) gamma subunit --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||--|||--- 2 [E] COG0832 Urea amidohydrolase (urease) beta subunit -------------||---------------||--|||-----|||||--|-----|||-------- 2 [E] COG0833 Amino acid transporters --||--|||-------||||-|--------|-----------|||||-||--|---||-|||||-| 2 [M] COG0836 Mannose-1-phosphate guanylyltransferase ------------------||----------------------|||||--|--||||||-|||||-- 2 [G] COG0837 Glucokinase ----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||--- 2 [D] COG0850 Septum formation inhibitor ------------------||||--------------------||||||||--||||||-||||--- 2 [D] COG0851 Septum formation topological specificity factor ||||--|||||||-----------------|----|||----|||-|---------||---|-|-- 2 [K] COG0864 Predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain and a metal-binding domain -----------------|---|--------||||||||-|--|||||||-------||-||-|--- 2 [G] COG1015 Phosphopentomutase |-|-----|-------|-||-------||-|-----------|||-|-||--|---||-|-|||-- 2 [M] COG1089 GDP-D-mannose dehydratase |||||-||||-|-||||||-|------||||---|---|||||||-|--|--|---|--------| 2 [L] COG1112 Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits |||-|----|-|------|||-----||||----|-------|||||-|------|||-||-|--- 2 [R] COG1123 ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase --------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|------||-||||--- 2 [E] COG1125 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, ATPase components |||-||||||||----||--------------------------------------||-------- 2 [C] COG1144 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, delta subunit --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||--- 2 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components |||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||-- 2 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon) --------------------|-----|||-|---|-||----|||||-||-|---|||-|-|---| 2 [R] COG1279 Lysine efflux permease --------------------|---|-|-----||||||-|--|||-|-||--------|||||--- 2 [P] COG1283 Na+/phosphate symporter --|-----|-----------||----|----|-|||||----|||||-||||-|||||-||||--- 2 [E] COG1296 Predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance) --||||||---|-----|||||----|||-||-|||||----|||----|||---|--||||||-- 2 [R] COG1473 Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase -------------||--|--||--|-----|||||||-------------------||-||||--- 2 [H] COG1564 Thiamine pyrophosphokinase --|-----------------|-----|---------|-------------||----||-------- 2 [E] COG1687 Predicted branched-chain amino acid permeases (azaleucine resistance) -------------||----||---|-----|||||||------------|---||-|-|-|----- 2 [M] COG1696 Predicted membrane protein involved in D-alanine export ---|----|----------|||-----||-|||||||-----|||-|--|-----|||-||||--- 2 [M] COG1732 Periplasmic glycine betaine/choline-binding (lipo)protein of an ABC-type transport system (osmoprotectant binding protein) ||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||-- 2 [K] COG1733 Predicted transcriptional regulators -----------------||--|---------------|------------------||-------- 2 [V] COG1787 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase and Mrr-like restriction enzymes --------|--|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-| 2 [I] COG1788 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit --||------|-|-----|||-----|-----|||--|-----||||-||||||||--|||||--- 2 [P] COG1840 ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component |-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--| 2 [R] COG1881 Phospholipid-binding protein -|||--|||||||---||-|-------------|||-------||-----------||-------- 2 [S] COG1912 Uncharacterized conserved protein |||----|||-------||--|--------||--||------|||||-||--|--|-||----|-- 2 [P] COG1918 Fe2+ transport system protein A --|-||----------|--|-------||--------------------------|||--|-|--- 2 [R] COG1926 Predicted phosphoribosyltransferases -------------------|------------|-|-||----|||||-|-||----||-----|-- 2 [F] COG1972 Nucleoside permease ||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||-- 2 [R] COG1994 Zn-dependent proteases --------|---|-------|-----|-----|----|----|------||-----||-------- 2 [I] COG2031 Short chain fatty acids transporter --||||--|-|||---|--|-|----|||-------|-----|||||--|-|---|--||||||-- 2 [R] COG2041 Sulfite oxidase and related enzymes -----------|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-| 2 [I] COG2057 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit ----------------|---|---------------------|||||-|||||||-||-|||||-- 2 [I] COG2067 Long-chain fatty acid transport protein ---------------------------|||------------|||||---------||-------- 2 [I] COG2134 CDP-diacylglycerol pyrophosphatase ----------------||--------------------------------------||-------- 2 [O] COG2143 Thioredoxin-related protein --|---|||----||-----------|---||-|||||----|||-|---||----||-|------ 2 [H] COG2145 Hydroxyethylthiazole kinase, sugar kinase family ----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||-- 2 [NU] COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG ---------------------------||----|--------|||-|--||-|||-||-||-|--- 2 [D] COG2184 Protein involved in cell division ------------------||-|----|-------|--||----|||---||----|||-||||--- 2 [O] COG2371 Urease accessory protein UreE -------------------|------------|-|---|-----------||----||-------- 2 [R] COG2503 Predicted secreted acid