| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 46 [NT] COG0840 Methyl-accepting chemotaxis protein ----------------||||-|--|-|||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 41 [T] COG2199 FOG: GGDEF domain ||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 40 [K] COG0583 Transcriptional regulator |-||--|||----|||-|||-|--||-||-|----|||----|||||-|||||--|||||||||-- 29 [T] COG0784 FOG: CheY-like receiver |-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 28 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 19 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily ----------------|-||-|---||||||----|||----|||||-||--|--|---||||||| 19 [T] COG2200 FOG: EAL domain |-||----|-----|-||||-|||-||||||----|||----|||||-||--|--|--||||||-- 17 [T] COG2202 FOG: PAS/PAC domain |||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 16 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases --|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-||||||||||||| 14 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain ----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-|||||||||||||||||| 13 [M] COG0845 Membrane-fusion protein |-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 13 [K] COG1309 Transcriptional regulator -----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||-- 13 [K] COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins |||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 12 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases ----------------||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 12 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain |-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 11 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases |-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 11 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily --|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 11 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) -----------------|--||----|||-||||||||-|--|||||-|||||--|---|||||-- 11 [K] COG1609 Transcriptional regulators |-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 10 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes |||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||| 9 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases ----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||-- 9 [NU] COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG --||--|||--------|||----||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 8 [NT] COG0835 Chemotaxis signal transduction protein |-|-||--|||||----||--|----|---------||----|||||-|||||--|--||||||-- 8 [E] COG1280 Putative threonine efflux protein |-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---||||||| 8 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators -|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-||||||||||||| 8 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins ----------------|---|-||||-----------|----|||||-||-||||||||||||||| 8 [T] COG2204 Response regulator containing CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains |||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 7 [L] COG0582 Integrase |-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-|||| 7 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase -------------||---||----------------------|||||-||||----------|--- 7 [T] COG2198 FOG: HPt domain --|-||--|----||---||||----|||--|||||-|||--|||||-|||--|||---|||||-- 7 [L] COG2801 Transposase and inactivated derivatives -------------------|-|-----||--------------|||--||--|--|---|||||-- 7 [R] COG3668 Plasmid stabilization system protein ||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-| 6 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) |||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [R] COG0517 FOG: CBS domain |||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins ||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 6 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific --||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-|||||||||||||||||| 6 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) ----------------||||||--||||||||--||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases --|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump ||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-| 6 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 6 [N] COG1344 Flagellin and related hook-associated proteins --------------------|-|||||---||||||||-||||||||-||||-|||---|||||-- 6 [GT] COG1762 Phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain (Ntr-type) ----------------|--||-||||-||-------------|||||||||||||||||||||||| 6 [M] COG2885 Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins -----|--------------||----|||--|||||-|----|||||-|||----|---|||||-- 6 [L] COG2963 Transposase and inactivated derivatives |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [O] COG0443 Molecular chaperone ||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 5 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [E] COG0527 Aspartokinases -------------||---||------------||--------|||||-||||||||---||||||| 5 [O] COG0625 Glutathione S-transferase --|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 5 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators -------------||----|------||||-||||||-----|||||-||-----|--||-||--- 5 [Q] COG1020 Non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins ||||----|||||---|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component --------------------|----||---||||||||-|||||||||||-|---|-------|-- 5 [G] COG1263 Phosphotransferase system IIC components, glucose/maltose/N-acetylglucosamine-specific --------------------|----||---||||||||||||||||||||-|---|-------|-- 5 [G] COG1264 Phosphotransferase system IIB components --------------------||---||---||||||||-||||||||-||||---|---------- 5 [G] COG1445 Phosphotransferase system fructose-specific component IIB |||||||||||||--------|----|||-|-----||----|||||-||||-|||---|||||-- 5 [K] COG1522 Transcriptional regulators ----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||||||||| 5 [MU] COG1538 Outer membrane protein ----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||-- 5 [P] COG1629 Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport ---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||-- 5 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase ------------------||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 5 [TK] COG2197 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain ----------------||-|-|--||----|------|----------||-----|---|--|--- 5 [T] COG2206 HD-GYP domain ---------||-------||-|----||||||--||||----|||||-||-----|---|||||-- 5 [K] COG2771 DNA-binding HTH domain-containing proteins ---|---------------------------|---|-|-------||-||---------------- 5 [R] COG3979 Uncharacterized protein contain chitin-binding domain type 3 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 4 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase |||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||-- 4 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 4 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase ||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [M] COG0438 Glycosyltransferase |||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 4 [R] COG0457 FOG: TPR repeat -------------|||--||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 4 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains |||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||-- 4 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family ||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---||||||| 4 [E] COG0531 Amino acid transporters ||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 4 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component |||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---||||||| 4 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||--- 4 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components --|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 4 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase -------------||---||-|----|||-----|-||----|||||-||-|||||---||||||| 4 [HC] COG0654 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases --|----------||||-||--||--||||-|---|||----|||-|-||-|---|||-||-|--- 4 [P] COG0659 Sulfate permease and related transporters (MFS superfamily) -------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||-- 4 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases |||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--|||||||||||||| 4 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel ---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 4 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein |-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---||||||| 4 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins |||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [R] COG0730 Predicted permeases |--|----|----||-|||--|--|-|---|||-||||-|--|||||-|-||---|||-||-|--- 4 [F] COG0737 5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 4 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component ----||----------||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein |-|------|------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 4 [U] COG0811 Biopolymer transport proteins -------------|||------||--|---------------|||||-||||-||-|||------- 4 [E] COG0814 Amino acid permeases ----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases ----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||---||-- 4 [M] COG0859 ADP-heptose:LPS heptosyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 4 [G] COG1109 Phosphomannomutase --||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||--- 4 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components ---|--||--|-|-----||||--|-|------|---|----|||||-||||-|||--|||||--- 4 [P] COG1178 ABC-type Fe3+ transport system, permease component ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases ||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 4 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes ---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---||||||| 4 [K] COG1278 Cold shock proteins --------------------||---||---||||||||-||||||||-|||----|---------- 4 [G] COG1299 Phosphotransferase system, fructose-specific IIC component ----------------||--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---||||--- 4 [KG] COG1349 Transcriptional regulators of sugar metabolism ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||-- 4 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF ---|--||----|-------|----|----|---|-||-------||-|-||-||-|||------- 4 [C] COG1757 Na+/H+ antiporter --||------|-|-----|||-----|-----|||--|-----||||-||||||||--|||||--- 4 [P] COG1840 ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component |||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||-- 4 [K] COG1846 Transcriptional regulators --|--------------|--|---|-|--|||----||----|||||-||||---|---|||||-- 4 [G] COG1879 ABC-type sugar transport system, periplasmic component --||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||-- 4 [L] COG1943 Transposase and inactivated derivatives ---|-------------|||-------||----||-------|||-|-|----------|-----| 4 [D] COG2161 Antitoxin of toxin-antitoxin stability system ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 4 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB --------------------------|---------------|||-|-||--------||--||-- 4 [M] COG3040 Bacterial lipocalin ------------------------------------------|||||||-||-|||---------- 4 [M] COG3203 Outer membrane protein (porin) ---------------------------||-----------------|-||---------------- 4 [U] COG3267 Type II secretory pathway, component ExeA (predicted ATPase) -----------------|||-|--|-----|-----------------||--|------------- 4 [KT] COG3437 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HD-GYP domain --||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||-- 4 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||| 3 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5) |||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 3 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase] --||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0031 Cysteine synthase ||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0073 EMAP domain |||---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0084 Mg-dependent DNase -|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes ||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-||||||| 3 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase -|||--|||-|||-----||-|---------------|--||||||||||||||||---|||||-- 3 [HJ] COG0189 Glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase) |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 3 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component |-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||-- 3 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase ||-||||||||||---|-||-|----|||-------||----|||||-||||---|||||||||-- 3 [C] COG0243 Anaerobic dehydrogenases, typically selenocysteine-containing ||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||--- 3 [C] COG0247 Fe-S oxidoreductase --|----------||-|-||-|----||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 3 [S] COG0316 Uncharacterized conserved protein |-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 3 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II |||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--|||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs |-||||--|-|||||||-||-|-----||--|--||||----|||||-||-||--||-||||||-- 3 [I] COG0365 Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases --|-||----|--||--|||-|----|||-||||||||-|--|||||-||-----|---||-||-- 3 [G] COG0366 Glycosidases |-||-------|-|----||------|-----|-||------||||||||----|----|--||-- 3 [L] COG0415 Deoxyribodipyrimidine photolyase ||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases ||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 3 [R] COG0456 Acetyltransferases -|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||-- 3 [G] COG0469 Pyruvate kinase ||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||---- 3 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters |||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein ||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase |------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||| 3 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit -------------||---||-||||-|---------------||||||||||||||-------|-- 3 [O] COG0545 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 1 |||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||------- 3 [L] COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I |-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase |-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|--- 3 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32) |-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-|| 3 [ER] COG0591 Na+/proline symporter -||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||-- 3 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component ---|---------||||-||-|||--|---------------||||||||||-|||---||||||| 3 [C] COG0633 Ferredoxin ----------------|||||||||||||-|||||||||---|||||||||||||||||||||||| 3 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases |||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||-- 3 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 3 [NT] COG0643 Chemotaxis protein histidine kinase and related kinases |||-----||---||---|||---|-----||||-||-----|||||||||||--||||------- 3 [C] COG0716 Flavodoxins -|||--|||-------|---|-|||-|------|||||----------|-||-||-|||------- 3 [R] COG0733 Na+-dependent transporters of the SNF family ----------------||||----||----||||-|||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains) --|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||--- 3 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component -------------|||||||||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase |||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [C] COG0778 Nitroreductase -----------------|---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0782 Transcription elongation factor -------------|||-----|--------------------|||||-||||-|||||||||||-- 3 [R] COG0790 FOG: TPR repeat, SEL1 subfamily |||------|-|----|--|||--------||||||||----|||||-||||-|||||||||---- 3 [O] COG0826 Collagenase and related proteases |-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||-- 3 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component ----------------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [U] COG0848 Biopolymer transport protein ||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||-- 3 [R] COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily) ---|----|-|-|||||-|||---||||||---------------|--||||-------------- 3 [I] COG1022 Long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming) --||----------|--|||------||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 3 [E] COG1045 Serine acetyltransferase --|---||------------|||||-|-----|||-||----|||-|-||||-||-|||-||---- 3 [E] COG1115 Na+/alanine symporter --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 3 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component |||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|--- 3 [C] COG1145 Ferredoxin ||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--|||||||||||||| 3 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning -----------------|||----------|----||-----|||||-||-----|---------- 3 [KT] COG1221 Transcriptional regulators containing an AAA-type ATPase domain and a DNA-binding domain ||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-|||||||||||||| 3 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component --||||--|-------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 3 [C] COG1271 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1 --||------------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 3 [C] COG1294 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2 --||--|||--------|-|----||----|----|||----|||||-||-----|--|||-||-- 3 [NT] COG1352 Methylase of chemotaxis methyl-accepting proteins ----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---||||||| 3 [S] COG1434 Uncharacterized conserved protein |-|||||||--||||-||--|-----|---||-|||||----|||||-||-|---|---||||--- 3 [C] COG1454 Alcohol dehydrogenase, class IV -|||--|----------|-||-----|---|----|--||---|||--|--|--|-|||------- 3 [S] COG1479 Uncharacterized conserved protein --------------------|-||--||||------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG1560 Lauroyl/myristoyl acyltransferase -----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||-- 3 [K] COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog -----------------|------|-----------------------||--------|------- 3 [T] COG1639 Predicted signal transduction protein --------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 3 [M] COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase -----------------|--------|---||||||||-|--|||||-||||-|||---|||||-- 3 [K] COG1737 Transcriptional regulators --||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components --||||--|--|-||--|-|||----|||-|||-||||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 3 [C] COG1902 NADH:flavin oxidoreductases, Old Yellow Enzyme family --------------------|||||||---||||||||||||||||||||||||||---|||||-- 3 [G] COG1925 Phosphotransferase system, HPr-related proteins -------------------|------------|-|-||----|||||-|-||----||-----|-- 3 [F] COG1972 Nucleoside permease --|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--| 3 [L] COG2003 DNA repair proteins -||---|-|---|-----|||------||----|--------|--||-|------|---||----- 3 [JD] COG2026 Cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system ----------------|---|---------------------|||||-|||||||-||-|||||-- 3 [I] COG2067 Long-chain fatty acid transport protein --|-----------------||---|----||||||||----|||||-|-||------|-|--|-- 3 [E] COG2195 Di- and tripeptidases |-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||-- 3 [P] COG2217 Cation transport ATPase |----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----||||||| 3 [P] COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain) ------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 3 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase ----------------------||-------||-|-|-----|||||-||||------|-----|| 3 [G] COG2271 Sugar phosphate permease ------------------||----------||-|--||||||-||||-||--||||----|-||-- 3 [V] COG2274 ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain ---------------------|-----------------------|--||-|-||||||-|----- 3 [C] COG2863 Cytochrome c553 ------------------------------------------|||||-||||------|||----- 3 [C] COG3005 Nitrate/TMAO reductases, membrane-bound tetraheme cytochrome c subunit ------------------------------|--------------|--||--|------------- 3 [S] COG3007 Uncharacterized paraquat-inducible protein B ------------------------------------------|||||-||---------------- 3 [S] COG3148 Uncharacterized conserved protein -----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-||||||| 3 [M] COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes ------------------------------------------|||||-|---|--|----|||--- 3 [K] COG3311 Predicted transcriptional regulator ------------------------------------------|||||-||-----|----||||-- 3 [R] COG3313 Predicted Fe-S protein --|-----------------------|||--------|--------|-||-|---|---|||||-- 3 [R] COG3324 Predicted enzyme related to lactoylglutathione lyase ---|---------|---------------------|-|--------|-|----------------- 3 [G] COG3325 Chitinase ----------------|-------------------|-----------|----------------- 3 [T] COG3434 Predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains -------------------|-----------------------||||-||-----|---|--|--- 3 [S] COG3501 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------|--------------------------------------||---------------- 3 [O] COG4067 Uncharacterized protein conserved in archaea -----------------|--|-|||||||-||-||||-||--|||||-||||---|||-||||--- 3 [E] COG4166 ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component --|-------------|---||--||----|-----------|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG4591 ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component ------------------------------------------------|-----------|-|--- 3 [O] COG5640 Secreted trypsin-like serine protease ||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||-- 2 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase |||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||--- 2 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family |||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase -------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0021 Transketolase ||||||-|||---|||--||-|----|||--|-||||-----|||||-||-||------|--|--- 2 [P] COG0025 NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control ---------|---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 2 [E] COG0067 Glutamate synthase domain 1 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 2 [E] COG0069 Glutamate synthase domain 2 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 2 [E] COG0070 Glutamate synthase domain 3 ||||||||||||||--||||-|--------||--|-||--------|-||------||-||-||-- 2 [E] COG0075 Serine-pyruvate aminotransferase/archaeal aspartate aminotransferase ||||--||||--||----||-------||--|---|-|----||||--|-|---------|||--- 2 [E] COG0076 Glutamate decarboxylase and related PLP-dependent proteins ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase ||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase ||--|-||--||-|----||-------||-------------|||||-||||-|||---||||--- 2 [R] COG0121 Predicted glutamine amidotransferase |||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase -|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I --||||||--|||||----|-|----|||||---|-||----|||||-|||----|---||||--- 2 [E] COG0160 4-aminobutyrate aminotransferase and related aminotransferases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase ||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||---- 2 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components -||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 2 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes |||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 2 [Q] COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway) --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit ------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||-- 2 [J] COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class) |-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 2 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A) ------------------|--|----||||-----|------|||||-||||---|---||||||| 2 [F] COG0232 dGTP triphosphohydrolase --|----------||-||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10) --|----------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein -|--||-------|||--|-|------||-|-----------|||||||||||||||||---||-- 2 [E] COG0241 Histidinol phosphatase and related phosphatases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase --|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-|||||||||||||||||| 2 [FP] COG0248 Exopolyphosphatase |||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0250 Transcription antiterminator ---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0254 Ribosomal protein L31 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0257 Ribosomal protein L36 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) ------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-|||||||||||| 2 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase |-||------||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain --||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases -|--||----------|-|-|------||-|-----------||||||||||-||-|||---|--- 2 [G] COG0279 Phosphoheptose isomerase --|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [C] COG0281 Malic enzyme --|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-|| 2 [C] COG0282 Acetate kinase |||||||||||||---|-||-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [H] COG0303 Molybdopterin biosynthesis enzyme |||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||-- 2 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs ----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-| 2 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases ---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0328 Ribonuclease HI |||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase ----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD |||-----||------||||-|----|||-||---||-----|||||-||||||||---|||||-- 2 [E] COG0347 Nitrogen regulatory protein PII -------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||-- 2 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase |-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-||||||||||||||| 2 [C] COG0372 Citrate synthase |-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||-- 2 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase ----||----||||||--||||----|||-----|-||----|||-|-||--||||||-||-||-- 2 [E] COG0405 Gamma-glutamyltransferase --|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-||||||||||||||| 2 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation ||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||-- 2 [O] COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation --|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||--- 2 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component |||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||-- 2 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases -----------------|||||||--||||||-|--||----|||||-|-||-------||-|--- 2 [G] COG0448 ADP-glucose pyrophosphorylase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family) |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase |-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2 ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases) ||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning --|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--|||||||| 2 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases |||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||-- 2 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function ||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||--- 2 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins ---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 2 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II |-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||-- 2 [E] COG0520 Selenocysteine lyase |||||||||-|||||||-||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-| 2 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0550 Topoisomerase IA --||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|----- 2 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family |||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||-- 2 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase --------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [J] COG0566 rRNA methylases ---|||-----|-|||--|--|---|||||-|||||||----|||||-|||||--|---||||--- 2 [C] COG0578 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 2 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component ---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||-- 2 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase ||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes --||||----||-||-|--|-|----||||-|--||||----|||||-||-||--|---|||||-- 2 [CR] COG0604 NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductases |-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [P] COG0605 Superoxide dismutase ----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--||||||||||| 2 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases -||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component |||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----|||||||||||||||||||||||| 2 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class) -------------|||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase |||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase -|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases --||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases ||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0628 Predicted permease |-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase) --|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating) ||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-||||||| 2 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase |-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||-- 2 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins -------------||---||-------------------------|--|-||-|||---|||||-- 2 [O] COG0678 Peroxiredoxin ||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--|||||||| 2 [R] COG0679 Predicted permeases |||-----||---|-------|----||||-------|----|||||-||||---|---||-|--- 2 [H] COG0684 Demethylmenaquinone methyltransferase -||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||-- 2 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase -||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||-- 2 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid) |||||||||||||---||||-|---||||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 2 [R] COG0714 MoxR-like ATPases -------------||----|-|----|----|-|--------||||||||||||||------||-- 2 [E] COG0722 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase --|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||-- 2 [G] COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase ----------------|---|---------------------|||||-||||||||---|||||-- 2 [M] COG0729 Outer membrane protein --|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||-- 2 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins -----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [M] COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein) ----------------||||||||------||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2 ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase --------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0787 Alanine racemase ----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0793 Periplasmic protease -----------------|||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [R] COG0795 Predicted permeases -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 2 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase ----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II ----------------|--||---------------------|||||-||||||||||||||||-- 2 [M] COG0810 Periplasmic protein TonB, links inner and outer membranes -----------|--------||--|------||||||-|||||||||||-||----||----|--- 2 [F] COG0813 Purine-nucleoside phosphorylase |-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [R] COG0824 Predicted thioesterase --||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--|||||||||||||| 2 [CP] COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit ---|---------||-----||----|||-----|-||----||||||||--||||---|||||-- 2 [C] COG1018 Flavodoxin reductases (ferredoxin-NADPH reductases) family 1 ---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---||||||| 2 [I] COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase |||||||||||||-------||--|-----------------|||||-|||||||||||------- 2 [O] COG1047 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2 ----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||-- 2 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases ||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit --|||||||-||||||---|||--|-|||||-||||------|||||-|----------------- 2 [KL] COG1061 DNA or RNA helicases of superfamily II ||||||||||-------|------|-----|-----||----|||||-||||-------------- 2 [O] COG1067 Predicted ATP-dependent protease --||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||-- 2 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily --------|----||---||-|----|---|---|-||-|--------||--|--|---------- 2 [R] COG1075 Predicted acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold -------------|||--|-----------------------||||||||||-|||--|||||||| 2 [O] COG1076 DnaJ-domain-containing proteins 1 -|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||--- 2 [R] COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 2 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component -||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||-- 2 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components |||-|----|-|------|||-----||||----|-------|||||-|------|||-||-|--- 2 [R] COG1123 ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase -----------------|--|---|||----|----||-|--|||||-||||---|---|||||-- 2 [G] COG1129 ABC-type sugar transport system, ATPase component ---|--------------||------||||-|--|||-----|||||-||||---------|---- 2 [HQ] COG1169 Isochorismate synthase ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|---||||--- 2 [G] COG1175 ABC-type sugar transport systems, permease components ||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|-- 2 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases ---|||--|-|||-------||-----||||---|-||----|||||-||-----|---||||||| 2 [I] COG1250 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase --||---------||-|||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains -|--|-|||----||-----------|||--||||-------|||-|-|-||-|------------ 2 [P] COG1275 Tellurite resistance protein and related permeases --||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-|||| 2 [C] COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 2 [M] COG1346 Putative effector of murein hydrolase ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 2 [N] COG1360 Flagellar motor protein -----------------||||||||--||-|---||||----------||---------||--|-- 2 [T] COG1366 Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor) --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 2 [R] COG1380 Putative effector of murein hydrolase LrgA -------------------|||----|--||||||||||-|||||||-||||||||--||||||-- 2 [P] COG1393 Arsenate reductase and related proteins, glutaredoxin family -------------||-----|-||------------------|||||-||||||||----|-|--- 2 [E] COG1448 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase -------------------------|----||||||||----|||||-|----------------- 2 [G] COG1455 Phosphotransferase system cellobiose-specific component IIC ||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--|||||||||||||| 2 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators --------|----||--|---|---|||||||||||||-|--|||||-|--|-------------- 2 [G] COG1482 Phosphomannose isomerase ----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-||||||| 2 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes ---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---||||||| 2 [J] COG1530 Ribonucleases G and E ----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---||||||| 2 [J] COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1) ----------------|-----------------|-|-----|||||-|||--|||---||||||| 2 [V] COG1566 Multidrug resistance efflux pump ----------------||------||----|-----||----|||||-||-----||||------- 2 [N] COG1580 Flagellar basal body-associated protein -----------------|--|---|-|----------|----|--||-||||-------||--|-- 2 [G] COG1593 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component ||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG1605 Chorismate mutase ---|||----|||--------|||--|-------||||----||||||||||-|||||||||||-- 2 [I] COG1607 Acyl-CoA hydrolase ----||------------||||--|-----||-|-|||-|--|||-|-||---|||--------|| 2 [V] COG1619 Uncharacterized proteins, homologs of microcin C7 resistance protein MccF -----------------||-|---|-|---------||----|--||-||||---|---||-||-- 2 [G] COG1638 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, periplasmic component -------------|||-----|--|||---------------|||||-||||||||---|||||-- 2 [L] COG1643 HrpA-like helicases ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||----|||||-||-||--|---||||--- 2 [G] COG1653 ABC-type sugar transport system, periplasmic component --|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-| 2 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase |--------|--------||-------||||----|||----------|||--||||||||||||| 2 [S] COG1714 Predicted membrane protein/domain --------------------||----||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 2 [E] COG1760 L-serine deaminase ----||---------------|----|----|--|||---|||||-|-||--|--|---|||||-- 2 [O] COG1764 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation --||--|||--------|------|-----|----|||----------|-------|||------- 2 [NT] COG1776 Chemotaxis protein CheC, inhibitor of MCP methylation -----------|-----|-|||---||||-||||||||-|--|||||-|||||------|||||-- 2 [G] COG1820 N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase ------|||--------|--|---|-------|-------------|-|--|-------------- 2 [C] COG1883 Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit ---|||--|-||||-----|||----|||||---|-||----|||||-||---|||---|||||-- 2 [I] COG1960 Acyl-CoA dehydrogenases ------------------|||------||||--|||||----|||||-||||---|----|----- 2 [E] COG1982 Arginine/lysine/ornithine decarboxylases ||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 2 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases ------------------||-|--------||--|-||----|||||-|-||--------|-|--- 2 [R] COG2103 Predicted sugar phosphate isomerase ---------|---|------|---------|||||||-----|||||-||||-------------- 2 [P] COG2116 Formate/nitrite family of transporters --|-||||||---||--|--||--|-----||||||||-|--------|----------------- 2 [F] COG2131 Deoxycytidylate deaminase ---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||-- 2 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis -------------||------------|||------------||||--||-----|------|--- 2 [Q] COG2175 Probable taurine catabolism dioxygenase ---------------------|----|||||----|||----|||||-||||-|||---|||||-- 2 [K] COG2186 Transcriptional regulators -------------------|-|----|||-||||||||||--|||||-||-----|---|||||-- 2 [K] COG2188 Transcriptional regulators --||--|||--------|-|----||----|-----||----|||||-||--|--|--|||-||-- 2 [NT] COG2201 Chemotaxis response regulator containing a CheY-like receiver domain and a methylesterase domain |-||----|-----|-||||-|-----||||---|-||----|||---||-----|---|||||-- 2 [T] COG2203 FOG: GAF domain ---|---------|||-|||-|--||----|---------|||||-|-||--|||-||||||||-- 2 [O] COG2214 DnaJ-class molecular chaperone ||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--| 2 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold ----------||-|-------|----||||-------|----|||||-||-----|---|||||-- 2 [C] COG2225 Malate synthase -------|------|--|--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---|||---- 2 [F] COG2233 Xanthine/uracil permeases --|-----|--||-----||||---|||||------||----|--||-||------------|--- 2 [R] COG2304 Uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain ---|----|---|-----|--|---------------|----------||-|--------||--|| 2 [R] COG2358 TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component ---|||---|||-----|---|------------|-------|||||-||--|--|--|||||--- 2 [R] COG2391 Predicted transporter component --|-----------------|-----|---|-|-|-||----|||||-||||-|||---------- 2 [GE] COG2610 H+/gluconate symporter and related permeases ------------------------------|-----------|||||-|-||----|||------- 2 [R] COG2704 Anaerobic C4-dicarboxylate transporter ------------------------------------------|||||-||--|----------|-- 2 [E] COG2716 Glycine cleavage system regulatory protein --|-----|-------|-||-|--------------|-----------||-----|---||-|--- 2 [T] COG2770 FOG: HAMP domain -|----||-|-|-----|---|---------|||||||----||||||||||-------|||||-- 2 [J] COG2813 16S RNA G1207 methylase RsmC ---|------|||-----------|----|-||---------|||||-|-||-------------- 2 [F] COG2820 Uridine phosphorylase ------------------------|-----------------||||||||||||||---|||||-- 2 [S] COG2840 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|------||---------|----|----||---||----|||||-||||---|--||||||-- 2 [S] COG2860 Predicted membrane protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors --------|-------|---------|----------|----------||---------------- 2 [T] COG2905 Predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains ------------------------------------|-----------|---|||----------- 2 [L] COG2946 Putative phage replication protein RstA --------------------|-----|-------|--|----||||--|--|-||--------|-- 2 [H] COG2978 Putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter ---------------------------------------------|--||||-||----------- 2 [S] COG2991 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-|||---------- 2 [S] COG2995 Uncharacterized paraquat-inducible protein A ------------------------------------------|||||-||||-|||---------- 2 [R] COG3008 Paraquat-inducible protein B ------------------|-----------------------|||||-||-||-||---|||||-| 2 [C] COG3038 Cytochrome B561 --||||---------------------||-------------|-----|----|||---||-|--- 2 [L] COG3039 Transposase and inactivated derivatives, IS5 family --------------------|---------------------|||||-|-||---------|---- 2 [S] COG3055 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|--|||------|||||-||||-|-|----|-||-| 2 [K] COG3070 Regulator of competence-specific genes ------------------------------------------|||||-||||-------------- 2 [R] COG3083 Predicted hydrolase of alkaline phosphatase superfamily --------------------|-----|----------|----|--||-||||-------||--|-- 2 [G] COG3090 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 2 [S] COG3110 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||-|---|---------- 2 [R] COG3150 Predicted esterase -------------------------------|--||------|||||-||----------|-||-- 2 [S] COG3152 Predicted membrane protein --|----------------|------|----|--||------|||||-||---------|||||-- 2 [R] COG3153 Predicted acetyltransferase ------------------------------------------|||||-||-----|---|--|--- 2 [S] COG3157 Hemolysin-coregulated protein (uncharacterized) -------------------|-------||-------------------||-----|---|||||-- 2 [R] COG3176 Putative hemolysin ------------------------------------------|||||-||---------------- 2 [S] COG3266 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------||||||||----|||||-||--|--|---|||||-- 2 [KT] COG3279 Response regulator of the LytR/AlgR family -|-------|---------|----------------------------||----------|-|--- 2 [S] COG3287 Uncharacterized conserved protein --------------------------|-----|---||----|||-|-|----------------- 2 [T] COG3290 Signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism ------------------||----------------------------|---|------------- 2 [T] COG3292 Predicted periplasmic ligand-binding sensor domain --------------------|---------|---|-||----|||-|-|-----------|----- 2 [S] COG3314 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------||------------|-----|||-|-||---||----------- 2 [R] COG3318 Predicted metal-binding protein related to the C-terminal domain of SecA ---|-------|------------------------------|||||-|-||---|---------- 2 [R] COG3381 Uncharacterized component of anaerobic dehydrogenases -------------------------------|---|-|-------|--||---------------- 2 [S] COG3397 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------||||-||-----|---|--|--- 2 [S] COG3515 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|-|--------------|---|------||--|-- 2 [G] COG3525 N-acetyl-beta-hexosaminidase ------|||---------------|---------------------|-|--|-------------- 2 [C] COG3630 Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, gamma subunit -------------|----|-----------------------------|----------------- 2 [I] COG3675 Predicted lipase ---------------------------||--------|----|||||-|-----------|-|--- 2 [K] COG3710 DNA-binding winged-HTH domains ---------------------------||-------------|||||-|------|-----|||-- 2 [S] COG3714 Predicted membrane protein |||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||--- 2 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components ------------------------------------------------||---------|------ 2 [S] COG3915 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----------------|-------------------------|--||-----|---|--|--- 2 [S] COG4104 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||||-||||-------||-|--- 2 [E] COG4160 ABC-type arginine/histidine transport system, permease component --------------------|---------------------|||||-||-----|---||||--- 2 [R] COG4172 ABC-type uncharacterized transport system, duplicated ATPase component ------------------------------------------------||-----|---||-|--- 2 [T] COG4191 Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system ------------------------------------------|||||-||||-------||-|--- 2 [E] COG4215 ABC-type arginine transport system, permease component ---------------------------||--------------||-|-|-|-|--|----|----- 2 [S] COG4453 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------|------|----------------------------||---------||-|--- 2 [P] COG4454 Uncharacterized copper-binding protein ---------------------|-------------|||----|||||-|----------------- 2 [R] COG4533 ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component --------------------------|-----|---||----|||-|-|----------------- 2 [KT] COG4565 Response regulator of citrate/malate metabolism --|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||--- 2 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component ---------------------|-----------------------|--|----------------- 2 [S] COG4628 Uncharacterized conserved protein ------------------||----------------------------|----------||||--- 2 [Q] COG4663 TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system, periplasmic component ---|----|---|--------|---------------|----------||-|--------||---- 2 [R] COG4666 TRAP-type uncharacterized