| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ |-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 122 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase |-||--|||----|||-|||-|--||-||-|----|||----|||||-|||||--|||||||||-- 103 [T] COG0784 FOG: CheY-like receiver |-||----|-----|-||||-|||-||||||----|||----|||||-||--|--|--||||||-- 61 [T] COG2202 FOG: PAS/PAC domain |-||----|-----|-||||-|-----||||---|-||----|||---||-----|---|||||-- 61 [T] COG2203 FOG: GAF domain ----------------|-||-|-----------------------------------------|-- 61 [S] COG4636 Uncharacterized protein conserved in cyanobacteria |||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 56 [R] COG0457 FOG: TPR repeat ||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 52 [M] COG0438 Glycosyltransferase ---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|--- 50 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase ||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 44 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis |||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 34 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases --||--------------||-|--|-|||-||---|||----|||||--|-|-------||-|||| 34 [S] COG1357 Uncharacterized low-complexity proteins -|||||||-|||----||||-|---|-||-------------|||-|-----|---||-------- 28 [L] COG0675 Transposase and inactivated derivatives ----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||-- 28 [P] COG1629 Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport ----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-|||||||||||||||||| 26 [M] COG0845 Membrane-fusion protein --|----------|||-|||||--------------------------|----------|||||-- 25 [R] COG2319 FOG: WD40 repeat ------------------||----------------------|||||------------------| 24 [S] COG5464 Uncharacterized conserved protein -||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||-- 23 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component --||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-|||||||||||||||||| 22 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) -----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||-- 22 [K] COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins ------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|-- 22 [U] COG3210 Large exoproteins involved in heme utilization or adhesion |||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 21 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 20 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily --|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 20 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) |||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 19 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins ----------------||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 19 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain --|--|--|--|------||-|----|------|---|-----||-|-------||----|-|--- 18 [L] COG3335 Transposase and inactivated derivatives --||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 17 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components ------------------||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 17 [TK] COG2197 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain |-||---------|||--||--||||--------|-||----||-----|------------|--- 16 [C] COG1413 FOG: HEAT repeat --|---------------||-|----||-----|---------------------|---|-|||-- 16 [L] COG3293 Transposase and inactivated derivatives --|---------------||-|----|||||-----||----------|------|---||||--- 16 [M] COG3409 Putative peptidoglycan-binding domain-containing protein --|---------------||------------------------------------------|--- 16 [T] COG5635 Predicted NTPase (NACHT family) ---|--------------||-|-----||||||-|||-----|||---|---|--|---|||||-- 15 [V] COG1403 Restriction endonuclease ----------------|-||-------------------------|--||--||||---||-||-- 15 [Q] COG2931 RTX toxins and related Ca2+-binding proteins -------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||-- 14 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases |||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 13 [R] COG0517 FOG: CBS domain |||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 13 [L] COG0582 Integrase -------------||----|------||||-||||||-----|||||-||-----|--||-||--- 13 [Q] COG1020 Non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins |-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 13 [K] COG1309 Transcriptional regulator ------------------||----------||-|--||||||-||||-||--||||----|-||-- 13 [V] COG2274 ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain -------------------|------|||||-----|--------|---------|---||-|--- 13 [Q] COG3321 Polyketide synthase modules and related proteins --------------|----||--------||-|---------------------------|-|--- 13 [R] COG3899 Predicted ATPase ------------------||-|---------------------------|-----|----|--|-- 13 [T] COG4252 Predicted transmembrane sensor domain |||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---||||||| 12 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins --|--------|-------||-----||||--||---|-------|---|---||----||-||-- 12 [L] COG3547 Transposase and inactivated derivatives |-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 11 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases ||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 11 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases --||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||-- 11 [L] COG1943 Transposase and inactivated derivatives ----------------||||-|--|-|||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 11 [T] COG2199 FOG: GGDEF domain ---|---------|||-|||-|--||----|---------|||||-|-||--|||-||||||||-- 11 [O] COG2214 DnaJ-class molecular chaperone ------|----||-----||-------||-----------------------|------------- 11 [S] COG2442 Uncharacterized conserved protein --|----------|----|||------||-|---|--|----|--||-||----------|----- 11 [L] COG3344 Retron-type reverse transcriptase ---|----|--|-------|-|---------------|----------------------|-|--- 11 [L] COG3415 Transposase and inactivated derivatives ------------------||-------------------------------------------|-- 11 [S] COG4995 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 10 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component |-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---||||||| 10 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators --|--|-------------||-----|||----||--|-----------------|---||-|--- 10 [L] COG3464 Transposase and inactivated derivatives ||||||||||||||||--||-|----||||------||-----------|-----|--|||-|--- 9 [O] COG0464 ATPases of the AAA+ class |||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||-- 9 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators |-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 9 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component ||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--|||||||||||||| 9 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning -----------------||||||||--||-|---||||----------||---------||--|-- 9 [T] COG1366 Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor) ----------||-||---||-|||--|||||------|--------------|------------- 9 [T] COG1716 FOG: FHA domain ||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 8 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 8 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32) ||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 8 [K] COG0583 Transcriptional regulator -------------||---||------------||--------|||||-||||||||---||||||| 8 [O] COG0625 Glutathione S-transferase ||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 8 [R] COG0628 Predicted permease -------------|||--||----|-----------------------|-------||-------- 8 [R] COG0724 RNA-binding proteins (RRM domain) ----------------||||||--||||||||--||||----|||||||||||||||||||||||| 8 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases ----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||-- 8 [M] COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase ||||----|||||---|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 8 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component ---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||-- 8 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis |-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||-- 8 [P] COG2217 Cation transport ATPase ----------------||||----------------------|||-|-||-||--|---|||||-- 8 [M] COG3206 Uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 7 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase |-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 7 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes |-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-|||| 7 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase ---|---------||||-||-|||--|---------------||||||||||-|||---||||||| 7 [C] COG0633 Ferredoxin |||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--|||||||||||||| 7 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel ---|---------||-|-||-|----|----|--||||----|||||-|||-|--|---|||||-- 7 [MG] COG0702 Predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerases |||-|||||||||----|||||-----||-||-----|----|||-|-||------------|--- 7 [C] COG1032 Fe-S oxidoreductase |||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|--- 7 [C] COG1145 Ferredoxin ||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-|||||||||||||| 7 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component ||||-------||-----||-|----|||-----||-|-----------------|------||-- 7 [Q] COG1233 Phytoene dehydrogenase and related proteins ---|-------|-||---||-|----||||-|--||||----|||||-|||----|---||||--- 7 [C] COG1252 NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit --|-----------|---||--||---||-------||----------||-|||||---|||||-- 7 [S] COG1262 Uncharacterized conserved protein --||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|--- 7 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases -|||--|----------|-||-----|---|----|--||---|||--|--|--|-|||------- 7 [S] COG1479 Uncharacterized conserved protein ||-|--||-|---||-|--|------|-------|-|--|||-------|||-||---|||||--- 7 [L] COG1525 Micrococcal nuclease (thermonuclease) homologs ------------------||-|--------------|-----||||---------|-----|---- 7 [S] COG1649 Uncharacterized protein conserved in bacteria -|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-||||||||||||| 7 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins ----------------|-||-|---||||||----|||----|||||-||--|--|---||||||| 7 [T] COG2200 FOG: EAL domain ------------------||------|--------------------------------------- 7 [O] COG4759 Uncharacterized protein conserved in bacteria containing thioredoxin-like domain ||||||-|||---|||--||-|----|||--|-||||-----|||||-||-||------|--|--- 6 [P] COG0025 NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters ||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||-- 6 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase ||||---||----------|-------||--|||||--|||-|||-|-|||||||||||-||-|-| 6 [V] COG0286 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit |||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||-- 6 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs --|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||-- 6 [G] COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase |||---|||-------|||||---------|-----------|||-|--|-----|---------- 6 [C] COG0426 Uncharacterized flavoproteins |||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 6 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 6 [O] COG0443 Molecular chaperone |||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-|||||||||||||| 6 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components |||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||-- 6 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function |-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 6 [R] COG0546 Predicted phosphatases ----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--||||||||||| 6 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases -|-|----|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 6 [E] COG0683 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component |-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily ||||-|-||----------|-------||--|||||--|||||||-|-|||||---|||-||-|-| 6 [V] COG0732 Restriction endonuclease S subunits -------------|||||||||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase --|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-||||||||||||| 6 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain |-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||-- 6 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component --|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||-- 6 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases |||||||||||||||||-||-|----------------------------------------|--- 6 [R] COG1100 GTPase SAR1 and related small G proteins -||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||-- 6 [P] COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component |-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||-- 6 [R] COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease ----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---||||||| 6 [S] COG1434 Uncharacterized conserved protein -||---|||-||------||-|-----||-----------------|---|-|--|---||-||-| 6 [R] COG1487 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain |-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---||||||| 6 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family --|----------|||--||----|-||||-------------------|---------||-||-- 6 [T] COG2114 Adenylate cyclase, family 3 (some proteins contain HAMP domain) ---|---------||---||-|----|||||-----||-----------|--|--|--||||||-- 6 [Q] COG2124 Cytochrome P450 --|----------||---||-|-----||------------------------------||-||-- 6 [M] COG2335 Secreted and surface protein containing fasciclin-like repeats |||------|--------|||---------|-----------------------------|-|--- 6 [C] COG2710 Nitrogenase molybdenum-iron protein, alpha and beta chains ---|--------------||-------||------------------------------------- 6 [S] COG3349 Uncharacterized conserved protein ------------------||-------||------------------------|-----||----- 6 [S] COG3744 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-|---------------|||------||||----|-----------------------|||||-- 6 [T] COG3920 Signal transduction histidine kinase -------------------|--------------------------------|---------|--- 6 [R] COG4249 Uncharacterized protein containing caspase domain -----------------|||------|||-------------||||---|-----|---|||||-- 6 [PR] COG4638 Phenylpropionate dioxygenase and related ring-hydroxylating dioxygenases, large terminal subunit ------||----------||-------|||----------------|------------------- 6 [S] COG5305 Predicted membrane protein --||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 5 [E] COG0031 Cysteine synthase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 5 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component --|----------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein |||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-||||||||||||||| 5 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases --||---------||---||------|||-||||||||----|||---|-----------|--|-- 5 [S] COG0398 Uncharacterized conserved protein -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases ||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 5 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases |||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--|||||||||||||| 5 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase -||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||-- 5 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component -|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||-- 5 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases ---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||-- 5 [C] COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases) -||-----||---||--|||||||--|---|--||-||----||||--||||---|---|||||-- 5 [P] COG0715 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components --||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--|||||||||||||| 5 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein -----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 5 [M] COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein) --|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 5 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators -|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||-- 5 [L] COG0863 DNA modification methylase --||||----------|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 5 [C] COG1008 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M) ||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-| 5 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases --|||||||-||||||---|||--|-|||||-||||------|||||-|----------------- 5 [KL] COG1061 DNA or RNA helicases of superfamily II --||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-| 5 [O] COG1225 Peroxiredoxin ||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--|||||||||||||| 5 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators |-|||---|--------|||-------------|--------||||--------|--|--|-||-| 5 [S] COG1598 Uncharacterized conserved protein ------|||-------|-|||---------|-----|-----|||||--|--||||---|||||-- 5 [M] COG1807 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family -----------------|||-|||---||-|---||||---------------------------- 5 [T] COG2172 Anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase) -------------||---||----------------------|||||-||||----------|--- 5 [T] COG2198 FOG: HPt domain -----------------||||-|||--||-|---||||----------||----------|-|--- 5 [TK] COG2208 Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit ||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 5 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid --|-----|--||-----||||---|||||------||----|--||-||------------|--- 5 [R] COG2304 Uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain --------|----|-|---|||---||---|---||||-----------|---------|||||-- 5 [S] COG2340 Uncharacterized protein with SCP/PR1 domains ---------||-------||-|----||||||--||||----|||||-||-----|---|||||-- 5 [K] COG2771 DNA-binding HTH domain-containing proteins ---|------|--------||-----|||--|--|--|----||||--||---------||-||-- 5 [P] COG3221 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, periplasmic component ------------------||-|-----------------------|------------|||-|--- 5 [S] COG4222 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|||--------------|------|||-|------------------- 5 [QC] COG4577 Carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein ||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-| 4 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) |||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||-- 4 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I ||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---||||||||||||| 4 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases |-||------||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain --||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases |||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--|||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs --|-||----|--||--|||-|----|||-||||||||-|--|||||-||-----|---||-||-- 4 [G] COG0366 Glycosidases --|-|------|-||-|-||-------|||------|-----|||||--|-----|---||-||-- 4 [Q] COG0412 Dienelactone hydrolase and related enzymes |||-|--------||||-|||-----||||||||-||||||||||||--|----------|||--- 4 [P] COG0474 Cation transport ATPase ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II --|----------||-|-||||----|||-----|-||----|||||-||--||||||-|||||-- 4 [R] COG0523 Putative GTPases (G3E family) |||||||||||||---||||-|-----||-||--|-||-----------|-----|----|-|--- 4 [R] COG0535 Predicted Fe-S oxidoreductases |------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||| 4 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit --||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|----- 4 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family --||--|||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases -||-----||-------|||||||--|---|--||-||----||||---|||---|---|||||-- 4 [P] COG0600 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component ||||---||----------|-----------||-||--|||-------||||||--|||-||-|-| 4 [V] COG0610 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases -----|-------||-|-||-|||--||||||||||||||||-------|--|--||--|--|--- 4 [T] COG0631 Serine/threonine protein phosphatase --|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 4 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase -------------||---||-|----|||-----|-||----|||||-||-|||||---||||||| 4 [HC] COG0654 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases |-||||-----|-||---||-------||||------|----|||||-||-|||||---||||||| 4 [R] COG0661 Predicted unusual protein kinase |-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||-- 4 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins -------------|||--||-|-----||-----|-||----|||----|-----||||------- 4 [R] COG0699 Predicted GTPases (dynamin-related) |||||||||||||---||||-|---||||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 4 [R] COG0714 MoxR-like ATPases --|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||-- 4 [G] COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase |||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [R] COG0730 Predicted permeases ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases ---|--------------||||--|||----|||||||-|--|||||-|||||--|||||-|-||| 4 [P] COG0783 DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant) ----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [M] COG0793 Periplasmic protease --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 4 [NT] COG0840 Methyl-accepting chemotaxis protein --|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 4 [G] COG1109 Phosphomannomutase -||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||-- 4 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components ||||--|||||||----|||||--|-||||||||||||||||-||-|-|-|----|---|||---- 4 [P] COG1122 ABC-type cobalt transport system, ATPase component --|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes |-|-||||||||-||||-||------|---|||-||||----|||||--|-----|---|||||-| 4 [M] COG1215 Glycosyltransferases, probably involved in cell wall biogenesis ||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 4 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes |-|---|||||-|||-|-||--||--||||||--|||-----|||||-||||---|---|||||-- 4 [R] COG1409 Predicted phosphohydrolases ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||----|||||-||-||--|---||||--- 4 [G] COG1653 ABC-type sugar transport system, periplasmic component --|-----|---------||-|----||||------||----------||---|||||||||||-- 4 [C] COG2010 Cytochrome c, mono- and diheme variants -||---|-|---|-----|||------||----|--------|--||-|------|---||----- 4 [JD] COG2026 Cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system ----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||-- 4 [NU] COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG -----------|-||---||-------|||||||-|||----|||||-||-|-|||--||||||-- 4 [E] COG2755 Lysophospholipase L1 and related esterases ------------------||-------||-------|------------|-----|----|-||-- 4 [I] COG3239 Fatty acid desaturase -----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-||||||| 4 [M] COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes --||||||-|||----|-||---------------------------------------------- 4 [S] COG3431 Predicted membrane protein --|-----|-----|---||----------||----|----------------------||----- 4 [T] COG3476 Tryptophan-rich sensory protein (mitochondrial benzodiazepine receptor homolog) ----------------|-||----------------------|||-|--|-----|||--|--|-- 4 [P] COG3696 Putative silver efflux pump -------------------|-|--------|-----|----------------------------- 4 [S] COG3861 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||--------------------------------|------------- 4 [S] COG4634 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------||----|---------------------------------------------- 4 [H] COG5031 Uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis ------------------||---------------------------------------|--|--- 4 [S] COG5469 Predicted metal-binding protein ||-|||-|-||-|||-|-|||------|||-----|-|---------------------------- 3 [P] COG0003 Oxyanion-translocating ATPase |||-||--||-|-||-||||-|----|||-||--|||||---|||||--|--||||---|||||-- 3 [P] COG0004 Ammonia permease |||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 3 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase] |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||-- 3 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 3 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase |||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 3 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase ||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||---- 3 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases --|--------|-|--|-||||||--|||----|--|-----|||||-||||---|---||-|--- 3 [G] COG0296 1,4-alpha-glucan branching enzyme ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0305 Replicative DNA helicase --|----------||-|-||-|----||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 3 [S] COG0316 Uncharacterized conserved protein |-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 3 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II |-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||-- 3 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase |-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||-- 3 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||-||||||||-||-||--|---||||--- 3 [G] COG0395 ABC-type sugar transport system, permease component ||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||-- 3 [M] COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 3 [E] COG0410 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component ||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||---------------- 3 [L] COG0419 ATPase involved in DNA repair ||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-|| 3 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase |-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2 ||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0492 Thioredoxin reductase --|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||-- 3 [L] COG0514 Superfamily II DNA helicase |-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||-- 3 [E] COG0520 Selenocysteine lyase |||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||-- 3 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 3 [E] COG0559 Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease components |-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|--- 3 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily ||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||---- 3 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component --|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---||||||| 3 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||--- 3 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components |||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----|||||||||||||||||||||||| 3 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class) ||||--||||-||----|||||----||||||||||||||||-||-|---|--------|||---- 3 [P] COG0619 ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 3 [NT] COG0643 Chemotaxis protein histidine kinase and related kinases --|----------||||-||--||--||||-|---|||----|||-|-||-|---|||-||-|--- 3 [P] COG0659 Sulfate permease and related transporters (MFS superfamily) |||---||||------|||||------||-------||----|||||-||--||||||-|||||-- 3 [G] COG0662 Mannose-6-phosphate isomerase --|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating) ----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-|||| 3 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat -||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||-- 3 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase ---|----|----||---||--||----------||||----|||||||||||---|||||||||| 3 [O] COG0694 Thioredoxin-like proteins and domains |-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---||||||| 3 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins -||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||-- 3 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid) --|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||-- 3 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins --|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||--- 3 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component |||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1 |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase |||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [C] COG0778 Nitroreductase |-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-|| 3 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin |-|------|------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [U] COG0811 Biopolymer transport proteins |-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [R] COG0824 Predicted thioesterase ----------------|-||--||||----|||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0828 Ribosomal protein S21 --||--|||--------|||----||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 3 [NT] COG0835 Chemotaxis signal transduction protein ---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 3 [C] COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1 --||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--|||||||||||||| 3 [CP] COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit |||---|||||||---|-||-|----||||||-|-|||-------|--||-----|---|||||-| 3 [F] COG1051 ADP-ribose pyrophosphatase --|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-||||||||||||| 3 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 3 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||--- 3 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|---||||--- 3 [G] COG1175 ABC-type sugar transport systems, permease components |||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||-- 3 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon) --||---------||-|||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains ---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--|||||||||||||| 3 [C] COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex --|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||-- 3 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase |||--||--|||-----|-|-------||------------------------------------- 3 [L] COG1337 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily) |||------|--------|||---------|-----------------------------|-|--- 3 [P] COG1348 Nitrogenase subunit NifH (ATPase) -----------------|||------|||||-----||----|||-|-||---|||---||||--- 3 [S] COG1376 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||-----|--------||-------||--------------------|-----|---||||--- 3 [H] COG1429 Cobalamin biosynthesis protein CobN and related Mg-chelatases ||-|--||-||------|||----||--------------------------|--|---|||||-- 3 [S] COG1430 Uncharacterized conserved protein ||||--||||------|-||-|--|-|---------------------||----|-||||||||-- 3 [S] COG1432 Uncharacterized conserved protein |||-|||-|||||---||-||------||---|--|-|----|||||----|--|---|------- 3 [L] COG1518 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair ----------------||||----------------------|||-|-||-|||||--||||||-- 3 [M] COG1596 Periplasmic protein involved in polysaccharide export ---|----|-||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 3 [C] COG1622 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2 |-|||||||-|||----|-|||----||||||||||||----|||||-|------|------||-- 3 [K] COG1695 Predicted transcriptional regulators -|||----|---|-----||-------------|-------------------------------- 3 [S] COG1808 Predicted membrane protein ---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 3 [C] COG1845 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3 |||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||-- 3 [K] COG1846 Transcriptional regulators --|----------||----||----|--------------------|--|-----||||----|-- 3 [F] COG1864 DNA/RNA endonuclease G, NUC1 ---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||-- 3 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase ------------------||-|----||||-----|||-----------------|---------- 3 [S] COG1950 Predicted membrane protein -----------|-||----|-|----|||-----|--|----|||-|--|-|---|--||||||-- 3 [F] COG1957 Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase --------|----|--||-|||----|||-||||||||-----------|--||||||||||-|-- 3 [R] COG2070 Dioxygenases related to 2-nitropropane dioxygenase ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 3 [H] COG2082 Precorrin isomerase --||||||--|------|||||-----||-------------|||||-||-----|---||||--- 3 [H] COG2109 ATP:corrinoid adenosyltransferase ---|---------||---||-------||-------------------||-----|-------|-- 3 [S] COG2119 Predicted membrane protein ||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--| 3 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold ------------------||------|----|----||----|||-|--|------------|--- 3 [S] COG2268 Uncharacterized protein conserved in bacteria -||---------------||-|---|-||--|--|-||-----------|-----|---------- 3 [S] COG2314 Predicted membrane protein -------------------|-|-----||-|---||||----|||-------|||----|||---| 3 [T] COG2337 Growth inhibitor ---|--||-----------|-|----|-----||||||---------------------------- 3 [S] COG2339 Predicted membrane protein --||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||---- 3 [P] COG2608 Copper chaperone --|-----|-------|-||-|--------------|-----------||-----|---||-|--- 3 [T] COG2770 FOG: HAMP domain ------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|-- 3 [U] COG2831 Hemolysin activation/secretion protein ----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------ 3 [E] COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase ------------------||--------------------------|-|---|||-----||-|-- 3 [S] COG2929 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-----------------|----------||--------|||-||-- 3 [R] COG3211 Predicted phosphatase --|-|------|-------|-|--||-||-|-----||----|||-|--|-----|----|-|--- 3 [S] COG3391 Uncharacterized conserved protein -------------------|----------|---------------|-----|--|||-||-|-|| 3 [U] COG3505 Type IV secretory pathway, VirD4 components -------------------|------|---------|------------|----------|-||-- 3 [P] COG3540 Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D -|-----------------|----------|-----|------------|-----|------|--- 3 [R] COG3541 Predicted nucleotidyltransferase ------------------||-|----|---------------------------------|-|--- 3 [S] COG3544 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|---------------||-----|----|--|--|-|--||||---|---------||-||-- 3 [P] COG3638 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component ---|------|--------||-----|----|--|--|-|||||||---|---------||-||-- 3 [P] COG3639 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component --|----------------||---------|-|||--|-----------|---------||--|-- 3 [L] COG3666 Transposase and inactivated derivatives ------------------||-------||--------------------------|-------|-- 3 [Q] COG3670 Lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzymes -----------------|||-----|-----------|-----------|--------|||||||| 3 [T] COG3706 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain --------------|---||----------||-----------------|----------|||--- 3 [G] COG3957 Phosphoketolase -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 3 [E] COG4177 ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component ------------------||-------------------------------------------|-- 3 [QP] COG4242 Cyanophycinase and related exopeptidases ----------------|-||-----------------------------|----------|-|--- 3 [S] COG4244 Predicted membrane protein ------------------||----------------------------------------|----- 3 [C] COG4451 Ribulose bisphosphate carboxylase small subunit -------------------|-----------------------------|----------|----- 3 [R] COG4637 Predicted ATPase ------------------||---------------------------------------||-|--- 3 [R] COG4671 Predicted glycosyl transferase -------------||-||||||||||----------------|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87 --|----------||----|----------------------------|----------------- 3 [O] COG4935 Regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertases and other proteases -------------------|-|---------------|-----------------|---|--||-- 3 [T] COG5278 Predicted periplasmic ligand-binding sensor domain -------------------|------------|---------|||---------------|----- 3 [L] COG5433 Transposase ----------------|--|----------------------------------------|-|--- 3 [S] COG5502 Uncharacterized conserved protein -------------|||---|----------|----------------------------------- 3 [S] COG5542 Predicted integral membrane protein ----------||-------|---------------------------------------------- 3 [O] COG5550 Predicted aspartyl protease ||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||-- 2 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 2 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase ||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||-- 2 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||| 2 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5) --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase -------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0021 Transketolase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase -|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||-- 2 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC ||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase -||---||--||-|--|-||||||--|||-||||--||----|||||-||||-------||-|--- 2 [G] COG0058 Glucan phosphorylase |||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 2 [G] COG0061 Predicted sugar kinase |||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---||||||| 2 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0073 EMAP domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||||| 2 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase ||--|-||--||-|----||-------||-------------|||||-||||-|||---||||--- 2 [R] COG0121 Predicted glutamine amidotransferase ||||--|||||||||||-||-|------------|-||----------||---|||---|||||-- 2 [BQ] COG0123 Deacetylases, including yeast histone deacetylase and acetoin utilization protein ||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase -|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases --------|-||-||-|-||-|----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 2 [P] COG0155 Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein) ||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain --||||||--|||||----|-|----|||||---|-||----|||||-|||----|---||||--- 2 [E] COG0160 4-aminobutyrate aminotransferase and related aminotransferases |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase -||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 2 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes -|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||-- 2 [G] COG0176 Transaldolase --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit --||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||| 2 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase -------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|--- 2 [G] COG0205 6-phosphofructokinase |-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 2 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase ||-||||||||||---|-||-|----|||-------||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [C] COG0243 Anaerobic dehydrogenases, typically selenocysteine-containing ---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family ||------||------|||||-||--|||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase ----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase) |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase ||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3) |||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 2 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes -|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|--- 2 [G] COG0297 Glycogen synthase --|----|---|-|||---||-----||||||||||||-----------|-|---|---||-||-- 2 [R] COG0300 Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities ----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--||||||||||| 2 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase ||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|--- 2 [P] COG0306 Phosphate/sulphate permeases --|-||----||-|||--||-|----||||-|||--------|||||-||||||||---|||||-- 2 [E] COG0308 Aminopeptidase N ||||----||--------||----------|----|----------|---|----------|---- 2 [P] COG0310 ABC-type Co2+ transport system, permease component ----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-| 2 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases ---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 2 [H] COG0320 Lipoate synthase -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase --|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|-- 2 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase ----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase -|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------| 2 [L] COG0338 Site-specific DNA methylase |||-----||------||||-|----|||-||---||-----|||||-||||||||---|||||-- 2 [E] COG0347 Nitrogen regulatory protein PII -------------|----||------|||||-----------|||||-|||||------||||||| 2 [J] COG0349 Ribonuclease D -------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||-- 2 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase |-||||--|-|||||||-||-|-----||--|--||||----|||||-||-||--||-||||||-- 2 [I] COG0365 Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases |||---|||||-----||||-|--------||--||------|||||-||--|--||||----|-- 2 [P] COG0370 Fe2+ transport system protein B |||-----||----|-|-||||----|||-----|--||---|||||--||----||||||||--- 2 [OK] COG0378 Ni2+-binding GTPase involved in regulation of expression and maturation of urease and hydrogenase ||||--||||------||||------|||||---|||-|||||||-|--|--|--|---||||--- 2 [S] COG0392 Predicted integral membrane protein -------------||---||----------------------|||-|--|---------|------ 2 [S] COG0401 Uncharacterized homolog of Blt101 -------------||---||----------------------|||||-||--|--|---||||||| 2 [H] COG0408 Coproporphyrinogen III oxidase -|------|-|||----|||||-----------|--------|||||--|-----|--|||||--- 2 [E] COG0411 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component |-||-------|-|----||------|-----|-||------||||||||----|----|--||-- 2 [L] COG0415 Deoxyribodipyrimidine photolyase |||---|||||||-|-||||-|-----||-|-----||----|||-|-||---------||----- 2 [S] COG0432 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase |||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--||||||||||| 2 [O] COG0450 Peroxiredoxin ||-|--||||------||-|----||-||||-----||----------||-----||||------- 2 [D] COG0455 ATPases involved in chromosome partitioning ||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 2 [R] COG0456 Acetyltransferases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family) |||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase -|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||-- 2 [G] COG0469 Pyruvate kinase |||||||||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases) ||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--|||||||| 2 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family -------------|||--||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains ||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||-- 2 [R] COG0496 Predicted acid phosphatase |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0498 Threonine synthase -|-----------||----|-|||-|-||-||||||||-|--|||||||||||||---|||||--- 2 [L] COG0507 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member |||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||| 2 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases |||||||||-|||||||-||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases -------------||-||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0539 Ribosomal protein S1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0550 Topoisomerase IA ---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [K] COG0557 Exoribonuclease R -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific --------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [J] COG0566 rRNA methylases -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease ---|---------||--|||-|-|||----|||||||||-|||||||-|-||-------------- 2 [F] COG0572 Uridine kinase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||-- 2 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein) ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 2 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component ---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||-- 2 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase ----||-----|------||-|--||||||||--||||----|||||||||||||||||--|||-- 2 [S] COG0586 Uncharacterized membrane-associated protein ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog) ||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes --||||----||-||-|--|-|----||||-|--||||----|||||-||-||--|---|||||-- 2 [CR] COG0604 NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductases |-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [P] COG0605 Superoxide dismutase ||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease -------------|||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase -|||--|||||-|---||||||--|||||-||||||||||||------|----------------- 2 [R] COG0618 Exopolyphosphatase-related proteins |||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase ----------------|||||||||||||-|||||||||---|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases |||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||-- 2 [C] COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins) |-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family |||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--|||||||| 2 [R] COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily -------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-||||||||||||| 2 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH ||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-||||||| 2 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 2 [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit ||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--|||||||| 2 [R] COG0679 Predicted permeases |||---||||-|----|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 2 [C] COG0680 Ni,Fe-hydrogenase maturation factor ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0681 Signal peptidase I ---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 2 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein |||-----||------||||-------||-|-||-|||----|||-------------|------- 2 [R] COG0701 Predicted permeases --|------|-|----||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase --|-------------|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 2 [O] COG0719 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component ||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase ------------------||----------------------------||||----|||||-|--- 2 [P] COG0748 Putative heme iron utilization protein ----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-| 2 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake -----------------||||-||||||||||||||||----|||||-||||---||||||-||-- 2 [S] COG0762 Predicted integral membrane protein ----------------||||||||------||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 2 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2 ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein |-|---|||-|-|---||||||--|-||||--||--||------------||----||-||||--- 2 [O] COG0785 Cytochrome c biogenesis protein |-|---|-|----|---|||------|||-|----||--------------|--|----|------ 2 [P] COG0798 Arsenite efflux pump ACR3 and related permeases --|-----|---------||--||------------------|||||-|||||--||||||||||| 2 [U] COG0823 Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system ----------------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG0848 Biopolymer transport protein |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 2 [C] COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit |||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||-- 2 [C] COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit --||----------|--|||------||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 2 [E] COG1045 Serine acetyltransferase ----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||-- 2 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases -------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 2 [H] COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase ||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||------- 2 [HR] COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes --------|----||---||-|----|---|---|-||-|--------||--|--|---------- 2 [R] COG1075 Predicted acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold |||---||||-|-----|||------|||||-|-||||----|||||--|-----|---|||||-- 2 [G] COG1082 Sugar phosphate isomerases/epimerases |------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||-- 2 [M] COG1087 UDP-glucose 4-epimerase |-|-----|-------|-||-------||-|-----------|||-|-||--|---||-|-|||-- 2 [M] COG1089 GDP-D-mannose dehydratase |-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-|||| 2 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase |-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 2 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components ------------------||-------||--------|----|||||-||--||||||||||||-- 2 [P] COG1118 ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component |-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 2 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component |||-|----|-|------|||-----||||----|-------|||||-|------|||-||-|--- 2 [R] COG1123 ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 2 [GM] COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component --|-------------|||||----||||||||||||||||||||||-||||||||------|--- 2 [R] COG1162 Predicted GTPases ---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [E] COG1171 Threonine dehydratase -------------||-|||||||||||||||||-||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG1186 Protein chain release factor B ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases ----------------||||--|||--||-|---||||----|||||-||-----||||------- 2 [K] COG1191 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit |-|--||||---|-----||-|----|||||-----------|---|--||-|--|---||-||-- 2 [R] COG1216 Predicted glycosyltransferases --|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||-- 2 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component ||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---||||||| 2 [R] COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I ||||||--||--------||-|----|||--------------------|-----|---------- 2 [H] COG1239 Mg-chelatase subunit ChlI --|||||||--||----|||-|--||----|---|||||||--------|-----|----||---- 2 [R] COG1277 ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component --|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 2 [S] COG1295 Predicted membrane protein |||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----||||||| 2 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases |-|---||||||----||||-|-----||||----|||-----------||||--|---||-||-- 2 [E] COG1305 Transglutaminase-like enzymes, putative cysteine proteases -----------------|||-|--||||||||||||||---------------------------- 2 [K] COG1316 Transcriptional regulator |||--|--||||-----|-||------||---|----|---------------------------- 2 [L] COG1343 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair --||--|||--------|-|----||----|----|||----|||||-||-----|--|||-||-- 2 [NT] COG1352 Methylase of chemotaxis methyl-accepting proteins |||-----||---||-||||-|----||||||--||||-----------|---|||---|||||-- 2 [E] COG1364 N-acetylglutamate synthase (N-acetylornithine aminotransferase) -|--||||-|--||--|-||-|-----|||------|----------------------------- 2 [L] COG1372 Intein/homing endonuclease -||-----|-------|--|-|--------|--|--------|||-|---------------|--- 2 [O] COG1397 ADP-ribosylglycohydrolase -------------||---||-----------------------------|-----|--------|| 2 [I] COG1398 Fatty-acid desaturase ||-|-----||||----|||-------||------|-|---------------------|||||-- 2 [R] COG1402 Uncharacterized protein, putative amidase |-|-------|-----|--|-|||--||||||---|||----|------------||||-|-|--- 2 [R] COG1408 Predicted phosphohydrolases -----------------|-|--||||-----|||||||----|||||-|||||--|--------|| 2 [S] COG1426 Uncharacterized protein conserved in bacteria -||-||||--||----|-||----|----------------------------------------- 2 [G] COG1449 Alpha-amylase/alpha-mannosidase |-|--------------|||----------|----------------------------------- 2 [R] COG1453 Predicted oxidoreductases of the aldo/keto reductase family ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit --||||||---|-----|||||----|||-||-|||||----|||----|||---|--||||||-- 2 [R] COG1473 Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase ----||----||-||--|-|----------||-|-|-|----|||||--------|---|---|-- 2 [G] COG1501 Alpha-glucosidases, family 31 of glycosyl hydrolases ----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-||||||| 2 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes ------|------|-----|-------|||||---||--|--|||--------||----------- 2 [G] COG1554 Trehalose and maltose hydrolases (possible phosphorylases) --|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|------- 2 [L] COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins |--|-------|-||---||-|----|||-----|-|---------------||||---|||||-- 2 [I] COG1562 Phytoene/squalene synthetase -|----|||---------||--------------------------------|------------- 2 [R] COG1569 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain ||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||--- 2 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase -----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||-- 2 [K] COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog ----|--------||--|||-|----|||-||||||||----|||||--|---------||-||-- 2 [IR] COG1597 Sphingosine kinase and enzymes related to eukaryotic diacylglycerol kinase --------|---------||------|||||----------------------------------- 2 [S] COG1615 Uncharacterized conserved protein ----||------------||||--|-----||-|-|||-|--|||-|-||---|||--------|| 2 [V] COG1619 Uncharacterized proteins, homologs of microcin C7 resistance protein MccF ---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-|||||||||||||||||| 2 [O] COG1651 Protein-disulfide isomerase -------------------|-|--||---------||-----|||-|-||-|||||---|||||-- 2 [S] COG1652 Uncharacterized protein containing LysM domain |||---||--||-----||||------------------------|------------|------- 2 [R] COG1672 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) --|---||--|-|-----||-|----||||||||||||----|||||--|--|--|---||||||| 2 [V] COG1680 Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 2 [GM] COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component -------------||----||---|-----|||||||------------|---||-|-|-|----- 2 [M] COG1696 Predicted membrane protein involved in D-alanine export |-||---------------|-|-----||-------------|---|------------------- 2 [V] COG1715 Restriction endonuclease --|||||||-|-|---||||-|---|-|||-----|||----------||-----|---|||||-- 2 [R] COG1721 Uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain) --|--------------|||-------------------------|-----------|--|-||-- 2 [N] COG1724 Predicted periplasmic or secreted lipoprotein ||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||-- 2 [K] COG1733 Predicted transcriptional regulators --|-||----|-------||------|||-|-----------|||||-||-|---|---|||||-- 2 [R] COG1741 Pirin-related protein ||-----||--------||||---|--||-|-----------|||-|--|--||||-------|-- 2 [C] COG1773 Rubredoxin --||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components --|-------------|-||-|----|||-|----|||----|||||-||------------||-- 2 [KT] COG1842 Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription |-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||-- 2 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes --||||--|--|-||--|-|||----|||-|||-||||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 2 [C] COG1902 NADH:flavin oxidoreductases, Old Yellow Enzyme family -----------------|||-|--|-----|---|||-----|||||-|---|------|-|||-- 2 [M] COG1922 Teichoic acid biosynthesis proteins ----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator ---|||--|-||||-----|||----|||||---|-||----|||||-||---|||---|||||-- 2 [I] COG1960 Acyl-CoA dehydrogenases -----||---|-------||-|----|||-|-||||||----|||||-||--|--|---|||||-- 2 [L] COG1961 Site-specific recombinases, DNA invertase Pin homologs --||||-||-||----|-||-|-----||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [H] COG1977 Molybdopterin converting factor, small subunit ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis ||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||-- 2 [R] COG1994 Zn-dependent proteases --|---------------||-|----||||------|-----|||||-||||||||---------- 2 [M] COG2027 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein 4) --||||--|-|||---|--|-|----|||-------|-----|||||--|-|---|--||||||-- 2 [R] COG2041 Sulfite oxidase and related enzymes ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||-- 2 [P] COG2060 K+-transporting ATPase, A chain ------------------|||-----|---------||----|||||-||-----|---|||||-- 2 [E] COG2066 Glutaminase ||-|||--||||------|||---------|----|----------|--|-----|---||||--- 2 [H] COG2073 Cobalamin biosynthesis protein CbiG ------------------||-|----|||||-----------|||||-||--||||||||||||-- 2 [S] COG2127 Uncharacterized conserved protein --|-----|----------|-|----|||||--||-||----|||||--|---|||---|||||-- 2 [S] COG2128 Uncharacterized conserved protein ---|---------||----|--------------|-|-----|||-|--|-----|------||-- 2 [R] COG2130 Putative NADP-dependent oxidoreductases ||||----||-|-------|-|----||||--||||||-|--|||||--|--|--|---|||||-- 2 [C] COG2141 Coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||-- 2 [P] COG2156 K+-transporting ATPase, c chain ---|-------------|||-------||----||-------|||-|-|----------|-----| 2 [D] COG2161 Antitoxin of toxin-antitoxin stability system -----------------|||-|---------|||||||---------------------------- 2 [R] COG2179 Predicted hydrolase of the HAD superfamily --||--|||--------|-|----||----|-----||----|||||-||--|--|--|||-||-- 2 [NT] COG2201 Chemotaxis response regulator containing a CheY-like receiver domain and a methylesterase domain ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|--|||-||-- 2 [P] COG2216 High-affinity K+ transport system, ATPase chain B --|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 2 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis -------------||---||-|--------------------|||||-||-|||||---||||||| 2 [H] COG2227 2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4-benzoquinol methylase |-||--||||---||-|--|-------||-|-----||----|||-|-||--|----------|-- 2 [R] COG2234 Predicted aminopeptidases |----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----||||||| 2 [P] COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain) ||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|---------||||--- 2 [H] COG2242 Precorrin-6B methylase 2 ---||||||||||-----||------||||||-||||-----|---|--|-----|------||-- 2 [S] COG2246 Predicted membrane protein -------------------|-|----||||-||||-|-----|||||--|-----|---|||||-- 2 [S] COG2261 Predicted membrane protein ----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase --|---------------||-|----|||-------------------||-----|--||||||-- 2 [S] COG2326 Uncharacterized conserved protein |----------------|||-|--------|-----------|||-|------------|-|---- 2 [S] COG2327 Uncharacterized conserved protein ------------------||-|-----||--------------------------|----|-|--- 2 [S] COG2343 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||||----|---|-----|-----|||||-||||-|||---|||||-- 2 [S] COG2350 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||||-----||||||||||----------------------||----- 2 [V] COG2367 Beta-lactamase class A ------------------||||--------|-----||---------------------------- 2 [D] COG2385 Sporulation protein and related proteins -|--||-|---|-------|-------||-----------------------|------------- 2 [L] COG2452 Predicted site-specific integrase-resolvase ----------------||||||--------|-----------|||||-||--||||---------- 2 [NU] COG2805 Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits ------------------||----------------------||||||||||-|||---|||||-- 2 [M] COG2821 Membrane-bound lytic murein transglycosylase ---|--|||-|-|-----||---------------------------------------------- 2 [S] COG2886 Uncharacterized small protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors |--|------|||||-|--|-|----||||-------|----|||||-||-----|---|||||-- 2 [P] COG2897 Rhodanese-related sulfurtransferase --||------------|--||-----|-----|-||-------|||---|-|-|||||-||-|--| 2 [S] COG3177 Uncharacterized conserved protein -------------------|-------||||-----||-------|---|-----|---|--|--- 2 [Q] COG3208 Predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis -------------------|------|----||||||-----|||-|--|---------||-||-- 2 [S] COG3237 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|----|---||--||------|||-|--|-|-------|--|--- 2 [S] COG3238 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-------|-|------------|||||-||||-|||---||||||| 2 [C] COG3288 NAD/NADP transhydrogenase alpha subunit --|----------------||------|||------|-----------||-|--------|-|--- 2 [Q] COG3315 O-Methyltransferase involved in polyketide biosynthesis -------------||----|-------|||----|--------------|---------|------ 2 [Q] COG3320 Putative dehydrogenase domain of multifunctional non-ribosomal peptide synthetases and related enzymes ------------------||-------||--------|-------------------------|-- 2 [R] COG3329 Predicted permease -----------------|||----------|------|---------------------------- 