| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ ----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||-- 20 [P] COG1629 Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 18 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 15 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily |||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 14 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins ||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 14 [K] COG0583 Transcriptional regulator ||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 13 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis |-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 11 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily ||-||||||||||---|-||-|----|||-------||----|||||-||||---|||||||||-- 10 [C] COG0243 Anaerobic dehydrogenases, typically selenocysteine-containing |-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 10 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 10 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific -----------------|--||----|||-||||||||-|--|||||-|||||--|---|||||-- 10 [K] COG1609 Transcriptional regulators |-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 9 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase ----------------||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 9 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain -------------|||------||--|---------------|||||-||||-||-|||------- 9 [E] COG0814 Amino acid permeases -----------------|--|---|||----|----||-|--|||||-||||---|---|||||-- 9 [G] COG1129 ABC-type sugar transport system, ATPase component ----------------||--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---||||--- 9 [KG] COG1349 Transcriptional regulators of sugar metabolism -----------------|--|---|-|----------|----|--||-||||-------||--|-- 9 [G] COG1593 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component -----------------||-|---|-|---------||----|--||-||||---|---||-||-- 9 [G] COG1638 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, periplasmic component --||------|-|-----|||-----|-----|||--|-----||||-||||||||--|||||--- 9 [P] COG1840 ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component ----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||---||-- 8 [M] COG0859 ADP-heptose:LPS heptosyltransferase |||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|--- 8 [C] COG1145 Ferredoxin --|--------------|--|---|-|--|||----||----|||||-||||---|---|||||-- 8 [G] COG1879 ABC-type sugar transport system, periplasmic component --------------------|-----|----------|----|--||-||||-------||--|-- 8 [G] COG3090 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component --||---||-|||---|-------------------------|||||-||||---|--|-|-|--- 7 [C] COG0437 Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1 ||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 7 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases -------------|||--||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 7 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains |-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|--- 7 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily |-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-|||| 7 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase -||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||-- 7 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component ---|--||--|-|-----||||--|-|------|---|----|||||-||||-|||--|||||--- 7 [P] COG1178 ABC-type Fe3+ transport system, permease component ---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||-- 7 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase ||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase --|----------||-|-||-|----||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 6 [S] COG0316 Uncharacterized conserved protein |||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||| 6 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases -|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases -------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||-- 6 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 6 [P] COG0725 ABC-type molybdate transport system, periplasmic component |||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||-- 6 [R] COG0730 Predicted permeases ----||----------||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein |||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 6 [C] COG0778 Nitroreductase --------|---|||--|||----|||||-||-|||||----|||||--|||---|---||||--- 6 [G] COG1070 Sugar (pentulose and hexulose) kinases |-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 6 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components -||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||-- 6 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components --||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components -----------------|--|-----|--|-|----||----|||||-||||---|---|||||-- 6 [G] COG1172 Ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport systems, permease components ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 6 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases |-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 6 [K] COG1309 Transcriptional regulator ------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 6 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase ---------------------------------------------|----||-||-||-|-||--| 6 [M] COG3306 Glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis --||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||-- 6 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components -----------------|--|-|||||||-||-||||-||--|||||-||||---|||-||||--- 6 [E] COG4166 ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component |||---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [L] COG0084 Mg-dependent DNase ||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--|||||| 5 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases ||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||--- 5 [C] COG0247 Fe-S oxidoreductase |||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--|||||||||||||||||||||||| 5 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs ||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||---- 5 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters ||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 5 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases ||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||--- 5 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins ||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 5 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase |||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||-- 5 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family |||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 5 [L] COG0582 Integrase |||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---||||||| 5 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins -------------||---||------------||--------|||||-||||||||---||||||| 5 [O] COG0625 Glutathione S-transferase --|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||-- 5 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating) ---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 5 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 5 [G] COG1109 Phosphomannomutase ||||----|||||---|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component --------------------|----||---||||||||||||||||||||-|---|-------|-- 5 [G] COG1264 Phosphotransferase system IIB components -------------------|||----|--||||||||||-|||||||-||||||||--||||||-- 5 [P] COG1393 Arsenate reductase and related proteins, glutaredoxin family |||||||||||||--------|----|||-|-----||----|||||-||||-|||---|||||-- 5 [K] COG1522 Transcriptional regulators ---|------|--||-|--|------|||-------||----|||||--|||||||--||||||-- 5 [Q] COG2132 Putative multicopper oxidases --||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||---- 5 [P] COG2608 Copper chaperone --|-----------------|-----|---|-|-|-||----|||||-||||-|||---------- 5 [GE] COG2610 H+/gluconate symporter and related permeases ----------------|--||-||||-||-------------|||||||||||||||||||||||| 5 [M] COG2885 Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins ------------------------------------------|||-|-|-||-------------- 5 [C] COG3069 C4-dicarboxylate transporter ---|-------|------------------------------|||||-|-||---|---------- 5 [R] COG3381 Uncharacterized component of anaerobic dehydrogenases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||| 4 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5) |||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 4 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase] |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control ---------|---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [R] COG0073 EMAP domain |||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 4 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase ||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase -|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 4 [H] COG0132 Dethiobiotin synthetase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases -|--||-------|||--|-|------||-|-----------|||||||||||||||||---||-- 4 [E] COG0241 Histidinol phosphatase and related phosphatases ---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family ------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-|||||||||||| 4 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase |-||------||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain -|--||----------|-|-|------||-|-----------||||||||||-||-|||---|--- 4 [G] COG0279 Phosphoheptose isomerase --||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-||||||||| 4 [C] COG0280 Phosphotransacetylase |||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||-- 4 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs ----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-| 4 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases |-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 4 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II |||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase -------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||-- 4 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase ||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [M] COG0438 Glycosyltransferase |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0443 Molecular chaperone --|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||--- 4 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component |||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 4 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases ||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-|| 4 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase ---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 4 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II |||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [R] COG0517 FOG: CBS domain |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [E] COG0527 Aspartokinases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0550 Topoisomerase IA |||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||------- 4 [L] COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I --------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [J] COG0566 rRNA methylases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32) ||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 4 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation --||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||--- 4 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components ||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes -||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||-- 4 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component |||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----|||||||||||||||||||||||| 4 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class) -------------|||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase --||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases ||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [R] COG0628 Predicted permease ---|---------||||-||-|||--|---------------||||||||||-|||---||||||| 4 [C] COG0633 Ferredoxin --|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 4 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase -|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||-- 4 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases |-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---||||||| 4 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins |||-----||---||---|||---|-----||||-||-----|||||||||||--||||------- 4 [C] COG0716 Flavodoxins -|||--|||-------|---|-|||-|------|||||----------|-||-||-|||------- 4 [R] COG0733 Na+-dependent transporters of the SNF family |--|----|----||-|||--|--|-|---|||-||||-|--|||||-|-||---|||-||-|--- 4 [F] COG0737 5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases ----------------||||||--||||||||--||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases ----------------||||----||----||||-|||----|||||||||||||||||||||||| 4 [M] COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains) -----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [M] COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein) -------------|||||||||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase ----------------||||||||------||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2 ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase -----------------|---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [K] COG0782 Transcription elongation factor --|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators -----------------|||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 4 [R] COG0795 Predicted permeases |-|------|------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 4 [U] COG0811 Biopolymer transport proteins ----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [M] COG0845 Membrane-fusion protein ----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases ----------------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 4 [U] COG0848 Biopolymer transport protein --|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) -------------|||--|-----------------------||||||||||-|||--|||||||| 4 [O] COG1076 DnaJ-domain-containing proteins 1 --|---||------------|||||-|-----|||-||----|||-|-||||-||-|||-||---- 4 [E] COG1115 Na+/alanine symporter |-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 4 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component --|-----|-|-|--------|--------------------|||||-|||||------||||||| 4 [O] COG1138 Cytochrome c biogenesis factor --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||--- 4 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components -||------|------|-------------------------|||||-||||||||--|||||||| 4 [S] COG1238 Predicted membrane protein ||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 4 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes --------------------|----||---||||||||-|||||||||||-|---|-------|-- 4 [G] COG1263 Phosphotransferase system IIC components, glucose/maltose/N-acetylglucosamine-specific |-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---||||||| 4 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators ---|--||||||||||--------------------------|||||-|-||-------------- 4 [R] COG1444 Predicted P-loop ATPase fused to an acetyltransferase |-|-----|------|-|--------|||-|---|--||---|||||-|-||----|||------- 4 [P] COG1528 Ferritin-like protein ---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---||||||| 4 [J] COG1530 Ribonucleases G and E ----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||||||||| 4 [MU] COG1538 Outer membrane protein --------------------|-||--||||------------|||||-|||||||||||||||||| 4 [M] COG1560 Lauroyl/myristoyl acyltransferase -----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||-- 4 [K] COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog ||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [E] COG1605 Chorismate mutase --||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components ||||||-||-||-----|||------|||-----|--|-----------|||---|---||-|--- 4 [R] COG1878 Predicted metal-dependent hydrolase --------------------|||||||---||||||||||||||||||||||||||---|||||-- 4 [G] COG1925 Phosphotransferase system, HPr-related proteins -----------------|||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|---|||||-- 4 [KT] COG1974 SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidases) ---------------------|----|||||----|||----|||||-||||-|||---|||||-- 4 [K] COG2186 Transcriptional regulators ------------------------------------------|||||-|||||||-||||||--|| 4 [R] COG2194 Predicted membrane-associated, metal-dependent hydrolase --|-----------------||---|----||||||||----|||||-|-||------|-|--|-- 4 [E] COG2195 Di- and tripeptidases ----------------------||-------||-|-|-----|||||-||||------|-----|| 4 [G] COG2271 Sugar phosphate permease ------------------------------|-----------|||||-|-||----|||------- 4 [R] COG2704 Anaerobic C4-dicarboxylate transporter --|-||--|----||---||||----|||--|||||-|||--|||||-|||--|||---|||||-- 4 [L] COG2801 Transposase and inactivated derivatives |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors ------------------------------------------|||||-|-||-||---|---|--- 4 [S] COG2990 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||------|||----- 4 [C] COG3005 Nitrate/TMAO reductases, membrane-bound tetraheme cytochrome c subunit ---------------------|--------------------|||||--||||------|||||-- 4 [O] COG3088 Uncharacterized protein involved in biosynthesis of c-type cytochromes ------------------------------------------|||||||-||-|||---------- 4 [M] COG3203 Outer membrane protein (porin) ------------------------------------------|||||---||-||----||||||| 4 [M] COG3637 Opacity protein and related surface antigens ---------------------------------------------------|||------------ 4 [S] COG3792 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------|----||-------|||------------|||-----||-|-|---||||--- 4 [R] COG4178 ABC-type uncharacterized transport system, permease and ATPase components ------------------------------------------|||||--||||------|||||-- 4 [O] COG4235 Cytochrome c biogenesis factor --|-------------|---||--||----|-----------|||||||||||||||||||||||| 4 [M] COG4591 ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component --|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||--- 4 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component --------------------|-----|||--||-||||----|||||-|-||-------|-|-|-- 4 [CO] COG4988 ABC-type transport system involved in cytochrome bd biosynthesis, ATPase and permease components --|-----------------|----------------|-----||||---||||||----|||--- 4 [UW] COG5295 Autotransporter adhesin |||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase -------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 3 [G] COG0021 Transketolase -|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 3 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 3 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase -|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||-- 3 [G] COG0176 Transaldolase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E -------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||-- 3 [G] COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0254 Ribosomal protein L31 |||---|||||||-----------------|-|||-|--||-|||-|-|-||-------------- 3 [G] COG0269 3-hexulose-6-phosphate synthase and related proteins --||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases ---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---||||||| 3 [F] COG0283 Cytidylate kinase |||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 3 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes |-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 3 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases |||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||-- 3 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases ||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||-- 3 [O] COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases ||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning |||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||-- 3 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function |||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain |-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||-- 3 [E] COG0520 Selenocysteine lyase ||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---||||||| 3 [E] COG0531 Amino acid transporters -------------||---||-||||-|---------------||||||||||||||-------|-- 3 [O] COG0545 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 1 --||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|----- 3 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family |-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase |-------|--|-|||-||-||---|----||||||||-|||||||||-||||--|---|||||-- 3 [G] COG0580 Glycerol uptake facilitator and related permeases (Major Intrinsic Protein Family) |-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-|| 3 [ER] COG0591 Na+/proline symporter ||||---||----------|-----------||-||--|||-------||||||--|||-||-|-| 3 [V] COG0610 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases |||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase ----------------|||||||||||||-|||||||||---|||||||||||||||||||||||| 3 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases |||-----|--|-----|||----------|-----------|||||---||--------|----- 3 [R] COG0641 Arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase) |-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family -------------||---||-|----|||-----|-||----|||||-||-|||||---||||||| 3 [HC] COG0654 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases |-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||-- 3 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins -------------|------------|---------------|||||-|||||------------- 3 [G] COG0676 Uncharacterized enzymes related to aldose 1-epimerase -------------||----|-|----|----|-|--------||||||||||||||------||-- 3 [E] COG0722 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase ||||-|-||----------|-------||--|||||--|||||||-|-|||||---|||-||-|-| 3 [V] COG0732 Restriction endonuclease S subunits --|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||--- 3 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component ------------------||----------------------------||||----|||||-|--- 3 [P] COG0748 Putative heme iron utilization protein ----------|-|---||||-------------||-||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [R] COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I |-||--|||----|||-|||-|--||-||-|----|||----|||||-|||||--|||||||||-- 3 [T] COG0784 FOG: CheY-like receiver -------------|||-----|--------------------|||||-||||-|||||||||||-- 3 [R] COG0790 FOG: TPR repeat, SEL1 subfamily ------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [M] COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins) --|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-||||||||||||| 3 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain |-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||-- 3 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component ||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||-- 3 [R] COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily) ||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-| 3 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases ----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||-- 3 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases |||-|||||||||---||--|------||-||||||------|||||-||||---|---------- 3 [O] COG1180 Pyruvate-formate lyase-activating enzyme --|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes ---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---||||||| 3 [K] COG1278 Cold shock proteins -----------------|------------|||-|||-----|||-|-||||-||-|||||-|--- 3 [M] COG1368 Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily ----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-||||||| 3 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes |||------|-------|------------------------||||||||||-------------- 3 [P] COG1553 Uncharacterized conserved protein involved in intracellular sulfur reduction --------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 3 [M] COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase ----------------|-----||||----|-----||----||||||||||||||--|||||||| 3 [T] COG1734 DnaK suppressor protein -----------------|--------|---||||||||-|--|||||-||||-|||---|||||-- 3 [K] COG1737 Transcriptional regulators ---|--||----|-------|----|----|---|-||-------||-|-||-||-|||------- 3 [C] COG1757 Na+/H+ antiporter --------------------|-|||||---||||||||-||||||||-||||-|||---|||||-- 3 [GT] COG1762 Phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain (Ntr-type) ------------------||----||----||||-|||-------|--|-|||------------- 3 [M] COG1876 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase --|----|--|-|---|---|-----|||-||----||----|||||-||||-||||||------- 3 [T] COG1966 Carbon starvation protein, predicted membrane protein --------|-|||---|-||------||||------------|||||-|||||--|--||||||-- 3 [T] COG2062 Phosphohistidine phosphatase SixA -----|--|-----------|-----|------|-|--||------|---|||-|-||-|--|--- 3 [L] COG2189 Adenine specific DNA methylase Mod ------------------||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 3 [TK] COG2197 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain -------------||---||----------------------|||||-||||----------|--- 3 [T] COG2198 FOG: HPt domain -----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||-- 3 [K] COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins ||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 3 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid --|-----------|-----|---------|----||||---|||||-||||-||||||-|-||-- 3 [R] COG2249 Putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B) -|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|-- 3 [R] COG2252 Permeases ---|-------|-||----|-|----||||----|-||----|||||-||||-|||---|||||-- 3 [S] COG2259 Predicted membrane protein --------------------|---------|--|-----|--|||||-|-||----||-------- 3 [G] COG2731 Beta-galactosidase, beta subunit ------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|-- 3 [U] COG2831 Hemolysin activation/secretion protein ------------------------------------------|||||-|||||--|--------|| 3 [S] COG2904 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------||||||||||||||---||||||| 3 [J] COG2913 Small protein A (tmRNA-binding) --------------------------|-------||||----|||||-||||---|---|||||-- 3 [R] COG2962 Predicted permeases --------------------|---------------------|||||-||||||||---|||||-| 3 [V] COG3023 Negative regulator of beta-lactamase expression -----------------|--|---------------------|||||-||||-------------- 3 [T] COG3086 Positive regulator of sigma E activity ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 3 [S] COG3102 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------|||||-- 3 [S] COG3108 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||-------------- 3 [T] COG3109 Activator of osmoprotectant transporter ProP --||---|------|------------||-------------|||||--|||-------|||||-- 3 [P] COG3119 Arylsulfatase A and related enzymes ------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|-- 3 [U] COG3210 Large exoproteins involved in heme utilization or adhesion -----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-||||||| 3 [M] COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes -------------------|||----|--------|||----|||-|---||-------------- 3 [E] COG3340 Peptidase E ------------------------------------------|||||---||-||----||||--- 3 [MU] COG3468 Type V secretory pathway, adhesin AidA ---|----------------------------------------------|--||----------- 3 [L] COG3676 Transposase and inactivated derivatives ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 3 [S] COG3691 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||--|||-------------- 3 [M] COG3765 Chain length determinant protein |||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||--- 3 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components ||--------------|-||-|---|----------------|||||-||||---|--|||--|-- 3 [S] COG4121 Uncharacterized conserved protein ---------------------|--------||-|||||--|-||||||||||---|---------- 3 [G] COG4668 Mannitol/fructose-specific phosphotransferase system, IIA domain ------------------------------------------------|-||-------------| 3 [R] COG5595 Zn-ribbon-containing, possibly nucleic-acid-binding protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit ||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||------------- 2 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase |||||||||||||||---||----------------------|||||-||||-------------- 2 [J] COG0023 Translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1) and related proteins ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase ---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||-- 2 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation) --||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0031 Cysteine synthase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase |--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||-- 2 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase -|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||-- 2 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC ||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--|||||||| 2 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||-- 2 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0048 Ribosomal protein S12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0049 Ribosomal protein S7 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0051 Ribosomal protein S10 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0052 Ribosomal protein S2 ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase -||---||--||-|--|-||||||--|||-||||--||----|||||-||||-------||-|--- 2 [G] COG0058 Glucan phosphorylase |||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 2 [G] COG0061 Predicted sugar kinase ||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit |||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit ||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0077 Prephenate dehydratase |||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0080 Ribosomal protein L11 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0081 Ribosomal protein L1 ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0082 Chorismate synthase -|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||------- 2 [E] COG0083 Homoserine kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0087 Ribosomal protein L3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0088 Ribosomal protein L4 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0089 Ribosomal protein L23 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0090 Ribosomal protein L2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0091 Ribosomal protein L22 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0092 Ribosomal protein S3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0093 Ribosomal protein L14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0094 Ribosomal protein L5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0096 Ribosomal protein S8 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0098 Ribosomal protein S5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0099 Ribosomal protein S13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0100 Ribosomal protein S11 |||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0102 Ribosomal protein L13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0103 Ribosomal protein S9 ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase |||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase ||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-| 2 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) |||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||-- 2 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase --||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [C] COG0114 Fumarase -|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||---------- 2 [L] COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase -------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase |||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases ||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||-- 2 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase ||--|-||--||-|----||-------||-------------|||||-||||-|||---||||--- 2 [R] COG0121 Predicted glutamine amidotransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0125 Thymidylate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase |||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--|||||||| 2 [J] COG0130 Pseudouridine synthase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase ||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase ||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase --||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful) ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase ||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase -|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0148 Enolase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase ------|---|--||--|--|---|-|||-||-|--||----|||||-|-||-------------- 2 [G] COG0153 Galactokinase -|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes ||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||-- 2 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase ---|---------||---||----------------------|||||-||||-||||||-||-|-- 2 [G] COG0158 Fructose-1,6-bisphosphatase ||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain -|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0164 Ribonuclease HII ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase -|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase ||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||---- 2 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [E] COG0174 Glutamine synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit |||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 2 [Q] COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0185 Ribosomal protein S19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0186 Ribosomal protein S17 -|||--|||-|||-----||-|---------------|--||||||||||||||||---|||||-- 2 [HJ] COG0189 Glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase) --||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||| 2 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase -------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase -------------|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0194 Guanylate kinase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0195 Transcription elongation factor -------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0196 FAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0198 Ribosomal protein L24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0199 Ribosomal protein S14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0200 Ribosomal protein L15 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0203 Ribosomal protein L17 -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|--- 2 [G] COG0205 6-phosphofructokinase ||||||||||------||||||--||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 2 [D] COG0206 Cell division GTPase |||-----||---|||----||----||||||||||||-|||||||||||||||||---|||||-- 2 [F] COG0207 Thymidylate synthase ---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-||| 2 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit |-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0211 Ribosomal protein L27 |--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-|||||||||||||||||| 2 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase |||||||||||||||--|--||----|||||--|||||------------||-------------- 2 [H] COG0214 Pyridoxine biosynthesis enzyme --|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0216 Protein chain release factor A -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein -|||--||||---|--||--|---------|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0218 Predicted GTPase ------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||-- 2 [J] COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class) -------------||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase |-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit |-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 2 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 2 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component -------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0227 Ribosomal protein L28 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0228 Ribosomal protein S16 |-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||-- 2 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0230 Ribosomal protein L34 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A) ------------------|--|----||||-----|------|||||-||||---|---||||||| 2 [F] COG0232 dGTP triphosphohydrolase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0233 Ribosome recycling factor --|----------||-||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10) --|----------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0238 Ribosomal protein S18 -|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation |-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 2 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0244 Ribosomal protein L10 ----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||-- 2 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase --|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-|||||||||||||||||| 2 [FP] COG0248 Exopolyphosphatase --||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---||||||| 2 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family) |||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0250 Transcription antiterminator ||------||------|||||-||--|||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0255 Ribosomal protein L29 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0256 Ribosomal protein L18 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0257 Ribosomal protein L36 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0261 Ribosomal protein L21 --|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-| 2 [H] COG0262 Dihydrofolate reductase --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts ------------------||-|----||||-||||||||||||||||-||||||||---|||||-| 2 [L] COG0266 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0267 Ribosomal protein L33 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0268 Ribosomal protein S20 ---|---------||---||----------------------||||||||||||||---||||||| 2 [T] COG0271 Stress-induced morphogen (activity