| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ |||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 26 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 23 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily |-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 17 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes --|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 16 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) ----------------||||-|--|-|||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 16 [T] COG2199 FOG: GGDEF domain --||-|-----|------||-|---------------|----|------------|----|----- 16 [L] COG3385 FOG: Transposase and inactivated derivatives |-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 15 [K] COG1309 Transcriptional regulator |||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 14 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases |-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 14 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase |-||--|||----|||-|||-|--||-||-|----|||----|||||-|||||--|||||||||-- 14 [T] COG0784 FOG: CheY-like receiver |||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 11 [R] COG0457 FOG: TPR repeat ||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 10 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases --||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-|||||||||||||||||| 10 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) --||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|--- 10 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases -|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-||||||||||||| 10 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins ---|||--|-||||-----|||----|||||---|-||----|||||-||---|||---|||||-- 10 [I] COG1960 Acyl-CoA dehydrogenases -|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||-- 9 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases -|||||||-|||----||||-|---|-||-------------|||-|-----|---||-------- 9 [L] COG0675 Transposase and inactivated derivatives --||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||-- 9 [L] COG1943 Transposase and inactivated derivatives |-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 8 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases ||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 8 [M] COG0438 Glycosyltransferase ---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|--- 8 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase ----------------||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 8 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain --|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||--- 8 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component ||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-| 8 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases --||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||-- 8 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily --||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 8 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components |-|||||||-|||----|-|||----||||||||||||----|||||-|------|------||-- 8 [K] COG1695 Predicted transcriptional regulators --|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||-- 7 [G] COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase |||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 7 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins --|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 7 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators ||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--|||||||||||||| 7 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning ||||-------||-----||-|----|||-----||-|-----------------|------||-- 7 [Q] COG1233 Phytoene dehydrogenase and related proteins ------------------|--|--------|-----|------|||-------------------- 7 [T] COG2310 Uncharacterized proteins involved in stress response, homologs of TerZ and putative cAMP-binding protein CABP1 |-||------||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain --|-||----|--||--|||-|----|||-||||||||-|--|||||-||-----|---||-||-- 6 [G] COG0366 Glycosidases -|-|----|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 6 [E] COG0683 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component --|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-||||||||||||| 6 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain ----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||-- 6 [M] COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase ---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---||||||| 6 [I] COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase ||||--|||--------|---|---|-|||------|-----|||||-||--|--|-------||| 6 [S] COG1520 FOG: WD40-like repeat --|---||-|-|-|||-----|----||||----|-||----|--|-------------||||--- 6 [S] COG2120 Uncharacterized proteins, LmbE homologs ------------------||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 6 [TK] COG2197 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain |-||----|-----|-||||-|||-||||||----|||----|||||-||--|--|--||||||-- 6 [T] COG2202 FOG: PAS/PAC domain ---|----|--|-------|-|---------------|----------------------|-|--- 6 [L] COG3415 Transposase and inactivated derivatives ||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-||||||| 5 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase |-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 5 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 5 [E] COG0410 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component ||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 5 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis |||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||-- 5 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 5 [E] COG0559 Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease components --||--|||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases -||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||-- 5 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component -|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases --|--|--|--|-||--|||-|--|-|||||||-||-|----|||||-||--|--|---||-||-- 5 [I] COG0657 Esterase/lipase -|||||----|----------|---||---|-----|-|----||-|---|---|-|||----|-- 5 [V] COG1002 Type II restriction enzyme, methylase subunits ||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||-- 5 [R] COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily) |||---|||||||---|-||-|----||||||-|-|||-------|--||-----|---|||||-| 5 [F] COG1051 ADP-ribose pyrophosphatase ----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||-- 5 [KE] COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs -----------------|--||----|||-||||||||||||-------|---------------- 5 [S] COG1307 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|--------------||-|-----||||||-|||-----|||---|---|--|---|||||-- 5 [V] COG1403 Restriction endonuclease --|-----|---------||-|----||||------||----------||---|||||||||||-- 5 [C] COG2010 Cytochrome c, mono- and diheme variants --|||||||-||--|-|----|----|||--|||||||----|||||-||||---|||||||||-- 5 [Q] COG2050 Uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism ---|---------||---||-|----|||||-----||-----------|--|--|--||||||-- 5 [Q] COG2124 Cytochrome P450 ----------------|-||-|---||||||----|||----|||||-||--|--|---||||||| 5 [T] COG2200 FOG: EAL domain --|----------|||-|||||--------------------------|----------|||||-- 5 [R] COG2319 FOG: WD40 repeat --------|----|-|---|||---||---|---||||-----------|---------|||||-- 5 [S] COG2340 Uncharacterized protein with SCP/PR1 domains -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 5 [E] COG4177 ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component ||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---||||||||||||| 4 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases -|------|-|||----|||||-----------|--------|||||--|-----|--|||||--- 4 [E] COG0411 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component ||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases |||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 4 [L] COG0582 Integrase --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||--- 4 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components -||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||-- 4 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component -------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||-- 4 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases ---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||-- 4 [C] COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases) |-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily ----------------||||||--||||||||--||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 4 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component |-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 4 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component ||||----|||||---|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||--- 4 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components ---|||--|-|||-------||-----||||---|-||----|||||-||-----|---||||||| 4 [I] COG1250 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase ||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--|||||||||||||| 4 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators ||------||------|----|-----||------------------------||----------- 4 [R] COG2018 Uncharacterized distant relative of homeotic protein bithoraxoid ----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||-- 4 [NU] COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG ---------------------|----|||-|---||||----|||-|--||----|--||-|---- 4 [S] COG2258 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|--|--|--|------||-|----|------|---|-----||-|-------||----|-|--- 4 [L] COG3335 Transposase and inactivated derivatives ------------------||-|----|||-||||||||-----------|-----|---||-||-- 4 [T] COG4585 Signal transduction histidine kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases ||||||-|||---|||--||-|----|||--|-||||-----|||||-||-||------|--|--- 3 [P] COG0025 NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters ||||||||||||||--||||-|--------||--|-||--------|-||------||-||-||-- 3 [E] COG0075 Serine-pyruvate aminotransferase/archaeal aspartate aminotransferase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase |-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 3 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit ||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||--- 3 [C] COG0247 Fe-S oxidoreductase --||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases --|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|-- 3 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase ----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||-- 3 [S] COG0344 Predicted membrane protein |-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||-- 3 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase |||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases -------------|||--||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains ||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0492 Thioredoxin reductase ||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||--- 3 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins ---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 3 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes |------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||| 3 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit --||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|----- 3 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family |-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|--- 3 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific --------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [J] COG0566 rRNA methylases |||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--|||||||||||||| 3 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase ||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 3 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component ---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||-- 3 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase ----||-----|------||-|--||||||||--||||----|||||||||||||||||--|||-- 3 [S] COG0586 Uncharacterized membrane-associated protein -||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-| 3 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters --||||----||-||-|--|-|----||||-|--||||----|||||-||-||--|---|||||-- 3 [CR] COG0604 NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductases ----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--||||||||||| 3 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases -------------|||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase ||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0628 Predicted permease |||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||-- 3 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators ---|------------|-||-|-----||--------------------|----------|-||-- 3 [R] COG0645 Predicted kinase |-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family ----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-|||| 3 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat ||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-||||||| 3 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 3 [U] COG0681 Signal peptidase I |||||||||||||---||||-|---|||||||||||-||-|||||||-||--|--|---|||||-- 3 [P] COG0704 Phosphate uptake regulator |||||||||||||---||||-|---||||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 3 [R] COG0714 MoxR-like ATPases -||-----||---||--|||||||--|---|--||-||----||||--||||---|---|||||-- 3 [P] COG0715 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components --|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||-- 3 [G] COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase |--|----|----||-|||--|--|-|---|||-||||-|--|||||-|-||---|||-||-|--- 3 [F] COG0737 5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases |||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [C] COG0778 Nitroreductase -----------------|---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0782 Transcription elongation factor ------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [M] COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins) ----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0793 Periplasmic protease -----------------|||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [R] COG0795 Predicted permeases --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 3 [NT] COG0840 Methyl-accepting chemotaxis protein |||-|||||||||----|||||-----||-||-----|----|||-|-||------------|--- 3 [C] COG1032 Fe-S oxidoreductase --|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||-- 3 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases -|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||--- 3 [R] COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases --||-------------|--||||||-----|||||||||||------|-------||||||||-- 3 [E] COG1164 Oligoendopeptidase F --||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-| 3 [O] COG1225 Peroxiredoxin ||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-|||||||||||||| 3 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component --||---------||-|||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains |-|---||||||----||||-|-----||||----|||-----------||||--|---||-||-- 3 [E] COG1305 Transglutaminase-like enzymes, putative cysteine proteases ----------------|----|||-||||-||--||||-------|--||||-------------- 3 [M] COG1388 FOG: LysM repeat |-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---||||||| 3 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators ---|------------||---|----|||-------||----|||||-||||---|--||||||-- 3 [K] COG1414 Transcriptional regulator -||---|||-||------||-|-----||-----------------|---|-|--|---||-||-| 3 [R] COG1487 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain |||||||||||||--------|----|||-|-----||----|||||-||||-|||---|||||-- 3 [K] COG1522 Transcriptional regulators ----|--------||--|||-|----|||-||||||||----|||||--|---------||-||-- 3 [IR] COG1597 Sphingosine kinase and enzymes related to eukaryotic diacylglycerol kinase ---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-|||||||||||||||||| 3 [O] COG1651 Protein-disulfide isomerase -||-----|--------||--|-------------------------------|-----|---|-- 3 [R] COG1669 Predicted nucleotidyltransferases --|---||--|-|-----||-|----||||||||||||----|||||--|--|--|---||||||| 3 [V] COG1680 Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins |||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||-- 3 [K] COG1846 Transcriptional regulators ----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 3 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator |-||||-|||-||----||--|--------|||----------------|------------||-- 3 [S] COG2013 Uncharacterized conserved protein ---|----|--|-||-----||----||||----|-|-----|--||-||-----|---|||||-- 3 [I] COG2030 Acyl dehydratase --||||--|-|||---|--|-|----|||-------|-----|||||--|-|---|--||||||-- 3 [R] COG2041 Sulfite oxidase and related enzymes |||-||||-||||----|---|----||||-|||||||----|---------|--|---|||||-- 3 [R] COG2151 Predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme -----------------|||-|||---||-|---||||---------------------------- 3 [T] COG2172 Anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase) |-||----|-----|-||||-|-----||||---|-||----|||---||-----|---|||||-- 3 [T] COG2203 FOG: GAF domain ----------------||-|-|--||----|------|----------||-----|---|--|--- 3 [T] COG2206 HD-GYP domain |-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||-- 3 [P] COG2217 Cation transport ATPase ---|-------||-------||----|||--||---------|||||-|||----|---|||||-- 3 [G] COG2301 Citrate lyase beta subunit ---|--|--|--|---|----|---|-------|||||---------------------||||--- 3 [E] COG2309 Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T) ------------------|--|--------------||-----------|---------||||--- 3 [S] COG2318 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|||-----||--------|----||||----||||-----------|-----|---||||--- 3 [R] COG2329 Conserved protein involved in polyketide biosynthesis related to monooxygenase -||---------------|--|-------------------------------|-----|---|-- 3 [S] COG2361 Uncharacterized conserved protein ------------------||||-----||||||||||----------------------||----- 3 [V] COG2367 Beta-lactamase class A ---------------------|----|---|-----||-----------|---------------- 3 [V] COG2720 Uncharacterized vancomycin resistance protein ----------------||||||--------|-----------|||||-||--||||---------- 3 [NU] COG2805 Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT ----------------|-||-|-----------------------------------------|-- 3 [S] COG4636 Uncharacterized protein conserved in cyanobacteria ---|--|||--|-||--|--||----||||------||-----------|-----|---||||||| 3 [I] COG4799 Acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta) ---|||--||-||----|||||----||||||--||||----|||||--|-----|---|||||-- 3 [MR] COG4948 L-alanine-DL-glutamate epimerase and related enzymes of enolase superfamily --|------------------|-----------------------------------------|-- 3 [S] COG5316 Uncharacterized conserved protein |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 2 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase |||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||--- 2 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family ||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||------------- 2 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases |||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control ||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--|||||||| 2 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases ||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||-- 2 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases ---------|---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors ||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---||||||||||||| 2 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog) ||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit |||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit |||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---||||||| 2 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0073 EMAP domain |||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase |||---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0084 Mg-dependent DNase |||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||-- 2 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases ||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase |||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I ||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||---- 2 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit |||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 2 [Q] COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase |-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase ------------------|--|----||||-----|------|||||-||||---|---||||||| 2 [F] COG0232 dGTP triphosphohydrolase ---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family --|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-| 2 [H] COG0262 Dihydrofolate reductase --|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [C] COG0281 Malic enzyme ---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase --|--------|-|--|-||||||--|||----|--|-----|||||-||||---|---||-|--- 2 [G] COG0296 1,4-alpha-glucan branching enzyme --|----------||-|-||-|----||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 2 [S] COG0316 Uncharacterized conserved protein ||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||------- 2 [S] COG0327 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs ----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III |-||||--|-|||||||-||-|-----||--|--||||----|||||-||-||--||-||||||-- 2 [I] COG0365 Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases |||-----||----|-|-||||----|||-----|--||---|||||--||----||||||||--- 2 [OK] COG0378 Ni2+-binding GTPase involved in regulation of expression and maturation of urease and hydrogenase |||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-||||||||||||||| 2 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases --||---------||---||||----|||-|----|||----|||-|-||-|---|---|||||-- 2 [R] COG0384 Predicted epimerase, PhzC/PhzF homolog |||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||-- 2 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases ---|---------||---||-|----|||--|||||||--|||||||-||-|-|||---||-||-- 2 [R] COG0431 Predicted flavoprotein |||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [I] COG0439 Biotin carboxylase -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division -----------------|||||||--||||||-|--||----|||||-|-||-------||-|--- 2 [G] COG0448 ADP-glucose pyrophosphorylase --|----------||-||--||||||----|-----|||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type ||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-|| 2 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase |||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--|||||||| 2 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase |||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-|||||||||||||| 2 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases) ||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning --|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--|||||||| 2 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases |||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II |||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||| 2 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases ||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase |||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [R] COG0517 FOG: CBS domain |-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||-- 2 [E] COG0520 Selenocysteine lyase ||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 2 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-| 2 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase ---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [K] COG0557 Exoribonuclease R ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32) ||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [K] COG0583 Transcriptional regulator |||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---||||||| 2 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins --|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---||||||| 2 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases |||-||--||-|-||--||--|----|||--|---|||-------|---||-||||---|||||-- 2 [S] COG0599 Uncharacterized homolog of gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit -||-----||-------|||||||--|---|--||-||----||||---|||---|---|||||-- 2 [P] COG0600 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component |-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-|||| 2 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase |||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein -----|-------||-|-||-|||--||||||||||||||||-------|--|--||--|--|--- 2 [T] COG0631 Serine/threonine protein phosphatase --|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 2 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase -------------||---||-|----|||-----|-||----|||||-||-|||||---||||||| 2 [HC] COG0654 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases |||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--|||||||||||||| 2 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel |-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||-- 2 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins -||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||-- 2 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase |-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---||||||| 2 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins ---|---------||-|-||-|----|----|--||||----|||||-|||-|--|---|||||-- 2 [MG] COG0702 Predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerases --|------|-|----||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 2 [O] COG0719 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component --||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--|||||||||||||| 2 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein |||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [R] COG0730 Predicted permeases -----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [M] COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein) -------------||------|----|-------||||----|||||-||||-||||||||||--- 2 [P] COG0753 Catalase -------------|||||||||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase --|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||-- 2 [F] COG0775 Nucleoside phosphorylase ---|--------------||||--|||----|||||||-|--|||||-|||||--|||||-|-||| 2 [P] COG0783 DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant) |-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [R] COG0824 Predicted thioesterase ------------------||-|----|||-|---||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [P] COG0861 Membrane protein TerC, possibly involved in tellurium resistance --||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--|||||||||||||| 2 [CP] COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit |||||||||-|||-----|--|-----||--|----------|||||---||---|---------- 2 [H] COG1056 Nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase ||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||------- 2 [HR] COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes --------|----||---||-|----|---|---|-||-|--------||--|--|---------- 2 [R] COG1075 Predicted acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 2 [G] COG1109 Phosphomannomutase -||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||-- 2 [P] COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component -||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||-- 2 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components ||||--|||||||----|||||--|-||||||||||||||||-||-|-|-|----|---|||---- 2 [P] COG1122 ABC-type cobalt transport system, ATPase component --------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|-----|||-||||--- 2 [E] COG1174 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, permease component ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|---||||--- 2 [G] COG1175 ABC-type sugar transport systems, permease components |||---||||||-||----|-|----|||-------||-----||---------------|----- 2 [R] COG1205 Distinct helicase family with a unique C-terminal domain including a metal-binding cysteine cluster |-|||||||--||----|||-|----|||||||---||----|||||--|--||||---||-||-- 2 [M] COG1209 dTDP-glucose pyrophosphorylase ||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 2 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes --|||||||--||----|||-|--||----|---|||||||--------|-----|----||---- 2 [R] COG1277 ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component --||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-|||| 2 [C] COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters -----------------|--||||------||||||||---------------------------- 2 [S] COG1302 Uncharacterized protein conserved in bacteria |||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----||||||| 2 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases -----------------|||-|--||||||||||||||---------------------------- 2 [K] COG1316 Transcriptional regulator ----------|||--------|--||-||-------||----|||----|-----|---||-|--- 2 [C] COG1319 Aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, middle subunit CoxM/CutM homologs --||--------------|-||----|||-||-|-||-----|||||-||-|-|||---||-||-- 2 [S] COG1359 Uncharacterized conserved protein ||||--|||||-|----|-|||--------||||||||||--|||-|--|----------|----- 2 [G] COG1363 Cellulase M and related proteins -----------------||||||||--||-|---||||----------||---------||--|-- 2 [T] COG1366 Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor) |||-||||||---||-||--||-----||-||--||||----|||||-|-----------|----- 2 [ER] COG1387 Histidinol phosphatase and related hydrolases of the PHP family |-|---|---||----|-|--|-----------|--|-----|--|----------|||------- 2 [V] COG1401 GTPase subunit of restriction endonuclease ---------------------|---|-----||-|||-||||-------------|---------- 2 [F] COG1428 Deoxynucleoside kinases ||||--||||------|-||-|--|-|---------------------||----|-||||||||-- 2 [S] COG1432 Uncharacterized conserved protein --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [P] COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen --||||||---|-----|||||----|||-||-|||||----|||----|||---|--||||||-- 2 [R] COG1473 Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase ||||---||----------|-|--------||||||||-----------|-------------|-- 2 [K] COG1476 Predicted transcriptional regulators --|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||--- 2 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase --|--------|-----||-||||--|||-|-||--||-|--|||||-||||---|---||-|--- 2 [G] COG1523 Type II secretory pathway, pullulanase PulA and related glycosidases ----------|||---|----|--|--||-------||----|||----|-----|---||-||-- 2 [C] COG1529 Aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, large subunit CoxL/CutL homologs ||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||--- 2 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase -----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||-- 2 [K] COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog ---|||----|||--------|||--|-------||||----||||||||||-|||||||||||-- 2 [I] COG1607 Acyl-CoA hydrolase -----------------|--||----|||-||||||||-|--|||||-|||||--|---|||||-- 2 [K] COG1609 Transcriptional regulators ------------------||-|--------------|-----||||---------|-----|---- 2 [S] COG1649 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-| 2 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase ---||||||--||--------|----||||-------|----|||----------|-------|-- 2 [E] COG1703 Putative periplasmic protein kinase ArgK and related GTPases of G3E family |-||---------------|-|-----||-------------|---|------------------- 2 [V] COG1715 Restriction endonuclease --|||||||-|-|---||||-|---|-|||-----|||----------||-----|---|||||-- 2 [R] COG1721 Uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain) --------------------||----||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 2 [E] COG1760 L-serine deaminase ----||---------------|----|----|--|||---|||||-|-||--|--|---|||||-- 2 [O] COG1764 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation --------|--|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-| 2 [I] COG1788 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit --|-|||||-|||---||-|-|------------||||----|||||-||-|---|---||-||-- 2 [S] COG1801 Uncharacterized conserved protein -----|--|-||---------|-----||-------------|||-|--|-----|---|||||-- 2 [C] COG1804 Predicted acyl-CoA transferases/carnitine dehydratase --||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components |-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---||||||| 2 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family ||||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|| 2 [P] COG1863 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit ---||||||--||--------|----||||-------|----|||----------|---|||||-- 2 [I] COG1884 Methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit --||||--|--|-||--|-|||----|||-|||-||||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 2 [C] COG1902 NADH:flavin oxidoreductases, Old Yellow Enzyme family ------------------||-|----||||||--||||----|||-|--|-----|--|||----- 2 [S] COG1937 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||-- 2 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase ----------|||--------|-----||-------||----|||----|-----|---|||||-- 2 [O] COG1975 Xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family ---|------|-|||-|----|--------------||----------||--||||--|||||||| 2 [R] COG1999 Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC, involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems --|----------||-|----|-----||||-----|-----|||||-|--|-|||----||-|-- 2 [P] COG2032 Cu/Zn superoxide dismutase -----------|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-| 2 [I] COG2057 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit --||---------------|-|-----|||||---|||----|||||-||---||---||||||-- 2 [P] COG2076 Membrane transporters of cations and cationic drugs ----------|||--------|--||-||-------||----|||----|-----|---||-||-- 2 [C] COG2080 Aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, small subunit CoxS/CutS homologs ||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--|| 2 [P] COG2111 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhB subunit ----------|-------||-|---|-|||-------|----|||-|--|--|--|---||-||-- 2 [G] COG2133 Glucose/sorbosone dehydrogenases ||||----||||------||-|----|||-----|-||-----------------|---------- 2 [S] COG2138 Uncharacterized conserved protein ||||----||-|-------|-|----||||--||||||-|--|||||--|--|--|---|||||-- 2 [C] COG2141 Coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases ---||||||--||-------||----||||-------|----|||----------|---|||||-- 2 [I] COG2185 Methylmalonyl-CoA mutase, C-terminal domain/subunit (cobalamin-binding) -------------------|-|----|||-||||||||||--|||||-||-----|---|||||-- 2 [K] COG2188 Transcriptional regulators ----------||-|-------|----||||-------|----|||||-||-----|---|||||-- 2 [C] COG2225 Malate synthase -------|------|--|--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---|||---- 2 [F] COG2233 Xanthine/uracil permeases -------||----||--|-|||----||||||--||||----|||||-||||---|---|||||-- 2 [I] COG2267 Lysophospholipase --------------|------|----|||-|---|-|---------|--------|-------|-- 2 [I] COG2272 Carboxylesterase type B ||-|-----|---------|-|-----|||----|-------||||---|-----|--||||||-- 2 [E] COG2303 Choline dehydrogenase and related flavoproteins ---|-----------------|-----||-------||----------------------|--|-- 2 [R] COG2312 Erythromycin esterase homolog ---|---------------|-|--------||||||||----|||||-||||||||---------- 2 [R] COG2333 Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily) -------------------|-|-----||-|---||||----|||-------|||----|||---| 2 [T] COG2337 Growth inhibitor ---------------------|----|||-------------|||-|-||-----|---||----- 2 [P] COG2375 Siderophore-interacting protein ---|||---|||-----|---|------------|-------|||||-||--|--|--|||||--- 2 [R] COG2391 Predicted