| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ ----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||-- 63 [P] COG1629 Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |-||--|||----|||-|||-|--||-||-|----|||----|||||-|||||--|||||||||-- 50 [T] COG0784 FOG: CheY-like receiver |-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 44 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase --|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 30 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 28 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily |-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 28 [K] COG1309 Transcriptional regulator --||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-|||||||||||||||||| 23 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) |-||----|-----|-||||-|||-||||||----|||----|||||-||--|--|--||||||-- 22 [T] COG2202 FOG: PAS/PAC domain ---|||--|-||||-----|||----|||||---|-||----|||||-||---|||---|||||-- 21 [I] COG1960 Acyl-CoA dehydrogenases -------------||---||------------||--------|||||-||||||||---||||||| 19 [O] COG0625 Glutathione S-transferase --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 19 [NT] COG0840 Methyl-accepting chemotaxis protein |||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 17 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases |||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 15 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases ---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---||||||| 15 [I] COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase |-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 14 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II ||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-| 14 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases |-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---||||||| 14 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators -----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||-- 14 [K] COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog |-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 13 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases -----------------|--||----|||-||||||||-|--|||||-|||||--|---|||||-- 13 [K] COG1609 Transcriptional regulators |-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 12 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes ----------------||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 12 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain --|---||--|-|-----||-|----||||||||||||----|||||--|--|--|---||||||| 12 [V] COG1680 Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins |||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||-- 12 [K] COG1846 Transcriptional regulators --|---------------||-|----||-----|---------------------|---|-|||-- 12 [L] COG3293 Transposase and inactivated derivatives |-|---------------|||------||||----|-----------------------|||||-- 12 [T] COG3920 Signal transduction histidine kinase ||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-||||||| 11 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase ||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 11 [K] COG0583 Transcriptional regulator ----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-|||||||||||||||||| 11 [M] COG0845 Membrane-fusion protein -----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||-- 11 [K] COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins --|-||--|----||---||||----|||--|||||-|||--|||||-|||--|||---|||||-- 11 [L] COG2801 Transposase and inactivated derivatives -|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-||||||||||||| 10 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins ||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 9 [M] COG0438 Glycosyltransferase |||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 9 [R] COG0457 FOG: TPR repeat ----------------|-||-|---||||||----|||----|||||-||--|--|---||||||| 9 [T] COG2200 FOG: EAL domain --||||----||-||-|--|-|----||||-|--||||----|||||-||-||--|---|||||-- 8 [CR] COG0604 NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductases |-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 8 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily |-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 8 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component |||||||||||||--------|----|||-|-----||----|||||-||||-|||---|||||-- 8 [K] COG1522 Transcriptional regulators ----------------||||-|--|-|||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 8 [T] COG2199 FOG: GGDEF domain ||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 7 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases |||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||-- 7 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators |--||||-|--|-|---|--||-----||-|-|-|-||-------||-||-----|---|||||-- 7 [Q] COG1228 Imidazolonepropionase and related amidohydrolases ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 7 [N] COG1344 Flagellin and related hook-associated proteins -----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---||||||| 7 [G] COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases ---|||||--|||||---|-||------------|-||-----------|--|------|---|-| 7 [E] COG1506 Dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases ----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||||||||| 7 [MU] COG1538 Outer membrane protein --|||||||-||--|-|----|----|||--|||||||----|||||-||||---|||||||||-- 7 [Q] COG2050 Uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism |-||--||||---||-|--|-------||-|-----||----|||-|-||--|----------|-- 7 [R] COG2234 Predicted aminopeptidases -------------------|-|-----||--------------|||--||--|--|---|||||-- 7 [R] COG3668 Plasmid stabilization system protein --|-|------|-||-|-||-------|||------|-----|||||--|-----|---||-||-- 6 [Q] COG0412 Dienelactone hydrolase and related enzymes -|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases ----------------||||||--||||||||--||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases --||--------------||-|--|-|||-||---|||----|||||--|-|-------||-|||| 6 [S] COG1357 Uncharacterized low-complexity proteins ||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||-- 6 [K] COG1733 Predicted transcriptional regulators --|--------|-------||-----||||--||---|-------|---|---||----||-||-- 6 [L] COG3547 Transposase and inactivated derivatives ||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---||||||||||||| 5 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases |-||------||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain ||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 5 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases ||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 5 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis -------------|||--||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 5 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains |||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 5 [R] COG0517 FOG: CBS domain |||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||-- 5 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family |-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 5 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family --|--|--|--|-||--|||-|--|-|||||||-||-|----|||||-||--|--|---||-||-- 5 [I] COG0657 Esterase/lipase -------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||-- 5 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases |-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||-- 5 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins -||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||-- 5 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase -----------------|||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 5 [R] COG0795 Predicted permeases --|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 5 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump ----|------|-----|--||----|||-|||-||||----|||||-||---|||---|||||-- 5 [K] COG1802 Transcriptional regulators --|----------------|||----||||-||||||------||-|--||-||||---|||||-| 5 [I] COG1835 Predicted acyltransferases --|-----|---------||-|----||||------||----------||---|||||||||||-- 5 [C] COG2010 Cytochrome c, mono- and diheme variants -------------||---|--|----||||------||-----------|-----|---||-||-- 5 [P] COG2072 Predicted flavoprotein involved in K+ transport ||-|-----|---------|-|-----|||----|-------||||---|-----|--||||||-- 5 [E] COG2303 Choline dehydrogenase and related flavoproteins ----------------|--||-||||-||-------------|||||||||||||||||||||||| 5 [M] COG2885 Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins --------------------|---------||||||||----|||||-||--|--|---|||||-- 5 [KT] COG3279 Response regulator of the LytR/AlgR family |||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase --|-||----||-|||--||-|----||||-|||--------|||||-||||||||---|||||-- 4 [E] COG0308 Aminopeptidase N |||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||-- 4 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs ||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-| 4 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase |-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||-- 4 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase ||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||-- 4 [M] COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis |||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase |||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins ----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--||||||||||| 4 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases ---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||-- 4 [C] COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases) ---|---------||-|-||-|----|----|--||||----|||||-|||-|--|---|||||-- 4 [MG] COG0702 Predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerases |||||||||||||---||||-|---||||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 4 [R] COG0714 MoxR-like ATPases -----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [M] COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein) ----||----------||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein |||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [C] COG0778 Nitroreductase --|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators --||--|||--------|||----||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 4 [NT] COG0835 Chemotaxis signal transduction protein ----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||---||-- 4 [M] COG0859 ADP-heptose:LPS heptosyltransferase ||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||-- 4 [R] COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily) ---|||--|-|||-------||-----||||---|-||----|||||-||-----|---||||||| 4 [I] COG1250 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase |-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||-- 4 [R] COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease ---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---||||||| 4 [K] COG1278 Cold shock proteins |-|-||--|||||----||--|----|---------||----|||||-|||||--|--||||||-- 4 [E] COG1280 Putative threonine efflux protein --|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--||||||||||||| 4 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase |-|||||||-|||----|-|||----||||||||||||----|||||-|------|------||-- 4 [K] COG1695 Predicted transcriptional regulators ---|----|--|-||-----||----||||----|-|-----|--||-||-----|---|||||-- 4 [I] COG2030 Acyl dehydratase --------|----|--||-|||----|||-||||||||-----------|--||||||||||-|-- 4 [R] COG2070 Dioxygenases related to 2-nitropropane dioxygenase ---|---------||---||-|----|||||-----||-----------|--|--|--||||||-- 4 [Q] COG2124 Cytochrome P450 ---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||-- 4 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis ---------------------|----|||||----|||----|||||-||||-|||---|||||-- 4 [K] COG2186 Transcriptional regulators ----------------|---|-||||-----------|----|||||-||-||||||||||||||| 4 [T] COG2204 Response regulator containing CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains ---|---------|||-|||-|--||----|---------|||||-|-||--|||-||||||||-- 4 [O] COG2214 DnaJ-class molecular chaperone -------||----||--|-|||----||||||--||||----|||||-||||---|---|||||-- 4 [I] COG2267 Lysophospholipase ----||---------------|----|||-----||------|||||-||--|||||||||-||-- 4 [S] COG2353 Uncharacterized conserved protein ----------------|-||-------------------------|--||--||||---||-||-- 4 [Q] COG2931 RTX toxins and related Ca2+-binding proteins -----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-||||||| 4 [M] COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes ----||-----|-|-------|------------|-|---------|--|-||--|---|||||-- 4 [G] COG3386 Gluconolactonase ------------------------------------------|------|-----|---||--|-- 4 [PT] COG3712 Fe2+-dicitrate sensor, membrane component ------------------------------|---|----------------------------|-- 4 [KT] COG4219 Antirepressor regulating drug resistance, predicted signal transduction N-terminal membrane component --------------------------|-------------------------|----------|-- 4 [S] COG4805 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------------------|---|-|---|---||-||-- 4 [U] COG4961 Flp pilus assembly protein TadG ||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||-- 3 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase |||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 3 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase ||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase -|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes -|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase |||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [E] COG0174 Glutamine synthetase -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase ---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family ------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-|||||||||||| 3 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase ----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III |||-----||------||||-|----|||-||---||-----|||||-||||||||---|||||-- 3 [E] COG0347 Nitrogen regulatory protein PII --|-||----|--||--|||-|----|||-||||||||-|--|||||-||-----|---||-||-- 3 [G] COG0366 Glycosidases |-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-||||||||||||||| 3 [C] COG0372 Citrate synthase ----||----||||||--||||----|||-----|-||----|||-|-||--||||||-||-||-- 3 [E] COG0405 Gamma-glutamyltransferase --|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||-- 3 [G] COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase |||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [I] COG0439 Biotin carboxylase |||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-|||||||||||||| 3 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components ||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--|||||||| 3 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family ---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 3 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes |||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein |||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||| 3 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases |-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||-- 3 [E] COG0520 Selenocysteine lyase ||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---||||||| 3 [E] COG0531 Amino acid transporters |||||||||-|||||||-||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases |||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||-- 3 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific --------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [J] COG0566 rRNA methylases |||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0582 Integrase ---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||-- 3 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation -||-----||-------|||||||--|---|--||-||----||||---|||---|---|||||-- 3 [P] COG0600 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component --||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases --|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating) -||-----||---||--|||||||--|---|--||-||----||||--||||---|---|||||-- 3 [P] COG0715 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components --|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||-- 3 [G] COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase |||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [R] COG0730 Predicted permeases ----------------||||----||----||||-|||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains) -------------|||||||||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein -------------|||-----|--------------------|||||-||||-|||||||||||-- 3 [R] COG0790 FOG: TPR repeat, SEL1 subfamily |-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [R] COG0824 Predicted thioesterase |-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||-- 3 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component ----------------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [U] COG0848 Biopolymer transport protein ------------------||-|----|||-|---||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [P] COG0861 Membrane protein TerC, possibly involved in tellurium resistance -----------|-||---||------||||-------|----|||||--||--|||---|||||-- 3 [C] COG1062 Zn-dependent alcohol dehydrogenases, class III |||---||||-|-----|||------|||||-|-||||----|||||--|-----|---|||||-- 3 [G] COG1082 Sugar phosphate isomerases/epimerases -||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||-- 3 [P] COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component --||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components ||||----|||||---|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases ||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--|||||||||||||| 3 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning |-|--||||---|-----||-|----|||||-----------|---|--||-|--|---||-||-- 3 [R] COG1216 Predicted glycosyltransferases ||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-|||||||||||||| 3 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component ||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 3 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes --||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-|||| 3 [C] COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters --||--|||--------|-|----||----|----|||----|||||-||-----|--|||-||-- 3 [NT] COG1352 Methylase of chemotaxis methyl-accepting proteins --||--------------|-||----|||-||-|-||-----|||||-||-|-|||---||-||-- 3 [S] COG1359 Uncharacterized conserved protein ---|||||--||--|---||----------------------|||-|-|------|---|---|-- 3 [E] COG1446 Asparaginase --||||||---|-----|||||----|||-||-|||||----|||----|||---|--||||||-- 3 [R] COG1473 Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase ---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-|||||||||||||||||| 3 [O] COG1651 Protein-disulfide isomerase --|-||----|-------||------|||-|-----------|||||-||-|---|---|||||-- 3 [R] COG1741 Pirin-related protein -----|--|-||---------|-----||-------------|||-|--|-----|---|||||-- 3 [C] COG1804 Predicted acyl-CoA transferases/carnitine dehydratase ---||||||--||--------|----||||-------|----|||----------|---|||||-- 3 [I] COG1884 Methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit --||||--|--|-||--|-|||----|||-|||-||||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 3 [C] COG1902 NADH:flavin oxidoreductases, Old Yellow Enzyme family --------------------|||||||---||||||||||||||||||||||||||---|||||-- 3 [G] COG1925 Phosphotransferase system, HPr-related proteins ---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||-- 3 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase ----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 3 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator --|-----|----------|-|----|||||--||-||----|||||--|---|||---|||||-- 3 [S] COG2128 Uncharacterized conserved protein ||||----||-|-------|-|----||||--||||||-|--|||||--|--|--|---|||||-- 3 [C] COG2141 Coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases --||||----||--|---||-|----||------|-||----|||||--|--|--|---||-||-- 3 [PR] COG2146 Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenases -------------------|-|----|||-||||||||||--|||||-||-----|---|||||-- 3 [K] COG2188 Transcriptional regulators |-||----|-----|-||||-|-----||||---|-||----|||---||-----|---|||||-- 3 [T] COG2203 FOG: GAF domain -----------|-||---||-------|||||||-|||----|||||-||-|-|||--||||||-- 3 [E] COG2755 Lysophospholipase L1 and related esterases ---------||-------||-|----||||||--||||----|||||-||-----|---|||||-- 3 [K] COG2771 DNA-binding HTH domain-containing proteins ---|----------------|----------|||||||----|||||-||---||-----||||-- 3 [L] COG2827 Predicted endonuclease containing a URI domain -------------------|-|-------------|------|-------|--||-----|--|-- 3 [S] COG2852 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----|--------------||----|||--|||||-|----|||||-|||----|---|||||-- 3 [L] COG2963 Transposase and inactivated derivatives -------------||---||-------||-------------------||-----|---||-||-- 3 [I] COG3000 Sterol desaturase --||-----------------|-----||--|---|||-----------|-----|---||-||-| 3 [R] COG3173 Predicted aminoglycoside phosphotransferase --------------------------|-------|--|----------||---|||---|---|-- 3 [S] COG3182 Uncharacterized iron-regulated membrane protein -------------||--------------------------------------------||||||| 3 [C] COG3474 Cytochrome c2 ------------------------------||----||----|-----------------|--|-- 3 [G] COG3507 Beta-xylosidase --------------------|-----|---------------|||---|-|--|-|---||-||-- 3 [R] COG3550 Uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzymes -------------------|------|---|-||-|||-----------|-------------|-- 3 [K] COG3655 Predicted transcriptional regulator ------||----------||------|||||||||----------------------------|-- 3 [K] COG3682 Predicted transcriptional regulator -------------------|-|--------------------|||-|--|---------||-||-- 3 [S] COG3755 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------|-------------------------------|--|-----|---|||||-- 3 [S] COG3791 Uncharacterized conserved protein ------------------||---------------------------------------|---|-- 3 [O] COG3914 Predicted O-linked N-acetylglucosamine transferase, SPINDLY family -----------|------||---------------------------------|||-------|-| 3 [R] COG3975 Predicted protease with the C-terminal PDZ domain -------------------------------------|-------------------------|-| 3 [G] COG4421 Capsular polysaccharide biosynthesis protein -----------------|||------|||-------------||||---|-----|---|||||-- 3 [PR] COG4638 Phenylpropionate dioxygenase and related ring-hydroxylating dioxygenases, large terminal subunit -------------------|------------------------------------------||-- 3 [R] COG4798 Predicted methyltransferase ---|--|||--|-||--|--||----||||------||-----------|-----|---||||||| 3 [I] COG4799 Acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta) ---|||--||-||----|||||----||||||--||||----|||||--|-----|---|||||-- 3 [MR] COG4948 L-alanine-DL-glutamate epimerase and related enzymes of enolase superfamily -----------------------------------------------------------|||||-- 3 [K] COG4957 Predicted transcriptional regulator -----------------------------------------------------------|||||-- 3 [S] COG5330 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------------------------------|||||-- 3 [S] COG5349 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------------------------------||-||-- 3 [M] COG5653 Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase |||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase |||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase] --||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0031 Cysteine synthase ||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||-- 2 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases ---------|---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain |||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---||||||| 2 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein) |||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases ||||--|||||||||||-||-|------------|-||----------||---|||---|||||-- 2 [BQ] COG0123 Deacetylases, including yeast histone deacetylase and acetoin utilization protein |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase -|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase -||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 2 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease |||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 2 [Q] COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway) --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit |-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit |-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 2 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase --|----------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein ||-||||||||||---|-||-|----|||-------||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [C] COG0243 Anaerobic dehydrogenases, typically selenocysteine-containing --|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-|||||||||||||||||| 2 [FP] COG0248 Exopolyphosphatase ||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||-- 2 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase ---|---------||---||----------------------||||||||||||||---||||||| 2 [T] COG0271 Stress-induced morphogen (activity unknown) --||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases --||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-||||||||| 2 [C] COG0280 Phosphotransacetylase --|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [C] COG0281 Malic enzyme |--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [P] COG0288 Carbonic anhydrase --|----|---|-|||---||-----||||||||||||-----------|-|---|---||-||-- 2 [R] COG0300 Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase --|----------||-|-||-|----||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 2 [S] COG0316 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs -------------|----||------|||||-----------|||||-|||||------||||||| 2 [J] COG0349 Ribonuclease D --|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase --||-------|-||---|||-----|||-|||||||||||||||||-||-|-|||---|||||-- 2 [L] COG0389 Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair |-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||-- 2 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase -------------||---||------|----------|----|||-|-||--|--|---||--|-- 2 [S] COG0397 Uncharacterized conserved protein --||---------||---||------|||-||||||||----|||---|-----------|--|-- 2 [S] COG0398 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||-- 2 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases --|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-||||||||||||||| 2 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation ---|---------||---||-|----|||--|||||||--|||||||-||-|-|||---||-||-- 2 [R] COG0431 Predicted flavoprotein |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0443 Molecular chaperone ||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning |||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||-- 2 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function ||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain |------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||| 2 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit -------------||---||-||||-|---------------||||||||||||||-------|-- 2 [O] COG0545 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 1 |-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 2 [R] COG0546 Predicted phosphatases |-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit -||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-| 2 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters |-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [P] COG0605 Superoxide dismutase |-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-|||| 2 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase ||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0628 Predicted permease ----------------|||||||||||||-|||||||||---|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 2 [NT] COG0643 Chemotaxis protein histidine kinase and related kinases |||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||-- 2 [C] COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins) -------------||---||-|----|||-----|-||----|||||-||-|||||---||||||| 2 [HC] COG0654 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases |-||||-----|-||---||-------||||------|----|||||-||-|||||---||||||| 2 [R] COG0661 Predicted unusual protein kinase ||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-||||||| 2 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0681 Signal peptidase I |-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---||||||| 2 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins |-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0708 Exonuclease III --|-------------|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 2 [O] COG0719 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component --|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||-- 2 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins -------------|----------------------|-----|||-|---|-|||-|||--|-|-- 2 [G] COG0738 Fucose permease ----------------||||||||------||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [Q] COG0767 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2 --|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||-- 2 [F] COG0775 Nucleoside phosphorylase -----------------|---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0782 Transcription elongation factor ------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [M] COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins) ----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0793 Periplasmic protease -----------------|||----|-----||||--||----|||||-||||||||||-|||||-- 2 [G] COG0800 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase |-|------|------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG0811 Biopolymer transport proteins ------------------||----------------------|||||--|--||||||-|||||-- 2 [G] COG0837 Glucokinase ---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 2 [C] COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1 ----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases -|||---||--|----|-||------|||---|---||----|||||-||-||--|--|||||||| 2 [M] COG1004 Predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase ---|---------||-----||----|||-----|-||----||||||||--||||---|||||-- 2 [C] COG1018 Flavodoxin reductases (ferredoxin-NADPH reductases) family 1 |||---|||||||---|-||-|----||||||-|-|||-------|--||-----|---|||||-| 2 [F] COG1051 ADP-ribose pyrophosphatase ----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||-- 2 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases --------------------||||-||---||||||||-|||||||||||||||||------||-- 2 [G] COG1080 Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria) -|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-|||||| 2 [MG] COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases |------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||-- 2 [M] COG1087 UDP-glucose 4-epimerase |-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-|||| 2 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 2 [G] COG1109 Phosphomannomutase ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [Q] COG1127 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component ----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||-- 2 [KE] COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs ---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [E] COG1171 Threonine dehydratase -------------||-|||||||||||||||||-||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG1186 Protein chain release factor B --||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-| 2 [O] COG1225 Peroxiredoxin ------------------||-|----|||-------|------------|-----|------||-- 2 [E] COG1231 Monoamine oxidase -||||||-|-||||||--||-|--------------------------||-----|---||-||-- 2 [J] COG1236 Predicted exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing --||---------||-|||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains --------------------|----||---||||||||-|||||||||||-|---|-------|-- 2 [G] COG1263 Phosphotransferase system IIC components, glucose/maltose/N-acetylglucosamine-specific --------------------|----||---||||||||||||||||||||-|---|-------|-- 2 [G] COG1264 Phosphotransferase system IIB components |||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----||||||| 2 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases --|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||-- 2 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase -------------------|||----|--||||||||||-|||||||-||||||||--||||||-- 2 [P] COG1393 Arsenate reductase and related proteins, glutaredoxin family ---|--------------||-|-----||||||-|||-----|||---|---|--|---|||||-- 2 [V] COG1403 Restriction endonuclease |-|---|||||-|||-|-||--||--||||||--|||-----|||||-||||---|---|||||-- 2 [R] COG1409 Predicted phosphohydrolases ----------------|-||-|--------------------|||||--|---|||-------|-- 2 [M] COG1462 Uncharacterized protein involved in formation of curli polymers ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [Q] COG1463 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, periplasmic component ||||||--||-|------||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---|||||-- 2 [H] COG1492 Cobyric acid synthase ------||-----------|-|----|||------------------------||-------|||| 2 [E] COG1505 Serine proteases of the peptidase family S9A |||-|||||||||---||-|-|----|---|---|-||----|||||--|-----|---|||||-- 2 [J] COG1514 2'-5' RNA ligase ----|||||--|-|||-|-|------|---|----|-|-----------|--|-----|-|-||-- 2 [R] COG1524 Uncharacterized proteins of the AP superfamily ----------|||---|----|--|--||-------||----|||----|-----|---||-||-- 2 [C] COG1529 Aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, large subunit CoxL/CutL homologs ---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---||||||| 2 [J] COG1530 Ribonucleases G and E ---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||-- 2 [R] COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced) ----------------||||----------------------|||-|-||-|||||--||||||-- 2 [M] COG1596 Periplasmic protein involved in polysaccharide export |-|||---|--------|||-------------|--------||||--------|--|--|-||-| 2 [S] COG1598 Uncharacterized conserved protein ||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG1605 Chorismate mutase --|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||-- 2 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein ---|----|-||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 2 [C] COG1622 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2 ----------------------||||----|-----|--------|--||--|--||||----|-- 2 [M] COG1664 Integral membrane protein CcmA involved in cell shape determination ---------||-|---||||-|----||||-|||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 2 [T] COG1702 Phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase |--------|--------||-------||||----|||----------|||--||||||||||||| 2 [S] COG1714 Predicted membrane protein/domain --|||||||-|-|---||||-|---|-|||-----|||----------||-----|---|||||-- 2 [R] COG1721 Uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain) ----------------|-------||----|----|------||||||||-----|||||||||-- 2 [N] COG1749 Flagellar hook protein FlgE -------------||||||-|---|--|||-|----||----|||-|-||--||||---||||||| 2 [R] COG1752 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily ----||---------------|----|----|--|||---|||||-|-||--|--|---|||||-- 2 [O] COG1764 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation --------|--|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-| 2 [I] COG1788 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit ------|||----------------------|----|-----|||||----|---|--|||-||-- 2 [M] COG1794 Aspartate racemase ------|||-------|-|||---------|-----|-----|||||--|--||||---|||||-- 2 [M] COG1807 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family -----------|-----|-|||---||||-||||||||-|--|||||-|||||------|||||-- 2 [G] COG1820 N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase --||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components ---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 2 [C] COG1845 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3 -|------------------|---|-----|-----|--------------------------|-- 2 [M] COG1861 Spore coat polysaccharide biosynthesis protein F, CMP-KDO synthetase homolog ------||---------|------------|--|--||-------|------|-------|--|-- 2 [G] COG1874 Beta-galactosidase ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 2 [NU] COG1886 Flagellar motor switch/type III secretory pathway protein -------------|-|----------||||------------|||||-|||||------|||||-- 2 [I] COG1946 Acyl-CoA thioesterase -----------|-||----|-|----|||-----|--|----|||-|--|-|---|--||||||-- 2 [F] COG1957 Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase ----------|||--------|-----||-------||----|||----|-----|---|||||-- 2 [O] COG1975 Xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family ---|------|-|||-|----|--------------||----------||--||||--|||||||| 2 [R] COG1999 Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC, involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems ----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||-- 2 [G] COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes |-||---------||------|----||||----||-------------|||||||------||-- 2 [E] COG2021 Homoserine acetyltransferase -----------|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-| 2 [I] COG2057 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit ----------|||--------|--||-||-------||----|||----|-----|---||-||-- 2 [C] COG2080 Aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, small subunit CoxS/CutS homologs ------------------||----------||||||||----|||||-||||---|---|||-|-- 2 [R] COG2081 Predicted flavoproteins |-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||-- 2 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases -||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||-- 2 [U] COG2095 Multiple antibiotic transporter ----------|-------||-|---|-|||-------|----|||-|--|--|--|---||-||-- 2 [G] COG2133 Glucose/sorbosone dehydrogenases ----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||-- 2 [NU] COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG ---||||||--||-------||----||||-------|----|||----------|---|||||-- 2 [I] COG2185 Methylmalonyl-CoA mutase, C-terminal domain/subunit (cobalamin-binding) --------------------|----||---||||||||-|||||||||||||---|-------|-- 2 [G] COG2190 Phosphotransferase system IIA components --||--|||--------|-|----||----|-----||----|||||-||--|--|--|||-||-- 2 [NT] COG2201 Chemotaxis response regulator containing a CheY-like receiver domain and a methylesterase domain ------------------|||---------||----|-----|||||----------------|-- 2 [G] COG2211 Na+/melibiose symporter and related transporters |-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||-- 2 [P] COG2217 Cation transport ATPase |-----||-|-------|--||--------|-||-||-----|||||--|--|------|||||-- 2 [M] COG2222 Predicted phosphosugar isomerases --|-------------|----|----|||||-----------|||||-||-----|||||||||-- 2 [M] COG2230 Cyclopropane fatty acid synthase and related methyltransferases ||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 2 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid --|-----------|-----|---------|----||||---|||||-||||-||||||-|-||-- 2 [R] COG2249 Putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B) ---|-------||-------||----|||--||---------|||||-|||----|---|||||-- 2 [G] COG2301 Citrate lyase beta subunit -------------||------|-----||--|---|---------|---|-----|---|---|-- 2 [T] COG2365 Protein tyrosine/serine phosphatase ----||--|-|||-----||-|---------------------------|-----|-----|-|-- 2 [R] COG2366 Protein related to penicillin acylase --------------------||----|||||---||||----|---|-||--|-||--||||||-- 2 [K] COG2378 Predicted transcriptional regulator ||||--|||||||-|--|------------------------|||||-||--||||||||||||-- 2 [O] COG2518 Protein-L-isoaspartate carboxylmethyltransferase ------------------|--------||--|--||----------------|-------|-||-- 2 [R] COG2936 Predicted acyl esterases ----------------------------------------------------|--|||-||||||| 2 [U] COG2948 Type IV secretory pathway, VirB10 components --------------------|-----|-------|--|----||||--|--|-||--------|-- 2 [H] COG2978 Putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter --------------------------|---------------|||-|-||--------||--||-- 2 [M] COG3040 Bacterial lipocalin ------------------------------------------|||||-||-||--|---|-||||| 2 [M] COG3047 Outer membrane protein W ------------------------------------------|||||-||-------------|-- 2 [E] COG3138 Arginine/ornithine N-succinyltransferase beta subunit -------------------------------|--||------|||||-||----------|-||-- 2 [S] COG3152 Predicted membrane protein ----------------||||----------------------|||-|-||-||--|---|||||-- 2 [M] COG3206 Uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis --|-----------------|-----------|-||||----------||---||-------||-- 2 [S] COG3212 Predicted membrane protein ------------------------------|------------------|||-|||----|--|-- 2 [S] COG3220 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-------|-|------------|||||-||||-|||---||||||| 2 [C] COG3288 NAD/NADP transhydrogenase alpha subunit --|-----------------------|||--------|--------|-||-|---|---|||||-- 2 [R] COG3324 Predicted enzyme related to lactoylglutathione lyase -------------||-----------||||-------------------|-----|---||||||| 2 [S] COG3346 Uncharacterized conserved protein --------------------------|------------------|---|-----|---||||||| 2 [Q] COG3485 Protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit ----------------------------------------------------|--|||-||||||| 2 [U] COG3504 Type IV secretory pathway, VirB9 components ---------------------------||--|-|------------------|----------|-- 2 [G] COG3537 Putative alpha-1,2-mannosidase -------------------|------|---------|------------|----------|-||-- 2 [P] COG3540 Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D --------------------------------||-|------|||-|--|--|--|---|||||-- 2 [R] COG3568 Metal-dependent hydrolase -||||||||-|||------|-------||--------------||||-----|--|---||-||-- 2 [K] COG3609 Predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain ------------------------------------------|||||---||-||----||||||| 2 [M] COG3637 Opacity protein and related surface antigens --------------|------|--------------|----------------------||--|-- 2 [S] COG3665 Uncharacterized conserved protein --|----------------||---------|-|||--|-----------|---------||--|-- 2 [L] COG3666 Transposase and inactivated derivatives ------------------||-------||--------------------------|-------|-- 2 [Q] COG3670 Lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzymes -----------------------------------------------------|||-------||| 2 [S] COG3671 Predicted membrane protein -----------------|-|----------|------|---------------------|---|-- 2 [G] COG3693 Beta-1,4-xylanase ----------------|-||----------------------|||-|--|-----|||--|--|-- 2 [P] COG3696 Putative silver efflux pump -----------------|||-----|-----------|-----------|--------|||||||| 2 [T] COG3706 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain ------------------------------------------|||||--|-------------|-- 2 [E] COG3724 Succinylarginine dihydrolase ---------------------|-----------------------|---|---------|||||-- 2 [E] COG3741 N-formylglutamate amidohydrolase -------------------------------------------------|-----|---|||||-- 2 [S] COG3748 Predicted membrane protein -------------|||--||----------------------------||-------------|-- 2 [O] COG3751 Predicted proline hydroxylase ------------------------------------||----|||-|--------|---|---|-- 2 [S] COG3766 Predicted membrane protein ------------------------------|-----||---------------------|||||-- 2 [M] COG3773 Cell wall hydrolyses involved in spore germination ------------------||-|---------------------|||-------------|---|-- 2 [P] COG3793 Tellurite resistance protein -------------------------------------------------|-----|---||-||-- 2 [S] COG3795 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------||---------------------------------||-- 2 [S] COG3801 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------------|-|---|---||-||-- 2 [U] COG3847 Flp pilus assembly protein, pilin Flp -------------||----------------------------------|---------|||||-- 2 [R] COG3897 Predicted methyltransferase -------------------------------------------------|--|------||-||-- 2 [K] COG3905 Predicted transcriptional regulator -------------------------------------------------|-----|---|---|-- 2 [Q] COG3917 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase -------------------------------------------------------|---|--||-- 2 [S] COG4102 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||-----|-----|-|-- 2 [H] COG4206 Outer membrane cobalamin receptor protein -------------------------------------------------|--|--|---|||||-- 2 [TK] COG4567 Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a Fis-type HTH domain --|-------------|---||--||----|-----------|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG4591 ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component ------------------------||-----------------------------|||-|||||-- 2 [S] COG4731 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|----------------------||||-------------------|-----|---||||||| 2 [I] COG4770 Acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 2 [N] COG4786 Flagellar basal body rod protein -------------------------------------------------|-----|----|-||-- 2 [K] COG4941 Predicted RNA polymerase sigma factor containing a TPR repeat domain -------------------------------------------||----|-----|---|||||-- 2 [K] COG4977 Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 2 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase -------------------------------------------------------|---|--||-- 2 [S] COG5267 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|------------------|-----------------------------------------|-- 2 [S] COG5316 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------------------------||||-- 2 [S] COG5352 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------------------------------||||||| 2 [S] COG5375 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------------------|---------|------||-- 2 [S] COG5419 Uncharacterized conserved protein ||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||-- 1 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase |||-||--||-|-||-||||-|----|||-||--|||||---|||||--|--||||---|||||-- 1 [P] COG0004 Ammonia permease |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase -------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0021 Transketolase ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 1 [C] COG0022 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase ---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase) ---|--||---|----|-|||------||||----|||----|||||-||--||||---||-||-- 1 [H] COG0029 Aspartate oxidase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation) -------------||---|--|----|||-------------|||||-|----------|||||-- 1 [G] COG0033 Phosphoglucomutase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase |--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase -|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control -|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||-- 1 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC ||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--|||||||| 1 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||-- 1 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 1 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0048 Ribosomal protein S12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0049 Ribosomal protein S7 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0051 Ribosomal protein S10 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2 ||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--|||||||| 1 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase |||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [G] COG0061 Predicted sugar kinase |||||||||||||||-||||-|----|||||-----------|||||-||--|--|||||||||-- 1 [S] COG0062 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||-- 1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase ||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---||||||||||||| 1 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog) ||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit |||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0067 Glutamate synthase domain 1 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0069 Glutamate synthase domain 2 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0070 Glutamate synthase domain 3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0073 EMAP domain ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit ||||||||||||||--||||-|--------||--|-||--------|-||------||-||-||-- 1 [E] COG0075 Serine-pyruvate aminotransferase/archaeal aspartate aminotransferase ||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0077 Prephenate dehydratase |||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1 ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0082 Chorismate synthase |||---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0084 Mg-dependent DNase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11 |||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9 ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase |||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase ---|||--|-|||||-|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 1 [O] COG0109 Polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor) ||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-| 1 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) |||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||-- 1 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase --||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0114 Fumarase -------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase ||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||-- 1 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase |-||--|||---||||--|--|-----||-|-----||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 1 [L] COG0122 3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0125 Thymidylate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--|||||||| 1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase -|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 1 [H] COG0132 Dethiobiotin synthetase ||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase ||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase --||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful) ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase ||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase -||--|--|||||||-|-||-------|-------|-|------------------||-|||||-- 1 [EQ] COG0145 N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit -||--|---||||||-|-||-------|----------------------------||-|||||-- 1 [EQ] COG0146 N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0148 Enolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase --------|-||-||-|-||-|----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 1 [P] COG0155 Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein) ||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||-- 1 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase ---|---------||---||----------------------|||||-||||-||||||-||-|-- 1 [G] COG0158 Fructose-1,6-bisphosphatase ||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 1 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0164 Ribonuclease HII ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase -|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0171 NAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase -|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [G] COG0176 Transaldolase |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-||||||||||||||| 1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17 -|||--|||-|||-----||-|---------------|--||||||||||||||||---|||||-- 1 [HJ] COG0189 Glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase) --||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||| 1 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase -------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||-- 1 [G] COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase -------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase -------------|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0194 Guanylate kinase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0195 Transcription elongation factor -------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0196 FAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0203 Ribosomal protein L17 ||||||||||------||||||--||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0206 Cell division GTPase |||-----||---|||----||----||||||||||||-|||||||||||||||||---|||||-- 1 [F] COG0207 Thymidylate synthase ---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-||| 1 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0211 Ribosomal protein L27 |--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase --|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0216 Protein chain release factor A -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein -|||--||||---|--||--|---------|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0218 Predicted GTPase ------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class) -------------||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase |-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 1 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component -------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0227 Ribosomal protein L28 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0228 Ribosomal protein S16 |-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||-- 1 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0230 Ribosomal protein L34 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A) ------------------|--|----||||-----|------|||||-||||---|---||||||| 1 [F] COG0232 dGTP triphosphohydrolase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0233 Ribosome recycling factor --|----------||-||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10) ||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--|||||| 1 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0238 Ribosomal protein S18 -|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation |-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase -|--||-------|||--|-|------||-|-----------|||||||||||||||||---||-- 1 [E] COG0241 Histidinol phosphatase and related phosphatases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10 ----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase -------------|---|--------|---||-||-||-||-||||||||-|---|---|||||-- 1 [G] COG0246 Mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenases --||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family) |||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0250 Transcription antiterminator ||------||------|||||-||--|||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0254 Ribosomal protein L31 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0257 Ribosomal protein L36 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) -------------||---||-|-----|||------------|||||-|||-||||---|||||-- 1 [H] COG0259 Pyridoxamine-phosphate oxidase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0261 Ribosomal protein L21 --|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-| 1 [H] COG0262 Dihydrofolate reductase --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts ------------------||-|----||||-||||||||||||||||-||||||||---|||||-| 1 [L] COG0266 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0267 Ribosomal protein L33 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0268 Ribosomal protein S20 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis ----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase) ---|---------|||--||----------------------||||||||||||||---||||||| 1 [O] COG0278 Glutaredoxin-related protein ---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---||||||| 1 [F] COG0283 Cytidylate kinase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase ---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase ||||---||----------|-------||--|||||--|||-|||-|-|||||||||||-||-|-| 1 [V] COG0286 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit ||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase |||-----||------||||--||--|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3) -------------|--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0291 Ribosomal protein L35 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0292 Ribosomal protein L20 ||||||--||---|||--------||----------------||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG0293 23S rRNA methylase |||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes ---|------|-|||--|---|---|-||||||||||||||||||||-|-||-------||-||-- 1 [F] COG0295 Cytidine deaminase --||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN ----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--||||||||||| 1 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I |||||||||||||---|-||-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0303 Molybdopterin biosynthesis enzyme ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0305 Replicative DNA helicase ---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0313 Predicted methyltransferases |||||||||-|||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0314 Molybdopterin converting factor, large subunit |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0315 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme ----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-| 1 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase ---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 1 [H] COG0320 Lipoate synthase ----------|--||---||-|----||||------------||||||||||||||---||||||| 1 [H] COG0321 Lipoate-protein ligase B |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex --||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase) -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase --|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold ---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0328 Ribonuclease HI |||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0333 Ribosomal protein L32 --|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|-- 1 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0335 Ribosomal protein L19 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase ----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase -------------||---||-|----|---------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [E] COG0339 Zn-dependent oligopeptidases ||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD |||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase ----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||-- 1 [S] COG0344 Predicted membrane protein |-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase -||-||--||-|------||----------|-----------|||-|-||||-|||||||||||-- 1 [C] COG0348 Polyferredoxin |||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase ----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) -------------||-|-||-|----||||------------||||||||||||||---||||||| 1 [R] COG0354 Predicted aminomethyltransferase related to GcvT --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit) --|----------|--|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type) --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0359 Ribosomal protein L9 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0360 Ribosomal protein S6 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1) -------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase -------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase |-||||--|-|||||||-||-|-----||--|--||||----|||||-||-||--||-||||||-- 1 [I] COG0365 Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases -------------|||--||--||----------|-||----||||||||--|||----|-|-|-- 1 [P] COG0369 Sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein) |||---|||||-----||||-|--------||--||------|||||-||--|--||||----|-- 1 [P] COG0370 Fe2+ transport system protein B --||----|----|----|--------||--------|----|||||-|---|--|---||-||-- 1 [P] COG0376 Catalase (peroxidase I) --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases ||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||-- 1 [H] COG0379 Quinolinate synthase |||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases --||---------||---||||----|||-|----|||----|||-|-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG0384 Predicted epimerase, PhzC/PhzF homolog --|----------|--|-||------|--|----|-||----|||||--|---|||---|||||-- 1 [R] COG0385 Predicted Na+-dependent transporter -------------|||--|-|-----|---|||||||||---|||||--|--||||-------|-- 1 [O] COG0386 Glutathione peroxidase |||||||||--|-----|||-------|||-|---|-|----|||-|-|--|-----------|-- 1 [S] COG0393 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 1 [O] COG0396 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, ATPase component ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG0403 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), N-terminal domain ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--||||---|||||-- 1 [E] COG0404 Glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase) --|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase -------------||---||----------------------|||||-||--|--|---||||||| 1 [H] COG0408 Coproporphyrinogen III oxidase ---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase -------------||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0414 Panthothenate synthetase |-||-------|-|----||------|-----|-||------||||||||----|----|--||-- 1 [L] COG0415 Deoxyribodipyrimidine photolyase ----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||-- 1 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme ||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||-- 1 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC ||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||-- 1 [O] COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation ---|----|----||---|-|-----|---------------|||||--|---------|-|-|-- 1 [C] COG0427 Acetyl-CoA hydrolase |||||||||||||---||||-|-----||---|----|----||||---|-|---|---|||||-- 1 [R] COG0433 Predicted ATPase |||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||-- 1 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division |||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases ||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains |||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--||||||||||| 1 [O] COG0450 Peroxiredoxin |||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase ||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 1 [R] COG0456 Acetyltransferases ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ) ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family) |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase |||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| 