transport system, fused permease components ---------------------|--------||-|||||--|-||||||||||---|---------- 2 [G] COG4668 Mannitol/fructose-specific phosphotransferase system, IIA domain --|----------||----|----------------------------|----------------- 2 [O] COG4935 Regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertases and other proteases |||---|-|-------||--|---|-------|-------------|-||-|------|------- 2 [C] COG5016 Pyruvate/oxaloacetate carboxyltransferase --------------------------------------------|-|-|-|--------------- 2 [S] COG5566 Uncharacterized conserved protein ||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||-- 1 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit ||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||------------- 1 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase |||||||||||||||---||----------------------|||||-||||-------------- 1 [J] COG0023 Translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1) and related proteins ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase ---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase) -|----||---|------||------|||-------|-----|||||-||-|-------------- 1 [F] COG0027 Formate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase (GAR transformylase) ---|--||---|----|-|||------||||----|||----|||||-||--||||---||-||-- 1 [H] COG0029 Aspartate oxidase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation) -------------||---|--|----|||-------------|||||-|----------|||||-- 1 [G] COG0033 Phosphoglucomutase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase |--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase -|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase -|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||-- 1 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC ||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--|||||||| 1 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||-- 1 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 1 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0048 Ribosomal protein S12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0049 Ribosomal protein S7 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0051 Ribosomal protein S10 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2 ||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--|||||||| 1 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit -||---||--||-|--|-||||||--|||-||||--||----|||||-||||-------||-|--- 1 [G] COG0058 Glucan phosphorylase |||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [G] COG0061 Predicted sugar kinase |||||||||||||||-||||-|----|||||-----------|||||-||--|--|||||||||-- 1 [S] COG0062 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||-- 1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase ||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit |||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit |||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---||||||| 1 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit ||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0077 Prephenate dehydratase |||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase |||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1 ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0082 Chorismate synthase -|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||------- 1 [E] COG0083 Homoserine kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5 ---|||||---||||-||||--||--|----|||||||-||||||||-||---------------- 1 [H] COG0095 Lipoate-protein ligase A |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11 |||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9 ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase |||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase --||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0114 Fumarase -|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||---------- 1 [L] COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase -------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase |||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases ||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||-- 1 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase |-||--|||---||||--|--|-----||-|-----||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 1 [L] COG0122 3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase ||||--|||||||||||-||-|------------|-||----------||---|||---|||||-- 1 [BQ] COG0123 Deacetylases, including yeast histone deacetylase and acetoin utilization protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0125 Thymidylate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--|||||||| 1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase -|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 1 [H] COG0132 Dethiobiotin synthetase ||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase ||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase --||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful) ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase ||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0148 Enolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase ------|---|--||--|--|---|-|||-||-|--||----|||||-|-||-------------- 1 [G] COG0153 Galactokinase --------|-||-||-|-||-|----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 1 [P] COG0155 Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein) ||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||-- 1 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase ---|---------||---||----------------------|||||-||||-||||||-||-|-- 1 [G] COG0158 Fructose-1,6-bisphosphatase ||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain -|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 1 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0164 Ribonuclease HII ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase -|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0171 NAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [E] COG0174 Glutamine synthetase -|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [G] COG0176 Transaldolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-||||||||||||||| 1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17 --||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||| 1 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase -------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||-- 1 [G] COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase -------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase -------------|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0194 Guanylate kinase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0195 Transcription elongation factor -------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0196 FAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0203 Ribosomal protein L17 -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|--- 1 [G] COG0205 6-phosphofructokinase ||||||||||------||||||--||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0206 Cell division GTPase |||-----||---|||----||----||||||||||||-|||||||||||||||||---|||||-- 1 [F] COG0207 Thymidylate synthase ---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-||| 1 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit |-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0211 Ribosomal protein L27 |--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase -||---|||--------|---|-----||-||-||||||||||||-|-|------|---||-|--- 1 [F] COG0213 Thymidine phosphorylase --|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0216 Protein chain release factor A -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein -|||--||||---|--||--|---------|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0218 Predicted GTPase -------------||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase |-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit -------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0227 Ribosomal protein L28 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0228 Ribosomal protein S16 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0230 Ribosomal protein L34 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0233 Ribosome recycling factor ||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--|||||| 1 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0238 Ribosomal protein S18 -|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation |-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10 ----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase -------------|---|--------|---||-||-||-||-||||||||-|---|---|||||-- 1 [G] COG0246 Mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenases --||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family) |||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|---- 1 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D ||------||------|||||-||--|||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18 -------------||---||-|-----|||------------|||||-|||-||||---|||||-- 1 [H] COG0259 Pyridoxamine-phosphate oxidase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0261 Ribosomal protein L21 --|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-| 1 [H] COG0262 Dihydrofolate reductase --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts ------------------||-|----||||-||||||||||||||||-||||||||---|||||-| 1 [L] COG0266 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0267 Ribosomal protein L33 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0268 Ribosomal protein S20 |||---|||||||-----------------|-|||-|--||-|||-|-|-||-------------- 1 [G] COG0269 3-hexulose-6-phosphate synthase and related proteins ||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||-- 1 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase ---|---------||---||----------------------||||||||||||||---||||||| 1 [T] COG0271 Stress-induced morphogen (activity unknown) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II) |--|||----|-|---||||-|--|-|||||||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 1 [F] COG0274 Deoxyribose-phosphate aldolase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis ----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase) ---|---------|||--||----------------------||||||||||||||---||||||| 1 [O] COG0278 Glutaredoxin-related protein --||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-||||||||| 1 [C] COG0280 Phosphotransacetylase ---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---||||||| 1 [F] COG0283 Cytidylate kinase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase ---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase ||||---||----------|-------||--|||||--|||-|||-|-|||||||||||-||-|-| 1 [V] COG0286 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit ||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase |--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG0288 Carbonic anhydrase |||-----||------||||--||--|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3) -------------|--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0291 Ribosomal protein L35 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0292 Ribosomal protein L20 ||||||--||---|||--------||----------------||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG0293 23S rRNA methylase |||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes ---|------|-|||--|---|---|-||||||||||||||||||||-|-||-------||-||-- 1 [F] COG0295 Cytidine deaminase --|--------|-|--|-||||||--|||----|--|-----|||||-||||---|---||-|--- 1 [G] COG0296 1,4-alpha-glucan branching enzyme -|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|--- 1 [G] COG0297 Glycogen synthase --||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN |||||||||||||----|------|-----|||||||||||||||||-||||-------------- 1 [H] COG0301 Thiamine biosynthesis ATP pyrophosphatase ----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--||||||||||| 1 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0305 Replicative DNA helicase ||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|--- 1 [P] COG0306 Phosphate/sulphate permeases ---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain --|-||----||-|||--||-|----||||-|||--------|||||-||||||||---|||||-- 1 [E] COG0308 Aminopeptidase N ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0313 Predicted methyltransferases |||||||||-|||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0314 Molybdopterin converting factor, large subunit |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0315 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase ---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 1 [H] COG0320 Lipoate synthase ----------|--||---||-|----||||------------||||||||||||||---||||||| 1 [H] COG0321 Lipoate-protein ligase B |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex --||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase) -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase --|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold -------------|||--|||---|||||||----|||----|||||||||||--||||-|-|-|| 1 [O] COG0326 Molecular chaperone, HSP90 family ||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||------- 1 [S] COG0327 Uncharacterized conserved protein -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0333 Ribosomal protein L32 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0335 Ribosomal protein L19 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase ----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase -|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------| 1 [L] COG0338 Site-specific DNA methylase -------------||---||-|----|---------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [E] COG0339 Zn-dependent oligopeptidases ||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF |||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase ----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||-- 1 [S] COG0344 Predicted membrane protein |-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase -||-||--||-|------||----------|-----------|||-|-||||-|||||||||||-- 1 [C] COG0348 Polyferredoxin -------------|----||------|||||-----------|||||-|||||------||||||| 1 [J] COG0349 Ribonuclease D ||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-| 1 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase |||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase --|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase ----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) -------------||-|-||-|----||||------------||||||||||||||---||||||| 1 [R] COG0354 Predicted aminomethyltransferase related to GcvT --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit) --|----------|--|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type) --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0359 Ribosomal protein L9 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0360 Ribosomal protein S6 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1) -------------|||-|||--||||||||-|-||||-----|||||||-||-||----||||--- 1 [G] COG0362 6-phosphogluconate dehydrogenase -------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase |||||||||||-||||----------||||||---|||----|||||-||--|-------|-|--- 1 [E] COG0367 Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing) |||||||||||||-----||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||--- 1 [H] COG0368 Cobalamin-5-phosphate synthase -------------|||--||--||----------|-||----||||||||--|||----|-|-|-- 1 [P] COG0369 Sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein) |||---|||||-----||||-|--------||--||------|||||-||--|--||||----|-- 1 [P] COG0370 Fe2+ transport system protein B ||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||------- 1 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase --||----|----|----|--------||--------|----|||||-|---|--|---||-||-- 1 [P] COG0376 Catalase (peroxidase I) ||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||-- 1 [H] COG0379 Quinolinate synthase ||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----|| 1 [M] COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase |||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases --||---------||---||||----|||-|----|||----|||-|-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG0384 Predicted epimerase, PhzC/PhzF homolog |-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||-- 1 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase --||-------|-||---|||-----|||-|||||||||||||||||-||-|-|||---|||||-- 1 [L] COG0389 Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair ||||----||---|--||||-|----||||||||||||----|||||-|--|-------------- 1 [S] COG0391 Uncharacterized conserved protein |||||||||--|-----|||-------|||-|---|-|----|||-|-|--|-----------|-- 1 [S] COG0393 Uncharacterized conserved protein ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||-||||||||-||-||--|---||||--- 1 [G] COG0395 ABC-type sugar transport system, permease component -------------||---||------|----------|----|||-|-||--|--|---||--|-- 1 [S] COG0397 Uncharacterized conserved protein --||---------||---||------|||-||||||||----|||---|-----------|--|-- 1 [S] COG0398 Uncharacterized conserved protein ||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||-- 1 [M] COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis --|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||-- 1 [G] COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase --|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase -------------||---||----------------------|||||-||--|--|---||||||| 1 [H] COG0408 Coproporphyrinogen III oxidase ---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase -------------||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0414 Panthothenate synthetase ----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||-- 1 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme ||||||||||||||||---|----------------------|||||-||---------------- 1 [L] COG0417 DNA polymerase elongation subunit (family B) -------------||---|-----------------------||||||||---||||||||----- 1 [F] COG0418 Dihydroorotase ||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||---------------- 1 [L] COG0419 ATPase involved in DNA repair ||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|----- 1 [L] COG0420 DNA repair exonuclease ||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||-- 1 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC -------------|-|--||----------------------|||||-||---|||---------- 1 [R] COG0429 Predicted hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold ---|---------||---||-|----|||--|||||||--|||||||-||-|-|||---||-||-- 1 [R] COG0431 Predicted flavoprotein |||---|||||||-|-||||-|-----||-|-----||----|||-|-||---------||----- 1 [S] COG0432 Uncharacterized conserved protein ---|---------||---||------|---------------|||-|-||---------||||--- 1 [O] COG0435 Predicted glutathione S-transferase |||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase --||---||-|||---|-------------------------|||||-||||---|--|-|-|--- 1 [C] COG0437 Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1 |||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0439 Biotin carboxylase |||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||-- 1 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division ---|----|---------||------||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 1 [H] COG0447 Dihydroxynaphthoic acid synthase ||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains |||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--||||||||||| 1 [O] COG0450 Peroxiredoxin |||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase ||-|--||||------||-|----||-||||-----||----------||-----||||------- 1 [D] COG0455 ATPases involved in chromosome partitioning ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ) |||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| 1 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase ||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases --|----------||-||--||||||----|-----|||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase |||||||||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication ||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-|| 1 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase |||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--|||||||| 1 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase |||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-|||||||||||||| 1 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA -------------||-||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain ||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--|||||||| 1 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0486 Predicted GTPase ||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0492 Thioredoxin reductase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase ||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||-- 1 [R] COG0496 Predicted acid phosphatase ----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0498 Threonine synthase |||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 1 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase) ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit -|-----------||----|-|||-|-||-||||||||-|--|||||||||||||---|||||--- 1 [L] COG0507 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member ---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||-- 1 [E] COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding) -------------||-----|---|------|||||||-||||||||-|-|-----------|--- 1 [M] COG0510 Predicted choline kinase involved in LPS biosynthesis --|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||-- 1 [L] COG0514 Superfamily II DNA helicase ---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|--- 1 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit |||||||||||||---|--|-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0521 Molybdopterin biosynthesis enzymes |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins --|----------||-|-||||----|||-----|-||----|||||-||--||||||-|||||-- 1 [R] COG0523 Putative GTPases (G3E family) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0528 Uridylate kinase -------||---|||-|-|--|-----||-|-----||----||||||||--|--|--|-||||-- 1 [P] COG0529 Adenylylsulfate kinase and related kinases ||||||||||||-||-|||-----||-----------|----|||||-|--|--------|----- 1 [P] COG0530 Ca2+/Na+ antiporter |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0536 Predicted GTPase -------------||-||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0539 Ribosomal protein S1 |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase |||-||||||-|-||-||--|---|-|||-||-|-|||----|||||-||---|||---|----|| 1 [HC] COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor) |-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 1 [R] COG0546 Predicted phosphatases ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase ---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||-- 1 [C] COG0554 Glycerol kinase ||||||||||||------||-|-----||-|------|----|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG0555 ABC-type sulfate transport system, permease component |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex ---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [K] COG0557 Exoribonuclease R --||--|||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases ||||||--||-||-----||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-| 1 [J] COG0565 rRNA methylase -------------||------|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 1 [C] COG0567 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, and related enzymes ||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||---- 1 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease ---|---------||--|||-|-|||----|||||||||-|||||||-|-||-------------- 1 [F] COG0572 Uridine kinase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||-- 1 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component |||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--|||||||||||||| 1 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein) ----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||-- 