| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 41 [NT] COG0840 Methyl-accepting chemotaxis protein |||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 29 [R] COG0457 FOG: TPR repeat |-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 29 [K] COG1309 Transcriptional regulator ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 25 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily |-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 25 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase |-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---||||||| 25 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators ||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 21 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis ----------------||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 21 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain |||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 20 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases ||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 20 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component |-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 20 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component ||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 18 [M] COG0438 Glycosyltransferase |||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||-- 18 [K] COG1846 Transcriptional regulators ------------------------------|----||------||||------------------- 18 [N] COG5492 Bacterial surface proteins containing Ig-like domains |-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||-- 17 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component ||||----|||||---|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 17 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component |||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 15 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases ||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 14 [K] COG0583 Transcriptional regulator --||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-|||||||||||||||||| 13 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) --|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||-- 13 [G] COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase --|---------------||-|----|||||-----||----------|------|---||||--- 13 [M] COG3409 Putative peptidoglycan-binding domain-containing protein |||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 12 [C] COG0778 Nitroreductase --||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 11 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components ----------------||||-|--|-|||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 11 [T] COG2199 FOG: GGDEF domain --|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 10 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators --|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 10 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) |||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|--- 10 [C] COG1145 Ferredoxin ||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||-- 10 [K] COG1733 Predicted transcriptional regulators --|---------------------------|-|----|---------------------------- 10 [T] COG5585 NAD+--asparagine ADP-ribosyltransferase |||-----||-|-||-|---||-----||||--|||||----||-||-||--|--|---|||-|-| 9 [R] COG0655 Multimeric flavodoxin WrbA |-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 9 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 9 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2 --|||||||--||----|||-|--||----|---|||||||--------|-----|----||---- 9 [R] COG1277 ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component ||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 8 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump |-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|--- 8 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily ||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-||||||| 8 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase |-||--|||----|||-|||-|--||-||-|----|||----|||||-|||||--|||||||||-- 8 [T] COG0784 FOG: CheY-like receiver |-|--||||---|-----||-|----|||||-----------|---|--||-|--|---||-||-- 8 [R] COG1216 Predicted glycosyltransferases -----------------|--||----|||-||||||||-|--|||||-|||||--|---|||||-- 8 [K] COG1609 Transcriptional regulators ----------------||-|-|--||----|------|----------||-----|---|--|--- 8 [T] COG2206 HD-GYP domain ||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 7 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases ||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---||||||| 7 [E] COG0531 Amino acid transporters |||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 7 [L] COG0582 Integrase ----------------||||--|||--||-|---||||----|||||-||-----||||------- 7 [K] COG1191 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit ----------------||--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---||||--- 7 [KG] COG1349 Transcriptional regulators of sugar metabolism ------------------||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 7 [TK] COG2197 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain ----||||--||--------------|---||||||||----|||||-|----------||--|-- 7 [G] COG2723 Beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/beta-galactosidase --------------------------|||||---||||---------------------------- 7 [S] COG4842 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein |||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase ||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 6 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases -------------|||--||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 6 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains |-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes |||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [R] COG0517 FOG: CBS domain |||||||||||||---||||-|-----||-||--|-||-----------|-----|----|-|--- 6 [R] COG0535 Predicted Fe-S oxidoreductases --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||--- 6 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components ||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase ----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [M] COG0845 Membrane-fusion protein --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||--- 6 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components |-|-||||||||-||||-||------|---|||-||||----|||||--|-----|---|||||-| 6 [M] COG1215 Glycosyltransferases, probably involved in cell wall biogenesis --------------------|----||---||||||||-|||||||||||-|---|-------|-- 6 [G] COG1263 Phosphotransferase system IIC components, glucose/maltose/N-acetylglucosamine-specific --------------------|----||---||||||||||||||||||||-|---|-------|-- 6 [G] COG1264 Phosphotransferase system IIB components |-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||-- 6 [R] COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||----|||||-||-||--|---||||--- 6 [G] COG1653 ABC-type sugar transport system, periplasmic component -|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-||||||||||||| 6 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins |-|||||||-|||----|-|||----||||||||||||----|||||-|------|------||-- 6 [K] COG1695 Predicted transcriptional regulators --||||--|--|-||--|-|||----|||-|||-||||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 6 [C] COG1902 NADH:flavin oxidoreductases, Old Yellow Enzyme family -----||---|-------||-|----|||-|-||||||----|||||-||--|--|---|||||-- 6 [L] COG1961 Site-specific recombinases, DNA invertase Pin homologs ---|--|||-|||-----||-------||-|----|||----|||--------------||-|--- 6 [K] COG2002 Regulators of stationary/sporulation gene expression --------------------|----||---||||||||-|||||||||||||---|-------|-- 6 [G] COG2190 Phosphotransferase system IIA components -----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||-- 6 [K] COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins ||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 6 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid ------||-----||--|-|----------|-----||--------------|--|---------- 6 [G] COG2730 Endoglucanase ------------------||-|----|||-||||||||-----------|-----|---||-||-- 6 [T] COG4585 Signal transduction histidine kinase |||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||-- 5 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases |-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 5 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases --|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||--- 5 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component |||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||-- 5 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases --|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 5 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase ----------------|||-|-----|||||-|||||||||||--||----|----|||-|||-|| 5 [G] COG0698 Ribose 5-phosphate isomerase RpiB |||-----||---||---|||---|-----||||-||-----|||||||||||--||||------- 5 [C] COG0716 Flavodoxins --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 5 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component ------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||-- 5 [M] COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins) --|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-||||||||||||| 5 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain |||-|||||||||----|||||-----||-||-----|----|||-|-||------------|--- 5 [C] COG1032 Fe-S oxidoreductase --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 5 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 5 [N] COG1344 Flagellin and related hook-associated proteins -----------------|||------|||||-----||----|||-|-||---|||---||||--- 5 [S] COG1376 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||---||----------|-|--------||||||||-----------|-------------|-- 5 [K] COG1476 Predicted transcriptional regulators |--------------------|----||||||||||||---------------------------- 5 [S] COG1511 Predicted membrane protein -----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||-- 5 [K] COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog -------------------|-||||||||||||||||||---|||||-|||||||||||||||||| 5 [D] COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins ----------||-||---||-|||--|||||------|--------------|------------- 5 [T] COG1716 FOG: FHA domain ---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||-- 5 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase -------------------|||--------||-|--||----|||-|-------------|----- 5 [S] COG2323 Predicted membrane protein --------------------|-----|---||||||||----|||||------------------- 5 [K] COG3711 Transcriptional antiterminator ------------------------------|-----|----------------------||||--- 5 [G] COG4124 Beta-mannanase --|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||--- 5 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component --|----------|||---|----------|-|--|------|||||--|-----|---------- 5 [S] COG4886 Leucine-rich repeat (LRR) protein ------------------------------|---|-||---------------------------- 5 [M] COG5577 Spore coat protein ||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-| 4 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) |-||------||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain |||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||-- 4 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs ||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning |||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||| 4 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases |||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||-- 4 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family |------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||| 4 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit -||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||-- 4 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component -------------|||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase ||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [R] COG0628 Predicted permease -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein -------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||-- 4 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases |-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||-- 4 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins -||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||-- 4 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase --||--|||--------|||----||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 4 [NT] COG0835 Chemotaxis signal transduction protein |||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||-- 4 [C] COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit --||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||-- 4 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily ||||--|||||||----|||||--|-||||||||||||||||-||-|-|-|----|---|||---- 4 [P] COG1122 ABC-type cobalt transport system, ATPase component |||----|||-------|--|---------|-----------|||||------------------- 4 [C] COG1151 6Fe-6S prismane cluster-containing protein ||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||-- 4 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III ---------|-------|--|-||-|----||||||||||||------|----------|||---- 4 [S] COG1284 Uncharacterized conserved protein -----------------|--||----|||-||||||||||||-------|---------------- 4 [S] COG1307 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||-- 4 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase --||--------------||-|--|-|||-||---|||----|||||--|-|-------||-|||| 4 [S] COG1357 Uncharacterized low-complexity proteins ||||--|||||-|----|-|||--------||||||||||--|||-|--|----------|----- 4 [G] COG1363 Cellulase M and related proteins -----------------|------------|||-|||-----|||-|-||||-||-|||||-|--- 4 [M] COG1368 Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily |-|||||||--||||-||--|-----|---||-|||||----|||||-||-|---|---||||--- 4 [C] COG1454 Alcohol dehydrogenase, class IV |||||||||||||--------|----|||-|-----||----|||||-||||-|||---|||||-- 4 [K] COG1522 Transcriptional regulators |||----|||-|-----|-||---------|-----|---------------------|------- 4 [C] COG1592 Rubrerythrin --------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 4 [M] COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase -----------------|--------|---||||||||-|--|||||-||||-|||---|||||-- 4 [K] COG1737 Transcriptional regulators |||------|---|----|--|-----||||-----|------||||-||------------|--- 4 [GC] COG1819 Glycosyl transferases, related to UDP-glucuronosyltransferase ---|--|||-|-|||-|--|------|||-|||-||||----|||||-||-----|------||-- 4 [H] COG1893 Ketopantoate reductase ----||-----|-||----|||----||||||-|||||----|||||--|||||||---||||--- 4 [P] COG1914 Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family ----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 4 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator -------------------|-|----|||-||||||||||--|||||-||-----|---|||||-- 4 [K] COG2188 Transcriptional regulators ----------------|-||-|---||||||----|||----|||||-||--|--|---||||||| 4 [T] COG2200 FOG: EAL domain ------------------|||---------||----|-----|||||----------------|-- 4 [G] COG2211 Na+/melibiose symporter and related transporters ------------------------|-----|-------------------------|||------- 4 [S] COG2604 Uncharacterized protein conserved in bacteria |||------|--------|||---------|-----------------------------|-|--- 4 [C] COG2710 Nitrogenase molybdenum-iron protein, alpha and beta chains ------------------------------||||--------|||-------|------||||--- 4 [M] COG3757 Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase) --------------------|-----|---||--|------------------------------- 4 [S] COG5438 Predicted multitransmembrane protein ||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||------------- 3 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases ||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--|||||||| 3 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters |||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||-- 3 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases ||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase -------------|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [F] COG0194 Guanylate kinase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases --||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---||||||| 3 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family) --|----|---|-|||---||-----||||||||||||-----------|-|---|---||-||-- 3 [R] COG0300 Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase ----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III |||-----||------||||-|----|||-||---||-----|||||-||||||||---|||||-- 3 [E] COG0347 Nitrogen regulatory protein PII --|-||----|--||--|||-|----|||-||||||||-|--|||||-||-----|---||-||-- 3 [G] COG0366 Glycosidases -------------|||--|-|-----|---|||||||||---|||||--|--||||-------|-- 3 [O] COG0386 Glutathione peroxidase |-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||-- 3 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||-||||||||-||-||--|---||||--- 3 [G] COG0395 ABC-type sugar transport system, permease component ||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||-- 3 [M] COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis --|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||-- 3 [G] COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase |||---|||-------|||||---------|-----------|||-|--|-----|---------- 3 [C] COG0426 Uncharacterized flavoproteins |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0443 Molecular chaperone ||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 3 [R] COG0456 Acetyltransferases -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases) ||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0492 Thioredoxin reductase ||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||--- 3 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins ---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|--- 3 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase ||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase |-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||-- 3 [E] COG0520 Selenocysteine lyase |||||||||||||---|--|-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 3 [H] COG0521 Molybdopterin biosynthesis enzymes |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins |||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins |||-||||||-|-||-||--|---|-|||-||-|-|||----|||||-||---|||---|----|| 3 [HC] COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0550 Topoisomerase IA --||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|----- 3 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family |-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific |||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--|||||||||||||| 3 