transporter component -------------------|-|--------|----||---------------------|-|-|--- 2 [V] COG2746 Aminoglycoside N3'-acetyltransferase ---------||-------||-|----||||||--||||----|||||-||-----|---|||||-- 2 [K] COG2771 DNA-binding HTH domain-containing proteins --|-||--|----||---||||----|||--|||||-|||--|||||-|||--|||---|||||-- 2 [L] COG2801 Transposase and inactivated derivatives ----------------||---|||||----------------|||||-||||-|||-------||| 2 [M] COG2825 Outer membrane protein --|-------------|----|--------------------|||-||||||---|||||---|-- 2 [S] COG2862 Predicted membrane protein --||---------||--|---|----|||-||---|-|-----------|-|---|--|||||--- 2 [E] COG2873 O-acetylhomoserine sulfhydrylase |--|------|||||-|--|-|----||||-------|----|||||-||-----|---|||||-- 2 [P] COG2897 Rhodanese-related sulfurtransferase -------------------|-|--------------------|||||-|--|-------|-|||-- 2 [S] COG3021 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|----|---------------|||-|-||----------|||--- 2 [Q] COG3135 Uncharacterized protein involved in benzoate metabolism --|---------------|-||----|---------------|||||-||-----||||||||--- 2 [O] COG3187 Heat shock protein -------------------|-|----|---||--||------|||-|--|-|-------|--|--- 2 [S] COG3238 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---------------||-|----||-----|---------------------|---|-|||-- 2 [L] COG3293 Transposase and inactivated derivatives ----||------|--------|-------------------------------------------- 2 [S] COG3375 Uncharacterized conserved protein ----||-----|-|-------|------------|-|---------|--|-||--|---|||||-- 2 [G] COG3386 Gluconolactonase -----------|---------|---------------|----|------------|----|----- 2 [S] COG3396 Uncharacterized conserved protein ---------------------|-----||-------||---------------------------- 2 [Q] COG3424 Predicted naringenin-chalcone synthase ------------------||-|----|---------------------------------|-|--- 2 [S] COG3544 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||||----------||-------------------------------- 2 [R] COG3694 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ---------------------|----------------------------------------||-- 2 [S] COG3798 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|||--------------------|||--------------|--|--- 2 [S] COG3831 Uncharacterized conserved protein --||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||-- 2 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components -------------------|-|--------|-----|----------------------------- 2 [S] COG3861 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|----|--------|------------------|-----|---------- 2 [S] COG3868 Uncharacterized conserved protein -------------------|-|--------|---|||----------------------|------ 2 [R] COG3871 Uncharacterized stress protein (general stress protein 26) ------------------||-|-----------------------|------------|||-|--- 2 [S] COG4222 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------||---||||----------||-------------------------------- 2 [R] COG4586 ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component ------------------||||----------||-------------------------------- 2 [R] COG4587 ABC-type uncharacterized transport system, permease component -------------------|||--------|---------------------------|------- 2 [R] COG4639 Predicted kinase ---|----|---|--------|---------------|----------||-|--------||---- 2 [R] COG4666 TRAP-type uncharacterized transport system, fused permease components ---------------------|----|||------------------------------------- 2 [S] COG4762 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------||------|----|--------------------------------------- 2 [S] COG4850 Uncharacterized conserved protein --|------------------|----|------------------------------------|-- 2 [S] COG4891 Uncharacterized conserved protein |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 2 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase ---------------------|--||----------------------------------|-|--- 2 [S] COG5497 Predicted secreted protein ---------------------|---------------------------------|------|--- 2 [L] COG5534 Plasmid replication initiator protein ------------------||-|-------------------------------------------- 2 [S] COG5637 Predicted integral membrane protein ||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||-- 1 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase |||-||--||-|-||-||||-|----|||-||--|||||---|||||--|--||||---|||||-- 1 [P] COG0004 Ammonia permease ||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||-- 1 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase -------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0021 Transketolase ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 1 [C] COG0022 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase ---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase) |||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase] |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation) --||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0031 Cysteine synthase -------------||---|--|----|||-------------|||||-|----------|||||-- 1 [G] COG0033 Phosphoglucomutase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase |--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase -|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase -|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||-- 1 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||-- 1 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 1 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0048 Ribosomal protein S12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0049 Ribosomal protein S7 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0051 Ribosomal protein S10 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2 ||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--|||||||| 1 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase -||---||--||-|--|-||||||--|||-||||--||----|||||-||||-------||-|--- 1 [G] COG0058 Glucan phosphorylase |||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||-|----|||||-----------|||||-||--|--|||||||||-- 1 [S] COG0062 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||-- 1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0067 Glutamate synthase domain 1 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0069 Glutamate synthase domain 2 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0070 Glutamate synthase domain 3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit ||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0077 Prephenate dehydratase |||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1 ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0082 Chorismate synthase -|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||------- 1 [E] COG0083 Homoserine kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11 |||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9 ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase |||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase ---|||--|-|||||-|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 1 [O] COG0109 Polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor) ||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-| 1 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase --||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0114 Fumarase -|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||---------- 1 [L] COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase -------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase ||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||-- 1 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase |-||--|||---||||--|--|-----||-|-----||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 1 [L] COG0122 3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase ||||--|||||||||||-||-|------------|-||----------||---|||---|||||-- 1 [BQ] COG0123 Deacetylases, including yeast histone deacetylase and acetoin utilization protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0125 Thymidylate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase |||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--|||||||| 1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase ||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase ||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase --||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful) ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase ||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase -|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0148 Enolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase --------|-||-||-|-||-|----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 1 [P] COG0155 Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein) -|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes ||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain --||||||--|||||----|-|----|||||---|-||----|||||-|||----|---||||--- 1 [E] COG0160 4-aminobutyrate aminotransferase and related aminotransferases -|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 1 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0164 Ribonuclease HII ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase -|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0171 NAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [E] COG0174 Glutamine synthetase -||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 1 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes -|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [G] COG0176 Transaldolase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-||||||||||||||| 1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17 --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit -|||--|||-|||-----||-|---------------|--||||||||||||||||---|||||-- 1 [HJ] COG0189 Glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase) --||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||| 1 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase -------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||-- 1 [G] COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase -------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase -------------|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0194 Guanylate kinase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0195 Transcription elongation factor -------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0196 FAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0203 Ribosomal protein L17 -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|--- 1 [G] COG0205 6-phosphofructokinase ||||||||||------||||||--||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0206 Cell division GTPase |||-----||---|||----||----||||||||||||-|||||||||||||||||---|||||-- 1 [F] COG0207 Thymidylate synthase ---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-||| 1 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0211 Ribosomal protein L27 |--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase -||---|||--------|---|-----||-||-||||||||||||-|-|------|---||-|--- 1 [F] COG0213 Thymidine phosphorylase |||||||||||||||--|--||----|||||--|||||------------||-------------- 1 [H] COG0214 Pyridoxine biosynthesis enzyme --|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0216 Protein chain release factor A -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein ------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class) -------------||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase |-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 1 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 1 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component -------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0227 Ribosomal protein L28 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0228 Ribosomal protein S16 |-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||-- 1 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0230 Ribosomal protein L34 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0233 Ribosome recycling factor --|----------||-||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10) --|----------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0238 Ribosomal protein S18 -|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation |-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase ||-||||||||||---|-||-|----|||-------||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [C] COG0243 Anaerobic dehydrogenases, typically selenocysteine-containing |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10 ----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase --|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-|||||||||||||||||| 1 [FP] COG0248 Exopolyphosphatase --||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family) |||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0250 Transcription antiterminator |||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|---- 1 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0254 Ribosomal protein L31 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0257 Ribosomal protein L36 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) -------------||---||-|-----|||------------|||||-|||-||||---|||||-- 1 [H] COG0259 Pyridoxamine-phosphate oxidase ------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-|||||||||||| 1 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0261 Ribosomal protein L21 --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts ------------------||-|----||||-||||||||||||||||-||||||||---|||||-| 1 [L] COG0266 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0267 Ribosomal protein L33 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0268 Ribosomal protein S20 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II) |--|||----|-|---||||-|--|-|||||||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 1 [F] COG0274 Deoxyribose-phosphate aldolase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis ----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase) --||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-||||||||| 1 [C] COG0280 Phosphotransacetylase --|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-|| 1 [C] COG0282 Acetate kinase ---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---||||||| 1 [F] COG0283 Cytidylate kinase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase ||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase |--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG0288 Carbonic anhydrase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3) -------------|--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0291 Ribosomal protein L35 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0292 Ribosomal protein L20 |||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes ---|------|-|||--|---|---|-||||||||||||||||||||-|-||-------||-||-- 1 [F] COG0295 Cytidine deaminase -|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|--- 1 [G] COG0297 Glycogen synthase --||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN ----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--||||||||||| 1 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I |||||||||||||---|-||-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0303 Molybdopterin biosynthesis enzyme -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0305 Replicative DNA helicase ||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|--- 1 [P] COG0306 Phosphate/sulphate permeases ---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain --|-||----||-|||--||-|----||||-|||--------|||||-||||||||---|||||-- 1 [E] COG0308 Aminopeptidase N |||||||||||||||--|---|----|||||--|||||------------||-------------- 1 [H] COG0311 Predicted glutamine amidotransferase involved in pyridoxine biosynthesis |||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||-- 1 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0313 Predicted methyltransferases |||||||||-|||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0314 Molybdopterin converting factor, large subunit |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0315 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme ----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-| 1 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase ---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 1 [H] COG0320 Lipoate synthase ----------|--||---||-|----||||------------||||||||||||||---||||||| 1 [H] COG0321 Lipoate-protein ligase B |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex --||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase) -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase --|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold ---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0328 Ribonuclease HI -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0333 Ribosomal protein L32 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0335 Ribosomal protein L19 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase ----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase -------------||---||-|----|---------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [E] COG0339 Zn-dependent oligopeptidases ||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD |||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase |-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase |||-----||------||||-|----|||-||---||-----|||||-||||||||---|||||-- 1 [E] COG0347 Nitrogen regulatory protein PII |||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase --|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase ----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) -------------||-|-||-|----||||------------||||||||||||||---||||||| 1 [R] COG0354 Predicted aminomethyltransferase related to GcvT ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type) --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0359 Ribosomal protein L9 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0360 Ribosomal protein S6 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1) -------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase |||||||||||||-----||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||--- 1 [H] COG0368 Cobalamin-5-phosphate synthase |||---|||||-----||||-|--------||--||------|||||-||--|--||||----|-- 1 [P] COG0370 Fe2+ transport system protein B |-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [C] COG0372 Citrate synthase ||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||------- 1 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase |||---||||------|-||-|--------------------|||-|---------|||------- 1 [R] COG0375 Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression) --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases ||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----|| 1 [M] COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase -------------||---||-|----||||------|-----|||||------------||-|--- 1 [P] COG0387 Ca2+/H+ antiporter ||||----||---|--||||-|----||||||||||||----|||||-|--|-------------- 1 [S] COG0391 Uncharacterized conserved protein |-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||-- 1 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||-||||||||-||-||--|---||||--- 1 [G] COG0395 ABC-type sugar transport system, permease component |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 1 [O] COG0396 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, ATPase component -------------||---||-|||-------|--||||----|||----|--|------||||-|| 1 [R] COG0400 Predicted esterase ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG0403 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), N-terminal domain ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--||||---|||||-- 1 [E] COG0404 Glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase) ----||----||||||--||||----|||-----|-||----|||-|-||--||||||-||-||-- 1 [E] COG0405 Gamma-glutamyltransferase --|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase ---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase -------------||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0414 Panthothenate synthetase ----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||-- 1 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme ||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||---------------- 1 [L] COG0419 ATPase involved in DNA repair ||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|----- 1 [L] COG0420 DNA repair exonuclease -|--|||||||||||-||---|----|---|--|--||----||||||-|--||||||----|--- 1 [E] COG0421 Spermidine synthase ||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||-- 1 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC ||||||||||||||||-----|--|||||||---|---||||------------------------ 1 [J] COG0423 Glycyl-tRNA synthetase (class II) --|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation ||||--||--||||||||-|-|---||||------|------|||-|--|---|||--|-|----- 1 [P] COG0428 Predicted divalent heavy-metal cations transporter |||---|||||||-|-||||-|-----||-|-----||----|||-|-||---------||----- 1 [S] COG0432 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||---||||-|-----||---|----|----||||---|-|---|---|||||-- 1 [R] COG0433 Predicted ATPase |||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||-- 1 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0443 Molecular chaperone --|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||--- 1 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component |||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases ||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains |||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--||||||||||| 1 [O] COG0450 Peroxiredoxin |||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase ||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 1 [R] COG0456 Acetyltransferases ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ) ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family) |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase |||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| 1 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase ||||||||||||||||--||-|----||||------||-----------|-----|--|||-|--- 1 [O] COG0464 ATPases of the AAA+ class |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase -|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||-- 1 [G] COG0469 Pyruvate kinase |||||||||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication ||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||---- 1 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters |-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2 ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA -------------||-||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain ||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--|||||||| 1 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0486 Predicted GTPase --------|-------|----|-----||||||---|----------------------------- 1 [P] COG0490 Putative regulatory, ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase ||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||-- 1 [R] COG0496 Predicted acid phosphatase ----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0498 Threonine synthase |||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||-- 1 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase) ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit ---|---------||---||-|----|||-----|-||----|||||--|-|-|||||||||||-- 1 [E] COG0506 Proline dehydrogenase -|-----------||----|-|||-|-||-||||||||-|--|||||||||||||---|||||--- 1 [L] COG0507 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member ---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||-- 1 [E] COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding) --|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||-- 1 [L] COG0514 Superfamily II DNA helicase |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit |||||||||||||---|--|-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0521 Molybdopterin biosynthesis enzymes |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins --|----------||-|-||||----|||-----|-||----|||||-||--||||||-|||||-- 1 [R] COG0523 Putative GTPases (G3E family) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0527 Aspartokinases |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0528 Uridylate kinase -------||---|||-|-|--|-----||-|-----||----||||||||--|--|--|-||||-- 1 [P] COG0529 Adenylylsulfate kinase and related kinases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity |||||||||||||---||||-|-----||-||--|-||-----------|-----|----|-|--- 1 [R] COG0535 Predicted Fe-S oxidoreductases -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0536 Predicted GTPase |||||||||-|||||||-||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases ---|||--|-|||||-||||-|-----||--|--||||----|||||--|-|---|||-|||||-- 1 [C] COG0538 Isocitrate dehydrogenases -------------||-||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0539 Ribosomal protein S1 |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor) -------------||---||-||||-|---------------||||||||||||||-------|-- 1 [O] COG0545 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 1 |-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 1 [R] COG0546 Predicted phosphatases ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0550 Topoisomerase IA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase ---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||-- 1 [C] COG0554 Glycerol kinase ||||||||||||------||-|-----||-|------|----|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG0555 ABC-type sulfate transport system, permease component |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex |--------------------|----|||||---------|||---|-----------||------ 1 [M] COG0562 UDP-galactopyranose mutase ||||||--||-||-----||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-| 1 [J] COG0565 rRNA methylase -------------||------|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 1 [C] COG0567 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, and related enzymes ||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||---- 1 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease ---|---------||--|||-|-|||----|||||||||-|||||||-|-||-------------- 1 [F] COG0572 Uridine kinase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||-- 1 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein) ---|||-----|-|||--|--|---|||||-|||||||----|||||-|||||--|---||||--- 1 [C] COG0578 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase |-------|--|-|||-||-||---|----||||||||-|||||||||-||||--|---|||||-- 1 [G] COG0580 Glycerol uptake facilitator and related permeases (Major Intrinsic Protein Family) ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 1 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component |||||||||||||||||----|--------------------|||||-||||----|||------- 1 [S] COG0585 Uncharacterized conserved protein ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog) ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation -----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0594 RNase P protein component ||||--||-|-------|||||----||||||||||||||||--------------|||||||||| 1 [R] COG0595 Predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase |-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [P] COG0605 Superoxide dismutase |--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-| 1 [O] COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity ||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease ||||----|--||---||||-|--------|------|----|||||-||||-|||---------- 1 [R] COG0613 Predicted metal-dependent phosphoesterases (PHP family) |||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class) -|||--|||||-|---||||||--|||||-||||||||||||------|----------------- 1 [R] COG0618 Exopolyphosphatase-related proteins ||||--||||-||----|||||----||||||||||||||||-||-|---|--------|||---- 1 [P] COG0619 ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters ----------------|-||-|||---|||-|--||||----|||-||-|||-||||||||||||| 1 [I] COG0623 Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH) --||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit ---|---------||||-||-|||--|---------------||||||||||-|||---||||||| 1 [C] COG0633 Ferredoxin ----------------||--||----||||||-|||||||||||||||||||||||---|||||-- 1 [F] COG0634 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase ----------------|||||||||||||-|||||||||---|||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases ||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 1 [NT] COG0643 Chemotaxis protein histidine kinase and related kinases -----------------|||||----|||||---||||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG0646 Methionine synthase I (cobalamin-dependent), methyltransferase domain --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7 ||||-||||-|||----|||-|----|||-----||||----|||-|-||---------|||--|| 1 [CP] COG0651 Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase) |||-----||-|-||-|---||-----||||--|||||----||-||-||--|--|---|||-|-| 1 [R] COG0655 Multimeric flavodoxin WrbA ----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-| 1 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein |||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--|||||||| 1 [R] COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily --|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating) ----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase -------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-||||||||||||| 1 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase |||-----||---|-------|----||||-------|----|||||-||||---|---||-|--- 1 [H] COG0684 Demethylmenaquinone methyltransferase --|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase ------------------||-|-----|||-|--||||----------|-------||--|-||-- 1 [E] COG0686 Alanine dehydrogenase ---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 1 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein ||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-|| 1 [I] COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase |---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---||||||| 1 [J] COG0689 RNase PH ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0691 tmRNA-binding protein -------------|||----||||-|||||-||||||||||||||||||||||||||||||----- 1 [L] COG0692 Uracil DNA glycosylase -------------|||--||-|-----||-----|-||----|||----|-----||||------- 1 [R] COG0699 Predicted GTPases (dynamin-related) --|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0703 Shikimate kinase -||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||-- 1 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC |-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0708 Exonuclease III --||||------|---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0713 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K) -----------------|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---||||||||||||| 1 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit -------------||----|-|----|----|-|--------||||||||||||||------||-- 1 [E] COG0722 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [P] COG0725 ABC-type molybdate transport system, periplasmic component -|||--|||-||------||-|---------||---------|||||-||--|--||||-|-|--- 1 [R] COG0727 Predicted Fe-S-cluster oxidoreductase ----------------|||||||||||||||-----------|||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor --|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins -------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||| 1 [I] COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases -----------------|||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase ----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|-- 1 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase |||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||-- 1 [H] COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains |||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1 --|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component -----------------|||||----|||||-----||-------|-||||||--|||||||||-- 1 [E] COG0757 3-dehydroquinate dehydratase II ----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-| 1 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake ----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||- 1 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein ----------------||||||||------||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2 |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase |||------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase ----||----------||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit ----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0781 Transcription termination factor |-|---|||-|-|---||||||--|-||||--||--||------------||----||-||||--- 1 [O] COG0785 Cytochrome c biogenesis protein --------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0787 Alanine racemase ---|------------|-||-|----|||-------||----|||-|-|||||--|||||||-|-- 1 [F] COG0788 Formyltetrahydrofolate hydrolase -------------|||-----|--------------------|||||-||||-|||||||||||-- 1 [R] COG0790 FOG: TPR repeat, SEL1 subfamily ----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||-- 1 [L] COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase ----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [M] COG0796 Glutamate racemase ----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase |-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-|| 1 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||-||||--- 1 [E] COG0804 Urea amidohydrolase (urease) alpha subunit --||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC ----------------||||||--||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing ----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II ----------------||||||---|----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase) |-|------|------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0811 Biopolymer transport proteins ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase -----------|--------||--|------||||||-|||||||||||-||----||----|--- 1 [F] COG0813 Purine-nucleoside phosphorylase ----------------||||-|||||||||------------|||||-||||-||||||||||||| 1 [M] COG0815 Apolipoprotein N-acyltransferase ----------------||||||||--|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis) -----------------||||||||-||||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit -----------------|||-|--------||||||||----|||||-|||||||||||||||--- 1 [M] COG0818 Diacylglycerol kinase ----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||-- 1 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit |||------|-|----|--|||--------||||||||----|||||-||||-|||||||||---- 1 [O] COG0826 Collagenase and related proteases --------------|---||-|----|-------|--||----||----||----|||-||||--- 1 [O] COG0829 Urease accessory protein UreH --------------|---||-|----|||-----|--||----|||---||----|||-||||--- 1 [O] COG0830 Urease accessory protein UreF --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||-||||--- 1 [E] COG0831 Urea amidohydrolase (urease) gamma subunit --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||--|||--- 1 [E] COG0832 Urea amidohydrolase (urease) beta subunit --||--|||-------||||-|--------|-----------|||||-||--|---||-|||||-| 1 [M] COG0836 Mannose-1-phosphate guanylyltransferase --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0838 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 3 (chain A) --||||--|--||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0839 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J) --|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump |-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||-- 1 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component ---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 1 [C] COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1 ----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0845 Membrane-fusion protein ------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|-- 1 [K] COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family ----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases ----------------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0848 Biopolymer transport protein ---------|------||--||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division ----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||--- 1 [D] COG0850 Septum formation inhibitor ------------------||||--------------------||||||||--||||||-||||--- 1 [D] COG0851 Septum formation topological specificity factor --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit ----------------||||-|----|||||---||||----|||||--|--||||||||--||-- 1 [H] COG0853 Aspartate 1-decarboxylase --|---------------||-|-----||||------|----|||||-||--||||||||||||-- 1 [P] COG0855 Polyphosphate kinase ---|----|---------||-|-----||-------------||||||||||-||-|||------- 1 [R] COG0857 BioD-like N-terminal domain of phosphotransacetylase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A -|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||-- 1 [L] COG0863 DNA modification methylase |||-----||-----------|---|----|----|||----|||--------------||||--- 1 [F] COG1001 Adenine deaminase ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG1003 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), C-terminal domain --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1005 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 1 (chain H) ||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--|| 1 [P] COG1006 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1007 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N) --||||----------|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1008 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M) -----------------|---|--------||||||||-|--|||||||-------||-||-|--- 1 [G] COG1015 Phosphopentomutase -------------||-|----|----|-------|-||----|||||-||--|--|--|-|----- 1 [C] COG1017 Hemoglobin-like flavoprotein ---|---------||-----||----|||-----|-||----||||||||--||||---|||||-- 1 [C] COG1018 Flavodoxin reductases (ferredoxin-NADPH reductases) family 1 ---|------------|----|-----||--|----||---------------------|--|--- 1 [G] COG1023 Predicted 6-phosphogluconate dehydrogenase -------------||------|||||----|----------------------------------- 1 [R] COG1026 Predicted Zn-dependent peptidases, insulinase-like ----------------||||-|-----||-|-----------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1034 NADH dehydrogenase/NADH:ubiquinone oxidoreductase 75 kD subunit (chain G) ----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases |||||||||||||-------||--|-----------------|||||-|||||||||||------- 1 [O] COG1047 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2 --||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---||||||| 1 [C] COG1048 Aconitase A ||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit ------------------||-|||--|----||||||-----||||||||--|--|---||||||| 1 [R] COG1054 Predicted sulfurtransferase ---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||-- 1 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA --|||||||-||||||---|||--|-|||||-||||------|||||-|----------------- 1 [KL] COG1061 DNA or RNA helicases of superfamily II ----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 1 [C] COG1071 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, alpha subunit ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG1079 Uncharacterized ABC-type transport system, permease component --------------------||||-||---||||||||-|||||||||||||||||------||-- 1 [G] COG1080 Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria) |------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||-- 1 [M] COG1087 UDP-glucose 4-epimerase |-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||-- 1 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase |-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-|||| 1 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase -----------------|---|--------||||||||---------------------------- 1 [J] COG1098 Predicted RNA binding protein (contains ribosomal protein S1 domain) |||||||||||||||||-||-|----------------------------------------|--- 1 [R] COG1100 GTPase SAR1 and related small G proteins --|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-||||||||||||| 1 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes -----------------|--||---||||-||||||||--|||||||-||||---|---------- 1 [G] COG1105 Fructose-1-phosphate kinase and related fructose-6-phosphate kinase (PfkB) |-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 1 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components --|---||------------|||||-|-----|||-||----|||-|-||||-||-|||-||---- 1 [E] COG1115 Na+/alanine symporter ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 1 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component --|----------||------|----||||-|--||||----|||||----|-------------- 1 [P] COG1119 ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA |-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 1 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component --------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|------||-||||--- 1 [E] COG1125 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, ATPase components --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 1 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component ------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component ----------------||||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component --|-----|-|-|--------|--------------------|||||-|||||------||||||| 1 [O] COG1138 Cytochrome c biogenesis factor |--|||--|-|||-------||---------|----||----|||------|-||||||------- 1 [C] COG1139 Uncharacterized conserved protein containing a ferredoxin-like domain |||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I) |||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|--- 1 [C] COG1145 Ferredoxin ||||||-|||||-----|||-|----|||||-----------|||-|-||--|--||||||||||| 1 [C] COG1146 Ferredoxin ----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||-- 1 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1155 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit A ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1156 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit B ----------------||--|||||||||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG1158 Transcription termination factor ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1159 GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1160 Predicted GTPases ------------------||-|--------------------|||||-||-||||-|||------- 1 [E] COG1166 Arginine decarboxylase (spermidine biosynthesis) --------------------||----||||||-|-|||----|||||---|----|---------- 1 [E] COG1168 Bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities ---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [E] COG1171 Threonine dehydratase ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 1 [E] COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II ---|--||--|-|-----||||--|-|------|---|----|||||-||||-|||--|||||--- 1 [P] COG1178 ABC-type Fe3+ transport system, permease component --|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase) -------------||-|||||||||||||||||-||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1186 Protein chain release factor B ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases --|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||----- 1 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II) |-||--||--------||||||---|----||||||||------------------|||------- 1 [L] COG1193 Mismatch repair ATPase (MutS family) |--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase ----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------||||||| 1 [L] COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway) -||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||-- 1 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases -----------------|||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase ----------------||||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [LK] COG1200 RecG-like helicase ----------------||||||---------|||||||---------------------|||||-- 1 [J] COG1206 NAD(FAD)-utilizing enzyme possibly involved in translation ----------------||||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains) |||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||-- 1 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon) ------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone |-|--||||---|-----||-|----|||||-----------|---|--||-|--|---||-||-- 1 [R] COG1216 Predicted glycosyltransferases ------------------||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [T] COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit -|------|----|||-|--||--------|||||||-----------|----------------- 1 [C] COG1227 Inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase |--||||-|--|-|---|--||-----||-|-|-|-||-------||-||-----|---|||||-- 1 [Q] COG1228 Imidazolonepropionase and related amidohydrolases --|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||-- 1 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component ------------------||-|----|||-------|------------|-----|------||-- 1 [E] COG1231 Monoamine oxidase --||--|-|-|--||-|----|||--||||----||||-------|---------|-------|-- 1 [H] COG1232 Protoporphyrinogen oxidase ||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||-- 1 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III -||||||-|-||||||--||-|--------------------------||-----|---||-||-- 1 [J] COG1236 Predicted exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing ||||||--||--------||-|----|||--------------------|-----|---------- 1 [H] COG1239 Mg-chelatase subunit ChlI --||------------|----|-----|||------||----||||||||-|-|||---------- 1 [E] COG1246 N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferases --|-------|-|-----||-|----|---||-|||||----|||-|-||-----|---|||||-- 1 [M] COG1247 Sortase and related acyltransferases ---|-------|-||---||-|----||||-|--||||----|||||-|||----|---||||--- 1 [C] COG1252 NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit -||-|||||-|||----|-|-|---|--|-||||||||----|||||-||-|---|----|-|--- 1 [C] COG1254 Acylphosphatases |-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||-- 1 [R] COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease |-||--|||--------||||||-|-|---||||||||---------------------||||-|| 1 [R] COG1268 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1269 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit I |||||||||||||-----||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---||||--- 1 [H] COG1270 Cobalamin biosynthesis protein CobD/CbiB -------------|||----||--|||||-||||||||----|||||-||--|||----|||||-- 1 [R] COG1272 Predicted membrane protein, hemolysin III homolog ----------------|----|-------------|||----|||||--------|----|-|--- 1 [P] COG1276 Putative copper export protein ---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---||||||| 1 [K] COG1278 Cold shock proteins |-|-||--|||||----||--|----|---------||----|||||-|||||--|--||||||-- 1 [E] COG1280 Putative threonine efflux protein ----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family ----------------|-||||--|--||-||-|-|||----|||||--|||---|---|||---- 1 [S] COG1285 Uncharacterized membrane protein ------------------|--|------------|||-----|||||-||||||||--|||||--- 1 [S] COG1289 Predicted membrane protein ---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--|||||||||||||| 1 [C] COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex ||||||||||||||||-|||||---|----||||||||------------------|||------- 1 [K] COG1293 Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP --|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG1295 Predicted membrane protein --|-----|-----------||----|----|-|||||----|||||-||||-|||||-||||--- 1 [E] COG1296 Predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance) --------------------||---||---||||||||-||||||||-|||----|---------- 1 [G] COG1299 Phosphotransferase system, fructose-specific IIC component |-|||||||||||||||-||-|-----||--------------||||--|-----|---------- 1 [R] COG1310 Predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily ----------------|-|||||||||||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG ||||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|| 1 [P] COG1320 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhG subunit |||||||||||||----|---||||-||||||||||||----|||-|-----|---------|--- 1 [K] COG1321 Mn-dependent transcriptional regulator |-|-|||||||-|--|||-|-|-|------------------|||||-----|--|--------|| 1 [P] COG1324 Uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations -----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [K] COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains ---------------------|--||||||------||---------------------||||||| 1 [K] COG1329 Transcriptional regulators, similar to M. xanthus CarD |-||||--|-|||---|--|-|||---||-|-----|------------------------||--- 1 [O] COG1331 Highly conserved protein containing a thioredoxin domain --|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||-- 1 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 1 [M] COG1346 Putative effector of murein hydrolase ----------------||--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---||||--- 1 [KG] COG1349 Transcriptional regulators of sugar metabolism -||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [S] COG1354 Uncharacterized conserved protein --||--------------||-|--|-|||-||---|||----|||||--|-|-------||-|||| 1 [S] COG1357 Uncharacterized low-complexity proteins |||-----||---||-||||-|----||||||--||||-----------|---|||---|||||-- 1 [E] COG1364 N-acetylglutamate synthase (N-acetylornithine aminotransferase) -|--||||-|--||--|-||-|-----|||------|----------------------------- 1 [L] COG1372 Intein/homing endonuclease |||||||||||||--------|--------------|----------------------------- 1 [K] COG1378 Predicted transcriptional regulators --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 1 [R] COG1380 Putative effector of murein hydrolase LrgA ------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---||||||| 1 [L] COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) ----------------||||||--||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-|||||--------|||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [K] COG1386 Predicted transcriptional regulator containing the HTH domain |||||||||||-||||----||||||---------------------------------------- 1 [C] COG1390 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit E |||---|||--|-----|---|||------|---|||-----------||||---|---||-|--- 1 [P] COG1392 Phosphate transport regulator (distant homolog of PhoU) -------------------|||----|--||||||||||-|||||||-||||||||--||||||-- 1 [P] COG1393 Arsenate reductase and related proteins, glutaredoxin family ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1394 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit D -||-----|-------|--|-|--------|--|--------|||-|---------------|--- 1 [O] COG1397 ADP-ribosylglycohydrolase ----------------||||-|----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [R] COG1399 Predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein |-|-------|-----|--|-|||--||||||---|||----|------------||||-|-|--- 1 [R] COG1408 Predicted phosphohydrolases -----------------|||-|----|||||------|----|||||-|||-|--|---|||||-- 1 [E] COG1410 Methionine synthase I, cobalamin-binding domain |--|||--|-------|----|---------------------------------|------|--- 1 [S] COG1416 Uncharacterized conserved protein ||||||||||------||--||--||----|||||||||-|||||-|---------|||||----- 1 [R] COG1418 Predicted HD superfamily hydrolase ----||--|-|-|---|----|||-------------|------------------|||------- 1 [R] COG1427 Predicted periplasmic solute-binding protein ----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---||||||| 1 [S] COG1434 Uncharacterized conserved protein ---||-----|----|-|---|---|----|||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 1 [F] COG1435 Thymidine kinase ||||||||||||||||----||--|--------|-------------------------------- 1 [C] COG1436 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit F -----------------|---|-|--||||||||||||----|||||-|-||-------------- 1 [K] COG1438 Arginine repressor --------------------||---||---||||||||-||||||||-||||---|---------- 1 [G] COG1445 Phosphotransferase system fructose-specific component IIB ||||--|||-------|---||----|---|-------||--|||||-||--||||||||||||-| 1 [R] COG1451 Predicted metal-dependent hydrolase ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||-- 1 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF -----------------|--||----|||-||||||||||||------------------------ 1 [R] COG1461 Predicted kinase related to dihydroxyacetone kinase ----------------|-||-|--------------------|||||--|---|||-------|-- 1 [M] COG1462 Uncharacterized protein involved in formation of curli polymers ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit -----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---||||||| 1 [G] COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases --|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||-- 1 [H] COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis --------|----||--|---|---|||||||||||||-|--|||||-|--|-------------- 1 [G] COG1482 Phosphomannose isomerase -------------||------|-----||-------------|||||-||--||||---||||||| 1 [R] COG1485 Predicted ATPase -------------||-||--||----|||-||||||||----|||||-||||-|||---------- 1 [J] COG1490 D-Tyr-tRNAtyr deacylase ||||||--||-|------||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---|||||-- 1 [H] COG1492 Cobyric acid synthase --|---------------||||----|||||-----||----|||-|-|-||---------|||-- 1 [G] COG1494 Fructose-1,6-bisphosphatase/sedoheptulose 1,7-bisphosphatase and related proteins ---------------------|||------------||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG1495 Disulfide bond formation protein DsbB ----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein ------||-----------|-|----|||------------------------||-------|||| 1 [E] COG1505 Serine proteases of the peptidase family S9A ---|||||--|||||---|-||------------|-||-----------|--|------|---|-| 1 [E] COG1506 Dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases -||-------------||--||--|-----------||----|||||-|-|||------||-||-- 1 [E] COG1509 Lysine 2,3-aminomutase |--------------------|----||||||||||||---------------------------- 1 [S] COG1511 Predicted membrane protein |||-|||||||||---||-|-|----|---|---|-||----|||||--|-----|---|||||-- 1 [J] COG1514 2'-5' RNA ligase ---||||||||||-|-||-|-|--------|-----|-----|||||-----|------------- 1 [L] COG1515 Deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V) ----------------||||||--||-||||----|||-|---------|--|||||||----|-- 1 [K] COG1521 Putative transcriptional regulator, homolog of Bvg accessory factor |||||||||||--|||----||----------||-------------------------------- 