| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ |-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---||||||| 53 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 36 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily |||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 31 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases -----|--------------||----|||--|||||-|----|||||-|||----|---|||||-- 31 [L] COG2963 Transposase and inactivated derivatives --|-||--|----||---||||----|||--|||||-|||--|||||-|||--|||---|||||-- 28 [L] COG2801 Transposase and inactivated derivatives --||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 27 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components |-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 24 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes |-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|--- 24 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily ||||----|||||---|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 22 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component |||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||-- 22 [K] COG1846 Transcriptional regulators ||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 21 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis |-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||-- 21 [R] COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease -----------------|--||----|||-||||||||-|--|||||-|||||--|---|||||-- 21 [K] COG1609 Transcriptional regulators |||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 20 [L] COG0582 Integrase |-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 20 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component |-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 20 [K] COG1309 Transcriptional regulator ----------------||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 19 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 18 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component --|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-||||||||||||| 18 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain ||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 17 [M] COG0438 Glycosyltransferase ||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 17 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component |-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 16 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase --|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 16 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) -------------------|||----|--||||||||||-|||||||-||||||||--||||||-- 16 [P] COG1393 Arsenate reductase and related proteins, glutaredoxin family ----||||--||--------------|---||||||||----|||||-|----------||--|-- 16 [G] COG2723 Beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/beta-galactosidase --------------------------|||--|-|---|-|--|||--------|||---||--|-- 16 [L] COG2826 Transposase and inactivated derivatives, IS30 family ------------------------------||-|-------------------------------- 16 [R] COG5263 FOG: Glucan-binding domain (YG repeat) --|-||----|--||--|||-|----|||-||||||||-|--|||||-||-----|---||-||-- 15 [G] COG0366 Glycosidases --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 15 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component --------------------|-|||||---||||||||-||||||||-||||-|||---|||||-- 15 [GT] COG1762 Phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain (Ntr-type) -------------|||--||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 14 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains |||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 14 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases ---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||-- 14 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase -|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-||||||||||||| 13 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins ||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 12 [K] COG0583 Transcriptional regulator --------------------|----||---||||||||-|||||||||||-|---|-------|-- 12 [G] COG1263 Phosphotransferase system IIC components, glucose/maltose/N-acetylglucosamine-specific --------------------|----||---||||||||||||||||||||-|---|-------|-- 12 [G] COG1264 Phosphotransferase system IIB components -------------------|-|----|||-||||||||||--|||||-||-----|---|||||-- 12 [K] COG2188 Transcriptional regulators --|--|--|--|------||-|----|------|---|-----||-|-------||----|-|--- 12 [L] COG3335 Transposase and inactivated derivatives --------------------|-----|---||||||||----|||||------------------- 12 [K] COG3711 Transcriptional antiterminator |||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 11 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins ||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---||||||| 11 [E] COG0531 Amino acid transporters ||||--|||||||----|||||--|-||||||||||||||||-||-|-|-|----|---|||---- 11 [P] COG1122 ABC-type cobalt transport system, ATPase component ---------|-------|--|-||-|----||||||||||||------|----------|||---- 11 [S] COG1284 Uncharacterized conserved protein -----------------|--||||------||||||||---------------------------- 11 [S] COG1302 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|--||----|||-||||||||||||-------|---------------- 11 [S] COG1307 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|||-|--||||||||||||||---------------------------- 11 [K] COG1316 Transcriptional regulator ----------------||--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---||||--- 11 [KG] COG1349 Transcriptional regulators of sugar metabolism -------------------------|----||||||||----|||||-|----------------- 11 [G] COG1455 Phosphotransferase system cellobiose-specific component IIC -----------------|--------|---||||||||-|--|||||-||||-|||---|||||-- 11 [K] COG1737 Transcriptional regulators --------------------|----||---||||||||-|||||||||||||---|-------|-- 11 [G] COG2190 Phosphotransferase system IIA components --|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 10 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators --|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||-- 9 [G] COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase |||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 9 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase ||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||--- 9 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins ||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 9 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase |------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||| 9 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 9 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific |-------|--|-|||-||-||---|----||||||||-|||||||||-||||--|---|||||-- 9 [G] COG0580 Glycerol uptake facilitator and related permeases (Major Intrinsic Protein Family) |-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||-- 9 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins -----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 9 [M] COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein) |||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 9 [C] COG0778 Nitroreductase |-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-|| 9 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 9 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases -------------------------|----||||||||----|||||-|----------------- 9 [G] COG1447 Phosphotransferase system cellobiose-specific component IIA ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||----|||||-||-||--|---||||--- 9 [G] COG1653 ABC-type sugar transport system, periplasmic component -----------------|-------------||-|||-----|||||-||-----|-----|---- 9 [NU] COG1705 Muramidase (flagellum-specific) --------------------|---------|-||||||----------||--|--|---------- 9 [T] COG2972 Predicted signal transduction protein with a C-terminal ATPase domain -------------------------------||||----------------------------|-- 9 [R] COG3942 Surface antigen |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 8 [R] COG0073 EMAP domain --|----------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 8 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||-||||||||-||-||--|---||||--- 8 [G] COG0395 ABC-type sugar transport system, permease component |||-|--------||||-|||-----||||||||-||||||||||||--|----------|||--- 8 [P] COG0474 Cation transport ATPase |||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||| 8 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases |||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---||||||| 8 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins ----------------|||-|-----|||||-|||||||||||--||----|----|||-|||-|| 8 [G] COG0698 Ribose 5-phosphate isomerase RpiB ||||-|-||----------|-------||--|||||--|||||||-|-|||||---|||-||-|-| 8 [V] COG0732 Restriction endonuclease S subunits ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|---||||--- 8 [G] COG1175 ABC-type sugar transport systems, permease components ||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 8 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes -----------------|---|-|--||||||||||||----|||||-|-||-------------- 8 [K] COG1438 Arginine repressor ||||---||----------|-|--------||||||||-----------|-------------|-- 8 [K] COG1476 Predicted transcriptional regulators |-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||-- 8 [P] COG2217 Cation transport ATPase --------------------|---------||||-||-----|||||----|||||---|||||-- 8 [G] COG2893 Phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA --------------------|---------||||-||-----|||||----|-------------- 8 [G] COG3444 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB --|--|-------------||-----|||----||--|-----------------|---||-|--- 8 [L] COG3464 Transposase and inactivated derivatives --------------------|---------||||-||-----|||||----|-------------- 8 [G] COG3715 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC --------------------|---------||||-||-----|||||----|-------------- 8 [G] COG3716 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IID |--------|----------------|---||||||||---------------------------- 8 [M] COG3764 Sortase (surface protein transpeptidase) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 7 [J] COG0267 Ribosomal protein L33 |-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 7 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases |||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 7 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase |||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 7 [R] COG0517 FOG: CBS domain ||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 7 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump --||--|||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 7 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases -||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||-- 7 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component ||||--||||-||----|||||----||||||||||||||||-||-|---|--------|||---- 7 [P] COG0619 ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters -|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 7 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases |||------|-|----|--|||--------||||||||----|||||-||||-|||||||||---- 7 [O] COG0826 Collagenase and related proteases ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 7 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component --|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||-- 7 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase ||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--|||||||||||||| 7 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators ||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 7 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid --------------------|---------||||||||----|||||-||--|--|---|||||-- 7 [KT] COG3279 Response regulator of the LytR/AlgR family --|---------------||-|----||-----|---------------------|---|-|||-- 7 [L] COG3293 Transposase and inactivated derivatives --------------------------|---|-||||-|-||-|||-|-|--|-------------- 7 [G] COG3414 Phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 6 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase -|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||-- 6 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC ||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-| 6 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) ||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit |-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 6 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase ||||---||----------|-------||--|||||--|||-|||-|-|||||||||||-||-|-| 6 [V] COG0286 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit |||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||-- 6 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases ||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 6 [R] COG0456 Acetyltransferases |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| 6 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase ---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|--- 6 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase |||||||||-|||||||-||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases |-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 6 [R] COG0546 Predicted phosphatases --------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 6 [J] COG0566 rRNA methylases ||||--||-|-------|||||----||||||||||||||||--------------|||||||||| 6 [R] COG0595 Predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily -||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-| 6 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters |-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-|||| 6 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase ----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--||||||||||| 6 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases ||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [R] COG0628 Predicted permease -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein ---|||||--||||||-||-------||||||||||||----|||||--|-----|---|||||-- 6 [R] COG0656 Aldo/keto reductases, related to diketogulonate reductase ||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-||||||| 6 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 6 [O] COG0719 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component --|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||-- 6 [G] COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase -------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-||||||| 6 [F] COG0756 dUTPase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein |-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||-- 6 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component ----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases ||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||-- 6 [R] COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily) --|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||-- 6 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases --|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-||||||||||||| 6 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 6 [G] COG1109 Phosphomannomutase |-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 6 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component -||---||-|||||||-||||----|----||||||||||||------|----||----------- 6 [R] COG1161 Predicted GTPases |||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----||||||| 6 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases ||||||||||------||--||--||----|||||||||-|||||-|---------|||||----- 6 [R] COG1418 Predicted HD superfamily hydrolase -------------------------|----||||-|||----|||||-|----------------- 6 [G] COG1440 Phosphotransferase system cellobiose-specific component IIB --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 6 [P] COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen --|-------------|----------||-|||||||||---||||||-------|---||-|--- 6 [L] COG1484 DNA replication protein ||||--||||||||||---------|-----|||||------------------------------ 6 [I] COG1577 Mevalonate kinase ----|--------||--|||-|----|||-||||||||----|||||--|---------||-||-- 6 [IR] COG1597 Sphingosine kinase and enzymes related to eukaryotic diacylglycerol kinase |-|||||||-|||----|-|||----||||||||||||----|||||-|------|------||-- 6 [K] COG1695 Predicted transcriptional regulators --------------------||----||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 6 [E] COG1760 L-serine deaminase ----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||-- 6 [NU] COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG -------|------|--|--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---|||---- 6 [F] COG2233 Xanthine/uracil permeases -------------------|-|----||||-||||-|-----|||||--|-----|---|||||-- 6 [S] COG2261 Predicted membrane protein ------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 6 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase -----------|-||---||-------|||||||-|||----|||||-||-|-|||--||||||-- 6 [E] COG2755 Lysophospholipase L1 and related esterases --------------------|----------||-|--------|--|--||||||----|||||-- 6 [K] COG2932 Predicted transcriptional regulator |--------------------|---------|------------------------------||-- 6 [S] COG3548 Predicted integral membrane protein ------------------||-|----||||||||||||-|-------------------------- 6 [D] COG3599 Cell division initiation protein ------------------------------||||||||---------------------------- 6 [L] COG3935 Putative primosome component and related proteins -----------------|--|-|||||||-||-||||-||--|||||-||||---|||-||||--- 6 [E] COG4166 ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component ------||----------------------|||||------------------------------- 6 [S] COG4720 Predicted membrane protein |||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 5 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase] ||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--|||||||| 5 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases |||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||-- 5 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase ---|||||---||||-||||--||--|----|||||||-||||||||-||---------------- 5 [H] COG0095 Lipoate-protein ligase A ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase -|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 5 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 