1 [R] COG0579 Predicted dehydrogenase |||||||||||||||||----|--------------------|||||-||||----|||------- 1 [S] COG0585 Uncharacterized conserved protein ----||-----|------||-|--||||||||--||||----|||||||||||||||||--|||-- 1 [S] COG0586 Uncharacterized membrane-associated protein ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit --|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---||||||| 1 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog) ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation -----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0594 RNase P protein component ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase -||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-| 1 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters |||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase |--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-| 1 [O] COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity ||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease ||||---||----------|-----------||-||--|||-------||||||--|||-||-|-| 1 [V] COG0610 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases |||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|-- 1 [H] COG0611 Thiamine monophosphate kinase ||||----|--||---||||-|--------|------|----|||||-||||-|||---------- 1 [R] COG0613 Predicted metal-dependent phosphoesterases (PHP family) -|||--|||||-|---||||||--|||||-||||||||||||------|----------------- 1 [R] COG0618 Exopolyphosphatase-related proteins |||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||-- 1 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent) ||||--|||||||||--|--|---|----|||||||||-||||||||-||---------------- 1 [R] COG0622 Predicted phosphoesterase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit ----------------||--||----||||||-|||||||||||||||||||||||---|||||-- 1 [F] COG0634 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase ||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K -|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||-- 1 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases -----------------|||||----|||||---||||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG0646 Methionine synthase I (cobalamin-dependent), methyltransferase domain ||||||||--||||||||----||---||||---|||||||||||||||----------------- 1 [L] COG0648 Endonuclease IV ||||-||||-|||----|||-|----|||-----||||----|||-|-||---------|||--|| 1 [CP] COG0651 Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit |||-----||-|-||-|---||-----||||--|||||----||-||-||--|--|---|||-|-| 1 [R] COG0655 Multimeric flavodoxin WrbA --|--|--|--|-||--|||-|--|-|||||||-||-|----|||||-||--|--|---||-||-- 1 [I] COG0657 Esterase/lipase ----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-| 1 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein |-||||-----|-||---||-------||||------|----|||||-||-|||||---||||||| 1 [R] COG0661 Predicted unusual protein kinase |||---||||------|||||------||-------||----|||||-||--||||||-|||||-- 1 [G] COG0662 Mannose-6-phosphate isomerase |||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--|||||||| 1 [R] COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily ----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-|||| 1 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat ---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||-- 1 [C] COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases) ----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase -------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-||||||||||||| 1 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 1 [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit -------------|------------|---------------|||||-|||||------------- 1 [G] COG0676 Uncharacterized enzymes related to aldose 1-epimerase ||----||--|------|------------|---|-------|||||-||-||--|---||-|--- 1 [M] COG0677 UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0681 Signal peptidase I ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase --|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase ------------------||-|-----|||-|--||||----------|-------||--|-||-- 1 [E] COG0686 Alanine dehydrogenase ||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-|| 1 [I] COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase |---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---||||||| 1 [J] COG0689 RNase PH ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0691 tmRNA-binding protein -------------|||----||||-|||||-||||||||||||||||||||||||||||||----- 1 [L] COG0692 Uracil DNA glycosylase ---|----|----||---||--||----------||||----|||||||||||---|||||||||| 1 [O] COG0694 Thioredoxin-like proteins and domains --||-----------|--||----------|---|||||||||||||-||------||||------ 1 [G] COG0696 Phosphoglyceromutase ------------------|-----------|-----||----|||-|-||-----|---------- 1 [S] COG0700 Uncharacterized membrane protein ---|---------||-|-||-|----|----|--||||----|||||-|||-|--|---|||||-- 1 [MG] COG0702 Predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerases --|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0703 Shikimate kinase |||||||||||||---||||-|---|||||||||||-||-|||||||-||--|--|---|||||-- 1 [P] COG0704 Phosphate uptake regulator -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC --|------|-|----||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase |-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0708 Exonuclease III --|-------------|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b -------------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein) -||-----||---||--|||||||--|---|--||-||----||||--||||---|---|||||-- 1 [P] COG0715 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components -----------------|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase --||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--|||||||||||||| 1 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein -------------|||--||----|-----------------------|-------||-------- 1 [R] COG0724 RNA-binding proteins (RRM domain) |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [P] COG0725 ABC-type molybdate transport system, periplasmic component -|||--|||-||------||-|---------||---------|||||-||--|--||||-|-|--- 1 [R] COG0727 Predicted Fe-S-cluster oxidoreductase ----------------|||||||||||||||-----------|||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor ||||-|-||----------|-------||--|||||--|||||||-|-|||||---|||-||-|-| 1 [V] COG0732 Restriction endonuclease S subunits -------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||| 1 [I] COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases -----------------|||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase ----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|-- 1 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase |||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||-- 1 [H] COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A ------------------||----------------------------||||----|||||-|--- 1 [P] COG0748 Putative heme iron utilization protein -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains |||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1 ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit -------------||------|----|-------||||----|||||-||||-||||||||||--- 1 [P] COG0753 Catalase --|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component -----------------|||||----|||||-----||-------|-||||||--|||||||||-- 1 [E] COG0757 3-dehydroquinate dehydratase II ----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-| 1 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake ----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||- 1 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein -----------------||||-||||||||||||||||----|||||-||||---||||||-||-- 1 [S] COG0762 Predicted integral membrane protein ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0763 Lipid A disaccharide synthetase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [Q] COG0767 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase |||------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase --|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||-- 1 [F] COG0775 Nucleoside phosphorylase ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit ----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------|-|---||||-------------||-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0781 Transcription termination factor ---|--------------||||--|||----|||||||-|--|||||-|||||--|||||-|-||| 1 [P] COG0783 DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant) ------------------|-|-----|-------|-------|||||-|||--||-||-------- 1 [E] COG0786 Na+/glutamate symporter ---|------------|-||-|----|||-------||----|||-|-|||||--|||||||-|-- 1 [F] COG0788 Formyltetrahydrofolate hydrolase ------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [M] COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins) ----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||-- 1 [L] COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase |||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation ----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [M] COG0796 Glutamate racemase ----------------|-||----||----|-----------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0797 Lipoproteins ----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein -----------------|||----|-----||||--||----|||||-||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0800 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase --||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC ----------------||||||--||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing ----------------||||||---|----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase ----------------||||-|||||||||------------|||||-||||-||||||||||||| 1 [M] COG0815 Apolipoprotein N-acyltransferase ----------------||||||||--|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis) -----------------||||||||-||||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit -----------------|||-|--------||||||||----|||||-|||||||||||||||--- 1 [M] COG0818 Diacylglycerol kinase ----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||-- 1 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis --||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||| 1 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation --|-----|---------||--||------------------|||||-|||||--||||||||||| 1 [U] COG0823 Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit ----------------|-||--||||----|||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0828 Ribosomal protein S21 --||--|||-------||||-|--------|-----------|||||-||--|---||-|||||-| 1 [M] COG0836 Mannose-1-phosphate guanylyltransferase ------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|-- 1 [K] COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family ---------|------||--||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division ----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||--- 1 [D] COG0850 Septum formation inhibitor ------------------||||--------------------||||||||--||||||-||||--- 1 [D] COG0851 Septum formation topological specificity factor ----------------|-||----------------------|||||-||--||||||||||||-- 1 [H] COG0854 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein --|---------------||-|-----||||------|----|||||-||--||||||||||||-- 1 [P] COG0855 Polyphosphate kinase ---|----|---------||-|-----||-------------||||||||||-||-|||------- 1 [R] COG0857 BioD-like N-terminal domain of phosphotransacetylase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A ----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase ------------------||-|----|||-|---||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [P] COG0861 Membrane protein TerC, possibly involved in tellurium resistance -|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||-- 1 [L] COG0863 DNA modification methylase -|||---||--|----|-||------|||---|---||----|||||-||-||--|--|||||||| 1 [M] COG1004 Predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase ||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--|| 1 [P] COG1006 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 1 [C] COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit |||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||-- 1 [C] COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit -----------------|---|--------||||||||-|--|||||||-------||-||-|--- 1 [G] COG1015 Phosphopentomutase -------------||-|----|----|-------|-||----|||||-||--|--|--|-|----- 1 [C] COG1017 Hemoglobin-like flavoprotein ---------------------------||-------|-----|||||-||-----------|---- 1 [Q] COG1021 Peptide arylation enzymes -------------|||------||------------------|||||-||---------------- 1 [O] COG1025 Secreted/periplasmic Zn-dependent peptidases, insulinase-like ----||-----------|-|------|---|-----||----|||||-||||-||-||||-|---- 1 [E] COG1027 Aspartate ammonia-lyase |||-|||||||||----|||||-----||-||-----|----|||-|-||------------|--- 1 [C] COG1032 Fe-S oxidoreductase ----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases -|||||||||||-------|----------------------|||||-||---||-----|-|--- 1 [C] COG1042 Acyl-CoA synthetase (NDP forming) ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase --||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---||||||| 1 [C] COG1048 Aconitase A ------------------||----------------------|||||-||-|||||||||------ 1 [C] COG1049 Aconitase B |||---|||||||---|-||-|----||||||-|-|||-------|--||-----|---|||||-| 1 [F] COG1051 ADP-ribose pyrophosphatase ------------------||-|||--|----||||||-----||||||||--|--|---||||||| 1 [R] COG1054 Predicted sulfurtransferase ----|||||-|||----||||-||---|||----||||----||||--||---|||--||--|--- 1 [P] COG1055 Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases -------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase ---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||-- 1 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA ||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||------- 1 [HR] COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes --|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||-- 1 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases ----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease -----|-------||-----------||||-|||-|||----|||||-|-||-------||||--- 1 [H] COG1072 Panthothenate kinase --------------------|-||||-||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains) |---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----||| 1 [D] COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis --------------------||||-||---||||||||-|||||||||||||||||------||-- 1 [G] COG1080 Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria) --|---|-|-|--||--|--------||--||----------|||||-|-||-------------- 1 [C] COG1085 Galactose-1-phosphate uridylyltransferase -|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-|||||| 1 [MG] COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases |------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||-- 1 [M] COG1087 UDP-glucose 4-epimerase |-|-----|-------|-||-------||-|-----------|||-|-||--|---||-|-|||-- 1 [M] COG1089 GDP-D-mannose dehydratase --------------------|-----|-----||--------------||-----|---||||-|| 1 [R] COG1101 ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component --|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-||||||||||||| 1 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes -----------------|--||---||||-||||||||--|||||||-||||---|---------- 1 [G] COG1105 Fructose-1-phosphate kinase and related fructose-6-phosphate kinase (PfkB) |-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 1 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components --------------------|-|||-|---|-|||-|-----|||||-||||-------------- 1 [E] COG1114 Branched-chain amino acid permeases ------------------||-------||--------|----|||||-||--||||||||||||-- 1 [P] COG1118 ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component |-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 1 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component ||||--|||||||----|||||--|-||||||||||||||||-||-|-|-|----|---|||---- 1 [P] COG1122 ABC-type cobalt transport system, ATPase component ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [Q] COG1127 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component |-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 1 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 1 [GM] COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component ------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component ----------------||||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component --|-----|-|-|--------|--------------------|||||-|||||------||||||| 1 [O] COG1138 Cytochrome c biogenesis factor ||||||-|||||-----|||-|----|||||-----------|||-|-||--|--||||||||||| 1 [C] COG1146 Ferredoxin ----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||-- 1 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1157 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase ----------------||--|||||||||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG1158 Transcription termination factor ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1159 GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1160 Predicted GTPases -||---||-|||||||-||||----|----||||||||||||------|----||----------- 1 [R] COG1161 Predicted GTPases --|-------------|||||----||||||||||||||||||||||-||||||||------|--- 1 [R] COG1162 Predicted GTPases --||-------------|--||||||-----|||||||||||------|-------||||||||-- 1 [E] COG1164 Oligoendopeptidase F ---|--------------||------||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 1 [H] COG1165 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase ------------------||-|--------------------|||||-||-||||-|||------- 1 [E] COG1166 Arginine decarboxylase (spermidine biosynthesis) ----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||-- 1 [KE] COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs ---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [E] COG1171 Threonine dehydratase -----------------|--|-----|--|-|----||----|||||-||||---|---|||||-- 1 [G] COG1172 Ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport systems, permease components ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 1 [E] COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II -------------||-----|---------|---|-||----|||||-|||||||||||------- 1 [H] COG1179 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 1 |||-|||||||||---||--|------||-||||||------|||||-||||---|---------- 1 [O] COG1180 Pyruvate-formate lyase-activating enzyme --|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase) -------------||-|||||||||||||||||-||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1186 Protein chain release factor B -----------------|--|-----|---||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 1 [J] COG1188 Ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit (S4 paralog) --|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||----- 1 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II) ----------------||||--|||--||-|---||||----|||||-||-----||||------- 1 [K] COG1191 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit |--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase ----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------||||||| 1 [L] COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway) -----------------|||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase ----------------||||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [LK] COG1200 RecG-like helicase ----------------||||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains) |||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||-- 1 [M] COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase ------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1212 CMP-2-keto-3-deoxyoctulosonic acid synthetase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone ------------------||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [T] COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response -------------||-|-||--||--||||------------|||||||||||-----|||||||| 1 [P] COG1218 3'-Phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit ----------------||-------|--------||||----|||||||||||--||||||||||| 1 [O] COG1220 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), ATPase subunit --||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [O] COG1225 Peroxiredoxin -|------|----|||-|--||--------|||||||-----------|----------------- 1 [C] COG1227 Inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase |--||||-|--|-|---|--||-----||-|-|-|-||-------||-||-----|---|||||-- 1 [Q] COG1228 Imidazolonepropionase and related amidohydrolases -||||||-|-||||||--||-|--------------------------||-----|---||-||-- 1 [J] COG1236 Predicted exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing -||------|------|-------------------------|||||-||||||||--|||||||| 1 [S] COG1238 Predicted membrane protein -|-------|------||--|---------|||-||||----|||||-|----------------- 1 [R] COG1242 Predicted Fe-S oxidoreductase --||------------|----|-----|||------||----||||||||-|-|||---------- 1 [E] COG1246 N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferases --|-------|-|-----||-|----|---||-|||||----|||-|-||-----|---|||||-- 1 [M] COG1247 Sortase and related acyltransferases ---|-------|-||---||-|----||||-|--||||----|||||-|||----|---||||--- 1 [C] COG1252 NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit -||-|||||-|||----|-|-|---|--|-||||||||----|||||-||-|---|----|-|--- 1 [C] COG1254 Acylphosphatases ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1256 Flagellar hook-associated protein ||||||||||||||||---------|-----|||||------------|----------------- 1 [I] COG1257 Hydroxymethylglutaryl-CoA reductase ----------------||------------------------||||||||-----|||||||||-- 1 [NO] COG1261 Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein --|-----------|---||--||---||-------||----------||-|||||---|||||-- 1 [S] COG1262 Uncharacterized conserved protein |-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||-- 1 [R] COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease |||---||-||-|---|---|-----------|--|||----|||||-||||-||||||-----|| 1 [I] COG1267 Phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins |||||||||||||-----||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---||||--- 1 [H] COG1270 Cobalamin biosynthesis protein CobD/CbiB -------------|||----||--|||||-||||||||----|||||-||--|||----|||||-- 1 [R] COG1272 Predicted membrane protein, hemolysin III homolog --------------------|-----|||-|---|-||----|||||-||-|---|||-|-|---| 1 [R] COG1279 Lysine efflux permease ----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family ------------------||-------|||------------|||||-||||-|||---||||||| 1 [C] COG1282 NAD/NADP transhydrogenase beta subunit --------------------|---|-|-----||||||-|--|||-|-||--------|||||--- 1 [P] COG1283 Na+/phosphate symporter ---------|-------|--|-||-|----||||||||||||------|----------|||---- 1 [S] COG1284 Uncharacterized conserved protein ------------------------||-----|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG1286 Uncharacterized membrane protein, required for colicin V production ------------------|--|------------|||-----|||||-||||||||--|||||--- 1 [S] COG1289 Predicted membrane protein ---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--|||||||||||||| 1 [C] COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||-- 1 [N] COG1291 Flagellar motor component ---|--------------------|-|||-----||||----|||||-||||-||-----|----- 1 [M] COG1292 Choline-glycine betaine transporter --|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG1295 Predicted membrane protein --|-----|-----------||----|----|-|||||----|||||-||||-|||||-||||--- 1 [E] COG1296 Predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance) ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1298 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhA |||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----||||||| 1 