1 [C] COG1527 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit C -------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase ------||------------||----|--|----|-||----|||||-|||--|||--||------ 1 [R] COG1540 Uncharacterized proteins, homologs of lactam utilization protein B |-|-----|--|-------|||---------------|----|--|--|---|--|---------- 1 [H] COG1541 Coenzyme F390 synthetase ----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---||||||| 1 [J] COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1) ---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||-- 1 [R] COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced) ---|||----|||---|-||-|------------|-||---------------------------- 1 [S] COG1547 Uncharacterized conserved protein -----------------|---|-----||||----|||---------------------------- 1 [S] COG1550 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|------- 1 [L] COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins ---|----|-----------||---------|----||----|||------|-||||||------- 1 [S] COG1556 Uncharacterized conserved protein ----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein |--|-------|-||---||-|----|||-----|-|---------------||||---|||||-- 1 [I] COG1562 Phytoene/squalene synthetase -------------||--|--||--|-----|||||||-------------------||-||||--- 1 [H] COG1564 Thiamine pyrophosphokinase -----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit --|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--||||||||||||| 1 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase --||||||----|---||--||-----||------|||--------|--|-----|---|||||-- 1 [R] COG1574 Predicted metal-dependent hydrolase with the TIM-barrel fold -----------------|--||--------||||||||||--|||||-||||||||||||||||-- 1 [S] COG1576 Uncharacterized conserved protein ----------------|----|||||||-||-------------------------|||------- 1 [R] COG1579 Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding ||-|--||-||||----|||||----|||||-----------|||||-||-||------|||||-- 1 [OU] COG1585 Membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity ------------------||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 1 [M] COG1589 Cell division septal protein |-|-----|---------||-|--------|-|-||||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [C] COG1600 Uncharacterized Fe-S protein ||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG1605 Chorismate mutase --|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||-- 1 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein ---|--------|||-|-||-|----||||----||||-----------|--|--|---||||||| 1 [O] COG1612 Uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly ----||------------||||--|-----||-|-|||-|--|||-|-||---|||--------|| 1 [V] COG1619 Uncharacterized proteins, homologs of microcin C7 resistance protein MccF ---|----||-|---------|---|--------|-||----|||-|-||||-||||||--|---- 1 [C] COG1620 L-lactate permease ---|----|-||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 1 [C] COG1622 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2 -|||--||||------|-||-|||||----||||||||-|||------------------------ 1 [S] COG1624 Uncharacterized conserved protein |||---||-|--------||-|--------|----------------------------------- 1 [C] COG1625 Fe-S oxidoreductase, related to NifB/MoaA family |||||||||||||--------|-------------------------------------------- 1 [S] COG1628 Uncharacterized conserved protein ----------|-----|-||||||-||||--|||--------|||||-||||---|---------- 1 [G] COG1640 4-alpha-glucanotransferase -------------|||-----|--|||---------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [L] COG1643 HrpA-like helicases -------------------|-|--||---------||-----|||-|-||-|||||---|||||-- 1 [S] COG1652 Uncharacterized protein containing LysM domain ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||----|||||-||-||--|---||||--- 1 [G] COG1653 ABC-type sugar transport system, periplasmic component --||---||------------|--------||||||||----|||||-|||||------------- 1 [K] COG1654 Biotin operon repressor --------------------||----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [R] COG1660 Predicted P-loop-containing kinase ||||--|||-|||----|---|--------||-|||||--------------|----------|-- 1 [CP] COG1668 ABC-type Na+ efflux pump, permease component -------------------|-||||||||||||||||||---|||||-|||||||||||||||||| 1 [D] COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins ---------------------|||--||||------------|||||-||||||||---||||||| 1 [K] COG1678 Putative transcriptional regulator |||||||||||||--|||-|-|----|||-|------|----|||-|--|-----|---------- 1 [S] COG1690 Uncharacterized conserved protein ----------------|---||---|--------||||||||-----------------|||||-- 1 [S] COG1692 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------||-|---||||-|----||||-|||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [T] COG1702 Phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase -----------------||-||--|-----||||||||||||------------------------ 1 [H] COG1713 Predicted HD superfamily hydrolase involved in NAD metabolism ----------||-||---||-|||--|||||------|--------------|------------- 1 [T] COG1716 FOG: FHA domain ||||||||||||||||-----|-----------------------|---|---------------- 1 [TD] COG1718 Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control -----------------|-|||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG1722 Exonuclease VII small subunit ---|----|----------|||-----||-|||||||-----|||-|--|-----|||-||||--- 1 [M] COG1732 Periplasmic glycine betaine/choline-binding (lipo)protein of an ABC-type transport system (osmoprotectant binding protein) ||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||-- 1 [K] COG1733 Predicted transcriptional regulators -----------|---------|-----||------|-|-||-|---|------------|--|--- 1 [R] COG1735 Predicted metal-dependent hydrolase with the TIM-barrel fold --||----|-|-|----|--||||-||-------|-|-----|||||-||||-||----||||--- 1 [S] COG1738 Uncharacterized conserved protein --||---------||--|--||---||---||||||||||--|||-|-||||-|||||||||---- 1 [S] COG1739 Uncharacterized conserved protein ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-|||||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG1744 Uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein ----|||-|-|-|||---||-|-----------|---|----------|--|----|||||||--- 1 [E] COG1748 Saccharopine dehydrogenase and related proteins ------------------||-|---|||||----------------------|------||||||| 1 [R] COG1754 Uncharacterized C-terminal domain of topoisomerase IA ---------------------|-----||---|||-||------------||-||----------- 1 [S] COG1755 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega -||-||||-|-||---||---|----|||-|----|-|--|||||||-||---|||---||-||-- 1 [O] COG1765 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation ---------------------|||------|----------------------------------- 1 [R] COG1768 Predicted phosphohydrolase -------------|||||--||--|-----||--||||---------------------------- 1 [S] COG1774 Uncharacterized homolog of PSP1 ---------------------|----||||-||||-|--||||||||------------|-|---- 1 [F] COG1780 Protein involved in ribonucleotide reduction --||---|-----||--|-|-|----|-------|-||----||||---|--|--|-----|---- 1 [P] COG1785 Alkaline phosphatase -----------------||--|---------------|------------------||-------- 1 [V] COG1787 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase and Mrr-like restriction enzymes |-|-||-------||-|----|------------||||---------------------------- 1 [L] COG1796 DNA polymerase IV (family X) ||||||--||||------||||-----||-|----|-|--------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG1797 Cobyrinic acid a,c-diamide synthase ----|------|-----|--||----|||-|||-||||----|||||-||---|||---|||||-- 1 [K] COG1802 Transcriptional regulators ---------------------|------------||||----|||||-||--||||---||||||| 1 [S] COG1806 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------|--------|--||--------|----|||----|||-|------------------- 1 [R] COG1811 Uncharacterized membrane protein, possible Na+ channel or pump ||--|||||||||||--|---||---|----|-----------------|------------||-- 1 [S] COG1814 Uncharacterized membrane protein |||------|---|----|--|-----||||-----|------||||-||------------|--- 1 [GC] COG1819 Glycosyl transferases, related to UDP-glucuronosyltransferase -----------|-----|-|||---||||-||||||||-|--|||||-|||||------|||||-- 1 [G] COG1820 N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase ----------------||||-|||||||||----||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc) ||||||||||||----||||-|----||||-|--||||--------------------|-||||-- 1 [F] COG1828 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, PurS component ---|||||--|||---||---|---------|||-|||----|||||--------|--|||-|--- 1 [R] COG1832 Predicted CoA-binding protein --|----------------|||----||||-||||||------||-|--||-||||---|||||-| 1 [I] COG1835 Predicted acyltransferases ----------------||||||||||-|||||||-|||------------------|||------- 1 [R] COG1837 Predicted RNA-binding protein (contains KH domain) ||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----|||||| 1 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E --|-------------|-||-|----|||-|----|||----|||||-||------------||-- 1 [KT] COG1842 Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription ---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 1 [C] COG1845 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3 -----------------|||||--||-|||||||-|||---------------------------- 1 [R] COG1847 Predicted RNA-binding protein -|----|||-|||--------|-----||-------------------------------|----- 1 [R] COG1848 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain ---------------------|---|----||||||||----|||||-|-||-||-|||------- 1 [T] COG1854 LuxS protein involved in autoinducer AI2 synthesis --|-------------|----|--------------------|||||-||-|---|||||--|--- 1 [P] COG1858 Cytochrome c peroxidase --|-|||||||-|||-----||--------------------|||----|---------|------ 1 [J] COG1859 RNA:NAD 2'-phosphotransferase ------------||------||------------|-||----|||||-||||------|||||--- 1 [C] COG1866 Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP) |-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---||||||| 1 [C] COG1894 NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit ---|--|||||||||------|------------||------|||||-||-|----||||||||-- 1 [R] COG1896 Predicted hydrolases of HD superfamily |-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||-- 1 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes |-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---||||||| 1 [C] COG1905 NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit ----||-----|-||----|||----||||||-|||||----|||||--|||||||---||||--- 1 [P] COG1914 Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family |||----|||-------||--|--------||--||------|||||-||--|--|-||----|-- 1 [P] COG1918 Fe2+ transport system protein A -----------------|||-|--|-----|---|||-----|||||-|---|------|-|||-- 1 [M] COG1922 Teichoic acid biosynthesis proteins --------------------|||||||---||||||||||||||||||||||||||---|||||-- 1 [G] COG1925 Phosphotransferase system, HPr-related proteins ----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase ------------------||-|----||||-----|||-----------------|---------- 1 [S] COG1950 Predicted membrane protein -----------|-||----|-|----|||-----|--|----|||-|--|-|---|--||||||-- 1 [F] COG1957 Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase -----||---|-------||-|----|||-|-||||||----|||||-||--|--|---|||||-- 1 [L] COG1961 Site-specific recombinases, DNA invertase Pin homologs -----------------|||-|--||-----|---|||---------------------------- 1 [S] COG1963 Uncharacterized protein conserved in bacteria |--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||-- 1 [V] COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein --|---------------|-||----||||-||||||-----|||||-|||||--|---|||||-- 1 [M] COG1970 Large-conductance mechanosensitive channel -----------------|||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|---|||||-- 1 [KT] COG1974 SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidases) --||||-||-||----|-||-|-----||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG1977 Molybdopterin converting factor, small subunit ------||-----|------||----||||----|-||----|||||-|||--|||--||---|-- 1 [E] COG1984 Allophanate hydrolase subunit 2 ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis ||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 1 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases ||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||-- 1 [R] COG1994 Zn-dependent proteases ---------------------|--|-|||||---|||||||||||||--|||||||----|--||| 1 [S] COG2001 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|---------||--|-|||--------|---||-|----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2008 Threonine aldolase ---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--|||||||||||||| 1 [C] COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component ----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||-- 1 [G] COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes |-||---------||------|----||||----||-------------|||||||------||-- 1 [E] COG2021 Homoserine acetyltransferase ----------------|-||||----|||||-----||----|||||-||--||||--||||||-- 1 [H] COG2022 Uncharacterized enzyme of thiazole biosynthesis ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 1 [C] COG2025 Electron transfer flavoprotein, alpha subunit --|---------------||-|----||||------|-----|||||-||||||||---------- 1 [M] COG2027 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein 4) |||||||||||||-----||||----|||||------|----|||-|-||-----|---|||||-- 1 [H] COG2038 NaMN:DMB phosphoribosyltransferase ------||---|--------||-----||---|||-||-------|---------|---------- 1 [O] COG2039 Pyrrolidone-carboxylate peptidase (N-terminal pyroglutamyl peptidase) ||--||---|-------|||-|--------|-----|------------------|---------- 1 [HR] COG2045 Phosphosulfolactate phosphohydrolase and related enzymes -------||-|||||-|-||-|--------------||--------------------|------- 1 [P] COG2046 ATP sulfurylase (sulfate adenylyltransferase) ------||-----|------||----||||----|-||----|||-|-|||--|||--||---|-- 1 [E] COG2049 Allophanate hydrolase subunit 1 -|---------------|||||---||---------||-|--------||-----|---||-||-- 1 [P] COG2059 Chromate transport protein ChrA ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||-- 1 [P] COG2060 K+-transporting ATPase, A chain ------------------||||----|||-||||||||-----------|||---|---------- 1 [F] COG2065 Pyrimidine operon attenuation protein/uracil phosphoribosyltransferase |--------||||--------|-----||-------||----|||----------|---||-||-- 1 [R] COG2068 Uncharacterized MobA-related protein --------|----|--||-|||----|||-||||||||-----------|--||||||||||-|-- 1 [R] COG2070 Dioxygenases related to 2-nitropropane dioxygenase -------------||---|--|----||||------||-----------|-----|---||-||-- 1 [P] COG2072 Predicted flavoprotein involved in K+ transport ||--||||-|-----------|-------------------------------------------- 1 [G] COG2074 2-phosphoglycerate kinase |-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||-- 1 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 1 [C] COG2086 Electron transfer flavoprotein, beta subunit ------------------||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||--- 1 [H] COG2087 Adenosyl cobinamide kinase/adenosyl cobinamide phosphate guanylyltransferase ------------|--|-----|-|-|-||||---|||------------|---------||-|-|| 1 [L] COG2094 3-methyladenine DNA glycosylase -||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||-- 1 [U] COG2095 Multiple antibiotic transporter ---||||||-|||-------||----||||-----|||--------|--|-----|---|||||-- 1 [S] COG2096 Uncharacterized conserved protein ------------------||-|--------||--|-||----|||||-|-||--------|-|--- 1 [R] COG2103 Predicted sugar phosphate isomerase |-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||-- 1 [H] COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis -||---|---||------||-|--------------||----|||||-||-----|---------- 1 [S] COG2105 Uncharacterized conserved protein ----||--|-|||---|----|||-------------|------------------|||------- 1 [R] COG2107 Predicted periplasmic solute-binding protein --||||||--|------|||||-----||-------------|||||-||-----|---||||--- 1 [H] COG2109 ATP:corrinoid adenosyltransferase --|-||||||||||--||--||-----||---|-||------|||-|--|-----|------|--- 1 [R] COG2110 Predicted phosphatase homologous to the C-terminal domain of histone macroH2A1 ------------------||-|----|||||-----------|||||-||--||||||||||||-- 1 [S] COG2127 Uncharacterized conserved protein --|-----|----------|-|----|||||--||-||----|||||--|---|||---|||||-- 1 [S] COG2128 Uncharacterized conserved protein --|-||||||---||--|--||--|-----||||||||-|--------|----------------- 1 [F] COG2131 Deoxycytidylate deaminase -----------------|--||--|-||||||||||||----|||||-||||-|||---|------ 1 [R] COG2137 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----||--|---|--------|-----|||------------|||||-||--||||---||||||| 1 [C] COG2142 Succinate dehydrogenase, hydrophobic anchor subunit --||||----||--|---||-|----||------|-||----|||||--|--|--|---||-||-- 1 [PR] COG2146 Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenases ---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||-- 1 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||-- 1 [P] COG2156 K+-transporting ATPase, c chain ------------------||-|||---||-------------|||||-|||||------|||||-- 1 [R] COG2166 SufE protein probably involved in Fe-S center assembly -------------------|||----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 1 [D] COG2177 Cell division protein -----------------|||-|---------|||||||---------------------------- 1 [R] COG2179 Predicted hydrolase of the HAD superfamily ----|-||--|||----|---|---------|||||||----|||||-|----------|------ 1 [G] COG2182 Maltose-binding periplasmic proteins/domains ---------------------|----|||||----|||----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [K] COG2186 Transcriptional regulators |-|-|||||------------|-------------------------------------------- 1 [C] COG2191 Formylmethanofuran dehydrogenase subunit E -|----||-|--------|--|---------------------------|-----|----|-|--- 1 [O] COG2192 Predicted carbamoyl transferase, NodU family --|-----------------||---|----||||||||----|||||-|-||------|-|--|-- 1 [E] COG2195 Di- and