5 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I ||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---||||||||||||| 5 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 5 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase ||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-||||||| 5 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [J] COG0199 Ribosomal protein S14 ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 5 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component |-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||-- 5 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase ---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase |||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase |||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 5 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase ---|---------||---||-|----|||--|||||||--|||||||-||-|-|||---||-||-- 5 [R] COG0431 Predicted flavoprotein --|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||--- 5 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component ||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-|| 5 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase ||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [O] COG0492 Thioredoxin reductase |||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 5 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein ---|||||--|-|-----|------------||||-----|-|||-|--||---------|----- 5 [E] COG0549 Carbamate kinase ---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||-- 5 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase --||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-|||||||||||||||||| 5 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||--- 5 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components ||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K |-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 5 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family |-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily |||||||||||||---||||-|---|||||||||||-||-|||||||-||--|--|---|||||-- 5 [P] COG0704 Phosphate uptake regulator ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2 ------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||-- 5 [M] COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins) ||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-| 5 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases -----------------|--||---||||-||||||||--|||||||-||||---|---------- 5 [G] COG1105 Fructose-1-phosphate kinase and related fructose-6-phosphate kinase (PfkB) |-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 5 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components --------------------------|||||||-||||----|||||--|---------|-|---- 5 [E] COG1113 Gamma-aminobutyrate permease and related permeases --||-------------|--||||||-----|||||||||||------|-------||||||||-- 5 [E] COG1164 Oligoendopeptidase F --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||--- 5 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components |||-|||||||||---||--|------||-||||||------|||||-||||---|---------- 5 [O] COG1180 Pyruvate-formate lyase-activating enzyme ||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||-- 5 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III --------------------||---||---||||||||-||||||||-|||----|---------- 5 [G] COG1299 Phosphotransferase system, fructose-specific IIC component ---------------------------------|--|-----|||-|---||----||--|---|| 5 [M] COG1442 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins, LPS:glycosyltransferases |-------|-----------|---------||||||------|||||-|-||---|---------- 5 [C] COG1882 Pyruvate-formate lyase |-----|------------------------|--|||------------|--|------------- 5 [M] COG1887 Putative glycosyl/glycerophosphate transferases involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC --|---||---------|--------|---||||-|||----|||||-|----------------- 5 [KT] COG1983 Putative stress-responsive transcriptional regulator ----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||-- 5 [G] COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes ------------------||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 5 [TK] COG2197 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain -----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||-- 5 [K] COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins --|------------------|--||------|||------------------------------- 5 [V] COG2348 Uncharacterized protein involved in methicillin resistance --------------------||----|||-||||||||---------------------------- 5 [S] COG2357 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|------|----||||||-----|||-|--|---------||-||-- 5 [S] COG3237 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||-- 5 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components -------------------------------|-||--|---------------------------- 5 [S] COG4652 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|-----------||||||---------------------------- 5 [T] COG4753 Response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain ||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||------------- 4 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases |||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase --||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [E] COG0031 Cysteine synthase -|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 4 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase ||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--|||||||| 4 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 4 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 4 [G] COG0148 Enolase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase -|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||-- 4 [G] COG0176 Transaldolase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY ---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-||| 4 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit |-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 4 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit ---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family --|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-| 4 [H] COG0262 Dihydrofolate reductase --|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-|| 4 [C] COG0282 Acetate kinase ---|------|-|||--|---|---|-||||||||||||||||||||-|-||-------||-||-- 4 [F] COG0295 Cytidine deaminase |||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--|||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs ||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase -------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||-- 4 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase --||-------|-||---|||-----|||-|||||||||||||||||-||-|-|||---|||||-- 4 [L] COG0389 Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair |-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||-- 4 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase --||---------||---||------|||-||||||||----|||---|-----------|--|-- 4 [S] COG0398 Uncharacterized conserved protein |||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [I] COG0439 Biotin carboxylase -----------------|||||||--||||||-|--||----|||||-|-||-------||-|--- 4 [G] COG0448 ADP-glucose pyrophosphorylase ---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 4 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes -------------||-----|---|------|||||||-||||||||-|-|-----------|--- 4 [M] COG0510 Predicted choline kinase involved in LPS biosynthesis ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II |||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||-- 4 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family ---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 4 [K] COG0557 Exoribonuclease R ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||-- 4 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 4 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component -||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||-- 4 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component --||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases -|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||-- 4 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase) --|--|--|--|-||--|||-|--|-|||||||-||-|----|||||-||--|--|---||-||-- 4 [I] COG0657 Esterase/lipase -------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||-- 4 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 4 [U] COG0681 Signal peptidase I -------------||----|-|----|----|-|--------||||||||||||||------||-- 4 [E] COG0722 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase |--|----|----||-|||--|--|-|---|||-||||-|--|||||-|-||---|||-||-|--- 4 [F] COG0737 5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases |||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1 -------------|||||||||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase ----------------||||||||------||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases ----||----------||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein -------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 4 [H] COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase |------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||-- 4 [M] COG1087 UDP-glucose 4-epimerase --|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||----- 4 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II) -||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||-- 4 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases |||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||-- 4 [M] COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase |-|-||||||||-||||-||------|---|||-||||----|||||--|-----|---|||||-| 4 [M] COG1215 Glycosyltransferases, probably involved in cell wall biogenesis --||---------||-|||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||| 4 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains |-||--|||--------||||||-|-|---||||||||---------------------||||-|| 4 [R] COG1268 Uncharacterized conserved protein ||||--|||||-|----|-|||--------||||||||||--|||-|--|----------|----- 4 [G] COG1363 Cellulase M and related proteins ---|--------------||-|-----||||||-|||-----|||---|---|--|---|||||-- 4 [V] COG1403 Restriction endonuclease --------------------||---||---||||||||-||||||||-||||---|---------- 4 [G] COG1445 Phosphotransferase system fructose-specific component IIB -----------------|--||----|||-||||||||||||------------------------ 4 [R] COG1461 Predicted kinase related to dihydroxyacetone kinase --|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||-- 4 [H] COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis ----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-||||||| 4 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes |--------------------|----||||||||||||---------------------------- 4 [S] COG1511 Predicted membrane protein ----------|-----|-||||||-||||--|||--------|||||-||||---|---------- 4 [G] COG1640 4-alpha-glucanotransferase -------------------|-||||||||||||||||||---|||||-|||||||||||||||||| 4 [D] COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins --------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 4 [M] COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase -----------------||-||--|-----||||||||||||------------------------ 4 [H] COG1713 Predicted HD superfamily hydrolase involved in NAD metabolism ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-|||||||-------|-----|---||||--- 4 [R] COG1744 Uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein ---------------------|----||||-||||-|--||||||||------------|-|---- 4 [F] COG1780 Protein involved in ribonucleotide reduction ----------------||--|-||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [U] COG1862 Preprotein translocase subunit YajC --------------|-----|------|||||||-|------|||----|--------|||||||| 4 [R] COG2071 Predicted glutamine amidotransferases |||-||||-||||----|---|----||||-|||||||----|---------|--|---|||||-- 4 [R] COG2151 Predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme ----|-||--|||----|---|---------|||||||----|||||-|----------|------ 4 [G] COG2182 Maltose-binding periplasmic proteins/domains ---|---------------|-|--------||||||||----|||||-||||||||---------- 4 [R] COG2333 Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily) ----||-------||--|--|---------||||||--|---------|----||-----|-|--- 4 [F] COG2759 Formyltetrahydrofolate synthetase --------------------|----||----|||||---|--|||||-|-||---------|---- 4 [G] COG3010 Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase --------------------------|-----||||-|-||-|||||-|--|-------------- 4 [S] COG3037 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|----------|-|----------------|-------------|| 4 [M] COG3475 LPS biosynthesis protein -------------------------------||--|-------|||---||-|--------|---- 4 [K] COG3617 Prophage antirepressor --|---------------|-|------||-||||-||------------|-----|---||||--- 4 [S] COG3619 Predicted membrane protein ------------------------------||||--------|||-------|------||||--- 4 [M] COG3757 Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase) ----|--|--||-----|---|---------|||||||-|--|||||-|----------------- 4 [G] COG3833 ABC-type maltose transport systems, permease component ------------------------------||||-|||---------------------------- 4 [S] COG3883 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|||-|-||||||---------------------|-|---- 4 [S] COG4129 Predicted membrane protein -------------------------------|||-|||---------------------|------ 4 [G] COG4209 ABC-type polysaccharide transport system, permease component ------------------------------||||||||---------------------------- 4 [K] COG4465 Pleiotropic transcriptional repressor ------------------||-|----|||-||||||||-----------|-----|---||-||-- 4 [T] COG4585 Signal transduction histidine kinase --|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||--- 4 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component ------------------------------||||-|------------------------------ 4 [S] COG4687 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----------------------------||-------------|--|---------------- 4 [E] COG4690 Dipeptidase ------------------------------|||--|||---------------------------- 4 [S] COG4722 Phage-related protein --------------------------|---||-|-|-|---------------------------- 4 [V] COG4767 Glycopeptide antibiotics resistance protein -------------------|------------|---------|||---------------|----- 4 [L] COG5433 Transposase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||| 3 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 3 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase -------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 3 [G] COG0021 Transketolase ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 3 [C] COG0022 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase ||||||-|||---|||--||-|----|||--|-||||-----|||||-||-||------|--|--- 3 [P] COG0025 NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters ---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||-- 3 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation) ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 3 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase |--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||-- 3 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 3 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase ||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||-- 3 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 3 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 3 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0048 Ribosomal protein S12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0049 Ribosomal protein S7 ---------|---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0051 Ribosomal protein S10 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0052 Ribosomal protein S2 --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit -||---||--||-|--|-||||||--|||-||||--||----|||||-||||-------||-|--- 3 [G] COG0058 Glucan phosphorylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 3 [G] COG0061 Predicted sugar kinase ||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---||||||||||||| 3 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0080 Ribosomal protein L11 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0081 Ribosomal protein L1 ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0082 Chorismate synthase |||---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0084 Mg-dependent DNase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0087 Ribosomal protein L3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0088 Ribosomal protein L4 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0089 Ribosomal protein L23 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0090 Ribosomal protein L2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0091 Ribosomal protein L22 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0092 Ribosomal protein S3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0093 Ribosomal protein L14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0094 Ribosomal protein L5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0096 Ribosomal protein S8 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0098 Ribosomal protein S5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0099 Ribosomal protein S13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0100 Ribosomal protein S11 |||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0102 Ribosomal protein L13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0103 Ribosomal protein S9 ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 3 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase -|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||---------- 3 [L] COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase ||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||-- 3 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [F] COG0125 Thymidylate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 3 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 3 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--|||||||| 3 [J] COG0130 Pseudouridine synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 3 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 3 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--|||||||| 3 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0164 Ribonuclease HII -|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 