| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ |-||--|||----|||-|||-|--||-||-|----|||----|||||-|||||--|||||||||-- 42 [T] COG0784 FOG: CheY-like receiver --|--|--|--|------||-|----|------|---|-----||-|-------||----|-|--- 42 [L] COG3335 Transposase and inactivated derivatives |-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 38 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase ----------------|-||-|-----------------------------------------|-- 38 [S] COG4636 Uncharacterized protein conserved in cyanobacteria |-||----|-----|-||||-|-----||||---|-||----|||---||-----|---|||||-- 29 [T] COG2203 FOG: GAF domain |||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 28 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases --|---------------||-|----||-----|---------------------|---|-|||-- 27 [L] COG3293 Transposase and inactivated derivatives |-||----|-----|-||||-|||-||||||----|||----|||||-||--|--|--||||||-- 25 [T] COG2202 FOG: PAS/PAC domain ||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 22 [M] COG0438 Glycosyltransferase |||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 22 [R] COG0457 FOG: TPR repeat ----------------||||-|--|-|||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 22 [T] COG2199 FOG: GGDEF domain ||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 18 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis --||--------------||-|--|-|||-||---|||----|||||--|-|-------||-|||| 16 [S] COG1357 Uncharacterized low-complexity proteins --||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-|||||||||||||||||| 13 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) ----------------|-||-|---||||||----|||----|||||-||--|--|---||||||| 13 [T] COG2200 FOG: EAL domain -------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||-- 12 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases --||-|-----|------||-|---------------|----|------------|----|----- 12 [L] COG3385 FOG: Transposase and inactivated derivatives |||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 11 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases |||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 11 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins --|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 11 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) ||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 10 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases ----------------||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 10 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain --|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-||||||||||||| 10 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 9 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily ---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|--- 9 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase ---|---------||||-||-|||--|---------------||||||||||-|||---||||||| 9 [C] COG0633 Ferredoxin ----------||-||---||-|||--|||||------|--------------|------------- 9 [T] COG1716 FOG: FHA domain |||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---||||||| 8 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins |-|||---|--------|||-------------|--------||||--------|--|--|-||-| 8 [S] COG1598 Uncharacterized conserved protein ------------------||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 8 [TK] COG2197 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain ----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-|||||||||||||||||| 7 [M] COG0845 Membrane-fusion protein --||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 7 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components --|----------|||-|||||--------------------------|----------|||||-- 7 [R] COG2319 FOG: WD40 repeat ------------------|------------------------------------|------|--- 7 [L] COG5659 FOG: Transposase ||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 6 [K] COG0583 Transcriptional regulator ||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [R] COG0628 Predicted permease |||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--|||||||||||||| 6 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel -||-----||---||--|||||||--|---|--||-||----||||--||||---|---|||||-- 6 [P] COG0715 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 6 [NT] COG0840 Methyl-accepting chemotaxis protein |||-|||||||||----|||||-----||-||-----|----|||-|-||------------|--- 6 [C] COG1032 Fe-S oxidoreductase |||---|||||||---|-||-|----||||||-|-|||-------|--||-----|---|||||-| 6 [F] COG1051 ADP-ribose pyrophosphatase ||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-|||||||||||||| 6 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component |-||---------|||--||--||||--------|-||----||-----|------------|--- 6 [C] COG1413 FOG: HEAT repeat ----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||-- 6 [NU] COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG -------------||---||----------------------|||||-||||----------|--- 6 [T] COG2198 FOG: HPt domain ------------------||----------------------|||||------------------| 6 [S] COG5464 Uncharacterized conserved protein ||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||-- 5 [M] COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis |||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 5 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase |||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 5 [R] COG0517 FOG: CBS domain ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 5 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32) ----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--||||||||||| 5 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases |-||||-----|-||---||-------||||------|----|||||-||-|||||---||||||| 5 [R] COG0661 Predicted unusual protein kinase -||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||-- 5 [P] COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component |-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 5 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component |-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---||||||| 5 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family -----------------||||-|||--||-|---||||----------||----------|-|--- 5 [TK] COG2208 Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit ---|---------|||-|||-|--||----|---------|||||-|-||--|||-||||||||-- 5 [O] COG2214 DnaJ-class molecular chaperone ------------------||-------||-------|------------|-----|----|-||-- 5 [I] COG3239 Fatty acid desaturase ------------------|||--------------|------|||-|------------------- 5 [QC] COG4577 Carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein -----------------|||------|||-------------||||---|-----|---|||||-- 5 [PR] COG4638 Phenylpropionate dioxygenase and related ring-hydroxylating dioxygenases, large terminal subunit ------------------||-------------------------------------------|-- 5 [S] COG4995 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 4 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component |||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||-- 4 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs |||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--|||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs |-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||-- 4 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase |||---|||-------|||||---------|-----------|||-|--|-----|---------- 4 [C] COG0426 Uncharacterized flavoproteins |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0443 Molecular chaperone -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases |||-|--------||||-|||-----||||||||-||||||||||||--|----------|||--- 4 [P] COG0474 Cation transport ATPase |-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 4 [R] COG0546 Predicted phosphatases |-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-|||| 4 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase -||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||-- 4 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component -------------||---||------------||--------|||||-||||||||---||||||| 4 [O] COG0625 Glutathione S-transferase --|----------||||-||--||--||||-|---|||----|||-|-||-|---|||-||-|--- 4 [P] COG0659 Sulfate permease and related transporters (MFS superfamily) |-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily ---|---------||-|-||-|----|----|--||||----|||||-|||-|--|---|||||-- 4 [MG] COG0702 Predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerases --||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--|||||||||||||| 4 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein ----------------||||||--||||||||--||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases --|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump ----------------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 4 [U] COG0848 Biopolymer transport protein --||||----------|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 4 [C] COG1008 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M) |||||||||||||||||-||-|----------------------------------------|--- 4 [R] COG1100 GTPase SAR1 and related small G proteins --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 4 [GM] COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component ||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--|||||||||||||| 4 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning |||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||-- 4 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon) ---|-------|-||---||-|----||||-|--||||----|||||-|||----|---||||--- 4 [C] COG1252 NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit |-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||-- 4 [R] COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease -----------------||||||||--||-|---||||----------||---------||--|-- 4 [T] COG1366 Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor) ---|--------------||-|-----||||||-|||-----|||---|---|--|---|||||-- 4 [V] COG1403 Restriction endonuclease ----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||-- 4 [P] COG1629 Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport --|--------|----|-|-----------------------||||-----|-------------- 4 [L] COG1662 Transposase and inactivated derivatives, IS1 family ------|||-------|-|||---------|-----|-----|||||--|--||||---|||||-- 4 [M] COG1807 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family -----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||-- 4 [K] COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins |-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||-- 4 [P] COG2217 Cation transport ATPase ------|----||-----||-------||-----------------------|------------- 4 [S] COG2442 Uncharacterized conserved protein ----------------|-||-------------------------|--||--||||---||-||-- 4 [Q] COG2931 RTX toxins and related Ca2+-binding proteins ---|--------------||-------||------------------------------------- 4 [S] COG3349 Uncharacterized conserved protein ------------------||-------||------------------------|-----||----- 4 [S] COG3744 Uncharacterized protein conserved in bacteria |||-||--||-|-||-||||-|----|||-||--|||||---|||||--|--||||---|||||-- 3 [P] COG0004 Ammonia permease ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||| 3 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5) ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase ||||||-|||---|||--||-|----|||--|-||||-----|||||-||-||------|--|--- 3 [P] COG0025 NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters -|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||-- 3 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC ||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-| 3 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase |-||------||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain --||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex |-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 3 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases |||-----||----|-|-||||----|||-----|--||---|||||--||----||||||||--- 3 [OK] COG0378 Ni2+-binding GTPase involved in regulation of expression and maturation of urease and hydrogenase |||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-||||||||||||||| 3 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases --|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||-- 3 [G] COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase ||||||||||||||--||||---------------------------------------||-|--- 3 [T] COG0467 RecA-superfamily ATPases implicated in signal transduction |||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-|||||||||||||| 3 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases) ||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--|||||||| 3 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family ||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases |-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes |||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||-- 3 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function |------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||| 3 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit |-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|--- 3 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily ||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||---- 3 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component --|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---||||||| 3 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases -||-----||-------|||||||--|---|--||-||----||||---|||---|---|||||-- 3 [P] COG0600 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component -----|-------||-|-||-|||--||||||||||||||||-------|--|--||--|--|--- 3 [T] COG0631 Serine/threonine protein phosphatase --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 3 [NT] COG0643 Chemotaxis protein histidine kinase and related kinases |-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family --|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating) |-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||-- 3 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins -|-|----|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 3 [E] COG0683 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component -------------|||--||----|-----------------------|-------||-------- 3 [R] COG0724 RNA-binding proteins (RRM domain) --|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||-- 3 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins -----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [M] COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein) |||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1 |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase ----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0793 Periplasmic protease |-|------|------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [U] COG0811 Biopolymer transport proteins --||--|||--------|||----||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 3 [NT] COG0835 Chemotaxis signal transduction protein ----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [M] COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase --||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--|||||||||||||| 3 [CP] COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit ||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-| 3 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases |------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||-- 3 [M] COG1087 UDP-glucose 4-epimerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 3 [G] COG1109 Phosphomannomutase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 3 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component ||||--|||||||----|||||--|-||||||||||||||||-||-|-|-|----|---|||---- 3 [P] COG1122 ABC-type cobalt transport system, ATPase component --||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-| 3 [O] COG1225 Peroxiredoxin ||||-------||-----||-|----|||-----||-|-----------------|------||-- 3 [Q] COG1233 Phytoene dehydrogenase and related proteins ||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 3 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes |-|---||||||----||||-|-----||||----|||-----------||||--|---||-||-- 3 [E] COG1305 Transglutaminase-like enzymes, putative cysteine proteases |-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 3 [K] COG1309 Transcriptional regulator -|--||||-|--||--|-||-|-----|||------|----------------------------- 3 [L] COG1372 Intein/homing endonuclease ||||-----|--------||-------||--------------------|-----|---||||--- 3 [H] COG1429 Cobalamin biosynthesis protein CobN and related Mg-chelatases ||||--||||------|-||-|--|-|---------------------||----|-||||||||-- 3 [S] COG1432 Uncharacterized conserved protein ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 3 [Q] COG1463 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, periplasmic component -----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||-- 3 [K] COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||----|||||-||-||--|---||||--- 3 [G] COG1653 ABC-type sugar transport