phosphatase --||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||---- 2 [P] COG2608 Copper chaperone ----|------|------------------|-----||----|||||--------|--||||||-- 2 [G] COG2721 Altronate dehydratase --------------------|---------|--|-----|--|||||-|-||----||-------- 2 [G] COG2731 Beta-galactosidase, beta subunit ----------------||||||--------|----|||----||||||||--||||||-||||--- 2 [D] COG2894 Septum formation inhibitor-activating ATPase ------------------------------------------|||||-||||------|||----- 2 [C] COG3005 Nitrate/TMAO reductases, membrane-bound tetraheme cytochrome c subunit ------------------------------------------|||-|-|-||----||-------- 2 [S] COG3059 Predicted membrane protein --------------------------|----|||--------|||||--|||----||-------- 2 [H] COG3201 Nicotinamide mononucleotide transporter ------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|-- 2 [U] COG3210 Large exoproteins involved in heme utilization or adhesion ------------------|------------------------------|-----|--|--|---- 2 [C] COG3258 Cytochrome c -----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-||||||| 2 [M] COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes -------------------|---------------|-|----------|--|----||--|-|--- 2 [P] COG3338 Carbonic anhydrase ----|------|--|------------||-----|----------||--------|||-------- 2 [P] COG3376 High-affinity nickel permease -------------------------------------------||-|-|-------||-------- 2 [S] COG3528 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----------------------------------------||-----|-----||---|---- 2 [S] COG3586 Uncharacterized conserved protein ---------------------------------------------|---|-----|--|||||--- 2 [R] COG3618 Predicted metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold --||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||-- 2 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components --|-----------------|-----|---|---|-------------|-------||-------- 2 [L] COG3886 Predicted HKD family nuclease -|----------------------------|-----|-------------------|-|----|-- 2 [M] COG3980 Spore coat polysaccharide biosynthesis protein, predicted glycosyltransferase -----------------|--|-|||||||-||-||||-||--|||||-||||---|||-||||--- 2 [E] COG4166 ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component ------------------------------------------|||||-||-----|||-||||--- 2 [R] COG4174 ABC-type uncharacterized transport system, permease component -------------------------|----------------|||||-||-----|||-||||--- 2 [R] COG4239 ABC-type uncharacterized transport system, permease component -------------------------------------------||---|---------|-|----- 2 [R] COG4588 Accessory colonization factor AcfC, contains ABC-type periplasmic domain --------------------------------------------------------||--|-|--- 2 [Q] COG4647 Acetone carboxylase, gamma subunit ----------------------------------------------|---------||-||----- 2 [G] COG4692 Predicted neuraminidase (sialidase) ----------------------------------------------------|--|||-------- 2 [S] COG4694 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------||-----------------------------|||-|||||-- 2 [S] COG4731 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-----------------|-----------------|-----------------||-------- 2 [S] COG4866 Uncharacterized conserved protein ---------------------------------------------|---------|--|------- 2 [S] COG5472 Predicted small integral membrane protein ----------------------------------------------|----------||------- 2 [R] COG5610 Predicted hydrolase (HAD superfamily) |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase |||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase] ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase |--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||-- 1 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain ||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--|||||||| 1 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters ||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit |||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0067 Glutamate synthase domain 1 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0069 Glutamate synthase domain 2 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0070 Glutamate synthase domain 3 ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit ||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0077 Prephenate dehydratase |||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase |||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--|||||||| 1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase --||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful) ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase ||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase -|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase ||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||---- 1 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components |||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 1 [Q] COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway) ------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class) ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 1 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase --|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0281 Malic enzyme --||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN |-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II |-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases |-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||-- 1 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG0410 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component -|------|-|||----|||||-----------|--------|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG0411 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component ||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||-- 1 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC ||||--||--||||||||-|-|---||||------|------|||-|--|---|||--|-|----- 1 [P] COG0428 Predicted divalent heavy-metal cations transporter --||---||-|||---|-------------------------|||||-||||---|--|-|-|--- 1 [C] COG0437 Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1 |||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||-- 1 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit ||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 1 [R] COG0456 Acetyltransferases ||||||||||||||||--||-|----||||------||-----------|-----|--|||-|--- 1 [O] COG0464 ATPases of the AAA+ class -|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||-- 1 [G] COG0469 Pyruvate kinase |||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--|||||||| 1 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase ||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--|||||||| 1 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family --|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--|||||||| 1 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases -|-----------||----|-|||-|-||-||||||||-|--|||||||||||||---|||||--- 1 [L] COG0507 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member ---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|--- 1 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase -------||---|||-|-|--|-----||-|-----||----||||||||--|--|--|-||||-- 1 [P] COG0529 Adenylylsulfate kinase and related kinases |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-| 1 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG0559 Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease components |--------------------|----|||||---------|||---|-----------||------ 1 [M] COG0562 UDP-galactopyranose mutase ||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||---- 1 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||-- 1 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 1 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component ||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [K] COG0583 Transcriptional regulator |||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|-- 1 [H] COG0611 Thiamine monophosphate kinase |||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||-- 1 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent) -----|-------||-|-||-|||--||||||||||||||||-------|--|--||--|--|--- 1 [T] COG0631 Serine/threonine protein phosphatase -|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||-- 1 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases |||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||-- 1 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators ---|--|||--||||-||--|-----|||--|||||||----|||||--|--------|||||||| 1 [G] COG0647 Predicted sugar phosphatases of the HAD superfamily |||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--|||||||| 1 [R] COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily -------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases ---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||-- 1 [C] COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases) --------|---|||--||||---|---------|||-----||||---|-|-||---|--|--|| 1 [P] COG0672 High-affinity Fe2+/Pb2+ permease ||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--|||||||| 1 [R] COG0679 Predicted permeases --|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase -||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||-- 1 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase |||-----||------||||-------||-|-||-|||----|||-------------|------- 1 [R] COG0701 Predicted permeases -||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||-- 1 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid) -|-------|||----|-------------------------|||||--|||------|-|----- 1 [E] COG0709 Selenophosphate synthase |-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-|| 1 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin -|||---||--|----|-||------|||---|---||----|||||-||-||--|--|||||||| 1 [M] COG1004 Predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase -------------||-|----|----|-------|-||----|||||-||--|--|--|-|----- 1 [C] COG1017 Hemoglobin-like flavoprotein -------------||----|------||||-||||||-----|||||-||-----|--||-||--- 1 [Q] COG1020 Non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins -|||--||||-------|------||-----------|-----------|--------|------- 1 [R] COG1033 Predicted exporters of the RND superfamily ----|||||-|||----||||-||---|||----||||----||||--||---|||--||--|--- 1 [P] COG1055 Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases -------------|||--|-----------------------||||||||||-|||--|||||||| 1 [O] COG1076 DnaJ-domain-containing proteins 1 |-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 1 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 1 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component |-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 1 