3 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase ||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||---- 3 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 3 [H] COG0171 NAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [E] COG0174 Glutamine synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0185 Ribosomal protein S19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0186 Ribosomal protein S17 --||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||| 3 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase -------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||-- 3 [G] COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase -------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase -------------|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [F] COG0194 Guanylate kinase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0195 Transcription elongation factor -------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG0196 FAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0198 Ribosomal protein L24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0200 Ribosomal protein L15 ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0203 Ribosomal protein L17 -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|--- 3 [G] COG0205 6-phosphofructokinase ||||||||||------||||||--||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 3 [D] COG0206 Cell division GTPase |||-----||---|||----||----||||||||||||-|||||||||||||||||---|||||-- 3 [F] COG0207 Thymidylate synthase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0211 Ribosomal protein L27 --|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0216 Protein chain release factor A -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein -|||--||||---|--||--|---------|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0218 Predicted GTPase ------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||-- 3 [J] COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class) -------------||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit -------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0227 Ribosomal protein L28 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0228 Ribosomal protein S16 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0230 Ribosomal protein L34 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0233 Ribosome recycling factor --|----------||-||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10) ||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--|||||| 3 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 3 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0238 Ribosomal protein S18 |-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 3 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0244 Ribosomal protein L10 -------------|---|--------|---||-||-||-||-||||||||-|---|---|||||-- 3 [G] COG0246 Mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenases |||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0250 Transcription antiterminator |||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|---- 3 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0254 Ribosomal protein L31 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0255 Ribosomal protein L29 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0256 Ribosomal protein L18 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0257 Ribosomal protein L36 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0261 Ribosomal protein L21 --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 3 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts |-||------||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain ------------------||-|----||||-||||||||||||||||-||||||||---|||||-| 3 [L] COG0266 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0268 Ribosomal protein S20 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II) |--|||----|-|---||||-|--|-|||||||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 3 [F] COG0274 Deoxyribose-phosphate aldolase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis --||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-||||||||| 3 [C] COG0280 Phosphotransacetylase --|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 3 [C] COG0281 Malic enzyme ---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---||||||| 3 [F] COG0283 Cytidylate kinase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3) -------------|--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0291 Ribosomal protein L35 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0292 Ribosomal protein L20 |||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 3 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes --||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 3 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN --|----|---|-|||---||-----||||||||||||-----------|-|---|---||-||-- 3 [R] COG0300 Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities |||||||||||||----|------|-----|||||||||||||||||-||||-------------- 3 [H] COG0301 Thiamine biosynthesis ATP pyrophosphatase ----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--||||||||||| 3 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0305 Replicative DNA helicase --|-||----||-|||--||-|----||||-|||--------|||||-||||||||---|||||-- 3 [E] COG0308 Aminopeptidase N ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0313 Predicted methyltransferases ----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-| 3 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases |-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 3 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex --||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---||||||| 3 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase) -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase --|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold ||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||------- 3 [S] COG0327 Uncharacterized conserved protein -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase ----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0333 Ribosomal protein L32 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0335 Ribosomal protein L19 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase ----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase |||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase ----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||-- 3 [S] COG0344 Predicted membrane protein |-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase --|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase ----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit) --|----------|--|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type) --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0359 Ribosomal protein L9 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0360 Ribosomal protein S6 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1) |||||||||||||-|--|||----------||||-|||----|||||-------------|----- 3 [C] COG0371 Glycerol dehydrogenase and related enzymes ||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----|| 3 [M] COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase -----||----|-||--|||-------||--|||-|-|----|----------------------- 3 [G] COG0383 Alpha-mannosidase -------------|||--|-|-----|---|||||||||---|||||--|--||||-------|-- 3 [O] COG0386 Glutathione peroxidase ||||----||---|--||||-|----||||||||||||----|||||-|--|-------------- 3 [S] COG0391 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 3 [O] COG0396 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, ATPase component ----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||-- 3 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0443 Molecular chaperone -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division ||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains ||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases |||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 3 [R] COG0457 FOG: TPR repeat ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 3 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ) ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family) |||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase -|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||-- 3 [G] COG0469 Pyruvate kinase |||||||||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication ||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||---- 3 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA -------------||-||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain ||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--|||||||| 3 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0486 Predicted GTPase ||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase ----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 3 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase) ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 3 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit -|-----------||----|-|||-|-||-||||||||-|--|||||||||||||---|||||--- 3 [L] COG0507 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit |-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||-- 3 [E] COG0520 Selenocysteine lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [F] COG0528 Uridylate kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0536 Predicted GTPase -------------||-||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0539 Ribosomal protein S1 |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||-- 3 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0550 Topoisomerase IA |||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||------- 3 [L] COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase --||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|----- 3 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family ---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||-- 3 [C] COG0554 Glycerol kinase |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex |-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32) ||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||---- 3 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease ---|---------||--|||-|-|||----|||||||||-|||||||-|-||-------------- 3 [F] COG0572 Uridine kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein) ---|||-----|-|||--|--|---|||||-|||||||----|||||-|||||--|---||||--- 3 [C] COG0578 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase ----||-----|------||-|--||||||||--||||----|||||||||||||||||--|||-- 3 [S] COG0586 Uncharacterized membrane-associated protein ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit --|----------||-----|-||||||||||||||------||||||--||||||----||||-- 3 [G] COG0588 Phosphoglycerate mutase 1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog) ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation -----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 3 [J] COG0594 RNase P protein component ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase ||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes |-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [P] COG0605 Superoxide dismutase ||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease -------------|||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase -|||--|||||-|---||||||--|||||-||||||||||||------|----------------- 3 [R] COG0618 Exopolyphosphatase-related proteins |||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||-- 3 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent) ||||--|||||||||--|--|---|----|||||||||-||||||||-||---------------- 3 [R] COG0622 Predicted phosphoesterase -------------|----||------||||-|||||------|||||--|||-|||---|||||-- 3 [R] COG0627 Predicted esterase -----|-------||-|-||-|||--||||||||||||||||-------|--|--||--|--|--- 3 [T] COG0631 Serine/threonine protein phosphatase -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit ----------------||--||----||||||-|||||||||||||||||||||||---|||||-- 3 [F] COG0634 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase ----------------|||||||||||||-|||||||||---|||||||||||||||||||||||| 3 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases --|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 3 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase |||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||-- 3 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators ---|--|||--||||-||--|-----|||--|||||||----|||||--|--------|||||||| 3 [G] COG0647 Predicted sugar phosphatases of the HAD superfamily ----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-| 3 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein --|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating) |||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--|||||||||||||| 3 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel ----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase -------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-||||||||||||| 3 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase ---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 3 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0691 tmRNA-binding protein -------------|||----||||-|||||-||||||||||||||||||||||||||||||----- 3 [L] COG0692 Uracil DNA glycosylase |-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---||||||| 3 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins --|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0703 Shikimate kinase -||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||-- 3 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid) --|------|-|----||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase |-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0708 Exonuclease III ||||||-|||||-||-|-----||-------||||||-----|||-|------||----------- 3 [E] COG0710 3-dehydroquinate dehydratase --|-------------|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b -------------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein) |||-----||---||---|||---|-----||||-||-----|||||||||||--||||------- 3 [C] COG0716 Flavodoxins -----------------|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---||||||||||||| 3 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit -------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||| 3 [I] COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase) ----------------||||----||----||||-|||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains) -----------------|||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit ----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||- 3 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein -----------------||||-||||||||||||||||----|||||-||||---||||||-||-- 3 [S] COG0762 Predicted integral membrane protein |||------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase --|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||-- 3 [F] COG0775 Nucleoside phosphorylase ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit ----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0781 Transcription termination factor -----------------|---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0782 Transcription elongation factor ---|--------------||||--|||----|||||||-|--|||||-|||||--|||||-|-||| 3 [P] COG0783 DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant) |-|---|||-|-|---||||||--|-||||--||--||------------||----||-||||--- 3 [O] COG0785 Cytochrome c biogenesis protein --------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0787 Alanine racemase ----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 3 [M] COG0796 Glutamate racemase ----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [S] COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein -----------------|||----|-----||||--||----|||||-||||||||||-|||||-- 3 [G] COG0800 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 3 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 3 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase ----------------||||||--||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing ----------------||||||---|----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase -----------|--------||--|------||||||-|||||||||||-||----||----|--- 3 [F] COG0813 Purine-nucleoside phosphorylase -----------------|||-|--------||||||||----|||||-|||||||||||||||--- 3 [M] COG0818 Diacylglycerol kinase ----||||--|||||----|------|----|-|||||------------||----|||--|---- 3 [K] COG0819 Putative transcription activator ----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||-- 3 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme --||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||| 3 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit -|-------------------------|||||||||||------------|-----||-|--|--- 3 [L] COG0827 Adenine-specific DNA methylase ----------------|-||--||||----|||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0828 Ribosomal protein S21 ----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0845 Membrane-fusion protein ---------|------||--||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [D] COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A -----------------|---|--------||||||||-|--|||||||-------||-||-|--- 3 [G] COG1015 Phosphopentomutase -------------||----|------||||-||||||-----|||||-||-----|--||-||--- 3 [Q] COG1020 Non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins ----------------|-----||-------||||||-||||------------------------ 3 [L] COG1039 Ribonuclease HIII ----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 3 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases --||----------|--|||------||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 3 [E] COG1045 Serine acetyltransferase ------------------||-|||--|----||||||-----||||||||--|--|---||||||| 3 [R] COG1054 Predicted sulfurtransferase --|-||----|||||---||------||||-||||-||----|||-|--|--|||||||||||--- 3 [R] COG1064 Zn-dependent alcohol dehydrogenases --------|---|||--|||----|||||-||-|||||----|||||--|||---|---||||--- 3 [G] COG1070 Sugar (pentulose and hexulose) kinases ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 3 [C] COG1071 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, alpha subunit -----|-------||-----------||||-|||-|||----|||||-|-||-------||||--- 3 [H] COG1072 Panthothenate kinase --||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||-- 3 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily --------------------|-||||-||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains) |||||||||||||--|||--|----------||||||||-||------------------------ 3 [R] COG1078 HD superfamily phosphohydrolases ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 3 [R] COG1079 Uncharacterized ABC-type transport system, permease component --------------------||||-||---||||||||-|||||||||||||||||------||-- 3 [G] COG1080 Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria) -|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||--- 3 [R] COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases -----------------|---|--------||||||||---------------------------- 3 [J] COG1098 Predicted RNA binding protein (contains ribosomal protein S1 domain) -||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||-- 3 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components --------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|------||-||||--- 3 [E] COG1125 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, ATPase components --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 3 [GM] COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component ------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [P] COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component |--|---||-|-|----|||-------||-||||||||---------------------------- 3 [C] COG1141 Ferredoxin ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG1159 GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG1160 Predicted GTPases --|-------------|||||----||||||||||||||||||||||-||||||||------|--- 3 [R] COG1162 Predicted GTPases --------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|-----|||-||||--- 3 [E] COG1174 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, permease component ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 3 [E] COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||-- 3 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II --|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase) -----------------|--|-----|---||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 3 [J] COG1188 Ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit (S4 paralog) --|-----|-------|||||----|||||||||-|||||----------------|||||||||| 3 [J] COG1189 Predicted rRNA methylase |-||--||--------||||||---|----||||||||------------------|||------- 3 [L] COG1193 Mismatch repair ATPase (MutS family) |--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase ----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------||||||| 3 [L] COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway) -----------------|||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase ||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|-- 3 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases ----------------||||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [LK] COG1200 RecG-like helicase ----------------||||||---------|||||||---------------------|||||-- 3 [J] COG1206 NAD(FAD)-utilizing enzyme possibly involved in translation ----------------||||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone ------------------||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [T] COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit -|------|----|||-|--||--------|||||||-----------|----------------- 3 [C] COG1227 Inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase --|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||-- 3 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component ||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---||||||| 3 [R] COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I -||-|||||-|||----|-|-|---|--|-||||||||----|||||-||-|---|----|-|--- 3 [C] COG1254 Acylphosphatases ||||||||||||||||---------|-----|||||------------|----------------- 3 [I] COG1257 Hydroxymethylglutaryl-CoA reductase -------------|||----||--|||||-||||||||----|||||-||--|||----|||||-- 3 [R] COG1272 Predicted membrane protein, hemolysin III homolog -|--|-|||----||-----------|||--||||-------|||-|-|-||-|------------ 3 [P] COG1275 Tellurite resistance protein and related permeases ---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---||||||| 3 [K] COG1278 Cold shock proteins ----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 3 [O] COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family ------------------------||-----|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [R] COG1286 Uncharacterized membrane protein, required for colicin V production ||||||||||||||||-|||||---|----||||||||------------------|||------- 3 [K] COG1293 Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP --|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 3 [S] COG1295 Predicted membrane protein ----------------|-|||||||||||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||| 3 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG |||||||||||||----|---||||-||||||||||||----|||-|-----|---------|--- 3 [K] COG1321 Mn-dependent transcriptional regulator ----------------------||-------|||-----|--|||||-||||||||---||||||| 3 [S] COG1322 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||-------|-------|--|---------||||||||-|-------------------------- 3 [R] COG1323 Predicted nucleotidyltransferase -----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 3 [K] COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains |||---||-|-------|--|---------||||||------|||||-||||---|---------- 3 [F] COG1328 Oxygen-sensitive ribonucleoside-triphosphate reductase -||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 3 [S] COG1354 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||-|--|---------||||||||---------------------------- 3 [J] COG1358 Ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a) --||--------------|-||----|||-||-|-||-----|||||-||-|-|||---||-||-- 3 [S] COG1359 Uncharacterized conserved protein -----------------|------------|||-|||-----|||-|-||||-||-|||||-|--- 3 [M] COG1368 Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily ------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---||||||| 3 [L] COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) ----------------||||||--||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 3 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-|||||--------|||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 3 [K] COG1386 Predicted transcriptional regulator containing the HTH domain ----------------|----|||-||||-||--||||-------|--||||-------------- 3 [M] COG1388 FOG: LysM repeat ----------------||||-|----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 3 [R] COG1399 Predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein --||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|--- 3 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases -----------------||||-||--||||||||||||||||----------|--|||||||||-- 3 [K] COG1420 Transcriptional regulator of heat shock gene -----------------|-|--||||-----|||||||----|||||-|||||--|--------|| 3 [S] COG1426 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|---|-----||-|||-||||-------------|---------- 3 [F] COG1428 Deoxynucleoside kinases ----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---||||||| 3 [S] COG1434 Uncharacterized conserved protein ---||-----|----|-|---|---|----|||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 3 [F] COG1435 Thymidine kinase |-|||||||--||||-||--|-----|---||-|||||----|||||-||-|---|---||||--- 3 [C] COG1454 Alcohol dehydrogenase, class IV ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||-- 3 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit --||||||---|-----|||||----|||-||-|||||----|||----|||---|--||||||-- 3 [R] COG1473 Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase -----------------|--|-----||||||||||||||||------------------------ 3 [S] COG1481 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------|----||--|---|---|||||||||||||-|--|||||-|--|-------------- 3 [G] COG1482 Phosphomannose isomerase --|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||--- 3 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase -------------||-||--||----|||-||||||||----|||||-||||-|||---------- 3 [J] COG1490 D-Tyr-tRNAtyr deacylase ---------|----------|---|-----||||||||||||----------||||---|||||-- 3 [T] COG1493 Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism --|--------|-----||-||||--|||-|-||--||-|--|||||-||||---|---||-|--- 3 [G] COG1523 Type II secretory pathway, pullulanase PulA and related glycosidases ||||--||||-||-------|---------||||||||----|||||-||||||||---------- 3 [J] COG1534 Predicted RNA-binding protein containing KH domain, possibly ribosomal protein -------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase ----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---||||||| 3 [J] COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1) --|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|------- 3 [L] COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins ----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [R] COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein -------------||--|--||--|-----|||||||-------------------||-||||--- 3 [H] COG1564 Thiamine pyrophosphokinase -----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit --|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--||||||||||||| 3 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase ---|-------------||||-----||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 3 [H] COG1575 1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase -----------------|--||--------||||||||||--|||||-||||||||||||||||-- 3 [S] COG1576 Uncharacterized conserved protein ------------------||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 3 [M] COG1589 Cell division septal protein ||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG1605 Chorismate mutase -------------||--|--------|---|-|||-||-----||---|--|---|---|------ 3 [G] COG1621 Beta-fructosidases (levanase/invertase) -|||--||||------|-||-|||||----||||||||-|||------------------------ 3 [S] COG1624 Uncharacterized conserved protein --||---||------------|--------||||||||----|||||-|||||------------- 3 [K] COG1654 Biotin operon repressor |||-|||||-------|---|----|----|||||||||-||------------------------ 3 [L] COG1658 Small primase-like proteins (Toprim domain) --------------------||----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 3 [R] COG1660 Predicted P-loop-containing kinase --|---||--|-|-----||-|----||||||||||||----|||||--|--|--|---||||||| 3 [V] COG1680 Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 3 [GM] COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component -------------||----||---|-----|||||||------------|---||-|-|-|----- 3 [M] COG1696 Predicted membrane protein involved in D-alanine export ---------||-|---||||-|----||||-|||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 3 [T] COG1702 Phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase -----------------|-|||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG1722 Exonuclease VII small subunit ---|----|----------|||-----||-|||||||-----|||-|--|-----|||-||||--- 3 [M] COG1732 Periplasmic glycine betaine/choline-binding (lipo)protein of an ABC-type transport system (osmoprotectant binding protein) --||---------||--|--||---||---||||||||||--|||-|-||||-|||||||||---- 3 [S] COG1739 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega ----||---------------|----|----|--|||---|||||-|-||--|--|---|||||-- 3 [O] COG1764 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation ------------------|||-----||||||||||||---------------------------- 3 [S] COG1799 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------|-----|-|||---||||-||||||||-|--|||||-|||||------|||||-- 3 [G] COG1820 N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase ---|||||--|||---||---|---------|||-|||----|||||--------|--|||-|--- 3 [R] COG1832 Predicted CoA-binding protein --|----------------|||----||||-||||||------||-|--||-||||---|||||-| 3 [I] COG1835 Predicted acyltransferases ----------------||||||||||-|||||||-|||------------------|||------- 3 [R] COG1837 Predicted RNA-binding protein (contains KH domain) --||------|-|-----|||-----|-----|||--|-----||||-||||||||--|||||--- 3 [P] COG1840 ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component ||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----|||||| 3 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E -----------------|||||--||-|||||||-|||---------------------------- 3 [R] COG1847 Predicted RNA-binding protein ---------------------|---|----||||||||----|||||-|-||-||-|||------- 3 [T] COG1854 LuxS protein involved in autoinducer AI2 synthesis ------------------||----||----||||-|||-------|--|-|||------------- 3 [M] COG1876 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase |-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||-- 3 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes ||||||||--||----|||||-----||--|||--|||-------||--|-----||||||||--- 3 [S] COG1917 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain --------------------|||||||---||||||||||||||||||||||||||---|||||-- 3 [G] COG1925 Phosphotransferase system, HPr-related proteins ------------------|-------|||-||||||||----|||||-||||-||----------- 3 [G] COG1929 Glycerate kinase -----------------||||---------||||||||---------------------------- 3 [S] COG1939 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-------|----------|------|----|||||||----||||------|||||||||-||-- 3 [R] COG1942 Uncharacterized protein, 4-oxalocrotonate tautomerase homolog ---|||-------|---|------------||||||||----|||||-||-||||-------||-- 3 [T] COG1956 GAF domain-containing protein |--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||-- 3 [V] COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein --|---------------|-||----||||-||||||-----|||||-|||||--|---|||||-- 3 [M] COG1970 Large-conductance mechanosensitive channel ||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 3 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases --|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--| 3 [L] COG2003 DNA repair proteins --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [P] COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component ------||---|--------||-----||---|||-||-------|---------|---------- 3 [O] COG2039 Pyrrolidone-carboxylate peptidase (N-terminal pyroglutamyl peptidase) --|||||||-||--|-|----|----|||--|||||||----|||||-||||---|||||||||-- 3 [Q] COG2050 Uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism ------------------||||----|||-||||||||-----------|||---|---------- 3 [F] COG2065 Pyrimidine operon attenuation protein/uracil phosphoribosyltransferase --------|----|--||-|||----|||-||||||||-----------|--||||||||||-|-- 3 [R] COG2070 Dioxygenases related to 2-nitropropane dioxygenase ------------------||----------||||||||----|||||-||||---|---|||-|-- 3 [R] COG2081 Predicted flavoproteins ---------|---|------|---------|||||||-----|||||-||||-------------- 3 [P] COG2116 Formate/nitrite family of transporters --|-||||||---||--|--||--|-----||||||||-|--------|----------------- 3 [F] COG2131 Deoxycytidylate deaminase -----------------|--||--|-||||||||||||----|||||-||||-|||---|------ 3 [R] COG2137 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---|||----||-----------|---||-|||||----|||-|---||----||-|------ 3 [H] COG2145 Hydroxyethylthiazole kinase, sugar kinase family -----------------|--|---------||||||||||||------------------------ 3 [L] COG2176 DNA polymerase III, alpha subunit (gram-positive type) -------------------|||----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 3 [D] COG2177 Cell division protein -----------------|||-|---------|||||||---------------------------- 3 [R] COG2179 Predicted hydrolase of the HAD superfamily -------------|||---||---|-|---|||||||||---|||||-||||||||---||||--- 3 [K] COG2183 Transcriptional accessory protein --|-----------------||---|----||||||||----|||||-|-||------|-|--|-- 3 [E] COG2195 Di- and tripeptidases ------------------|||---------||----|-----|||||----------------|-- 3 [G] COG2211 Na+/melibiose symporter and related transporters ---|||-----|-------------|-||--|||||----|-----|-||----------|-|--- 3 [E] COG2235 Arginine deiminase -|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|-- 3 [R] COG2252 Permeases -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit -------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 3 [L] COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase -|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 3 [R] COG2262 GTPases ----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase ------------------||----------||-|--||||||-||||-||--||||----|-||-- 3 [V] COG2274 ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain ------------------||||---------|||||||---------------------------- 3 [S] COG2302 Uncharacterized conserved protein, contains S4-like domain --------------------||----|----|||-||-----|||||--|-----|---|--||-- 3 [S] COG2315 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|---|--------||||||||---------------------------- 3 [R] COG2344 AT-rich DNA-binding protein ------------------||||-----||||||||||----------------------||----- 3 [V] COG2367 Beta-lactamase class A -------------||-----||---------|--||-|----||||-----|-------||||--- 3 [G] COG2376 Dihydroxyacetone kinase ---------------------|--------|||||||||-||------|----------------- 3 [R] COG2384 Predicted SAM-dependent methyltransferase ---------------------|--------||||||||----|||||-|--|---|---||||--- 3 [K] COG2390 Transcriptional regulator, contains sigma factor-related N-terminal domain -------||--------|--|---------||-|---|---------------------------- 3 [S] COG2461 Uncharacterized conserved protein -------------------|||----|---||||||||||--|||||-|----|||---------- 3 [S] COG2501 Uncharacterized conserved protein ---------------------|----||||||||-|||-----------|---------|------ 3 [TQ] COG2508 Regulator of polyketide synthase expression ----------|-|------||-----||-|-||||||-----|||||-||||-|||---|||||-- 3 [S] COG2606 Uncharacterized conserved protein --||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||---- 3 [P] COG2608 Copper chaperone --------------------|---------|--|-----|--|||||-|-||----||-------- 3 [G] COG2731 Beta-galactosidase, beta subunit --------------------|---------|||||||||||------------------------- 3 [S] COG2739 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|||----||||||||||||||----------------||||||||-- 3 [K] COG2740 Predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 3 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits -|----||-|-|-----|---|---------|||||||----||||||||||-------|||||-- 3 [J] COG2813 16S RNA G1207 methylase RsmC -----------------|--||--||||||||||||||---------------------------- 3 [S] COG2815 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------||||-|||||-|----|||||-||||-|||---|||||-- 3 [L] COG2818 3-methyladenine DNA glycosylase --------------------------|----|||-|------|||||-||||-|||||||||||-- 3 [P] COG2824 