(order) Xanthomonadales - 1 genome Functional categories Fun All J A K L B D Y V T M N Z W U O C G E F H I P Q R S COGs 1,309 131 1 61 90 -  23 -  15 38 95 31 -  1 71 73 82 63 112 44 81 37 59 14 149 148 proteins 1,806 142 1 107 146 -  28 -  30 75 145 53 -  3 116 98 101 89 139 46 93 57 77 38 244 191 Distribution of COGs by number of proteins proteins 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 12 13 17 COGs 1045 174 41 21 9 6 3 3 2 2 1 1 1

++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
|||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 17 [L] COG0582 Integrase
|-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 13 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase
|-||--|||----|||-|||-|--||-||-|----|||----|||||-|||||--|||||||||-- 12 [T] COG0784 FOG: CheY-like receiver
--|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 10 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases)
---------------------------------------------------|||------------ 10 [S] COG3792 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  9 [K] COG0583 Transcriptional regulator
----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-||||||||||||||||||  9 [M] COG0845 Membrane-fusion protein
|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  8 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins
|-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||||  8 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators
----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||--  8 [P] COG1629 Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport
||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  7 [M] COG0438 Glycosyltransferase
-------------------|----------|-----------|||||-----|--|------||-|  7 [R] COG3772 Phage-related lysozyme (muraminidase)
----------------|-------------------------|||||-||||||||----------  7 [NU] COG4969 Tfp pilus assembly protein, major pilin PilA
|-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  6 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  6 [L] COG0550 Topoisomerase IA
--||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-||||||||||||||||||  6 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) 
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  6 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein
----------------||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  6 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain
-------------------------------||--|-------|||---||-|--------|----  6 [K] COG3617 Prophage antirepressor
||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  5 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  5 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily
|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  5 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases
----------------||||||--||||||||--||||----||||||||||||||||||||||||  5 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases
----------------|--||---------------------|||||-||||||||||||||||--  5 [M] COG0810 Periplasmic protein TonB, links inner and outer membranes
--|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  5 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  5 [M] COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase
------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|--  5 [U] COG3210 Large exoproteins involved in heme utilization or adhesion
-------------------|-|-----||--------------|||--||--|--|---|||||--  5 [R] COG3668 Plasmid stabilization system protein
||||---||----------|-------||--|||||--|||-|||-|-|||||||||||-||-|-|  4 [V] COG0286 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit
--|----------||-|-||-|----||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  4 [S] COG0316 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  4 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases
|||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-|||||||||||||||  4 [R] COG0457 FOG: TPR repeat
||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  4 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases
|||-----||-|-||-|---||-----||||--|||||----||-||-||--|--|---|||-|-|  4 [R] COG0655 Multimeric flavodoxin WrbA
---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||--  4 [C] COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases)
--|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||--  4 [G] COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase
||||-|-||----------|-------||--|||||--|||||||-|-|||||---|||-||-|-|  4 [V] COG0732 Restriction endonuclease S subunits
----------------||||----||----||||-|||----||||||||||||||||||||||||  4 [M] COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains)
----------------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  4 [U] COG0848 Biopolymer transport protein
-|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||--  4 [L] COG0863 DNA modification methylase
--|-||----|||||---||------||||-||||-||----|||-|--|--|||||||||||---  4 [R] COG1064 Zn-dependent alcohol dehydrogenases
||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--||||||||||||||  4 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning
----||---------------|----|||-----||------|||||-||--|||||||||-||--  4 [S] COG2353 Uncharacterized conserved protein
----------------|-||-------------------------|--||--||||---||-||--  4 [Q] COG2931 RTX toxins and related Ca2+-binding proteins
------------------------------------------|||||--|--|-------------  4 [NU] COG3539 P pilus assembly protein, pilin FimA
---------------------------------------------|----|-|--|----|--|--  4 [K] COG3636 Predicted transcriptional regulator
-------------------|-------------------------|----|-|--|----|--|--  4 [S] COG3657 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------------||--||||------|---  4 [NU] COG4970 Tfp pilus assembly protein FimT
-------------------|---------------|------|||-|-----|--|----------  4 [R] COG5525 Bacteriophage tail assembly protein
--||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  3 [E] COG0031 Cysteine synthase
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  3 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I
-||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||--  3 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes
|||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--||||||||||||||||||||||||  3 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type)
-------------|||--||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  3 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains
---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  3 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes
|||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||  3 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases
|||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  3 [R] COG0517 FOG: CBS domain
||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---|||||||  3 [E] COG0531 Amino acid transporters
--||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|-----  3 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family
|-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-||||  3 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase
||||---||----------|-----------||-||--|||-------||||||--|||-||-|-|  3 [V] COG0610 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases
-||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||--  3 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid)
----------------||||||||------||||||||----||||||||||||||||||||||||  3 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases
----||----------||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein
----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-||||||||||||||||||  3 [M] COG0793 Periplasmic protease
|-|------|------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  3 [U] COG0811 Biopolymer transport proteins
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  3 [G] COG1109 Phosphomannomutase
--||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-||||  3 [C] COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters
--||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|---  3 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases
-----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---|||||||  3 [G] COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases
||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--||||||||||||||  3 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators
---|||||--|||||---|-||------------|-||-----------|--|------|---|-|  3 [E] COG1506 Dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases
|||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||--  3 [K] COG1846 Transcriptional regulators
----------------||||-|--|-|||||---||||----|||||-||--|--|---|||||--  3 [T] COG2199 FOG: GGDEF domain
------||-----||--|-|----------|-----||--------------|--|----------  3 [G] COG2730 Endoglucanase
----------------|--||-||||-||-------------||||||||||||||||||||||||  3 [M] COG2885 Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins
------------------------------------------|||||||-|||--|----------  3 [R] COG2916 DNA-binding protein H-NS
--------------------|----------||-|--------|--|--||||||----|||||--  3 [K] COG2932 Predicted transcriptional regulator
----------------------------------------------------|--|||-|||||||  3 [U] COG2948 Type IV secretory pathway, VirB10 components
-------------------------------------------------|--|-||----------  3 [NU] COG3419 Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1
----------------------------------------------------|--|||-|||||||  3 [U] COG3504 Type IV secretory pathway, VirB9 components
--------------------------|----|------|-------------|--------|-|--  3 [S] COG3600 Uncharacterized phage-associated protein
------------------------------------------|---------|---------|---  3 [S] COG3756 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|----------------------------|--|--|---|--|---  3 [S] COG4625 Uncharacterized protein with a C-terminal OMP (outer membrane protein) domain
-------------------|-------------|---------||||---|-|-------------  3 [S] COG4679 Phage-related protein
--------------------------|-------------------------|----------|--  3 [S] COG4805 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-----------------|----------------|-----||||---||||||----|||---  3 [UW] COG5295 Autotransporter adhesin
-------------------------------------------||-|-----|--|----------  3 [R] COG5511 Bacteriophage capsid protein
-------------------|-----------------------||-|-----|-------------  3 [S] COG5606 Uncharacterized conserved small protein
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control
---------|---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0073 EMAP domain
|||---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0084 Mg-dependent DNase
||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase
|||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A)
--|----------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein
---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family
------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-||||||||||||  2 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase
|-||------||-||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain
------------------||-|----||||-||||||||||||||||-||||||||---|||||-|  2 [L] COG0266 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase
--||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||--  2 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases
---|---------|||--||----------------------||||||||||||||---|||||||  2 [O] COG0278 Glutaredoxin-related protein
-------------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase
|||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||--  2 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs
----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-|  2 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases
|-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--||||||||  2 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II
----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III
-|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------|  2 [L] COG0338 Site-specific DNA methylase
-------------||---||-|----|---------------|||||-||||||||---|||||--  2 [E] COG0339 Zn-dependent oligopeptidases
|-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  2 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases
--|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase
|-||||--|-|||||||-||-|-----||--|--||||----|||||-||-||--||-||||||--  2 [I] COG0365 Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases
-------------|||--|-|-----|---|||||||||---|||||--|--||||-------|--  2 [O] COG0386 Glutathione peroxidase
|-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||--  2 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase
|||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-|  2 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases
||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-||  2 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase
|||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||||  2 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase
|||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||--  2 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II
||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain
|||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||--  2 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0527 Aspartokinases
|------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||  2 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit
-------------||---||-||||-|---------------||||||||||||||-------|--  2 [O] COG0545 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 1
-------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation
|-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [P] COG0605 Superoxide dismutase
-------------|||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase
-|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases
-------------||---||------------||--------|||||-||||||||---|||||||  2 [O] COG0625 Glutathione S-transferase
||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0628 Predicted permease
|||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||--  2 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators
-------------||---||-|----|||-----|-||----|||||-||-|||||---|||||||  2 [HC] COG0654 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases
--|--|--|--|-||--|||-|--|-|||||||-||-|----|||||-||--|--|---||-||--  2 [I] COG0657 Esterase/lipase
|||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--||||||||  2 [R] COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily
|||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--||||||||||||||  2 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel
||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-|||||||  2 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase
-|||||||-|||----||||-|---|-||-------------|||-|-----|---||--------  2 [L] COG0675 Transposase and inactivated derivatives
|-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  2 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily
---|---------||-|-||-|----|----|--||||----|||||-|||-|--|---|||||--  2 [MG] COG0702 Predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerases
|-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0708 Exonuclease III
|||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||--  2 [O] COG0719 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component
