(order) Desulfurococcales - 1 genome Functional categories Fun All J A K L B D Y V T M N Z W U O C G E F H I P Q R S COGs 947 151 2 48 53 1 4 -  6 11 16 6 -  -  16 38 81 39 100 33 57 24 44 10 158 112 proteins 1,253 162 2 69 65 2 6 -  21 15 26 11 -  -  20 60 115 62 154 37 67 40 69 22 243 118 Distribution of COGs by number of proteins proteins 1 2 3 4 5 6 7 8 10 11 COGs 768 114 39 12 5 4 2 1 1 1

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|||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 11 [R] COG0517 FOG: CBS domain
|-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 10 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component
|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  8 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  7 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily
||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  7 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases
|||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||--  6 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators
|||||||||||||---||||-|---||||||---||||----|||||-||--|--|---|||||--  6 [R] COG0714 MoxR-like ATPases
|-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||--  6 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component
|||||||||||||--------|----|||-|-----||----|||||-||||-|||---|||||--  6 [K] COG1522 Transcriptional regulators
||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-|||||||  5 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase
|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  5 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases
|||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||--  5 [C] COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins)
-|----|||-|||--------|-----||-------------------------------|-----  5 [R] COG1848 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain
---|||--|-||||-----|||----|||||---|-||----|||||-||---|||---|||||--  5 [I] COG1960 Acyl-CoA dehydrogenases
|||||||||||||---||||-|-----||---|----|----||||---|-|---|---|||||--  4 [R] COG0433 Predicted ATPase
||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  4 [M] COG0438 Glycosyltransferase
--|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||---  4 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component
--|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||---  4 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components
-|-|----|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||---  4 [E] COG0683 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component
|-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  4 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily
--|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||---  4 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components
|||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||--  4 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon)
---|||||--|||||---|-||------------|-||-----------|--|------|---|-|  4 [E] COG1506 Dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases
|||||||||||||--------------||----------------------------------|--  4 [R] COG1545 Predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon
|||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||---  4 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components
--|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||---  4 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control
||||--||||--||----||-------||--|---|-|----||||--|-|---------|||---  3 [E] COG0076 Glutamate decarboxylase and related PLP-dependent proteins
---|||||---||||-||||--||--|----|||||||-||||||||-||----------------  3 [H] COG0095 Lipoate-protein ligase A
-|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||--  3 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases
||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||---  3 [C] COG0247 Fe-S oxidoreductase
|-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--||||||||  3 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II
|-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||--  3 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||-||||||||-||-||--|---||||---  3 [G] COG0395 ABC-type sugar transport system, permease component
-|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||---  3 [E] COG0410 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component
-|------|-|||----|||||-----------|--------|||||--|-----|--|||||---  3 [E] COG0411 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component
||||||||||||||||---|----------------------|||||-||----------------  3 [L] COG0417 DNA polymerase elongation subunit (family B)
|||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  3 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
|||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-|  3 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases
||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  3 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis
||||||||||||||||--||-|----||||------||-----------|-----|--|||-|---  3 [O] COG0464 ATPases of the AAA+ class
||||||||||||||--||||---------------------------------------||-|---  3 [T] COG0467 RecA-superfamily ATPases implicated in signal transduction
|-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  3 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes
|||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||--  3 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family
-|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||---  3 [E] COG0559 Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease components
|||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--||||||||||||||  3 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog)
-|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  3 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases
-||||||||-|||---------------------------------------|---||-|||||||  3 [NU] COG0630 Type IV secretory pathway, VirB11 components, and related ATPases involved in archaeal flagella biosynthesis
||||||||||||||||-----------|||------------------------------------  3 [O] COG0638 20S proteasome, alpha and beta subunits
-|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||--  3 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases
|||||||||||||---||||-|---|||||||||||-||-|||||||-||--|--|---|||||--  3 [P] COG0704 Phosphate uptake regulator
--|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||---  3 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component
|||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  3 [C] COG0778 Nitroreductase
||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-|  3 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases
---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---|||||||  3 [I] COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase
--|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  3 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases)
||||--|||||||----|||||--|-||||||||||||||||-||-|-|-|----|---|||----  3 [P] COG1122 ABC-type cobalt transport system, ATPase component
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|---||||---  3 [G] COG1175 ABC-type sugar transport systems, permease components
--||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-|  3 [O] COG1225 Peroxiredoxin
--||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|---  3 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases
||||||||||||||||--------------------------------------------------  3 [K] COG1405 Transcription initiation factor TFIIIB, Brf1 subunit/Transcription initiation factor TFIIB
-||-|-|||||||----||-|------||-|-----||-----------|-----|---|||||-|  3 [L] COG1533 DNA repair photolyase
|||---|||||||---||------------|---|-----------|---|--------||----|  3 [R] COG1708 Predicted nucleotidyltransferases
-|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||---  3 [E] COG4177 ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component
||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||--  2 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase
||-|||-|-||-|||-|-|||------|||-----|-|----------------------------  2 [P] COG0003 Oxyanion-translocating ATPase
|||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||---  2 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family
--||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0031 Cysteine synthase
-|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||--  2 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  2 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases
|||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---|||||||  2 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit
||||--|||||||||||-||-|------------|-||----------||---|||---|||||--  2 [BQ] COG0123 Deacetylases, including yeast histone deacetylase and acetoin utilization protein
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--||||||||  2 [J] COG0130 Pseudouridine synthase
-||--|--|||||||-|-||-------|-------|-|------------------||-|||||--  2 [EQ] COG0145 N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit
-||--|---||||||-|-||-------|----------------------------||-|||||--  2 [EQ] COG0146 N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit
||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---|||||||||||||  2 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases
||-||||||||||---|-||-|----|||-------||----|||||-||||---|||||||||--  2 [C] COG0243 Anaerobic dehydrogenases, typically selenocysteine-containing
||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||--  2 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase
--||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||--  2 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases
|||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  2 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes
|||||||||||||---|-||-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||--  2 [H] COG0303 Molybdopterin biosynthesis enzyme
|||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||--  2 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs
|-||||--|-|||||||-||-|-----||--|--||||----|||||-||-||--||-||||||--  2 [I] COG0365 Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases
|||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-|||||||||||||||  2 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases
||||--||--||||||||-|-|---||||------|------|||-|--|---|||--|-|-----  2 [P] COG0428 Predicted divalent heavy-metal cations transporter
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||--  2 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family)
|||||||||||||||||||||||||-||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0498 Threonine synthase
|||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||--  2 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function
||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||---  2 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins
---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  2 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes
|-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||--  2 [E] COG0520 Selenocysteine lyase
||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||--  2 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump
|||||||||||||---||||-|-----||-||--|-||-----------|-----|----|-|---  2 [R] COG0535 Predicted Fe-S oxidoreductases
|||||||||-|||||||-||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases
|-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase
-||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||--  2 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component
|||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||--  2 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent)
--||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases
---|||||--||||||-||-------||||||||||||----|||||--|-----|---|||||--  2 [R] COG0656 Aldo/keto reductases, related to diketogulonate reductase
