(order) Neisseriales - 2 genomes Functional categories Fun All J A K L B D Y V T M N Z W U O C G E F H I P Q R S COGs 1,289 132 1 52 94 1 23 -  16 26 101 20 -  1 47 59 95 47 122 47 81 37 67 14 139 161 proteins 3,208 312 2 148 310 2 50 -  36 63 262 60 -  2 140 153 243 133 314 100 180 95 192 59 381 333 Distribution of COGs by number of proteins proteins 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 12 15 16 17 18 20 24 25 COGs 55 1001 49 121 16 19 6 8 2 2 1 2 1 1 1 2 1 1

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---|----------------------------------------------|--||----------- 25 [L] COG3676 Transposase and inactivated derivatives
--||||---------------------||-------------|-----|----|||---||-|--- 24 [L] COG3039 Transposase and inactivated derivatives, IS5 family
--------------------------|||--|-|---|-|--|||--------|||---||--|-- 20 [L] COG2826 Transposase and inactivated derivatives, IS30 family
----------------|-------------------------|||||-||||||||---------- 20 [NU] COG4969 Tfp pilus assembly protein, major pilin PilA
|||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 18 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 17 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily
|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 16 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases
----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||-- 15 [P] COG1629 Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport
------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|-- 15 [U] COG3210 Large exoproteins involved in heme utilization or adhesion
||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 12 [K] COG0583 Transcriptional regulator
|-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 10 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes
--|--------|-------||-----||||--||---|-------|---|---||----||-||-- 10 [L] COG3547 Transposase and inactivated derivatives
|-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||||  9 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators
----------------|-||-------------------------|--||--||||---||-||--  9 [Q] COG2931 RTX toxins and related Ca2+-binding proteins
||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||--  8 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase
||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  8 [M] COG0438 Glycosyltransferase
|||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-|  8 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases
-------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  8 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific
--|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||--  8 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating)
|-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  8 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily
-------------|||||||||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  8 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase
--|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|-------  8 [L] COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins
-------------|||--||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  7 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains
----||----------||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  7 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein
----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-||||||||||||||||||  7 [M] COG0845 Membrane-fusion protein
----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||--  7 [M] COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase
----------------||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  7 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases
------------------------------------------|||||---||-||----||||---  7 [MU] COG3468 Type V secretory pathway, adhesin AidA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  6 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases
||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  6 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase
-||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||--  6 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes
--||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||--  6 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases
|-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  6 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase
---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||--  6 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein
|||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||--  6 [R] COG0730 Predicted permeases
----------------||||----||----||||-|||----||||||||||||||||||||||||  6 [M] COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains)
||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-|  6 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases
--|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  6 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases)
--|---||------------|||||-|-----|||-||----|||-|-||||-||-|||-||----  6 [E] COG1115 Na+/alanine symporter
||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  6 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes
-----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||--  6 [K] COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins
---|----------------|----------|||||||----|||||-||---||-----||||--  6 [L] COG2827 Predicted endonuclease containing a URI domain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  6 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors
--------------------|----------||-|--------|--|--||||||----|||||--  6 [K] COG2932 Predicted transcriptional regulator
------------------------------------|-----------|---|||-----------  6 [L] COG2946 Putative phage replication protein RstA
|-|----------------------------------------------|---|||--|-------  6 [R] COG3271 Predicted double-glycine peptidase
--||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||--  6 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components
-|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||--  5 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC
|||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  5 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase
-------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  5 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  5 [O] COG0443 Molecular chaperone
||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  5 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis
---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  5 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes
|-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||--  5 [R] COG0546 Predicted phosphatases
--------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  5 [J] COG0566 rRNA methylases
---|---------||||-||-|||--|---------------||||||||||-|||---|||||||  5 [C] COG0633 Ferredoxin
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  5 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase
-------------|||-----|--------------------|||||-||||-|||||||||||--  5 [R] COG0790 FOG: TPR repeat, SEL1 subfamily
--|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||--  5 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases
|--|-------|-||---||-|----|||-----|-|---------------||||---|||||--  5 [I] COG1562 Phytoene/squalene synthetase
--|-||--|----||---||||----|||--|||||-|||--|||||-|||--|||---|||||--  5 [L] COG2801 Transposase and inactivated derivatives
--||------------|--||-----|-----|-||-------|||---|-|-|||||-||-|--|  5 [S] COG3177 Uncharacterized conserved protein
------------------------------------------|||||--|---||-----------  5 [P] COG4773 Outer membrane receptor for ferric coprogen and ferric-rhodotorulic acid
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---|||||||  4 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5)
---------|---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  4 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [R] COG0073 EMAP domain
|||---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [L] COG0084 Mg-dependent DNase
||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  4 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  4 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase
-|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||--  4 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  4 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I
-|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  4 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases
--|----------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein
||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||---  4 [C] COG0247 Fe-S oxidoreductase
---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  4 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [J] COG0254 Ribosomal protein L31
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  4 [J] COG0257 Ribosomal protein L36
--|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-||  4 [C] COG0282 Acetate kinase
-------------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  4 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase
|||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||--  4 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [R] COG0313 Predicted methyltransferases
--|----------||-|-||-|----||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  4 [S] COG0316 Uncharacterized conserved protein
----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-|  4 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases
|-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--||||||||  4 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II
--|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|--  4 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase
|-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-|||||||||||||||  4 [C] COG0372 Citrate synthase
-|--|||||||||||-||---|----|---|--|--||----||||||-|--||||||----|---  4 [E] COG0421 Spermidine synthase
--|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-|||||||||||||||  4 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation
|||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  4 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  4 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases
||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||----  4 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters
||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--||||||||  4 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family
||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  4 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases
|||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||  4 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases
||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  4 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase
|||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  4 [R] COG0517 FOG: CBS domain
|||||||||-|||||||-||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases
|------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||  4 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit
-------------||---||-||||-|---------------||||||||||||||-------|--  4 [O] COG0545 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 1
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-|  4 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase
---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||--  4 [K] COG0557 Exoribonuclease R
|||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||--  4 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)
----||-----|------||-|--||||||||--||||----|||||||||||||||||--|||--  4 [S] COG0586 Uncharacterized membrane-associated protein
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation
--||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-||||||||||||||||||  4 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) 
|-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-||||  4 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase
|||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----||||||||||||||||||||||||  4 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class)
-------------|||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  4 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase
--||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  4 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases
----------------|||||||||||||-|||||||||---||||||||||||||||||||||||  4 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases
|-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  4 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family
|||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--||||||||||||||  4 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel
|-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---|||||||  4 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins
|-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-||||||||||||||||||  4 [L] COG0708 Exonuclease III
-|||--|||-------|---|-|||-|------|||||----------|-||-||-|||-------  4 [R] COG0733 Na+-dependent transporters of the SNF family
--|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||--  4 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins
----------------||||||--||||||||--||||----||||||||||||||||||||||||  4 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  4 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component
|||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  4 [C] COG0778 Nitroreductase
-----------------|---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [K] COG0782 Transcription elongation factor
------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||--  4 [M] COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins)
-----------------|||||||||----------------|||||-||||||||||||||||||  4 [R] COG0795 Predicted permeases
----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  4 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II
--|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||||  4 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain
----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  4 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases
----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||---||--  4 [M] COG0859 ADP-heptose:LPS heptosyltransferase
------------------||-|----|||-|---||||----||||||||||||||||||||||||  4 [P] COG0861 Membrane protein TerC, possibly involved in tellurium resistance
---|---------||-----||----|||-----|-||----||||||||--||||---|||||--  4 [C] COG1018 Flavodoxin reductases (ferredoxin-NADPH reductases) family 1
----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||--  4 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases
|------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||--  4 [M] COG1087 UDP-glucose 4-epimerase
|-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||--  4 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  4 [G] COG1109 Phosphomannomutase
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  4 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component
--||--||--||-|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components
||||----|||||---|||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component
---|--||--|-|-----||||--|-|------|---|----|||||-||||-|||--|||||---  4 [P] COG1178 ABC-type Fe3+ transport system, permease component
|-|||||||--||----|||-|----|||||||---||----|||||--|--||||---||-||--  4 [M] COG1209 dTDP-glucose pyrophosphorylase
------------------|--|------------|||-----|||||-||||||||--|||||---  4 [S] COG1289 Predicted membrane protein
|-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||--  4 [K] COG1309 Transcriptional regulator
-------------------|||----|--||||||||||-|||||||-||||||||--||||||--  4 [P] COG1393 Arsenate reductase and related proteins, glutaredoxin family
-------------||-----|-||------------------|||||-||||||||----|-|---  4 [E] COG1448 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