unknown) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II) |--|||----|-|---||||-|--|-|||||||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 2 [F] COG0274 Deoxyribose-phosphate aldolase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis ----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase) ---|---------|||--||----------------------||||||||||||||---||||||| 2 [O] COG0278 Glutaredoxin-related protein --|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [C] COG0281 Malic enzyme --|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-|| 2 [C] COG0282 Acetate kinase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase ---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase ||||---||----------|-------||--|||||--|||-|||-|-|||||||||||-||-|-| 2 [V] COG0286 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit ||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase |--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [P] COG0288 Carbonic anhydrase |||-----||------||||--||--|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3) -------------|--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0291 Ribosomal protein L35 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0292 Ribosomal protein L20 ||||||--||---|||--------||----------------||||||||||||||---||||||| 2 [J] COG0293 23S rRNA methylase ---|------|-|||--|---|---|-||||||||||||||||||||-|-||-------||-||-- 2 [F] COG0295 Cytidine deaminase --|--------|-|--|-||||||--|||----|--|-----|||||-||||---|---||-|--- 2 [G] COG0296 1,4-alpha-glucan branching enzyme -|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|--- 2 [G] COG0297 Glycogen synthase --||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN |||||||||||||----|------|-----|||||||||||||||||-||||-------------- 2 [H] COG0301 Thiamine biosynthesis ATP pyrophosphatase ----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--||||||||||| 2 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I |||||||||||||---|-||-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [H] COG0303 Molybdopterin biosynthesis enzyme -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0305 Replicative DNA helicase ||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|--- 2 [P] COG0306 Phosphate/sulphate permeases ---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain --|-||----||-|||--||-|----||||-|||--------|||||-||||||||---|||||-- 2 [E] COG0308 Aminopeptidase N |||||||||||||||--|---|----|||||--|||||------------||-------------- 2 [H] COG0311 Predicted glutamine amidotransferase involved in pyridoxine biosynthesis ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0313 Predicted methyltransferases |||||||||-|||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [H] COG0314 Molybdopterin converting factor, large subunit |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [H] COG0315 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase ---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 2 [H] COG0320 Lipoate synthase ----------|--||---||-|----||||------------||||||||||||||---||||||| 2 [H] COG0321 Lipoate-protein ligase B |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex --||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---||||||| 2 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase) -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase --|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold -------------|||--|||---|||||||----|||----|||||||||||--||||-|-|-|| 2 [O] COG0326 Molecular chaperone, HSP90 family ||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||------- 2 [S] COG0327 Uncharacterized conserved protein ---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0328 Ribonuclease HI -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase ----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0333 Ribosomal protein L32 --|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|-- 2 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0335 Ribosomal protein L19 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase ----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase -|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------| 2 [L] COG0338 Site-specific DNA methylase -------------||---||-|----|---------------|||||-||||||||---|||||-- 2 [E] COG0339 Zn-dependent oligopeptidases ||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD |||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase ----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||-- 2 [S] COG0344 Predicted membrane protein |-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase |||-----||------||||-|----|||-||---||-----|||||-||||||||---|||||-- 2 [E] COG0347 Nitrogen regulatory protein PII -||-||--||-|------||----------|-----------|||-|-||||-|||||||||||-- 2 [C] COG0348 Polyferredoxin -------------|----||------|||||-----------|||||-|||||------||||||| 2 [J] COG0349 Ribonuclease D ||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-| 2 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase |||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase --|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase ----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) -------------||-|-||-|----||||------------||||||||||||||---||||||| 2 [R] COG0354 Predicted aminomethyltransferase related to GcvT --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit) --|----------|--|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type) --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0359 Ribosomal protein L9 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0360 Ribosomal protein S6 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1) -------------|||-|||--||||||||-|-||||-----|||||||-||-||----||||--- 2 [G] COG0362 6-phosphogluconate dehydrogenase -------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||-- 2 [G] COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase |-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||-- 2 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase |||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase |||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [I] COG0439 Biotin carboxylase |||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||-- 2 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division ---|----|---------||------||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 2 [H] COG0447 Dihydroxynaphthoic acid synthase -----------------|||||||--||||||-|--||----|||||-|-||-------||-|--- 2 [G] COG0448 ADP-glucose pyrophosphorylase ||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains |||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase ||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 2 [R] COG0456 Acetyltransferases |||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 2 [R] COG0457 FOG: TPR repeat ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family) |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase |||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| 2 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase --|----------||-||--||||||----|-----|||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase -|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||-- 2 [G] COG0469 Pyruvate kinase |||||||||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication |||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--|||||||| 2 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase |-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2 ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA -------------||-||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain ||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--|||||||| 2 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0486 Predicted GTPase ||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0492 Thioredoxin reductase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase ||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||-- 2 [R] COG0496 Predicted acid phosphatase ----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0498 Threonine synthase |||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 2 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase) -|-----------||----|-|||-|-||-||||||||-|--|||||||||||||---|||||--- 2 [L] COG0507 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member --|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||-- 2 [L] COG0514 Superfamily II DNA helicase ---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|--- 2 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit |||||||||||||---|--|-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [H] COG0521 Molybdopterin biosynthesis enzymes |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0528 Uridylate kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity ||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 2 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0536 Predicted GTPase |||||||||-|||||||-||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases -------------||-||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0539 Ribosomal protein S1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase |------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||| 2 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor) |-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 2 [R] COG0546 Predicted phosphatases ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-| 2 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase ---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||-- 2 [C] COG0554 Glycerol kinase ||||||||||||------||-|-----||-|------|----|||||-||||||||---|||||-- 2 [O] COG0555 ABC-type sulfate transport system, permease component |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex ---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [K] COG0557 Exoribonuclease R |||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||-- 2 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase --||--|||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases ||||||--||-||-----||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-| 2 [J] COG0565 rRNA methylase -------------||------|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 2 [C] COG0567 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, and related enzymes ||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||---- 2 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease ---|---------||--|||-|-|||----|||||||||-|||||||-|-||-------------- 2 [F] COG0572 Uridine kinase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||-- 2 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein) ---|||-----|-|||--|--|---|||||-|||||||----|||||-|||||--|---||||--- 2 [C] COG0578 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 2 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component ---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||-- 2 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase |||||||||||||||||----|--------------------|||||-||||----|||------- 2 [S] COG0585 Uncharacterized conserved protein ----||-----|------||-|--||||||||--||||----|||||||||||||||||--|||-- 2 [S] COG0586 Uncharacterized membrane-associated protein ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit --|----------||-----|-||||||||||||||------||||||--||||||----||||-- 2 [G] COG0588 Phosphoglycerate mutase 1 --|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---||||||| 2 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog) -----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0594 RNase P protein component ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase -||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-| 2 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters -||-----||-------|||||||--|---|--||-||----||||---|||---|---|||||-- 2 [P] COG0600 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component |||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase |-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [P] COG0605 Superoxide dismutase |--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-| 2 [O] COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity ||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease |||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|-- 2 [H] COG0611 Thiamine monophosphate kinase ----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--||||||||||| 2 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases ||||----|--||---||||-|--------|------|----|||||-||||-|||---------- 2 [R] COG0613 Predicted metal-dependent phosphoesterases (PHP family) |||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||-- 2 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent) ----------------|-||-|||---|||-|--||||----|||-||-|||-||||||||||||| 2 [I] COG0623 Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH) -------------|----||------||||-|||||------|||||--|||-|||---|||||-- 2 [R] COG0627 Predicted esterase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit ----------------||--||----||||||-|||||||||||||||||||||||---|||||-- 2 [F] COG0634 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase ||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase) ----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-| 2 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein ----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase -------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-||||||||||||| 2 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH ||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-||||||| 2 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase -------------||---||-------------------------|--|-||-|||---|||||-- 2 [O] COG0678 Peroxiredoxin ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0681 Signal peptidase I ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase |||-----||---|-------|----||||-------|----|||||-||||---|---||-|--- 2 [H] COG0684 Demethylmenaquinone methyltransferase --|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase ||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-|| 2 [I] COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase |---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---||||||| 2 [J] COG0689 RNase PH ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0691 tmRNA-binding protein -------------|||----||||-|||||-||||||||||||||||||||||||||||||----- 2 [L] COG0692 Uracil DNA glycosylase ---|----|----||---||--||----------||||----|||||||||||---|||||||||| 2 [O] COG0694 Thioredoxin-like proteins and domains --|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0703 Shikimate kinase -||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||-- 2 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC --|------|-|----||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase |-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0708 Exonuclease III -|-------|||----|-------------------------|||||--|||------|-|----- 2 [E] COG0709 Selenophosphate synthase --|-------------|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b -------------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein) -||-----||---||--|||||||--|---|--||-||----||||--||||---|---|||||-- 2 [P] COG0715 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components |||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-||||||||||||||||| 2 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase -----------------|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase ----------------|||||||||||||||-----------|||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor ----------------|---|---------------------|||||-||||||||---|||||-- 2 [M] COG0729 Outer membrane protein --|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||-- 2 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases -----------------|||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase ----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|-- 2 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase |||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||-- 2 [H] COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains |||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1 ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit -------------||------|----|-------||||----|||||-||||-||||||||||--- 2 [P] COG0753 Catalase --|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [O] COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component -------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-||||||| 2 [F] COG0756 dUTPase -----------------|||||----|||||-----||-------|-||||||--|||||||||-- 2 [E] COG0757 3-dehydroquinate dehydratase II ----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-| 2 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake ----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||- 2 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 2 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein -----------------||||-||||||||||||||||----|||||-||||---||||||-||-- 2 [S] COG0762 Predicted integral membrane protein ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0763 Lipid A disaccharide synthetase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [Q] COG0767 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase |||------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase --|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||-- 2 [F] COG0775 Nucleoside phosphorylase ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit ----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0781 Transcription termination factor ---|--------------||||--|||----|||||||-|--|||||-|||||--|||||-|-||| 2 [P] COG0783 DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant) |-|---|||-|-|---||||||--|-||||--||--||------------||----||-||||--- 2 [O] COG0785 Cytochrome c biogenesis protein --------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0787 Alanine racemase ---|------------|-||-|----|||-------||----|||-|-|||||--|||||||-|-- 2 [F] COG0788 Formyltetrahydrofolate hydrolase ----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||-- 2 [L] COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase ----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0793 Periplasmic protease |||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation ----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 2 [M] COG0796 Glutamate racemase ----------------|-||----||----|-----------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0797 Lipoproteins ----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [S] COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein -----------------|||----|-----||||--||----|||||-||||||||||-|||||-- 2 [G] COG0800 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 2 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 2 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase |-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-|| 2 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin --||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC ----------------||||||--||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing ----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II ----------------||||||---|----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase) ----------------|--||---------------------|||||-||||||||||||||||-- 2 [M] COG0810 Periplasmic protein TonB, links inner and outer membranes ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase -----------|--------||--|------||||||-|||||||||||-||----||----|--- 2 [F] COG0813 Purine-nucleoside phosphorylase ----------------||||-|||||||||------------|||||-||||-||||||||||||| 2 [M] COG0815 Apolipoprotein N-acyltransferase ----------------||||||||--|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis) -----------------||||||||-||||------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit -----------------|||-|--------||||||||----|||||-|||||||||||||||--- 2 [M] COG0818 Diacylglycerol kinase ----||||--|||||----|------|----|-|||||------------||----|||--|---- 2 [K] COG0819 Putative transcription activator ----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||-- 2 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 2 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis --||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||| 2 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation --|-----|---------||--||------------------|||||-|||||--||||||||||| 2 [U] COG0823 Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system |-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [R] COG0824 Predicted thioesterase ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit |||------|-|----|--|||--------||||||||----|||||-||||-|||||||||---- 2 [O] COG0826 Collagenase and related proteases ----------------|-||--||||----|||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0828 Ribosomal protein S21 --|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump ---------|------||--||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [D] COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division ---|----|---------||-|-----||-------------||||||||||-||-|||------- 2 [R] COG0857 BioD-like N-terminal domain of phosphotransacetylase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A ----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [M] COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase ------------------||-|----|||-|---||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [P] COG0861 Membrane protein TerC, possibly involved in tellurium resistance ---|----|-|-|||||-|||---||||||---------------|--||||-------------- 2 [I] COG1022 Long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming) ----||-----------|-|------|---|-----||----|||||-||||-||-||||-|---- 2 [E] COG1027 Aspartate ammonia-lyase ----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 2 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase --||----------|--|||------||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 2 [E] COG1045 Serine acetyltransferase |||||||||||||-------||--|-----------------|||||-|||||||||||------- 2 [O] COG1047 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2 ||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit |||||||||-|||-----|--|-----||--|----------|||||---||---|---------- 2 [H] COG1056 Nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase ----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease ||||||||||-------|------|-----|-----||----|||||-||||-------------- 2 [O] COG1067 Predicted ATP-dependent protease -----|-------||-----------||||-|||-|||----|||||-|-||-------||||--- 2 [H] COG1072 Panthothenate kinase --------------------|-||||-||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains) |---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----||| 2 [D] COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis --------------------||||-||---||||||||-|||||||||||||||||------||-- 2 [G] COG1080 Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria) --|---------------|-------------------------------||-|--|-|------- 2 [M] COG1083 CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase --|---|-|-|--||--|--------||--||----------|||||-|-||-------------- 2 [C] COG1085 Galactose-1-phosphate uridylyltransferase -|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-|||||| 2 [MG] COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases |------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||-- 2 [M] COG1087 UDP-glucose 4-epimerase |-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||-- 2 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase ----||------------||------||||----||||----|||||--||||------------- 2 [R] COG1090 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase -|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||--- 2 [R] COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases --|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-||||||||||||| 2 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes -----------------|--||---||||-||||||||--|||||||-||||---|---------- 2 [G] COG1105 Fructose-1-phosphate kinase and related fructose-6-phosphate kinase (PfkB) --------------------|-|||-|---|-|||-|-----|||||-||||-------------- 2 [E] COG1114 Branched-chain amino acid permeases -||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||-- 2 [P] COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 2 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [Q] COG1127 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component |-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 2 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component ------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [P] COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component ----------------||||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [R] COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component ----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||-- 2 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase ----------------||--|||||||||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG1158 Transcription termination factor ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG1159 GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG1160 Predicted GTPases --|-------------|||||----||||||||||||||||||||||-||||||||------|--- 2 [R] COG1162 Predicted GTPases ---|--------------||------||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 2 [H] COG1165 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase ---|--------------||------||||-|--|||-----|||||-||||---------|---- 2 [HQ] COG1169 Isochorismate synthase ---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [E] COG1171 Threonine dehydratase ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 2 [E] COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||-- 2 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II -------------||-----|---------|---|-||----|||||-|||||||||||------- 2 [H] COG1179 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 1 -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase) -------------||-|||||||||||||||||-||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG1186 Protein chain release factor B -----------------|--|-----|---||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 2 [J] COG1188 Ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit (S4 paralog) --|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||----- 2 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II) |--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase ----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------||||||| 2 [L] COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway) -----------------|||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase ||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|-- 2 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases ----------------||||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [LK] COG1200 RecG-like helicase ----------------||||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains) |||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||-- 2 [M] COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase ------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||-- 2 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG1212 CMP-2-keto-3-deoxyoctulosonic acid synthetase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone ------------------||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [T] COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response -------------||-|-||--||--||||------------|||||||||||-----|||||||| 2 [P] COG1218 3'-Phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit ----------------||-------|--------||||----|||||||||||--||||||||||| 2 [O] COG1220 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), ATPase subunit --||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-| 2 [O] COG1225 Peroxiredoxin --|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||-- 2 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component --||---------||-|||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains |||---||-||-|---|---|-----------|--|||----|||||-||||-||||||-----|| 2 [I] COG1267 Phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins --||||--|-------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 2 [C] COG1271 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1 -|--|-|||----||-----------|||--||||-------|||-|-|-||-|------------ 2 [P] COG1275 Tellurite resistance protein and related permeases |-|-||--|||||----||--|----|---------||----|||||-|||||--|--||||||-- 2 [E] COG1280 Putative threonine efflux protein ----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 2 [O] COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family ------------------||-------|||------------|||||-||||-|||---||||||| 2 [C] COG1282 NAD/NADP transhydrogenase beta subunit ----------------|-||||--|--||-||-|-|||----|||||--|||---|---|||---- 2 [S] COG1285 Uncharacterized membrane protein ------------------------||-----|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [R] COG1286 Uncharacterized membrane protein, required for colicin V production ------------------|--|------------|||-----|||||-||||||||--|||||--- 2 [S] COG1289 Predicted membrane protein ---|--------------------|-|||-----||||----|||||-||||-||-----|----- 2 [M] COG1292 Choline-glycine betaine transporter --||------------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 2 [C] COG1294 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2 --|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 2 [S] COG1295 Predicted membrane protein --|-----|-----------||----|----|-|||||----|||||-||||-|||||-||||--- 2 [E] COG1296 Predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance) |||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----||||||| 2 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases |-|---||||||----||||-|-----||||----|||-----------||||--|---||-||-- 2 [E] COG1305 Transglutaminase-like enzymes, putative cysteine proteases ----------------|-|||||||||||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG ----------------------||-------|||-----|--|||||-||||||||---||||||| 2 [S] COG1322 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 2 [K] COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains |||---||-|-------|--|---------||||||------|||||-||||---|---------- 2 [F] COG1328 Oxygen-sensitive ribonucleoside-triphosphate reductase ----------------------||-|-||-------------|||||||||||||----------- 2 [L] COG1330 Exonuclease V gamma subunit --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 2 [M] COG1346 Putative effector of murein hydrolase ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 2 [C] COG1347 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrD --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 2 [R] COG1380 Putative effector of murein hydrolase LrgA ------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---||||||| 2 [L] COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) ----------------||||||--||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 2 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|----|||-||||-||--||||-------|--||||-------------- 2 [M] COG1388 FOG: LysM repeat ----------------|---------||||------------|||||-||||-|||---|||||-- 2 [OT] COG1391 Glutamine synthetase adenylyltransferase |||---|||--|-----|---|||------|---|||-----------||||---|---||-|--- 2 [P] COG1392 Phosphate transport regulator (distant homolog of PhoU) ----------------||||-|----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 2 [R] COG1399 Predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein |-|---|||||-|||-|-||--||--||||||--|||-----|||||-||||---|---|||||-- 2 [R] COG1409 Predicted phosphohydrolases ---|------------||---|----|||-------||----|||||-||||---|--||||||-- 2 [K] COG1414 Transcriptional regulator -----------------|-|--||||-----|||||||----|||||-|||||--|--------|| 2 [S] COG1426 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---||||||| 2 [S] COG1434 Uncharacterized conserved protein ---||-----|----|-|---|---|----|||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 2 [F] COG1435 Thymidine kinase -----------------|---|-|--||||||||||||----|||||-|-||-------------- 2 [K] COG1438 Arginine repressor ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [H] COG1441 O-succinylbenzoate synthase ---------------------------------|--|-----|||-|---||----||--|---|| 2 [M] COG1442 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins, LPS:glycosyltransferases --------------------||---||---||||||||-||||||||-||||---|---------- 2 [G] COG1445 Phosphotransferase system fructose-specific component IIB -------------||-----|-||------------------|||||-||||||||----|-|--- 2 [E] COG1448 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase ----------------|-------||----------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG1452 Organic solvent tolerance protein OstA ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||-- 2 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [Q] COG1463 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, periplasmic component --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [P] COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit -----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---||||||| 2 [G] COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases --||||||---|-----|||||----|||-||-|||||----|||----|||---|--||||||-- 2 [R] COG1473 Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase --|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||-- 2 [H] COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis -|||--|----------|-||-----|---|----|--||---|||--|--|--|-|||------- 2 [S] COG1479 Uncharacterized conserved protein -||---|||-||------||-|-----||-----------------|---|-|--|---||-||-| 2 [R] COG1487 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain |---||--|-|||---||||----------|------|----|||||-||||-------|||-|-- 2 [R] COG1489 DNA-binding protein, stimulates sugar fermentation -------------||-||--||----|||-||||||||----|||||-||||-|||---------- 2 [J] COG1490 D-Tyr-tRNAtyr deacylase --|---------------||||----|||||-----||----|||-|-|-||---------|||-- 2 [G] COG1494 Fructose-1,6-bisphosphatase/sedoheptulose 1,7-bisphosphatase and related proteins ---------------------|||------------||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [O] COG1495 Disulfide bond formation protein DsbB ----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein -||-------------||--||--|-----------||----|||||-|-|||------||-||-- 2 [E] COG1509 Lysine 2,3-aminomutase |||-|||-|||||---||-||------||---|--|-|----|||||----|--|---|------- 2 [L] COG1518 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG1519 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase --|--------|-----||-||||--|||-|-||--||-|--|||||-||||---|---||-|--- 2 [G] COG1523 Type II secretory pathway, pullulanase PulA and related glycosidases ||-|--||-|---||-|--|------|-------|-|--|||-------|||-||---|||||--- 2 [L] COG1525 Micrococcal nuclease (thermonuclease) homologs |||-||--|-||--------------|||-----||||----|||||-||||---|--||||||-- 2 [C] COG1526 Uncharacterized protein required for formate dehydrogenase activity ||||--||||-||-------|---------||||||||----|||||-||||||||---------- 2 [J] COG1534 Predicted RNA-binding protein containing KH domain, possibly ribosomal protein -------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase ----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---||||||| 2 [J] COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1) -----------------|------||----|-----||----|||||||||||---|||------- 2 [T] COG1551 Carbon storage regulator (could also regulate swarming and quorum sensing) --|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|------- 2 [L] COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins ----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [R] COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein ----------------||--|----|----|----|||----|||||-||||||||---|||||-- 2 [S] COG1561 Uncharacterized stress-induced protein -----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit ---|-------------||||-----||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 2 [H] COG1575 1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase -----------------|--||--------||||||||||--|||||-||||||||||||||||-- 2 [S] COG1576 Uncharacterized conserved protein ------------------||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 2 [M] COG1589 Cell division septal protein ----------------||||----------------------|||-|-||-|||||--||||||-- 2 [M] COG1596 Periplasmic protein involved in polysaccharide export ---|||----|||--------|||--|-------||||----||||||||||-|||||||||||-- 2 [I] COG1607 Acyl-CoA hydrolase ---|----||-|---------|---|--------|-||----|||-|-||||-||||||--|---- 2 [C] COG1620 L-lactate permease ----------------||--|---------|||-|---------------|||||-|||-----|| 2 [S] COG1636 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------|-----|-||||||-||||--|||--------|||||-||||---|---------- 2 [G] COG1640 4-alpha-glucanotransferase -------------|||-----|--|||---------------|||||-||||||||---|||||-- 2 [L] COG1643 HrpA-like helicases ---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-|||||||||||||||||| 2 [O] COG1651 Protein-disulfide isomerase --||---||------------|--------||||||||----|||||-|||||------------- 2 [K] COG1654 Biotin operon repressor --------------------||----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 2 [R] COG1660 Predicted P-loop-containing kinase ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG1663 Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase -------------------|-------||-------||----|||||-||||---|--|------- 2 [S] COG1666 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-||||||||||||||||||---|||||-|||||||||||||||||| 2 [D] COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins ---------------------|||--||||------------|||||-||||||||---||||||| 2 [K] COG1678 Putative transcriptional regulator --|-----------------|-----|---------|-------------||----||-------- 2 [E] COG1687 Predicted branched-chain amino acid permeases (azaleucine resistance) --|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-| 2 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase ||||--|||||||----|------------------------|||||-||||-||-------||-- 2 [S] COG1720 Uncharacterized conserved protein -----------------|-|||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG1722 Exonuclease VII small subunit ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 2 [C] COG1726 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrA --||----|-|-|----|--||||-||-------|-|-----|||||-||||-||----||||--- 2 [S] COG1738 Uncharacterized conserved protein --||---------||--|--||---||---||||||||||--|||-|-||||-|||||||||---- 2 [S] COG1739 Uncharacterized conserved protein ---------------------|-----||---|||-||------------||-||----------- 2 [S] COG1755 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega --------------------||----||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 2 [E] COG1760 L-serine deaminase |||||-|||||||---|-----------------||||----|||||-|-||---|--|||||--- 2 [H] COG1763 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein --|-------------|---|---------------------|||||-|||||||||||------- 2 [R] COG1778 Low specificity phosphatase (HAD superfamily) ----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----||| 2 [M] COG1792 Cell