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases ----------------|-|||||||||||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG -----------------|------||----|------|----------|----------------- 1 [L] COG1315 Predicted polymerase, most proteins contain PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain -----------------|----||||----|-----||----||||||||-----||||---|--- 1 [NU] COG1317 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein ||||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|| 1 [P] COG1320 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhG subunit ----------------------||-------|||-----|--|||||-||||||||---||||||| 1 [S] COG1322 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [K] COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains |||---||-|-------|--|---------||||||------|||||-||||---|---------- 1 [F] COG1328 Oxygen-sensitive ribonucleoside-triphosphate reductase ----------------------||-|-||-------------|||||||||||||----------- 1 [L] COG1330 Exonuclease V gamma subunit ----------------||------------|-----||----------||------|||------- 1 [N] COG1334 Uncharacterized flagellar protein FlaG --|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||-- 1 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1338 Flagellar biosynthesis pathway, component FliP |||---|||---------------------|-----------------|----------------- 1 [R] COG1342 Predicted DNA-binding proteins ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----||||------- 1 [N] COG1345 Flagellar capping protein ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 1 [C] COG1347 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrD --||--------------|-||----|||-||-|-||-----|||||-||-|-|||---||-||-- 1 [S] COG1359 Uncharacterized conserved protein -----------------|------------|||-|||-----|||-|-||||-||-|||||-|--- 1 [M] COG1368 Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily -----------------|||------|||||-----||----|||-|-||---|||---||||--- 1 [S] COG1376 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1377 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhB ------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---||||||| 1 [L] COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) ----------------||||||--||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria |||-||||||---||-||--||-----||-||--||||----|||||-|-----------|----- 1 [ER] COG1387 Histidinol phosphatase and related hydrolases of the PHP family ----------------|----|||-||||-||--||||-------|--||||-------------- 1 [M] COG1388 FOG: LysM repeat ----------------|---------||||------------|||||-||||-|||---|||||-- 1 [OT] COG1391 Glutamine synthetase adenylyltransferase |||---|||--|-----|---|||------|---|||-----------||||---|---||-|--- 1 [P] COG1392 Phosphate transport regulator (distant homolog of PhoU) ----------------||||-|----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [R] COG1399 Predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein ---|--------------||-|-----||||||-|||-----|||---|---|--|---|||||-- 1 [V] COG1403 Restriction endonuclease --||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|--- 1 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases -----------------|------||----|------|----------|----------------- 1 [N] COG1406 Predicted inhibitor of MCP methylation, homolog of CheC |-|---|||||-|||-|-||--||--||||||--|||-----|||||-||||---|---|||||-- 1 [R] COG1409 Predicted phosphohydrolases -----------------|||-|----|||||------|----|||||-|||-|--|---|||||-- 1 [E] COG1410 Methionine synthase I, cobalamin-binding domain ---|------------||---|----|||-------||----|||||-||||---|--||||||-- 1 [K] COG1414 Transcriptional regulator ----------------||------||----|----|||----------||-----||||------- 1 [N] COG1419 Flagellar GTP-binding protein -----------------|-|--||||-----|||||||----|||||-|||||--|--------|| 1 [S] COG1426 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||--||||------|-||-|--|-|---------------------||----|-||||||||-- 1 [S] COG1432 Uncharacterized conserved protein |||-|||||||------|------------|-----------------|----------------- 1 [S] COG1433 Uncharacterized conserved protein ---||-----|----|-|---|---|----|||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 1 [F] COG1435 Thymidine kinase -----------------|---|-|--||||||||||||----|||||-|-||-------------- 1 [K] COG1438 Arginine repressor -------------------------|----||||-|||----|||||-|----------------- 1 [G] COG1440 Phosphotransferase system cellobiose-specific component IIB ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [H] COG1441 O-succinylbenzoate synthase ---|--||||||||||--------------------------|||||-|-||-------------- 1 [R] COG1444 Predicted P-loop ATPase fused to an acetyltransferase ---|||||--||--|---||----------------------|||-|-|------|---|---|-- 1 [E] COG1446 Asparaginase -------------------------|----||||||||----|||||-|----------------- 1 [G] COG1447 Phosphotransferase system cellobiose-specific component IIA ----------------|---|-||------------------|||||-||--|--|--|---||-- 1 [NU] COG1450 Type II secretory pathway, component PulD ||||--|||-------|---||----|---|-------||--|||||-||--||||||||||||-| 1 [R] COG1451 Predicted metal-dependent hydrolase ----------------|-------||----------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1452 Organic solvent tolerance protein OstA ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [Q] COG1463 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, periplasmic component --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit -----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---||||||| 1 [G] COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases --|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||-- 1 [H] COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis -------------||------|-----||-------------|||||-||--||||---||||||| 1 [R] COG1485 Predicted ATPase -----------------|------------|----|||----|||||-|----------||-|--- 1 [G] COG1486 Alpha-galactosidases/6-phospho-beta-glucosidases, family 4 of glycosyl hydrolases --|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||--- 1 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase |---||--|-|||---||||----------|------|----|||||-||||-------|||-|-- 1 [R] COG1489 DNA-binding protein, stimulates sugar fermentation -------------||-||--||----|||-||||||||----|||||-||||-|||---------- 1 [J] COG1490 D-Tyr-tRNAtyr deacylase ||||||--||-|------||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---|||||-- 1 [H] COG1492 Cobyric acid synthase --|---------------||||----|||||-----||----|||-|-|-||---------|||-- 1 [G] COG1494 Fructose-1,6-bisphosphatase/sedoheptulose 1,7-bisphosphatase and related proteins ---------------------|||------------||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG1495 Disulfide bond formation protein DsbB ----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein ----------------|-----||||----|----|||----|||||-||--||||||||||||-- 1 [K] COG1508 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma54 homolog -||-------------||--||--|-----------||----|||||-|-|||------||-||-- 1 [E] COG1509 Lysine 2,3-aminomutase ----------------||------||----|----|||----|||||-||-----||||------- 1 [NUO] COG1516 Flagellin-specific chaperone FliS ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1519 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase ||||--|||--------|---|---|-|||------|-----|||||-||--|--|-------||| 1 [S] COG1520 FOG: WD40-like repeat --|--------|-----||-||||--|||-|-||--||-|--|||||-||||---|---||-|--- 1 [G] COG1523 Type II secretory pathway, pullulanase PulA and related glycosidases |||-||--|-||--------------|||-----||||----|||||-||||---|--||||||-- 1 [C] COG1526 Uncharacterized protein required for formate dehydrogenase activity |-|-----|------|-|--------|||-|---|--||---|||||-|-||----|||------- 1 [P] COG1528 Ferritin-like protein ||||--||||-||-------|---------||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [J] COG1534 Predicted RNA-binding protein containing KH domain, possibly ribosomal protein -----------------|------------------|-----|||-|-||-----------|---- 1 [Q] COG1535 Isochorismate hydrolase ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1536 Flagellar motor switch protein -------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase ------||------------||----|--|----|-||----|||||-|||--|||--||------ 1 [R] COG1540 Uncharacterized proteins, homologs of lactam utilization protein B |-|-----|--|-------|||---------------|----|--|--|---|--|---------- 1 [H] COG1541 Coenzyme F390 synthetase ---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||-- 1 [R] COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced) -----------------|------||----|-----||----|||||||||||---|||------- 1 [T] COG1551 Carbon storage regulator (could also regulate swarming and quorum sensing) |||------|-------|------------------------||||||||||-------------- 1 [P] COG1553 Uncharacterized conserved protein involved in intracellular sulfur reduction --|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|------- 1 [L] COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1558 Flagellar basal body rod protein ----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein ----------------||--|----|----|----|||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [S] COG1561 Uncharacterized stress-induced protein -----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit --|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--||||||||||||| 1 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase ---|-------------||||-----||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 1 [H] COG1575 1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase -----------------|--||--------||||||||||--|||||-||||||||||||||||-- 1 [S] COG1576 Uncharacterized conserved protein |-|-||-----|-||---------------------------|||||-|--|-------------- 1 [S] COG1584 Predicted membrane protein ||-|--||-||||----|||||----|||||-----------|||||-||-||------|||||-- 1 [OU] COG1585 Membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity ||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||--- 1 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase ------------------||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 1 [M] COG1589 Cell division septal protein ----------------||||----------------------|||-|-||-|||||--||||||-- 1 [M] COG1596 Periplasmic protein involved in polysaccharide export |-|-----|---------||-|--------|-|-||||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [C] COG1600 Uncharacterized Fe-S protein -------------|---|--------|||-|----|||----------||--||||--|||||--- 1 [S] COG1610 Uncharacterized conserved protein --|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||-- 1 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein ---|----||-|---------|---|--------|-||----|||-|-||||-||||||--|---- 1 [C] COG1620 L-lactate permease -------------||--|--------|---|-|||-||-----||---|--|---|---|------ 1 [G] COG1621 Beta-fructosidases (levanase/invertase) ----------|-----|-||||||-||||--|||--------|||||-||||---|---------- 1 [G] COG1640 4-alpha-glucanotransferase ||||||--|||-|||-|---|------||-|---||||----||||||||--|||----|||||-- 1 [H] COG1648 Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain) ---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG1651 Protein-disulfide isomerase -------------------|-|--||---------||-----|||-|-||-|||||---|||||-- 1 [S] COG1652 Uncharacterized protein containing LysM domain --||---||------------|--------||||||||----|||||-|||||------------- 1 [K] COG1654 Biotin operon repressor --------------------||----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [R] COG1660 Predicted P-loop-containing kinase |-||||||||--|---------------------|--------||-|-|----------||-|--- 1 [R] COG1661 Predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1663 Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase ----------------------||||----|-----|--------|--||--|--||||----|-- 1 [M] COG1664 Integral membrane protein CcmA involved in cell shape determination -------------------|-------||-------||----|||||-||||---|--|------- 1 [S] COG1666 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------||----|---||||----|||||-||---------|||||-- 1 [S] COG1671 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-||||||||||||||||||---|||||-|||||||||||||||||| 1 [D] COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1677 Flagellar hook-basal body protein ---------------------|||--||||------------|||||-||||||||---||||||| 1 [K] COG1678 Putative transcriptional regulator --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 1 [GM] COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component |-|-------------||--|---------|----|||--------|-||-----|---||-|--- 1 [S] COG1683 Uncharacterized conserved protein ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1684 Flagellar biosynthesis pathway, component FliR |-|||||||-|||----|-|||----||||||||||||----|||||-|------|------||-- 1 [K] COG1695 Predicted transcriptional regulators ---------||-|---||||-|----||||-|||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [T] COG1702 Phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase -----------------|-------------||-|||-----|||||-||-----|-----|---- 1 [NU] COG1705 Muramidase (flagellum-specific) ----------------||-------|----------------||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1706 Flagellar basal-body P-ring protein ||||--|||||||----|------------------------|||||-||||-||-------||-- 1 [S] COG1720 Uncharacterized conserved protein --|||||||-|-|---||||-|---|-|||-----|||----------||-----|---|||||-- 1 [R] COG1721 Uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain) -----------------|-|||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG1722 Exonuclease VII small subunit ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 1 [C] COG1726 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrA ----------------|-------------------------|||||-||--||||---||||||| 1 [S] COG1729 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||-- 1 [K] COG1733 Predicted transcriptional regulators ----------------|-----||||----|-----||----||||||||||||||--|||||||| 1 [T] COG1734 DnaK suppressor protein --||----|-|-|----|--||||-||-------|-|-----|||||-||||-||----||||--- 1 [S] COG1738 Uncharacterized conserved protein --||---------||--|--||---||---||||||||||--|||-|-||||-|||||||||---- 1 [S] COG1739 Uncharacterized conserved protein --|-||----|-------||------|||-|-----------|||||-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG1741 Pirin-related protein ----|||-|-|-|||---||-|-----------|---|----------|--|----|||||||--- 1 [E] COG1748 Saccharopine dehydrogenase and related proteins ----------------|-------||----|----|------||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1749 Flagellar hook protein FlgE -------------||||||-|---|--|||-|----||----|||-|-||--||||---||||||| 1 [R] COG1752 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily ||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega |||||-|||||||---|-----------------||||----|||||-|-||---|--|||||--- 1 [H] COG1763 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein -||-||||-|-||---||---|----|||-|----|-|--|||||||-||---|||---||-||-- 1 [O] COG1765 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1766 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway lipoprotein |||---||||-||-------|-----------|---------|||-|-|||--------------- 1 [H] COG1767 Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthetase -------------------|------||||---|--------|||||-||--|------||||||| 1 [E] COG1770 Protease II --|-------------|---|---------------------|||||-|||||||||||------- 1 [R] COG1778 Low specificity phosphatase (HAD superfamily) |||||||||||||----|------------|-----------|||||||----||----------- 1 [F] COG1781 Aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit ----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----||| 1 [M] COG1792 Cell shape-determining protein |||||||||||||||||----------||-------||----------|||--||---|||-||-- 1 [L] COG1793 ATP-dependent DNA ligase --|-|||||-|||---||-|-|------------||||----|||||-||-|---|---||-||-- 1 [S] COG1801 Uncharacterized conserved protein ----|------|-----|--||----|||-|||-||||----|||||-||---|||---|||||-- 1 [K] COG1802 Transcriptional regulators -----------------||------|----|----|||----|||||-|-||---|---|||---- 1 [G] COG1803 Methylglyoxal synthase ------------------||--||---------------------|--||||-||-------|--- 1 [C] COG1805 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrB ---------------------|------------||||----|||||-||--||||---||||||| 1 [S] COG1806 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1815 Flagellar basal body protein -------------||----|----|--|-|||----------|||-|-||-----|---||-||-- 1 [F] COG1816 Adenosine deaminase |||------|---|----|--|-----||||-----|------||||-||------------|--- 1 [GC] COG1819 Glycosyl transferases, related to UDP-glucuronosyltransferase -------------------------|--------|-|-----|||||-|-||------|------- 1 [R] COG1823 Predicted Na+/dicarboxylate symporter ----------------||||-|||||||||----||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc) |||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||--- 1 [C] COG1838 Tartrate dehydratase beta subunit/Fumarate hydratase class I, C-terminal domain ||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----|||||| 1 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E --|-------------|-||-|----|||-|----|||----|||||-||------------||-- 1 [KT] COG1842 Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG1843 Flagellar hook capping protein ---------------------|---|----||||||||----|||||-|-||-||-|||------- 1 [T] COG1854 LuxS protein involved in autoinducer AI2 synthesis --|-------------|----|--------------------|||||-||-|---|||||--|--- 1 [P] COG1858 Cytochrome c peroxidase ----------------||--|-||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG1862 Preprotein translocase subunit YajC ||||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|| 1 [P] COG1863 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit ------------||------||------------|-||----|||||-||||------|||||--- 1 [C] COG1866 Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP) ----------------||------||----|----|||----||||||||-----||||||||--- 1 [N] COG1868 Flagellar motor switch protein -----------------|--------|----|--|-||-|--|||||-|-||-------------- 1 [G] COG1869 ABC-type ribose transport system, auxiliary component --||--|||--------|-------|----|-----||----------||-----|---||--|-- 1 [NT] COG1871 Chemotaxis protein; stimulates methylation of MCP proteins |||----|||--|------|--||----|-------------|||||-|--|-------|--|||| 1 [S] COG1872 Uncharacterized conserved protein -----------------|----||--||||------||----------||--|--|---------- 1 [T] COG1875 Predicted ATPase related to phosphate starvation-inducible protein PhoH ------------------||----||----||||-|||-------|--|-|||------------- 1 [M] COG1876 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase |-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--| 1 [R] COG1881 Phospholipid-binding protein |-------|-----------|---------||||||------|||||-|-||---|---------- 1 [C] COG1882 Pyruvate-formate lyase ----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1886 Flagellar motor switch/type III secretory pathway protein ---|--|||-|-|||-|--|------|||-|||-||||----|||||-||-----|------||-- 1 [H] COG1893 Ketopantoate reductase ---|--|||||||||------|------------||------|||||-||-|----||||||||-- 1 [R] COG1896 Predicted hydrolases of HD superfamily -----------------|------------||-|--||----|||||-|---------||||---- 1 [E] COG1897 Homoserine trans-succinylase -|||--|||||-|-----------------------------------|----------------- 1 [S] COG1901 Uncharacterized conserved protein |||----|||-------||--|--------||--||------|||||-||--|--|-||----|-- 1 [P] COG1918 Fe2+ transport system protein A -----------------|||-|--|-----|---|||-----|||||-|---|------|-|||-- 1 [M] COG1922 Teichoic acid biosynthesis proteins -|--------------||------------|---||||----|||||-||||||||----||||-- 1 [R] COG1923 Uncharacterized host factor I protein ------------------|-------|||-||||||||----|||||-||||-||----------- 1 [G] COG1929 Glycerate kinase --|----------||----|------||||-|---|||----||||||||||||||--||||||-- 1 [HE] COG1932 Phosphoserine aminotransferase ----------------|-||----------------------|||||-||||||||||||||||-- 1 [S] COG1934 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------|-|----------||||------------|||||-|||||------|||||-- 1 [I] COG1946 Acyl-CoA thioesterase ----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase -------------||-----------||||------------||||||||||||||---------- 1 [A] COG1949 Oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease) |||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||--- 1 [C] COG1951 Tartrate dehydratase alpha subunit/Fumarate hydratase class I, N-terminal domain -|----------------------------------------||||||||||||||---||||||| 1 [U] COG1952 Preprotein translocase subunit SecB ---|||-------|---|------------||||||||----|||||-||-||||-------||-- 1 [T] COG1956 GAF domain-containing protein ----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator -----||---|-------||-|----|||-|-||||||----|||||-||--|--|---|||||-- 1 [L] COG1961 Site-specific recombinases, DNA invertase Pin homologs -------------|||--------------------------||||||||||-|||--------|| 1 [P] COG1965 Protein implicated in iron transport, frataxin homolog --|----|--|-|---|---|-----|||-||----||----|||||-||||-||||||------- 1 [T] COG1966 Carbon starvation protein, predicted membrane protein |--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||-- 1 [V] COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein --|---------------|-||----||||-||||||-----|||||-|||||--|---|||||-- 1 [M] COG1970 Large-conductance mechanosensitive channel -----------------|||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|---|||||-- 1 [KT] COG1974 SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidases) --||||-||-||----|-||-|-----||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG1977 Molybdopterin converting factor, small subunit -----------------|-||---------|----|||----|||||-|--|-------------- 1 [C] COG1979 Uncharacterized oxidoreductases, Fe-dependent alcohol dehydrogenase family --|---||---------|--------|---||||-|||----|||||-|----------------- 1 [KT] COG1983 Putative stress-responsive transcriptional regulator ------||-----|------||----||||----|-||----|||||-|||--|||--||---|-- 1 [E] COG1984 Allophanate hydrolase subunit 2 ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis ||--||--|||||------------------------|----|||||-|----------------- 1 [S] COG1986 Uncharacterized conserved protein ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [NU] COG1987 Flagellar biosynthesis pathway, component FliQ ||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||-- 1 [R] COG1994 Zn-dependent proteases ----------------|-|||----------------|----|||||-||-|||||||||||||-- 1 [H] COG1995 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein ---|------|-|||-|----|--------------||----------||--||||--|||||||| 1 [R] COG1999 Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC, involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems ---|---------||--|-|||--------|---||-|----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2008 Threonine aldolase ---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--|||||||||||||| 1 [C] COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit --|-----|---------||-|----||||------||----------||---|||||||||||-- 1 [C] COG2010 Cytochrome c, mono- and diheme variants --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component -------------|-------------||-------------|||---||-------------|-- 1 [Q] COG2015 Alkyl sulfatase and related hydrolases ----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||-- 1 [G] COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes --|---|||---||||--||-------||-|-----------------|-||---|----|||--- 1 [O] COG2020 Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase ----------------|-||||----|||||-----||----|||||-||--||||--||||||-- 1 [H] COG2022 Uncharacterized enzyme of thiazole biosynthesis --|---------------||-|----||||------|-----|||||-||||||||---------- 