-|||--|||-||------||-|---------||---------|||||-||--|--||||-|-|---  2 [R] COG0727 Predicted Fe-S-cluster oxidoreductase
--|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||--  2 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins
-------------|----------------------|-----|||-|---|-|||-|||--|-|--  2 [G] COG0738 Fucose permease
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases
-----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [M] COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)
-------------|||||||||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  2 [Q] COG0767 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase
------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||--  2 [M] COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins)
-----------------|||||||||----------------|||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG0795 Predicted permeases
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  2 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase
----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  2 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II
------------------||----------------------|||||--|--||||||-|||||--  2 [G] COG0837 Glucokinase
----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases
---|---------||-----||----|||-----|-||----||||||||--||||---|||||--  2 [C] COG1018 Flavodoxin reductases (ferredoxin-NADPH reductases) family 1
--||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||--  2 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily
-|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||---  2 [R] COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  2 [Q] COG1127 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component
|-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||--  2 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component
--||--||--||-|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components
----------------||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases
||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-||||||||||||||  2 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component
||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  2 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes
---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---|||||||  2 [K] COG1278 Cold shock proteins
----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||--  2 [O] COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family
|-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||--  2 [K] COG1309 Transcriptional regulator
||||--|||-------|---||----|---|-------||--|||||-||--||||||||||||-|  2 [R] COG1451 Predicted metal-dependent hydrolase
----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||--  2 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  2 [Q] COG1463 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, periplasmic component
-||---|||-||------||-|-----||-----------------|---|-|--|---||-||-|  2 [R] COG1487 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain
----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-|||||||  2 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes
||||--|||--------|---|---|-|||------|-----|||||-||--|--|-------|||  2 [S] COG1520 FOG: WD40-like repeat
---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---|||||||  2 [J] COG1530 Ribonucleases G and E
--------------------|-||--||||------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1560 Lauroyl/myristoyl acyltransferase
||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG1605 Chorismate mutase
-------------|||-----|--|||---------------|||||-||||||||---|||||--  2 [L] COG1643 HrpA-like helicases
------|||-------|-|||---------|-----|-----|||||--|--||||---|||||--  2 [M] COG1807 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family
--||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components
--|----------------|||----||||-||||||------||-|--||-||||---|||||-|  2 [I] COG1835 Predicted acyltransferases
-----------------|----||--||||------||----------||--|--|----------  2 [T] COG1875 Predicted ATPase related to phosphate starvation-inducible protein PhoH
-----||---|-------||-|----|||-|-||||||----|||||-||--|--|---|||||--  2 [L] COG1961 Site-specific recombinases, DNA invertase Pin homologs
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  2 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis
|-||---------||------|----||||----||-------------|||||||------||--  2 [E] COG2021 Homoserine acetyltransferase
---|---------||---||-|----|||||-----||-----------|--|--|--||||||--  2 [Q] COG2124 Cytochrome P450
---|------|--||-|--|------|||-------||----|||||--|||||||--||||||--  2 [Q] COG2132 Putative multicopper oxidases
----------|-------||-|---|-|||-------|----|||-|--|--|--|---||-||--  2 [G] COG2133 Glucose/sorbosone dehydrogenases
----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||--  2 [NU] COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG
------------------||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||--  2 [TK] COG2197 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain
----------------|-||-|---||||||----|||----|||||-||--|--|---|||||||  2 [T] COG2200 FOG: EAL domain
|-||----|-----|-||||-|||-||||||----|||----|||||-||--|--|--||||||--  2 [T] COG2202 FOG: PAS/PAC domain
----------------|---|-||||-----------|----|||||-||-|||||||||||||||  2 [T] COG2204 Response regulator containing CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains
---|---------|||-|||-|--||----|---------|||||-|-||--|||-||||||||--  2 [O] COG2214 DnaJ-class molecular chaperone
||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--|  2 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold
|-||--||||---||-|--|-------||-|-----||----|||-|-||--|----------|--  2 [R] COG2234 Predicted aminopeptidases
|----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----|||||||  2 [P] COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)
------------------||----------||-|--||||||-||||-||--||||----|-||--  2 [V] COG2274 ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain
-------------------|-|-----||-|---||||----|||-------|||----|||---|  2 [T] COG2337 Growth inhibitor
-|-------------------|-------------|--------|-----|-|||-----------  2 [S] COG2369 Uncharacterized protein, homolog of phage Mu protein gp30
---|||---|||-----|---|------------|-------|||||-||--|--|--|||||---  2 [R] COG2391 Predicted transporter component
-|--||-|---|-------|-------||-----------------------|-------------  2 [L] COG2452 Predicted site-specific integrase-resolvase
||||--|||||||-|--|------------------------|||||-||--||||||||||||--  2 [O] COG2518 Protein-L-isoaspartate carboxylmethyltransferase
----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||--  2 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB
--------------------------|||--|--||||----|||||--||||--||||||-|---  2 [G] COG2814 Arabinose efflux permease
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors
------------------||--------------------------|-|---|||-----||-|--  2 [S] COG2929 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|----------------------|||-|-|---||||---||----|  2 [K] COG2944 Predicted transcriptional regulator
-------------------||-----|---------------|||---|||-|-------|-||--  2 [R] COG3093 Plasmid maintenance system antidote protein
------------------||----------------------|||||-||--||||------|---  2 [NU] COG3166 Tfp pilus assembly protein PilN
-----------------------------------||-----|-||----|-|-|-----------  2 [S] COG3299 Uncharacterized homolog of phage Mu protein gp47
-----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-|||||||  2 [M] COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes
---|-------|-------|------|||--||--|-------|||------|--|----------  2 [R] COG3378 Predicted ATPase
----||-----|-|-------|------------|-|---------|--|-||--|---|||||--  2 [G] COG3386 Gluconolactonase
-------------------|-----------------------||||--|--|--|---|--|---  2 [R] COG3497 Phage tail sheath protein FI
-------------------------------------------||-|--|--|--|----------  2 [R] COG3498 Phage tail tube protein FII
-------------------------------------------||-|--|--|--|---|------  2 [R] COG3499 Phage protein U
-------------------|----------------------|||-|--|--|--|---|--|---  2 [R] COG3500 Phage protein D
-------------------|----------|---------------|-----|--|||-||-|-||  2 [U] COG3505 Type IV secretory pathway, VirD4 components
---------------------------------------------||-----|||----||-|---  2 [S] COG3514 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|----------------------------|-|-|-------|-|---  2 [R] COG3549 Plasmid maintenance system killer protein
-------------------|--------------------------|--|--|--|-----||---  2 [O] COG3555 Aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase and related dioxygenases
-----------------------------------|--------------|-|---------|---  2 [S] COG3566 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------------------------|--------------|-|---------|---  2 [S] COG3567 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|-------------------------||--|--|--|------|---  2 [R] COG3628 Phage baseplate assembly protein W
-----------|-----|---------------|------------------|----------|--  2 [G] COG3669 Alpha-L-fucosidase
----------------------------------------------------|--|---|--||--  2 [U] COG3701 Type IV secretory pathway, TrbF components
-------------------------------------------------|--|----------|--  2 [P] COG3746 Phosphate-selective porin
----------------------------------------------------|--|---||-||||  2 [U] COG3838 Type IV secretory pathway, VirB2 components (pilins)
----------------------------------------------------|--|||-|--|---  2 [U] COG3846 Type IV secretory pathway, TrbL components
-------------------------------------------------|--|--|---|||----  2 [U] COG3946 Type IV secretory pathway, VirJ component
----------------------------------------------|--|--|--|----------  2 [R] COG3948 Phage-related baseplate assembly protein
----------------------------------------------|--|--|------|------  2 [R] COG3972 Superfamily I DNA and RNA helicases
------------------------------------------|||||-||-|||||----------  2 [R] COG4137 ABC-type uncharacterized transport system, permease component
------------------------------------------|||-------|------|------  2 [S] COG4197 Uncharacterized protein conserved in bacteria, prophage-related
------------------------------------------|||-|-----|------|------  2 [L] COG4220 Phage DNA packaging protein, Nu1 subunit of terminase
---|---------||---||||----|||--|-|||------|||-|-||||||||||||||----  2 [R] COG4221 Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity
----------------------------------------------|--|--|--|---|------  2 [R] COG4385 Bacteriophage P2-related tail formation protein
------------------|---------------------------|---|-|-------|-||--  2 [S] COG4456 Virulence-associated protein and related proteins
---------------------------------------------||--|--|--|----------  2 [R] COG4540 Phage P2 baseplate assembly protein gpV
-------------------------------------------||||-----|--|----------  2 [S] COG4643 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------------------------|--||||----------  2 [NU] COG4726 Tfp pilus assembly protein PilX
-----------------------------------|----------------|---------|---  2 [S] COG4834 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------------------------|--||||----------  2 [NU] COG4966 Tfp pilus assembly protein PilW
------------------------------------------|||||-||--||||----------  2 [NU] COG4967 Tfp pilus assembly protein PilV
------------------------------------------------||--||||----------  2 [NU] COG4968 Tfp pilus assembly protein PilE
----------------------------------------------|--|--|--|----------  2 [R] COG5004 P2-like prophage tail protein X
------------------------------||---|-------||-|-----|-------------  2 [S] COG5283 Phage-related tail protein
----------------------------------------------------|--|---|--|---  2 [U] COG5314 Conjugal transfer/entry exclusion protein
-----------------------------------|-|--------------|------------|  2 [S] COG5410 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|-----------|--------------------|-------------  2 [R] COG5545 Predicted P-loop ATPase and inactivated derivatives
----------------------------------------------------|-------|-|---  2 [R] COG5565 Bacteriophage terminase large (ATPase) subunit and inactivated derivatives
||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||--  1 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||--  1 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase
|||-||--||-|-||-||||-|----|||-||--|||||---|||||--|--||||---|||||--  1 [P] COG0004 Ammonia permease
|||||||||||||||-||||-------||||-||-|||----|--||--|--|------||-|---  1 [F] COG0005 Purine nucleoside phosphorylase
||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||--  1 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---|||||||  1 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5)
|||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||---  1 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase
--|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||--  1 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit
||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||-------------  1 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase
|||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase
-------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0021 Transketolase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase
||||||-|||---|||--||-|----|||--|-||||-----|||||-||-||------|--|---  1 [P] COG0025 NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters
---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||--  1 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase)
|||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase]
---|--||---|----|-|||------||||----|||----|||||-||--||||---||-||--  1 [H] COG0029 Aspartate oxidase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase
-|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase
||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--||||||||  1 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||--  1 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase
||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||--  1 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  1 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0048 Ribosomal protein S12
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0049 Ribosomal protein S7
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0051 Ribosomal protein S10
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase
|||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [G] COG0061 Predicted sugar kinase
|||||||||||||||-||||-|----|||||-----------|||||-||--|--|||||||||--  1 [S] COG0062 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||--  1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase
||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit
|||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit
|||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||--  1 [E] COG0067 Glutamate synthase domain 1
|||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||--  1 [E] COG0069 Glutamate synthase domain 2
|||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||--  1 [E] COG0070 Glutamate synthase domain 3
|||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---|||||||  1 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  1 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit
||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||--  1 [E] COG0077 Prephenate dehydratase
