| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 135 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily |||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 91 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases |||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||-- 64 [K] COG1846 Transcriptional regulators --|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 63 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) |-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 60 [K] COG1309 Transcriptional regulator |-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 56 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase |-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---||||||| 55 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators |-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 54 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component ----------------||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 51 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain --|--|-------------||-----|||----||--|-----------------|---||-|--- 51 [L] COG3464 Transposase and inactivated derivatives |||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 44 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases |-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 41 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases |||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 41 [R] COG0457 FOG: TPR repeat -----------------|--||----|||-||||||||-|--|||||-|||||--|---|||||-- 41 [K] COG1609 Transcriptional regulators ||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 39 [K] COG0583 Transcriptional regulator ||||----|||||---|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 37 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component -----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||-- 37 [K] COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins --||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 36 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components ||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-| 35 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases --------------------|-|||||---||||||||-||||||||-||||-|||---|||||-- 35 [GT] COG1762 Phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain (Ntr-type) |-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|--- 34 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily |||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 33 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins --|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 33 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators ||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 32 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis |||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 32 [L] COG0582 Integrase ||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 31 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component --||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-|||||||||||||||||| 31 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) ||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 30 [M] COG0438 Glycosyltransferase --------------------|-----|---||||||||----|||||------------------- 30 [K] COG3711 Transcriptional antiterminator -||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||-- 29 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||-||||||||-||-||--|---||||--- 28 [G] COG0395 ABC-type sugar transport system, permease component |-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||-- 28 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins --------------------|----||---||||||||||||||||||||-|---|-------|-- 28 [G] COG1264 Phosphotransferase system IIB components ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||----|||||-||-||--|---||||--- 28 [G] COG1653 ABC-type sugar transport system, periplasmic component |||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||-- 27 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators |-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 27 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily -------------||----|------||||-||||||-----|||||-||-----|--||-||--- 27 [Q] COG1020 Non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins --------------------|----||---||||||||-|||||||||||-|---|-------|-- 27 [G] COG1263 Phosphotransferase system IIC components, glucose/maltose/N-acetylglucosamine-specific -|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-||||||||||||| 27 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins --|----------------||---------|-|||--|-----------|---------||--|-- 27 [L] COG3666 Transposase and inactivated derivatives ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|---||||--- 26 [G] COG1175 ABC-type sugar transport systems, permease components -----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||-- 26 [K] COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog -------------------|-|----|||-||||||||||--|||||-||-----|---|||||-- 25 [K] COG2188 Transcriptional regulators --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 24 [NT] COG0840 Methyl-accepting chemotaxis protein -||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||-- 23 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component ||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 22 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases |-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 22 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes -----------------||||||||--||-|---||||----------||---------||--|-- 22 [T] COG1366 Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor) ------------------||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 22 [TK] COG2197 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain |||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 21 [C] COG0778 Nitroreductase ----------------|----|||-||||-||--||||-------|--||||-------------- 21 [M] COG1388 FOG: LysM repeat ------------------||-|----|||-||||||||-----------|-----|---||-||-- 21 [T] COG4585 Signal transduction histidine kinase --|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||-- 20 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases ---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||-- 20 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase |||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 19 [R] COG0517 FOG: CBS domain ||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---||||||| 19 [E] COG0531 Amino acid transporters |-||--|||----|||-|||-|--||-||-|----|||----|||||-|||||--|||||||||-- 19 [T] COG0784 FOG: CheY-like receiver ----------------||--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---||||--- 19 [KG] COG1349 Transcriptional regulators of sugar metabolism ----||||--||--------------|---||||||||----|||||-|----------||--|-- 19 [G] COG2723 Beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/beta-galactosidase --|-||----|--||--|||-|----|||-||||||||-|--|||||-||-----|---||-||-- 18 [G] COG0366 Glycosidases |||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 18 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase ||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 18 [O] COG0492 Thioredoxin reductase --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||--- 18 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||--- 18 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components ---------|-------|--|-||-|----||||||||||||------|----------|||---- 18 [S] COG1284 Uncharacterized conserved protein ||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||-- 18 [K] COG1733 Predicted transcriptional regulators ||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 17 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases ||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 17 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 17 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 17 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2 ---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---||||||| 17 [I] COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase --------------------|---------|-||||||----------||--|--|---------- 17 [T] COG2972 Predicted signal transduction protein with a C-terminal ATPase domain |-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 16 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II -------------|||--||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 16 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains ---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 16 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes |-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-|||| 16 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase -------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||-- 16 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases ----------------||||||--||||||||--||||----|||||||||||||||||||||||| 16 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases --|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||--- 16 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component --|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-||||||||||||| 16 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain ----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||-- 16 [M] COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase ----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||-- 16 [KE] COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs ----------------||||--|||--||-|---||||----|||||-||-----||||------- 16 [K] COG1191 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit --||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|--- 16 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases -------------------------|----||||||||----|||||-|----------------- 16 [G] COG1455 Phosphotransferase system cellobiose-specific component IIC --||||||---|-----|||||----|||-||-|||||----|||----|||---|--||||||-- 16 [R] COG1473 Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase ||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 16 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid -------------------|------|||||-----|--------|---------|---||-|--- 16 [Q] COG3321 Polyketide synthase modules and related proteins --|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||--- 15 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component |||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||-- 15 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family -|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 15 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases ||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 15 [R] COG0628 Predicted permease --|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||-- 15 [G] COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase |||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||-- 15 [R] COG0730 Predicted permeases ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 15 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein ||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 15 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes ----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 15 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator -----||---|-------||-|----|||-|-||||||----|||||-||--|--|---|||||-- 15 [L] COG1961 Site-specific recombinases, DNA invertase Pin homologs --------------------|----||---||||||||-|||||||||||||---|-------|-- 15 [G] COG2190 Phosphotransferase system IIA components -------------------|||--------||-|--||----|||-|-------------|----- 15 [S] COG2323 Predicted membrane protein ----------------------------------||||---------------------------- 15 [S] COG5444 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 14 [R] COG0073 EMAP domain ------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||-- 14 [M] COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins) |-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||-- 14 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component |||---||||-|-----|||------|||||-|-||||----|||||--|-----|---|||||-- 14 [G] COG1082 Sugar phosphate isomerases/epimerases |-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||-- 14 [R] COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease -------------------------|----||||-|||----|||||-|----------------- 14 [G] COG1440 Phosphotransferase system cellobiose-specific component IIB --|-------------|----------||-|||||||||---||||||-------|---||-|--- 14 [L] COG1484 DNA replication protein -----------------|--------|---||||||||-|--|||||-||||-|||---|||||-- 14 [K] COG1737 Transcriptional regulators ||||----||-|-------|-|----||||--||||||-|--|||||--|--|--|---|||||-- 14 [C] COG2141 Coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases --|---------------||-|----|||||-----||----------|------|---||||--- 14 [M] COG3409 Putative peptidoglycan-binding domain-containing protein ---|||||---||||-||||--||--|----|||||||-||||||||-||---------------- 13 [H] COG0095 Lipoate-protein ligase A ||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 13 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase --|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||-- 13 [G] COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase |||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||| 13 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases ---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||-- 13 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase ----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--||||||||||| 13 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases --||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 13 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases |--|----|----||-|||--|--|-|---|||-||||-|--|||||-|-||---|||-||-|--- 13 [F] COG0737 5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases -----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 13 [M] COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein) --------------------------|||||||-||||----|||||--|---------|-|---- 13 [E] COG1113 Gamma-aminobutyrate permease and related permeases -||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||-- 13 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 13 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component -------------------------|----||||||||----|||||-|----------------- 13 [G] COG1447 Phosphotransferase system cellobiose-specific component IIA ||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--|||||||||||||| 13 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators |||||||||||||--------|----|||-|-----||----|||||-||||-|||---|||||-- 13 [K] COG1522 Transcriptional regulators -------------------|-||||||||||||||||||---|||||-|||||||||||||||||| 13 [D] COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins |-|||||||-|||----|-|||----||||||||||||----|||||-|------|------||-- 13 [K] COG1695 Predicted transcriptional regulators ---|||--|-||||-----|||----|||||---|-||----|||||-||---|||---|||||-- 13 [I] COG1960 Acyl-CoA dehydrogenases --||---------------|-|-----|||||---|||----|||||-||---||---||||||-- 13 [P] COG2076 Membrane transporters of cations and cationic drugs --|-||--|----||---||||----|||--|||||-|||--|||||-|||--|||---|||||-- 13 [L] COG2801 Transposase and inactivated derivatives --------------------|---------|---||||-----------|-|-------||-|--- 13 [S] COG3708 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||--- 13 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 12 [C] COG0022 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit ||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-||||||| 12 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase --|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|-- 12 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase --||-------|-||---|||-----|||-|||||||||||||||||-||-|-|||---|||||-- 12 [L] COG0389 Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair |-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||-- 12 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase ||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||--- 12 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins ---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|--- 12 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase ||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 12 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase --||||----||-||-|--|-|----||||-|--||||----|||||-||-||--|---|||||-- 12 [CR] COG0604 NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 12 [U] COG0681 Signal peptidase I --|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||-- 12 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins ||||--|||||||----|||||--|-||||||||||||||||-||-|-|-|----|---|||---- 12 [P] COG1122 ABC-type cobalt transport system, ATPase component --------------------||---||---||||||||-||||||||-|||----|---------- 12 [G] COG1299 Phosphotransferase system, fructose-specific IIC component ----|------|-----|||------|||-|-||||||---------------------------- 12 [K] COG1725 Predicted transcriptional regulators |-----|------------------------|--|||------------|--|------------- 12 [M] COG1887 Putative glycosyl/glycerophosphate transferases involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC |-||----|-----|-||||-|||-||||||----|||----|||||-||--|--|--||||||-- 12 [T] COG2202 FOG: PAS/PAC domain -|-|----|-------|---------|-------||---------|------|--------|||-- 12 [L] COG3316 Transposase and inactivated derivatives -------------------------------|||-|||---------------------------- 12 [S] COG5578 Predicted integral membrane protein ----------------------------------|||----------------------------- 12 [M] COG5632 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase |||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 11 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase] ||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-| 11 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) |-||------||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 11 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain ||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 11 [R] COG0456 Acetyltransferases |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 11 [E] COG0527 Aspartokinases -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 11 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific ---|||||--||||||-||-------||||||||||||----|||||--|-----|---|||||-- 11 [R] COG0656 Aldo/keto reductases, related to diketogulonate reductase ---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||-- 11 [C] COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases) ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 11 [C] COG1071 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, alpha subunit --|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-||||||||||||| 11 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes --|---||------------|||||-|-----|||-||----|||-|-||||-||-|||-||---- 11 [E] COG1115 Na+/alanine symporter -----------------|||-|--||||||||||||||---------------------------- 11 [K] COG1316 Transcriptional regulator --|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||-- 11 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase ||||--|||||-|----|-|||--------||||||||||--|||-|--|----------|----- 11 [G] COG1363 Cellulase M and related proteins |--------------------|----||||||||||||---------------------------- 11 [S] COG1511 Predicted membrane protein ----|--------||--|||-|----|||-||||||||----|||||--|---------||-||-- 11 [IR] COG1597 Sphingosine kinase and enzymes related to eukaryotic diacylglycerol kinase ----------------||||-|--|-|||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 11 [T] COG2199 FOG: GGDEF domain |-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||-- 11 [P] COG2217 Cation transport ATPase ---|||-----||--------|----||||----||||-----------|-----|---||||--- 11 [R] COG2329 Conserved protein involved in polyketide biosynthesis related to monooxygenase ---------------------|----||||||||-|||-----------|---------|------ 11 [TQ] COG2508 Regulator of polyketide synthase expression -----------|-||---||-------|||||||-|||----|||||-||-|-|||--||||||-- 11 [E] COG2755 Lysophospholipase L1 and related esterases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 10 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase |||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||--- 10 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 10 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation) ||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--|||||||| 10 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 10 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase --|----------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 10 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein |-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 10 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase |------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||| 10 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit |||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---||||||| 10 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 10 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein ---|---------||-|-||-|----|----|--||||----|||||-|||-|--|---|||||-- 10 [MG] COG0702 Predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerases |-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-|| 10 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin --------|---|||--|||----|||||-||-|||||----|||||--|||---|---||||--- 10 [G] COG1070 Sugar (pentulose and hexulose) kinases |-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 10 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 10 [G] COG1109 Phosphomannomutase --------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|-----|||-||||--- 10 [E] COG1174 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, permease component --|||||||--||----|||-|--||----|---|||||||--------|-----|----||---- 10 [R] COG1277 ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component ---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---||||||| 10 [K] COG1278 Cold shock proteins ||||||||||------||--||--||----|||||||||-|||||-|---------|||||----- 10 [R] COG1418 Predicted HD superfamily hydrolase -----------------|------------|----|||----|||||-|----------||-|--- 10 [G] COG1486 Alpha-galactosidases/6-phospho-beta-glucosidases, family 4 of glycosyl hydrolases --|---||--|-|-----||-|----||||||||||||----|||||--|--|--|---||||||| 10 [V] COG1680 Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins --------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 10 [M] COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase ||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--|| 10 [P] COG2111 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhB subunit ---|---------||---||-|----|||||-----||-----------|--|--|--||||||-- 10 [Q] COG2124 Cytochrome P450 -------|------|--|--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---|||---- 10 [F] COG2233 Xanthine/uracil permeases -----|--------------||----|||--|||||-|----|||||-|||----|---|||||-- 10 [L] COG2963 Transposase and inactivated derivatives -------------------------------||||----------------------------|-- 10 [R] COG3942 Surface antigen --------------------------|||-|-||||||---------------------|-|---- 10 [S] COG4129 Predicted membrane protein --------------------|-----------||||||---------------------------- 10 [T] COG4753 Response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain --|----------|||---|----------|-|--|------|||||--|-----|---------- 10 [S] COG4886 Leucine-rich repeat (LRR) protein ||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||-- 9 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase --||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 9 [E] COG0031 Cysteine synthase ||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--|||||||| 9 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters -------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||-- 9 [G] COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase |-||||--|-|||||||-||-|-----||--|--||||----|||||-||-||--||-||||||-- 9 [I] COG0365 Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases ||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-|| 9 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase ||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 9 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning ||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||---- 9 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component ----||-----|------||-|--||||||||--||||----|||||||||||||||||--|||-- 9 [S] COG0586 Uncharacterized membrane-associated protein ||||--||||-||----|||||----||||||||||||||||-||-|---|--------|||---- 9 [P] COG0619 ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters -||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||-- 9 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 9 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases |-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||-- 9 [R] COG0824 Predicted thioesterase ||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||-- 9 [R] COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily) |---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----||| 9 [D] COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis |-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 9 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component --||-------------|--||||||-----|||||||||||------|-------||||||||-- 9 [E] COG1164 Oligoendopeptidase F ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 9 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases |||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||-- 9 [M] COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase ---|-------|-||---||-|----||||-|--||||----|||||-|||----|---||||--- 9 [C] COG1252 NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit --||---------||-|||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||| 9 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains -----------------|--||||------||||||||---------------------------- 9 [S] COG1302 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|||----|--||||||||||-|||||||-||||||||--||||||-- 9 [P] COG1393 Arsenate reductase and related proteins, glutaredoxin family --------------------||---||---||||||||-||||||||-||||---|---------- 9 [G] COG1445 Phosphotransferase system fructose-specific component IIB ----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-||||||| 9 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes ||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||--- 9 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase ----|------|-----|--||----|||-|||-||||----|||||-||---|||---|||||-- 9 [K] COG1802 Transcriptional regulators |-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---||||||| 9 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family --|||||||-||--|-|----|----|||--|||||||----|||||-||||---|||||||||-- 9 [Q] COG2050 Uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism -----------------|||-|||---||-|---||||---------------------------- 9 [T] COG2172 Anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase) -|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|-- 9 [R] COG2252 Permeases ---|-----------------|----|---------||----|||||-----|----------|-- 9 [S] COG2311 Predicted membrane protein -------------||-----||---------|--||-|----||||-----|-------||||--- 9 [G] COG2376 Dihydroxyacetone kinase --------------------------|||--|--||||----|||||--||||--||||||-|--- 9 [G] COG2814 Arabinose efflux permease --------------------|---------||||||||----|||||-||--|--|---|||||-- 9 [KT] COG3279 Response regulator of the LytR/AlgR family --|-||-----|------|--------||-||-----||----||||--------|----|-|--- 9 [L] COG3328 Transposase and inactivated derivatives -----------------|---|--------||---|||---------------------------- 9 [S] COG3584 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------||-|-----|||||-------------|-|--- 9 [E] COG3591 V8-like Glu-specific endopeptidase |--------|----------------|---||||||||---------------------------- 9 [M] COG3764 Sortase (surface protein transpeptidase) ----------------|-------------|----|||----|||-|--|-----|---------- 9 [KT] COG3829 Transcriptional regulator containing PAS, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains -------------------------------|||-|||---------------------|------ 9 [G] COG4209 ABC-type polysaccharide transport system, permease component -|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 8 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase |||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||-- 8 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 8 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 8 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 8 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit |-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 8 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit -|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 8 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 8 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) --|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 8 [C] COG0281 Malic enzyme ||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||------- 8 [S] COG0327 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-| 8 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase -------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||-- 8 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase |||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 8 [I] COG0439 Biotin carboxylase |-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 8 [R] COG0546 Predicted phosphatases --||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|----- 8 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family --||--|||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 8 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases --------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 8 [J] COG0566 rRNA methylases |-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-|| 8 [ER] COG0591 Na+/proline symporter ||||--||-|-------|||||----||||||||||||||||--------------|||||||||| 8 [R] COG0595 Predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily ----------------|||-|-----|||||-|||||||||||--||----|----|||-|||-|| 8 [G] COG0698 Ribose 5-phosphate isomerase RpiB --|------|-|----||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 8 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 8 [O] COG0719 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 8 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase |||------|-|----|--|||--------||||||||----|||||-||||-|||||||||---- 8 [O] COG0826 Collagenase and related proteases ----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 8 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases ------------------||-|----|||-|---||||----|||||||||||||||||||||||| 8 [P] COG0861 Membrane protein TerC, possibly involved in tellurium resistance ----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||-- 8 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases --||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||-- 8 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily -----------------|---|--------||||||||---------------------------- 8 [J] COG1098 Predicted RNA binding protein (contains ribosomal protein S1 domain) -||---||-|||||||-||||----|----||||||||||||------|----||----------- 8 [R] COG1161 Predicted GTPases --|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 8 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes -------------------|----------||--||||-||||||||--||----|---||-|--- 8 [I] COG1182 Acyl carrier protein phosphodiesterase ---|--------------------|-|||-----||||----|||||-||||-||-----|----- 8 [M] COG1292 Choline-glycine betaine transporter -----------------|--||----|||-||||||||||||-------|---------------- 8 [S] COG1307 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 8 [N] COG1344 Flagellin and related hook-associated proteins --|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-| 8 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase -----------------|-------------||-|||-----|||||-||-----|-----|---- 8 [NU] COG1705 Muramidase (flagellum-specific) |--------|--------||-------||||----|||----------|||--||||||||||||| 8 [S] COG1714 Predicted membrane protein/domain --------------------||----||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 8 [E] COG1760 L-serine deaminase --||||--|--|-||--|-|||----|||-|||-||||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 8 [C] COG1902 NADH:flavin oxidoreductases, Old Yellow Enzyme family ------------------||-|----||||||--||||----|||-|--|-----|--|||----- 8 [S] COG1937 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||-- 8 [L] COG1943 Transposase and inactivated derivatives |||---||||--|-----------------|---||||----|||||--|-|-------------- 8 [R] COG1988 Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolases --------|----|--||-|||----|||-||||||||-----------|--||||||||||-|-- 8 [R] COG2070 Dioxygenases related to 2-nitropropane dioxygenase ||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--| 8 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold ------------------|--|--------------||-----------|---------||||--- 8 [S] COG2318 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------|----|-|---|||---||---|---||||-----------|---------|||||-- 8 [S] COG2340 Uncharacterized protein with SCP/PR1 domains --------------------||----|||-||||||||---------------------------- 8 [S] COG2357 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------||----|||||---||||----|---|-||--|-||--||||||-- 8 [K] COG2378 Predicted transcriptional regulator ---------------------|--------||||||||----|||||-|--|---|---||||--- 8 [K] COG2390 Transcriptional regulator, contains sigma factor-related N-terminal domain --------------------------|---|-||||-|-||-|||-|-|--|-------------- 8 [G] COG3414 Phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component --|--------|-------||-----||||--||---|-------|---|---||----||-||-- 8 [L] COG3547 Transposase and inactivated derivatives ------||----------------------||---|||-------|-------------------- 8 [S] COG3595 Uncharacterized conserved protein ------------------||-|----||||||||||||-|-------------------------- 8 [D] COG3599 Cell division initiation protein ---|----|----------------------|||||||---------------------------- 8 [S] COG3679 Uncharacterized conserved protein ------------------------------||||||||---------------------------- 8 [L] COG3935 Putative primosome component and related proteins ---|||--||-||----|||||----||||||--||||----|||||--|-----|---|||||-- 8 [MR] COG4948 L-alanine-DL-glutamate epimerase and related enzymes of enolase superfamily --------------------|---|-|||||---||||----|||||-||||||||---||||||| 8 [L] COG4974 Site-specific recombinase XerD ------------------||----------|---||||---------------------------- 8 [R] COG4980 Gas vesicle protein ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 7 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase |||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 7 [G] COG0061 Predicted sugar kinase |||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 7 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase |||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||-- 7 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases -|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||-- 7 [H] COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase ||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||---- 7 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components -|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||-- 7 [G] COG0176 Transaldolase |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 7 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 7 [J] COG0199 Ribosomal protein S14 |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 7 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases |-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 7 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase ||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||--- 7 [C] COG0247 Fe-S oxidoreductase --|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-| 7 [H] COG0262 Dihydrofolate reductase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 7 [J] COG0267 Ribosomal protein L33 --||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||-- 7 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases |||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 7 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase ----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 7 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III |||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 7 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase |-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-||||||||||||||| 7 [C] COG0372 Citrate synthase -----||----|-||--|||-------||--|||-|-|----|----------------------- 7 [G] COG0383 Alpha-mannosidase |-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||-- 7 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase --||---------||---||------|||-||||||||----|||---|-----------|--|-- 7 [S] COG0398 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|----- 7 [L] COG0420 DNA repair exonuclease |||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||-- 7 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases |||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 7 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein --|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||-- 7 [L] COG0514 Superfamily II DNA helicase --|----------||-|-||||----|||-----|-||----|||||-||--||||||-|||||-- 7 [R] COG0523 Putative GTPases (G3E family) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 7 [L] COG0550 Topoisomerase IA -||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-| 7 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters |-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 7 [P] COG0605 Superoxide dismutase |||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||-- 7 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent) --|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 7 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase --|--|--|--|-||--|||-|--|-|||||||-||-|----|||||-||--|--|---||-||-- 7 [I] COG0657 Esterase/lipase --|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||-- 7 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating) |||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--|||||||||||||| 7 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel ||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-||||||| 7 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 7 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC -|||--|||-------|---|-|||-|------|||||----------|-||-||-|||------- 7 [R] COG0733 Na+-dependent transporters of the SNF family ----------------||||----||----||||-|||----|||||||||||||||||||||||| 7 [M] COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains) -------------||------|----|-------||||----|||||-||||-||||||||||--- 7 [P] COG0753 Catalase -------------||---------------||--|||-----|||||--|-----|||-------- 7 [E] COG0833 Amino acid transporters ---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 7 [C] COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1 ----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-|||||||||||||||||| 7 [M] COG0845 Membrane-fusion protein --||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--|||||||||||||| 7 [CP] COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit ----|||||-|||----||||-||---|||----||||----||||--||---|||--||--|--- 7 [P] COG1055 Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases |||||||||||||--|||--|----------||||||||-||------------------------ 7 [R] COG1078 HD superfamily phosphohydrolases ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 7 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component ||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|-- 7 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases ||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-|||||||||||||| 7 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component ||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||-- 7 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III ||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---||||||| 7 [R] COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I ---|||--|-|||-------||-----||||---|-||----|||||-||-----|---||||||| 7 [I] COG1250 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase ||||||||||||||||-|--|---------||||||||---------------------------- 7 [J] COG1358 Ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a) -----------------|------------|||-|||-----|||-|-||||-||-|||||-|--- 7 [M] COG1368 Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily |||-||||||---||-||--||-----||-||--||||----|||||-|-----------|----- 7 [ER] COG1387 Histidinol phosphatase and related hydrolases of the PHP family --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 7 [P] COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen --------|----||--|---|---|||||||||||||-|--|||||-|--|-------------- 7 [G] COG1482 Phosphomannose isomerase ----||----||-||--|-|----------||-|-|-|----|||||--------|---|---|-- 7 [G] COG1501 Alpha-glucosidases, family 31 of glycosyl hydrolases ---|----||-|---------|---|--------|-||----|||-|-||||-||||||--|---- 7 [C] COG1620 L-lactate permease ---|----|-||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 7 [C] COG1622 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2 -----------------|------|---------||||---------------------------- 7 [R] COG1647 Esterase/lipase --||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 7 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components ---|--|||-|-|||-|--|------|||-|||-||||----|||||-||-----|------||-- 7 [H] COG1893 Ketopantoate reductase -------------------|------------|-|-||----|||||-|-||----||-----|-- 7 [F] COG1972 Nucleoside permease ---|--|||-|||-----||-------||-|----|||----|||--------------||-|--- 7 [K] COG2002 Regulators of stationary/sporulation gene expression --|-----------------||---|----||||||||----|||||-|-||------|-|--|-- 7 [E] COG2195 Di- and tripeptidases ----------------|-||-|---||||||----|||----|||||-||--|--|---||||||| 7 [T] COG2200 FOG: EAL domain -----------------||||-|||--||-|---||||----------||----------|-|--- 7 [TK] COG2208 Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit --|-----------|-----|---------|----||||---|||||-||||-||||||-|-||-- 7 [R] COG2249 Putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B) ------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 7 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase ---|---------------|-|--------||||||||----|||||-||||||||---------- 7 [R] COG2333 Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily) -------------------|------|||-||--||-|----|||-|--|-----|----|-||-- 7 [S] COG2764 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|-----|---||----|||-|-|----------------- 7 [T] COG3290 Signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism ---|------|--------||-----|----|--|--|-|||||||---|---------||-||-- 7 [P] COG3639 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component --|--------------|--------|||-|---||||-----------|-----|---||-||-- 7 [S] COG3832 Uncharacterized conserved protein ------------------------------|-----||--------------|------------- 7 [R] COG3858 Predicted glycosyl hydrolase -----------------|--|-|||||||-||-||||-||--|||||-||||---|||-||||--- 7 [E] COG4166 ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component ---|---------------|--------------|--|-------|---------|----|----- 7 [Q] COG4264 Siderophore synthetase component ------------------|||--------------|------|||-|------------------- 7 [QC] COG4577 Carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein --|------------------------||-----||-|-----|||---------|---||-|--- 7 [L] COG4584 Transposase and inactivated derivatives ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 7 [N] COG4786 Flagellar basal body rod protein -------------------------------|---|-|---------------------------- 7 [M] COG4932 Predicted outer membrane protein |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 7 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase ------------------------------|---|-||---------------------------- 7 [M] COG5577 Spore coat protein |||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 6 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase -------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 6 [G] COG0021 Transketolase ||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||-- 6 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 6 [E] COG0069 Glutamate synthase domain 2 |||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---||||||| 6 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein) ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 6 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase |||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 6 [Q] COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway) -------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 6 [H] COG0196 FAD synthase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 6 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein ||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--|||||| 6 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase ||-||||||||||---|-||-|----|||-------||----|||||-||||---|||||||||-- 6 [C] COG0243 Anaerobic dehydrogenases, typically selenocysteine-containing --||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-||||||||| 6 [C] COG0280 Phosphotransacetylase --|----|---|-|||---||-----||||||||||||-----------|-|---|---||-||-- 6 [R] COG0300 Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase ||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|--- 6 [P] COG0306 Phosphate/sulphate permeases |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 6 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase --||---------||---||||----|||-|----|||----|||-|-||-|---|---|||||-- 6 [R] COG0384 Predicted epimerase, PhzC/PhzF homolog ---|---------||---||-|----|||--|||||||--|||||||-||-|-|||---||-||-- 6 [R] COG0431 Predicted flavoprotein ||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 6 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains |||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 6 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 6 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ) |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 6 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase ||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||---- 6 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters |||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--|||||||| 6 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 6 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 6 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II |-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||-- 6 [E] COG0520 Selenocysteine lyase |||||||||||||---||||-|-----||-||--|-||-----------|-----|----|-|--- 6 [R] COG0535 Predicted Fe-S oxidoreductases |||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||------- 6 [L] COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I |||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----|||||||||||||||||||||||| 6 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase ----------------|||||||||||||-|||||||||---|||||||||||||||||||||||| 6 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases ---|--|||--||||-||--|-----|||--|||||||----|||||--|--------|||||||| 6 [G] COG0647 Predicted sugar phosphatases of the HAD superfamily ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase) ------------------||-|-----|||-|--||||----------|-------||--|-||-- 6 [E] COG0686 Alanine dehydrogenase -||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||-- 6 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid) |||||||||||||---||||-|---||||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 6 [R] COG0714 MoxR-like ATPases -||-----||---||--|||||||--|---|--||-||----||||--||||---|---|||||-- 6 [P] COG0715 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components |||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1 -------------|||||||||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase ----------------||||||||------||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases --|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||-- 6 [F] COG0775 Nucleoside phosphorylase ----||----------||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein --------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [M] COG0787 Alanine racemase --||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC --||--|||--------|||----||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 