||||--|||-------|---||----|---|-------||--|||||-||--||||||||||||-|  4 [R] COG1451 Predicted metal-dependent hydrolase
|||||||||||||--------|----|||-|-----||----|||||-||||-|||---|||||--  4 [K] COG1522 Transcriptional regulators
---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---|||||||  4 [J] COG1530 Ribonucleases G and E
----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||||  4 [MU] COG1538 Outer membrane protein
--------------------|-||--||||------------|||||-||||||||||||||||||  4 [M] COG1560 Lauroyl/myristoyl acyltransferase
---|||----|||--------|||--|-------||||----||||||||||-|||||||||||--  4 [I] COG1607 Acyl-CoA hydrolase
---|----||-|---------|---|--------|-||----|||-|-||||-||||||--|----  4 [C] COG1620 L-lactate permease
-------------|||-----|--|||---------------|||||-||||||||---|||||--  4 [L] COG1643 HrpA-like helicases
-------------------|-||||||||||||||||||---|||||-||||||||||||||||||  4 [D] COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins
--------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---|||||||  4 [M] COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase
|--------|--------||-------||||----|||----------|||--|||||||||||||  4 [S] COG1714 Predicted membrane protein/domain
---|--||----|-------|----|----|---|-||-------||-|-||-||-|||-------  4 [C] COG1757 Na+/H+ antiporter
--||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  4 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components
|||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||--  4 [K] COG1846 Transcriptional regulators
----||-----|-||----|||----||||||-|||||----|||||--|||||||---||||---  4 [P] COG1914 Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family
--||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||--  4 [L] COG1943 Transposase and inactivated derivatives
----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||||  4 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator
---|||--|-||||-----|||----|||||---|-||----|||||-||---|||---|||||--  4 [I] COG1960 Acyl-CoA dehydrogenases
--|-----|---------||-|----||||------||----------||---|||||||||||--  4 [C] COG2010 Cytochrome c, mono- and diheme variants
------------------||-------|||------------|||||-||--||||---|||||--  4 [P] COG2193 Bacterioferritin (cytochrome b1)
------------------------------------------|||||-|||||||-||||||--||  4 [R] COG2194 Predicted membrane-associated, metal-dependent hydrolase
----------------|---|-||||-----------|----|||||-||-|||||||||||||||  4 [T] COG2204 Response regulator containing CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains
|-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||--  4 [P] COG2217 Cation transport ATPase
-------|------|--|--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---|||----  4 [F] COG2233 Xanthine/uracil permeases
--|-----------|-----|---------|----||||---|||||-||||-||||||-|-||--  4 [R] COG2249 Putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)
---|-------|-||----|-|----||||----|-||----|||||-||||-|||---|||||--  4 [S] COG2259 Predicted membrane protein
------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|--  4 [U] COG2831 Hemolysin activation/secretion protein
-------------------|-|----|||-----|||-----|||||-||-|-|||------|---  4 [P] COG2837 Predicted iron-dependent peroxidase
-|--------------|---|---------------------||||||-|||-||||||---||--  4 [M] COG2870 ADP-heptose synthase, bifunctional sugar kinase/adenylyltransferase
------------------------------------------||||||||||||||---|||||||  4 [J] COG2913 Small protein A (tmRNA-binding)
------------------------------------------|||||-||||||||----------  4 [S] COG3117 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||||-||-|||----------  4 [M] COG3203 Outer membrane protein (porin)
------------------------------------------------||---|||---|||----  4 [P] COG3213 Uncharacterized protein involved in response to NO
---------------------------------------------|----||-||-||-|-||--|  4 [M] COG3306 Glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis
--------------------------------------------|-----|--||-----------  4 [S] COG4382 Mu-like prophage protein gp16
--------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|----  4 [P] COG4607 ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component
------------------------------------------------||--||||----------  4 [NU] COG4968 Tfp pilus assembly protein PilE
------------------------------------------------||--||||----------  4 [NU] COG5008 Tfp pilus assembly protein, ATPase PilU
||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||--  3 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control
||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||--  3 [G] COG0063 Predicted sugar kinase
||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-|  3 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)
--------|-||-||-|-||-|----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||--  3 [P] COG0155 Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)
||||---||----------|-------||--|||||--|||-|||-|-|||||||||||-||-|-|  3 [V] COG0286 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [L] COG0305 Replicative DNA helicase
|-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  3 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases
-------------|||--||--||----------|-||----||||||||--|||----|-|-|--  3 [P] COG0369 Sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)
--|----------|--|-||------|--|----|-||----|||||--|---|||---|||||--  3 [R] COG0385 Predicted Na+-dependent transporter
|||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||--  3 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function
|||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||--  3 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes
--|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||--  3 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase
|||---||||------|||||------||-------||----|||||-||--||||||-|||||--  3 [G] COG0662 Mannose-6-phosphate isomerase
----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-||||  3 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat
----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  3 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit
----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  3 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases
-----------------|--|-----|---||||||||----|||||-||||-|||||||||||--  3 [J] COG1188 Ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit (S4 paralog)
-----------------|------------|||-|||-----|||-|-||||-||-|||||-|---  3 [M] COG1368 Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily
----------------|-||-|--------------------|||||--|---|||-------|--  3 [M] COG1462 Uncharacterized protein involved in formation of curli polymers
--|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||--  3 [H] COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis
------|------|-----|-------|||||---||--|--|||--------||-----------  3 [G] COG1554 Trehalose and maltose hydrolases (possible phosphorylases)
||||||--|||-|||-|---|------||-|---||||----||||||||--|||----|||||--  3 [H] COG1648 Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain)
--|----------------|||----||||-||||||------||-|--||-||||---|||||-|  3 [I] COG1835 Predicted acyltransferases
|-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||--  3 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes
-------------------|-|---------------|----|||--------|||---|------  3 [T] COG2336 Growth regulator
-------------------|-|-----||-|---||||----|||-------|||----|||---|  3 [T] COG2337 Growth inhibitor
-|-------------------|-------------|--------|-----|-|||-----------  3 [S] COG2369 Uncharacterized protein, homolog of phage Mu protein gp30
-----------|-||---||-------|||||||-|||----|||||-||-|-|||--||||||--  3 [E] COG2755 Lysophospholipase L1 and related esterases
-------------------|-|------------||--------|-----|--||-----------  3 [R] COG2842 Uncharacterized ATPase, putative transposase
--|------------------|-----||---||-||----------------||-----|-||--  3 [M] COG2843 Putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)
--------------------------|||-|-----------||||||||--||||---|||||--  3 [P] COG2895 GTPases - Sulfate adenylate transferase subunit 1
---------------------------||-------------------|----||----|--||--  3 [R] COG2907 Predicted NAD/FAD-binding protein
------------------------------------------|||||-|||--|||----------  3 [S] COG2975 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------------||---|||-------|--  3 [C] COG3245 Cytochrome c5
-----------------------------------||-----|-||----|-|-|-----------  3 [S] COG3299 Uncharacterized homolog of phage Mu protein gp47
--|---------------------------------------||||---|-|-||----|-|||--  3 [S] COG3422 Uncharacterized conserved protein
------------------------------------------------|----|||-------|--  3 [C] COG3658 Cytochrome b
------------------------------------------|-||----|--||-----------  3 [S] COG3778 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|----------||-------|---  3 [S] COG3779 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------------------------------|||------------  3 [S] COG3792 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------------------------||----|--||-----------  3 [R] COG4228 Mu-like prophage DNA circulation protein
---------------------------------------------|---|---|||----------  3 [S] COG4259 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------------------------||----|--||-----------  3 [R] COG4379 Mu-like prophage tail protein gpP
---------------------------------------------|---|---|||----------  3 [S] COG4380 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------------------------||----|--||-----------  3 [S] COG4381 Mu-like prophage protein gp46
--------------------------------------------|-----|--||-----------  3 [S] COG4383 Mu-like prophage protein gp29
--------------------------------------------||----|--||-----------  3 [S] COG4384 Mu-like prophage protein gp45
||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||--  2 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||--  2 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase
|||-||--||-|-||-||||-|----|||-||--|||||---|||||--|--||||---|||||--  2 [P] COG0004 Ammonia permease
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase
|||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||---  2 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase
--|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||--  2 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase
|||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase
-------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  2 [G] COG0021 Transketolase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase
---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||--  2 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase)
|||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  2 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase]
---|--||---|----|-|||------||||----|||----|||||-||--||||---||-||--  2 [H] COG0029 Aspartate oxidase
--||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0031 Cysteine synthase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  2 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase
|--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||--  2 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase
-|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  2 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||--  2 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  2 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  2 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  2 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  2 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  2 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0048 Ribosomal protein S12
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0049 Ribosomal protein S7
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2 [J] COG0051 Ribosomal protein S10
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0052 Ribosomal protein S2
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  2 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit
|||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  2 [G] COG0061 Predicted sugar kinase
||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---|||||||||||||  2 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog)
||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  2 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit
|||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  2 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  2 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit
||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||--  2 [E] COG0077 Prephenate dehydratase
|||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||--  2 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase
|||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  2 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0080 Ribosomal protein L11
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0081 Ribosomal protein L1
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0082 Chorismate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0087 Ribosomal protein L3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0088 Ribosomal protein L4
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0089 Ribosomal protein L23
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0090 Ribosomal protein L2
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0091 Ribosomal protein L22
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0092 Ribosomal protein S3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0093 Ribosomal protein L14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0094 Ribosomal protein L5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0096 Ribosomal protein S8
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0098 Ribosomal protein S5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0099 Ribosomal protein S13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0100 Ribosomal protein S11
|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0102 Ribosomal protein L13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0103 Ribosomal protein S9
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase
|||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  2 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  2 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  2 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||||  2 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase
--||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [C] COG0114 Fumarase
-|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||----------  2 [L] COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase
-------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  2 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  2 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase
|||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||--  2 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases
||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||--  2 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase
||--|-||--||-|----||-------||-------------|||||-||||-|||---||||---  2 [R] COG0121 Predicted glutamine amidotransferase
||||--|||||||||||-||-|------------|-||----------||---|||---|||||--  2 [BQ] COG0123 Deacetylases, including yeast histone deacetylase and acetoin utilization protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [F] COG0125 Thymidylate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  2 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  2 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--||||||||  2 [J] COG0130 Pseudouridine synthase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  2 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase
-|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||--  2 [H] COG0132 Dethiobiotin synthetase