2 [S] COG3330 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||-|-----|------||-|---------------|----|------------|----|----- 2 [L] COG3385 FOG: Transposase and inactivated derivatives --|-||||---|-|-----|-|---------------|----------------------|-|--- 2 [G] COG3408 Glycogen debranching enzyme -----|-------------|-|---------------------||--------||----------- 2 [V] COG3440 Predicted restriction endonuclease -------------------|----------------------||||---|---------||||--- 2 [P] COG3454 Metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism ----------|--------|----------|-----||-----||-|--|---------------- 2 [P] COG3546 Mn-containing catalase --|----------------|-----------------------------|||---|------|--- 2 [H] COG3585 Molybdopterin-binding protein -------------------|------|---|-||-|||-----------|-------------|-- 2 [K] COG3655 Predicted transcriptional regulator -------------------|----------|-----------------|------|----|-||-- 2 [S] COG3837 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain |||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||--- 2 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components --||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||-- 2 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components ------------------||---------------------------------------|---|-- 2 [O] COG3914 Predicted O-linked N-acetylglucosamine transferase, SPINDLY family ------------------||---------------------------------------||--|-- 2 [R] COG3932 Uncharacterized ABC-type transport system, permease components --|---------------||----------|------|---------------------------- 2 [S] COG3937 Uncharacterized conserved protein --|----------------|-------------|--------|||-|--------|---------- 2 [V] COG4096 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases ------------------||-------||------------------------|------|----| 2 [D] COG4118 Antitoxin of toxin-antitoxin stability system -------------|----||-------|||------------|||-----||-|-|---||||--- 2 [R] COG4178 ABC-type uncharacterized transport system, permease and ATPase components ------------------||-----------------|-----------|-----|---|---|-- 2 [R] COG4188 Predicted dienelactone hydrolase ---|---------||---||||----|||--|-|||------|||-|-||||||||||||||---- 2 [R] COG4221 Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity ---|--------------||---------------------------------------------- 2 [T] COG4250 Predicted sensor protein/domain ------------------||-|---------------------------|---------|------ 2 [T] COG4251 Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase) ---|---------------|--------------|--|-------|---------|----|----- 2 [Q] COG4264 Siderophore synthetase component --|--------|------||------|||------------------------------------- 2 [S] COG4279 Uncharacterized conserved protein -----------|-------|------------------------------------------|--- 2 [S] COG4280 Predicted membrane protein ------------------||----------------------------|----------------- 2 [S] COG4446 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|----------------------|||-|------------------| 2 [R] COG4572 Putative cation transport regulator ------------------||-|----|||-||||||||-----------|-----|---||-||-- 2 [T] COG4585 Signal transduction histidine kinase -------------------|----------|--|-------------------------------- 2 [S] COG4633 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|||--------|---------------------------|------- 2 [R] COG4639 Predicted kinase ------------------||-----------------------||----------|---------- 2 [G] COG4678 Muramidase (phage lambda lysozyme) -------------------|-----------------------------------|-------|-- 2 [S] COG4704 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|------------------------------------------||-- 2 [R] COG4798 Predicted methyltransferase -|---------------|-|-|----|-------------------|------------|------ 2 [R] COG4928 Predicted P-loop ATPase ---|||--||-||----|||||----||||||--||||----|||||--|-----|---|||||-- 2 [MR] COG4948 L-alanine-DL-glutamate epimerase and related enzymes of enolase superfamily --------------|----|----------------|----------------------------- 2 [GM] COG5039 Exopolysaccharide biosynthesis protein -------------|----||------|--------------------------------------- 2 [P] COG5398 Heme oxygenase --------|-|--------|-------||------------------------------------- 2 [S] COG5551 Uncharacterized conserved protein ------------|------|-----------------------------------|----|----- 2 [R] COG5573 Predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain ------------------||-|-------------------------------------------- 2 [S] COG5637 Predicted integral membrane protein |||||||||||||||-||||-------||||-||-|||----|--||--|--|------||-|--- 1 [F] COG0005 Purine nucleoside phosphorylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases |||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||--- 1 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit ||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||------------- 1 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase |||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 1 [C] COG0022 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit |||||||||||||||---||----------------------|||||-||||-------------- 1 [J] COG0023 Translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1) and related proteins ---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase) -|----||---|------||------|||-------|-----|||||-||-|-------------- 1 [F] COG0027 Formate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase (GAR transformylase) ---|--||---|----|-|||------||||----|||----|||||-||--||||---||-||-- 1 [H] COG0029 Aspartate oxidase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation) ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase |--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase -|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control ||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--|||||||| 1 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||-- 1 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 1 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0048 Ribosomal protein S12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0049 Ribosomal protein S7 ---------|---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0051 Ribosomal protein S10 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2 ||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--|||||||| 1 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit |||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||-|----|||||-----------|||||-||--|--|||||||||-- 1 [S] COG0062 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||-- 1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase ||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---||||||||||||| 1 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog) ||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit |||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0067 Glutamate synthase domain 1 |||---||||------|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 1 [O] COG0068 Hydrogenase maturation factor |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0069 Glutamate synthase domain 2 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 1 [E] COG0070 Glutamate synthase domain 3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit ||||||||||||||--||||-|--------||--|-||--------|-||------||-||-||-- 1 [E] COG0075 Serine-pyruvate aminotransferase/archaeal aspartate aminotransferase ||||--||||--||----||-------||--|---|-|----||||--|-|---------|||--- 1 [E] COG0076 Glutamate decarboxylase and related PLP-dependent proteins ||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0077 Prephenate dehydratase |||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1 ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0082 Chorismate synthase -|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||------- 1 [E] COG0083 Homoserine kinase |||---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0084 Mg-dependent DNase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5 ---|||||---||||-||||--||--|----|||||||-||||||||-||---------------- 1 [H] COG0095 Lipoate-protein ligase A |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11 |||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9 ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase |||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase ---|||--|-|||||-|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 1 [O] COG0109 Polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor) |||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||-- 1 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase ||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase -------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase ||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||-- 1 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0125 Thymidylate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase |||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--|||||||| 1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase -|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 1 [H] COG0132 Dethiobiotin synthetase ||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase --||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful) ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase ||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase -||--|--|||||||-|-||-------|-------|-|------------------||-|||||-- 1 [EQ] COG0145 N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit -||--|---||||||-|-||-------|----------------------------||-|||||-- 1 [EQ] COG0146 N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0148 Enolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase -|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes ||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||-- 1 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase ---|---------||---||----------------------|||||-||||-||||||-||-|-- 1 [G] COG0158 Fructose-1,6-bisphosphatase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 1 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0164 Ribonuclease HII ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase -|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase |||-|||||||--||||-||----||--------------------------------------|| 1 [I] COG0170 Dolichol kinase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0171 NAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [E] COG0174 Glutamine synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit |||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 1 [Q] COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-||||||||||||||| 1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase |||-|||||||||||-|||||---------------|------------|--|-------|-|--- 1 [J] COG0182 Predicted translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17 --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit -|||--|||-|||-----||-|---------------|--||||||||||||||||---|||||-- 1 [HJ] COG0189 Glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase) -------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||-- 1 [G] COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase -------------|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0194 Guanylate kinase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0195 Transcription elongation factor -------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0196 FAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0203 Ribosomal protein L17 ||||||||||------||||||--||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0206 Cell division GTPase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0211 Ribosomal protein L27 |--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase --|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0216 Protein chain release factor A -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein ------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class) -------------||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase |-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit -------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0227 Ribosomal protein L28 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0228 Ribosomal protein S16 |-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||-- 1 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0230 Ribosomal protein L34 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0233 Ribosome recycling factor --|----------||-||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10) ||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--|||||| 1 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0238 Ribosomal protein S18 -|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation |-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10 ----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase ||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||--- 1 [C] COG0247 Fe-S oxidoreductase --|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-|||||||||||||||||| 1 [FP] COG0248 Exopolyphosphatase --||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family) |||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0250 Transcription antiterminator ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0254 Ribosomal protein L31 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0257 Ribosomal protein L36 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) -------------||---||-|-----|||------------|||||-|||-||||---|||||-- 1 [H] COG0259 Pyridoxamine-phosphate oxidase ------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-|||||||||||| 1 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0261 Ribosomal protein L21 --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts ------------------||-|----||||-||||||||||||||||-||||||||---|||||-| 1 [L] COG0266 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0267 Ribosomal protein L33 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0268 Ribosomal protein S20 ---|---------||---||----------------------||||||||||||||---||||||| 1 [T] COG0271 Stress-induced morphogen (activity unknown) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II) |--|||----|-|---||||-|--|-|||||||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 1 [F] COG0274 Deoxyribose-phosphate aldolase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis ---|---------|||--||----------------------||||||||||||||---||||||| 1 [O] COG0278 Glutaredoxin-related protein --|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0281 Malic enzyme --|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-|| 1 [C] COG0282 Acetate kinase ---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---||||||| 1 [F] COG0283 Cytidylate kinase ---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase |--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG0288 Carbonic anhydrase |||-----||------||||--||--|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase -------------|--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0291 Ribosomal protein L35 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0292 Ribosomal protein L20 |||---||||--------||----------|-----------|||-|---|-----|||------- 1 [O] COG0298 Hydrogenase maturation factor --||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN |||||||||||||---|-||-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0303 Molybdopterin biosynthesis enzyme ---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain |||||||||||||---|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 1 [O] COG0309 Hydrogenase maturation factor ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0313 Predicted methyltransferases |||||||||-|||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0314 Molybdopterin converting factor, large subunit |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0315 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase ----------|--||---||-|----||||------------||||||||||||||---||||||| 1 [H] COG0321 Lipoate-protein ligase B |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex --||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase) --|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold -------------|||--|||---|||||||----|||----|||||||||||--||||-|-|-|| 1 [O] COG0326 Molecular chaperone, HSP90 family ||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||------- 1 [S] COG0327 Uncharacterized conserved protein ---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0328 Ribonuclease HI |||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase ----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0333 Ribosomal protein L32 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0335 Ribosomal protein L19 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase -------------||---||-|----|---------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [E] COG0339 Zn-dependent oligopeptidases ||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD |||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase ----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||-- 1 [S] COG0344 Predicted membrane protein |-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase -||-||--||-|------||----------|-----------|||-|-||||-|||||||||||-- 1 [C] COG0348 Polyferredoxin ||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-| 1 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase |||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase --|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase ----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) -------------||-|-||-|----||||------------||||||||||||||---||||||| 1 [R] COG0354 Predicted aminomethyltransferase related to GcvT --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit) --|----------|--|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type) --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0359 Ribosomal protein L9 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0360 Ribosomal protein S6 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1) -------------|||-|||--||||||||-|-||||-----|||||||-||-||----||||--- 1 [G] COG0362 6-phosphogluconate dehydrogenase -------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase |||||||||||||-----||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||--- 1 [H] COG0368 Cobalamin-5-phosphate synthase -------------|||--||--||----------|-||----||||||||--|||----|-|-|-- 1 [P] COG0369 Sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein) |||||||||||||-|--|||----------||||-|||----|||||-------------|----- 1 [C] COG0371 Glycerol dehydrogenase and related enzymes |-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [C] COG0372 Citrate synthase ||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||------- 1 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase --|-----||------|--|----------|-----------|||-|---------|||------- 1 [C] COG0374 Ni,Fe-hydrogenase I large subunit |||---||||------|-||-|--------------------|||-|---------|||------- 1 [R] COG0375 Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression) --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases ||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||-- 1 [H] COG0379 Quinolinate synthase ||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----|| 1 [M] COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase -----||----|-||--|||-------||--|||-|-|----|----------------------- 1 [G] COG0383 Alpha-mannosidase --||---------||---||||----|||-|----|||----|||-|-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG0384 Predicted epimerase, PhzC/PhzF homolog --|----------|--|-||------|--|----|-||----|||||--|---|||---|||||-- 1 [R] COG0385 Predicted Na+-dependent transporter -------------||---||-|----||||------|-----|||||------------||-|--- 1 [P] COG0387 Ca2+/H+ antiporter --||-------|-||---|||-----|||-|||||||||||||||||-||-|-|||---|||||-- 1 [L] COG0389 Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair -||-------------||||-------||-----|-|-----|||-|--------|---------- 1 [R] COG0390 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ||||----||---|--||||-|----||||||||||||----|||||-|--|-------------- 1 [S] COG0391 Uncharacterized conserved protein |||||||||--|-----|||-------|||-|---|-|----|||-|-|--|-----------|-- 1 [S] COG0393 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 1 [O] COG0396 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, ATPase component -------------||---||------|----------|----|||-|-||--|--|---||--|-- 1 [S] COG0397 Uncharacterized conserved protein -------------||---||-|||-------|--||||----|||----|--|------||||-|| 1 [R] COG0400 Predicted esterase |||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||-- 1 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG0403 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), N-terminal domain ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--||||---|||||-- 1 [E] COG0404 Glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase) ----||----||||||--||||----|||-----|-||----|||-|-||--||||||-||-||-- 1 [E] COG0405 Gamma-glutamyltransferase --|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase |||---||||------|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 1 [O] COG0409 Hydrogenase maturation factor ---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase -------------||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0414 Panthothenate synthetase ----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||-- 1 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme ||||||||||||||||---|----------------------|||||-||---------------- 1 [L] COG0417 DNA polymerase elongation subunit (family B) ||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|----- 1 [L] COG0420 DNA repair exonuclease ||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||-- 1 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC --|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation ||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||-- 1 [O] COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation ||||--||--||||||||-|-|---||||------|------|||-|--|---|||--|-|----- 1 [P] COG0428 Predicted divalent heavy-metal cations transporter -------------|-|--||----------------------|||||-||---|||---------- 1 [R] COG0429 Predicted hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold ||||--|||||||||||--|----------------------|||-|--|-----|---------- 1 [A] COG0430 RNA 3'-terminal phosphate cyclase ---|---------||---||-|----|||--|||||||--|||||||-||-|-|||---||-||-- 1 [R] COG0431 Predicted flavoprotein |||||||||||||---||||-|-----||---|----|----||||---|-|---|---|||||-- 1 [R] COG0433 Predicted ATPase -|-|--|||||-|-----||----------------------|---|------------|--|--- 1 [R] COG0434 Predicted TIM-barrel enzyme ---|---------||---||------|---------------|||-|-||---------||||--- 1 [O] COG0435 Predicted glutathione S-transferase |||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0439 Biotin carboxylase |||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||-- 1 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division |||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases ---|----|---------||------||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 1 [H] COG0447 Dihydroxynaphthoic acid synthase -----------------|||||||--||||||-|--||----|||||-|-||-------||-|--- 1 [G] COG0448 ADP-glucose pyrophosphorylase ||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains |||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ) |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| 1 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase ||||||||||||||--||||---------------------------------------||-|--- 1 [T] COG0467 RecA-superfamily ATPases implicated in signal transduction |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase |||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--|||||||| 1 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA -------------||-||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0486 Predicted GTPase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase ----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair |||||||||||||||-||||------||||-------------------|--|--|---|||||-- 1 [H] COG0499 S-adenosylhomocysteine hydrolase |||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 1 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes ||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||--- 1 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase) ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit ---|---------||---||-|----|||-----|-||----|||||--|-|-|||||||||||-- 1 [E] COG0506 Proline dehydrogenase ---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 1 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes ---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||-- 1 [E] COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding) |||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein ||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit |||||||||||||---|--|-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0521 Molybdopterin biosynthesis enzymes |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0527 Aspartokinases |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0528 Uridylate kinase ||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---||||||| 1 [E] COG0531 Amino acid transporters |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0536 Predicted GTPase ---|||--|-|||||-||||-|-----||--|--||||----|||||--|-|---|||-|||||-- 1 [C] COG0538 Isocitrate dehydrogenases |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor) -------------||---||-||||-|---------------||||||||||||||-------|-- 1 [O] COG0545 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 1 |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-| 1 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase ---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||-- 1 [C] COG0554 Glycerol kinase ||||||||||||------||-|-----||-|------|----|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG0555 ABC-type sulfate transport system, permease component |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex |-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase ||||||--||-||-----||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-| 1 [J] COG0565 rRNA methylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase ----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||-- 1 [R] COG0579 Predicted dehydrogenase ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation -----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0594 RNase P protein component ||||--||-|-------|||||----||||||||||||||||--------------|||||||||| 1 [R] COG0595 Predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase -||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-| 1 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters |||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase |--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-| 1 [O] COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity |||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|-- 1 [H] COG0611 Thiamine monophosphate kinase ||||----|--||---||||-|--------|------|----|||||-||||-|||---------- 1 [R] COG0613 Predicted metal-dependent phosphoesterases (PHP family) ----------------|-||-|||---|||-|--||||----|||-||-|||-||||||||||||| 1 [I] COG0623 Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH) -------------|----||------||||-|||||------|||||--|||-|||---|||||-- 1 [R] COG0627 Predicted esterase -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit ||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K |||-----|--|-----|||----------|-----------|||||---||--------|----- 1 [R] COG0641 Arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase) ---|------------|-||-|-----||--------------------|----------|-||-- 1 [R] COG0645 Predicted kinase -----------------|||||----|||||---||||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG0646 Methionine synthase I (cobalamin-dependent), methyltransferase domain --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7 ||||-||||-|||----|||-|----|||-----||||----|||-|-||---------|||--|| 1 [CP] COG0651 Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase) --|--|--|--|-||--|||-|--|-|||||||-||-|----|||||-||--|--|---||-||-- 1 [I] COG0657 Esterase/lipase ----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-| 1 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein ----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase --------|---|||--||||---|---------|||-----||||---|-|-||---|--|--|| 1 [P] COG0672 High-affinity Fe2+/Pb2+ permease -------------||---||-------------------------|--|-||-|||---|||||-- 1 [O] COG0678 Peroxiredoxin ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase --|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase ------------------||-|-----|||-|--||||----------|-------||--|-||-- 1 [E] COG0686 Alanine dehydrogenase |---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---||||||| 1 [J] COG0689 RNase PH ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0691 tmRNA-binding protein --||-----------|--||----------|---|||||||||||||-||------||||------ 1 [G] COG0696 Phosphoglyceromutase --|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0703 Shikimate kinase |||||||||||||---||||-|---|||||||||||-||-|||||||-||--|--|---|||||-- 1 [P] COG0704 Phosphate uptake regulator -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC |-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0708 Exonuclease III -------------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein) --||||------|---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0713 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K) |||-----||---||---|||---|-----||||-||-----|||||||||||--||||------- 1 [C] COG0716 Flavodoxins |||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-||||||||||||||||| 1 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase -----------------|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---||||||||||||| 1 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit -------------||----|-|----|----|-|--------||||||||||||||------||-- 1 [E] COG0722 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [P] COG0725 ABC-type molybdate transport system, periplasmic component -|||--|||-||------||-|---------||---------|||||-||--|--||||-|-|--- 1 [R] COG0727 Predicted Fe-S-cluster oxidoreductase ----------------|||||||||||||||-----------|||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor |||||||||||||||--||||---------|-------------------------|||------- 1 [C] COG0731 Fe-S oxidoreductases ----------------||||----||----||||-|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains) -----------------|||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase ----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|-- 1 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase |||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||-- 1 [H] COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit --|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component -----------------|||||----|||||-----||-------|-||||||--|||||||||-- 1 [E] COG0757 3-dehydroquinate dehydratase II ----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||- 1 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0763 Lipid A disaccharide synthetase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [Q] COG0767 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component |||------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase ----||----------||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit ----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------|-|---||||-------------||-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0781 Transcription termination factor --------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0787 Alanine racemase ---|------------|-||-|----|||-------||----|||-|-|||||--|||||||-|-- 1 [F] COG0788 Formyltetrahydrofolate hydrolase ------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [M] COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins) ----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||-- 1 [L] COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase -----------------|||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0795 Predicted permeases ----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [M] COG0796 Glutamate racemase ----------------|-||----||----|-----------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0797 Lipoproteins ----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein -----------------|||----|-----||||--||----|||||-||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0800 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||-||||--- 1 [E] COG0804 Urea amidohydrolase (urease) alpha subunit --||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC ----------------||||||--||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing ----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II ----------------||||||---|----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase) ----------------|--||---------------------|||||-||||||||||||||||-- 1 [M] COG0810 Periplasmic protein TonB, links inner and outer membranes ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase ----------------||||-|||||||||------------|||||-||||-||||||||||||| 1 [M] COG0815 Apolipoprotein N-acyltransferase ----------------||||||||--|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis) -----------------||||||||-||||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit -----------------|||-|--------||||||||----|||||-|||||||||||||||--- 1 [M] COG0818 Diacylglycerol kinase ----||||--|||||----|------|----|-|||||------------||----|||--|---- 1 [K] COG0819 Putative transcription activator ----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||-- 1 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis --||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||| 1 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit |||------|-|----|--|||--------||||||||----|||||-||||-|||||||||---- 1 [O] COG0826 Collagenase and related proteases --------------|---||-|----|-------|--||----||----||----|||-||||--- 1 [O] COG0829 Urease accessory protein UreH --------------|---||-|----|||-----|--||----|||---||----|||-||||--- 1 [O] COG0830 Urease accessory protein UreF --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||-||||--- 1 [E] COG0831 Urea amidohydrolase (urease) gamma subunit --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||--|||--- 1 [E] COG0832 Urea amidohydrolase (urease) beta subunit --||--|||-------||||-|--------|-----------|||||-||--|---||-|||||-| 1 [M] COG0836 Mannose-1-phosphate guanylyltransferase ------------------||----------------------|||||--|--||||||-|||||-- 1 [G] COG0837 Glucokinase --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0838 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 3 (chain A) --||||--|--||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0839 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J) ----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||--- 1 [D] COG0850 Septum formation inhibitor ------------------||||--------------------||||||||--||||||-||||--- 1 [D] COG0851 Septum formation topological specificity factor --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit ----------------||||-|----|||||---||||----|||||--|--||||||||--||-- 1 [H] COG0853 Aspartate 1-decarboxylase ----------------|-||----------------------|||||-||--||||||||||||-- 1 [H] COG0854 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein --|---------------||-|-----||||------|----|||||-||--||||||||||||-- 1 [P] COG0855 Polyphosphate kinase ---|----|---------||-|-----||-------------||||||||||-||-|||------- 1 [R] COG0857 BioD-like N-terminal domain of phosphotransacetylase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A ----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||---||-- 1 [M] COG0859 ADP-heptose:LPS heptosyltransferase ------------------||-|----|||-|---||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [P] COG0861 Membrane protein TerC, possibly involved in tellurium resistance ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG1003 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), C-terminal domain -|||---||--|----|-||------|||---|---||----|||||-||-||--|--|||||||| 1 [M] COG1004 Predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1005 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 1 (chain H) ||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--|| 1 [P] COG1006 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1007 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N) ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG1010 Precorrin-3B methylase ||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||-- 1 [R] COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily) ---|----|-|-|||||-|||---||||||---------------|--||||-------------- 1 [I] COG1022 Long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming) ---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---||||||| 1 [I] COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase ----||-----------|-|------|---|-----||----|||||-||||-||-||||-|---- 1 [E] COG1027 Aspartate ammonia-lyase ----------------||||-|-----||-|-----------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1034 NADH dehydrogenase/NADH:ubiquinone oxidoreductase 75 kD subunit (chain G) |||-----||--------||----------------------------------------|----- 1 [C] COG1035 Coenzyme F420-reducing hydrogenase, beta subunit ----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases -|||||||||||-------|----------------------|||||-||---||-----|-|--- 1 [C] COG1042 Acyl-CoA synthetase (NDP forming) ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase ------------------||----------------------|||||-||-|||||||||------ 1 [C] COG1049 Aconitase B ||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit ------------------||-|||--|----||||||-----||||||||--|--|---||||||| 1 [R] COG1054 Predicted sulfurtransferase ----|||||-|||----||||-||---|||----||||----||||--||---|||--||--|--- 1 [P] COG1055 Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases ---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||-- 1 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA -----------|-||---||------||||-------|----|||||--||--|||---|||||-- 1 [C] COG1062 Zn-dependent alcohol dehydrogenases, class III --|-||----|||||---||------||||-||||-||----|||-|--|--|||||||||||--- 1 [R] COG1064 Zn-dependent alcohol dehydrogenases ----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease --------|---|||--|||----|||||-||-|||||----|||||--|||---|---||||--- 1 [G] COG1070 Sugar (pentulose and hexulose) kinases ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 1 [C] COG1071 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, alpha subunit --||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||-- 1 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily |---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----||| 1 [D] COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG1079 Uncharacterized ABC-type transport system, permease component |-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||-- 1 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase ----||------------||------||||----||||----|||||--||||------------- 1 [R] COG1090 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase ||------||---------|---------------------------------------------- 1 [R] COG1099 Predicted metal-dependent hydrolases with the TIM-barrel fold -|----||---|-------||-----------------------------------||-------- 1 [R] COG1106 Predicted ATPases --------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|------||-||||--- 1 [E] COG1125 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, ATPase components --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 1 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [Q] COG1127 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component ------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component ----------------||||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component |--|---||-|-|----|||-------||-||||||||---------------------------- 1 [C] COG1141 Ferredoxin |||---||||-------|||----------------------|||||------------------- 1 [C] COG1142 Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2 |||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I) ||||||-|||||-----|||-|----|||||-----------|||-|-||--|--||||||||||| 1 [C] COG1146 Ferredoxin ----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||-- 1 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1159 GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1160 Predicted GTPases -||---||-|||||||-||||----|----||||||||||||------|----||----------- 1 [R] COG1161 Predicted GTPases ---|--------------||------||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 1 [H] COG1165 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase ------------------||-|--------------------|||||-||-||||-|||------- 1 [E] COG1166 Arginine decarboxylase (spermidine biosynthesis) ----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||-- 1 [KE] COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs ---|--------------||------||||-|--|||-----|||||-||||---------|---- 1 [HQ] COG1169 Isochorismate synthase --------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|-----|||-||||--- 1 [E] COG1174 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, permease component ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 1 [E] COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II ---|--||--|-|-----||||--|-|------|---|----|||||-||||-|||--|||||--- 1 [P] COG1178 ABC-type Fe3+ transport system, permease component -------------------|----------||--||||-||||||||--||----|---||-|--- 1 [I] COG1182 Acyl carrier protein phosphodiesterase -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase) --|-----|-------|||||----|||||||||-|||||----------------|||||||||| 1 [J] COG1189 Predicted rRNA methylase --|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||----- 1 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II) |-||--||--------||||||---|----||||||||------------------|||------- 1 [L] COG1193 Mismatch repair ATPase (MutS family) ----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------||||||| 1 [L] COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway) -||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||-- 1 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases -----------------|||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase ||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|-- 1 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases ----------------||||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [LK] COG1200 RecG-like helicase |||||||||||||------|------|||-------------|||----|-----|---|||||-- 1 [R] COG1201 Lhr-like helicases |||---||||||-||----|-|----|||-------||-----||---------------|----- 1 [R] COG1205 Distinct helicase family with a unique C-terminal domain including a metal-binding cysteine cluster ----------------||||||---------|||||||---------------------|||||-- 1 [J] COG1206 NAD(FAD)-utilizing enzyme possibly involved in translation ----------------||||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains) |-|||||||--||----|||-|----|||||||---||----|||||--|--||||---||-||-- 1 [M] COG1209 dTDP-glucose pyrophosphorylase |||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||-- 1 [M] COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase ------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone ------------------||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [T] COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response -------------||-|-||--||--||||------------|||||||||||-----|||||||| 1 [P] COG1218 3'-Phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit -----------------|||----------|----||-----|||||-||-----|---------- 1 [KT] COG1221 Transcriptional regulators containing an AAA-type ATPase domain and a DNA-binding domain ------------------||-|----|||-------|------------|-----|------||-- 1 [E] COG1231 Monoamine oxidase ||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||-- 1 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III -||||||-|-||||||--||-|--------------------------||-----|---||-||-- 1 [J] COG1236 Predicted exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing ||||||---|--------||------|||--------------------|-----|---------- 1 [H] COG1240 Mg-chelatase subunit ChlD --|-------|-|-----||-|----|---||-|||||----|||-|-||-----|---|||||-- 1 [M] COG1247 Sortase and related acyltransferases -||-|||||-|||----|-|-|---|--|-||||||||----|||||-||-|---|----|-|--- 1 [C] COG1254 Acylphosphatases --||----|-|||---||||--||--||||------------------------------------ 1 [S] COG1259 Uncharacterized conserved protein |-||--|||--------||||||-|-|---||||||||---------------------||||-|| 1 [R] COG1268 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||-----||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---||||--- 1 [H] COG1270 Cobalamin biosynthesis protein CobD/CbiB --||||--|-------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 1 [C] COG1271 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1 ----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family ------------------||-------|||------------|||||-||||-|||---||||||| 1 [C] COG1282 NAD/NADP transhydrogenase beta subunit ----------------|-||||--|--||-||-|-|||----|||||--|||---|---|||---- 1 [S] COG1285 Uncharacterized membrane protein ||||||||||||||||-|||||---|----||||||||------------------|||------- 1 [K] COG1293 Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP --||------------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 1 [C] COG1294 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2 |||---||||--|-----||-------||-|---|-||-----------|------------||-- 1 [S] COG1300 Uncharacterized membrane protein --||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-|||| 1 [C] COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters |-|||||||||||||||-||-|-----||--------------||||--|-----|---------- 1 [R] COG1310 Predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily ----------------|-|||||||||||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG |-|-|||||||-|--|||-|-|-|------------------|||||-----|--|--------|| 1 [P] COG1324 Uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations |-||||--|-|||---|--|-|||---||-|-----|------------------------||--- 1 [O] COG1331 Highly conserved protein containing a thioredoxin domain ----------------|-||------||||------||---------------|||---------- 1 [O] COG1333 ResB protein required for cytochrome c biosynthesis ---|||||--|||---||||--|||||||||-------------------------|||-----|| 1 [F] COG1351 Predicted alternative thymidylate synthase -||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [S] COG1354 Uncharacterized conserved protein ||||--|||||-|----|-|||--------||||||||||--|||-|--|----------|----- 1 [G] COG1363 Cellulase M and related proteins ------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---||||||| 1 [L] COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) ----------------||||||--||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-|||||--------|||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [K] COG1386 Predicted transcriptional regulator containing the HTH domain -------------------|||----|--||||||||||-|||||||-||||||||--||||||-- 1 [P] COG1393 Arsenate reductase and related proteins, glutaredoxin family ----------------||||-|----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [R] COG1399 Predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein -----------------|||-|----|||||------|----|||||-|||-|--|---|||||-- 1 [E] COG1410 Methionine synthase I, cobalamin-binding domain -----------------||||-||--||||||||||||||||----------|--|||||||||-- 1 [K] COG1420 Transcriptional regulator of heat shock gene ---|||||--||--|---||----------------------|||-|-|------|---|---|-- 1 [E] COG1446 Asparaginase ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||-- 1 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF ----------------|-||-|--------------------|||||--|---|||-------|-- 1 [M] COG1462 Uncharacterized protein involved in formation of curli polymers ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [Q] COG1463 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, periplasmic component |||---|||-|||---||-||-----------|----|---------------------------- 1 [L] COG1468 RecB family exonuclease -----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---||||||| 1 [G] COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases ||||---||----------|-|--------||||||||-----------|-------------|-- 1 [K] COG1476 Predicted transcriptional regulators -----------------||||--||-----|----|||---------------------------- 1 [R] COG1480 Predicted membrane-associated HD superfamily hydrolase --|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||--- 1 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase |---||--|-|||---||||----------|------|----|||||-||||-------|||-|-- 1 [R] COG1489 DNA-binding protein, stimulates sugar fermentation ||||||--||-|------||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---|||||-- 1 [H] COG1492 Cobyric acid synthase --|---------------||||----|||||-----||----|||-|-|-||---------|||-- 1 [G] COG1494 Fructose-1,6-bisphosphatase/sedoheptulose 1,7-bisphosphatase and related proteins ----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein ------||-----------|-|----|||------------------------||-------|||| 1 [E] COG1505 Serine proteases of the peptidase family S9A -----------------|||----|------|----||----|||----|-|---|-----|||-- 1 [R] COG1512 Beta-propeller domains of methanol dehydrogenase type ----------------|-||----------------------|||----|-----|---------- 1 [P] COG1513 Cyanate lyase |||-|||||||||---||-|-|----|---|---|-||----|||||--|-----|---|||||-- 1 [J] COG1514 2'-5' RNA ligase ---||||||||||-|-||-|-|--------|-----|-----|||||-----|------------- 1 [L] COG1515 Deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V) ----------------||||||--||-||||----|||-|---------|--|||||||----|-- 1 [K] COG1521 Putative transcriptional regulator, homolog of Bvg accessory factor ----|||||--|-|||-|-|------|---|----|-|-----------|--|-----|-|-||-- 1 [R] COG1524 Uncharacterized proteins of the AP superfamily ---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG1530 Ribonucleases G and E ----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [MU] COG1538 Outer membrane protein -------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase |-|-----|--|-------|||---------------|----|--|--|---|--|---------- 1 [H] COG1541 Coenzyme F390 synthetase ------||----------||----|--||||------|---------------------------- 1 [S] COG1543 Uncharacterized conserved protein ----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---||||||| 1 [J] COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1) ---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||-- 1 [R] COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced) ---|||----|||---|-||-|------------|-||---------------------------- 1 [S] COG1547 Uncharacterized conserved protein ||----|----------|||--------------------------------------------|| 1 [P] COG1563 Predicted subunit of the Multisubunit Na+/H+ antiporter ----------------|-||--------------------------------|||||||||||||| 1 [S] COG1565 Uncharacterized conserved protein -----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit |-|---|||----------|---------------------------------------------- 1 [S] COG1572 Uncharacterized conserved protein --|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--||||||||||||| 1 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase ---|-------------||||-----||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 1 [H] COG1575 1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase ||-|--||-||||----|||||----|||||-----------|||||-||-||------|||||-- 1 [OU] COG1585 Membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity ------------------||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 1 [M] COG1589 Cell division septal protein |||----|||-|-----|-||---------|-----|---------------------|------- 1 [C] COG1592 Rubrerythrin |-|-----|---------||-|--------|-|-||||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [C] COG1600 Uncharacterized Fe-S protein |||-----||-------|||----------|----------------------------------- 1 [R] COG1606 ATP-utilizing enzymes of the PP-loop superfamily --|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||-- 1 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein ---|--------|||-|-||-|----||||----||||-----------|--|--|---||||||| 1 [O] COG1612 Uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly ------------------||-------|||-------|----|||||--|--||||---|||||-- 1 [P] COG1613 ABC-type sulfate transport system, periplasmic component -|||--||||------|-||-|||||----||||||||-|||------------------------ 1 [S] COG1624 Uncharacterized conserved protein |||---||-|--------||-|--------|----------------------------------- 1 [C] COG1625 Fe-S oxidoreductase, related to NifB/MoaA family -------------|||---|----||----------------|||-|--|-----|---------- 1 [G] COG1626 Neutral trehalase ||-|--||-||||------|------||||------------------------------------ 1 [L] COG1637 Predicted nuclease of the RecB family ----------|-----|-||||||-||||--|||--------|||||-||||---|---------- 1 [G] COG1640 4-alpha-glucanotransferase |||-----||-------|||------|---|----------------------------------- 1 [S] COG1641 Uncharacterized conserved protein --|------|---||---||----------------|----------------------------- 1 [I] COG1657 Squalene cyclase -------------------|-------||-------||----|||||-||||---|--|------- 1 [S] COG1666 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-||||||||||||||||||---|||||-|||||||||||||||||| 1 [D] COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins |||||||||||||--|||-|-|----|||-|------|----|||-|--|-----|---------- 1 [S] COG1690 Uncharacterized conserved protein |||-----||-------|||------|---|----------------------------------- 1 [R] COG1691 NCAIR mutase (PurE)-related proteins --|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-| 1 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase ---------||-|---||||-|----||||-|||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [T] COG1702 Phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase |--------|--------||-------||||----|||----------|||--||||||||||||| 1 [S] COG1714 Predicted membrane protein/domain -----------------|-|||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG1722 Exonuclease VII small subunit -------------|||---|--||----------------------------------------|| 1 [S] COG1723 Uncharacterized conserved protein ----|------|-----|||------|||-|-||||||---------------------------- 1 [K] COG1725 Predicted transcriptional regulators ---|----|----------|||-----||-|||||||-----|||-|--|-----|||-||||--- 1 [M] COG1732 Periplasmic glycine betaine/choline-binding (lipo)protein of an ABC-type transport system (osmoprotectant binding protein) --|-----|-------|--|----------|-----------|||-|---------|||------- 1 [C] COG1740 Ni,Fe-hydrogenase I small subunit ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-|||||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG1744 Uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein ----|||-|-|-|||---||-|-----------|---|----------|--|----|||||||--- 1 [E] COG1748 Saccharopine dehydrogenase and related proteins ------------------||-|---|||||----------------------|------||||||| 1 [R] COG1754 Uncharacterized C-terminal domain of topoisomerase IA ||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega -------------------|------||||---|--------|||||-||--|------||||||| 1 [E] COG1770 Protease II --||---|-----||--|-|-|----|-------|-||----||||---|--|--|-----|---- 1 [P] COG1785 Alkaline phosphatase -------------||-|--|----------------|------------|--|------------- 1 [S] COG1791 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain ----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----||| 1 [M] COG1792 Cell shape-determining protein ||||||--||||------||||-----||-|----|-|--------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG1797 Cobyrinic acid a,c-diamide synthase ------------------|||-----||||||||||||---------------------------- 1 [S] COG1799 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-|||||-|||---||-|-|------------||||----|||||-||-|---|---||-||-- 1 [S] COG1801 Uncharacterized conserved protein ------------------||--||---------------------|--||||-||-------|--- 1 [C] COG1805 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrB -------------||----|----|--|-|||----------|||-|-||-----|---||-||-- 1 [F] COG1816 Adenosine deaminase -----------|-----|-|||---||||-||||||||-|--|||||-|||||------|||||-- 1 [G] COG1820 N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase ----------------||||-|||||||||----||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc) ||||||||||||----||||-|----||||-|--||||--------------------|-||||-- 1 [F] COG1828 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, PurS component ||||--||||-||---|--|--||------------------|||||----|-------||-|--- 1 [G] COG1830 DhnA-type fructose-1,6-bisphosphate aldolase and related enzymes --|---------|-----||-------||-|-----||-----------|----------|-|--- 1 [E] COG1834 N-Dimethylarginine dimethylaminohydrolase --|----------------|||----||||-||||||------||-|--||-||||---|||||-| 1 [I] COG1835 Predicted acyltransferases |||||||||-|-------||-----------------|---------------------------- 1 [S] COG1836 Predicted membrane protein ----------------||||||||||-|||||||-|||------------------|||------- 1 [R] COG1837 Predicted RNA-binding protein (contains KH domain) --||------|-|-----|||-----|-----|||--|-----||||-||||||||--|||||--- 1 [P] COG1840 ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component -----------------|||||--||-|||||||-|||---------------------------- 1 [R] COG1847 Predicted RNA-binding protein -||---|||---------||----------------|-----------------------|-|--- 1 [G] COG1850 Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase, large subunit |||----|||--|------|--||----|-------------|||||-|--|-------|--|||| 1 [S] COG1872 Uncharacterized conserved protein ------------------||----||----||||-|||-------|--|-|||------------- 1 [M] COG1876 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase ||||||-||-||-----|||------|||-----|--|-----------|||---|---||-|--- 1 [R] COG1878 Predicted metal-dependent hydrolase ---|--|||-|-|||-|--|------|||-|||-||||----|||||-||-----|------||-- 1 [H] COG1893 Ketopantoate reductase |-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---||||||| 1 [C] COG1894 NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit ||||||||||||||||---|-------------------------------------------|-- 1 [O] COG1899 Deoxyhypusine synthase |||-----||--------||---------------------------------------------- 1 [S] COG1900 Uncharacterized conserved protein |||-||--||||------|||---------|----|----------|--|-----|---|-|---- 1 [H] COG1903 Cobalamin biosynthesis protein CbiD |-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---||||||| 1 [C] COG1905 NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit -|||--|||||||---||-|-------------|||-------||-----------||-------- 1 [S] COG1912 Uncharacterized conserved protein ----||-----|-||----|||----||||||-|||||----|||||--|||||||---||||--- 1 [P] COG1914 Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family ||------||--------||---------------------------------------------- 1 [S] COG1915 Uncharacterized conserved protein ||||||||--||----|||||-----||--|||--|||-------||--|-----||||||||--- 1 [S] COG1917 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain --|-||----------|--|-------||--------------------------|||--|-|--- 1 [R] COG1926 Predicted phosphoribosyltransferases -------------|||--||------||||------------------------------------ 1 [O] COG1928 Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase ||||----|----------|---------------|----------|------------------- 1 [P] COG1930 ABC-type cobalt transport system, periplasmic component --|----------||----|------||||-|---|||----||||||||||||||--||||||-- 1 [HE] COG1932 Phosphoserine aminotransferase ----------------|-||----------------------|||||-||||||||||||||||-- 1 [S] COG1934 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|----||||||--||||----|||-|--|-----|--|||----- 1 [S] COG1937 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------||||---------||||||||---------------------------- 1 [S] COG1939 Uncharacterized protein conserved in bacteria |||---||||--------||---------------------------------------------- 1 [C] COG1941 Coenzyme F420-reducing hydrogenase, gamma subunit |-------|----------|------|----|||||||----||||------|||||||||-||-- 1 [R] COG1942 Uncharacterized protein, 4-oxalocrotonate tautomerase homolog ----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase -----------------|||-|--||-----|---|||---------------------------- 1 [S] COG1963 Uncharacterized protein conserved in bacteria |--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||-- 1 [V] COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein -------------------|------------|-|-||----|||||-|-||----||-----|-- 1 [F] COG1972 Nucleoside permease -----------------|||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|---|||||-- 1 [KT] COG1974 SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidases) -----------------|-||---------|----|||----|||||-|--|-------------- 1 [C] COG1979 Uncharacterized oxidoreductases, Fe-dependent alcohol dehydrogenase family ------------------||-----------------------------|--|||||||||||||| 1 [S] COG1981 Predicted membrane protein ------------------|||------||||--|||||----|||||-||||---|----|----- 1 [E] COG1982 Arginine/lysine/ornithine decarboxylases ||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 1 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases ----------------|-|||----------------|----|||||-||-|||||||||||||-- 1 [H] COG1995 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein ---|--|||-|||-----||-------||-|----|||----|||--------------||-|--- 1 [K] COG2002 Regulators of stationary/sporulation gene expression --|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--| 1 [L] COG2003 DNA repair proteins |-|-----|--------|||---------------------------------------------- 1 [S] COG2006 Uncharacterized conserved protein ---|---------||--|-|||--------|---||-|----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2008 Threonine aldolase ----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||-- 1 [G] COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes --|---|||---||||--||-------||-|-----------------|-||---|----|||--- 1 [O] COG2020 Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase ----------------|-||||----|||||-----||----|||||-||--||||--||||||-- 1 [H] COG2022 Uncharacterized enzyme of thiazole biosynthesis |||||||||||||-----||||----|||||------|----|||-|-||-----|---|||||-- 1 [H] COG2038 NaMN:DMB phosphoribosyltransferase ||--||---|-------|||-|--------|-----|------------------|---------- 1 [HR] COG2045 Phosphosulfolactate phosphohydrolase and related enzymes -------||-|||||-|-||-|--------------||--------------------|------- 1 [P] COG2046 ATP sulfurylase (sulfate adenylyltransferase) |||-----||-|----|-||--------------------------------------|------- 1 [C] COG2048 Heterodisulfide reductase, subunit B -----------------|||----------|-----||---------------------------- 1 [S] COG2052 Uncharacterized protein conserved in bacteria -|---------------|||||---||---------||-|--------||-----|---||-||-- 1 [P] COG2059 Chromate transport protein ChrA --------|-|||---|-||------||||------------|||||-|||||--|--||||||-- 1 [T] COG2062 Phosphohistidine phosphatase SixA ------------------||||----|||-||||||||-----------|||---|---------- 1 [F] COG2065 Pyrimidine operon attenuation protein/uracil phosphoribosyltransferase --||---------------|-|-----|||||---|||----|||||-||---||---||||||-- 1 [P] COG2076 Membrane transporters of cations and cationic drugs ------------------||----------||||||||----|||||-||||---|---|||-|-- 1 [R] COG2081 Predicted flavoproteins |-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||-- 1 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases ||||----||---------|------|----|--------------------|--|---||-|--- 1 [R] COG2085 Predicted dinucleotide-binding enzymes ------------------||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||--- 1 [H] COG2087 Adenosyl cobinamide kinase/adenosyl cobinamide phosphate guanylyltransferase -------------||---||----------|---|-||----|||-|---|||--|---------- 1 [H] COG2091 Phosphopantetheinyl transferase -||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||-- 1 [U] COG2095 Multiple antibiotic transporter ||----------------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2099 Precorrin-6x reductase ------------------||-|--------||--|-||----|||||-|-||--------|-|--- 1 [R] COG2103 Predicted sugar phosphate isomerase |-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||-- 1 [H] COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis -||---|---||------||-|--------------||----|||||-||-----|---------- 1 [S] COG2105 Uncharacterized conserved protein ||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--|| 1 [P] COG2111 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhB subunit ---|------|--||-|--|------|||-------||----|||||--|||||||--||||||-- 1 [Q] COG2132 Putative multicopper oxidases ----------|-------||-|---|-|||-------|----|||-|--|--|--|---||-||-- 1 [G] COG2133 Glucose/sorbosone dehydrogenases ---|---------|-----|------||||------|-----|||-|--|---------||||--- 1 [S] COG2135 Uncharacterized conserved protein ||||----||||------||-|----|||-----|-||-----------------|---------- 1 [S] COG2138 Uncharacterized conserved protein --||||----||--|---||-|----||------|-||----|||||--|--|--|---||-||-- 1 [PR] COG2146 Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenases ----------------|-||------|||-------------|||-|------------------- 1 [S] COG2149 Predicted membrane protein ---|------||-||-|-||------||||------------------||--|--|----||||-- 1 [H] COG2154 Pterin-4a-carbinolamine dehydratase ------------------||-|||---||-------------|||||-|||||------|||||-- 1 [R] COG2166 SufE protein probably involved in Fe-S center assembly ---|--------------||------|||-------------|||-|--|-----|---------- 1 [S] COG2170 Uncharacterized conserved protein ------------------||-------||-------------|||-|---------------||-- 1 [M] COG2173 D-alanyl-D-alanine dipeptidase -------------------|||----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 1 [D] COG2177 Cell division protein -------------|||---||---|-|---|||||||||---|||||-||||||||---||||--- 1 [K] COG2183 Transcriptional accessory protein ----------------|-||-------||--------------------|------------||-- 1 [S] COG2187 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|----|||-||||||||||--|||||-||-----|---|||||-- 1 [K] COG2188 Transcriptional regulators ------------------||-------|||------------|||||-||--||||---|||||-- 1 [P] COG2193 Bacterioferritin (cytochrome b1) ------------------||-|-----||-|---||------|||||-||-----|--|||-||-- 1 [T] COG2205 Osmosensitive K+ channel histidine kinase ----------------||-|-|--||----|------|----------||-----|---|--|--- 1 [T] COG2206 HD-GYP domain ------------------|||---------||----|-----|||||----------------|-- 1 [G] COG2211 Na+/melibiose symporter and related transporters --|||||||-|||||----|----|||--------------------------||||||------- 1 [R] COG2236 Predicted phosphoribosyltransferases ||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2241 Precorrin-6B methylase 1 ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2243 Precorrin-2 methylase ------||---------|||------||||------------------------------------ 1 [R] COG2251 Predicted nuclease (RecB family) -|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|-- 1 [R] COG2252 Permeases -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit ---|-------|-||----|-|----||||----|-||----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [S] COG2259 Predicted membrane protein -|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [R] COG2262 GTPases ------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase -------||----||--|-|||----||||||--||||----|||||-||||---|---|||||-- 1 [I] COG2267 Lysophospholipase ------------------||||---------|||||||---------------------------- 1 [S] COG2302 Uncharacterized conserved protein, contains S4-like domain ||-|-----|---------|-|-----|||----|-------||||---|-----|--||||||-- 1 [E] COG2303 Choline dehydrogenase and related flavoproteins -------------------|||--------||-|--||----|||-|-------------|----- 1 [S] COG2323 Predicted membrane protein |--|--------------||-|-------------------------------------------- 1 [S] COG2324 Predicted membrane protein ---|---------------|-|--------||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [R] COG2333 Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily) -------------------|-|---------------|----|||--------|||---|------ 1 [T] COG2336 Growth regulator ----||------------||-|----||||-------|-------|--|----------------- 1 [K] COG2345 Predicted transcriptional regulator ------------------||-|----|--|--||--------|||||-||||-|||-------|-- 1 [C] COG2352 Phosphoenolpyruvate carboxylase ------------------||-|--------------------|||||-||--||||--||||||-- 1 [O] COG2360 Leu/Phe-tRNA-protein transferase --------------|----|-|------------||||----|||||-||||-------|||||-- 1 [S] COG2363 Uncharacterized small membrane protein ----||--|-|||-----||-|---------------------------|-----|-----|-|-- 1 [R] COG2366 Protein related to penicillin acylase ----------------|-||-|---------------------------|-----|---|--|--- 1 [O] COG2370 Hydrogenase/urease accessory protein ------------------||-|----|-------|--||----|||---||----|||-||||--- 1 [O] COG2371 Urease accessory protein UreE -----------------|-|||--------------------|||||--|-||--|---||-|||| 1 [R] COG2373 Large extracellular alpha-helical protein ------------------||-|--|-|-----|---------------||---------------- 1 [R] COG2374 Predicted extracellular nuclease ---------|--------||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG2377 Predicted molecular chaperone distantly related to HSP70-fold metalloproteases --|-------------|-||-|-------------------------------------------- 1 [R] COG2389 Uncharacterized metal-binding protein ---|---||-|-----|-||-------|-------------------------------------- 1 [R] COG2402 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain --------|---|-----||---------------------------------------------- 1 [R] COG2405 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain ------||---||-|--|-|---------------|-|----------------------|--|-- 1 [C] COG2421 Predicted acetamidase/formamidase -||---||--||-||----|-|----|---------------||||--||---------------- 1 [T] COG2453 Predicted protein-tyrosine phosphatase -------------------|||----|---||||||||||--|||||-|----|||---------- 1 [S] COG2501 Uncharacterized conserved protein -------------------|------------|-|---|-----------||----||-------- 1 [R] COG2503 Predicted secreted acid phosphatase ||----||-|---------|-------------------------|---|---||----|-|---- 1 [S] COG2510 Predicted membrane protein ----||----|||------|------|||------|||----|||-|-||--||||----|-||-- 1 [G] COG2513 PEP phosphonomutase and related enzymes ------||------|--|-|----------------------|||||-|------|--|---||-- 1 [E] COG2515 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase ------------------||--------------|-|------------|-----|--||--|--| 1 [V] COG2602 Beta-lactamase class D ----------|-|------||-----||-|-||||||-----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [S] COG2606 Uncharacterized conserved protein ----------------|-||----------|------------------|---|||--||||||-- 1 [R] COG2607 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) -------------------|-|--|-----|-----------|||||--|-|---|--||||-|-- 1 [S] COG2717 Predicted membrane protein ------||-----||--|-|----------|-----||--------------|--|---------- 1 [G] COG2730 Endoglucanase -------------------|||----||||||||||||||----------------||||||||-- 1 [K] COG2740 Predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination -------------------|-|--------|----||---------------------|-|-|--- 1 [V] COG2746 Aminoglycoside N3'-acetyltransferase -------------------|------|||-||--||-|----|||-|--|-----|----|-||-- 1 [S] COG2764 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-||--|----||---||||----|||--|||||-|||--|||||-|||--|||---|||||-- 1 [L] COG2801 Transposase and inactivated derivatives --------------|---||-|-----||-------------------||-----|---|||||-- 1 [R] COG2802 Uncharacterized protein, similar to the N-terminal domain of Lon protease ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 1 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB ---|---------------|----------|-----------------||---||||||------- 1 [S] COG2836 Uncharacterized conserved protein -------------------|-|----|||-----|||-----|||||-||-|-|||------|--- 1 [P] COG2837 Predicted iron-dependent peroxidase -------------------|-|------------|-||---------------||----------- 1 [S] COG2839 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|------------||--------|-----|--||----------- 1 [R] COG2842 Uncharacterized ATPase, putative transposase -------------------|-|-------------|------|-------|--||-----|--|-- 1 [S] COG2852 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|||---|-||-|--|||||--------------||-|-----|---- 1 [E] COG2856 Predicted Zn peptidase ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2875 Precorrin-4 methylase -------------------|-|----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 1 [D] COG2884 Predicted ATPase involved in cell division ----------------|--||-||||-||-------------|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG2885 Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins -------------------|----|------|-|||||----|||||-|||||--|---------- 1 [M] COG2891 Cell shape-determining protein ----------------||||||--------|----|||----||||||||--||||||-||||--- 1 [D] COG2894 Septum formation inhibitor-activating ATPase |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG2896 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme -------------------|--||------------------|||||||||||--|-------|-- 1 [S] COG2912 Uncharacterized conserved protein ---|---------------||-||-------------|-----------|--||||---||-|--- 1 [S] COG2928 Uncharacterized conserved protein ------------------||----------------------|||-|-----|--|---|||||-- 1 [G] COG2942 N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase -------------------|----------------------|||-|-|---||||---||----| 1 [K] COG2944 Predicted transcriptional regulator --------------|---||-|---------------------------|--|--|---||||--- 1 [S] COG2947 Uncharacterized conserved protein -------------------|-|--------------------|||||-|-||-------------- 1 [S] COG2949 Uncharacterized membrane protein ------------------||--------------------------------|||----||-|--- 1 [S] COG2954 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||--------------||-------||--------|----|||||-|---|------|||||-- 1 [S] COG2968 Uncharacterized conserved protein ----||-----|-----|-|-|--------|-----------------|-----------|||--- 1 [G] COG2971 Predicted N-acetylglucosamine kinase ------------------||----------------------|||||-||---------------- 1 [E] COG2988 Succinylglutamate desuccinylase -------------||---||-------||-------------------||-----|---||-||-- 1 [I] COG3000 Sterol desaturase ------------------||------|-------|-------|||||-|--|-------------- 1 [G] COG3001 Fructosamine-3-kinase ------------------||--------------|-||-------|--||--|--|------||-- 1 [S] COG3011 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|--------------------|||||-|--|-------|-|||-- 1 [S] COG3021 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-------------|--------|||-|-|-|-|---||-|------ 1 [S] COG3041 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------||-----|---------------|||---|||-|-------|-||-- 1 [R] COG3093 Plasmid maintenance system antidote protein --------------|----|------||||------------|||-|-||--|--|---|||||-- 1 [L] COG3145 Alkylated DNA repair protein ------------------||-----------------------------|--|--|---|||||-- 1 [S] COG3146 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----------------|------|----|--||------|||||-||---------|||||-- 1 [R] COG3153 Predicted acetyltransferase ------------------||----------------------|||||-||--||||------|--- 1 [NU] COG3166 Tfp pilus assembly protein PilN -------------------|-------||-------------------||-----|---|||||-- 1 [R] COG3176 Putative hemolysin -------------------||-----|-------|-||----|||-|-||---------||-|--- 1 [R] COG3180 Putative ammonia monooxygenase ------------------||------|---------------------||-----|---||-||-- 1 [ER] COG3185 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase and related hemolysins ---|---------------|----------------------|||||-||---------||-||-- 1 [R] COG3217 Uncharacterized Fe-S protein ------------------||-------||--------------------|---------------- 1 [S] COG3222 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|---------------------------|---------------- 1 [S] COG3224 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||----||-----------------------|---------------- 1 [N] COG3225 ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component --|----------------|----------|---|-|-----------||---------------- 1 [E] COG3227 Zinc metalloprotease (elastase) ------------------||----------------------|||||--|-----|---------- 1 [S] COG3228 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|----|---------------|------|---------------- 1 [S] COG3236 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|--------------------------|-||-||--|---------- 1 [IR] COG3240 Phospholipase/lecithinase/hemolysin --|----------------|-------||--|--||------||||---|-----|----|||--- 1 [S] COG3247 Uncharacterized conserved protein |||---||||--------||---------------------------------------------- 1 [C] COG3259 Coenzyme F420-reducing hydrogenase, alpha subunit -------------||----|-|----|---------------|||||-||-|-|||---||-|--- 1 [G] COG3265 Gluconate kinase -----------|-------|-|----|||-----------------|--|-----|----|----- 1 [G] COG3280 Maltooligosyl trehalose synthase -------------------|----------|-----||----|-----||-----|---|||||-- 1 [QK] COG3284 Transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism -|-------|---------|----------------------------||----------|-|--- 1 [S] COG3287 Uncharacterized conserved protein ------------------||----------------------------|---|------------- 1 [T] COG3292 Predicted periplasmic ligand-binding sensor domain ------------------||-|------------|--------------|---------------- 1 [S] COG3296 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|------||||------|-----|||||--|-----|-----||--- 1 [Q] COG3319 Thioesterase domains of type I polyketide synthases or non-ribosomal peptide synthetases -------------------|---------------|-|----------|--|----||--|-|--- 1 [P] COG3338 Carbonic anhydrase |-|---------------||----------|-----||-----------------|---|||||-- 1 [S] COG3339 Uncharacterized conserved protein -------------------|||----|--------|||----|||-|---||-------------- 1 [E] COG3340 Peptidase E --|-||----|------|-|-------------------------|-----|------|------- 1 [S] COG3350 Uncharacterized conserved protein |--|||---|-------|-|----------------------------------------|----- 1 [S] COG3367 Uncharacterized conserved protein --|||||||-||-------|---------------------------------------------- 1 [S] COG3372 Uncharacterized conserved protein ---|-------|-------|------|||--||--|-------|||------|--|---------- 1 [R] COG3378 Predicted ATPase ---|--------------||-----------------------------|-----|---------- 1 [R] COG3380 Predicted NAD/FAD-dependent oxidoreductase -||-||-----|-||----|------|||-|------------------------|---|--||-- 1 [G] COG3387 Glucoamylase and related glycosyl hydrolases --|----------------|----|--||------|-|-------------------------|-- 1 [R] COG3393 Predicted acetyltransferase ------------------|||----------------|----|--||---||-------||||--- 1 [S] COG3395 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|------------||||-|---------------|-----------------|---------- 1 [C] COG3411 Ferredoxin ------------------||-|----||||------------------------------------ 1 [G] COG3429 Glucose-6-P dehydrogenase subunit -----------------|||-|--|-----|-----------------||--|------------- 1 [KT] COG3437 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HD-GYP domain ------------------||------|||||||||------------------------------- 1 [R] COG3442 Predicted glutamine amidotransferase ------------------||----------------------|||-|--|----------|-|--- 1 [T] COG3447 Predicted integral membrane sensor domain -----------------|-|--------------------------|--|---------||-|--- 1 [R] COG3450 Predicted enzyme of the cupin superfamily ------------------||----------------------------|-----------|-|--- 1 [T] COG3452 Predicted periplasmic ligand-binding sensor domain |-|||--------------|||--------||-----|--------|------|||----|||--- 1 [R] COG3467 Predicted flavin-nucleotide-binding protein -|-|-------------|-|------|--------------------------------------- 1 [S] COG3472 Uncharacterized conserved protein ---|----------|----|-----------------|-------|---|-----|----|-|--- 1 [Q] COG3486 Lysine/ornithine N-monooxygenase -------------------|-----------------------||||--|--|--|---|--|--- 1 [R] COG3497 Phage tail sheath protein FI -------------------|----------------------|||-|--|--|--|---|--|--- 1 [R] COG3500 Phage protein D -------------------|-----------------------||||-||-----|---|--|--- 1 [S] COG3501 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|-----||------------------------------|||||-- 1 [S] COG3502 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------|-----|----------------------------|-----------|-|--- 1 [S] COG3506 Uncharacterized conserved protein -------------------|----------------------------|-|-|-------|-|--- 1 [R] COG3549 Plasmid maintenance system killer protein -------------------|--------------------------|--|--|--|-----||--- 1 [O] COG3555 Aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase and related dioxygenases -------------------|-|---------|-|-----------|--|----------|--||-- 1 [S] COG3575 Uncharacterized protein conserved in bacteria |||----------------|||-----|||--|----------------|---------||-||-- 1 [R] COG3576 Predicted flavin-nucleotide-binding protein structurally related to pyridoxine 5'-phosphate oxidase ------------------||----------------------|||---|-----|--|-------- 1 [R] COG3596 Predicted GTPase ------------------||-|---------|-------------------------|-------- 1 [S] COG3597 Uncharacterized protein/domain associated with GTPases ------------------||-|----||||||||||||-|-------------------------- 1 [D] COG3599 Cell division initiation protein -||||||||-|||------|-------||--------------||||-----|--|---||-||-- 1 [K] COG3609 Predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain -------------------|----------------|-----------|---------------|| 1 [R] COG3621 Patatin -------------------|----------------------||||---|---------||-|--- 1 [P] COG3624 Uncharacterized enzyme of phosphonate metabolism -------------------|----------------------||||---|---------||-|--- 1 [P] COG3625 Uncharacterized enzyme of phosphonate metabolism -------------------|----------------------||||---|---------||-|--- 1 [P] COG3626 Uncharacterized enzyme of phosphonate metabolism -------------------|----------------------||||---|---------||-|--- 1 [P] COG3627 Uncharacterized enzyme of phosphonate metabolism -------------------|-------------------------||--|--|--|------|--- 1 [R] COG3628 Phage baseplate assembly protein W -------------------|----------------------------||-------------|-- 1 [S] COG3650 Predicted membrane protein ------------------||-------||----------------------------------|-- 1 [S] COG3651 