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component ------------------------------------------|||-|-----------|||||--- 1 [I] COG1133 ABC-type long-chain fatty acid transport system, fused permease and ATPase components --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 1 [GM] COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component ---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [E] COG1171 Threonine dehydratase ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II ---|--||--|-|-----||||--|-|------|---|----|||||-||||-|||--|||||--- 1 [P] COG1178 ABC-type Fe3+ transport system, permease component |-----|||---|---|---|----------------------------|--------|----|-- 1 [M] COG1213 Predicted sugar nucleotidyltransferases -------------||-|-||--||--||||------------|||||||||||-----|||||||| 1 [P] COG1218 3'-Phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase --|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||-- 1 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component -||------|------|-------------------------|||||-||||||||--|||||||| 1 [S] COG1238 Predicted membrane protein --||||--|-------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 1 [C] COG1271 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1 |-|-||--|||||----||--|----|---------||----|||||-|||||--|--||||||-- 1 [E] COG1280 Putative threonine efflux protein |||||||||-||-||-------------------------------------------|------- 1 [R] COG1287 Uncharacterized membrane protein, required for N-linked glycosylation ------------------|--|------------|||-----|||||-||||||||--|||||--- 1 [S] COG1289 Predicted membrane protein --||------------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 1 [C] COG1294 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2 ---|--|------|-------------||--------------------||-||||--|----|-- 1 [S] COG1297 Predicted membrane protein --||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-|||| 1 [C] COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters |-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 1 [K] COG1309 Transcriptional regulator --|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||-- 1 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase --||--|||--------|-|----||----|----|||----|||||-||-----|--|||-||-- 1 [NT] COG1352 Methylase of chemotaxis methyl-accepting proteins -------------------|||----|--||||||||||-|||||||-||||||||--||||||-- 1 [P] COG1393 Arsenate reductase and related proteins, glutaredoxin family --||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|--- 1 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases ---|------------||---|----|||-------||----|||||-||||---|--||||||-- 1 [K] COG1414 Transcriptional regulator ----------------|---|-||------------------|||||-||--|--|--|---||-- 1 [NU] COG1450 Type II secretory pathway, component PulD --|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||--- 1 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase ----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein |||-|||-|||||---||-||------||---|--|-|----|||||----|--|---|------- 1 [L] COG1518 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair ----|||||--|-|||-|-|------|---|----|-|-----------|--|-----|-|-||-- 1 [R] COG1524 Uncharacterized proteins of the AP superfamily ||-|--||-|---||-|--|------|-------|-|--|||-------|||-||---|||||--- 1 [L] COG1525 Micrococcal nuclease (thermonuclease) homologs |||-||--|-||--------------|||-----||||----|||||-||||---|--||||||-- 1 [C] COG1526 Uncharacterized protein required for formate dehydrogenase activity ------||------------||----|--|----|-||----|||||-|||--|||--||------ 1 [R] COG1540 Uncharacterized proteins, homologs of lactam utilization protein B --|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|------- 1 [L] COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins |||----|||-|-----|-||---------|-----|---------------------|------- 1 [C] COG1592 Rubrerythrin ----------------||||----------------------|||-|-||-|||||--||||||-- 1 [M] COG1596 Periplasmic protein involved in polysaccharide export |-|||---|--------|||-------------|--------||||--------|--|--|-||-| 1 [S] COG1598 Uncharacterized conserved protein -------------|---|--------|||-|----|||----------||--||||--|||||--- 1 [S] COG1610 Uncharacterized conserved protein --|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||-- 1 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein -----------------|------|-----------------------||--------|------- 1 [T] COG1639 Predicted signal transduction protein -------------------|-------||-------||----|||||-||||---|--|------- 1 [S] COG1666 Uncharacterized protein conserved in bacteria |||---||--||-----||||------------------------|------------|------- 1 [R] COG1672 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 1 [GM] COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component --|--------------|||-------------------------|-----------|--|-||-- 1 [N] COG1724 Predicted periplasmic or secreted lipoprotein ----------------|-----||||----|-----||----||||||||||||||--|||||||| 1 [T] COG1734 DnaK suppressor protein |||||-|||||||---|-----------------||||----|||||-|-||---|--|||||--- 1 [H] COG1763 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein |||||||||||||||||----------||-------||----------|||--||---|||-||-- 1 [L] COG1793 ATP-dependent DNA ligase ------|||----------------------|----|-----|||||----|---|--|||-||-- 1 [M] COG1794 Aspartate racemase -------------------------|--------|-|-----|||||-|-||------|------- 