|||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase
|||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0082 Chorismate synthase
-|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||-------  1 [E] COG0083 Homoserine kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11
|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase
|||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase
---|||--|-|||||-|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  1 [O] COG0109 Polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)
|||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||--  1 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase
--||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG0114 Fumarase
-|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||----------  1 [L] COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase
-------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase
|||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases
||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||--  1 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase
|-||--|||---||||--|--|-----||-|-----||-|--|||||-||--|--|---|||||--  1 [L] COG0122 3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0125 Thymidylate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--||||||||  1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase
-|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||--  1 [H] COG0132 Dethiobiotin synthetase
||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase
||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase
||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase
--||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful)
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase
||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase
-|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0148 Enolase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase
--------|-||-||-|-||-|----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||--  1 [P] COG0155 Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)
-|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes
||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||--  1 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain
-|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0164 Ribonuclease HII
||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase
-|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||--  1 [H] COG0171 NAD synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [E] COG0174 Glutamine synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-|||||||||||||||  1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase
|||-|||||||||||-|||||---------------|------------|--|-------|-|---  1 [J] COG0182 Predicted translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17
-|||--|||-|||-----||-|---------------|--||||||||||||||||---|||||--  1 [HJ] COG0189 Glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)
--||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||  1 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase
-------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase
-------------|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0194 Guanylate kinase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0195 Transcription elongation factor
-------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0196 FAD synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY
||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0203 Ribosomal protein L17
-------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase
-------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|---  1 [G] COG0205 6-phosphofructokinase
||||||||||------||||||--||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [D] COG0206 Cell division GTPase
|||-----||---|||----||----||||||||||||-|||||||||||||||||---|||||--  1 [F] COG0207 Thymidylate synthase
---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-|||  1 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit
|-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0211 Ribosomal protein L27
|--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase
--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0216 Protein chain release factor A
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein
-|||--||||---|--||--|---------||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0218 Predicted GTPase
------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||--  1 [J] COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class)
-------------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase
|-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-|||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit
|-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||--  1 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component
-------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0227 Ribosomal protein L28
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0228 Ribosomal protein S16
|-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||--  1 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0230 Ribosomal protein L34
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0233 Ribosome recycling factor
--|----------||-||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10)
||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--||||||  1 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0238 Ribosomal protein S18
-|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation
|-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase
-|--||-------|||--|-|------||-|-----------|||||||||||||||||---||--  1 [E] COG0241 Histidinol phosphatase and related phosphatases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10
----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||--  1 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase
--|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-||||||||||||||||||  1 [FP] COG0248 Exopolyphosphatase
--||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---|||||||  1 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family)
|||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0250 Transcription antiterminator
|||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|----  1 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D
||------||------|||||-||--|||||---||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0254 Ribosomal protein L31
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0257 Ribosomal protein L36
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)
-------------||---||-|-----|||------------|||||-|||-||||---|||||--  1 [H] COG0259 Pyridoxamine-phosphate oxidase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0261 Ribosomal protein L21
--|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-|  1 [H] COG0262 Dihydrofolate reductase
--|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||--  1 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0267 Ribosomal protein L33
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0268 Ribosomal protein S20
||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||--  1 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase
---|---------||---||----------------------||||||||||||||---|||||||  1 [T] COG0271 Stress-induced morphogen (activity unknown)
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II)
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis
----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase)
--||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-|||||||||  1 [C] COG0280 Phosphotransacetylase
--|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [C] COG0281 Malic enzyme
---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---|||||||  1 [F] COG0283 Cytidylate kinase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase
||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase
|--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG0288 Carbonic anhydrase
|||-----||------||||--||--|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3)
-------------|--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0291 Ribosomal protein L35
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0292 Ribosomal protein L20
||||||--||---|||--------||----------------||||||||||||||---|||||||  1 [J] COG0293 23S rRNA methylase
|||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes
--||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN
----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--|||||||||||  1 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0305 Replicative DNA helicase
---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain
--|-||----||-|||--||-|----||||-|||--------|||||-||||||||---|||||--  1 [E] COG0308 Aminopeptidase N
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0313 Predicted methyltransferases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase
---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  1 [H] COG0320 Lipoate synthase
----------|--||---||-|----||||------------||||||||||||||---|||||||  1 [H] COG0321 Lipoate-protein ligase B
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex
--||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---|||||||  1 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase)
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase
--|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold
-------------|||--|||---|||||||----|||----|||||||||||--||||-|-|-||  1 [O] COG0326 Molecular chaperone, HSP90 family
---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0328 Ribonuclease HI
|||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0333 Ribosomal protein L32
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0335 Ribosomal protein L19
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase
----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase
||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD
|||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase
|-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase
|||-----||------||||-|----|||-||---||-----|||||-||||||||---|||||--  1 [E] COG0347 Nitrogen regulatory protein PII
-------------|----||------|||||-----------|||||-|||||------|||||||  1 [J] COG0349 Ribonuclease D
||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-|  1 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase
|||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase
----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
-------------||-|-||-|----||||------------||||||||||||||---|||||||  1 [R] COG0354 Predicted aminomethyltransferase related to GcvT
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit)
--|----------|--|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a
----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0359 Ribosomal protein L9
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0360 Ribosomal protein S6
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1)
-------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||--  1 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase
-------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||--  1 [G] COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase
|||||||||||-||||----------||||||---|||----|||||-||--|-------|-|---  1 [E] COG0367 Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)
-------------|||--||--||----------|-||----||||||||--|||----|-|-|--  1 [P] COG0369 Sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)
|||---|||||-----||||-|--------||--||------|||||-||--|--||||----|--  1 [P] COG0370 Fe2+ transport system protein B
|-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [C] COG0372 Citrate synthase
||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||-------  1 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase
--||----|----|----|--------||--------|----|||||-|---|--|---||-||--  1 [P] COG0376 Catalase (peroxidase I)
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases
||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||--  1 [H] COG0379 Quinolinate synthase
|||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases
||||--||||------||||------|||||---|||-|||||||-|--|--|--|---||||---  1 [S] COG0392 Predicted integral membrane protein
|-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||--  1 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||-||||||||-||-||--|---||||---  1 [G] COG0395 ABC-type sugar transport system, permease component
|||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||--  1 [O] COG0396 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, ATPase component
-------------||---||------|----------|----|||-|-||--|--|---||--|--  1 [S] COG0397 Uncharacterized conserved protein
-------------||---||-|||-------|--||||----|||----|--|------||||-||  1 [R] COG0400 Predicted esterase
|||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||--  1 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||--  1 [E] COG0403 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), N-terminal domain
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--||||---|||||--  1 [E] COG0404 Glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)
----||----||||||--||||----|||-----|-||----|||-|-||--||||||-||-||--  1 [E] COG0405 Gamma-glutamyltransferase
--|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||--  1 [G] COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase
--|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase
-------------||---||----------------------|||||-||--|--|---|||||||  1 [H] COG0408 Coproporphyrinogen III oxidase
---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||--  1 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase
-------------||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||--  1 [H] COG0414 Panthothenate synthetase
-|--|||||||||||-||---|----|---|--|--||----||||||-|--||||||----|---  1 [E] COG0421 Spermidine synthase
||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||--  1 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC
--|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation
|||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
|||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [I] COG0439 Biotin carboxylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0443 Molecular chaperone
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division
||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains
|||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--|||||||||||  1 [O] COG0450 Peroxiredoxin
|||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase
||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||--  1 [R] COG0456 Acetyltransferases
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  1 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family)
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase
|||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|  1 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases
--|----------||-||--||||||----|-----||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase
-|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||--  1 [G] COG0469 Pyruvate kinase
|||||||||||||||||||||||||-||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication
||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||----  1 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters
|||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-||||||||||||||  1 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components
|-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA
-------------||-||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain
||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--||||||||  1 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0486 Predicted GTPase