--|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||--  2 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating)
|||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--||||||||||||||  2 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel
|||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||-------  2 [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit
|||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-|||||||||||||||||  2 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase
|||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||--  2 [O] COG0719 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component
--||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--||||||||||||||  2 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein
|||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [R] COG0730 Predicted permeases
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1
|-|---|||-|-|---||||||--|-||||--||--||------------||----||-||||---  2 [O] COG0785 Cytochrome c biogenesis protein
---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  2 [C] COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1
||||--|||||||-----------------|----|||----|||-|---------||---|-|--  2 [K] COG0864 Predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain and a metal-binding domain
|||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||-------  2 [C] COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit
|||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||--  2 [C] COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit
|||-|||||||||----|||||-----||-||-----|----|||-|-||------------|---  2 [C] COG1032 Fe-S oxidoreductase
----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||--  2 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases
|||||||||-|||-----|--|-----||--|----------|||||---||---|----------  2 [H] COG1056 Nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase
||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||-------  2 [HR] COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes
--|-||----|||||---||------||||-||||-||----|||-|--|--|||||||||||---  2 [R] COG1064 Zn-dependent alcohol dehydrogenases
---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||---  2 [R] COG1079 Uncharacterized ABC-type transport system, permease component
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  2 [G] COG1109 Phosphomannomutase
-|----|||||||---||------------------------------------------------  2 [L] COG1110 Reverse gyrase
|--|||--|-|||-------||---------|----||----|||------|-||||||-------  2 [C] COG1139 Uncharacterized conserved protein containing a ferredoxin-like domain
|||-|||||||||---||--|------||-||||||------|||||-||||---|----------  2 [O] COG1180 Pyruvate-formate lyase-activating enzyme
|||||||||||||------|------|||-------------|||----|-----|---|||||--  2 [R] COG1201 Lhr-like helicases
||||-------||-----||-|----|||-----||-|-----------------|------||--  2 [Q] COG1233 Phytoene dehydrogenase and related proteins
||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||--  2 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III
-||||||-|-||||||--||-|--------------------------||-----|---||-||--  2 [J] COG1236 Predicted exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing
||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  2 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes
-|----|||||||||---------------------------------------------------  2 [R] COG1341 Predicted GTPase or GTP-binding protein
|-|-|||||-|||---||------------------------------------------------  2 [R] COG1350 Predicted alternative tryptophan synthase beta-subunit (paralog of TrpB)
|||||||||||||--------|--------------|-----------------------------  2 [K] COG1378 Predicted transcriptional regulators
---|--||||||||||--------------------------|||||-|-||--------------  2 [R] COG1444 Predicted P-loop ATPase fused to an acetyltransferase
|-|||||||-||||||--------------------------------------------------  2 [LO] COG1474 Cdc6-related protein, AAA superfamily ATPase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  2 [J] COG1499 NMD protein affecting ribosome stability and mRNA decay
----------|||---|----|--|--||-------||----|||----|-----|---||-||--  2 [C] COG1529 Aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, large subunit CoxL/CutL homologs
||--|||||||||-----------------------------------------------------  2 [K] COG1581 Archaeal DNA-binding protein
-|--|||||-|||---||------------|-----||----||||||-|--|--|----------  2 [E] COG1586 S-adenosylmethionine decarboxylase
|||||||||-||||||--------------------------------------------------  2 [K] COG1594 DNA-directed RNA polymerase, subunit M/Transcription elongation factor TFIIS
---|----|-||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  2 [C] COG1622 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||----|||||-||-||--|---||||---  2 [G] COG1653 ABC-type sugar transport system, periplasmic component
||||--|||-|||----|---|--------||-|||||--------------|----------|--  2 [CP] COG1668 ABC-type Na+ efflux pump, permease component
||||||||||||||||--------------------------------------------------  2 [J] COG1676 tRNA splicing endonuclease
-||||||||--||-----------------------------------------------------  2 [N] COG1681 Archaeal flagellins
|-|||||||-|||----|-|||----||||||||||||----|||||-|------|------||--  2 [K] COG1695 Predicted transcriptional regulators
--|||||||-|-|---||||-|---|-|||-----|||----------||-----|---|||||--  2 [R] COG1721 Uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)
---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-|||||||-------|-----|---||||---  2 [R] COG1744 Uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein
-||---|||-|||-----------------------------------------------------  2 [R] COG1750 Archaeal serine proteases
||--|||||||||||--|---||---|----|-----------------|------------||--  2 [S] COG1814 Uncharacterized membrane protein
--||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components
|||---||||-||-----------------------------------------------------  2 [R] COG1907 Predicted archaeal sugar kinases
|||||||||||||-----------------------------------------------------  2 [R] COG1938 Archaeal enzymes of ATP-grasp superfamily
|-||||||||||||||--------------------------------------------------  2 [K] COG1958 Small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) homolog
---|------|-|||-|----|--------------||----------||--||||--||||||||  2 [R] COG1999 Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC, involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems
---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||--  2 [C] COG2025 Electron transfer flavoprotein, alpha subunit
|||||||||||||-------------||--|--------------|---|-|---|---||-||--  2 [NU] COG2064 Flp pilus assembly protein TadC
---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||--  2 [C] COG2086 Electron transfer flavoprotein, beta subunit
||||||||||||||||--------------------------------------------------  2 [R] COG2102 Predicted ATPases of PP-loop superfamily
---|--||-|-||-----|-------|||-|---||-----------------------||-||--  2 [R] COG2159 Predicted metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold
|-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||--  2 [P] COG2217 Cation transport ATPase
||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--|  2 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold
--|||||||-|||||----|----|||--------------------------||||||-------  2 [R] COG2236 Predicted phosphoribosyltransferases
-|----|||||||----|------------------------------------------------  2 [S] COG2250 Uncharacterized conserved protein related to C-terminal domain of eukaryotic chaperone, SACSIN
---|----|---|-----|--|---------------|----------||-|--------||--||  2 [R] COG2358 TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component
--------|---|-----||----------------------------------------------  2 [R] COG2405 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain
--|---|||-|-|-----------------------------------------------------  2 [S] COG2430 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  2 [R] COG2520 Predicted methyltransferase
---|------|||-----------|----|-||---------|||||-|-||--------------  2 [F] COG2820 Uridine phosphorylase
-|-----||---|-----------------------------------------------------  2 [S] COG2880 Uncharacterized protein conserved in archaea
---|---|---||-----------------------------------------------------  2 [S] COG3379 Uncharacterized conserved protein
---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||---  2 [R] COG3845 ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase components
----------|||-----||------||||------------------------------------  2 [S] COG4243 Predicted membrane protein
---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||---  2 [R] COG4603 ABC-type uncharacterized transport system, permease component
---|----|---|--------|---------------|----------||-|--------||----  2 [R] COG4666 TRAP-type uncharacterized transport system, fused permease components
-----------||||---------------------------------------------------  2 [N] COG5491 Conserved protein implicated in secretion
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||--  1 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase
|||||||||||||||-||||-------||||-||-|||----|--||--|--|------||-|---  1 [F] COG0005 Purine nucleoside phosphorylase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase
||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||--  1 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---|||||||  1 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit
||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||-------------  1 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase
---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---|||||||  1 [C] COG0022 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit
|||||||||||||||---||----------------------|||||-||||--------------  1 [J] COG0023 Translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1) and related proteins
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase
|||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase]
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)
|--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||--  1 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase
||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--||||||||  1 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||--  1 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  1 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0048 Ribosomal protein S12
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0049 Ribosomal protein S7
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0051 Ribosomal protein S10
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2
||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--||||||||  1 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [G] COG0061 Predicted sugar kinase
|||||||||||||||-||||-|----|||||-----------|||||-||--|--|||||||||--  1 [S] COG0062 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||--  1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase
||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---|||||||||||||  1 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0073 EMAP domain
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  1 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit
||||||||||||||--||||-|--------||--|-||--------|-||------||-||-||--  1 [E] COG0075 Serine-pyruvate aminotransferase/archaeal aspartate aminotransferase
|||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase
|||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0082 Chorismate synthase
-|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||-------  1 [E] COG0083 Homoserine kinase
|||---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0084 Mg-dependent DNase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9
|||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase
---|||--|-|||||-|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  1 [O] COG0109 Polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)
|||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||--  1 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase
--||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG0114 Fumarase
-|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||----------  1 [L] COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase
||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||--  1 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase
|-||--|||---||||--|--|-----||-|-----||-|--|||||-||--|--|---|||||--  1 [L] COG0122 3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0125 Thymidylate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase
|||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase
||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0148 Enolase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase
||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain
--||||||--|||||----|-|----|||||---|-||----|||||-|||----|---||||---  1 [E] COG0160 4-aminobutyrate aminotransferase and related aminotransferases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  1 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase
||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0164 Ribonuclease HII
-|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase
||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||----  1 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||--  1 [H] COG0171 NAD synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase
|||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [E] COG0174 Glutamine synthetase
-||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||--  1 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease
|||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||--  1 [Q] COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-|||||||||||||||  1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase
|||-|||||||||||-|||||---------------|------------|--|-------|-|---  1 [J] COG0182 Predicted translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17
-|||--|||-|||-----||-|---------------|--||||||||||||||||---|||||--  1 [HJ] COG0189 Glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0195 Transcription elongation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY
||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit
|-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit
|--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase
|||||||||||||||--|--||----|||||--|||||------------||--------------  1 [H] COG0214 Pyridoxine biosynthesis enzyme
--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase
|-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-|||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A)
||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--||||||  1 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10
|||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0250 Transcription antiterminator
---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family
|||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|----  1 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)
------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-||||||||||||  1 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase
|||---|||||||-----------------|-|||-|--||-|||-|-|-||--------------  1 [G] COG0269 3-hexulose-6-phosphate synthase and related proteins
|--|||----|-|---||||-|--|-|||||||||||||||||||||-|-||-------||-|---  1 [F] COG0274 Deoxyribose-phosphate aldolase
--|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [C] COG0281 Malic enzyme
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase
---|------|-|||--|---|---|-||||||||||||||||||||-|-||-------||-||--  1 [F] COG0295 Cytidine deaminase
|||||||||||||----|------|-----|||||||||||||||||-||||--------------  1 [H] COG0301 Thiamine biosynthesis ATP pyrophosphatase
|||||||||||||---|-||----------|-----------|||-|---------|||-------  1 [O] COG0309 Hydrogenase maturation factor
|||||||||||||||--|---|----|||||--|||||------------||--------------  1 [H] COG0311 Predicted glutamine amidotransferase involved in pyridoxine biosynthesis
|||||||||-|||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0314 Molybdopterin converting factor, large subunit
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0315 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme
---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  1 [H] COG0320 Lipoate synthase
|||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs
--|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|--  1 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase
----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase
|||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase
|-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase
|-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases
||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-|  1 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase
|||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1)
|||||||||||-||||----------||||||---|||----|||||-||--|-------|-|---  1 [E] COG0367 Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)
|||||||||||||-----||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||---  1 [H] COG0368 Cobalamin-5-phosphate synthase
|||||||||||||-|--|||----------||||-|||----|||||-------------|-----  1 [C] COG0371 Glycerol dehydrogenase and related enzymes
|-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [C] COG0372 Citrate synthase
||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||-------  1 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases
|||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||--  1 [O] COG0396 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, ATPase component
|||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||--  1 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||--  1 [E] COG0403 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), N-terminal domain
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--||||---|||||--  1 [E] COG0404 Glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)
----||----||||||--||||----|||-----|-||----|||-|-||--||||||-||-||--  1 [E] COG0405 Gamma-glutamyltransferase
---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||--  1 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase
||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||----------------  1 [L] COG0419 ATPase involved in DNA repair
||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|-----  1 [L] COG0420 DNA repair exonuclease
-|--|||||||||||-||---|----|---|--|--||----||||||-|--||||||----|---  1 [E] COG0421 Spermidine synthase
||||||||||||||||-----|--|||||||---|---||||------------------------  1 [J] COG0423 Glycyl-tRNA synthetase (class II)
||||--|||||||||||--|----------------------|||-|--|-----|----------  1 [A] COG0430 RNA 3'-terminal phosphate cyclase
|||---|||||||-|-||||-|-----||-|-----||----|||-|-||---------||-----  1 [S] COG0432 Uncharacterized conserved protein
-|-|--|||||-|-----||----------------------|---|------------|--|---  1 [R] COG0434 Predicted TIM-barrel enzyme
--||---||-|||---|-------------------------|||||-||||---|--|-|-|---  1 [C] COG0437 Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1
|||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||--  1 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase
||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains
|||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--|||||||||||  1 [O] COG0450 Peroxiredoxin
|||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase
||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||--  1 [R] COG0456 Acetyltransferases
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase
|||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|  1 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase
-|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||--  1 [G] COG0469 Pyruvate kinase
|||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-||||||||||||||  1 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components
|-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2
-|||--||||||||||--------------------------------------------------  1 [T] COG0478 RIO-like serine/threonine protein kinase fused to N-terminal HTH domain
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases)
||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--||||||||  1 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family
||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning
||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0492 Thioredoxin reductase
--|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||||  1 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase
||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||--  1 [R] COG0496 Predicted acid phosphatase
|||||||||||||||-||||------||||-------------------|--|--|---|||||--  1 [H] COG0499 S-adenosylhomocysteine hydrolase
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase)
---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||--  1 [E] COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding)
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II
--|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||--  1 [L] COG0514 Superfamily II DNA helicase
||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit
|||||||||||||---|--|-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0521 Molybdopterin biosynthesis enzymes
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0527 Aspartokinases
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0528 Uridylate kinase
-------||---|||-|-|--|-----||-|-----||----||||||||--|--|--|-||||--  1 [P] COG0529 Adenylylsulfate kinase and related kinases
||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---|||||||  1 [E] COG0531 Amino acid transporters
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity
---|||--|-|||||-||||-|-----||--|--||||----|||||--|-|---|||-|||||--  1 [C] COG0538 Isocitrate dehydrogenases
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||--  1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-|  1 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase
---|||||--|-|-----|------------||||-----|-|||-|--||---------|-----  1 [E] COG0549 Carbamate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0550 Topoisomerase IA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase
--||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|-----  1 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family
---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||--  1 [C] COG0554 Glycerol kinase
|||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase
|-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|---  1 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily
||||||--||-||-----||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-|  1 [J] COG0565 rRNA methylase
||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||----  1 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||--  1 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase
----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||--  1 [R] COG0579 Predicted dehydrogenase
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component
|||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0582 Integrase
---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||--  1 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
|||||||||||||||||----|--------------------|||||-||||----|||-------  1 [S] COG0585 Uncharacterized conserved protein
|||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---|||||||  1 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins
|-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-||  1 [ER] COG0591 Na+/proline symporter
--||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) 
|||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase
|-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [P] COG0605 Superoxide dismutase