||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase
||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase
||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  2 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase
--||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  2 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful)
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  2 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase
||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  2 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  2 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  2 [G] COG0148 Enolase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  2 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  2 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||||  2 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase
||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---|||||||||||||  2 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases
-|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes
||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||--  2 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
---|---------||---||----------------------|||||-||||-||||||-||-|--  2 [G] COG0158 Fructose-1,6-bisphosphatase
||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain
-|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||--  2 [H] COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  2 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase
||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0164 Ribonuclease HII
||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  2 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase
||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||----  2 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||--  2 [H] COG0171 NAD synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [E] COG0174 Glutamine synthetase
-|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||--  2 [G] COG0176 Transaldolase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit
|||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||--  2 [Q] COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-|||||||||||||||  2 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0185 Ribosomal protein S19
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2 [J] COG0186 Ribosomal protein S17
-|||--|||-|||-----||-|---------------|--||||||||||||||||---|||||--  2 [HJ] COG0189 Glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)
-------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||--  2 [G] COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase
-------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  2 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase
-------------|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [F] COG0194 Guanylate kinase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0195 Transcription elongation factor
-------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  2 [H] COG0196 FAD synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0198 Ribosomal protein L24
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0199 Ribosomal protein S14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0200 Ribosomal protein L15
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY
||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0203 Ribosomal protein L17
||||||||||------||||||--||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  2 [D] COG0206 Cell division GTPase
|||-----||---|||----||----||||||||||||-|||||||||||||||||---|||||--  2 [F] COG0207 Thymidylate synthase
---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-|||  2 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit
|-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  2 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0211 Ribosomal protein L27
|--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-||||||||||||||||||  2 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase
--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0216 Protein chain release factor A
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein
-|||--||||---|--||--|---------||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0218 Predicted GTPase
------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||--  2 [J] COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class)
-------------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase
|-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-|||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit
|-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||--  2 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase
-------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2 [J] COG0227 Ribosomal protein L28
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0228 Ribosomal protein S16
|-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||--  2 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2 [J] COG0230 Ribosomal protein L34
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0233 Ribosome recycling factor
--|----------||-||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  2 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2 [J] COG0238 Ribosomal protein S18
-|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation
|-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  2 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase
-|--||-------|||--|-|------||-|-----------|||||||||||||||||---||--  2 [E] COG0241 Histidinol phosphatase and related phosphatases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0244 Ribosomal protein L10
----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||--  2 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase
--|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-||||||||||||||||||  2 [FP] COG0248 Exopolyphosphatase
--||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---|||||||  2 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family)
|||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0250 Transcription antiterminator
|||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|----  2 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D
||------||------|||||-||--|||||---||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0255 Ribosomal protein L29
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0256 Ribosomal protein L18
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)
-------------||---||-|-----|||------------|||||-|||-||||---|||||--  2 [H] COG0259 Pyridoxamine-phosphate oxidase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0261 Ribosomal protein L21
--|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-|  2 [H] COG0262 Dihydrofolate reductase
--|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||--  2 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts
|-||------||-||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain
------------------||-|----||||-||||||||||||||||-||||||||---|||||-|  2 [L] COG0266 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2 [J] COG0267 Ribosomal protein L33
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0268 Ribosomal protein S20
---|---------||---||----------------------||||||||||||||---|||||||  2 [T] COG0271 Stress-induced morphogen (activity unknown)
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II)
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis
----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase)
---|---------|||--||----------------------||||||||||||||---|||||||  2 [O] COG0278 Glutaredoxin-related protein
-|--||----------|-|-|------||-|-----------||||||||||-||-|||---|---  2 [G] COG0279 Phosphoheptose isomerase
--||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-|||||||||  2 [C] COG0280 Phosphotransacetylase
--|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--||||||||  2 [C] COG0281 Malic enzyme
---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---|||||||  2 [F] COG0283 Cytidylate kinase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase
||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase
|--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||--  2 [P] COG0288 Carbonic anhydrase
|||-----||------||||--||--|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3)
-------------|--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0291 Ribosomal protein L35
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0292 Ribosomal protein L20
||||||--||---|||--------||----------------||||||||||||||---|||||||  2 [J] COG0293 23S rRNA methylase
|||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  2 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes
--||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  2 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN
||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|---  2 [P] COG0306 Phosphate/sulphate permeases
---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  2 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain
--|-||----||-|||--||-|----||||-|||--------|||||-||||||||---|||||--  2 [E] COG0308 Aminopeptidase N
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase
---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  2 [H] COG0320 Lipoate synthase
----------|--||---||-|----||||------------||||||||||||||---|||||||  2 [H] COG0321 Lipoate-protein ligase B
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex
--||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---|||||||  2 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase)
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase
--|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold
||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||-------  2 [S] COG0327 Uncharacterized conserved protein
---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0328 Ribonuclease HI
|||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase
----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0333 Ribosomal protein L32
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0335 Ribosomal protein L19
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase
----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase
-------------||---||-|----|---------------|||||-||||||||---|||||--  2 [E] COG0339 Zn-dependent oligopeptidases
||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD
|||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase
----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||--  2 [S] COG0344 Predicted membrane protein
|-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase
|||-----||------||||-|----|||-||---||-----|||||-||||||||---|||||--  2 [E] COG0347 Nitrogen regulatory protein PII
-||-||--||-|------||----------|-----------|||-|-||||-|||||||||||--  2 [C] COG0348 Polyferredoxin
||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-|  2 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase
|||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase
--|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase
----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
-------------||-|-||-|----||||------------||||||||||||||---|||||||  2 [R] COG0354 Predicted aminomethyltransferase related to GcvT
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit)
--|----------|--|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a
----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type)
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0359 Ribosomal protein L9
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2 [J] COG0360 Ribosomal protein S6
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1)
-------------|||-|||--||||||||-|-||||-----|||||||-||-||----||||---  2 [G] COG0362 6-phosphogluconate dehydrogenase
-------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||--  2 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase
-------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||--  2 [G] COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase
||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||-------  2 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases
||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||--  2 [H] COG0379 Quinolinate synthase
||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----||  2 [M] COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase
|||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-|||||||||||||||  2 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases
-------------|||--|-|-----|---|||||||||---|||||--|--||||-------|--  2 [O] COG0386 Glutathione peroxidase
|-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||--  2 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase
--||-------|-||---|||-----|||-|||||||||||||||||-||-|-|||---|||||--  2 [L] COG0389 Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair
|-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||--  2 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase
||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||--  2 [M] COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--||||---|||||--  2 [E] COG0404 Glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)
----||----||||||--||||----|||-----|-||----|||-|-||--||||||-||-||--  2 [E] COG0405 Gamma-glutamyltransferase
--|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  2 [H] COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase
---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||--  2 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase
-------------||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||--  2 [H] COG0414 Panthothenate synthetase
----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||--  2 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme
-------------||---|-----------------------||||||||---||||||||-----  2 [F] COG0418 Dihydroorotase
||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||--  2 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC
||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||--  2 [O] COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation
||||--||--||||||||-|-|---||||------|------|||-|--|---|||--|-|-----  2 [P] COG0428 Predicted divalent heavy-metal cations transporter
-------------|-|--||----------------------|||||-||---|||----------  2 [R] COG0429 Predicted hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold
---|---------||---||-|----|||--|||||||--|||||||-||-|-|||---||-||--  2 [R] COG0431 Predicted flavoprotein
|||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [I] COG0439 Biotin carboxylase
|||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||--  2 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division
||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains
|||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase
||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||--  2 [R] COG0456 Acetyltransferases
|||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-|||||||||||||||  2 [R] COG0457 FOG: TPR repeat
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  2 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family)
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase
|||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|  2 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases
--|----------||-||--||||||----|-----||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase
-|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||--  2 [G] COG0469 Pyruvate kinase
|||||||||||||||||||||||||-||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication
||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-||  2 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase
|||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||||  2 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase
|||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-||||||||||||||  2 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components
|-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA
-------------||-||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0486 Predicted GTPase
||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning
||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0492 Thioredoxin reductase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase
||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||--  2 [R] COG0496 Predicted acid phosphatase
----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0498 Threonine synthase
||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||---  2 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  2 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase)
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  2 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit
---|---------||---||-|----|||-----|-||----|||||--|-|-|||||||||||--  2 [E] COG0506 Proline dehydrogenase
-|-----------||----|-|||-|-||-||||||||-|--|||||||||||||---|||||---  2 [L] COG0507 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member
---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||--  2 [E] COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding)
|||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II
--|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||--  2 [L] COG0514 Superfamily II DNA helicase
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins
--|----------||-|-||||----|||-----|-||----|||||-||--||||||-|||||--  2 [R] COG0523 Putative GTPases (G3E family)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0527 Aspartokinases
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [F] COG0528 Uridylate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity
||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||--  2 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0536 Predicted GTPase
-------------||-||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0539 Ribosomal protein S1
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||--  2 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase
|||-||||||-|-||-||--|---|-|||-||-|-|||----|||||-||---|||---|----||  2 [HC] COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0550 Topoisomerase IA
|||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||-------  2 [L] COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase
||||||||||||------||-|-----||-|------|----|||||-||||||||---|||||--  2 [O] COG0555 ABC-type sulfate transport system, permease component
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex
|-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase
|-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|---  2 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily
--||--|||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases
||||||--||-||-----||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-|  2 [J] COG0565 rRNA methylase
-------------||------|||--||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  2 [C] COG0567 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, and related enzymes
||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||----  2 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease
|||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--||||||||||||||  2 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)
||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||--  2 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||--  2 [R] COG0579 Predicted dehydrogenase
|||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0582 Integrase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit
--|----------||-----|-||||||||||||||------||||||--||||||----||||--  2 [G] COG0588 Phosphoglycerate mutase 1
|||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---|||||||  2 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins
--|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---|||||||  2 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases
|-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-||  2 [ER] COG0591 Na+/proline symporter
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog)
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2 [J] COG0594 RNase P protein component
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase
|||-||--||-|-||--||--|----|||--|---|||-------|---||-||||---|||||--  2 [S] COG0599 Uncharacterized homolog of gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit
||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes
|||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase
|-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [P] COG0605 Superoxide dismutase
|--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-|  2 [O] COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity
||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease
||||---||----------|-----------||-||--|||-------||||||--|||-||-|-|  2 [V] COG0610 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases
|||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|--  2 [H] COG0611 Thiamine monophosphate kinase
||||----|--||---||||-|--------|------|----|||||-||||-|||----------  2 [R] COG0613 Predicted metal-dependent phosphoesterases (PHP family)
|||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||--  2 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent)
|||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase
----------------|-||-|||---|||-|--||||----|||-||-|||-|||||||||||||  2 [I] COG0623 Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH)
-|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases
-------------||---||------------||--------|||||-||||||||---|||||||  2 [O] COG0625 Glutathione S-transferase
-------------|----||------||||-|||||------|||||--|||-|||---|||||--  2 [R] COG0627 Predicted esterase
||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0628 Predicted permease
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit
----------------||--||----||||||-|||||||||||||||||||||||---|||||--  2 [F] COG0634 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase
||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K
-|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||--  2 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases
|||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||--  2 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators
|||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||--  2 [C] COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins)
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)
-------------||---||-|----|||-----|-||----|||||-||-|||||---|||||||  2 [HC] COG0654 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases
----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-|  2 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein
|-||||-----|-||---||-------||||------|----|||||-||-|||||---|||||||  2 [R] COG0661 Predicted unusual protein kinase
|||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--||||||||  2 [R] COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily
-------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||--  2 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases
----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||--  2 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase
-------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-|||||||||||||  2 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH
--------|---|||--||||---|---------|||-----||||---|-|-||---|--|--||  2 [P] COG0672 High-affinity Fe2+/Pb2+ permease
-------------||---||-------------------------|--|-||-|||---|||||--  2 [O] COG0678 Peroxiredoxin
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG0681 Signal peptidase I
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase
--|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||--  2 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase
||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-||  2 [I] COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase
|---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---|||||||  2 [J] COG0689 RNase PH
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0691 tmRNA-binding protein
-------------|||----||||-|||||-||||||||||||||||||||||||||||||-----  2 [L] COG0692 Uracil DNA glycosylase
--|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0703 Shikimate kinase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC
--|------|-|----||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase
||||||-|||||-||-|-----||-------||||||-----|||-|------||-----------  2 [E] COG0710 3-dehydroquinate dehydratase
--|-------------|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b
-------------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein)
--||||------|---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0713 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)
|||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-|||||||||||||||||  2 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase
-----------------|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase
||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---|||||||||||||  2 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit
-------------||----|-|----|----|-|--------||||||||||||||------||--  2 [E] COG0722 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase
--||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--||||||||||||||  2 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein
----------------|||||||||||||||-----------||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
----------------|---|---------------------|||||-||||||||---|||||--  2 [M] COG0729 Outer membrane protein
-------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||  2 [I] COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)
-------------|----------------------|-----|||-|---|-|||-|||--|-|--  2 [G] COG0738 Fucose permease
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases
-----------------|||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase
----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|--  2 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase
-----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [M] COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)
----------------||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain
-------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit
-------------||------|----|-------||||----|||||-||||-||||||||||---  2 [P] COG0753 Catalase
--|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [O] COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component
-------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-|||||||  2 [F] COG0756 dUTPase
----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-|  2 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake
----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||-  2 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein
----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||--  2 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0763 Lipid A disaccharide synthetase
----------------||||||||------||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  2 [Q] COG0767 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase
|||------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase
--|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||--  2 [F] COG0775 Nucleoside phosphorylase
----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit
----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------|-|---||||-------------||-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0781 Transcription termination factor
------------------|-|-----|-------|-------|||||-|||--||-||--------  2 [E] COG0786 Na+/glutamate symporter
--------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0787 Alanine racemase
--|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators
----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||--  2 [L] COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase
----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0793 Periplasmic protease
|||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation
----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||--  2 [M] COG0796 Glutamate racemase
----------------|-||----||----|-----------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0797 Lipoproteins
----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [S] COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein
-----------------|||----|-----||||--||----|||||-||||||||||-|||||--  2 [G] COG0800 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  2 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase
----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase
|-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-||  2 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin
--||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC
----------------||||||--||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing
----------------||||||---|----||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase)
----------------|--||---------------------|||||-||||||||||||||||--  2 [M] COG0810 Periplasmic protein TonB, links inner and outer membranes
|-|------|------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG0811 Biopolymer transport proteins
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase
-------------|||------||--|---------------|||||-||||-||-|||-------  2 [E] COG0814 Amino acid permeases
----------------||||-|||||||||------------|||||-||||-|||||||||||||  2 [M] COG0815 Apolipoprotein N-acyltransferase
----------------||||||||--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis)
-----------------||||||||-||||------------|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit
-----------------|||-|--------||||||||----|||||-|||||||||||||||---  2 [M] COG0818 Diacylglycerol kinase
----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||--  2 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme
----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||--  2 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis
--||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||  2 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation
|-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [R] COG0824 Predicted thioesterase
|||------|-|----|--|||--------||||||||----|||||-||||-|||||||||----  2 [O] COG0826 Collagenase and related proteases
----------------|-||--||||----|||||||||-||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0828 Ribosomal protein S21
------------------||----------------------|||||--|--||||||-|||||--  2 [G] COG0837 Glucokinase
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0838 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 3 (chain A)
--||||--|--||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0839 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J)
--|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  2 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump
----------------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG0848 Biopolymer transport protein
---------|------||--||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [D] COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division
----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||---  2 [D] COG0850 Septum formation inhibitor
------------------||||--------------------||||||||--||||||-||||---  2 [D] COG0851 Septum formation topological specificity factor
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit
----------------||||-|----|||||---||||----|||||--|--||||||||--||--  2 [H] COG0853 Aspartate 1-decarboxylase
----------------|-||----------------------|||||-||--||||||||||||--  2 [H] COG0854 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein
--|---------------||-|-----||||------|----|||||-||--||||||||||||--  2 [P] COG0855 Polyphosphate kinase
---|----|---------||-|-----||-------------||||||||||-||-|||-------  2 [R] COG0857 BioD-like N-terminal domain of phosphotransacetylase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG1005 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG1007 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N)
--||||----------|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG1008 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)
--||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--||||||||||||||  2 [CP] COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit
||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||--  2 [R] COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily)
----||-----------|-|------|---|-----||----|||||-||||-||-||||-|----  2 [E] COG1027 Aspartate ammonia-lyase
----------------||||-|-----||-|-----------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG1034 NADH dehydrogenase/NADH:ubiquinone oxidoreductase 75 kD subunit (chain G)
-|||||||||||-------|----------------------|||||-||---||-----|-|---  2 [C] COG1042 Acyl-CoA synthetase (NDP forming)
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase
--||----------|--|||------||||||||||||----||||||||||-|||||||||||--  2 [E] COG1045 Serine acetyltransferase
|||||||||||||-------||--|-----------------|||||-|||||||||||-------  2 [O] COG1047 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2
--||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---|||||||  2 [C] COG1048 Aconitase A
------------------||----------------------|||||-||-|||||||||------  2 [C] COG1049 Aconitase B
||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit
----|||||-|||----||||-||---|||----||||----||||--||---|||--||--|---  2 [P] COG1055 Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases
-------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||--  2 [H] COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase
---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||--  2 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA
-----------|-||---||------||||-------|----|||||--||--|||---|||||--  2 [C] COG1062 Zn-dependent alcohol dehydrogenases, class III
--|-||----|||||---||------||||-||||-||----|||-|--|--|||||||||||---  2 [R] COG1064 Zn-dependent alcohol dehydrogenases
----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease
--------------------|-||||-||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains)
-------------|||--|-----------------------||||||||||-|||--||||||||  2 [O] COG1076 DnaJ-domain-containing proteins 1
--------------------||||-||---||||||||-|||||||||||||||||------||--  2 [G] COG1080 Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria)
-|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-||||||  2 [MG] COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases
|-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-||||  2 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase
-|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||---  2 [R] COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases
--|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-|||||||||||||  2 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes
|-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  2 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components
------------------||-------||--------|----|||||-||--||||||||||||--  2 [P] COG1118 ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component
|-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  2 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  2 [Q] COG1127 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component
|-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||--  2 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component
--|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-||||||  2 [GM] COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component
------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [P] COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component
----------------||||||||||----------------|||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component
|--|||--|-|||-------||---------|----||----|||------|-||||||-------  2 [C] COG1139 Uncharacterized conserved protein containing a ferredoxin-like domain
|||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)
|||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|---  2 [C] COG1145 Ferredoxin
----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||--  2 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase
----------------||--|||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG1158 Transcription termination factor
----------------||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG1159 GTPase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG1160 Predicted GTPases
-||---||-|||||||-||||----|----||||||||||||------|----||-----------  2 [R] COG1161 Predicted GTPases
--|-------------|||||----||||||||||||||||||||||-||||||||------|---  2 [R] COG1162 Predicted GTPases
------------------||-|--------------------|||||-||-||||-|||-------  2 [E] COG1166 Arginine decarboxylase (spermidine biosynthesis)
---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--||||||||  2 [E] COG1171 Threonine dehydratase
---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||--  2 [E] COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I
---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||--  2 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II
-------------||-----|---------|---|-||----|||||-|||||||||||-------  2 [H] COG1179 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 1
--|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes
||||----||---||-----|-||-|-||||-----||-----------|--|||||||||||-||  2 [I] COG1183 Phosphatidylserine synthase
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)
-------------||-|||||||||||||||||-||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG1186 Protein chain release factor B
--|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||-----  2 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II)
||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--||||||||||||||  2 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning
|--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase
-||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||--  2 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases
-----------------|||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase
||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|--  2 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases
----------------||||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [LK] COG1200 RecG-like helicase
----------------||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains)
|||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||--  2 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon)
|||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||--  2 [M] COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase
------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||--  2 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1212 CMP-2-keto-3-deoxyoctulosonic acid synthetase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone
------------------||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [T] COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response
-------------|--||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit
--||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-|  2 [O] COG1225 Peroxiredoxin
||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-||||||||||||||  2 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component
--|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||--  2 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component
-||------|------|-------------------------|||||-||||||||--||||||||  2 [S] COG1238 Predicted membrane protein
--||------------|----|-----|||------||----||||||||-|-|||----------  2 [E] COG1246 N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferases
--||---------||-|||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains
--|-----------|---||--||---||-------||----------||-|||||---|||||--  2 [S] COG1262 Uncharacterized conserved protein
|||---||-||-|---|---|-----------|--|||----|||||-||||-||||||-----||  2 [I] COG1267 Phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins
-------------|||----||--|||||-||||||||----|||||-||--|||----|||||--  2 [R] COG1272 Predicted membrane protein, hemolysin III homolog
---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---|||||||  2 [K] COG1278 Cold shock proteins
----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||--  2 [O] COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family
------------------||-------|||------------|||||-||||-|||---|||||||  2 [C] COG1282 NAD/NADP transhydrogenase beta subunit
------------------------||-----|||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG1286 Uncharacterized membrane protein, required for colicin V production
---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--||||||||||||||  2 [C] COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex
---|--------------------|-|||-----||||----|||||-||||-||-----|-----  2 [M] COG1292 Choline-glycine betaine transporter
--|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  2 [S] COG1295 Predicted membrane protein
--|-----|-----------||----|----|-|||||----|||||-||||-|||||-||||---  2 [E] COG1296 Predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)
---|--|------|-------------||--------------------||-||||--|----|--  2 [S] COG1297 Predicted membrane protein
|||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----|||||||  2 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases
----------------|-|||||||||||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG
----------------------||-------|||-----|--|||||-||||||||---|||||||  2 [S] COG1322 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||--  2 [K] COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains
----------------------||-|-||-------------|||||||||||||-----------  2 [L] COG1330 Exonuclease V gamma subunit
----------------|-||------||||------||---------------|||----------  2 [O] COG1333 ResB protein required for cytochrome c biosynthesis
--|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||--  2 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase
--|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|----  2 [M] COG1346 Putative effector of murein hydrolase
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  2 [C] COG1347 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrD
----------------||--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---||||---  2 [KG] COG1349 Transcriptional regulators of sugar metabolism
-||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||--  2 [S] COG1354 Uncharacterized conserved protein
--||--------------|-||----|||-||-|-||-----|||||-||-|-|||---||-||--  2 [S] COG1359 Uncharacterized conserved protein
|||-----||---||-||||-|----||||||--||||-----------|---|||---|||||--  2 [E] COG1364 N-acetylglutamate synthase (N-acetylornithine aminotransferase)
-----------------|||------|||||-----||----|||-|-||---|||---||||---  2 [S] COG1376 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|----  2 [R] COG1380 Putative effector of murein hydrolase LrgA
------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---|||||||  2 [L] COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
----------------||||||--||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  2 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-|||||--------|||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||--  2 [K] COG1386 Predicted transcriptional regulator containing the HTH domain
----------------|---------||||------------|||||-||||-|||---|||||--  2 [OT] COG1391 Glutamine synthetase adenylyltransferase
----------------||||-|----||||||||||||----|||||-||||||||----------  2 [R] COG1399 Predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein
--||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|---  2 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases
----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---|||||||  2 [S] COG1434 Uncharacterized conserved protein
----------------|-------||----------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1452 Organic solvent tolerance protein OstA
----||||---|-|---------------------|||----|||-|--|-|-||-----------  2 [F] COG1457 Purine-cytosine permease and related proteins
----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||--  2 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  2 [Q] COG1463 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, periplasmic component
--------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [P] COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit
||||||||||--|----|----------------|-||-----------|--||||----------  2 [S] COG1469 Uncharacterized conserved protein
-----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---|||||||  2 [G] COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases
||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--||||||||||||||  2 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators
-------------||------|-----||-------------|||||-||--||||---|||||||  2 [R] COG1485 Predicted ATPase
--|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||---  2 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase
-------------||-||--||----|||-||||||||----|||||-||||-|||----------  2 [J] COG1490 D-Tyr-tRNAtyr deacylase
---------|----------|---|-----||||||||||||----------||||---|||||--  2 [T] COG1493 Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism
---------------------|||------------||----|||||-||||||||||||||||||  2 [O] COG1495 Disulfide bond formation protein DsbB
----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--||||||||  2 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein
----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-|||||||  2 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes
------||-----------|-|----|||------------------------||-------||||  2 [E] COG1505 Serine proteases of the peptidase family S9A
----------------|-----||||----|----|||----|||||-||--||||||||||||--  2 [K] COG1508 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma54 homolog
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1519 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase
----------------||||||--||-||||----|||-|---------|--|||||||----|--  2 [K] COG1521 Putative transcriptional regulator, homolog of Bvg accessory factor
||-|--||-|---||-|--|------|-------|-|--|||-------|||-||---|||||---  2 [L] COG1525 Micrococcal nuclease (thermonuclease) homologs
||||--||||-||-------|---------||||||||----|||||-||||||||----------  2 [J] COG1534 Predicted RNA-binding protein containing KH domain, possibly ribosomal protein
-------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase
------||------------||----|--|----|-||----|||||-|||--|||--||------  2 [R] COG1540 Uncharacterized proteins, homologs of lactam utilization protein B
---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||--  2 [R] COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced)
---|----|-----------||---------|----||----|||------|-||||||-------  2 [S] COG1556 Uncharacterized conserved protein
----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein
----------------||--|----|----|----|||----|||||-||||||||---|||||--  2 [S] COG1561 Uncharacterized stress-induced protein
----------------|-||--------------------------------||||||||||||||  2 [S] COG1565 Uncharacterized conserved protein
----------------|-----------------|-|-----|||||-|||--|||---|||||||  2 [V] COG1566 Multidrug resistance efflux pump
-----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit
--|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--|||||||||||||  2 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase
-----------------|--||--------||||||||||--|||||-||||||||||||||||--  2 [S] COG1576 Uncharacterized conserved protein
||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||---  2 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase
------------------||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||---|||||||  2 [M] COG1589 Cell division septal protein
-----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||--  2 [K] COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog
----------------||||----------------------|||-|-||-|||||--||||||--  2 [M] COG1596 Periplasmic protein involved in polysaccharide export
||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG1605 Chorismate mutase
-------------|---|--------|||-|----|||----------||--||||--|||||---  2 [S] COG1610 Uncharacterized conserved protein