Uncharacterized Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism ---|----------------|----------|||||||----|||||-||---||-----||||-- 3 [L] COG2827 Predicted endonuclease containing a URI domain --------|-----------|-----|----|||||------|||||--|||-|||--||||||-- 3 [S] COG2855 Predicted membrane protein --------------------|---||----|||||||||-||------------------------ 3 [J] COG2868 Predicted ribosomal protein -------------------|-|----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 3 [D] COG2884 Predicted ATPase involved in cell division |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors ------------------------||||||-|||||||----||||||||||||||---||||||| 3 [D] COG2919 Septum formation initiator --------------------|---------||||||||----------||---------------- 3 [S] COG2996 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||----|||||-||||-------------- 3 [S] COG3091 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|----------|||-|------|||||-|--||------||-||-- 3 [P] COG3142 Uncharacterized protein involved in copper resistance -------------------------------|--||------|||||-||----------|-||-- 3 [S] COG3152 Predicted membrane protein --|-----------------------|----||---------|||||-||--|--|---|||||-- 3 [P] COG3158 K+ transporter --------------------------|----|||--------|||||--|||----||-------- 3 [H] COG3201 Nicotinamide mononucleotide transporter -----------|-----|-------------|||---|----||||------|------||----- 3 [G] COG3250 Beta-galactosidase/beta-glucuronidase --|----------------------------|||-|||--------|--|---||-|--|------ 3 [S] COG3326 Predicted membrane protein -------------------------------|||||||||||------------------------ 3 [R] COG3331 Penicillin-binding protein-related factor A, putative recombinase -------------------------------||||||||-||------------------------ 3 [K] COG3343 DNA-directed RNA polymerase, delta subunit ---|||-----|-|||---------|-----|||||------------------------------ 3 [I] COG3407 Mevalonate pyrophosphate decarboxylase ||||||||||||||||---------|-----||||||--------|-----------------|-- 3 [I] COG3425 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase --||-|---------------|----------||---------|||-------------||||--- 3 [L] COG3436 Transposase and inactivated derivatives ------------------||------|||||||||------------------------------- 3 [R] COG3442 Predicted glutamine amidotransferase -------------------------------||||-|-----|||-|------------|--|--- 3 [R] COG3443 Predicted periplasmic or secreted protein --------------------------||||-|||-|||---------------------------- 3 [T] COG3480 Predicted secreted protein containing a PDZ domain -|-------|----------|---------||||||||----------------------|----- 3 [R] COG3481 Predicted HD-superfamily hydrolase --|---------------------------||-||||-----------|----------------- 3 [Q] COG3527 Alpha-acetolactate decarboxylase --------------|----------------|||-|-|--------------|------------- 3 [S] COG3538 Uncharacterized conserved protein --|--------|-------||-----||||--||---|-------|---|---||----||-||-- 3 [L] COG3547 Transposase and inactivated derivatives -------------------------------|||||||||-------------------------- 3 [J] COG3557 Uncharacterized domain/protein associated with RNAses G and E -------------|----------|------|||-|------------------------------ 3 [E] COG3579 Aminopeptidase C -----------|-------------|-----||-||-|---------------------------- 3 [S] COG3589 Uncharacterized conserved protein --|-----------------------||||-|||------------------|----------|-- 3 [O] COG3590 Predicted metalloendopeptidase ------||---------|------------|||||||----------------------------- 3 [S] COG3601 Predicted membrane protein -------------------------------||||||||-||------------------------ 3 [L] COG3611 Replication initiation/membrane attachment protein -------------------------------||-|||------|||-------------------- 3 [S] COG3645 Uncharacterized phage-encoded protein -------------------------------|-|-||------||-----||-------------- 3 [S] COG3646 Uncharacterized phage-encoded protein ---|----|----------------------|||||||---------------------------- 3 [S] COG3679 Uncharacterized conserved protein ------||----------||------|||||||||----------------------------|-- 3 [K] COG3682 Predicted transcriptional regulator --------------------------------||||------|||-|---------------|--- 3 [G] COG3684 Tagatose-1,6-bisphosphate aldolase ---------------------------||--|---|-------||-|--------|---|---|-- 3 [R] COG3740 Phage head maturation protease -------------------------------|||||||||||------------------------ 3 [S] COG3763 Uncharacterized protein conserved in bacteria |||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||--- 3 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 3 [R] COG3845 ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase components ------------------------------||||||||---------------------------- 3 [L] COG3857 ATP-dependent nuclease, subunit B ---------------------------|||||||-------------------------------- 3 [I] COG3884 Acyl-ACP thioesterase ------------------------------||||||||-|-------------------------- 3 [T] COG3887 Predicted signaling protein consisting of a modified GGDEF domain and a DHH domain -----------------|------------||||||||---------------------------- 3 [S] COG3906 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------||||||----------------------------- 3 [M] COG3966 Protein involved in D-alanine esterification of lipoteichoic acid and wall teichoic acid (D-alanine transfer protein) --------------------||----|---||||---|----------|--|----------|--- 3 [R] COG3981 Predicted acetyltransferase -------------------------------|||||||---------------------------- 3 [L] COG4098 Superfamily II DNA/RNA helicase required for DNA uptake (late competence protein) ------------------||-|----|---||||||------||||||||||||||---|||||-- 3 [J] COG4108 Peptide chain release factor RF-3 ------------------------------||||||||---------------------------- 3 [K] COG4109 Predicted transcriptional regulator containing CBS domains -------------------------------|||||||---------------------------- 3 [S] COG4116 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||--------|-|-|-||||----||||||||||||-----------|---||-------|--- 3 [R] COG4122 Predicted O-methyltransferase ----------------||--|---------||||||||||--|||||-|-||----||||||||-- 3 [R] COG4123 Predicted O-methyltransferase -------------------------------|||||||---------------------------- 3 [S] COG4199 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|---------||---||||----|||--|-|||------|||-|-||||||||||||||---- 3 [R] COG4221 Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity --------------------|---------||||||||---------------------------- 3 [S] COG4224 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|------|----||||------------------||----------- 3 [P] COG4300 Predicted permease, cadmium resistance protein -------------------|----------|-||---|---------------------------- 3 [V] COG4403 Lantibiotic modifying enzyme ------------------------|-----||||-|------------------------------ 3 [S] COG4443 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------||||||||---------------------------- 3 [K] COG4463 Transcriptional repressor of class III stress genes ------------------------------||||||||---------------------------- 3 [S] COG4466 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||---------------------------- 3 [S] COG4467 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------||-|--||---------------------------- 3 [G] COG4468 Galactose-1-phosphate uridyltransferase -------------------------------|||||||---------------------------- 3 [R] COG4469 Competence protein -------------------------------|||||||---------------------------- 3 [S] COG4470 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||---------------------------- 3 [S] COG4471 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------||||||-|---------------------------- 3 [S] COG4472 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||---------------------------- 3 [U] COG4473 Predicted ABC-type exoprotein transport system, permease component -------------------------------|||||||---------------------------- 3 [S] COG4474 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------||||-||---------------------------- 3 [S] COG4475 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||---------------------------- 3 [S] COG4476 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||---------------------------- 3 [D] COG4477 Negative regulator of septation ring formation ------------------------------||||-----|-------------------------- 3 [S] COG4478 Predicted membrane protein -------------------------------||||||----------------------------- 3 [S] COG4479 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------||||||----------------------------- 3 [S] COG4483 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------||||-|----------------------------- 3 [S] COG4485 Predicted membrane protein -------------------------------|||||||---------------------------- 3 [U] COG4537 Competence protein ComGC ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 3 [R] COG4603 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ------------------------------||--||------|||-----------------|--- 3 [R] COG4626 Phage terminase-like protein, large subunit ------------------------------||||-------------------------------- 3 [S] COG4684 Predicted membrane protein ------------------------------|||---------|||----------|---|-|||-- 3 [S] COG4695 Phage-related protein ---------------------|---------|||-------------------------------- 3 [S] COG4696 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||------------------------------ 3 [S] COG4699 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||-||----------------------------- 3 [S] COG4703 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------||||-|------------------------------ 3 [S] COG4708 Predicted membrane protein -------------------------------|||||||---------------------------- 3 [S] COG4758 Predicted membrane protein -------------------------------|||||||---------------------------- 3 [R] COG4768 Uncharacterized protein containing a divergent version of the methyl-accepting chemotaxis-like domain -------------------------------|||||------------------------------ 3 [C] COG4781 Membrane domain of membrane-anchored glycerophosphoryl diester phosphodiesterase -------------------------------|||-|------------------------------ 3 [S] COG4835 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||---------------------------- 3 [D] COG4839 Protein required for the initiation of cell division -------------------------------|||-|------------------------------ 3 [S] COG4858 Uncharacterized membrane-bound protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||---------------------------- 3 [OTN] COG4862 Negative regulator of genetic competence, sporulation and motility ------------------------------|||--|------------------------------ 3 [S] COG4926 Phage-related protein -------------------------------|||||||------------------|||------- 3 [U] COG4940 Competence protein ComGF ---------------------|---------|||||||---------------------------- 3 [T] COG5002 Signal transduction histidine kinase -------------------------------|--|||----------------------------- 3 [S] COG5294 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||---------------------------- 3 [S] COG5503 Uncharacterized conserved small protein ------------------------------||||-|------------------------------ 3 [S] COG5523 Predicted integral membrane protein -------------------------------||||------------------------------- 3 [S] COG5547 Small integral membrane protein -------------------------------|||-|||---------------------------- 3 [S] COG5578 Predicted integral membrane protein |||||||||||||||-||||-------||||-||-|||----|--||--|--|------||-|--- 2 [F] COG0005 Purine nucleoside phosphorylase ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain |||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase |||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit ||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0077 Prephenate dehydratase -|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||------- 2 [E] COG0083 Homoserine kinase ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase |||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||-- 2 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases -------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase |||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase ||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase ||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase --||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful) ------|---|--||--|--|---|-|||-||-|--||----|||||-|-||-------------- 2 [G] COG0153 Galactokinase ||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||-- 2 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase ||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain |--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-|||||||||||||||||| 2 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase -||---|||--------|---|-----||-||-||||||||||||-|-|------|---||-|--- 2 [F] COG0213 Thymidine phosphorylase -|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation --||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---||||||| 2 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family) |||---|||||||-----------------|-|||-|--||-|||-|-|-||-------------- 2 [G] COG0269 3-hexulose-6-phosphate synthase and related proteins ||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||-- 2 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase ----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase) ||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase |--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [P] COG0288 Carbonic anhydrase |||-----||------||||--||--|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase -|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|--- 2 [G] COG0297 Glycogen synthase ---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain ||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-| 2 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase -------------|||-|||--||||||||-|-||||-----|||||||-||-||----||||--- 2 [G] COG0362 6-phosphogluconate dehydrogenase -------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||-- 2 [G] COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase |||||||||||-||||----------||||||---|||----|||||-||--|-------|-|--- 2 [E] COG0367 Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing) |||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||-- 2 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit |||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--||||||||||| 2 [O] COG0450 Peroxiredoxin |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase --------|-------|----|-----||||||---|----------------------------- 2 [P] COG0490 Putative regulatory, ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0498 Threonine synthase |||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||-- 2 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0527 Aspartokinases |||||||||||||---||||-|-----||-||--|-||-----------|-----|----|-|--- 2 [R] COG0535 Predicted Fe-S oxidoreductases |||-||||||-|-||-||--|---|-|||-||-|-|||----|||||-||---|||---|----|| 2 [HC] COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase --|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---||||||| 2 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases |||-||--||-|-||--||--|----|||--|---|||-------|---||-||||---|||||-- 2 [S] COG0599 Uncharacterized homolog of gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit ||||---||----------|-----------||-||--|||-------||||||--|||-||-|-| 2 [V] COG0610 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases |||||||||||||||||--------------|--|||----------------------------| 2 [MI] COG0615 Cytidylyltransferase -------------||---||------------||--------|||||-||||||||---||||||| 2 [O] COG0625 Glutathione S-transferase --|----------||||-||--||--||||-|---|||----|||-|-||-|---|||-||-|--- 2 [P] COG0659 Sulfate permease and related transporters (MFS superfamily) --|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase |||-----||------||||-------||-|-||-|||----|||-------------|------- 2 [R] COG0701 Predicted permeases ---|---------||-|-||-|----|----|--||||----|||||-|||-|--|---|||||-- 2 [MG] COG0702 Predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerases -|||--|||-||------||-|---------||---------|||||-||--|--||||-|-|--- 2 [R] COG0727 Predicted Fe-S-cluster oxidoreductase -|||--|||-------|---|-|||-|------|||||----------|-||-||-|||------- 2 [R] COG0733 Na+-dependent transporters of the SNF family --|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||-- 2 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins --|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||--- 2 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component ----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-| 2 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake ----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II ----------------||||||||--|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis) -------------||---------------||--|||-----|||||--|-----|||-------- 2 [E] COG0833 Amino acid transporters -|||---||--|----|-||------|||---|---||----|||||-||-||--|--|||||||| 2 [M] COG1004 Predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase ---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---||||||| 2 [I] COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase |||---|||||||---|-||-|----||||||-|-|||-------|--||-----|---|||||-| 2 [F] COG1051 ADP-ribose pyrophosphatase ---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||-- 2 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA --|||||||-||||||---|||--|-|||||-||||------|||||-|----------------- 2 [KL] COG1061 DNA or RNA helicases of superfamily II ----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease -|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-|||||| 2 [MG] COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases |-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||-- 2 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase |-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-|||| 2 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase --------------------|-----|-----||--------------||-----|---||||-|| 2 [R] COG1101 ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component --------------------|-|||-|---|-|||-|-----|||||-||||-------------- 2 [E] COG1114 Branched-chain amino acid permeases --|---||------------|||||-|-----|||-||----|||-|-||||-||-|||-||---- 2 [E] COG1115 