| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ --------------------|-||------------|--------||--|---||---|------- 27 [S] COG2849 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 12 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily --|-||--|----||---||||----|||--|||||-|||--|||||-|||--|||---|||||-- 12 [L] COG2801 Transposase and inactivated derivatives |||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 10 [R] COG0457 FOG: TPR repeat |||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 9 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases ||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 9 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump ---|--||----|-------|----|----|---|-||-------||-|-||-||-|||------- 9 [C] COG1757 Na+/H+ antiporter |||-----||---||---|||---|-----||||-||-----|||||||||||--||||------- 8 [C] COG0716 Flavodoxins --|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||--- 8 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component |||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 7 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||--- 7 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components --||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 7 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||--- 7 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components --|----------------||---------|-|||--|-----------|---------||--|-- 7 [L] COG3666 Transposase and inactivated derivatives |||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins --|---||------------|||||-|-----|||-||----|||-|-||||-||-|||-||---- 6 [E] COG1115 Na+/alanine symporter -||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||-- 6 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components |-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 6 [K] COG1309 Transcriptional regulator ----------------|--||-||||-||-------------|||||||||||||||||||||||| 6 [M] COG2885 Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins -----|--------------||----|||--|||||-|----|||||-|||----|---|||||-- 6 [L] COG2963 Transposase and inactivated derivatives --|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||--- 5 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component |-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes -||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||-- 5 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component -||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||-- 5 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component ----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||---||-- 5 [M] COG0859 ADP-heptose:LPS heptosyltransferase ||||----|||||---|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component --------------------|----|------|||-||----|||-|---|------------|-- 5 [S] COG1288 Predicted membrane protein |-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---||||||| 5 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators ----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||-- 5 [P] COG1629 Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport --|--------|-------||-----||||--||---|-------|---|---||----||-||-- 5 [L] COG3547 Transposase and inactivated derivatives --|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||--- 5 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component ||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases ||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis |||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [R] COG0517 FOG: CBS domain ||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 4 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component --||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) |-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 4 [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit --|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||-- 4 [G] COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase |-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-|| 4 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 4 [C] COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit -||-|-||--||-----|--|------||----|-|--------------|-----|||---|--| 4 [R] COG1373 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) --||||||---|-----|||||----|||-||-|||||----|||----|||---|--||||||-- 4 [R] COG1473 Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase --|-----------------||---|----||||||||----|||||-|-||------|-|--|-- 4 [E] COG2195 Di- and tripeptidases -|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|-- 4 [R] COG2252 Permeases ------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|-- 4 [U] COG2831 Hemolysin activation/secretion protein ------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|-- 4 [U] COG3210 Large exoproteins involved in heme utilization or adhesion |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control |-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 3 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases ||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0438 Glycosyltransferase |||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||-- 3 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases -------------||-||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain ||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases --||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|----- 3 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific |||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0582 Integrase ---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||-- 3 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase --||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases ----------------|||||||||||||-|||||||||---|||||||||||||||||||||||| 3 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases ----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-|||| 3 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat ----------------||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain |||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [C] COG0778 Nitroreductase ------------------|-|-----|-------|-------|||||-|||--||-||-------- 3 [E] COG0786 Na+/glutamate symporter --|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump ----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0845 Membrane-fusion protein --|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) ----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||-- 3 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases -|----||---|-------||-----------------------------------||-------- 3 [R] COG1106 Predicted ATPases |-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 3 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components ----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||-- 3 [KE] COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs --||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-|||| 3 [C] COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters --||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|--- 3 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases -----------------|--|---|-|----------|----|--||-||||-------||--|-- 3 [G] COG1593 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component ||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||-- 3 [K] COG1733 Predicted transcriptional regulators --------------------|-|||||---||||||||-||||||||-||||-|||---|||||-- 3 [GT] COG1762 Phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain (Ntr-type) --------|--|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-| 3 [I] COG1788 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit --||------|-|-----|||-----|-----|||--|-----||||-||||||||--|||||--- 3 [P] COG1840 ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component ---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||-- 3 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase ----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 3 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator ---|||--|-||||-----|||----|||||---|-||----|||||-||---|||---|||||-- 3 [I] COG1960 Acyl-CoA dehydrogenases ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 3 [C] COG2025 Electron transfer flavoprotein, alpha subunit -||---|-|---|-----|||------||----|--------|--||-|------|---||----- 3 [JD] COG2026 Cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system -----------|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-| 3 [I] COG2057 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit |-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||-- 3 [P] COG2217 Cation transport ATPase --|-----------------|-----|---|-|-|-||----|||||-||||-|||---------- 3 [GE] COG2610 H+/gluconate symporter and related permeases --|----|------------||----|-----------|-------------------|------- 3 [K] COG2865 Predicted transcriptional regulator containing an HTH domain and an uncharacterized domain shared with the mammalian protein Schlafen --||------------|--||-----|-----|-||-------|||---|-|-|||||-||-|--| 3 [S] COG3177 Uncharacterized conserved protein --|--|-------------||-----|||----||--|-----------------|---||-|--- 3 [L] COG3464 Transposase and inactivated derivatives --|-----------------|----------------|-----||||---||||||----|||--- 3 [UW] COG5295 Autotransporter adhesin ||-|||-|-||-|||-|-|||------|||-----|-|---------------------------- 2 [P] COG0003 Oxyanion-translocating ATPase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase |||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||--- 2 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family --||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0031 Cysteine synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0073 EMAP domain ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase ||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||---- 2 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases |-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 2 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase |-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||-- 2 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase ---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family ----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III --|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase ----||----||||||--||||----|||-----|-||----|||-|-||--||||||-||-||-- 2 [E] COG0405 Gamma-glutamyltransferase --|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||-- 2 [G] COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase ||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||---------------- 2 [L] COG0419 ATPase involved in DNA repair |||---|||-------|||||---------|-----------|||-|--|-----|---------- 2 [C] COG0426 Uncharacterized flavoproteins |||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division -----------------|||||||--||||||-|--||----|||||-|-||-------||-|--- 2 [G] COG0448 ADP-glucose pyrophosphorylase ||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains ||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 2 [R] COG0456 Acetyltransferases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 2 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases) |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain -------------|||--||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains ||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0492 Thioredoxin reductase ||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||--- 2 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins -------------||-----|---|------|||||||-||||||||-|-|-----------|--- 2 [M] COG0510 Predicted choline kinase involved in LPS biosynthesis ||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase |-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase |-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|--- 2 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily --||--|||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases --------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [J] COG0566 rRNA methylases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32) ||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||---- 2 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component ||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [K] COG0583 Transcriptional regulator --|----------||-----|-||||||||||||||------||||||--||||||----||||-- 2 [G] COG0588 Phosphoglycerate mutase 1 |-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-|| 2 [ER] COG0591 Na+/proline symporter |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog) |-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-|||| 2 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase ||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease |||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----|||||||||||||||||||||||| 2 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class) |||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase ||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K ---|--|||--||||-||--|-----|||--|||||||----|||||--|--------|||||||| 2 [G] COG0647 Predicted sugar phosphatases of the HAD superfamily |-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family -------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases -||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||-- 2 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase -|||--|||-------|---|-|||-|------|||||----------|-||-||-|||------- 2 [R] COG0733 Na+-dependent transporters of the SNF family ----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-| 2 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake -------------|||||||||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2 ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein ----||----------||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein |-|---|||-|-|---||||||--|-||||--||--||------------||----||-||||--- 2 [O] COG0785 Cytochrome c biogenesis protein --------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0787 Alanine racemase -----------------|||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [R] COG0795 Predicted permeases ----------------|--||---------------------|||||-||||||||||||||||-- 2 [M] COG0810 Periplasmic protein TonB, links inner and outer membranes |-|------|------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG0811 Biopolymer transport proteins |||------|-|----|--|||--------||||||||----|||||-||||-|||||||||---- 2 [O] COG0826 Collagenase and related proteases --|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-||||||||||||| 2 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain ----------------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG0848 Biopolymer transport protein ||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-| 2 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases |||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||-- 2 [C] COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit ---|----|-|-|||||-|||---||||||---------------|--||||-------------- 2 [I] COG1022 Long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming) ---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---||||||| 2 [I] COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase |||-|||||||||----|||||-----||-||-----|----|||-|-||------------|--- 2 [C] COG1032 Fe-S oxidoreductase ----|||||-|||----||||-||---|||----||||----||||--||---|||--||--|--- 2 [P] COG1055 Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases --|||||||-||||||---|||--|-|||||-||||------|||||-|----------------- 2 [KL] COG1061 DNA or RNA helicases of superfamily II |---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----||| 2 [D] COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis -|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-|||||| 2 [MG] COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases |------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||-- 2 [M] COG1087 UDP-glucose 4-epimerase |-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-|||| 2 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 2 [G] COG1109 Phosphomannomutase |||||-||||-|-||||||-|------||||---|---|||||||-|--|--|---|--------| 2 [L] COG1112 Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits --------------------|-|||-|---|-|||-|-----|||||-||||-------------- 2 [E] COG1114 Branched-chain amino acid permeases |-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 2 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component ||||--|||||||----|||||--|-||||||||||||||||-||-|-|-|----|---|||---- 2 [P] COG1122 ABC-type cobalt transport system, ATPase component -----------------|--|---|||----|----||-|--|||||-||||---|---|||||-- 2 [G] COG1129 ABC-type sugar transport system, ATPase component ----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||-- 2 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 2 [C] COG1155 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit A -||---||-|||||||-||||----|----||||||||||||------|----||----------- 2 [R] COG1161 Predicted GTPases --||-------------|--||||||-----|||||||||||------|-------||||||||-- 2 [E] COG1164 Oligoendopeptidase F -----------------|--|-----|--|-|----||----|||||-||||---|---|||||-- 2 [G] COG1172 Ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport systems, permease components ---|--||--|-|-----||||--|-|------|---|----|||||-||||-|||--|||||--- 2 [P] COG1178 ABC-type Fe3+ transport system, permease component ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases |-||--||--------||||||---|----||||||||------------------|||------- 2 [L] COG1193 Mismatch repair ATPase (MutS family) |--||||-|--|-|---|--||-----||-|-|-|-||-------||-||-----|---|||||-- 2 [Q] COG1228 Imidazolonepropionase and related amidohydrolases --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 2 [M] COG1346 Putative effector of murein hydrolase ----------------||--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---||||--- 2 [KG] COG1349 Transcriptional regulators of sugar metabolism --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 2 [R] COG1380 Putative effector of murein hydrolase LrgA ||||||--||-|------||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---|||||-- 2 [H] COG1492 Cobyric acid synthase ----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [MU] COG1538 Outer membrane protein --|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--||||||||||||| 2 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase --||||||----|---||--||-----||------|||--------|--|-----|---|||||-- 2 [R] COG1574 Predicted metal-dependent hydrolase with the TIM-barrel fold -----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||-- 2 [K] COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog -----------------||-|---|-|---------||----|--||-||||---|---||-||-- 2 [G] COG1638 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, periplasmic component -|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-||||||||||||| 2 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins -|------||----------|---------|-----------|||--------------------- 2 [E] COG1775 Benzoyl-CoA reductase/2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase subunit, BcrC/BadD/HgdB ----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----||| 2 [M] COG1792 Cell shape-determining protein ------------------|||-----||||||||||||---------------------------- 2 [S] COG1799 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----|------|-----|--||----|||-|||-||||----|||||-||---|||---|||||-- 2 [K] COG1802 Transcriptional regulators --------|--------|--||--------|----|||----|||-|------------------- 2 [R] COG1811 Uncharacterized membrane protein, possible Na+ channel or pump |||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||-- 2 [K] COG1846 Transcriptional regulators |-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---||||||| 2 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family |||-----||------||--|---------||---|------|||--------------------- 2 [I] COG1924 Activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase (HSP70-class ATPase domain) --------------------|||||||---||||||||||||||||||||||||||---|||||-- 2 [G] COG1925 Phosphotransferase system, HPr-related proteins --||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||-- 2 [L] COG1943 Transposase and inactivated derivatives --------------------|-------------|-||----------||||-||-|||------- 2 [R] COG2056 Predicted permease -|---------------|||||---||---------||-|--------||-----|---||-||-- 2 [P] COG2059 Chromate transport protein ChrA --------|----|--||-|||----|||-||||||||-----------|--||||||||||-|-- 2 [R] COG2070 Dioxygenases related to 2-nitropropane dioxygenase --------------|-----|------|||||||-|------|||----|--------|||||||| 2 [R] COG2071 Predicted glutamine amidotransferases ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 2 [C] COG2086 Electron transfer flavoprotein, beta subunit ----------------|---|-||||-----------|----|||||-||-||||||||||||||| 2 [T] COG2204 Response regulator containing CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains -|-------|-------|--||---------------------------------|---------- 2 [G] COG2342 Predicted extracellular endo alpha-1,4 polygalactosaminidase or related polysaccharide hydrolase -------------||-----||---------|--||-|----||||-----|-------||||--- 2 [G] COG2376 Dihydroxyacetone kinase ----------|-|------||-----||-|-||||||-----|||||-||||-|||---|||||-- 2 [S] COG2606 Uncharacterized conserved protein --||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||---- 2 [P] COG2608 Copper chaperone -|--------------|---|---------------------||||||-|||-||||||---||-- 2 [M] COG2870 ADP-heptose synthase, bifunctional sugar kinase/adenylyltransferase --------------------|-----|-------|--|----||||--|--|-||--------|-- 2 [H] COG2978 Putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter ---|||--------------||----------|-|-||-------||-||-----|---|||||-- 2 [E] COG2986 Histidine ammonia-lyase ---|||--------------||----------|-|-||-------|--||-----|---|||||-- 2 [E] COG2987 Urocanate hydratase ---|--------|-------|---------------------|||---|--|-------------- 2 [E] COG3033 Tryptophanase --------------------|-----|----------|----|--||-||||-------||--|-- 2 [G] COG3090 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component --|-----------------|-----------|-||||----------||---||-------||-- 2 [S] COG3212 Predicted membrane protein --------------------|---------|---|-||----|||-|-|-----------|----- 2 [S] COG3314 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----------------||------|||------|-----------||-|--------|-|--- 2 [Q] COG3315 O-Methyltransferase involved in polyketide biosynthesis --------------------|----------------|------------------|||------- 2 [L] COG3392 Adenine-specific DNA methylase ----||-----------|--||--------|-|--------------------------------- 2 [E] COG3404 Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase |-|||--------------|||--------||-----|--------|------|||----|||--- 2 [R] COG3467 Predicted flavin-nucleotide-binding protein -----------------|--|------||---|--------------------------||-|--- 2 [T] COG3629 DNA-binding transcriptional activator of the SARP family ----||-----------|--|-----------|--------------------------------- 2 [E] COG3643 Glutamate formiminotransferase --------------------|---------|---||||-----------|-|-------||-|--- 2 [S] COG3708 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||-- 2 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components |-|---------------|||------||||----|-----------------------|||||-- 2 [T] COG3920 Signal transduction histidine kinase --------------------||----|---||||---|----------|--|----------|--- 2 [R] COG3981 Predicted acetyltransferase ----------------||--|---------||||||||||--|||||-|-||----||||||||-- 2 [R] COG4123 Predicted O-methyltransferase -------------|------|----------|-|-|---------------|-------------- 2 [S] COG4283 Uncharacterized conserved protein ------------------|||--------------|------|||-|------------------- 2 [QC] COG4577 Carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein --------------------|----------------------------|--|--|---|--|--- 2 [S] COG4625 Uncharacterized protein with a C-terminal OMP (outer membrane protein) domain --------------------|---|--------|----------------|--------------- 2 [M] COG4750 CTP:phosphocholine cytidylyltransferase involved in choline phosphorylation for cell surface LPS epitopes -----------------|--|---------|----------------------------------- 2 [S] COG4878 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-----------------|-----------------------------|--||------|---- 2 [P] COG5266 ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component ||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||-- 1 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase ||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||-- 1 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit ||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||------------- 1 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase ---|--||---|----|-|||------||||----|||----|||||-||--||||---||-||-- 1 [H] COG0029 Aspartate oxidase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation) ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase |--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase -|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase -|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||-- 1 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC ||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--|||||||| 1 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase ||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||-- 1 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0048 Ribosomal protein S12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0049 Ribosomal protein S7 ---------|---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0051 Ribosomal protein S10 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2 ||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--|||||||| 1 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase -||---||--||-|--|-||||||--|||-||||--||----|||||-||||-------||-|--- 1 [G] COG0058 Glucan phosphorylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [G] COG0061 Predicted sugar kinase ||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---||||||||||||| 1 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit |||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1 ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0082 Chorismate synthase |||---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0084 Mg-dependent DNase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11 |||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9 ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase ||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase -|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||---------- 