-||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||--  1 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component
|||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|--  1 [H] COG0611 Thiamine monophosphate kinase
----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--|||||||||||  1 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases
||||----|--||---||||-|--------|------|----|||||-||||-|||----------  1 [R] COG0613 Predicted metal-dependent phosphoesterases (PHP family)
|||||||||||||||||--------------|--|||----------------------------|  1 [MI] COG0615 Cytidylyltransferase
|||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----||||||||||||||||||||||||  1 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class)
-|||--|||||-|---||||||--|||||-||||||||||||------|-----------------  1 [R] COG0618 Exopolyphosphatase-related proteins
||||--||||-||----|||||----||||||||||||||||-||-|---|--------|||----  1 [P] COG0619 ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters
|||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase
||||--|||||||||--|--|---|----|||||||||-||||||||-||----------------  1 [R] COG0622 Predicted phosphoesterase
||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K
---|--|||--||||-||--|-----|||--|||||||----|||||--|--------||||||||  1 [G] COG0647 Predicted sugar phosphatases of the HAD superfamily
||||||||--||||||||----||---||||---|||||||||||||||-----------------  1 [L] COG0648 Endonuclease IV
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7
||||-||||-|||----|||-|----|||-----||||----|||-|-||---------|||--||  1 [CP] COG0651 Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit
---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||--  1 [C] COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases)
--------|---|||--||||---|---------|||-----||||---|-|-||---|--|--||  1 [P] COG0672 High-affinity Fe2+/Pb2+ permease
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0681 Signal peptidase I
--|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase
---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||--  1 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein
|---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---|||||||  1 [J] COG0689 RNase PH
-||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||--  1 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase
-||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||--  1 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid)
--||||------|---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0713 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)
||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---|||||||||||||  1 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [P] COG0725 ABC-type molybdate transport system, periplasmic component
|||||||||||||||--||||---------|-------------------------|||-------  1 [C] COG0731 Fe-S oxidoreductases
--|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins
|||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||--  1 [H] COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A
--|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [O] COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  1 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component
----------|-|---||||-------------||-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I
|||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation
|-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-||  1 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin
--||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC
----||||--|||||----|------|----|-|||||------------||----|||--|----  1 [K] COG0819 Putative transcription activator
|-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [R] COG0824 Predicted thioesterase
--|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||||  1 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0838 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 3 (chain A)
--||||--|--||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0839 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J)
------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|--  1 [K] COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||--  1 [E] COG1003 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), C-terminal domain
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG1005 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG1007 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N)
--||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--||||||||||||||  1 [CP] COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit
---|----|-|-|||||-|||---||||||---------------|--||||--------------  1 [I] COG1022 Long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)
--|-|||||-|-|---|-----------------|-||-----------|-----|----|-|---  1 [O] COG1030 Membrane-bound serine protease (ClpP class)
-|||--|||||-|----|------------------------------------------------  1 [C] COG1031 Uncharacterized Fe-S oxidoreductase
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [L] COG1041 Predicted DNA modification methylase
|||||||||||||-------||--|-----------------|||||-|||||||||||-------  1 [O] COG1047 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2
--||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---|||||||  1 [C] COG1048 Aconitase A
|||---|||||||---|-||-|----||||||-|-|||-------|--||-----|---|||||-|  1 [F] COG1051 ADP-ribose pyrophosphatase
||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit
----|||||-|||----||||-||---|||----||||----||||--||---|||--||--|---  1 [P] COG1055 Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases
---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||--  1 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA
--|||||||-||||||---|||--|-|||||-||||------|||||-|-----------------  1 [KL] COG1061 DNA or RNA helicases of superfamily II
--|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||--  1 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases
--------|---|||--|||----|||||-||-|||||----|||||--|||---|---||||---  1 [G] COG1070 Sugar (pentulose and hexulose) kinases
---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---|||||||  1 [C] COG1071 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, alpha subunit
--||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||--  1 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily
|||||||||||||--|||--|----------||||||||-||------------------------  1 [R] COG1078 HD superfamily phosphohydrolases
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1084 Predicted GTPase
|-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||--  1 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase
|-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-||||  1 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase
-|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||---  1 [R] COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1093 Translation initiation factor 2, alpha subunit (eIF-2alpha)
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1094 Predicted RNA-binding protein (contains KH domains)
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1095 DNA-directed RNA polymerase, subunit E'
|-|-|||||||||||---------------------------------------------------  1 [J] COG1096 Predicted RNA-binding protein (consists of S1 domain and a Zn-ribbon domain)
|-|-||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1097 RNA-binding protein Rrp4 and related proteins (contain S1 domain and KH domain)
|||||||||||||||||-||-|----------------------------------------|---  1 [R] COG1100 GTPase SAR1 and related small G proteins
|||||||||||||-----------||----------------------------------------  1 [F] COG1102 Cytidylate kinase
|-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  1 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component
-||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||--  1 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components
|-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  1 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  1 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component
||||----|||||---|||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component
--|-----|-|-|--------|--------------------|||||-|||||------|||||||  1 [O] COG1138 Cytochrome c biogenesis factor
----------|-|-------------|||-----|-|-----|||-|--|-----|-----|----  1 [C] COG1140 Nitrate reductase beta subunit
|--|---||-|-|----|||-------||-||||||||----------------------------  1 [C] COG1141 Ferredoxin
|||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)
|||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|---  1 [C] COG1145 Ferredoxin
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1 [C] COG1155 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit A
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1 [C] COG1156 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit B
-||---||-|||||||-||||----|----||||||||||||------|----||-----------  1 [R] COG1161 Predicted GTPases
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1163 Predicted GTPase
----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||--  1 [KE] COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs
---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [E] COG1171 Threonine dehydratase
---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||--  1 [E] COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I
---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||--  1 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II
---|--||--|-|-----||||--|-|------|---|----|||||-||||-|||--|||||---  1 [P] COG1178 ABC-type Fe3+ transport system, permease component
-||||||||-|-|||--|------------------------------------------------  1 [J] COG1184 Translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family
|--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase
||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|--  1 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases
|||---|||-|||---||--|-----------|----|----|||||----|--------------  1 [R] COG1203 Predicted helicases
|||||||||||||||||-------------------------|----------------||-----  1 [R] COG1204 Superfamily II helicase
|-|||||||--||----|||-|----|||||||---||----|||||--|--||||---||-||--  1 [M] COG1209 dTDP-glucose pyrophosphorylase
|-----|||---|---|---|----------------------------|--------|----|--  1 [M] COG1213 Predicted sugar nucleotidyltransferases
|-|--||||---|-----||-|----|||||-----------|---|--||-|--|---||-||--  1 [R] COG1216 Predicted glycosyltransferases
||||--||||-|||||--------------------------------------------------  1 [O] COG1222 ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit
------||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1224 DNA helicase TIP49, TBP-interacting protein
||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-||||||||||||||  1 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [L] COG1241 Predicted ATPase involved in replication control, Cdc46/Mcm family
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1245 Predicted ATPase, RNase L inhibitor (RLI) homolog
--|-------|-|-----||-|----|---||-|||||----|||-|-||-----|---|||||--  1 [M] COG1247 Sortase and related acyltransferases
---|||--|-|||-------||-----||||---|-||----|||||-||-----|---|||||||  1 [I] COG1250 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase
-||-|||||-|||----|-|-|---|--|-||||||||----|||||-||-|---|----|-|---  1 [C] COG1254 Acylphosphatases
||||||||||||||||---------|-----|||||------------|-----------------  1 [I] COG1257 Hydroxymethylglutaryl-CoA reductase
|||||||||||||--|--------------------------------------------------  1 [J] COG1258 Predicted pseudouridylate synthase
--||----|-|||---||||--||--||||------------------------------------  1 [S] COG1259 Uncharacterized conserved protein
|-|---|||-||||--||--------||||------------------------------|-----  1 [I] COG1260 Myo-inositol-1-phosphate synthase
|-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||--  1 [R] COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease
|||---||-||-|---|---|-----------|--|||----|||||-||||-||||||-----||  1 [I] COG1267 Phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1 [C] COG1269 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit I
|||||||||||||-----||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---||||---  1 [H] COG1270 Cobalamin biosynthesis protein CobD/CbiB
--|||||||--||----|||-|--||----|---|||||||--------|-----|----||----  1 [R] COG1277 ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component
|-|-||--|||||----||--|----|---------||----|||||-|||||--|--||||||--  1 [E] COG1280 Putative threonine efflux protein
---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--||||||||||||||  1 [C] COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex
||||||||||||||||-|||||---|----||||||||------------------|||-------  1 [K] COG1293 Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP
|||---||||--|-----||-------||-|---|-||-----------|------------||--  1 [S] COG1300 Uncharacterized membrane protein
--||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-||||  1 [C] COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters
||||||||||-||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1303 Uncharacterized protein conserved in archaea
|||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----|||||||  1 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases
|||||||||||-||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1308 Transcription factor homologous to NACalpha-BTF3
|-|||||||||||||||-||-|-----||--------------||||--|-----|----------  1 [R] COG1310 Predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily
|||---|||||-|---||------------|-----------------------------------  1 [R] COG1313 Uncharacterized Fe-S protein PflX, homolog of pyruvate formate lyase activating proteins
-|----|||||-|---||------------------------------------------------  1 [K] COG1318 Predicted transcriptional regulators
----------|||--------|--||-||-------||----|||----|-----|---||-|---  1 [C] COG1319 Aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, middle subunit CoxM/CutM homologs
|||||||||||||----|---||||-||||||||||||----|||-|-----|---------|---  1 [K] COG1321 Mn-dependent transcriptional regulator
|-|-|||||||-|--|||-|-|-|------------------|||||-----|--|--------||  1 [P] COG1324 Uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations
||||--|||||||-----------------------------------------------------  1 [J] COG1325 Predicted exosome subunit
|-||||--|-|||---|--|-|||---||-|-----|------------------------||---  1 [O] COG1331 Highly conserved protein containing a thioredoxin domain
--|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||--  1 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [KH] COG1339 Transcriptional regulator of a riboflavin/FAD biosynthetic operon
|-|||||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1340 Uncharacterized archaeal coiled-coil protein
---|||||--|||---||||--|||||||||-------------------------|||-----||  1 [F] COG1351 Predicted alternative thymidylate synthase
|||-|||||||||||-||--------------------------------------------|---  1 [R] COG1355 Predicted dioxygenase
||||||||||||||||-|--|---------||||||||----------------------------  1 [J] COG1358 Ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a)
||||--|||||-|----|-|||--------||||||||||--|||-|--|----------|-----  1 [G] COG1363 Cellulase M and related proteins
||||--||||-||||---------------------------------------------------  1 [J] COG1369 RNase P/RNase MRP subunit POP5
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [O] COG1370 Prefoldin, molecular chaperone implicated in de novo protein folding, alpha subunit
|||||||||||||---||---------||-------------------------------------  1 [S] COG1371 Uncharacterized conserved protein
-|--||||-|--||--|-||-|-----|||------|-----------------------------  1 [L] COG1372 Intein/homing endonuclease
-|----||||--||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1374 Protein involved in ribosomal biogenesis, contains PUA domain
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [O] COG1382 Prefoldin, chaperonin cofactor
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1383 Ribosomal protein S17E
||||||||||--|-----------||-----------------------------------|||||  1 [J] COG1384 Lysyl-tRNA synthetase (class I)
||||--|||||||-----------------------------------------------------  1 [L] COG1389 DNA topoisomerase VI, subunit B
|||||||||||-||||----||||||----------------------------------------  1 [C] COG1390 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit E
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1 [C] COG1394 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit D
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [K] COG1395 Predicted transcriptional regulator
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [U] COG1400 Signal recognition particle 19 kDa protein
||-|-----||||----|||-------||------|-|---------------------|||||--  1 [R] COG1402 Uncharacterized protein, putative amidase
|||||||||||||----------------------------------------------|||||--  1 [R] COG1407 Predicted ICC-like phosphoesterases
|-|---|||||-|||-|-||--||--||||||--|||-----|||||-||||---|---|||||--  1 [R] COG1409 Predicted phosphohydrolases
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1412 Uncharacterized proteins of PilT N-term./Vapc superfamily
|---|||||||||-----------------------------------------------|-|---  1 [S] COG1415 Uncharacterized conserved protein
|||---||||--|---|-------------------------------------------------  1 [L] COG1423 ATP-dependent DNA ligase, homolog of eukaryotic ligase III
----||--|-|-|---|----|||-------------|------------------|||-------  1 [R] COG1427 Predicted periplasmic solute-binding protein
||||||||||||||||----||--|--------|--------------------------------  1 [C] COG1436 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit F
||||--|||||||------------|----|--------------|---------|----------  1 [F] COG1437 Adenylate cyclase, class 2 (thermophilic)
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1439 Predicted nucleic acid-binding protein, consists of a PIN domain and a Zn-ribbon module
|-|||||||--||||-||--|-----|---||-|||||----|||||-||-|---|---||||---  1 [C] COG1454 Alcohol dehydrogenase, class IV
|||---||||--|---|-------------------------------------------------  1 [R] COG1458 Predicted DNA-binding protein containing PIN domain
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1460 DNA-directed RNA polymerase, subunit F
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [L] COG1467 Eukaryotic-type DNA primase, catalytic (small) subunit
|||---|||-|||---||-||-----------|----|----------------------------  1 [L] COG1468 RecB family exonuclease
||||||||||--|----|----------------|-||-----------|--||||----------  1 [S] COG1469 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1471 Ribosomal protein S4E
||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--||||||||||||||  1 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators
------||||--|----|------------------------------------------|-----  1 [R] COG1483 Predicted ATPase (AAA+ superfamily)
--|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||---  1 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase
|---||--|-|||---||||----------|------|----|||||-||||-------|||-|--  1 [R] COG1489 DNA-binding protein, stimulates sugar fermentation
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [J] COG1491 Predicted RNA-binding protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1498 Protein implicated in ribosomal biogenesis, Nop56p homolog
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1500 Predicted exosome subunit
|||||||||||||||||-------------------------------------------------  1 [J] COG1503 Peptide chain release factor 1 (eRF1)
|||-|||||||||---||-|-|----|---|---|-||----|||||--|-----|---|||||--  1 [J] COG1514 2'-5' RNA ligase
---||||||||||-|-||-|-|--------|-----|-----|||||-----|-------------  1 [L] COG1515 Deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V)
|||-|||-|||||---||-||------||---|--|-|----|||||----|--|---|-------  1 [L] COG1518 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---|||||||  1 [J] COG1530 Ribonucleases G and E
||-----||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1531 Uncharacterized protein conserved in archaea
||||--||||-||-------|---------||||||||----|||||-||||||||----------  1 [J] COG1534 Predicted RNA-binding protein containing KH domain, possibly ribosomal protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1537 Predicted RNA-binding proteins
---|||----|||---|-||-|------------|-||----------------------------  1 [S] COG1547 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1552 Ribosomal protein L40E
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1571 Predicted DNA-binding protein containing a Zn-ribbon domain
--|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--|||||||||||||  1 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase
--||||||----|---||--||-----||------|||--------|--|-----|---|||||--  1 [R] COG1574 Predicted metal-dependent hydrolase with the TIM-barrel fold
||||--||||||||||---------|-----|||||------------------------------  1 [I] COG1577 Mevalonate kinase
||-|--||-||||----|||||----|||||-----------|||||-||-||------|||||--  1 [OU] COG1585 Membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity
||||||||||--|-----------------------------------------------------  1 [J] COG1588 RNase P/RNase MRP subunit p29
-|----|||||||||---------------------------------------------------  1 [S] COG1590 Uncharacterized conserved protein
||-|--|||||||-----------------------------------------------------  1 [L] COG1591 Holliday junction resolvase - archaeal type
||||||||||-|||||--------------------------------------------------  1 [L] COG1599 Single-stranded DNA-binding replication protein A (RPA), large (70 kD) subunit and related ssDNA-binding proteins
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1601 Translation initiation factor 2, beta subunit (eIF-2beta)/eIF-5 N-terminal domain
|-|||||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1602 Uncharacterized conserved protein
||||--||||-||||---------------------------------------------------  1 [J] COG1603 RNase P/RNase MRP subunit p30
||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG1605 Chorismate mutase
---|||----|||--------|||--|-------||||----||||||||||-|||||||||||--  1 [I] COG1607 Acyl-CoA hydrolase
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1608 Predicted archaeal kinase
---|--------|||-|-||-|----||||----||||-----------|--|--|---|||||||  1 [O] COG1612 Uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly
|||-|||||||||---||------------------------------------------------  1 [F] COG1618 Predicted nucleotide kinase
|||||||||||||--------|--------------------------------------------  1 [S] COG1628 Uncharacterized conserved protein
||--|||||--||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1630 Uncharacterized protein conserved in archaea
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1631 Ribosomal protein L44E
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1632 Ribosomal protein L15E
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1634 Uncharacterized Rossmann fold enzyme
||||--|||||||||--|------------------------------------------------  1 [H] COG1635 Flavoprotein involved in thiazole biosynthesis
||-|--||-||||------|------||||------------------------------------  1 [L] COG1637 Predicted nuclease of the RecB family
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1644 DNA-directed RNA polymerase, subunit N (RpoN/RPB10)
-|||--|||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1645 Uncharacterized Zn-finger containing protein
|||||||||||||---------------------||||----------------------------  1 [R] COG1646 Predicted phosphate-binding enzymes, TIM-barrel fold
||||||--|||-|||-|---|------||-|---||||----||||||||--|||----|||||--  1 [H] COG1648 Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain)
-||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1650 Uncharacterized protein conserved in archaea