||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning
||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0492 Thioredoxin reductase
--|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||||  1 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase
||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||--  1 [R] COG0496 Predicted acid phosphatase
----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0498 Threonine synthase
|||||||||||||||-||||------||||-------------------|--|--|---|||||--  1 [H] COG0499 S-adenosylhomocysteine hydrolase
|||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||--  1 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase)
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  1 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit
-|-----------||----|-|||-|-||-||||||||-|--|||||||||||||---|||||---  1 [L] COG0507 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member
---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||--  1 [E] COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding)
|||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein
--|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||--  1 [L] COG0514 Superfamily II DNA helicase
---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|---  1 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit
|-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||--  1 [E] COG0520 Selenocysteine lyase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins
--|----------||-|-||||----|||-----|-||----|||||-||--||||||-|||||--  1 [R] COG0523 Putative GTPases (G3E family)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0528 Uridylate kinase
-------||---|||-|-|--|-----||-|-----||----||||||||--|--|--|-||||--  1 [P] COG0529 Adenylylsulfate kinase and related kinases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity
||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||--  1 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0536 Predicted GTPase
|||||||||-|||||||-||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases
-------------||-||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0539 Ribosomal protein S1
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||--  1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)
|-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||--  1 [R] COG0546 Predicted phosphatases
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-|  1 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase
|||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||-------  1 [L] COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase
---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||--  1 [C] COG0554 Glycerol kinase
||||||||||||------||-|-----||-|------|----|||||-||||||||---|||||--  1 [O] COG0555 ABC-type sulfate transport system, permease component
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex
---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [K] COG0557 Exoribonuclease R
|-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase
|||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase
--||--|||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases
||||||--||-||-----||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-|  1 [J] COG0565 rRNA methylase
--------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [J] COG0566 rRNA methylases
-------------||------|||--||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  1 [C] COG0567 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, and related enzymes
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||--  1 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component
|||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--||||||||||||||  1 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)
---|||-----|-|||--|--|---|||||-|||||||----|||||-|||||--|---||||---  1 [C] COG0578 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase
----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||--  1 [R] COG0579 Predicted dehydrogenase
|-------|--|-|||-||-||---|----||||||||-|||||||||-||||--|---|||||--  1 [G] COG0580 Glycerol uptake facilitator and related permeases (Major Intrinsic Protein Family)
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component
----||-----|------||-|--||||||||--||||----|||||||||||||||||--|||--  1 [S] COG0586 Uncharacterized membrane-associated protein
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit
--|----------||-----|-||||||||||||||------||||||--||||||----||||--  1 [G] COG0588 Phosphoglycerate mutase 1
--|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---|||||||  1 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog)
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0594 RNase P protein component
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase
-||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-|  1 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters
|||-||--||-|-||--||--|----|||--|---|||-------|---||-||||---|||||--  1 [S] COG0599 Uncharacterized homolog of gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit
||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes
|||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase
--||||----||-||-|--|-|----||||-|--||||----|||||-||-||--|---|||||--  1 [CR] COG0604 NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductases
|--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-|  1 [O] COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity
||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease
|||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|--  1 [H] COG0611 Thiamine monophosphate kinase
----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--|||||||||||  1 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases
|||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----||||||||||||||||||||||||  1 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class)
|||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||--  1 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent)
|||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase
--||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases
-||||||||-|||---------------------------------------|---||-|||||||  1 [NU] COG0630 Type IV secretory pathway, VirB11 components, and related ATPases involved in archaeal flagella biosynthesis
-----|-------||-|-||-|||--||||||||||||||||-------|--|--||--|--|---  1 [T] COG0631 Serine/threonine protein phosphatase
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit
----------------||--||----||||||-|||||||||||||||||||||||---|||||--  1 [F] COG0634 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase
----------------|||||||||||||-|||||||||---||||||||||||||||||||||||  1 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases
||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K
--|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||--  1 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase
-|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||--  1 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases
--||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||--  1 [NT] COG0643 Chemotaxis protein histidine kinase and related kinases
|||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||--  1 [C] COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins)
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7
|-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)
----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-|  1 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein
|-||||-----|-||---||-------||||------|----|||||-||-|||||---|||||||  1 [R] COG0661 Predicted unusual protein kinase
|||---||||------|||||------||-------||----|||||-||--||||||-|||||--  1 [G] COG0662 Mannose-6-phosphate isomerase
-------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases
--|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating)
----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-||||  1 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat
----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase
-------------|------------|---------------|||||-|||||-------------  1 [G] COG0676 Uncharacterized enzymes related to aldose 1-epimerase
||----||--|------|------------|---|-------|||||-||-||--|---||-|---  1 [M] COG0677 UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase
||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--||||||||  1 [R] COG0679 Predicted permeases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0681 Signal peptidase I
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase
--|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase
||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-||  1 [I] COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase
|---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---|||||||  1 [J] COG0689 RNase PH
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0691 tmRNA-binding protein
-------------|||----||||-|||||-||||||||||||||||||||||||||||||-----  1 [L] COG0692 Uracil DNA glycosylase
-||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||--  1 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase
---|----|----||---||--||----------||||----|||||||||||---||||||||||  1 [O] COG0694 Thioredoxin-like proteins and domains
|-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---|||||||  1 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins
--|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0703 Shikimate kinase
|||||||||||||---||||-|---|||||||||||-||-|||||||-||--|--|---|||||--  1 [P] COG0704 Phosphate uptake regulator
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC
--|------|-|----||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase
--|-------------|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b
-------------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein)
--||||------|---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0713 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)
|||||||||||||---||||-|---||||||---||||----|||||-||--|--|---|||||--  1 [R] COG0714 MoxR-like ATPases
|||-----||---||---|||---|-----||||-||-----|||||||||||--||||-------  1 [C] COG0716 Flavodoxins
|||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-|||||||||||||||||  1 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase
-----------------|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase
-------------||----|-|----|----|-|--------||||||||||||||------||--  1 [E] COG0722 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase
--||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--||||||||||||||  1 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein
----------------|||||||||||||||-----------||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
----------------|---|---------------------|||||-||||||||---|||||--  1 [M] COG0729 Outer membrane protein
|||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [R] COG0730 Predicted permeases
-----------------|||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase
----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|--  1 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase
-------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit
--|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [O] COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component
-------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-|||||||  1 [F] COG0756 dUTPase
-----------------|||||----|||||-----||-------|-||||||--|||||||||--  1 [E] COG0757 3-dehydroquinate dehydratase II
----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-|  1 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake
----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||-  1 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein
----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||--  1 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0763 Lipid A disaccharide synthetase
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase
|||------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase
----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit
|||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [C] COG0778 Nitroreductase
----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------|-|---||||-------------||-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0781 Transcription termination factor
-----------------|---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0782 Transcription elongation factor
---|--------------||||--|||----|||||||-|--|||||-|||||--|||||-|-|||  1 [P] COG0783 DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)
--------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0787 Alanine racemase
---|------------|-||-|----|||-------||----|||-|-|||||--|||||||-|--  1 [F] COG0788 Formyltetrahydrofolate hydrolase
--|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators
----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||--  1 [L] COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase
|||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation
----------------|-||----||----|-----------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0797 Lipoproteins
----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [S] COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein
-----------------|||----|-----||||--||----|||||-||||||||||-|||||--  1 [G] COG0800 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase
----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase
--||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC
----------------||||||--||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing
----------------||||||---|----||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase)
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase
----------------||||||||--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis)
-----------------||||||||-||||------------|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit
-----------------|||-|--------||||||||----|||||-|||||||||||||||---  1 [M] COG0818 Diacylglycerol kinase
----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||--  1 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme
----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||--  1 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis
--|-----|---------||--||------------------|||||-|||||--|||||||||||  1 [U] COG0823 Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system
|-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [R] COG0824 Predicted thioesterase
----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit
----------------|-||--||||----|||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0828 Ribosomal protein S21
--||--|||--------|||----||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||--  1 [NT] COG0835 Chemotaxis signal transduction protein
--||--|||-------||||-|--------|-----------|||||-||--|---||-|||||-|  1 [M] COG0836 Mannose-1-phosphate guanylyltransferase
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0838 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 3 (chain A)
--||||--|--||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0839 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J)
--||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||--  1 [NT] COG0840 Methyl-accepting chemotaxis protein
|-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||--  1 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component
---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  1 [C] COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1
---------|------||--||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [D] COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division