1 [L] COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase -------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0125 Thymidylate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--|||||||| 1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase -|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 1 [H] COG0132 Dethiobiotin synthetase ||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain --||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase -|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0148 Enolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase ------|---|--||--|--|---|-|||-||-|--||----|||||-|-||-------------- 1 [G] COG0153 Galactokinase ||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---||||||||||||| 1 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases -|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes ||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||-- 1 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase -|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0164 Ribonuclease HII -|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0171 NAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase -||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 1 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-||||||||||||||| 1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase |||-|||||||||||-|||||---------------|------------|--|-------|-|--- 1 [J] COG0182 Predicted translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family ||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-||||||| 1 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17 --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit --||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||| 1 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase -------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase -------------|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0194 Guanylate kinase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0195 Transcription elongation factor -------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0196 FAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0203 Ribosomal protein L17 -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|--- 1 [G] COG0205 6-phosphofructokinase ||||||||||------||||||--||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0206 Cell division GTPase |||-----||---|||----||----||||||||||||-|||||||||||||||||---|||||-- 1 [F] COG0207 Thymidylate synthase ---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-||| 1 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit |-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0211 Ribosomal protein L27 |--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase |||||||||||||||--|--||----|||||--|||||------------||-------------- 1 [H] COG0214 Pyridoxine biosynthesis enzyme --|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0216 Protein chain release factor A -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein -|||--||||---|--||--|---------|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0218 Predicted GTPase ------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class) -------------||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase |-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit -------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0227 Ribosomal protein L28 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0228 Ribosomal protein S16 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0233 Ribosome recycling factor --|----------||-||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10) ||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--|||||| 1 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases --|----------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0238 Ribosomal protein S18 |-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase -|--||-------|||--|-|------||-|-----------|||||||||||||||||---||-- 1 [E] COG0241 Histidinol phosphatase and related phosphatases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10 ----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase ||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||--- 1 [C] COG0247 Fe-S oxidoreductase --|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-|||||||||||||||||| 1 [FP] COG0248 Exopolyphosphatase --||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family) |||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0250 Transcription antiterminator |||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|---- 1 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D ||------||------|||||-||--|||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0254 Ribosomal protein L31 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) ------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-|||||||||||| 1 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0261 Ribosomal protein L21 --|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-| 1 [H] COG0262 Dihydrofolate reductase --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts |-||------||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0267 Ribosomal protein L33 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0268 Ribosomal protein S20 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis --||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases -|--||----------|-|-|------||-|-----------||||||||||-||-|||---|--- 1 [G] COG0279 Phosphoheptose isomerase --||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-||||||||| 1 [C] COG0280 Phosphotransacetylase --|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-|| 1 [C] COG0282 Acetate kinase ---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---||||||| 1 [F] COG0283 Cytidylate kinase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase ---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3) -------------|--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0291 Ribosomal protein L35 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0292 Ribosomal protein L20 |||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes --|--------|-|--|-||||||--|||----|--|-----|||||-||||---|---||-|--- 1 [G] COG0296 1,4-alpha-glucan branching enzyme -|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|--- 1 [G] COG0297 Glycogen synthase --||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN --|----|---|-|||---||-----||||||||||||-----------|-|---|---||-||-- 1 [R] COG0300 Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities ----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--||||||||||| 1 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0305 Replicative DNA helicase ---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0313 Predicted methyltransferases ----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-| 1 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex --||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase) -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase --|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold -------------|||--|||---|||||||----|||----|||||||||||--||||-|-|-|| 1 [O] COG0326 Molecular chaperone, HSP90 family ||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||------- 1 [S] COG0327 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase |||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0333 Ribosomal protein L32 --|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|-- 1 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0335 Ribosomal protein L19 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase ----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase -|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------| 1 [L] COG0338 Site-specific DNA methylase ||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD |||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase ----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||-- 1 [S] COG0344 Predicted membrane protein ||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-| 1 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase |||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase ----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit) --|----------|--|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type) --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0359 Ribosomal protein L9 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0360 Ribosomal protein S6 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1) -------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase |||||||||||||-----||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||--- 1 [H] COG0368 Cobalamin-5-phosphate synthase ||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||------- 1 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase |||-----||----|-|-||||----|||-----|--||---|||||--||----||||||||--- 1 [OK] COG0378 Ni2+-binding GTPase involved in regulation of expression and maturation of urease and hydrogenase ||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||-- 1 [H] COG0379 Quinolinate synthase --||---------||---||||----|||-|----|||----|||-|-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG0384 Predicted epimerase, PhzC/PhzF homolog -------------|||--|-|-----|---|||||||||---|||||--|--||||-------|-- 1 [O] COG0386 Glutathione peroxidase --||-------|-||---|||-----|||-|||||||||||||||||-||-|-|||---|||||-- 1 [L] COG0389 Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG0410 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component -|------|-|||----|||||-----------|--------|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG0411 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component ----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||-- 1 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme ||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|----- 1 [L] COG0420 DNA repair exonuclease ||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||-- 1 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC --|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation ||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||-- 1 [O] COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation ---|----|----||---|-|-----|---------------|||||--|---------|-|-|-- 1 [C] COG0427 Acetyl-CoA hydrolase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0443 Molecular chaperone |||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--||||||||||| 1 [O] COG0450 Peroxiredoxin |||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ) ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family) |||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| 1 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases --|----------||-||--||||||----|-----|||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase -|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||-- 1 [G] COG0469 Pyruvate kinase |||||||||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication ||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-|| 1 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase |||-|--------||||-|||-----||||||||-||||||||||||--|----------|||--- 1 [P] COG0474 Cation transport ATPase |-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0486 Predicted GTPase ||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase ----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair |||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||-- 1 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function |||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 1 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit |||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II |||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||| 1 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases --|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||-- 1 [L] COG0514 Superfamily II DNA helicase |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit |-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||-- 1 [E] COG0520 Selenocysteine lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins --|----------||-|-||||----|||-----|-||----|||||-||--||||||-|||||-- 1 [R] COG0523 Putative GTPases (G3E family) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0528 Uridylate kinase ||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---||||||| 1 [E] COG0531 Amino acid transporters |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0536 Predicted GTPase |||||||||-|||||||-||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases -------------||-||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0539 Ribosomal protein S1 |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase |------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit |||-||||||-|-||-||--|---|-|||-||-|-|||----|||||-||---|||---|----|| 1 [HC] COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0550 Topoisomerase IA |||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||------- 1 [L] COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase ---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||-- 1 [C] COG0554 Glycerol kinase |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex ---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [K] COG0557 Exoribonuclease R -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG0559 Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease components |||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease |||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--|||||||||||||| 1 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein) ----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||-- 1 [R] COG0579 Predicted dehydrogenase |-------|--|-|||-||-||---|----||||||||-|||||||||-||||--|---|||||-- 1 [G] COG0580 Glycerol uptake facilitator and related permeases (Major Intrinsic Protein Family) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit -----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0594 RNase P protein component ||||--||-|-------|||||----||||||||||||||||--------------|||||||||| 1 [R] COG0595 Predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase -||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-| 1 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters -||-----||-------|||||||--|---|--||-||----||||---|||---|---|||||-- 1 [P] COG0600 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component ||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes |--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-| 1 [O] COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity ----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--||||||||||| 1 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases -------------|||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase -|||--|||||-|---||||||--|||||-||||||||||||------|----------------- 1 [R] COG0618 Exopolyphosphatase-related proteins ||||--||||-||----|||||----||||||||||||||||-||-|---|--------|||---- 1 [P] COG0619 ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters ||||--|||||||||--|--|---|----|||||||||-||||||||-||---------------- 1 [R] COG0622 Predicted phosphoesterase -|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases ||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0628 Predicted permease -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit ----------------||--||----||||||-|||||||||||||||||||||||---|||||-- 1 [F] COG0634 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase -|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||-- 1 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases |||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||-- 1 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators |||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||-- 1 [C] COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins) -----------------|||||----|||||---||||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG0646 Methionine synthase I (cobalamin-dependent), methyltransferase domain ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase) |||-----||-|-||-|---||-----||||--|||||----||-||-||--|--|---|||-|-| 1 [R] COG0655 Multimeric flavodoxin WrbA ----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-| 1 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein |||---||||------|||||------||-------||----|||||-||--||||||-|||||-- 1 [G] COG0662 Mannose-6-phosphate isomerase ---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||-- 1 [C] COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases) |||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--|||||||||||||| 1 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel ----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase -------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-||||||||||||| 1 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH ||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-||||||| 1 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase --------|---|||--||||---|---------|||-----||||---|-|-||---|--|--|| 1 [P] COG0672 High-affinity Fe2+/Pb2+ permease ||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--|||||||| 1 [R] COG0679 Predicted permeases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0681 Signal peptidase I ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase -|-|----|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG0683 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component ---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 1 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein ||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-|| 1 [I] COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase |---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---||||||| 1 [J] COG0689 RNase PH ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0691 tmRNA-binding protein -------------|||----||||-|||||-||||||||||||||||||||||||||||||----- 1 [L] COG0692 Uracil DNA glycosylase ----------------|||-|-----|||||-|||||||||||--||----|----|||-|||-|| 1 [G] COG0698 Ribose 5-phosphate isomerase RpiB --|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0703 Shikimate kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC --|------|-|----||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase |-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0708 Exonuclease III --|-------------|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b -------------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein) -||-----||---||--|||||||--|---|--||-||----||||--||||---|---|||||-- 1 [P] COG0715 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components -----------------|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---||||||||||||| 1 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit ----------------|||||||||||||||-----------|||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor ----------------|---|---------------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [M] COG0729 Outer membrane protein |||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [R] COG0730 Predicted permeases |||||||||||||||--||||---------|-------------------------|||------- 1 [C] COG0731 Fe-S oxidoreductases --|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins -------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||| 1 [I] COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase) ----------------||||||--||||||||--||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases -----------------|||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase ----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|-- 1 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase -----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein) -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains |||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1 ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit -------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-||||||| 1 [F] COG0756 dUTPase -----------------|||||----|||||-----||-------|-||||||--|||||||||-- 1 [E] COG0757 3-dehydroquinate dehydratase II ----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||- 1 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein -----------------||||-||||||||||||||||----|||||-||||---||||||-||-- 1 [S] COG0762 Predicted integral membrane protein ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0763 Lipid A disaccharide synthetase ----------------||||||||------||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 1 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase |||------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase --|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||-- 1 [F] COG0775 Nucleoside phosphorylase ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit ----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0781 Transcription termination factor ---|--------------||||--|||----|||||||-|--|||||-|||||--|||||-|-||| 1 [P] COG0783 DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant) --|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators ----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||-- 1 [L] COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase ----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0793 Periplasmic protease |||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation ----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [M] COG0796 Glutamate racemase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase ----------------||||||--||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing ----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II ----------------||||||---|----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase -----------|--------||--|------||||||-|||||||||||-||----||----|--- 1 [F] COG0813 Purine-nucleoside phosphorylase ----------------||||||||--|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis) -----------------||||||||-||||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit ----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||-- 1 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis --||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||| 1 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation |-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [R] COG0824 Predicted thioesterase ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit ------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|-- 1 [K] COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family ---------|------||--||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division ----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||--- 1 [D] COG0850 Septum formation inhibitor ------------------||||--------------------||||||||--||||||-||||--- 1 [D] COG0851 Septum formation topological specificity factor ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A ----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase -|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||-- 1 [L] COG0863 DNA modification methylase ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG1010 Precorrin-3B methylase ---|---------||-----||----|||-----|-||----||||||||--||||---|||||-- 1 [C] COG1018 Flavodoxin reductases (ferredoxin-NADPH reductases) family 1 ----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase |||||||||||||-------||--|-----------------|||||-|||||||||||------- 1 [O] COG1047 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2 ||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit -------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase ---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||-- 1 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA -|--||--|--|----||--|--------------------------------------------- 1 [L] COG1059 Thermostable 8-oxoguanine DNA glycosylase ||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||------- 1 [HR] COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes ----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease --||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||-- 1 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily --------------------|-||||-||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains) |||||||||||||--|||--|----------||||||||-||------------------------ 1 [R] COG1078 HD superfamily phosphohydrolases --------------------||||-||---||||||||-|||||||||||||||||------||-- 1 [G] COG1080 Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria) |-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||-- 1 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase -|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||--- 1 [R] COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases --------------------|-----|-----||--------------||-----|---||||-|| 1 [R] COG1101 ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component --|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-||||||||||||| 1 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes -----------------|--||---||||-||||||||--|||||||-||||---|---------- 1 [G] COG1105 Fructose-1-phosphate kinase and related fructose-6-phosphate kinase (PfkB) -||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||-- 1 [P] COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component |||-|----|-|------|||-----||||----|-------|||||-|------|||-||-|--- 1 [R] COG1123 ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase --|--|--------------|-||--------|-|--|||--|||||------------||||--- 1 [EP] COG1124 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component --------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|------||-||||--- 1 [E] COG1125 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, ATPase components --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 1 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component ------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component ----------------||||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component |--|||--|-|||-------||---------|----||----|||------|-||||||------- 1 [C] COG1139 Uncharacterized conserved protein containing a ferredoxin-like domain |||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|--- 1 [C] COG1145 Ferredoxin |||----|||-------|--|---------|-----------|||||------------------- 1 [C] COG1151 6Fe-6S prismane cluster-containing protein ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1156 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit B ----------------||--|||||||||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG1158 Transcription termination factor ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1159 GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1160 Predicted GTPases --|-------------|||||----||||||||||||||||||||||-||||||||------|--- 1 [R] COG1162 Predicted GTPases --------------------||----||||||-|-|||----|||||---|----|---------- 1 [E] COG1168 Bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities ---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [E] COG1171 Threonine dehydratase --------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|-----|||-||||--- 1 [E] COG1174 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, permease component ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 1 [E] COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II -------------||-----|---------|---|-||----|||||-|||||||||||------- 1 [H] COG1179 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 1 |||-|||||||||---||--|------||-||||||------|||||-||||---|---------- 1 [O] COG1180 Pyruvate-formate lyase-activating enzyme --|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes ||||----||---||-----|-||-|-||||-----||-----------|--|||||||||||-|| 1 [I] COG1183 Phosphatidylserine synthase -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase) -------------||-|||||||||||||||||-||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1186 Protein chain release factor B -----------------|--|-----|---||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 1 [J] COG1188 Ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit (S4 paralog) --|-----|-------|||||----|||||||||-|||||----------------|||||||||| 1 [J] COG1189 Predicted rRNA methylase --|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||----- 1 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II) ----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------||||||| 1 [L] COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway) -||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||-- 1 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases -----------------|||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase ||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|-- 1 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases ----------------||||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [LK] COG1200 RecG-like helicase |||---|||-|||---||--|-----------|----|----|||||----|-------------- 1 [R] COG1203 Predicted helicases ----------------||||||---------|||||||---------------------|||||-- 1 [J] COG1206 NAD(FAD)-utilizing enzyme possibly involved in translation ----------------||||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains) |||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||-- 1 [M] COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase ------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1212 CMP-2-keto-3-deoxyoctulosonic acid synthetase |-----|||---|---|---|----------------------------|--------|----|-- 1 [M] COG1213 Predicted sugar nucleotidyltransferases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone ------------------||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [T] COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit -|------|----|||-|--||--------|||||||-----------|----------------- 1 [C] COG1227 Inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase ||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---||||||| 1 [R] COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I -|-------|------||--|---------|||-||||----|||||-|----------------- 1 [R] COG1242 Predicted Fe-S oxidoreductase ||||||||||||-|||-|--|---------|----------------------------------- 1 [KB] COG1243 Histone acetyltransferase ||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 1 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes ---|||--|-|||-------||-----||||---|-||----|||||-||-----|---||||||| 1 [I] COG1250 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase --||---------||-|||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains --------------------|----||---||||||||-|||||||||||-|---|-------|-- 1 [G] COG1263 Phosphotransferase system IIC components, glucose/maltose/N-acetylglucosamine-specific --------------------|----||---||||||||||||||||||||-|---|-------|-- 1 [G] COG1264 Phosphotransferase system IIB components |-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||-- 1 [R] COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease |||---||-||-|---|---|-----------|--|||----|||||-||||-||||||-----|| 1 [I] COG1267 Phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins |-||--|||--------||||||-|-|---||||||||---------------------||||-|| 1 [R] COG1268 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1269 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit I |||||||||||||-----||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---||||--- 1 [H] COG1270 Cobalamin biosynthesis protein CobD/CbiB -------------|||----||--|||||-||||||||----|||||-||--|||----|||||-- 1 [R] COG1272 Predicted membrane protein, hemolysin III homolog ---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---||||||| 1 [K] COG1278 Cold shock proteins --------------------|-----|||-|---|-||----|||||-||-|---|||-|-|---| 1 [R] COG1279 Lysine efflux permease ----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family --------------------|---|-|-----||||||-|--|||-|-||--------|||||--- 1 [P] COG1283 Na+/phosphate symporter ---------|-------|--|-||-|----||||||||||||------|----------|||---- 1 [S] COG1284 Uncharacterized conserved protein ----------------|-||||--|--||-||-|-|||----|||||--|||---|---|||---- 1 [S] COG1285 Uncharacterized membrane protein ||||||||||||||||-|||||---|----||||||||------------------|||------- 1 [K] COG1293 Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP --|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG1295 Predicted membrane protein --|-----|-----------||----|----|-|||||----|||||-||||-|||||-||||--- 1 [E] COG1296 Predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance) --------------------||---||---||||||||-||||||||-|||----|---------- 1 [G] COG1299 Phosphotransferase system, fructose-specific IIC component -----------------|--||||------||||||||---------------------------- 1 [S] COG1302 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---||---------------------------------------- 1 [S] COG1306 Uncharacterized conserved protein -----------------|--||----|||-||||||||||||-------|---------------- 1 [S] COG1307 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|-|||||||||||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG ||-------|-------|--|---------||||||||-|-------------------------- 1 [R] COG1323 Predicted nucleotidyltransferase -----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [K] COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains |||---||-|-------|--|---------||||||------|||||-||||---|---------- 1 [F] COG1328 Oxygen-sensitive ribonucleoside-triphosphate reductase |||--|--||||-----|-||------||---|----|---------------------------- 1 [L] COG1343 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair |||------|--------|||---------|-----------------------------|-|--- 1 [P] COG1348 Nitrogenase subunit NifH (ATPase) -||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [S] COG1354 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||-|--|---------||||||||---------------------------- 1 [J] COG1358 Ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a) --||--------------|-||----|||-||-|-||-----|||||-||-|-|||---||-||-- 1 [S] COG1359 Uncharacterized conserved protein -------------||--|--|----||||||------------------|---------------- 1 [E] COG1362 Aspartyl aminopeptidase ||||--|||||-|----|-|||--------||||||||||--|||-|--|----------|----- 1 [G] COG1363 Cellulase M and related proteins -----------------||||||||--||-|---||||----------||---------||--|-- 1 [T] COG1366 Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor) ------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---||||||| 1 [L] COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) ----------------||||||--||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-|||||--------|||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [K] COG1386 Predicted transcriptional regulator containing the HTH domain |||-||||||---||-||--||-----||-||--||||----|||||-|-----------|----- 1 [ER] COG1387 Histidinol phosphatase and related hydrolases of the PHP family |||||||||||-||||----||||||---------------------------------------- 1 [C] COG1390 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit E -------------------|||----|--||||||||||-|||||||-||||||||--||||||-- 1 [P] COG1393 Arsenate reductase and related proteins, glutaredoxin family ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1394 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit D ||||||||||------||--||--||----|||||||||-|||||-|---------|||||----- 1 [R] COG1418 Predicted HD superfamily hydrolase -----------------||||-||--||||||||||||||||----------|--|||||||||-- 1 [K] COG1420 Transcriptional regulator of heat shock gene ||||||||||||||||----||--|--------|-------------------------------- 1 [C] COG1436 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit F --------------------||---||---||||||||-||||||||-||||---|---------- 1 [G] COG1445 Phosphotransferase system fructose-specific component IIB -------------||-----|-||------------------|||||-||||||||----|-|--- 1 [E] COG1448 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase ----------------|---|-||------------------|||||-||--|--|--|---||-- 1 [NU] COG1450 Type II secretory pathway, component PulD ||||--|||-------|---||----|---|-------||--|||||-||--||||||||||||-| 1 [R] COG1451 Predicted metal-dependent hydrolase |-|||||||--||||-||--|-----|---||-|||||----|||||-||-|---|---||||--- 1 [C] COG1454 Alcohol dehydrogenase, class IV ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||-- 1 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF -----------------|--||----|||-||||||||||||------------------------ 1 [R] COG1461 Predicted kinase related to dihydroxyacetone kinase --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen |||---|||-|||---||-||-----------|----|---------------------------- 1 [L] COG1468 RecB family exonuclease --|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||-- 1 [H] COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis -|||--|----------|-||-----|---|----|--||---|||--|--|--|-|||------- 1 [S] COG1479 Uncharacterized conserved protein -----------------||||--||-----|----|||---------------------------- 1 [R] COG1480 Predicted membrane-associated HD superfamily hydrolase -----------------|--|-----||||||||||||||||------------------------ 1 [S] COG1481 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||--- 1 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase -------------||-||--||----|||-||||||||----|||||-||||-|||---------- 1 [J] COG1490 D-Tyr-tRNAtyr deacylase ---------|----------|---|-----||||||||||||----------||||---|||||-- 1 [T] COG1493 Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism --|---------------||||----|||||-----||----|||-|-|-||---------|||-- 1 [G] COG1494 Fructose-1,6-bisphosphatase/sedoheptulose 1,7-bisphosphatase and related proteins ----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein ----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-||||||| 1 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes ---|||||--|||||---|-||------------|-||-----------|--|------|---|-| 1 [E] COG1506 Dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases -||-------------||--||--|-----------||----|||||-|-|||------||-||-- 1 [E] COG1509 Lysine 2,3-aminomutase |||-|||-|||||---||-||------||---|--|-|----|||||----|--|---|------- 1 [L] COG1518 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1519 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase ----------------||||||--||-||||----|||-|---------|--|||||||----|-- 1 [K] COG1521 Putative transcriptional regulator, homolog of Bvg accessory factor --|--------|-----||-||||--|||-|-||--||-|--|||||-||||---|---||-|--- 1 [G] COG1523 Type II secretory pathway, pullulanase PulA and related glycosidases |||||||||||--|||----||----------||-------------------------------- 1 [C] COG1527 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit C ---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG1530 Ribonucleases G and E -||-|-|||||||----||-|------||-|-----||-----------|-----|---|||||-| 1 [L] COG1533 DNA repair photolyase ||||--||||-||-------|---------||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [J] COG1534 Predicted RNA-binding protein containing KH domain, possibly ribosomal protein -------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase ------||------------||----|--|----|-||----|||||-|||--|||--||------ 1 [R] COG1540 Uncharacterized proteins, homologs of lactam utilization protein B |-|-----|--|-------|||---------------|----|--|--|---|--|---------- 1 [H] COG1541 Coenzyme F390 synthetase ----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---||||||| 1 [J] COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1) ---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||-- 1 [R] COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced) --|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|------- 1 [L] COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins ---|----|-----------||---------|----||----|||------|-||||||------- 1 [S] COG1556 Uncharacterized conserved protein ----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein --------------------|-||--||||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1560 Lauroyl/myristoyl acyltransferase ----------------||--|----|----|----|||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [S] COG1561 Uncharacterized stress-induced protein -------------||--|--||--|-----|||||||-------------------||-||||--- 1 [H] COG1564 Thiamine pyrophosphokinase -----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit ---|-------------||||-----||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 1 [H] COG1575 1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase -----------------|--||--------||||||||||--|||||-||||||||||||||||-- 1 [S] COG1576 Uncharacterized conserved protein ||-|--||-||||----|||||----|||||-----------|||||-||-||------|||||-- 1 [OU] COG1585 Membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity ||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||--- 1 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase |||----|||-|-----|-||---------|-----|---------------------|------- 1 [C] COG1592 Rubrerythrin ||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG1605 Chorismate mutase -----------------|--||----|||-||||||||-|--|||||-|||||--|---|||||-- 1 [K] COG1609 Transcriptional regulators --|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||-- 1 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein ----||------------||||--|-----||-|-|||-|--|||-|-||---|||--------|| 1 [V] COG1619 Uncharacterized proteins, homologs of microcin C7 resistance protein MccF -----------------|--|-----|||-|-----||---------------------------- 1 [R] COG1623 Predicted nucleic-acid-binding protein (contains the HHH domain) ----------------||--|---------|||-|---------------|||||-|||-----|| 1 [S] COG1636 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------|-----|-||||||-||||--|||--------|||||-||||---|---------- 1 [G] COG1640 4-alpha-glucanotransferase ||||||--|||-|||-|---|------||-|---||||----||||||||--|||----|||||-- 1 [H] COG1648 Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain) |||-|||||-------|---|----|----|||||||||-||------------------------ 1 [L] COG1658 Small primase-like proteins (Toprim domain) --------------------||----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [R] COG1660 Predicted P-loop-containing kinase ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1663 Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase |||---||--||-----||||------------------------|------------|------- 1 [R] COG1672 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) |-|-------------||--|---------|----|||--------|-||-----|---||-|--- 1 [S] COG1683 Uncharacterized conserved protein --------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 1 [M] COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase --|-----------------|-----|---------|-------------||----||-------- 1 [E] COG1687 Predicted branched-chain amino acid permeases (azaleucine resistance) ----------------|---||---|--------||||||||-----------------|||||-- 1 [S] COG1692 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-| 1 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase |-|||||||-|||----|-|||----||||||||||||----|||||-|------|------||-- 1 [K] COG1695 Predicted transcriptional regulators -------------||----||---|-----|||||||------------|---||-|-|-|----- 1 [M] COG1696 Predicted membrane protein involved in D-alanine export -||--------------|--|---|-------||-|--||---|||---|-|---|---|||||-- 1 [S] COG1704 Uncharacterized conserved protein -----------------||-||--|-----||||||||||||------------------------ 1 [H] COG1713 Predicted HD superfamily hydrolase involved in NAD metabolism -----------------|-|||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG1722 Exonuclease VII small subunit ---|----|----------|||-----||-|||||||-----|||-|--|-----|||-||||--- 1 [M] COG1732 Periplasmic glycine betaine/choline-binding (lipo)protein of an ABC-type transport system (osmoprotectant binding protein) --||----|-|-|----|--||||-||-------|-|-----|||||-||||-||----||||--- 1 [S] COG1738 Uncharacterized conserved protein --||---------||--|--||---||---||||||||||--|||-|-||||-|||||||||---- 1 [S] COG1739 Uncharacterized conserved protein -------------||||||-|---|--|||-|----||----|||-|-||--||||---||||||| 1 [R] COG1752 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily --------------------||----||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 1 [E] COG1760 L-serine deaminase |||---||||-||-------|-----------|---------|||-|-|||--------------- 1 [H] COG1767 Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthetase ||-----||--------||||---|--||-|-----------|||-|--|--||||-------|-- 1 [C] COG1773 Rubredoxin -------------|||||--||--|-----||--||||---------------------------- 1 [S] COG1774 Uncharacterized homolog of PSP1 --|-------------|---|---------------------|||||-|||||||||||------- 1 [R] COG1778 Low specificity phosphatase (HAD superfamily) ||||||--||||------||||-----||-|----|-|--------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG1797 Cobyrinic acid a,c-diamide synthase ------|||-------|-|||---------|-----|-----|||||--|--||||---|||||-- 1 [M] COG1807 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family -----------|-----|-|||---||||-||||||||-|--|||||-|||||------|||||-- 1 [G] COG1820 N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase |--------|-------|--|---------|-||-|||---------------------------- 1 [R] COG1827 Predicted small molecule binding protein (contains 3H domain) --|----------------|||----||||-||||||------||-|--||-||||---|||||-| 1 [I] COG1835 Predicted acyltransferases ----------------||||||||||-|||||||-|||------------------|||------- 1 [R] COG1837 Predicted RNA-binding protein (contains KH domain) ||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----|||||| 1 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E -----------------|||||--||-|||||||-|||---------------------------- 1 [R] COG1847 Predicted RNA-binding protein |||----||-----------|--------------------------------------------- 1 [S] COG1852 Uncharacterized conserved protein |||---|||-|||---|---|--------------------------------------------- 1 [L] COG1857 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair --|-|||||||-|||-----||--------------------|||----|---------|------ 1 [J] COG1859 RNA:NAD 2'-phosphotransferase -|------------------|---|-----|-----|--------------------------|-- 1 [M] COG1861 Spore coat polysaccharide biosynthesis protein F, CMP-KDO synthetase homolog ----------------||--|-||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG1862 Preprotein translocase subunit YajC --|----------||----||----|--------------------|--|-----||||----|-- 1 [F] COG1864 DNA/RNA endonuclease G, NUC1 ------------||------||------------|-||----|||||-||||------|||||--- 1 [C] COG1866 Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP) --|--------------|--|---|-|--|||----||----|||||-||||---|---|||||-- 1 [G] COG1879 ABC-type sugar transport system, periplasmic component |-------|-----------|---------||||||------|||||-|-||---|---------- 1 [C] COG1882 Pyruvate-formate lyase ------|||--------|--|---|-------|-------------|-|--|-------------- 1 [C] COG1883 Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit |-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||-- 1 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes --||||--|--|-||--|-|||----|||-|||-||||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 1 [C] COG1902 NADH:flavin oxidoreductases, Old Yellow Enzyme family |||-||--||||------|||---------|----|----------|--|-----|---|-|---- 1 [H] COG1903 Cobalamin biosynthesis protein CbiD ----||-----|-||----|||----||||||-|||||----|||||--|||||||---||||--- 1 [P] COG1914 Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family ||||||||--||----|||||-----||--|||--|||-------||--|-----||||||||--- 1 [S] COG1917 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain -----------------||||---------||||||||---------------------------- 1 [S] COG1939 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase -----------------|--|---------|---||||----|||--------------------- 1 [K] COG1954 Glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (mRNA-binding) --|----|--|-|---|---|-----|||-||----||----|||||-||||-||||||------- 1 [T] COG1966 Carbon starvation protein, predicted membrane protein |--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||-- 1 [V] COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein --|---------------|-||----||||-||||||-----|||||-|||||--|---|||||-- 1 [M] COG1970 Large-conductance mechanosensitive channel |-|-----------------|-----|---|-----||----|||||--|--|||---|------- 1 [S] COG1971 Predicted membrane protein -----------------|-||---------|----|||----|||||-|--|-------------- 1 [C] COG1979 Uncharacterized oxidoreductases, Fe-dependent alcohol dehydrogenase family ------------------|||------||||--|||||----|||||-||||---|----|----- 1 [E] COG1982 Arginine/lysine/ornithine decarboxylases ------||-----|------||----||||----|-||----|||||-|||--|||--||---|-- 1 [E] COG1984 Allophanate hydrolase subunit 2 ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis ----------------|-|||----------------|----|||||-||-|||||||||||||-- 1 [H] COG1995 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein --|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--| 1 [L] COG2003 DNA repair proteins ---|---------||--|-|||--------|---||-|----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2008 Threonine aldolase --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component ----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||-- 1 [G] COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes ----------------|-||||----|||||-----||----|||||-||--||||--||||||-- 1 [H] COG2022 Uncharacterized enzyme of thiazole biosynthesis ---|----|--|-||-----||----||||----|-|-----|--||-||-----|---|||||-- 1 [I] COG2030 Acyl dehydratase --------|---|-------|-----|-----|----|----|------||-----||-------- 1 [I] COG2031 Short chain fatty acids transporter |--|-------------|--|---|||-----|||--|----------|----------------- 1 [S] COG2035 Predicted membrane protein |||||||||||||-----||||----|||||------|----|||-|-||-----|---|||||-- 1 [H] COG2038 NaMN:DMB phosphoribosyltransferase ------||---|--------||-----||---|||-||-------|---------|---------- 1 [O] COG2039 Pyrrolidone-carboxylate peptidase (N-terminal pyroglutamyl peptidase) ------||-----|------||----||||----|-||----|||-|-|||--|||--||---|-- 1 [E] COG2049 Allophanate hydrolase subunit 1 ------------------||||----|||-||||||||-----------|||---|---------- 1 [F] COG2065 Pyrimidine operon attenuation protein/uracil phosphoribosyltransferase ------------------|||-----|---------||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2066 Glutaminase ----------------|---|---------------------|||||-|||||||-||-|||||-- 1 [I] COG2067 Long-chain fatty acid transport protein ||-|||--||||------|||---------|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2073 Cobalamin biosynthesis protein CbiG ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2082 Precorrin isomerase ------------------||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||--- 1 [H] COG2087 Adenosyl cobinamide kinase/adenosyl cobinamide phosphate guanylyltransferase --------|-----------|----|----|---||||---------------------------- 1 [M] COG2088 Uncharacterized protein, involved in the regulation of septum location -||-----------------|---|-----|-----|----------------|--|||----|-- 1 [M] COG2089 Sialic acid synthase ---||||||-|||-------||----||||-----|||--------|--|-----|---|||||-- 1 [S] COG2096 Uncharacterized conserved protein ||----------------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2099 Precorrin-6x reductase |-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||-- 1 [H] COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis --||||||--|------|||||-----||-------------|||||-||-----|---||||--- 1 [H] COG2109 ATP:corrinoid adenosyltransferase --|-||||||||||--||--||-----||---|-||------|||-|--|-----|------|--- 1 [R] COG2110 Predicted phosphatase homologous to the C-terminal domain of histone macroH2A1 ---------|---|------|---------|||||||-----|||||-||||-------------- 1 [P] COG2116 Formate/nitrite family of transporters ----------------|---|-----------------------------------|||--||||| 1 [S] COG2121 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-||||||---||--|--||--|-----||||||||-|--------|----------------- 1 [F] COG2131 Deoxycytidylate deaminase -----------------|--||--|-||||||||||||----|||||-||||-|||---|------ 1 [R] COG2137 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||-- 1 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis ----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||-- 1 [NU] COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG -----------------|--|---------||||||||||||------------------------ 1 [L] COG2176 DNA polymerase III, alpha subunit (gram-positive type) -------------------|||----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 1 [D] COG2177 Cell division protein -------------|||---||---|-|---|||||||||---|||||-||||||||---||||--- 1 [K] COG2183 Transcriptional accessory protein ---||||||--||-------||----||||-------|----|||----------|---|||||-- 1 [I] COG2185 Methylmalonyl-CoA mutase, C-terminal domain/subunit (cobalamin-binding) -----|--|-----------|-----|------|-|--||------|---|||-|-||-|--|--- 1 [L] COG2189 Adenine specific DNA methylase Mod --------------------|----||---||||||||-|||||||||||||---|-------|-- 1 [G] COG2190 Phosphotransferase system IIA components -----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [K] COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins -----------------||||-|||--||-|---||||----------||----------|-|--- 1 [TK] COG2208 Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit --||||--|-||----|---|-------------|-|----------------------------- 1 [S] COG2210 Uncharacterized conserved protein ------------------|||---------||----|-----|||||----------------|-- 1 [G] COG2211 Na+/melibiose symporter and related