----|||||||||---||------|--||--------------------------|----------  1 [S] COG1656 Uncharacterized conserved protein
|-||||||||--|---------------------|--------||-|-|----------||-|---  1 [R] COG1661 Predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif
||||--||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1675 Transcription initiation factor IIE, alpha subunit
|||---|||||-|------------------------------------|---------||-|---  1 [S] COG1679 Uncharacterized conserved protein
--|---||--|-|-----||-|----||||||||||||----|||||--|--|--|---|||||||  1 [V] COG1680 Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins
||||||-||||||-----------------------------------------------------  1 [EH] COG1685 Archaeal shikimate kinase
|||---|||-|||---||------------------------------------------------  1 [L] COG1688 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily)
|||||||||||||--|||-|-|----|||-|------|----|||-|--|-----|----------  1 [S] COG1690 Uncharacterized conserved protein
--|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-|  1 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase
||||--||||||||||--------------------------------------------------  1 [L] COG1697 DNA topoisomerase VI, subunit A
|||-||||||-||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1698 Uncharacterized protein conserved in archaea
||||--|||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1701 Uncharacterized protein conserved in archaea
---------||-|---||||-|----||||-|||||||----|||||-||-|||||---|||||--  1 [T] COG1702 Phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase
---||||||--||--------|----||||-------|----|||----------|-------|--  1 [E] COG1703 Putative periplasmic protein kinase ArgK and related GTPases of G3E family
-||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [K] COG1709 Predicted transcriptional regulator
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1717 Ribosomal protein L32E
||||||||||||||||-----|-----------------------|---|----------------  1 [TD] COG1718 Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control
||||--|||||||----|------------------------|||||-||||-||-------||--  1 [S] COG1720 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1727 Ribosomal protein L18E
|||||||||||||||-|-------------------------------------------------  1 [O] COG1730 Predicted prefoldin, molecular chaperone implicated in de novo protein folding
|||-----|||||-----------------------------------------------------  1 [H] COG1731 Archaeal riboflavin synthase
||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||--  1 [K] COG1733 Predicted transcriptional regulators
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1736 Diphthamide synthase subunit DPH2
--||----|-|-|----|--||||-||-------|-|-----|||||-||||-||----||||---  1 [S] COG1738 Uncharacterized conserved protein
------||||--|----|------------------------------------------|-----  1 [L] COG1743 Adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [J] COG1746 tRNA nucleotidyltransferase (CCA-adding enzyme)
----|||-|-|-|||---||-|-----------|---|----------|--|----|||||||---  1 [E] COG1748 Saccharopine dehydrogenase and related proteins
-|--||||||||||||--------------------------------------------------  1 [S] COG1756 Uncharacterized conserved protein
---|--||----|-------|----|----|---|-||-------||-|-||-||-|||-------  1 [C] COG1757 Na+/H+ antiporter
||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1761 DNA-directed RNA polymerase, subunit L
|||||-|||||||---|-----------------||||----|||||-|-||---|--|||||---  1 [H] COG1763 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein
-||-||||-|-||---||---|----|||-|----|-|--|||||||-||---|||---||-||--  1 [O] COG1765 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation
|||---||||-||-------|-----------|---------|||-|-|||---------------  1 [H] COG1767 Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthetase
|||-|||||||||||---------------------------------------------------  1 [R] COG1779 C4-type Zn-finger protein
|||||||||||||----|------------|-----------|||||||----||-----------  1 [F] COG1781 Aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1782 Predicted metal-dependent RNase, consists of a metallo-beta-lactamase domain and an RNA-binding KH domain
|||---|||||-|------------------------------------|---------||-|---  1 [S] COG1786 Uncharacterized conserved protein
|||||||||||||||||----------||-------||----------|||--||---|||-||--  1 [L] COG1793 ATP-dependent DNA ligase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1798 Diphthamide biosynthesis methyltransferase
--|-|||||-|||---||-|-|------------||||----|||||-||-|---|---||-||--  1 [S] COG1801 Uncharacterized conserved protein
-|||----|---|-----||-------------|--------------------------------  1 [S] COG1808 Predicted membrane protein
|||||||||||||---|---------------|---------------------------------  1 [E] COG1812 Archaeal S-adenosylmethionine synthetase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1813 Predicted transcription factor, homolog of eukaryotic MBF1
||----||||||||----------------------------------------------------  1 [R] COG1818 Predicted RNA-binding protein, contains THUMP domain
|-||--||||--|-----------------------------------------------------  1 [P] COG1824 Permease, similar to cation transporters
||||--|||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1829 Predicted archaeal kinase (sugar kinase superfamily)
||||--||||-||---|--|--||------------------|||||----|-------||-|---  1 [G] COG1830 DhnA-type fructose-1,6-bisphosphate aldolase and related enzymes
|||||||||||-|-----------------------------------------------------  1 [R] COG1831 Predicted metal-dependent hydrolase (urease superfamily)
---|||||--|||---||---|---------|||-|||----|||||--------|--|||-|---  1 [R] COG1832 Predicted CoA-binding protein
--|---------|-----||-------||-|-----||-----------|----------|-|---  1 [E] COG1834 N-Dimethylarginine dimethylaminohydrolase
|---|||||-|||----|---------||--------------------------|----------  1 [S] COG1839 Uncharacterized conserved protein
--||------|-|-----|||-----|-----|||--|-----||||-||||||||--|||||---  1 [P] COG1840 ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component
||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----||||||  1 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E
---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  1 [C] COG1845 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3
|||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||--  1 [K] COG1846 Transcriptional regulators
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1849 Uncharacterized protein conserved in archaea
|-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---|||||||  1 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1855 ATPase (PilT family)
|||---|||-|||---|---|---------------------------------------------  1 [L] COG1857 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
--|-|||||||-|||-----||--------------------|||----|---------|------  1 [J] COG1859 RNA:NAD 2'-phosphotransferase
-||||||||||||-----------------------||----------------------------  1 [S] COG1865 Uncharacterized conserved protein
------------||------||------------|-||----|||||-||||------|||||---  1 [C] COG1866 Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)
|||||||||||||||||-------------------------------------------------  1 [J] COG1867 N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase
|||----|||--|------|--||----|-------------|||||-|--|-------|--||||  1 [S] COG1872 Uncharacterized conserved protein
---||||||--||--------|----||||-------|----|||----------|---|||||--  1 [I] COG1884 Methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit
||--|||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1888 Uncharacterized protein conserved in archaea
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1889 Fibrillarin-like rRNA methylase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1890 Ribosomal protein S3AE
---|--|||-|-|||-|--|------|||-|||-||||----|||||-||-----|------||--  1 [H] COG1893 Ketopantoate reductase
---|--|||||||||------|------------||------|||||-||-|----||||||||--  1 [R] COG1896 Predicted hydrolases of HD superfamily
|-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||--  1 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes
||||||||||||||||---|-------------------------------------------|--  1 [O] COG1899 Deoxyhypusine synthase
-|||--|||||-|-----------------------------------|-----------------  1 [S] COG1901 Uncharacterized conserved protein
|||-|||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1909 Uncharacterized protein conserved in archaea
|||---||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1911 Ribosomal protein L30E
-|||--|||||||---||-|-------------|||-------||-----------||--------  1 [S] COG1912 Uncharacterized conserved protein
-|-|--|||||||---|-------------------------------------------------  1 [R] COG1913 Predicted Zn-dependent proteases
||||--|||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1931 Uncharacterized protein conserved in archaea
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [F] COG1936 Predicted nucleotide kinase (related to CMP and AMP kinases)
---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||--  1 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase
||||--||||||||||--------------------------------------------------  1 [L] COG1948 ERCC4-type nuclease
-----------||||---------------------|-----|||||--|-----|----||||--  1 [FH] COG1953 Cytosine/uracil/thiamine/allantoin permeases
-||||||||--||-----------------------------------------------------  1 [NU] COG1955 Archaeal flagella assembly protein J
|||-|||||||||--------------||-------------------------------------  1 [R] COG1964 Predicted Fe-S oxidoreductases
--|----|--|-|---|---|-----|||-||----||----|||||-||||-||||||-------  1 [T] COG1966 Carbon starvation protein, predicted membrane protein
----------|||--------|-----||-------||----|||----|-----|---|||||--  1 [O] COG1975 Xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1976 Translation initiation factor 6 (eIF-6)
||--|||||||||---|-------------------------------------------------  1 [G] COG1980 Archaeal fructose 1,6-bisphosphatase
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis
||--||--|||||------------------------|----|||||-|-----------------  1 [S] COG1986 Uncharacterized conserved protein
|||---||||--|-----------------|---||||----|||||--|-|--------------  1 [R] COG1988 Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolases
||||||||||||||||----------|---------------------------------------  1 [S] COG1990 Uncharacterized conserved protein
||||--||-||||----|------------------------------------------------  1 [S] COG1992 Uncharacterized conserved protein
||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||--  1 [R] COG1994 Zn-dependent proteases
|||||||||||||||---------------|-----------------------------------  1 [K] COG1996 DNA-directed RNA polymerase, subunit RPC10 (contains C4-type Zn-finger)
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1997 Ribosomal protein L37AE/L43A
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [J] COG1998 Ribosomal protein S27AE
---|--|||-|||-----||-------||-|----|||----|||--------------||-|---  1 [K] COG2002 Regulators of stationary/sporulation gene expression
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2004 Ribosomal protein S24E
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2007 Ribosomal protein S8E
---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--||||||||||||||  1 [C] COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG2012 DNA-directed RNA polymerase, subunit H, RpoH/RPB5
|-||||-|||-||----||--|--------|||----------------|------------||--  1 [S] COG2013 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2016 Predicted RNA-binding protein (contains PUA domain)
||--||||-||||------------------------------------------------|----  1 [F] COG2019 Archaeal adenylate kinase
--|---|||---||||--||-------||-|-----------------|-||---|----|||---  1 [O] COG2020 Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase
||||||||||-|||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2023 RNase P subunit RPR2