Na+/alanine symporter ----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||-- 2 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 2 [C] COG1155 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit A ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 2 [C] COG1156 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit B ----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||-- 2 [KE] COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs --------------------||----||||||-|-|||----|||||---|----|---------- 2 [E] COG1168 Bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities ---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [E] COG1171 Threonine dehydratase -------------------|----------||--||||-||||||||--||----|---||-|--- 2 [I] COG1182 Acyl carrier protein phosphodiesterase -------------||-|||||||||||||||||-||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG1186 Protein chain release factor B |-|||||||--||----|||-|----|||||||---||----|||||--|--||||---||-||-- 2 [M] COG1209 dTDP-glucose pyrophosphorylase -|-------|------||--|---------|||-||||----|||||-|----------------- 2 [R] COG1242 Predicted Fe-S oxidoreductase --|-------|-|-----||-|----|---||-|||||----|||-|-||-----|---|||||-- 2 [M] COG1247 Sortase and related acyltransferases ---|-------|-||---||-|----||||-|--||||----|||||-|||----|---||||--- 2 [C] COG1252 NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 2 [C] COG1269 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit I --------------------|---|-|-----||||||-|--|||-|-||--------|||||--- 2 [P] COG1283 Na+/phosphate symporter ----------------|-||||--|--||-||-|-|||----|||||--|||---|---|||---- 2 [S] COG1285 Uncharacterized membrane protein --------------------|----|------|||-||----|||-|---|------------|-- 2 [S] COG1288 Predicted membrane protein --|-----|-----------||----|----|-|||||----|||||-||||-|||||-||||--- 2 [E] COG1296 Predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance) ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 2 [C] COG1394 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit D |-|-------|-----|--|-|||--||||||---|||----|------------||||-|-|--- 2 [R] COG1408 Predicted phosphohydrolases ----||----||-||--|-|----------||-|-|-|----|||||--------|---|---|-- 2 [G] COG1501 Alpha-glucosidases, family 31 of glycosyl hydrolases |||-|||-|||||---||-||------||---|--|-|----|||||----|--|---|------- 2 [L] COG1518 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair |||||||||||--|||----||----------||-------------------------------- 2 [C] COG1527 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit C ---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||-- 2 [R] COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced) ------|------|-----|-------|||||---||--|--|||--------||----------- 2 [G] COG1554 Trehalose and maltose hydrolases (possible phosphorylases) ----||------------||||--|-----||-|-|||-|--|||-|-||---|||--------|| 2 [V] COG1619 Uncharacterized proteins, homologs of microcin C7 resistance protein MccF ----------------||--|---------|||-|---------------|||||-|||-----|| 2 [S] COG1636 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||--|||-|||----|---|--------||-|||||--------------|----------|-- 2 [CP] COG1668 ABC-type Na+ efflux pump, permease component -||--------------|--|---|-------||-|--||---|||---|-|---|---|||||-- 2 [S] COG1704 Uncharacterized conserved protein ----|------|-----|||------|||-|-||||||---------------------------- 2 [K] COG1725 Predicted transcriptional regulators ||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||-- 2 [K] COG1733 Predicted transcriptional regulators ---------------------|-----||---|||-||------------||-||----------- 2 [S] COG1755 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------|--|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-| 2 [I] COG1788 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit ----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----||| 2 [M] COG1792 Cell shape-determining protein ----|------|-----|--||----|||-|||-||||----|||||-||---|||---|||||-- 2 [K] COG1802 Transcriptional regulators ||--|||||||||||--|---||---|----|-----------------|------------||-- 2 [S] COG1814 Uncharacterized membrane protein |--------|-------|--|---------|-||-|||---------------------------- 2 [R] COG1827 Predicted small molecule binding protein (contains 3H domain) |-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---||||||| 2 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family ------|||--------|--|---|-------|-------------|-|--|-------------- 2 [C] COG1883 Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit ---|--|||-|-|||-|--|------|||-|||-||||----|||||-||-----|------||-- 2 [H] COG1893 Ketopantoate reductase -----------------|------------||-|--||----|||||-|---------||||---- 2 [E] COG1897 Homoserine trans-succinylase --||||--|--|-||--|-|||----|||-|||-||||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 2 [C] COG1902 NADH:flavin oxidoreductases, Old Yellow Enzyme family ----||-----|-||----|||----||||||-|||||----|||||--|||||||---||||--- 2 [P] COG1914 Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family --||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||-- 2 [L] COG1943 Transposase and inactivated derivatives ----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator -----||---|-------||-|----|||-|-||||||----|||||-||--|--|---|||||-- 2 [L] COG1961 Site-specific recombinases, DNA invertase Pin homologs ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis |-||||-|||-||----||--|--------|||----------------|------------||-- 2 [S] COG2013 Uncharacterized conserved protein |--|-------------|--|---|||-----|||--|----------|----------------- 2 [S] COG2035 Predicted membrane protein -----------|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-| 2 [I] COG2057 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit ----------------|---------|||-||-|||||-|--|||||-||||---||||------- 2 [O] COG2077 Peroxiredoxin --|----------------------|-----||--||-----|||||--|-----|---||||--- 2 [E] COG2113 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, periplasmic components ||||----||-|-------|-|----||||--||||||-|--|||||--|--|--|---|||||-- 2 [C] COG2141 Coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases ---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||-- 2 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis ---------|-------|--------||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG2171 Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase ||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--| 2 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold |-----||-|-------|--||--------|-||-||-----|||||--|--|------|||||-- 2 [M] COG2222 Predicted phosphosugar isomerases ---||||||||||-----||------||||||-||||-----|---|--|-----|------||-- 2 [S] COG2246 Predicted membrane protein ----------------------||-------||-|-|-----|||||-||||------|-----|| 2 [G] COG2271 Sugar phosphate permease ---|-------||-------||----|||--||---------|||||-|||----|---|||||-- 2 [G] COG2301 Citrate lyase beta subunit -------------------|||--------||-|--||----|||-|-------------|----- 2 [S] COG2323 Predicted membrane protein ---|--||-----------|-|----|-----||||||---------------------------- 2 [S] COG2339 Predicted membrane protein ------------------||-|----|--|--||--------|||||-||||-|||-------|-- 2 [C] COG2352 Phosphoenolpyruvate carboxylase --------------------|---|-------||----|---|||||---||-------------- 2 [E] COG2502 Asparagine synthetase A ----------|-|--------|----|-----||||||---------------------||||--- 2 [R] COG2514 Predicted ring-cleavage extradiol dioxygenase --------------|---------------||-||||-----||||||-|-----|---------- 2 [G] COG2706 3-carboxymuconate cyclase ---|------|||-----------|----|-||---------|||||-|-||-------------- 2 [F] COG2820 Uridine phosphorylase --|------------------|-----||---||-||----------------||-----|-||-- 2 [M] COG2843 Putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation) -||------||||-------------|---||-|-|-----------------||----------- 2 [S] COG2848 Uncharacterized conserved protein ---|------||---------|----|----||---||----|||||-||||---|--||||||-- 2 [S] COG2860 Predicted membrane protein -------------------|----|------|-|||||----|||||-|||||--|---------- 2 [M] COG2891 Cell shape-determining protein -------------------------------|-|-||-----------||-----|--|||-|--- 2 [R] COG2910 Putative NADH-flavin reductase ---------------------|---------|-|-----------|---|--|---|||----|-- 2 [E] COG2957 Peptidylarginine deiminase and related enzymes ----------------|---|-||--|-----||--------------||-----|---||||-|| 2 [R] COG2984 ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component ----------------|---|-----|-----||--------|||||-||||-|||--|----|-| 2 [S] COG3022 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---------------|------------|--|-|---------|-|----------|-||--- 2 [M] COG3049 Penicillin V acylase and related amidases --------------------|----------||---------|||-|-|-|--------------- 2 [C] COG3051 Citrate lyase, alpha subunit --------------------|----------||---------|||-|-|-|--------------- 2 [C] COG3052 Citrate lyase, gamma subunit --------------------|----------||---------|||-|-|-|--------------- 2 [C] COG3053 Citrate lyase synthetase --------------------|-----------||--------|||||-|-|-|------||----| 2 [L] COG3077 DNA-damage-inducible protein J ------|||-----------------------||--------|||-|-|----------------- 2 [S] COG3270 Uncharacterized conserved protein ---|-------|-------|------|||--||--|-------|||------|--|---------- 2 [R] COG3378 Predicted ATPase ---------||||-----------------|||---||--------|--|-----|------|--- 2 [S] COG3382 Uncharacterized conserved protein --------------------||---------|-|||-|----|||-----------------|--- 2 [S] COG3412 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|----------||---||--------|-|----------------- 2 [C] COG3493 Na+/citrate symporter -------------------------------|-|--------------|---|------||--|-- 2 [G] COG3525 N-acetyl-beta-hexosaminidase ---------------------------||--|-|------------------|----------|-- 2 [G] COG3537 Putative alpha-1,2-mannosidase ------------------------------|||-|--------||-----|---|----------- 2 [K] COG3561 Phage anti-repressor protein --------------------------------||-|------|||-|--|--|--|---|||||-- 2 [R] COG3568 Metal-dependent hydrolase -------------------|-|---------|-|-----------|--|----------|--||-- 2 [S] COG3575 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------||-----||-|||||-|-||-------------- 2 [G] COG3623 Putative L-xylulose-5-phosphate 3-epimerase -------------------------------||-|-|-----|||-|--|--|--|-------|-- 2 [O] COG3634 Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit ---|------|--------||-----|----|--|--|-|||||||---|---------||-||-- 2 [P] COG3639 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component --------------------|---|-------|-||-|---------------------------- 2 [R] COG3641 Predicted membrane protein, putative toxin regulator -------------------|------|---|-||-|||-----------|-------------|-- 2 [K] COG3655 Predicted transcriptional regulator --|----------------||---------|-|||--|-----------|---------||--|-- 2 [L] COG3666 Transposase and inactivated derivatives ------------------||----------|-||-|||---------------------------- 2 [S] COG3689 Predicted membrane protein ------------------||||----------||-------------------------------- 2 [R] COG3694 ABC-type uncharacterized transport system, permease component -------------------------------||-||||----|||--------------------- 2 [L] COG3723 Recombinational DNA repair protein (RecE pathway) -------------------------------||-|||------|||---|------------|--- 2 [L] COG3728 Phage terminase, small subunit ---------------------------||-||-----------||--------------------- 2 [L] COG3747 Phage terminase, small subunit -------------------------------||--------------------------|--||-- 2 [M] COG3754 Lipopolysaccharide biosynthesis protein --------------------------|----|-|||--------------|--|||---|--|--- 2 [S] COG3759 Predicted membrane protein ------------------------------|-||||-|----|||-|------------------- 2 [G] COG3775 Phosphotransferase system, galactitol-specific IIC component --------------------------------||-----------|---------|--|----|-- 2 [S] COG3817 Predicted membrane protein --------------------------------||-----------|---------|--|----|-- 2 [S] COG3819 Predicted membrane protein -||-----|||---------------||||||-|-|-------------|---||----------- 2 [T] COG3830 ACT domain-containing protein --|------------------|--------|||-||||---------------------------- 2 [P] COG3853 Uncharacterized protein involved in tellurite resistance ------------------------------|||--|||---------------------------- 2 [S] COG3859 Predicted membrane protein ---------------------------||-||--|-|----------------------------- 2 [R] COG3953 SLT domain proteins -------------------------------||--|------|||-|--|-----|---------- 2 [R] COG3969 Predicted phosphoadenosine phosphosulfate sulfotransferase --|----------------|-------------|--------|||-|--------|---------- 2 [V] COG4096 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases --------------------|-----|-----||--------------||-----|---||||-|| 2 [R] COG4120 ABC-type uncharacterized transport system, permease component -||----------------------------|-|||||-------------------------|-- 2 [R] COG4152 ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component --|----------------------|-----||--||-----|||||--|-----|---||||--- 2 [E] COG4175 ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component --|----------------------|-----||--||-----|||||--|-----|---||||--- 2 [E] COG4176 ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component -------------|------|----------|-|-|---------------|-------------- 2 [S] COG4283 Uncharacterized conserved protein -------------||-----------------|||------------------------------- 2 [S] COG4357 Uncharacterized conserved protein ---------------------|---------|-|||-|----------||-----|---------- 2 [S] COG4392 Predicted membrane protein ------------------------------||-|-|||-----|-||------------------- 2 [S] COG4405 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|------|------------|-|--|-------------- 2 [G] COG4409 Neuraminidase (sialidase) ------------------------------|-||||-|---------------------------- 2 [S] COG4481 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------||----|-||--------------|||---|--- 2 [S] COG4487 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------||-||||---------------------------- 2 [S] COG4550 Predicted membrane protein ----------------|--------------||-|||-----|||--------------------- 2 [L] COG4570 Holliday junction resolvase -------------||---||||----------||-------------------------------- 2 [R] COG4586 ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component ------------------||||----------||-------------------------------- 2 [R] COG4587 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ------------------|-------------||---------------|---||-------|--- 2 [S] COG4642 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|--------||-|||||--|-||||||||||---|---------- 2 [G] COG4668 Mannitol/fructose-specific phosphotransferase system, IIA domain -------------------------------||--|||---------------------------- 2 [S] COG4698 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|--|--|---------------------------- 2 [S] COG4707 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|-||||---------------------------|-- 2 [S] COG4709 Predicted membrane protein ------------------------------|||--------------------------------- 2 [S] COG4713 Predicted membrane protein -------------------------------||-||------------------------------ 2 [S] COG4716 Myosin-crossreactive antigen -------------------------------|-|---|---------------------------- 2 [G] COG4724 Endo-beta-N-acetylglucosaminidase D -------------------------------|--||------------------------------ 2 [R] COG4814 Uncharacterized protein with an alpha/beta hydrolase fold -------------------------------|---|-|---------------------------- 2 [S] COG4817 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|-||||||---------------------------- 2 [S] COG4856 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|-----|-----||-------------------------------- 2 [S] COG4868 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----------|||---|----------|-|--|------|||||--|-----|---------- 2 [S] COG4886 Leucine-rich repeat (LRR) protein -------------------------------|---|-|---------------------------- 2 [M] COG4932 Predicted outer membrane protein ---------------------------------|-------------------------|--|--- 2 [S] COG4947 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------||-|||----------------------------- 2 [G] COG4975 Putative glucose uptake permease --------------------|-----|||--||-||||----|||||-|-||-------|-|-|-- 2 [CO] COG4988 ABC-type transport system involved in cytochrome bd biosynthesis, ATPase and permease components -------------------------------|--|||----------------------------- 2 [S] COG4990 Uncharacterized protein conserved in bacteria |||---|-|-------||--|---|-------|-------------|-||-|------|------- 2 [C] COG5016 Pyruvate/oxaloacetate carboxyltransferase ------------------------------||---|-------||-|-----|------------- 2 [S] COG5283 Phage-related tail protein -------------------------------|-|-|||---------------------------- 2 [S] COG5353 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|-----|---||--|------------------------------- 2 [S] COG5438 Predicted multitransmembrane protein --------------------------------||-|||---------------------------- 2 [S] COG5506 Uncharacterized conserved protein --------------------------------||-||----------------------------- 2 [S] COG5521 Predicted integral membrane protein --------------------------------|-||------------------------------ 2 [S] COG5546 Small integral membrane protein --|---------------------------|-|----|---------------------------- 2 [T] COG5585 NAD+--asparagine ADP-ribosyltransferase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase |||-||--||-|-||-||||-|----|||-||--|||||---|||||--|--||||---|||||-- 1 [P] COG0004 Ammonia permease |||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||--- 1 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family ||-||||||||--|--|||-------|||-|--||-||---------------------------- 1 [S] COG0011 Uncharacterized conserved protein ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||-- 1 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase ||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||-- 1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase ||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0067 Glutamate synthase domain 1 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0069 