system, periplasmic component -||-----|--------||--|-------------------------------|-----|---|-- 3 [R] COG1669 Predicted nucleotidyltransferases --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 3 [GM] COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component --||------|-|-----|||-----|-----|||--|-----||||-||||||||--|||||--- 3 [P] COG1840 ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component |-||||-|||-||----||--|--------|||----------------|------------||-- 3 [S] COG2013 Uncharacterized conserved protein --|---------------||-|----||||------|-----|||||-||||||||---------- 3 [M] COG2027 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein 4) ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 3 [H] COG2082 Precorrin isomerase --|----------|||--||----|-||||-------------------|---------||-||-- 3 [T] COG2114 Adenylate cyclase, family 3 (some proteins contain HAMP domain) ---|---------||---||-------||-------------------||-----|-------|-- 3 [S] COG2119 Predicted membrane protein ---|-------------|||-------||----||-------|||-|-|----------|-----| 3 [D] COG2161 Antitoxin of toxin-antitoxin stability system ------------------||||--------|-----||---------------------------- 3 [D] COG2385 Sporulation protein and related proteins ------------------||--------------------------------|||----||-|--- 3 [S] COG2954 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||----------------------|||-|--|----------|-|--- 3 [T] COG3447 Predicted integral membrane sensor domain --||--||---|------|-----------|-----------|||||--------|---------- 3 [L] COG3677 Transposase and inactivated derivatives -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 3 [E] COG4177 ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component ||-|||-|-||-|||-|-|||------|||-----|-|---------------------------- 2 [P] COG0003 Oxyanion-translocating ATPase ||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||-- 2 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase |||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||--- 2 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase |||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase |||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase] --||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0031 Cysteine synthase ||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase -||---||--||-|--|-||||||--|||-||||--||----|||||-||||-------||-|--- 2 [G] COG0058 Glucan phosphorylase |||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 2 [G] COG0061 Predicted sugar kinase |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 2 [E] COG0067 Glutamate synthase domain 1 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 2 [E] COG0069 Glutamate synthase domain 2 |||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||-- 2 [E] COG0070 Glutamate synthase domain 3 |||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit |||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||-- 2 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases ||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase |||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 2 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I ||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---||||||||||||| 2 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases --------|-||-||-|-||-|----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 2 [P] COG0155 Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|--- 2 [G] COG0205 6-phosphofructokinase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12 |-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 2 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase ---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family |--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [P] COG0288 Carbonic anhydrase |||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 2 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes -|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|--- 2 [G] COG0297 Glycogen synthase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0305 Replicative DNA helicase --|----------||-|-||-|----||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 2 [S] COG0316 Uncharacterized conserved protein ----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-| 2 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases ---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 2 [H] COG0320 Lipoate synthase ---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0328 Ribonuclease HI -|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------| 2 [L] COG0338 Site-specific DNA methylase |||---||||------|-||-|--------------------|||-|---------|||------- 2 [R] COG0375 Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression) -------------|||--|-|-----|---|||||||||---|||||--|--||||-------|-- 2 [O] COG0386 Glutathione peroxidase |-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||-- 2 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||-||||||||-||-||--|---||||--- 2 [G] COG0395 ABC-type sugar transport system, permease component -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 2 [E] COG0410 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component |-||-------|-|----||------|-----|-||------||||||||----|----|--||-- 2 [L] COG0415 Deoxyribodipyrimidine photolyase |||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--||||||||||| 2 [O] COG0450 Peroxiredoxin ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 2 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ) ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family) ||||||||||||||||--||-|----||||------||-----------|-----|--|||-|--- 2 [O] COG0464 ATPases of the AAA+ class -|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||-- 2 [G] COG0469 Pyruvate kinase ||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-|| 2 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit -------------|||--||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains ||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning ||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||-- 2 [R] COG0496 Predicted acid phosphatase |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0498 Threonine synthase |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain |-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||-- 2 [E] COG0520 Selenocysteine lyase --|----------||-|-||||----|||-----|-||----|||||-||--||||||-|||||-- 2 [R] COG0523 Putative GTPases (G3E family) |||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||-- 2 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family ||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 2 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump |||||||||||||---||||-|-----||-||--|-||-----------|-----|----|-|--- 2 [R] COG0535 Predicted Fe-S oxidoreductases -------------||-||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0539 Ribosomal protein S1 ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase ---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [K] COG0557 Exoribonuclease R -|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||--- 2 [E] COG0559 Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease components --||--|||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific --------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [J] COG0566 rRNA methylases -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||-- 2 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component ||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 2 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 2 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component ----||-----|------||-|--||||||||--||||----|||||||||||||||||--|||-- 2 [S] COG0586 Uncharacterized membrane-associated protein ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit -||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-| 2 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||--- 2 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components -||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||-- 2 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component |||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----|||||||||||||||||||||||| 2 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class) -------------|||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase -|||--|||||-|---||||||--|||||-||||||||||||------|----------------- 2 [R] COG0618 Exopolyphosphatase-related proteins ||||--||||-||----|||||----||||||||||||||||-||-|---|--------|||---- 2 [P] COG0619 ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters |||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein ----------------|||||||||||||-|||||||||---|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases |||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||-- 2 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators |||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||-- 2 [C] COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins) ||||-||||-|||----|||-|----|||-----||||----|||-|-||---------|||--|| 2 [CP] COG0651 Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit |||---||||------|||||------||-------||----|||||-||--||||||-|||||-- 2 [G] COG0662 Mannose-6-phosphate isomerase |||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--|||||||| 2 [R] COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily ---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||-- 2 [C] COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases) ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0681 Signal peptidase I |-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---||||||| 2 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins -------------|||--||-|-----||-----|-||----|||----|-----||||------- 2 [R] COG0699 Predicted GTPases (dynamin-related) |||-----||------||||-------||-|-||-|||----|||-------------|------- 2 [R] COG0701 Predicted permeases --|-------------|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b |||||||||||||---||||-|---||||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 2 [R] COG0714 MoxR-like ATPases |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 2 [O] COG0719 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component |||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [R] COG0730 Predicted permeases |--|----|----||-|||--|--|-|---|||-||||-|--|||||-|-||---|||-||-|--- 2 [F] COG0737 5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases --|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||--- 2 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component -----------------||||-||||||||||||||||----|||||-||||---||||||-||-- 2 [S] COG0762 Predicted integral membrane protein ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [Q] COG0767 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component |-|---|||-|-|---||||||--|-||||--||--||------------||----||-||||--- 2 [O] COG0785 Cytochrome c biogenesis protein ------------------|-|-----|-------|-------|||||-|||--||-||-------- 2 [E] COG0786 Na+/glutamate symporter --|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators -----------------|||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [R] COG0795 Predicted permeases ----------------|-||----||----|-----------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0797 Lipoproteins |-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-|| 2 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin --|-----|---------||--||------------------|||||-|||||--||||||||||| 2 [U] COG0823 Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system |-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [R] COG0824 Predicted thioesterase |-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||-- 2 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component ---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 2 [C] COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1 ---|----|---------||-|-----||-------------||||||||||-||-|||------- 2 [R] COG0857 BioD-like N-terminal domain of phosphotransacetylase ||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--|| 2 [P] COG1006 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit ||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||------- 2 [HR] COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes |||---||||-|-----|||------|||||-|-||||----|||||--|-----|---|||||-- 2 [G] COG1082 Sugar phosphate isomerases/epimerases |-|-----|-------|-||-------||-|-----------|||-|-||--|---||-|-|||-- 2 [M] COG1089 GDP-D-mannose dehydratase --|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-||||||||||||| 2 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes |-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 2 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components ------------------||-------||--------|----|||||-||--||||||||||||-- 2 [P] COG1118 ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component |-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 2 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [Q] COG1127 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component ||||----|||||---|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component |||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|--- 2 [C] COG1145 Ferredoxin ------------------||-|--------------------|||||-||-||||-|||------- 2 [E] COG1166 Arginine decarboxylase (spermidine biosynthesis) --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||--- 2 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|---||||--- 2 [G] COG1175 ABC-type sugar transport systems, permease components ---|--||--|-|-----||||--|-|------|---|----|||||-||||-|||--|||||--- 2 [P] COG1178 ABC-type Fe3+ transport system, permease component --|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases |-|-||||||||-||||-||------|---|||-||||----|||||--|-----|---|||||-| 2 [M] COG1215 Glycosyltransferases, probably involved in cell wall biogenesis ||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||-- 2 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III ||||||--||--------||-|----|||--------------------|-----|---------- 2 [H] COG1239 Mg-chelatase subunit ChlI --||---------||-|||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains --|||||||--||----|||-|--||----|---|||||||--------|-----|----||---- 2 [R] COG1277 ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component ---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--|||||||||||||| 2 [C] COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex -----------------|||-|--||||||||||||||---------------------------- 2 [K] COG1316 Transcriptional regulator -----------------|||------|||||-----||----|||-|-||---|||---||||--- 2 [S] COG1376 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||-|-----||||----|||-------||------|-|---------------------|||||-- 2 [R] COG1402 Uncharacterized protein, putative amidase --||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|--- 2 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases |-|---|||||-|||-|-||--||--||||||--|||-----|||||-||||---|---|||||-- 2 [R] COG1409 Predicted phosphohydrolases |-|--------------|||----------|----------------------------------- 2 [R] COG1453 Predicted oxidoreductases of the aldo/keto reductase family ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||-- 2 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF --||||||---|-----|||||----|||-||-|||||----|||----|||---|--||||||-- 2 [R] COG1473 Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase -||---|||-||------||-|-----||-----------------|---|-|--|---||-||-| 2 [R] COG1487 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain --|--------|-----||-||||--|||-|-||--||-|--|||||-||||---|---||-|--- 2 [G] COG1523 Type II secretory pathway, pullulanase PulA and related glycosidases --|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|------- 2 [L] COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins |--|-------|-||---||-|----|||-----|-|---------------||||---|||||-- 2 [I] COG1562 Phytoene/squalene synthetase -|----|||---------||--------------------------------|------------- 2 [R] COG1569 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain ---|----|-||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 2 [C] COG1622 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2 ------------------||-|--------------|-----||||---------|-----|---- 2 [S] COG1649 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---||--|-|-----||-|----||||||||||||----|||||--|--|--|---||||||| 2 [V] COG1680 Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins |||------|------|-|----------------------------------------------- 2 [R] COG1719 Predicted hydrocarbon binding protein (contains V4R domain) --|||||||-|-|---||||-|---|-|||-----|||----------||-----|---|||||-- 2 [R] COG1721 Uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain) --|--------------|||-------------------------|-----------|--|-||-- 2 [N] COG1724 Predicted periplasmic or secreted lipoprotein --||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components --|-------------|-||-|----|||-|----|||----|||||-||------------||-- 2 [KT] COG1842 Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription ---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 2 [C] COG1845 