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-------------|-----|-----||-||---|-------|-|-- 1 [R] COG3654 Prophage maintenance system killer protein -------------------|-------------------------|----|-|--|----|--|-- 1 [S] COG3657 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|-----||--------------|||--||--|--|---|||||-- 1 [R] COG3668 Plasmid stabilization system protein ------------------||----------------------|||||-||----||----|----- 1 [UNTP] COG3678 P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc-resistance associated protein ------||----------||------|||||||||----------------------------|-- 1 [K] COG3682 Predicted transcriptional regulator -------------------|----------------------|||-|--|---------||-|--- 1 [S] COG3685 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-----------------------------|---|||---|-|-|-- 1 [S] COG3686 Predicted membrane protein ------------------||----------|-|-||||---------------------------- 1 [R] COG3688 Predicted RNA-binding protein containing a PIN domain ------------------||----------|-||-|||---------------------------- 1 [S] COG3689 Predicted membrane protein -----------------|-|----------|------|---------------------|---|-- 1 [G] COG3693 Beta-1,4-xylanase ------------------||||----------||-------------------------------- 1 [R] COG3694 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ----------------|-||-|--------||---|||-----------|---|||---|||||-- 1 [E] COG3705 ATP phosphoribosyltransferase involved in histidine biosynthesis -------------------|----------------|-----|||-|--|-------------|-- 1 [R] COG3729 General stress protein -----------|--|----|-|--------------------|-------------------|--- 1 [Q] COG3733 Cu2+-containing amine oxidase -------------|||--||----------------------------||-------------|-- 1 [O] COG3751 Predicted proline hydroxylase -------------------|-|--------------------|||-|--|---------||-||-- 1 [S] COG3755 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|----------|-----------|||||-----|--|------||-| 1 [R] COG3772 Phage-related lysozyme (muraminidase) ------------------||----------------------|||-|--------|------|--- 1 [S] COG3781 Predicted membrane protein -------------------|----------------------|||||-|--------------|-- 1 [R] COG3788 Uncharacterized relative of glutathione S-transferase, MAPEG superfamily ------------------||-|---------------------|||-------------|---|-- 1 [P] COG3793 Tellurite resistance protein --||--------------||---------------------------------------||||--- 1 [C] COG3794 Plastocyanin -------------------|----------------------------|-------------|--- 1 [Q] COG3805 Aromatic ring-cleaving dioxygenase -------------------|-----------------------------|-----|------||-- 1 [S] COG3825 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|||--------------------|||--------------|--|--- 1 [S] COG3831 Uncharacterized conserved protein ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG3845 ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase components ---|--------------||--------------||||---------------------------- 1 [T] COG3848 Phosphohistidine swiveling domain ------------------||----------|-----||---------------------------- 1 [S] COG3854 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|--------|------|---------------------------- 1 [S] COG3860 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|--------|---|||----------------------|------ 1 [R] COG3871 Uncharacterized stress protein (general stress protein 26) -------------------|----------||----|------------------|---||----- 1 [M] COG3967 Short-chain dehydrogenase involved in D-alanine esterification of lipoteichoic acid and wall teichoic acid (D-alanine transfer protein) -----------|------||---------------------------------|||-------|-| 1 [R] COG3975 Predicted protease with the C-terminal PDZ domain -------------------|----------------------|||||-|----||----------- 1 [E] COG3977 Alanine-alpha-ketoisovalerate (or valine-pyruvate) aminotransferase -------------------|---------------|-|---------------------|-||--- 1 [E] COG4091 Predicted homoserine dehydrogenase ------------------||---------------------------------------||--|-- 1 [S] COG4094 Predicted membrane protein -|-----------------|-------------|----||-------------------------| 1 [S] COG4095 Uncharacterized conserved protein -------------------|----------|--|--------------||---------------- 1 [P] COG4097 Predicted ferric reductase ------------------||----------|---||||---------------------------- 1 [P] COG4100 Cystathionine beta-lyase family protein involved in aluminum resistance --|----------------|-------------------------|--||-----|---|--|--- 1 [S] COG4104 Uncharacterized conserved protein -------------------|----------------------||||---|---------||-|--- 1 [P] COG4107 ABC-type phosphonate transport system, ATPase component ------------------||-|----|---||||||------||||||||||||||---|||||-- 1 [J] COG4108 Peptide chain release factor RF-3 ------|---||------||-------||-------------------------------|----- 1 [R] COG4113 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain -------------------|-------||----||------------------------|-----| 1 [S] COG4115 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|----------------------|||-|--|-----|-----||--- 1 [C] COG4117 Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein) ||--------------|-||-|---|----------------|||||-||||---|--|||--|-- 1 [S] COG4121 Uncharacterized conserved protein --||--------|-|-|-||||----||||||||||||-----------|---||-------|--- 1 [R] COG4122 Predicted O-methyltransferase --------|-------|--|-|----|---------||----|||||-||--|--|---------- 1 [R] COG4147 Predicted symporter --|---------|---|-||------|||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [P] COG4149 ABC-type molybdate transport system, permease component -------------------|-------||-|-------------------|--------|------ 1 [S] COG4185 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-------||--------|----|||||-||--||||---|||||-- 1 [P] COG4208 ABC-type sulfate transport system, permease component -------------------|-|---------------------||-------|--|----|----| 1 [S] COG4226 Uncharacterized protein encoded in hypervariable junctions of pilus gene clusters -------------||----|-------------------------------------------|-- 1 [R] COG4240 Predicted kinase ------------------||----------|---|-||---------------------------- 1 [S] COG4241 Predicted membrane protein ----------|||-----||------||||------------------------------------ 1 [S] COG4243 Predicted membrane protein -------------------|----------------------||||----------|--------- 1 [R] COG4245 Uncharacterized protein encoded in toxicity protection region of plasmid R478, contains von Willebrand factor (vWF) domain -------------------|----------------|--------------------------|-- 1 [I] COG4247 3-phytase (myo-inositol-hexaphosphate 3-phosphohydrolase) -------------------|-|--------------------|||--------------------- 1 [R] COG4248 Uncharacterized protein with protein kinase and helix-hairpin-helix DNA-binding domains -------------------|-|------------|--------------|---------------- 1 [S] COG4270 Predicted membrane protein ---|---------------|------|----------|---------------------------- 1 [S] COG4276 Uncharacterized conserved protein -----------|-------|-----------------------------|-----|---------- 1 [S] COG4278 Uncharacterized conserved protein -----------------|-|----------------------------------------|----- 1 [S] COG4288 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|-----||------------------------------------- 1 [S] COG4293 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------|----|-|--------------||---------------------------- 1 [L] COG4294 UV damage repair endonuclease -------------------|-|--------|----------------------------------- 1 [S] COG4295 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|--------|----------------------------------- 1 [S] COG4296 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|----------------------------------------|--- 1 [S] COG4298 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-|-----------------------------------------|-- 1 [S] COG4299 Uncharacterized conserved protein -------------------|------|----||||------------------||----------- 1 [P] COG4300 Predicted permease, cadmium resistance protein --------------|---||-------||--------------------------|---------- 1 [S] COG4301 Uncharacterized conserved protein -------------------|----------------|------------|-----|----|-|--- 1 [S] COG4319 Ketosteroid isomerase homolog -------------------|------|||----------------------|-------------- 1 [S] COG4325 Predicted membrane protein -------------------|----------------|-----------|----------------- 1 [R] COG4326 Sporulation control protein -------------------|-----------------|----------|------|---------- 1 [S] COG4327 Predicted membrane protein ------------------||-------||-------------------------------|----- 1 [S] COG4328 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-----------------|----------------------|----- 1 [S] COG4329 Predicted membrane protein ------------------||----|---------||------------------------------ 1 [S] COG4330 Predicted membrane protein -------------------|----------------------------|--------------|-- 1 [S] COG4337 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|----------------------------|--------------|-- 1 [S] COG4338 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-----------------------------|------------|--- 1 [S] COG4339 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|----------------------------|--------------|-- 1 [S] COG4340 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-----------------------------|-----|------|--- 1 [R] COG4341 Predicted HD phosphohydrolase -----------|------||---------------------------------------------- 1 [G] COG4354 Predicted bile acid beta-glucosidase -------------|----||---------------------------------------------- 1 [F] COG4360 ATP adenylyltransferase (5',5'''-P-1,P-4-tetraphosphate phosphorylase II) ------------------||-|-------------------------------------------- 1 [S] COG4370 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|-------------------------------------------- 1 [S] COG4371 Predicted membrane protein ------------------||-|-------------------------------------------- 1 [S] COG4372 Uncharacterized protein conserved in bacteria with the myosin-like domain ------------------||-------||------------------------------------- 1 [S] COG4398 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|||-------------||||---------------------------- 1 [S] COG4399 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||---------------|||---------------------------- 1 [E] COG4401 Chorismate mutase ------------------||-------||------------------------------------- 1 [S] COG4402 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|----------|-||---|---------------------------- 1 [V] COG4403 Lantibiotic modifying enzyme -------------------|--------------||||----------------------|-||-- 1 [S] COG4430 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|--------------------------|-||---------------- 1 [FJ] COG4445 Hydroxylase for synthesis of 2-methylthio-cis-ribozeatin in tRNA ------------------||-----------------------------|-------------|-- 1 [R] COG4447 Uncharacterized protein related to plant photosystem II stability/assembly factor ------------------||---------------------------------------||||--- 1 [E] COG4448 L-asparaginase II ------------------||-------------------------------------------|-- 1 [R] COG4449 Predicted protease of the Abi (CAAX) family ------------|------|----------------------------||---------||-|--- 1 [P] COG4454 Uncharacterized copper-binding protein -------------------|-----------------------------|-----|------|--- 1 [R] COG4551 Predicted protein tyrosine phosphatase -------------------||------||--|-----|---------------------------- 1 [R] COG4552 Predicted acetyltransferase involved in intracellular survival and related acetyltransferases ------------------|||--------------|------|||-|------------------- 1 [QC] COG4576 Carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein -------------|||--||------||||------------------------------------ 1 [L] COG4581 Superfamily II RNA helicase -------------||---||||----------||-------------------------------- 1 [R] COG4586 ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component ------------------||||----------||-------------------------------- 1 [R] COG4587 ABC-type uncharacterized transport system, permease component -------------------|----------------------|||---|----------||||--- 1 [E] COG4597 ABC-type amino acid transport system, permease component ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG4603 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ------------------||-|---------------|---------------------------- 1 [S] COG4627 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||----------------------------|----------||||--- 1 [Q] COG4663 TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system, periplasmic component ------------------||----------------------------|----------||||--- 1 [Q] COG4664 TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system, large permease component ------------------||----------------------------|----------||||--- 1 [Q] COG4665 TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system, small permease component ------------------||-|----|----------|-------|---|-----|---||-|--- 1 [R] COG4674 Uncharacterized ABC-type transport system, ATPase component -------------------|-----------------------------------|------|--- 1 [S] COG4675 Microcystin-dependent protein -------------------|-------------|---------||||---|-|------------- 1 [S] COG4679 Phage-related protein -------------------|----------------------|||-|-------------|-|--- 1 [S] COG4680 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-------||----------------|-------------------- 1 [S] COG4683 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-----------------------------------|------|--- 1 [S] COG4705 Uncharacterized membrane-anchored protein conserved in bacteria ---|----|-------|--|---------------------------------------||----- 1 [S] COG4711 Predicted membrane protein --||---------------|-|--------------------------|--------------|-- 1 [S] COG4715 Uncharacterized conserved protein -------------------|-|--------------------------------------|----- 1 [S] COG4719 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------|-----|----------------------------------------|----- 1 [TK] COG4725 Transcriptional activator, adenine-specific DNA methyltransferase -------------------|-------------------------|-------------|------ 1 [R] COG4734 Antirestriction protein ------------------||----------------------|||-|---------||-------- 1 [S] COG4735 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-----------------------||-|------|||----|----- 1 [S] COG4737 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----------------|-----||--------|------------------------------ 1 [S] COG4748 Uncharacterized conserved protein -------------------|----------------------||||---|---------||-|--- 1 [P] COG4778 ABC-type phosphonate transport system, ATPase component -------------------|-----------------------------------|---||||--- 1 [S] COG4782 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|-||----------------------|||||-||--|--|-----|||-- 1 [R] COG4783 Putative Zn-dependent protease, contains TPR repeats ----------------||||----------------------|||||-||||||||---------- 1 [U] COG4796 Type II secretory pathway, component HofQ |-|-----|---------||---------------------------------------------- 1 [C] COG4802 Ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit --|-------|--------|---------------------------------------------- 1 [O] COG4826 Serine protease inhibitor --|----------------|-----------------------------------------||--- 1 [S] COG4872 Predicted membrane protein --|----------|||---|----------|-|--|------|||||--|-----|---------- 1 [S] COG4886 Leucine-rich repeat (LRR) protein --|----------------||------------------------|-----|---------|---- 1 [S] COG4929 Uncharacterized membrane-anchored protein -------------------||---------------------|||-|----||------||-||-| 1 [M] COG4953 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC ------------------||-|--------||--||||---------------------------- 1 [R] COG4956 Integral membrane protein (PIN domain superfamily) ------------------||-|--------------------------||--||||---------- 1 [NU] COG4972 Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM |-|-------|--------|------|---|-----||---------------------------- 1 [KT] COG4978 Transcriptional regulator, effector-binding domain/component ------------------||----------|---||||---------------------------- 1 [R] COG4980 Gas vesicle protein |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase -----------------|||----------|----------------------------------- 1 [S] COG5011 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----------||----|---------------------------------------------- 1 [S] COG5017 Uncharacterized conserved protein -------------||----|---------------------------------------------- 1 [R] COG5119 Uncharacterized protein, contains ParB-like nuclease domain -------------|||---|---------------------------------------------- 1 [TZDR] COG5126 Ca2+-binding protein (EF-Hand superfamily) -------------||----|---------------------------------------------- 1 [S] COG5135 Uncharacterized conserved protein -------------|-----|-------||--------------------------|----|-|--- 1 [Q] COG5285 Protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin -------------------|----------------|---------------|------------- 1 [S] COG5293 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|---------------------------------|---------- 1 [R] COG5322 Predicted dehydrogenase -------------------|---------------------------------------||-|--- 1 [S] COG5331 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|---------------------------------||---------|| 1 [S] COG5346 Predicted membrane protein ------------------||----||----------||---------------------------- 1 [R] COG5401 Spore germination protein ------------------||------------------------------||-------------- 1 [S] COG5413 Uncharacterized integral membrane protein -------------------|----------------------------------------|-|--- 1 [S] COG5420 Uncharacterized conserved small protein containing a coiled-coil domain --|--|-------------|---------------------------------------------- 1 [L] COG5421 Transposase ------------------||----------------------------|----------------- 1 [S] COG5474 Uncharacterized conserved protein -------------------|-----------------------------|-----|---||-|--- 1 [R] COG5485 Predicted ester cyclase -------------------|----------------------|||-|-------------|-|--- 1 [K] COG5499 Predicted transcription regulator containing HTH domain -------------------|----------------------------------------|-|--- 1 [S] COG5500 Predicted integral membrane protein -----------------|||-|----||||------------------------------------ 1 [R] COG5512 Zn-ribbon-containing, possibly RNA-binding protein and truncated derivatives ---|---------||----|---------------------------------------------- 1 [R] COG5524 Bacteriorhodopsin -------------------|---------------|------|||-|-----|--|---------- 1 [R] COG5525 Bacteriophage tail assembly protein -------------------|------------------------------------------||-- 1 [S] COG5526 Uncharacterized conserved protein -------------------|-----------|--------------------|------------- 1 [R] COG5545 Predicted P-loop ATPase and inactivated derivatives -------------||----|---------------------------------------------- 1 [S] COG5548 Small integral membrane protein --|---------------||-------------|-------------------------------- 1 [O] COG5549 Predicted Zn-dependent protease -------------------|-----------------------------|------------|--- 1 [R] COG5553 Predicted metal-dependent enzyme of the double-stranded beta helix superfamily -------------------|----------------------------------------|-|--- 1 [Q] COG5554 Nitrogen fixation protein -------------------|----------------------------------------|-|--- 1 [N] COG5555 Cytolysin, a secreted calcineurin-like phosphatase --|----------------|---|-----------------------------------|------ 1 [S] COG5563 Predicted integral membrane proteins containing uncharacterized repeats -------------------|-----------------------||-|-----|------------- 1 [S] COG5606 Uncharacterized conserved small protein --|--------|------||-----------------------------|-----|----|----- 1 [S] COG5607 Uncharacterized conserved protein -------------------|--------------|-||---------------------------- 1 [S] COG5609 Uncharacterized conserved protein ------------------||-----------------------------|---------------- 1 [S] COG5626 Uncharacterized conserved small protein -------------------|----------------|------------------|---------- 1 [S] COG5634 Uncharacterized conserved protein ------------------||----|--||-------||-----------------|---||-|--- 1 [K] COG5662 Predicted transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)