Glutamate synthase domain 2 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0070 Glutamate synthase domain 3 ||||||||||||||--||||-|--------||--|-||--------|-||------||-||-||-- 1 [E] COG0075 Serine-pyruvate aminotransferase/archaeal aspartate aminotransferase ||||--||||--||----||-------||--|---|-|----||||--|-|---------|||--- 1 [E] COG0076 Glutamate decarboxylase and related PLP-dependent proteins |||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase |||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase |||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase ||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase |||||||||||||||--|--||----|||||--|||||------------||-------------- 1 [H] COG0214 Pyridoxine biosynthesis enzyme ||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||--- 1 [C] COG0247 Fe-S oxidoreductase --|--------|-|--|-||||||--|||----|--|-----|||||-||||---|---||-|--- 1 [G] COG0296 1,4-alpha-glucan branching enzyme |||||||||||||||--|---|----|||||--|||||------------||-------------- 1 [H] COG0311 Predicted glutamine amidotransferase involved in pyridoxine biosynthesis --|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|-- 1 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase |||-----||------||||-|----|||-||---||-----|||||-||||||||---|||||-- 1 [E] COG0347 Nitrogen regulatory protein PII |-||||--|-|||||||-||-|-----||--|--||||----|||||-||-||--||-||||||-- 1 [I] COG0365 Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases |||---|||||-----||||-|--------||--||------|||||-||--|--||||----|-- 1 [P] COG0370 Fe2+ transport system protein B |-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [C] COG0372 Citrate synthase |-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||-- 1 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase |||||||||--|-----|||-------|||-|---|-|----|||-|-|--|-----------|-- 1 [S] COG0393 Uncharacterized conserved protein ||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||-- 1 [M] COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis -------------||---||-|||-------|--||||----|||----|--|------||||-|| 1 [R] COG0400 Predicted esterase |||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||-- 1 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG0410 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component -|------|-|||----|||||-----------|--------|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG0411 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component |-||-------|-|----||------|-----|-||------||||||||----|----|--||-- 1 [L] COG0415 Deoxyribodipyrimidine photolyase ||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||---------------- 1 [L] COG0419 ATPase involved in DNA repair ||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|----- 1 [L] COG0420 DNA repair exonuclease -|--|||||||||||-||---|----|---|--|--||----||||||-|--||||||----|--- 1 [E] COG0421 Spermidine synthase |||||||||||||---||||-|-----||---|----|----||||---|-|---|---|||||-- 1 [R] COG0433 Predicted ATPase ---|----|---------||------||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 1 [H] COG0447 Dihydroxynaphthoic acid synthase |||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--|||||||| 1 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase |||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-|||||||||||||| 1 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components |-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2 ||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning --|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--|||||||| 1 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases ---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||-- 1 [E] COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding) --|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||-- 1 [L] COG0514 Superfamily II DNA helicase ---|||--|-|||||-||||-|-----||--|--||||----|||||--|-|---|||-|||||-- 1 [C] COG0538 Isocitrate dehydrogenases |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-| 1 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG0559 Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease components |||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase |||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--|||||||||||||| 1 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase |-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-|| 1 [ER] COG0591 Na+/proline symporter -||-----||-------|||||||--|---|--||-||----||||---|||---|---|||||-- 1 [P] COG0600 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component --||||----||-||-|--|-|----||||-|--||||----|||||-||-||--|---|||||-- 1 [CR] COG0604 NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductases ----------------|-||-|||---|||-|--||||----|||-||-|||-||||||||||||| 1 [I] COG0623 Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH) |||-----||-|-||-|---||-----||||--|||||----||-||-||--|--|---|||-|-| 1 [R] COG0655 Multimeric flavodoxin WrbA ---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||-- 1 [C] COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases) |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 1 [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit ||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--|||||||| 1 [R] COG0679 Predicted permeases -|-|----|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG0683 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component ------------------||-|-----|||-|--||||----------|-------||--|-||-- 1 [E] COG0686 Alanine dehydrogenase -||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||-- 1 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase -||-----||---||--|||||||--|---|--||-||----||||--||||---|---|||||-- 1 [P] COG0715 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components |||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [R] COG0730 Predicted permeases ----------------||||||--||||||||--||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases ----------|-|---||||-------------||-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I ------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|-- 1 [K] COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family -|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||-- 1 [L] COG0863 DNA modification methylase |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 1 [C] COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit |||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||-- 1 [C] COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit ---|------------|----|-----||--|----||---------------------|--|--- 1 [G] COG1023 Predicted 6-phosphogluconate dehydrogenase |||-|||||||||----|||||-----||-||-----|----|||-|-||------------|--- 1 [C] COG1032 Fe-S oxidoreductase -------------||-----------|||-||--||||---------------------||||--- 1 [C] COG1038 Pyruvate carboxylase --||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---||||||| 1 [C] COG1048 Aconitase A ----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||-- 1 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases ||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit |||||||||-|||-----|--|-----||--|----------|||||---||---|---------- 1 [H] COG1056 Nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase |||---||||-|-----|||------|||||-|-||||----|||||--|-----|---|||||-- 1 [G] COG1082 Sugar phosphate isomerases/epimerases --|---|-|-|--||--|--------||--||----------|||||-|-||-------------- 1 [C] COG1085 Galactose-1-phosphate uridylyltransferase -||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||-- 1 [P] COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component --|----------||------|----||||-|--||||----|||||----|-------------- 1 [P] COG1119 ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA --|--|--------------|-||--------|-|--|||--|||||------------||||--- 1 [EP] COG1124 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component -----------------|--|---|||----|----||-|--|||||-||||---|---|||||-- 1 [G] COG1129 ABC-type sugar transport system, ATPase component |--|||--|-|||-------||---------|----||----|||------|-||||||------- 1 [C] COG1139 Uncharacterized conserved protein containing a ferredoxin-like domain ---|--------------||------||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 1 [H] COG1165 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase ---|--------------||------||||-|--|||-----|||||-||||---------|---- 1 [HQ] COG1169 Isochorismate synthase -----------------|--|-----|--|-|----||----|||||-||||---|---|||||-- 1 [G] COG1172 Ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport systems, permease components ---|--||--|-|-----||||--|-|------|---|----|||||-||||-|||--|||||--- 1 [P] COG1178 ABC-type Fe3+ transport system, permease component |||---|||-|||---||--|-----------|----|----|||||----|-------------- 1 [R] COG1203 Predicted helicases ------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase ||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-|||||||||||||| 1 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component |--||||-|--|-|---|--||-----||-|-|-|-||-------||-||-----|---|||||-- 1 [Q] COG1228 Imidazolonepropionase and related amidohydrolases |||---||-||-|---|---|-----------|--|||----|||||-||||-||||||-----|| 1 [I] COG1267 Phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins --||||--|-------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 1 [C] COG1271 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1 --||------------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 1 [C] COG1294 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2 ----||-----------|------------||----||----|||||---|--------||||--- 1 [G] COG1312 D-mannonate dehydratase |||--|--||||-----|-||------||---|----|---------------------------- 1 [L] COG1343 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 1 [M] COG1346 Putative effector of murein hydrolase --||--------------||-|--|-|||-||---|||----|||||--|-|-------||-|||| 1 [S] COG1357 Uncharacterized low-complexity proteins |||-----||---||-||||-|----||||||--||||-----------|---|||---|||||-- 1 [E] COG1364 N-acetylglutamate synthase (N-acetylornithine aminotransferase) -||-|-||--||-----|--|------||----|-|--------------|-----|||---|--| 1 [R] COG1373 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 1 [R] COG1380 Putative effector of murein hydrolase LrgA |||-||||||---||-||--||-----||-||--||||----|||||-|-----------|----- 1 [ER] COG1387 Histidinol phosphatase and related hydrolases of the PHP family -||-----|-------|--|-|--------|--|--------|||-|---------------|--- 1 [O] COG1397 ADP-ribosylglycohydrolase |-|---|---||----|-|--|-----------|--|-----|--|----------|||------- 1 [V] COG1401 GTPase subunit of restriction endonuclease |-|---|||||-|||-|-||--||--||||||--|||-----|||||-||||---|---|||||-- 1 [R] COG1409 Predicted phosphohydrolases ||||||||||||||||----||--|--------|-------------------------------- 1 [C] COG1436 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit F |||---|||-|||---||-||-----------|----|---------------------------- 1 [L] COG1468 RecB family exonuclease -----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---||||||| 1 [G] COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases ||||----||------------||---|||--|--------------------------------- 1 [S] COG1478 Uncharacterized conserved protein -----------------|||----|------|----||----|||----|-|---|-----|||-- 1 [R] COG1512 Beta-propeller domains of methanol dehydrogenase type ---|----|-----------||---------|----||----|||------|-||||||------- 1 [S] COG1556 Uncharacterized conserved protein -----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [K] COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog |-|||---|--------|||-------------|--------||||--------|--|--|-||-| 1 [S] COG1598 Uncharacterized conserved protein |-|-----|---------||-|--------|-|-||||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [C] COG1600 Uncharacterized Fe-S protein --|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||-- 1 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein --|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-| 1 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase ----|||-|-|-|||---||-|-----------|---|----------|--|----|||||||--- 1 [E] COG1748 Saccharopine dehydrogenase and related proteins -------------||||||-|---|--|||-|----||----|||-|-||--||||---||||||| 1 [R] COG1752 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily |||---||||-||-------|-----------|---------|||-|-|||--------------- 1 [H] COG1767 Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthetase -------------------|------||||---|--------|||||-||--|------||||||| 1 [E] COG1770 Protease II -------------|||||--||--|-----||--||||---------------------------- 1 [S] COG1774 Uncharacterized homolog of PSP1 -------------------------|------|--||-------------|--------------- 1 [R] COG1783 Phage terminase large subunit ------|||----------------------|----|-----|||||----|---|--|||-||-- 1 [M] COG1794 Aspartate racemase -|||----|---|-----||-------------|-------------------------------- 1 [S] COG1808 Predicted membrane protein |||||||||||||---|---------------|--------------------------------- 1 [E] COG1812 Archaeal S-adenosylmethionine synthetase -------------||----|----|--|-|||----------|||-|-||-----|---||-||-- 1 [F] COG1816 Adenosine deaminase ||||||||||||----||||-|----||||-|--||||--------------------|-||||-- 1 [F] COG1828 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, PurS component -----------------|--------|----|--|-||-|--|||||-|-||-------------- 1 [G] COG1869 ABC-type ribose transport system, auxiliary component ------||---------|------------|--|--||-------|------|-------|--|-- 1 [G] COG1874 Beta-galactosidase --|--------------|--|---|-|--|||----||----|||||-||||---|---|||||-- 1 [G] COG1879 ABC-type sugar transport system, periplasmic component -----------------|--------|---||----||----|||||-------------||||-- 1 [G] COG1904 Glucuronate isomerase -|||--|||||||---||-|-------------|||-------||-----------||-------- 1 [S] COG1912 Uncharacterized conserved protein |||----|||-------||--|--------||--||------|||||-||--|--|-||----|-- 1 [P] COG1918 Fe2+ transport system protein A |||-----||------||--|---------||---|------|||--------------------- 1 [I] COG1924 Activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase (HSP70-class ATPase domain) --|----------||----|------||||-|---|||----||||||||||||||--||||||-- 1 [HE] COG1932 Phosphoserine aminotransferase ------------------||-|----||||||--||||----|||-|--|-----|--|||----- 1 [S] COG1937 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|||-|--||-----|---|||---------------------------- 1 [S] COG1963 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----|--|-|---|---|-----|||-||----||----|||||-||||-||||||------- 1 [T] COG1966 Carbon starvation protein, predicted membrane protein -------------------|------------|-|-||----|||||-|-||----||-----|-- 1 [F] COG1972 Nucleoside permease -----------------|||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|---|||||-- 1 [KT] COG1974 SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidases) ------------------|||------||||--|||||----|||||-||||---|----|----- 1 [E] COG1982 Arginine/lysine/ornithine decarboxylases -||---|-|---|-----|||------||----|--------|--||-|------|---||----- 1 [JD] COG2026 Cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system --------|---|-------|-----|-----|----|----|------||-----||-------- 1 [I] COG2031 Short chain fatty acids transporter --||---------------|-|-----|||||---|||----|||||-||---||---||||||-- 1 [P] COG2076 Membrane transporters of cations and cationic drugs |-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||-- 1 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases ||||----||---------|------|----|--------------------|--|---||-|--- 1 [R] COG2085 Predicted dinucleotide-binding enzymes ------------------||-|--------||--|-||----|||||-|-||--------|-|--- 1 [R] COG2103 Predicted sugar phosphate isomerase --|-||||||||||--||--||-----||---|-||------|||-|--|-----|------|--- 1 [R] COG2110 Predicted phosphatase homologous to the C-terminal domain of histone macroH2A1 -----------------|-------------|----||----|||||---|--------||||--- 1 [G] COG2115 Xylose isomerase --|-----|----------|-|----|||||--||-||----|||||--|---|||---|||||-- 1 [S] COG2128 Uncharacterized conserved protein --------------|---|-------|||--|-----|----|||-|-||-----------|---- 1 [R] COG2153 Predicted acyltransferase ---|-------------|||-------||----||-------|||-|-|----------|-----| 1 [D] COG2161 Antitoxin of toxin-antitoxin stability system ---------------------------||--|---|||----|||||-||-----|---|||||-| 1 [F] COG2169 Adenosine deaminase ---------------------------||----|--------|||-|--||-|||-||-||-|--- 1 [D] COG2184 Protein involved in cell division -----|--|-----------|-----|------|-|--||------|---|||-|-||-|--|--- 1 [L] COG2189 Adenine specific DNA methylase Mod ------------------------------|--|||||-||-|||||||--|-------------- 1 [G] COG2213 Phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component -------------||------|---||---|-|---------|||||--|||-------|||||-- 1 [H] COG2240 Pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase -------||----||--|-|||----||||||--||||----|||||-||||---|---|||||-- 1 [I] COG2267 Lysophospholipase ------------------||------|----|----||----|||-|--|------------|--- 1 [S] COG2268 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|--|--|--|---|----|---|-------|||||---------------------||||--- 1 [E] COG2309 Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T) -||---------------||-|---|-||--|--|-||-----------|-----|---------- 1 [S] COG2314 Predicted membrane protein ---------------------|----|||---|---------|||||--|-|---|---||||--- 1 [R] COG2321 Predicted metalloprotease -------------||------|-----||--|---|---------|---|-----|---|---|-- 1 [T] COG2365 Protein tyrosine/serine phosphatase ------------------||-|--|-|-----|---------------||---------------- 1 [R] COG2374 Predicted extracellular nuclease --------|---|-------||----|----|--||------|||---||-|-------|||||-- 1 [R] COG2388 Predicted acetyltransferase ------||--|-|----|------------|--|--------|||||---|--------------- 1 [G] COG2407 L-fucose isomerase and related proteins -------------------|------------|-|---|-----------||----||-------- 1 [R] COG2503 Predicted secreted acid phosphatase --|---||||||-----||-|---------||-----|----------|--------------|-- 1 [R] COG2509 Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases --|-----------------|-----|---|-|-|-||----|||||-||||-|||---------- 1 [GE] COG2610 H+/gluconate symporter and related permeases -------------------|------|||-||--||-|----|||-|--|-----|----|-||-- 1 [S] COG2764 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------||-------||-|----||||||--||||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [K] COG2771 