--|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||--  2 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein
------------------||-------|||-------|----|||||--|--||||---|||||--  2 [P] COG1613 ABC-type sulfate transport system, periplasmic component
----||------------||||--|-----||-|-|||-|--|||-|-||---|||--------||  2 [V] COG1619 Uncharacterized proteins, homologs of microcin C7 resistance protein MccF
----------------||--|---------|||-|---------------|||||-|||-----||  2 [S] COG1636 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-||||||||||||||||||  2 [O] COG1651 Protein-disulfide isomerase
-------------------|-|--||---------||-----|||-|-||-|||||---|||||--  2 [S] COG1652 Uncharacterized protein containing LysM domain
--------------------||----||||||||||||----|||||-||||||||----------  2 [R] COG1660 Predicted P-loop-containing kinase
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1663 Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase
-|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-|||||||||||||  2 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins
---------------------|||--||||------------|||||-||||||||---|||||||  2 [K] COG1678 Putative transcriptional regulator
--|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-||||||  2 [GM] COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component
-------------||----||---|-----|||||||------------|---||-|-|-|-----  2 [M] COG1696 Predicted membrane protein involved in D-alanine export
---------||-|---||||-|----||||-|||||||----|||||-||-|||||---|||||--  2 [T] COG1702 Phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase
||||--|||||||----|------------------------|||||-||||-||-------||--  2 [S] COG1720 Uncharacterized conserved protein
-----------------|-|||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG1722 Exonuclease VII small subunit
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  2 [C] COG1726 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrA
----------------|-------------------------|||||-||--||||---|||||||  2 [S] COG1729 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|-----||||----|-----||----||||||||||||||--||||||||  2 [T] COG1734 DnaK suppressor protein
-----------------|--------|---||||||||-|--|||||-||||-|||---|||||--  2 [K] COG1737 Transcriptional regulators
--||----|-|-|----|--||||-||-------|-|-----|||||-||||-||----||||---  2 [S] COG1738 Uncharacterized conserved protein
--||---------||--|--||---||---||||||||||--|||-|-||||-|||||||||----  2 [S] COG1739 Uncharacterized conserved protein
-------------||||||-|---|--|||-|----||----|||-|-||--||||---|||||||  2 [R] COG1752 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily
---------------------|-----||---|||-||------------||-||-----------  2 [S] COG1755 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega
--------------------||----||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||--  2 [E] COG1760 L-serine deaminase
--------------------|-|||||---||||||||-||||||||-||||-|||---|||||--  2 [GT] COG1762 Phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain (Ntr-type)
-||-||||-|-||---||---|----|||-|----|-|--|||||||-||---|||---||-||--  2 [O] COG1765 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation
||-----||--------||||---|--||-|-----------|||-|--|--||||-------|--  2 [C] COG1773 Rubredoxin
--|-------------|---|---------------------|||||-|||||||||||-------  2 [R] COG1778 Low specificity phosphatase (HAD superfamily)
|||||||||||||----|------------|-----------|||||||----||-----------  2 [F] COG1781 Aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit
|||||||||||||||||----------||-------||----------|||--||---|||-||--  2 [L] COG1793 ATP-dependent DNA ligase
----|------|-----|--||----|||-|||-||||----|||||-||---|||---|||||--  2 [K] COG1802 Transcriptional regulators
------------------||--||---------------------|--||||-||-------|---  2 [C] COG1805 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrB
---------------------|------------||||----|||||-||--||||---|||||||  2 [S] COG1806 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------|||-------|-|||---------|-----|-----|||||--|--||||---|||||--  2 [M] COG1807 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family
----------------||||-|||||||||----||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc)
|||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||---  2 [C] COG1838 Tartrate dehydratase beta subunit/Fumarate hydratase class I, C-terminal domain
--||------|-|-----|||-----|-----|||--|-----||||-||||||||--|||||---  2 [P] COG1840 ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component
||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----||||||  2 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E
|-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---|||||||  2 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family
---------------------|---|----||||||||----|||||-|-||-||-|||-------  2 [T] COG1854 LuxS protein involved in autoinducer AI2 synthesis
----------------||--|-||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG1862 Preprotein translocase subunit YajC
|-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--|  2 [R] COG1881 Phospholipid-binding protein
|-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---|||||||  2 [C] COG1894 NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit
|-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---|||||||  2 [C] COG1905 NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit
-|--------------||------------|---||||----|||||-||||||||----||||--  2 [R] COG1923 Uncharacterized host factor I protein
--------------------|||||||---||||||||||||||||||||||||||---|||||--  2 [G] COG1925 Phosphotransferase system, HPr-related proteins
------------------|-------|||-||||||||----|||||-||||-||-----------  2 [G] COG1929 Glycerate kinase
--|----------||----|------||||-|---|||----||||||||||||||--||||||--  2 [HE] COG1932 Phosphoserine aminotransferase
----------------|-||----------------------|||||-||||||||||||||||--  2 [S] COG1934 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|-------|----------|------|----|||||||----||||------|||||||||-||--  2 [R] COG1942 Uncharacterized protein, 4-oxalocrotonate tautomerase homolog
----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||--  2 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase
-------------||-----------||||------------||||||||||||||----------  2 [A] COG1949 Oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)
|||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||---  2 [C] COG1951 Tartrate dehydratase alpha subunit/Fumarate hydratase class I, N-terminal domain
-|----------------------------------------||||||||||||||---|||||||  2 [U] COG1952 Preprotein translocase subunit SecB
---|||-------|---|------------||||||||----|||||-||-||||-------||--  2 [T] COG1956 GAF domain-containing protein
-------------|||--------------------------||||||||||-|||--------||  2 [P] COG1965 Protein implicated in iron transport, frataxin homolog
--|----|--|-|---|---|-----|||-||----||----|||||-||||-||||||-------  2 [T] COG1966 Carbon starvation protein, predicted membrane protein
|--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||--  2 [V] COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein
|-|-----------------|-----|---|-----||----|||||--|--|||---|-------  2 [S] COG1971 Predicted membrane protein
------------------||-----------------------------|--||||||||||||||  2 [S] COG1981 Predicted membrane protein
------||-----|------||----||||----|-||----|||||-|||--|||--||---|--  2 [E] COG1984 Allophanate hydrolase subunit 2
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  2 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis
||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||--  2 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases
||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||--  2 [R] COG1994 Zn-dependent proteases
----------------|-|||----------------|----|||||-||-|||||||||||||--  2 [H] COG1995 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein
---|------|-|||-|----|--------------||----------||--||||--||||||||  2 [R] COG1999 Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC, involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems
---------------------|--|-|||||---|||||||||||||--|||||||----|--|||  2 [S] COG2001 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--|  2 [L] COG2003 DNA repair proteins
---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--||||||||||||||  2 [C] COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit
--------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [P] COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component
----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||--  2 [G] COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes
||------||------|----|-----||------------------------||-----------  2 [R] COG2018 Uncharacterized distant relative of homeotic protein bithoraxoid
|-||---------||------|----||||----||-------------|||||||------||--  2 [E] COG2021 Homoserine acetyltransferase
----------------|-||||----|||||-----||----|||||-||--||||--||||||--  2 [H] COG2022 Uncharacterized enzyme of thiazole biosynthesis
---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||--  2 [C] COG2025 Electron transfer flavoprotein, alpha subunit
--|---------------||-|----||||------|-----|||||-||||||||----------  2 [M] COG2027 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein 4)
--|----------||-|----|-----||||-----|-----|||||-|--|-|||----||-|--  2 [P] COG2032 Cu/Zn superoxide dismutase
------||-----|------||----||||----|-||----|||-|-|||--|||--||---|--  2 [E] COG2049 Allophanate hydrolase subunit 1
--------------------|-------------|-||----------||||-||-|||-------  2 [R] COG2056 Predicted permease
----------------|---|---------------------|||||-|||||||-||-|||||--  2 [I] COG2067 Long-chain fatty acid transport protein
--------|----|--||-|||----|||-||||||||-----------|--||||||||||-|--  2 [R] COG2070 Dioxygenases related to 2-nitropropane dioxygenase
--||---------------|-|-----|||||---|||----|||||-||---||---||||||--  2 [P] COG2076 Membrane transporters of cations and cationic drugs
|-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||--  2 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases
---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||--  2 [C] COG2086 Electron transfer flavoprotein, beta subunit
-||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||--  2 [U] COG2095 Multiple antibiotic transporter
|-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||--  2 [H] COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis
------------------||-|----|||||-----------|||||-||--||||||||||||--  2 [S] COG2127 Uncharacterized conserved protein
--|-----|----------|-|----|||||--||-||----|||||--|---|||---|||||--  2 [S] COG2128 Uncharacterized conserved protein
---|------|--||-|--|------|||-------||----|||||--|||||||--||||||--  2 [Q] COG2132 Putative multicopper oxidases
-----------------|--||--|-||||||||||||----|||||-||||-|||---|------  2 [R] COG2137 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----||--|---|--------|-----|||------------|||||-||--||||---|||||||  2 [C] COG2142 Succinate dehydrogenase, hydrophobic anchor subunit
---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||--  2 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis
---------|-------|--------||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG2171 Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase
-------------------|||----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||--  2 [D] COG2177 Cell division protein
-------------|||---||---|-|---|||||||||---|||||-||||||||---||||---  2 [K] COG2183 Transcriptional accessory protein
---------------------------||----|--------|||-|--||-|||-||-||-|---  2 [D] COG2184 Protein involved in cell division
---------------------|----|||||----|||----|||||-||||-|||---|||||--  2 [K] COG2186 Transcriptional regulators
-----|--|-----------|-----|------|-|--||------|---|||-|-||-|--|---  2 [L] COG2189 Adenine specific DNA methylase Mod
------------------||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||--  2 [TK] COG2197 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  2 [C] COG2209 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrE
---|---------|||-|||-|--||----|---------|||||-|-||--|||-||||||||--  2 [O] COG2214 DnaJ-class molecular chaperone
--|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  2 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis
-------------||---||-|--------------------|||||-||-|||||---|||||||  2 [H] COG2227 2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4-benzoquinol methylase
||-------|---||-|----|-----||------------------------||-----------  2 [R] COG2229 Predicted GTPase
--|||||||-|||||----|----|||--------------------------||||||-------  2 [R] COG2236 Predicted phosphoribosyltransferases
|----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----|||||||  2 [P] COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)
||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||--  2 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid
-|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|--  2 [R] COG2252 Permeases
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit
-------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||--  2 [L] COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase
-|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||--  2 [R] COG2262 GTPases
----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase
------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||--  2 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase
------------------||----------||-|--||||||-||||-||--||||----|-||--  2 [V] COG2274 ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain
---|---------------|-|--------||||||||----|||||-||||||||----------  2 [R] COG2333 Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)
--|---------------|-||--------------||----|||||-||---|||---|||||--  2 [R] COG2334 Putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)
------------------||||----|---|-----|-----|||||-||||-|||---|||||--  2 [S] COG2350 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------||-|----|--|--||--------|||||-||||-|||-------|--  2 [C] COG2352 Phosphoenolpyruvate carboxylase
----||---------------|----|||-----||------|||||-||--|||||||||-||--  2 [S] COG2353 Uncharacterized conserved protein
------------------||-|--------------------|||||-||--||||--||||||--  2 [O] COG2360 Leu/Phe-tRNA-protein transferase
---------|--------||-|--------------------|||||-||||||||---|||||--  2 [O] COG2377 Predicted molecular chaperone distantly related to HSP70-fold metalloproteases
------||--|||-------|---------------------|||||-|-||-||-----------  2 [S] COG2431 Predicted membrane protein
-------------------|||----|---||||||||||--|||||-|----|||----------  2 [S] COG2501 Uncharacterized conserved protein
||----||-|---------|-------------------------|---|---||----|-|----  2 [S] COG2510 Predicted membrane protein
----||----|||------|------|||------|||----|||-|-||--||||----|-||--  2 [G] COG2513 PEP phosphonomutase and related enzymes
||||--|||||||-|--|------------------------|||||-||--||||||||||||--  2 [O] COG2518 Protein-L-isoaspartate carboxylmethyltransferase
----------|-|------||-----||-|-||||||-----|||||-||||-|||---|||||--  2 [S] COG2606 Uncharacterized conserved protein
----------------|-||----------|------------------|---|||--||||||--  2 [R] COG2607 Predicted ATPase (AAA+ superfamily)
--||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||----  2 [P] COG2608 Copper chaperone
---------------------|----||||------------||||||||||||||------||--  2 [C] COG2609 Pyruvate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component
--|-----------------|-----|---|-|-|-||----|||||-||||-|||----------  2 [GE] COG2610 H+/gluconate symporter and related permeases
------------------------------|----|||----|||||---||-||-----------  2 [S] COG2707 Predicted membrane protein
----||-------||--|--|---------||||||--|---------|----||-----|-|---  2 [F] COG2759 Formyltetrahydrofolate synthetase