1 [M] COG2027 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein 4) ---|----|--|-||-----||----||||----|-|-----|--||-||-----|---|||||-- 1 [I] COG2030 Acyl dehydratase --|----------||-|----|-----||||-----|-----|||||-|--|-|||----||-|-- 1 [P] COG2032 Cu/Zn superoxide dismutase |--|-------------|--|---|||-----|||--|----------|----------------- 1 [S] COG2035 Predicted membrane protein |||||||||||||-----||||----|||||------|----|||-|-||-----|---|||||-- 1 [H] COG2038 NaMN:DMB phosphoribosyltransferase ------||-----|------||----||||----|-||----|||-|-|||--|||--||---|-- 1 [E] COG2049 Allophanate hydrolase subunit 1 --|||||||-||--|-|----|----|||--|||||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [Q] COG2050 Uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism --------------------|-------------|-||----------||||-||-|||------- 1 [R] COG2056 Predicted permease -|---------------|||||---||---------||-|--------||-----|---||-||-- 1 [P] COG2059 Chromate transport protein ChrA --------|-|||---|-||------||||------------|||||-|||||--|--||||||-- 1 [T] COG2062 Phosphohistidine phosphatase SixA ----------------||------------------------||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG2063 Flagellar basal body L-ring protein ------------------|||-----|---------||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2066 Glutaminase --||---------------|-|-----|||||---|||----|||||-||---||---||||||-- 1 [P] COG2076 Membrane transporters of cations and cationic drugs ----------------|---------|||-||-|||||-|--|||||-||||---||||------- 1 [O] COG2077 Peroxiredoxin ------------------||----------||||||||----|||||-||||---|---|||-|-- 1 [R] COG2081 Predicted flavoproteins |-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||-- 1 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases ------------------||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||--- 1 [H] COG2087 Adenosyl cobinamide kinase/adenosyl cobinamide phosphate guanylyltransferase -||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||-- 1 [U] COG2095 Multiple antibiotic transporter |-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||-- 1 [H] COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis -||---|---||------||-|--------------||----|||||-||-----|---------- 1 [S] COG2105 Uncharacterized conserved protein --||||||--|------|||||-----||-------------|||||-||-----|---||||--- 1 [H] COG2109 ATP:corrinoid adenosyltransferase ||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--|| 1 [P] COG2111 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhB subunit ---|---------||---||-------||-------------------||-----|-------|-- 1 [S] COG2119 Predicted membrane protein ------------------||-|----|||||-----------|||||-||--||||||||||||-- 1 [S] COG2127 Uncharacterized conserved protein -----------------|--||--|-||||||||||||----|||||-||||-|||---|------ 1 [R] COG2137 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----||--|---|--------|-----|||------------|||||-||--||||---||||||| 1 [C] COG2142 Succinate dehydrogenase, hydrophobic anchor subunit --------------|---|-------|||--|-----|----|||-|-||-----------|---- 1 [R] COG2153 Predicted acyltransferase ---|------||-||-|-||------||||------------------||--|--|----||||-- 1 [H] COG2154 Pterin-4a-carbinolamine dehydratase ------------------||-|||---||-------------|||||-|||||------|||||-- 1 [R] COG2166 SufE protein probably involved in Fe-S center assembly |----------------|------------------------||||||||||-------------- 1 [P] COG2168 Uncharacterized conserved protein involved in oxidation of intracellular sulfur ---------------------------||--|---|||----|||||-||-----|---|||||-| 1 [F] COG2169 Adenosine deaminase ---------|-------|--------||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG2171 Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase -------------------|||----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 1 [D] COG2177 Cell division protein ----|-||--|||----|---|---------|||||||----|||||-|----------|------ 1 [G] COG2182 Maltose-binding periplasmic proteins/domains -------------|||---||---|-|---|||||||||---|||||-||||||||---||||--- 1 [K] COG2183 Transcriptional accessory protein --------------------|----||---||||||||-|||||||||||||---|-------|-- 1 [G] COG2190 Phosphotransferase system IIA components ------------------||-------|||------------|||||-||--||||---|||||-- 1 [P] COG2193 Bacterioferritin (cytochrome b1) ------------------------------------------|||||-|||||||-||||||--|| 1 [R] COG2194 Predicted membrane-associated, metal-dependent hydrolase ------------------||-|-----||-|---||------|||||-||-----|--|||-||-- 1 [T] COG2205 Osmosensitive K+ channel histidine kinase -----------------||||-|||--||-|---||||----------||----------|-|--- 1 [TK] COG2208 Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 1 [C] COG2209 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrE |-||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|- 1 [P] COG2212 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit ------------------------------|--|||||-||-|||||||--|-------------- 1 [G] COG2213 Phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component -----------|-||------|----||||-------|----|||||-||-----|---|||||-- 1 [C] COG2224 Isocitrate lyase --|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis -------------||---||-|--------------------|||||-||-|||||---||||||| 1 [H] COG2227 2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4-benzoquinol methylase --|-------------|----|----|||||-----------|||||-||-----|||||||||-- 1 [M] COG2230 Cyclopropane fatty acid synthase and related methyltransferases |-||--||||---||-|--|-------||-|-----||----|||-|-||--|----------|-- 1 [R] COG2234 Predicted aminopeptidases ---|||-----|-------------|-||--|||||----|-----|-||----------|-|--- 1 [E] COG2235 Arginine deiminase ||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid --|-----------|-----|---------|----||||---|||||-||||-||||||-|-||-- 1 [R] COG2249 Putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B) -|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|-- 1 [R] COG2252 Permeases -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit -------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 1 [L] COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase ---|-------|-||----|-|----||||----|-||----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [S] COG2259 Predicted membrane protein -|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [R] COG2262 GTPases ----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase -------||----||--|-|||----||||||--||||----|||||-||||---|---|||||-- 1 [I] COG2267 Lysophospholipase ----------------|-------|-----------------|||||||-|||------||-||-- 1 [J] COG2269 Truncated, possibly inactive, lysyl-tRNA synthetase (class II) ---|-------||-------||----|||--||---------|||||-|||----|---|||||-- 1 [G] COG2301 Citrate lyase beta subunit ---|--||--|||-------||-------------|||-------|--|-------------|--| 1 [E] COG2317 Zn-dependent carboxypeptidase --|----------|||-|||||--------------------------|----------|||||-- 1 [R] COG2319 FOG: WD40 repeat --||-----------------|-----|||------||----------||---------------- 1 [S] COG2320 Uncharacterized conserved protein --|---------------||-|----|||-------------------||-----|--||||||-- 1 [S] COG2326 Uncharacterized conserved protein --|------------------|--------------------|||||-|||||------||||||| 1 [O] COG2332 Cytochrome c-type biogenesis protein CcmE ---|---------------|-|--------||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [R] COG2333 Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily) --|---------------|-||--------------||----|||||-||---|||---|||||-- 1 [R] COG2334 Putative homoserine kinase type II (protein kinase fold) ----||------------||-|----||||-------|-------|--|----------------- 1 [K] COG2345 Predicted transcriptional regulator ------------------||||----|---|-----|-----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [S] COG2350 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|----|--|--||--------|||||-||||-|||-------|-- 1 [C] COG2352 Phosphoenolpyruvate carboxylase ----||---------------|----|||-----||------|||||-||--|||||||||-||-- 1 [S] COG2353 Uncharacterized conserved protein ---------------------|----|||-------------|||-|-||---|-------|-|-- 1 [S] COG2354 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|--------------|-----||||||||---------------- 1 [L] COG2356 Endonuclease I ------------------||-|--------------------|||||-||--||||--||||||-- 1 [O] COG2360 Leu/Phe-tRNA-protein transferase --------------|----|-|------------||||----|||||-||||-------|||||-- 1 [S] COG2363 Uncharacterized small membrane protein ------------------||-|--|-|-----|---------------||---------------- 1 [R] COG2374 Predicted extracellular nuclease ---------------------|----|||-------------|||-|-||-----|---||----- 1 [P] COG2375 Siderophore-interacting protein ---------|--------||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG2377 Predicted molecular chaperone distantly related to HSP70-fold metalloproteases --------------------||----|||||---||||----|---|-||--|-||--||||||-- 1 [K] COG2378 Predicted transcriptional regulator ---------------------|--------|||||||||-||------|----------------- 1 [R] COG2384 Predicted SAM-dependent methyltransferase --|-----|------------|--------------------|||||-|||||------|||||-- 1 [O] COG2386 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component --------|---|-------||----|----|--||------|||---||-|-------|||||-- 1 [R] COG2388 Predicted acetyltransferase ---------------------|--------||||||||----|||||-|--|---|---||||--- 1 [K] COG2390 Transcriptional regulator, contains sigma factor-related N-terminal domain -||------||||-----------------------------|||||-|----------------- 1 [R] COG2425 Uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain ------||--|||-------|---------------------|||||-|-||-||----------- 1 [S] COG2431 Predicted membrane protein -||---||--||-||----|-|----|---------------||||--||---------------- 1 [T] COG2453 Predicted protein-tyrosine phosphatase -------------------|||----|---||||||||||--|||||-|----|||---------- 1 [S] COG2501 Uncharacterized conserved protein --|---||||||-----||-|---------||-----|----------|--------------|-- 1 [R] COG2509 Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases ----||----|||------|------|||------|||----|||-|-||--||||----|-||-- 1 [G] COG2513 PEP phosphonomutase and related enzymes ------||------|--|-|----------------------|||||-|------|--|---||-- 1 [E] COG2515 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase ||||--|||||||-|--|------------------------|||||-||--||||||||||||-- 1 [O] COG2518 Protein-L-isoaspartate carboxylmethyltransferase ----------|-|------||-----||-|-||||||-----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [S] COG2606 Uncharacterized conserved protein ---------------------|----||||------------||||||||||||||------||-- 1 [C] COG2609 Pyruvate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component -|--------------|-------------|-----------------||-----|--|------- 1 [P] COG2703 Hemerythrin ---|--------------------------|-----||----|||||-||----------|-|--- 1 [S] COG2718 Uncharacterized conserved protein ---|--------------------------|-----||----|||||-||----------|-|--- 1 [S] COG2719 Uncharacterized conserved protein ----||||--||--------------|---||||||||----|||||-|----------||--|-- 1 [G] COG2723 Beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/beta-galactosidase --------------------|---------|--|-----|--|||||-|-||----||-------- 1 [G] COG2731 Beta-galactosidase, beta subunit ----------------||------------|-----||----|||||-||-----|---------- 1 [KNU] COG2747 Negative regulator of flagellin synthesis (anti-sigma28 factor) -----------|-||---||-------|||||||-|||----|||||-||-|-|||--||||||-- 1 [E] COG2755 Lysophospholipase L1 and related esterases ----||-------||--|--|---------||||||--|---------|----||-----|-|--- 1 [F] COG2759 Formyltetrahydrofolate synthetase ---|-------|---------|----|---|---||||----------|---|--|---|||||-- 1 [Q] COG2761 Predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis ---|--------------------------|-----||----|||||-||----------|-|--- 1 [T] COG2766 Putative Ser protein kinase --------------|---||-|-----||-------------------||-----|---|||||-- 1 [R] COG2802 Uncharacterized protein, similar to the N-terminal domain of Lon protease ----------------||||||--------|-----------|||||-||--||||---------- 1 [NU] COG2805 Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits --|----------||------|----|||-|-----------|||||-||||-------|||||-- 1 [L] COG2816 NTP pyrophosphohydrolases containing a Zn-finger, probably nucleic-acid-binding --------------------------||||-|||||-|----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [L] COG2818 3-methyladenine DNA glycosylase ------------------||----------------------||||||||||-|||---|||||-- 1 [M] COG2821 Membrane-bound lytic murein transglycosylase ---------------------|--------|-----------|||||-||||-|||----|---|| 1 [R] COG2823 Predicted periplasmic or secreted lipoprotein --------------------------|----|||-|------|||||-||||-|||||||||||-- 1 [P] COG2824 Uncharacterized Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism ----------------||---|||||----------------|||||-||||-|||-------||| 1 [M] COG2825 Outer membrane protein ---|----------------|----------|||||||----|||||-||---||-----||||-- 1 [L] COG2827 Predicted endonuclease containing a URI domain ------------------------------------|-----|||---||--||||---||-|--- 1 [S] COG2828 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------||-----------||-------|||-|-||||-||----|||---- 1 [S] COG2832 Uncharacterized protein conserved in bacteria -|||----|-------|----|--||----|-----||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG2834 Outer membrane lipoprotein-sorting protein --||------|||-------------||||------------|||||-||-|||||----||||-- 1 [S] COG2835 Uncharacterized conserved protein ---|---------------|----------|-----------------||---||||||------- 1 [S] COG2836 Uncharacterized conserved protein -------------------|-|----|||-----|||-----|||||-||-|-|||------|--- 1 [P] COG2837 Predicted iron-dependent peroxidase --------------------------||||------------------||--|||---|------- 1 [C] COG2838 Monomeric isocitrate dehydrogenase --------------------------|||-------------|||||-||||-|||---|||||-- 1 [O] COG2844 UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase ----------|-----|----|----|---------------------||-|-|||--|||||||| 1 [S] COG2847 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------------------|||||-||||||||--|----||| 1 [M] COG2853 Surface lipoprotein ------------------------------------------|||||-||||||||--|----||| 1 [Q] COG2854 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, auxiliary component -------------||-|-------------------||----------||--|||||||||||||| 1 [C] COG2857 Cytochrome c1 ------------------|------|-----------------||---|---------|------- 1 [S] COG2859 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-------------|----|--------------------|||-||||||---|||||---|-- 1 [S] COG2862 Predicted membrane protein --|-----|-------|-------------------------|||||-||||---|--|-|----- 1 [C] COG2864 Cytochrome b subunit of formate dehydrogenase -------------||---------------------------|||||-||-|||||---||||||| 1 [I] COG2867 Oligoketide cyclase/lipid transport protein ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 1 [C] COG2869 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrC ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 1 [C] COG2871 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF --|-||||--||||---|--||--------|------|----------||-----|---||||--- 1 [R] COG2872 Predicted metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase HxxxH domain ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG2877 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (KDO) 8-phosphate synthase --|--------------|--|---------------------||||||||||||||---------- 1 [C] COG2878 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB -----------------|------|-----|-----||----||||||||-----|---------- 1 [NUO] COG2882 Flagellar biosynthesis chaperone -------------------|-|----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 1 [D] COG2884 Predicted ATPase involved in cell division -------------------|----|------|-|||||----|||||-|||||--|---------- 1 [M] COG2891 Cell shape-determining protein ----------------||||||--------|----|||----||||||||--||||||-||||--- 1 [D] COG2894 Septum formation inhibitor-activating ATPase --------------------------|||-|-----------||||||||--||||---|||||-- 1 [P] COG2895 GTPases - Sulfate adenylate transferase subunit 1 |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG2896 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme |--|------|||||-|--|-|----||||-------|----|||||-||-----|---|||||-- 1 [P] COG2897 Rhodanese-related sulfurtransferase ------------------------------------------|||||-|||||||----||||--- 1 [S] COG2900 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------||||||||||||||---------- 1 [KL] COG2901 Factor for inversion stimulation Fis, transcriptional activator -------------||------------|||------------------||--|------||||||| 1 [E] COG2902 NAD-specific glutamate dehydrogenase ------------------------------------------|||||-|||||--|--------|| 1 [S] COG2904 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|---------|-------------||-||-||--||||-------|-- 1 [P] COG2906 Bacterioferritin-associated ferredoxin ---------------------------||-------------------|----||----|--||-- 1 [R] COG2907 Predicted NAD/FAD-binding protein -----------------|------------------------|||||-|||||||||||||-||-- 1 [S] COG2908 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------||-|-----------|||||-||---------------- 1 [K] COG2909 ATP-dependent transcriptional regulator -------------------------------|-|-||-----------||-----|--|||-|--- 1 [R] COG2910 Putative NADH-flavin reductase ------------------------------------------||||||||||||||---|||||-- 1 [S] COG2911 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|--||------------------|||||||||||--|-------|-- 1 [S] COG2912 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG2913 Small protein A (tmRNA-binding) ------------------------------------------||||||||||||||---------- 1 [S] COG2914 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||||||||------------- 1 [R] COG2915 Uncharacterized protein involved in purine metabolism ------------------------------------------|||||||-|||--|---------- 1 [R] COG2916 DNA-binding protein H-NS ------------------------------------------||||||||||-|||----|||||| 1 [D] COG2917 Intracellular septation protein A ------------------------------|----|------||||||||-|-------------- 1 [H] COG2918 Gamma-glutamylcysteine synthetase ------------------------||||||-|||||||----||||||||||||||---||||||| 1 [D] COG2919 Septum formation initiator --------|-|-------------------------------||||||||||-------------- 1 [P] COG2920 Dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), gamma subunit ------------------------------------------||||||||||||||---------- 1 [S] COG2921 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||||||---|||----------- 1 [S] COG2922 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-|--------------|------------------------||||||||||-------------- 1 [P] COG2923 Uncharacterized protein involved in the oxidation of intracellular sulfur ------------------------------------------||||||||||||||---------- 1 [CO] COG2924 Fe-S cluster protector protein ------------------------------------------|||||||||||--|---------- 1 [L] COG2925 Exonuclease I --------------------|---------------------|||||||-||-------------- 1 [S] COG2926 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||||||---||||||| 1 [L] COG2927 DNA polymerase III, chi subunit ------------------||--------------------------|-|---|||-----||-|-- 1 [S] COG2929 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|-||-------------------------|--||--||||---||-||-- 1 [Q] COG2931 RTX toxins and related Ca2+-binding proteins -------------||---------------------------------||--|--|--||||||-- 1 [O] COG2935 Putative arginyl-tRNA:protein arginylyltransferase ---------------------------|||------------|||||-|||||------------- 1 [I] COG2937 Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase -------------||---------------------------|||||-||||||||---||||||| 1 [S] COG2938 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||-|-||--|--|-------|-- 1 [M] COG2943 Membrane glycosyltransferase -------------------|----------------------|||-|-|---||||---||----| 1 [K] COG2944 Predicted transcriptional regulator -------------------|-|--------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG2949 Uncharacterized membrane protein --------------------------|||-------------|||||-||-|||||---|||||-- 1 [M] COG2951 Membrane-bound lytic murein transglycosylase B ------------------------------------------|||||-|-||||||---------- 1 [G] COG2956 Predicted N-acetylglucosaminyl transferase ------------------------------------------|||||-||||-|||---------- 1 [H] COG2959 Uncharacterized enzyme of heme biosynthesis ------------------------------------------|||||-||--||||---||||--- 1 [S] COG2960 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||||||---|||||-| 1 [R] COG2961 Protein involved in catabolism of external DNA --------------------------|-------||||----|||||-||||---|---|||||-- 1 [R] COG2962 Predicted permeases --------------------|-----------|---------|||||-||||---|--|-|----- 1 [S] COG2964 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-|||---------- 1 [L] COG2965 Primosomal replication protein N |------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|------- 1 [S] COG2966 Uncharacterized conserved protein ---------------------|--------------------|||||-||--|--|---|||||-- 1 [P] COG2967 Uncharacterized protein affecting Mg2+/Co2+ transport --||--------------||-------||--------|----|||||-|---|------|||||-- 1 [S] COG2968 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 1 [R] COG2969 Stringent starvation protein B ----||-----|-----|-|-|--------|-----------------|-----------|||--- 1 [G] COG2971 Predicted N-acetylglucosamine kinase --------------------|---------|-||||||----------||--|--|---------- 1 [T] COG2972 Predicted signal transduction protein with a C-terminal ATPase domain ----------------------|-------------------|||||-|-|||------------- 1 [K] COG2973 Trp operon repressor ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 1 [L] COG2974 DNA recombination-dependent growth factor C ------------------------------------------|||||-|||--|||---------- 1 [S] COG2975 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------||||||||||||||---------- 1 [S] COG2976 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------||||------------|||||-||---------|-||--- 1 [Q] COG2977 Phosphopantetheinyl transferase component of siderophore synthetase ------------------------------------------|||-|-||-|-||----||||--- 1 [S] COG2979 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 1 [M] COG2980 Rare lipoprotein B ------------------|-----------------------|||||-||||-------||||--- 1 [E] COG2981 Uncharacterized protein involved in cysteine biosynthesis ------------------------------------------|||||-||---|||----|||-|| 1 [M] COG2982 Uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis -|----------------------------------------|||||-||||-------|||||-- 1 [S] COG2983 Uncharacterized conserved protein ----------------|---|-||--|-----||--------------||-----|---||||-|| 1 [R] COG2984 ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component ---|----------------|-----|---------------|||||-|-||-------------- 1 [R] COG2985 Predicted permease ---|||--------------||----------|-|-||-------||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2986 Histidine ammonia-lyase ---|||--------------||----------|-|-||-------|--||-----|---|||||-- 1 [E] COG2987 Urocanate hydratase ------------------||----------------------|||||-||---------------- 1 [E] COG2988 Succinylglutamate desuccinylase ------------------------------------------|||||-|-||-------|||||-- 1 [S] COG2989 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-||---|---|--- 1 [S] COG2990 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------------------|||-|-|---------|------- 