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase -||-----||-------|||||||--|---|--||-||----||||---|||---|---|||||-- 3 [P] COG0600 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component ||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease ----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--||||||||||| 3 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases -||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||-- 3 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component ||||--||||-||----|||||----||||||||||||||||-||-|---|--------|||---- 3 [P] COG0619 ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters |||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase --||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases -----|-------||-|-||-|||--||||||||||||||||-------|--|--||--|--|--- 3 [T] COG0631 Serine/threonine protein phosphatase |||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||-- 3 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 3 [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit -||-----||---||--|||||||--|---|--||-||----||||--||||---|---|||||-- 3 [P] COG0715 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components --|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||-- 3 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases --|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||--- 3 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein -----------------|---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0782 Transcription elongation factor |||------|-|----|--|||--------||||||||----|||||-||||-|||||||||---- 3 [O] COG0826 Collagenase and related proteases --||--|||-------||||-|--------|-----------|||||-||--|---||-|||||-| 3 [M] COG0836 Mannose-1-phosphate guanylyltransferase ||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||-- 3 [R] COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily) ||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-| 3 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 3 [C] COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit ---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---||||||| 3 [I] COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase ----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||-- 3 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases ||||||||||-------|------|-----|-----||----|||||-||||-------------- 3 [O] COG1067 Predicted ATP-dependent protease |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 3 [G] COG1109 Phosphomannomutase -||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||-- 3 [P] COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component -||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||-- 3 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components --------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|-----|||-||||--- 3 [E] COG1174 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, permease component ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|---||||--- 3 [G] COG1175 ABC-type sugar transport systems, permease components ||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--|||||||||||||| 3 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning |-||--|||--------||||||-|-|---||||||||---------------------||||-|| 3 [R] COG1268 Uncharacterized conserved protein -----------------|||-|--||||||||||||||---------------------------- 3 [K] COG1316 Transcriptional regulator --||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|--- 3 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases |-|---|||||-|||-|-||--||--||||||--|||-----|||||-||||---|---|||||-- 3 [R] COG1409 Predicted phosphohydrolases ||||||||||------||--||--||----|||||||||-|||||-|---------|||||----- 3 [R] COG1418 Predicted HD superfamily hydrolase --||||||---|-----|||||----|||-||-|||||----|||----|||---|--||||||-- 3 [R] COG1473 Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase ----||----||-||--|-|----------||-|-|-|----|||||--------|---|---|-- 3 [G] COG1501 Alpha-glucosidases, family 31 of glycosyl hydrolases ----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-||||||| 3 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes -||-|-|||||||----||-|------||-|-----||-----------|-----|---|||||-| 3 [L] COG1533 DNA repair photolyase -------------||--|--------|---|-|||-||-----||---|--|---|---|------ 3 [G] COG1621 Beta-fructosidases (levanase/invertase) |||----|||-------||--|--------||--||------|||||-||--|--|-||----|-- 3 [P] COG1918 Fe2+ transport system protein A |||-----||------||--|---------||---|------|||--------------------- 3 [I] COG1924 Activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase (HSP70-class ATPase domain) |-|-----------------|-----|---|-----||----|||||--|--|||---|------- 3 [S] COG1971 Predicted membrane protein -----------------|-||---------|----|||----|||||-|--|-------------- 3 [C] COG1979 Uncharacterized oxidoreductases, Fe-dependent alcohol dehydrogenase family |-||||-|||-||----||--|--------|||----------------|------------||-- 3 [S] COG2013 Uncharacterized conserved protein ----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||-- 3 [G] COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes ---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||-- 3 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis ----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||-- 3 [NU] COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG ---------------------|----||||||||-|||-----------|---------|------ 3 [TQ] COG2508 Regulator of polyketide synthase expression --||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||---- 3 [P] COG2608 Copper chaperone -----------|-||---||-------|||||||-|||----|||||-||-|-|||--||||||-- 3 [E] COG2755 Lysophospholipase L1 and related esterases --|----------------|----------|---|-|-----------||---------------- 3 [E] COG3227 Zinc metalloprotease (elastase) --------------------|---------||||||||----|||||-||--|--|---|||||-- 3 [KT] COG3279 Response regulator of the LytR/AlgR family -|-------|----------|---------||||||||----------------------|----- 3 [R] COG3481 Predicted HD-superfamily hydrolase ------------------------------||----||----|-----------------|--|-- 3 [G] COG3507 Beta-xylosidase -----------------|---|--------||---|||---------------------------- 3 [S] COG3584 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|-----||---------------------|||||-- 3 [M] COG3773 Cell wall hydrolyses involved in spore germination ------------------------------||||-|||---------------------------- 3 [S] COG3883 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------||----|---||||---|----------|--|----------|--- 3 [R] COG3981 Predicted acetyltransferase -----------------|--|-|||||||-||-||||-||--|||||-||||---|||-||||--- 3 [E] COG4166 ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component ------------------------------||--|--|---------------------------- 3 [S] COG4495 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|---||-|-|-|---------------------------- 3 [V] COG4767 Glycopeptide antibiotics resistance protein --|------------------------||-|----|------------------------------ 3 [R] COG4908 Uncharacterized protein containing a NRPS condensation (elongation) domain -------|-|--------------------|----------------------------------- 3 [S] COG5617 Predicted integral membrane protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase ||-||||||||--|--|||-------|||-|--||-||---------------------------- 2 [S] COG0011 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase -------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0021 Transketolase |||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase] --||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0031 Cysteine synthase ||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--|||||||| 2 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases ||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase -||---||--||-|--|-||||||--|||-||||--||----|||||-||||-------||-|--- 2 [G] COG0058 Glucan phosphorylase ||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---||||||||||||| 2 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog) |||---||||------|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 2 [O] COG0068 Hydrogenase maturation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0073 EMAP domain ||||||||||||||--||||-|--------||--|-||--------|-||------||-||-||-- 2 [E] COG0075 Serine-pyruvate aminotransferase/archaeal aspartate aminotransferase |||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase |||---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0084 Mg-dependent DNase |||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase --||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful) ||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---||||||||||||| 2 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases --||||||--|||||----|-|----|||||---|-||----|||||-|||----|---||||--- 2 [E] COG0160 4-aminobutyrate aminotransferase and related aminotransferases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 2 [H] COG0171 NAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase -||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 2 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit ||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-||||||| 2 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit -------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||-- 2 [G] COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase |-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12 -|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase -------------|---|--------|---||-||-||-||-||||||||-|---|---|||||-- 2 [G] COG0246 Mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenases ---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family --|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-| 2 [H] COG0262 Dihydrofolate reductase ||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||-- 2 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II) --||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-||||||||| 2 [C] COG0280 Phosphotransacetylase --|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [C] COG0281 Malic enzyme ---|------|-|||--|---|---|-||||||||||||||||||||-|-||-------||-||-- 2 [F] COG0295 Cytidine deaminase |||||||||||||---|-||-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [H] COG0303 Molybdopterin biosynthesis enzyme ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0305 Replicative DNA helicase ||||----||--------||----------|----|----------|---|----------|---- 2 [P] COG0310 ABC-type Co2+ transport system, permease component |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex |||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase |||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase ||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase --|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type) |||||||||||-||||----------||||||---|||----|||||-||--|-------|-|--- 2 [E] COG0367 Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing) |||---|||||-----||||-|--------||--||------|||||-||--|--||||----|-- 2 [P] COG0370 Fe2+ transport system protein B ||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----|| 2 [M] COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase |||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-||||||||||||||| 2 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases |-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||-- 2 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase --||---------||---||------|||-||||||||----|||---|-----------|--|-- 2 [S] COG0398 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase -----------------|||||||--||||||-|--||----|||||-|-||-------||-|--- 2 [G] COG0448 ADP-glucose pyrophosphorylase ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 2 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ) |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| 2 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase --|----------||-||--||||||----|-----|||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type -|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||-- 2 [G] COG0469 Pyruvate kinase ||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-|| 2 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase |||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--|||||||| 2 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase |||-|--------||||-|||-----||||||||-||||||||||||--|----------|||--- 2 [P] COG0474 Cation transport ATPase --|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--|||||||| 2 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases |||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 2 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes -|-----------||----|-|||-|-||-||||||||-|--|||||||||||||---|||||--- 2 [L] COG0507 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member |||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0527 Aspartokinases |||||||||-|||||||-||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases -------------||-||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0539 Ribosomal protein S1 |-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 2 [R] COG0546 Predicted phosphatases |||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||------- 2 [L] COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I |||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||-- 2 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase --||--|||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases --------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [J] COG0566 rRNA methylases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein) ----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||-- 2 [R] COG0579 Predicted dehydrogenase |-------|--|-|||-||-||---|----||||||||-|||||||||-||||--|---|||||-- 2 [G] COG0580 Glycerol uptake facilitator and related permeases (Major Intrinsic Protein Family) ---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||-- 2 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit -||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-| 2 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters ||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes |-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-|||| 2 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase ||||--|||||||||--|--|---|----|||||||||-||||||||-||---------------- 2 [R] COG0622 Predicted phosphoesterase ----------------|||||||||||||-|||||||||---|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases |||-----|--|-----|||----------|-----------|||||---||--------|----- 2 [R] COG0641 Arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase) --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 2 [NT] COG0643 Chemotaxis protein histidine kinase and related kinases -----------------|||||----|||||---||||----|||||-||-----|---|||||-- 2 [E] COG0646 Methionine synthase I (cobalamin-dependent), methyltransferase domain ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase) ----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-|||| 2 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat ||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--|||||||| 2 [R] COG0679 Predicted permeases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0681 Signal peptidase I ||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-|| 2 [I] COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase --|------|-|----||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 2 [O] COG0719 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component ||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---||||||||||||| 2 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit |--|----|----||-|||--|--|-|---|||-||||-|--|||||-|-||---|||-||-|--- 2 [F] COG0737 5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases ----------------||||----||----||||-|||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains) -----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [M] COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein) |||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1 -------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-||||||| 2 [F] COG0756 dUTPase -------------|||||||||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase --------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0787 Alanine racemase -----------------|||----|-----||||--||----|||||-||||||||||-|||||-- 2 [G] COG0800 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase |-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-|| 2 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin ----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||-- 2 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme --||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||| 2 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation |-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [R] COG0824 Predicted thioesterase -------------||---------------||--|||-----|||||--|-----|||-------- 2 [E] COG0833 Amino acid transporters ---------|------||--||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [D] COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division ------------------||-|----|||-|---||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [P] COG0861 Membrane protein TerC, possibly involved in tellurium resistance -|||||----|----------|---||---|-----|-|----||-|---|---|-|||----|-- 2 [V] COG1002 Type II restriction enzyme, methylase subunits -------------||------|||||----|----------------------------------- 2 [R] COG1026 Predicted Zn-dependent peptidases, insulinase-like ----||-----------|-|------|---|-----||----|||||-||||-||-||||-|---- 2 [E] COG1027 Aspartate ammonia-lyase -------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 2 [H] COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase ||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||------- 2 [HR] COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes --------|---|||--|||----|||||-||-|||||----|||||--|||---|---||||--- 2 [G] COG1070 Sugar (pentulose and hexulose) kinases |---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----||| 2 [D] COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis |||---||||-|-----|||------|||||-|-||||----|||||--|-----|---|||||-- 2 [G] COG1082 Sugar phosphate isomerases/epimerases |------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||-- 2 [M] COG1087 UDP-glucose 4-epimerase |-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-|||| 2 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase --|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-||||||||||||| 2 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes -----------------|--||---||||-||||||||--|||||||-||||---|---------- 2 [G] COG1105 Fructose-1-phosphate kinase and related fructose-6-phosphate kinase (PfkB) --------------------------|||||||-||||----|||||--|---------|-|---- 2 [E] COG1113 Gamma-aminobutyrate permease and related permeases --------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|------||-||||--- 2 [E] COG1125 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, ATPase