shape-determining protein |||||||||||||||||----------||-------||----------|||--||---|||-||-- 2 [L] COG1793 ATP-dependent DNA ligase -----------------||------|----|----|||----|||||-|-||---|---|||---- 2 [G] COG1803 Methylglyoxal synthase ------------------||--||---------------------|--||||-||-------|--- 2 [C] COG1805 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrB -----------|-----|-|||---||||-||||||||-|--|||||-|||||------|||||-- 2 [G] COG1820 N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase -------------------------|--------|-|-----|||||-|-||------|------- 2 [R] COG1823 Predicted Na+/dicarboxylate symporter ----------------||||-|||||||||----||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc) ||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----|||||| 2 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E ---------------------|---|----||||||||----|||||-|-||-||-|||------- 2 [T] COG1854 LuxS protein involved in autoinducer AI2 synthesis ----------------||--|-||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG1862 Preprotein translocase subunit YajC ------------||------||------------|-||----|||||-||||------|||||--- 2 [C] COG1866 Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP) -----------------|--------|----|--|-||-|--|||||-|-||-------------- 2 [G] COG1869 ABC-type ribose transport system, auxiliary component |-------|-----------|---------||||||------|||||-|-||---|---------- 2 [C] COG1882 Pyruvate-formate lyase ----||-----|-||----|||----||||||-|||||----|||||--|||||||---||||--- 2 [P] COG1914 Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family ||--|----|------|-------------------------|||||--|||----|||||-|--- 2 [E] COG1921 Selenocysteine synthase [seryl-tRNASer selenium transferase] -|--------------||------------|---||||----|||||-||||||||----||||-- 2 [R] COG1923 Uncharacterized host factor I protein ------------------|-------|||-||||||||----|||||-||||-||----------- 2 [G] COG1929 Glycerate kinase --|----------||----|------||||-|---|||----||||||||||||||--||||||-- 2 [HE] COG1932 Phosphoserine aminotransferase ----------------|-||----------------------|||||-||||||||||||||||-- 2 [S] COG1934 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||-- 2 [L] COG1943 Transposase and inactivated derivatives ||||-----|-----------------||-------------|||||--|||-------||-|--- 2 [S] COG1944 Uncharacterized conserved protein -------------|-|----------||||------------|||||-|||||------|||||-- 2 [I] COG1946 Acyl-CoA thioesterase ----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||-- 2 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase -------------||-----------||||------------||||||||||||||---------- 2 [A] COG1949 Oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease) -|----------------------------------------||||||||||||||---||||||| 2 [U] COG1952 Preprotein translocase subunit SecB ----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator -------------|||--------------------------||||||||||-|||--------|| 2 [P] COG1965 Protein implicated in iron transport, frataxin homolog --|---------------|-||----||||-||||||-----|||||-|||||--|---|||||-- 2 [M] COG1970 Large-conductance mechanosensitive channel -------------------|------------|-|-||----|||||-|-||----||-----|-- 2 [F] COG1972 Nucleoside permease --||||-||-||----|-||-|-----||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [H] COG1977 Molybdopterin converting factor, small subunit ------------------|||------||||--|||||----|||||-||||---|----|----- 2 [E] COG1982 Arginine/lysine/ornithine decarboxylases ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis ||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 2 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases ---------------------|--|-|||||---|||||||||||||--|||||||----|--||| 2 [S] COG2001 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--| 2 [L] COG2003 DNA repair proteins |-|-----||||------------------------------|||||--|||---|--|||-||-- 2 [R] COG2005 N-terminal domain of molybdenum-binding protein --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [P] COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component ----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||-- 2 [G] COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes --|---|||---||||--||-------||-|-----------------|-||---|----|||--- 2 [O] COG2020 Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase |-||---------||------|----||||----||-------------|||||||------||-- 2 [E] COG2021 Homoserine acetyltransferase --|---------------||-|----||||------|-----|||||-||||||||---------- 2 [M] COG2027 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein 4) --|||||||-||--|-|----|----|||--|||||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [Q] COG2050 Uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism ||----||-|----------------|---|-----|-----|||-|--|||-------||||--- 2 [C] COG2055 Malate/L-lactate dehydrogenases --------------------|-------------|-||----------||||-||-|||------- 2 [R] COG2056 Predicted permease ------------------||||----|||-||||||||-----------|||---|---------- 2 [F] COG2065 Pyrimidine operon attenuation protein/uracil phosphoribosyltransferase ----------------|---|---------------------|||||-|||||||-||-|||||-- 2 [I] COG2067 Long-chain fatty acid transport protein ----------------|---------|||-||-|||||-|--|||||-||||---||||------- 2 [O] COG2077 Peroxiredoxin ------------------||----------||||||||----|||||-||||---|---|||-|-- 2 [R] COG2081 Predicted flavoproteins |-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||-- 2 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases -------------||---||----------|---|-||----|||-|---|||--|---------- 2 [H] COG2091 Phosphopantetheinyl transferase -||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||-- 2 [U] COG2095 Multiple antibiotic transporter ------------------||-|--------||--|-||----|||||-|-||--------|-|--- 2 [R] COG2103 Predicted sugar phosphate isomerase ---------|---|------|---------|||||||-----|||||-||||-------------- 2 [P] COG2116 Formate/nitrite family of transporters -----------------|--||--|-||||||||||||----|||||-||||-|||---|------ 2 [R] COG2137 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---|||----||-----------|---||-|||||----|||-|---||----||-|------ 2 [H] COG2145 Hydroxyethylthiazole kinase, sugar kinase family ---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||-- 2 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis ----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||-- 2 [NU] COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG ------------------||-|||---||-------------|||||-|||||------|||||-- 2 [R] COG2166 SufE protein probably involved in Fe-S center assembly |----------------|------------------------||||||||||-------------- 2 [P] COG2168 Uncharacterized conserved protein involved in oxidation of intracellular sulfur ---------|-------|--------||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG2171 Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase -------------------|||----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 2 [D] COG2177 Cell division protein -------------|||---||---|-|---|||||||||---|||||-||||||||---||||--- 2 [K] COG2183 Transcriptional accessory protein --------------------|----||---||||||||-|||||||||||||---|-------|-- 2 [G] COG2190 Phosphotransferase system IIA components ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 2 [C] COG2209 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrE -|------------------|---|-----------------|||||---||---|---||||--- 2 [R] COG2215 ABC-type uncharacterized transport system, permease component |-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||-- 2 [P] COG2217 Cation transport ATPase -------|------|--|--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---|||---- 2 [F] COG2233 Xanthine/uracil permeases -------------||------|---||---|-|---------|||||--|||-------|||||-- 2 [H] COG2240 Pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit -------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 2 [L] COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase ----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase -------||----||--|-|||----||||||--||||----|||||-||||---|---|||||-- 2 [I] COG2267 Lysophospholipase ----------------|-------|-----------------|||||||-|||------||-||-- 2 [J] COG2269 Truncated, possibly inactive, lysyl-tRNA synthetase (class II) --|------------------|--------------------|||||-|||||------||||||| 2 [O] COG2332 Cytochrome c-type biogenesis protein CcmE ---|---------------|-|--------||||||||----|||||-||||||||---------- 2 [R] COG2333 Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily) ------------------||||----|---|-----|-----|||||-||||-|||---|||||-- 2 [S] COG2350 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|----|--|--||--------|||||-||||-|||-------|-- 2 [C] COG2352 Phosphoenolpyruvate carboxylase ---|----|---|-----|--|---------------|----------||-|--------||--|| 2 [R] COG2358 TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component --------------|----|-|------------||||----|||||-||||-------|||||-- 2 [S] COG2363 Uncharacterized small membrane protein ---------------------|----|---|-----||------------||-------------- 2 [S] COG2364 Predicted membrane protein -|-------------------|-------------|--------|-----|-|||----------- 2 [S] COG2369 Uncharacterized protein, homolog of phage Mu protein gp30 -------------||-----||---------|--||-|----||||-----|-------||||--- 2 [G] COG2376 Dihydroxyacetone kinase ---------|--------||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-- 2 [O] COG2377 Predicted molecular chaperone distantly related to HSP70-fold metalloproteases --|-----|------------|--------------------|||||-|||||------|||||-- 2 [O] COG2386 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component ---------------------|--------||||||||----|||||-|--|---|---||||--- 2 [K] COG2390 Transcriptional regulator, contains sigma factor-related N-terminal domain ------||--|||-------|---------------------|||||-|-||-||----------- 2 [S] COG2431 Predicted membrane protein --------------------|---|-------||----|---|||||---||-------------- 2 [E] COG2502 Asparagine synthetase A -------------------|------------|-|---|-----------||----||-------- 2 [R] COG2503 Predicted secreted acid phosphatase ----------|-|------||-----||-|-||||||-----|||||-||||-|||---|||||-- 2 [S] COG2606 Uncharacterized conserved protein ---------------------|----||||------------||||||||||||||------||-- 2 [C] COG2609 Pyruvate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component ------------------------------|----|||----|||||---||-||----------- 2 [S] COG2707 Predicted membrane protein ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 2 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits -|----||-|-|-----|---|---------|||||||----||||||||||-------|||||-- 2 [J] COG2813 16S RNA G1207 methylase RsmC --------------------------|||--|--||||----|||||--||||--||||||-|--- 2 [G] COG2814 Arabinose efflux permease --|----------||------|----|||-|-----------|||||-||||-------|||||-- 2 [L] COG2816 NTP pyrophosphohydrolases containing a Zn-finger, probably nucleic-acid-binding --------------------------||||-|||||-|----|||||-||||-|||---|||||-- 2 [L] COG2818 3-methyladenine DNA glycosylase ---|------|||-----------|----|-||---------|||||-|-||-------------- 2 [F] COG2820 Uridine phosphorylase ------------------||----------------------||||||||||-|||---|||||-- 2 [M] COG2821 Membrane-bound lytic murein transglycosylase ---------------------|--------|-----------|||||-||||-|||----|---|| 2 [R] COG2823 Predicted periplasmic or secreted lipoprotein --------------------------|----|||-|------|||||-||||-|||||||||||-- 2 [P] COG2824 Uncharacterized Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism ----------------||---|||||----------------|||||-||||-|||-------||| 2 [M] COG2825 Outer membrane protein --------------------------------------------------||-||---|------- 2 [S] COG2830 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------||-----------||-------|||-|-||||-||----|||---- 2 [S] COG2832 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------------------------||-|||--||||---- 2 [S] COG2833 Uncharacterized protein conserved in bacteria -|||----|-------|----|--||----|-----||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG2834 Outer membrane lipoprotein-sorting protein ------------------------|-----------------||||||||||||||---|||||-- 2 [S] COG2840 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|||-------------|||||-||||-|||---|||||-- 2 [O] COG2844 UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase ------------------------------------|-----|||||--|||||||---------- 2 [S] COG2850 Uncharacterized conserved protein -------------------|-|-------------|------|-------|--||-----|--|-- 2 [S] COG2852 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------------------|||||-||||||||--|----||| 2 [M] COG2853 Surface lipoprotein ------------------------------------------|||||-||||||||--|----||| 2 [Q] COG2854 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, auxiliary component --------|-----------|-----|----|||||------|||||--|||-|||--||||||-- 2 [S] COG2855 Predicted membrane protein ---|------||---------|----|----||---||----|||||-||||---|--||||||-- 2 [S] COG2860 Predicted membrane protein -------------------------|-----------|----|||-|--|||------|||-||-- 2 [S] COG2861 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-------------|----|--------------------|||-||||||---|||||---|-- 2 [S] COG2862 Predicted membrane protein --|-----|-------|-------------------------|||||-||||---|--|-|----- 2 [C] COG2864 Cytochrome b subunit of formate dehydrogenase ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 2 [C] COG2869 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrC -|--------------|---|---------------------||||||-|||-||||||---||-- 2 [M] COG2870 ADP-heptose synthase, bifunctional sugar kinase/adenylyltransferase ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 2 [C] COG2871 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG2877 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (KDO) 8-phosphate synthase --|--------------|--|---------------------||||||||||||||---------- 2 [C] COG2878 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB -------------------|-|----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 2 [D] COG2884 Predicted ATPase involved in cell division -------------------|----|------|-|||||----|||||-|||||--|---------- 2 [M] COG2891 Cell shape-determining protein |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [H] COG2896 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme ------------------------------------------|||||-|||||||----||||--- 2 [S] COG2900 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------||||||||||||||---------- 2 [KL] COG2901 Factor for inversion stimulation Fis, transcriptional activator -----------------|------------------------|||||-|||||||||||||-||-- 2 [S] COG2908 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------||||||||||||||---|||||-- 2 [S] COG2911 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|--||------------------|||||||||||--|-------|-- 2 [S] COG2912 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------||||||||||||||---------- 2 [S] COG2914 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||||||||------------- 2 [R] COG2915 Uncharacterized protein involved in purine metabolism ------------------------------------------|||||||-|||--|---------- 2 [R] COG2916 DNA-binding protein H-NS ------------------------------------------||||||||||-|||----|||||| 2 [D] COG2917 Intracellular septation protein A ------------------------||||||-|||||||----||||||||||||||---||||||| 2 [D] COG2919 Septum formation initiator --------|-|-------------------------------||||||||||-------------- 2 [P] COG2920 Dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), gamma subunit ------------------------------------------||||||||||||||---------- 2 [S] COG2921 Uncharacterized conserved protein |-|--------------|------------------------||||||||||-------------- 2 [P] COG2923 Uncharacterized protein involved in the oxidation of intracellular sulfur ------------------------------------------||||||||||||||---------- 2 [CO] COG2924 Fe-S cluster protector protein ------------------------------------------|||||||||||--|---------- 2 [L] COG2925 Exonuclease I --------------------|---------------------|||||||-||-------------- 2 [S] COG2926 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||||||---||||||| 2 [L] COG2927 DNA polymerase III, chi subunit --------------------|----------||-|--------|--|--||||||----|||||-- 2 [K] COG2932 Predicted transcriptional regulator ------------------------------------------|||||--||||------------- 2 [R] COG2933 Predicted SAM-dependent methyltransferase ---------------------------|||------------|||||-|||||------------- 2 [I] COG2937 Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase -------------||---------------------------|||||-||||||||---||||||| 2 [S] COG2938 Uncharacterized conserved protein -------------------|-|--------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG2949 Uncharacterized membrane protein ------------------------------------------|||||-|-||||||---------- 2 [G] COG2956 Predicted N-acetylglucosaminyl transferase ------------------------------------------|||||-||||-|||---------- 2 [H] COG2959 Uncharacterized enzyme of heme biosynthesis ------------------------------------------|||||-||||||||---|||||-| 2 [R] COG2961 Protein involved in catabolism of external DNA -----|--------------||----|||--|||||-|----|||||-|||----|---|||||-- 2 [L] COG2963 Transposase and inactivated derivatives --------------------|-----------|---------|||||-||||---|--|-|----- 2 [S] COG2964 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-|||---------- 2 [L] COG2965 Primosomal replication protein N |------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|------- 2 [S] COG2966 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 2 [R] COG2969 Stringent starvation protein B ----------------------|-------------------|||||-|-|||------------- 2 [K] COG2973 Trp operon repressor ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 2 [L] COG2974 DNA recombination-dependent growth factor C ------------------------------------------||||||||||||||---------- 2 [S] COG2976 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 2 [M] COG2980 Rare lipoprotein B ------------------|-----------------------|||||-||||-------||||--- 2 [E] COG2981 Uncharacterized protein involved in cysteine biosynthesis -|----------------------------------------|||||-||||-------|||||-- 2 [S] COG2983 Uncharacterized conserved protein ---|----------------|-----|---------------|||||-|-||-------------- 2 [R] COG2985 Predicted permease ------------------------------------------|||||-|-||-------|||||-- 2 [S] COG2989 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------------------|--||||-||----------- 2 [S] COG2991 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-|||---------- 2 [S] COG2995 Uncharacterized paraquat-inducible protein A ------------------------------------------|||||-|-||----|||-||||-| 2 [P] COG3004 Na+/H+ antiporter ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [D] COG3006 Uncharacterized protein involved in chromosome partitioning ------------------------------------------|||||-||||-|||---------- 2 [R] COG3008 Paraquat-inducible protein B --------------------|----||----|||||---|--|||||-|-||---------|---- 2 [G] COG3010 Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase ---------------------|----|---------------|||||-||||-|-|---------- 2 [S] COG3012 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 2 [M] COG3017 Outer membrane lipoprotein involved in outer membrane biogenesis ----------------|---|-----|-----||--------|||||-||||-|||--|----|-| 2 [S] COG3022 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||-|||----||||-- 2 [S] COG3024 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---------------------------------------|||||-||||---|------||-- 2 [S] COG3025 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||||-||||---|---------- 2 [T] COG3026 Negative regulator of sigma E activity -----------------------|------|---||||----|||||-|||||||----||||||| 2 [S] COG3027 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 2 [S] COG3028 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------||-------------|||||-|-||-------------- 2 [C] COG3029 Fumarate reductase subunit C ---|--------|-------|---------------------|||---|--|-------------- 2 [E] COG3033 Tryptophanase ------------------------------------------|--||-||||-|------------ 2 [S] COG3036 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||------|||----- 2 [C] COG3043 Nitrate reductase cytochrome c-type subunit ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [L] COG3050 DNA polymerase III, psi subunit ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [R] COG3054 Predicted transcriptional regulator --------------------|---------------------|||||-|-||---------|---- 2 [S] COG3055 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [M] COG3056 Uncharacterized lipoprotein ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [L] COG3057 Negative regulator of replication initiationR ----------------|-------------------------|||||--|||--------|----- 2 [O] COG3058 Uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation ------------------------------------------|||-|-|-||----||-------- 2 [S] COG3059 Predicted membrane protein ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [KE] COG3060 Transcriptional regulator of met regulon ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [M] COG3061 Cell envelope opacity-associated protein A ------------------------------------------|||||-||||------|||----- 2 [P] COG3062 Uncharacterized protein involved in formation of periplasmic nitrate reductase ---------------------------------------------|--||||||||---------- 2 [NU] COG3063 Tfp pilus assembly protein PilF ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [M] COG3064 Membrane protein involved in colicin uptake ------------------------------------------|||||-|-|||------------- 2 [M] COG3065 Starvation-inducible outer membrane lipoprotein ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [L] COG3066 DNA mismatch repair protein ------------------------------------------|||||-||||-------------- 2 [P] COG3067 Na+/H+ antiporter ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG3068 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|--|||------|||||-||||-|-|----|-||-| 2 [K] COG3070 Regulator of competence-specific genes ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 2 [H] COG3071 Uncharacterized enzyme of heme biosynthesis ------------------------------------------|||||-||||-------------- 2 [F] COG3072 Adenylate cyclase ------------------------------------------|||||-|||||--|---------- 2 [T] COG3073 Negative regulator of sigma E activity ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG3074 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|--------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [E] COG3075 Anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG3076 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG3078 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|||||------------- 2 [S] COG3079 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------||-------------|||||-|-||-------------- 2 [C] COG3080 Fumarate reductase subunit D ------------------------------------------|||||-||||-------------- 2 [R] COG3081 Nucleoid-associated protein ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG3082 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||-------------- 2 [R] COG3083 Predicted hydrolase of alkaline phosphatase superfamily ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG3084 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG3085 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 2 [D] COG3087 Cell division protein ------------------------------------------|||||-||||-------------- 2 [S] COG3089 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||----|||||-||||-------------- 2 [S] COG3091 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG3092 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-||----------- 2 [S] COG3094 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [D] COG3095 Uncharacterized protein involved in chromosome partitioning ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [D] COG3096 Uncharacterized protein involved in chromosome partitioning ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG3097 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||-------------- 2 [S] COG3098 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG3099 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||-------------- 2 [S] COG3100 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG3101 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------||-----|||||-||||-------------- 2 [T] COG3103 SH3 domain protein ------------------------------------------|||||-||||-------------- 2 [S] COG3105 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------||||--- 2 [R] COG3106 Predicted ATPase ------------------------------------------|||||-|||||------------- 2 [R] COG3107 Putative lipoprotein ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG3110 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||-------------- 2 [S] COG3111 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG3112 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||||||---------- 2 [R] COG3113 Predicted NTP binding protein (contains STAS domain) ------------------------------------------|||||-||||-------------- 2 [U] COG3114 Heme exporter protein D ------------------------------------------|||||-|||||------------- 2 [D] COG3115 Cell division protein ------------------------------------------|||||||||||--|---------- 2 [D] COG3116 Cell division protein ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 2 [S] COG3117 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------||||------------|||||-|||||--|---|||||-- 2 [O] COG3118 Thioredoxin domain-containing protein ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG3120 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||--|||---|---------- 2 [M] COG3133 Outer membrane lipoprotein ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG3140 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||--|||-||----------- 2 [S] COG3171 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------||--|----------|||||--|||-------------- 2 [H] COG3172 Predicted ATPase/kinase involved in NAD metabolism --------------------------|----|||--------|||||--|||----||-------- 2 [H] COG3201 Nicotinamide mononucleotide transporter -------------------------------------------------|||-||----------- 2 [S] COG3219 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|------------------|||-|||----|--|-- 2 [S] COG3220 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|-----------------------|||||--|||---|---|||||-- 2 [M] COG3264 Small-conductance mechanosensitive channel -||-||---|-|----|-------------------------|||-|--|||------|-|----- 2 [J] COG3276 Selenocysteine-specific translation elongation factor ------------------------------------------|||||-||||-------------- 2 [KE] COG3283 Transcriptional regulator of aromatic amino acids metabolism ------------------||-------|-|------------|||||-||||-|||---||||||| 2 [C] COG3288 NAD/NADP transhydrogenase alpha subunit --------|-||------------------------------|||-|---||-------------- 2 [P] COG3301 Formate-dependent nitrite reductase, membrane component ----------------|-------------------------|||||---||----------|--- 2 [R] COG3302 DMSO reductase anchor subunit ------------------------------------------|||-|---||------|------- 2 [P] COG3303 Formate-dependent nitrite reductase, periplasmic cytochrome c552 subunit ------------------------------------------|||||-||||-||----------- 2 [C] COG3312 F0F1-type ATP synthase, subunit I ------------------------------------------|||||-||||-|||---------- 2 [M] COG3317 Uncharacterized lipoprotein ------------------|||----------------|----|--||---||-------||||--- 2 [S] COG3395 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------------|----------|---|--|-------- 2 [S] COG3421 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||---||--|----------- 2 [K] COG3423 Predicted transcriptional regulator ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [R] COG3445 Acid-induced glycyl radical enzyme --------------------|-----|---------------|||---|-|--|-|---||-||-- 2 [R] COG3550 Uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzymes --|----------------|-----------------------------|||---|------|--- 2 [H] COG3585 Molybdopterin-binding protein |------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|------- 2 [S] COG3610 Uncharacterized conserved protein ---------------------------------|--------|||||---||-||----------- 2 [P] COG3615 Uncharacterized protein/domain, possibly involved in tellurite resistance --------------------------|---------------|||||--|||---|----|||--- 2 [G] COG3622 Hydroxypyruvate isomerase --------------------------------||-----||-|||||-|-||-------------- 2 [G] COG3623 Putative L-xylulose-5-phosphate 3-epimerase --------------------------------|---------|||||-||||-||---|------- 2 [E] COG3633 Na+/serine symporter -------------------------------|-|-||------||-----||-------------- 2 [S] COG3646 Uncharacterized phage-encoded protein --------------------|---|--------------------||---||-------||||--- 2 [R] COG3683 ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component ------------------------------------------|||-|---||-------|||||-- 2 [J] COG3719 Ribonuclease I -------------------------------------------------|||-||----------- 2 [S] COG3767 Uncharacterized low-complexity protein ------------------------------------------|||||---||-------||||--- 2 [S] COG3768 Predicted membrane protein ------------------------------------------|||||---||-------||||--- 2 [M] COG3770 Murein endopeptidase ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG3771 Predicted membrane protein ------------------------------------------|||||-|-||-------||||--- 2 [H] COG3840 ABC-type thiamine transport system, ATPase component ------------------------------------------|||||-||||-|||---------- 2 [T] COG3850 Signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [L] COG3923 Primosomal replication protein N'' ------------------------------------------|||||---||-------------- 2 [S] COG3924 Predicted membrane protein ------------------------------------------|||||---||-------------- 2 [G] COG3925 N-terminal domain of the phosphotransferase system fructose-specific component IIB ----------------|-------------------------|||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG4105 DNA uptake lipoprotein ------------------||-|----|---||||||------||||||||||||||---|||||-- 2 [J] COG4108 Peptide chain release factor RF-3 ----------------||--|---------||||||||||--|||||-|-||----||||||||-- 2 [R] COG4123 Predicted O-methyltransferase ------------------------------------------|||||-|||||------||||||| 2 [O] COG4133 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, ATPase component ---|--||--|----------|--|-----------------|||||-|-||-||----||||--- 2 [H] COG4143 ABC-type thiamine transport system, periplasmic component --------|-----------|----|----------------|||||---||-------------- 2 [H] COG4145 Na+/panthothenate symporter -------------------------------------|----|||-----||-------------- 2 [R] COG4146 Predicted symporter ----------------------------------|-------|||||-||||-------||||--- 2 [P] COG4148 ABC-type molybdate transport system, ATPase component --|---------|---|-||------|||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [P] COG4149 ABC-type molybdate transport system, permease component ------------------------------------------|||||-||||-------||-|--- 2 [E] COG4160 ABC-type arginine/histidine transport system, permease component ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [E] COG4161 ABC-type arginine transport system, ATPase component ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [V] COG4167 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [V] COG4168 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [V] COG4170 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [V] COG4171 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component --------------------|---|-----------------|||||-|-||-------------- 2 [G] COG4211 ABC-type glucose/galactose transport system, permease component ------------------------------------------|||||-||||-------||-|--- 2 [E] COG4215 ABC-type arginine transport system, permease component ---|---------||---||||----|||--|-|||------|||-|-||||||||||||||---- 2 [R] COG4221 Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity ----------------------||------------------|||||-||||||||--|----|-- 2 [OC] COG4232 Thiol:disulfide interchange protein --------------------------------------------|-----|--||----------- 2 [S] COG4383 Mu-like prophage protein gp29 --------------------------|------|------------|-|--|-------------- 2 [G] COG4409 Neuraminidase (sialidase) ------------------|---------------------------|---|-|-------|-||-- 2 [S] COG4456 Virulence-associated protein and related proteins ------------------------------------------|||||-||||-------|||---- 2 [P] COG4531 ABC-type Zn2+ transport system, periplasmic component/surface adhesin ------------------------------------------||||||||||||||---------- 2 [P] COG4535 Putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC ----------------------------------|-------|||||-||||---|----|||||| 2 [P] COG4536 Putative Mg2+ and Co2+ transporter CorB --------------------|---|-------------------------||-------------- 2 [O] COG4545 Glutaredoxin-related protein ------------------------------------------|||||-||||-------------- 2 [M] COG4623 Predicted soluble lytic transglycosylase fused to an ABC-type amino acid-binding protein --|--------------|--|---||---------|------||||||||||-------------- 2 [C] COG4656 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC --|--------------|--|---------------------||||||||||-------------- 2 [C] COG4657 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfA --|--------------|--|---|-----------------||||||||||-------------- 2 [C] COG4658 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfD --|--------------|--|---------------------||||||||||-------------- 2 [C] COG4659 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfG --|--------------|--|---------------------||||||||||-------------- 2 [C] COG4660 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfE ---|----|---|--------|---------------|----------||-|--------||---- 2 [R] COG4666 TRAP-type uncharacterized transport system, fused permease components ---------------------------------------------|--|-||-------------- 2 [S] COG4701 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------||-||||||||||----------------|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87 ------------------------------------------|||||||-||-------------- 2 [K] COG4776 Exoribonuclease II ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [R] COG4785 Lipoprotein NlpI, contains TPR repeats ------------------------------------------|||||-|||||--|-------|-- 2 [U] COG4795 Type II secretory pathway, component PulJ ----------------||||----------------------|||||-||||||||---------- 2 [U] COG4796 Type II secretory pathway, component HofQ --------------------|--------------|---------------|-------------- 2 [V] COG4823 Abortive infection bacteriophage resistance protein --------------------|---------------------|||||-|||||||----|||||-- 2 [D] COG4942 Membrane-bound metallopeptidase ----------------|-------------------------|||||-||||||||---------- 2 [NU] COG4969 Tfp pilus assembly protein, major pilin PilA ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 2 [L] COG4973 Site-specific recombinase XerC --------------------|---|-|||||---||||----|||||-||||||||---||||||| 2 [L] COG4974 Site-specific recombinase XerD -------------------------------|--||||----|||||-|-||-------|-|-|-- 2 [CO] COG4987 ABC-type transport system involved in cytochrome bd biosynthesis, fused ATPase and permease components --------------------------------------------|-----|---|----------- 2 [R] COG5005 Mu-like prophage protein gpG ------------------------------------------||||||||||||||---------- 2 [K] COG5007 Predicted transcriptional regulator, BolA superfamily ----------------|-------||----------------|||||-||||||||---||||||| 2 [M] COG5009 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein --|-----------------|-----------------------------|--||------|---- 2 [P] COG5266 ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component ---------------------|--------------------|||||-|-||-||----------- 2 [S] COG5339 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||-------|--------||||----|||||||||||--||||||||||| 2 [O] COG5405 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), peptidase subunit ------------------||------------------------------||-------------- 2 [S] COG5413 Uncharacterized integral membrane protein ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [R] COG5633 Predicted periplasmic lipoprotein ------------------------------------------|||||--|||-------------- 2 [R] COG5645 Predicted periplasmic lipoprotein ||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||-- 1 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase |||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||--- 1 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family ||||||-|||---|||--||-|----|||--|-||||-----|||||-||-||------|--|--- 1 [P] COG0025 NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters -|----||---|------||------|||-------|-----|||||-||-|-------------- 1 [F] COG0027 Formate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase (GAR transformylase) |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 1 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases ||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--|||||||| 1 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters ||||--||||--||----||-------||--|---|-|----||||--|-|---------|||--- 1 [E] COG0076 Glutamate decarboxylase and related PLP-dependent proteins ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase --||||||--|||||----|-|----|||||---|-||----|||||-|||----|---||||--- 1 [E] COG0160 4-aminobutyrate aminotransferase and related aminotransferases |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 1 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-||||||||||||||| 1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase ||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-||||||| 1 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase -------------|---|--------|---||-||-||-||-||||||||-|---|---|||||-- 1 [G] COG0246 Mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenases |||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|---- 1 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D -------------||---||-|-----|||------------|||||-|||-||||---|||||-- 1 [H] COG0259 Pyridoxamine-phosphate oxidase ||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||-- 1 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase |||---||||--------||----------|-----------|||-|---|-----|||------- 1 [O] COG0298 Hydrogenase maturation factor --|----|---|-|||---||-----||||||||||||-----------|-|---|---||-||-- 1 [R] COG0300 Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities ||||----||--------||----------|----|----------|---|----------|---- 1 [P] COG0310 ABC-type Co2+ transport system, permease component |-||||--|-|||||||-||-|-----||--|--||||----|||||-||-||--||-||||||-- 1 [I] COG0365 Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases |-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [C] COG0372 Citrate synthase ||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||------- 1 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase |||-----||----|-|-||||----|||-----|--||---|||||--||----||||||||--- 1 [OK] COG0378 Ni2+-binding GTPase involved in regulation of expression and maturation of urease and hydrogenase ||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----|| 1 [M] COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase |||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases --||---------||---||||----|||-|----|||----|||-|-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG0384 Predicted epimerase, PhzC/PhzF homolog --||-------|-||---|||-----|||-|||||||||||||||||-||-|-|||---|||||-- 1 [L] COG0389 Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair ||||----||---|--||||-|----||||||||||||----|||||-|--|-------------- 1 [S] COG0391 Uncharacterized conserved protein |||||||||--|-----|||-------|||-|---|-|----|||-|-|--|-----------|-- 1 [S] COG0393 Uncharacterized conserved protein ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||-||||||||-||-||--|---||||--- 1 [G] COG0395 ABC-type sugar transport system, permease component ||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||-- 1 [M] COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis --|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||-- 1 [G] COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase --|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase ----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||-- 1 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme --|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation ---|---------||---||-|----|||--|||||||--|||||||-||-|-|||---||-||-- 1 [R] COG0431 Predicted flavoprotein |||||||||||||---||||-|-----||---|----|----||||---|-|---|---|||||-- 1 [R] COG0433 Predicted ATPase |||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases |||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--||||||||||| 1 [O] COG0450 Peroxiredoxin ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ) |||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-|||||||||||||| 1 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit ---|---------||---||-|----|||-----|-||----|||||--|-|-|||||||||||-- 1 [E] COG0506 Proline dehydrogenase -------------||-----|---|------|||||||-||||||||-|-|-----------|--- 1 [M] COG0510 Predicted choline kinase involved in LPS biosynthesis ||||||||||||-||-|||-----||-----------|----|||||-|--|--------|----- 1 [P] COG0530 Ca2+/Na+ antiporter ---|||--|-|||||-||||-|-----||--|--||||----|||||--|-|---|||-|||||-- 1 [C] COG0538 Isocitrate dehydrogenases ---|||||--|-|-----|------------||||-----|-|||-|--||---------|----- 1 [E] COG0549 Carbamate kinase |||-||--||-|-||--||--|----|||--|---|||-------|---||-||||---|||||-- 1 [S] COG0599 Uncharacterized homolog of gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit --||||----||-||-|--|-|----||||-|--||||----|||||-||-||--|---|||||-- 1 [CR] COG0604 NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductases ||||--||||-||----|||||----||||||||||||||||-||-|---|--------|||---- 1 [P] COG0619 ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters |||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||-- 1 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators --|----------||||-||--||--||||-|---|||----|||-|-||-|---|||-||-|--- 1 [P] COG0659 Sulfate permease and related transporters (MFS superfamily) |-||||-----|-||---||-------||||------|----|||||-||-|||||---||||||| 1 [R] COG0661 Predicted unusual protein kinase ----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-|||| 1 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat --------|---|||--||||---|---------|||-----||||---|-|-||---|--|--|| 1 [P] COG0672 High-affinity Fe2+/Pb2+ permease ||----||--|------|------------|---|-------|||||-||-||--|---||-|--- 1 [M] COG0677 UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase ||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--|||||||| 1 [R] COG0679 Predicted permeases -||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||-- 1 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase ----------------|||-|-----|||||-|||||||||||--||----|----|||-|||-|| 1 [G] COG0698 Ribose 5-phosphate isomerase RpiB ---|---------||-|-||-|----|----|--||||----|||||-|||-|--|---|||||-- 1 [MG] COG0702 Predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerases -------------|----------------------|-----|||-|---|-|||-|||--|-|-- 1 [G] COG0738 Fucose permease ------------------|-----------------------|||||---|-----||||---|-- 1 [E] COG0754 Glutathionylspermidine synthase --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 1 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component ------------------|-|-----|-------|-------|||||-|||--||-||-------- 1 [E] COG0786 Na+/glutamate symporter |-|---|-|----|---|||------|||-|----||--------------|--|----|------ 1 [P] COG0798 Arsenite efflux pump ACR3 and related permeases --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||-||||--- 1 [E] COG0804 Urea amidohydrolase (urease) alpha subunit -|-------------------------|||||||||||------------|-----||-|--|--- 1 [L] COG0827 Adenine-specific DNA methylase --------------|---||-|----|-------|--||----||----||----|||-||||--- 1 [O] COG0829 Urease accessory protein UreH --------------|---||-|----|||-----|--||----|||---||----|||-||||--- 1 [O] COG0830 Urease accessory protein UreF --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||-||||--- 1 [E] COG0831 Urea amidohydrolase (urease) gamma subunit --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||--|||--- 1 [E] COG0832 Urea amidohydrolase (urease) beta subunit ------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|-- 1 [K] COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family ----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||--- 1 [D] COG0850 Septum formation inhibitor -|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||-- 1 [L] COG0863 DNA modification methylase -|||||----|----------|---||---|-----|-|----||-|---|---|-|||----|-- 1 [V] COG1002 Type II restriction enzyme, methylase subunits -|||---||--|----|-||------|||---|---||----|||||-||-||--|--|||||||| 1 [M] COG1004 Predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase ------------------||----------------------|||||-||-|||||||||------ 1 [C] COG1049 Aconitase B -----------|-||---||------||||-------|----|||||--||--|||---|||||-- 1 [C] COG1062 Zn-dependent alcohol dehydrogenases, class III --|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||-- 1 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases --||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||-- 1 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily --|----------||------|----||||-|--||||----|||||----|-------------- 1 [P] COG1119 ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA ||||--|||||||----|||||--|-||||||||||||||||-||-|-|-|----|---|||---- 1 [P] COG1122 ABC-type cobalt transport system, ATPase component --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 1 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 1 [GM] COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component |--|||--|-|||-------||---------|----||----|||------|-||||||------- 1 [C] COG1139 Uncharacterized conserved protein containing a ferredoxin-like domain ------------------||-|--------------------|||||-||-||||-|||------- 1 [E] COG1166 Arginine decarboxylase (spermidine biosynthesis) ----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||-- 1 [KE] COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs --------------------||----||||||-|-|||----|||||---|----|---------- 1 [E] COG1168 Bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|---||||--- 1 [G] COG1175 ABC-type sugar transport systems, permease components -------------------|----------||--||||-||||||||--||----|---||-|--- 1 [I] COG1182 Acyl carrier protein phosphodiesterase |||---|||-|||---||--|-----------|----|----|||||----|-------------- 1 [R] COG1203 Predicted helicases |-|--||||---|-----||-|----|||||-----------|---|--||-|--|---||-||-- 1 [R] COG1216 Predicted glycosyltransferases ||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-|||||||||||||| 1 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component ||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||-- 1 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III --||------------|----|-----|||------||----||||||||-|-|||---------- 1 [E] COG1246 N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferases ---|-------|-||---||-|----||||-|--||||----|||||-|||----|---||||--- 1 [C] COG1252 NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit -||-|||||-|||----|-|-|---|--|-||||||||----|||||-||-|---|----|-|--- 1 [C] COG1254 Acylphosphatases --|-----------|---||--||---||-------||----------||-|||||---|||||-- 1 [S] COG1262 Uncharacterized conserved protein --------------------|-----|||-|---|-||----|||||-||-|---|||-|-|---| 1 [R] COG1279 Lysine efflux permease --------------------|----|------|||-||----|||-|---|------------|-- 1 [S] COG1288 Predicted membrane protein ---|--|------|-------------||--------------------||-||||--|----|-- 1 [S] COG1297 Predicted membrane protein --------------------||---||---||||||||-||||||||-|||----|---------- 1 [G] COG1299 Phosphotransferase system, fructose-specific IIC component ----||-----------|------------||----||----|||||---|--------||||--- 1 [G] COG1312 D-mannonate dehydratase --||--------------||-|--|-|||-||---|||----|||||--|-|-------||-|||| 1 [S] COG1357 Uncharacterized low-complexity proteins --||--------------|-||----|||-||-|-||-----|||||-||-|-|||---||-||-- 1 [S] COG1359 Uncharacterized conserved protein -||-|-||--||-----|--|------||----|-|--------------|-----|||---|--| 1 [R] COG1373 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) -----------------|||-|----|||||------|----|||||-|||-|--|---|||||-- 1 [E] COG1410 Methionine synthase I, cobalamin-binding domain |-|||||||--||||-||--|-----|---||-|||||----|||||-||-|---|---||||--- 1 [C] COG1454 Alcohol dehydrogenase, class IV ----||||---|-|---------------------|||----|||-|--|-|-||----------- 1 [F] COG1457 Purine-cytosine permease and related proteins --------|----||--|---|---|||||||||||||-|--|||||-|--|-------------- 1 [G] COG1482 Phosphomannose isomerase --|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||--- 1 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase -----------------|||----|------|----||----|||----|-|---|-----|||-- 1 [R] COG1512 Beta-propeller domains of methanol dehydrogenase type ------||------------||----|--|----|-||----|||||-|||--|||--||------ 1 [R] COG1540 Uncharacterized proteins, homologs of lactam utilization protein B ---|----|-----------||---------|----||----|||------|-||||||------- 1 [S] COG1556 Uncharacterized conserved protein ----------------|-----------------|-|-----|||||-|||--|||---||||||| 1 [V] COG1566 Multidrug resistance efflux pump --|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--||||||||||||| 1 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase |-|-||-----|-||---------------------------|||||-|--|-------------- 1 [S] COG1584 Predicted membrane protein ||-|--||-||||----|||||----|||||-----------|||||-||-||------|||||-- 1 [OU] COG1585 Membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity ||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||--- 1 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase --|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||-- 1 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein -------------||--|--------|---|-|||-||-----||---|--|---|---|------ 1 [G] COG1621 Beta-fructosidases (levanase/invertase) -------------------|-|--||---------||-----|||-|-||-|||||---|||||-- 1 [S] COG1652 Uncharacterized protein containing LysM domain ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||----|||||-||-||--|---||||--- 1 [G] COG1653 ABC-type sugar transport system, periplasmic component --|--------|----|-|-----------------------||||-----|-------------- 1 [L] COG1662 Transposase and inactivated derivatives, IS1 family -|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-||||||||||||| 1 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 1 [GM] COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component ---------||-|---||||-|----||||-|||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [T] COG1702 Phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase -||--------------|--|---|-------||-|--||---|||---|-|---|---|||||-- 1 [S] COG1704 Uncharacterized conserved protein |||---|||||||---||------------|---|-----------|---|--------||----| 1 [R] COG1708 Predicted nucleotidyltransferases |--------|--------||-------||||----|||----------|||--||||||||||||| 1 [S] COG1714 Predicted membrane protein/domain ||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||-- 1 [K] COG1733 Predicted transcriptional regulators --|-||----|-------||------|||-|-----------|||||-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG1741 Pirin-related protein ----|||-|-|-|||---||-|-----------|---|----------|--|----|||||||--- 1 [E] COG1748 Saccharopine dehydrogenase and related proteins |||---||||-||-------|-----------|---------|||-|-|||--------------- 1 [H] COG1767 Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthetase -------------------------|------|--||-------------|--------------- 1 [R] COG1783 Phage terminase large subunit --------|--|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-| 1 [I] COG1788 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit ------|||----------------------|----|-----|||||----|---|--|||-||-- 1 [M] COG1794 Aspartate racemase --|-|||||-|||---||-|-|------------||||----|||||-||-|---|---||-||-- 1 [S] COG1801 Uncharacterized conserved protein ||||--||||-||---|--|--||------------------|||||----|-------||-|--- 1 [G] COG1830 DhnA-type fructose-1,6-bisphosphate aldolase and related enzymes --|----------------|||----||||-||||||------||-|--||-||||---|||||-| 1 [I] COG1835 Predicted acyltransferases |-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---||||||| 1 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family --|-------------|----|--------------------|||||-||-|---|||||--|--- 1 [P] COG1858 Cytochrome c peroxidase |||----|||--|------|--||----|-------------|||||-|--|-------|--|||| 1 [S] COG1872 Uncharacterized conserved protein |-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--| 1 [R] COG1881 Phospholipid-binding protein ------|||--------|--|---|-------|-------------|-|--|-------------- 1 [C] COG1883 Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit ---|--|||||||||------|------------||------|||||-||-|----||||||||-- 1 [R] COG1896 Predicted hydrolases of HD superfamily |-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||-- 1 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes ---|||-------|---|------------||||||||----|||||-||-||||-------||-- 1 [T] COG1956 GAF domain-containing protein -----------|-||----|-|----|||-----|--|----|||-|--|-|---|--||||||-- 1 [F] COG1957 Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase -----------------|-||---------|----|||----|||||-|--|-------------- 1 [C] COG1979 Uncharacterized oxidoreductases, Fe-dependent alcohol dehydrogenase family ------||-----|------||----||||----|-||----|||||-|||--|||--||---|-- 1 [E] COG1984 Allophanate hydrolase subunit 2 |||---||||--|-----------------|---||||----|||||--|-|-------------- 1 [R] COG1988 Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolases ----------------|-|||----------------|----|||||-||-|||||||||||||-- 1 [H] COG1995 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein --------|---|-------|-----|-----|----|----|------||-----||-------- 1 [I] COG2031 Short chain fatty acids transporter --|----------||-|----|-----||||-----|-----|||||-|--|-|||----||-|-- 1 [P] COG2032 Cu/Zn superoxide dismutase --||||--|-|||---|--|-|----|||-------|-----|||||--|-|---|--||||||-- 1 [R] COG2041 Sulfite oxidase and related enzymes ------||-----|------||----||||----|-||----|||-|-|||--|||--||---|-- 1 [E] COG2049 Allophanate hydrolase subunit 1 -----------|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-| 1 [I] COG2057 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit |||||||||||||-------------||--|--------------|---|-|---|---||-||-- 1 [NU] COG2064 Flp pilus assembly protein TadC -----------------|-------------|----||----|||||---|--------||||--- 1 [G] COG2115 Xylose isomerase ---------------------------||----|--------|||-|--||-|||-||-||-|--- 1 [D] COG2184 Protein involved in cell division ----------------|---|-||||-----------|----|||||-||-||||||||||||||| 1 [T] COG2204 Response regulator containing CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains ------------------------------|--|||||-||-|||||||--|-------------- 1 [G] COG2213 Phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component ||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--| 1 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold --|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis -------------||---||-|--------------------|||||-||-|||||---||||||| 1 [H] COG2227 2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4-benzoquinol methylase ---------------------|----|||-|---||||----|||-|--||----|--||-|---- 1 [S] COG2258 Uncharacterized protein conserved in bacteria -|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [R] COG2262 GTPases ---|-------||-------||----|||--||---------|||||-|||----|---|||||-- 1 [G] COG2301 Citrate lyase beta subunit ---------------------|----|||---|---------|||||--|-|---|---||||--- 1 [R] COG2321 Predicted metalloprotease --------|-||---------|--------------||-------||--|-|-------------- 1 [Q] COG2368 Aromatic ring hydroxylase ------------------||-|----|-------|--||----|||---||----|||-||||--- 1 [O] COG2371 Urease accessory protein UreE -----------------|-|||--------------------|||||--|-||--|---||-|||| 1 [R] COG2373 Large extracellular alpha-helical protein --------|---|-------||----|----|--||------|||---||-|-------|||||-- 1 [R] COG2388 Predicted acetyltransferase ------||--|-|----|------------|--|--------|||||---|--------------- 1 [G] COG2407 L-fucose isomerase and related proteins -------------------|-|--|-----|-----------|||||--|-|---|--||||-|-- 1 [S] COG2717 Predicted membrane protein -----------|-||---||-------|||||||-|||----|||||-||-|-|||--||||||-- 1 [E] COG2755 Lysophospholipase L1 and related esterases ------------------------------------------|||||----|-||-|||------- 1 [M] COG2829 Outer membrane phospholipase A --||------|||-------------||||------------|||||-||-|||||----||||-- 1 [S] COG2835 Uncharacterized conserved protein -------------------|-|----|||-----|||-----|||||-||-|-|||------|--- 1 [P] COG2837 Predicted iron-dependent peroxidase ------------------------------------------|||----|-|-||-|||--|---- 1 [S] COG2841 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|------------||--------|-----|--||----------- 1 [R] COG2842 Uncharacterized ATPase, putative transposase ------------------------------|---|-------|||||---|--|||----|----- 1 [D] COG2846 Regulator of cell morphogenesis and NO signaling ----------|-----|----|----|---------------------||-|-|||--|||||||| 1 [S] COG2847 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|-----------------------|--||-|-||||||-|----- 1 [C] COG2863 Cytochrome c553 -------------||---------------------------|||||-||-|||||---||||||| 1 [I] COG2867 Oligoketide cyclase/lipid transport protein --||---------||--|---|----|||-||---|-|-----------|-|---|--|||||--- 