tripeptidases ------------------||-|-----||-|---||------|||||-||-----|--|||-||-- 1 [T] COG2205 Osmosensitive K+ channel histidine kinase |-||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|- 1 [P] COG2212 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit ---|---------|||-|||-|--||----|---------|||||-|-||--|||-||||||||-- 1 [O] COG2214 DnaJ-class molecular chaperone ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|--|||-||-- 1 [P] COG2216 High-affinity K+ transport system, ATPase chain B ||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--| 1 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold |-----||-|-------|--||--------|-||-||-----|||||--|--|------|||||-- 1 [M] COG2222 Predicted phosphosugar isomerases -----------|-||------|----||||-------|----|||||-||-----|---|||||-- 1 [C] COG2224 Isocitrate lyase --|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis -------------||---||-|--------------------|||||-||-|||||---||||||| 1 [H] COG2227 2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4-benzoquinol methylase ||-------|---||-|----|-----||------------------------||----------- 1 [R] COG2229 Predicted GTPase --|-------------|----|----|||||-----------|||||-||-----|||||||||-- 1 [M] COG2230 Cyclopropane fatty acid synthase and related methyltransferases -------------||------|---||---|-|---------|||||--|||-------|||||-- 1 [H] COG2240 Pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase ||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid -|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|-- 1 [R] COG2252 Permeases -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit -------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 1 [L] COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase ---|-------|-||----|-|----||||----|-||----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [S] COG2259 Predicted membrane protein -------------------|-|----||||-||||-|-----|||||--|-----|---|||||-- 1 [S] COG2261 Predicted membrane protein -|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [R] COG2262 GTPases ----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase ------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase ------------------||||---------|||||||---------------------------- 1 [S] COG2302 Uncharacterized conserved protein, contains S4-like domain --|-----|--||-----||||---|||||------||----|--||-||------------|--- 1 [R] COG2304 Uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain ------||-------------|----|||-----|------------------------------- 1 [S] COG2306 Uncharacterized conserved protein ------------------|--|-----|||-------------------|-----|---||-||-- 1 [S] COG2307 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------|------|--|-----|||-------------------|-----|---||-||-- 1 [S] COG2308 Uncharacterized conserved protein ---|-----------------|----|---------||----|||||-----|----------|-- 1 [S] COG2311 Predicted membrane protein --------------|--|---|------------||------|||--------------||-|--- 1 [Q] COG2313 Uncharacterized enzyme involved in pigment biosynthesis -||---------------||-|---|-||--|--|-||-----------|-----|---------- 1 [S] COG2314 Predicted membrane protein --------------------||----|----|||-||-----|||||--|-----|---|--||-- 1 [S] COG2315 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------|--------|---|-------------------------------------------- 1 [R] COG2316 Predicted hydrolase (HD superfamily) ---|--||--|||-------||-------------|||-------|--|-------------|--| 1 [E] COG2317 Zn-dependent carboxypeptidase --||-----------------|-----|||------||----------||---------------- 1 [S] COG2320 Uncharacterized conserved protein ---------------------|----|||---|---------|||||--|-|---|---||||--- 1 [R] COG2321 Predicted metalloprotease ---|------------|----|------------||||---------------------------- 1 [S] COG2322 Predicted membrane protein -------------------|||--------||-|--||----|||-|-------------|----- 1 [S] COG2323 Predicted membrane protein |--|--------------||-|-------------------------------------------- 1 [S] COG2324 Predicted membrane protein --|---------------||-|----|||-------------------||-----|--||||||-- 1 [S] COG2326 Uncharacterized conserved protein |----------------|||-|--------|-----------|||-|------------|-|---- 1 [S] COG2327 Uncharacterized conserved protein -----------------|---|-----|||-------------------------|---------- 1 [S] COG2331 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|------------------|--------------------|||||-|||||------||||||| 1 [O] COG2332 Cytochrome c-type biogenesis protein CcmE --|---------------|-||--------------||----|||||-||---|||---|||||-- 1 [R] COG2334 Putative homoserine kinase type II (protein kinase fold) --|----------||---||-|-----||------------------------------||-||-- 1 [M] COG2335 Secreted and surface protein containing fasciclin-like repeats -------------------|-|---------------|----|||--------|||---|------ 1 [T] COG2336 Growth regulator ---|--||-----------|-|----|-----||||||---------------------------- 1 [S] COG2339 Predicted membrane protein -|-------|-------|--||---------------------------------|---------- 1 [G] COG2342 Predicted extracellular endo alpha-1,4 polygalactosaminidase or related polysaccharide hydrolase ------------------||-|-----||--------------------------|----|-|--- 1 [S] COG2343 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|---|--------||||||||---------------------------- 1 [R] COG2344 AT-rich DNA-binding protein ----||------------||-|----||||-------|-------|--|----------------- 1 [K] COG2345 Predicted transcriptional regulator ------------------|--|----||||----|-||-----------------|--||||||-- 1 [R] COG2346 Truncated hemoglobins --|------------------|--||------|||------------------------------- 1 [V] COG2348 Uncharacterized protein involved in methicillin resistance ------------------||||----|---|-----|-----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [S] COG2350 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------|------|--------------||----|||-|--|-----|--||||||-- 1 [R] COG2351 Transthyretin-like protein ------------------||-|----|--|--||--------|||||-||||-|||-------|-- 1 [C] COG2352 Phosphoenolpyruvate carboxylase ----||---------------|----|||-----||------|||||-||--|||||||||-||-- 1 [S] COG2353 Uncharacterized conserved protein ---------------------|----|||-------------|||-|-||---|-------|-|-- 1 [S] COG2354 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------||--|||-|------|||-----------|-|-----------|-----|---|||||-- 1 [E] COG2355 Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase homolog ---------------------|--------------|-----||||||||---------------- 1 [L] COG2356 Endonuclease I --------------------||----|||-||||||||---------------------------- 1 [S] COG2357 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|----|---|-----|--|---------------|----------||-|--------||--|| 1 [R] COG2358 TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component -----------------|---|--------|-----||---------------------------- 1 [S] COG2359 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|--------------------|||||-||--||||--||||||-- 1 [O] COG2360 Leu/Phe-tRNA-protein transferase ------||----|--------|-------------||------------------|------|--- 1 [E] COG2362 D-aminopeptidase --------------|----|-|------------||||----|||||-||||-------|||||-- 1 [S] COG2363 Uncharacterized small membrane protein ---------------------|----|---|-----||------------||-------------- 1 [S] COG2364 Predicted membrane protein -------------||------|-----||--|---|---------|---|-----|---|---|-- 1 [T] COG2365 Protein tyrosine/serine phosphatase ----||--|-|||-----||-|---------------------------|-----|-----|-|-- 1 [R] COG2366 Protein related to penicillin acylase --------|-||---------|--------------||-------||--|-|-------------- 1 [Q] COG2368 Aromatic ring hydroxylase -|-------------------|-------------|--------|-----|-|||----------- 1 [S] COG2369 Uncharacterized protein, homolog of phage Mu protein gp30 ----------------|-||-|---------------------------|-----|---|--|--- 1 [O] COG2370 Hydrogenase/urease accessory protein ------------------||-|----|-------|--||----|||---||----|||-||||--- 1 [O] COG2371 Urease accessory protein UreE ---------------------|----|--------|||----|||||--------|----|-|--- 1 [R] COG2372 Uncharacterized protein, homolog of Cu resistance protein CopC -----------------|-|||--------------------|||||--|-||--|---||-|||| 1 [R] COG2373 Large extracellular alpha-helical protein ------------------||-|--|-|-----|---------------||---------------- 1 [R] COG2374 Predicted extracellular nuclease -------------||-----||---------|--||-|----||||-----|-------||||--- 1 [G] COG2376 Dihydroxyacetone kinase ---------|--------||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG2377 Predicted molecular chaperone distantly related to HSP70-fold metalloproteases --------------------||----|||||---||||----|---|-||--|-||--||||||-- 1 [K] COG2378 Predicted transcriptional regulator ----||||--|||----|---|---------------------------|-----|---||||--- 1 [G] COG2379 Putative glycerate kinase ----------------||---|-------------------------------------------- 1 [S] COG2380 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|----|---|---||||----|||-|--|---------------- 1 [P] COG2382 Enterochelin esterase and related enzymes -|----||----|--------|-------------------------------------------- 1 [S] COG2383 Uncharacterized conserved protein ---------------------|--------|||||||||-||------|----------------- 1 [R] COG2384 Predicted SAM-dependent methyltransferase ------------------||||--------|-----||---------------------------- 1 [D] COG2385 Sporulation protein and related proteins --|-----|------------|--------------------|||||-|||||------|||||-- 1 [O] COG2386 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component --------|---|-------||----|----|--||------|||---||-|-------|||||-- 1 [R] COG2388 Predicted acetyltransferase --|-------------|-||-|-------------------------------------------- 1 [R] COG2389 Uncharacterized metal-binding protein ---------------------|--------||||||||----|||||-|--|---|---||||--- 1 [K] COG2390 Transcriptional regulator, contains sigma factor-related N-terminal domain ----||----|||--------|----|||||---|||----------------------------- 1 [R] COG2409 Predicted drug exporters of the RND superfamily -||---||--||-||----|-|----|---------------||||--||---------------- 1 [T] COG2453 Predicted protein-tyrosine phosphatase -------------------|||----|---||||||||||--|||||-|----|||---------- 1 [S] COG2501 Uncharacterized conserved protein ---------------------|----||||||||-|||-----------|---------|------ 1 [TQ] COG2508 Regulator of polyketide synthase expression ----------|-|--------|----|-----||||||---------------------||||--- 1 [R] COG2514 Predicted ring-cleavage extradiol dioxygenase --||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||---- 1 [P] COG2608 Copper chaperone ---------------------|----||||------------||||||||||||||------||-- 1 [C] COG2609 Pyruvate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component -------------------|-|--|-----|-----------|||||--|-|---|--||||-|-- 1 [S] COG2717 Predicted membrane protein -----------------|---|--------|---||||---------------------------- 1 [R] COG2738 Predicted Zn-dependent protease -------------------|||----||||||||||||||----------------||||||||-- 1 [K] COG2740 Predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination ---|-------|---------|----|---|---||||----------|---|--|---|||||-- 1 [Q] COG2761 Predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis --|-----|-------|-||-|--------------|-----------||-----|---||-|--- 1 [T] COG2770 FOG: HAMP domain --------------|---||-|-----||-------------------||-----|---|||||-- 1 [R] COG2802 Uncharacterized protein, similar to the N-terminal domain of Lon protease ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 1 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB ---------------------|----|---|--|-||-----|||-|--|-----|--|--|---- 1 [P] COG2807 Cyanate permease -------------|-------|--------------||-----------|--|--|------||-- 1 [K] COG2808 Transcriptional regulator ------||----|--------|-------------------------------------------- 1 [V] COG2810 Predicted type IV restriction endonuclease |||||||||------------|-------------------------------------------- 1 [C] COG2811 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit H ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits -|----||-|-|-----|---|---------|||||||----||||||||||-------|||||-- 1 [J] COG2813 16S RNA G1207 methylase RsmC -----------------|--||--||||||||||||||---------------------------- 1 [S] COG2815 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----------||------|----|||-|-----------|||||-||||-------|||||-- 1 [L] COG2816 NTP pyrophosphohydrolases containing a Zn-finger, probably nucleic-acid-binding ---------------------|--------|--|--|------||-|--|---|----||---|-- 1 [R] COG2819 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily ---------------------|--------|-----------|||||-||||-|||----|---|| 1 [R] COG2823 Predicted periplasmic or secreted lipoprotein --------------------||-----------||-------|||-|-||||-||----|||---- 1 [S] COG2832 Uncharacterized protein conserved in bacteria -|||----|-------|----|--||----|-----||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG2834 Outer membrane lipoprotein-sorting protein -------------------|-|----|||-----|||-----|||||-||-|-|||------|--- 1 [P] COG2837 Predicted iron-dependent peroxidase -------------------|-|------------|-||---------------||----------- 1 [S] COG2839 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|------------||--------|-----|--||----------- 1 [R] COG2842 Uncharacterized ATPase, putative transposase --|------------------|-----||---||-||----------------||-----|-||-- 1 [M] COG2843 Putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation) ----------|-----|----|----|---------------------||-|-|||--|||||||| 1 [S] COG2847 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|-------------|------|-------|--||-----|--|-- 1 [S] COG2852 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|||---|-||-|--|||||--------------||-|-----|---- 1 [E] COG2856 Predicted Zn peptidase ---|------||---------|----|----||---||----|||||-||||---|--||||||-- 1 [S] COG2860 Predicted membrane protein ---------------------|-----------------------|--||-|-||||||-|----- 1 [C] COG2863 Cytochrome c553 --|----|------------||----|-----------|-------------------|------- 1 [K] COG2865 Predicted transcriptional regulator containing an HTH domain and an uncharacterized domain shared with the mammalian protein Schlafen --|-||||--||||---|--||--------|------|----------||-----|---||||--- 1 [R] COG2872 Predicted metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase HxxxH domain ----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------ 1 [E] COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase -------------------|-|----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 1 [D] COG2884 Predicted ATPase involved in cell division |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors ----------------||||||--------|----|||----||||||||--||||||-||||--- 1 [D] COG2894 Septum formation inhibitor-activating ATPase |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG2896 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme ---------------------|-----|||-|--------------------|------|||---- 1 [S] COG2899 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------||------|------------------------------|--|-------|-- 1 [E] COG2939 Carboxypeptidase C (cathepsin A) --------------|---||-|---------------------------|--|--|---||||--- 1 [S] COG2947 Uncharacterized conserved protein -------------------|-|--------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG2949 Uncharacterized membrane protein ---------------------|---------|-|-----------|---|--|---|||----|-- 1 [E] COG2957 Peptidylarginine deiminase and related enzymes -----|--------------||----|||--|||||-|----|||||-|||----|---|||||-- 1 [L] COG2963 Transposase and inactivated derivatives ---------------------|--------------------|||||-||--|--|---|||||-- 1 [P] COG2967 Uncharacterized protein affecting Mg2+/Co2+ transport ----||-----|-----|-|-|--------|-----------------|-----------|||--- 1 [G] COG2971 Predicted N-acetylglucosamine kinase ---|||--------------||----------|-|-||-------||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2986 Histidine ammonia-lyase ---|||--------------||----------|-|-||-------|--||-----|---|||||-- 1 [E] COG2987 Urocanate hydratase ---------------------|----|---------------|||||-||||-|-|---------- 1 [S] COG3012 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|--------------------|||||--||||------|||||-- 1 [O] COG3088 Uncharacterized protein involved in biosynthesis of c-type cytochromes ------------------|--|--------------------|||||--|--|--|---||-|--| 1 [NU] COG3121 P pilus assembly protein, chaperone PapD ---------------------|----|---------|-----|||||--|--|------------- 1 [S] COG3162 Predicted membrane protein ---------------------|--------------------------||--|-------||---- 1 [S] COG3169 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||-----------------|-----||--|---|||-----------|-----|---||-||-| 1 [R] COG3173 Predicted aminoglycoside phosphotransferase ---------------------|------------------------|--||---------|----- 1 [R] COG3179 Predicted chitinase --|------------------|------------------------|-||------------|--- 1 [V] COG3183 Predicted restriction endonuclease ------||---|---------|----||||-------------------|-----|---|||||-- 1 [EQ] COG3191 L-aminopeptidase/D-esterase ---------------------|----|---------||-----------|-----|---|||||-- 1 [S] COG3195 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|-----||-------------|||-|--|---------||-||-- 1 [S] COG3214 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|---------------------------|---------------- 1 [S] COG3224 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|---------------------------|---||----|------ 1 [P] COG3230 Heme oxygenase ---------------------|-----||--|-----------------|----------|-|--- 1 [J] COG3231 Aminoglycoside phosphotransferase ---------------------|-----------------------||-||-|---|-----|---- 1 [E] COG3232 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate isomerase -------------------|-|----|---------------|------|---------------- 1 [S] COG3236 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------|-----------||-----|---------------------|-----|---||-|--- 1 [S] COG3246 