-||---|-|---|-----|||------||----|--------|--||-|------|---||-----  1 [JD] COG2026 Cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system
--------|---|-------|-----|-----|----|----|------||-----||--------  1 [I] COG2031 Short chain fatty acids transporter
|||-||||||-||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2034 Predicted membrane protein
|||||||||||||-----||||----|||||------|----|||-|-||-----|---|||||--  1 [H] COG2038 NaMN:DMB phosphoribosyltransferase
--||||--|-|||---|--|-|----|||-------|-----|||||--|-|---|--||||||--  1 [R] COG2041 Sulfite oxidase and related enzymes
-------||-|||||-|-||-|--------------||--------------------|-------  1 [P] COG2046 ATP sulfurylase (sulfate adenylyltransferase)
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2051 Ribosomal protein S27E
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2053 Ribosomal protein S28E/S33
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2058 Ribosomal protein L12E/L44/L45/RPP1/RPP2
--------|-|||---|-||------||||------------|||||-|||||--|--||||||--  1 [T] COG2062 Phosphohistidine phosphatase SixA
|--------||||--------|-----||-------||----|||----------|---||-||--  1 [R] COG2068 Uncharacterized MobA-related protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2075 Ribosomal protein L24E
|||||||||||||||-||------------|-----------------------------------  1 [S] COG2078 Uncharacterized conserved protein
|---||----||||------------|||-------||----|||-|--|-----|---||-|---  1 [R] COG2079 Uncharacterized protein involved in propionate catabolism
----------|||--------|--||-||-------||----|||----|-----|---||-||--  1 [C] COG2080 Aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, small subunit CoxS/CutS homologs
|-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||--  1 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases
||-|--|||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2090 Uncharacterized protein conserved in archaea
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [J] COG2092 Translation elongation factor EF-1beta
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [K] COG2093 DNA-directed RNA polymerase, subunit E''
------------|--|-----|-|-|-||||---|||------------|---------||-|-||  1 [L] COG2094 3-methyladenine DNA glycosylase
-||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||--  1 [U] COG2095 Multiple antibiotic transporter
---||||||-|||-------||----||||-----|||--------|--|-----|---|||||--  1 [S] COG2096 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2097 Ribosomal protein L31E
-|----|||||-|-----------------------------------------------------  1 [R] COG2100 Predicted Fe-S oxidoreductase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG2101 TATA-box binding protein (TBP), component of TFIID and TFIIIB
|--|--|||||||||---------------------------------------------------  1 [S] COG2106 Uncharacterized conserved protein
----||--|-|||---|----|||-------------|------------------|||-------  1 [R] COG2107 Predicted periplasmic solute-binding protein
-|||--|||||||-----------------|-----------------------------------  1 [R] COG2108 Uncharacterized conserved protein related to pyruvate formate-lyase activating enzyme
--|-||||||||||--||--||-----||---|-||------|||-|--|-----|------|---  1 [R] COG2110 Predicted phosphatase homologous to the C-terminal domain of histone macroH2A1
-|----|||-|||---|-------------------------------------------------  1 [T] COG2112 Predicted Ser/Thr protein kinase
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [R] COG2118 DNA-binding protein
|-|-||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2123 RNase PH-related exoribonuclease
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2125 Ribosomal protein S6E (S10)
||||||||||-|||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2126 Ribosomal protein L37E
|||---|||||||---|-------------------------------------------|-----  1 [R] COG2129 Predicted phosphoesterases, related to the Icc protein
|||---||||||||||--------------------------------------------------  1 [JA] COG2136 Predicted exosome subunit/U3 small nucleolar ribonucleoprotein (snoRNP) component, contains IMP4 domain
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2139 Ribosomal protein L21E
----||--|---|--------|-----|||------------|||||-||--||||---|||||||  1 [C] COG2142 Succinate dehydrogenase, hydrophobic anchor subunit
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2147 Ribosomal protein L19E
|||-||||-||||----|---|----||||-|||||||----|---------|--|---|||||--  1 [R] COG2151 Predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme
--|---||----|---||-----------------|---------|--------------------  1 [G] COG2152 Predicted glycosylase
|||---||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2157 Ribosomal protein L20A (L18A)
||----||-|||||||--------------|------|----------------------------  1 [J] COG2163 Ribosomal protein L14E/L6E/L27E
||||||||||-|||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2167 Ribosomal protein L39E
||----||-|||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2174 Ribosomal protein L34E
-||---|||||||-|---------------------------------------------------  1 [J] COG2178 Predicted RNA-binding protein of the translin family
--------|-|-|-------------|||-----|-|-----|||-|--|-----|-----|----  1 [C] COG2180 Nitrate reductase delta subunit
----|-||--|||----|---|---------|||||||----|||||-|----------|------  1 [G] COG2182 Maltose-binding periplasmic proteins/domains
---||||||--||-------||----||||-------|----|||----------|---|||||--  1 [I] COG2185 Methylmalonyl-CoA mutase, C-terminal domain/subunit (cobalamin-binding)
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [L] COG2219 Eukaryotic-type DNA primase, large subunit
-||||||||-|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2237 Predicted membrane protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2238 Ribosomal protein S19E (S16A)
-|----||--|-|----|------------------------------------------------  1 [S] COG2245 Predicted membrane protein
---||||||||||-----||------||||||-||||-----|---|--|-----|------||--  1 [S] COG2246 Predicted membrane protein
-|----|||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG2248 Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)
-|----|||-|||-----------------------------------------------------  1 [L] COG2254 Predicted HD superfamily hydrolase, possibly a nuclease
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [J] COG2260 Predicted Zn-ribbon RNA-binding protein
-|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||--  1 [R] COG2262 GTPases
|||||||||||||--|--------------------------------------------------  1 [J] COG2263 Predicted RNA methylase
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [H] COG2266 GTP:adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase
---|-------||-------||----|||--||---------|||||-|||----|---|||||--  1 [G] COG2301 Citrate lyase beta subunit
--|-----|--||-----||||---|||||------||----|--||-||------------|---  1 [R] COG2304 Uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain
---|--|--|--|---|----|---|-------|||||---------------------||||---  1 [E] COG2309 Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)
---|--||--|||-------||-------------|||-------|--|-------------|--|  1 [E] COG2317 Zn-dependent carboxypeptidase
---|||-----||--------|----||||----||||-----------|-----|---||||---  1 [R] COG2329 Conserved protein involved in polyketide biosynthesis related to monooxygenase
------||--|||-|------|||-----------|-|-----------|-----|---|||||--  1 [E] COG2355 Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase homolog
------||----|--------|-------------||------------------|------|---  1 [E] COG2362 D-aminopeptidase
----||--|-|||-----||-|---------------------------|-----|-----|-|--  1 [R] COG2366 Protein related to penicillin acylase
----||||--|||----|---|---------------------------|-----|---||||---  1 [G] COG2379 Putative glycerate kinase
-|----||----|--------|--------------------------------------------  1 [S] COG2383 Uncharacterized conserved protein
--------|---|-------||----|----|--||------|||---||-|-------|||||--  1 [R] COG2388 Predicted acetyltransferase
------||||--|--------------------------------|--------------------  1 [R] COG2401 ABC-type ATPase fused to a predicted acetyltransferase domain
|-----||-||-|-----|-----------------------------------------------  1 [R] COG2403 Predicted GTPase
--||-------||-------|---------------|-------------------|||-------  1 [R] COG2404 Predicted phosphohydrolase (DHH superfamily)
|-|-------|||----|------------------------------------------------  1 [R] COG2406 Protein distantly related to bacterial ferritins
------||--|-|----|------------|--|--------|||||---|---------------  1 [G] COG2407 L-fucose isomerase and related proteins
----||----|||--------|----|||||---|||-----------------------------  1 [R] COG2409 Predicted drug exporters of the RND superfamily
|-------|||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2410 Uncharacterized conserved protein
------|||||-|-----------------------------------------------------  1 [S] COG2411 Uncharacterized conserved protein
--||||||||-||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2412 Uncharacterized conserved protein
------||||-||-----------------------------------------------------  1 [R] COG2413 Predicted nucleotidyltransferase
-||-|||||-|-|-----------------|-----------|||---------------------  1 [C] COG2414 Aldehyde:ferredoxin oxidoreductase
------|||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2419 Uncharacterized conserved protein
------||---||-|--|-|---------------|-|----------------------|--|--  1 [C] COG2421 Predicted acetamidase/formamidase
|-||||--|||||||-----------|-------|----------|---|-----|---||||---  1 [E] COG2423 Predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin homolog
-||------||||-----------------------------|||||-|-----------------  1 [R] COG2425 Uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain
------|||---|------------------------|----------------------------  1 [S] COG2426 Predicted membrane protein
----||--|-|||---------------------|||-----------------------------  1 [S] COG2427 Uncharacterized conserved protein
------||-|--||----------------------------------------------------  1 [S] COG2428 Uncharacterized conserved protein
||-|------|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2429 Uncharacterized conserved protein
------||--|||-------|---------------------|||||-|-||-||-----------  1 [S] COG2431 Predicted membrane protein
|-||--|||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2433 Uncharacterized conserved protein
----||----|||----|--|---------------------|||-|-------------|-|---  1 [C] COG2440 Ferredoxin-like protein
------|||--||-----------------------------------------------------  1 [C] COG2441 Predicted butyrate kinase
------|----||-----||-------||-----------------------|-------------  1 [S] COG2442 Uncharacterized conserved protein
||||||||||--||||--------------------------------------------------  1 [U] COG2443 Preprotein translocase subunit Sss1
------||-|--||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2451 Ribosomal protein L35AE/L33A
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [J] COG2511 Archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit E (contains GAD domain)
--|-|||||-|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2512 Uncharacterized membrane-associated protein/domain
----||----|||------|------|||------|||----|||-|-||--||||----|-||--  1 [G] COG2513 PEP phosphonomutase and related enzymes
----------|-|--------|----|-----||||||---------------------||||---  1 [R] COG2514 Predicted ring-cleavage extradiol dioxygenase
||||--|||||||-|--|------------------------|||||-||--||||||||||||--  1 [O] COG2518 Protein-L-isoaspartate carboxylmethyltransferase
||-||||||||||||-||--------||||------------------------------------  1 [J] COG2519 tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase and related methyltransferases
-|----||-||-|---------------------------------------|-------------  1 [R] COG2521 Predicted archaeal methyltransferase