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3 ------------------||----||----||||-|||-------|--|-|||------------- 2 [M] COG1876 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase |-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||-- 2 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes ||||||||--||----|||||-----||--|||--|||-------||--|-----||||||||--- 2 [S] COG1917 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain -----------------|||-|--|-----|---|||-----|||||-|---|------|-|||-- 2 [M] COG1922 Teichoic acid biosynthesis proteins --||||-||-||----|-||-|-----||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [H] COG1977 Molybdopterin converting factor, small subunit --|-----|---------||-|----||||------||----------||---|||||||||||-- 2 [C] COG2010 Cytochrome c, mono- and diheme variants ------------------||-|----|||||-----------|||||-||--||||||||||||-- 2 [S] COG2127 Uncharacterized conserved protein ||||----||||------||-|----|||-----|-||-----------------|---------- 2 [S] COG2138 Uncharacterized conserved protein ---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||-- 2 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis -----------------|||-|||---||-|---||||---------------------------- 2 [T] COG2172 Anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase) ------------------||-------|||------------|||||-||--||||---|||||-- 2 [P] COG2193 Bacterioferritin (cytochrome b1) ||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--| 2 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold --|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 2 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis -------------||---||-|--------------------|||||-||-|||||---||||||| 2 [H] COG2227 2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4-benzoquinol methylase ||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|---------||||--- 2 [H] COG2242 Precorrin-6B methylase 2 ------------------||----------||-|--||||||-||||-||--||||----|-||-- 2 [V] COG2274 ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain -||---------------||-|---|-||--|--|-||-----------|-----|---------- 2 [S] COG2314 Predicted membrane protein --|----------||---||-|-----||------------------------------||-||-- 2 [M] COG2335 Secreted and surface protein containing fasciclin-like repeats ------------------||-|-----||--------------------------|----|-|--- 2 [S] COG2343 Uncharacterized protein conserved in bacteria -||---------------|--|-------------------------------|-----|---|-- 2 [S] COG2361 Uncharacterized conserved protein |||------|--------|||---------|-----------------------------|-|--- 2 [C] COG2710 Nitrogenase molybdenum-iron protein, alpha and beta chains --|-----|-------|-||-|--------------|-----------||-----|---||-|--- 2 [T] COG2770 FOG: HAMP domain ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 2 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB ----------------||||||--------|-----------|||||-||--||||---------- 2 [NU] COG2805 Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits -------------||---||-------||-------------------||-----|---||-||-- 2 [I] COG3000 Sterol desaturase ----------||------|----------------|------|---|--|-----|---|-|||-- 2 [R] COG3193 Uncharacterized protein, possibly involved in utilization of glycolate and propanediol ------------------||-|---------------------------|---------------- 2 [S] COG3224 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|-----------------------|||||--|||---|---|||||-- 2 [M] COG3264 Small-conductance mechanosensitive channel -----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-||||||| 2 [M] COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes --|----------|----|||------||-|---|--|----|--||-||----------|----- 2 [L] COG3344 Retron-type reverse transcriptase --||||||-|||----|-||---------------------------------------------- 2 [S] COG3431 Predicted membrane protein -----------------|||-|--|-----|-----------------||--|------------- 2 [KT] COG3437 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HD-GYP domain ------------------||-------||--------------------------|-------|-- 2 [Q] COG3670 Lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzymes -------------|||--||----------------------------||-------------|-- 2 [O] COG3751 Predicted proline hydroxylase |||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||--- 2 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components --|---------------||----------|------|---------------------------- 2 [S] COG3937 Uncharacterized conserved protein --------------|---||----------||-----------------|----------|||--- 2 [G] COG3957 Phosphoketolase ------------------||-----------------|-----------|-----|---|---|-- 2 [R] COG4188 Predicted dienelactone hydrolase ----------------|-||-----------------------------|----------|-|--- 2 [S] COG4244 Predicted membrane protein ------------------||-|-------------------------------------------- 2 [S] COG4370 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||----------------------------------------|----- 2 [C] COG4451 Ribulose bisphosphate carboxylase small subunit ------------------||--------------------------------|------------- 2 [S] COG4634 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-----------------------||----------|---------- 2 [G] COG4678 Muramidase (phage lambda lysozyme) -------------|----||------|--------------------------------------- 2 [P] COG5398 Heme oxygenase --|---------------||------------------------------------------|--- 2 [T] COG5635 Predicted NTPase (NACHT family) ||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||-- 1 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase |||||||||||||||-||||-------||||-||-|||----|--||--|--|------||-|--- 1 [F] COG0005 Purine nucleoside phosphorylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases ||-||||||||--|--|||-------|||-|--||-||---------------------------- 1 [S] COG0011 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit ||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||------------- 1 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase -------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0021 Transketolase ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 1 [C] COG0022 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit |||||||||||||||---||----------------------|||||-||||-------------- 1 [J] COG0023 Translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1) and related proteins ---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase) -|----||---|------||------|||-------|-----|||||-||-|-------------- 1 [F] COG0027 Formate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase (GAR transformylase) ---|--||---|----|-|||------||||----|||----|||||-||--||||---||-||-- 1 [H] COG0029 Aspartate oxidase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation) -------------||---|--|----|||-------------|||||-|----------|||||-- 1 [G] COG0033 Phosphoglucomutase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase |--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase -|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control ||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--|||||||| 1 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||-- 1 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 1 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||-- 1 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0048 Ribosomal protein S12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0049 Ribosomal protein S7 ---------|---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0051 Ribosomal protein S10 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2 ||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--|||||||| 1 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit |||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||-|----|||||-----------|||||-||--|--|||||||||-- 1 [S] COG0062 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||-- 1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase ||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---||||||||||||| 1 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog) ||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit |||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit |||---||||------|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 1 [O] COG0068 Hydrogenase maturation factor |||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---||||||| 1 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0073 EMAP domain ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit ||||||||||||||--||||-|--------||--|-||--------|-||------||-||-||-- 1 [E] COG0075 Serine-pyruvate aminotransferase/archaeal aspartate aminotransferase ||||--||||--||----||-------||--|---|-|----||||--|-|---------|||--- 1 [E] COG0076 Glutamate decarboxylase and related PLP-dependent proteins ||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0077 Prephenate dehydratase |||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1 ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0082 Chorismate synthase -|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||------- 1 [E] COG0083 Homoserine kinase |||---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0084 Mg-dependent DNase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5 ---|||||---||||-||||--||--|----|||||||-||||||||-||---------------- 1 [H] COG0095 Lipoate-protein ligase A |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11 |||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9 ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase |||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase ---|||--|-|||||-|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---||||||| 1 [O] COG0109 Polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor) ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase --||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0114 Fumarase -|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||---------- 1 [L] COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase -------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase ||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||-- 1 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase ||--|-||--||-|----||-------||-------------|||||-||||-|||---||||--- 1 [R] COG0121 Predicted glutamine amidotransferase |-||--|||---||||--|--|-----||-|-----||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 1 [L] COG0122 3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase ||||--|||||||||||-||-|------------|-||----------||---|||---|||||-- 1 [BQ] COG0123 Deacetylases, including yeast histone deacetylase and acetoin utilization protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0125 Thymidylate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase |||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--|||||||| 1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase -|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 1 [H] COG0132 Dethiobiotin synthetase ||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase ||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase --||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful) ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase ||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase -|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases -||--|--|||||||-|-||-------|-------|-|------------------||-|||||-- 1 [EQ] COG0145 N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit -||--|---||||||-|-||-------|----------------------------||-|||||-- 1 [EQ] COG0146 N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0148 Enolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase -|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes ||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||-- 1 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase ---|---------||---||----------------------|||||-||||-||||||-||-|-- 1 [G] COG0158 Fructose-1,6-bisphosphatase ||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 1 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0164 Ribonuclease HII ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase -|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase ||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||---- 1 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase |||-|||||||--||||-||----||--------------------------------------|| 1 [I] COG0170 Dolichol kinase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0171 NAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [E] COG0174 Glutamine synthetase -||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 1 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes -|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [G] COG0176 Transaldolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit |||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 1 [Q] COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-||||||||||||||| 1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase |||-|||||||||||-|||||---------------|------------|--|-------|-|--- 1 [J] COG0182 Predicted translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family ||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-||||||| 1 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17 -|||--|||-|||-----||-|---------------|--||||||||||||||||---|||||-- 1 [HJ] COG0189 Glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase) --||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||| 1 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase -------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||-- 1 [G] COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase -------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase -------------|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0194 Guanylate kinase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0195 Transcription elongation factor -------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0196 FAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0203 Ribosomal protein L17 ||||||||||------||||||--||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0206 Cell division GTPase ---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-||| 1 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit |-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0211 Ribosomal protein L27 |--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase --|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0216 Protein chain release factor A -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein ------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class) -------------||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase |-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit -------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0227 Ribosomal protein L28 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0228 Ribosomal protein S16 |-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||-- 1 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0230 Ribosomal protein L34 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A) ------------------|--|----||||-----|------|||||-||||---|---||||||| 1 [F] COG0232 dGTP triphosphohydrolase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0233 Ribosome recycling factor --|----------||-||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10) --|----------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0238 Ribosomal protein S18 -|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation |-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase -|--||-------|||--|-|------||-|-----------|||||||||||||||||---||-- 1 [E] COG0241 Histidinol phosphatase and related phosphatases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase ||-||||||||||---|-||-|----|||-------||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [C] COG0243 Anaerobic dehydrogenases, typically selenocysteine-containing |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10 ----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase ||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||--- 1 [C] COG0247 Fe-S oxidoreductase --|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-|||||||||||||||||| 1 [FP] COG0248 Exopolyphosphatase --||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family) |||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0250 Transcription antiterminator ||------||------|||||-||--|||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0254 Ribosomal protein L31 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0257 Ribosomal protein L36 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) -------------||---||-|-----|||------------|||||-|||-||||---|||||-- 1 [H] COG0259 Pyridoxamine-phosphate oxidase ------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-|||||||||||| 1 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0261 Ribosomal protein L21 --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts ------------------||-|----||||-||||||||||||||||-||||||||---|||||-| 1 [L] COG0266 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0267 Ribosomal protein L33 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0268 Ribosomal protein S20 ||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||-- 