----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||---  1 [D] COG0850 Septum formation inhibitor
------------------||||--------------------||||||||--||||||-||||---  1 [D] COG0851 Septum formation topological specificity factor
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit
----------------||||-|----|||||---||||----|||||--|--||||||||--||--  1 [H] COG0853 Aspartate 1-decarboxylase
----------------|-||----------------------|||||-||--||||||||||||--  1 [H] COG0854 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein
--|---------------||-|-----||||------|----|||||-||--||||||||||||--  1 [P] COG0855 Polyphosphate kinase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A
----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||---||--  1 [M] COG0859 ADP-heptose:LPS heptosyltransferase
----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||--  1 [M] COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase
------------------||-|----|||-|---||||----||||||||||||||||||||||||  1 [P] COG0861 Membrane protein TerC, possibly involved in tellurium resistance
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||--  1 [E] COG1003 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), C-terminal domain
-|||---||--|----|-||------|||---|---||----|||||-||-||--|--||||||||  1 [M] COG1004 Predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG1005 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG1007 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N)
--||||----------|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG1008 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)
--||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--||||||||||||||  1 [CP] COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit
-------------||-|----|----|-------|-||----|||||-||--|--|--|-|-----  1 [C] COG1017 Hemoglobin-like flavoprotein
---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---|||||||  1 [I] COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase
----------------||||-|-----||-|-----------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG1034 NADH dehydrogenase/NADH:ubiquinone oxidoreductase 75 kD subunit (chain G)
----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase
|||||||||||||-------||--|-----------------|||||-|||||||||||-------  1 [O] COG1047 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2
--||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---|||||||  1 [C] COG1048 Aconitase A
------------------||----------------------|||||-||-|||||||||------  1 [C] COG1049 Aconitase B
||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit
------------------||-|||--|----||||||-----||||||||--|--|---|||||||  1 [R] COG1054 Predicted sulfurtransferase
-------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||--  1 [H] COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase
--|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||--  1 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases
----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease
--------------------|-||||-||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains)
--------|----||---||-|----|---|---|-||-|--------||--|--|----------  1 [R] COG1075 Predicted acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold
|---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----|||  1 [D] COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis
--------------------||||-||---||||||||-|||||||||||||||||------||--  1 [G] COG1080 Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria)
-|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-||||||  1 [MG] COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases
|-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||--  1 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase
|-|-----|-------|-||-------||-|-----------|||-|-||--|---||-|-|||--  1 [M] COG1089 GDP-D-mannose dehydratase
----||------------||------||||----||||----|||||--||||-------------  1 [R] COG1090 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase
|-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-||||  1 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase
|||||-||||-|-||||||-|------||||---|---|||||||-|--|--|---|--------|  1 [L] COG1112 Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits
-||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||--  1 [P] COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component
------------------||-------||--------|----|||||-||--||||||||||||--  1 [P] COG1118 ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component
--|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-||||||  1 [GM] COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component
------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component
||||----|||||---|||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component
----------------||||||||||----------------|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component
--|-----|-|-|--------|--------------------|||||-|||||------|||||||  1 [O] COG1138 Cytochrome c biogenesis factor
|||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)
|||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|---  1 [C] COG1145 Ferredoxin
||||||-|||||-----|||-|----|||||-----------|||-|-||--|--|||||||||||  1 [C] COG1146 Ferredoxin
----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||--  1 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase
----------------||--|||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG1158 Transcription termination factor
----------------||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG1159 GTPase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG1160 Predicted GTPases
--|-------------|||||----||||||||||||||||||||||-||||||||------|---  1 [R] COG1162 Predicted GTPases
------------------||-|--------------------|||||-||-||||-|||-------  1 [E] COG1166 Arginine decarboxylase (spermidine biosynthesis)
---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [E] COG1171 Threonine dehydratase
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|---||||---  1 [G] COG1175 ABC-type sugar transport systems, permease components
-------------||-----|---------|---|-||----|||||-|||||||||||-------  1 [H] COG1179 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 1
--|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes
||||----||---||-----|-||-|-||||-----||-----------|--|||||||||||-||  1 [I] COG1183 Phosphatidylserine synthase
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)
-------------||-|||||||||||||||||-||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG1186 Protein chain release factor B
--|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||-----  1 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II)
|--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase
----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------|||||||  1 [L] COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)
-||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||--  1 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases
-----------------|||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase
||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|--  1 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases
----------------||||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [LK] COG1200 RecG-like helicase
----------------||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains)
|||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||--  1 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon)
|-|||||||--||----|||-|----|||||||---||----|||||--|--||||---||-||--  1 [M] COG1209 dTDP-glucose pyrophosphorylase
|||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||--  1 [M] COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase
------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||--  1 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1212 CMP-2-keto-3-deoxyoctulosonic acid synthetase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone
|-|--||||---|-----||-|----|||||-----------|---|--||-|--|---||-||--  1 [R] COG1216 Predicted glycosyltransferases
------------------||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [T] COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response
-------------||-|-||--||--||||------------|||||||||||-----||||||||  1 [P] COG1218 3'-Phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase
-------------|--||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit
----------------||-------|--------||||----|||||||||||--|||||||||||  1 [O] COG1220 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), ATPase subunit
--||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-|  1 [O] COG1225 Peroxiredoxin
--|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||--  1 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component
-||------|------|-------------------------|||||-||||||||--||||||||  1 [S] COG1238 Predicted membrane protein
--||---------||-|||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains
--|-----------|---||--||---||-------||----------||-|||||---|||||--  1 [S] COG1262 Uncharacterized conserved protein
-------------|||----||--|||||-||||||||----|||||-||--|||----|||||--  1 [R] COG1272 Predicted membrane protein, hemolysin III homolog
|-|-||--|||||----||--|----|---------||----|||||-|||||--|--||||||--  1 [E] COG1280 Putative threonine efflux protein
------------------------||-----|||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG1286 Uncharacterized membrane protein, required for colicin V production
------------------|--|------------|||-----|||||-||||||||--|||||---  1 [S] COG1289 Predicted membrane protein
---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--||||||||||||||  1 [C] COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex
--|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1 [S] COG1295 Predicted membrane protein
---|--|------|-------------||--------------------||-||||--|----|--  1 [S] COG1297 Predicted membrane protein
|-|---||||||----||||-|-----||||----|||-----------||||--|---||-||--  1 [E] COG1305 Transglutaminase-like enzymes, putative cysteine proteases
----------------|-|||||||||||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG
|||||||||||||----|---||||-||||||||||||----|||-|-----|---------|---  1 [K] COG1321 Mn-dependent transcriptional regulator
----------------------||-------|||-----|--|||||-||||||||---|||||||  1 [S] COG1322 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|-|-|||||||-|--|||-|-|-|------------------|||||-----|--|--------||  1 [P] COG1324 Uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations
-----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||--  1 [K] COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains
----------------------||-|-||-------------|||||||||||||-----------  1 [L] COG1330 Exonuclease V gamma subunit
--|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||--  1 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase
-||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||--  1 [S] COG1354 Uncharacterized conserved protein
------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---|||||||  1 [L] COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
----------------||||||--||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  1 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-|||||--------|||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||--  1 [K] COG1386 Predicted transcriptional regulator containing the HTH domain
-------------------|||----|--||||||||||-|||||||-||||||||--||||||--  1 [P] COG1393 Arsenate reductase and related proteins, glutaredoxin family
----------------||||-|----||||||||||||----|||||-||||||||----------  1 [R] COG1399 Predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein
---|--------------||-|-----||||||-|||-----|||---|---|--|---|||||--  1 [V] COG1403 Restriction endonuclease
-----------------|||-|----|||||------|----|||||-|||-|--|---|||||--  1 [E] COG1410 Methionine synthase I, cobalamin-binding domain
-----------------||||-||--||||||||||||||||----------|--|||||||||--  1 [K] COG1420 Transcriptional regulator of heat shock gene
-----------------|-|--||||-----|||||||----|||||-|||||--|--------||  1 [S] COG1426 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||-|--||-||------|||----||--------------------------|--|---|||||--  1 [S] COG1430 Uncharacterized conserved protein
----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---|||||||  1 [S] COG1434 Uncharacterized conserved protein
-------------||-----|-||------------------|||||-||||||||----|-|---  1 [E] COG1448 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
----------------|---|-||------------------|||||-||--|--|--|---||--  1 [NU] COG1450 Type II secretory pathway, component PulD
----------------|-------||----------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1452 Organic solvent tolerance protein OstA
--------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit
||||||||||--|----|----------------|-||-----------|--||||----------  1 [S] COG1469 Uncharacterized conserved protein
--|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||--  1 [H] COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis
-------------||------|-----||-------------|||||-||--||||---|||||||  1 [R] COG1485 Predicted ATPase
--|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||---  1 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase
---------|----------|---|-----||||||||||||----------||||---|||||--  1 [T] COG1493 Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism
---------------------|||------------||----|||||-||||||||||||||||||  1 [O] COG1495 Disulfide bond formation protein DsbB
----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--||||||||  1 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein
----------------|-----||||----|----|||----|||||-||--||||||||||||--  1 [K] COG1508 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma54 homolog
-||-------------||--||--|-----------||----|||||-|-|||------||-||--  1 [E] COG1509 Lysine 2,3-aminomutase
---||||||||||-|-||-|-|--------|-----|-----|||||-----|-------------  1 [L] COG1515 Deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V)
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1519 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase
----------------||||||--||-||||----|||-|---------|--|||||||----|--  1 [K] COG1521 Putative transcriptional regulator, homolog of Bvg accessory factor
----|||||--|-|||-|-|------|---|----|-|-----------|--|-----|-|-||--  1 [R] COG1524 Uncharacterized proteins of the AP superfamily
||||--||||-||-------|---------||||||||----|||||-||||||||----------  1 [J] COG1534 Predicted RNA-binding protein containing KH domain, possibly ribosomal protein
----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [MU] COG1538 Outer membrane protein
-------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase
|-|-----|--|-------|||---------------|----|--|--|---|--|----------  1 [H] COG1541 Coenzyme F390 synthetase
----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||||  1 [J] COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1)
---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||--  1 [R] COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced)
-----------------|------||----|-----||----|||||||||||---|||-------  1 [T] COG1551 Carbon storage regulator (could also regulate swarming and quorum sensing)
--|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|-------  1 [L] COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins
----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein
----------------||--|----|----|----|||----|||||-||||||||---|||||--  1 [S] COG1561 Uncharacterized stress-induced protein