6 [NT] COG0835 Chemotaxis signal transduction protein -|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-|||||| 6 [MG] COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases -----------------|--||---||||-||||||||--|||||||-||||---|---------- 6 [G] COG1105 Fructose-1-phosphate kinase and related fructose-6-phosphate kinase (PfkB) --------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|------||-||||--- 6 [E] COG1125 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, ATPase components ------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 6 [P] COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component |--|---||-|-|----|||-------||-||||||||---------------------------- 6 [C] COG1141 Ferredoxin ------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||-- 6 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase -||-|||||-|||----|-|-|---|--|-||||||||----|||||-||-|---|----|-|--- 6 [C] COG1254 Acylphosphatases --||||--|-------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 6 [C] COG1271 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1 |-|-||--|||||----||--|----|---------||----|||||-|||||--|--||||||-- 6 [E] COG1280 Putative threonine efflux protein --------------------|---|-|-----||||||-|--|||-|-||--------|||||--- 6 [P] COG1283 Na+/phosphate symporter --||------------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 6 [C] COG1294 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2 --||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-|||| 6 [C] COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 6 [M] COG1346 Putative effector of murein hydrolase --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 6 [R] COG1380 Putative effector of murein hydrolase LrgA |-|-------|-----|--|-|||--||||||---|||----|------------||||-|-|--- 6 [R] COG1408 Predicted phosphohydrolases |-|||||||--||||-||--|-----|---||-|||||----|||||-||-|---|---||||--- 6 [C] COG1454 Alcohol dehydrogenase, class IV ||||---||----------|-|--------||||||||-----------|-------------|-- 6 [K] COG1476 Predicted transcriptional regulators |||-|||||-------|---|----|----|||||||||-||------------------------ 6 [L] COG1658 Small primase-like proteins (Toprim domain) ---|----|----------|||-----||-|||||||-----|||-|--|-----|||-||||--- 6 [M] COG1732 Periplasmic glycine betaine/choline-binding (lipo)protein of an ABC-type transport system (osmoprotectant binding protein) ---|--||----|-------|----|----|---|-||-------||-|-||-||-|||------- 6 [C] COG1757 Na+/H+ antiporter ----||---------------|----|----|--|||---|||||-|-||--|--|---|||||-- 6 [O] COG1764 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation ---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 6 [C] COG1845 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3 --|--------------|--|---|-|--|||----||----|||||-||||---|---|||||-- 6 [G] COG1879 ABC-type sugar transport system, periplasmic component ----||-----|-||----|||----||||||-|||||----|||||--|||||||---||||--- 6 [P] COG1914 Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family --------------------|||||||---||||||||||||||||||||||||||---|||||-- 6 [G] COG1925 Phosphotransferase system, HPr-related proteins ------------------|||------||||--|||||----|||||-||||---|----|----- 6 [E] COG1982 Arginine/lysine/ornithine decarboxylases --|-----|---------||-|----||||------||----------||---|||||||||||-- 6 [C] COG2010 Cytochrome c, mono- and diheme variants --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 6 [P] COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component ---------|---|------|---------|||||||-----|||||-||||-------------- 6 [P] COG2116 Formate/nitrite family of transporters ---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||-- 6 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis ----|-||--|||----|---|---------|||||||----|||||-|----------|------ 6 [G] COG2182 Maltose-binding periplasmic proteins/domains |----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----||||||| 6 [P] COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain) ---|-------|-||----|-|----||||----|-||----|||||-||||-|||---|||||-- 6 [S] COG2259 Predicted membrane protein -------||----||--|-|||----||||||--||||----|||||-||||---|---|||||-- 6 [I] COG2267 Lysophospholipase ---|--|--|--|---|----|---|-------|||||---------------------||||--- 6 [E] COG2309 Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T) ----------|-|--------|----|-----||||||---------------------||||--- 6 [R] COG2514 Predicted ring-cleavage extradiol dioxygenase --|-----------------|-----|---|-|-|-||----|||||-||||-|||---------- 6 [GE] COG2610 H+/gluconate symporter and related permeases ---|-------|---------|----|---|---||||----------|---|--|---|||||-- 6 [Q] COG2761 Predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis -----------------------------------||-----|||||-||||-------------- 6 [T] COG3103 SH3 domain protein ----------------------------------||||----||||||-|--|--|---|-|||-- 6 [C] COG3125 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 4 --|-----------------|-----------|-||||----------||---||-------||-- 6 [S] COG3212 Predicted membrane protein --------------------|---------|---|-||----|||-|-|-----------|----- 6 [S] COG3314 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||||||------------------------ 6 [R] COG3331 Penicillin-binding protein-related factor A, putative recombinase --|----------|----|||------||-|---|--|----|--||-||----------|----- 6 [L] COG3344 Retron-type reverse transcriptase ----------|--------|----------|-----||-----||-|--|---------------- 6 [P] COG3546 Mn-containing catalase -------------------------------||-|||------|||-------------------- 6 [S] COG3645 Uncharacterized phage-encoded protein ------------------------------|-----||---------------------|||||-- 6 [M] COG3773 Cell wall hydrolyses involved in spore germination ----|--|--||-----|---|---------|||||||-|--|||||-|----------------- 6 [G] COG3833 ABC-type maltose transport systems, permease component |||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||--- 6 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components --------------------|---------||||||||---------------------------- 6 [S] COG4224 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|-----|---||----|||-|-|----------------- 6 [KT] COG4565 Response regulator of citrate/malate metabolism --------------------------|---||-|-|-|---------------------------- 6 [V] COG4767 Glycopeptide antibiotics resistance protein -------------------------------|||||||---------------------------- 6 [OTN] COG4862 Negative regulator of genetic competence, sporulation and motility -------------------------------||-|||----------------------------- 6 [G] COG4975 Putative glucose uptake permease ----------------------------------||-|---------------------------- 6 [M] COG5386 Cell surface protein -------------------|--------------|-||---------------------------- 6 [S] COG5609 Uncharacterized conserved protein ||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||-- 5 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||| 5 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5) ||-||||||||--|--|||-------|||-|--||-||---------------------------- 5 [S] COG0011 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase ||||||-|||---|||--||-|----|||--|-||||-----|||||-||-||------|--|--- 5 [P] COG0025 NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit |||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||-- 5 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [J] COG0080 Ribosomal protein L11 ---|||--|-|||||-|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 5 [O] COG0109 Polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor) ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 5 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 5 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 5 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase ||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---||||||||||||| 5 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases -|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 5 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes --||||||--|||||----|-|----|||||---|-||----|||||-|||----|---||||--- 5 [E] COG0160 4-aminobutyrate aminotransferase and related aminotransferases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 5 [E] COG0174 Glutamine synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY |||-----||---|||----||----||||||||||||-|||||||||||||||||---|||||-- 5 [F] COG0207 Thymidylate synthase ---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-||| 5 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit |--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-|||||||||||||||||| 5 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit -------------|---|--------|---||-||-||-||-||||||||-|---|---|||||-- 5 [G] COG0246 Mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenases --||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---||||||| 5 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family) ---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 5 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family |||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|---- 5 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D ||------||------|||||-||--|||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [J] COG0254 Ribosomal protein L31 |--|||----|-|---||||-|--|-|||||||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 5 [F] COG0274 Deoxyribose-phosphate aldolase --|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-|| 5 [C] COG0282 Acetate kinase ||||---||----------|-------||--|||||--|||-|||-|-|||||||||||-||-|-| 5 [V] COG0286 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [L] COG0305 Replicative DNA helicase ----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-| 5 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [J] COG0333 Ribosomal protein L32 --|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 5 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit) |||||||||||-||||----------||||||---|||----|||||-||--|-------|-|--- 5 [E] COG0367 Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing) -------------|||--||--||----------|-||----||||||||--|||----|-|-|-- 5 [P] COG0369 Sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein) ||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----|| 5 [M] COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase --|----------|--|-||------|--|----|-||----|||||--|---|||---|||||-- 5 [R] COG0385 Predicted Na+-dependent transporter -------------|||--|-|-----|---|||||||||---|||||--|--||||-------|-- 5 [O] COG0386 Glutathione peroxidase -------------||---||-|||-------|--||||----|||----|--|------||||-|| 5 [R] COG0400 Predicted esterase ||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||-- 5 [O] COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase |||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--||||||||||| 5 [O] COG0450 Peroxiredoxin |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| 5 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases |||-|--------||||-|||-----||||||||-||||||||||||--|----------|||--- 5 [P] COG0474 Cation transport ATPase |||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-|||||||||||||| 5 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components |-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 5 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2 ||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--|||||||| 5 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family |||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||-- 5 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function ---|---------||---||-|----|||-----|-||----|||||--|-|-|||||||||||-- 5 [E] COG0506 Proline dehydrogenase ---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||-- 5 [E] COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding) |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 5 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain |||||||||-|||||||-||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases ---|---------||--|||-|-|||----|||||||||-|||||||-|-||-------------- 5 [F] COG0572 Uridine kinase |-------|--|-|||-||-||---|----||||||||-|||||||||-||||--|---|||||-- 5 [G] COG0580 Glycerol uptake facilitator and related permeases (Major Intrinsic Protein Family) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit --|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---||||||| 5 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases -||-----||-------|||||||--|---|--||-||----||||---|||---|---|||||-- 5 [P] COG0600 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component ||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 5 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes ||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 5 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease -------------|||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase ||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K -----------------|||||----|||||---||||----|||||-||-----|---|||||-- 5 [E] COG0646 Methionine synthase I (cobalamin-dependent), methyltransferase domain ||||-||||-|||----|||-|----|||-----||||----|||-|-||---------|||--|| 5 [CP] COG0651 Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit -------------||---||-|----|||-----|-||----|||||-||-|||||---||||||| 5 [HC] COG0654 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases |||-----||-|-||-|---||-----||||--|||||----||-||-||--|--|---|||-|-| 5 [R] COG0655 Multimeric flavodoxin WrbA --|----------||||-||--||--||||-|---|||----|||-|-||-|---|||-||-|--- 5 [P] COG0659 Sulfate permease and related transporters (MFS superfamily) -------------|||----||||-|||||-||||||||||||||||||||||||||||||----- 5 [L] COG0692 Uracil DNA glycosylase --|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 5 [O] COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase ---|--------------||||--|||----|||||||-|--|||||-|||||--|||||-|-||| 5 [P] COG0783 DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant) ----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-|||||||||||||||||| 5 [M] COG0793 Periplasmic protease ----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 5 [M] COG0796 Glutamate racemase ----------------||||||---|----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase) --||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||| 5 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation -|-------------------------|||||||||||------------|-----||-|--|--- 5 [L] COG0827 Adenine-specific DNA methylase ------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|-- 5 [K] COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family ---------|------||--||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [D] COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division |||-----||-----------|---|----|----|||----|||--------------||||--- 5 [F] COG1001 Adenine deaminase ||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--|| 5 [P] COG1006 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit -----------------|---|--------||||||||-|--|||||||-------||-||-|--- 5 [G] COG1015 Phosphopentomutase ----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 5 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases --------|----||---||-|----|---|---|-||-|--------||--|--|---------- 5 [R] COG1075 Predicted acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold --------------------|-|||-|---|-|||-|-----|||||-||||-------------- 5 [E] COG1114 Branched-chain amino acid permeases -||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||-- 5 [P] COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 5 [GM] COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component --|-------------|||||----||||||||||||||||||||||-||||||||------|--- 5 [R] COG1162 Predicted GTPases ---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 5 [E] COG1171 Threonine dehydratase |-||--||--------||||||---|----||||||||------------------|||------- 5 [L] COG1193 Mismatch repair ATPase (MutS family) |--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 5 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase |--||||-|--|-|---|--||-----||-|-|-|-||-------||-||-----|---|||||-- 5 [Q] COG1228 Imidazolonepropionase and related amidohydrolases ||||-------||-----||-|----|||-----||-|-----------------|------||-- 5 [Q] COG1233 Phytoene dehydrogenase and related proteins --|-------|-|-----||-|----|---||-|||||----|||-|-||-----|---|||||-- 5 [M] COG1247 Sortase and related acyltransferases |||---||-||-|---|---|-----------|--|||----|||||-||||-||||||-----|| 5 [I] COG1267 Phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins |-||--|||--------||||||-|-|---||||||||---------------------||||-|| 5 [R] COG1268 Uncharacterized conserved protein |-|---||||||----||||-|-----||||----|||-----------||||--|---||-||-- 5 [E] COG1305 Transglutaminase-like enzymes, putative cysteine proteases ||||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|| 5 [P] COG1320 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhG subunit --||--------------|-||----|||-||-|-||-----|||||-||-|-|||---||-||-- 5 [S] COG1359 Uncharacterized conserved protein -----------------|||------|||||-----||----|||-|-||---|||---||||--- 5 [S] COG1376 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|---|-----||-|||-||||-------------|---------- 5 [F] COG1428 Deoxynucleoside kinases -----------------|---|-|--||||||||||||----|||||-|-||-------------- 5 [K] COG1438 Arginine repressor -----------------|--||----|||-||||||||||||------------------------ 5 [R] COG1461 Predicted kinase related to dihydroxyacetone kinase |||-|||||||||---||-|-|----|---|---|-||----|||||--|-----|---|||||-- 5 [J] COG1514 2'-5' RNA ligase ||-|--||-|---||-|--|------|-------|-|--|||-------|||-||---|||||--- 5 [L] COG1525 Micrococcal nuclease (thermonuclease) homologs --|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|------- 5 [L] COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins ---|||----|||--------|||--|-------||||----||||||||||-|||||||||||-- 5 [I] COG1607 Acyl-CoA hydrolase ----||------------||||--|-----||-|-|||-|--|||-|-||---|||--------|| 5 [V] COG1619 Uncharacterized proteins, homologs of microcin C7 resistance protein MccF -------------||--|--------|---|-|||-||-----||---|--|---|---|------ 5 [G] COG1621 Beta-fructosidases (levanase/invertase) -|||--||||------|-||-|||||----||||||||-|||------------------------ 5 [S] COG1624 Uncharacterized conserved protein -----------------||-|---|-|---------||----|--||-||||---|---||-||-- 5 [G] COG1638 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, periplasmic component ||||--|||-|||----|---|--------||-|||||--------------|----------|-- 5 [CP] COG1668 ABC-type Na+ efflux pump, permease component |||---|||||||---||------------|---|-----------|---|--------||----| 5 [R] COG1708 Predicted nucleotidyltransferases -----------------||-||--|-----||||||||||||------------------------ 5 [H] COG1713 Predicted HD superfamily hydrolase involved in NAD metabolism ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-|||||||-------|-----|---||||--- 5 [R] COG1744 Uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein --||--|||--------|------|-----|----|||----------|-------|||------- 5 [NT] COG1776 Chemotaxis protein CheC, inhibitor of MCP methylation ---------------------|------------||||----|||||-||--||||---||||||| 5 [S] COG1806 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------|-----|-|||---||||-||||||||-|--|||||-|||||------|||||-- 5 [G] COG1820 N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase ||||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|| 5 [P] COG1863 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 5 [NU] COG1886 Flagellar motor switch/type III secretory pathway protein ------------------|-------|||-||||||||----|||||-||||-||----------- 5 [G] COG1929 Glycerate kinase -----------------|--|---------|---||||----|||--------------------- 5 [K] COG1954 Glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (mRNA-binding) --|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--| 5 [L] COG2003 DNA repair proteins ----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||-- 5 [G] COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes -|---------------|||||---||---------||-|--------||-----|---||-||-- 5 [P] COG2059 Chromate transport protein ChrA ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||-- 5 [P] COG2060 K+-transporting ATPase, A chain --------|-----------|----|----|---||||---------------------------- 5 [M] COG2088 Uncharacterized protein, involved in the regulation of septum location --|---||-|-|-|||-----|----||||----|-||----|--|-------------||||--- 5 [S] COG2120 Uncharacterized proteins, LmbE homologs |||-||||-||||----|---|----||||-|||||||----|---------|--|---|||||-- 5 [R] COG2151 Predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme ----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||-- 5 [NU] COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG ---------------------|----|||||----|||----|||||-||||-|||---|||||-- 5 [K] COG2186 Transcriptional regulators |-||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|- 5 [P] COG2212 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit ----------------|---------||||----|-||----|||-|--|-----|----||-|-- 5 [P] COG2223 Nitrate/nitrite transporter -|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 5 [R] COG2262 GTPases -------------------|-|-----||-|---||||----|||-------|||----|||---| 5 [T] COG2337 Growth inhibitor --|------------------|--||------|||------------------------------- 5 [V] COG2348 Uncharacterized protein involved in methicillin resistance ----||----|||--------|----|||||---|||----------------------------- 5 [R] COG2409 Predicted drug exporters of the RND superfamily ----||--|-|||---------------------|||----------------------------- 5 [S] COG2427 Uncharacterized conserved protein -----------------|---|--------|---||||---------------------------- 5 [R] COG2738 Predicted Zn-dependent protease ---------||-------||-|----||||||--||||----|||||-||-----|---|||||-- 5 [K] COG2771 DNA-binding HTH domain-containing proteins --------------------------|-----|-|-||-----------|--|||---|------- 5 [C] COG2851 H+/citrate symporter -------------------|||---|-||-|--|||||--------------||-|-----|---- 5 [E] COG2856 Predicted Zn peptidase --------------------|---------||||-||-----|||||----|||||---|||||-- 5 [G] COG2893 Phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA --------------------|-----||-||---||||-----------|---------------- 5 [S] COG3323 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------||------------------|||------- 5 [R] COG3401 Fibronectin type 3 domain-containing protein --------------------|---------||||-||-----|||||----|-------------- 5 [G] COG3444 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB -|-------|----------|---------||||||||----------------------|----- 5 [R] COG3481 Predicted HD-superfamily hydrolase ------------------------------||----||----|-----------------|--|-- 5 [G] COG3507 Beta-xylosidase --------------------|---------||||-||-----|||||----|-------------- 5 [G] COG3715 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC --------------------|---------||||-||-----|||||----|-------------- 5 [G] COG3716 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IID -------------------------------||-||||----|||--------------------- 5 [L] COG3723 Recombinational DNA repair protein (RecE pathway) ------------------------------|-||||-|----|||-|------------------- 5 [G] COG3775 Phosphotransferase system, galactitol-specific IIC component --|------------------|--------|||-||||---------------------------- 5 [P] COG3853 Uncharacterized protein involved in tellurite resistance ---------------------|--------|---||||---------------------------- 5 [S] COG3870 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------||--------|---|||----------------------------- 5 [S] COG3878 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|---|--||-||---------------------------- 5 [M] COG3944 Capsular polysaccharide biosynthesis protein ------||------------------|---|---|-||---------------------------- 5 [S] COG3949 Uncharacterized membrane protein --||--------|-|-|-||||----||||||||||||-----------|---||-------|--- 5 [R] COG4122 Predicted O-methyltransferase -------------------------------|||||||---------------------------- 5 [U] COG4473 Predicted ABC-type exoprotein transport system, permease component -------------------------------|||||||---------------------------- 5 [S] COG4474 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|||--|||---------------------------- 5 [S] COG4722 Phage-related protein -------------------------------|||||||---------------------------- 5 [R] COG4768 Uncharacterized protein containing a divergent version of the methyl-accepting chemotaxis-like domain ----------------------------------||||---------------------------- 5 [S] COG4841 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-|-------|--------|------|---|-----||---------------------------- 5 [KT] COG4978 Transcriptional regulator, effector-binding domain/component --------------------|-----|||--||-||||----|||||-|-||-------|-|-|-- 5 [CO] COG4988 ABC-type transport system involved in cytochrome bd biosynthesis, ATPase and permease components -------------------------------|--|||----------------------------- 5 [S] COG5294 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------|-||-|---------------------------- 5 [S] COG5412 Phage-related protein ----------------------------------||||---------------------------- 5 [S] COG5582 Uncharacterized conserved protein ------------------------------|---||-|---------------------------- 5 [L] COG5655 Plasmid rolling circle replication initiator protein and truncated derivatives --|-----|-----------------|--------||--------------------------|-- 5 [S] COG5658 Predicted integral membrane protein |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 4 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase |||-||--||-|-||-||||-|----|||-||--|||||---|||||--|--||||---|||||-- 4 [P] COG0004 Ammonia permease |||||||||||||||-||||-------||||-||-|||----|--||--|--|------||-|--- 4 [F] COG0005 Purine nucleoside phosphorylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit ||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||------------- 4 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase ---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||-- 4 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase) ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 4 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase |--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||-- 4 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||-- 4 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 4 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 4 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 4 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0048 Ribosomal protein S12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0049 Ribosomal protein S7 ---------|---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 4 [J] COG0051 Ribosomal protein S10 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0052 Ribosomal protein S2 |||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase ||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---||||||||||||| 4 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog) ||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 4 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit |||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 4 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 4 [E] COG0067 Glutamate synthase domain 1 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 4 [E] COG0070 Glutamate synthase domain 3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit ||||--||||--||----||-------||--|---|-|----||||--|-|---------|||--- 4 [E] COG0076 Glutamate decarboxylase and related PLP-dependent proteins ||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||-- 4 [E] COG0077 Prephenate dehydratase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0081 Ribosomal protein L1 ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [E] COG0082 Chorismate synthase -|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||------- 4 [E] COG0083 Homoserine kinase |||---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0084 Mg-dependent DNase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0087 Ribosomal protein L3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0088 Ribosomal protein L4 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0089 Ribosomal protein L23 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0090 Ribosomal protein L2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0091 Ribosomal protein L22 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0092 Ribosomal protein S3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0093 Ribosomal protein L14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0094 Ribosomal protein L5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0096 Ribosomal protein S8 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0098 Ribosomal protein S5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0099 Ribosomal protein S13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0100 Ribosomal protein S11 |||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0102 Ribosomal protein L13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0103 Ribosomal protein S9 ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase |||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 4 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 4 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 4 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||||| 4 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase --||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [C] COG0114 Fumarase -|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||---------- 4 [L] COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 4 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [F] COG0125 Thymidylate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 4 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase |||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--|||||||| 4 [J] COG0130 Pseudouridine synthase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 4 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase ||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase ||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 4 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase --||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 4 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful) ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 4 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase ||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 4 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 4 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase -|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 4 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 4 [G] COG0148 Enolase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 4 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--|||||||| 4 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase ||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [L] COG0164 Ribonuclease HII ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 4 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase -|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 4 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 4 [H] COG0171 NAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-||||||||||||||| 4 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0185 Ribosomal protein S19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 4 [J] COG0186 Ribosomal protein S17 --||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||| 4 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase -------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 4 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase -------------|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [F] COG0194 Guanylate kinase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [K] COG0195 Transcription elongation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0198 Ribosomal protein L24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0200 Ribosomal protein L15 ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0203 Ribosomal protein L17 -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|--- 4 [G] COG0205 6-phosphofructokinase ||||||||||------||||||--||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 4 [D] COG0206 Cell division GTPase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0211 Ribosomal protein L27 -||---|||--------|---|-----||-||-||||||||||||-|-|------|---||-|--- 4 [F] COG0213 Thymidine phosphorylase |||||||||||||||--|--||----|||||--|||||------------||-------------- 4 [H] COG0214 Pyridoxine biosynthesis enzyme --|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0216 Protein chain release factor A -|||--||||---|--||--|---------|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [R] COG0218 Predicted GTPase -------------||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 4 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component -------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 4 [J] COG0227 Ribosomal protein L28 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0228 Ribosomal protein S16 |-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||-- 4 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 4 [J] COG0230 Ribosomal protein L34 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0233 Ribosome recycling factor --|----------||-||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10) ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 4 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 4 [J] COG0238 Ribosomal protein S18 |-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 4 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0244 Ribosomal protein L10 |||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [K] COG0250 Transcription antiterminator |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0255 Ribosomal protein L29 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0256 Ribosomal protein L18 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 4 [J] COG0257 Ribosomal protein L36 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0261 Ribosomal protein L21 --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 4 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts ------------------||-|----||||-||||||||||||||||-||||||||---|||||-| 4 [L] COG0266 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0268 Ribosomal protein S20 ||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||-- 4 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis ----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase) ---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---||||||| 4 [F] COG0283 Cytidylate kinase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase ---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase ||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase |--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [P] COG0288 Carbonic anhydrase |||-----||------||||--||--|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3) -------------|--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0291 Ribosomal protein L35 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0292 Ribosomal protein L20 |||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 4 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes ---|------|-|||--|---|---|-||||||||||||||||||||-|-||-------||-||-- 4 [F] COG0295 Cytidine deaminase --||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 4 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN |||||||||||||----|------|-----|||||||||||||||||-||||-------------- 4 [H] COG0301 Thiamine biosynthesis ATP pyrophosphatase |||||||||||||---|-||-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 4 [H] COG0303 Molybdopterin biosynthesis enzyme |||||||||||||||--|---|----|||||--|||||------------||-------------- 4 [H] COG0311 Predicted glutamine amidotransferase involved in pyridoxine biosynthesis ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [R] COG0313 Predicted methyltransferases |||||||||-|||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 4 [H] COG0314 Molybdopterin converting factor, large subunit |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 4 [H] COG0315 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase --||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---||||||| 4 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase) -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase --|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold ---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [L] COG0328 Ribonuclease HI -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0335 Ribosomal protein L19 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase ----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase ||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 4 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 4 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD |||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase ----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||-- 4 [S] COG0344 Predicted membrane protein ----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 4 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) --|----------|--|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type) --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0359 Ribosomal protein L9 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 4 [J] COG0360 Ribosomal protein S6 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1) -------------|||-|||--||||||||-|-||||-----|||||||-||-||----||||--- 4 [G] COG0362 6-phosphogluconate dehydrogenase ||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||------- 4 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase ||||----||---|--||||-|----||||||||||||----|||||-|--|-------------- 4 [S] COG0391 Uncharacterized conserved protein ||||--||||------||||------|||||---|||-|||||||-|--|--|--|---||||--- 4 [S] COG0392 Predicted integral membrane protein |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 4 [O] COG0396 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, ATPase component ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 4 [E] COG0403 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), N-terminal domain ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--||||---|||||-- 4 [E] COG0404 Glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase) ----||----||||||--||||----|||-----|-||----|||-|-||--||||||-||-||-- 4 [E] COG0405 Gamma-glutamyltransferase --|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 4 [H] COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase ---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 4 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase -------------||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 4 [H] COG0414 Panthothenate synthetase ----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||-- 4 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme |||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||-- 4 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0443 Molecular chaperone -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division -----------------|||||||--||||||-|--||----|||||-|-||-------||-|--- 4 [G] COG0448 ADP-glucose pyrophosphorylase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family) |||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase -|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||-- 4 [G] COG0469 Pyruvate kinase |||||||||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA -------------||-||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [R] COG0486 Predicted GTPase --|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--|||||||| 4 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase ----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [E] COG0498 Threonine synthase ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 4 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase) -|-----------||----|-|||-|-||-||||||||-|--|||||||||||||---|||||--- 4 [L] COG0507 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member -------------||-----|---|------|||||||-||||||||-|-|-----------|--- 4 [M] COG0510 Predicted choline kinase involved in LPS biosynthesis |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit |||||||||||||---|--|-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 4 [H] COG0521 Molybdopterin biosynthesis enzymes |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [F] COG0528 Uridylate kinase -------||---|||-|-|--|-----||-|-----||----||||||||--|--|--|-||||-- 4 [P] COG0529 Adenylylsulfate kinase and related kinases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [R] COG0536 Predicted GTPase ---|||--|-|||||-||||-|-----||--|--||||----|||||--|-|---|||-|||||-- 4 [C] COG0538 Isocitrate dehydrogenases -------------||-||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0539 Ribosomal protein S1 |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||-- 4 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor) ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-| 4 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase ---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||-- 4 [C] COG0554 Glycerol kinase |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex ---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 4 [K] COG0557 Exoribonuclease R |-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||-- 4 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component |||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--|||||||||||||| 4 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein) ---|||-----|-|||--|--|---|||||-|||||||----|||||-|||||--|---||||--- 4 [C] COG0578 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 4 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog) ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation -----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 4 [J] COG0594 RNase P protein component ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase -|||--|||||-|---||||||--|||||-||||||||||||------|----------------- 4 [R] COG0618 Exopolyphosphatase-related proteins ||||--|||||||||--|--|---|----|||||||||-||||||||-||---------------- 4 [R] COG0622 Predicted phosphoesterase ----------------|-||-|||---|||-|--||||----|||-||-|||-||||||||||||| 4 [I] COG0623 Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH) -----|-------||-|-||-|||--||||||||||||||||-------|--|--||--|--|--- 4 [T] COG0631 Serine/threonine protein phosphatase -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit ----------------||--||----||||||-|||||||||||||||||||||||---|||||-- 4 [F] COG0634 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase -|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||-- 4 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases ||||||||--||||||||----||---||||---|||||||||||||||----------------- 4 [L] COG0648 Endonuclease IV |-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family ----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-| 4 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein |||---||||------|||||------||-------||----|||||-||--||||||-|||||-- 4 [G] COG0662 Mannose-6-phosphate isomerase ----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||-- 4 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase ||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--|||||||| 4 [R] COG0679 Predicted permeases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase --|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 4 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0691 tmRNA-binding protein ---|----|----||---||--||----------||||----|||||||||||---|||||||||| 4 [O] COG0694 Thioredoxin-like proteins and domains --||-----------|--||----------|---|||||||||||||-||------||||------ 4 [G] COG0696 Phosphoglyceromutase -------------|||--||-|-----||-----|-||----|||----|-----||||------- 4 [R] COG0699 Predicted GTPases (dynamin-related) --|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [E] COG0703 Shikimate kinase --|-------------|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b -------------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein) |||-----||---||---|||---|-----||||-||-----|||||||||||--||||------- 4 [C] COG0716 Flavodoxins -----------------|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---||||||||||||| 4 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit --||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--|||||||||||||| 4 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 4 [P] COG0725 ABC-type molybdate transport system, periplasmic component ||||-|-||----------|-------||--|||||--|||||||-|-|||||---|||-||-|-| 4 [V] COG0732 Restriction endonuclease S subunits -------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||| 4 [I] COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase) -----------------|||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase |||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||-- 4 [H] COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains ----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-| 4 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake ----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||- 4 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein -----------------||||-||||||||||||||||----|||||-||||---||||||-||-- 4 [S] COG0762 Predicted integral membrane protein |||------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit ----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [K] COG0781 Transcription termination factor -----------------|---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [K] COG0782 Transcription elongation factor ----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [S] COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 4 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 4 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase ----------------||||||--||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase -----------|--------||--|------||||||-|||||||||||-||----||----|--- 4 [F] COG0813 Purine-nucleoside phosphorylase ----------------||||||||--|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis) -----------------|||-|--------||||||||----|||||-|||||||||||||||--- 4 [M] COG0818 Diacylglycerol kinase ----||||--|||||----|------|----|-|||||------------||----|||--|---- 4 [K] COG0819 Putative transcription activator ----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||-- 4 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit ----------------|-||--||||----|||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0828 Ribosomal protein S21 ----------------||||-|----|||||---||||----|||||--|--||||||||--||-- 4 [H] COG0853 Aspartate 1-decarboxylase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 4 [E] COG1003 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), C-terminal domain -|||---||--|----|-||------|||---|---||----|||||-||-||--|--|||||||| 4 [M] COG1004 Predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase --|-|||||-|-|---|-----------------|-||-----------|-----|----|-|--- 4 [O] COG1030 Membrane-bound serine protease (ClpP class) -------------||-----------|||-||--||||---------------------||||--- 4 [C] COG1038 Pyruvate carboxylase --||----------|--|||------||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 4 [E] COG1045 Serine acetyltransferase |||---|||||||---|-||-|----||||||-|-|||-------|--||-----|---|||||-| 4 [F] COG1051 ADP-ribose pyrophosphatase ||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit -------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 4 [H] COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase ---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||-- 4 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA ----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease --------------------|-||||-||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains) --------------------||||-||---||||||||-|||||||||||||||||------||-- 4 [G] COG1080 Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria) ----||------------||------||||----||||----|||||--||||------------- 4 [R] COG1090 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase --|----------||------|----||||-|--||||----|||||----|-------------- 4 [P] COG1119 ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA -----------------|--|---|||----|----||-|--|||||-||||---|---|||||-- 4 [G] COG1129 ABC-type sugar transport system, ATPase component ----------------||--|||||||||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [K] COG1158 Transcription termination factor ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [R] COG1159 GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [R] COG1160 Predicted GTPases ---|--------------||------||||-|--|||-----|||||-||||---------|---- 4 [HQ] COG1169 Isochorismate synthase -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase) -------------||-|||||||||||||||||-||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG1186 Protein chain release factor B -----------------|--|-----|---||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 4 [J] COG1188 Ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit (S4 paralog) --|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||----- 4 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II) ||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--|||||||||||||| 4 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning ----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------||||||| 4 [L] COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway) -||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||-- 4 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases -----------------|||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase ----------------||||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [LK] COG1200 RecG-like helicase ----------------||||||---------|||||||---------------------|||||-- 4 [J] COG1206 NAD(FAD)-utilizing enzyme possibly involved in translation ----------------||||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone |-|-||||||||-||||-||------|---|||-||||----|||||--|-----|---|||||-| 4 [M] COG1215 Glycosyltransferases, probably involved in cell wall biogenesis ------------------||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [T] COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit ----------------||-------|--------||||----|||||||||||--||||||||||| 4 [O] COG1220 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), ATPase subunit -----------------|||----------|----||-----|||||-||-----|---------- 4 [KT] COG1221 Transcriptional regulators containing an AAA-type ATPase domain and a DNA-binding domain --|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||-- 4 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component --||--|-|-|--||-|----|||--||||----||||-------|---------|-------|-- 4 [H] COG1232 Protoporphyrinogen oxidase -|-------|------||--|---------|||-||||----|||||-|----------------- 4 [R] COG1242 Predicted Fe-S oxidoreductase --|-------------|----------||-|---|-||----|||||--|-----|---||-||-- 4 [C] COG1251 NAD(P)H-nitrite reductase -------------|||----||--|||||-||||||||----|||||-||--|||----|||||-- 4 [R] COG1272 Predicted membrane protein, hemolysin III homolog ----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 4 [O] COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family ----------------|-||||--|--||-||-|-|||----|||||--|||---|---|||---- 4 [S] COG1285 Uncharacterized membrane protein ------------------------||-----|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [R] COG1286 Uncharacterized membrane protein, required for colicin V production --------------------|----|------|||-||----|||-|---|------------|-- 4 [S] COG1288 Predicted membrane protein ---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--|||||||||||||| 4 [C] COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 4 [N] COG1291 Flagellar motor component ||||||||||||||||-|||||---|----||||||||------------------|||------- 4 [K] COG1293 Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP --|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 4 [S] COG1295 Predicted membrane protein --|-----|-----------||----|----|-|||||----|||||-||||-|||||-||||--- 4 [E] COG1296 Predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance) |||---||||--|-----||-------||-|---|-||-----------|------------||-- 4 [S] COG1300 Uncharacterized membrane protein ----------------|-|||||||||||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||| 4 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG |||||||||||||----|---||||-||||||||||||----|||-|-----|---------|--- 4 [K] COG1321 Mn-dependent transcriptional regulator ||-------|-------|--|---------||||||||-|-------------------------- 4 [R] COG1323 Predicted nucleotidyltransferase -----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 4 [K] COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains -||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 4 [S] COG1354 Uncharacterized conserved protein --||--------------||-|--|-|||-||---|||----|||||--|-|-------||-|||| 4 [S] COG1357 Uncharacterized low-complexity proteins ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 4 [N] COG1360 Flagellar motor protein |||-----||---||-||||-|----||||||--||||-----------|---|||---|||||-- 4 [E] COG1364 N-acetylglutamate synthase (N-acetylornithine aminotransferase) ------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---||||||| 4 [L] COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) ----------------||||||--||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 4 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-|||||--------|||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 4 [K] COG1386 Predicted transcriptional regulator containing the HTH domain ----------------||||-|----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 4 [R] COG1399 Predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein |-|---|||||-|||-|-||--||--||||||--|||-----|||||-||||---|---|||||-- 4 [R] COG1409 Predicted phosphohydrolases |-||---------|||--||--||||--------|-||----||-----|------------|--- 4 [C] COG1413 FOG: HEAT repeat ---|------------||---|----|||-------||----|||||-||||---|--||||||-- 4 [K] COG1414 Transcriptional regulator -----------------||||-||--||||||||||||||||----------|--|||||||||-- 4 [K] COG1420 Transcriptional regulator of heat shock gene -----------------|-|--||||-----|||||||----|||||-|||||--|--------|| 4 [S] COG1426 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---||-----|----|-|---|---|----|||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 4 [F] COG1435 Thymidine kinase ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||-- 4 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit -----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---||||||| 4 [G] COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases -----------------|--|-----||||||||||||||||------------------------ 4 [S] COG1481 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||--- 4 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase -------------||-||--||----|||-||||||||----|||||-||||-|||---------- 4 [J] COG1490 D-Tyr-tRNAtyr deacylase ---------|----------|---|-----||||||||||||----------||||---|||||-- 4 [T] COG1493 Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism ---|||||--|||||---|-||------------|-||-----------|--|------|---|-| 4 [E] COG1506 Dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases -|----||--------------------------|-|------------------|---|-|---- 4 [K] COG1510 Predicted transcriptional regulators ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----||||------- 4 [NUO] COG1516 Flagellin-specific chaperone FliS ----|||||--|-|||-|-|------|---|----|-|-----------|--|-----|-|-||-- 4 [R] COG1524 Uncharacterized proteins of the AP superfamily |||-||--|-||--------------|||-----||||----|||||-||||---|--||||||-- 4 [C] COG1526 Uncharacterized protein required for formate dehydrogenase activity ||||--||||-||-------|---------||||||||----|||||-||||||||---------- 4 [J] COG1534 Predicted RNA-binding protein containing KH domain, possibly ribosomal protein -------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase ----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---||||||| 4 [J] COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1) -----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit ---|-------------||||-----||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 4 [H] COG1575 1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase -----------------|--||--------||||||||||--|||||-||||||||||||||||-- 4 [S] COG1576 Uncharacterized conserved protein ||||--||||||||||---------|-----|||||------------------------------ 4 [I] COG1577 Mevalonate kinase ------------------||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 4 [M] COG1589 Cell division septal protein |-|-----|---------||-|--------|-|-||||----|||||-||-----|---|||||-- 4 [C] COG1600 Uncharacterized Fe-S protein ||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [E] COG1605 Chorismate mutase --|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||-- 4 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein ---|--------|||-|-||-|----||||----||||-----------|--|--|---||||||| 4 [O] COG1612 Uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly |||||||||||||---------------------||||---------------------------- 4 [R] COG1646 Predicted phosphate-binding enzymes, TIM-barrel fold ||||||--|||-|||-|---|------||-|---||||----||||||||--|||----|||||-- 4 [H] COG1648 Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain) --||---||------------|--------||||||||----|||||-|||||------------- 4 [K] COG1654 Biotin operon repressor --------------------||----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 4 [R] COG1660 Predicted P-loop-containing kinase ------------------------||----|---||||----|||||-||---------|||||-- 4 [S] COG1671 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 4 [GM] COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component ----------------|---||---|--------||||||||-----------------|||||-- 4 [S] COG1692 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------||-|---||||-|----||||-|||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 4 [T] COG1702 Phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase --|||||||-|-|---||||-|---|-|||-----|||----------||-----|---|||||-- 4 [R] COG1721 Uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain) -----------------|-|||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [L] COG1722 Exonuclease VII small subunit ----------------|-----||||----|-----||----||||||||||||||--|||||||| 4 [T] COG1734 DnaK suppressor protein --||---------||--|--||---||---||||||||||--|||-|-||||-|||||||||---- 4 [S] COG1739 Uncharacterized conserved protein -------------||||||-|---|--|||-|----||----|||-|-||--||||---||||||| 4 [R] COG1752 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily ||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega |||||-|||||||---|-----------------||||----|||||-|-||---|--|||||--- 4 [H] COG1763 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein -------------|||||--||--|-----||--||||---------------------------- 4 [S] COG1774 Uncharacterized homolog of PSP1 -------------------------|------|--||-------------|--------------- 4 [R] COG1783 Phage terminase large subunit --||---|-----||--|-|-|----|-------|-||----||||---|--|--|-----|---- 4 [P] COG1785 Alkaline phosphatase ----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----||| 4 [M] COG1792 Cell shape-determining protein |-|-||-------||-|----|------------||||---------------------------- 4 [L] COG1796 DNA polymerase IV (family X) ------------------|||-----||||||||||||---------------------------- 4 [S] COG1799 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-|||||-|||---||-|-|------------||||----|||||-||-|---|---||-||-- 4 [S] COG1801 Uncharacterized conserved protein ----------------||||-|||||||||----||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc) ||||||||||||----||||-|----||||-|--||||--------------------|-||||-- 4 [F] COG1828 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, PurS component --|----------------|||----||||-||||||------||-|--||-||||---|||||-| 4 [I] COG1835 Predicted acyltransferases ||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----|||||| 4 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E --|-------------|-||-|----|||-|----|||----|||||-||------------||-- 4 [KT] COG1842 Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription ---------------------|---|----||||||||----|||||-|-||-||-|||------- 4 [T] COG1854 LuxS protein involved in autoinducer AI2 synthesis ----------------||--|-||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [U] COG1862 Preprotein translocase subunit YajC ||||||||||--------------------|-----||---------------------------- 4 [S] COG1873 Uncharacterized conserved protein ------||---------|------------|--|--||-------|------|-------|--|-- 4 [G] COG1874 Beta-galactosidase ||||||||--||----|||||-----||--|||--|||-------||--|-----||||||||--- 4 [S] COG1917 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain -|--------------||------------|---||||----|||||-||||||||----||||-- 4 [R] COG1923 Uncharacterized host factor I protein -----------------||||---------||||||||---------------------------- 4 [S] COG1939 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-------|----------|------|----|||||||----||||------|||||||||-||-- 4 [R] COG1942 Uncharacterized protein, 4-oxalocrotonate tautomerase homolog ----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||-- 4 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase ---|||-------|---|------------||||||||----|||||-||-||||-------||-- 4 [T] COG1956 GAF domain-containing protein |--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||-- 4 [V] COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein |-|-----------------|-----|---|-----||----|||||--|--|||---|------- 4 [S] COG1971 Predicted membrane protein -----------------|||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|---|||||-- 4 [KT] COG1974 SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidases) --||||-||-||----|-||-|-----||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 4 [H] COG1977 Molybdopterin converting factor, small subunit -----------------|-||---------|----|||----|||||-|--|-------------- 4 [C] COG1979 Uncharacterized oxidoreductases, Fe-dependent alcohol dehydrogenase family --|---||---------|--------|---||||-|||----|||||-|----------------- 4 [KT] COG1983 Putative stress-responsive transcriptional regulator ------||-----|------||----||||----|-||----|||||-|||--|||--||---|-- 4 [E] COG1984 Allophanate hydrolase subunit 2 ||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 4 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases ||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||-- 4 [R] COG1994 Zn-dependent proteases ---------------------|--|-|||||---|||||||||||||--|||||||----|--||| 4 [S] COG2001 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------||-|||||-|-||-|--------------||--------------------|------- 4 [P] COG2046 ATP sulfurylase (sulfate adenylyltransferase) ------||-----|------||----||||----|-||----|||-|-|||--|||--||---|-- 4 [E] COG2049 Allophanate hydrolase subunit 1 --------------------|-------------|-||----------||||-||-|||------- 4 [R] COG2056 Predicted permease ------------------||||----|||-||||||||-----------|||---|---------- 4 [F] COG2065 Pyrimidine operon attenuation protein/uracil phosphoribosyltransferase ------------------|||-----|---------||----|||||-||-----|---|||||-- 4 [E] COG2066 Glutaminase ----------------|---------|||-||-|||||-|--|||||-||||---||||------- 4 [O] COG2077 Peroxiredoxin ------------------||----------||||||||----|||||-||||---|---|||-|-- 4 [R] COG2081 Predicted flavoproteins |-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||-- 4 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases ---||||||-|||-------||----||||-----|||--------|--|-----|---|||||-- 4 [S] COG2096 Uncharacterized conserved protein --|-||||||---||--|--||--|-----||||||||-|--------|----------------- 4 [F] COG2131 Deoxycytidylate deaminase -----------------|--||--|-||||||||||||----|||||-||||-|||---|------ 4 [R] COG2137 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---|||----||-----------|---||-|||||----|||-|---||----||-|------ 4 [H] COG2145 Hydroxyethylthiazole kinase, sugar kinase family ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||-- 4 [P] COG2156 K+-transporting ATPase, c chain ---------------------------||--|---|||----|||||-||-----|---|||||-| 4 [F] COG2169 Adenosine deaminase ---------|-------|--------||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [E] COG2171 Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase -----------------|--|---------||||||||||||------------------------ 4 [L] COG2176 DNA polymerase III, alpha subunit (gram-positive type) -----------------|||-|---------|||||||---------------------------- 4 [R] COG2179 Predicted hydrolase of the HAD superfamily -------------|||---||---|-|---|||||||||---|||||-||||||||---||||--- 4 [K] COG2183 Transcriptional accessory protein |-||----|-----|-||||-|-----||||---|-||----|||---||-----|---|||||-- 4 [T] COG2203 FOG: GAF domain ------------------||-|-----||-|---||------|||||-||-----|--|||-||-- 4 [T] COG2205 Osmosensitive K+ channel histidine kinase ------------------------------|--|||||-||-|||||||--|-------------- 4 [G] COG2213 Phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|--|||-||-- 4 [P] COG2216 High-affinity K+ transport system, ATPase chain B --|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 4 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis ---||||||||||-----||------||||||-||||-----|---|--|-----|------||-- 4 [S] COG2246 Predicted membrane protein -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit -------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 4 [L] COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase ---------------------|----|||-|---||||----|||-|--||----|--||-|---- 4 [S] COG2258 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase ------------------||||---------|||||||---------------------------- 4 [S] COG2302 Uncharacterized conserved protein, contains S4-like domain --|-----|--||-----||||---|||||------||----|--||-||------------|--- 4 [R] COG2304 Uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain -||---------------||-|---|-||--|--|-||-----------|-----|---------- 4 [S] COG2314 Predicted membrane protein ---|------------|----|------------||||---------------------------- 4 [S] COG2322 Predicted membrane protein ---|--||-----------|-|----|-----||||||---------------------------- 4 [S] COG2339 Predicted membrane protein -----------------|---|--------||||||||---------------------------- 4 [R] COG2344 AT-rich DNA-binding protein --------------|----|-|------------||||----|||||-||||-------|||||-- 4 [S] COG2363 Uncharacterized small membrane protein ---------------------|----|---|-----||------------||-------------- 4 [S] COG2364 Predicted membrane protein ---------------------|----|---|---||||----|||-|--|---------------- 4 [P] COG2382 Enterochelin esterase and related enzymes ---------------------|--------|||||||||-||------|----------------- 4 [R] COG2384 Predicted SAM-dependent methyltransferase ------------------||||--------|-----||---------------------------- 4 [D] COG2385 Sporulation protein and related proteins -------------------|||----|---||||||||||--|||||-|----|||---------- 4 [S] COG2501 Uncharacterized conserved protein ----------|-|------||-----||-|-||||||-----|||||-||||-|||---|||||-- 4 [S] COG2606 Uncharacterized conserved protein --||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||---- 4 [P] COG2608 Copper chaperone --------------------|---------|||||||||||------------------------- 4 [S] COG2739 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|||----||||||||||||||----------------||||||||-- 4 [K] COG2740 Predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 4 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits -|----||-|-|-----|---|---------|||||||----||||||||||-------|||||-- 4 [J] COG2813 16S RNA G1207 methylase RsmC -----------------|--||--||||||||||||||---------------------------- 4 [S] COG2815 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|----------------|----------|||||||----|||||-||---||-----||||-- 4 [L] COG2827 Predicted endonuclease containing a URI domain --|----------||---|-----------------||----|||||--|---|||-------|-- 4 [E] COG2866 Predicted carboxypeptidase --------------------|---||----|||||||||-||------------------------ 4 [J] COG2868 Predicted ribosomal protein ----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------ 4 [E] COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors -------------------|----|------|-|||||----|||||-|||||--|---------- 4 [M] COG2891 Cell shape-determining protein |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 4 [H] COG2896 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme ------------------------||||||-|||||||----||||||||||||||---||||||| 4 [D] COG2919 Septum formation initiator --------------------------|-------||||----|||||-||||---|---|||||-- 4 [R] COG2962 Predicted permeases |------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|------- 4 [S] COG2966 Uncharacterized conserved protein --------------------|---------||||||||----------||---------------- 4 [S] COG2996 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------|------|---||||----|||||-|||||||----||||||| 4 [S] COG3027 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||----|||||-||||-------------- 4 [S] COG3091 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||-----------------|-----||--|---|||-----------|-----|---||-||-| 4 [R] COG3173 Predicted aminoglycoside phosphotransferase ---|------|--------||-----|||--|--|--|----||||--||---------||-||-- 4 [P] COG3221 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, periplasmic component -------------------|------|----||||||-----|||-|--|---------||-||-- 4 [S] COG3237 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|||-----||--------|----||||----||||---------------------------- 4 [S] COG3253 Uncharacterized conserved protein -----------------------------------||-----|-||----|-|-|----------- 4 [S] COG3299 Uncharacterized homolog of phage Mu protein gp47 -------------------|------||||------|-----|||||--|-----|-----||--- 4 [Q] COG3319 Thioesterase domains of type I polyketide synthases or non-ribosomal peptide synthetases -------------------------------||||||||-||------------------------ 4 [K] COG3343 DNA-directed RNA polymerase, delta subunit |---||-----|----------------------|||----------------------||-|--- 4 [R] COG3383 Uncharacterized anaerobic dehydrogenase -----------------------------------|-|----|||||-|------------||--- 4 [S] COG3394 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|----------------------||------||||---------------------------- 4 [S] COG3402 Uncharacterized conserved protein --------------------||---------|-|||-|----|||-----------------|--- 4 [S] COG3412 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||||||||||||||---------|-----||||||--------|-----------------|-- 4 [I] COG3425 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase ---|----------------------|||-----||||---------------------------- 4 [S] COG3428 Predicted membrane protein ------------------------------|----|||----|||-|--------|------||-- 4 [L] COG3449 DNA gyrase inhibitor --------------------------||||-|||-|||---------------------------- 4 [T] COG3480 Predicted secreted protein containing a PDZ domain --|---------------------------||-||||-----------|----------------- 4 [Q] COG3527 Alpha-acetolactate decarboxylase -----------------|------------|-----||---------------------||-||-- 4 [G] COG3534 Alpha-L-arabinofuranosidase -------------------------------|||||||||-------------------------- 4 [J] COG3557 Uncharacterized domain/protein associated with RNAses G and E |------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|------- 4 [S] COG3610 Uncharacterized conserved protein -------------------------------||||||||-||------------------------ 4 [L] COG3611 Replication initiation/membrane attachment protein ---|---------------||-----|----|--|--|-|--||||---|---------||-||-- 4 [P] COG3638 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component --------------------|---|-------|-||-|---------------------------- 4 [R] COG3641 Predicted membrane protein, putative toxin regulator ------------------||----------|-|-||||---------------------------- 4 [R] COG3688 Predicted RNA-binding protein containing a PIN domain -------------------------------|||||||||||------------------------ 4 [S] COG3763 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||-- 4 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components ---|--------------||--------------||||---------------------------- 4 [T] COG3848 Phosphohistidine swiveling domain ------------------------------||||||||---------------------------- 4 [L] COG3857 ATP-dependent nuclease, subunit B -----------------|------------|-----||---------------------------- 4 [G] COG3866 Pectate lyase ----------------------||------|---||||---------------------------- 4 [E] COG3869 Arginine kinase ---------------------------||-|-----||---------------------------- 4 [S] COG3879 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------||------|---||||---------------------------- 4 [S] COG3880 Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs ------------------------------||||-|||---------------------------- 4 [S] COG3883 