1 [E] COG2873 O-acetylhomoserine sulfhydrylase --------------------|---------||||-||-----|||||----|||||---|||||-- 1 [G] COG2893 Phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA ------------------------------|----|------||||||||-|-------------- 1 [H] COG2918 Gamma-glutamylcysteine synthetase --------------------------|||-------------|||||-||-|||||---|||||-- 1 [M] COG2951 Membrane-bound lytic murein transglycosylase B ------------------------------------------|||||-|||--|||---------- 1 [S] COG2975 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|-----|-------|--|----||||--|--|-||--------|-- 1 [H] COG2978 Putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter ------------------------------------------|||-|-||-|-||----||||--- 1 [S] COG2979 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||-|-|--|-||----------- 1 [O] COG2999 Glutaredoxin 2 ------------------||------|-------|-------|||||-|--|-------------- 1 [G] COG3001 Fructosamine-3-kinase -|----------------------------------------|||||-|--|-------------- 1 [S] COG3013 Uncharacterized conserved protein ----------|-----|-------------------------------||-|------|-|----- 1 [R] COG3019 Predicted metal-binding protein -------------------|-|--------------------|||||-|--|-------|-|||-- 1 [S] COG3021 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||----------------------||-------|||----|||||-||-|-||----||||--- 1 [R] COG3030 Protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid --------------------------|-----||||-|-||-|||||-|--|-------------- 1 [S] COG3037 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|-----------------------|||||-||-||-||---|||||-| 1 [C] COG3038 Cytochrome B561 -------------------|-------------|--------|||-|-|-|-|---||-|------ 1 [S] COG3041 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||-||--|---|-||||| 1 [M] COG3047 Outer membrane protein W --------------------|----------||---------|||-|-|-|--------------- 1 [C] COG3051 Citrate lyase, alpha subunit --------------------|----------||---------|||-|-|-|--------------- 1 [C] COG3052 Citrate lyase, gamma subunit --------------------|----------||---------|||-|-|-|--------------- 1 [C] COG3053 Citrate lyase synthetase --------------------|-----------||--------|||||-|-|-|------||----| 1 [L] COG3077 DNA-damage-inducible protein J -------------------||-----|---------------|||---|||-|-------|-||-- 1 [R] COG3093 Plasmid maintenance system antidote protein --------------------|----------|||-|------|||||-|--||------||-||-- 1 [P] COG3142 Uncharacterized protein involved in copper resistance ------------------------------------------|||||-||-|---|---------- 1 [R] COG3150 Predicted esterase ------------------------------------------|||||-||-||--|-------|-- 1 [S] COG3159 Uncharacterized protein conserved in bacteria |||-----||-----------------|||------------|||||-||-|-|||---------- 1 [H] COG3161 4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase) ------------------------------------------|||||-||-|||||---------- 1 [S] COG3165 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||------------|--||-----|-----|-||-------|||---|-|-|||||-||-|--| 1 [S] COG3177 Uncharacterized conserved protein ---------------------|------------------------|--||---------|----- 1 [R] COG3179 Predicted chitinase --------------------|-----|---------||--------|-||-|---|---||----- 1 [S] COG3181 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||||----------------------|||-|-||-||--|---|||||-- 1 [M] COG3206 Uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis -------------------------------|---||-----|||||--||--------------- 1 [S] COG3223 Predicted membrane protein ---------------------|-----------------------||-||-|---|-----|---- 1 [E] COG3232 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate isomerase -------------------|-|----|---||--||------|||-|--|-|-------|--|--- 1 [S] COG3238 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|--------------------------|-||-||--|---------- 1 [IR] COG3240 Phospholipase/lecithinase/hemolysin -------------||----|-|----|---------------|||||-||-|-|||---||-|--- 1 [G] COG3265 Gluconate kinase -----------------------------------||-----|-||----|-|-|----------- 1 [S] COG3299 Uncharacterized homolog of phage Mu protein gp47 --------------------------|||-------------|||||-|--|-----------|-- 1 [S] COG3304 Predicted membrane protein --------------------------------------------------|-||--||-------- 1 [S] COG3309 Uncharacterized virulence-associated protein D --|----------------||------|||------|-----------||-|--------|-|--- 1 [Q] COG3315 O-Methyltransferase involved in polyketide biosynthesis --|-----------------------|||--------|--------|-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG3324 Predicted enzyme related to lactoylglutathione lyase --------------------|-----|----------|--------|-||-|---|---||----- 1 [S] COG3333 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|---------------|-|----------|--|----||--|-|--- 1 [P] COG3338 Carbonic anhydrase --|-||----|------|-|-------------------------|-----|------|------- 1 [S] COG3350 Uncharacterized conserved protein --|-|------|--|---------------|-----------|||||--|-|---|-------|-- 1 [S] COG3384 Uncharacterized conserved protein ----||-----|-|-------|------------|-|---------|--|-||--|---|||||-- 1 [G] COG3386 Gluconolactonase --------------------------|---|-||||-|-||-|||-|-|--|-------------- 1 [G] COG3414 Phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component --|---------------------------------------||||---|-|-||----|-|||-- 1 [S] COG3422 Uncharacterized conserved protein --------------------|---------||||-||-----|||||----|-------------- 1 [G] COG3444 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB --------------------|---|--------------------|-----|------|--|---- 1 [P] COG3470 Uncharacterized protein probably involved in high-affinity Fe2+ transport -------------------------------------------------|-|-|||---------- 1 [S] COG3471 Predicted periplasmic/secreted protein --------------------|----------|-|----------------|-------------|| 1 [M] COG3475 LPS biosynthesis protein --------------------------------|------------------|--|---|------- 1 [S] COG3512 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------|--|---------------|--|---|------- 1 [S] COG3513 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------------------------|-||---|-|----- 1 [M] COG3524 Capsule polysaccharide export protein -------------------|----------------------------|-|-|-------|-|--- 1 [R] COG3549 Plasmid maintenance system killer protein ------------------------------|||-|--------||-----|---|----------- 1 [K] COG3561 Phage anti-repressor protein ---------------------------------------------------|-||---|-|----- 1 [M] COG3562 Capsule polysaccharide export protein ---------------------------------------------------|-||---|-|----- 1 [M] COG3563 Capsule polysaccharide export protein -----------------------------------|--------------|-|---------|--- 1 [S] COG3566 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------|--------------|-|---------|--- 1 [S] COG3567 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----------------------------------------||-----|-----||---|---- 1 [S] COG3586 Uncharacterized conserved protein --------------------|-------------------------|----|-||-||-------- 1 [V] COG3587 Restriction endonuclease -||---------------|-|---------------------|||||-||-|-------|--|--- 1 [L] COG3593 Predicted ATP-dependent endonuclease of the OLD family -------------------------------||--|-------|||---||-|--------|---- 1 [K] COG3617 Prophage antirepressor ------|||---------------|---------------------|-|--|-------------- 1 [C] COG3630 Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, gamma subunit ---------------------------------------------|----|-|--|----|--|-- 1 [K] COG3636 Predicted transcriptional regulator ------------------------------------------|||---|--|-------------- 1 [S] COG3647 Predicted membrane protein -------------------|-------------------------|----|-|--|----|--|-- 1 [S] COG3657 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-----------|------|--------------------|||-|----|-|||--|----|-- 1 [L] COG3663 G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase -|------------------|---------------------|||-|---|--------------- 1 [S] COG3681 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||-----|--|---------|-- 1 [S] COG3692 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|-----------|---------|||-|-|-|--------------- 1 [HI] COG3697 Phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase (holo-ACP synthetase) --------------------------------|---------|||-|---|--------------- 1 [R] COG3700 Acid phosphatase (class B) --------------------|---------|---||||-----------|-|-------||-|--- 1 [S] COG3708 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------------------|||||-|--|---|---||-||-- 1 [M] COG3713 Outer membrane protein V --------------------|---------||||-||-----|||||----|-------------- 1 [G] COG3715 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC --------------------|---------||||-||-----|||||----|-------------- 1 [G] COG3716 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IID -------------------------------------------|||--|--|-------|------ 1 [P] COG3721 Putative heme iron utilization protein ------------------------------------------|||||-|--|-------------- 1 [K] COG3722 Transcriptional regulator ------------------------------------------|||||-||-|-------------- 1 [R] COG3726 Uncharacterized membrane protein affecting hemolysin expression -----------------------------------|-|----|||-|----|----------|--- 1 [G] COG3730 Phosphotransferase system sorbitol-specific component IIC -----------------------------------|-|----|||-|----|----------|--- 1 [G] COG3731 Phosphotransferase system sorbitol-specific component IIA -----------------------------------|-|----||--|----|----------|--- 1 [G] COG3732 Phosphotransferase system sorbitol-specific component IIBC ------------------------------------------|||-|--|-|-----------|-- 1 [S] COG3738 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|---|||-------------|-------|---|-- 1 [S] COG3739 Uncharacterized integral membrane protein --------------------------|----|-|||--------------|--|||---|--|--- 1 [S] COG3759 Predicted membrane protein ------------------------|--------------------------|---|-----|||-- 1 [S] COG3762 Predicted membrane protein -------------||-----|---------------------------|--|---|---|------ 1 [M] COG3774 Mannosyltransferase OCH1 and related enzymes ------------------------------------------|-||----|--||----------- 1 [S] COG3778 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|--|-------------- 1 [C] COG3783 Soluble cytochrome b562 ------------------------------------------|||||----|------|------- 1 [S] COG3787 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|--|-------------- 1 [S] COG3790 Predicted membrane protein ------------------------------------|------|||-----|---------||--- 1 [R] COG3822 ABC-type sugar transport system, auxiliary component ------------------------------|-----||----|||||-|||--------------- 1 [KT] COG3835 Sugar diacid utilization regulator ---------------------|------------|-------|||||--|-|---|---||||--- 1 [G] COG3836 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase -------------------------------------------------|-|---|---||-||-- 1 [U] COG3847 Flp pilus assembly protein, pilin Flp ------------------------------------------|||-|-|--|-------------- 1 [T] COG3851 Signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific --------------------------------------------||--|||--------------- 1 [R] COG3941 Mu-like prophage protein ------------------------------|--|----------------|--------------- 1 [M] COG3955 Exopolysaccharide biosynthesis protein ---------------------|-----||-------------|||||--|-|---|---|-|-|-- 1 [Q] COG3971 2-keto-4-pentenoate hydratase ------------------------------------------|||||-|--||------------- 1 [S] COG3978 Acetolactate synthase (isozyme II), small (regulatory) subunit --------------------||----|---||||---|----------|--|----------|--- 1 [R] COG3981 Predicted acetyltransferase -----------------|---------------------------|-----|--------|----- 1 [R] COG4099 Predicted peptidase ------------------------------------------|||||-||-|||||---------- 1 [R] COG4137 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ---------------------------------|--------|||-|---|--------||||--- 1 [G] COG4154 Fucose dissimilation pathway protein FucU -------------------------------------------|||-----|----------|--- 1 [R] COG4158 Predicted ABC-type sugar transport system, permease component -------------------|-------||-|-------------------|--------|------ 1 [S] COG4185 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------------------|-|--|-------------- 1 [T] COG4192 Signal transduction histidine kinase regulating phosphoglycerate transport system -------------------------------------|-|--||||----|----|---||||--- 1 [G] COG4213 ABC-type xylose transport system, periplasmic component -------------------------------------|-|--||||----|----|---||||--- 1 [G] COG4214 ABC-type xylose transport system, permease component --------------------------------------------||----|--||----------- 1 [R] COG4228 Mu-like prophage DNA circulation protein ------------------------------------------|||||--|-|-|||---|||||-- 1 [C] COG4230 Delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase -------------|------|----------|-|-|---------------|-------------- 1 [S] COG4283 Uncharacterized conserved protein --------------------------------------------------|--||-------|--- 1 [S] COG4316 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|------|||----------------------|-------------- 1 [S] COG4325 Predicted membrane protein ------------------------------------|--------------|-------|------ 1 [L] COG4335 DNA alkylation repair enzyme ---------------------|----------------------|-----|--------------- 1 [R] COG4373 Mu-like prophage FluMu protein gp28 --------------------------------------------||----|--||----------- 1 [R] COG4379 Mu-like prophage tail protein gpP --------------------------------------------||----|--||----------- 1 [S] COG4381 Mu-like prophage protein gp46 --------------------------------------------|-----|--||----------- 1 [S] COG4382 Mu-like prophage protein gp16 --------------------------------------------||----|--||----------- 1 [S] COG4384 Mu-like prophage protein gp45 --------------------------------------------||----|--||----------- 1 [R] COG4386 Mu-like prophage tail sheath protein gpL --------------------------------------------|-----|--||----------- 1 [S] COG4387 Mu-like prophage protein gp36 --------------------------------------------|-----|--||----------- 1 [R] COG4388 Mu-like prophage I protein ---------------------------------------------------|-|||---------- 1 [L] COG4389 Site-specific recombinase ---------------------------------------------------|-|||---------- 1 [S] COG4390 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|------------------------|-----|------|------- 1 [S] COG4393 Predicted membrane protein --------------------------------------------|-----|---|----------- 1 [R] COG4396 Mu-like prophage host-nuclease inhibitor protein Gam --------------------------------------------|-----|---|----------- 1 [R] COG4397 Mu-like prophage major head subunit gpT ------------------------------|-------------|-----|--------------- 1 [R] COG4416 Mu-like prophage protein Com ---------------------------||--------------||-|-|-|-|--|----|----- 1 [S] COG4453 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------------------||----|----------|--- 1 [S] COG4457 Uncharacterized protein conserved in bacteria, putative virulence factor ---------------------------------------------||----|----------|--- 1 [S] COG4458 Uncharacterized protein conserved in bacteria, putative virulence factor --------------------------------------------|---|-|--------------- 1 [S] COG4518 Mu-like prophage FluMu protein gp41 ---------------------|----|----------------|||--||-|-------||-|--- 1 [P] COG4558 ABC-type hemin transport system, periplasmic component ----------------------------------------------|--|-|---|---|||||-- 1 [T] COG4566 Response regulator ------------------------------------------|||||--|-|---|---------- 1 [S] COG4575 Uncharacterized conserved protein --------------------------||||-------|----|||-|----|----------|--- 1 [K] COG4578 Glucitol operon activator --------------------|---------------------||||--||-|--------|----- 1 [R] COG4589 Predicted CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase ----------------------------------|-|-----|--------|-------------- 1 [P] COG4594 ABC-type Fe3+-citrate transport system, periplasmic component --|----------------------------|----------|||||-|--|----------|--- 1 [CH] COG4635 Flavodoxin --------------------|-----|---|-----------|||||-|--|-------------- 1 [R] COG4667 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily -------------------|-------------|---------||||---|-|------------- 1 [S] COG4679 Phage-related protein -------------------------------------------||------|---|---------- 1 [S] COG4688 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------------------|----|---|---------- 1 [S] COG4714 Uncharacterized membrane-anchored protein conserved in bacteria ---|----|----------------------------|-----------|-|-------------- 1 [S] COG4729 Uncharacterized conserved protein --------------------|---|--------|----------------|--------------- 1 [M] COG4750 CTP:phosphocholine cytidylyltransferase involved in choline phosphorylation for cell surface LPS epitopes --------------------|------------------------------|-||---------|| 1 [R] COG4797 Predicted regulatory domain of a methyltransferase -----------------------------------|------|||||----|-------------- 1 [S] COG4811 Predicted membrane protein --|----------------||------------------------|-----|---------|---- 1 [S] COG4929 Uncharacterized membrane-anchored protein -------------------||---------------------|||-|----||------||-||-| 1 [M] COG4953 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC ---------------------------------------------|---|-|---|---||-||-- 1 [OU] COG4960 Flp pilus assembly protein, protease CpaA ---------------------------------------------|---|-|---|---||-||-- 1 [U] COG4961 Flp pilus assembly protein TadG ||----||-|----------------|||-|--------------|---|-||--|---||-||-- 1 [U] COG4962 Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF ---------------------------------------------|---|-|---|---||-||-- 1 [U] COG4963 Flp pilus assembly protein, ATPase CpaE ---------------------|---------------------------|-|---|---||-||-- 1 [U] COG4964 Flp pilus assembly protein, secretin CpaC --------------------------|||----------------|---|-|---|---||-||-- 1 [U] COG4965 Flp pilus assembly protein TadB --------------------|------------------------|-----|-------------- 1 [S] COG4984 Predicted membrane protein |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase --------------------------------------------|-----|--||----------- 1 [R] COG5003 Mu-like prophage protein gp37 ---------------------------------------------|---|-|---|---||-||-- 1 [U] COG5010 Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeats |||---|-|-------||--|---|-------|-------------|-||-|------|------- 1 [C] COG5016 Pyruvate/oxaloacetate carboxyltransferase --|-------------------------------|--------||||----|-------------- 1 [L] COG5519 Superfamily II helicase and inactivated derivatives --------------------------------------------|-|-|-|--------------- 1 [S] COG5566 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||-|--|-||------------- 1 [N] COG5571 Autotransporter protein or domain, integral membrane beta-barrel involved in protein secretion