|--|-------|-||---||-|----|||-----|-|---------------||||---|||||--  1 [I] COG1562 Phytoene/squalene synthetase
----------------|-||--------------------------------||||||||||||||  1 [S] COG1565 Uncharacterized conserved protein
-|----|||---------||--------------------------------|-------------  1 [R] COG1569 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain
-----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit
-----------------|--||--------||||||||||--|||||-||||||||||||||||--  1 [S] COG1576 Uncharacterized conserved protein
||-|--||-||||----|||||----|||||-----------|||||-||-||------|||||--  1 [OU] COG1585 Membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity
-|--|||||-|||---||------------|-----||----||||||-|--|--|----------  1 [E] COG1586 S-adenosylmethionine decarboxylase
||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||---  1 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase
------------------||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||---|||||||  1 [M] COG1589 Cell division septal protein
-----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||--  1 [K] COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog
----------------||||----------------------|||-|-||-|||||--||||||--  1 [M] COG1596 Periplasmic protein involved in polysaccharide export
-----------------|--||----|||-||||||||-|--|||||-|||||--|---|||||--  1 [K] COG1609 Transcriptional regulators
-------------|---|--------|||-|----|||----------||--||||--|||||---  1 [S] COG1610 Uncharacterized conserved protein
--|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||--  1 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein
---|--------|||-|-||-|----||||----||||-----------|--|--|---|||||||  1 [O] COG1612 Uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly
------------------||-------|||-------|----|||||--|--||||---|||||--  1 [P] COG1613 ABC-type sulfate transport system, periplasmic component
---|----|-||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  1 [C] COG1622 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2
----------------||--|---------|||-|---------------|||||-|||-----||  1 [S] COG1636 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||||||--|||-|||-|---|------||-|---||||----||||||||--|||----|||||--  1 [H] COG1648 Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain)
---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-||||||||||||||||||  1 [O] COG1651 Protein-disulfide isomerase
-------------------|-|--||---------||-----|||-|-||-|||||---|||||--  1 [S] COG1652 Uncharacterized protein containing LysM domain
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||----|||||-||-||--|---||||---  1 [G] COG1653 ABC-type sugar transport system, periplasmic component
--||---||------------|--------||||||||----|||||-|||||-------------  1 [K] COG1654 Biotin operon repressor
--------------------||----||||||||||||----|||||-||||||||----------  1 [R] COG1660 Predicted P-loop-containing kinase
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1663 Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase
----------------------||||----|-----|--------|--||--|--||||----|--  1 [M] COG1664 Integral membrane protein CcmA involved in cell shape determination
||||--|||-|||----|---|--------||-|||||--------------|----------|--  1 [CP] COG1668 ABC-type Na+ efflux pump, permease component
-------------------|-||||||||||||||||||---|||||-||||||||||||||||||  1 [D] COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins
---------------------|||--||||------------|||||-||||||||---|||||||  1 [K] COG1678 Putative transcriptional regulator
--|---||--|-|-----||-|----||||||||||||----|||||--|--|--|---|||||||  1 [V] COG1680 Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins
--|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-||||||  1 [GM] COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component
--------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---|||||||  1 [M] COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase
--|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-|  1 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase
---------||-|---||||-|----||||-|||||||----|||||-||-|||||---|||||--  1 [T] COG1702 Phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase
----------||-||---||-|||--|||||------|--------------|-------------  1 [T] COG1716 FOG: FHA domain
-----------------|-|||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG1722 Exonuclease VII small subunit
----------------|-------------------------|||||-||--||||---|||||||  1 [S] COG1729 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||--  1 [K] COG1733 Predicted transcriptional regulators
----------------|-----||||----|-----||----||||||||||||||--||||||||  1 [T] COG1734 DnaK suppressor protein
-------------||||||-|---|--|||-|----||----|||-|-||--||||---|||||||  1 [R] COG1752 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily
------------------||-|---|||||----------------------|------|||||||  1 [R] COG1754 Uncharacterized C-terminal domain of topoisomerase IA
||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega
----||---------------|----|----|--|||---|||||-|-||--|--|---|||||--  1 [O] COG1764 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation
-------------------|------||||---|--------|||||-||--|------|||||||  1 [E] COG1770 Protease II
||-----||--------||||---|--||-|-----------|||-|--|--||||-------|--  1 [C] COG1773 Rubredoxin
--|-------------|---|---------------------|||||-|||||||||||-------  1 [R] COG1778 Low specificity phosphatase (HAD superfamily)
--||---|-----||--|-|-|----|-------|-||----||||---|--|--|-----|----  1 [P] COG1785 Alkaline phosphatase
-------------||-|--|----------------|------------|--|-------------  1 [S] COG1791 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain
----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----|||  1 [M] COG1792 Cell shape-determining protein
---------------------|------------||||----|||||-||--||||---|||||||  1 [S] COG1806 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------|-----|-|||---||||-||||||||-|--|||||-|||||------|||||--  1 [G] COG1820 N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase
----------------||||-|||||||||----||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc)
|||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||---  1 [C] COG1838 Tartrate dehydratase beta subunit/Fumarate hydratase class I, C-terminal domain
--||------|-|-----|||-----|-----|||--|-----||||-||||||||--|||||---  1 [P] COG1840 ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component
||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----||||||  1 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E
---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  1 [C] COG1845 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3
----------------||--|-||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG1862 Preprotein translocase subunit YajC
------||---------|------------|--|--||-------|------|-------|--|--  1 [G] COG1874 Beta-galactosidase
------------------||----||----||||-|||-------|--|-|||-------------  1 [M] COG1876 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase
|-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--|  1 [R] COG1881 Phospholipid-binding protein
|-----|------------------------|--|||------------|--|-------------  1 [M] COG1887 Putative glycosyl/glycerophosphate transferases involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC
|-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---|||||||  1 [C] COG1894 NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit
|-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||--  1 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes
--||||--|--|-||--|-|||----|||-|||-||||-|--|||||-||--|--|---|||||--  1 [C] COG1902 NADH:flavin oxidoreductases, Old Yellow Enzyme family
|-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---|||||||  1 [C] COG1905 NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit
----||-----|-||----|||----||||||-|||||----|||||--|||||||---||||---  1 [P] COG1914 Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family
||||--||||--------------||--------------------------|-------------  1 [S] COG1916 Uncharacterized homolog of PrgY (pheromone shutdown protein)
|||----|||-------||--|--------||--||------|||||-||--|--|-||----|--  1 [P] COG1918 Fe2+ transport system protein A
-----------------|||-|--|-----|---|||-----|||||-|---|------|-|||--  1 [M] COG1922 Teichoic acid biosynthesis proteins
-|--------------||------------|---||||----|||||-||||||||----||||--  1 [R] COG1923 Uncharacterized host factor I protein
--------------------|||||||---||||||||||||||||||||||||||---|||||--  1 [G] COG1925 Phosphotransferase system, HPr-related proteins
--|----------||----|------||||-|---|||----||||||||||||||--||||||--  1 [HE] COG1932 Phosphoserine aminotransferase
----------------|-||----------------------|||||-||||||||||||||||--  1 [S] COG1934 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|-------|----------|------|----|||||||----||||------|||||||||-||--  1 [R] COG1942 Uncharacterized protein, 4-oxalocrotonate tautomerase homolog
-------------|-|----------||||------------|||||-|||||------|||||--  1 [I] COG1946 Acyl-CoA thioesterase
----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||--  1 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase
-------------||-----------||||------------||||||||||||||----------  1 [A] COG1949 Oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)
|||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||---  1 [C] COG1951 Tartrate dehydratase alpha subunit/Fumarate hydratase class I, N-terminal domain
-|----------------------------------------||||||||||||||---|||||||  1 [U] COG1952 Preprotein translocase subunit SecB
---|||-------|---|------------||||||||----|||||-||-||||-------||--  1 [T] COG1956 GAF domain-containing protein
----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator
|--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||--  1 [V] COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein
--|---------------|-||----||||-||||||-----|||||-|||||--|---|||||--  1 [M] COG1970 Large-conductance mechanosensitive channel
|-|-----------------|-----|---|-----||----|||||--|--|||---|-------  1 [S] COG1971 Predicted membrane protein
-----------------|||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|---|||||--  1 [KT] COG1974 SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidases)
------------------||-----------------------------|--||||||||||||||  1 [S] COG1981 Predicted membrane protein
||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||--  1 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases
----------------|-|||----------------|----|||||-||-|||||||||||||--  1 [H] COG1995 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein
---|------|-|||-|----|--------------||----------||--||||--||||||||  1 [R] COG1999 Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC, involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems
---------------------|--|-|||||---|||||||||||||--|||||||----|--|||  1 [S] COG2001 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--|  1 [L] COG2003 DNA repair proteins
---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--||||||||||||||  1 [C] COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit
--------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component
----------------|-||||----|||||-----||----|||||-||--||||--||||||--  1 [H] COG2022 Uncharacterized enzyme of thiazole biosynthesis
---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||--  1 [C] COG2025 Electron transfer flavoprotein, alpha subunit
--|---------------||-|----||||------|-----|||||-||||||||----------  1 [M] COG2027 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein 4)
--------|-|||---|-||------||||------------|||||-|||||--|--||||||--  1 [T] COG2062 Phosphohistidine phosphatase SixA
----------------|---|---------------------|||||-|||||||-||-|||||--  1 [I] COG2067 Long-chain fatty acid transport protein
--------|----|--||-|||----|||-||||||||-----------|--||||||||||-|--  1 [R] COG2070 Dioxygenases related to 2-nitropropane dioxygenase
||||----||---------|------|----|--------------------|--|---||-|---  1 [R] COG2085 Predicted dinucleotide-binding enzymes
---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||--  1 [C] COG2086 Electron transfer flavoprotein, beta subunit
-------------||---||----------|---|-||----|||-|---|||--|----------  1 [H] COG2091 Phosphopantetheinyl transferase
-||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||--  1 [U] COG2095 Multiple antibiotic transporter
|-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||--  1 [H] COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis
------------------||-|----|||||-----------|||||-||--||||||||||||--  1 [S] COG2127 Uncharacterized conserved protein
||||----||-|-------|-|----||||--||||||-|--|||||--|--|--|---|||||--  1 [C] COG2141 Coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases
----||--|---|--------|-----|||------------|||||-||--||||---|||||||  1 [C] COG2142 Succinate dehydrogenase, hydrophobic anchor subunit
--||||----||--|---||-|----||------|-||----|||||--|--|--|---||-||--  1 [PR] COG2146 Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenases
---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||--  1 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis
|||-||||-||||----|---|----||||-|||||||----|---------|--|---|||||--  1 [R] COG2151 Predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme
---|------||-||-|-||------||||------------------||--|--|----||||--  1 [H] COG2154 Pterin-4a-carbinolamine dehydratase
------------------||-|||---||-------------|||||-|||||------|||||--  1 [R] COG2166 SufE protein probably involved in Fe-S center assembly
---------|-------|--------||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG2171 Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase
-------------------|||----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||--  1 [D] COG2177 Cell division protein
-------------|||---||---|-|---|||||||||---|||||-||||||||---||||---  1 [K] COG2183 Transcriptional accessory protein
---------------------------||----|--------|||-|--||-|||-||-||-|---  1 [D] COG2184 Protein involved in cell division
-----|--|-----------|-----|------|-|--||------|---|||-|-||-|--|---  1 [L] COG2189 Adenine specific DNA methylase Mod
------------------||-------|||------------|||||-||--||||---|||||--  1 [P] COG2193 Bacterioferritin (cytochrome b1)
------------------------------------------|||||-|||||||-||||||--||  1 [R] COG2194 Predicted membrane-associated, metal-dependent hydrolase
--||--|||--------|-|----||----|-----||----|||||-||--|--|--|||-||--  1 [NT] COG2201 Chemotaxis response regulator containing a CheY-like receiver domain and a methylesterase domain
-----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [K] COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins
|-----||-|-------|--||--------|-||-||-----|||||--|--|------|||||--  1 [M] COG2222 Predicted phosphosugar isomerases
--|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis
-------------||---||-|--------------------|||||-||-|||||---|||||||  1 [H] COG2227 2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4-benzoquinol methylase
||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||--  1 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit
-------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||--  1 [L] COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase
-|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||--  1 [R] COG2262 GTPases
----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase
------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase
----------------|-------|-----------------|||||||-|||------||-||--  1 [J] COG2269 Truncated, possibly inactive, lysyl-tRNA synthetase (class II)
---|-----------------|----|---------||----|||||-----|----------|--  1 [S] COG2311 Predicted membrane protein
--|------------------|--------------------|||||-|||||------|||||||  1 [O] COG2332 Cytochrome c-type biogenesis protein CcmE
---|---------------|-|--------||||||||----|||||-||||||||----------  1 [R] COG2333 Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)
------------------||-|--------------------|||||-||--||||--||||||--  1 [O] COG2360 Leu/Phe-tRNA-protein transferase
-----------------|-|||--------------------|||||--|-||--|---||-||||  1 [R] COG2373 Large extracellular alpha-helical protein
---------|--------||-|--------------------|||||-||||||||---|||||--  1 [O] COG2377 Predicted molecular chaperone distantly related to HSP70-fold metalloproteases
--------------------||----|||||---||||----|---|-||--|-||--||||||--  1 [K] COG2378 Predicted transcriptional regulator
--|-----|------------|--------------------|||||-|||||------|||||--  1 [O] COG2386 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component
------|----||-----||-------||-----------------------|-------------  1 [S] COG2442 Uncharacterized conserved protein
----||----|||------|------|||------|||----|||-|-||--||||----|-||--  1 [G] COG2513 PEP phosphonomutase and related enzymes
-|----||-||-|---------------------------------------|-------------  1 [R] COG2521 Predicted archaeal methyltransferase
---------------------|----||||------------||||||||||||||------||--  1 [C] COG2609 Pyruvate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component
------------------------------------------|||||-||--|----------|--  1 [E] COG2716 Glycine cleavage system regulatory protein
--------------------------|||-|-----------|||-|-----|---------|---  1 [S] COG2733 Predicted membrane protein
---|-------|---------|----|---|---||||----------|---|--|---|||||--  1 [Q] COG2761 Predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis
----------------||||||--------|-----------|||||-||--||||----------  1 [NU] COG2805 Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT
-------------|-------|--------------||-----------|--|--|------||--  1 [K] COG2808 Transcriptional regulator
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits
------------------------------------|-----|||---||--||||---||-|---  1 [S] COG2828 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|--  1 [U] COG2831 Hemolysin activation/secretion protein
-|||----|-------|----|--||----|-----||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG2834 Outer membrane lipoprotein-sorting protein
--||------|||-------------||||------------|||||-||-|||||----||||--  1 [S] COG2835 Uncharacterized conserved protein
--------------------------||||------------------||--|||---|-------  1 [C] COG2838 Monomeric isocitrate dehydrogenase
------------------------|-----------------||||||||||||||---|||||--  1 [S] COG2840 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------|-----|||||--|||||||----------  1 [S] COG2850 Uncharacterized conserved protein
--------------------------|-----|-|-||-----------|--|||---|-------  1 [C] COG2851 H+/citrate symporter
--------------------|---------------------|||||-||||||||--|----|||  1 [M] COG2853 Surface lipoprotein
------------------------------------------|||||-||||||||--|----|||  1 [Q] COG2854 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, auxiliary component
-------------------|||---|-||-|--|||||--------------||-|-----|----  1 [E] COG2856 Predicted Zn peptidase
-------------||-|-------------------||----------||--||||||||||||||  1 [C] COG2857 Cytochrome c1
-------------||---------------------------|||||-||-|||||---|||||||  1 [I] COG2867 Oligoketide cyclase/lipid transport protein
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG2877 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (KDO) 8-phosphate synthase
--|--------------|--|---------------------||||||||||||||----------  1 [C] COG2878 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB
-------------------|-|----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||--  1 [D] COG2884 Predicted ATPase involved in cell division
-------------------|----|------|-|||||----|||||-|||||--|----------  1 [M] COG2891 Cell shape-determining protein
--------------------|---------||||-||-----|||||----|||||---|||||--  1 [G] COG2893 Phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA
----------------||||||--------|----|||----||||||||--||||||-||||---  1 [D] COG2894 Septum formation inhibitor-activating ATPase
--------------------------|||-|-----------||||||||--||||---|||||--  1 [P] COG2895 GTPases - Sulfate adenylate transferase subunit 1
--|-----------------------||||-|--|||------------|--|--|---|||||--  1 [S] COG2898 Uncharacterized conserved protein
---------------------|-----|||-|--------------------|------|||----  1 [S] COG2899 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|||||||----||||---  1 [S] COG2900 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||----------  1 [KL] COG2901 Factor for inversion stimulation Fis, transcriptional activator
-------------||------------|||------------------||--|------|||||||  1 [E] COG2902 NAD-specific glutamate dehydrogenase
------------------------------------------|||||-|||||--|--------||  1 [S] COG2904 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------|---------|-------------||-||-||--||||-------|--  1 [P] COG2906 Bacterioferritin-associated ferredoxin
-----------------|------------------------|||||-|||||||||||||-||--  1 [S] COG2908 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||---|||||--  1 [S] COG2911 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|--||------------------|||||||||||--|-------|--  1 [S] COG2912 Uncharacterized conserved protein
------------------------------------------||||||||||||||---|||||||  1 [J] COG2913 Small protein A (tmRNA-binding)
------------------------------------------||||||||||||||----------  1 [S] COG2914 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||||||||-------------  1 [R] COG2915 Uncharacterized protein involved in purine metabolism
------------------------||||||-|||||||----||||||||||||||---|||||||  1 [D] COG2919 Septum formation initiator
------------------------------------------||||||||||||||----------  1 [S] COG2921 Uncharacterized conserved protein
------------------------------------------|||||||---|||-----------  1 [S] COG2922 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||----------  1 [CO] COG2924 Fe-S cluster protector protein
------------------------------------------|||||||||||--|----------  1 [L] COG2925 Exonuclease I
------------------------------------------|||||-||||||||---|||||||  1 [L] COG2927 DNA polymerase III, chi subunit
---|---------------||-||-------------|-----------|--||||---||-|---  1 [S] COG2928 Uncharacterized conserved protein
-------------||--|----------------------------------|--|----------  1 [S] COG2930 Uncharacterized conserved protein
------------------------------------------|||||--||||-------------  1 [R] COG2933 Predicted SAM-dependent methyltransferase
-------------||---------------------------------||--|--|--||||||--  1 [O] COG2935 Putative arginyl-tRNA:protein arginylyltransferase
------------------|--------||--|--||----------------|-------|-||--  1 [R] COG2936 Predicted acyl esterases
---------------------------|||------------|||||-|||||-------------  1 [I] COG2937 Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase
-------------||---------------------------|||||-||||||||---|||||||  1 [S] COG2938 Uncharacterized conserved protein
-------------||------|------------------------------|--|-------|--  1 [E] COG2939 Carboxypeptidase C (cathepsin A)
--|----------|||------||----------------------------|--|------|---  1 [R] COG2940 Proteins containing SET domain
-------------||----------------------------------|--|--|-------|||  1 [H] COG2941 Ubiquinone biosynthesis protein COQ7
------------------||----------------------|||-|-----|--|---|||||--  1 [G] COG2942 N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase
------------------------------------------|||-|-||--|--|-------|--  1 [M] COG2943 Membrane glycosyltransferase
---|----|----------------------------------------|--||||---|||||||  1 [R] COG2945 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily
------------------------------------|-----------|---|||-----------  1 [L] COG2946 Putative phage replication protein RstA
--------------|---||-|---------------------------|--|--|---||||---  1 [S] COG2947 Uncharacterized conserved protein
--------------------------|||-------------|||||-||-|||||---|||||--  1 [M] COG2951 Membrane-bound lytic murein transglycosylase B
------------------||--------------------------------|||----||-|---  1 [S] COG2954 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|-||||||----------  1 [G] COG2956 Predicted N-acetylglucosaminyl transferase
---------------------|---------|-|-----------|---|--|---|||----|--  1 [E] COG2957 Peptidylarginine deiminase and related enzymes
-------------------------------------------------|--|--||||-------  1 [S] COG2958 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||--||||---||||---  1 [S] COG2960 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||||||---|||||-|  1 [R] COG2961 Protein involved in catabolism of external DNA
|------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|-------  1 [S] COG2966 Uncharacterized conserved protein
---------------------|--------------------|||||-||--|--|---|||||--  1 [P] COG2967 Uncharacterized protein affecting Mg2+/Co2+ transport
--||--------------||-------||--------|----|||||-|---|------|||||--  1 [S] COG2968 Uncharacterized conserved protein
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [R] COG2969 Stringent starvation protein B
--------------------|---------|-||||||----------||--|--|----------  1 [T] COG2972 Predicted signal transduction protein with a C-terminal ATPase domain
----------------------|-------------------|||||-|-|||-------------  1 [K] COG2973 Trp operon repressor
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [L] COG2974 DNA recombination-dependent growth factor C
------------------------------------------||||||||||||||----------  1 [S] COG2976 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [M] COG2980 Rare lipoprotein B
------------------------------|--------------|--||--|-------------  1 [S] COG3007 Uncharacterized paraquat-inducible protein B
------------------||--------------|-||-------|--||--|--|------||--  1 [S] COG3011 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [M] COG3017 Outer membrane lipoprotein involved in outer membrane biogenesis
--------------------|---------------------|||||-||||||||---|||||-|  1 [V] COG3023 Negative regulator of beta-lactamase expression
-----------------------|------|---||||----|||||-|||||||----|||||||  1 [S] COG3027 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [S] COG3028 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------|-----------------------|||||-||-||-||---|||||-|  1 [C] COG3038 Cytochrome B561
-------------------|-------------|--------|||-|-|-|-|---||-|------  1 [S] COG3041 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||-||--|---|-|||||  1 [M] COG3047 Outer membrane protein W
---------------------------------------------|--||||||||----------  1 [NU] COG3063 Tfp pilus assembly protein PilF
------------------------------------------|||||-|-|||-------------  1 [M] COG3065 Starvation-inducible outer membrane lipoprotein
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [H] COG3071 Uncharacterized enzyme of heme biosynthesis
------------------------------------------|||||-|||||--|----------  1 [T] COG3073 Negative regulator of sigma E activity
--------------------|-----------||--------|||||-|-|-|------||----|  1 [L] COG3077 DNA-damage-inducible protein J
------------------------------------------|||||-|||||-------------  1 [S] COG3079 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [D] COG3087 Cell division protein
---------------------|--------------------|||||--||||------|||||--  1 [O] COG3088 Uncharacterized protein involved in biosynthesis of c-type cytochromes
-------------|||----------|---||--|||-----|||||-|---|||--------|--  1 [E] COG3104 Dipeptide/tripeptide permease
------------------------------------------|||||-|||||-------------  1 [R] COG3107 Putative lipoprotein
------------------------------------------|||||-|-||||||----------  1 [R] COG3113 Predicted NTP binding protein (contains STAS domain)
------------------------------------------|||||-|||||-------------  1 [D] COG3115 Cell division protein
------------------------------------------|||||||||||--|----------  1 [D] COG3116 Cell division protein
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [S] COG3117 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------||||------------|||||-|||||--|---|||||--  1 [O] COG3118 Thioredoxin domain-containing protein
------------------|--|--------------------|||||--|--|--|---||-|--|  1 [NU] COG3121 P pilus assembly protein, chaperone PapD
------------------------------------------|||||--|--|-------------  1 [S] COG3122 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------------------------||||----||||||-|--|--|---|-|||--  1 [C] COG3125 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 4
------------------------------------------|||----|--|---------||--  1 [S] COG3128 Uncharacterized iron-regulated protein
------------------------------------------|||-|-||--|--|----------  1 [P] COG3131 Periplasmic glucans biosynthesis protein
------------------------------------------|||||--|--|-------------  1 [S] COG3134 Predicted outer membrane lipoprotein
------------------------------------------|||||-|---|-------------  1 [M] COG3137 Putative salt-induced outer membrane protein
--------------------|----------|||-|------|||||-|--||------||-||--  1 [P] COG3142 Uncharacterized protein involved in copper resistance
--------------|----|------||||------------|||-|-||--|--|---|||||--  1 [L] COG3145 Alkylated DNA repair protein
------------------||-----------------------------|--|--|---|||||--  1 [S] COG3146 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||--|--|----------  1 [S] COG3147 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||--|-------------  1 [S] COG3151 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|--|--||--|--|------||--  1 [U] COG3156 Type II secretory pathway, component PulK
--|-----------------------|----||---------|||||-||--|--|---|||||--  1 [P] COG3158 K+ transporter
------------------------------------------|||||-||-||--|-------|--  1 [S] COG3159 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------|----|---------|-----|||||--|--|-------------  1 [S] COG3162 Predicted membrane protein
------------------------------------------|||||-||--|--|----------  1 [S] COG3164 Predicted membrane protein
------------------------------------------|||||-||-|||||----------  1 [S] COG3165 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------------||--||||----------  1 [NU] COG3167 Tfp pilus assembly protein PilO
------------------------------------------------||--||||----------  1 [NU] COG3168 Tfp pilus assembly protein PilP
---------------------|--------------------------||--|-------||----  1 [S] COG3169 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------------||--||||----------  1 [NU] COG3170 Tfp pilus assembly protein FimV
-------------------------------------------------|--||||---|||||--  1 [R] COG3178 Predicted phosphotransferase related to Ser/Thr protein kinases
-------------------------------------------------|--|||----||||---  1 [S] COG3184 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------|-----------------------|||||--|--|--|---|--|--|  1 [NU] COG3188 P pilus assembly protein, porin PapC