components ----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||-- 2 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG1160 Predicted GTPases ----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||-- 2 [KE] COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs |||-|||||||||---||--|------||-||||||------|||||-||||---|---------- 2 [O] COG1180 Pyruvate-formate lyase-activating enzyme --|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes -------------------|----------||--||||-||||||||--||----|---||-|--- 2 [I] COG1182 Acyl carrier protein phosphodiesterase ||||----||---||-----|-||-|-||||-----||-----------|--|||||||||||-|| 2 [I] COG1183 Phosphatidylserine synthase -------------||-|||||||||||||||||-||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG1186 Protein chain release factor B ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases |-||--||--------||||||---|----||||||||------------------|||------- 2 [L] COG1193 Mismatch repair ATPase (MutS family) |||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||-- 2 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon) |||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||-- 2 [M] COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase |--||||-|--|-|---|--||-----||-|-|-|-||-------||-||-----|---|||||-- 2 [Q] COG1228 Imidazolonepropionase and related amidohydrolases ---|||--|-|||-------||-----||||---|-||----|||||-||-----|---||||||| 2 [I] COG1250 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase --||---------||-|||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains -------------|||----||--|||||-||||||||----|||||-||--|||----|||||-- 2 [R] COG1272 Predicted membrane protein, hemolysin III homolog ---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---||||||| 2 [K] COG1278 Cold shock proteins ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 2 [N] COG1291 Flagellar motor component --|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 2 [S] COG1295 Predicted membrane protein -----------------|--||||------||||||||---------------------------- 2 [S] COG1302 Uncharacterized protein conserved in bacteria |||||||||||||----|---||||-||||||||||||----|||-|-----|---------|--- 2 [K] COG1321 Mn-dependent transcriptional regulator |||---||-|-------|--|---------||||||------|||||-||||---|---------- 2 [F] COG1328 Oxygen-sensitive ribonucleoside-triphosphate reductase --||--|||--------|-|----||----|----|||----|||||-||-----|--|||-||-- 2 [NT] COG1352 Methylase of chemotaxis methyl-accepting proteins ||||||||||||||||-|--|---------||||||||---------------------------- 2 [J] COG1358 Ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a) ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 2 [N] COG1360 Flagellar motor protein -------------||--|--|----||||||------------------|---------------- 2 [E] COG1362 Aspartyl aminopeptidase |||-----||---||-||||-|----||||||--||||-----------|---|||---|||||-- 2 [E] COG1364 N-acetylglutamate synthase (N-acetylornithine aminotransferase) |||-||||||---||-||--||-----||-||--||||----|||||-|-----------|----- 2 [ER] COG1387 Histidinol phosphatase and related hydrolases of the PHP family ----------------|----|||-||||-||--||||-------|--||||-------------- 2 [M] COG1388 FOG: LysM repeat |-|-------|-----|--|-|||--||||||---|||----|------------||||-|-|--- 2 [R] COG1408 Predicted phosphohydrolases ----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---||||||| 2 [S] COG1434 Uncharacterized conserved protein -------------------------|----||||||||----|||||-|----------------- 2 [G] COG1447 Phosphotransferase system cellobiose-specific component IIA |-|--------------|||----------|----------------------------------- 2 [R] COG1453 Predicted oxidoreductases of the aldo/keto reductase family -------------------------|----||||||||----|||||-|----------------- 2 [G] COG1455 Phosphotransferase system cellobiose-specific component IIC -----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---||||||| 2 [G] COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases ||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--|||||||||||||| 2 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators --|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||-- 2 [H] COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis --|-------------|----------||-|||||||||---||||||-------|---||-|--- 2 [L] COG1484 DNA replication protein -----------------|------------|----|||----|||||-|----------||-|--- 2 [G] COG1486 Alpha-galactosidases/6-phospho-beta-glucosidases, family 4 of glycosyl hydrolases --|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||--- 2 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase --|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--||||||||||||| 2 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase ----||------------||||--|-----||-|-|||-|--|||-|-||---|||--------|| 2 [V] COG1619 Uncharacterized proteins, homologs of microcin C7 resistance protein MccF |-|---||---|----||------------|-----||---------------------||||--- 2 [S] COG1633 Uncharacterized conserved protein --|---||--|-|-----||-|----||||||||||||----|||||--|--|--|---||||||| 2 [V] COG1680 Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins -----------------||-||--|-----||||||||||||------------------------ 2 [H] COG1713 Predicted HD superfamily hydrolase involved in NAD metabolism ----|------|-----|||------|||-|-||||||---------------------------- 2 [K] COG1725 Predicted transcriptional regulators ---|----|----------|||-----||-|||||||-----|||-|--|-----|||-||||--- 2 [M] COG1732 Periplasmic glycine betaine/choline-binding (lipo)protein of an ABC-type transport system (osmoprotectant binding protein) ---|--||----|-------|----|----|---|-||-------||-|-||-||-|||------- 2 [C] COG1757 Na+/H+ antiporter --------------------||----||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 2 [E] COG1760 L-serine deaminase --------------------|-|||||---||||||||-||||||||-||||-|||---|||||-- 2 [GT] COG1762 Phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain (Ntr-type) --||--|||--------|------|-----|----|||----------|-------|||------- 2 [NT] COG1776 Chemotaxis protein CheC, inhibitor of MCP methylation ------|||-------|-|||---------|-----|-----|||||--|--||||---|||||-- 2 [M] COG1807 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family ||||||||||--------------------|-----||---------------------------- 2 [S] COG1873 Uncharacterized conserved protein --|--------------|--|---|-|--|||----||----|||||-||||---|---|||||-- 2 [G] COG1879 ABC-type sugar transport system, periplasmic component -|||||--|-|-------------------|-----|------------------|---------- 2 [P] COG1910 Periplasmic molybdate-binding protein/domain --------------------|||||||---||||||||||||||||||||||||||---|||||-- 2 [G] COG1925 Phosphotransferase system, HPr-related proteins ------------------||-|----||||||--||||----|||-|--|-----|--|||----- 2 [S] COG1937 Uncharacterized protein conserved in bacteria |--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||-- 2 [V] COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein -----------------|||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|---|||||-- 2 [KT] COG1974 SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidases) ------------------|||------||||--|||||----|||||-||||---|----|----- 2 [E] COG1982 Arginine/lysine/ornithine decarboxylases |||---||||--|-----------------|---||||----|||||--|-|-------------- 2 [R] COG1988 Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolases ||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||-- 2 [R] COG1994 Zn-dependent proteases ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 2 [C] COG2025 Electron transfer flavoprotein, alpha subunit --------|----|--||-|||----|||-||||||||-----------|--||||||||||-|-- 2 [R] COG2070 Dioxygenases related to 2-nitropropane dioxygenase ------------------||----------||||||||----|||||-||||---|---|||-|-- 2 [R] COG2081 Predicted flavoproteins ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 2 [C] COG2086 Electron transfer flavoprotein, beta subunit -------------||---||----------|---|-||----|||-|---|||--|---------- 2 [H] COG2091 Phosphopantetheinyl transferase -----------------|------------|-----||----|||||-------------|----- 2 [G] COG2160 L-arabinose isomerase -------------------|||----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 2 [D] COG2177 Cell division protein ---------------------|----|||||----|||----|||||-||||-|||---|||||-- 2 [K] COG2186 Transcriptional regulators |-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||-- 2 [P] COG2217 Cation transport ATPase -------|------|--|--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---|||---- 2 [F] COG2233 Xanthine/uracil permeases |-||--||||---||-|--|-------||-|-----||----|||-|-||--|----------|-- 2 [R] COG2234 Predicted aminopeptidases -|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|-- 2 [R] COG2252 Permeases -------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 2 [L] COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase ------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase -------------||-|---------|||||----|||---------------------|||||-- 2 [R] COG2270 Permeases of the major facilitator superfamily ------------------|--|--------|-----|------|||-------------------- 2 [T] COG2310 Uncharacterized proteins involved in stress response, homologs of TerZ and putative cAMP-binding protein CABP1 ---|---------------|-|--------||||||||----|||||-||||||||---------- 2 [R] COG2333 Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily) -------------------|-|-----||-|---||||----|||-------|||----|||---| 2 [T] COG2337 Growth inhibitor --------------------||----|||-||||||||---------------------------- 2 [S] COG2357 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|---|--------|-----||---------------------------- 2 [S] COG2359 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||||--------|-----||---------------------------- 2 [D] COG2385 Sporulation protein and related proteins ----||----|||--------|----|||||---|||----------------------------- 2 [R] COG2409 Predicted drug exporters of the RND superfamily --|---||||||-----||-|---------||-----|----------|--------------|-- 2 [R] COG2509 Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases --|-----------------|-----|---|-|-|-||----|||||-||||-|||---------- 2 [GE] COG2610 H+/gluconate symporter and related permeases -------------------|-|--|-----|-----------|||||--|-|---|--||||-|-- 2 [S] COG2717 Predicted membrane protein --------------------------|||-|-----------|||-|-----|---------|--- 2 [S] COG2733 Predicted membrane protein -------------------|------|||-||--||-|----|||-|--|-----|----|-||-- 2 [S] COG2764 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits --|----------||------|----|||-|-----------|||||-||||-------|||||-- 2 [L] COG2816 NTP pyrophosphohydrolases containing a Zn-finger, probably nucleic-acid-binding --||---------||--|---|----|||-||---|-|-----------|-|---|--|||||--- 2 [E] COG2873 O-acetylhomoserine sulfhydrylase --------------------|---------||||-||-----|||||----|||||---|||||-- 2 [G] COG2893 Phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA --------------------|---------|-||||||----------||--|--|---------- 2 [T] COG2972 Predicted signal transduction protein with a C-terminal ATPase domain --|---------------------------|----||-----|||||--|-----|------|--- 2 [M] COG3209 Rhs family protein -------------||--|------------|------|---------------------------- 2 [R] COG3341 Predicted double-stranded RNA/RNA-DNA hybrid binding protein --|-|------|-------|-|--||-||-|-----||----|||-|--|-----|----|-|--- 2 [S] COG3391 Uncharacterized conserved protein -----------------|---|--------|----||----------------------------- 2 [C] COG3426 Butyrate kinase --------------------|---------||||-||-----|||||----|-------------- 2 [G] COG3444 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB -|-----------------|----------|-----|------------|-----|------|--- 2 [R] COG3541 Predicted nucleotidyltransferase ----------|--------|----------|-----||-----||-|--|---------------- 2 [P] COG3546 Mn-containing catalase ----------------||--|---------||---|------------------------------ 2 [S] COG3580 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||--|---------||---|------------------------------ 2 [S] COG3581 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---------------------------|---|||------------|--|---------|--- 2 [G] COG3594 Fucose 4-O-acetylase and related acetyltransferases -------------------|------|---|-||-|||-----------|-------------|-- 2 [K] COG3655 Predicted transcriptional regulator --|----------------||---------|-|||--|-----------|---------||--|-- 2 [L] COG3666 Transposase and inactivated derivatives --||--||---|------|-----------|-----------|||||--------|---------- 2 [L] COG3677 Transposase and inactivated derivatives -----------------|-|----------|------|---------------------|---|-- 2 [G] COG3693 Beta-1,4-xylanase --------------------|---------|---||||-----------|-|-------||-|--- 2 [S] COG3708 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------||||-||-----|||||----|-------------- 2 [G] COG3715 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC --------------------|---------||||-||-----|||||----|-------------- 2 [G] COG3716 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IID ----------------|-------------|----|||----|||-|--|-----|---------- 2 [KT] COG3829 Transcriptional regulator containing PAS, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains --|------------------|--------|||-||||---------------------------- 2 [P] COG3853 Uncharacterized protein involved in tellurite resistance ------------------------------|-----||--------------|------------- 2 [R] COG3858 Predicted glycosyl hydrolase -------------------|-|--------|-----|----------------------------- 2 [S] COG3861 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------|---------|--|---------|----------------------------------- 2 [S] COG3862 Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs |-|---------------------------|-----||---------------------------- 2 [S] COG3874 Uncharacterized conserved protein ---------------------------||-|-----||---------------------------- 2 [S] COG3879 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|------|--------------------|-|----- 2 [Q] COG3882 Predicted enzyme involved in methoxymalonyl-ACP biosynthesis --------------------------|---|--||-||---------------------------- 2 [M] COG3944 Capsular polysaccharide biosynthesis protein ----------|||-----------------|-----------------|----------------- 2 [S] COG3945 Uncharacterized conserved protein ---------------------|--------|------|---------------------------- 2 [T] COG3947 Response regulator containing CheY-like receiver and SARP domains ---------------------------||-||--|-|----------------------------- 2 [R] COG3953 SLT domain proteins ------------------------------|--|----------------|--------------- 2 [M] COG3955 Exopolysaccharide biosynthesis protein ---------------------|----|---|-----|----------------------------- 2 [R] COG3973 Superfamily I DNA and RNA helicases ------------------------|-----|-------------------------------|--- 2 [S] COG3976 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|||-|-||||||---------------------|-|---- 2 [S] COG4129 Predicted membrane protein ------------------------------|--||-||---------------------------- 2 [GM] COG4464 Capsular polysaccharide biosynthesis protein -------------|||-|------------|----------------------------------- 2 [R] COG4624 Iron only hydrogenase large subunit, C-terminal domain ------------------------------||----|----------------------------- 2 [G] COG4632 Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase ------------------------------|---|-|----------------------------- 2 [S] COG4640 Predicted membrane protein ------------------------------|-----||----------------------|----- 2 [S] COG4641 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|--------|--------------|-------------|--|--- 2 [L] COG4644 Transposase and inactivated derivatives, TnpA family ------------------------------||||-------------------------------- 2 [S] COG4684 Predicted membrane protein ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 2 [N] COG4786 Flagellar basal body rod protein --------------------|---------|----|----------|------------------- 2 [H] COG4822 Cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase --|---------------|--|--------|----------------------------------- 2 [V] COG4845 Chloramphenicol O-acetyltransferase -------------||---|-----------|-|--------------------------------- 2 [D] COG5279 Uncharacterized protein involved in cytokinesis, contains TGc (transglutaminase/protease-like) domain -------------|---|------------|------------------------|---|---|-- 2 [M] COG5434 Endopolygalacturonase ------------------------------|-----|---------|----------------|-- 2 [M] COG5520 O-Glycosyl hydrolase ------------------------------||||-|------------------------------ 2 [S] COG5523 Predicted integral membrane protein ------------------------------|----------------------------|--|--- 2 [S] COG5620 Uncharacterized conserved protein ||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||-- 1 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase |||-||--||-|-||-||||-|----|||-||--|||||---|||||--|--||||---|||||-- 1 [P] COG0004 Ammonia permease |||||||||||||||-||||-------||||-||-|||----|--||--|--|------||-|--- 1 [F] COG0005 Purine nucleoside phosphorylase ||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||-- 1 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5) |||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||--- 1 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase |||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase ---|--||---|----|-|||------||||----|||----|||||-||--||||---||-||-- 1 [H] COG0029 Aspartate oxidase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation) ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase |--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase -|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control -|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||-- 1 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||-- 1 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||-- 1 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0048 Ribosomal protein S12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0049 Ribosomal protein S7 ---------|---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0051 Ribosomal protein S10 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2 ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase |||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [G] COG0061 Predicted sugar kinase |||||||||||||||-||||-|----|||||-----------|||||-||--|--|||||||||-- 1 [S] COG0062 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||-- 1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase ||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit |||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0067 Glutamate synthase domain 1 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0069 Glutamate synthase domain 2 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0070 Glutamate synthase domain 3 |||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---||||||| 1 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit ||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0077 Prephenate dehydratase |||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1 ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0082 Chorismate synthase -|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||------- 1 [E] COG0083 Homoserine kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11 |||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9 ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase |||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase -|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||---------- 1 [L] COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase -------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase ||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||-- 1 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase |-||--|||---||||--|--|-----||-|-----||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 1 [L] COG0122 3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--|||||||| 1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase -|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 1 [H] COG0132 Dethiobiotin synthetase ||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase ||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase ||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase -|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0148 Enolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase ------|---|--||--|--|---|-|||-||-|--||----|||||-|-||-------------- 1 [G] COG0153 Galactokinase --------|-||-||-|-||-|----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 1 [P] COG0155 Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein) ||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||-- 1 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase ||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain -|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0164 Ribonuclease HII ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase -|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase -|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [G] COG0176 Transaldolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-||||||||||||||| 1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17 --||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||| 1 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase -------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0195 Transcription elongation factor -------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0196 FAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0203 Ribosomal protein L17 -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|--- 1 [G] COG0205 6-phosphofructokinase ||||||||||------||||||--||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0206 Cell division GTPase |||-----||---|||----||----||||||||||||-|||||||||||||||||---|||||-- 1 [F] COG0207 Thymidylate synthase ---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-||| 1 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0211 Ribosomal protein L27 |--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase -||---|||--------|---|-----||-||-||||||||||||-|-|------|---||-|--- 1 [F] COG0213 Thymidine phosphorylase |||||||||||||||--|--||----|||||--|||||------------||-------------- 1 [H] COG0214 Pyridoxine biosynthesis enzyme --|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0216 Protein chain release factor A -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein -|||--||||---|--||--|---------|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0218 Predicted GTPase ------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class) -------------||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase |-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit |-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 1 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 1 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component -------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0227 Ribosomal protein L28 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0228 Ribosomal protein S16 |-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||-- 1 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0230 Ribosomal protein L34 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0233 Ribosome recycling factor --|----------||-||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10) ||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--|||||| 1 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0238 Ribosomal protein S18 |-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase -|--||-------|||--|-|------||-|-----------|||||||||||||||||---||-- 1 [E] COG0241 Histidinol phosphatase and related phosphatases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10 ----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase --|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-|||||||||||||||||| 1 [FP] COG0248 Exopolyphosphatase |||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0250 Transcription antiterminator |||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|---- 1 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D ||------||------|||||-||--|||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0254 Ribosomal protein L31 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0257 Ribosomal protein L36 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0261 Ribosomal protein L21 --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0267 Ribosomal protein L33 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0268 Ribosomal protein S20 |||---|||||||-----------------|-|||-|--||-|||-|-|-||-------------- 1 [G] COG0269 3-hexulose-6-phosphate synthase and related proteins |--|||----|-|---||||-|--|-|||||||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 1 [F] COG0274 Deoxyribose-phosphate aldolase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis --||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases -|--||----------|-|-|------||-|-----------||||||||||-||-|||---|--- 1 [G] COG0279 Phosphoheptose isomerase --|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-|| 1 [C] COG0282 Acetate kinase ---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---||||||| 1 [F] COG0283 Cytidylate kinase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase ---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase ||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase |--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG0288 Carbonic anhydrase |||-----||------||||--||--|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3) -------------|--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0291 Ribosomal protein L35 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0292 Ribosomal protein L20 |||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes -|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|--- 1 [G] COG0297 Glycogen synthase |||---||||--------||----------|-----------|||-|---|-----|||------- 1 [O] COG0298 Hydrogenase maturation factor --||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN |||||||||||||----|------|-----|||||||||||||||||-||||-------------- 1 [H] COG0301 Thiamine biosynthesis ATP pyrophosphatase ----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--||||||||||| 1 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I ||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|--- 1 [P] COG0306 Phosphate/sulphate permeases ---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain |||||||||||||---|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 1 [O] COG0309 Hydrogenase maturation factor |||||||||||||||--|---|----|||||--|||||------------||-------------- 1 [H] COG0311 Predicted glutamine amidotransferase involved in pyridoxine biosynthesis ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0313 Predicted methyltransferases |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0315 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme ----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-| 1 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase --||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase) -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase --|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold -------------|||--|||---|||||||----|||----|||||||||||--||||-|-|-|| 1 [O] COG0326 Molecular chaperone, HSP90 family ||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||------- 1 [S] COG0327 Uncharacterized conserved protein -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0333 Ribosomal protein L32 --|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|-- 1 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0335 Ribosomal protein L19 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase ----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase -|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------| 1 [L] COG0338 Site-specific DNA methylase ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD |||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase ----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||-- 1 [S] COG0344 Predicted membrane protein |-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase -||-||--||-|------||----------|-----------|||-|-||||-|||||||||||-- 1 [C] COG0348 Polyferredoxin -------------|----||------|||||-----------|||||-|||||------||||||| 1 [J] COG0349 Ribonuclease D ||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-| 1 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase |||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase ----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit) --|----------|--|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0359 Ribosomal protein L9 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0360 Ribosomal protein S6 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1) -------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase |||||||||||||-----||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||--- 1 [H] COG0368 Cobalamin-5-phosphate synthase |||||||||||||-|--|||----------||||-|||----|||||-------------|----- 1 [C] COG0371 Glycerol dehydrogenase and related enzymes ||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||------- 1 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase --|-----||------|--|----------|-----------|||-|---------|||------- 1 [C] COG0374 Ni,Fe-hydrogenase I large subunit ||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||-- 1 [H] COG0379 Quinolinate synthase --||---------||---||||----|||-|----|||----|||-|-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG0384 Predicted epimerase, PhzC/PhzF homolog --||-------|-||---|||-----|||-|||||||||||||||||-||-|-|||---|||||-- 1 [L] COG0389 Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair ||||----||---|--||||-|----||||||||||||----|||||-|--|-------------- 1 [S] COG0391 Uncharacterized conserved protein ||||--||||------||||------|||||---|||-|||||||-|--|--|--|---||||--- 1 [S] COG0392 Predicted integral membrane protein |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 1 [O] COG0396 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, ATPase component |||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||-- 1 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases |||---||||------|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 1 [O] COG0409 Hydrogenase maturation factor ---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase -------------||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0414 Panthothenate synthetase ----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||-- 1 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme ||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||---------------- 1 [L] COG0419 ATPase involved in DNA repair ||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|----- 1 [L] COG0420 DNA repair exonuclease -|--|||||||||||-||---|----|---|--|--||----||||||-|--||||||----|--- 1 [E] COG0421 Spermidine synthase ||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||-- 1 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC ||||||||||||||||-----|--|||||||---|---||||------------------------ 1 [J] COG0423 Glycyl-tRNA synthetase (class II) --|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation |||---|||||||-|-||||-|-----||-|-----||----|||-|-||---------||----- 1 [S] COG0432 Uncharacterized conserved protein |||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0439 Biotin carboxylase |||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||-- 1 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division ||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains |||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase ||-|--||||------||-|----||-||||-----||----------||-----||||------- 1 [D] COG0455 ATPases involved in chromosome partitioning ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family) |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase |||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase ||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||---- 1 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters |||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-|||||||||||||| 1 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components |-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA -------------||-||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0486 Predicted GTPase --------|-------|----|-----||||||---|----------------------------- 1 [P] COG0490 Putative regulatory, ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase ----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0498 Threonine synthase |||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||-- 1 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase) ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II --|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||-- 1 [L] COG0514 Superfamily II DNA helicase |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0528 Uridylate kinase -------||---|||-|-|--|-----||-|-----||----||||||||--|--|--|-||||-- 1 [P] COG0529 Adenylylsulfate kinase and related kinases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0536 Predicted GTPase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor) ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-| 1 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase ---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||-- 1 [C] COG0554 Glycerol kinase ||||||||||||------||-|-----||-|------|----|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG0555 ABC-type sulfate transport system, permease component |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex ---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [K] COG0557 Exoribonuclease R |--------------------|----|||||---------|||---|-----------||------ 1 [M] COG0562 UDP-galactopyranose mutase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease ---|---------||--|||-|-|||----|||||||||-|||||||-|-||-------------- 1 [F] COG0572 Uridine kinase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||-- 1 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 1 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component ----||-----|------||-|--||||||||--||||----|||||||||||||||||--|||-- 1 [S] COG0586 Uncharacterized membrane-associated protein --|----------||-----|-||||||||||||||------||||||--||||||----||||-- 1 [G] COG0588 Phosphoglycerate mutase 1 --|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---||||||| 1 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog) ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation -----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0594 RNase P protein component ||||--||-|-------|||||----||||||||||||||||--------------|||||||||| 1 [R] COG0595 Predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase |||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase |-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [P] COG0605 Superoxide dismutase |--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-| 1 [O] COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity ||||----|--||---||||-|--------|------|----|||||-||||-|||---------- 1 [R] COG0613 Predicted metal-dependent phosphoesterases (PHP family) -|||--|||||-|---||||||--|||||-||||||||||||------|----------------- 1 [R] COG0618 Exopolyphosphatase-related proteins -|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit ----------------||--||----||||||-|||||||||||||||||||||||---|||||-- 1 [F] COG0634 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase ||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K -|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||-- 1 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases |||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||-- 1 [C] COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins) ||||||||--||||||||----||---||||---|||||||||||||||----------------- 1 [L] COG0648 Endonuclease IV |-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family ---|||||--||||||-||-------||||||||||||----|||||--|-----|---|||||-- 1 [R] COG0656 Aldo/keto reductases, related to diketogulonate reductase --|--|--|--|-||--|||-|--|-|||||||-||-|----|||||-||--|--|---||-||-- 1 [I] COG0657 Esterase/lipase ----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-| 1 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein |-||||-----|-||---||-------||||------|----|||||-||-|||||---||||||| 1 [R] COG0661 Predicted unusual protein kinase |||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--|||||||| 1 [R] COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily --|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating) |||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--|||||||||||||| 1 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel ----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase -------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-||||||||||||| 1 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH ||----||--|------|------------|---|-------|||||-||-||--|---||-|--- 1 [M] COG0677 UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase |||---||||-|----|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 1 [C] COG0680 Ni,Fe-hydrogenase maturation factor ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase --|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase ---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 1 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0691 tmRNA-binding protein |-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---||||||| 1 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins --||-----------|--||----------|---|||||||||||||-||------||||------ 1 [G] COG0696 Phosphoglyceromutase ------------------|-----------|-----||----|||-|-||-----|---------- 1 [S] COG0700 Uncharacterized membrane protein |||-----||------||||-------||-|-||-|||----|||-------------|------- 1 [R] COG0701 Predicted permeases --|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0703 Shikimate kinase |||||||||||||---||||-|---|||||||||||-||-|||||||-||--|--|---|||||-- 1 [P] COG0704 Phosphate uptake regulator -||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||-- 1 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC |-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0708 Exonuclease III --|-------------|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b -------------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein) |||||||||||||---||||-|---||||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 1 [R] COG0714 MoxR-like ATPases |||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-||||||||||||||||| 1 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase -----------------|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--|||||||||||||| 1 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [P] COG0725 ABC-type molybdate transport system, periplasmic component ----------------|||||||||||||||-----------|||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor |||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [R] COG0730 Predicted permeases |||||||||||||||--||||---------|-------------------------|||------- 1 [C] COG0731 Fe-S oxidoreductases -------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||| 1 [I] COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase) ----------------||||||--||||||||--||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases -----------------|||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase ----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|-- 1 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains -----------------|||||----|||||-----||-------|-||||||--|||||||||-- 1 [E] COG0757 3-dehydroquinate dehydratase II ----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-| 1 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake ----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||- 1 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein -----------------||||-||||||||||||||||----|||||-||||---||||||-||-- 1 [S] COG0762 Predicted integral membrane protein ----------------||||||||------||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases |||------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase --|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||-- 1 [F] COG0775 Nucleoside phosphorylase ----||----------||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit ----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0781 Transcription termination factor ----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||-- 1 [L] COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase ----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0793 Periplasmic protease |||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation ----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [M] COG0796 Glutamate racemase ----------------|-||----||----|-----------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0797 Lipoproteins |-|---|-|----|---|||------|||-|----||--------------|--|----|------ 1 [P] COG0798 Arsenite efflux pump ACR3 and related permeases -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase ----------------||||||--||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing ----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II ----------------||||||---|----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase ----------------||||||||--|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis) -----------------|||-|--------||||||||----|||||-|||||||||||||||--- 1 [M] COG0818 Diacylglycerol kinase ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit -|-------------------------|||||||||||------------|-----||-|--|--- 1 [L] COG0827 Adenine-specific DNA methylase ----------------|-||--||||----|||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0828 Ribosomal protein S21 --|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump ------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|-- 1 [K] COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family ----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases ----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||--- 1 [D] COG0850 Septum formation inhibitor ----------------||||-|----|||||---||||----|||||--|--||||||||--||-- 1 [H] COG0853 Aspartate 1-decarboxylase --|---------------||-|-----||||------|----|||||-||--||||||||||||-- 1 [P] COG0855 Polyphosphate kinase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A ----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase ||||--|||||||-----------------|----|||----|||-|---------||---|-|-- 1 [K] COG0864 Predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain and a metal-binding domain |||-----||-----------|---|----|----|||----|||--------------||||--- 1 [F] COG1001 Adenine deaminase ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG1010 Precorrin-3B methylase -----------------|---|--------||||||||-|--|||||||-------||-||-|--- 1 [G] COG1015 Phosphopentomutase ----------------||||-|-----||-|-----------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1034 NADH dehydrogenase/NADH:ubiquinone oxidoreductase 75 kD subunit (chain G) -------------||-----------|||-||--||||---------------------||||--- 1 [C] COG1038 Pyruvate carboxylase ----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases --||----------|--|||------||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [E] COG1045 Serine acetyltransferase --||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---||||||| 1 [C] COG1048 Aconitase A |||---|||||||---|-||-|----||||||-|-|||-------|--||-----|---|||||-| 1 [F] COG1051 ADP-ribose pyrophosphatase ||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit ---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||-- 1 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA --|||||||-||||||---|||--|-|||||-||||------|||||-|----------------- 1 [KL] COG1061 DNA or RNA helicases of superfamily II --|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||-- 1 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases ----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease --------------------|-||||-||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains) --------|----||---||-|----|---|---|-||-|--------||--|--|---------- 1 [R] COG1075 Predicted acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG1079 Uncharacterized ABC-type transport system, permease component --------------------||||-||---||||||||-|||||||||||||||||------||-- 1 [G] COG1080 Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria) --|---|-|-|--||--|--------||--||----------|||||-|-||-------------- 1 [C] COG1085 Galactose-1-phosphate uridylyltransferase -|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-|||||| 1 [MG] COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases |-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||-- 1 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase |-|-----|-------|-||-------||-|-----------|||-|-||--|---||-|-|||-- 1 [M] COG1089 GDP-D-mannose dehydratase -----------------|---|--------||||||||---------------------------- 1 [J] COG1098 Predicted RNA binding protein (contains ribosomal protein S1 domain) |-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 1 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components |||||-||||-|-||||||-|------||||---|---|||||||-|--|--|---|--------| 1 [L] COG1112 Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits --------------------|-|||-|---|-|||-|-----|||||-||||-------------- 1 [E] COG1114 Branched-chain amino acid permeases ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 1 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component |-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 1 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 1 [GM] COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component ------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component |--|---||-|-|----|||-------||-||||||||---------------------------- 1 [C] COG1141 Ferredoxin ||||||-|||||-----|||-|----|||||-----------|||-|-||--|--||||||||||| 1 [C] COG1146 Ferredoxin ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1157 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase ----------------||--|||||||||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG1158 Transcription termination factor ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1159 GTPase -||---||-|||||||-||||----|----||||||||||||------|----||----------- 1 [R] COG1161 Predicted GTPases --|-------------|||||----||||||||||||||||||||||-||||||||------|--- 1 [R] COG1162 Predicted GTPases --------------------||----||||||-|-|||----|||||---|----|---------- 1 [E] COG1168 Bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 1 [E] COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II -------------||-----|---------|---|-||----|||||-|||||||||||------- 1 [H] COG1179 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 1 -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase) -----------------|--|-----|---||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 1 [J] COG1188 Ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit (S4 paralog) --|-----|-------|||||----|||||||||-|||||----------------|||||||||| 1 [J] COG1189 Predicted rRNA methylase --|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||----- 1 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II) |--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase ----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------||||||| 1 [L] COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway) -||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||-- 1 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases -----------------|||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase ||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|-- 1 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases ----------------||||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [LK] COG1200 RecG-like helicase ----------------||||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains) |-|||||||--||----|||-|----|||||||---||----|||||--|--||||---||-||-- 1 [M] COG1209 dTDP-glucose pyrophosphorylase ------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone ------------------||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [T] COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit -----------------|||----------|----||-----|||||-||-----|---------- 1 [KT] COG1221 Transcriptional regulators containing an AAA-type ATPase domain and a DNA-binding domain --||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [O] COG1225 Peroxiredoxin ||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-|||||||||||||| 1 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component -|------|----|||-|--||--------|||||||-----------|----------------- 1 [C] COG1227 Inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase --|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||-- 1 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component ||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---||||||| 1 [R] COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I |||---||||-------|------------|---------------|------------------- 1 [R] COG1237 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily II -|-------|------||--|---------|||-||||----|||||-|----------------- 1 [R] COG1242 Predicted Fe-S oxidoreductase ||||||||||||-|||-|--|---------|----------------------------------- 1 [KB] COG1243 Histone acetyltransferase ||||||||||--------------------|----------------------------------- 1 [R] COG1244 Predicted Fe-S oxidoreductase --|-------|-|-----||-|----|---||-|||||----|||-|-||-----|---|||||-- 1 [M] COG1247 Sortase and related acyltransferases --|-------------|----------||-|---|-||----|||||--|-----|---||-||-- 1 [C] COG1251 NAD(P)H-nitrite reductase -||-|||||-|||----|-|-|---|--|-||||||||----|||||-||-|---|----|-|--- 1 [C] COG1254 Acylphosphatases ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1256 Flagellar hook-associated protein |||||||||||||-----||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---||||--- 1 [H] COG1270 Cobalamin biosynthesis protein CobD/CbiB --------------------|-----|||-|---|-||----|||||-||-|---|||-|-|---| 1 [R] COG1279 Lysine efflux permease ----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family ----------------|-||||--|--||-||-|-|||----|||||--|||---|---|||---- 1 [S] COG1285 Uncharacterized membrane protein ||||||||||||||||-|||||---|----||||||||------------------|||------- 1 [K] COG1293 Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1298 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhA --------------------||---||---||||||||-||||||||-|||----|---------- 1 [G] COG1299 Phosphotransferase system, fructose-specific IIC component |||---||||--|-----||-------||-|---|-||-----------|------------||-- 1 [S] COG1300 Uncharacterized membrane protein --||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-|||| 1 [C] COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters |-|---||||||----||||-|-----||||----|||-----------||||--|---||-||-- 1 [E] COG1305 Transglutaminase-like enzymes, putative cysteine proteases ----||-----------|------------||----||----|||||---|--------||||--- 1 [G] COG1312 D-mannonate dehydratase |||---|||||-|---||------------|----------------------------------- 1 [R] COG1313 Uncharacterized Fe-S protein PflX, homolog of pyruvate formate lyase activating proteins ----------------|-|||||||||||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG -----------------|------||----|------|----------|----------------- 1 [L] COG1315 Predicted polymerase, most proteins contain PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain -----------------|----||||----|-----||----||||||||-----||||---|--- 1 [NU] COG1317 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein ||-------|-------|--|---------||||||||-|-------------------------- 1 [R] COG1323 Predicted nucleotidyltransferase -----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [K] COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains |-||||--|-|||---|--|-|||---||-|-----|------------------------||--- 1 [O] COG1331 Highly conserved protein containing a thioredoxin domain ----------------||------------|-----||----------||------|||------- 1 [N] COG1334 Uncharacterized flagellar protein FlaG ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1338 Flagellar biosynthesis pathway, component FliP |||---|||---------------------|-----------------|----------------- 1 [R] COG1342 Predicted DNA-binding proteins ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----||||------- 1 [N] COG1345 Flagellar capping protein --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 1 [M] COG1346 Putative effector of murein hydrolase |||------|--------|||---------|-----------------------------|-|--- 1 [P] COG1348 Nitrogenase subunit NifH (ATPase) ---|||||--|||---||||--|||||||||-------------------------|||-----|| 1 [F] COG1351 Predicted alternative thymidylate synthase -||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [S] COG1354 Uncharacterized conserved protein --||--------------|-||----|||-||-|-||-----|||||-||-|-|||---||-||-- 1 [S] COG1359 Uncharacterized conserved protein -----------------||||||||--||-|---||||----------||---------||--|-- 1 [T] COG1366 Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor) ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1377 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhB --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 1 [R] COG1380 Putative effector of murein hydrolase LrgA ------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---||||||| 1 [L] COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) ----------------||||||--||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-|||||--------|||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [K] COG1386 Predicted transcriptional regulator containing the HTH domain |||---|||--|-----|---|||------|---|||-----------||||---|---||-|--- 1 [P] COG1392 Phosphate transport regulator (distant homolog of PhoU) -------------------|||----|--||||||||||-|||||||-||||||||--||||||-- 1 [P] COG1393 Arsenate reductase and related proteins, glutaredoxin family -||-----|-------|--|-|--------|--|--------|||-|---------------|--- 1 [O] COG1397 ADP-ribosylglycohydrolase ----------------||||-|----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [R] COG1399 Predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein ---|--------------||-|-----||||||-|||-----|||---|---|--|---|||||-- 1 [V] COG1403 Restriction endonuclease -----------------|------||----|------|----------|----------------- 1 [N] COG1406 Predicted inhibitor of MCP methylation, homolog of CheC -----------------|||-|----|||||------|----|||||-|||-|--|---|||||-- 1 [E] COG1410 Methionine synthase I, cobalamin-binding domain ----------------||------||----|----|||----------||-----||||------- 1 [N] COG1419 Flagellar GTP-binding protein -----------------||||-||--||||||||||||||||----------|--|||||||||-- 1 [K] COG1420 Transcriptional regulator of heat shock gene |||-|||||||------|------------|-----------------|----------------- 1 [S] COG1433 Uncharacterized conserved protein ---||-----|----|-|---|---|----|||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 1 [F] COG1435 Thymidine kinase ||||--|||||||------------|----|--------------|---------|---------- 1 [F] COG1437 Adenylate cyclase, class 2 (thermophilic) -----------------|---|-|--||||||||||||----|||||-|-||-------------- 1 [K] COG1438 Arginine repressor -------------------------|----||||-|||----|||||-|----------------- 1 [G] COG1440 Phosphotransferase system cellobiose-specific component IIB --------------------||---||---||||||||-||||||||-||||---|---------- 1 [G] COG1445 Phosphotransferase system fructose-specific component IIB ||||--|||-------|---||----|---|-------||--|||||-||--||||||||||||-| 1 [R] COG1451 Predicted metal-dependent hydrolase ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||-- 1 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF -----------------|--||----|||-||||||||||||------------------------ 1 [R] COG1461 Predicted kinase related to dihydroxyacetone kinase --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit -|||--|----------|-||-----|---|----|--||---|||--|--|--|-|||------- 1 [S] COG1479 Uncharacterized conserved protein -----------------||||--||-----|----|||---------------------------- 1 [R] COG1480 Predicted membrane-associated HD superfamily hydrolase -----------------|--|-----||||||||||||||||------------------------ 1 [S] COG1481 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------|----||--|---|---|||||||||||||-|--|||||-|--|-------------- 1 [G] COG1482 Phosphomannose isomerase |---||--|-|||---||||----------|------|----|||||-||||-------|||-|-- 1 [R] COG1489 DNA-binding protein, stimulates sugar fermentation -------------||-||--||----|||-||||||||----|||||-||||-|||---------- 1 [J] COG1490 D-Tyr-tRNAtyr deacylase ||||||--||-|------||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---|||||-- 1 [H] COG1492 Cobyric acid synthase ---------|----------|---|-----||||||||||||----------||||---|||||-- 1 [T] COG1493 Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism --|---------------||||----|||||-----||----|||-|-|-||---------|||-- 