1 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases --|----------||-||--||||||----|-----|||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase -|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||-- 1 [G] COG0469 Pyruvate kinase |||||||||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication |||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--|||||||| 1 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase |-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2 ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA -------------||-||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0486 Predicted GTPase ||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0492 Thioredoxin reductase --|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--|||||||| 1 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase ||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||-- 1 [R] COG0496 Predicted acid phosphatase ----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0498 Threonine synthase |||||||||||||||-||||------||||-------------------|--|--|---|||||-- 1 [H] COG0499 S-adenosylhomocysteine hydrolase |||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 1 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase) ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit ---|---------||---||-|----|||-----|-||----|||||--|-|-|||||||||||-- 1 [E] COG0506 Proline dehydrogenase ---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||-- 1 [E] COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding) ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II --|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||-- 1 [L] COG0514 Superfamily II DNA helicase |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit |||||||||||||---|--|-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0521 Molybdopterin biosynthesis enzymes |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins --|----------||-|-||||----|||-----|-||----|||||-||--||||||-|||||-- 1 [R] COG0523 Putative GTPases (G3E family) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0527 Aspartokinases |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0528 Uridylate kinase -------||---|||-|-|--|-----||-|-----||----||||||||--|--|--|-||||-- 1 [P] COG0529 Adenylylsulfate kinase and related kinases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity ||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 1 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0536 Predicted GTPase ---|||--|-|||||-||||-|-----||--|--||||----|||||--|-|---|||-|||||-- 1 [C] COG0538 Isocitrate dehydrogenases -------------||-||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0539 Ribosomal protein S1 |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor) ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-| 1 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0550 Topoisomerase IA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase ---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||-- 1 [C] COG0554 Glycerol kinase ||||||||||||------||-|-----||-|------|----|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG0555 ABC-type sulfate transport system, permease component |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex ---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [K] COG0557 Exoribonuclease R --||--|||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases ||||||--||-||-----||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-| 1 [J] COG0565 rRNA methylase -------------||------|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 1 [C] COG0567 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, and related enzymes -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||-- 1 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component |||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--|||||||||||||| 1 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein) ||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 1 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component ----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||-- 1 [R] COG0579 Predicted dehydrogenase |-------|--|-|||-||-||---|----||||||||-|||||||||-||||--|---|||||-- 1 [G] COG0580 Glycerol uptake facilitator and related permeases (Major Intrinsic Protein Family) ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 1 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component ----||-----|------||-|--||||||||--||||----|||||||||||||||||--|||-- 1 [S] COG0586 Uncharacterized membrane-associated protein --|----------||-----|-||||||||||||||------||||||--||||||----||||-- 1 [G] COG0588 Phosphoglycerate mutase 1 |||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---||||||| 1 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins --|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---||||||| 1 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog) -----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0594 RNase P protein component ||||--||-|-------|||||----||||||||||||||||--------------|||||||||| 1 [R] COG0595 Predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase |||-||--||-|-||--||--|----|||--|---|||-------|---||-||||---|||||-- 1 [S] COG0599 Uncharacterized homolog of gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit ||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes |||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase |--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-| 1 [O] COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity ||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease -||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||-- 1 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component ||||---||----------|-----------||-||--|||-------||||||--|||-||-|-| 1 [V] COG0610 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases |||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|-- 1 [H] COG0611 Thiamine monophosphate kinase -||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component |||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class) -------------|||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase |||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||-- 1 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent) |||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase ----------------|-||-|||---|||-|--||||----|||-||-|||-||||||||||||| 1 [I] COG0623 Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH) -------------|----||------||||-|||||------|||||--|||-|||---|||||-- 1 [R] COG0627 Predicted esterase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein -||||||||-|||---------------------------------------|---||-||||||| 1 [NU] COG0630 Type IV secretory pathway, VirB11 components, and related ATPases involved in archaeal flagella biosynthesis -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit ---|---------||||-||-|||--|---------------||||||||||-|||---||||||| 1 [C] COG0633 Ferredoxin ----------------||--||----||||||-|||||||||||||||||||||||---|||||-- 1 [F] COG0634 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase ||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K --|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 1 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase -|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||-- 1 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases ---|------------|-||-|-----||--------------------|----------|-||-- 1 [R] COG0645 Predicted kinase -----------------|||||----|||||---||||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG0646 Methionine synthase I (cobalamin-dependent), methyltransferase domain ---|--|||--||||-||--|-----|||--|||||||----|||||--|--------|||||||| 1 [G] COG0647 Predicted sugar phosphatases of the HAD superfamily --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase) |||-----||-|-||-|---||-----||||--|||||----||-||-||--|--|---|||-|-| 1 [R] COG0655 Multimeric flavodoxin WrbA ---|||||--||||||-||-------||||||||||||----|||||--|-----|---|||||-- 1 [R] COG0656 Aldo/keto reductases, related to diketogulonate reductase ----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-| 1 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein |||---||||------|||||------||-------||----|||||-||--||||||-|||||-- 1 [G] COG0662 Mannose-6-phosphate isomerase |||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--|||||||| 1 [R] COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily ----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-|||| 1 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat |||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--|||||||||||||| 1 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel ----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase -------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-||||||||||||| 1 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH -------------||---||-------------------------|--|-||-|||---|||||-- 1 [O] COG0678 Peroxiredoxin ||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--|||||||| 1 [R] COG0679 Predicted permeases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase --|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase ------------------||-|-----|||-|--||||----------|-------||--|-||-- 1 [E] COG0686 Alanine dehydrogenase ---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 1 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein |---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---||||||| 1 [J] COG0689 RNase PH ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0691 tmRNA-binding protein ---|----|----||---||--||----------||||----|||||||||||---|||||||||| 1 [O] COG0694 Thioredoxin-like proteins and domains --|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0703 Shikimate kinase |||||||||||||---||||-|---|||||||||||-||-|||||||-||--|--|---|||||-- 1 [P] COG0704 Phosphate uptake regulator -||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||-- 1 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC --|------|-|----||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase -------------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein) --||||------|---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0713 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K) |||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-||||||||||||||||| 1 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase -----------------|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase ||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---||||||||||||| 1 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit -------------||----|-|----|----|-|--------||||||||||||||------||-- 1 [E] COG0722 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase --||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--|||||||||||||| 1 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [P] COG0725 ABC-type molybdate transport system, periplasmic component ----------------|||||||||||||||-----------|||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor ----------------|---|---------------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [M] COG0729 Outer membrane protein ||||-|-||----------|-------||--|||||--|||||||-|-|||||---|||-||-|-| 1 [V] COG0732 Restriction endonuclease S subunits -------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||| 1 [I] COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases -----------------|||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase ----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|-- 1 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase |||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||-- 1 [H] COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains |||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1 ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit ------------------|-----------------------|||||---|-----||||---|-- 1 [E] COG0754 Glutathionylspermidine synthase --|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component -------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-||||||| 1 [F] COG0756 dUTPase -----------------|||||----|||||-----||-------|-||||||--|||||||||-- 1 [E] COG0757 3-dehydroquinate dehydratase II ----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-| 1 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake ----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||- 1 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein -----------------||||-||||||||||||||||----|||||-||||---||||||-||-- 1 [S] COG0762 Predicted integral membrane protein ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0763 Lipid A disaccharide synthetase --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 1 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase |||------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit ----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------|-|---||||-------------||-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0781 Transcription termination factor ---|--------------||||--|||----|||||||-|--|||||-|||||--|||||-|-||| 1 [P] COG0783 DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant) --------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0787 Alanine racemase ---|------------|-||-|----|||-------||----|||-|-|||||--|||||||-|-- 1 [F] COG0788 Formyltetrahydrofolate hydrolase ----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||-- 1 [L] COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase |||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation ----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [M] COG0796 Glutamate racemase ----------------|-||----||----|-----------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0797 Lipoproteins ----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase --||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC ----------------||||||--||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing ----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II ----------------||||||---|----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase) ----------------|--||---------------------|||||-||||||||||||||||-- 1 [M] COG0810 Periplasmic protein TonB, links inner and outer membranes ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase ----------------||||-|||||||||------------|||||-||||-||||||||||||| 1 [M] COG0815 Apolipoprotein N-acyltransferase ----------------||||||||--|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis) -----------------||||||||-||||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit ----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||-- 1 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis --||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||| 1 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation --|-----|---------||--||------------------|||||-|||||--||||||||||| 1 [U] COG0823 Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit ----------------|-||--||||----|||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0828 Ribosomal protein S21 --|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-||||||||||||| 1 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain --||--|||-------||||-|--------|-----------|||||-||--|---||-|||||-| 1 [M] COG0836 Mannose-1-phosphate guanylyltransferase --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0838 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 3 (chain A) --||||--|--||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0839 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J) ------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|-- 1 [K] COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family ---------|------||--||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit ----------------||||-|----|||||---||||----|||||--|--||||||||--||-- 1 [H] COG0853 Aspartate 1-decarboxylase ----------------|-||----------------------|||||-||--||||||||||||-- 1 [H] COG0854 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein --|---------------||-|-----||||------|----|||||-||--||||||||||||-- 1 [P] COG0855 Polyphosphate kinase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A ----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase -|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||-- 1 [L] COG0863 DNA modification methylase ||||--|||||||-----------------|----|||----|||-|---------||---|-|-- 1 [K] COG0864 Predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain and a metal-binding domain -|||||----|----------|---||---|-----|-|----||-|---|---|-|||----|-- 1 [V] COG1002 Type II restriction enzyme, methylase subunits ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG1003 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), C-terminal domain --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1005 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 1 (chain H) --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1007 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N) --||||----------|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1008 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M) --||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--|||||||||||||| 1 [CP] COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit |||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||-- 1 [C] COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit ----------------||||-|-----||-|-----------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1034 NADH dehydrogenase/NADH:ubiquinone oxidoreductase 75 kD subunit (chain G) ----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase --||----------|--|||------||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [E] COG1045 Serine acetyltransferase --||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---||||||| 1 [C] COG1048 Aconitase A ||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit ------------------||-|||--|----||||||-----||||||||--|--|---||||||| 1 [R] COG1054 Predicted sulfurtransferase -------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase ---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||-- 1 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA --|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||-- 1 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases ----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 1 [C] COG1071 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, alpha subunit --||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||-- 1 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily --------------------|-||||-||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains) -------------|||--|-----------------------||||||||||-|||--|||||||| 1 [O] COG1076 DnaJ-domain-containing proteins 1 |---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----||| 1 [D] COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis |-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||-- 1 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase |-|-----|-------|-||-------||-|-----------|||-|-||--|---||-|-|||-- 1 [M] COG1089 GDP-D-mannose dehydratase --|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-||||||||||||| 1 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 1 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component ------------------||-------||--------|----|||||-||--||||||||||||-- 1 [P] COG1118 ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component -||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||-- 1 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 1 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component -----------------|--|---|||----|----||-|--|||||-||||---|---|||||-- 1 [G] COG1129 ABC-type sugar transport system, ATPase component --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 1 [GM] COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component ------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component ----------------||||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component --|-----|-|-|--------|--------------------|||||-|||||------||||||| 1 [O] COG1138 Cytochrome c biogenesis factor |||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I) ||||||-|||||-----|||-|----|||||-----------|||-|-||--|--||||||||||| 1 [C] COG1146 Ferredoxin ----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||-- 1 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1157 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase ----------------||--|||||||||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG1158 Transcription termination factor ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1159 GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1160 Predicted GTPases --||-------------|--||||||-----|||||||||||------|-------||||||||-- 1 [E] COG1164 Oligoendopeptidase F -----------------|--|-----|--|-|----||----|||||-||||---|---|||||-- 1 [G] COG1172 Ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport systems, permease components ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 1 [E] COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II --|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase) -----------------|--|-----|---||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 1 [J] COG1188 Ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit (S4 paralog) --|-----|-------|||||----|||||||||-|||||----------------|||||||||| 1 [J] COG1189 Predicted rRNA methylase |--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase ----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------||||||| 1 [L] COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway) -||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||-- 1 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases -----------------|||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase ||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|-- 1 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases ----------------||||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [LK] COG1200 RecG-like helicase |||||||||||||------|------|||-------------|||----|-----|---|||||-- 1 [R] COG1201 Lhr-like helicases ----------------||||||---------|||||||---------------------|||||-- 1 [J] COG1206 NAD(FAD)-utilizing enzyme possibly involved in translation ----------------||||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains) |||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||-- 1 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon) |-|||||||--||----|||-|----|||||||---||----|||||--|--||||---||-||-- 1 [M] COG1209 dTDP-glucose pyrophosphorylase |||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||-- 1 [M] COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase ------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1212 CMP-2-keto-3-deoxyoctulosonic acid synthetase |-----|||---|---|---|----------------------------|--------|----|-- 1 [M] COG1213 Predicted sugar nucleotidyltransferases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone |-|-||||||||-||||-||------|---|||-||||----|||||--|-----|---|||||-| 1 [M] COG1215 Glycosyltransferases, probably involved in cell wall biogenesis ------------------||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [T] COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response -------------||-|-||--||--||||------------|||||||||||-----|||||||| 1 [P] COG1218 3'-Phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit ----------------||-------|--------||||----|||||||||||--||||||||||| 1 [O] COG1220 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), ATPase subunit --|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||-- 1 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component --||--|-|-|--||-|----|||--||||----||||-------|---------|-------|-- 1 [H] COG1232 Protoporphyrinogen oxidase ||||-------||-----||-|----|||-----||-|-----------------|------||-- 1 [Q] COG1233 Phytoene dehydrogenase and related proteins ||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||-- 1 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III ||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---||||||| 1 [R] COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I -||------|------|-------------------------|||||-||||||||--|||||||| 1 [S] COG1238 Predicted membrane protein --|-------|-|-----||-|----|---||-|||||----|||-|-||-----|---|||||-- 1 [M] COG1247 Sortase and related acyltransferases --|-------------|----------||-|---|-||----|||||--|-----|---||-||-- 1 [C] COG1251 NAD(P)H-nitrite reductase ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1256 Flagellar hook-associated protein ----------------||------------------------||||||||-----|||||||||-- 1 [NO] COG1261 Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein --|-----------|---||--||---||-------||----------||-|||||---|||||-- 1 [S] COG1262 Uncharacterized conserved protein --||||--|-------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 1 [C] COG1271 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1 -------------|||----||--|||||-||||||||----|||||-||--|||----|||||-- 1 [R] COG1272 Predicted membrane protein, hemolysin III homolog ----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family ------------------||-------|||------------|||||-||||-|||---||||||| 1 [C] COG1282 NAD/NADP transhydrogenase beta subunit ------------------------||-----|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG1286 Uncharacterized membrane protein, required for colicin V production --------------------|----|------|||-||----|||-|---|------------|-- 1 [S] COG1288 Predicted membrane protein ---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--|||||||||||||| 1 [C] COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 1 [N] COG1291 Flagellar motor component --||------------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 1 [C] COG1294 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2 --|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG1295 Predicted membrane protein ---|--|------|-------------||--------------------||-||||--|----|-- 1 [S] COG1297 Predicted membrane protein ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1298 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhA |||---||||--|-----||-------||-|---|-||-----------|------------||-- 1 [S] COG1300 Uncharacterized membrane protein |-|---||||||----||||-|-----||||----|||-----------||||--|---||-||-- 1 [E] COG1305 Transglutaminase-like enzymes, putative cysteine proteases ----------------|-|||||||||||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG ----------------------||-------|||-----|--|||||-||||||||---||||||| 1 [S] COG1322 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [K] COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains ---------------------|--||||||------||---------------------||||||| 1 [K] COG1329 Transcriptional regulators, similar to M. xanthus CarD ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1338 Flagellar biosynthesis pathway, component FliP -||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [S] COG1354 Uncharacterized conserved protein ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 1 [N] COG1360 Flagellar motor protein |||-----||---||-||||-|----||||||--||||-----------|---|||---|||||-- 1 [E] COG1364 N-acetylglutamate synthase (N-acetylornithine aminotransferase) -----------------||||||||--||-|---||||----------||---------||--|-- 1 [T] COG1366 Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor) ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1377 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhB ------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---||||||| 1 [L] COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) ||||||||||--|-----------||-----------------------------------||||| 1 [J] COG1384 Lysyl-tRNA synthetase (class I) ----------------||||||--||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-|||||--------|||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [K] COG1386 Predicted transcriptional regulator containing the HTH domain ----------------|---------||||------------|||||-||||-|||---|||||-- 1 [OT] COG1391 Glutamine synthetase adenylyltransferase ||-|-----||||----|||-------||------|-|---------------------|||||-- 1 [R] COG1402 Uncharacterized protein, putative amidase |||||||||||||----------------------------------------------|||||-- 1 [R] COG1407 Predicted ICC-like phosphoesterases -----------------|||-|----|||||------|----|||||-|||-|--|---|||||-- 1 [E] COG1410 Methionine synthase I, cobalamin-binding domain ---|------------||---|----|||-------||----|||||-||||---|--||||||-- 1 [K] COG1414 Transcriptional regulator -----------------||||-||--||||||||||||||||----------|--|||||||||-- 1 [K] COG1420 Transcriptional regulator of heat shock gene ||-|--||-||------|||----||--------------------------|--|---|||||-- 1 [S] COG1430 Uncharacterized conserved protein ||||--||||------|-||-|--|-|---------------------||----|-||||||||-- 1 [S] COG1432 Uncharacterized conserved protein ----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---||||||| 1 [S] COG1434 Uncharacterized conserved protein ----------------|---|-||------------------|||||-||--|--|--|---||-- 1 [NU] COG1450 Type II secretory pathway, component PulD ||||--|||-------|---||----|---|-------||--|||||-||--||||||||||||-| 1 [R] COG1451 Predicted metal-dependent hydrolase ----------------|-------||----------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1452 Organic solvent tolerance protein OstA ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||-- 1 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit ||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--|||||||||||||| 1 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators ||||---||----------|-|--------||||||||-----------|-------------|-- 1 [K] COG1476 Predicted transcriptional regulators --|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||-- 1 [H] COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis -------------||------|-----||-------------|||||-||--||||---||||||| 1 [R] COG1485 Predicted ATPase -||---|||-||------||-|-----||-----------------|---|-|--|---||-||-| 1 [R] COG1487 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain |---||--|-|||---||||----------|------|----|||||-||||-------|||-|-- 1 [R] COG1489 DNA-binding protein, stimulates sugar fermentation ---------|----------|---|-----||||||||||||----------||||---|||||-- 1 [T] COG1493 Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism --|---------------||||----|||||-----||----|||-|-|-||---------|||-- 1 [G] COG1494 Fructose-1,6-bisphosphatase/sedoheptulose 1,7-bisphosphatase and related proteins ---------------------|||------------||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG1495 Disulfide bond formation protein DsbB ----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein ----||----||-||--|-|----------||-|-|-|----|||||--------|---|---|-- 1 [G] COG1501 Alpha-glucosidases, family 31 of glycosyl hydrolases ----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-||||||| 1 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes ----------------|-----||||----|----|||----|||||-||--||||||||||||-- 1 [K] COG1508 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma54 homolog -||-------------||--||--|-----------||----|||||-|-|||------||-||-- 1 [E] COG1509 Lysine 2,3-aminomutase -----------------|||----|------|----||----|||----|-|---|-----|||-- 1 [R] COG1512 Beta-propeller domains of methanol dehydrogenase type ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1519 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase ||||--|||--------|---|---|-|||------|-----|||||-||--|--|-------||| 1 [S] COG1520 FOG: WD40-like repeat ----------------||||||--||-||||----|||-|---------|--|||||||----|-- 1 [K] COG1521 Putative transcriptional regulator, homolog of Bvg accessory factor |||-||--|-||--------------|||-----||||----|||||-||||---|--||||||-- 1 [C] COG1526 Uncharacterized protein required for formate dehydrogenase activity -||-|-|||||||----||-|------||-|-----||-----------|-----|---|||||-| 1 [L] COG1533 DNA repair photolyase ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1536 Flagellar motor switch protein -------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase ----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---||||||| 1 [J] COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1) |||||||||||||--------------||----------------------------------|-- 1 [R] COG1545 Predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1558 Flagellar basal body rod protein ----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein --------------------|-||--||||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1560 Lauroyl/myristoyl acyltransferase ----------------||--|----|----|----|||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [S] COG1561 Uncharacterized stress-induced protein |--|-------|-||---||-|----|||-----|-|---------------||||---|||||-- 1 [I] COG1562 Phytoene/squalene synthetase ----------------|-||--------------------------------|||||||||||||| 1 [S] COG1565 Uncharacterized conserved protein ----------------|-----------------|-|-----|||||-|||--|||---||||||| 1 [V] COG1566 Multidrug resistance efflux pump -----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit --||||||----|---||--||-----||------|||--------|--|-----|---|||||-- 1 [R] COG1574 Predicted metal-dependent hydrolase with the TIM-barrel fold -----------------|--||--------||||||||||--|||||-||||||||||||||||-- 1 [S] COG1576 Uncharacterized conserved protein ||-|--||-||||----|||||----|||||-----------|||||-||-||------|||||-- 1 [OU] COG1585 Membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity ------------------||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 1 [M] COG1589 Cell division septal protein -----------------|--|---|-|----------|----|--||-||||-------||--|-- 1 [G] COG1593 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component ----|--------||--|||-|----|||-||||||||----|||||--|---------||-||-- 1 [IR] COG1597 Sphingosine kinase and enzymes related to eukaryotic diacylglycerol kinase |-|-----|---------||-|--------|-|-||||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [C] COG1600 Uncharacterized Fe-S protein ---|||----|||--------|||--|-------||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [I] COG1607 Acyl-CoA hydrolase ---|--------|||-|-||-|----||||----||||-----------|--|--|---||||||| 1 [O] COG1612 Uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly ------------------||-------|||-------|----|||||--|--||||---|||||-- 1 [P] COG1613 ABC-type sulfate transport system, periplasmic component -----------------||-|---|-|---------||----|--||-||||---|---||-||-- 1 [G] COG1638 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, periplasmic component -------------|||-----|--|||---------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [L] COG1643 HrpA-like helicases ||||||--|||-|||-|---|------||-|---||||----||||||||--|||----|||||-- 1 [H] COG1648 Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain) -------------------|-|--||---------||-----|||-|-||-|||||---|||||-- 1 [S] COG1652 Uncharacterized protein containing LysM domain ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1663 Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase ||||--|||-|||----|---|--------||-|||||--------------|----------|-- 1 [CP] COG1668 ABC-type Na+ efflux pump, permease component -||-----|--------||--|-------------------------------|-----|---|-- 1 [R] COG1669 Predicted nucleotidyltransferases ------------------------||----|---||||----|||||-||---------|||||-- 1 [S] COG1671 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-||||||||||||||||||---|||||-|||||||||||||||||| 1 [D] COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1677 Flagellar hook-basal body protein ---------------------|||--||||------------|||||-||||||||---||||||| 1 [K] COG1678 Putative transcriptional regulator --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 1 [GM] COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1684 Flagellar biosynthesis pathway, component FliR --------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 1 [M] COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase ----------------|---||---|--------||||||||-----------------|||||-- 1 [S] COG1692 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-| 1 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase ---||||||--||--------|----||||-------|----|||----------|-------|-- 1 [E] COG1703 Putative periplasmic protein kinase ArgK and related GTPases of G3E family -||--------------|--|---|-------||-|--||---|||---|-|---|---|||||-- 1 [S] COG1704 Uncharacterized conserved protein ----------------||-------|----------------||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1706 Flagellar basal-body P-ring protein ||||--|||||||----|------------------------|||||-||||-||-------||-- 1 [S] COG1720 Uncharacterized conserved protein -----------------|-|||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG1722 Exonuclease VII small subunit --|--------------|||-------------------------|-----------|--|-||-- 1 [N] COG1724 Predicted periplasmic or secreted lipoprotein ----------------|-------------------------|||||-||--||||---||||||| 1 [S] COG1729 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|-----||||----|-----||----||||||||||||||--|||||||| 1 [T] COG1734 DnaK suppressor protein -----------------|--------|---||||||||-|--|||||-||||-|||---|||||-- 1 [K] COG1737 Transcriptional regulators --|---------------|--------||-----|-||----|||-|--|-----|---||-||-- 1 [S] COG1742 Uncharacterized conserved protein ------------------||-|---|||||----------------------|------||||||| 1 [R] COG1754 Uncharacterized C-terminal domain of topoisomerase IA ||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega --------------------||----||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 1 [E] COG1760 L-serine deaminase --------------------|-|||||---||||||||-||||||||-||||-|||---|||||-- 1 [GT] COG1762 Phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain (Ntr-type) -||-||||-|-||---||---|----|||-|----|-|--|||||||-||---|||---||-||-- 1 [O] COG1765 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1766 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway lipoprotein -------------------|------||||---|--------|||||-||--|------||||||| 1 [E] COG1770 Protease II ||-----||--------||||---|--||-|-----------|||-|--|--||||-------|-- 1 [C] COG1773 Rubredoxin ----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----||| 1 [M] COG1792 Cell shape-determining protein |||||||||||||||||----------||-------||----------|||--||---|||-||-- 1 [L] COG1793 ATP-dependent DNA ligase --|-|||||-|||---||-|-|------------||||----|||||-||-|---|---||-||-- 1 [S] COG1801 Uncharacterized conserved protein ---------------------|------------||||----|||||-||--||||---||||||| 1 [S] COG1806 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||--|||||||||||--|---||---|----|-----------------|------------||-- 1 [S] COG1814 Uncharacterized membrane protein ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1815 Flagellar basal body protein -------------||----|----|--|-|||----------|||-|-||-----|---||-||-- 1 [F] COG1816 Adenosine deaminase ----------------||||-|||||||||----||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc) ||||||||||||----||||-|----||||-|--||||--------------------|-||||-- 1 [F] COG1828 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, PurS component ||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----|||||| 1 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E --|-------------|-||-|----|||-|----|||----|||||-||------------||-- 1 [KT] COG1842 Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1843 Flagellar hook capping protein |-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---||||||| 1 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family ----------------||--|-||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG1862 Preprotein translocase subunit YajC --|----------||----||----|--------------------|--|-----||||----|-- 1 [F] COG1864 DNA/RNA endonuclease G, NUC1 --||--|||--------|-------|----|-----||----------||-----|---||--|-- 1 [NT] COG1871 Chemotaxis protein; stimulates methylation of MCP proteins |||----|||--|------|--||----|-------------|||||-|--|-------|--|||| 1 [S] COG1872 Uncharacterized conserved protein --|--------------|--|---|-|--|||----||----|||||-||||---|---|||||-- 1 [G] COG1879 ABC-type sugar transport system, periplasmic component ---|--|||-|-|||-|--|------|||-|||-||||----|||||-||-----|------||-- 1 [H] COG1893 Ketopantoate reductase |-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---||||||| 1 [C] COG1894 NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit ---|--|||||||||------|------------||------|||||-||-|----||||||||-- 1 [R] COG1896 Predicted hydrolases of HD superfamily |-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||-- 1 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes ||||||||||||||||---|-------------------------------------------|-- 1 [O] COG1899 Deoxyhypusine synthase -----------------|--------|---||----||----|||||-------------||||-- 1 [G] COG1904 Glucuronate isomerase |-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---||||||| 1 [C] COG1905 NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit |||----|||-------||--|--------||--||------|||||-||--|--|-||----|-- 1 [P] COG1918 Fe2+ transport system protein A -----------------|||-|--|-----|---|||-----|||||-|---|------|-|||-- 1 [M] COG1922 Teichoic acid biosynthesis proteins -|--------------||------------|---||||----|||||-||||||||----||||-- 1 [R] COG1923 Uncharacterized host factor I protein --|----------||----|------||||-|---|||----||||||||||||||--||||||-- 1 [HE] COG1932 Phosphoserine aminotransferase ----------------|-||----------------------|||||-||||||||||||||||-- 1 [S] COG1934 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-------|----------|------|----|||||||----||||------|||||||||-||-- 1 [R] COG1942 Uncharacterized protein, 4-oxalocrotonate tautomerase homolog --||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||-- 1 [L] COG1943 Transposase and inactivated derivatives ----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase -|----------------------------------------||||||||||||||---||||||| 1 [U] COG1952 Preprotein translocase subunit SecB -----------||||---------------------|-----|||||--|-----|----||||-- 1 [FH] COG1953 Cytosine/uracil/thiamine/allantoin permeases ---|||-------|---|------------||||||||----|||||-||-||||-------||-- 1 [T] COG1956 GAF domain-containing protein -----||---|-------||-|----|||-|-||||||----|||||-||--|--|---|||||-- 1 [L] COG1961 Site-specific recombinases, DNA invertase Pin homologs |--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||-- 1 [V] COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein --|---------------|-||----||||-||||||-----|||||-|||||--|---|||||-- 1 [M] COG1970 Large-conductance mechanosensitive channel -------------------|------------|-|-||----|||||-|-||----||-----|-- 1 [F] COG1972 Nucleoside permease -----------------|||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|---|||||-- 1 [KT] COG1974 SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidases) --||||-||-||----|-||-|-----||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG1977 Molybdopterin converting factor, small subunit ------------------||-----------------------------|--|||||||||||||| 1 [S] COG1981 Predicted membrane protein ------||-----|------||----||||----|-||----|||||-|||--|||--||---|-- 1 [E] COG1984 Allophanate hydrolase subunit 2 ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1987 Flagellar biosynthesis pathway, component FliQ ||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 1 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases -||---||-|------||---------||--------------------------------|-|-- 1 [S] COG1993 Uncharacterized conserved protein ||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||-- 1 [R] COG1994 Zn-dependent proteases ----------------|-|||----------------|----|||||-||-|||||||||||||-- 1 [H] COG1995 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein ---------------------|--|-|||||---|||||||||||||--|||||||----|--||| 1 [S] COG2001 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-|-----||||------------------------------|||||--|||---|--|||-||-- 1 [R] COG2005 N-terminal domain of molybdenum-binding protein ---|---------||--|-|||--------|---||-|----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2008 Threonine aldolase ---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--|||||||||||||| 1 [C] COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component |-||||-|||-||----||--|--------|||----------------|------------||-- 1 [S] COG2013 Uncharacterized conserved protein -------------|-------------||-------------|||---||-------------|-- 1 [Q] COG2015 Alkyl sulfatase and related hydrolases ----------------|-||||----|||||-----||----|||||-||--||||--||||||-- 1 [H] COG2022 Uncharacterized enzyme of thiazole biosynthesis ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 1 [C] COG2025 Electron transfer flavoprotein, alpha subunit --|----------||-|----|-----||||-----|-----|||||-|--|-|||----||-|-- 1 [P] COG2032 Cu/Zn superoxide dismutase |||||||||||||-----||||----|||||------|----|||-|-||-----|---|||||-- 1 [H] COG2038 NaMN:DMB phosphoribosyltransferase --||||--|-|||---|--|-|----|||-------|-----|||||--|-|---|--||||||-- 1 [R] COG2041 Sulfite oxidase and related enzymes ------||-----|------||----||||----|-||----|||-|-|||--|||--||---|-- 1 [E] COG2049 Allophanate hydrolase subunit 1 -|---------------|||||---||---------||-|--------||-----|---||-||-- 1 [P] COG2059 Chromate transport protein ChrA ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||-- 1 [P] COG2060 K+-transporting ATPase, A chain --------|-|||---|-||------||||------------|||||-|||||--|--||||||-- 1 [T] COG2062 Phosphohistidine phosphatase SixA ----------------||------------------------||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG2063 Flagellar basal body L-ring protein |||||||||||||-------------||--|--------------|---|-|---|---||-||-- 1 [NU] COG2064 Flp pilus assembly protein TadC ------------------|||-----|---------||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2066 Glutaminase ----------------|---|---------------------|||||-|||||||-||-|||||-- 1 [I] COG2067 Long-chain fatty acid transport protein |--------||||--------|-----||-------||----|||----------|---||-||-- 1 [R] COG2068 Uncharacterized MobA-related protein --------------|-----|------|||||||-|------|||----|--------|||||||| 1 [R] COG2071 Predicted glutamine amidotransferases --||---------------|-|-----|||||---|||----|||||-||---||---||||||-- 1 [P] COG2076 Membrane transporters of cations and cationic drugs ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 1 [C] COG2086 Electron transfer flavoprotein, beta subunit -||-----------------|---|-----|-----|----------------|--|||----|-- 1 [M] COG2089 Sialic acid synthase ---||||||-|||-------||----||||-----|||--------|--|-----|---|||||-- 1 [S] COG2096 Uncharacterized conserved protein |-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||-- 1 [H] COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis --|----------|||--||----|-||||-------------------|---------||-||-- 1 [T] COG2114 Adenylate cyclase, family 3 (some proteins contain HAMP domain) ---|---------||---||-------||-------------------||-----|-------|-- 1 [S] COG2119 Predicted membrane protein ----------------|---|-----------------------------------|||--||||| 1 [S] COG2121 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|----|||||-----------|||||-||--||||||||||||-- 1 [S] COG2127 Uncharacterized conserved protein ---|---------||----|--------------|-|-----|||-|--|-----|------||-- 1 [R] COG2130 Putative NADP-dependent oxidoreductases ---|------|--||-|--|------|||-------||----|||||--|||||||--||||||-- 1 [Q] COG2132 Putative multicopper oxidases ----||--|---|--------|-----|||------------|||||-||--||||---||||||| 1 [C] COG2142 Succinate dehydrogenase, hydrophobic anchor subunit |||-||||-||||----|---|----||||-|||||||----|---------|--|---|||||-- 1 [R] COG2151 Predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme ---|------||-||-|-||------||||------------------||--|--|----||||-- 1 [H] COG2154 Pterin-4a-carbinolamine dehydratase ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||-- 1 [P] COG2156 K+-transporting ATPase, c chain ---|--||-|-||-----|-------|||-|---||-----------------------||-||-- 1 [R] COG2159 Predicted metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold ---------------------------||-----|-||----|||-|--|------------||-- 1 [Q] COG2162 Arylamine N-acetyltransferase ------------------||-|||---||-------------|||||-|||||------|||||-- 1 [R] COG2166 SufE protein probably involved in Fe-S center assembly ---------------------------||--|---|||----|||||-||-----|---|||||-| 1 [F] COG2169 Adenosine deaminase ---------|-------|--------||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG2171 Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase ------------------||-------||-------------|||-|---------------||-- 1 [M] COG2173 D-alanyl-D-alanine dipeptidase -------------------|||----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 1 [D] COG2177 Cell division protein ----------------|-||-------||--------------------|------------||-- 1 [S] COG2187 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-------|||------------|||||-||--||||---|||||-- 1 [P] COG2193 Bacterioferritin (cytochrome b1) --|-----------------||---|----||||||||----|||||-|-||------|-|--|-- 1 [E] COG2195 Di- and tripeptidases ------------------||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [TK] COG2197 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain ------------------||-|-----||-|---||------|||||-||-----|--|||-||-- 1 [T] COG2205 Osmosensitive K+ channel histidine kinase ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|--|||-||-- 1 [P] COG2216 High-affinity K+ transport system, ATPase chain B ----------------|---------||||----|-||----|||-|--|-----|----||-|-- 1 [P] COG2223 Nitrate/nitrite transporter -----------|-||------|----||||-------|----|||||-||-----|---|||||-- 1 [C] COG2224 Isocitrate lyase ----------||-|-------|----||||-------|----|||||-||-----|---|||||-- 1 [C] COG2225 Malate synthase --|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis -------------||---||-|--------------------|||||-||-|||||---||||||| 1 [H] COG2227 2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4-benzoquinol methylase |----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----||||||| 1 [P] COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain) -------------||------|---||---|-|---------|||||--|||-------|||||-- 1 [H] COG2240 Pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase ---||||||||||-----||------||||||-||||-----|---|--|-----|------||-- 1 [S] COG2246 Predicted membrane protein -|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|-- 1 [R] COG2252 Permeases -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit -------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 1 [L] COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase -----------------|------|-----|-----||-----------|------|||----|-- 1 [S] COG2257 Uncharacterized homolog of the cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB ---|-------|-||----|-|----||||----|-||----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [S] COG2259 Predicted membrane protein -------------------|-|----||||-||||-|-----|||||--|-----|---|||||-- 1 [S] COG2261 Predicted membrane protein -|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [R] COG2262 GTPases ----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase ------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase ----------------|-------|-----------------|||||||-|||------||-||-- 1 [J] COG2269 Truncated, possibly inactive, lysyl-tRNA synthetase (class II) -------------||-|---------|||||----|||---------------------|||||-- 1 [R] COG2270 Permeases of the major facilitator superfamily --------------|------|----|||-|---|-|---------|--------|-------|-- 1 [I] COG2272 Carboxylesterase type B -------------||--|---------||-|-----||---------------------||-||-- 1 [G] COG2273 Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase ------------------||----------||-|--||||||-||||-||--||||----|-||-- 1 [V] COG2274 ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain ------------------|--|-----|||-------------------|-----|---||-||-- 1 [S] COG2307 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------|------|--|-----|||-------------------|-----|---||-||-- 1 [S] COG2308 Uncharacterized conserved protein ---|-----------------|----|---------||----|||||-----|----------|-- 1 [S] COG2311 Predicted membrane protein ---|-----------------|-----||-------||----------------------|--|-- 1 [R] COG2312 Erythromycin esterase homolog --------------------||----|----|||-||-----|||||--|-----|---|--||-- 1 [S] COG2315 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----------|||-|||||--------------------------|----------|||||-- 1 [R] COG2319 FOG: WD40 repeat --|---------------||-|----|||-------------------||-----|--||||||-- 1 [S] COG2326 Uncharacterized conserved protein --|------------------|--------------------|||||-|||||------||||||| 1 [O] COG2332 Cytochrome c-type biogenesis protein CcmE --|---------------|-||--------------||----|||||-||---|||---|||||-- 1 [R] COG2334 Putative homoserine kinase type II (protein kinase fold) --|----------||---||-|-----||------------------------------||-||-- 1 [M] COG2335 Secreted and surface protein containing fasciclin-like repeats --------|----|-|---|||---||---|---||||-----------|---------|||||-- 1 [S] COG2340 Uncharacterized protein with SCP/PR1 domains ------------------|--|----||||----|-||-----------------|--||||||-- 1 [R] COG2346 Truncated hemoglobins ------------------||||----|---|-----|-----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [S] COG2350 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------|------|--------------||----|||-|--|-----|--||||||-- 1 [R] COG2351 Transthyretin-like protein ------------------||-|----|--|--||--------|||||-||||-|||-------|-- 1 [C] COG2352 Phosphoenolpyruvate carboxylase ---------------------|----|||-------------|||-|-||---|-------|-|-- 1 [S] COG2354 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------||--|||-|------|||-----------|-|-----------|-----|---|||||-- 1 [E] COG2355 Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase homolog ------------------||-|--------------------|||||-||--||||--||||||-- 1 [O] COG2360 Leu/Phe-tRNA-protein transferase -||---------------|--|-------------------------------|-----|---|-- 1 [S] COG2361 Uncharacterized conserved protein --------------|----|-|------------||||----|||||-||||-------|||||-- 1 [S] COG2363 Uncharacterized small membrane protein -----------------|-|||--------------------|||||--|-||--|---||-|||| 1 [R] COG2373 Large extracellular alpha-helical protein ---------|--------||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG2377 Predicted molecular chaperone distantly related to HSP70-fold metalloproteases --|-----|------------|--------------------|||||-|||||------|||||-- 1 [O] COG2386 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component --------|---|-------||----|----|--||------|||---||-|-------|||||-- 1 [R] COG2388 Predicted acetyltransferase ------||---||-|--|-|---------------|-|----------------------|--|-- 1 [C] COG2421 Predicted acetamidase/formamidase --|---||||||-----||-|---------||-----|----------|--------------|-- 1 [R] COG2509 Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases ----||----|||------|------|||------|||----|||-|-||--||||----|-||-- 1 [G] COG2513 PEP phosphonomutase and related enzymes ------||------|--|-|----------------------|||||-|------|--|---||-- 1 [E] COG2515 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase ----------|-|------||-----||-|-||||||-----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [S] COG2606 Uncharacterized conserved protein ----------------|-||----------|------------------|---|||--||||||-- 1 [R] COG2607 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) ---------------------|----||||------------||||||||||||||------||-- 1 [C] COG2609 Pyruvate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component ------------------------------------------|||||-||--|----------|-- 1 [E] COG2716 Glycine cleavage system regulatory protein -------------------|-|--|-----|-----------|||||--|-|---|--||||-|-- 1 [S] COG2717 Predicted membrane protein ----|------|------------------|-----||----|||||--------|--||||||-- 1 [G] COG2721 Altronate dehydratase ----||||--||--------------|---||||||||----|||||-|----------||--|-- 1 [G] COG2723 Beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/beta-galactosidase -------------------|||----||||||||||||||----------------||||||||-- 1 [K] COG2740 Predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination ---|-------|---------|----|---|---||||----------|---|--|---|||||-- 1 [Q] COG2761 Predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis -------------------|------|||-||--||-|----|||-|--|-----|----|-||-- 1 [S] COG2764 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------|---||-|-----||-------------------||-----|---|||||-- 1 [R] COG2802 Uncharacterized protein, similar to the N-terminal domain of Lon protease ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 1 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB -------------|-------|--------------||-----------|--|--|------||-- 1 [K] COG2808 Transcriptional regulator ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits -|----||-|-|-----|---|---------|||||||----||||||||||-------|||||-- 1 [J] COG2813 16S RNA G1207 methylase RsmC --|----------||------|----|||-|-----------|||||-||||-------|||||-- 1 [L] COG2816 NTP pyrophosphohydrolases containing a Zn-finger, probably nucleic-acid-binding --------------------------||||-|||||-|----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [L] COG2818 3-methyladenine DNA glycosylase ---------------------|--------|--|--|------||-|--|---|----||---|-- 1 [R] COG2819 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily ------------------||----------------------||||||||||-|||---|||||-- 1 [M] COG2821 Membrane-bound lytic murein transglycosylase --------------------------|----|||-|------|||||-||||-|||||||||||-- 1 [P] COG2824 Uncharacterized Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism ----------------||---|||||----------------|||||-||||-|||-------||| 1 [M] COG2825 Outer membrane protein --------------------------|||--|-|---|-|--|||--------|||---||--|-- 1 [L] COG2826 Transposase and inactivated derivatives, IS30 family ------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|-- 1 [U] COG2831 Hemolysin activation/secretion protein -|||----|-------|----|--||----|-----||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG2834 Outer membrane lipoprotein-sorting protein --||------|||-------------||||------------|||||-||-|||||----||||-- 1 [S] COG2835 Uncharacterized conserved protein ------------------------|-----------------||||||||||||||---|||||-- 1 [S] COG2840 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|------------------|-----||---||-||----------------||-----|-||-- 1 [M] COG2843 Putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation) --------------------------|||-------------|||||-||||-|||---|||||-- 1 [O] COG2844 UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase ----------|-----|----|----|---------------------||-|-|||--|||||||| 1 [S] COG2847 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------------------|||||-||||||||--|----||| 1 [M] COG2853 Surface lipoprotein ------------------------------------------|||||-||||||||--|----||| 1 [Q] COG2854 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, auxiliary component --------|-----------|-----|----|||||------|||||--|||-|||--||||||-- 1 [S] COG2855 Predicted membrane protein -------------||-|-------------------||----------||--|||||||||||||| 1 [C] COG2857 Cytochrome c1 ---|------||---------|----|----||---||----|||||-||||---|--||||||-- 1 [S] COG2860 Predicted membrane protein -------------------------|-----------|----|||-|--|||------|||-||-- 1 [S] COG2861 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-------------|----|--------------------|||-||||||---|||||---|-- 1 [S] COG2862 Predicted membrane protein --|----------||---|-----------------||----|||||--|---|||-------|-- 1 [E] COG2866 Predicted carboxypeptidase -------------||---------------------------|||||-||-|||||---||||||| 1 [I] COG2867 Oligoketide cyclase/lipid transport protein -|--------------|---|---------------------||||||-|||-||||||---||-- 1 [M] COG2870 ADP-heptose synthase, bifunctional sugar kinase/adenylyltransferase ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG2877 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (KDO) 8-phosphate synthase -------------------|-|----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 1 [D] COG2884 Predicted ATPase involved in cell division --|---------|-----------|-||||-------------------------||||||||||| 1 [L] COG2887 RecB family exonuclease |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors --------------------|---------||||-||-----|||||----|||||---|||||-- 1 [G] COG2893 Phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA --------------------------|||-|-----------||||||||--||||---|||||-- 1 [P] COG2895 GTPases - Sulfate adenylate transferase subunit 1 |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG2896 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme |--|------|||||-|--|-|----||||-------|----|||||-||-----|---|||||-- 1 [P] COG2897 Rhodanese-related sulfurtransferase --|-----------------------||||-|--|||------------|--|--|---|||||-- 1 [S] COG2898 Uncharacterized conserved protein -------------||------------|||------------------||--|------||||||| 1 [E] COG2902 NAD-specific glutamate dehydrogenase ------------------|---------|-------------||-||-||--||||-------|-- 1 [P] COG2906 Bacterioferritin-associated ferredoxin ---------------------------||-------------------|----||----|--||-- 1 [R] COG2907 Predicted NAD/FAD-binding protein -----------------|------------------------|||||-|||||||||||||-||-- 1 [S] COG2908 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------||||||||||||||---|||||-- 1 [S] COG2911 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|--||------------------|||||||||||--|-------|-- 1 [S] COG2912 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG2913 Small protein A (tmRNA-binding) ------------------------------------------||||||||||-|||----|||||| 1 [D] COG2917 Intracellular septation protein A ------------------------||||||-|||||||----||||||||||||||---||||||| 1 [D] COG2919 Septum formation initiator ------------------------------------------|||||-||||||||---||||||| 1 [L] COG2927 DNA polymerase III, chi subunit ------------------||--------------------------|-|---|||-----||-|-- 1 [S] COG2929 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|----------||-|--------|--|--||||||----|||||-- 1 [K] COG2932 Predicted transcriptional regulator -------------||---------------------------------||--|--|--||||||-- 1 [O] COG2935 Putative arginyl-tRNA:protein arginylyltransferase -------------||---------------------------|||||-||||||||---||||||| 1 [S] COG2938 Uncharacterized conserved protein -------------||------|------------------------------|--|-------|-- 1 [E] COG2939 Carboxypeptidase C (cathepsin A) -------------||----------------------------------|--|--|-------||| 1 [H] COG2941 Ubiquinone biosynthesis protein COQ7 ------------------||----------------------|||-|-----|--|---|||||-- 1 [G] COG2942 N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase ------------------------------------------|||-|-||--|--|-------|-- 1 [M] COG2943 Membrane glycosyltransferase ---|----|----------------------------------------|--||||---||||||| 1 [R] COG2945 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily --------------------------|||-------------|||||-||-|||||---|||||-- 1 [M] COG2951 Membrane-bound lytic murein transglycosylase B ---------------------|---------|-|-----------|---|--|---|||----|-- 1 [E] COG2957 Peptidylarginine deiminase and related enzymes ------------------------------------------|||||-||||||||---|||||-| 1 [R] COG2961 Protein involved in catabolism of external DNA --------------------------|-------||||----|||||-||||---|---|||||-- 1 [R] COG2962 Predicted permeases ---------------------|--------------------|||||-||--|--|---|||||-- 1 [P] COG2967 Uncharacterized protein affecting Mg2+/Co2+ transport --||--------------||-------||--------|----|||||-|---|------|||||-- 1 [S] COG2968 Uncharacterized conserved protein -|----------------------------------------|||||-||||-------|||||-- 1 [S] COG2983 Uncharacterized conserved protein ---|||--------------||----------|-|-||-------||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2986 Histidine ammonia-lyase ---|||--------------||----------|-|-||-------|--||-----|---|||||-- 1 [E] COG2987 Urocanate hydratase ------------------------------------------|||||-|-||-------|||||-- 1 [S] COG2989 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------------||---|||||||||||-- 1 [C] COG2993 Cbb3-type cytochrome oxidase, cytochrome c subunit ------------------------------------------|||||-|-||----|||-||||-| 1 [P] COG3004 Na+/H+ antiporter ------------------||--------------|-||-------|--||--|--|------||-- 1 [S] COG3011 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|--------------------|||||-|--|-------|-|||-- 1 [S] COG3021 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|---|-----|-----||--------|||||-||||-|||--|----|-| 1 [S] COG3022 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------------------|||||-||||||||---|||||-| 1 [V] COG3023 Negative regulator of beta-lactamase expression ------------------------------------------|||||-||||-|||----||||-- 1 [S] COG3024 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---------------------------------------|||||-||||---|------||-- 1 [S] COG3025 Uncharacterized conserved protein -----------------------|------|---||||----|||||-|||||||----||||||| 1 [S] COG3027 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|-----------------------|||||-||-||-||---|||||-| 1 [C] COG3038 Cytochrome B561 |--|--------------|-----------------------------|----------|---|-- 1 [R] COG3046 Uncharacterized protein related to deoxyribodipyrimidine photolyase ------------------------------|--|||------|||||-||||-|-|----|-||-| 1 [K] COG3070 Regulator of competence-specific genes ---------------------|--------------------|||||--||||------|||||-- 1 [O] COG3088 Uncharacterized protein involved in biosynthesis of c-type cytochromes --------------------|-----|----------|----|--||-||||-------||--|-- 1 [G] COG3090 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component -------------------||-----|---------------|||---|||-|-------|-||-- 1 [R] COG3093 Plasmid maintenance system antidote protein -------------|||----------|---||--|||-----|||||-|---|||--------|-- 1 [E] COG3104 Dipeptide/tripeptide permease ------------------------------------------|||||-|-||-------|||||-- 1 [S] COG3108 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------||||------------|||||-|||||--|---|||||-- 1 [O] COG3118 Thioredoxin domain-containing protein --||---|------|------------||-------------|||||--|||-------|||||-- 1 [P] COG3119 Arylsulfatase A and related enzymes ----------------------------------||||----||||||-|--|--|---|-|||-- 1 [C] COG3125 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 4 ------------------------------------------|||||-||-----|---|||||-- 1 [Q] COG3127 Predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component ------------------------------------------|||----|--|---------||-- 1 [S] COG3128 Uncharacterized iron-regulated protein --------------------|----------|||-|------|||||-|--||------||-||-- 1 [P] COG3142 Uncharacterized protein involved in copper resistance --------------|----|------||||------------|||-|-||--|--|---|||||-- 1 [L] COG3145 Alkylated DNA repair protein ------------------||-----------------------------|--|--|---|||||-- 1 [S] COG3146 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----------------|------|----|--||------|||||-||---------|||||-- 1 [R] COG3153 Predicted acetyltransferase ------------------------------------------|--|--||--|--|------||-- 1 [U] COG3156 Type II secretory pathway, component PulK --|-----------------------|----||---------|||||-||--|--|---|||||-- 1 [P] COG3158 K+ transporter ------------------------------------------|||||-||-||--|-------|-- 1 [S] COG3159 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------||----------------------------------|-----|---||||||| 1 [O] COG3175 Cytochrome oxidase assembly factor -------------------|-------||-------------------||-----|---|||||-- 1 [R] COG3176 Putative hemolysin -------------------------------------------------|--||||---|||||-- 1 [R] COG3178 Predicted phosphotransferase related to Ser/Thr protein kinases ------------------||------|---------------------||-----|---||-||-- 1 [ER] COG3185 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase and related hemolysins -----------------------|------------------------||-----|------||-- 1 [E] COG3186 Phenylalanine-4-hydroxylase ------||---|---------|----||||-------------------|-----|---|||||-- 1 [EQ] COG3191 L-aminopeptidase/D-esterase ----------||------|----------------|------|---|--|-----|---|-|||-- 1 [R] COG3193 Uncharacterized protein, possibly involved in utilization of glycolate and propanediol ---------------------|----|---------||-----------|-----|---|||||-- 1 [S] COG3195 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------------||---||||||-|-||-- 1 [P] COG3197 Uncharacterized protein, possibly involved in nitrogen fixation --------------------------||||-------------------|------||||||||-- 1 [E] COG3200 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase ---|--------------------------------------------||---|---------|-- 1 [S] COG3205 Predicted membrane protein ------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|-- 1 [U] COG3210 Large exoproteins involved in heme utilization or adhesion -------------------|-----------------|----------||--------|||-||-- 1 [R] COG3211 Predicted phosphatase ---------------------|-----||-------------|||-|--|---------||-||-- 1 [S] COG3214 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|---------------|----------------------|||||-||---------||-||-- 1 [R] COG3217 Uncharacterized Fe-S protein -------------------------------------------------|--|-----||||||-- 1 [R] COG3218 ABC-type uncharacterized transport system, auxiliary component ---|------|--------||-----|||--|--|--|----||||--||---------||-||-- 1 [P] COG3221 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, periplasmic component -------------------|------|----||||||-----|||-|--|---------||-||-- 1 [S] COG3237 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-------||-------|------------|-----|----|-||-- 1 [I] COG3239 Fatty acid desaturase --------|---------|--------|||------------------||-----|---||-|||| 1 [I] COG3243 Poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase ------------------------------------------------||---|||-------|-- 1 [C] COG3245 Cytochrome c5 ----||--|-|||---|--------------------|-----------|------------||-- 1 [I] COG3255 Putative sterol carrier protein ------------------|-----------------------|||||--|||---|---|||||-- 1 [M] COG3264 Small-conductance mechanosensitive channel ------------------------------------------------||---|||||||||||-- 1 [O] COG3278 Cbb3-type cytochrome oxidase, subunit 1 -------------------|----------|-----||----|-----||-----|---|||||-- 1 [QK] COG3284 Transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism ---------------------|--------------------------|---|--|-------|-- 1 [S] COG3295 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|--|--||-------------|-- 1 [U] COG3297 Type II secretory pathway, component PulL ------------------|-----------------|---------|--|-----|---||-||-- 1 [T] COG3300 MHYT domain (predicted integral membrane sensor domain) --------------------------|||-------------|||||-|--|-----------|-- 1 [S] COG3304 Predicted membrane protein ------------------------------------------|||||-||-----|----||||-- 1 [R] COG3313 Predicted Fe-S protein -|-|----|-------|---------|-------||---------|------|--------|||-- 1 [L] COG3316 Transposase and inactivated derivatives --|-----|------------------------------------|--||----------|--|-- 1 [T] COG3322 Predicted periplasmic ligand-binding sensor domain ------------------||-------||--------|-------------------------|-- 1 [R] COG3329 Predicted permease ----------------|-------------------||------------------||||||||-- 1 [S] COG3334 Uncharacterized conserved protein |-|---------------||----------|-----||-----------------|---|||||-- 1 [S] COG3339 Uncharacterized conserved protein --|-|------|--|---------------|-----------|||||--|-|---|-------|-- 1 [S] COG3384 Uncharacterized conserved protein -||-||-----|-||----|------|||-|------------------------|---|--||-- 1 [G] COG3387 Glucoamylase and related glycosyl hydrolases --|----------------|----|--||------|-|-------------------------|-- 1 [R] COG3393 Predicted acetyltransferase --|---------------------------------------||||---|-|-||----|-|||-- 1 [S] COG3422 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||---------|-----||||||--------|-----------------|-- 1 [I] COG3425 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase ------------------------------|----|||----|||-|--------|------||-- 1 [L] COG3449 DNA gyrase inhibitor ---|--------------------------|--------|------|-----|--|||-||||||| 1 [U] COG3451 Type IV secretory pathway, VirB4 components ----------------------------------------------------|||----|||||-- 1 [S] COG3453 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|---------------------------|-----|------||-- 1 [E] COG3483 Tryptophan 2,3-dioxygenase (vermilion) --------------|------------------------------|---|-----|--|---||-- 1 [R] COG3491 Isopenicillin N synthase and related dioxygenases ------------------------------------------------||---------||-||-- 1 [S] COG3492 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|---|--------------------------------------||||||| 1 [S] COG3494 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------||-------------------|----------|--||-- 1 [S] COG3496 Uncharacterized conserved protein -------------------|-|-----||------------------------------|||||-- 1 [S] COG3502 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-|-----|----------------------------------------|-----|---|||||-- 1 [S] COG3503 Predicted membrane protein -----------|------------------------------------||-----|----|-||-- 1 [Q] COG3508 Homogentisate 1,2-dioxygenase --------------------------||||-------------------|-----|---||-||-- 1 [Q] COG3509 Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase -----------|---------------||--------------------|-----|------||-- 1 [M] COG3511 Phospholipase C -------------------------------|-|--------------|---|------||--|-- 1 [G] COG3525 N-acetyl-beta-hexosaminidase -----------------|-------------------|-----||-|------------||-||-- 1 [S] COG3533 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|------------|-----||---------------------||-||-- 1 [G] COG3534 Alpha-L-arabinofuranosidase -------------|----|--------------||--------------------|---||-||-- 1 [S] COG3542 Uncharacterized conserved protein ---------------------|------------|-||-----------|-----|---|||||-- 1 [R] COG3545 Predicted esterase of the alpha/beta hydrolase fold |--------------------|---------|------------------------------||-- 1 [S] COG3548 Predicted integral membrane protein ------------------------------------------------||-----------|||-- 1 [S] COG3553 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------||----|------------------|------|||||-- 1 [H] COG3572 Gamma-glutamylcysteine synthetase -------------------|-|---------|-|-----------|--|----------|--||-- 1 [S] COG3575 Uncharacterized protein conserved in bacteria |||----------------|||-----|||--|----------------|---------||-||-- 1 [R] COG3576 Predicted flavin-nucleotide-binding protein structurally related to pyridoxine 5'-phosphate oxidase -------------------------------------------------|---------||||||| 1 [R] COG3577 Predicted aspartyl protease --|-----------------------||||-|||------------------|----------|-- 1 [O] COG3590 Predicted metalloendopeptidase --------------------------|----|------|-------------|--------|-|-- 1 [S] COG3600 Uncharacterized phage-associated protein ------------------------------------------------||----------|-||-- 1 [S] COG3602 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||---------|||||-- 1 [T] COG3605 Signal transduction protein containing GAF and PtsI domains --|-----------|----------|-----|------|----------|-----|---|--||-- 1 [F] COG3613 Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase -------------||-----|-----|||--------------------|-----|---|||||-- 1 [E] COG3616 Predicted amino acid aldolase or racemase --||-----------------|-----||-------|------------|---------|--||-- 1 [R] COG3631 Ketosteroid isomerase-related protein -------------------------------||-|-|-----|||-|--|--|--|-------|-- 1 [O] COG3634 Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit ---------------------------------------------|----|-|--|----|--|-- 1 [K] COG3636 Predicted transcriptional regulator ---|---------------||-----|----|--|--|-|--||||---|---------||-||-- 1 [P] COG3638 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component ---|------|--------||-----|----|--|--|-|||||||---|---------||-||-- 1 [P] COG3639 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component ---------------------|---------------------------|-----|-------|-- 1 [S] COG3644 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|----------------------------||-------------|-- 1 [S] COG3650 Predicted membrane protein ------------------||-------||----------------------------------|-- 1 [S] COG3651 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|---------------------------|----------|-||-- 1 [S] COG3652 Predicted outer membrane protein -------|-------------------||--------------------------|-------|-- 1 [Q] COG3653 N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase -------------------|-------------|-----|-----||-||---|-------|-|-- 1 [R] COG3654 Prophage maintenance system killer protein ---------------------|------------------------------|----------|-- 1 [S] COG3656 Predicted periplasmic protein -------------------|-------------------------|----|-|--|----|--|-- 1 [S] COG3657 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------------|----|||-------|-- 1 [C] COG3658 Cytochrome b ------------------|------------------------------|-----|-------|-- 1 [M] COG3659 Carbohydrate-selective porin ----------------------------------------------------|-------|--||| 1 [M] COG3660 Predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerase -----------------|-------------------|-------------------------|-- 1 [G] COG3661 Alpha-glucuronidase ---------------------------||--------------------|-----|-------|-- 1 [S] COG3662 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-----------|------|--------------------|||-|----|-|||--|----|-- 1 [L] COG3663 G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase ----------------------------------||-|-----------|----------|--|-- 1 [G] COG3664 Beta-xylosidase -------------------------------------------------|--|--|-------|-- 1 [P] COG3667 Uncharacterized protein involved in copper resistance -----------|-----|---------------|------------------|----------|-- 1 [G] COG3669 Alpha-L-fucosidase ------------------------------------------------||---------|||||-- 1 [S] COG3672 Predicted periplasmic protein -------------|-----------------------------------|-------------|-- 1 [S] COG3673 Uncharacterized conserved protein -------------------|-----------------------------|---|||---|-|-|-- 1 [S] COG3686 Predicted membrane protein ---------------------------||--------------------|-----|-------|-- 1 [R] COG3687 Predicted metal-dependent hydrolase ------------------------------------------|||-----|--|---------|-- 1 [S] COG3692 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------------------------|--|---|--||-- 1 [U] COG3701 Type IV secretory pathway, TrbF components ----------------------------------------------------|------|||||-| 1 [U] COG3702 Type IV secretory pathway, VirB3 components -------------||---------------------|-----|||----------|---|||||-- 1 [P] COG3703 Uncharacterized protein involved in cation transport ----------------------------------------------------|------||||||| 1 [U] COG3704 Type IV secretory pathway, VirB6 components ----------------|-||-|--------||---|||-----------|---|||---|||||-- 1 [E] COG3705 ATP phosphoribosyltransferase involved in histidine biosynthesis --------------------|------||||----|-------------|-----|---||-||-- 1 [T] COG3707 Response regulator with putative antiterminator output domain --------------------|---------------------|||||-|--|---|---||-||-- 1 [M] COG3713 Outer membrane protein V ---------------------------||-------------|||||-|------|-----|||-- 1 [S] COG3714 Predicted membrane protein ------------------------------------||----|||||------------||--|-- 1 [G] COG3717 5-keto 4-deoxyuronate isomerase --------------------------|--------|||-------||--------|---|||||-- 1 [G] COG3718 Uncharacterized enzyme involved in inositol metabolism ------------------------------------------|||-|---||-------|||||-- 1 [J] COG3719 Ribonuclease I ------------------------------------------|||-|-------||----|--|-- 1 [L] COG3727 DNA G:T-mismatch repair endonuclease -------------------|----------------|-----|||-|--|-------------|-- 1 [R] COG3729 General stress protein ------------------------------------------|---|--------|---|||||-- 1 [G] COG3734 2-keto-3-deoxy-galactonokinase ------------------------|-----|-----------|||||-|----------|||||-- 1 [S] COG3735 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------------------------||||---|||||-- 1 [S] COG3737 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||-|--|-|-----------|-- 1 [S] COG3738 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|---|||-------------|-------|---|-- 1 [S] COG3739 Uncharacterized integral membrane protein ---------------------------||--|---|-------||-|--------|---|---|-- 1 [R] COG3740 Phage head maturation protease ---------------------------||-------------------------------|-||-- 1 [S] COG3742 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|-------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG3743 Uncharacterized conserved protein -------------------------------------------------|-----|---||-||-- 1 [U] COG3745 Flp pilus assembly protein CpaB -------------------------------------------------|--|----------|-- 1 [P] COG3746 Phosphate-selective porin -------------------------------------------------|-----|---|||||-- 1 [S] COG3749 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------------------------------||||||| 1 [S] COG3750 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------|------------||--|---|-----------------------|--||-- 1 [S] COG3752 Predicted membrane protein -------------------------------||--------------------------|--||-- 1 [M] COG3754 Lipopolysaccharide biosynthesis protein -------------------------------|-----------------|---------|||||-- 1 [S] COG3760 Uncharacterized conserved protein -----------------------------------------------------------||||||| 1 [C] COG3761 NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit ------------------------|--------------------------|---|-----|||-- 1 [S] COG3762 Predicted membrane protein -------------------|----------|-----------|||||-----|--|------||-| 1 [R] COG3772 Phage-related lysozyme (muraminidase) -------------||----------------------------------|-----------|-|-- 1 [S] COG3777 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||||--|-------------|-- 1 [S] COG3784 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||------------|||||-- 1 [S] COG3785 Uncharacterized conserved protein ---------------------------||||----|-----------------------|||||-- 1 [S] COG3786 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|----------------------|||||-|--------------|-- 1 [R] COG3788 Uncharacterized relative of glutathione S-transferase, MAPEG superfamily ------------------------------------------|||-|--|-------------|-- 1 [S] COG3789 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------||----|-|-----------------------||-||-- 1 [S] COG3797 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|----------------------------------------||-- 1 [S] COG3798 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|||------------------------------|||||-- 1 [R] COG3800 Predicted transcriptional regulator -------------------------------------------------|---------|||||-- 1 [S] COG3802 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------------|-----|---|||||-- 1 [S] COG3803 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------------|------|------||-- 1 [T] COG3806 Anti-sigma factor -----------------------------------------------------------||||||| 1 [S] COG3807 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-------|------|--|--------------------------------------|||||-- 1 [C] COG3808 Inorganic pyrophosphatase ----------|-----------------------------------------------|---||-- 1 [S] COG3809 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------------------|--|----------|-||-- 1 [S] COG3811 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------------|-----|------||-- 1 [S] COG3812 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------------|-----|---||-||-- 1 [S] COG3813 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------------------------------||||||| 1 [S] COG3814 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------------|---------|||||-- 1 [S] COG3816 