---------------|------||----------------------------|-----------||  1 [C] COG3202 ATP/ADP translocase
----------------||||----------------------|||-|-||-||--|---|||||--  1 [M] COG3206 Uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis
-------------------------------------------------|--||||----------  1 [NU] COG3215 Tfp pilus assembly protein PilZ
-------------------------------------------------|--|-----||||||--  1 [R] COG3218 ABC-type uncharacterized transport system, auxiliary component
-------------------|--------------------------|-||-||--|----------  1 [IR] COG3240 Phospholipase/lecithinase/hemolysin
-------------------------------------------------|--|||-----------  1 [C] COG3241 Azurin
------------------------------------------|||||-||--|--|-----||---  1 [S] COG3242 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------------||--|---------|---  1 [S] COG3249 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------|-----|-------------|||---|----||||------|------||-----  1 [G] COG3250 Beta-galactosidase/beta-glucuronidase
--------------------|---------||||||||----|||||-||--|--|---|||||--  1 [KT] COG3279 Response regulator of the LytR/AlgR family
------------------||----------------------------|---|-------------  1 [T] COG3292 Predicted periplasmic ligand-binding sensor domain
---------------------|--------------------------|---|--|-------|--  1 [S] COG3295 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------||-------------------|---|-------------  1 [S] COG3305 Predicted membrane protein
--------------------------------------------------|-||--||--------  1 [S] COG3309 Uncharacterized virulence-associated protein D
------------------------------------------------|---||||----------  1 [S] COG3310 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|---|--|----|||---  1 [K] COG3311 Predicted transcriptional regulator
-|-|----|-------|---------|-------||---------|------|--------|||--  1 [L] COG3316 Transposase and inactivated derivatives
---|-----------------|----|-------------------------|-------------  1 [S] COG3358 Uncharacterized conserved protein
-----------------------------------------------|-|--|--|---|------  1 [S] COG3416 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------|||-|--|-----|-----------------||--|-------------  1 [KT] COG3437 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HD-GYP domain
---|--------------------------|--------|------|-----|--|||-|||||||  1 [U] COG3451 Type IV secretory pathway, VirB4 components
----------------------------------------------------|||----|||||--  1 [S] COG3453 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------|-|--------------|---|------||--|--  1 [G] COG3525 N-acetyl-beta-hexosaminidase
---------------------------||--|-|------------------|----------|--  1 [G] COG3537 Putative alpha-1,2-mannosidase
--------------|----------------|||-|-|--------------|-------------  1 [S] COG3538 Uncharacterized conserved protein
--------------------------------||-|------|||-|--|--|--|---|||||--  1 [R] COG3568 Metal-dependent hydrolase
---------------------------||----|------------------|------|||||--  1 [H] COG3572 Gamma-glutamylcysteine synthetase
---------------|--|-|---------|---|-----------------|------||-|---  1 [G] COG3588 Fructose-1,6-bisphosphate aldolase
--|-----------------------||||-|||------------------|----------|--  1 [O] COG3590 Predicted metalloendopeptidase
--|---------------------------|---|||------------|--|---------|---  1 [G] COG3594 Fucose 4-O-acetylase and related acetyltransferases
----------------|---------------|-------------------|---------|---  1 [L] COG3598 RecA-family ATPase
-||||||||-|||------|-------||--------------||||-----|--|---||-||--  1 [K] COG3609 Predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain
|------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|-------  1 [S] COG3610 Uncharacterized conserved protein
-------------------------------||-|-|-----|||-|--|--|--|-------|--  1 [O] COG3634 Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit
---------------------|------------------------------|----------|--  1 [S] COG3656 Predicted periplasmic protein
----------------------------------------------------|-------|--|||  1 [M] COG3660 Predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerase
-------------------------------------------------|--|--|-------|--  1 [P] COG3667 Uncharacterized protein involved in copper resistance
----------------------------------------------------|------|||||-|  1 [U] COG3702 Type IV secretory pathway, VirB3 components
----------------------------------------------------|------|||||||  1 [U] COG3704 Type IV secretory pathway, VirB6 components
------------------------------------------|||||--|--|-------------  1 [V] COG3725 Membrane protein required for beta-lactamase induction
----------------------------------------------------|---||-||||-||  1 [U] COG3736 Type IV secretory pathway, component VirB8
----------------------------------------------------||||---|||||--  1 [S] COG3737 Uncharacterized conserved protein
------------------------------||||--------|||-------|------||||---  1 [M] COG3757 Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)
----------------------------------------------------|---------||--  1 [R] COG3818 Predicted acetyltransferase, GNAT superfamily
|||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||---  1 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components
---------------------------------|------------------|--|||-|--|---  1 [U] COG3843 Type IV secretory pathway, VirD2 components (relaxase)
------------------------------------------|||||-||--|--|---|||||--  1 [T] COG3852 Signal transduction histidine kinase, nitrogen specific
------------------------------|-----||--------------|-------------  1 [R] COG3858 Predicted glycosyl hydrolase
-------------------------------------------------|--|------||-||--  1 [K] COG3905 Predicted transcriptional regulator
---------------------------------------------|---|--|-------------  1 [R] COG3907 PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein
----------------------||----------------------------|------|--|---  1 [S] COG3952 Predicted membrane protein
------------------------------------------|||||-|--||-------------  1 [S] COG3978 Acetolactate synthase (isozyme II), small (regulatory) subunit
----------------------------------------------------|--|----|-|---  1 [G] COG4101 Predicted mannose-6-phosphate isomerase
----------------|-------------------------||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG4105 DNA uptake lipoprotein
------------------||-|----|---||||||------||||||||||||||---|||||--  1 [J] COG4108 Peptide chain release factor RF-3
------------------------------------------|||||-|||||------|||||||  1 [O] COG4133 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, ATPase component
--------|-------|--|-|----|---------||----|||||-||--|--|----------  1 [R] COG4147 Predicted symporter
------------------||-------||--------|----|||||-||--||||---|||||--  1 [P] COG4208 ABC-type sulfate transport system, permease component
-------------------|-|---------------------||-------|--|----|----|  1 [S] COG4226 Uncharacterized protein encoded in hypervariable junctions of pilus gene clusters
----------------------------------------------------|------|--|---  1 [L] COG4227 Antirestriction protein
-------------||-|--------------------------------|--|-------------  1 [C] COG4229 Predicted enolase-phosphatase
----------------------||------------------|||||-||||||||--|----|--  1 [OC] COG4232 Thiol:disulfide interchange protein
------------------------------------------|||||--||||------|||||--  1 [O] COG4235 Cytochrome c biogenesis factor
-------------------|--------------------------------|---------|---  1 [R] COG4249 Uncharacterized protein containing caspase domain
----------------------------------------------------||||----------  1 [S] COG4255 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------------------||-------|--|----------  1 [R] COG4258 Predicted exporter
-------------------------------------------||-------|--|----------  1 [R] COG4261 Predicted acyltransferase
--|------------------------------------|------------|--|-------|--  1 [K] COG4271 Predicted nucleotide-binding protein containing TIR -like domain
-----------------|----------------------------|-----|--|----------  1 [R] COG4287 PhoPQ-activated pathogenicity-related protein
---------------------|----|-------------------------|--|----------  1 [F] COG4290 Guanyl-specific ribonuclease Sa
------------------------------------|---------------|--|----------  1 [G] COG4305 Endoglucanase C-terminal domain/subunit and related proteins
------------------------------|---------------------|--|----------  1 [S] COG4306 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------------------------------------------|--|------|---  1 [S] COG4320 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------------------------------------------|--|-------|--  1 [S] COG4322 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------|--------------------|-------|-----  1 [S] COG4334 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------------------------------------------||||---|||-|-|  1 [S] COG4391 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------||--------------||-|-|-|-|--|----|-----  1 [S] COG4453 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|---||||--------------|-------------  1 [S] COG4496 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------------------------|---|--|-------------  1 [S] COG4517 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||----------  1 [P] COG4535 Putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC
-----------------|---|--|-----|-----|---------------|-------------  1 [CP] COG4555 ABC-type Na+ transport system, ATPase component
-------------------------------------------------|--|--|---|||||--  1 [TK] COG4567 Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a Fis-type HTH domain
--|-------------|---||--||----|-----------||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG4591 ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component
------------------||--------------------------------|-------------  1 [S] COG4634 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||--|--|----|||---  1 [P] COG4651 Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component
---------------------------||-----------------------|-------|-----  1 [R] COG4691 Plasmid stability protein
----------------------------------------------------|--|||--------  1 [S] COG4694 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------------------------------------------|-----||------  1 [R] COG4710 Predicted DNA-binding protein with an HTH domain
----------------------------------------------|-----|--|----------  1 [S] COG4727 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----||----||----------------------------------------|--|----------  1 [S] COG4754 Uncharacterized conserved protein
--------------------------||||----------------------|-------------  1 [S] COG4760 Predicted membrane protein
------------------------------------------|||----|--|----------|--  1 [P] COG4774 Outer membrane receptor for monomeric catechols
-------------||-||||||||||----------------||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87
----------------|-||----------------------|||||-||--|--|-----|||--  1 [R] COG4783 Putative Zn-dependent protease, contains TPR repeats
------------------------------------------|||||-|||||--|-------|--  1 [U] COG4795 Type II secretory pathway, component PulJ
----------------||||----------------------|||||-||||||||----------  1 [U] COG4796 Type II secretory pathway, component HofQ
--|-----|-----------|---------|---------------------|-------------  1 [O] COG4870 Cysteine protease
----------------------------------------------------|--|-----|----  1 [S] COG4875 Uncharacterized protein conserved in bacteria with a cystatin-like fold
--------------------------|------------------|------|-------------  1 [S] COG4913 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------|------------------|------|-------------  1 [S] COG4924 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-------------------------------------------------|--|----------  1 [S] COG4925 Uncharacterized conserved protein
--------------------|---------------------|||||-|||||||----|||||--  1 [D] COG4942 Membrane-bound metallopeptidase
------------------------------------------|||-|--|--|--------|----  1 [T] COG4943 Predicted signal transduction protein containing sensor and EAL domains
-------------------||---------------------|||-|----||------||-||-|  1 [M] COG4953 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC
----------------------------------------------------|--|---|--|---  1 [OU] COG4959 Type IV secretory pathway, protease TraF
||----||-|----------------|||-|--------------|---|-||--|---||-||--  1 [U] COG4962 Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF
------------------||-|--------------------------||--||||----------  1 [NU] COG4972 Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [L] COG4973 Site-specific recombinase XerC
--------------------|---|-|||||---||||----|||||-||||||||---|||||||  1 [L] COG4974 Site-specific recombinase XerD
----||----||----------------------------------------|--|----------  1 [P] COG4986 ABC-type anion transport system, duplicated permease component
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||--  1 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase
------------------------------------------||||||||||||||----------  1 [K] COG5007 Predicted transcriptional regulator, BolA superfamily
------------------------------------------------||--||||----------  1 [NU] COG5008 Tfp pilus assembly protein, ATPase PilU
----------------|-------||----------------|||||-||||||||---|||||||  1 [M] COG5009 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein
----------------------------------------------------|--|---|--|---  1 [NU] COG5268 Type IV secretory pathway, TrbD component
-------------------|----------------|---------------|-------------  1 [S] COG5293 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------||-----------------------|--|----------  1 [G] COG5297 Cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)
----------------------------------------------------|------||-|---  1 [S] COG5368 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------------------------|||--------------|-------------  1 [L] COG5377 Phage-related protein, predicted endonuclease
----------------------------------------------------|------||-|---  1 [I] COG5379 S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase
------------------------------------------------||--|-------------  1 [O] COG5380 Lipase chaperone
----------------||-------|--------||||----|||||||||||--|||||||||||  1 [O] COG5405 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), peptidase subunit
-------------------------------------------||-|-----|------|------  1 [S] COG5471 Uncharacterized conserved protein
----------------------------------------------------|-------||||||  1 [S] COG5508 Uncharacterized conserved small protein
------------------------------------------|---------||------------  1 [S] COG5532 Uncharacterized conserved protein
------------------------------------------|||-|--|-||-------------  1 [N] COG5571 Autotransporter protein or domain, integral membrane beta-barrel involved in protein secretion
----------------------------------------------------|--------||---  1 [S] COG5587 Uncharacterized conserved protein
-------------------------------------------------|--|------|------  1 [S] COG5619 Uncharacterized conserved protein
-------------||-------------------------------------|-------------  1 [E] COG5630 Acetylglutamate synthase