(Pmu) Pasteurella multocida Functional categories Fun All J A K L B D Y V T M N Z W U O C G E F H I P Q R S COGs 1,455 135 1 60 90 -  22 -  17 34 113 8 -  1 46 72 93 102 133 59 96 38 83 16 161 170 proteins 1,888 158 1 101 111 -  25 -  29 54 151 8 -  2 55 96 128 187 188 63 108 45 137 29 228 178 Distribution of COGs by number of proteins proteins 1 2 3 4 5 6 7 8 10 11 COGs 1202 170 44 12 11 9 4 1 1 1

Co-ocurrences in sister taxa 0 1 order Pasteurellales 267 1188

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----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||-- 11 [P] COG1629 Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport
|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 10 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases
||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  8 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  7 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily
|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  7 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins
||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  7 [K] COG0583 Transcriptional regulator
--||------|-|-----|||-----|-----|||--|-----||||-||||||||--|||||---  7 [P] COG1840 ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component
||-||||||||||---|-||-|----|||-------||----|||||-||||---|||||||||--  6 [C] COG0243 Anaerobic dehydrogenases, typically selenocysteine-containing
|-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  6 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes
|-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  6 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase
|-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  6 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily
-----------------|--|---|||----|----||-|--|||||-||||---|---|||||--  6 [G] COG1129 ABC-type sugar transport system, ATPase component
-----------------|--|---|-|----------|----|--||-||||-------||--|--  6 [G] COG1593 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component
-----------------|--||----|||-||||||||-|--|||||-|||||--|---|||||--  6 [K] COG1609 Transcriptional regulators
-----------------||-|---|-|---------||----|--||-||||---|---||-||--  6 [G] COG1638 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, periplasmic component
--|--------------|--|---|-|--|||----||----|||||-||||---|---|||||--  6 [G] COG1879 ABC-type sugar transport system, periplasmic component
|-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|---  5 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily
-------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  5 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific
-||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||--  5 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component
----------------||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  5 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain
-------------|||------||--|---------------|||||-||||-||-|||-------  5 [E] COG0814 Amino acid permeases
----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||---||--  5 [M] COG0859 ADP-heptose:LPS heptosyltransferase
-----------------|--|-----|--|-|----||----|||||-||||---|---|||||--  5 [G] COG1172 Ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport systems, permease components
--------------------|----||---||||||||||||||||||||-|---|-------|--  5 [G] COG1264 Phosphotransferase system IIB components
----------------||--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---||||---  5 [KG] COG1349 Transcriptional regulators of sugar metabolism
---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||--  5 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase
--------------------|-----|----------|----|--||-||||-------||--|--  5 [G] COG3090 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component
--||---||-|||---|-------------------------|||||-||||---|--|-|-|---  4 [C] COG0437 Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1
||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  4 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases
||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||--  4 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
|-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-||||  4 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase
-|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  4 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases
|||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  4 [C] COG0778 Nitroreductase
-||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||--  4 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components
||||----|||||---|||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component
|||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|---  4 [C] COG1145 Ferredoxin
---|--||--|-|-----||||--|-|------|---|----|||||-||||-|||--|||||---  4 [P] COG1178 ABC-type Fe3+ transport system, permease component
--------------------|----||---||||||||-|||||||||||-|---|-------|--  4 [G] COG1263 Phosphotransferase system IIC components, glucose/maltose/N-acetylglucosamine-specific
---------------------------------------------------|||------------  4 [S] COG3792 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  3 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase
||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||---  3 [C] COG0247 Fe-S oxidoreductase
--|----------||-|-||-|----||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  3 [S] COG0316 Uncharacterized conserved protein
|||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--||||||||||||||||||||||||  3 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs
||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  3 [M] COG0438 Glycosyltransferase
|||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-|  3 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases
||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||----  3 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters
-------------|||--||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  3 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains
||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  3 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases
|||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||  3 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases
|||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||--  3 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family
|||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  3 [L] COG0582 Integrase
|||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---|||||||  3 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins
-------------||---||------------||--------|||||-||||||||---|||||||  3 [O] COG0625 Glutathione S-transferase