1 [R] COG2992 Uncharacterized FlgJ-related protein ------------------------------------------------||---|||||||||||-- 1 [C] COG2993 Cbb3-type cytochrome oxidase, cytochrome c subunit ------------------|-----------------------------|----|-|----|----- 1 [O] COG2994 ACP:hemolysin acyltransferase (hemolysin-activating protein) --------------------|---------||||||||----------||---------------- 1 [S] COG2996 Uncharacterized protein conserved in bacteria |---------|-------------------------------------|------|--|------- 1 [H] COG2998 ABC-type tungstate transport system, permease component ------------------------------------------|||-|-|--|-||----------- 1 [O] COG2999 Glutaredoxin 2 -------------||---||-------||-------------------||-----|---||-||-- 1 [I] COG3000 Sterol desaturase ------------------||------|-------|-------|||||-|--|-------------- 1 [G] COG3001 Fructosamine-3-kinase ----------------|-----------------|-|-----------|----------------- 1 [S] COG3002 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||----|||-||||-| 1 [P] COG3004 Na+/H+ antiporter ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [D] COG3006 Uncharacterized protein involved in chromosome partitioning ------------------------------------------|||||-||---|||---------- 1 [S] COG3009 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|----||----|||||---|--|||||-|-||---------|---- 1 [G] COG3010 Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase ------------------||--------------|-||-------|--||--|--|------||-- 1 [S] COG3011 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|----|---------------|||||-||||-|-|---------- 1 [S] COG3012 Uncharacterized protein conserved in bacteria -|----------------------------------------|||||-|--|-------------- 1 [S] COG3013 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------------|-------|||------- 1 [S] COG3014 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------|-----------------||||--|----------------- 1 [MP] COG3015 Uncharacterized lipoprotein NlpE involved in copper resistance ----------------|-------------------------------||--------|------- 1 [S] COG3016 Uncharacterized iron-regulated protein ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 1 [M] COG3017 Outer membrane lipoprotein involved in outer membrane biogenesis ------------------------------------------------|-------|||------- 1 [S] COG3018 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------|-----|-------------------------------||-|------|-|----- 1 [R] COG3019 Predicted metal-binding protein -------------------|-|--------------------|||||-|--|-------|-|||-- 1 [S] COG3021 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|---|-----|-----||--------|||||-||||-|||--|----|-| 1 [S] COG3022 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------------------|||||-||||||||---|||||-| 1 [V] COG3023 Negative regulator of beta-lactamase expression ------------------------------------------|||||-||||-|||----||||-- 1 [S] COG3024 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---------------------------------------|||||-||||---|------||-- 1 [S] COG3025 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||||-||||---|---------- 1 [T] COG3026 Negative regulator of sigma E activity -----------------------|------|---||||----|||||-|||||||----||||||| 1 [S] COG3027 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 1 [S] COG3028 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------||-------------|||||-|-||-------------- 1 [C] COG3029 Fumarate reductase subunit C --||----------------------||-------|||----|||||-||-|-||----||||--- 1 [R] COG3030 Protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid ----------------|-------------------------|-----|----------------- 1 [U] COG3031 Type II secretory pathway, component PulC ---|--------|-------|---------------------|||---|--|-------------- 1 [E] COG3033 Tryptophanase ----------------|-------------------------|||||-||------|||||||--- 1 [S] COG3034 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|--||-||||-|------------ 1 [S] COG3036 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|-----||||-|-||-|||||-|--|-------------- 1 [S] COG3037 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-------------|--------|||-|-|-|-|---||-|------ 1 [S] COG3041 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------|---------------------------------|||||-|----|||------|--- 1 [R] COG3042 Putative hemolysin ------------------------------------------|||||-||||------|||----- 1 [C] COG3043 Nitrate reductase cytochrome c-type subunit -|-------|--|-----------------------------------|----------------- 1 [R] COG3044 Predicted ATPase of the ABC class ------------------------------------------|||||-||---|||---||||--- 1 [S] COG3045 Uncharacterized protein conserved in bacteria |--|--------------|-----------------------------|----------|---|-- 1 [R] COG3046 Uncharacterized protein related to deoxyribodipyrimidine photolyase ------------------------------------------|||||-||-||--|---|-||||| 1 [M] COG3047 Outer membrane protein W --------------------|---------------||----|||-|-||---------------- 1 [E] COG3048 D-serine dehydratase --|---------------|------------|--|-|---------|-|----------|-||--- 1 [M] COG3049 Penicillin V acylase and related amidases ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [L] COG3050 DNA polymerase III, psi subunit --------------------|----------||---------|||-|-|-|--------------- 1 [C] COG3051 Citrate lyase, alpha subunit --------------------|----------||---------|||-|-|-|--------------- 1 [C] COG3052 Citrate lyase, gamma subunit --------------------|----------||---------|||-|-|-|--------------- 1 [C] COG3053 Citrate lyase synthetase ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [R] COG3054 Predicted transcriptional regulator ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [M] COG3056 Uncharacterized lipoprotein ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [L] COG3057 Negative regulator of replication initiationR ------------------------------------------|||-|-|-||----||-------- 1 [S] COG3059 Predicted membrane protein ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [KE] COG3060 Transcriptional regulator of met regulon ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [M] COG3061 Cell envelope opacity-associated protein A ------------------------------------------|||||-||||------|||----- 1 [P] COG3062 Uncharacterized protein involved in formation of periplasmic nitrate reductase ---------------------------------------------|--||||||||---------- 1 [NU] COG3063 Tfp pilus assembly protein PilF ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [M] COG3064 Membrane protein involved in colicin uptake ------------------------------------------|||||-|-|||------------- 1 [M] COG3065 Starvation-inducible outer membrane lipoprotein ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [L] COG3066 DNA mismatch repair protein ------------------------------------------|||||-||||-------------- 1 [P] COG3067 Na+/H+ antiporter ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG3068 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||-|-|-||-------------- 1 [C] COG3069 C4-dicarboxylate transporter ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 1 [H] COG3071 Uncharacterized enzyme of heme biosynthesis ------------------------------------------|||||-||||-------------- 1 [F] COG3072 Adenylate cyclase ------------------------------------------|||||-|||||--|---------- 1 [T] COG3073 Negative regulator of sigma E activity ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG3074 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|--------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [E] COG3075 Anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG3076 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|-----------||--------|||||-|-|-|------||----| 1 [L] COG3077 DNA-damage-inducible protein J ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG3078 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|||||------------- 1 [S] COG3079 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------||-------------|||||-|-||-------------- 1 [C] COG3080 Fumarate reductase subunit D ------------------------------------------|||||-||||-------------- 1 [R] COG3081 Nucleoid-associated protein ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG3082 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG3084 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG3085 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|--|---------------------|||||-||||-------------- 1 [T] COG3086 Positive regulator of sigma E activity ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 1 [D] COG3087 Cell division protein ------------------------------------------|||||-||||-------------- 1 [S] COG3089 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------|||||||----|||||-||||-------------- 1 [S] COG3091 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG3092 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------||-----|---------------|||---|||-|-------|-||-- 1 [R] COG3093 Plasmid maintenance system antidote protein ------------------------------------------|||||-|-||-||----------- 1 [S] COG3094 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [D] COG3095 Uncharacterized protein involved in chromosome partitioning ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [D] COG3096 Uncharacterized protein involved in chromosome partitioning ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG3097 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||-------------- 1 [S] COG3098 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG3099 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||-------------- 1 [S] COG3100 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG3101 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG3102 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------------------||-----|||||-||||-------------- 1 [T] COG3103 SH3 domain protein -------------|||----------|---||--|||-----|||||-|---|||--------|-- 1 [E] COG3104 Dipeptide/tripeptide permease ------------------------------------------|||||-||||-------------- 1 [S] COG3105 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------||||--- 1 [R] COG3106 Predicted ATPase ------------------------------------------|||||-|||||------------- 1 [R] COG3107 Putative lipoprotein ------------------------------------------|||||-|-||-------|||||-- 1 [S] COG3108 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||-------------- 1 [T] COG3109 Activator of osmoprotectant transporter ProP ------------------------------------------|||||-||||-------------- 1 [S] COG3111 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG3112 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||||||---------- 1 [R] COG3113 Predicted NTP binding protein (contains STAS domain) ------------------------------------------|||||-||||-------------- 1 [U] COG3114 Heme exporter protein D ------------------------------------------|||||-|||||------------- 1 [D] COG3115 Cell division protein ------------------------------------------|||||||||||--|---------- 1 [D] COG3116 Cell division protein ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 1 [S] COG3117 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------||||------------|||||-|||||--|---|||||-- 1 [O] COG3118 Thioredoxin domain-containing protein ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG3120 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||-----|---------- 1 [S] COG3123 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||---------------- 1 [S] COG3124 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||---------|-||--- 1 [S] COG3126 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||-----|---|||||-- 1 [Q] COG3127 Predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component --------------|---------------------------|||||-||---------------- 1 [R] COG3129 Predicted SAM-dependent methyltransferase ------------------------------------------|||||-||---------------- 1 [J] COG3130 Ribosome modulation factor ------------------------------------------|||-|-||--|--|---------- 1 [P] COG3131 Periplasmic glucans biosynthesis protein ------------------------------------------|||||-||------------|--- 1 [S] COG3132 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|----|---------------|||-|-||----------|||--- 1 [Q] COG3135 Uncharacterized protein involved in benzoate metabolism ------------------------------------------|||||-||------------|--- 1 [R] COG3136 Uncharacterized membrane protein required for alginate biosynthesis ------------------------------------------|||||-|---|------------- 1 [M] COG3137 Putative salt-induced outer membrane protein ------------------------------------------|||||-||-------------|-- 1 [E] COG3138 Arginine/ornithine N-succinyltransferase beta subunit ------------------------------------------|||||-||---------------- 1 [S] COG3139 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG3140 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||---------------- 1 [S] COG3141 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|----------|||-|------|||||-|--||------||-||-- 1 [P] COG3142 Uncharacterized protein involved in copper resistance ------------------------------------------|||||-||-----|---------- 1 [NT] COG3143 Chemotaxis protein -----------------|------------|-----||----||||||||-----|---------- 1 [N] COG3144 Flagellar hook-length control protein --------------|----|------||||------------|||-|-||--|--|---|||||-- 1 [L] COG3145 Alkylated DNA repair protein ------------------------------------------|||||-||--|--|---------- 1 [S] COG3147 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|-----||-----|---------- 1 [U] COG3149 Type II secretory pathway, component PulM ------------------------------------------|||||-||--|------------- 1 [S] COG3151 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||-----|---|||---- 1 [I] COG3154 Putative lipid carrier protein ------------------------------------------|||||-||---------------- 1 [Q] COG3155 Uncharacterized protein involved in an early stage of isoprenoid biosynthesis ------------------------------------------|--|--||--|--|------||-- 1 [U] COG3156 Type II secretory pathway, component PulK --|-----------------------|----||---------|||||-||--|--|---|||||-- 1 [P] COG3158 K+ transporter ------------------------------------------|||||-||-||--|-------|-- 1 [S] COG3159 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||---------------- 1 [K] COG3160 Regulator of sigma D |||-----||-----------------|||------------|||||-||-|-|||---------- 1 [H] COG3161 4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase) ------------------------------------------|||||-||--|--|---------- 1 [S] COG3164 Predicted membrane protein ------------------------------------------|||||-||-|||||---------- 1 [S] COG3165 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||----------------------|||||-||--||||------|--- 1 [NU] COG3166 Tfp pilus assembly protein PilN ------------------------------------------------||--||||---------- 1 [NU] COG3167 Tfp pilus assembly protein PilO ------------------------------------------------||--||||---------- 1 [NU] COG3168 Tfp pilus assembly protein PilP ---------------------|--------------------------||--|-------||---- 1 [S] COG3169 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------------||--||||---------- 1 [NU] COG3170 Tfp pilus assembly protein FimV -------------------||-----|-------|-||----|||-|-||---------||-|--- 1 [R] COG3180 Putative ammonia monooxygenase --------------------|-----|---------||--------|-||-|---|---||----- 1 [S] COG3181 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|-------|--|----------||---|||---|---|-- 1 [S] COG3182 Uncharacterized iron-regulated membrane protein --|------------------|------------------------|-||------------|--- 1 [V] COG3183 Predicted restriction endonuclease ------------------||------|---------------------||-----|---||-||-- 1 [ER] COG3185 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase and related hemolysins -----------------------|------------------------||-----|------||-- 1 [E] COG3186 Phenylalanine-4-hydroxylase --|---------------|-||----|---------------|||||-||-----||||||||--- 1 [O] COG3187 Heat shock protein ----------------------||------------||----||||||||-----|---------- 1 [N] COG3190 Flagellar biogenesis protein ------------------------------------------------||---||||||-|-||-- 1 [P] COG3197 Uncharacterized protein, possibly involved in nitrogen fixation ------------------------------------------------||---||----------- 1 [S] COG3198 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|--------------------------------------------||---|---------|-- 1 [S] COG3205 Predicted membrane protein ----------------||||----------------------|||-|-||-||--|---|||||-- 1 [M] COG3206 Uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis -------------|----------------------------------||---------------- 1 [Q] COG3207 Pyoverdine/dityrosine biosynthesis protein -------------------|-----------------|----------||--------|||-||-- 1 [R] COG3211 Predicted phosphatase --|-----------------|-----------|-||||----------||---||-------||-- 1 [S] COG3212 Predicted membrane protein ------------------------------------------------||---|||---|||---- 1 [P] COG3213 Uncharacterized protein involved in response to NO ------------------|-----------------------------||---------||||--- 1 [S] COG3216 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|---------------|----------------------|||||-||---------||-||-- 1 [R] COG3217 Uncharacterized Fe-S protein ---|------|--------||-----|||--|--|--|----||||--||---------||-||-- 1 [P] COG3221 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, periplasmic component --|----------------|----------|---|-|-----------||---------------- 1 [E] COG3227 Zinc metalloprotease (elastase) ---------------------|-----------------------||-||-|---|-----|---- 1 [E] COG3232 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate isomerase ------------------------------------------------||---||----------- 1 [S] COG3235 Predicted membrane protein -------------------|--------------------------|-||-||--|---------- 1 [IR] COG3240 Phospholipase/lecithinase/hemolysin ------------------------------------------|||||-||--|--|-----||--- 1 [S] COG3242 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------|---------|--------|||------------------||-----|---||-|||| 1 [I] COG3243 Poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase ------------------------------------------------||---|||-------|-- 1 [C] COG3245 Cytochrome c5 ------------------------------------------|||-|-||---------------- 1 [M] COG3248 Nucleoside-binding outer membrane protein ------------------------------------------------||--|---------|--- 1 [S] COG3249 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|----------------|----|||-|-||---------|--|--- 1 [P] COG3263 NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters with a unique C-terminal domain -------------||----|-|----|---------------|||||-||-|-|||---||-|--- 1 [G] COG3265 Gluconate kinase ------|||-----------------------||--------|||-|-|----------------- 1 [S] COG3270 Uncharacterized conserved protein |-|---------------------------------------|||||-||---------------- 1 [S] COG3272 Uncharacterized conserved protein -------------------------------|----------|||||-|------|--------|- 1 [S] COG3274 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|-------------|-|-----|||||-|-----------|----- 1 [T] COG3275 Putative regulator of cell autolysis ------------------------------------------------||---|||||||||||-- 1 [O] COG3278 Cbb3-type cytochrome oxidase, subunit 1 ------------------------------------------|||||-||||-------------- 1 [KE] COG3283 Transcriptional regulator of aromatic amino acids metabolism -------------------|----------|-----||----|-----||-----|---|||||-- 1 [QK] COG3284 Transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism ------------------||-------|-|------------|||||-||||-|||---||||||| 1 [C] COG3288 NAD/NADP transhydrogenase alpha subunit |||---|-|---|------------------|-----|----------|----------------- 1 [R] COG3291 FOG: PKD repeat ---------------------|--------------------------|---|--|-------|-- 1 [S] COG3295 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|--|--||-------------|-- 1 [U] COG3297 Type II secretory pathway, component PulL --------------------------|||-------------|||||-|--|-----------|-- 1 [S] COG3304 Predicted membrane protein ---------------------------||-------------------|---|------------- 1 [S] COG3305 Predicted membrane protein ------------------------------------------------||---|||---------- 1 [S] COG3308 Predicted membrane protein ------------------------------------------------|---||||---------- 1 [S] COG3310 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||-||----------- 1 [C] COG3312 F0F1-type ATP synthase, subunit I --|----------------||------|||------|-----------||-|--------|-|--- 1 [Q] COG3315 O-Methyltransferase involved in polyketide biosynthesis ------------------------------------------|||||-||||-|||---------- 1 [M] COG3317 Uncharacterized lipoprotein --|-----|------------------------------------|--||----------|--|-- 1 [T] COG3322 Predicted periplasmic ligand-binding sensor domain --------------------|-----|----------|--------|-||-|---|---||----- 1 [S] COG3333 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|---------------|-|----------|--|----||--|-|--- 1 [P] COG3338 Carbonic anhydrase --|----------|----|||------||-|---|--|----|--||-||----------|----- 1 [L] COG3344 Retron-type reverse transcriptase -----------------|---------------|---|-------|--|----------------- 1 [G] COG3345 Alpha-galactosidase -----------------------------------|-|----|||||-|------------||--- 1 [S] COG3394 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---------------||-|----|||||-----||----------|------|---||||--- 1 [M] COG3409 Putative peptidoglycan-binding domain-containing protein --------------------------|---|-||||-|-||-|||-|-|--|-------------- 1 [G] COG3414 Phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component ------------------------------------------|||||||-------|||------- 1 [R] COG3417 Collagen-binding surface adhesin SpaP (antigen I/II family) ------------------------------------------||||||||---------------- 1 [NUO] COG3418 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway chaperone ---------------------------||-------|-----|||||-||-----------|---- 1 [Q] COG3433 Aryl carrier domain ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [R] COG3445 Acid-induced glycyl radical enzyme ------------------||----------------------------|-----------|-|--- 1 [T] COG3452 Predicted periplasmic ligand-binding sensor domain -------------------------------------------||||-||-----|---|--|--- 1 [S] COG3455 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------|||--||---------|--|--- 1 [T] COG3456 Uncharacterized conserved protein, contains FHA domain -----------------|------------|----|---------|--|----------||||--- 1 [G] COG3459 Cellobiose phosphorylase -------------------------------|---|------------||---------------- 1 [G] COG3469 Chitinase -------------------------------|----|-----------|----------------- 1 [Q] COG3479 Phenolic acid decarboxylase ------------------------------------------------||---------||-|--- 1 [P] COG3487 Uncharacterized iron-regulated protein ------------------------------------------------||---------||-|--- 1 [C] COG3488 Predicted thiol oxidoreductase ------------------------------------------------||---------||-|--- 1 [R] COG3489 Predicted periplasmic lipoprotein ------------------------------------------------||---------||-|--- 1 [S] COG3490 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------------||---------||-||-- 1 [S] COG3492 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|----------||---||--------|-|----------------- 1 [C] COG3493 Na+/citrate symporter ------------------------------------------------||------------|--- 1 [S] COG3495 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------||-------------------|----------|--||-- 1 [S] COG3496 Uncharacterized conserved protein -------------|-----|----------------------------|-----------|-|--- 