1 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase ---|---------||---||----------------------||||||||||||||---||||||| 1 [T] COG0271 Stress-induced morphogen (activity unknown) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II) |--|||----|-|---||||-|--|-|||||||||||||||||||||-|-||-------||-|--- 1 [F] COG0274 Deoxyribose-phosphate aldolase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis ----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase) ---|---------|||--||----------------------||||||||||||||---||||||| 1 [O] COG0278 Glutaredoxin-related protein -|--||----------|-|-|------||-|-----------||||||||||-||-|||---|--- 1 [G] COG0279 Phosphoheptose isomerase --||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-||||||||| 1 [C] COG0280 Phosphotransacetylase --|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0281 Malic enzyme --|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-|| 1 [C] COG0282 Acetate kinase ---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---||||||| 1 [F] COG0283 Cytidylate kinase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase ---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase ||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase |||-----||------||||--||--|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3) -------------|--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0291 Ribosomal protein L35 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0292 Ribosomal protein L20 --|--------|-|--|-||||||--|||----|--|-----|||||-||||---|---||-|--- 1 [G] COG0296 1,4-alpha-glucan branching enzyme |||---||||--------||----------|-----------|||-|---|-----|||------- 1 [O] COG0298 Hydrogenase maturation factor --||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN ----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--||||||||||| 1 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I |||||||||||||---|-||-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0303 Molybdopterin biosynthesis enzyme ---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain --|-||----||-|||--||-|----||||-|||--------|||||-||||||||---|||||-- 1 [E] COG0308 Aminopeptidase N |||||||||||||---|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 1 [O] COG0309 Hydrogenase maturation factor ||||----||--------||----------|----|----------|---|----------|---- 1 [P] COG0310 ABC-type Co2+ transport system, permease component ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0313 Predicted methyltransferases |||||||||-|||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0314 Molybdopterin converting factor, large subunit |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0315 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme |-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase ----------|--||---||-|----||||------------||||||||||||||---||||||| 1 [H] COG0321 Lipoate-protein ligase B --||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase) -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase --|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold -------------|||--|||---|||||||----|||----|||||||||||--||||-|-|-|| 1 [O] COG0326 Molecular chaperone, HSP90 family |||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase ----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0333 Ribosomal protein L32 --|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|-- 1 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0335 Ribosomal protein L19 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase ----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase -------------||---||-|----|---------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [E] COG0339 Zn-dependent oligopeptidases ||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD |||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase ----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||-- 1 [S] COG0344 Predicted membrane protein |-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase |||-----||------||||-|----|||-||---||-----|||||-||||||||---|||||-- 1 [E] COG0347 Nitrogen regulatory protein PII -||-||--||-|------||----------|-----------|||-|-||||-|||||||||||-- 1 [C] COG0348 Polyferredoxin -------------|----||------|||||-----------|||||-|||||------||||||| 1 [J] COG0349 Ribonuclease D --|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase ----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) -------------||-|-||-|----||||------------||||||||||||||---||||||| 1 [R] COG0354 Predicted aminomethyltransferase related to GcvT --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit) --|----------|--|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type) --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0359 Ribosomal protein L9 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0360 Ribosomal protein S6 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1) -------------|||-|||--||||||||-|-||||-----|||||||-||-||----||||--- 1 [G] COG0362 6-phosphogluconate dehydrogenase -------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase -------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase |-||||--|-|||||||-||-|-----||--|--||||----|||||-||-||--||-||||||-- 1 [I] COG0365 Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases --|-||----|--||--|||-|----|||-||||||||-|--|||||-||-----|---||-||-- 1 [G] COG0366 Glycosidases |||||||||||||-----||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||--- 1 [H] COG0368 Cobalamin-5-phosphate synthase -------------|||--||--||----------|-||----||||||||--|||----|-|-|-- 1 [P] COG0369 Sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein) |||---|||||-----||||-|--------||--||------|||||-||--|--||||----|-- 1 [P] COG0370 Fe2+ transport system protein B |||||||||||||-|--|||----------||||-|||----|||||-------------|----- 1 [C] COG0371 Glycerol dehydrogenase and related enzymes |-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [C] COG0372 Citrate synthase ||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||------- 1 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase --||----|----|----|--------||--------|----|||||-|---|--|---||-||-- 1 [P] COG0376 Catalase (peroxidase I) --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases ||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||-- 1 [H] COG0379 Quinolinate synthase |---||----|--|||--|-------||||------------|||-|--------|----|-|--- 1 [G] COG0380 Trehalose-6-phosphate synthase ||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----|| 1 [M] COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase -----||----|-||--|||-------||--|||-|-|----|----------------------- 1 [G] COG0383 Alpha-mannosidase --||---------||---||||----|||-|----|||----|||-|-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG0384 Predicted epimerase, PhzC/PhzF homolog --|----------|--|-||------|--|----|-||----|||||--|---|||---|||||-- 1 [R] COG0385 Predicted Na+-dependent transporter -------------||---||-|----||||------|-----|||||------------||-|--- 1 [P] COG0387 Ca2+/H+ antiporter --||-------|-||---|||-----|||-|||||||||||||||||-||-|-|||---|||||-- 1 [L] COG0389 Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair -||-------------||||-------||-----|-|-----|||-|--------|---------- 1 [R] COG0390 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ||||----||---|--||||-|----||||||||||||----|||||-|--|-------------- 1 [S] COG0391 Uncharacterized conserved protein ||||--||||------||||------|||||---|||-|||||||-|--|--|--|---||||--- 1 [S] COG0392 Predicted integral membrane protein |||||||||--|-----|||-------|||-|---|-|----|||-|-|--|-----------|-- 1 [S] COG0393 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 1 [O] COG0396 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, ATPase component -------------||---||------|----------|----|||-|-||--|--|---||--|-- 1 [S] COG0397 Uncharacterized conserved protein --||---------||---||------|||-||||||||----|||---|-----------|--|-- 1 [S] COG0398 Uncharacterized conserved protein -------------||---||-|||-------|--||||----|||----|--|------||||-|| 1 [R] COG0400 Predicted esterase -------------||---||----------------------|||-|--|---------|------ 1 [S] COG0401 Uncharacterized homolog of Blt101 |||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||-- 1 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG0403 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), N-terminal domain ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--||||---|||||-- 1 [E] COG0404 Glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase) ----||----||||||--||||----|||-----|-||----|||-|-||--||||||-||-||-- 1 [E] COG0405 Gamma-glutamyltransferase --|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase -------------||---||----------------------|||||-||--|--|---||||||| 1 [H] COG0408 Coproporphyrinogen III oxidase |||---||||------|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 1 [O] COG0409 Hydrogenase maturation factor -|------|-|||----|||||-----------|--------|||||--|-----|--|||||--- 1 [E] COG0411 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component --|-|------|-||-|-||-------|||------|-----|||||--|-----|---||-||-- 1 [Q] COG0412 Dienelactone hydrolase and related enzymes ---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase -------------||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0414 Panthothenate synthetase ----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||-- 1 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme -------------||---|-----------------------||||||||---||||||||----- 1 [F] COG0418 Dihydroorotase ||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||---------------- 1 [L] COG0419 ATPase involved in DNA repair ||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|----- 1 [L] COG0420 DNA repair exonuclease ||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||-- 1 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC --|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation ||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||-- 1 [O] COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation ---|----|----||---|-|-----|---------------|||||--|---------|-|-|-- 1 [C] COG0427 Acetyl-CoA hydrolase -------------|-|--||----------------------|||||-||---|||---------- 1 [R] COG0429 Predicted hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold ---|---------||---||-|----|||--|||||||--|||||||-||-|-|||---||-||-- 1 [R] COG0431 Predicted flavoprotein |||---|||||||-|-||||-|-----||-|-----||----|||-|-||---------||----- 1 [S] COG0432 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||---||||-|-----||---|----|----||||---|-|---|---|||||-- 1 [R] COG0433 Predicted ATPase -|-|--|||||-|-----||----------------------|---|------------|--|--- 1 [R] COG0434 Predicted TIM-barrel enzyme ---|---------||---||------|---------------|||-|-||---------||||--- 1 [O] COG0435 Predicted glutathione S-transferase |||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0439 Biotin carboxylase |||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||-- 1 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division |||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases ---|----|---------||------||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 1 [H] COG0447 Dihydroxynaphthoic acid synthase -----------------|||||||--||||||-|--||----|||||-|-||-------||-|--- 1 [G] COG0448 ADP-glucose pyrophosphorylase ||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains |||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase ||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 1 [R] COG0456 Acetyltransferases |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase |||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| 1 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase |||||||||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication ||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||---- 1 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters |||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--|||||||| 1 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase |-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA -------------||-||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0486 Predicted GTPase ||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0492 Thioredoxin reductase --|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--|||||||| 1 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase ----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair |||||||||||||||-||||------||||-------------------|--|--|---|||||-- 1 [H] COG0499 S-adenosylhomocysteine hydrolase |||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 1 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes ||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||--- 1 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase) ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit ---|---------||---||-|----|||-----|-||----|||||--|-|-|||||||||||-- 1 [E] COG0506 Proline dehydrogenase ---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 1 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes ---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||-- 1 [E] COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding) |||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II |||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||| 1 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases --|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||-- 1 [L] COG0514 Superfamily II DNA helicase ||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0527 Aspartokinases |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0528 Uridylate kinase -------||---|||-|-|--|-----||-|-----||----||||||||--|--|--|-||||-- 1 [P] COG0529 Adenylylsulfate kinase and related kinases ||||||||||||-||-|||-----||-----------|----|||||-|--|--------|----- 1 [P] COG0530 Ca2+/Na+ antiporter ||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---||||||| 1 [E] COG0531 Amino acid transporters |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0536 Predicted GTPase |||||||||-|||||||-||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases ---|||--|-|||||-||||-|-----||--|--||||----|||||--|-|---|||-|||||-- 1 [C] COG0538 Isocitrate dehydrogenases |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor) -------------||---||-||||-|---------------||||||||||||||-------|-- 1 [O] COG0545 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 1 |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-| 1 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase ---|||||--|-|-----|------------||||-----|-|||-|--||---------|----- 1 [E] COG0549 Carbamate kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0550 Topoisomerase IA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase --||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|----- 1 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family ---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||-- 1 [C] COG0554 Glycerol kinase ||||||||||||------||-|-----||-|------|----|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG0555 ABC-type sulfate transport system, permease component |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex |-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase ||||||--||-||-----||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-| 1 [J] COG0565 rRNA methylase ---|---------||--|||-|-|||----|||||||||-|||||||-|-||-------------- 1 [F] COG0572 Uridine kinase |||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--|||||||||||||| 1 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein) ---|||-----|-|||--|--|---|||||-|||||||----|||||-|||||--|---||||--- 1 [C] COG0578 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase ----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||-- 1 [R] COG0579 Predicted dehydrogenase |-------|--|-|||-||-||---|----||||||||-|||||||||-||||--|---|||||-- 1 [G] COG0580 Glycerol uptake facilitator and related permeases (Major Intrinsic Protein Family) |||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0582 Integrase |-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-|| 1 [ER] COG0591 Na+/proline symporter |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog) ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation -----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0594 RNase P protein component ||||--||-|-------|||||----||||||||||||||||--------------|||||||||| 1 [R] COG0595 Predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase |||-||--||-|-||--||--|----|||--|---|||-------|---||-||||---|||||-- 1 [S] COG0599 Uncharacterized homolog of gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit ||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes |||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase |-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [P] COG0605 Superoxide dismutase |--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-| 1 [O] COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity ||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease |||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|-- 1 [H] COG0611 Thiamine monophosphate kinase ||||----|--||---||||-|--------|------|----|||||-||||-|||---------- 1 [R] COG0613 Predicted metal-dependent phosphoesterases (PHP