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------||||||||-|-------------------------- 4 [T] COG3887 Predicted signaling protein consisting of a modified GGDEF domain and a DHH domain -----------------|------------||||||||---------------------------- 4 [S] COG3906 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|---------------------------|---|-|-------||-||---------------- 4 [R] COG3979 Uncharacterized protein contain chitin-binding domain type 3 -------------------------------|||||||---------------------------- 4 [L] COG4098 Superfamily II DNA/RNA helicase required for DNA uptake (late competence protein) ------------------||----------|---||||---------------------------- 4 [P] COG4100 Cystathionine beta-lyase family protein involved in aluminum resistance ------------------------------||||||||---------------------------- 4 [K] COG4109 Predicted transcriptional regulator containing CBS domains -------------------------------|||||||---------------------------- 4 [S] COG4116 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||--|---------||||||||||--|||||-|-||----||||||||-- 4 [R] COG4123 Predicted O-methyltransferase --|---------|---|-||------|||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 4 [P] COG4149 ABC-type molybdate transport system, permease component -||----------------------------|-|||||-------------------------|-- 4 [R] COG4152 ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component ------------------------------|--||-|----------------------------- 4 [G] COG4193 Beta- N-acetylglucosaminidase ---------------------------||-------|-------------------------|--- 4 [R] COG4195 Phage-related replication protein -------------------------------|||||||---------------------------- 4 [S] COG4199 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|------|-------------------------|-- 4 [S] COG4200 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|-----||-------||------------|------ 4 [R] COG4225 Predicted unsaturated glucuronyl hydrolase involved in regulation of bacterial surface properties, and related proteins ---|------------------------------||||---------------------------- 4 [S] COG4347 Predicted membrane protein ------------------|||-------------||||---------------------------- 4 [S] COG4399 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|--------------||||----------------------|-||-- 4 [S] COG4430 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------||||||||---------------------------- 4 [K] COG4463 Transcriptional repressor of class III stress genes ------------------------------|--||-||---------------------------- 4 [GM] COG4464 Capsular polysaccharide biosynthesis protein ------------------------------||||||||---------------------------- 4 [K] COG4465 Pleiotropic transcriptional repressor ------------------------------||||||||---------------------------- 4 [S] COG4466 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||---------------------------- 4 [S] COG4467 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||---------------------------- 4 [R] COG4469 Competence protein -------------------------------|||||||---------------------------- 4 [S] COG4470 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||---------------------------- 4 [S] COG4471 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||---------------------------- 4 [S] COG4476 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||---------------------------- 4 [D] COG4477 Negative regulator of septation ring formation -------------------------------|--||||---------------------------- 4 [S] COG4493 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|---||||--------------|------------- 4 [S] COG4496 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|---||||---------------------------- 4 [S] COG4499 Predicted membrane protein ------------------------------|---||||---------------------------- 4 [S] COG4506 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||---------------------------- 4 [U] COG4537 Competence protein ComGC -------------------------------||-||||---------------------------- 4 [S] COG4550 Predicted membrane protein ----------------|--------------||-|||-----|||--------------------- 4 [L] COG4570 Holliday junction resolvase ----------------------------------|-|-----|--------|-------------- 4 [P] COG4594 ABC-type Fe3+-citrate transport system, periplasmic component ---------------------|--------||-|||||--|-||||||||||---|---------- 4 [G] COG4668 Mannitol/fructose-specific phosphotransferase system, IIA domain -------------------------------|||||||---------------------------- 4 [S] COG4758 Predicted membrane protein ---|--|||--|-||--|--||----||||------||-----------|-----|---||||||| 4 [I] COG4799 Acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta) -------------------------------|--||------------------------------ 4 [R] COG4814 Uncharacterized protein with an alpha/beta hydrolase fold -------------------------------|---|-|---------------------------- 4 [S] COG4817 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------|-|-----------------------|---- 4 [R] COG4821 Uncharacterized protein containing SIS (Sugar ISomerase) phosphosugar binding domain ------------------------------|----|||---------------------------- 4 [R] COG4824 Phage-related holin (Lysis protein) ----------------------------------||||---------------------------- 4 [S] COG4836 Predicted membrane protein ----------------------------------||||---------------------------- 4 [S] COG4837 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------||||---------------------------- 4 [S] COG4838 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||---------------------------- 4 [D] COG4839 Protein required for the initiation of cell division ----------------------------------||||---------------------------- 4 [S] COG4840 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|||||---||||---------------------------- 4 [S] COG4842 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------||||---------------------------- 4 [S] COG4843 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------||||---------------------------- 4 [S] COG4844 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------||||---------------------------- 4 [O] COG4846 Membrane protein involved in cytochrome C biogenesis ----------------------------------||||---------------------------- 4 [S] COG4848 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------||||---------------------------- 4 [R] COG4851 Protein involved in sex pheromone biosynthesis ----------------------------------||||---------------------------- 4 [S] COG4853 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|-||||||---------------------------- 4 [S] COG4856 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------||||---------------------------- 4 [S] COG4863 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------||||---------------------------- 4 [S] COG4864 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||------------------|||------- 4 [U] COG4940 Competence protein ComGF ----------------------------------||||---------------------------- 4 [S] COG4955 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|--------||--||||---------------------------- 4 [R] COG4956 Integral membrane protein (PIN domain superfamily) -------------------------------|--||||----|||||-|-||-------|-|-|-- 4 [CO] COG4987 ABC-type transport system involved in cytochrome bd biosynthesis, fused ATPase and permease components ------------------------------|--|||||----|||||-|----------|--|--- 4 [R] COG4989 Predicted oxidoreductase -------------------------------|--|||----------------------------- 4 [S] COG4990 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|---------|||||||---------------------------- 4 [T] COG5002 Signal transduction histidine kinase -----------------------------------|||--------------|------------- 4 [L] COG5377 Phage-related protein, predicted endonuclease ----------------||-------|--------||||----|||||||||||--||||||||||| 4 [O] COG5405 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), peptidase subunit ----------------------------------||||---------------------------- 4 [S] COG5417 Uncharacterized small protein -------------------------------|||||||---------------------------- 4 [S] COG5503 Uncharacterized conserved small protein ---------------------|------------|-||---------------------------- 4 [O] COG5504 Predicted Zn-dependent protease ----------------------------------||||---------------------------- 4 [S] COG5584 Predicted small secreted protein --------------------------|----|---|||-------------------------|-- 4 [S] COG5646 Uncharacterized conserved protein --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 3 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase ---|--||---|----|-|||------||||----|||----|||||-||--||||---||-||-- 3 [H] COG0029 Aspartate oxidase ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 3 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain ||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||-- 3 [G] COG0063 Predicted sugar kinase ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 3 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit ||||||||||||||--||||-|--------||--|-||--------|-||------||-||-||-- 3 [E] COG0075 Serine-pyruvate aminotransferase/archaeal aspartate aminotransferase ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase -------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase |-||--|||---||||--|--|-----||-|-----||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 3 [L] COG0122 3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase ||||--|||||||||||-||-|------------|-||----------||---|||---|||||-- 3 [BQ] COG0123 Deacetylases, including yeast histone deacetylase and acetoin utilization protein -|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 3 [H] COG0132 Dethiobiotin synthetase -||--|--|||||||-|-||-------|-------|-|------------------||-|||||-- 3 [EQ] COG0145 N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit ||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||-- 3 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase -||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 3 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes ------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||-- 3 [J] COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class) ----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||-- 3 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase ------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-|||||||||||| 3 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase ----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--||||||||||| 3 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I ---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain --|----------||-|-||-|----||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 3 [S] COG0316 Uncharacterized conserved protein ---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 3 [H] COG0320 Lipoate synthase -------------|||--|||---|||||||----|||----|||||||||||--||||-|-|-|| 3 [O] COG0326 Molecular chaperone, HSP90 family -------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||-- 3 [G] COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase |||---|||||-----||||-|--------||--||------|||||-||--|--||||----|-- 3 [P] COG0370 Fe2+ transport system protein B |||||||||||||-|--|||----------||||-|||----|||||-------------|----- 3 [C] COG0371 Glycerol dehydrogenase and related enzymes ||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||-- 3 [H] COG0379 Quinolinate synthase |||||||||--|-----|||-------|||-|---|-|----|||-|-|--|-----------|-- 3 [S] COG0393 Uncharacterized conserved protein ||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||-- 3 [M] COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis |||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||-- 3 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases ||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||---------------- 3 [L] COG0419 ATPase involved in DNA repair -|--|||||||||||-||---|----|---|--|--||----||||||-|--||||||----|--- 3 [E] COG0421 Spermidine synthase ---|----|---------||------||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 3 [H] COG0447 Dihydroxynaphthoic acid synthase ||||||||||||||||--||-|----||||------||-----------|-----|--|||-|--- 3 [O] COG0464 ATPases of the AAA+ class ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit |||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 3 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes |||-||||||-|-||-||--|---|-|||-||-|-|||----|||||-||---|||---|----|| 3 [HC] COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases -------------||------|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 3 [C] COG0567 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, and related enzymes ----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||-- 3 [R] COG0579 Predicted dehydrogenase |||-||--||-|-||--||--|----|||--|---|||-------|---||-||||---|||||-- 3 [S] COG0599 Uncharacterized homolog of gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit |||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase |||||||||||||||||--------------|--|||----------------------------| 3 [MI] COG0615 Cytidylyltransferase |||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----|||||||||||||||||||||||| 3 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class) --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 3 [NT] COG0643 Chemotaxis protein histidine kinase and related kinases |||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--|||||||| 3 [R] COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily -------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-||||||||||||| 3 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH --------|---|||--||||---|---------|||-----||||---|-|-||---|--|--|| 3 [P] COG0672 High-affinity Fe2+/Pb2+ permease |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 3 [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit |---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---||||||| 3 [J] COG0689 RNase PH |-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---||||||| 3 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins |||-----||------||||-------||-|-||-|||----|||-------------|------- 3 [R] COG0701 Predicted permeases |||||||||||||---||||-|---|||||||||||-||-|||||||-||--|--|---|||||-- 3 [P] COG0704 Phosphate uptake regulator ||||||-|||||-||-|-----||-------||||||-----|||-|------||----------- 3 [E] COG0710 3-dehydroquinate dehydratase ||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase ----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|-- 3 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit -------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-||||||| 3 [F] COG0756 dUTPase ----------|-|---||||-------------||-||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [R] COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I |||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation |-|---|-|----|---|||------|||-|----||--------------|--|----|------ 3 [P] COG0798 Arsenite efflux pump ACR3 and related permeases --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||-||||--- 3 [E] COG0804 Urea amidohydrolase (urease) alpha subunit ----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||-||||--- 3 [E] COG0831 Urea amidohydrolase (urease) gamma subunit --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||--|||--- 3 [E] COG0832 Urea amidohydrolase (urease) beta subunit --|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump ----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||--- 3 [D] COG0850 Septum formation inhibitor -|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||-- 3 [L] COG0863 DNA modification methylase ||||--|||||||-----------------|----|||----|||-|---------||---|-|-- 3 [K] COG0864 Predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain and a metal-binding domain |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 3 [C] COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit |||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||-- 3 [C] COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit -------------||-|----|----|-------|-||----|||||-||--|--|--|-|----- 3 [C] COG1017 Hemoglobin-like flavoprotein ---|---------||-----||----|||-----|-||----||||||||--||||---|||||-- 3 [C] COG1018 Flavodoxin reductases (ferredoxin-NADPH reductases) family 1 ----------------|-----||-------||||||-||||------------------------ 3 [L] COG1039 Ribonuclease HIII --||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---||||||| 3 [C] COG1048 Aconitase A ------------------||-|||--|----||||||-----||||||||--|--|---||||||| 3 [R] COG1054 Predicted sulfurtransferase --|||||||-||||||---|||--|-|||||-||||------|||||-|----------------- 3 [KL] COG1061 DNA or RNA helicases of superfamily II --|-||----|||||---||------||||-||||-||----|||-|--|--|||||||||||--- 3 [R] COG1064 Zn-dependent alcohol dehydrogenases -------------|--------------------|-||----|||||------------||||--- 3 [C] COG1069 Ribulose kinase -----|-------||-----------||||-|||-|||----|||||-|-||-------||||--- 3 [H] COG1072 Panthothenate kinase |------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||-- 3 [M] COG1087 UDP-glucose 4-epimerase -|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||--- 3 [R] COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases ----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||-- 3 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [NU] COG1157 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase ---|--------------||------||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 3 [H] COG1165 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase --------------------||----||||||-|-|||----|||||---|----|---------- 3 [E] COG1168 Bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities -----------------|--|-----|--|-|----||----|||||-||||---|---|||||-- 3 [G] COG1172 Ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport systems, permease components -------------||-----|---------|---|-||----|||||-|||||||||||------- 3 [H] COG1179 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 1 --|-----|-------|||||----|||||||||-|||||----------------|||||||||| 3 [J] COG1189 Predicted rRNA methylase |||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||-- 3 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon) --||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-| 3 [O] COG1225 Peroxiredoxin -|------|----|||-|--||--------|||||||-----------|----------------- 3 [C] COG1227 Inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [N] COG1256 Flagellar hook-associated protein ----------------|----|-------------|||----|||||--------|----|-|--- 3 [P] COG1276 Putative copper export protein --------------------|-----|||-|---|-||----|||||-||-|---|||-|-|---| 3 [R] COG1279 Lysine efflux permease ------------------|--|------------|||-----|||||-||||||||--|||||--- 3 [S] COG1289 Predicted membrane protein ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [NU] COG1298 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhA |||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----||||||| 3 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases ----||-----------|------------||----||----|||||---|--------||||--- 3 [G] COG1312 D-mannonate dehydratase ----------|||--------|--||-||-------||----|||----|-----|---||-|--- 3 [C] COG1319 Aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, middle subunit CoxM/CutM homologs ---------------------|--||||||------||---------------------||||||| 3 [K] COG1329 Transcriptional regulators, similar to M. xanthus CarD ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [NU] COG1338 Flagellar biosynthesis pathway, component FliP ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----||||------- 3 [N] COG1345 Flagellar capping protein --||--|||--------|-|----||----|----|||----|||||-||-----|--|||-||-- 3 [NT] COG1352 Methylase of chemotaxis methyl-accepting proteins ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [NU] COG1377 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhB |||---|||--|-----|---|||------|---|||-----------||||---|---||-|--- 3 [P] COG1392 Phosphate transport regulator (distant homolog of PhoU) ---|--------------||-|-----||||||-|||-----|||---|---|--|---|||||-- 3 [V] COG1403 Restriction endonuclease ----------------||------||----|----|||----------||-----||||------- 3 [N] COG1419 Flagellar GTP-binding protein ----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---||||||| 3 [S] COG1434 Uncharacterized conserved protein ----||||---|-|---------------------|||----|||-|--|-|-||----------- 3 [F] COG1457 Purine-cytosine permease and related proteins ||||||||||--|----|----------------|-||-----------|--||||---------- 3 [S] COG1469 Uncharacterized conserved protein -----------------||||--||-----|----|||---------------------------- 3 [R] COG1480 Predicted membrane-associated HD superfamily hydrolase --|---------------||||----|||||-----||----|||-|-|-||---------|||-- 3 [G] COG1494 Fructose-1,6-bisphosphatase/sedoheptulose 1,7-bisphosphatase and related proteins ---------------------|||------------||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [O] COG1495 Disulfide bond formation protein DsbB ----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--|||||||| 3 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein ----------------|-----||||----|----|||----|||||-||--||||||||||||-- 3 [K] COG1508 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma54 homolog -||-------------||--||--|-----------||----|||||-|-|||------||-||-- 3 [E] COG1509 Lysine 2,3-aminomutase ----------------||||||--||-||||----|||-|---------|--|||||||----|-- 3 [K] COG1521 Putative transcriptional regulator, homolog of Bvg accessory factor --|--------|-----||-||||--|||-|-||--||-|--|||||-||||---|---||-|--- 3 [G] COG1523 Type II secretory pathway, pullulanase PulA and related glycosidases ----------|||---|----|--|--||-------||----|||----|-----|---||-||-- 3 [C] COG1529 Aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, large subunit CoxL/CutL homologs -||-|-|||||||----||-|------||-|-----||-----------|-----|---|||||-| 3 [L] COG1533 DNA repair photolyase ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [N] COG1536 Flagellar motor switch protein ------||------------||----|--|----|-||----|||||-|||--|||--||------ 3 [R] COG1540 Uncharacterized proteins, homologs of lactam utilization protein B ---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||-- 3 [R] COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced) ---|||----|||---|-||-|------------|-||---------------------------- 3 [S] COG1547 Uncharacterized conserved protein -----------------|---|-----||||----|||---------------------------- 3 [S] COG1550 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------|------|-----|-------|||||---||--|--|||--------||----------- 3 [G] COG1554 Trehalose and maltose hydrolases (possible phosphorylases) ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [N] COG1558 Flagellar basal body rod protein ----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [R] COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein ----------------||--|----|----|----|||----|||||-||||||||---|||||-- 3 [S] COG1561 Uncharacterized stress-induced protein -------------||--|--||--|-----|||||||-------------------||-||||--- 3 [H] COG1564 Thiamine pyrophosphokinase --||||||----|---||--||-----||------|||--------|--|-----|---|||||-- 3 [R] COG1574 Predicted metal-dependent hydrolase with the TIM-barrel fold -|--|||||-|||---||------------|-----||----||||||-|--|--|---------- 3 [E] COG1586 S-adenosylmethionine decarboxylase -----------------|--|---|-|----------|----|--||-||||-------||--|-- 3 [G] COG1593 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component -------------|---|--------|||-|----|||----------||--||||--|||||--- 3 [S] COG1610 Uncharacterized conserved protein ---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-|||||||||||||||||| 3 [O] COG1651 Protein-disulfide isomerase -------------------|-|--||---------||-----|||-|-||-|||||---|||||-- 3 [S] COG1652 Uncharacterized protein containing LysM domain ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [NU] COG1677 Flagellar hook-basal body protein |-|-------------||--|---------|----|||--------|-||-----|---||-|--- 3 [S] COG1683 Uncharacterized conserved protein ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [NU] COG1684 Flagellar biosynthesis pathway, component FliR -------------||----||---|-----|||||||------------|---||-|-|-|----- 3 [M] COG1696 Predicted membrane protein involved in D-alanine export -----------|---------|-----||------|-|-||-|---|------------|--|--- 3 [R] COG1735 Predicted metal-dependent