1 [R] COG1823 Predicted Na+/dicarboxylate symporter ||||||||||||----||||-|----||||-|--||||--------------------|-||||-- 1 [F] COG1828 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, PurS component ---|||||--|||---||---|---------|||-|||----|||||--------|--|||-|--- 1 [R] COG1832 Predicted CoA-binding protein ------------||------||------------|-||----|||||-||||------|||||--- 1 [C] COG1866 Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP) -----------------|------------||-|--||----|||||-|---------||||---- 1 [E] COG1897 Homoserine trans-succinylase |-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||-- 1 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes --|----------||----|------||||-|---|||----||||||||||||||--||||||-- 1 [HE] COG1932 Phosphoserine aminotransferase ------------------||-|----||||||--||||----|||-|--|-----|--|||----- 1 [S] COG1937 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------|-||----|-|----|||-----|--|----|||-|--|-|---|--||||||-- 1 [F] COG1957 Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase ----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator |--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||-- 1 [V] COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein |-|-----------------|-----|---|-----||----|||||--|--|||---|------- 1 [S] COG1971 Predicted membrane protein ------||-----|------||----||||----|-||----|||||-|||--|||--||---|-- 1 [E] COG1984 Allophanate hydrolase subunit 2 ||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 1 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases ---|------|-|||-|----|--------------||----------||--||||--|||||||| 1 [R] COG1999 Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC, involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems |-|-----||||------------------------------|||||--|||---|--|||-||-- 1 [R] COG2005 N-terminal domain of molybdenum-binding protein ----------------|-||||----|||||-----||----|||||-||--||||--||||||-- 1 [H] COG2022 Uncharacterized enzyme of thiazole biosynthesis -------||-|||||-|-||-|--------------||--------------------|------- 1 [P] COG2046 ATP sulfurylase (sulfate adenylyltransferase) |||-----||-|----|-||--------------------------------------|------- 1 [C] COG2048 Heterodisulfide reductase, subunit B ------||-----|------||----||||----|-||----|||-|-|||--|||--||---|-- 1 [E] COG2049 Allophanate hydrolase subunit 1 --------|-|||---|-||------||||------------|||||-|||||--|--||||||-- 1 [T] COG2062 Phosphohistidine phosphatase SixA --------------|-----|------|||||||-|------|||----|--------|||||||| 1 [R] COG2071 Predicted glutamine amidotransferases |-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||-- 1 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases -||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||-- 1 [U] COG2095 Multiple antibiotic transporter |-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||-- 1 [H] COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis ---|---------||---||-|----|||||-----||-----------|--|--|--||||||-- 1 [Q] COG2124 Cytochrome P450 ---|------|--||-|--|------|||-------||----|||||--|||||||--||||||-- 1 [Q] COG2132 Putative multicopper oxidases ---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||-- 1 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis --|-----------------||---|----||||||||----|||||-|-||------|-|--|-- 1 [E] COG2195 Di- and tripeptidases --||--|||--------|-|----||----|-----||----|||||-||--|--|--|||-||-- 1 [NT] COG2201 Chemotaxis response regulator containing a CheY-like receiver domain and a methylesterase domain ------------------||-|-----||-|---||------|||||-||-----|--|||-||-- 1 [T] COG2205 Osmosensitive K+ channel histidine kinase -----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [K] COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|--|||-||-- 1 [P] COG2216 High-affinity K+ transport system, ATPase chain B ||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--| 1 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold ---------------------|----|||-|---||||----|||-|--||----|--||-|---- 1 [S] COG2258 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase ----------------------||-------||-|-|-----|||||-||||------|-----|| 1 [G] COG2271 Sugar phosphate permease ||-|-----|---------|-|-----|||----|-------||||---|-----|--||||||-- 1 [E] COG2303 Choline dehydrogenase and related flavoproteins --|---------------||-|----|||-------------------||-----|--||||||-- 1 [S] COG2326 Uncharacterized conserved protein ------------------|--|----||||----|-||-----------------|--||||||-- 1 [R] COG2346 Truncated hemoglobins --------------|------|--------------||----|||-|--|-----|--||||||-- 1 [R] COG2351 Transthyretin-like protein ------------------||-|--------------------|||||-||--||||--||||||-- 1 [O] COG2360 Leu/Phe-tRNA-protein transferase --------------------||----|||||---||||----|---|-||--|-||--||||||-- 1 [K] COG2378 Predicted transcriptional regulator ---|||---|||-----|---|------------|-------|||||-||--|--|--|||||--- 1 [R] COG2391 Predicted transporter component ------||------|--|-|----------------------|||||-|------|--|---||-- 1 [E] COG2515 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase ------------------||--------------|-|------------|-----|--||--|--| 1 [V] COG2602 Beta-lactamase class D -|----------------------------------------|||-|--|--------|------- 1 [R] COG2603 Predicted ATPase ----||------------|--------||-|---------------------------|------- 1 [R] COG2605 Predicted