--|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||--  3 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase
-------------||---||-|----|||-----|-||----|||||-||-|||||---|||||||  3 [HC] COG0654 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases
-------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||--  3 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases
|-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||--  3 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins
---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||--  3 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  3 [P] COG0725 ABC-type molybdate transport system, periplasmic component
|||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||--  3 [R] COG0730 Predicted permeases
----||----------||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein
|-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||--  3 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component
----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-||||||||||||||||||  3 [M] COG0845 Membrane-fusion protein
||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||--  3 [R] COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily)
||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-|  3 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases
--------|---|||--|||----|||||-||-|||||----|||||--|||---|---||||---  3 [G] COG1070 Sugar (pentulose and hexulose) kinases
|-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  3 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components
--||--||--||-|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components
----------------||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  3 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases
|-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||--  3 [K] COG1309 Transcriptional regulator
-------------------|||----|--||||||||||-|||||||-||||||||--||||||--  3 [P] COG1393 Arsenate reductase and related proteins, glutaredoxin family
||||||-||-||-----|||------|||-----|--|-----------|||---|---||-|---  3 [R] COG1878 Predicted metal-dependent hydrolase
------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||--  3 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase
----------------------||-------||-|-|-----|||||-||||------|-----||  3 [G] COG2271 Sugar phosphate permease
--|-----------------|-----|---|-|-|-||----|||||-||||-|||----------  3 [GE] COG2610 H+/gluconate symporter and related permeases
----------------|--||-||||-||-------------||||||||||||||||||||||||  3 [M] COG2885 Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins
------------------------------------------|||-|-|-||--------------  3 [C] COG3069 C4-dicarboxylate transporter
------------------------------------------|||||||-||-|||----------  3 [M] COG3203 Outer membrane protein (porin)
---------------------------------------------|----||-||-||-|-||--|  3 [M] COG3306 Glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis
---|-------|------------------------------|||||-|-||---|----------  3 [R] COG3381 Uncharacterized component of anaerobic dehydrogenases
|||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||---  3 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components
--||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||--  3 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components
-----------------|--|-|||||||-||-||||-||--|||||-||||---|||-||||---  3 [E] COG4166 ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---|||||||  2 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5)
|||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase
-------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  2 [G] COG0021 Transketolase
|||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  2 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase]
-|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  2 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control
---------|---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0073 EMAP domain
|||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  2 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase
|||---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0084 Mg-dependent DNase
||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-|  2 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)
||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase
-|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||--  2 [H] COG0132 Dethiobiotin synthetase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  2 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase
-|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||--  2 [G] COG0176 Transaldolase
|||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||--  2 [Q] COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway)
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit
-------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||--  2 [G] COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase
-------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases
||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--||||||  2 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases
-|--||-------|||--|-|------||-|-----------|||||||||||||||||---||--  2 [E] COG0241 Histidinol phosphatase and related phosphatases
---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0254 Ribosomal protein L31
------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-||||||||||||  2 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase
|-||------||-||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain
|||---|||||||-----------------|-|||-|--||-|||-|-|-||--------------  2 [G] COG0269 3-hexulose-6-phosphate synthase and related proteins
-|--||----------|-|-|------||-|-----------||||||||||-||-|||---|---  2 [G] COG0279 Phosphoheptose isomerase
--||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-|||||||||  2 [C] COG0280 Phosphotransacetylase
|||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||--  2 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs
----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-|  2 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases
|-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--||||||||  2 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II
|||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase
|-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  2 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases
-------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||--  2 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase
|-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||--  2 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase
|||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||--  2 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0443 Molecular chaperone
--|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||---  2 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component
|||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-|||||||||||||||  2 [R] COG0457 FOG: TPR repeat
||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-||  2 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase
||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning
|||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||--  2 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function
||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||---  2 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins
---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  2 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes
|||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II
||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase
|||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG0517 FOG: CBS domain
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0527 Aspartokinases
||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---|||||||  2 [E] COG0531 Amino acid transporters
-------------||---||-||||-|---------------||||||||||||||-------|--  2 [O] COG0545 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 1
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-|  2 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0550 Topoisomerase IA
|||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||-------  2 [L] COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I
--||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|-----  2 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family
|-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase
--------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [J] COG0566 rRNA methylases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)
|-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-||  2 [ER] COG0591 Na+/proline symporter
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation
--||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) 
--|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||---  2 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components
||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes
-||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||--  2 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component
|||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----||||||||||||||||||||||||  2 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class)
-------------|||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase
|||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase
--||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases
||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0628 Predicted permease
---|---------||||-||-|||--|---------------||||||||||-|||---|||||||  2 [C] COG0633 Ferredoxin
----------------|||||||||||||-|||||||||---||||||||||||||||||||||||  2 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases
-|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||--  2 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases
|||-----|--|-----|||----------|-----------|||||---||--------|-----  2 [R] COG0641 Arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)
|-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family
--|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||--  2 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating)
-------------|------------|---------------|||||-|||||-------------  2 [G] COG0676 Uncharacterized enzymes related to aldose 1-epimerase
|-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---|||||||  2 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins
|||-----||---||---|||---|-----||||-||-----|||||||||||--||||-------  2 [C] COG0716 Flavodoxins
-------------||----|-|----|----|-|--------||||||||||||||------||--  2 [E] COG0722 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase
-|||--|||-------|---|-|||-|------|||||----------|-||-||-|||-------  2 [R] COG0733 Na+-dependent transporters of the SNF family
|--|----|----||-|||--|--|-|---|||-||||-|--|||||-|-||---|||-||-|---  2 [F] COG0737 5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases
----------------||||||--||||||||--||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases
----------------||||----||----||||-|||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains)
-----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [M] COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)
--|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||---  2 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component
------------------||----------------------------||||----|||||-|---  2 [P] COG0748 Putative heme iron utilization protein
-------------|||||||||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase
----------------||||||||------||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase
-----------------|---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0782 Transcription elongation factor
|-||--|||----|||-|||-|--||-||-|----|||----|||||-|||||--|||||||||--  2 [T] COG0784 FOG: CheY-like receiver
-------------|||-----|--------------------|||||-||||-|||||||||||--  2 [R] COG0790 FOG: TPR repeat, SEL1 subfamily
-----------------|||||||||----------------|||||-||||||||||||||||||  2 [R] COG0795 Predicted permeases
|-|------|------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG0811 Biopolymer transport proteins
----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases
----------------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG0848 Biopolymer transport protein
--|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases)
-------------|||--|-----------------------||||||||||-|||--||||||||  2 [O] COG1076 DnaJ-domain-containing proteins 1
-|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-||||||  2 [MG] COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  2 [G] COG1109 Phosphomannomutase
--|---||------------|||||-|-----|||-||----|||-|-||||-||-|||-||----  2 [E] COG1115 Na+/alanine symporter
|-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  2 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component
|-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||--  2 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component
--|-----|-|-|--------|--------------------|||||-|||||------|||||||  2 [O] COG1138 Cytochrome c biogenesis factor
--|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||---  2 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components
--|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes
--|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||--  2 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component
-||------|------|-------------------------|||||-||||||||--||||||||  2 [S] COG1238 Predicted membrane protein
||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  2 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes
---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---|||||||  2 [K] COG1278 Cold shock proteins
-|||--|----------|-||-----|---|----|--||---|||--|--|--|-|||-------  2 [S] COG1479 Uncharacterized conserved protein
----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-|||||||  2 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes
|||-|||-|||||---||-||------||---|--|-|----|||||----|--|---|-------  2 [L] COG1518 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
|||||||||||||--------|----|||-|-----||----|||||-||||-|||---|||||--  2 [K] COG1522 Transcriptional regulators
|-|-----|------|-|--------|||-|---|--||---|||||-|-||----|||-------  2 [P] COG1528 Ferritin-like protein
---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---|||||||  2 [J] COG1530 Ribonucleases G and E
----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||||  2 [MU] COG1538 Outer membrane protein
|||------|-------|------------------------||||||||||--------------  2 [P] COG1553 Uncharacterized conserved protein involved in intracellular sulfur reduction
--------------------|-||--||||------------|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1560 Lauroyl/myristoyl acyltransferase
-----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||--  2 [K] COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog
----------------||||----------------------|||-|-||-|||||--||||||--  2 [M] COG1596 Periplasmic protein involved in polysaccharide export
||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG1605 Chorismate mutase
-----------------|--------|---||||||||-|--|||||-||||-|||---|||||--  2 [K] COG1737 Transcriptional regulators
--------------------|-|||||---||||||||-||||||||-||||-|||---|||||--  2 [GT] COG1762 Phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain (Ntr-type)
--||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components
--------------------|||||||---||||||||||||||||||||||||||---|||||--  2 [G] COG1925 Phosphotransferase system, HPr-related proteins
-----------------|||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|---|||||--  2 [KT] COG1974 SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidases)
-||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||--  2 [U] COG2095 Multiple antibiotic transporter
---|------|--||-|--|------|||-------||----|||||--|||||||--||||||--  2 [Q] COG2132 Putative multicopper oxidases
---------------------|----|||||----|||----|||||-||||-|||---|||||--  2 [K] COG2186 Transcriptional regulators
------------------------------------------|||||-|||||||-||||||--||  2 [R] COG2194 Predicted membrane-associated, metal-dependent hydrolase
--|-----------------||---|----||||||||----|||||-|-||------|-|--|--  2 [E] COG2195 Di- and tripeptidases
------------------||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||--  2 [TK] COG2197 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain
-|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|--  2 [R] COG2252 Permeases
---|----|---|-----|--|---------------|----------||-|--------||--||  2 [R] COG2358 TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component
-------------||-----||---------|--||-|----||||-----|-------||||---  2 [G] COG2376 Dihydroxyacetone kinase
---------------------|--------||||||||----|||||-|--|---|---||||---  2 [K] COG2390 Transcriptional regulator, contains sigma factor-related N-terminal domain
--||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||----  2 [P] COG2608 Copper chaperone
------------------------------|-----------|||||-|-||----|||-------  2 [R] COG2704 Anaerobic C4-dicarboxylate transporter
--------------------|---------|--|-----|--|||||-|-||----||--------  2 [G] COG2731 Beta-galactosidase, beta subunit
------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|--  2 [U] COG2831 Hemolysin activation/secretion protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors
------------------------------------------||||||||||||||---|||||||  2 [J] COG2913 Small protein A (tmRNA-binding)
------------------------------------------|||||-|-||-||---|---|---  2 [S] COG2990 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||------|||-----  2 [C] COG3005 Nitrate/TMAO reductases, membrane-bound tetraheme cytochrome c subunit
---|--------|-------|---------------------|||---|--|--------------  2 [E] COG3033 Tryptophanase
---------------------|--------------------|||||--||||------|||||--  2 [O] COG3088 Uncharacterized protein involved in biosynthesis of c-type cytochromes
--||---|------|------------||-------------|||||--|||-------|||||--  2 [P] COG3119 Arylsulfatase A and related enzymes
------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|--  2 [U] COG3210 Large exoproteins involved in heme utilization or adhesion
-----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-|||||||  2 [M] COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes
-------------------|||----|--------|||----|||-|---||--------------  2 [E] COG3340 Peptidase E
-------------|----||-------|||------------|||-----||-|-|---||||---  2 [R] COG4178 ABC-type uncharacterized transport system, permease and ATPase components
------------------------------------------|||||--||||------|||||--  2 [O] COG4235 Cytochrome c biogenesis factor
--------------------------|------|------------|-|--|--------------  2 [G] COG4409 Neuraminidase (sialidase)
--|-------------|---||--||----|-----------||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG4591 ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component
--|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||---  2 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component
---|----|---|--------|---------------|----------||-|--------||----  2 [R] COG4666 TRAP-type uncharacterized transport system, fused permease components
---------------------|--------||-|||||--|-||||||||||---|----------  2 [G] COG4668 Mannitol/fructose-specific phosphotransferase system, IIA domain
--------------------|--------------|---------------|--------------  2 [V] COG4823 Abortive infection bacteriophage resistance protein
--------------------|-----|||--||-||||----|||||-|-||-------|-|-|--  2 [CO] COG4988 ABC-type transport system involved in cytochrome bd biosynthesis, ATPase and permease components
--|-----------------|----------------|-----||||---||||||----|||---  2 [UW] COG5295 Autotransporter adhesin
||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||--  1 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||--  1 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase
|||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||---  1 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase
--|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||--  1 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit
||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||-------------  1 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase
|||||||||||||||---||----------------------|||||-||||--------------  1 [J] COG0023 Translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1) and related proteins
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase
||||||-|||---|||--||-|----|||--|-||||-----|||||-||-||------|--|---  1 [P] COG0025 NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters
---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||--  1 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase)
-|----||---|------||------|||-------|-----|||||-||-|--------------  1 [F] COG0027 Formate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase (GAR transformylase)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)
--||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0031 Cysteine synthase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase
|--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||--  1 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase
-|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||--  1 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC
||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--||||||||  1 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||--  1 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  1 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  1 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0048 Ribosomal protein S12
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0049 Ribosomal protein S7
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0051 Ribosomal protein S10
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2
||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--||||||||  1 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase
-||---||--||-|--|-||||||--|||-||||--||----|||||-||||-------||-|---  1 [G] COG0058 Glucan phosphorylase
|||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [G] COG0061 Predicted sugar kinase
||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit
|||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  1 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit
||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||--  1 [E] COG0077 Prephenate dehydratase
|||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0082 Chorismate synthase
-|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||-------  1 [E] COG0083 Homoserine kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11
|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase
|||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase
|||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||--  1 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase
--||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG0114 Fumarase
-|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||----------  1 [L] COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase
-------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase
|||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases
||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||--  1 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase
||--|-||--||-|----||-------||-------------|||||-||||-|||---||||---  1 [R] COG0121 Predicted glutamine amidotransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0125 Thymidylate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase
|||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--||||||||  1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase
||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase
||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase
||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase
--||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful)
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase
||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase
-|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0148 Enolase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase
------|---|--||--|--|---|-|||-||-|--||----|||||-|-||--------------  1 [G] COG0153 Galactokinase
-|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes
||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||--  1 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
---|---------||---||----------------------|||||-||||-||||||-||-|--  1 [G] COG0158 Fructose-1,6-bisphosphatase
||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain
-|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  1 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase
||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0164 Ribonuclease HII
||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase
-|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase
||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||----  1 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [E] COG0174 Glutamine synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-|||||||||||||||  1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17
-|||--|||-|||-----||-|---------------|--||||||||||||||||---|||||--  1 [HJ] COG0189 Glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)
--||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||  1 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase
-------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase
-------------|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0194 Guanylate kinase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0195 Transcription elongation factor
-------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0196 FAD synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY
||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0203 Ribosomal protein L17
-------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|---  1 [G] COG0205 6-phosphofructokinase
||||||||||------||||||--||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [D] COG0206 Cell division GTPase
|||-----||---|||----||----||||||||||||-|||||||||||||||||---|||||--  1 [F] COG0207 Thymidylate synthase
---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-|||  1 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit
|-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0211 Ribosomal protein L27
|--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase
|||||||||||||||--|--||----|||||--|||||------------||--------------  1 [H] COG0214 Pyridoxine biosynthesis enzyme
--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0216 Protein chain release factor A
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein
-|||--||||---|--||--|---------||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0218 Predicted GTPase
------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||--  1 [J] COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class)
-------------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase
|-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-|||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit
|-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||--  1 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component
-------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0227 Ribosomal protein L28
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0228 Ribosomal protein S16
|-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||--  1 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0230 Ribosomal protein L34
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A)
------------------|--|----||||-----|------|||||-||||---|---|||||||  1 [F] COG0232 dGTP triphosphohydrolase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0233 Ribosome recycling factor
--|----------||-||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10)
--|----------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0238 Ribosomal protein S18
-|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation
|-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10
----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||--  1 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase
-------------|---|--------|---||-||-||-||-||||||||-|---|---|||||--  1 [G] COG0246 Mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenases
--|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-||||||||||||||||||  1 [FP] COG0248 Exopolyphosphatase
--||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---|||||||  1 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family)
|||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0250 Transcription antiterminator
||------||------|||||-||--|||||---||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0257 Ribosomal protein L36
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0261 Ribosomal protein L21
--|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-|  1 [H] COG0262 Dihydrofolate reductase
--|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||--  1 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts
------------------||-|----||||-||||||||||||||||-||||||||---|||||-|  1 [L] COG0266 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0267 Ribosomal protein L33
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0268 Ribosomal protein S20
---|---------||---||----------------------||||||||||||||---|||||||  1 [T] COG0271 Stress-induced morphogen (activity unknown)
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II)
|--|||----|-|---||||-|--|-|||||||||||||||||||||-|-||-------||-|---  1 [F] COG0274 Deoxyribose-phosphate aldolase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis
----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase)
--||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||--  1 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases
---|---------|||--||----------------------||||||||||||||---|||||||  1 [O] COG0278 Glutaredoxin-related protein
--|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [C] COG0281 Malic enzyme
--|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-||  1 [C] COG0282 Acetate kinase
---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---|||||||  1 [F] COG0283 Cytidylate kinase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase
||||---||----------|-------||--|||||--|||-|||-|-|||||||||||-||-|-|  1 [V] COG0286 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit
||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase
|--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG0288 Carbonic anhydrase
|||-----||------||||--||--|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3)
-------------|--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0291 Ribosomal protein L35
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0292 Ribosomal protein L20
||||||--||---|||--------||----------------||||||||||||||---|||||||  1 [J] COG0293 23S rRNA methylase
|||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes
---|------|-|||--|---|---|-||||||||||||||||||||-|-||-------||-||--  1 [F] COG0295 Cytidine deaminase
--|--------|-|--|-||||||--|||----|--|-----|||||-||||---|---||-|---  1 [G] COG0296 1,4-alpha-glucan branching enzyme
-|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|---  1 [G] COG0297 Glycogen synthase
--||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN
--|----|---|-|||---||-----||||||||||||-----------|-|---|---||-||--  1 [R] COG0300 Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities
|||||||||||||----|------|-----|||||||||||||||||-||||--------------  1 [H] COG0301 Thiamine biosynthesis ATP pyrophosphatase
----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--|||||||||||  1 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I
|||||||||||||---|-||-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0303 Molybdopterin biosynthesis enzyme
-------------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0305 Replicative DNA helicase
||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|---  1 [P] COG0306 Phosphate/sulphate permeases
---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain
--|-||----||-|||--||-|----||||-|||--------|||||-||||||||---|||||--  1 [E] COG0308 Aminopeptidase N
|||||||||||||||--|---|----|||||--|||||------------||--------------  1 [H] COG0311 Predicted glutamine amidotransferase involved in pyridoxine biosynthesis
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0313 Predicted methyltransferases
|||||||||-|||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0314 Molybdopterin converting factor, large subunit
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0315 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase
---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  1 [H] COG0320 Lipoate synthase
----------|--||---||-|----||||------------||||||||||||||---|||||||  1 [H] COG0321 Lipoate-protein ligase B
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex
--||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---|||||||  1 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase)
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase
--|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold
-------------|||--|||---|||||||----|||----|||||||||||--||||-|-|-||  1 [O] COG0326 Molecular chaperone, HSP90 family
||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||-------  1 [S] COG0327 Uncharacterized conserved protein
---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0328 Ribonuclease HI