--||--|||-|||-----------------------------------------------------  1 [R] COG2522 Predicted transcriptional regulator
||||----|-|||-----------------------------------------------------  1 [K] COG2524 Predicted transcriptional regulator, contains C-terminal CBS domains
----------|-|------||-----||-|-||||||-----|||||-||||-|||---|||||--  1 [S] COG2606 Uncharacterized conserved protein
--||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||----  1 [P] COG2608 Copper chaperone
------||----|--------|--------------------------------------------  1 [V] COG2810 Predicted type IV restriction endonuclease
--||------|||-------------||||------------|||||-||-|||||----||||--  1 [S] COG2835 Uncharacterized conserved protein
-||------||||-------------|---||-|-|-----------------||-----------  1 [S] COG2848 Uncharacterized conserved protein
--|-||||--||||---|--||--------|------|----------||-----|---||||---  1 [R] COG2872 Predicted metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase HxxxH domain
-||||||||--||-----------------------------------------------------  1 [NU] COG2874 Predicted ATPases involved in biogenesis of archaeal flagella
----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------  1 [E] COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase
---|--|||-|-|-----||----------------------------------------------  1 [S] COG2886 Uncharacterized small protein
--|---------|-----------|-||||-------------------------|||||||||||  1 [L] COG2887 RecB family exonuclease
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [J] COG2888 Predicted Zn-ribbon RNA-binding protein with a function in translation
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors
|||---||||--|-----------------------------------------------------  1 [S] COG2892 Uncharacterized protein conserved in archaea
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG2896 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme
|--|------|||||-|--|-|----||||-------|----|||||-||-----|---|||||--  1 [P] COG2897 Rhodanese-related sulfurtransferase
---|--------|-------|---------------------|||---|--|--------------  1 [E] COG3033 Tryptophanase
-|-------|--|-----------------------------------|-----------------  1 [R] COG3044 Predicted ATPase of the ABC class
|-||-----|--|---|--------------------------------|-----|----|-|---  1 [S] COG3174 Predicted membrane protein
---||||||--||------------------------------------|----------------  1 [S] COG3199 Uncharacterized conserved protein
---|||-----||--------|----||||----||||----------------------------  1 [S] COG3253 Uncharacterized conserved protein
----||--|-|||---|--------------------|-----------|------------||--  1 [I] COG3255 Putative sterol carrier protein
|-||--||||--|-----------------------------------------------------  1 [S] COG3273 Uncharacterized conserved protein
|||||||||||-||||--------------------------------------------------  1 [J] COG3277 RNA-binding protein involved in rRNA processing
------------|-------------|||--------------------|-----|----------  1 [G] COG3281 Uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis
-|----||-||-|-----------------------------------------------------  1 [S] COG3286 Uncharacterized protein conserved in archaea
|||---|-|---|------------------|-----|----------|-----------------  1 [R] COG3291 FOG: PKD repeat
-|-|------|-|--------|--------------------------------------------  1 [S] COG3294 Uncharacterized conserved protein
---|------|||------------------------|-----------|----------------  1 [S] COG3342 Uncharacterized conserved protein
|-|-||------|------------------------------------------|------|---  1 [S] COG3369 Uncharacterized conserved protein
----||--|-|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG3370 Uncharacterized protein conserved in archaea
----||||--|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG3371 Predicted membrane protein
----||------|--------|--------------------------------------------  1 [S] COG3375 Uncharacterized conserved protein
---------||||-----------------|||---||--------|--|-----|------|---  1 [S] COG3382 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||---------|-----||||||--------|-----------------|--  1 [I] COG3425 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase
---|||----|||--------|-----||--------------------------|----|||---  1 [S] COG3427 Uncharacterized conserved protein
-||-||--|-|||-----------------------------------------------------  1 [K] COG3432 Predicted transcriptional regulator
------||---||------------------------------------------|----|-|---  1 [Q] COG3473 Maleate cis-trans isomerase
|-----------|--------------||--------------------------|----|-|---  1 [R] COG3552 Protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain
-||||||||-|||------|-------||--------------||||-----|--|---||-||--  1 [K] COG3609 Predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain
|||-|||||||||---||---|--------------------------------------------  1 [G] COG3635 Predicted phosphoglycerate mutase, AP superfamily
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [T] COG3642 Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase
------||----|-----------------------------|||-|-------------------  1 [R] COG3769 Predicted hydrolase (HAD superfamily)
-|----||-|--|-----------------------------------------------------  1 [L] COG3780 DNA endonuclease related to intein-encoded endonucleases
--||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||--  1 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components
------||--|||-----------------------------------------------------  1 [R] COG3889 Predicted solute binding protein
----------|||-----------------|-----------------|-----------------  1 [S] COG3945 Uncharacterized conserved protein
-|--||-|--|||----|--|------------|-----------||------------||-|---  1 [G] COG3958 Transketolase, C-terminal subunit
-|--||-|--|||----|--|------------|-----------||------------||-|---  1 [G] COG3959 Transketolase, N-terminal subunit
---------||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG4006 Uncharacterized protein conserved in archaea
---|||---||-|-----------------------------------------------------  1 [U] COG4023 Preprotein translocase subunit Sec61beta
------||-|--|-----------------------------------------------------  1 [S] COG4027 Uncharacterized protein conserved in archaea
------||-|-||-----------------------------------------------------  1 [R] COG4028 Predicted P-loop ATPase/GTPase
--------|||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG4034 Uncharacterized protein conserved in archaea
|--------||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG4046 Uncharacterized protein conserved in archaea
------||-||-|-----------------------------------------------------  1 [S] COG4047 Uncharacterized protein conserved in archaea
-|-------||||-----------------------------------------------------  1 [L] COG4080 RecB-family nuclease
--||--------|-|-|-||||----||||||||||||-----------|---||-------|---  1 [R] COG4122 Predicted O-methyltransferase
--|---------|---|-||------|||-----||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [P] COG4149 ABC-type molybdate transport system, permease component
------|----||-----------------------------------------------------  1 [S] COG4342 Uncharacterized protein conserved in archaea
--------|-|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG4343 Uncharacterized protein conserved in archaea
------||--|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG4345 Uncharacterized protein conserved in archaea
------||--|||-----------------------------------------------------  1 [O] COG4346 Predicted membrane-bound dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase
----------||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG4352 Ribosomal protein L13E
----------|||---|-------------------------------------------------  1 [S] COG4353 Uncharacterized conserved protein
------------|------|----------------------------||---------||-|---  1 [P] COG4454 Uncharacterized copper-binding protein
---||-----|-|-------|-------------||-|----|||-|--------|----|||---  1 [I] COG4670 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase
------||---||-----------------------------------------------------  1 [S] COG4697 Uncharacterized protein conserved in archaea
----------|-|--------------------||-------------------------------  1 [S] COG4732 Predicted membrane protein
----------|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG4755 Uncharacterized protein conserved in archaea
--------|-|-|-----------------------------------------------------  1 [R] COG4756 Predicted cation transporter
----||----|-|-----------------------------------------------------  1 [S] COG4847 Uncharacterized protein conserved in archaea
----------|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG4879 Uncharacterized protein conserved in archaea
--------|-|-|-----------------------------------------------------  1 [S] COG4881 Predicted membrane protein
----------|||-----------------------------------------------------  1 [R] COG4882 Predicted aminopeptidase, Iap family
----------||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG4888 Uncharacterized Zn ribbon-containing protein
----------|||-----------------------------------------------------  1 [R] COG4900 Predicted metallopeptidase
----------||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG4901 Ribosomal protein S25
--------|-|-|-----------------------------------------------------  1 [S] COG4904 Uncharacterized protein conserved in archaea
----------|||-----------------------------------------------------  1 [R] COG4914 Predicted nucleotidyltransferase
----------|||-----------------------------------------------------  1 [J] COG4919 Ribosomal protein S30
----------|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG4920 Predicted membrane protein
---------||-|-------------------------|----------------------|----  1 [S] COG4933 Uncharacterized conserved protein
---|||--||-||----|||||----||||||--||||----|||||--|-----|---|||||--  1 [MR] COG4948 L-alanine-DL-glutamate epimerase and related enzymes of enolase superfamily
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||--  1 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase
----------|||-----------------------------------------------------  1 [R] COG4996 Predicted phosphatase
---------||-|-----------------------------------------------------  1 [L] COG4998 Predicted endonuclease (RecB family)
----------|-|-------------|||-----|-|-----|||-|--|-----|-----|----  1 [C] COG5013 Nitrate reductase alpha subunit
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG5256 Translation elongation factor EF-1alpha (GTPase)
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG5257 Translation initiation factor 2, gamma subunit (eIF-2gamma; GTPase)
-|-----|----|-----------------------------------------------------  1 [R] COG5378 Predicted nucleotide-binding protein
----------|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG5399 Uncharacterized protein conserved in archaea
--------|--||-----------------------------------------------------  1 [S] COG5431 Uncharacterized metal-binding protein
|-------|--||-----------------------------------------------------  1 [S] COG5440 Uncharacterized conserved protein
--|-------|-|-----------------------------------------------------  1 [S] COG5483 Uncharacterized conserved protein
----------|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG5493 Uncharacterized conserved protein containing a coiled-coil domain
----------|||-----------------------------------------------------  1 [O] COG5494 Predicted thioredoxin/glutaredoxin
--|--------||----|--||----|-----|---------------------------------  1 [R] COG5496 Predicted thioesterase
------------|------|-----------------------------------|----|-----  1 [R] COG5573 Predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain
----||------|------------------------------------|----------------  1 [S] COG5615 Predicted integral membrane protein
------|||-|-|-----------------------------------------------------  1 [K] COG5625 Predicted transcription regulator containing HTH domain