kinase related to galactokinase and mevalonate kinase ----------------|-||----------|------------------|---|||--||||||-- 1 [R] COG2607 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) -------------------|-|--|-----|-----------|||||--|-|---|--||||-|-- 1 [S] COG2717 Predicted membrane protein -----------|-||---||-------|||||||-|||----|||||-||-|-|||--||||||-- 1 [E] COG2755 Lysophospholipase L1 and related esterases ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 1 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB ---------------------|----|---|--|-||-----|||-|--|-----|--|--|---- 1 [P] COG2807 Cyanate permease ---------------------|--------|--|--|------||-|--|---|----||---|-- 1 [R] COG2819 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily --------------------------------------------------||-||---|------- 1 [S] COG2830 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|-- 1 [U] COG2831 Hemolysin activation/secretion protein --------------------------------------------------||-|||--||||---- 1 [S] COG2833 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------||||------------------||--|||---|------- 1 [C] COG2838 Monomeric isocitrate dehydrogenase ------------------------|----------------------------||---|||||--- 1 [S] COG2845 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------|-----|----|----|---------------------||-|-|||--|||||||| 1 [S] COG2847 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|-||------------|--------||--|---||---|------- 1 [S] COG2849 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|-----|-|-||-----------|--|||---|------- 1 [C] COG2851 H+/citrate symporter --------------------|---------------------|||||-||||||||--|----||| 1 [M] COG2853 Surface lipoprotein ------------------------------------------|||||-||||||||--|----||| 1 [Q] COG2854 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, auxiliary component --------|-----------|-----|----|||||------|||||--|||-|||--||||||-- 1 [S] COG2855 Predicted membrane protein ------------------|------|-----------------||---|---------|------- 1 [S] COG2859 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|------||---------|----|----||---||----|||||-||||---|--||||||-- 1 [S] COG2860 Predicted membrane protein -------------------------|-----------|----|||-|--|||------|||-||-- 1 [S] COG2861 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-----|-------|-------------------------|||||-||||---|--|-|----- 1 [C] COG2864 Cytochrome b subunit of formate dehydrogenase --|----|------------||----|-----------|-------------------|------- 1 [K] COG2865 Predicted transcriptional regulator containing an HTH domain and an uncharacterized domain shared with the mammalian protein Schlafen --||---------||--|---|----|||-||---|-|-----------|-|---|--|||||--- 1 [E] COG2873 O-acetylhomoserine sulfhydrylase ------------------------------------------|||||--|---|||--|------- 1 [S] COG2879 Uncharacterized small protein -------------------------------|-|-||-----------||-----|--|||-|--- 1 [R] COG2910 Putative NADH-flavin reductase -------------||---------------------------------||--|--|--||||||-- 1 [O] COG2935 Putative arginyl-tRNA:protein arginylyltransferase --------------------|-----------|---------|||||-||||---|--|-|----- 1 [S] COG2964 Uncharacterized protein conserved in bacteria |------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|------- 1 [S] COG2966 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||||-|-||-||---|---|--- 1 [S] COG2990 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------------------|||-|-|---------|------- 1 [R] COG2992 Uncharacterized FlgJ-related protein |---------|-------------------------------------|------|--|------- 1 [H] COG2998 ABC-type tungstate transport system, permease component ----------------|-------------------------------||--------|------- 1 [S] COG3016 Uncharacterized iron-regulated protein ----------|-----|-------------------------------||-|------|-|----- 1 [R] COG3019 Predicted metal-binding protein ----------------|---|-----|-----||--------|||||-||||-|||--|----|-| 1 [S] COG3022 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|---------------|||-|-||--------||--||-- 1 [M] COG3040 Bacterial lipocalin ------------------------------------------|||||-||||------|||----- 1 [C] COG3043 Nitrate reductase cytochrome c-type subunit ------------------------------------------|||||-||||------|||----- 1 [P] COG3062 Uncharacterized protein involved in formation of periplasmic nitrate reductase -------------------|-----------------|----------||--------|||-||-- 1 [R] COG3211 Predicted phosphatase -------------------------------------------------|--|-----||||||-- 1 [R] COG3218 ABC-type uncharacterized transport system, auxiliary component ----||-----------------------------|||----|||||-----------|||||--- 1 [S] COG3254 Uncharacterized conserved protein |-|----------------------------------------------|---|||--|------- 1 [R] COG3271 Predicted double-glycine peptidase -||-||---|-|----|-------------------------|||-|--|||------|-|----- 1 [J] COG3276 Selenocysteine-specific translation elongation factor ------------------------------------------|||-|---||------|------- 1 [P] COG3303 Formate-dependent nitrite reductase, periplasmic cytochrome c552 subunit --|----------------------------|||-|||--------|--|---||-|--|------ 1 [S] COG3326 Predicted membrane protein --|-||----|------|-|-------------------------|-----|------|------- 1 [S] COG3350 Uncharacterized conserved protein ---------------------------------------|----------|---|--|-------- 1 [S] COG3421 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---|--------------------|-----|------|--|---- 1 [P] COG3470 Uncharacterized protein probably involved in high-affinity Fe2+ transport -------------------------------|--|-------||||------------|------- 1 [S] COG3477 Predicted periplasmic/secreted protein --------------|------------------------------|---|-----|--|---||-- 1 [R] COG3491 Isopenicillin N synthase and related dioxygenases --------------------------------|------------------|--|---|------- 1 [S] COG3512 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------|--|---------------|--|---|------- 1 [S] COG3513 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------------------------|-||---|-|----- 1 [M] COG3524 Capsule polysaccharide export protein ---------------------------------------------------|-||---|-|----- 1 [M] COG3562 Capsule polysaccharide export protein ---------------------------------------------------|-||---|-|----- 1 [M] COG3563 Capsule polysaccharide export protein ------------------||----------------------|||---|-----|--|-------- 1 [R] COG3596 Predicted GTPase ------------------||-|---------|-------------------------|-------- 1 [S] COG3597 Uncharacterized protein/domain associated with GTPases |------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|------- 1 [S] COG3610 Uncharacterized conserved protein --------------------------------|---------|||||-||||-||---|------- 1 [E] COG3633 Na+/serine symporter --|-----------|------|--------------------|||-|----|-|||--|----|-- 1 [L] COG3663 G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase -----------------|||-----|-----------|-----------|--------|||||||| 1 [T] COG3706 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain ------------------------------------------|||||----|------|------- 1 [S] COG3787 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------|-----------------------------------------------|---||-- 1 [S] COG3809 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------||-----------|---------|--|----|-- 1 [S] COG3817 Predicted membrane protein --------------------------------||-----------|---------|--|----|-- 1 [S] COG3819 Predicted membrane protein |||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||--- 1 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components ------------------------------|------|--------------------|-|----- 1 [Q] COG3882 Predicted enzyme involved in methoxymalonyl-ACP biosynthesis ------------------------------------------------------|---|-|----- 1 [M] COG4092 Predicted glycosyltransferase involved in capsule biosynthesis ||--------------|-||-|---|----------------|||||-||||---|--|||--|-- 1 [S] COG4121 Uncharacterized conserved protein -------------------------------------------------|--------|||||--- 1 [R] COG4132 ABC-type uncharacterized transport system, permease component -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG4177 ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component ------------------||-|-----------------------|------------|||-|--- 1 [S] COG4222 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------||------------------|||||-||||||||--|----|-- 1 [OC] COG4232 Thiol:disulfide interchange protein -------------------|----------------------||||----------|--------- 1 [R] COG4245 Uncharacterized protein encoded in toxicity protection region of plasmid R478, contains von Willebrand factor (vWF) domain --|------------------|-----------|--------|--|------------|------- 1 [V] COG4268 McrBC 5-methylcytosine restriction system component ------------------------------|---------------------------||-|---- 1 [R] COG4310 Uncharacterized protein conserved in bacteria with an aminopeptidase-like domain ------------------------------|------|--------------------|------- 1 [S] COG4378 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|------------------------|-----|------|------- 1 [S] COG4393 Predicted membrane protein --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 1 [P] COG4604 ABC-type enterochelin transport system, ATPase component --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 1 [P] COG4605 ABC-type enterochelin transport system, permease component --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 1 [P] COG4606 ABC-type enterochelin transport system, permease component --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 1 [P] COG4607 ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component ------------------------------------------|||-|--|-----|--|------- 1 [QP] COG4615 ABC-type siderophore export system, fused ATPase and permease components -------------------|||--------|---------------------------|------- 1 [R] COG4639 Predicted kinase ---------------------------------------------------------|-|--|--- 1 [KL] COG4646 DNA methylase |---------|-------------------------------------|------|--|------- 1 [H] COG4662 ABC-type tungstate transport system, periplasmic component ----------------------------------------------------|-----||------ 1 [R] COG4710 Predicted DNA-binding protein with an HTH domain ------------------------------------------|||||-||--------||------ 1 [P] COG4771 Outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase --|-----------------|---------|---------------------------|------- 1 [S] COG5015 Uncharacterized conserved protein |||---|-|-------||--|---|-------|-------------|-||-|------|------- 1 [C] COG5016 Pyruvate/oxaloacetate carboxyltransferase