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase
----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0333 Ribosomal protein L32
--|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|--  1 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0335 Ribosomal protein L19
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase
----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase
-|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------|  1 [L] COG0338 Site-specific DNA methylase
-------------||---||-|----|---------------|||||-||||||||---|||||--  1 [E] COG0339 Zn-dependent oligopeptidases
||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD
|||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase
----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||--  1 [S] COG0344 Predicted membrane protein
|-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase
|||-----||------||||-|----|||-||---||-----|||||-||||||||---|||||--  1 [E] COG0347 Nitrogen regulatory protein PII
-||-||--||-|------||----------|-----------|||-|-||||-|||||||||||--  1 [C] COG0348 Polyferredoxin
-------------|----||------|||||-----------|||||-|||||------|||||||  1 [J] COG0349 Ribonuclease D
||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-|  1 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase
|||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase
--|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase
----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
-------------||-|-||-|----||||------------||||||||||||||---|||||||  1 [R] COG0354 Predicted aminomethyltransferase related to GcvT
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit)
--|----------|--|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a
----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type)
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0359 Ribosomal protein L9
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0360 Ribosomal protein S6
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1)
-------------|||-|||--||||||||-|-||||-----|||||||-||-||----||||---  1 [G] COG0362 6-phosphogluconate dehydrogenase
-------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||--  1 [G] COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase
|-||||--|-|||||||-||-|-----||--|--||||----|||||-||-||--||-||||||--  1 [I] COG0365 Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases
|-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [C] COG0372 Citrate synthase
||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||-------  1 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase
||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----||  1 [M] COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase
|||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases
--||---------||---||||----|||-|----|||----|||-|-||-|---|---|||||--  1 [R] COG0384 Predicted epimerase, PhzC/PhzF homolog
--||-------|-||---|||-----|||-|||||||||||||||||-||-|-|||---|||||--  1 [L] COG0389 Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair
||||----||---|--||||-|----||||||||||||----|||||-|--|--------------  1 [S] COG0391 Uncharacterized conserved protein
|||||||||--|-----|||-------|||-|---|-|----|||-|-|--|-----------|--  1 [S] COG0393 Uncharacterized conserved protein
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||-||||||||-||-||--|---||||---  1 [G] COG0395 ABC-type sugar transport system, permease component
||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||--  1 [M] COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis
--|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||--  1 [G] COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase
--|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase
----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||--  1 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme
--|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation
||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||--  1 [O] COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation
---|---------||---||-|----|||--|||||||--|||||||-||-|-|||---||-||--  1 [R] COG0431 Predicted flavoprotein
|||||||||||||---||||-|-----||---|----|----||||---|-|---|---|||||--  1 [R] COG0433 Predicted ATPase
|||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
|||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [I] COG0439 Biotin carboxylase
|||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||--  1 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division
|||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||--  1 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases
---|----|---------||------||||-|--|||-----|||||-|-||--------------  1 [H] COG0447 Dihydroxynaphthoic acid synthase
-----------------|||||||--||||||-|--||----|||||-|-||-------||-|---  1 [G] COG0448 ADP-glucose pyrophosphorylase
||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains
|||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--|||||||||||  1 [O] COG0450 Peroxiredoxin
|||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase
||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||--  1 [R] COG0456 Acetyltransferases
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  1 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family)
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase
|||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|  1 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases
--|----------||-||--||||||----|-----||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase
-|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||--  1 [G] COG0469 Pyruvate kinase
|||||||||||||||||||||||||-||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication
|||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||||  1 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase
|-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA
-------------||-||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain
||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--||||||||  1 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0486 Predicted GTPase
||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0492 Thioredoxin reductase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase
||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||--  1 [R] COG0496 Predicted acid phosphatase
----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0498 Threonine synthase
|||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||--  1 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase)
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  1 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit
---|---------||---||-|----|||-----|-||----|||||--|-|-|||||||||||--  1 [E] COG0506 Proline dehydrogenase