family) ----------------|-||-|||---|||-|--||||----|||-||-|||-||||||||||||| 1 [I] COG0623 Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH) -------------|----||------||||-|||||------|||||--|||-|||---|||||-- 1 [R] COG0627 Predicted esterase -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit ||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K --|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 1 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase -|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||-- 1 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases |||-----|--|-----|||----------|-----------|||||---||--------|----- 1 [R] COG0641 Arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase) ---|------------|-||-|-----||--------------------|----------|-||-- 1 [R] COG0645 Predicted kinase -----------------|||||----|||||---||||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG0646 Methionine synthase I (cobalamin-dependent), methyltransferase domain --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase) -------------||---||-|----|||-----|-||----|||||-||-|||||---||||||| 1 [HC] COG0654 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases ---|||||--||||||-||-------||||||||||||----|||||--|-----|---|||||-- 1 [R] COG0656 Aldo/keto reductases, related to diketogulonate reductase --|--|--|--|-||--|||-|--|-|||||||-||-|----|||||-||--|--|---||-||-- 1 [I] COG0657 Esterase/lipase ----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-| 1 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein ----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-|||| 1 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat ----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase -------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-||||||||||||| 1 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH ||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-||||||| 1 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase --------|---|||--||||---|---------|||-----||||---|-|-||---|--|--|| 1 [P] COG0672 High-affinity Fe2+/Pb2+ permease |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 1 [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit -|||||||-|||----||||-|---|-||-------------|||-|-----|---||-------- 1 [L] COG0675 Transposase and inactivated derivatives -------------||---||-------------------------|--|-||-|||---|||||-- 1 [O] COG0678 Peroxiredoxin ||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--|||||||| 1 [R] COG0679 Predicted permeases |||---||||-|----|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 1 [C] COG0680 Ni,Fe-hydrogenase maturation factor ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase --|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase ------------------||-|-----|||-|--||||----------|-------||--|-||-- 1 [E] COG0686 Alanine dehydrogenase ---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 1 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0691 tmRNA-binding protein -||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||-- 1 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase ---|----|----||---||--||----------||||----|||||||||||---|||||||||| 1 [O] COG0694 Thioredoxin-like proteins and domains --||-----------|--||----------|---|||||||||||||-||------||||------ 1 [G] COG0696 Phosphoglyceromutase ----------------|||-|-----|||||-|||||||||||--||----|----|||-|||-|| 1 [G] COG0698 Ribose 5-phosphate isomerase RpiB ------------------|-----------|-----||----|||-|-||-----|---------- 1 [S] COG0700 Uncharacterized membrane protein --|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0703 Shikimate kinase |||||||||||||---||||-|---|||||||||||-||-|||||||-||--|--|---|||||-- 1 [P] COG0704 Phosphate uptake regulator -||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||-- 1 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC --|------|-|----||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase |-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0708 Exonuclease III -------------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein) --||||------|---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0713 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K) |||-----||---||---|||---|-----||||-||-----|||||||||||--||||------- 1 [C] COG0716 Flavodoxins |||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-||||||||||||||||| 1 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase -----------------|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase ||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---||||||||||||| 1 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [P] COG0725 ABC-type molybdate transport system, periplasmic component --|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||-- 1 [G] COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase -|||--|||-||------||-|---------||---------|||||-||--|--||||-|-|--- 1 [R] COG0727 Predicted Fe-S-cluster oxidoreductase ----------------|||||||||||||||-----------|||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor |||||||||||||||--||||---------|-------------------------|||------- 1 [C] COG0731 Fe-S oxidoreductases ----------------||||----||----||||-|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains) -----------------|||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase ----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|-- 1 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase |||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||-- 1 [H] COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A ------------------||----------------------------||||----|||||-|--- 1 [P] COG0748 Putative heme iron utilization protein -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit ------------------|-----------------------|||||---|-----||||---|-- 1 [E] COG0754 Glutathionylspermidine synthase --|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component -----------------|||||----|||||-----||-------|-||||||--|||||||||-- 1 [E] COG0757 3-dehydroquinate dehydratase II ----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-| 1 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake ----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||- 1 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein -------------|||||||||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0763 Lipid A disaccharide synthetase ----------------||||||||------||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 1 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2 |||------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase ----||----------||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit |||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [C] COG0778 Nitroreductase ----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------|-|---||||-------------||-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0781 Transcription termination factor ---|--------------||||--|||----|||||||-|--|||||-|||||--|||||-|-||| 1 [P] COG0783 DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant) --------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0787 Alanine racemase ---|------------|-||-|----|||-------||----|||-|-|||||--|||||||-|-- 1 [F] COG0788 Formyltetrahydrofolate hydrolase ------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [M] COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins) ----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||-- 1 [L] COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase ----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [M] COG0796 Glutamate racemase |-|---|-|----|---|||------|||-|----||--------------|--|----|------ 1 [P] COG0798 Arsenite efflux pump ACR3 and related permeases ----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein -----------------|||----|-----||||--||----|||||-||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0800 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||-||||--- 1 [E] COG0804 Urea amidohydrolase (urease) alpha subunit --||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC ----------------||||||--||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing ----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II ----------------||||||---|----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase ----------------||||-|||||||||------------|||||-||||-||||||||||||| 1 [M] COG0815 Apolipoprotein N-acyltransferase ----------------||||||||--|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis) -----------------||||||||-||||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit -----------------|||-|--------||||||||----|||||-|||||||||||||||--- 1 [M] COG0818 Diacylglycerol kinase ----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||-- 1 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit ----------------|-||--||||----|||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0828 Ribosomal protein S21 --------------|---||-|----|-------|--||----||----||----|||-||||--- 1 [O] COG0829 Urease accessory protein UreH --------------|---||-|----|||-----|--||----|||---||----|||-||||--- 1 [O] COG0830 Urease accessory protein UreF --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||-||||--- 1 [E] COG0831 Urea amidohydrolase (urease) gamma subunit --------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||--|||--- 1 [E] COG0832 Urea amidohydrolase (urease) beta subunit --||--|||-------||||-|--------|-----------|||||-||--|---||-|||||-| 1 [M] COG0836 Mannose-1-phosphate guanylyltransferase ------------------||----------------------|||||--|--||||||-|||||-- 1 [G] COG0837 Glucokinase --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0838 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 3 (chain A) --||||--|--||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0839 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J) ----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases ----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||--- 1 [D] COG0850 Septum formation inhibitor ------------------||||--------------------||||||||--||||||-||||--- 1 [D] COG0851 Septum formation topological specificity factor --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit ----------------||||-|----|||||---||||----|||||--|--||||||||--||-- 1 [H] COG0853 Aspartate 1-decarboxylase ----------------|-||----------------------|||||-||--||||||||||||-- 1 [H] COG0854 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein --|---------------||-|-----||||------|----|||||-||--||||||||||||-- 1 [P] COG0855 Polyphosphate kinase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A ----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||---||-- 1 [M] COG0859 ADP-heptose:LPS heptosyltransferase ------------------||-|----|||-|---||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [P] COG0861 Membrane protein TerC, possibly involved in tellurium resistance ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG1003 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), C-terminal domain -|||---||--|----|-||------|||---|---||----|||||-||-||--|--|||||||| 1 [M] COG1004 Predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1005 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 1 (chain H) --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1007 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N) ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG1010 Precorrin-3B methylase |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 1 [C] COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit |||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||-- 1 [C] COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit ---|----|-|-|||||-|||---||||||---------------|--||||-------------- 1 [I] COG1022 Long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming) ----------------||||-|-----||-|-----------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1034 NADH dehydrogenase/NADH:ubiquinone oxidoreductase 75 kD subunit (chain G) |||-----||--------||----------------------------------------|----- 1 [C] COG1035 Coenzyme F420-reducing hydrogenase, beta subunit ----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase --||----------|--|||------||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [E] COG1045 Serine acetyltransferase ------------------||----------------------|||||-||-|||||||||------ 1 [C] COG1049 Aconitase B ----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||-- 1 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases ||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit ------------------||-|||--|----||||||-----||||||||--|--|---||||||| 1 [R] COG1054 Predicted sulfurtransferase ----|||||-|||----||||-||---|||----||||----||||--||---|||--||--|--- 1 [P] COG1055 Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases |||||||||-|||-----|--|-----||--|----------|||||---||---|---------- 1 [H] COG1056 Nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase -------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase ---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||-- 1 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA -----------|-||---||------||||-------|----|||||--||--|||---|||||-- 1 [C] COG1062 Zn-dependent alcohol dehydrogenases, class III --|-||----|||||---||------||||-||||-||----|||-|--|--|||||||||||--- 1 [R] COG1064 Zn-dependent alcohol dehydrogenases ----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease --------|---|||--|||----|||||-||-|||||----|||||--|||---|---||||--- 1 [G] COG1070 Sugar (pentulose and hexulose) kinases ---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---||||||| 1 [C] COG1071 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, alpha subunit --------|----||---||-|----|---|---|-||-|--------||--|--|---------- 1 [R] COG1075 Predicted acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold -------------|||--|-----------------------||||||||||-|||--|||||||| 1 [O] COG1076 DnaJ-domain-containing proteins 1 --|---------------|-------------------------------||-|--|-|------- 1 [M] COG1083 CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase |-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||-- 1 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase ----||------------||------||||----||||----|||||--||||------------- 1 [R] COG1090 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase |-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-|||| 1 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase |||||-||||-|-||||||-|------||||---|---|||||||-|--|--|---|--------| 1 [L] COG1112 Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits -||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||-- 1 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components |||-|----|-|------|||-----||||----|-------|||||-|------|||-||-|--- 1 [R] COG1123 ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 1 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component ------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component ----------------||||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component |--|---||-|-|----|||-------||-||||||||---------------------------- 1 [C] COG1141 Ferredoxin |||---||||-------|||----------------------|||||------------------- 1 [C] COG1142 Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2 |||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I) ||||||-|||||-----|||-|----|||||-----------|||-|-||--|--||||||||||| 1 [C] COG1146 Ferredoxin ----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||-- 1 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1159 GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1160 Predicted GTPases -||---||-|||||||-||||----|----||||||||||||------|----||----------- 1 [R] COG1161 Predicted GTPases --|-------------|||||----||||||||||||||||||||||-||||||||------|--- 1 [R] COG1162 Predicted GTPases ---|--------------||------||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 1 [H] COG1165 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase ---|--------------||------||||-|--|||-----|||||-||||---------|---- 1 [HQ] COG1169 Isochorismate synthase ---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [E] COG1171 Threonine dehydratase -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase) -------------||-|||||||||||||||||-||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1186 Protein chain release factor B --|-----|-------|||||----|||||||||-|||||----------------|||||||||| 1 [J] COG1189 Predicted rRNA methylase --|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||----- 1 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II) ----------------||||--|||--||-|---||||----|||||-||-----||||------- 1 [K] COG1191 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit |-||--||--------||||||---|----||||||||------------------|||------- 1 [L] COG1193 Mismatch repair ATPase (MutS family) ----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------||||||| 1 [L] COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway) -||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||-- 1 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases -----------------|||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase ||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|-- 1 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases ----------------||||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [LK] COG1200 RecG-like helicase ----------------||||||---------|||||||---------------------|||||-- 1 [J] COG1206 NAD(FAD)-utilizing enzyme possibly involved in translation ----------------||||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains) |-|||||||--||----|||-|----|||||||---||----|||||--|--||||---||-||-- 1 [M] COG1209 dTDP-glucose pyrophosphorylase ------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone |-|--||||---|-----||-|----|||||-----------|---|--||-|--|---||-||-- 1 [R] COG1216 Predicted glycosyltransferases ------------------||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [T] COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response -------------||-|-||--||--||||------------|||||||||||-----|||||||| 1 [P] COG1218 3'-Phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit -----------------|||----------|----||-----|||||-||-----|---------- 1 [KT] COG1221 Transcriptional regulators containing an AAA-type ATPase domain and a DNA-binding domain ------------------||-|----|||-------|------------|-----|------||-- 1 [E] COG1231 Monoamine oxidase ||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---||||||| 1 [R] COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I -||||||-|-||||||--||-|--------------------------||-----|---||-||-- 1 [J] COG1236 Predicted exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing ||||||---|--------||------|||--------------------|-----|---------- 1 [H] COG1240 Mg-chelatase subunit ChlD --|-------|-|-----||-|----|---||-|||||----|||-|-||-----|---|||||-- 1 [M] COG1247 Sortase and related acyltransferases --||----|-|||---||||--||--||||------------------------------------ 1 [S] COG1259 Uncharacterized conserved protein --|-----------|---||--||---||-------||----------||-|||||---|||||-- 1 [S] COG1262 Uncharacterized conserved protein |-||--|||--------||||||-|-|---||||||||---------------------||||-|| 1 [R] COG1268 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||-----||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---||||--- 1 [H] COG1270 Cobalamin biosynthesis protein CobD/CbiB --||||--|-------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 1 [C] COG1271 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1 |-|-||--|||||----||--|----|---------||----|||||-|||||--|--||||||-- 1 [E] COG1280 Putative threonine efflux protein ----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family ------------------||-------|||------------|||||-||||-|||---||||||| 1 [C] COG1282 NAD/NADP transhydrogenase beta subunit ----------------|-||||--|--||-||-|-|||----|||||--|||---|---|||---- 1 [S] COG1285 Uncharacterized membrane protein ------------------|--|------------|||-----|||||-||||||||--|||||--- 1 [S] COG1289 Predicted membrane protein ||||||||||||||||-|||||---|----||||||||------------------|||------- 1 [K] COG1293 Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP --||------------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--|||||||| 1 [C] COG1294 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2 --|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG1295 Predicted membrane protein |||---||||--|-----||-------||-|---|-||-----------|------------||-- 1 [S] COG1300 Uncharacterized membrane protein |||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----||||||| 1 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases |-|||||||||||||||-||-|-----||--------------||||--|-----|---------- 1 [R] COG1310 Predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily ----------------|-|||||||||||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG -----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [K] COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains ----------------|-||------||||------||---------------|||---------- 1 [O] COG1333 ResB protein required for cytochrome c biosynthesis |||------|--------|||---------|-----------------------------|-|--- 1 [P] COG1348 Nitrogenase subunit NifH (ATPase) ---|||||--|||---||||--|||||||||-------------------------|||-----|| 1 [F] COG1351 Predicted alternative thymidylate synthase -||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [S] COG1354 Uncharacterized conserved protein --||--------------|-||----|||-||-|-||-----|||||-||-|-|||---||-||-- 1 [S] COG1359 Uncharacterized conserved protein |||-----||---||-||||-|----||||||--||||-----------|---|||---|||||-- 1 [E] COG1364 N-acetylglutamate synthase (N-acetylornithine aminotransferase) ------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---||||||| 1 [L] COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) ----------------||||||--||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-|||||--------|||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [K] COG1386 Predicted transcriptional regulator containing the HTH domain -------------||---||-----------------------------|-----|--------|| 1 [I] COG1398 Fatty-acid desaturase ----------------||||-|----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [R] COG1399 Predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein |-|---|---||----|-|--|-----------|--|-----|--|----------|||------- 1 [V] COG1401 GTPase subunit of restriction endonuclease -----------------|||-|----|||||------|----|||||-|||-|--|---|||||-- 1 [E] COG1410 Methionine synthase I, cobalamin-binding domain -----------------||||-||--||||||||||||||||----------|--|||||||||-- 1 [K] COG1420 Transcriptional regulator of heat shock gene ||-|--||-||------|||----||--------------------------|--|---|||||-- 1 [S] COG1430 Uncharacterized conserved protein ----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---||||||| 1 [S] COG1434 Uncharacterized conserved protein ---|||||--||--|---||----------------------|||-|-|------|---|---|-- 1 [E] COG1446 Asparaginase -||-||||--||----|-||----|----------------------------------------- 1 [G] COG1449 Alpha-amylase/alpha-mannosidase ----------------|-||-|--------------------|||||--|---|||-------|-- 1 [M] COG1462 Uncharacterized protein involved in formation of curli polymers ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit -----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---||||||| 1 [G] COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases -----------------||||--||-----|----|||---------------------------- 1 [R] COG1480 Predicted membrane-associated HD superfamily hydrolase --|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||--- 1 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase |---||--|-|||---||||----------|------|----|||||-||||-------|||-|-- 1 [R] COG1489 DNA-binding protein, stimulates sugar fermentation ||||||--||-|------||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---|||||-- 1 [H] COG1492 Cobyric acid synthase --|---------------||||----|||||-----||----|||-|-|-||---------|||-- 1 [G] COG1494 Fructose-1,6-bisphosphatase/sedoheptulose 1,7-bisphosphatase and related proteins ----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein ----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-||||||| 1 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes ---|||||--|||||---|-||------------|-||-----------|--|------|---|-| 1 [E] COG1506 Dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases -----------------|||----|------|----||----|||----|-|---|-----|||-- 1 [R] COG1512 Beta-propeller domains of methanol dehydrogenase type ----------------|-||----------------------|||----|-----|---------- 1 [P] COG1513 Cyanate lyase ----------------||||||--||-||||----|||-|---------|--|||||||----|-- 1 [K] COG1521 Putative transcriptional regulator, homolog of Bvg accessory factor ---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG1530 Ribonucleases G and E -||-|-|||||||----||-|------||-|-----||-----------|-----|---|||||-| 1 [L] COG1533 DNA repair photolyase ----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [MU] COG1538 Outer membrane protein -------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase ------||----------||----|--||||------|---------------------------- 1 [S] COG1543 Uncharacterized conserved protein ----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---||||||| 1 [J] COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1) ---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||-- 1 [R] COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced) ---|||----|||---|-||-|------------|-||---------------------------- 1 [S] COG1547 Uncharacterized conserved protein ||----|----------|||--------------------------------------------|| 1 [P] COG1563 Predicted subunit of the Multisubunit Na+/H+ antiporter ----------------|-||--------------------------------|||||||||||||| 1 [S] COG1565 Uncharacterized conserved protein --|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--||||||||||||| 1 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase ---|-------------||||-----||||-|--|||-----|||||-|-||-------------- 1 [H] COG1575 1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase ||-|--||-||||----|||||----|||||-----------|||||-||-||------|||||-- 1 [OU] COG1585 Membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity ||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||--- 1 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase ------------------||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 1 [M] COG1589 Cell division septal protein ----------------||||----------------------|||-|-||-|||||--||||||-- 1 [M] COG1596 Periplasmic protein involved in polysaccharide export ----|--------||--|||-|----|||-||||||||----|||||--|---------||-||-- 1 [IR] COG1597 Sphingosine kinase and enzymes related to eukaryotic diacylglycerol kinase |-|-----|---------||-|--------|-|-||||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [C] COG1600 Uncharacterized Fe-S protein |||-----||-------|||----------|----------------------------------- 1 [R] COG1606 ATP-utilizing enzymes of the PP-loop superfamily ---|--------|||-|-||-|----||||----||||-----------|--|--|---||||||| 1 [O] COG1612 Uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly ------------------||-------|||-------|----|||||--|--||||---|||||-- 1 [P] COG1613 ABC-type sulfate transport system, periplasmic component --------|---------||------|||||----------------------------------- 1 [S] COG1615 Uncharacterized conserved protein ----||------------||||--|-----||-|-|||-|--|||-|-||---|||--------|| 1 [V] COG1619 Uncharacterized proteins, homologs of microcin C7 resistance protein MccF -|||--||||------|-||-|||||----||||||||-|||------------------------ 1 [S] COG1624 Uncharacterized conserved protein |||---||-|--------||-|--------|----------------------------------- 1 [C] COG1625 Fe-S oxidoreductase, related to NifB/MoaA family -----------------||-|---|-|---------||----|--||-||||---|---||-||-- 1 [G] COG1638 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, periplasmic component ----------|-----|-||||||-||||--|||--------|||||-||||---|---------- 1 [G] COG1640 4-alpha-glucanotransferase |||-----||-------|||------|---|----------------------------------- 1 [S] COG1641 Uncharacterized conserved protein ---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG1651 Protein-disulfide isomerase --|------|---||---||----------------|----------------------------- 1 [I] COG1657 Squalene cyclase |||---||--||-----||||------------------------|------------|------- 1 [R] COG1672 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) |||-----||-------|||------|---|----------------------------------- 1 [R] COG1691 NCAIR mutase (PurE)-related proteins --|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-| 1 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase ---------||-|---||||-|----||||-|||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [T] COG1702 Phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase -----------------||-||--|-----||||||||||||------------------------ 1 [H] COG1713 Predicted HD superfamily hydrolase involved in NAD metabolism |--------|--------||-------||||----|||----------|||--||||||||||||| 1 [S] COG1714 Predicted membrane protein/domain ----|------|-----|||------|||-|-||||||---------------------------- 1 [K] COG1725 Predicted transcriptional regulators ||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||-- 1 [K] COG1733 Predicted transcriptional regulators --|-||----|-------||------|||-|-----------|||||-||-|---|---|||||-- 1 [R] COG1741 Pirin-related protein --|---------------|--------||-----|-||----|||-|--|-----|---||-||-- 1 [S] COG1742 Uncharacterized conserved protein ----|||-|-|-|||---||-|-----------|---|----------|--|----|||||||--- 1 [E] COG1748 Saccharopine dehydrogenase and related proteins -------------||||||-|---|--|||-|----||----|||-|-||--||||---||||||| 1 [R] COG1752 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily ------------------||-|---|||||----------------------|------||||||| 1 [R] COG1754 Uncharacterized C-terminal domain of topoisomerase IA ||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega ||-----||--------||||---|--||-|-----------|||-|--|--||||-------|-- 1 [C] COG1773 Rubredoxin -----------------||--|---------------|------------------||-------- 1 [V] COG1787 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase and Mrr-like restriction enzymes ||||||--||||------||||-----||-|----|-|--------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG1797 Cobyrinic acid a,c-diamide synthase ------------------|||-----||||||||||||---------------------------- 1 [S] COG1799 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------||------|----|----|||----|||||-|-||---|---|||---- 1 [G] COG1803 Methylglyoxal synthase ------------------||--||---------------------|--||||-||-------|--- 1 [C] COG1805 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrB -|||----|---|-----||-------------|-------------------------------- 1 [S] COG1808 Predicted membrane protein |||------|---|----|--|-----||||-----|------||||-||------------|--- 1 [GC] COG1819 Glycosyl transferases, related to UDP-glucuronosyltransferase ----------------||||-|||||||||----||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc) ||||||||||||----||||-|----||||-|--||||--------------------|-||||-- 1 [F] COG1828 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, PurS component --|---------|-----||-------||-|-----||-----------|----------|-|--- 1 [E] COG1834 N-Dimethylarginine dimethylaminohydrolase |||||||||-|-------||-----------------|---------------------------- 1 [S] COG1836 Predicted membrane protein ----------------||||||||||-|||||||-|||------------------|||------- 1 [R] COG1837 Predicted RNA-binding protein (contains KH domain) -----------------|||||--||-|||||||-|||---------------------------- 1 [R] COG1847 Predicted RNA-binding protein -||---|||---------||----------------|-----------------------|-|--- 1 [G] COG1850 Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase, large subunit ||||||-||-||-----|||------|||-----|--|-----------|||---|---||-|--- 1 [R] COG1878 Predicted metal-dependent hydrolase |-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---||||||| 1 [C] COG1894 NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit |||-----||--------||---------------------------------------------- 1 [S] COG1900 Uncharacterized conserved protein |||-||--||||------|||---------|----|----------|--|-----|---|-|---- 1 [H] COG1903 Cobalamin biosynthesis protein CbiD |-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---||||||| 1 [C] COG1905 NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit ||------||--------||---------------------------------------------- 1 [S] COG1915 Uncharacterized conserved protein |||----|||-------||--|--------||--||------|||||-||--|--|-||----|-- 1 [P] COG1918 Fe2+ transport system protein A -------------|||--||------||||------------------------------------ 1 [O] COG1928 Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase ------------------|-------|||-||||||||----|||||-||||-||----------- 1 [G] COG1929 Glycerate kinase ----------------|-||----------------------|||||-||||||||||||||||-- 1 [S] COG1934 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|----||||||--||||----|||-|--|-----|--|||----- 1 [S] COG1937 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------||||---------||||||||---------------------------- 1 [S] COG1939 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||-- 1 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase |||---||||--------||---------------------------------------------- 1 [C] COG1941 Coenzyme F420-reducing hydrogenase, gamma subunit ----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase ------------------||-|----||||-----|||-----------------|---------- 1 [S] COG1950 Predicted membrane protein ----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator -----||---|-------||-|----|||-|-||||||----|||||-||--|--|---|||||-- 1 [L] COG1961 Site-specific recombinases, DNA invertase Pin homologs -----------------|||-|--||-----|---|||---------------------------- 1 [S] COG1963 Uncharacterized protein conserved in bacteria |--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||-- 1 [V] COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein --|---------------|-||----||||-||||||-----|||||-|||||--|---|||||-- 1 [M] COG1970 Large-conductance mechanosensitive channel -----------------|||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|---|||||-- 1 [KT] COG1974 SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidases) ------------------||-----------------------------|--|||||||||||||| 1 [S] COG1981 Predicted membrane protein ------------------|||------||||--|||||----|||||-||||---|----|----- 1 [E] COG1982 Arginine/lysine/ornithine decarboxylases ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis ||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 1 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases ||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||-- 1 [R] COG1994 Zn-dependent proteases ----------------|-|||----------------|----|||||-||-|||||||||||||-- 1 [H] COG1995 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein ---|--|||-|||-----||-------||-|----|||----|||--------------||-|--- 1 [K] COG2002 Regulators of stationary/sporulation gene expression --|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--| 1 [L] COG2003 DNA repair proteins |-|-----|--------|||---------------------------------------------- 1 [S] COG2006 Uncharacterized conserved protein ----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||-- 1 [G] COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes --|---|||---||||--||-------||-|-----------------|-||---|----|||--- 1 [O] COG2020 Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase ----------------|-||||----|||||-----||----|||||-||--||||--||||||-- 1 [H] COG2022 Uncharacterized enzyme of thiazole biosynthesis -||---|-|---|-----|||------||----|--------|--||-|------|---||----- 1 [JD] COG2026 Cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system |||||||||||||-----||||----|||||------|----|||-|-||-----|---|||||-- 1 [H] COG2038 NaMN:DMB phosphoribosyltransferase -------------||---|--------||||-----|-----|----------------|--|--- 1 [E] COG2040 Homocysteine/selenocysteine methylase (S-methylmethionine-dependent) ||--||---|-------|||-|--------|-----|------------------|---------- 1 [HR] COG2045 Phosphosulfolactate phosphohydrolase and related enzymes -------||-|||||-|-||-|--------------||--------------------|------- 1 [P] COG2046 ATP sulfurylase (sulfate adenylyltransferase) |||-----||-|----|-||--------------------------------------|------- 1 [C] COG2048 Heterodisulfide reductase, subunit B -----------------|||----------|-----||---------------------------- 1 [S] COG2052 Uncharacterized protein conserved in bacteria -|---------------|||||---||---------||-|--------||-----|---||-||-- 1 [P] COG2059 Chromate transport protein ChrA ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||-- 1 [P] COG2060 K+-transporting ATPase, A chain --------|-|||---|-||------||||------------|||||-|||||--|--||||||-- 1 [T] COG2062 Phosphohistidine phosphatase SixA ------------------||||----|||-||||||||-----------|||---|---------- 1 [F] COG2065 Pyrimidine operon attenuation protein/uracil phosphoribosyltransferase ------------------|||-----|---------||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [E] COG2066 Glutaminase -------------||---|--|----||||------||-----------|-----|---||-||-- 1 [P] COG2072 Predicted flavoprotein involved in K+ transport ||-|||--||||------|||---------|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2073 Cobalamin biosynthesis protein CbiG ------------------||----------||||||||----|||||-||||---|---|||-|-- 1 [R] COG2081 Predicted flavoproteins |-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||-- 1 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases ------------------||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||--- 1 [H] COG2087 Adenosyl cobinamide kinase/adenosyl cobinamide phosphate guanylyltransferase -------------||---||----------|---|-||----|||-|---|||--|---------- 1 [H] COG2091 Phosphopantetheinyl transferase ||----------------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2099 Precorrin-6x reductase ------------------||-|--------||--|-||----|||||-|-||--------|-|--- 1 [R] COG2103 Predicted sugar phosphate isomerase |-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||-- 1 [H] COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis -||---|---||------||-|--------------||----|||||-||-----|---------- 1 [S] COG2105 Uncharacterized conserved protein --||||||--|------|||||-----||-------------|||||-||-----|---||||--- 1 [H] COG2109 ATP:corrinoid adenosyltransferase ||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--|| 1 [P] COG2111 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhB subunit ---|---------||---||-|----|||||-----||-----------|--|--|--||||||-- 1 [Q] COG2124 Cytochrome P450 ----------|-------||-|---|-|||-------|----|||-|--|--|--|---||-||-- 1 [G] COG2133 Glucose/sorbosone dehydrogenases --|---|||---------|-----------------|---------|--------|---||-|--- 1 [GR] COG2140 Thermophilic glucose-6-phosphate isomerase and related metalloenzymes |||------|--------|----------------------------------------------- 1 [R] COG2144 Selenophosphate synthetase-related proteins --||||----||--|---||-|----||------|-||----|||||--|--|--|---||-||-- 1 [PR] COG2146 Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenases ----------------|-||------|||-------------|||-|------------------- 1 [S] COG2149 Predicted membrane protein --------------|---|-------|||--|-----|----|||-|-||-----------|---- 1 [R] COG2153 Predicted acyltransferase ---|------||-||-|-||------||||------------------||--|--|----||||-- 1 [H] COG2154 Pterin-4a-carbinolamine dehydratase ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||-- 1 [P] COG2156 K+-transporting ATPase, c chain ---|--||-|-||-----|-------|||-|---||-----------------------||-||-- 1 [R] COG2159 Predicted metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold ------------------||-|||---||-------------|||||-|||||------|||||-- 1 [R] COG2166 SufE protein probably involved in Fe-S center assembly ---|--------------||------|||-------------|||-|--|-----|---------- 1 [S] COG2170 Uncharacterized conserved protein ------------------||-------||-------------|||-|---------------||-- 1 [M] COG2173 D-alanyl-D-alanine dipeptidase -----------------|||-|---------|||||||---------------------------- 1 [R] COG2179 Predicted hydrolase of the HAD superfamily ----------------|-||-------||--------------------|------------||-- 1 [S] COG2187 Uncharacterized protein conserved in bacteria -|----||-|--------|--|---------------------------|-----|----|-|--- 1 [O] COG2192 Predicted carbamoyl transferase, NodU family ------------------||-|-----||-|---||------|||||-||-----|--|||-||-- 1 [T] COG2205 Osmosensitive K+ channel histidine kinase ------------------|||---------||----|-----|||||----------------|-- 1 [G] COG2211 Na+/melibiose symporter and related transporters ---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|--|||-||-- 1 [P] COG2216 High-affinity K+ transport system, ATPase chain B |----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----||||||| 1 [P] COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain) ||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2241 Precorrin-6B methylase 1 ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2243 Precorrin-2 methylase ---||||||||||-----||------||||||-||||-----|---|--|-----|------||-- 1 [S] COG2246 Predicted membrane protein ------||---------|||------||||------------------------------------ 1 [R] COG2251 Predicted nuclease (RecB family) -|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|-- 1 [R] COG2252 Permeases -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit -|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [R] COG2262 GTPases ----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase ------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase ------------------||------|----|----||----|||-|--|------------|--- 1 [S] COG2268 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||||---------|||||||---------------------------- 1 [S] COG2302 Uncharacterized conserved protein, contains S4-like domain --|-----|--||-----||||---|||||------||----|--||-||------------|--- 1 [R] COG2304 Uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain ------------------|--|-----|||-------------------|-----|---||-||-- 1 [S] COG2307 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------|------|--|-----|||-------------------|-----|---||-||-- 1 [S] COG2308 Uncharacterized conserved protein ------------------|--|--------|-----|------|||-------------------- 1 [T] COG2310 Uncharacterized proteins involved in stress response, homologs of TerZ and putative cAMP-binding protein CABP1 ------------------|--|--------------||-----------|---------||||--- 1 [S] COG2318 Uncharacterized protein conserved in bacteria |--|--------------||-|-------------------------------------------- 1 [S] COG2324 Predicted membrane protein --|---------------||-|----|||-------------------||-----|--||||||-- 1 [S] COG2326 Uncharacterized conserved protein |----------------|||-|--------|-----------|||-|------------|-|---- 1 [S] COG2327 Uncharacterized conserved protein --|---------------|-||--------------||----|||||-||---|||---|||||-- 1 [R] COG2334 Putative homoserine kinase type II (protein kinase fold) ----||------------||-|----||||-------|-------|--|----------------- 1 [K] COG2345 Predicted transcriptional regulator ------------------|--|----||||----|-||-----------------|--||||||-- 1 [R] COG2346 Truncated hemoglobins ------------------||||----|---|-----|-----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [S] COG2350 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|----|--|--||--------|||||-||||-|||-------|-- 1 [C] COG2352 Phosphoenolpyruvate carboxylase ---|----|---|-----|--|---------------|----------||-|--------||--|| 1 [R] COG2358 TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component ------------------||-|--------------------|||||-||--||||--||||||-- 1 [O] COG2360 Leu/Phe-tRNA-protein transferase ----||--|-|||-----||-|---------------------------|-----|-----|-|-- 1 [R] COG2366 Protein related to penicillin acylase ------------------||||-----||||||||||----------------------||----- 1 [V] COG2367 Beta-lactamase class A ----------------|-||-|---------------------------|-----|---|--|--- 1 [O] COG2370 Hydrogenase/urease accessory protein ------------------||-|----|-------|--||----|||---||----|||-||||--- 1 [O] COG2371 Urease accessory protein UreE ------------------||-|--|-|-----|---------------||---------------- 1 [R] COG2374 Predicted extracellular nuclease ---------|--------||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG2377 Predicted molecular chaperone distantly related to HSP70-fold metalloproteases --|-------------|-||-|-------------------------------------------- 1 [R] COG2389 Uncharacterized metal-binding protein ---|---||-|-----|-||-------|-------------------------------------- 1 [R] COG2402 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain |-----||-||-|-----|----------------------------------------------- 1 [R] COG2403 Predicted GTPase --------|---|-----||---------------------------------------------- 1 [R] COG2405 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain --|---||||||-----||-|---------||-----|----------|--------------|-- 1 [R] COG2509 Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases --|---||---|----|||----------------------------------------------- 1 [R] COG2516 Biotin synthase-related enzyme ------------------||--------------|-|------------|-----|--||--|--| 1 [V] COG2602 Beta-lactamase class D ----||------------|--------||-|---------------------------|------- 1 [R] COG2605 Predicted kinase related to galactokinase and mevalonate kinase ----------------|-||----------|------------------|---|||--||||||-- 1 [R] COG2607 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) --||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||---- 1 [P] COG2608 Copper chaperone ------------------|-----------|-----||-----------|-----|---------- 1 [R] COG2715 Uncharacterized membrane protein, required for spore maturation in B.subtilis. -----------|-||---||-------|||||||-|||----|||||-||-|-|||--||||||-- 1 [E] COG2755 Lysophospholipase L1 and related esterases ---------||-------||-|----||||||--||||----|||||-||-----|---|||||-- 1 [K] COG2771 DNA-binding HTH domain-containing proteins --|-||--|----||---||||----|||--|||||-|||--|||||-|||--|||---|||||-- 1 [L] COG2801 Transposase and inactivated derivatives --------------|---||-|-----||-------------------||-----|---|||||-- 1 [R] COG2802 Uncharacterized protein, similar to the N-terminal domain of Lon protease ------------------||----------------------||||||||||-|||---|||||-- 1 [M] COG2821 Membrane-bound lytic murein transglycosylase ------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|-- 1 [U] COG2831 Hemolysin activation/secretion protein ------------------|------|-----------------||---|---------|------- 1 [S] COG2859 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|----------||---|-----------------||----|||||--|---|||-------|-- 1 [E] COG2866 Predicted carboxypeptidase ||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||--- 1 [H] COG2875 Precorrin-4 methylase ----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------ 1 [E] COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase ---|--|||-|-|-----||---------------------------------------------- 1 [S] COG2886 Uncharacterized small protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors ----------------||||||--------|----|||----||||||||--||||||-||||--- 1 [D] COG2894 Septum formation inhibitor-activating ATPase |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG2896 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme ------------------|---------|-------------||-||-||--||||-------|-- 1 [P] COG2906 Bacterioferritin-associated ferredoxin ------------------||--------------------------|-|---|||-----||-|-- 1 [S] COG2929 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|--------||--|--||----------------|-------|-||-- 1 [R] COG2936 Predicted acyl esterases ------------------||----------------------|||-|-----|--|---|||||-- 1 [G] COG2942 N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase --------------|---||-|---------------------------|--|--|---||||--- 1 [S] COG2947 Uncharacterized conserved protein --||--------------||-------||--------|----|||||-|---|------|||||-- 1 [S] COG2968 Uncharacterized conserved protein ------------------|-----------------------|||||-||||-------||||--- 1 [E] COG2981 Uncharacterized protein involved in cysteine biosynthesis ------------------||----------------------|||||-||---------------- 1 [E] COG2988 Succinylglutamate desuccinylase ------------------|-----------------------------|----|-|----|----- 1 [O] COG2994 ACP:hemolysin acyltransferase (hemolysin-activating protein) ------------------||------|-------|-------|||||-|--|-------------- 1 [G] COG3001 Fructosamine-3-kinase ------------------||--------------|-||-------|--||--|--|------||-- 1 [S] COG3011 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|-----------------------|||||-||-||-||---|||||-| 1 [C] COG3038 Cytochrome B561 |--|--------------|-----------------------------|----------|---|-- 1 [R] COG3046 Uncharacterized protein related to deoxyribodipyrimidine photolyase --|---------------|------------|--|-|---------|-|----------|-||--- 1 [M] COG3049 Penicillin V acylase and related amidases ------------------|--|--------------------|||||--|--|--|---||-|--| 1 [NU] COG3121 P pilus assembly protein, chaperone PapD ------------------||-----------------------------|--|--|---|||||-- 1 [S] COG3146 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||----------------------|||||-||--||||------|--- 1 [NU] COG3166 Tfp pilus assembly protein PilN ------------------||------|---------------------||-----|---||-||-- 1 [ER] COG3185 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase and related hemolysins --|---------------|-||----|---------------|||||-||-----||||||||--- 1 [O] COG3187 Heat shock protein ------------------|-----------------------|||||--|--|--|---|--|--| 1 [NU] COG3188 P pilus assembly protein, porin PapC ------------------|-----------------------|||-|--|---------------- 1 [S] COG3204 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------||||----------------------|||-|-||-||--|---|||||-- 1 [M] COG3206 Uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis ------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|-- 1 [U] COG3210 Large exoproteins involved in heme utilization or adhesion ------------------|-----------------------------||---------||||--- 1 [S] COG3216 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-------||--------------------|---------------- 1 [S] COG3222 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||----||-----------------------|---------------- 1 [N] COG3225 ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component ------------------||----------------------|||||--|-----|---------- 1 [S] COG3228 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------|---------|--------|||------------------||-----|---||-|||| 1 [I] COG3243 Poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase ----------||------|------------------------------|---|||---|||---- 1 [P] COG3256 Nitric oxide reductase large subunit ------------------|------------------------------|-----|--|--|---- 1 [C] COG3258 Cytochrome c |||---||||--------||---------------------------------------------- 1 [C] COG3259 Coenzyme F420-reducing hydrogenase, alpha subunit ---|-----------|--|--------|||-------------------|-----------|---- 1 [S] COG3268 Uncharacterized