----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||--  2 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB
----------------||||||--------|-----------|||||-||--||||----------  2 [NU] COG2805 Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits
--------------------------||||-|||||-|----|||||-||||-|||---|||||--  2 [L] COG2818 3-methyladenine DNA glycosylase
------------------||----------------------||||||||||-|||---|||||--  2 [M] COG2821 Membrane-bound lytic murein transglycosylase
----------------------------------|||-----||||-------||-----------  2 [P] COG2822 Predicted periplasmic lipoprotein involved in iron transport
---------------------|--------|-----------|||||-||||-|||----|---||  2 [R] COG2823 Predicted periplasmic or secreted lipoprotein
--------------------------|----|||-|------|||||-||||-|||||||||||--  2 [P] COG2824 Uncharacterized Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism
----------------||---|||||----------------|||||-||||-|||-------|||  2 [M] COG2825 Outer membrane protein
------------------------------------|-----|||---||--||||---||-|---  2 [S] COG2828 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||----|-||-|||-------  2 [M] COG2829 Outer membrane phospholipase A
--------------------------------------------------||-||---|-------  2 [S] COG2830 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------||-----------||-------|||-|-||||-||----|||----  2 [S] COG2832 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------------------------------||-|||--||||----  2 [S] COG2833 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-|||----|-------|----|--||----|-----||----|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG2834 Outer membrane lipoprotein-sorting protein
--||------|||-------------||||------------|||||-||-|||||----||||--  2 [S] COG2835 Uncharacterized conserved protein
---|---------------|----------|-----------------||---||||||-------  2 [S] COG2836 Uncharacterized conserved protein
--------------------------||||------------------||--|||---|-------  2 [C] COG2838 Monomeric isocitrate dehydrogenase
-------------------|-|------------|-||---------------||-----------  2 [S] COG2839 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------|-----------------||||||||||||||---|||||--  2 [S] COG2840 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||----|-|-||-|||--|----  2 [S] COG2841 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------|||-------------|||||-||||-|||---|||||--  2 [O] COG2844 UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase
------------------------|----------------------------||---|||||---  2 [S] COG2845 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|---|-------|||||---|--|||----|-----  2 [D] COG2846 Regulator of cell morphogenesis and NO signaling
----------|-----|----|----|---------------------||-|-|||--||||||||  2 [S] COG2847 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-||------||||-------------|---||-|-|-----------------||-----------  2 [S] COG2848 Uncharacterized conserved protein
--------------------|-||------------|--------||--|---||---|-------  2 [S] COG2849 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------|-----|||||--|||||||----------  2 [S] COG2850 Uncharacterized conserved protein
--------------------------|-----|-|-||-----------|--|||---|-------  2 [C] COG2851 H+/citrate symporter
-------------------|-|-------------|------|-------|--||-----|--|--  2 [S] COG2852 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------------------|||||-||||||||--|----|||  2 [M] COG2853 Surface lipoprotein
------------------------------------------|||||-||||||||--|----|||  2 [Q] COG2854 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, auxiliary component
--------|-----------|-----|----|||||------|||||--|||-|||--||||||--  2 [S] COG2855 Predicted membrane protein
-------------||-|-------------------||----------||--||||||||||||||  2 [C] COG2857 Cytochrome c1
---------------------|-----------------------|--||-|-||||||-|-----  2 [C] COG2863 Cytochrome c553
--|----------||---|-----------------||----|||||--|---|||-------|--  2 [E] COG2866 Predicted carboxypeptidase
-------------||---------------------------|||||-||-|||||---|||||||  2 [I] COG2867 Oligoketide cyclase/lipid transport protein
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  2 [C] COG2869 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrC
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  2 [C] COG2871 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG2877 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (KDO) 8-phosphate synthase
--|--------------|--|---------------------||||||||||||||----------  2 [C] COG2878 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB
------------------------------------------|||||--|---|||--|-------  2 [S] COG2879 Uncharacterized small protein
-------------------|-|----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||--  2 [D] COG2884 Predicted ATPase involved in cell division
----------------|--||-||||-||-------------||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG2885 Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins
--------------------|---------||||-||-----|||||----|||||---|||||--  2 [G] COG2893 Phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA
----------------||||||--------|----|||----||||||||--||||||-||||---  2 [D] COG2894 Septum formation inhibitor-activating ATPase
------------------------------------------|||||-|||||||----||||---  2 [S] COG2900 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||----------  2 [KL] COG2901 Factor for inversion stimulation Fis, transcriptional activator
------------------|---------|-------------||-||-||--||||-------|--  2 [P] COG2906 Bacterioferritin-associated ferredoxin
-----------------|------------------------|||||-|||||||||||||-||--  2 [S] COG2908 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||---|||||--  2 [S] COG2911 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||----------  2 [S] COG2914 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||-|||----||||||  2 [D] COG2917 Intracellular septation protein A
------------------------||||||-|||||||----||||||||||||||---|||||||  2 [D] COG2919 Septum formation initiator
------------------------------------------||||||||||||||----------  2 [S] COG2921 Uncharacterized conserved protein
------------------------------------------|||||||---|||-----------  2 [S] COG2922 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||----------  2 [CO] COG2924 Fe-S cluster protector protein
------------------------------------------|||||-||||||||---|||||||  2 [L] COG2927 DNA polymerase III, chi subunit
---|---------------||-||-------------|-----------|--||||---||-|---  2 [S] COG2928 Uncharacterized conserved protein
------------------||--------------------------|-|---|||-----||-|--  2 [S] COG2929 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------||---------------------------|||||-||||||||---|||||||  2 [S] COG2938 Uncharacterized conserved protein
-------------------|----------------------|||-|-|---||||---||----|  2 [K] COG2944 Predicted transcriptional regulator
---|----|----------------------------------------|--||||---|||||||  2 [R] COG2945 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily
--------------------------|||-------------|||||-||-|||||---|||||--  2 [M] COG2951 Membrane-bound lytic murein transglycosylase B
------------------||--------------------------------|||----||-|---  2 [S] COG2954 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|-||||||----------  2 [G] COG2956 Predicted N-acetylglucosaminyl transferase
------------------------------------------|||||-||||-|||----------  2 [H] COG2959 Uncharacterized enzyme of heme biosynthesis
------------------------------------------|||||-||--||||---||||---  2 [S] COG2960 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||||||---|||||-|  2 [R] COG2961 Protein involved in catabolism of external DNA
------------------------------------------|||||-|-||-|||----------  2 [L] COG2965 Primosomal replication protein N
------------------------------------------|||||-||||||||----------  2 [R] COG2969 Stringent starvation protein B
------------------------------------------|||||-||||||||----------  2 [L] COG2974 DNA recombination-dependent growth factor C
------------------------------------------||||||||||||||----------  2 [S] COG2976 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|-----|-------|--|----||||--|--|-||--------|--  2 [H] COG2978 Putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter
------------------------------------------|||-|-||-|-||----||||---  2 [S] COG2979 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||||||----------  2 [M] COG2980 Rare lipoprotein B
------------------------------------------|||||-||---|||----|||-||  2 [M] COG2982 Uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis
------------------------------------------|||||-|-||-||---|---|---  2 [S] COG2990 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------------------------|--||||-||-----------  2 [S] COG2991 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------------||---|||||||||||--  2 [C] COG2993 Cbb3-type cytochrome oxidase, cytochrome c subunit
------------------|-----------------------------|----|-|----|-----  2 [O] COG2994 ACP:hemolysin acyltransferase (hemolysin-activating protein)
------------------------------------------|||||-|-||-|||----------  2 [S] COG2995 Uncharacterized paraquat-inducible protein A
------------------------------------------|||-|-|--|-||-----------  2 [O] COG2999 Glutaredoxin 2
------------------------------------------|||||-||||-|||----------  2 [R] COG3008 Paraquat-inducible protein B
------------------------------------------|||||-||---|||----------  2 [S] COG3009 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||||||----------  2 [M] COG3017 Outer membrane lipoprotein involved in outer membrane biogenesis
----------------|---|-----|-----||--------|||||-||||-|||--|----|-|  2 [S] COG3022 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------------------|||||-||||||||---|||||-|  2 [V] COG3023 Negative regulator of beta-lactamase expression
------------------------------------------|||||-||||-|||----||||--  2 [S] COG3024 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------------|------|---||||----|||||-|||||||----|||||||  2 [S] COG3027 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||||||----------  2 [S] COG3028 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--||----------------------||-------|||----|||||-||-|-||----||||---  2 [R] COG3030 Protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid
--------|---------------------------------|||||-|----|||------|---  2 [R] COG3042 Putative hemolysin
------------------------------------------|||||-||---|||---||||---  2 [S] COG3045 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------------------------|--||||||||----------  2 [NU] COG3063 Tfp pilus assembly protein PilF
------------------------------------------|||||-||||||||----------  2 [H] COG3071 Uncharacterized enzyme of heme biosynthesis
------------------------------------------|||||-||||||||----------  2 [D] COG3087 Cell division protein
------------------------------------------|||||-|-||-||-----------  2 [S] COG3094 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------|||----------|---||--|||-----|||||-|---|||--------|--  2 [E] COG3104 Dipeptide/tripeptide permease
------------------------------------------|||||-|-||||||----------  2 [R] COG3113 Predicted NTP binding protein (contains STAS domain)
|||-----||-----------------|||------------|||||-||-|-|||----------  2 [H] COG3161 4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)
------------------------------------------|||||-||-|||||----------  2 [S] COG3165 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------||----------------------|||||-||--||||------|---  2 [NU] COG3166 Tfp pilus assembly protein PilN
------------------------------------------------||--||||----------  2 [NU] COG3167 Tfp pilus assembly protein PilO
------------------------------------------------||--||||----------  2 [NU] COG3168 Tfp pilus assembly protein PilP
------------------------------------------------||--||||----------  2 [NU] COG3170 Tfp pilus assembly protein FimV
------------------------------------------|||||--|||-||-----------  2 [S] COG3171 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------------------------|--||||---|||||--  2 [R] COG3178 Predicted phosphotransferase related to Ser/Thr protein kinases
--------------------------|-------|--|----------||---|||---|---|--  2 [S] COG3182 Uncharacterized iron-regulated membrane protein
-------------------------------------------------|--|||----||||---  2 [S] COG3184 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------------||---||||||-|-||--  2 [P] COG3197 Uncharacterized protein, possibly involved in nitrogen fixation
------------------------------------------------||---||-----------  2 [S] COG3198 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-----------------|-----------|-||||----------||---||-------||--  2 [S] COG3212 Predicted membrane protein
-------------------------------------------------|--||||----------  2 [NU] COG3215 Tfp pilus assembly protein PilZ
-------------------------------------------------|||-||-----------  2 [S] COG3219 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|------------------|||-|||----|--|--  2 [S] COG3220 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------|---------------------------|---||----|------  2 [P] COG3230 Heme oxygenase
------------------------------------------------||---||-----------  2 [S] COG3235 Predicted membrane protein
-------------------------------------------------|--|||-----------  2 [C] COG3241 Azurin
----------||------|------------------------------|---|||---|||----  2 [P] COG3256 Nitric oxide reductase large subunit
-------------||----|-|----|---------------|||||-||-|-|||---||-|---  2 [G] COG3265 Gluconate kinase
------------------------------------------------||---|||||||||||--  2 [O] COG3278 Cbb3-type cytochrome oxidase, subunit 1
------------------||-------|-|------------|||||-||||-|||---|||||||  2 [C] COG3288 NAD/NADP transhydrogenase alpha subunit
-----------------------------------------------------||-|||-------  2 [L] COG3298 Predicted 3'-5' exonuclease related to the exonuclease domain of PolB
-----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-|||||||  2 [M] COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes
------------------------------------------------||---|||----------  2 [S] COG3308 Predicted membrane protein
------------------------------------------------|---||||----------  2 [S] COG3310 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||-||-----------  2 [C] COG3312 F0F1-type ATP synthase, subunit I
------------------------------------------|||||-||||-|||----------  2 [M] COG3317 Uncharacterized lipoprotein
----------------------||------------|-----|||-|-||---||-----------  2 [R] COG3318 Predicted metal-binding protein related to the C-terminal domain of SecA
--|----------------------------|||-|||--------|--|---||-|--|------  2 [S] COG3326 Predicted membrane protein
--|--|--|--|------||-|----|------|---|-----||-|-------||----|-|---  2 [L] COG3335 Transposase and inactivated derivatives
-----------------------------------------------------||-|||-------  2 [S] COG3399 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------|--------------------------------------|---|||----||----  2 [P] COG3420 Nitrous oxidase accessory protein
--||||-----|----|-------|---------------------|------||------|----  2 [S] COG3439 Uncharacterized conserved protein
-----|-------------|-|---------------------||--------||-----------  2 [V] COG3440 Predicted restriction endonuclease
----------------------------------------------------|||----|||||--  2 [S] COG3453 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|-|||--------------|||--------||-----|--------|------|||----|||---  2 [R] COG3467 Predicted flavin-nucleotide-binding protein
-------------------------------------------------|-|-|||----------  2 [S] COG3471 Predicted periplasmic/secreted protein
---------------------------------------------||-----|||----||-|---  2 [S] COG3514 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------------------------------|-||---|-|-----  2 [M] COG3524 Capsule polysaccharide export protein