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------||-----------|---------|--|----|-- 1 [S] COG3817 Predicted membrane protein ----------------------------------------------------|---------||-- 1 [R] COG3818 Predicted acetyltransferase, GNAT superfamily --------------------------------||-----------|---------|--|----|-- 1 [S] COG3819 Predicted membrane protein -----------------------------------------------------------||||||| 1 [S] COG3820 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------------|---------||-||-- 1 [S] COG3821 Predicted membrane protein ---------------------|----|-----|------------|-----------------|-- 1 [O] COG3823 Glutamine cyclotransferase --------------------------|||-------------------------------||||-- 1 [S] COG3824 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-----------------------------|-----|------||-- 1 [S] COG3825 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------||--------------------------|------||-- 1 [S] COG3826 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------------------------------||||||| 1 [S] COG3827 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------|---------------------||-||-- 1 [S] COG3828 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|--------------|--------|||-|---||||-----------|-----|---||-||-- 1 [S] COG3832 Uncharacterized conserved protein -------------------|----------|-----------------|------|----|-||-- 1 [S] COG3837 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain ----------------------------------------------------|--|---||-|||| 1 [U] COG3838 Type IV secretory pathway, VirB2 components (pilins) --||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components ------------------------------------------|||||-||--|--|---|||||-- 1 [T] COG3852 Signal transduction histidine kinase, nitrogen specific ---------------------------------------------||--------|---|||||-- 1 [S] COG3892 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------------------|||||||||-- 1 [L] COG3893 Inactivated superfamily I helicase -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG3898 Uncharacterized membrane-bound protein -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG3908 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------------|----------|--||-- 1 [R] COG3911 Predicted ATPase ------------------||---------------------------------------||--|-- 1 [R] COG3932 Uncharacterized ABC-type transport system, permease components -----|-----|-----|---------------------------------------------|-- 1 [G] COG3934 Endo-beta-mannanase -------------------------------||||----------------------------|-- 1 [R] COG3942 Surface antigen --------------------------|--------|||-------||--------|---|||||-- 1 [E] COG3962 Acetolactate synthase -----------|---------------------------------|-------------||-||-- 1 [R] COG3970 Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein ---------------------|-----||-------------|||||--|-|---|---|-|-|-- 1 [Q] COG3971 2-keto-4-pentenoate hydratase -|----------------------------|-----|-------------------|-|----|-- 1 [M] COG3980 Spore coat polysaccharide biosynthesis protein, predicted glycosyltransferase -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG4093 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||---------------------------------------||--|-- 1 [S] COG4094 Predicted membrane protein ----------------|-------------------------|||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG4105 DNA uptake lipoprotein ------------------||-|----|---||||||------||||||||||||||---|||||-- 1 [J] COG4108 Peptide chain release factor RF-3 -----------------------------------------------------||----||-||-- 1 [R] COG4111 Uncharacterized conserved protein ||--------------|-||-|---|----------------|||||-||||---|--|||--|-- 1 [S] COG4121 Uncharacterized conserved protein ----------------||--|---------||||||||||--|||||-|-||----||||||||-- 1 [R] COG4123 Predicted O-methyltransferase --|---------------------------|---------------|----------------|-- 1 [S] COG4127 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||||-|||||------||||||| 1 [O] COG4133 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, ATPase component --|---------|---|-||------|||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [P] COG4149 ABC-type molybdate transport system, permease component -||----------------------------|-|||||-------------------------|-- 1 [R] COG4152 ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component ------------------------------------------|||||-||-----|---||-||-- 1 [Q] COG4181 Predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, ATPase component ------------------||-----------------|-----------|-----|---|---|-- 1 [R] COG4188 Predicted dienelactone hydrolase ------------------------------|------|-------------------------|-- 1 [S] COG4200 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-------||--------|----|||||-||--||||---|||||-- 1 [P] COG4208 ABC-type sulfate transport system, permease component -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG4223 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||--|-|-|||---|||||-- 1 [C] COG4230 Delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase |-|-|||||-||------------------|------------------------|------||-- 1 [C] COG4231 Indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha and beta subunits ----------------------||------------------|||||-||||||||--|----|-- 1 [OC] COG4232 Thiol:disulfide interchange protein ----------------------||----------------------|------------|||||-- 1 [OC] COG4233 Uncharacterized protein predicted to be involved in C-type cytochrome biogenesis ------------------------------------------|||||--||||------|||||-- 1 [O] COG4235 Cytochrome c biogenesis factor -------------||----|-------------------------------------------|-- 1 [R] COG4240 Predicted kinase ------------------||-------------------------------------------|-- 1 [QP] COG4242 Cyanophycinase and related exopeptidases -----------------------------------------------------------||-||-- 1 [S] COG4246 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|----------------|--------------------------|-- 1 [I] COG4247 3-phytase (myo-inositol-hexaphosphate 3-phosphohydrolase) ------------------||-|---------------------------|-----|----|--|-- 1 [T] COG4252 Predicted transmembrane sensor domain -------------------------------------------------|-----|----|--|-- 1 [S] COG4254 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|------------------------------------|------------|--|-------|-- 1 [K] COG4271 Predicted nucleotide-binding protein containing TIR -like domain |-------------------|---------|----------------------------|---|-- 1 [R] COG4277 Predicted DNA-binding protein with the Helix-hairpin-helix motif -------------------|-|-----------------------------------------|-- 1 [S] COG4299 Uncharacterized conserved protein ---------------------------|-|-------------------------|-------|-- 1 [Q] COG4308 Limonene-1,2-epoxide hydrolase ----------------------------------------------------|--|-------|-- 1 [S] COG4322 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------------|-----|-------|-- 1 [S] COG4323 Predicted membrane protein -------------------|----------------------------|--------------|-- 1 [S] COG4337 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|----------------------------|--------------|-- 1 [S] COG4338 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|----------------------------|--------------|-- 1 [S] COG4340 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|-----------------------------------------|-| 1 [S] COG4374 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------------------------||||---|||-|-| 1 [S] COG4391 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------------||-----|---||||||| 1 [S] COG4395 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|----|||--|---------------------------||-||-- 1 [S] COG4420 Predicted membrane protein ---------------------------||------------------------------||--|-- 1 [S] COG4427 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|--------------||||----------------------|-||-- 1 [S] COG4430 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-----------------------------|-------------|-- 1 [R] COG4447 Uncharacterized protein related to plant photosystem II stability/assembly factor ------------------||-------------------------------------------|-- 1 [R] COG4449 Predicted protease of the Abi (CAAX) family ------------------|---------------------------|---|-|-------|-||-- 1 [S] COG4456 Virulence-associated protein and related proteins -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG4530 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------|-------|||||-||||---|----|||||| 1 [P] COG4536 Putative Mg2+ and Co2+ transporter CorB ---|-------------------------------------------------------|---|-- 1 [S] COG4538 Uncharacterized conserved protein -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG4544 Uncharacterized conserved protein ---------------------------------------------|-------------|||||-- 1 [H] COG4547 Cobalamin biosynthesis protein CobT (nicotinate-mononucleotide:5, 6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase) -------------------------------------------------------|---||-|||| 1 [I] COG4553 Poly-beta-hydroxyalkanoate depolymerase ----------------------------------------------|--|-|---|---|||||-- 1 [T] COG4566 Response regulator ------------------||-|----|||-||||||||-----------|-----|---||-||-- 1 [T] COG4585 Signal transduction histidine kinase ----------------|----------------------------|---|---------||-|||| 1 [R] COG4618 ABC-type protease/lipase transport system, ATPase and permease components ---------------------|---------------------------|-----|---|||||-- 1 [F] COG4631 Xanthine dehydrogenase, molybdopterin-binding subunit B ----------------|-||-|-----------------------------------------|-- 1 [S] COG4636 Uncharacterized protein conserved in cyanobacteria -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG4649 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------||--------------||----------|---|--||-- 1 [R] COG4653 Predicted phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein ------------------------------|||---------|||----------|---|-|||-- 1 [S] COG4695 Phage-related protein -------------------------------------------||----------|-------|-- 1 [S] COG4700 Uncharacterized protein conserved in bacteria containing a divergent form of TPR repeats -------------------|-----------------------------------|-------|-- 1 [S] COG4704 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|-||||---------------------------|-- 1 [S] COG4709 Predicted membrane protein --||---------------|-|--------------------------|--------------|-- 1 [S] COG4715 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------------|-----|||||-|-||-- 1 [O] COG4736 Cbb3-type cytochrome oxidase, subunit 3 -----------------------------------------------------------||||||| 1 [S] COG4765 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|------|------||--|--|-- 1 [P] COG4772 Outer membrane receptor for Fe3+-dicitrate ------------------------------------------|||----|--|----------|-- 1 [P] COG4774 Outer membrane receptor for monomeric catechols -------------||-||||||||||----------------|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87 ----------------|-||----------------------|||||-||--|--|-----|||-- 1 [R] COG4783 Putative Zn-dependent protease, contains TPR repeats ------------------------------------------|||||-|||||--|-------|-- 1 [U] COG4795 Type II secretory pathway, component PulJ --|------------------|----|------------------------------------|-- 1 [S] COG4891 Uncharacterized conserved protein --------------------------|---------------------------|--------|-- 1 [S] COG4899 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------------------|||||-|||||||----|||||-- 1 [D] COG4942 Membrane-bound metallopeptidase -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG4944 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------------------------------||-||-- 1 [S] COG4949 Uncharacterized membrane-anchored protein conserved in bacteria -------------------||---------------------|||-|----||------||-||-| 1 [M] COG4953 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC ---------------------------------------------|---|-|---|---||-||-- 1 [OU] COG4960 Flp pilus assembly protein, protease CpaA ||----||-|----------------|||-|--------------|---|-||--|---||-||-- 1 [U] COG4962 Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF ---------------------------------------------|---|-|---|---||-||-- 1 [U] COG4963 Flp pilus assembly protein, ATPase CpaE ---------------------|---------------------------|-|---|---||-||-- 1 [U] COG4964 Flp pilus assembly protein, secretin CpaC --------------------------|||----------------|---|-|---|---||-||-- 1 [U] COG4965 Flp pilus assembly protein TadB --------------------|---|-|||||---||||----|||||-||||||||---||||||| 1 [L] COG4974 Site-specific recombinase XerD -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [R] COG4976 Predicted methyltransferase (contains TPR repeat) -------------------------------|--||||----|||||-|-||-------|-|-|-- 1 [CO] COG4987 ABC-type transport system involved in cytochrome bd biosynthesis, fused ATPase and permease components --------------------|-----|||--||-||||----|||||-|-||-------|-|-|-- 1 [CO] COG4988 ABC-type transport system involved in cytochrome bd biosynthesis, ATPase and permease components ------------------||-------------------------------------------|-- 1 [S] COG4995 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|------------------------------------|||---||||||| 1 [T] COG5000 Signal transduction histidine kinase involved in nitrogen fixation and metabolism regulation -------------------------------------------------------|---|---|-- 1 [T] COG5001 Predicted signal transduction protein containing a membrane domain, an EAL and a GGDEF domain ---------------------|----|---------------|||||-||-----|------||-- 1 [R] COG5006 Predicted permease, DMT superfamily ----------------|-------||----------------|||||-||||||||---||||||| 1 [M] COG5009 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein ---------------------------------------------|---|-|---|---||-||-- 1 [U] COG5010 Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeats --------------|----------------------------------------|-----|-|-- 1 [F] COG5042 Purine nucleoside permease ---------------------------------|-------------------------|--||-- 1 [S] COG5255 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------||------------------------------|---------|---||||||| 1 [O] COG5265 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease and ATPase components -------------------|-|---------------|-----------------|---|--||-- 1 [T] COG5278 Predicted periplasmic ligand-binding sensor domain ------------------|--------------------------------------------|-| 1 [S] COG5304 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG5317 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------------------|---|||||-- 1 [S] COG5319 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG5321 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|--------------------------------------------------------|-|-|-- 1 [S] COG5323 Uncharacterized conserved protein -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG5328 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------------------------------||||||| 1 [S] COG5336 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG5338 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG5360 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|--------------------------------|-------------------|----|-||-- 1 [S] COG5361 Uncharacterized conserved protein -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG5385 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------||--------------------------------------------|||-|-- 1 [O] COG5387 Chaperone required for the assembly of the mitochondrial F1-ATPase -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG5388 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG5389 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------------------|---||-||-- 1 [S] COG5394 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------------------------------|-|||-- 1 [S] COG5395 Predicted membrane protein -----------------------------------------------------------||-||-- 1 [S] COG5397 Uncharacterized conserved protein -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG5400 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||-------|--------||||----|||||||||||--||||||||||| 1 [O] COG5405 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), peptidase subunit -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [E] COG5425 Usg protein, probable subunit of phosphoribosylanthranilate isomerase -------------------------------------------------------|---|||||-- 1 [S] COG5429 Uncharacterized secreted protein -------------|---|------------|------------------------|---|---|-- 1 [M] COG5434 Endopolygalacturonase -----------------------------------|-|---------------------|-|-|-- 1 [S] COG5437 Predicted secreted protein -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [N] COG5442 Flagellar biosynthesis regulator FlaF -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [N] COG5443 Flagellar biosynthesis regulator FlbT -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG5447 Uncharacterized conserved protein -----------------------------------------------------------|-|-|-| 1 [S] COG5448 Uncharacterized conserved protein -----------------------------------------------------------|-|-|-| 1 [S] COG5449 Uncharacterized conserved protein ---------------------------|||-----------------------------|---|-- 1 [K] COG5450 Transcription regulator of the Arc/MetJ class -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG5451 Predicted secreted protein -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG5452 Uncharacterized conserved protein -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG5454 Predicted secreted protein ------------------------------------------|||-|--------|---|||||-- 1 [S] COG5455 Predicted integral membrane protein -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [P] COG5456 Predicted integral membrane protein linked to a cation pump -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG5458 Uncharacterized conserved protein -------------------------------------|-------|-------------|---|-- 1 [S] COG5460 Uncharacterized conserved protein -----------------------------------------------------------||-||-- 1 [N] COG5461 Type IV pili component ------------------------------------------|||||------------|---|-- 1 [S] COG5463 Predicted integral membrane protein ----------------------||-----------------------------------|||||-- 1 [S] COG5465 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------------------------||||-- 1 [S] COG5467 Uncharacterized conserved protein -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG5468 Predicted secreted (periplasmic) protein -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG5481 Uncharacterized conserved small protein containing a coiled-coil domain -------------------------------------------------------|---|||||-- 1 [S] COG5488 Integral membrane protein -------------------------------------------------------|---||-||-- 1 [S] COG5489 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------------------------|-||-- 1 [S] COG5490 Uncharacterized conserved protein ----------------------------------------------------|-------|||||| 1 [S] COG5508 Uncharacterized conserved small protein ------------------------------------------------------------||||-- 1 [S] COG5509 Uncharacterized small protein containing a coiled-coil domain -------------------------------------------|--|--------|-----|-|-| 1 [S] COG5510 Predicted small secreted protein ------------------------------|-----|---------|----------------|-- 1 [M] COG5520 O-Glycosyl hydrolase -------------------|------------------------------------------||-- 1 [S] COG5526 Uncharacterized conserved protein -------------------------------------------------|----------|--|-- 1 [S] COG5528 Predicted integral membrane protein --|------------------------------------------|-----------------|-- 1 [R] COG5529 Pyocin large subunit -----------------------------------------------------------|||||-- 1 [S] COG5568 Uncharacterized small protein ------------------------------------------------------------||||-- 1 [S] COG5570 Uncharacterized small protein -------------------------------------------------------|----|--|-- 1 [S] COG5572 Predicted integral membrane protein ------------------------------------------------|-----------|--|-- 1 [S] COG5589 Uncharacterized conserved protein -------------||------------------------------------------------||| 1 [S] COG5590 Uncharacterized conserved protein -----------------------------------------------------------|--||-- 1 [S] COG5612 Predicted integral membrane protein -------------------------------------|-------------------------|-| 1 [R] COG5628 Predicted acetyltransferase -------------------------------------------------------|------||-- 1 [S] COG5639 Uncharacterized conserved small protein --------------------------|----|---|||-------------------------|-- 1 [S] COG5646 Uncharacterized conserved protein --|-----|-----------------|--------||--------------------------|-- 1 [S] COG5658 Predicted integral membrane protein