transporters -|------------------|---|-----------------|||||---||---|---||||--- 1 [R] COG2215 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--| 1 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold |-----||-|-------|--||--------|-||-||-----|||||--|--|------|||||-- 1 [M] COG2222 Predicted phosphosugar isomerases --|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis -------|------|--|--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---|||---- 1 [F] COG2233 Xanthine/uracil permeases |----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----||||||| 1 [P] COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain) ||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2241 Precorrin-6B methylase 1 ||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|---------||||--- 1 [H] COG2242 Precorrin-6B methylase 2 ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2243 Precorrin-2 methylase ||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid --|-----------|-----|---------|----||||---|||||-||||-||||||-|-||-- 1 [R] COG2249 Putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B) -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit -------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 1 [L] COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase -|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [R] COG2262 GTPases ----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase ------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase -------||----||--|-|||----||||||--||||----|||||-||||---|---|||||-- 1 [I] COG2267 Lysophospholipase ---|-------||-------||----|||--||---------|||||-|||----|---|||||-- 1 [G] COG2301 Citrate lyase beta subunit ------------------||||---------|||||||---------------------------- 1 [S] COG2302 Uncharacterized conserved protein, contains S4-like domain --|-----|--||-----||||---|||||------||----|--||-||------------|--- 1 [R] COG2304 Uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain --------------------||----|----|||-||-----|||||--|-----|---|--||-- 1 [S] COG2315 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|--||--|||-------||-------------|||-------|--|-------------|--| 1 [E] COG2317 Zn-dependent carboxypeptidase --|----------|||-|||||--------------------------|----------|||||-- 1 [R] COG2319 FOG: WD40 repeat -------------------|||--------||-|--||----|||-|-------------|----- 1 [S] COG2323 Predicted membrane protein --|---------------|-||--------------||----|||||-||---|||---|||||-- 1 [R] COG2334 Putative homoserine kinase type II (protein kinase fold) --------|----|-|---|||---||---|---||||-----------|---------|||||-- 1 [S] COG2340 Uncharacterized protein with SCP/PR1 domains ------------------||||----|---|-----|-----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [S] COG2350 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------||----|||-||||||||---------------------------- 1 [S] COG2357 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||||-----||||||||||----------------------||----- 1 [V] COG2367 Beta-lactamase class A -----------------|-|||--------------------|||||--|-||--|---||-|||| 1 [R] COG2373 Large extracellular alpha-helical protein --------------------||----|||||---||||----|---|-||--|-||--||||||-- 1 [K] COG2378 Predicted transcriptional regulator ------------------||||--------|-----||---------------------------- 1 [D] COG2385 Sporulation protein and related proteins --------|---|-------||----|----|--||------|||---||-|-------|||||-- 1 [R] COG2388 Predicted acetyltransferase --||-------||-------|---------------|-------------------|||------- 1 [R] COG2404 Predicted phosphohydrolase (DHH superfamily) ------||--|||-------|---------------------|||||-|-||-||----------- 1 [S] COG2431 Predicted membrane protein ----||----|||----|--|---------------------|||-|-------------|-|--- 1 [C] COG2440 Ferredoxin-like protein -------||--------|--|---------||-|---|---------------------------- 1 [S] COG2461 Uncharacterized conserved protein -------------------|||----|---||||||||||--|||||-|----|||---------- 1 [S] COG2501 Uncharacterized conserved protein --------------------|---|-------||----|---|||||---||-------------- 1 [E] COG2502 Asparagine synthetase A --|---||||||-----||-|---------||-----|----------|--------------|-- 1 [R] COG2509 Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases |||------|--------|||---------|-----------------------------|-|--- 1 [C] COG2710 Nitrogenase molybdenum-iron protein, alpha and beta chains --------------------|---------|--|-----|--|||||-|-||----||-------- 1 [G] COG2731 Beta-galactosidase, beta subunit --------------------|---------|||||||||||------------------------- 1 [S] COG2739 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|||----||||||||||||||----------------||||||||-- 1 [K] COG2740 Predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination ----||-------||--|--|---------||||||--|---------|----||-----|-|--- 1 [F] COG2759 Formyltetrahydrofolate synthetase ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 1 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB ----------------||||||--------|-----------|||||-||--||||---------- 1 [NU] COG2805 Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits -----------------|--||--||||||||||||||---------------------------- 1 [S] COG2815 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|----------------|----------|||||||----|||||-||---||-----||||-- 1 [L] COG2827 Predicted endonuclease containing a URI domain --------------------||-----------||-------|||-|-||||-||----|||---- 1 [S] COG2832 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------------------|||||-||||||||--|----||| 1 [M] COG2853 Surface lipoprotein --------|-----------|-----|----|||||------|||||--|||-|||--||||||-- 1 [S] COG2855 Predicted membrane protein -------------------|||---|-||-|--|||||--------------||-|-----|---- 1 [E] COG2856 Predicted Zn peptidase --------------------|---||----|||||||||-||------------------------ 1 [J] COG2868 Predicted ribosomal protein --|-||||--||||---|--||--------|------|----------||-----|---||||--- 1 [R] COG2872 Predicted metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase HxxxH domain ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2875 Precorrin-4 methylase ----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------ 1 [E] COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG2877 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (KDO) 8-phosphate synthase --|--------------|--|---------------------||||||||||||||---------- 1 [C] COG2878 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors --------------------|---------||||-||-----|||||----|||||---|||||-- 1 [G] COG2893 Phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA ----------------||||||--------|----|||----||||||||--||||||-||||--- 1 [D] COG2894 Septum formation inhibitor-activating ATPase --------------------|---------------------|||||||-||-------------- 1 [S] COG2926 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|---------------||-||-------------|-----------|--||||---||-|--- 1 [S] COG2928 Uncharacterized conserved protein --------------------|----------||-|--------|--|--||||||----|||||-- 1 [K] COG2932 Predicted transcriptional regulator --------------------|-----------|---------|||||-||||---|--|-|----- 1 [S] COG2964 Uncharacterized protein conserved in bacteria |------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|------- 1 [S] COG2966 Uncharacterized conserved protein --------------------|---------|-||||||----------||--|--|---------- 1 [T] COG2972 Predicted signal transduction protein with a C-terminal ATPase domain ----------------|---|-||--|-----||--------------||-----|---||||-|| 1 [R] COG2984 ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component ---|----------------|-----|---------------|||||-|-||-------------- 1 [R] COG2985 Predicted permease --------------------|---------------------|||-|-|---------|------- 1 [R] COG2992 Uncharacterized FlgJ-related protein --------------------|---------||||||||----------||---------------- 1 [S] COG2996 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|----||----|||||---|--|||||-|-||---------|---- 1 [G] COG3010 Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase ----------------|---|-----|-----||--------|||||-||||-|||--|----|-| 1 [S] COG3022 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------------------|||||-||||||||---|||||-| 1 [V] COG3023 Negative regulator of beta-lactamase expression --------------------|---------------||----|||-|-||---------------- 1 [E] COG3048 D-serine dehydratase --------------------|----------||---------|||-|-|-|--------------- 1 [C] COG3051 Citrate lyase, alpha subunit --------------------|----------||---------|||-|-|-|--------------- 1 [C] COG3052 Citrate lyase, gamma subunit --------------------|----------||---------|||-|-|-|--------------- 1 [C] COG3053 Citrate lyase synthetase --------------------|---------------------|||||-|-||---------|---- 1 [S] COG3055 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|-----------||--------|||||-|-|-|------||----| 1 [L] COG3077 DNA-damage-inducible protein J -----------------|--|---------------------|||||-||||-------------- 1 [T] COG3086 Positive regulator of sigma E activity -------------------||-----|---------------|||---|||-|-------|-||-- 1 [R] COG3093 Plasmid maintenance system antidote protein --------------------|----------|||-|------|||||-|--||------||-||-- 1 [P] COG3142 Uncharacterized protein involved in copper resistance -------------------||-----|-------|-||----|||-|-||---------||-|--- 1 [R] COG3180 Putative ammonia monooxygenase --------------------|-----|---------||--------|-||-|---|---||----- 1 [S] COG3181 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---------------|-||----|---------------|||||-||-----||||||||--- 1 [O] COG3187 Heat shock protein --------------------|--------------||-----|||-|--|---------------- 1 [E] COG3192 Ethanolamine utilization protein ---|------|--------||-----|||--|--|--|----||||--||---------||-||-- 1 [P] COG3221 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, periplasmic component --------|-----------||-----|---------------------|-----|---||-|--- 1 [S] COG3246 Uncharacterized conserved protein --------------------|----------------|----|||-|-||---------|--|--- 1 [P] COG3263 NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters with a unique C-terminal domain --------------------|-------------|-|-----|||||-|-----------|----- 1 [T] COG3275 Putative regulator of cell autolysis --------------------|---------||||||||----|||||-||--|--|---|||||-- 1 [KT] COG3279 Response regulator of the LytR/AlgR family -----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-||||||| 1 [M] COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes --------------------|-----||-||---||||-----------|---------------- 1 [S] COG3323 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|-----|----------|--------|-||-|---|---||----- 1 [S] COG3333 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|||----|--------|||----|||-|---||-------------- 1 [E] COG3340 Peptidase E --|----------|----|||------||-|---|--|----|--||-||----------|----- 1 [L] COG3344 Retron-type reverse transcriptase ------------------|||----------------|----|--||---||-------||||--- 1 [S] COG3395 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------||---------|-|||-|----|||-----------------|--- 1 [S] COG3412 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------||||-||-----|||||----|-------------- 1 [G] COG3444 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB --------------------|---|--------------------|-----|------|--|---- 1 [P] COG3470 Uncharacterized protein probably involved in high-affinity Fe2+ transport --------------------|----------|-|----------------|-------------|| 1 [M] COG3475 LPS biosynthesis protein -||-----------------|----------|----|----------------------------- 1 [R] COG3478 Predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon domain -|-------|----------|---------||||||||----------------------|----- 1 [R] COG3481 Predicted HD-superfamily hydrolase --------------------|----------||---||--------|-|----------------- 1 [C] COG3493 Na+/citrate symporter ----------------|---|--------------------------------------||||||| 1 [S] COG3494 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|-----|---------------|||---|-|--|-|---||-||-- 1 [R] COG3550 Uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzymes |||----------------|||-----|||--|----------------|---------||-||-- 1 [R] COG3576 Predicted flavin-nucleotide-binding protein structurally related to pyridoxine 5'-phosphate oxidase ----------------||--|---------||---|------------------------------ 1 [S] COG3580 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||--|---------||---|------------------------------ 1 [S] COG3581 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|-------------------------|----|-||-||-------- 1 [V] COG3587 Restriction endonuclease ---------------|--|-|---------|---|-----------------|------||-|--- 1 [G] COG3588 Fructose-1,6-bisphosphate aldolase -||---------------|-|---------------------|||||-||-|-------|--|--- 1 [L] COG3593 Predicted ATP-dependent endonuclease of the OLD family |------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|------- 1 [S] COG3610 Uncharacterized conserved protein -------------||-----|-----|||--------------------|-----|---|||||-- 1 [E] COG3616 Predicted amino acid aldolase or racemase --|---------------|-|------||-||||-||------------|-----|---||||--- 1 [S] COG3619 Predicted membrane protein ---|---------------||-----|----|--|--|-|--||||---|---------||-||-- 1 [P] COG3638 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component ---|------|--------||-----|----|--|--|-|||||||---|---------||-||-- 1 [P] COG3639 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component --------------------|---|-------|-||-|---------------------------- 1 [R] COG3641 Predicted membrane protein, putative toxin regulator -|------------------|---------------------|||-|---|--------------- 1 [S] COG3681 Uncharacterized conserved protein --------------------|---|--------------------||---||-------||||--- 1 [R] COG3683 ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component ------------------||||----------||-------------------------------- 1 [R] COG3694 ABC-type uncharacterized transport system, permease component --------------------|-----------|---------|||-|-|-|--------------- 1 [HI] COG3697 Phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase (holo-ACP synthetase) --------------------|------||||----|-------------|-----|---||-||-- 1 [T] COG3707 Response regulator with putative antiterminator output domain --------------------|-----|---||||||||----|||||------------------- 1 [K] COG3711 Transcriptional antiterminator --------------------|---------------------|||||-|--|---|---||-||-- 1 [M] COG3713 Outer membrane protein V --------------------|---------||||-||-----|||||----|-------------- 1 [G] COG3715 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC --------------------|---------||||-||-----|||||----|-------------- 1 [G] COG3716 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IID --------------------|-----------|---------||||---|-----|---||||--- 1 [S] COG3758 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------||-----|---------------------------|--|---|---|------ 1 [M] COG3774 Mannosyltransferase OCH1 and related enzymes --|-------|------|--|--------------------------------------|||||-- 1 [C] COG3808 Inorganic pyrophosphatase -------------------|||--------------------|||--------------|--|--- 1 [S] COG3831 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||--- 1 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components --------------------|---------||--|||----------------------------- 1 [G] COG3855 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------|---------|--|---------|----------------------------------- 1 [S] COG3862 Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs -----------------|--|---------|----|||---------------------------- 1 [R] COG3872 Predicted metal-dependent enzyme --------------------||--------|---|||----------------------------- 1 [S] COG3878 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-----------------|-----|---|---|-------------|-------||-------- 1 [L] COG3886 Predicted HKD family nuclease --------------|----||--------||-|---------------------------|-|--- 1 [R] COG3899 Predicted ATPase -|--||-|--|||----|--|------------|-----------||------------||-|--- 1 [G] COG3958 Transketolase, C-terminal subunit -|--||-|--|||----|--|------------|-----------||------------||-|--- 1 [G] COG3959 Transketolase, N-terminal subunit --------------------|-----|-----||--------------||-----|---||||-|| 1 [R] COG4120 ABC-type uncharacterized transport system, permease component --||--------|-|-|-||||----||||||||||||-----------|---||-------|--- 1 [R] COG4122 Predicted O-methyltransferase --------|-----------|----|----------------|||||---||-------------- 1 [H] COG4145 Na+/panthothenate symporter -----------------|--|-|||||||-||-||||-||--|||||-||||---|||-||||--- 1 [E] COG4166 ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component --------------------|---------------------|||||-||-----|---||||--- 1 [R] COG4172 ABC-type uncharacterized transport system, duplicated ATPase component -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG4177 ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component --------------------|---|-----------------|||||-|-||-------------- 1 [G] COG4211 ABC-type glucose/galactose transport system, permease component ---|---------||---||||----|||--|-|||------|||-|-||||||||||||||---- 1 [R] COG4221 Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity --------------------|---------||||||||---------------------------- 1 [S] COG4224 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|--|---------|------------------|-----|---------- 1 [S] COG4267 Predicted membrane protein |-------------------|---------|----------------------------|---|-- 1 [R] COG4277 Predicted DNA-binding protein with the Helix-hairpin-helix motif --------------------|---------|----|------|||-|--|-----|---------- 1 [E] COG4302 Ethanolamine ammonia-lyase, small subunit --------------------|---------|----|------|||-|--|-----|---------- 1 [E] COG4303 Ethanolamine ammonia-lyase, large subunit --------------------|------------------------|-----|------|------- 1 [S] COG4393 Predicted membrane protein --------------------|----------------------------|----||---------- 1 [S] COG4394 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|||-------------||||---------------------------- 1 [S] COG4399 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------------------|||||--|---------|------ 1 [V] COG4452 Inner membrane protein involved in colicin E2 resistance --------------------|---------||-|--||---------------------------- 1 [G] COG4468 Galactose-1-phosphate uridyltransferase --------------------|---------|---|-||---------------------------- 1 [R] COG4492 ACT domain-containing protein --------------------|---|-------------------------||-------------- 1 [O] COG4545 Glutaredoxin-related protein -------------------||------||--|-----|---------------------------- 1 [R] COG4552 Predicted acetyltransferase involved in intracellular survival and related acetyltransferases ------------------|||--------------|------|||-|------------------- 1 [QC] COG4576 Carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein -------------||---||||----------||-------------------------------- 1 [R] COG4586 ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component ------------------||||----------||-------------------------------- 1 [R] COG4587 ABC-type uncharacterized transport system, permease component --------------------|---------------------||||--||-|--------|----- 1 [R] COG4589 Predicted CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase --|-------------|---||--||----|-----------|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG4591 ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component -------------------|||--------|---------------------------|------- 1 [R] COG4639 Predicted kinase --|--------------|--|---||---------|------||||||||||-------------- 1 [C] COG4656 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC --|--------------|--|---------------------||||||||||-------------- 1 [C] COG4657 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfA --|--------------|--|---|-----------------||||||||||-------------- 1 [C] COG4658 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfD --|--------------|--|---------------------||||||||||-------------- 1 [C] COG4659 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfG --|--------------|--|---------------------||||||||||-------------- 1 [C] COG4660 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfE --------------------|-----|---|-----------|||||-|--|-------------- 1 [R] COG4667 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily ---||-----|-|-------|-------------||-|----|||-|--------|----|||--- 1 [I] COG4670 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase ----------------||--|--------------------------------------------- 1 [S] COG4752 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|-----------||||||---------------------------- 1 [T] COG4753 Response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain --------------------|--------------|------|||-|------------|------ 1 [E] COG4766 Ethanolamine utilization protein -----------------|--|---|------|---|------------------------------ 1 [S] COG4769 Predicted membrane protein -------------||-||||||||||----------------|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87 --------------------|------------------------------|-||---------|| 1 [R] COG4797 Predicted regulatory domain of a methyltransferase ---|--|||--|-||--|--||----||||------||-----------|-----|---||||||| 1 [I] COG4799 Acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta) --|-----------------|---------------------|||-|--------|---------| 1 [S] COG4804 Uncharacterized conserved protein --------------------|---------------------|||||--|---------------- 1 [S] COG4807 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|--------------|------|||-|------------------- 1 [E] COG4810 Ethanolamine utilization protein --------------------|--------------|------|||-|------------------- 1 [E] COG4812 Ethanolamine utilization cobalamin adenosyltransferase --------------------|--------------|------|||-|------------------- 1 [E] COG4816 Ethanolamine utilization protein --------------------|--------------|------|||-|------------------- 1 [E] COG4819 Ethanolamine utilization protein, possible chaperonin protecting lyase from inhibition --------------------|--------------|------|||-|------------------- 1 [E] COG4820 Ethanolamine utilization protein, possible chaperonin --------------------|---------|----|----------|------------------- 1 [H] COG4822 Cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase --------------------|--------------|---------------|-------------- 1 [V] COG4823 Abortive infection bacteriophage resistance protein --|-----------------|----------|---|------------------------------ 1 [S] COG4832 Uncharacterized conserved protein --------------------|---------------|-----------------------|-|--- 1 [R] COG4857 Predicted kinase --------------------|----------------------------|---||----------- 1 [S] COG4859 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|----------------|----------------------||--------------------- 1 [E] COG4865 Glutamate mutase epsilon subunit --|-----------------|-----------------|-----------------||-------- 1 [S] COG4866 Uncharacterized conserved protein --------------------|-----|-----||-------------------------------- 1 [S] COG4868 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-----|-----------|---------|---------------------|------------- 1 [O] COG4870 Cysteine protease --------------------|---------------------------|------|---------- 1 [S] COG4874 Uncharacterized protein conserved in bacteria containing a pentein-type domain --------------------|--------------|------|----------------------- 1 [S] COG4884 Uncharacterized protein conserved in bacteria -||-----------------|--------------------------------------------- 1 [S] COG4907 Predicted membrane protein --|-----------------|-----|----|---|------------------------|-|--| 1 [L] COG4912 Predicted DNA alkylation repair enzyme --------------------|--------------|------|||-|------------------- 1 [E] COG4917 Ethanolamine utilization protein --------------------|------------|---------------------|---|------ 1 [S] COG4922 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|-------------|-------------------------|----- 1 [R] COG4927 Predicted choloylglycine hydrolase --|----------------||------------------------|-----|---------|---- 1 [S] COG4929 Uncharacterized membrane-anchored protein --------------------|---|----------|------------------------------ 1 [S] COG4939 Major membrane immunogen, membrane-anchored lipoprotein --------------------|---------------------|||||-|||||||----|||||-- 1 [D] COG4942 Membrane-bound metallopeptidase ---|||--||-||----|||||----||||||--||||----|||||--|-----|---|||||-- 1 [MR] COG4948 L-alanine-DL-glutamate epimerase and related enzymes of enolase superfamily -------------------||---------------------|||-|----||------||-||-| 1 [M] COG4953 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC --------------------|---|-|||||---||||----|||||-||||||||---||||||| 1 [L] COG4974 Site-specific recombinase XerD --------------------|------------------------|-----|-------------- 1 [S] COG4984 Predicted membrane protein --------------------|-----|||--||-||||----|||||-|-||-------|-|-|-- 1 [CO] COG4988 ABC-type transport system involved in cytochrome bd biosynthesis, ATPase and permease components --|-----------------|---------|----------------------------------| 1 [S] COG4997 Uncharacterized conserved protein |-|-----|-----------|---------------------------------------|-|--- 1 [R] COG5012 Predicted cobalamin binding protein --|-----------------|---------|---------------------------|------- 1 [S] COG5015 Uncharacterized conserved protein |||---|-|-------||--|---|-------|-------------|-||-|------|------- 1 [C] COG5016 Pyruvate/oxaloacetate carboxyltransferase -------------||-----|--------------------------------------------- 1 [S] COG5324 Uncharacterized conserved protein -----------------|--|----------|---|------------------------------ 1 [S] COG5341 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|-----|---||--|------------------------------- 1 [S] COG5438 Predicted multitransmembrane protein --|--------||----|--||----|-----|--------------------------------- 1 [R] COG5496 Predicted thioesterase -------|------------|---------------||---------------------------- 1 [S] COG5505 Predicted integral membrane protein --------------------|---|-|---------|----------------------------- 1 [S] COG5522 Predicted integral membrane protein --------------------|------|||--------------------------||-------- 1 [N] COG5651 PPE-repeat proteins