hydrolase with the TIM-barrel fold --|---------------|--------||-----|-||----|||-|--|-----|---||-||-- 3 [S] COG1742 Uncharacterized conserved protein ---------------------|-----||---|||-||------------||-||----------- 3 [S] COG1755 Uncharacterized protein conserved in bacteria -||-||||-|-||---||---|----|||-|----|-|--|||||||-||---|||---||-||-- 3 [O] COG1765 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [NU] COG1766 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway lipoprotein ---------------------|----||||-||||-|--||||||||------------|-|---- 3 [F] COG1780 Protein involved in ribonucleotide reduction --------|--|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-| 3 [I] COG1788 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit |||||||||||||||||----------||-------||----------|||--||---|||-||-- 3 [L] COG1793 ATP-dependent DNA ligase -----------------||------|----|----|||----|||||-|-||---|---|||---- 3 [G] COG1803 Methylglyoxal synthase --------|--------|--||--------|----|||----|||-|------------------- 3 [R] COG1811 Uncharacterized membrane protein, possible Na+ channel or pump ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [N] COG1815 Flagellar basal body protein |||------|---|----|--|-----||||-----|------||||-||------------|--- 3 [GC] COG1819 Glycosyl transferases, related to UDP-glucuronosyltransferase |--------|-------|--|---------|-||-|||---------------------------- 3 [R] COG1827 Predicted small molecule binding protein (contains 3H domain) ---|||||--|||---||---|---------|||-|||----|||||--------|--|||-|--- 3 [R] COG1832 Predicted CoA-binding protein ----------------||||||||||-|||||||-|||------------------|||------- 3 [R] COG1837 Predicted RNA-binding protein (contains KH domain) ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [N] COG1843 Flagellar hook capping protein -----------------|||||--||-|||||||-|||---------------------------- 3 [R] COG1847 Predicted RNA-binding protein ------------||------||------------|-||----|||||-||||------|||||--- 3 [C] COG1866 Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP) ----------------||------||----|----|||----||||||||-----||||||||--- 3 [N] COG1868 Flagellar motor switch protein -----------------|--------|----|--|-||-|--|||||-|-||-------------- 3 [G] COG1869 ABC-type ribose transport system, auxiliary component ------------------||----||----||||-|||-------|--|-|||------------- 3 [M] COG1876 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase |-------|-----------|---------||||||------|||||-|-||---|---------- 3 [C] COG1882 Pyruvate-formate lyase ---||||||--||--------|----||||-------|----|||----------|---|||||-- 3 [I] COG1884 Methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit |-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||-- 3 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes -----------------|||-|--|-----|---|||-----|||||-|---|------|-|||-- 3 [M] COG1922 Teichoic acid biosynthesis proteins --|----------||----|------||||-|---|||----||||||||||||||--||||||-- 3 [HE] COG1932 Phosphoserine aminotransferase ------------------||-|----||||-----|||-----------------|---------- 3 [S] COG1950 Predicted membrane protein -----------|-||----|-|----|||-----|--|----|||-|--|-|---|--||||||-- 3 [F] COG1957 Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase -----------------|||-|--||-----|---|||---------------------------- 3 [S] COG1963 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---------------|-||----||||-||||||-----|||||-|||||--|---|||||-- 3 [M] COG1970 Large-conductance mechanosensitive channel ----------|||--------|-----||-------||----|||----|-----|---|||||-- 3 [O] COG1975 Xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 3 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 3 [NU] COG1987 Flagellar biosynthesis pathway, component FliQ ---|------|-|||-|----|--------------||----------||--||||--|||||||| 3 [R] COG1999 Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC, involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems ---|---------||--|-|||--------|---||-|----|||||-||-----|---|||||-- 3 [E] COG2008 Threonine aldolase ---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--|||||||||||||| 3 [C] COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit ------||---|--------||-----||---|||-||-------|---------|---------- 3 [O] COG2039 Pyrrolidone-carboxylate peptidase (N-terminal pyroglutamyl peptidase) -----------|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-| 3 [I] COG2057 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit |---||----||||------------|||-------||----|||-|--|-----|---||-|--- 3 [R] COG2079 Uncharacterized protein involved in propionate catabolism ----------|||--------|--||-||-------||----|||----|-----|---||-||-- 3 [C] COG2080 Aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, small subunit CoxS/CutS homologs ------------------||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||--- 3 [H] COG2087 Adenosyl cobinamide kinase/adenosyl cobinamide phosphate guanylyltransferase -------------||---||----------|---|-||----|||-|---|||--|---------- 3 [H] COG2091 Phosphopantetheinyl transferase ------------|--|-----|-|-|-||||---|||------------|---------||-|-|| 3 [L] COG2094 3-methyladenine DNA glycosylase ------------------||-|--------||--|-||----|||||-|-||--------|-|--- 3 [R] COG2103 Predicted sugar phosphate isomerase --|----------------------|-----||--||-----|||||--|-----|---||||--- 3 [E] COG2113 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, periplasmic components --|-----|----------|-|----|||||--||-||----|||||--|---|||---|||||-- 3 [S] COG2128 Uncharacterized conserved protein ---|---------|-----|------||||------|-----|||-|--|---------||||--- 3 [S] COG2135 Uncharacterized conserved protein ||||----||||------||-|----|||-----|-||-----------------|---------- 3 [S] COG2138 Uncharacterized conserved protein --||||----||--|---||-|----||------|-||----|||||--|--|--|---||-||-- 3 [PR] COG2146 Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenases ---------------------------||-----|-||----|||-|--|------------||-- 3 [Q] COG2162 Arylamine N-acetyltransferase -------------------|||----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 3 [D] COG2177 Cell division protein ---||||||--||-------||----||||-------|----|||----------|---|||||-- 3 [I] COG2185 Methylmalonyl-CoA mutase, C-terminal domain/subunit (cobalamin-binding) --||||--|-||----|---|-------------|-|----------------------------- 3 [S] COG2210 Uncharacterized conserved protein ------------------|||---------||----|-----|||||----------------|-- 3 [G] COG2211 Na+/melibiose symporter and related transporters -----------------|------|-----|-----||-----------|------|||----|-- 3 [S] COG2257 Uncharacterized homolog of the cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB -------------------|-|----||||-||||-|-----|||||--|-----|---|||||-- 3 [S] COG2261 Predicted membrane protein -------------||-|---------|||||----|||---------------------|||||-- 3 [R] COG2270 Permeases of the major facilitator superfamily ----------------------||-------||-|-|-----|||||-||||------|-----|| 3 [G] COG2271 Sugar phosphate permease -------------||--|---------||-|-----||---------------------||-||-- 3 [G] COG2273 Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase ------------------|--|--------|-----|------|||-------------------- 3 [T] COG2310 Uncharacterized proteins involved in stress response, homologs of TerZ and putative cAMP-binding protein CABP1 --------------------||----|----|||-||-----|||||--|-----|---|--||-- 3 [S] COG2315 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|--||--|||-------||-------------|||-------|--|-------------|--| 3 [E] COG2317 Zn-dependent carboxypeptidase ------------------|--|----||||----|-||-----------------|--||||||-- 3 [R] COG2346 Truncated hemoglobins ---|----|---|-----|--|---------------|----------||-|--------||--|| 3 [R] COG2358 TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component ------------------||||-----||||||||||----------------------||----- 3 [V] COG2367 Beta-lactamase class A ---------------------|----|--------|||----|||||--------|----|-|--- 3 [R] COG2372 Uncharacterized protein, homolog of Cu resistance protein CopC |||----||-|-----|-----------------|-||---------------------------- 3 [S] COG2445 Uncharacterized conserved protein ----||----|||------|------|||------|||----|||-|-||--||||----|-||-- 3 [G] COG2513 PEP phosphonomutase and related enzymes ------------------||--------------|-|------------|-----|--||--|--| 3 [V] COG2602 Beta-lactamase class D --------------|---------------||-||||-----||||||-|-----|---------- 3 [G] COG2706 3-carboxymuconate cyclase ------------------------------|----|||----|||||---||-||----------- 3 [S] COG2707 Predicted membrane protein ----|------|------------------|-----||----|||||--------|--||||||-- 3 [G] COG2721 Altronate dehydratase --------------------------||||-|||||-|----|||||-||||-|||---|||||-- 3 [L] COG2818 3-methyladenine DNA glycosylase ----------------------------------|||-----||||-------||----------- 3 [P] COG2822 Predicted periplasmic lipoprotein involved in iron transport --------------------------|||--|-|---|-|--|||--------|||---||--|-- 3 [L] COG2826 Transposase and inactivated derivatives, IS30 family -------------------|-|----|||-----|||-----|||||-||-|-|||------|--- 3 [P] COG2837 Predicted iron-dependent peroxidase -------------------|-|------------|-||---------------||----------- 3 [S] COG2839 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 3 [D] COG2884 Predicted ATPase involved in cell division ----------------||||||--------|----|||----||||||||--||||||-||||--- 3 [D] COG2894 Septum formation inhibitor-activating ATPase --|-----------------------||||-|--|||------------|--|--|---|||||-- 3 [S] COG2898 Uncharacterized conserved protein --------------------|-----|-------|--|----||||--|--|-||--------|-- 3 [H] COG2978 Putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter ---|||--------------||----------|-|-||-------||-||-----|---|||||-- 3 [E] COG2986 Histidine ammonia-lyase ---|||--------------||----------|-|-||-------|--||-----|---|||||-- 3 [E] COG2987 Urocanate hydratase ------------------||--------------|-||-------|--||--|--|------||-- 3 [S] COG3011 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||----------------------||-------|||----|||||-||-|-||----||||--- 3 [R] COG3030 Protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid --------------------------|-----||||-|-||-|||||-|--|-------------- 3 [S] COG3037 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|-----|----------|----|--||-||||-------||--|-- 3 [G] COG3090 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component -------------|||----------|---||--|||-----|||||-|---|||--------|-- 3 [E] COG3104 Dipeptide/tripeptide permease -------------------------------|--||------|||||-||----------|-||-- 3 [S] COG3152 Predicted membrane protein --|----------------|------|----|--||------|||||-||---------|||||-- 3 [R] COG3153 Predicted acetyltransferase -------------------||-----|-------|-||----|||-|-||---------||-|--- 3 [R] COG3180 Putative ammonia monooxygenase --------------------------|-------|--|----------||---|||---|---|-- 3 [S] COG3182 Uncharacterized iron-regulated membrane protein --|----------------|----------|---|-|-----------||---------------- 3 [E] COG3227 Zinc metalloprotease (elastase) -------------------|-|----|---||--||------|||-|--|-|-------|--|--- 3 [S] COG3238 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----------------|-------||--|--||------||||---|-----|----|||--- 3 [S] COG3247 Uncharacterized conserved protein ----||-----------------------------|||----|||||-----------|||||--- 3 [S] COG3254 Uncharacterized conserved protein --|----------------------------|||-|||--------|--|---||-|--|------ 3 [S] COG3326 Predicted membrane protein ---------------------|----||||------||----------------------|-|--- 3 [S] COG3336 Predicted membrane protein -------------------|||----|--------|||----|||-|---||-------------- 3 [E] COG3340 Peptidase E --||-|-----|------||-|---------------|----|------------|----|----- 3 [L] COG3385 FOG: Transposase and inactivated derivatives --|-|------|-------|-|--||-||-|-----||----|||-|--|-----|----|-|--- 3 [S] COG3391 Uncharacterized conserved protein --------------------|----------||---||--------|-|----------------- 3 [C] COG3493 Na+/citrate symporter ------|----|-----------------------|-|---------------------|--|--- 3 [S] COG3535 Uncharacterized conserved protein --------------|----------------|||-|-|--------------|------------- 3 [S] COG3538 Uncharacterized conserved protein ---------------------|------------|-||-----------|-----|---|||||-- 3 [R] COG3545 Predicted esterase of the alpha/beta hydrolase fold --------------------------|||||----|||---------------------------- 3 [S] COG3583 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------|-------------|-----||-||-|---------------------------- 3 [S] COG3589 Uncharacterized conserved protein --|---------------------------|---|||------------|--|---------|--- 3 [G] COG3594 Fucose 4-O-acetylase and related acetyltransferases ------||---------|------------|||||||----------------------------- 3 [S] COG3601 Predicted membrane protein --------------------------|----|--||-|---------------------||-|--- 3 [R] COG3607 Predicted lactoylglutathione lyase -------------------------------|-|-||------||-----||-------------- 3 [S] COG3646 Uncharacterized phage-encoded protein -------------------|------|---|-||-|||-----------|-------------|-- 3 [K] COG3655 Predicted transcriptional regulator ----------------------------------||-|-----------|----------|--|-- 3 [G] COG3664 Beta-xylosidase ------------------||----------|-||-|||---------------------------- 3 [S] COG3689 Predicted membrane protein ----------------|-||-|--------||---|||-----------|---|||---|||||-- 3 [E] COG3705 ATP phosphoribosyltransferase involved in histidine biosynthesis --------------------------|--------|||-------||--------|---|||||-- 3 [G] COG3718 Uncharacterized enzyme involved in inositol metabolism -------------------------------||-|||------|||---|------------|--- 3 [L] COG3728 Phage terminase, small subunit -------------------------------|---|||-------------|-------|---|-- 3 [S] COG3739 Uncharacterized integral membrane protein --------------------|---------||--|||----------------------------- 3 [G] COG3855 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|||--|||---------------------------- 3 [S] COG3859 Predicted membrane protein -------------------|-|--------|---|||----------------------|------ 3 [R] COG3871 Uncharacterized stress protein (general stress protein 26) -----------------|--|---------|----|||---------------------------- 3 [R] COG3872 Predicted metal-dependent enzyme ------------------------------|----||---------|------------------- 3 [K] COG3933 Transcriptional antiterminator ---------------------------||-||--|-|----------------------------- 3 [R] COG3953 SLT domain proteins ------------------------------|---|-||---------------------------- 3 [R] COG3956 Protein containing tetrapyrrole methyltransferase domain and MazG-like (predicted pyrophosphatase) domain --------------------------|--------|||-------||--------|---|||||-- 3 [E] COG3962 Acetolactate synthase -------------------------------||||||----------------------------- 3 [M] COG3966 Protein involved in D-alanine esterification of lipoteichoic acid and wall teichoic acid (D-alanine transfer protein) ------------------||----------|---|-||---------------------------- 3 [S] COG4241 Predicted membrane protein ---------------------|------------|-||---------------------------- 3 [PE] COG4362 Nitric oxide synthase, oxygenase domain ---------------------|------------|-||---------------------------- 3 [S] COG4365 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|---------|-|||-|----------||-----|---------- 3 [S] COG4392 Predicted membrane protein ------------------||---------------|||---------------------------- 3 [E] COG4401 Chorismate mutase ------------------------------||-|-|||-----|-||------------------- 3 [S] COG4405 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------||||||-|---------------------------- 3 [S] COG4472 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------||||-||---------------------------- 3 [S] COG4475 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------||||||----------------------------- 3 [S] COG4479 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|-||||-|---------------------------- 3 [S] COG4481 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------||||||----------------------------- 3 [S] COG4483 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------|---|-||---------------------------- 3 [R] COG4492 ACT domain-containing protein ------------------------------||--|--|---------------------------- 3 [S] COG4495 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------|-||-|---------------------------- 3 [S] COG4509 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|---||-|---------------------------- 3 [OTK] COG4512 Membrane protein putatively involved in post-translational modification of the autoinducing quorum-sensing peptide ---------------------|-------------|||----|||||-|----------------- 3 [R] COG4533 ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 3 [P] COG4604 ABC-type enterochelin transport system, ATPase component --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 3 [P] COG4605 ABC-type enterochelin transport system, permease component --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 3 [P] COG4606 ABC-type enterochelin transport system, permease component --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 3 [P] COG4607 ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component ------------------------------|-----||----------------------|----- 3 [S] COG4641 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|-||--|---------------------------- 3 [S] COG4652 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|----|---|--------|---------------|----------||-|--------||---- 3 [R] COG4666 TRAP-type uncharacterized transport system, fused permease components ---||-----|-|-------|-------------||-|----|||-|--------|----|||--- 3 [I] COG4670 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase -------------------------------||--|||---------------------------- 3 [S] COG4698 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-------------------------------|||-----------------------|----- 3 [S] COG4717 Uncharacterized conserved protein -----------------------------------|||----|||||------------------- 3 [G] COG4806 L-rhamnose isomerase ----------------------------------|||----------------------------- 3 [S] COG4873 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------|||----------------------------- 3 [S] COG4876 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------|||----------------------------- 3 [S] COG4896 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------|||----------------------------- 3 [S] COG4897 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------|||----------------------------- 3 [K] COG4903 Genetic competence transcription factor -------------------------------|--|||----------------------------- 3 [R] COG4915 5-bromo-4-chloroindolyl phosphate hydrolysis protein --------------|----|----------------|----------------------------- 3 [GM] COG5039 Exopolysaccharide biosynthesis protein -------------------|-|---------------|-----------------|---|--||-- 3 [T] COG5278 Predicted periplasmic ligand-binding sensor domain --|------------------|---------|--|||----------------------------- 3 [S] COG5280 Phage-related minor tail protein -------------------------------|-|-|||---------------------------- 3 [S] COG5353 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------||||-----|||---------------|||---------- 3 [S] COG5416 Uncharacterized integral membrane protein --------------------------------||-|||---------------------------- 3 [S] COG5506 Uncharacterized conserved protein -----------------------------------||---------|--------|---------- 3 [R] COG5518 Bacteriophage capsid portal protein --|-------------------------------|--------||||----|-------------- 3 [L] COG5519 Superfamily II helicase and inactivated derivatives --------------------------------|-||------------------------------ 3 [S] COG5546 Small integral membrane protein ------------------------------|-----||-----------|---------------- 3 [S] COG5583 Uncharacterized small protein ------------------||----|--||-------||-----------------|---||-|--- 3 [K] COG5662 Predicted transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor) ||-|||-|-||-|||-|-|||------|||-----|-|---------------------------- 2 [P] COG0003 Oxyanion-translocating ATPase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 2 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases -||---||--||-|--|-||||||--|||-||||--||----|||||-||||-------||-|--- 2 [G] COG0058 Glucan phosphorylase ||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||-- 2 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase ------|---|--||--|--|---|-|||-||-|--||----|||||-|-||-------------- 2 [G] COG0153 Galactokinase --------|-||-||-|-||-|----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 2 [P] COG0155 Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein) |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 2 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase |-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase |||---|||||||-----------------|-|||-|--||-|||-|-|-||-------------- 2 [G] COG0269 3-hexulose-6-phosphate synthase and related proteins -|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|--- 2 [G] COG0297 Glycogen synthase |||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||-- 2 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs |||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs -|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------| 2 [L] COG0338 Site-specific DNA methylase |||-----||------||||-|----|||-||---||-----|||||-||||||||---|||||-- 2 [E] COG0347 Nitrogen regulatory protein PII |||||||||||||-----||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||--- 2 [H] COG0368 Cobalamin-5-phosphate synthase |||-----||----|-|-||||----|||-----|--||---|||||--||----||||||||--- 2 [OK] COG0378 Ni2+-binding GTPase involved in regulation of expression and maturation of urease and hydrogenase -||-------------||||-------||-----|-|-----|||-|--------|---------- 2 [R] COG0390 ABC-type uncharacterized transport system, permease component |-||-------|-|----||------|-----|-||------||||||||----|----|--||-- 2 [L] COG0415 Deoxyribodipyrimidine photolyase ||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||-- 2 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC --|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-||||||||||||||| 2 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation |||---|||||||-|-||||-|-----||-|-----||----|||-|-||---------||----- 2 [S] COG0432 Uncharacterized conserved protein ||-|--||||------||-|----||-||||-----||----------||-----||||------- 2 [D] COG0455 ATPases involved in chromosome partitioning --|----------||-||--||||||----|-----|||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type --------|-------|----|-----||||||---|----------------------------- 2 [P] COG0490 Putative regulatory, ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels ||||||||||||-||-|||-----||-----------|----|||||-|--|--------|----- 2 [P] COG0530 Ca2+/Na+ antiporter ---|||||--|-|-----|------------||||-----|-|||-|--||---------|----- 2 [E] COG0549 Carbamate kinase --|----------||-----|-||||||||||||||------||||||--||||||----||||-- 2 [G] COG0588 Phosphoglycerate mutase 1 ||||---||----------|-----------||-||--|||-------||||||--|||-||-|-| 2 [V] COG0610 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases |||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|-- 2 [H] COG0611 Thiamine monophosphate kinase ||||----|--||---||||-|--------|------|----|||||-||||-|||---------- 2 [R] COG0613 Predicted metal-dependent phosphoesterases (PHP family) -------------|----||------||||-|||||------|||||--|||-|||---|||||-- 2 [R] COG0627 Predicted esterase ---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 2 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein ||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-|| 2 [I] COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase ------------------|-----------|-----||----|||-|-||-----|---------- 2 [S] COG0700 Uncharacterized membrane protein |-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0708 Exonuclease III -----------------|||||----|||||-----||-------|-||||||--|||||||||-- 2 [E] COG0757 3-dehydroquinate dehydratase II ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 2 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein |-|---|||-|-|---||||||--|-||||--||--||------------||----||-||||--- 2 [O] COG0785 Cytochrome c biogenesis protein ---|------------|-||-|----|||-------||----|||-|-|||||--|||||||-|-- 2 [F] COG0788 Formyltetrahydrofolate hydrolase -----------------|||----|-----||||--||----|||||-||||||||||-|||||-- 2 [G] COG0800 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 2 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis --------------|---||-|----|-------|--||----||----||----|||-||||--- 2 [O] COG0829 Urease accessory protein UreH --------------|---||-|----|||-----|--||----|||---||----|||-||||--- 2 [O] COG0830 Urease accessory protein UreF ---|------------|----|-----||--|----||---------------------|--|--- 2 [G] COG1023 Predicted 6-phosphogluconate dehydrogenase ----||-----------|-|------|---|-----||----|||||-||||-||-||||-|---- 2 [E] COG1027 Aspartate ammonia-lyase ||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||------- 2 [HR] COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes ||||||||||-------|------|-----|-----||----|||||-||||-------------- 2 [O] COG1067 Predicted ATP-dependent protease ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 2 [R] COG1079 Uncharacterized ABC-type transport system, permease component |-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||-- 2 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase |-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-|||| 2 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase --|--|--------------|-||--------|-|--|||--|||||------------||||--- 2 [EP] COG1124 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component |--|||--|-|||-------||---------|----||----|||------|-||||||------- 2 [C] COG1139 Uncharacterized conserved protein containing a ferredoxin-like domain ----------|-|-------------|||-----|-|-----|||-|--|-----|-----|---- 2 [C] COG1140 Nitrate reductase beta subunit ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 2 [E] COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||-- 2 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II |||-|||||||||---||--|------||-||||||------|||||-||||---|---------- 2 [O] COG1180 Pyruvate-formate lyase-activating enzyme ||||----||---||-----|-||-|-||||-----||-----------|--|||||||||||-|| 2 [I] COG1183 Phosphatidylserine synthase |||---||||||-||----|-|----|||-------||-----||---------------|----- 2 [R] COG1205 Distinct helicase family with a unique C-terminal domain including a metal-binding cysteine cluster |-|||||||--||----|||-|----|||||||---||----|||||--|--||||---||-||-- 2 [M] COG1209 dTDP-glucose pyrophosphorylase --||------------|----|-----|||------||----||||||||-|-|||---------- 2 [E] COG1246 N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferases ||||||||||||||||---------|-----|||||------------|----------------- 2 [I] COG1257 Hydroxymethylglutaryl-CoA reductase --|-----------|---||--||---||-------||----------||-|||||---|||||-- 2 [S] COG1262 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||-----||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---||||--- 2 [H] COG1270 Cobalamin biosynthesis protein CobD/CbiB --------|------------------||-------||-----------|---------||-|--- 2 [S] COG1273 Uncharacterized conserved protein -----------------|----||||----|-----||----||||||||-----||||---|--- 2 [NU] COG1317 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein |||---||-|-------|--|---------||||||------|||||-||||---|---------- 2 [F] COG1328 Oxygen-sensitive ribonucleoside-triphosphate reductase |-||||--|-|||---|--|-|||---||-|-----|------------------------||--- 2 [O] COG1331 Highly conserved protein containing a thioredoxin domain ----------------|-||------||||------||---------------|||---------- 2 [O] COG1333 ResB protein required for cytochrome c biosynthesis ----------------||------------|-----||----------||------|||------- 2 [N] COG1334 Uncharacterized flagellar protein FlaG |||---||-|--------------------------||---------------------------- 2 [S] COG1379 Uncharacterized conserved protein ||-|-----||||----|||-------||------|-|---------------------|||||-- 2 [R] COG1402 Uncharacterized protein, putative amidase -|--------------|-----------------|-|----------------------------- 2 [H] COG1424 Pimeloyl-CoA synthetase -|||--|----------|-||-----|---|----|--||---|||--|--|--|-|||------- 2 [S] COG1479 Uncharacterized conserved protein ||||||--||-|------||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---|||||-- 2 [H] COG1492 Cobyric acid synthase -----------------|||----|------|----||----|||----|-|---|-----|||-- 2 [R] COG1512 Beta-propeller domains of methanol dehydrogenase type |||-|||-|||||---||-||------||---|--|-|----|||||----|--|---|------- 2 [L] COG1518 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair ||||--|||--------|---|---|-|||------|-----|||||-||--|--|-------||| 2 [S] COG1520 FOG: WD40-like repeat |-|-----|------|-|--------|||-|---|--||---|||||-|-||----|||------- 2 [P] COG1528 Ferritin-like protein ---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---||||||| 2 [J] COG1530 Ribonucleases G and E -----------------|------||----|-----||----|||||||||||---|||------- 2 [T] COG1551 Carbon storage regulator (could also regulate swarming and quorum sensing) ---|----|-----------||---------|----||----|||------|-||||||------- 2 [S] COG1556 Uncharacterized conserved protein |--|-------|-||---||-|----|||-----|-|---------------||||---|||||-- 2 [I] COG1562 Phytoene/squalene synthetase ----------------|-----------------|-|-----|||||-|||--|||---||||||| 2 [V] COG1566 Multidrug resistance efflux pump ----------------||------||----|-----||----|||||-||-----||||------- 2 [N] COG1580 Flagellar basal body-associated protein -----------------|------||----|-----||---------------------------- 2 [N] COG1582 Uncharacterized protein, possibly involved in motility -----------------|--|-----|||-|-----||---------------------------- 2 [R] COG1623 Predicted nucleic-acid-binding protein (contains the HHH domain) |-|---||---|----||------------|-----||---------------------||||--- 2 [S] COG1633 Uncharacterized conserved protein ----------------------||||----|-----|--------|--||--|--||||----|-- 2 [M] COG1664 Integral membrane protein CcmA involved in cell shape determination -------------------|-------||-------||----|||||-||||---|--|------- 2 [S] COG1666 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|------||----|-----||------------------|||------- 2 [S] COG1699 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---||||||--||--------|----||||-------|----|||----------|-------|-- 2 [E] COG1703 Putative periplasmic protein kinase ArgK and related GTPases of G3E family -----------------|------||----|-----||---------------------------- 2 [S] COG1728 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||----|-|-|----|--||||-||-------|-|-----|||||-||||-||----||||--- 2 [S] COG1738 Uncharacterized conserved protein ----|||-|-|-|||---||-|-----------|---|----------|--|----|||||||--- 2 [E] COG1748 Saccharopine dehydrogenase and related proteins ||||||--||||------||||-----||-|----|-|--------|--|-----|---||||--- 2 [H] COG1797 Cobyrinic acid a,c-diamide synthase ------|||-------|-|||---------|-----|-----|||||--|--||||---|||||-- 2 [M] COG1807 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family -------------------------|--------|-|-----|||||-|-||------|------- 2 [R] COG1823 Predicted Na+/dicarboxylate symporter --|---------|-----||-------||-|-----||-----------|----------|-|--- 2 [E] COG1834 N-Dimethylarginine dimethylaminohydrolase --||------|-|-----|||-----|-----|||--|-----||||-||||||||--|||||--- 2 [P] COG1840 ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component -||||||||||||-----------------------||---------------------------- 2 [S] COG1865 Uncharacterized conserved protein --||--|||--------|-------|----|-----||----------||-----|---||--|-- 2 [NT] COG1871 Chemotaxis protein; stimulates methylation of MCP proteins -----------------|----||--||||------||----------||--|--|---------- 2 [T] COG1875 Predicted ATPase related to phosphate starvation-inducible protein PhoH ||||||-||-||-----|||------|||-----|--|-----------|||---|---||-|--- 2 [R] COG1878 Predicted metal-dependent hydrolase |-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--| 2 [R] COG1881 Phospholipid-binding protein ---|--|||||||||------|------------||------|||||-||-|----||||||||-- 2 [R] COG1896 Predicted hydrolases of HD superfamily -----------------|------------||-|--||----|||||-|---------||||---- 2 [E] COG1897 Homoserine trans-succinylase -----------------|--------|---||----||----|||||-------------||||-- 2 [G] COG1904 Glucuronate isomerase -|||--|||||||---||-|-------------|||-------||-----------||-------- 2 [S] COG1912 Uncharacterized conserved protein |||----|||-------||--|--------||--||------|||||-||--|--|-||----|-- 2 [P] COG1918 Fe2+ transport system protein A --|----|--|-|---|---|-----|||-||----||----|||||-||||-||||||------- 2 [T] COG1966 Carbon starvation protein, predicted membrane protein |-||---------||------|----||||----||-------------|||||||------||-- 2 [E] COG2021 Homoserine acetyltransferase ----------------|-||||----|||||-----||----|||||-||--||||--||||||-- 2 [H] COG2022 Uncharacterized enzyme of thiazole biosynthesis ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 2 [C] COG2025 Electron transfer flavoprotein, alpha subunit ---|----|--|-||-----||----||||----|-|-----|--||-||-----|---|||||-- 2 [I] COG2030 Acyl dehydratase |--|-------------|--|---|||-----|||--|----------|----------------- 2 [S] COG2035 Predicted membrane protein -----------------|||----------|-----||---------------------------- 2 [S] COG2052 Uncharacterized protein conserved in bacteria |--------||||--------|-----||-------||----|||----------|---||-||-- 2 [R] COG2068 Uncharacterized MobA-related protein -------------||---|--|----||||------||-----------|-----|---||-||-- 2 [P] COG2072 Predicted flavoprotein involved in K+ transport ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 2 [C] COG2086 Electron transfer flavoprotein, beta subunit |-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||-- 2 [H] COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis -||---|---||------||-|--------------||----|||||-||-----|---------- 2 [S] COG2105 Uncharacterized conserved protein --|-||||||||||--||--||-----||---|-||------|||-|--|-----|------|--- 2 [R] COG2110 Predicted phosphatase homologous to the C-terminal domain of histone macroH2A1 -----------------|-------------|----||----|||||---|--------||||--- 2 [G] COG2115 Xylose isomerase ---|---------||----|--------------|-|-----|||-|--|-----|------||-- 2 [R] COG2130 Putative NADP-dependent oxidoreductases ---|------|--||-|--|------|||-------||----|||||--|||||||--||||||-- 2 [Q] COG2132 Putative multicopper oxidases --|---|||---------|-----------------|---------|--------|---||-|--- 2 [GR] COG2140 Thermophilic glucose-6-phosphate isomerase and related metalloenzymes --|-------------------||------|-----||----------------------|-|-|- 2 [S] COG2155 Uncharacterized conserved protein ---|--||-|-||-----|-------|||-|---||-----------------------||-||-- 2 [R] COG2159 Predicted metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold -----------------|------------|-----||----|||||-------------|----- 2 [G] COG2160 L-arabinose isomerase ---|-------------|||-------||----||-------|||-|-|----------|-----| 2 [D] COG2161 Antitoxin of toxin-antitoxin stability system --------|-|-|-------------|||-----|-|-----|||-|--|-----|-----|---- 2 [C] COG2180 Nitrate reductase delta subunit --------|-|---------------|||-----|-|-----|||-|--|-----|-----|---- 2 [C] COG2181 Nitrate reductase gamma subunit --||--|||--------|-|----||----|-----||----|||||-||--|--|--|||-||-- 2 [NT] COG2201 Chemotaxis response regulator containing a CheY-like receiver domain and a methylesterase domain ----------------|---|-||||-----------|----|||||-||-||||||||||||||| 2 [T] COG2204 Response regulator containing CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains ----------------||-|-|--||----|------|----------||-----|---|--|--- 2 [T] COG2206 HD-GYP domain |-----||-|-------|--||--------|-||-||-----|||||--|--|------|||||-- 2 [M] COG2222 Predicted phosphosugar isomerases |||-||-----|----||----------------||--------------------|||------- 2 [L] COG2231 Uncharacterized protein related to Endonuclease III |-||--||||---||-|--|-------||-|-----||----|||-|-||--|----------|-- 2 [R] COG2234 Predicted aminopeptidases ---|||-----|-------------|-||--|||||----|-----|-||----------|-|--- 2 [E] COG2235 Arginine deiminase -|----||----------------------------|----------------------------- 2 [M] COG2247 Putative cell wall-binding domain ------------------||------|----|----||----|||-|--|------------|--- 2 [S] COG2268 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------|------|----|||-|---|-|---------|--------|-------|-- 2 [I] COG2272 Carboxylesterase type B ------------------||----------||-|--||||||-||||-||--||||----|-||-- 2 [V] COG2274 ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain ---|-----------------|-----||-------||----------------------|--|-- 2 [R] COG2312 Erythromycin esterase homolog --------------|--|---|------------||------|||--------------||-|--- 2 [Q] COG2313 Uncharacterized enzyme involved in pigment biosynthesis --||-----------------|-----|||------||----------||---------------- 2 [S] COG2320 Uncharacterized conserved protein --|---------------|-||--------------||----|||||-||---|||---|||||-- 2 [R] COG2334 Putative homoserine kinase type II (protein kinase fold) --------------|------|--------------||----|||-|--|-----|--||||||-- 2 [R] COG2351 Transthyretin-like protein ----||---------------|----|||-----||------|||||-||--|||||||||-||-- 2 [S] COG2353 Uncharacterized conserved protein ------||--|||-|------|||-----------|-|-----------|-----|---|||||-- 2 [E] COG2355 Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase homolog -----------------|---|--------|-----||---------------------------- 2 [S] COG2359 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------||----|--------|-------------||------------------|------|--- 2 [E] COG2362 D-aminopeptidase -------------||------|-----||--|---|---------|---|-----|---|---|-- 2 [T] COG2365 Protein tyrosine/serine phosphatase --------|-||---------|--------------||-------||--|-|-------------- 2 [Q] COG2368 Aromatic ring hydroxylase ------------------||-|----|-------|--||----|||---||----|||-||||--- 2 [O] COG2371 Urease accessory protein UreE --------|---|-------||----|----|--||------|||---||-|-------|||||-- 2 [R] COG2388 Predicted acetyltransferase ------||---||-|--|-|---------------|-|----------------------|--|-- 2 [C] COG2421 Predicted acetamidase/formamidase ------------------|-----------|-----||-----------|-----|---------- 2 [R] COG2715 Uncharacterized membrane protein, required for spore maturation in B.subtilis. ---|--------------------------|-----||----|||||-||----------|-|--- 2 [S] COG2718 Uncharacterized conserved protein ---|--------------------------|-----||----|||||-||----------|-|--- 2 [S] COG2719 Uncharacterized conserved protein ---------------------|----|---|-----||-----------|---------------- 2 [V] COG2720 Uncharacterized vancomycin resistance protein ------||-----||--|-|----------|-----||--------------|--|---------- 2 [G] COG2730 Endoglucanase -------------------|-|--------|----||---------------------|-|-|--- 2 [V] COG2746 Aminoglycoside N3'-acetyltransferase ----------------||------------|-----||----|||||-||-----|---------- 2 [KNU] COG2747 Negative regulator of flagellin synthesis (anti-sigma28 factor) ----||-------||--|--|---------||||||--|---------|----||-----|-|--- 2 [F] COG2759 Formyltetrahydrofolate synthetase ---|--------------------------|-----||----|||||-||----------|-|--- 2 [T] COG2766 Putative Ser protein kinase ---------------------|----|---|--|-||-----|||-|--|-----|--|--|---- 2 [P] COG2807 Cyanate permease -------------|-------|--------------||-----------|--|--|------||-- 2 [K] COG2808 Transcriptional regulator ---------------------|--------|--|--|------||-|--|---|----||---|-- 2 [R] COG2819 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily -|||----|-------|----|--||----|-----||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG2834 Outer membrane lipoprotein-sorting protein -------------------|-|------------||--------|-----|--||----------- 2 [R] COG2842 Uncharacterized ATPase, putative transposase --|------------------|-----||---||-||----------------||-----|-||-- 2 [M] COG2843 Putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation) --------|-----------|-----|----|||||------|||||--|||-|||--||||||-- 2 [S] COG2855 Predicted membrane protein -------------||-|-------------------||----------||--|||||||||||||| 2 [C] COG2857 Cytochrome c1 ---|------||---------|----|----||---||----|||||-||||---|--||||||-- 2 [S] COG2860 Predicted membrane protein --||---------||--|---|----|||-||---|-|-----------|-|---|--|||||--- 2 [E] COG2873 O-acetylhomoserine sulfhydrylase -----------------|------|-----|-----||----||||||||-----|---------- 2 [NUO] COG2882 Flagellar biosynthesis chaperone --------|-------|---------|----------|----------||---------------- 2 [T] COG2905 Predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains -------------------------------|-|-||-----------||-----|--|||-|--- 2 [R] COG2910 Putative NADH-flavin reductase ------------------|--------||--|--||----------------|-------|-||-- 2 [R] COG2936 Predicted acyl esterases ----------------|-----------------|-|-----------|----------------- 2 [S] COG3002 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|----||----|||||---|--|||||-|-||---------|---- 2 [G] COG3010 Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase --------------------|---------------||----|||-|-||---------------- 2 [E] COG3048 D-serine dehydratase --|---------------|------------|--|-|---------|-|----------|-||--- 2 [M] COG3049 Penicillin V acylase and related amidases ------------------------------|--|||------|||||-||||-|-|----|-||-| 2 [K] COG3070 Regulator of competence-specific genes --------------------|----------|||-|------|||||-|--||------||-||-- 2 [P] COG3142 Uncharacterized protein involved in copper resistance -----------------|------------|-----||----||||||||-----|---------- 2 [N] COG3144 Flagellar hook-length control protein --||------------|--||-----|-----|-||-------|||---|-|-|||||-||-|--| 2 [S] COG3177 Uncharacterized conserved protein --------------------|-----|---------||--------|-||-|---|---||----- 2 [S] COG3181 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------||------------||----||||||||-----|---------- 2 [N] COG3190 Flagellar biogenesis protein --------------------|--------------||-----|||-|--|---------------- 2 [E] COG3192 Ethanolamine utilization protein ---------------------|----|---------||-----------|-----|---|||||-- 2 [S] COG3195 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-------||||-----||-------|---|-----|---|--|--- 2 [Q] COG3208 Predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis --|---------------------------|----||-----|||||--|-----|------|--- 2 [M] COG3209 Rhs family protein -------------------------------|---||-----|||||--||--------------- 2 [S] COG3223 Predicted membrane protein --------------------|-------------|-|-----|||||-|-----------|----- 2 [T] COG3275 Putative regulator of cell autolysis -------------------|----------|-----||----|-----||-----|---|||||-- 2 [QK] COG3284 Transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism ---------------------------||-------||-----------|---------||-|--- 2 [L] COG3285 Predicted eukaryotic-type DNA primase ---|---------|---------------------|-|--------|-|----------------- 2 [G] COG3325 Chitinase ----------------|-------------------||------------------||||||||-- 2 [S] COG3334 Uncharacterized conserved protein -------------------|---------------|-|----------|--|----||--|-|--- 2 [P] COG3338 Carbonic anhydrase |-|---------------||----------|-----||-----------------|---|||||-- 2 [S] COG3339 Uncharacterized conserved protein ----|-------------|-----------------||-------|-------------||-|--- 2 [S] COG3347 Uncharacterized conserved protein |-||--------------------------|-----||---------------------------- 2 [L] COG3359 Predicted exonuclease --|-||--|---------------------------||---------------------------- 2 [S] COG3377 Uncharacterized conserved protein ---------||||-----------------|||---||--------|--|-----|------|--- 2 [S] COG3382 Uncharacterized conserved protein ----||-----|-|-------|------------|-|---------|--|-||--|---|||||-- 2 [G] COG3386 Gluconolactonase --|----------------|----|--||------|-|-------------------------|-- 2 [R] COG3393 Predicted acetyltransferase ------------------|||----------------|----|--||---||-------||||--- 2 [S] COG3395 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------|---------|---------------|----|------------|----|----- 2 [S] COG3396 Uncharacterized conserved protein -------------------------------|---|-|-------|--||---------------- 2 [S] COG3397 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|-----------------|--------------|----------------------------- 2 [S] COG3403 Uncharacterized conserved protein ---|||-----|-|||---------|-----|||||------------------------------ 2 [I] COG3407 Mevalonate pyrophosphate decarboxylase ---------------------|-----||-------||---------------------------- 2 [Q] COG3424 Predicted naringenin-chalcone synthase -----------------|---|--------|----||----------------------------- 2 [C] COG3426 Butyrate kinase -----------|--------------|----------|-----||-|--|-----|---------- 2 [Q] COG3435 Gentisate 1,2-dioxygenase -------------------------------||||-|-----|||-|------------|--|--- 2 [R] COG3443 Predicted periplasmic or secreted protein -----------------|----------------|--|----|---|---------------|--- 2 [E] COG3457 Predicted amino acid racemase -----------------|---------------|--||---------------------|--|--- 2 [Q] COG3458 Acetyl esterase (deacetylase) ----||--|---------------------------||---------------------------- 2 [S] COG3465 Uncharacterized conserved protein -------------|----------------||--||-------------|---||----|-|---- 2 [R] COG3560 Predicted oxidoreductase related to nitroreductase -------------------------------||--|-------|||---||-|--------|---- 2 [K] COG3617 Prophage antirepressor --|---------------|-|------||-||||-||------------|-----|---||||--- 2 [S] COG3619 Predicted membrane protein -------------------------------||-|-|-----|||-|--|--|--|-------|-- 2 [O] COG3634 Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit --------------|------|--------------||---------------------------- 2 [Q] COG3648 Uricase (urate oxidase) ------||----------||------|||||||||----------------------------|-- 2 [K] COG3682 Predicted transcriptional regulator --------------------------------||||------|||-|---------------|--- 2 [G] COG3684 Tagatose-1,6-bisphosphate aldolase -----------------|||-----|-----------|-----------|--------|||||||| 2 [T] COG3706 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain ------------------------------------||----|||||------------||--|-- 2 [G] COG3717 5-keto 4-deoxyuronate isomerase -----------------------------------|-|----|||-|----|----------|--- 2 [G] COG3730 Phosphotransferase system sorbitol-specific component IIC -----------------------------------|-|----|||-|----|----------|--- 2 [G] COG3731 Phosphotransferase system sorbitol-specific component IIA -----------------------------------|-|----||--|----|----------|--- 2 [G] COG3732 Phosphotransferase system sorbitol-specific component IIBC --------------------------|----|-|||--------------|--|||---|--|--- 2 [S] COG3759 Predicted membrane protein ------------------------------------||----|||-|--------|---|---|-- 2 [S] COG3766 Predicted membrane protein ------------------------------|-----||----|||||-|||--------------- 2 [KT] COG3835 Sugar diacid utilization regulator ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 2 [R] COG3845 ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase components ------------------||----------|-----||---------------------------- 2 [S] COG3854 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------||-|-----||---------------------------- 2 [S] COG3856 Uncharacterized conserved protein (small basic protein) --------------------------|---||--||-------------|-----|---||-|--- 2 [S] COG3865 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|------------|-----||-------|-------------------- 2 [G] COG3867 Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase |-|---------------------------|-----||---------------------------- 2 [S] COG3874 Uncharacterized conserved protein ----------------------||------|-----||---------------------------- 2 [S] COG3876 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|--------|-----||---------------------------- 2 [S] COG3881 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|---|-|----------------------------- 2