Uncharacterized conserved protein ---|||-----||--------|----||||----||||---------------------------- 1 [S] COG3253 Uncharacterized conserved protein ---------------------|--------------------|||-|--|---------||||--- 1 [R] COG3257 Uncharacterized protein, possibly involved in glyoxylate utilization -------------||----|-|----|---------------|||||-||-|-|||---||-|--- 1 [G] COG3265 Gluconate kinase -----------|-------|-|----|||-----------------|--|-----|----|----- 1 [G] COG3280 Maltooligosyl trehalose synthase -|-|------|-|--------|-------------------------------------------- 1 [S] COG3294 Uncharacterized conserved protein ---------------------|--------------------------|---|--|-------|-- 1 [S] COG3295 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|------------|--------------|---------------- 1 [S] COG3296 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|----||||------||----------------------|-|--- 1 [S] COG3336 Predicted membrane protein -------------------|||----|--------|||----|||-|---||-------------- 1 [E] COG3340 Peptidase E ---|-----------------|----|-------------------------|------------- 1 [S] COG3358 Uncharacterized conserved protein --|-|------|-------|-|--||-||-|-----||----|||-|--|-----|----|-|--- 1 [S] COG3391 Uncharacterized conserved protein ---|-----------------|--------------|----------------------------- 1 [S] COG3403 Uncharacterized conserved protein ----||-----------|--||--------|-|--------------------------------- 1 [E] COG3404 Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase --|-||||---|-|-----|-|---------------|----------------------|-|--- 1 [G] COG3408 Glycogen debranching enzyme --|---------------||-|----|||||-----||----------|------|---||||--- 1 [M] COG3409 Putative peptidoglycan-binding domain-containing protein ---|------------||||-|---------------|-----------------|---------- 1 [C] COG3411 Ferredoxin --------------------||---------|-|||-|----|||-----------------|--- 1 [S] COG3412 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|---|--------|----||----------------------------- 1 [C] COG3426 Butyrate kinase ---|||----|||--------|-----||--------------------------|----|||--- 1 [S] COG3427 Uncharacterized conserved protein ------------------||-|----||||------------------------------------ 1 [G] COG3429 Glucose-6-P dehydrogenase subunit --||-|---------------|----------||---------|||-------------||||--- 1 [L] COG3436 Transposase and inactivated derivatives -----------------|||-|--|-----|-----------------||--|------------- 1 [KT] COG3437 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HD-GYP domain -----|-------------|-|---------------------||--------||----------- 1 [V] COG3440 Predicted restriction endonuclease ---------------------|---------------|----|------------|----|----- 1 [Q] COG3460 Uncharacterized enzyme of phenylacetate metabolism |-|||--------------|||--------||-----|--------|------|||----|||--- 1 [R] COG3467 Predicted flavin-nucleotide-binding protein ---------------------|---------------------------|-----|------||-- 1 [E] COG3483 Tryptophan 2,3-dioxygenase (vermilion) -------------------|-|-----||------------------------------|||||-- 1 [S] COG3502 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|------------|-||-----------|-----|---|||||-- 1 [R] COG3545 Predicted esterase of the alpha/beta hydrolase fold |--------------------|---------|------------------------------||-- 1 [S] COG3548 Predicted integral membrane protein -------------||------|---------------------------|---------||-|--- 1 [L] COG3569 Topoisomerase IB ---------------------|---------------------------|---------||-|--- 1 [V] COG3570 Streptomycin 6-kinase ---------------------|-----||------------------------------|-||--- 1 [R] COG3573 Predicted oxidoreductase -------------------|-|---------|-|-----------|--|----------|--||-- 1 [S] COG3575 Uncharacterized protein conserved in bacteria |||----------------|||-----|||--|----------------|---------||-||-- 1 [R] COG3576 Predicted flavin-nucleotide-binding protein structurally related to pyridoxine 5'-phosphate oxidase -----------------|---|--------||---|||---------------------------- 1 [S] COG3584 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|---------|-------------------------|-------- 1 [S] COG3597 Uncharacterized protein/domain associated with GTPases ------------------||-|----||||||||||||-|-------------------------- 1 [D] COG3599 Cell division initiation protein --|-----|------------|-------------------------------------||-|--- 1 [S] COG3603 Uncharacterized conserved protein ------------------|--|--------------------------||------------|--- 1 [T] COG3614 Predicted periplasmic ligand-binding sensor domain --||-----------------|-----||-------|------------|---------|--||-- 1 [R] COG3631 Ketosteroid isomerase-related protein |||-|||||||||---||---|-------------------------------------------- 1 [G] COG3635 Predicted phosphoglycerate mutase, AP superfamily ---------------------|---------------------------|-----|-------|-- 1 [S] COG3644 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------|------|--------------||---------------------------- 1 [Q] COG3648 Uricase (urate oxidase) ---------------------|---------------------------|----------|-||-- 1 [S] COG3652 Predicted outer membrane protein ---------------------|------------------------------|----------|-- 1 [S] COG3656 Predicted periplasmic protein --|-----------|------|--------------------|||-|----|-|||--|----|-- 1 [L] COG3663 G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase --------------|------|--------------|----------------------||--|-- 1 [S] COG3665 Uncharacterized conserved protein -------------------|-|-----||--------------|||--||--|--|---|||||-- 1 [R] COG3668 Plasmid stabilization system protein ---------------------|---------------------||--------||----------- 1 [S] COG3680 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------|------|----|||--|---|------|||||-||---------------- 1 [L] COG3695 Predicted methylated DNA-protein cysteine methyltransferase ---------------------|--------------------|||--------------||||--- 1 [S] COG3698 Predicted periplasmic protein ----------------|-||-|--------||---|||-----------|---|||---|||||-- 1 [E] COG3705 ATP phosphoribosyltransferase involved in histidine biosynthesis -----------|--|----|-|--------------------|-------------------|--- 1 [Q] COG3733 Cu2+-containing amine oxidase ---------------------|-----------------------|---|---------|||||-- 1 [E] COG3741 N-formylglutamate amidohydrolase -------------------|-|--------------------|||-|--|---------||-||-- 1 [S] COG3755 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|---------------------|||-------------|---|-- 1 [P] COG3793 Tellurite resistance protein ---------------------|----|-----|------------|-----------------|-- 1 [O] COG3823 Glutamine cyclotransferase ----|--|--||-----|---|---------|||||||-|--|||||-|----------------- 1 [G] COG3833 ABC-type maltose transport systems, permease component ---------------------|------------|-------|||||--|-|---|---||||--- 1 [G] COG3836 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase |||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||--- 1 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components ---|---------|-------|---------------------------|-----|------|--- 1 [E] COG3844 Kynureninase ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG3845 ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase components --|------------------|--------|||-||||---------------------------- 1 [P] COG3853 Uncharacterized protein involved in tellurite resistance -------------------|-|--------|------|---------------------------- 1 [S] COG3860 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|---|--------|----------------------------------- 1 [S] COG3864 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|--------|---||||---------------------------- 1 [S] COG3870 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------|---|--------|----------------------------------- 1 [S] COG3877 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------||--------|---|||----------------------------- 1 [S] COG3878 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|--------|-----||---------------------------- 1 [S] COG3881 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|--------|------|---------------------------- 1 [T] COG3947 Response regulator containing CheY-like receiver and SARP domains ------------------|--|--------|----------------------------------- 1 [R] COG3968 Uncharacterized protein related to glutamine synthetase ---------------------|-----||-------------|||||--|-|---|---|-|-|-- 1 [Q] COG3971 2-keto-4-pentenoate hydratase ---------------------|----|---|-----|----------------------------- 1 [R] COG3973 Superfamily I DNA and RNA helicases --------------------||----|---||||---|----------|--|----------|--- 1 [R] COG3981 Predicted acetyltransferase ---------------------|-----||-------------||||---|---------||||--- 1 [R] COG4106 Trans-aconitate methyltransferase ------------------||-|----|---||||||------||||||||||||||---|||||-- 1 [J] COG4108 Peptide chain release factor RF-3 ---------------------|--------|------------|||-------------------- 1 [R] COG4110 Uncharacterized protein involved in stress response ||--------------|-||-|---|----------------|||||-||||---|--|||--|-- 1 [S] COG4121 Uncharacterized conserved protein --||--------|-|-|-||||----||||||||||||-----------|---||-------|--- 1 [R] COG4122 Predicted O-methyltransferase ---|--||--|----------|--|-----------------|||||-|-||-||----||||--- 1 [H] COG4143 ABC-type thiamine transport system, periplasmic component --------|-------|--|-|----|---------||----|||||-||--|--|---------- 1 [R] COG4147 Predicted symporter ---------------------|--------|-----|-----------------------|----- 1 [E] COG4187 Arginine degradation protein (predicted deacylase) ---|---------||---||||----|||--|-|||------|||-|-||||||||||||||---- 1 [R] COG4221 Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity -------------------|-|---------------------||-------|--|----|----| 1 [S] COG4226 Uncharacterized protein encoded in hypervariable junctions of pilus gene clusters -------------------|-|--------------------|||--------------------- 1 [R] COG4248 Uncharacterized protein with protein kinase and helix-hairpin-helix DNA-binding domains ------------------||-|---------------------------|---------|------ 1 [T] COG4251 Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase) ------------------||-|---------------------------|-----|----|--|-- 1 [T] COG4252 Predicted transmembrane sensor domain --|------------------|-----------|--------|--|------------|------- 1 [V] COG4268 McrBC 5-methylcytosine restriction system component ---------------------|--------------------|||||--------|---||----- 1 [S] COG4269 Predicted membrane protein -------------------|-|------------|--------------|---------------- 1 [S] COG4270 Predicted membrane protein -------------||------|---------------------------------|---------- 1 [I] COG4281 Acyl-CoA-binding protein -------------||------|--------------------------------------|----- 1 [G] COG4282 Protein involved in beta-1,3-glucan synthesis ---------------------|----|-------------------------|--|---------- 1 [F] COG4290 Guanyl-specific ribonuclease Sa ---------------------|---------------------------------|---||||--- 1 [S] COG4291 Predicted membrane protein ---------------------|------------||-------------------|---||----- 1 [S] COG4292 Predicted membrane protein -------------------|-|-----||------------------------------------- 1 [S] COG4293 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------|----|-|--------------||---------------------------- 1 [L] COG4294 UV damage repair endonuclease -------------------|-|--------|----------------------------------- 1 [S] COG4295 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|--------|----------------------------------- 1 [S] COG4296 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|--------------|----------------------||----- 1 [S] COG4297 Uncharacterized protein containing double-stranded beta helix domain -------------------|-|----------------------------------------|--- 1 [S] COG4298 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|-----------------------------------------|-- 1 [S] COG4299 Uncharacterized conserved protein ---------------------|------------|-||---------------------------- 1 [PE] COG4362 Nitric oxide synthase, oxygenase domain ---------------------|------------|-||---------------------------- 1 [S] COG4365 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|---------|--||------------------------------ 1 [S] COG4367 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|-------------------------------------------- 1 [S] COG4370 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|-------------------------------------------- 1 [S] COG4371 Predicted membrane protein ------------------||-|-------------------------------------------- 1 [S] COG4372 Uncharacterized protein conserved in bacteria with the myosin-like domain ---------------------|----------------------|-----|--------------- 1 [R] COG4373 Mu-like prophage FluMu protein gp28 ---------------------|-----------------------------------------|-| 1 [S] COG4374 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|---------|-|||-|----------||-----|---------- 1 [S] COG4392 Predicted membrane protein ---------------------|----|||--|---------------------------||-||-- 1 [S] COG4420 Predicted membrane protein ---------------------|-------------|||----|||||-|----------------- 1 [R] COG4533 ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component -----------------|---|--|-----|-----|---------------|------------- 1 [CP] COG4555 ABC-type Na+ transport system, ATPase component ---------------------|----|----------------|||--||-|-------||-|--- 1 [P] COG4558 ABC-type hemin transport system, periplasmic component ---------------------|----|----------------|||--||---------||-|--- 1 [P] COG4559 ABC-type hemin transport system, ATPase component --|-------------|---||--||----|-----------|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG4591 ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG4603 ABC-type uncharacterized transport system, permease component --|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||--- 1 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component ------------------||-|---------------|---------------------------- 1 [S] COG4627 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|-----------------------|--|----------------- 1 [S] COG4628 Uncharacterized conserved protein ---------------------|---------------------------|-----|---||||--- 1 [F] COG4630 Xanthine dehydrogenase, iron-sulfur cluster and FAD-binding subunit A ---------------------|---------------------------|-----|---|||||-- 1 [F] COG4631 Xanthine dehydrogenase, molybdopterin-binding subunit B ---------------------|--------|--------------|-------------|--|--- 1 [L] COG4644 Transposase and inactivated derivatives, TnpA family ---------------------|--------||-|||||--|-||||||||||---|---------- 1 [G] COG4668 Mannitol/fructose-specific phosphotransferase system, IIA domain ------------------||-|----|----------|-------|---|-----|---||-|--- 1 [R] COG4674 Uncharacterized ABC-type transport system, ATPase component ---------------------|---------|||-------------------------------- 1 [S] COG4696 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|--------||---------------------------------- 1 [S] COG4712 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||---------------|-|--------------------------|--------------|-- 1 [S] COG4715 Uncharacterized conserved protein -------------------|-|--------------------------------------|----- 1 [S] COG4719 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------||-||||||||||----------------|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87 --|---------------|--|-------------------------------------------- 1 [S] COG4828 Predicted membrane protein --|---------------|--|--------|----------------------------------- 1 [V] COG4845 Chloramphenicol O-acetyltransferase ---------------------|----|||------------------------------------- 1 [R] COG4867 Uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain --|------------------|--------------|----------------------------- 1 [S] COG4895 Uncharacterized conserved protein -|---------------|-|-|----|-------------------|------------|------ 1 [R] COG4928 Predicted P-loop ATPase ------------------||-|--------||--||||---------------------------- 1 [R] COG4956 Integral membrane protein (PIN domain superfamily) ---------------------|---------------------------|-|---|---||-||-- 1 [U] COG4964 Flp pilus assembly protein, secretin CpaC ------------------||-|--------------------------||--||||---------- 1 [NU] COG4972 Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM ---------------------|---------|||||||---------------------------- 1 [T] COG5002 Signal transduction histidine kinase ---------------------|----|---------------|||||-||-----|------||-- 1 [R] COG5006 Predicted permease, DMT superfamily -------------------|-|---------------|-----------------|---|--||-- 1 [T] COG5278 Predicted periplasmic ligand-binding sensor domain --|------------------|---------|--|||----------------------------- 1 [S] COG5280 Phage-related minor tail protein ------------------||-|---------------------------------|---------- 1 [R] COG5322 Predicted dehydrogenase ---------------------|--------------------|||||-|-||-||----------- 1 [S] COG5339 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|--------------------------------------|-|--- 1 [S] COG5403 Uncharacterized conserved protein --|------------------|----||||------------------------------------ 1 [M] COG5479 Uncharacterized protein potentially involved in peptidoglycan biosynthesis --|--------||----|--||----|-----|--------------------------------- 1 [R] COG5496 Predicted thioesterase ---------------------|------------|-||---------------------------- 1 [O] COG5504 Predicted Zn-dependent protease -----------------|||-|----||||------------------------------------ 1 [R] COG5512 Zn-ribbon-containing, possibly RNA-binding protein and truncated derivatives ---------------------|--------------------------------------|-|--- 1 [S] COG5530 Predicted integral membrane protein ---------------------|-----||-------------------|----------|------ 1 [R] COG5621 Predicted secreted hydrolase --||-------------|---|--------|----|-|-----------------|---------- 1 [S] COG5652 Predicted integral membrane protein