1 [G] COG1494 Fructose-1,6-bisphosphatase/sedoheptulose 1,7-bisphosphatase and related proteins ----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein ----------------|-----||||----|----|||----|||||-||--||||||||||||-- 1 [K] COG1508 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma54 homolog |||-|||||||||---||-|-|----|---|---|-||----|||||--|-----|---|||||-- 1 [J] COG1514 2'-5' RNA ligase ---||||||||||-|-||-|-|--------|-----|-----|||||-----|------------- 1 [L] COG1515 Deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V) ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----||||------- 1 [NUO] COG1516 Flagellin-specific chaperone FliS ----------------||||||--||-||||----|||-|---------|--|||||||----|-- 1 [K] COG1521 Putative transcriptional regulator, homolog of Bvg accessory factor --|--------|-----||-||||--|||-|-||--||-|--|||||-||||---|---||-|--- 1 [G] COG1523 Type II secretory pathway, pullulanase PulA and related glycosidases ----|||||--|-|||-|-|------|---|----|-|-----------|--|-----|-|-||-- 1 [R] COG1524 Uncharacterized proteins of the AP superfamily |-|-----|------|-|--------|||-|---|--||---|||||-|-||----|||------- 1 [P] COG1528 Ferritin-like protein ---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG1530 Ribonucleases G and E ||||--||||-||-------|---------||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [J] COG1534 Predicted RNA-binding protein containing KH domain, possibly ribosomal protein ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1536 Flagellar motor switch protein -------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase ------||----------||----|--||||------|---------------------------- 1 [S] COG1543 Uncharacterized conserved protein ----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---||||||| 1 [J] COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1) ---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||-- 1 [R] COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced) -----------------|---|-----||||----|||---------------------------- 1 [S] COG1550 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|------||----|-----||----|||||||||||---|||------- 1 [T] COG1551 Carbon storage regulator (could also regulate swarming and quorum sensing) ------|------|-----|-------|||||---||--|--|||--------||----------- 1 [G] COG1554 Trehalose and maltose hydrolases (possible phosphorylases) --|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|------- 1 [L] COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1558 Flagellar basal body rod protein ----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein ----------------||--|----|----|----|||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [S] COG1561 Uncharacterized stress-induced protein -------------||--|--||--|-----|||||||-------------------||-||||--- 1 [H] COG1564 Thiamine pyrophosphokinase -----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit -----------------|--||--------||||||||||--|||||-||||||||||||||||-- 1 [S] COG1576 Uncharacterized conserved protein ----------------|----|||||||-||-------------------------|||------- 1 [R] COG1579 Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding ----------------||------||----|-----||----|||||-||-----||||------- 1 [N] COG1580 Flagellar basal body-associated protein -----------------|------||----|-----||---------------------------- 1 [N] COG1582 Uncharacterized protein, possibly involved in motility ||-|--||-||||----|||||----|||||-----------|||||-||-||------|||||-- 1 [OU] COG1585 Membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity -|--|||||-|||---||------------|-----||----||||||-|--|--|---------- 1 [E] COG1586 S-adenosylmethionine decarboxylase ||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||--- 1 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase ------------------||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 1 [M] COG1589 Cell division septal protein ----|--------||--|||-|----|||-||||||||----|||||--|---------||-||-- 1 [IR] COG1597 Sphingosine kinase and enzymes related to eukaryotic diacylglycerol kinase |-|-----|---------||-|--------|-|-||||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [C] COG1600 Uncharacterized Fe-S protein ||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG1605 Chorismate mutase |||-----||-------|||----------|----------------------------------- 1 [R] COG1606 ATP-utilizing enzymes of the PP-loop superfamily -------------|---|--------|||-|----|||----------||--||||--|||||--- 1 [S] COG1610 Uncharacterized conserved protein --------|---------||------|||||----------------------------------- 1 [S] COG1615 Uncharacterized conserved protein -----------------|--|-----|||-|-----||---------------------------- 1 [R] COG1623 Predicted nucleic-acid-binding protein (contains the HHH domain) -|||--||||------|-||-|||||----||||||||-|||------------------------ 1 [S] COG1624 Uncharacterized conserved protein |||---||-|--------||-|--------|----------------------------------- 1 [C] COG1625 Fe-S oxidoreductase, related to NifB/MoaA family ----------------||--|---------|||-|---------------|||||-|||-----|| 1 [S] COG1636 Uncharacterized protein conserved in bacteria |||-----||-------|||------|---|----------------------------------- 1 [S] COG1641 Uncharacterized conserved protein ||||||--|||-|||-|---|------||-|---||||----||||||||--|||----|||||-- 1 [H] COG1648 Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain) --||---||------------|--------||||||||----|||||-|||||------------- 1 [K] COG1654 Biotin operon repressor -----------------|------||----|----------------------------------- 1 [S] COG1655 Uncharacterized protein conserved in bacteria |||-|||||-------|---|----|----|||||||||-||------------------------ 1 [L] COG1658 Small primase-like proteins (Toprim domain) --------------------||----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [R] COG1660 Predicted P-loop-containing kinase ----------------------||||----|-----|--------|--||--|--||||----|-- 1 [M] COG1664 Integral membrane protein CcmA involved in cell shape determination ||||--|||-|||----|---|--------||-|||||--------------|----------|-- 1 [CP] COG1668 ABC-type Na+ efflux pump, permease component ------------------------||----|---||||----|||||-||---------|||||-- 1 [S] COG1671 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1677 Flagellar hook-basal body protein --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 1 [GM] COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component |-|-------------||--|---------|----|||--------|-||-----|---||-|--- 1 [S] COG1683 Uncharacterized conserved protein ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1684 Flagellar biosynthesis pathway, component FliR |||||||||||||--|||-|-|----|||-|------|----|||-|--|-----|---------- 1 [S] COG1690 Uncharacterized conserved protein |||-----||-------|||------|---|----------------------------------- 1 [R] COG1691 NCAIR mutase (PurE)-related proteins --|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-| 1 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase -------------||----||---|-----|||||||------------|---||-|-|-|----- 1 [M] COG1696 Predicted membrane protein involved in D-alanine export -----------------|------||----|-----||------------------|||------- 1 [S] COG1699 Uncharacterized protein conserved in bacteria |||---|||||||---||------------|---|-----------|---|--------||----| 1 [R] COG1708 Predicted nucleotidyltransferases |--------|--------||-------||||----|||----------|||--||||||||||||| 1 [S] COG1714 Predicted membrane protein/domain -----------------|-|||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG1722 Exonuclease VII small subunit -----------------|------||----|-----||---------------------------- 1 [S] COG1728 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|-----||||----|-----||----||||||||||||||--|||||||| 1 [T] COG1734 DnaK suppressor protein --||---------||--|--||---||---||||||||||--|||-|-||||-|||||||||---- 1 [S] COG1739 Uncharacterized conserved protein --|-----|-------|--|----------|-----------|||-|---------|||------- 1 [C] COG1740 Ni,Fe-hydrogenase I small subunit --|-||----|-------||------|||-|-----------|||||-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG1741 Pirin-related protein ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-|||||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG1744 Uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein ----------------|-------||----|----|------||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1749 Flagellar hook protein FlgE ||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega -||-||||-|-||---||---|----|||-|----|-|--|||||||-||---|||---||-||-- 1 [O] COG1765 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1766 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway lipoprotein ---------------------|||------|----------------------------------- 1 [R] COG1768 Predicted phosphohydrolase ||-----||--------||||---|--||-|-----------|||-|--|--||||-------|-- 1 [C] COG1773 Rubredoxin -------------|||||--||--|-----||--||||---------------------------- 1 [S] COG1774 Uncharacterized homolog of PSP1 -|------||----------|---------|-----------|||--------------------- 1 [E] COG1775 Benzoyl-CoA reductase/2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase subunit, BcrC/BadD/HgdB |||||||||||||----|------------|-----------|||||||----||----------- 1 [F] COG1781 Aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit --------|--|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-| 1 [I] COG1788 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit ----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----||| 1 [M] COG1792 Cell shape-determining protein ||||||--||||------||||-----||-|----|-|--------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG1797 Cobyrinic acid a,c-diamide synthase ------------------|||-----||||||||||||---------------------------- 1 [S] COG1799 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----|------|-----|--||----|||-|||-||||----|||||-||---|||---|||||-- 1 [K] COG1802 Transcriptional regulators -----------------||------|----|----|||----|||||-|-||---|---|||---- 1 [G] COG1803 Methylglyoxal synthase --------|--------|--||--------|----|||----|||-|------------------- 1 [R] COG1811 Uncharacterized membrane protein, possible Na+ channel or pump ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1815 Flagellar basal body protein -------------||----|----|--|-|||----------|||-|-||-----|---||-||-- 1 [F] COG1816 Adenosine deaminase -----------|-----|-|||---||||-||||||||-|--|||||-|||||------|||||-- 1 [G] COG1820 N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase |--------|-------|--|---------|-||-|||---------------------------- 1 [R] COG1827 Predicted small molecule binding protein (contains 3H domain) --|---------|-----||-------||-|-----||-----------|----------|-|--- 1 [E] COG1834 N-Dimethylarginine dimethylaminohydrolase ----------------||||||||||-|||||||-|||------------------|||------- 1 [R] COG1837 Predicted RNA-binding protein (contains KH domain) |||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||--- 1 [C] COG1838 Tartrate dehydratase beta subunit/Fumarate hydratase class I, C-terminal domain ||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----|||||| 1 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E --|-------------|-||-|----|||-|----|||----|||||-||------------||-- 1 [KT] COG1842 Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1843 Flagellar hook capping protein -----------------|||||--||-|||||||-|||---------------------------- 1 [R] COG1847 Predicted RNA-binding protein |-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---||||||| 1 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family ---------------------|---|----||||||||----|||||-|-||-||-|||------- 1 [T] COG1854 LuxS protein involved in autoinducer AI2 synthesis -|------------------|---|-----|-----|--------------------------|-- 1 [M] COG1861 Spore coat polysaccharide biosynthesis protein F, CMP-KDO synthetase homolog ----------------||--|-||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG1862 Preprotein translocase subunit YajC ----------------||------||----|----|||----||||||||-----||||||||--- 1 [N] COG1868 Flagellar motor switch protein --||--|||--------|-------|----|-----||----------||-----|---||--|-- 1 [NT] COG1871 Chemotaxis protein; stimulates methylation of MCP proteins ------||---------|------------|--|--||-------|------|-------|--|-- 1 [G] COG1874 Beta-galactosidase ------------------||----||----||||-|||-------|--|-|||------------- 1 [M] COG1876 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase |-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--| 1 [R] COG1881 Phospholipid-binding protein |-------|-----------|---------||||||------|||||-|-||---|---------- 1 [C] COG1882 Pyruvate-formate lyase ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1886 Flagellar motor switch/type III secretory pathway protein -----------------|------------||-|--||----|||||-|---------||||---- 1 [E] COG1897 Homoserine trans-succinylase |-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||-- 1 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes |||-||--||||------|||---------|----|----------|--|-----|---|-|---- 1 [H] COG1903 Cobalamin biosynthesis protein CbiD -----------------|--------|---||----||----|||||-------------||||-- 1 [G] COG1904 Glucuronate isomerase ||||||||--||----|||||-----||--|||--|||-------||--|-----||||||||--- 1 [S] COG1917 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain -----------------|||-|--|-----|---|||-----|||||-|---|------|-|||-- 1 [M] COG1922 Teichoic acid biosynthesis proteins -|--------------||------------|---||||----|||||-||||||||----||||-- 1 [R] COG1923 Uncharacterized host factor I protein ------------------|-------|||-||||||||----|||||-||||-||----------- 1 [G] COG1929 Glycerate kinase -----------------||||---------||||||||---------------------------- 1 [S] COG1939 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||-- 1 [L] COG1943 Transposase and inactivated derivatives ----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase |||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||--- 1 [C] COG1951 Tartrate dehydratase alpha subunit/Fumarate hydratase class I, N-terminal domain -----------------|--|---------|---||||----|||--------------------- 1 [K] COG1954 Glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (mRNA-binding) ---|||-------|---|------------||||||||----|||||-||-||||-------||-- 1 [T] COG1956 GAF domain-containing protein ---|||--|-||||-----|||----|||||---|-||----|||||-||---|||---|||||-- 1 [I] COG1960 Acyl-CoA dehydrogenases --|----|--|-|---|---|-----|||-||----||----|||||-||||-||||||------- 1 [T] COG1966 Carbon starvation protein, predicted membrane protein ----------------||------------|-----|----------------------------- 1 [S] COG1978 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---||---------|--------|---||||-|||----|||||-|----------------- 1 [KT] COG1983 Putative stress-responsive transcriptional regulator ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1987 Flagellar biosynthesis pathway, component FliQ ||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 1 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases |||||||||||||||---------------|----------------------------------- 1 [K] COG1996 DNA-directed RNA polymerase, subunit RPC10 (contains C4-type Zn-finger) ---------------------|--|-|||||---|||||||||||||--|||||||----|--||| 1 [S] COG2001 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--| 1 [L] COG2003 DNA repair proteins ---|---------||--|-|||--------|---||-|----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2008 Threonine aldolase --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component --|---|||---||||--||-------||-|-----------------|-||---|----|||--- 1 [O] COG2020 Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase ----------------|-||||----|||||-----||----|||||-||--||||--||||||-- 1 [H] COG2022 Uncharacterized enzyme of thiazole biosynthesis --|----------||-|----|-----||||-----|-----|||||-|--|-|||----||-|-- 1 [P] COG2032 Cu/Zn superoxide dismutase |||---|||--------|------|-----|----------------------------------- 1 [C] COG2033 Desulfoferrodoxin |||||||||||||-----||||----|||||------|----|||-|-||-----|---|||||-- 1 [H] COG2038 NaMN:DMB phosphoribosyltransferase -------------||---|--------||||-----|-----|----------------|--|--- 1 [E] COG2040 Homocysteine/selenocysteine methylase (S-methylmethionine-dependent) ||--||---|-------|||-|--------|-----|------------------|---------- 1 [HR] COG2045 Phosphosulfolactate phosphohydrolase and related enzymes -----------------|||----------|-----||---------------------------- 1 [S] COG2052 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||----||-|----------------|---|-----|-----|||-|--|||-------||||--- 1 [C] COG2055 Malate/L-lactate dehydrogenases -----------|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-| 1 [I] COG2057 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||-- 1 [P] COG2060 K+-transporting ATPase, A chain |||||||||||||-------------||--|--------------|---|-|---|---||-||-- 1 [NU] COG2064 Flp pilus assembly protein TadC ------------------||||----|||-||||||||-----------|||---|---------- 1 [F] COG2065 Pyrimidine operon attenuation protein/uracil phosphoribosyltransferase --------------|-----|------|||||||-|------|||----|--------|||||||| 1 [R] COG2071 Predicted glutamine amidotransferases ||-|||--||||------|||---------|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2073 Cobalamin biosynthesis protein CbiG --||---------------|-|-----|||||---|||----|||||-||---||---||||||-- 1 [P] COG2076 Membrane transporters of cations and cationic drugs ----------------|---------|||-||-|||||-|--|||||-||||---||||------- 1 [O] COG2077 Peroxiredoxin |||||||||||||||-||------------|----------------------------------- 1 [S] COG2078 Uncharacterized conserved protein ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2082 Precorrin isomerase |-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||-- 1 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases ------------------||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||--- 1 [H] COG2087 Adenosyl cobinamide kinase/adenosyl cobinamide phosphate guanylyltransferase --------|-----------|----|----|---||||---------------------------- 1 [M] COG2088 Uncharacterized protein, involved in the regulation of septum location -||-----------------|---|-----|-----|----------------|--|||----|-- 1 [M] COG2089 Sialic acid synthase ------------|--|-----|-|-|-||||---|||------------|---------||-|-|| 1 [L] COG2094 3-methyladenine DNA glycosylase ||----------------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2099 Precorrin-6x reductase ------------------||-|--------||--|-||----|||||-|-||--------|-|--- 1 [R] COG2103 Predicted sugar phosphate isomerase |-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||-- 1 [H] COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis -|||--|||||||-----------------|----------------------------------- 1 [R] COG2108 Uncharacterized conserved protein related to pyruvate formate-lyase activating enzyme ---------|---|------|---------|||||||-----|||||-||||-------------- 1 [P] COG2116 Formate/nitrite family of transporters ---|---------||---||-|----|||||-----||-----------|--|--|--||||||-- 1 [Q] COG2124 Cytochrome P450 ------------------||-|----|||||-----------|||||-||--||||||||||||-- 1 [S] COG2127 Uncharacterized conserved protein --|-----|----------|-|----|||||--||-||----|||||--|---|||---|||||-- 1 [S] COG2128 Uncharacterized conserved protein --|-||||||---||--|--||--|-----||||||||-|--------|----------------- 1 [F] COG2131 Deoxycytidylate deaminase -----------------|--||--|-||||||||||||----|||||-||||-|||---|------ 1 [R] COG2137 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---|||----||-----------|---||-|||||----|||-|---||----||-|------ 1 [H] COG2145 Hydroxyethylthiazole kinase, sugar kinase family --|-------------------||------|-----||----------------------|-|-|- 1 [S] COG2155 Uncharacterized conserved protein ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||-- 1 [P] COG2156 K+-transporting ATPase, c chain |||-----||--------------------|----------------------------------- 1 [R] COG2158 Uncharacterized protein containing a Zn-finger-like domain ---|--||-|-||-----|-------|||-|---||-----------------------||-||-- 1 [R] COG2159 Predicted metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold ||----||-|||||||--------------|------|---------------------------- 1 [J] COG2163 Ribosomal protein L14E/L6E/L27E ---------|-------|--------||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG2171 Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase -----------------|||-|||---||-|---||||---------------------------- 1 [T] COG2172 Anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase) -----------------|--|---------||||||||||||------------------------ 1 [L] COG2176 DNA polymerase III, alpha subunit (gram-positive type) -------------|||---||---|-|---|||||||||---|||||-||||||||---||||--- 1 [K] COG2183 Transcriptional accessory protein --|-----------------||---|----||||||||----|||||-|-||------|-|--|-- 1 [E] COG2195 Di- and tripeptidases --||--|||--------|-|----||----|-----||----|||||-||--|--|--|||-||-- 1 [NT] COG2201 Chemotaxis response regulator containing a CheY-like receiver domain and a methylesterase domain |-||----|-----|-||||-|||-||||||----|||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [T] COG2202 FOG: PAS/PAC domain |-||----|-----|-||||-|-----||||---|-||----|||---||-----|---|||||-- 1 [T] COG2203 FOG: GAF domain ------------------||-|-----||-|---||------|||||-||-----|--|||-||-- 1 [T] COG2205 Osmosensitive K+ channel histidine kinase -----------------||||-|||--||-|---||||----------||----------|-|--- 1 [TK] COG2208 Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit ------------------------------|--|||||-||-|||||||--|-------------- 1 [G] COG2213 Phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component ---|---------|||-|||-|--||----|---------|||||-|-||--|||-||||||||-- 1 [O] COG2214 DnaJ-class molecular chaperone ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|--|||-||-- 1 [P] COG2216 High-affinity K+ transport system, ATPase chain B ||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--| 1 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold |||-----|||-------------------|---------------|------------------- 1 [C] COG2221 Dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha and beta subunits |-----||-|-------|--||--------|-||-||-----|||||--|--|------|||||-- 1 [M] COG2222 Predicted phosphosugar isomerases --|-------------|----|----|||||-----------|||||-||-----|||||||||-- 1 [M] COG2230 Cyclopropane fatty acid synthase and related methyltransferases |----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----||||||| 1 [P] COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain) -------------||------|---||---|-|---------|||||--|||-------|||||-- 1 [H] COG2240 Pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase ||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2241 Precorrin-6B methylase 1 ||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|---------||||--- 1 [H] COG2242 Precorrin-6B methylase 2 ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2243 Precorrin-2 methylase ---||||||||||-----||------||||||-||||-----|---|--|-----|------||-- 1 [S] COG2246 Predicted membrane protein --|-----------|-----|---------|----||||---|||||-||||-||||||-|-||-- 1 [R] COG2249 Putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B) -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit -----------------|------|-----|-----||-----------|------|||----|-- 1 [S] COG2257 Uncharacterized homolog of the cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB ---------------------|----|||-|---||||----|||-|--||----|--||-|---- 1 [S] COG2258 Uncharacterized protein conserved in bacteria -|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [R] COG2262 GTPases ----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase -------||----||--|-|||----||||||--||||----|||||-||||---|---|||||-- 1 [I] COG2267 Lysophospholipase --------------|------|----|||-|---|-|---------|--------|-------|-- 1 [I] COG2272 Carboxylesterase type B -------------||--|---------||-|-----||---------------------||-||-- 1 [G] COG2273 Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase ------------------||----------||-|--||||||-||||-||--||||----|-||-- 1 [V] COG2274 ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain |----------------|||-|--------|-----------|||-|------------|-|---- 1 [S] COG2327 Uncharacterized conserved protein --------|----|-|---|||---||---|---||||-----------|---------|||||-- 1 [S] COG2340 Uncharacterized protein with SCP/PR1 domains -----------------|---|--------||||||||---------------------------- 1 [R] COG2344 AT-rich DNA-binding protein ------------------||||----|---|-----|-----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [S] COG2350 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|----|---|-----||------------||-------------- 1 [S] COG2364 Predicted membrane protein ------------------||||-----||||||||||----------------------||----- 1 [V] COG2367 Beta-lactamase class A --------------------||----|||||---||||----|---|-||--|-||--||||||-- 1 [K] COG2378 Predicted transcriptional regulator ---------------------|----|---|---||||----|||-|--|---------------- 1 [P] COG2382 Enterochelin esterase and related enzymes ---------------------|--------|||||||||-||------|----------------- 1 [R] COG2384 Predicted SAM-dependent methyltransferase ---------------------|--------||||||||----|||||-|--|---|---||||--- 1 [K] COG2390 Transcriptional regulator, contains sigma factor-related N-terminal domain ------||--|-|----|------------|--|--------|||||---|--------------- 1 [G] COG2407 L-fucose isomerase and related proteins -||-|||||-|-|-----------------|-----------|||--------------------- 1 [C] COG2414 Aldehyde:ferredoxin oxidoreductase |||---||-|-|------------------|----------------------------------- 1 [S] COG2454 Uncharacterized conserved protein -------||--------|--|---------||-|---|---------------------------- 1 [S] COG2461 Uncharacterized conserved protein -------------------|||----|---||||||||||--|||||-|----|||---------- 1 [S] COG2501 Uncharacterized conserved protein ----||------------|--------||-|---------------------------|------- 1 [R] COG2605 Predicted kinase related to galactokinase and mevalonate kinase ----------------|-||----------|------------------|---|||--||||||-- 1 [R] COG2607 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) -|--------------|-------------|-----------------||-----|--|------- 1 [P] COG2703 Hemerythrin ------------------------------|-----------|||||-|-||----|||------- 1 [R] COG2704 Anaerobic C4-dicarboxylate transporter --------------|---------------||-||||-----||||||-|-----|---------- 1 [G] COG2706 3-carboxymuconate cyclase ------------------------------|----|||----|||||---||-||----------- 1 [S] COG2707 Predicted membrane protein ------------------|-----------|-----||-----------|-----|---------- 1 [R] COG2715 Uncharacterized membrane protein, required for spore maturation in B.subtilis. ---|--------------------------|-----||----|||||-||----------|-|--- 1 [S] COG2718 Uncharacterized conserved protein ---|--------------------------|-----||----|||||-||----------|-|--- 1 [S] COG2719 Uncharacterized conserved protein ---------------------|----|---|-----||-----------|---------------- 1 [V] COG2720 Uncharacterized vancomycin resistance protein ----|------|------------------|-----||----|||||--------|--||||||-- 1 [G] COG2721 Altronate dehydratase --------------------|---------|--|-----|--|||||-|-||----||-------- 1 [G] COG2731 Beta-galactosidase, beta subunit ------------------------------|-----|-----|||||------|------------ 1 [K] COG2732 Barstar, RNAse (barnase) inhibitor -----------------|---|--------|---||||---------------------------- 1 [R] COG2738 Predicted Zn-dependent protease --------------------|---------|||||||||||------------------------- 1 [S] COG2739 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|||----||||||||||||||----------------||||||||-- 1 [K] COG2740 Predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination -------------------|-|--------|----||---------------------|-|-|--- 1 [V] COG2746 Aminoglycoside N3'-acetyltransferase ----------------||------------|-----||----|||||-||-----|---------- 1 [KNU] COG2747 Negative regulator of flagellin synthesis (anti-sigma28 factor) ----||-------||--|--|---------||||||--|---------|----||-----|-|--- 1 [F] COG2759 Formyltetrahydrofolate synthetase ---|-------|---------|----|---|---||||----------|---|--|---|||||-- 1 [Q] COG2761 Predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis ---|--------------------------|-----||----|||||-||----------|-|--- 1 [T] COG2766 Putative Ser protein kinase |-|-----|--------|------------|----------------------------------- 1 [R] COG2768 Uncharacterized Fe-S center protein ---------||-------||-|----||||||--||||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [K] COG2771 DNA-binding HTH domain-containing proteins ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 1 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB ----------------||||||--------|-----------|||||-||--||||---------- 1 [NU] COG2805 Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT ---------------------|----|---|--|-||-----|||-|--|-----|--|--|---- 1 [P] COG2807 Cyanate permease -----------------|--||--||||||||||||||---------------------------- 1 [S] COG2815 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|--------|--|--|------||-|--|---|----||---|-- 1 [R] COG2819 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily ---------------------|--------|-----------|||||-||||-|||----|---|| 1 [R] COG2823 Predicted periplasmic or secreted lipoprotein -|||----|-------|----|--||----|-----||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG2834 Outer membrane lipoprotein-sorting protein ---|---------------|----------|-----------------||---||||||------- 1 [S] COG2836 Uncharacterized conserved protein ------------------------------|---|-------|||||---|--|||----|----- 1 [D] COG2846 Regulator of cell morphogenesis and NO signaling -||------||||-------------|---||-|-|-----------------||----------- 1 [S] COG2848 Uncharacterized conserved protein -------------------|||---|-||-|--|||||--------------||-|-----|---- 1 [E] COG2856 Predicted Zn peptidase --------------------|---||----|||||||||-||------------------------ 1 [J] COG2868 Predicted ribosomal protein --|-||||--||||---|--||--------|------|----------||-----|---||||--- 1 [R] COG2872 Predicted metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase HxxxH domain ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2875 Precorrin-4 methylase ----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------ 1 [E] COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase -----------------|------|-----|-----||----||||||||-----|---------- 1 [NUO] COG2882 Flagellar biosynthesis chaperone -------------------|-|----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 1 [D] COG2884 Predicted ATPase involved in cell division |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors ----------------||||||--------|----|||----||||||||--||||||-||||--- 1 [D] COG2894 Septum formation inhibitor-activating ATPase --------------------------|||-|-----------||||||||--||||---|||||-- 1 [P] COG2895 GTPases - Sulfate adenylate transferase subunit 1 |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG2896 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme ---------------------------||-|-----------|||||-||---------------- 1 [K] COG2909 ATP-dependent transcriptional regulator ------------------------------|----|------||||||||-|-------------- 1 [H] COG2918 Gamma-glutamylcysteine synthetase |------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|------- 1 [S] COG2966 Uncharacterized conserved protein ----||-----|-----|-|-|--------|-----------------|-----------|||--- 1 [G] COG2971 Predicted N-acetylglucosamine kinase --------------------|---------||||||||----------||---------------- 1 [S] COG2996 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|--------------|--||--|------------- 1 [S] COG3007 Uncharacterized paraquat-inducible protein B -----------------------|------|---||||----|||||-|||||||----||||||| 1 [S] COG3027 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|--|||------|||||-||||-|-|----|-||-| 1 [K] COG3070 Regulator of competence-specific genes -------------|||----------|---||--|||-----|||||-|---|||--------|-- 1 [E] COG3104 Dipeptide/tripeptide permease -----------------|------------|-----||----||||||||-----|---------- 1 [N] COG3144 Flagellar hook-length control protein -------------------|-------||||-----||-------|---|-----|---|--|--- 1 [Q] COG3208 Predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis ------------------------------|------------------|||-|||----|--|-- 1 [S] COG3220 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|----|---||--||------|||-|--|-|-------|--|--- 1 [S] COG3238 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|----------|-----||----|-----||-----|---|||||-- 1 [QK] COG3284 Transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism -----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-||||||| 1 [M] COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes --------------------|---------|---|-||----|||-|-|-----------|----- 1 [S] COG3314 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|------|||||-----|--------|---------|---||-|--- 1 [Q] COG3321 Polyketide synthase modules and related proteins --------------------|-----||-||---||||-----------|---------------- 1 [S] COG3323 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-||-----|------|--------||-||-----||----||||--------|----|-|--- 1 [L] COG3328 Transposase and inactivated derivatives -----------------|||----------|------|---------------------------- 1 [S] COG3330 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-|---------------||----------|-----||-----------------|---|||||-- 1 [S] COG3339 Uncharacterized conserved protein --|----------|----|||------||-|---|--|----|--||-||----------|----- 1 [L] COG3344 Retron-type reverse transcriptase |-||--------------------------|-----||---------------------------- 1 [L] COG3359 Predicted exonuclease ---------||||-----------------|||---||--------|--|-----|------|--- 1 [S] COG3382 Uncharacterized conserved protein --|-|------|--|---------------|-----------|||||--|-|---|-------|-- 1 [S] COG3384 Uncharacterized conserved protein -||-||-----|-||----|------|||-|------------------------|---|--||-- 1 [G] COG3387 Glucoamylase and related glycosyl hydrolases ----||-----------|--||--------|-|--------------------------------- 1 [E] COG3404 Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase --------------------------|---|-||||-|-||-|||-|-|--|-------------- 1 [G] COG3414 Phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component -----------------|||-|--|-----|-----------------||--|------------- 1 [KT] COG3437 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HD-GYP domain ------------------||------|||||||||------------------------------- 1 [R] COG3442 Predicted glutamine amidotransferase ------------------------------|----|||----|||-|--------|------||-- 1 [L] COG3449 DNA gyrase inhibitor ---|--------------------------|--------|------|-----|--|||-||||||| 1 [U] COG3451 Type IV secretory pathway, VirB4 components -----------------|------------|----|---------|--|----------||||--- 1 [G] COG3459 Cellobiose phosphorylase |-|||--------------|||--------||-----|--------|------|||----|||--- 1 [R] COG3467 Predicted flavin-nucleotide-binding protein --|-----|-----|---||----------||----|----------------------||----- 1 [T] COG3476 Tryptophan-rich sensory protein (mitochondrial benzodiazepine receptor homolog) -------------------|----------|---------------|-----|--|||-||-|-|| 1 [U] COG3505 Type IV secretory pathway, VirD4 components --|---------------------------||-||||-----------|----------------- 1 [Q] COG3527 Alpha-acetolactate decarboxylase -----------------|------------|-----||---------------------||-||-- 1 [G] COG3534 Alpha-L-arabinofuranosidase |-|-----|---------------------|----------------------------|-||--- 1 [S] COG3543 Uncharacterized conserved protein -------------|----------------||--||-------------|---||----|-|---- 1 [R] COG3560 Predicted oxidoreductase related to nitroreductase ------------------------------|||-|--------||-----|---|----------- 1 [K] COG3561 Phage anti-repressor protein --------------------------|||||----|||---------------------------- 1 [S] COG3583 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------|--|-|---------|---|-----------------|------||-|--- 1 [G] COG3588 Fructose-1,6-bisphosphate aldolase ------||----------------------||---|||-------|-------------------- 1 [S] COG3595 Uncharacterized conserved protein ------------------||-|----||||||||||||-|-------------------------- 1 [D] COG3599 Cell division initiation protein ------||---------|------------|||||||----------------------------- 1 [S] COG3601 Predicted membrane protein |------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|------- 1 [S] COG3610 Uncharacterized conserved protein --|---------------|-|------||-||||-||------------|-----|---||||--- 1 [S] COG3619 Predicted membrane protein ------||----------||------|||||||||----------------------------|-- 1 [K] COG3682 Predicted transcriptional regulator ------------------||----------|-|-||||---------------------------- 1 [R] COG3688 Predicted RNA-binding protein containing a PIN domain ------------------||----------|-||-|||---------------------------- 1 [S] COG3689 Predicted membrane protein ----------------|-||-|--------||---|||-----------|---|||---|||||-- 1 [E] COG3705 ATP phosphoribosyltransferase involved in histidine biosynthesis --------------------|------||||----|-------------|-----|---||-||-- 1 [T] COG3707 Response regulator with putative antiterminator output domain ------------------------|-----|-----------|||||-|----------|||||-- 1 [S] COG3735 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------||-||-----------||--------------------- 1 [L] COG3747 Phage terminase, small subunit |--------|----------------|---||||||||---------------------------- 1 [M] COG3764 Sortase (surface protein transpeptidase) -------------------|----------|-----------|||||-----|--|------||-| 1 [R] COG3772 Phage-related lysozyme (muraminidase) ------------------------------|-||||-|----|||-|------------------- 