1 [S] COG3506 Uncharacterized conserved protein -----------|------------------------------------||-----|----|-||-- 1 [Q] COG3508 Homogentisate 1,2-dioxygenase -------------------------------------------||||-||-----|---|--|--- 1 [S] COG3516 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------||||-||-----|---|--|--- 1 [S] COG3517 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------||||-||-----|---|--|--- 1 [S] COG3518 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------||||-||-----|---|--|--- 1 [S] COG3519 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------||||-||-----|---|--|--- 1 [S] COG3520 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------||||-||-----|------|--- 1 [S] COG3521 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------||||-||-----|---|--|--- 1 [S] COG3522 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------||||-||-----|---|--|--- 1 [S] COG3523 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------------||---------||||--- 1 [O] COG3526 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---------------------------||-||||-----------|----------------- 1 [Q] COG3527 Alpha-acetolactate decarboxylase -------------------------------------------||-|-|-------||-------- 1 [S] COG3528 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------|-||-||---------------- 1 [R] COG3529 Predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon domain -------------------------------------------|-||-||-----|---------- 1 [S] COG3530 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------------------|--||-----|------|--- 1 [O] COG3531 Predicted protein-disulfide isomerase -------------------|----------------------------|-|-|-------|-|--- 1 [R] COG3549 Plasmid maintenance system killer protein --------------------|-----|---------------|||---|-|--|-|---||-||-- 1 [R] COG3550 Uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzymes ------------------------------------------------||-----------|||-- 1 [S] COG3553 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|---------|-|-----------|--|----------|--||-- 1 [S] COG3575 Uncharacterized protein conserved in bacteria -||---------------|-|---------------------|||||-||-|-------|--|--- 1 [L] COG3593 Predicted ATP-dependent endonuclease of the OLD family ------------------||----------------------|||---|-----|--|-------- 1 [R] COG3596 Predicted GTPase ------------------------------------------------||----------|-||-- 1 [S] COG3602 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|-------|-----------------|||-|-||-----|----|-|--- 1 [KT] COG3604 Transcriptional regulator containing GAF, AAA-type ATPase, and DNA binding domains ------------------------------------------|||||-||---------|||||-- 1 [T] COG3605 Signal transduction protein containing GAF and PtsI domains |--|-----|--------------------------------------||---------||||--- 1 [R] COG3608 Predicted deacylase |------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|------- 1 [S] COG3610 Uncharacterized conserved protein ------------------|--|--------------------------||------------|--- 1 [T] COG3614 Predicted periplasmic ligand-binding sensor domain -------------------|----------------|-----------|---------------|| 1 [R] COG3621 Patatin --------------------------------||-----||-|||||-|-||-------------- 1 [G] COG3623 Putative L-xylulose-5-phosphate 3-epimerase --------------------------------|---------|||||-||||-||---|------- 1 [E] COG3633 Na+/serine symporter ------------------------------------------|||---|--|-------------- 1 [S] COG3647 Predicted membrane protein -------------------|----------------------------||-------------|-- 1 [S] COG3650 Predicted membrane protein -------------------|-------------|-----|-----||-||---|-------|-|-- 1 [R] COG3654 Prophage maintenance system killer protein ------------------------------------------------|----|||-------|-- 1 [C] COG3658 Cytochrome b ------------------------------------------------||---------|||||-- 1 [S] COG3672 Predicted periplasmic protein ------------------||----------------------|||||-||----||----|----- 1 [UNTP] COG3678 P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc-resistance associated protein ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG3691 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------|------|----|||--|---|------|||||-||---------------- 1 [L] COG3695 Predicted methylated DNA-protein cysteine methyltransferase --------------------|-----------|---------|||-|-|-|--------------- 1 [HI] COG3697 Phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase (holo-ACP synthetase) --------------------|---------------------|||||-|--|---|---||-||-- 1 [M] COG3713 Outer membrane protein V -------------------------------------------|||--|--|-------|------ 1 [P] COG3721 Putative heme iron utilization protein ------------------------------------------|||||-|--|-------------- 1 [K] COG3722 Transcriptional regulator ------------------------------------------|||||-||-|-------------- 1 [R] COG3726 Uncharacterized membrane protein affecting hemolysin expression ------------------------|-----|-----------|||||-|----------|||||-- 1 [S] COG3735 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------|||--||----------------------------||-------------|-- 1 [O] COG3751 Predicted proline hydroxylase ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG3771 Predicted membrane protein -------------||-----|---------------------------|--|---|---|------ 1 [M] COG3774 Mannosyltransferase OCH1 and related enzymes ------------------------------------------|||||-||---------------- 1 [S] COG3776 Predicted membrane protein ------------------------------------------------||---||----------- 1 [S] COG3782 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|--|-------------- 1 [C] COG3783 Soluble cytochrome b562 -------------------|----------------------|||||-|--------------|-- 1 [R] COG3788 Uncharacterized relative of glutathione S-transferase, MAPEG superfamily ------------------------------------------|||||-|--|-------------- 1 [S] COG3790 Predicted membrane protein -------------------|----------------------------|-------------|--- 1 [Q] COG3805 Aromatic ring-cleaving dioxygenase ------------------------------------------------|------|------||-- 1 [T] COG3806 Anti-sigma factor ----|--|--||-----|---|---------|||||||-|--|||||-|----------------- 1 [G] COG3833 ABC-type maltose transport systems, permease component ------------------------------|-----||----|||||-|||--------------- 1 [KT] COG3835 Sugar diacid utilization regulator -------------------|----------|-----------------|------|----|-||-- 1 [S] COG3837 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain ------------------------------------------|||||-|-||-------||||--- 1 [H] COG3840 ABC-type thiamine transport system, ATPase component ------------------------------------------|||||-||||-|||---------- 1 [T] COG3850 Signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific ------------------------------------------|||-|-|--|-------------- 1 [T] COG3851 Signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific ------------------------------------------|||||-||--|--|---|||||-- 1 [T] COG3852 Signal transduction histidine kinase, nitrogen specific --|-----------------|-----|---|---|-------------|-------||-------- 1 [L] COG3886 Predicted HKD family nuclease ------------------------------------------------|----------|--||-- 1 [R] COG3911 Predicted ATPase ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [L] COG3923 Primosomal replication protein N'' ------------------------------------------------||---------||----- 1 [S] COG3930 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------------------||--|||--------------- 1 [R] COG3941 Mu-like prophage protein ----------|||-----------------|-----------------|----------------- 1 [S] COG3945 Uncharacterized conserved protein ----------------------------------------------|-|-----------|----- 1 [R] COG3950 Predicted ATP-binding protein involved in virulence ------------------------|-----------------||||||||-----|---------- 1 [MNO] COG3951 Rod binding protein ------------------------------------------|||||-|-----------|----- 1 [C] COG3954 Phosphoribulokinase -------------------------------------|-------|--|----------||----- 1 [P] COG3965 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters -------------------|----------------------|||||-|----||----------- 1 [E] COG3977 Alanine-alpha-ketoisovalerate (or valine-pyruvate) aminotransferase ------------------------------------------|||||-|--||------------- 1 [S] COG3978 Acetolactate synthase (isozyme II), small (regulatory) subunit --------------------||----|---||||---|----------|--|----------|--- 1 [R] COG3981 Predicted acetyltransferase -------------------|----------|--|--------------||---------------- 1 [P] COG4097 Predicted ferric reductase ------------------------------------------------|----------||||--- 1 [S] COG4103 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|-------------------------|||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG4105 DNA uptake lipoprotein ------------------||-|----|---||||||------||||||||||||||---|||||-- 1 [J] COG4108 Peptide chain release factor RF-3 --------------------|-----|-----||--------------||-----|---||||-|| 1 [R] COG4120 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ||--------------|-||-|---|----------------|||||-||||---|--|||--|-- 1 [S] COG4121 Uncharacterized conserved protein ----------------||--|---------||||||||||--|||||-|-||----||||||||-- 1 [R] COG4123 Predicted O-methyltransferase ---------------------------------------------|--||---------------- 1 [R] COG4128 Zonula occludens toxin ------------------------------------------|||||-|||||------||||||| 1 [O] COG4133 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, ATPase component ------------------------------------------||||--|----------|||---- 1 [R] COG4134 ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component ------------------------------------------|||---|-----------|----- 1 [R] COG4135 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ------------------------------------------|||---|-----------|----- 1 [R] COG4136 ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component ------------------------------------------|||||-||-|||||---------- 1 [R] COG4137 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ------------------------------------------|||||-|----------------- 1 [H] COG4138 ABC-type cobalamin transport system, ATPase component ------------------------------------------|||||-|----------------- 1 [H] COG4139 ABC-type cobalamin transport system, permease component ---|--||--|----------|--|-----------------|||||-|-||-||----||||--- 1 [H] COG4143 ABC-type thiamine transport system, periplasmic component --------|-------|--|-|----|---------||----|||||-||--|--|---------- 1 [R] COG4147 Predicted symporter ----------------------------------|-------|||||-||||-------||||--- 1 [P] COG4148 ABC-type molybdate transport system, ATPase component --|---------|---|-||------|||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [P] COG4149 ABC-type molybdate transport system, permease component ------------------------------------------|||||-|----------|-||--- 1 [P] COG4150 ABC-type sulfate transport system, periplasmic component ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [E] COG4161 ABC-type arginine transport system, ATPase component ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [V] COG4167 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [V] COG4168 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [V] COG4170 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [V] COG4171 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component ------------------------------------------|||||-||-----|||-||||--- 1 [R] COG4174 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ------------------------------------------|||||-||-----|---||-||-- 1 [Q] COG4181 Predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, ATPase component ----------------------------------------------|-|--|-------------- 1 [T] COG4192 Signal transduction histidine kinase regulating phosphoglycerate transport system ------------------------------------------|||||-||-----|-----|-|-- 1 [H] COG4206 Outer membrane cobalamin receptor protein ------------------||-------||--------|----|||||-||--||||---|||||-- 1 [P] COG4208 ABC-type sulfate transport system, permease component --------------------|---|-----------------|||||-|-||-------------- 1 [G] COG4211 ABC-type glucose/galactose transport system, permease component ---|---------||---||||----|||--|-|||------|||-|-||||||||||||||---- 1 [R] COG4221 Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity ----------------------||------------------|||||-||||||||--|----|-- 1 [OC] COG4232 Thiol:disulfide interchange protein ------------------------------------------|||||-|-------------|--- 1 [M] COG4238 Murein lipoprotein -------------------------|----------------|||||-||-----|||-||||--- 1 [R] COG4239 ABC-type uncharacterized transport system, permease component -------------------|----------------|-----------|----------------- 1 [R] COG4326 Sporulation control protein -------------------|-----------------|----------|------|---------- 1 [S] COG4327 Predicted membrane protein -------------------|----------------------------|--------------|-- 1 [S] COG4337 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|----------------------------|--------------|-- 1 [S] COG4338 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|----------------------------|--------------|-- 1 [S] COG4340 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|---------|-|||-|----------||-----|---------- 1 [S] COG4392 Predicted membrane protein ------------------------------------------------||-----|---||||||| 1 [S] COG4395 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|------|------------|-|--|-------------- 1 [G] COG4409 Neuraminidase (sialidase) ------------------------------|-----|-----------|----------------- 1 [S] COG4412 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|--------------------------|-||---------------- 1 [FJ] COG4445 Hydroxylase for synthesis of 2-methylthio-cis-ribozeatin in tRNA ------------------||----------------------------|----------------- 1 [S] COG4446 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------------||---------||----- 1 [C] COG4459 Periplasmic nitrate reductase system, NapE component --------------------------------------------|---|-|--------------- 1 [S] COG4518 Mu-like prophage FluMu protein gp41 ---------------------------------------------|--||---------------- 1 [S] COG4519 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||-------|||---- 1 [P] COG4531 ABC-type Zn2+ transport system, periplasmic component/surface adhesin ------------------------------------------||||||||||||||---------- 1 [P] COG4535 Putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC ----------------------------------|-------|||||-||||---|----|||||| 1 [P] COG4536 Putative Mg2+ and Co2+ transporter CorB ---------------------|----|----------------|||--||-|-------||-|--- 1 [P] COG4558 ABC-type hemin transport system, periplasmic component ---------------------|----|----------------|||--||---------||-|--- 1 [P] COG4559 ABC-type hemin transport system, ATPase component ------------------------------------------------|------|---|-|---- 1 [T] COG4564 Signal transduction histidine kinase ------------------------------------------|||||-||---------------- 1 [K] COG4568 Transcriptional antiterminator ------------------------------------------|||||-|------|---------- 1 [G] COG4580 Maltoporin (phage lambda and maltose receptor) ------------------------------------------|||||-|------|---------- 1 [S] COG4582 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------||---|---------|-|----- 1 [R] COG4588 Accessory colonization factor AcfC, contains ABC-type periplasmic domain --------------------|---------------------||||--||-|--------|----- 1 [R] COG4589 Predicted CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase ---------------------------------------------|--||---------------- 1 [R] COG4590 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ------------------------------------------|||||-||---------------- 1 [P] COG4592 ABC-type Fe2+-enterobactin transport system, periplasmic component -------------------|----------------------|||---|----------||||--- 1 [E] COG4597 ABC-type amino acid transport system, permease component ------------------------------------------|||||-||---------||-|--- 1 [E] COG4598 ABC-type histidine transport system, ATPase component --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 1 [P] COG4604 ABC-type enterochelin transport system, ATPase component --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 1 [P] COG4605 ABC-type enterochelin transport system, permease component --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 1 [P] COG4606 ABC-type enterochelin transport system, permease component --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 1 [P] COG4607 ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component ------------------------------------------|||||-||||-------------- 1 [M] COG4623 Predicted soluble lytic transglycosylase fused to an ABC-type amino acid-binding protein --|----------------------------|----------|||||-|--|----------|--- 1 [CH] COG4635 Flavodoxin ------------------------------------------------|----------||||--- 1 [S] COG4645 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||--|--|----|||--- 1 [P] COG4651 Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component --|--------------|--|---||---------|------||||||||||-------------- 1 [C] COG4656 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC --|--------------|--|---------------------||||||||||-------------- 1 [C] COG4657 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfA --|--------------|--|---|-----------------||||||||||-------------- 1 [C] COG4658 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfD --|--------------|--|---------------------||||||||||-------------- 1 [C] COG4659 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfG --|--------------|--|---------------------||||||||||-------------- 1 [C] COG4660 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfE |---------|-------------------------------------|------|--|------- 1 [H] COG4662 ABC-type tungstate transport system, periplasmic component ------------------||----------------------------|----------||||--- 1 [Q] COG4664 TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system, large permease component ------------------||----------------------------|----------||||--- 1 [Q] COG4665 TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system, small permease component --------------------|-----|---|-----------|||||-|--|-------------- 1 [R] COG4667 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily ---------------------------------------------|--|-||-------------- 1 [S] COG4701 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||---------------|-|--------------------------|--------------|-- 1 [S] COG4715 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------------|-----|||||-|-||-- 1 [O] COG4736 Cbb3-type cytochrome oxidase, subunit 3 ------------------------------------------|||||-||--------||------ 1 [P] COG4771 Outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins -------------||-||||||||||----------------|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87 ------------------------------------------|||||||-||-------------- 1 [K] COG4776 Exoribonuclease II --------------------------|---------------|||||-||---------|------ 1 [P] COG4779 ABC-type enterobactin transport system, permease component ----------------|-||----------------------|||||-||--|--|-----|||-- 1 [R] COG4783 Putative Zn-dependent protease, contains TPR repeats ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [R] COG4785 Lipoprotein NlpI, contains TPR repeats ----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||-- 1 [N] COG4786 Flagellar basal body rod protein ------------------------------------------||||||||-----|---------- 1 [N] COG4787 Flagellar basal body rod protein ------------------------------------------|||||-|||||--|-------|-- 1 [U] COG4795 Type II secretory pathway, component PulJ ----------------||||----------------------|||||-||||||||---------- 1 [U] COG4796 Type II secretory pathway, component HofQ --------------------|---------------------------|------|---------- 1 [S] COG4874 Uncharacterized protein conserved in bacteria containing a pentein-type domain ----------------------------------------------|-|------------|---- 1 [S] COG4890 Predicted outer membrane lipoprotein ----------|------------------------|------------|----------------- 1 [S] COG4938 Uncharacterized conserved protein --------------------|---------------------|||||-|||||||----|||||-- 1 [D] COG4942 Membrane-bound metallopeptidase ------------------------------------------|||||-||--||||---------- 1 [NU] COG4967 Tfp pilus assembly protein PilV ------------------------------------------------||--||||---------- 1 [NU] COG4968 Tfp pilus assembly protein PilE ----------------|-------------------------|||||-||||||||---------- 1 [NU] COG4969 Tfp pilus assembly protein, major pilin PilA ------------------------------------------------||--||||------|--- 1 [NU] COG4970 Tfp pilus assembly protein FimT ------------------||-|--------------------------||--||||---------- 1 [NU] COG4972 Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 1 [L] COG4973 Site-specific recombinase XerC --------------------|---|-|||||---||||----|||||-||||||||---||||||| 1 [L] COG4974 Site-specific recombinase XerD ---------------------------------------------|--||---------------- 1 [P] COG4985 ABC-type phosphate transport system, auxiliary component -------------------------------|--||||----|||||-|-||-------|-|-|-- 1 [CO] COG4987 ABC-type transport system involved in cytochrome bd biosynthesis, fused ATPase and permease components --------------------|-----|||--||-||||----|||||-|-||-------|-|-|-- 1 [CO] COG4988 ABC-type transport system involved in cytochrome bd biosynthesis, ATPase and permease components ------------------------------|--|||||----|||||-|----------|--|--- 1 [R] COG4989 Predicted oxidoreductase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase ------------------------------------------|||||-|----------------- 1 [T] COG4999 Uncharacterized domain of BarA-like signal transduction histidine kinases ---------------------|----|---------------|||||-||-----|------||-- 1 [R] COG5006 Predicted permease, DMT superfamily ------------------------------------------||||||||||||||---------- 1 [K] COG5007 Predicted transcriptional regulator, BolA superfamily ------------------------------------------------||--||||---------- 1 [NU] COG5008 Tfp pilus assembly protein, ATPase PilU ----------------|-------||----------------|||||-||||||||---||||||| 1 [M] COG5009 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein ---------------------|--------------------|||||-|-||-||----------- 1 [S] COG5339 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------------||--|------------- 1 [O] COG5380 Lipase chaperone ----------------||-------|--------||||----|||||||||||--||||||||||| 1 [O] COG5405 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), peptidase subunit ------------------------------------------------|----------||||--- 1 [S] COG5453 Uncharacterized conserved protein ------------------||----------------------------|----------------- 1 [S] COG5474 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------------|-----------|--|-- 1 [S] COG5589 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------------|------|-----|---- 1 [S] COG5591 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------------|-||-------------| 1 [R] COG5595 Zn-ribbon-containing, possibly nucleic-acid-binding protein ------------------------------------------------|-----------|-|--- 1 [S] COG5616 Predicted integral membrane protein ---------------------|-----||-------------------|----------|------ 1 [R] COG5621 Predicted secreted hydrolase ------------------------------------------|||||-|-||-------------- 1 [R] COG5633 Predicted periplasmic lipoprotein