-------------------------------------------------|---|||---||||---  2 [S] COG3536 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------|----------------||--||-------------|---||----|-|----  2 [R] COG3560 Predicted oxidoreductase related to nitroreductase
---------------------------------------------------|-||---|-|-----  2 [M] COG3562 Capsule polysaccharide export protein
---------------------------------------------------|-||---|-|-----  2 [M] COG3563 Capsule polysaccharide export protein
--------------------|-------------------------|----|-||-||--------  2 [V] COG3587 Restriction endonuclease
------------------||----------------------|||---|-----|--|--------  2 [R] COG3596 Predicted GTPase
---------------------------------|--------|||||---||-||-----------  2 [P] COG3615 Uncharacterized protein/domain, possibly involved in tellurite resistance
--------------------------------|---------|||||-||||-||---|-------  2 [E] COG3633 Na+/serine symporter
------------------------------------------|||||---||-||----|||||||  2 [M] COG3637 Opacity protein and related surface antigens
--|-----------|------|--------------------|||-|----|-|||--|----|--  2 [L] COG3663 G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase
-----------------------------------------------------|||-------|||  2 [S] COG3671 Predicted membrane protein
---------------------|---------------------||--------||-----------  2 [S] COG3680 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|-----------------------------|---|||---|-|-|--  2 [S] COG3686 Predicted membrane protein
----------------|-||-|--------||---|||-----------|---|||---|||||--  2 [E] COG3705 ATP phosphoribosyltransferase involved in histidine biosynthesis
----------------------------------------------------||||---|||||--  2 [S] COG3737 Uncharacterized conserved protein
--------------------------|----|-|||--------------|--|||---|--|---  2 [S] COG3759 Predicted membrane protein
-------------------------------------------------|||-||-----------  2 [S] COG3767 Uncharacterized low-complexity protein
------------------------------------------------||---||-----------  2 [S] COG3782 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-||-----|||---------------||||||-|-|-------------|---||-----------  2 [T] COG3830 ACT domain-containing protein
------------------------------------------|||||-||||-|||----------  2 [T] COG3850 Signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific
-------------------------------------------------|---|||----||----  2 [K] COG3901 Regulator of nitric oxide reductase transcription
-------------------------------------------------|---||----||-|---  2 [C] COG3909 Cytochrome c556
----------------------------------------------|------||-----|||---  2 [R] COG3926 Putative secretion activating protein
---------------------------------------------||--|---||-----------  2 [R] COG3943 Virulence protein
-----------|------||---------------------------------|||-------|-|  2 [R] COG3975 Predicted protease with the C-terminal PDZ domain
-------------------|----------------------|||||-|----||-----------  2 [E] COG3977 Alanine-alpha-ketoisovalerate (or valine-pyruvate) aminotransferase
----------------|-------------------------||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG4105 DNA uptake lipoprotein
------------------||-|----|---||||||------||||||||||||||---|||||--  2 [J] COG4108 Peptide chain release factor RF-3
-----------------------------------------------------||----||-||--  2 [R] COG4111 Uncharacterized conserved protein
--||--------|-|-|-||||----||||||||||||-----------|---||-------|---  2 [R] COG4122 Predicted O-methyltransferase
------------------------------------------|||||-||-|||||----------  2 [R] COG4137 ABC-type uncharacterized transport system, permease component
---|--||--|----------|--|-----------------|||||-|-||-||----||||---  2 [H] COG4143 ABC-type thiamine transport system, periplasmic component
------------------||-------||--------|----|||||-||--||||---|||||--  2 [P] COG4208 ABC-type sulfate transport system, permease component
---|---------||---||||----|||--|-|||------|||-|-||||||||||||||----  2 [R] COG4221 Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity
------------------------------------------|||||--|-|-|||---|||||--  2 [C] COG4230 Delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase
----------------------||------------------|||||-||||||||--|----|--  2 [OC] COG4232 Thiol:disulfide interchange protein
----------------------------------------------------||||----------  2 [S] COG4255 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|------|----||||------------------||-----------  2 [P] COG4300 Predicted permease, cadmium resistance protein
------------------------------|--------------|-------||-----------  2 [S] COG4304 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------------------------|---|||----||----  2 [C] COG4314 Predicted lipoprotein involved in nitrous oxide reduction
--------------------------------------------------|--||-------|---  2 [S] COG4316 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------------------------||----|--||-----------  2 [R] COG4386 Mu-like prophage tail sheath protein gpL
--------------------------------------------|-----|--||-----------  2 [S] COG4387 Mu-like prophage protein gp36
--------------------------------------------|-----|--||-----------  2 [R] COG4388 Mu-like prophage I protein
---------------------------------------------------|-|||----------  2 [L] COG4389 Site-specific recombinase
---------------------------------------------------|-|||----------  2 [S] COG4390 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------------------------------------------||||---|||-|-|  2 [S] COG4391 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||----------  2 [P] COG4535 Putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC
--|-------------|---||--||----|-----------||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG4591 ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component
--------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|----  2 [P] COG4604 ABC-type enterochelin transport system, ATPase component
--------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|----  2 [P] COG4605 ABC-type enterochelin transport system, permease component
--------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|----  2 [P] COG4606 ABC-type enterochelin transport system, permease component
------------------|-------------||---------------|---||-------|---  2 [S] COG4642 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------------------------|--||||----------  2 [NU] COG4726 Tfp pilus assembly protein PilX
-------------------|-----------------------||-|------|||----|-----  2 [S] COG4737 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------||-||||||||||----------------||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87
----------------||||----------------------|||||-||||||||----------  2 [U] COG4796 Type II secretory pathway, component HofQ
--------------------|------------------------------|-||---------||  2 [R] COG4797 Predicted regulatory domain of a methyltransferase
--------------------|----------------------------|---||-----------  2 [S] COG4859 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------------------|||||-|||||||----|||||--  2 [D] COG4942 Membrane-bound metallopeptidase
-------------------------------------------------|--||||----------  2 [NU] COG4966 Tfp pilus assembly protein PilW
------------------------------------------|||||-||--||||----------  2 [NU] COG4967 Tfp pilus assembly protein PilV
------------------------------------------------||--||||------|---  2 [NU] COG4970 Tfp pilus assembly protein FimT
------------------||-|--------------------------||--||||----------  2 [NU] COG4972 Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM
------------------------------------------|||||-||||||||----------  2 [L] COG4973 Site-specific recombinase XerC
--------------------|---|-|||||---||||----|||||-||||||||---|||||||  2 [L] COG4974 Site-specific recombinase XerD
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||--  2 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase
----------------|------------------------------------|||---|||||||  2 [T] COG5000 Signal transduction histidine kinase involved in nitrogen fixation and metabolism regulation
--------------------------------------------|-----|--||-----------  2 [R] COG5003 Mu-like prophage protein gp37
--------------------------------------------|-----|---|-----------  2 [R] COG5005 Mu-like prophage protein gpG
------------------------------------------||||||||||||||----------  2 [K] COG5007 Predicted transcriptional regulator, BolA superfamily
----------------|-------||----------------|||||-||||||||---|||||||  2 [M] COG5009 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein
--|-----------------|-----------------------------|--||------|----  2 [P] COG5266 ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component
--|-----------------|----------------|-----||||---||||||----|||---  2 [UW] COG5295 Autotransporter adhesin
---------------------|--------------------|||||-|-||-||-----------  2 [S] COG5339 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|---------------------------------||---------||  2 [S] COG5346 Predicted membrane protein
--------------------------||||-----|||---------------|||----------  2 [S] COG5416 Uncharacterized integral membrane protein
--||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||  1 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase
------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-||||||||||||  1 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase
-|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------|  1 [L] COG0338 Site-specific DNA methylase
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||--  1 [E] COG0403 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), N-terminal domain
|-||-------|-|----||------|-----|-||------||||||||----|----|--||--  1 [L] COG0415 Deoxyribodipyrimidine photolyase
|||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||--  1 [H] COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A
|-|---|-|----|---|||------|||-|----||--------------|--|----|------  1 [P] COG0798 Arsenite efflux pump ACR3 and related permeases
-|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||--  1 [L] COG0863 DNA modification methylase
-|||||----|----------|---||---|-----|-|----||-|---|---|-|||----|--  1 [V] COG1002 Type II restriction enzyme, methylase subunits
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||--  1 [E] COG1003 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), C-terminal domain
--|---------------|-------------------------------||-|--|-|-------  1 [M] COG1083 CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase
-|--|-|||----||-----------|||--||||-------|||-|-|-||-|------------  1 [P] COG1275 Tellurite resistance protein and related permeases
||||--||||------|-||-|--|-|---------------------||----|-||||||||--  1 [S] COG1432 Uncharacterized conserved protein
-|||--|----------|-||-----|---|----|--||---|||--|--|--|-|||-------  1 [S] COG1479 Uncharacterized conserved protein
|||-|||-|||||---||-||------||---|--|-|----|||||----|--|---|-------  1 [L] COG1518 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
|-|||---|--------|||-------------|--------||||--------|--|--|-||-|  1 [S] COG1598 Uncharacterized conserved protein
-||-----|--------||--|-------------------------------|-----|---|--  1 [R] COG1669 Predicted nucleotidyltransferases
-||-----------------|---|-----|-----|----------------|--|||----|--  1 [M] COG2089 Sialic acid synthase
---------------------|----|||-------------|||-|-||---|-------|-|--  1 [S] COG2354 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-||---------------|--|-------------------------------|-----|---|--  1 [S] COG2361 Uncharacterized conserved protein
--------------------||----|||||---||||----|---|-||--|-||--||||||--  1 [K] COG2378 Predicted transcriptional regulator
------------------------------|-----|-----|||||------|------------  1 [K] COG2732 Barstar, RNAse (barnase) inhibitor
---------------------|--------|--|--|------||-|--|---|----||---|--  1 [R] COG2819 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily
-------------------|||---|-||-|--|||||--------------||-|-----|----  1 [E] COG2856 Predicted Zn peptidase
----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------  1 [E] COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase
---------------------|----|---------------|||||-||||-|-|----------  1 [S] COG3012 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|--||-||||-|------------  1 [S] COG3036 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------|-----------------------|||||-||-||-||---|||||-|  1 [C] COG3038 Cytochrome B561
------------------------------|--|||------|||||-||||-|-|----|-||-|  1 [K] COG3070 Regulator of competence-specific genes
---|--------------------------------------------||---|---------|--  1 [S] COG3205 Predicted membrane protein
--------------------------------------------------|-||--||--------  1 [S] COG3309 Uncharacterized virulence-associated protein D
-------------------------------------------------|--|-||----------  1 [NU] COG3419 Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1
---------------------------------------|----------|---|--|--------  1 [S] COG3421 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||---||--|-----------  1 [K] COG3423 Predicted transcriptional regulator
--------------------------------|------------------|--|---|-------  1 [S] COG3512 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------------|--|---------------|--|---|-------  1 [S] COG3513 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|-----|---------------|||---|-|--|-|---||-||--  1 [R] COG3550 Uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzymes
------------------------------|||-|--------||-----|---|-----------  1 [K] COG3561 Phage anti-repressor protein
-------------------|-------------|-----|-----||-||---|-------|-|--  1 [R] COG3654 Prophage maintenance system killer protein
------------------||----------------------|||||-||----||----|-----  1 [UNTP] COG3678 P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc-resistance associated protein
------------------------------------------|||-----|--|---------|--  1 [S] COG3692 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||-|-------||----|--|--  1 [L] COG3727 DNA G:T-mismatch repair endonuclease
------------------||-------||------------------------|-----||-----  1 [S] COG3744 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------------------|---|-|-----  1 [M] COG4092 Predicted glycosyltransferase involved in capsule biosynthesis
------------------||-------||------------------------|------|----|  1 [D] COG4118 Antitoxin of toxin-antitoxin stability system
-------------|----||-------|||------------|||-----||-|-|---||||---  1 [R] COG4178 ABC-type uncharacterized transport system, permease and ATPase components
--------------------|----------------------------|----||----------  1 [S] COG4394 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------------------------|-----|---|-----------  1 [R] COG4396 Mu-like prophage host-nuclease inhibitor protein Gam
--------------------------------------------|-----|---|-----------  1 [R] COG4397 Mu-like prophage major head subunit gpT
-------------------------------------------||---------||----------  1 [S] COG4648 Predicted membrane protein
-------------------------------------------||--------|-|----------  1 [I] COG4706 Predicted 3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase
------------------------------------------------|-----|||||-|-||--  1 [O] COG4736 Cbb3-type cytochrome oxidase, subunit 3
--------------------------|---------------------------|--------|--  1 [S] COG4899 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|---||-----------------|------------  1 [L] COG5527 Protein involved in initiation of plasmid replication
------------------------------------------|---------||------------  1 [S] COG5532 Uncharacterized conserved protein