1 [G] COG3775 Phosphotransferase system, galactitol-specific IIC component ---------------------------||||----|-----------------------|||||-- 1 [S] COG3786 Uncharacterized protein conserved in bacteria -||-----|||---------------||||||-|-|-------------|---||----------- 1 [T] COG3830 ACT domain-containing protein --|--------------|--------|||-|---||||-----------|-----|---||-||-- 1 [S] COG3832 Uncharacterized conserved protein ------------------------------|-----||----|||||-|||--------------- 1 [KT] COG3835 Sugar diacid utilization regulator -------------------|----------|-----------------|------|----|-||-- 1 [S] COG3837 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain |||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||--- 1 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components --||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG3845 ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase components ------------------||----------|-----||---------------------------- 1 [S] COG3854 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------||--|||----------------------------- 1 [G] COG3855 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------||-|-----||---------------------------- 1 [S] COG3856 Uncharacterized conserved protein (small basic protein) ------------------------------||||||||---------------------------- 1 [L] COG3857 ATP-dependent nuclease, subunit B ------------------------------|||--|||---------------------------- 1 [S] COG3859 Predicted membrane protein -------------------|-|--------|------|---------------------------- 1 [S] COG3860 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------|---------------------|-----|----------------------------- 1 [S] COG3863 Uncharacterized distant relative of cell wall-associated hydrolases -----------------|---|--------|----------------------------------- 1 [S] COG3864 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|---||--||-------------|-----|---||-|--- 1 [S] COG3865 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|------------|-----||---------------------------- 1 [G] COG3866 Pectate lyase -----------------|------------|-----||-------|-------------------- 1 [G] COG3867 Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase ----------------|----|--------|------------------|-----|---------- 1 [S] COG3868 Uncharacterized conserved protein ----------------------||------|---||||---------------------------- 1 [E] COG3869 Arginine kinase ---------------------|--------|---||||---------------------------- 1 [S] COG3870 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|--------|---|||----------------------|------ 1 [R] COG3871 Uncharacterized stress protein (general stress protein 26) -----------------|--|---------|----|||---------------------------- 1 [R] COG3872 Predicted metal-dependent enzyme --|-----|--------|------------|----------------------------------- 1 [S] COG3875 Uncharacterized conserved protein ----------------------||------|-----||---------------------------- 1 [S] COG3876 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|---|--------|----------------------------------- 1 [S] COG3877 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------||--------|---|||----------------------------- 1 [S] COG3878 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------||------|---||||---------------------------- 1 [S] COG3880 Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs ---------------------|--------|-----||---------------------------- 1 [S] COG3881 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------|||||||-------------------------------- 1 [I] COG3884 Acyl-ACP thioesterase ----||||---|------------------|----------------------------------- 1 [S] COG3885 Uncharacterized conserved protein --|-----------------|-----|---|---|-------------|-------||-------- 1 [L] COG3886 Predicted HKD family nuclease ------------------------------||||||||-|-------------------------- 1 [T] COG3887 Predicted signaling protein consisting of a modified GGDEF domain and a DHH domain --------------|----||--------||-|---------------------------|-|--- 1 [R] COG3899 Predicted ATPase -----------------|------------||||||||---------------------------- 1 [S] COG3906 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-|---------------|||------||||----|-----------------------|||||-- 1 [T] COG3920 Signal transduction histidine kinase ------------------------------|----||---------|------------------- 1 [K] COG3933 Transcriptional antiterminator ------------------------------||||||||---------------------------- 1 [L] COG3935 Putative primosome component and related proteins ------------------------------|---|-|----------------------------- 1 [G] COG3936 Protein involved in polysaccharide intercellular adhesin (PIA) synthesis/biofilm formation --|---------------||----------|------|---------------------------- 1 [S] COG3937 Uncharacterized conserved protein ------------------------------|------|--------|------------------- 1 [R] COG3940 Predicted beta-xylosidase ------||------------------|---|---|-||---------------------------- 1 [S] COG3949 Uncharacterized membrane protein ------------------------------|---|-||---------------------------- 1 [R] COG3956 Protein containing tetrapyrrole methyltransferase domain and MazG-like (predicted pyrophosphatase) domain --------------|---||----------||-----------------|----------|||--- 1 [G] COG3957 Phosphoketolase --|----------||------------|||||--|-----------|------------------- 1 [GHR] COG3961 Pyruvate decarboxylase and related thiamine pyrophosphate-requiring enzymes -------------------|----------||----|------------------|---||----- 1 [M] COG3967 Short-chain dehydrogenase involved in D-alanine esterification of lipoteichoic acid and wall teichoic acid (D-alanine transfer protein) ------------------|--|--------|----------------------------------- 1 [R] COG3968 Uncharacterized protein related to glutamine synthetase -|----------------------------|-----|-------------------|-|----|-- 1 [M] COG3980 Spore coat polysaccharide biosynthesis protein, predicted glycosyltransferase |--------|--------------------|--|--||---------------------------- 1 [S] COG4086 Predicted secreted protein -------------------|----------|--|--------------||---------------- 1 [P] COG4097 Predicted ferric reductase ------------------||----------|---||||---------------------------- 1 [P] COG4100 Cystathionine beta-lyase family protein involved in aluminum resistance ------------------||-|----|---||||||------||||||||||||||---|||||-- 1 [J] COG4108 Peptide chain release factor RF-3 ------------------------------||||||||---------------------------- 1 [K] COG4109 Predicted transcriptional regulator containing CBS domains ---------------------|--------|------------|||-------------------- 1 [R] COG4110 Uncharacterized protein involved in stress response --||--------|-|-|-||||----||||||||||||-----------|---||-------|--- 1 [R] COG4122 Predicted O-methyltransferase ----------------||--|---------||||||||||--|||||-|-||----||||||||-- 1 [R] COG4123 Predicted O-methyltransferase --|---------------------------|---------------|----------------|-- 1 [S] COG4127 Uncharacterized conserved protein -------------------|-------||-|-------------------|--------|------ 1 [S] COG4185 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|--------|-----|-----------------------|----- 1 [E] COG4187 Arginine degradation protein (predicted deacylase) ------------------------------|--||-|----------------------------- 1 [G] COG4193 Beta- N-acetylglucosaminidase ----|------|--------------|---|----|------------------------------ 1 [R] COG4194 Predicted membrane protein ----||-----------|------------|----|------------------------------ 1 [S] COG4198 Uncharacterized conserved protein ------------------------------|------|-------------------------|-- 1 [S] COG4200 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|---|----------------------------|-- 1 [KT] COG4219 Antirepressor regulating drug resistance, predicted signal transduction N-terminal membrane component --------------------|---------||||||||---------------------------- 1 [S] COG4224 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|-----||-------||------------|------ 1 [R] COG4225 Predicted unsaturated glucuronyl hydrolase involved in regulation of bacterial surface properties, and related proteins |-|-|||||-||------------------|------------------------|------||-- 1 [C] COG4231 Indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha and beta subunits ------------------||----------|---|-||---------------------------- 1 [S] COG4241 Predicted membrane protein -----------------|--|---------|------------------|-----|---------- 1 [S] COG4267 Predicted membrane protein |-------------------|---------|----------------------------|---|-- 1 [R] COG4277 Predicted DNA-binding protein with the Helix-hairpin-helix motif -------------------|-|--------|----------------------------------- 1 [S] COG4295 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|--------|----------------------------------- 1 [S] COG4296 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------|----|------|||-|--|-----|---------- 1 [E] COG4302 Ethanolamine ammonia-lyase, small subunit --------------------|---------|----|------|||-|--|-----|---------- 1 [E] COG4303 Ethanolamine ammonia-lyase, large subunit ------------------------------|--------------|-------||----------- 1 [S] COG4304 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|---------------------|--|---------- 1 [S] COG4306 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------|------------------|------------------------|---|||---- 1 [S] COG4309 Uncharacterized conserved protein ------------------------------|---------------------------||-|---- 1 [R] COG4310 Uncharacterized protein conserved in bacteria with an aminopeptidase-like domain ------------------------------||-------------|----------------|--- 1 [S] COG4331 Predicted membrane protein ------------------------------|---------------|------------|--|--- 1 [S] COG4332 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------||---------------|-----|----------------------------- 1 [E] COG4359 Uncharacterized conserved protein, possibly involved in methylthioadenosine recycling ------------------------------|------|--------------------|------- 1 [S] COG4378 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|----------|-||---|---------------------------- 1 [V] COG4403 Lantibiotic modifying enzyme ------------------------------||-|-|||-----|-||------------------- 1 [S] COG4405 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|-----|-----------|----------------- 1 [S] COG4412 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|-------------|-----|--------------- 1 [R] COG4416 Mu-like prophage protein Com ------------------------|-----||||-|------------------------------ 1 [S] COG4443 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------||||||||---------------------------- 1 [K] COG4463 Transcriptional repressor of class III stress genes ------------------------------||||||||---------------------------- 1 [K] COG4465 Pleiotropic transcriptional repressor ------------------------------||||||||---------------------------- 1 [S] COG4466 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------||-|--||---------------------------- 1 [G] COG4468 Galactose-1-phosphate uridyltransferase ------------------------------||||||-|---------------------------- 1 [S] COG4472 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------||||-----|-------------------------- 1 [S] COG4478 Predicted membrane protein ------------------------------|-||||-|---------------------------- 1 [S] COG4481 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------|---|-||---------------------------- 1 [R] COG4492 ACT domain-containing protein ------------------------------|---||||--------------|------------- 1 [S] COG4496 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|---||||---------------------------- 1 [S] COG4499 Predicted membrane protein ------------------------------|---|-|----------------------------- 1 [S] COG4502 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|---||||---------------------------- 1 [S] COG4506 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|------|-|-------------------------- 1 [S] COG4508 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|---||-|---------------------------- 1 [OTK] COG4512 Membrane protein putatively involved in post-translational modification of the autoinducing quorum-sensing peptide ------------------------------|----|----------|---------------|--- 1 [Q] COG4542 Protein involved in propanediol utilization, and related proteins (includes coumermycin biosynthetic protein), possible kinase -----------------|---|--|-----|-----|---------------|------------- 1 [CP] COG4555 ABC-type Na+ transport system, ATPase component --|-------------|---||--||----|-----------|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG4591 ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG4603 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ------------------------------||--||------|||-----------------|--- 1 [R] COG4626 Phage terminase-like protein, large subunit -------------------|----------|--|-------------------------------- 1 [S] COG4633 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|||--------|---------------------------|------- 1 [R] COG4639 Predicted kinase --------------------|-----|---|-----------|||||-|--|-------------- 1 [R] COG4667 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily ---------------------|--------||-|||||--|-||||||||||---|---------- 1 [G] COG4668 Mannitol/fructose-specific phosphotransferase system, IIA domain ------------------------------|-----------|||||--------|---------- 1 [G] COG4677 Pectin methylesterase ------------------------------||||-|------------------------------ 1 [S] COG4687 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|------------------------|------|--- 1 [Q] COG4689 Acetoacetate decarboxylase ------------------------------|||---------|||----------|---|-|||-- 1 [S] COG4695 Phage-related protein ------------------------------||||-|------------------------------ 1 [S] COG4708 Predicted membrane protein ------------------------------|-||||---------------------------|-- 1 [S] COG4709 Predicted membrane protein ---------------------|--------||---------------------------------- 1 [S] COG4712 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|||--------------------------------- 1 [S] COG4713 Predicted membrane protein ------||----------------------|||||------------------------------- 1 [S] COG4720 Predicted membrane protein ------------------------------|||--|||---------------------------- 1 [S] COG4722 Phage-related protein ------------------------------|------------------|-----|---------- 1 [S] COG4728 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|----|||---------------------------- 1 [R] COG4824 Phage-related holin (Lysis protein) ------------------------------|-||||||---------------------------- 1 [S] COG4856 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-----|-----------|---------|---------------------|------------- 1 [O] COG4870 Cysteine protease -----------------|--|---------|----------------------------------- 1 [S] COG4878 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-|---------------------------|----------------------------------- 1 [R] COG4892 Predicted heme/steroid binding protein ------------------------------||---|------------------------------ 1 [S] COG4905 Predicted membrane protein ------------------------------|||--|------------------------------ 1 [S] COG4926 Phage-related protein ----||-----|------------------|----------------------------------- 1 [O] COG4934 Predicted protease ------------------------------|----|----------|------------------- 1 [TK] COG4936 Predicted sensor domain ---|||--||-||----|||||----||||||--||||----|||||--|-----|---|||||-- 1 [MR] COG4948 L-alanine-DL-glutamate epimerase and related enzymes of enolase superfamily ------------------||-|--------||--||||---------------------------- 1 [R] COG4956 Integral membrane protein (PIN domain superfamily) ||----||-|----------------|||-|--------------|---|-||--|---||-||-- 1 [U] COG4962 Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF --------------------|---|-|||||---||||----|||||-||||||||---||||||| 1 [L] COG4974 Site-specific recombinase XerD |-|-------|--------|------|---|-----||---------------------------- 1 [KT] COG4978 Transcriptional regulator, effector-binding domain/component ------------------||----------|---||||---------------------------- 1 [R] COG4980 Gas vesicle protein ------------------------------|--|||||----|||||-|----------|--|--- 1 [R] COG4989 Predicted oxidoreductase ------------------------------|-----|----------------------||||--- 1 [S] COG4991 Uncharacterized protein with a bacterial SH3 domain homologue |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase ------------------------------|----|-------------------|---------- 1 [S] COG4994 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-----------------|---------|----------------------------------| 1 [S] COG4997 Uncharacterized conserved protein -----------------|||----------|----------------------------------- 1 [S] COG5011 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-----------------|---------|---------------------------|------- 1 [S] COG5015 Uncharacterized conserved protein -------------|||--------------|----------------------------------- 1 [R] COG5083 Uncharacterized protein involved in plasmid maintenance -------------|||--------------|----------------------------------- 1 [DZ] COG5184 Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins ------------------------------||-|-------------------------------- 1 [R] COG5263 FOG: Glucan-binding domain (YG repeat) ------------------------------||---|-------||-|-----|------------- 1 [S] COG5283 Phage-related tail protein ------------------------------|----------------------------||-|--- 1 [S] COG5482 Uncharacterized conserved protein --|---------------------------|------------------|---------------- 1 [S] COG5513 Predicted secreted protein ------------------------------|-----------------------------|||--- 1 [S] COG5515 Uncharacterized conserved small protein ------------------------------|---||-----------------|------------ 1 [L] COG5527 Protein involved in initiation of plasmid replication -------------|||---|----------|----------------------------------- 1 [S] COG5542 Predicted integral membrane protein -----------------|------------|-----||----|||||--|---------------- 1 [M] COG5581 Predicted glycosyltransferase ------------------------------|-----||-----------|---------------- 1 [S] COG5583 Uncharacterized small protein ------------------------------|------------||----------|---|------ 1 [R] COG5614 Bacteriophage head-tail adaptor --||-------------|---|--------|----|-|-----------------|---------- 1 [S] COG5652 Predicted integral membrane protein ------------------------------|---||-|---------------------------- 1 [L] COG5655 Plasmid rolling circle replication initiator protein and truncated derivatives ------------------------------|-----||------------------------|--- 1 [S] COG5663 Uncharacterized conserved protein