DNA-binding HTH domain-containing proteins ---------------------|----|---|--|-||-----|||-|--|-----|--|--|---- 1 [P] COG2807 Cyanate permease --------------------------|||--|--||||----|||||--||||--||||||-|--- 1 [G] COG2814 Arabinose efflux permease ---------------------|--------|--|--|------||-|--|---|----||---|-- 1 [R] COG2819 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily --------------------||-----------||-------|||-|-||||-||----|||---- 1 [S] COG2832 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|-----|-|-||-----------|--|||---|------- 1 [C] COG2851 H+/citrate symporter -------------------|||---|-||-|--|||||--------------||-|-----|---- 1 [E] COG2856 Predicted Zn peptidase --||---------||--|---|----|||-||---|-|-----------|-|---|--|||||--- 1 [E] COG2873 O-acetylhomoserine sulfhydrylase ----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------ 1 [E] COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase --|-----------------------||||-|--|||------------|--|--|---|||||-- 1 [S] COG2898 Uncharacterized conserved protein ---------------------|-----|||-|--------------------|------|||---- 1 [S] COG2899 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|--------||--|--||----------------|-------|-||-- 1 [R] COG2936 Predicted acyl esterases --------------------|-----------|---------|||||-||||---|--|-|----- 1 [S] COG2964 Uncharacterized protein conserved in bacteria |------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|------- 1 [S] COG2966 Uncharacterized conserved protein ---|||--------------||----------|-|-||-------||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2986 Histidine ammonia-lyase ---|||--------------||----------|-|-||-------|--||-----|---|||||-- 1 [E] COG2987 Urocanate hydratase -------------------|-------------|--------|||-|-|-|-|---||-|------ 1 [S] COG3041 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|--|||------|||||-||||-|-|----|-||-| 1 [K] COG3070 Regulator of competence-specific genes -------------|||----------|---||--|||-----|||||-|---|||--------|-- 1 [E] COG3104 Dipeptide/tripeptide permease --|----------------|------|----|--||------|||||-||---------|||||-- 1 [R] COG3153 Predicted acetyltransferase ---------------------------||--|----------|||||--|||-------------- 1 [H] COG3172 Predicted ATPase/kinase involved in NAD metabolism --||-----------------|-----||--|---|||-----------|-----|---||-||-| 1 [R] COG3173 Predicted aminoglycoside phosphotransferase --||------------|--||-----|-----|-||-------|||---|-|-|||||-||-|--| 1 [S] COG3177 Uncharacterized conserved protein --|-----------------|-----------|-||||----------||---||-------||-- 1 [S] COG3212 Predicted membrane protein ---|------|--------||-----|||--|--|--|----||||--||---------||-||-- 1 [P] COG3221 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, periplasmic component -------------------------------|---||-----|||||--||--------------- 1 [S] COG3223 Predicted membrane protein ---------------------|-----||--|-----------------|----------|-|--- 1 [J] COG3231 Aminoglycoside phosphotransferase -------------------|-|----|---||--||------|||-|--|-|-------|--|--- 1 [S] COG3238 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----------------|-------||--|--||------||||---|-----|----|||--- 1 [S] COG3247 Uncharacterized conserved protein -------------------------------|----------|||||-|------|--------|- 1 [S] COG3274 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|-----|---||----|||-|-|----------------- 1 [T] COG3290 Signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism |||---|-|---|------------------|-----|----------|----------------- 1 [R] COG3291 FOG: PKD repeat -----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-||||||| 1 [M] COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes --|-||-----|------|--------||-||-----||----||||--------|----|-|--- 1 [L] COG3328 Transposase and inactivated derivatives -----------------|---------------|---|-------|--|----------------- 1 [G] COG3345 Alpha-galactosidase -------------------------------|---|-|-------|--||---------------- 1 [S] COG3397 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----||-----------|--||--------|-|--------------------------------- 1 [E] COG3404 Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase -----------------|---------------|--||---------------------|--|--- 1 [Q] COG3458 Acetyl esterase (deacetylase) |-|||--------------|||--------||-----|--------|------|||----|||--- 1 [R] COG3467 Predicted flavin-nucleotide-binding protein -------------------------------|---|------------||---------------- 1 [G] COG3469 Chitinase --|-----|-----|---||----------||----|----------------------||----- 1 [T] COG3476 Tryptophan-rich sensory protein (mitochondrial benzodiazepine receptor homolog) -------------------------------|--|-------||||------------|------- 1 [S] COG3477 Predicted periplasmic/secreted protein -||-----------------|----------|----|----------------------------- 1 [R] COG3478 Predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon domain -------------------------------|----|-----------|----------------- 1 [Q] COG3479 Phenolic acid decarboxylase ------------------------------||----||----|-----------------|--|-- 1 [G] COG3507 Beta-xylosidase --------------------------------|------------------|--|---|------- 1 [S] COG3512 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------|--|---------------|--|---|------- 1 [S] COG3513 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------|----|--------------||--------------------|---||-||-- 1 [S] COG3542 Uncharacterized conserved protein --------------------------|||--|-----|---------------------------- 1 [M] COG3559 Putative exporter of polyketide antibiotics -------------|----------------||--||-------------|---||----|-|---- 1 [R] COG3560 Predicted oxidoreductase related to nitroreductase ---------------------------||----|------------------|------|||||-- 1 [H] COG3572 Gamma-glutamylcysteine synthetase |||----------------|||-----|||--|----------------|---------||-||-- 1 [R] COG3576 Predicted flavin-nucleotide-binding protein structurally related to pyridoxine 5'-phosphate oxidase ----------------||--|---------||---|------------------------------ 1 [S] COG3580 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||--|---------||---|------------------------------ 1 [S] COG3581 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|---|--------||---|||---------------------------- 1 [S] COG3584 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------||-|-----|||||-------------|-|--- 1 [E] COG3591 V8-like Glu-specific endopeptidase --|----------------------------|---|------|||-----------------|--- 1 [S] COG3592 Uncharacterized conserved protein ------||----------------------||---|||-------|-------------------- 1 [S] COG3595 Uncharacterized conserved protein ------------------||-|---------|-------------------------|-------- 1 [S] COG3597 Uncharacterized protein/domain associated with GTPases ----------------|---------------|-------------------|---------|--- 1 [L] COG3598 RecA-family ATPase --------------------------|----|------|-------------|--------|-|-- 1 [S] COG3600 Uncharacterized phage-associated protein --------------------------|----|--||-|---------------------||-|--- 1 [R] COG3607 Predicted lactoylglutathione lyase |------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|------- 1 [S] COG3610 Uncharacterized conserved protein --|-----------|----------|-----|------|----------|-----|---|--||-- 1 [F] COG3613 Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase ---------------------------------|--------|||||---||-||----------- 1 [P] COG3615 Uncharacterized protein/domain, possibly involved in tellurite resistance -----------------|--|------||---|--------------------------||-|--- 1 [T] COG3629 DNA-binding transcriptional activator of the SARP family --------------------------------|---------|||||-||||-||---|------- 1 [E] COG3633 Na+/serine symporter ---|---------------||-----|----|--|--|-|--||||---|---------||-||-- 1 [P] COG3638 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component ----||-----------|--|-----------|--------------------------------- 1 [E] COG3643 Glutamate formiminotransferase -----------------|--------------|----|---------------------------- 1 [L] COG3649 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair -------------------|-------------|-----|-----||-||---|-------|-|-- 1 [R] COG3654 Prophage maintenance system killer protein -----------|-----|---------------|------------------|----------|-- 1 [G] COG3669 Alpha-L-fucosidase ------------------||----------|-|-||||---------------------------- 1 [R] COG3688 Predicted RNA-binding protein containing a PIN domain --------------|------|----|||--|---|------|||||-||---------------- 1 [L] COG3695 Predicted methylated DNA-protein cysteine methyltransferase --------------------|-----------|---------|||-|-|-|--------------- 1 [HI] COG3697 Phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase (holo-ACP synthetase) --------------------------------|---------|||-|---|--------------- 1 [R] COG3700 Acid phosphatase (class B) ----------------|-||-|--------||---|||-----------|---|||---|||||-- 1 [E] COG3705 ATP phosphoribosyltransferase involved in histidine biosynthesis -------------------------------|---|||-------------|-------|---|-- 1 [S] COG3739 Uncharacterized integral membrane protein --------------|------------||--|---|-----------------------|--||-- 1 [S] COG3752 Predicted membrane protein --------------------|-----------|---------||||---|-----|---||||--- 1 [S] COG3758 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|-----------------|---------|||||-- 1 [S] COG3760 Uncharacterized conserved protein ---------------------------||----|-|-----------------------||-||-- 1 [S] COG3797 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|----|-----|------------|-----------------|-- 1 [O] COG3823 Glutamine cyclotransferase ---------------------------------|------------------|--|||-|--|--- 1 [U] COG3843 Type IV secretory pathway, VirD2 components (relaxase) --------------------|---------||--|||----------------------------- 1 [G] COG3855 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|---||--||-------------|-----|---||-|--- 1 [S] COG3865 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------|----||--------||-|---------------------------|-|--- 1 [R] COG3899 Predicted ATPase -------------------------------|---------------------------|--|--- 1 [R] COG3919 Predicted ATP-grasp enzyme --------------------------|---|--||-||---------------------------- 1 [M] COG3944 Capsular polysaccharide biosynthesis protein ------------------------------|--|----------------|--------------- 1 [M] COG3955 Exopolysaccharide biosynthesis protein --------------|---||----------||-----------------|----------|||--- 1 [G] COG3957 Phosphoketolase -|--||-|--|||----|--|------------|-----------||------------||-|--- 1 [G] COG3958 Transketolase, C-terminal subunit -|--||-|--|||----|--|------------|-----------||------------||-|--- 1 [G] COG3959 Transketolase, N-terminal subunit --|----------||------------|||||--|-----------|------------------- 1 [GHR] COG3961 Pyruvate decarboxylase and related thiamine pyrophosphate-requiring enzymes -------------------|----------||----|------------------|---||----- 1 [M] COG3967 Short-chain dehydrogenase involved in D-alanine esterification of lipoteichoic acid and wall teichoic acid (D-alanine transfer protein) ---|---------------------------|---|-|-------||-||---------------- 1 [R] COG3979 Uncharacterized protein contain chitin-binding domain type 3 |--------|--------------------|--|--||---------------------------- 1 [S] COG4086 Predicted secreted protein -|-----------------|-------------|----||-------------------------| 1 [S] COG4095 Uncharacterized conserved protein -------------------|----------|--|--------------||---------------- 1 [P] COG4097 Predicted ferric reductase -------------------|-------||----||------------------------|-----| 1 [S] COG4115 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------|--------|||-|---|--------||||--- 1 [G] COG4154 Fucose dissimilation pathway protein FucU -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG4177 ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component ------------------------------|--||-|----------------------------- 1 [G] COG4193 Beta- N-acetylglucosaminidase -------------------------------|----||-----------------|---------- 1 [S] COG4260 Putative virion core protein (lumpy skin disease virus) --|------------------|-----------|--------|--|------------|------- 1 [V] COG4268 McrBC 5-methylcytosine restriction system component ----||-----|-------------------|---|------------------------------ 1 [S] COG4272 Predicted membrane protein ------------------------------||-------------|----------------|--- 1 [S] COG4331 Predicted membrane protein -------------------------------|--------------------|-------|----- 1 [S] COG4334 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|---------|--||------------------------------ 1 [S] COG4367 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------|--|------------------|---------- 1 [S] COG4377 Predicted membrane protein ---------------------|----|||--|---------------------------||-||-- 1 [S] COG4420 Predicted membrane protein ------------------------------|--||-||---------------------------- 1 [GM] COG4464 Capsular polysaccharide biosynthesis protein -------------------------------|--||||---------------------------- 1 [S] COG4493 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------||--|--|---------------------------- 1 [S] COG4495 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------|-||-|---------------------------- 1 [S] COG4509 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------||------||--|-----|---------------------------- 1 [R] COG4552 Predicted acetyltransferase involved in intracellular survival and related acetyltransferases --------------------------|-----|---||----|||-|-|----------------- 1 [KT] COG4565 Response regulator of citrate/malate metabolism --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 1 [P] COG4604 ABC-type enterochelin transport system, ATPase component --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 1 [P] COG4605 ABC-type enterochelin transport system, permease component --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 1 [P] COG4606 ABC-type enterochelin transport system, permease component --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 1 [P] COG4607 ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component ------------------------------||----|----------------------------- 1 [G] COG4632 Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase -------------------|----------|--|-------------------------------- 1 [S] COG4633 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----------------------------|----------|||||-|--|----------|--- 1 [CH] COG4635 Flavodoxin -------------------|-------------|---------||||---|-|------------- 1 [S] COG4679 Phage-related protein ---------------------|--------||---------------------------------- 1 [S] COG4712 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|------||-|----------------------------- 1 [S] COG4721 Predicted membrane protein ----------|-|--------------------||------------------------------- 1 [S] COG4732 Predicted membrane protein --------------------|---|--------|----------------|--------------- 1 [M] COG4750 CTP:phosphocholine cytidylyltransferase involved in choline phosphorylation for cell surface LPS epitopes -----------------|--|---|------|---|------------------------------ 1 [S] COG4769 Predicted membrane protein --|-----------------|----------|---|------------------------------ 1 [S] COG4832 Uncharacterized conserved protein -------------------------------|---|-----------------------|--|--- 1 [S] COG4852 Predicted membrane protein --------------------------|------|-------------------------|------ 1 [S] COG4877 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-----------------------|------|--|----------------------------- 1 [S] COG4894 Uncharacterized conserved protein ---------------------------------|-|------------------------|----- 1 [S] COG4898 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------||---|------------------------------ 1 [S] COG4905 Predicted membrane protein --|-----------------|-----|----|---|------------------------|-|--| 1 [L] COG4912 Predicted DNA alkylation repair enzyme -------------------------------|--|||----------------------------- 1 [R] COG4915 5-bromo-4-chloroindolyl phosphate hydrolysis protein -------------------------------|---||----------------------------- 1 [S] COG4918 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|------------|---------------------|---|------ 1 [S] COG4922 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|||--||-||----|||||----||||||--||||----|||||--|-----|---|||||-- 1 [MR] COG4948 L-alanine-DL-glutamate epimerase and related enzymes of enolase superfamily --------------------------|------|---------||--------------------- 1 [S] COG4951 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|--------||--||||---------------------------- 1 [R] COG4956 Integral membrane protein (PIN domain superfamily) -------------------------------|--||||----|||||-|-||-------|-|-|-- 1 [CO] COG4987 ABC-type transport system involved in cytochrome bd biosynthesis, fused ATPase and permease components ------------------------------|--|||||----|||||-|----------|--|--- 1 [R] COG4989 Predicted oxidoreductase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase ---------------------------------|-------------------------|--||-- 1 [S] COG5255 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------||---|-----------|-|--------------------------------- 1 [D] COG5279 Uncharacterized protein involved in cytokinesis, contains TGc (transglutaminase/protease-like) domain --|------------------|---------|--|||----------------------------- 1 [S] COG5280 Phage-related minor tail protein -----------------|--|----------|---|------------------------------ 1 [S] COG5341 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------|-||-|---------------------------- 1 [S] COG5412 Phage-related protein --|--------||----|--||----|-----|--------------------------------- 1 [R] COG5496 Predicted thioesterase -------------------|-----------|--------------------|------------- 1 [R] COG5545 Predicted P-loop ATPase and inactivated derivatives --|---------------||-------------|-------------------------------- 1 [O] COG5549 Predicted Zn-dependent protease ---------------------------||--|--||------|||-|------------------- 1 [R] COG5562 Phage envelope protein --------------------------|----|---|||-------------------------|-- 1 [S] COG5646 Uncharacterized conserved protein