conserved protein ------------------||-------|-|------------|||||-||||-|||---||||||| 1 [C] COG3288 NAD/NADP transhydrogenase alpha subunit ------------------||----------------------------|---|------------- 1 [T] COG3292 Predicted periplasmic ligand-binding sensor domain ------------------||-|------------|--------------|---------------- 1 [S] COG3296 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|-----------------|---------|--|-----|---||-||-- 1 [T] COG3300 MHYT domain (predicted integral membrane sensor domain) --|-||-----|------|--------||-||-----||----||||--------|----|-|--- 1 [L] COG3328 Transposase and inactivated derivatives ------------------||-------||--------|-------------------------|-- 1 [R] COG3329 Predicted permease -----------------|||----------|------|---------------------------- 1 [S] COG3330 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-|---------------||----------|-----||-----------------|---|||||-- 1 [S] COG3339 Uncharacterized conserved protein ----|-------------|-----------------||-------|-------------||-|--- 1 [S] COG3347 Uncharacterized conserved protein ---|--------------||-----------------------------|-----|---------- 1 [R] COG3380 Predicted NAD/FAD-dependent oxidoreductase ------------------|||----------------|----|--||---||-------||||--- 1 [S] COG3395 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---------------||-|----|||||-----||----------|------|---||||--- 1 [M] COG3409 Putative peptidoglycan-binding domain-containing protein ---|------------||||-|---------------|-----------------|---------- 1 [C] COG3411 Ferredoxin ------------------||-|----||||------------------------------------ 1 [G] COG3429 Glucose-6-P dehydrogenase subunit ------------------||------|||||||||------------------------------- 1 [R] COG3442 Predicted glutamine amidotransferase ------------------|------------------------------|-----|---||-|--- 1 [T] COG3448 CBS-domain-containing membrane protein ------------------||----------------------------|-----------|-|--- 1 [T] COG3452 Predicted periplasmic ligand-binding sensor domain ----||||----------|----------------------------------------------- 1 [S] COG3463 Predicted membrane protein --|-----|-----|---||----------||----|----------------------||----- 1 [T] COG3476 Tryptophan-rich sensory protein (mitochondrial benzodiazepine receptor homolog) ------------------|------------------------------|-----|------|--- 1 [O] COG3484 Predicted proteasome-type protease ------------------|--------|||------------------------------|-|--- 1 [V] COG3510 Cephalosporin hydroxylase -------------|----|--------------||--------------------|---||-||-- 1 [S] COG3542 Uncharacterized conserved protein ------------------||-|----|---------------------------------|-|--- 1 [S] COG3544 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|------------------------------|-----|------|--- 1 [S] COG3556 Predicted membrane protein ------------------|------------------------------|---------|--|--- 1 [S] COG3558 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|------------------------------|---------|--|--- 1 [R] COG3565 Predicted dioxygenase of extradiol dioxygenase family ---------------|--|-|---------|---|-----------------|------||-|--- 1 [G] COG3588 Fructose-1,6-bisphosphate aldolase -||---------------|-|---------------------|||||-||-|-------|--|--- 1 [L] COG3593 Predicted ATP-dependent endonuclease of the OLD family ------------------||----------------------|||---|-----|--|-------- 1 [R] COG3596 Predicted GTPase ------------------||-|---------|-------------------------|-------- 1 [S] COG3597 Uncharacterized protein/domain associated with GTPases ------------------||-|----||||||||||||-|-------------------------- 1 [D] COG3599 Cell division initiation protein ------------------|--|--------------------------||------------|--- 1 [T] COG3614 Predicted periplasmic ligand-binding sensor domain --|---------------|-|------||-||||-||------------|-----|---||||--- 1 [S] COG3619 Predicted membrane protein ------------------||-------||----------------------------------|-- 1 [S] COG3651 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|------------------------------|-----|-------|-- 1 [M] COG3659 Carbohydrate-selective porin -------------|----|-----------------------------|----------------- 1 [I] COG3675 Predicted lipase ------------------||----------------------|||||-||----||----|----- 1 [UNTP] COG3678 P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc-resistance associated protein ------||----------||------|||||||||----------------------------|-- 1 [K] COG3682 Predicted transcriptional regulator ------------------||----------|-|-||||---------------------------- 1 [R] COG3688 Predicted RNA-binding protein containing a PIN domain ------------------||----------|-||-|||---------------------------- 1 [S] COG3689 Predicted membrane protein ------------------||||----------||-------------------------------- 1 [R] COG3694 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ----------------|-||----------------------|||-|--|-----|||--|--|-- 1 [P] COG3696 Putative silver efflux pump ----------------|-||-|--------||---|||-----------|---|||---|||||-- 1 [E] COG3705 ATP phosphoribosyltransferase involved in histidine biosynthesis -----------------|||-----|-----------|-----------|--------|||||||| 1 [T] COG3706 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain ------------------||----------------------|||-|--------|------|--- 1 [S] COG3781 Predicted membrane protein ------------------||-|---------------------|||-------------|---|-- 1 [P] COG3793 Tellurite resistance protein --||--------------||---------------------------------------||||--- 1 [C] COG3794 Plastocyanin --||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components ---|--------------||--------------||||---------------------------- 1 [T] COG3848 Phosphohistidine swiveling domain ------------------||----------|-----||---------------------------- 1 [S] COG3854 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|-----------------------|||||--|-----|---|||---- 1 [R] COG3895 Predicted periplasmic protein ------------------|-----------------------------------------|-|--- 1 [S] COG3900 Predicted periplasmic protein ------------------||---------------------------------------|---|-- 1 [O] COG3914 Predicted O-linked N-acetylglucosamine transferase, SPINDLY family |-|---------------|||------||||----|-----------------------|||||-- 1 [T] COG3920 Signal transduction histidine kinase ------------------||---------------------------------------||--|-- 1 [R] COG3932 Uncharacterized ABC-type transport system, permease components ------------------|--|--------|----------------------------------- 1 [R] COG3968 Uncharacterized protein related to glutamine synthetase -----------|------||---------------------------------|||-------|-| 1 [R] COG3975 Predicted protease with the C-terminal PDZ domain ------------------||---------------------------------------||--|-- 1 [S] COG4094 Predicted membrane protein ------------------||----------|---||||---------------------------- 1 [P] COG4100 Cystathionine beta-lyase family protein involved in aluminum resistance ------------------||-|----|---||||||------||||||||||||||---|||||-- 1 [J] COG4108 Peptide chain release factor RF-3 ------|---||------||-------||-------------------------------|----- 1 [R] COG4113 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain ------------------||-------||------------------------|------|----| 1 [D] COG4118 Antitoxin of toxin-antitoxin stability system ||--------------|-||-|---|----------------|||||-||||---|--|||--|-- 1 [S] COG4121 Uncharacterized conserved protein --||--------|-|-|-||||----||||||||||||-----------|---||-------|--- 1 [R] COG4122 Predicted O-methyltransferase --|---------|---|-||------|||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [P] COG4149 ABC-type molybdate transport system, permease component -------------|----||-------|||------------|||-----||-|-|---||||--- 1 [R] COG4178 ABC-type uncharacterized transport system, permease and ATPase components ------------------||-------||--------|----|||||-||--||||---|||||-- 1 [P] COG4208 ABC-type sulfate transport system, permease component ---|---------||---||||----|||--|-|||------|||-|-||||||||||||||---- 1 [R] COG4221 Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity ------------------||-|-----------------------|------------|||-|--- 1 [S] COG4222 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||----------|---|-||---------------------------- 1 [S] COG4241 Predicted membrane protein ------------------||-------------------------------------------|-- 1 [QP] COG4242 Cyanophycinase and related exopeptidases ----------|||-----||------||||------------------------------------ 1 [S] COG4243 Predicted membrane protein ---|--------------||---------------------------------------------- 1 [T] COG4250 Predicted sensor protein/domain ------------------||-|---------------------------|---------|------ 1 [T] COG4251 Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase) ------------------||-|---------------------------|-----|----|--|-- 1 [T] COG4252 Predicted transmembrane sensor domain ------------------|------------------------------|-----|---------- 1 [V] COG4257 Streptogramin lyase --|--------|------||------|||------------------------------------- 1 [S] COG4279 Uncharacterized conserved protein --------------|---||-------||--------------------------|---------- 1 [S] COG4301 Uncharacterized conserved protein ------------------||-------||-------------------------------|----- 1 [S] COG4328 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||----|---------||------------------------------ 1 [S] COG4330 Predicted membrane protein -----------|------||---------------------------------------------- 1 [G] COG4354 Predicted bile acid beta-glucosidase -------------|----||---------------------------------------------- 1 [F] COG4360 ATP adenylyltransferase (5',5'''-P-1,P-4-tetraphosphate phosphorylase II) ------------------||-|-------------------------------------------- 1 [S] COG4371 Predicted membrane protein ------------------||-|-------------------------------------------- 1 [S] COG4372 Uncharacterized protein conserved in bacteria with the myosin-like domain ------------------||-------||------------------------------------- 1 [S] COG4398 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|||-------------||||---------------------------- 1 [S] COG4399 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||---------------|||---------------------------- 1 [E] COG4401 Chorismate mutase ------------------||-------||------------------------------------- 1 [S] COG4402 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||----------------------------|----------------- 1 [S] COG4446 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-----------------------------|-------------|-- 1 [R] COG4447 Uncharacterized protein related to plant photosystem II stability/assembly factor ------------------||---------------------------------------||||--- 1 [E] COG4448 L-asparaginase II ------------------||-------------------------------------------|-- 1 [R] COG4449 Predicted protease of the Abi (CAAX) family ------------------|---------------------------|---|-|-------|-||-- 1 [S] COG4456 Virulence-associated protein and related proteins ------------------|||--------------|------|||-|------------------- 1 [QC] COG4576 Carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein -------------|||--||------||||------------------------------------ 1 [L] COG4581 Superfamily II RNA helicase ------------------||-|----|||-||||||||-----------|-----|---||-||-- 1 [T] COG4585 Signal transduction histidine kinase -------------||---||||----------||-------------------------------- 1 [R] COG4586 ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component ------------------||||----------||-------------------------------- 1 [R] COG4587 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ------------------||-|---------------|---------------------------- 1 [S] COG4627 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|-------------||---------------|---||-------|--- 1 [S] COG4642 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||----------------------------|----------||||--- 1 [Q] COG4663 TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system, periplasmic component ------------------||----------------------------|----------||||--- 1 [Q] COG4664 TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system, large permease component ------------------||----------------------------|----------||||--- 1 [Q] COG4665 TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system, small permease component ------------------||---------------------------------------||-|--- 1 [R] COG4671 Predicted glycosyl transferase ------------------||-|----|----------|-------|---|-----|---||-|--- 1 [R] COG4674 Uncharacterized ABC-type transport system, ATPase component ------------------||----------------------|||-|---------||-------- 1 [S] COG4735 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||------|--------------------------------------- 1 [O] COG4759 Uncharacterized protein conserved in bacteria containing thioredoxin-like domain -------------||-||||||||||----------------|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87 ----------------|-||----------------------|||||-||--|--|-----|||-- 1 [R] COG4783 Putative Zn-dependent protease, contains TPR repeats ----------------||||----------------------|||||-||||||||---------- 1 [U] COG4796 Type II secretory pathway, component HofQ |-|-----|---------||---------------------------------------------- 1 [C] COG4802 Ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit --|---------------|----------------------------------------||||--- 1 [S] COG4803 Predicted membrane protein --|---------------|--|-------------------------------------------- 1 [S] COG4828 Predicted membrane protein --|---------------|--|--------|----------------------------------- 1 [V] COG4845 Chloramphenicol O-acetyltransferase ------------------|------------------------------------|-----|---- 1 [S] COG4916 Uncharacterized protein containing a TIR (Toll-Interleukin 1-resistance) domain ---|||--||-||----|||||----||||||--||||----|||||--|-----|---|||||-- 1 [MR] COG4948 L-alanine-DL-glutamate epimerase and related enzymes of enolase superfamily ------------------||-|--------||--||||---------------------------- 1 [R] COG4956 Integral membrane protein (PIN domain superfamily) ------------------||-|--------------------------||--||||---------- 1 [NU] COG4972 Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM ------------------||----------|---||||---------------------------- 1 [R] COG4980 Gas vesicle protein |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase -----------------|||----------|----------------------------------- 1 [S] COG5011 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------||---|-----------|-|--------------------------------- 1 [D] COG5279 Uncharacterized protein involved in cytokinesis, contains TGc (transglutaminase/protease-like) domain ------------------|--------------------------------------------|-| 1 [S] COG5304 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------||----------||-------|||----------------|------------------- 1 [S] COG5305 Predicted membrane protein ------------------||-|---------------------------------|---------- 1 [R] COG5322 Predicted dehydrogenase ------------------|-----------------------------------------|-|--- 1 [S] COG5381 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||----||----------||---------------------------- 1 [R] COG5401 Spore germination protein ------------------||------------------------------||-------------- 1 [S] COG5413 Uncharacterized integral membrane protein ------|-|-|-------|-------|---------|----------------------------- 1 [S] COG5428 Uncharacterized conserved small protein ------------------|-----------------------------------------|-|--- 1 [S] COG5439 Uncharacterized conserved protein ------------------||---------------------------------------|--|--- 1 [S] COG5469 Predicted metal-binding protein ------------------||----------------------------|----------------- 1 [S] COG5474 Uncharacterized conserved protein ------------------|----------------------------------------||||--- 1 [S] COG5480 Predicted integral membrane protein -----------------|||-|----||||------------------------------------ 1 [R] COG5512 Zn-ribbon-containing, possibly RNA-binding protein and truncated derivatives --|---------------||-------------|-------------------------------- 1 [O] COG5549 Predicted Zn-dependent protease -------||---------|----------------------------------------------- 1 [S] COG5559 Uncharacterized conserved small protein --|--------|------||-----------------------------|-----|----|----- 1 [S] COG5607 Uncharacterized conserved protein ------------------||-----------------------------|---------------- 1 [S] COG5626 Uncharacterized conserved small protein ------------------||-|-------------------------------------------- 1 [S] COG5637 Predicted integral membrane protein ------------------|----------------------------------------||||--- 1 [O] COG5661 Predicted secreted Zn-dependent protease ------------------||----|--||-------||-----------------|---||-|--- 1 [K] COG5662 Predicted transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)