-|-----------||----|-|||-|-||-||||||||-|--|||||||||||||---|||||---  1 [L] COG0507 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member
--|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||--  1 [L] COG0514 Superfamily II DNA helicase
---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|---  1 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit
|-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||--  1 [E] COG0520 Selenocysteine lyase
|||||||||||||---|--|-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0521 Molybdopterin biosynthesis enzymes
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0528 Uridylate kinase
||||||||||||-||-|||-----||-----------|----|||||-|--|--------|-----  1 [P] COG0530 Ca2+/Na+ antiporter
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity
||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||--  1 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0536 Predicted GTPase
|||||||||-|||||||-||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases
---|||--|-|||||-||||-|-----||--|--||||----|||||--|-|---|||-|||||--  1 [C] COG0538 Isocitrate dehydrogenases
-------------||-||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0539 Ribosomal protein S1
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase
|------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||  1 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)
|-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||--  1 [R] COG0546 Predicted phosphatases
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase
---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||--  1 [C] COG0554 Glycerol kinase
||||||||||||------||-|-----||-|------|----|||||-||||||||---|||||--  1 [O] COG0555 ABC-type sulfate transport system, permease component
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex
---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [K] COG0557 Exoribonuclease R
|||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase
--||--|||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases
||||||--||-||-----||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-|  1 [J] COG0565 rRNA methylase
-------------||------|||--||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  1 [C] COG0567 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, and related enzymes
||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||----  1 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease
---|---------||--|||-|-|||----|||||||||-|||||||-|-||--------------  1 [F] COG0572 Uridine kinase
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||--  1 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)
---|||-----|-|||--|--|---|||||-|||||||----|||||-|||||--|---||||---  1 [C] COG0578 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase
|-------|--|-|||-||-||---|----||||||||-|||||||||-||||--|---|||||--  1 [G] COG0580 Glycerol uptake facilitator and related permeases (Major Intrinsic Protein Family)
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component
---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||--  1 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
|||||||||||||||||----|--------------------|||||-||||----|||-------  1 [S] COG0585 Uncharacterized conserved protein
----||-----|------||-|--||||||||--||||----|||||||||||||||||--|||--  1 [S] COG0586 Uncharacterized membrane-associated protein
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit
--|----------||-----|-||||||||||||||------||||||--||||||----||||--  1 [G] COG0588 Phosphoglycerate mutase 1
--|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---|||||||  1 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog)
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0594 RNase P protein component
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase
-||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-|  1 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters
-||-----||-------|||||||--|---|--||-||----||||---|||---|---|||||--  1 [P] COG0600 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component
|||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase
--||||----||-||-|--|-|----||||-|--||||----|||||-||-||--|---|||||--  1 [CR] COG0604 NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductases
|-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [P] COG0605 Superoxide dismutase
|--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-|  1 [O] COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity
||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease
||||---||----------|-----------||-||--|||-------||||||--|||-||-|-|  1 [V] COG0610 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases
|||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|--  1 [H] COG0611 Thiamine monophosphate kinase
----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--|||||||||||  1 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases
||||----|--||---||||-|--------|------|----|||||-||||-|||----------  1 [R] COG0613 Predicted metal-dependent phosphoesterases (PHP family)
|||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||--  1 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent)
----------------|-||-|||---|||-|--||||----|||-||-|||-|||||||||||||  1 [I] COG0623 Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH)
-------------|----||------||||-|||||------|||||--|||-|||---|||||--  1 [R] COG0627 Predicted esterase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit
----------------||--||----||||||-|||||||||||||||||||||||---|||||--  1 [F] COG0634 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase
||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K
|||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||--  1 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)
----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-|  1 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein
--|----------||||-||--||--||||-|---|||----|||-|-||-|---|||-||-|---  1 [P] COG0659 Sulfate permease and related transporters (MFS superfamily)
|-||||-----|-||---||-------||||------|----|||||-||-|||||---|||||||  1 [R] COG0661 Predicted unusual protein kinase
----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-||||  1 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat
----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase
-------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-|||||||||||||  1 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH
||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-|||||||  1 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase
--------|---|||--||||---|---------|||-----||||---|-|-||---|--|--||  1 [P] COG0672 High-affinity Fe2+/Pb2+ permease
||----||--|------|------------|---|-------|||||-||-||--|---||-|---  1 [M] COG0677 UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase
-------------||---||-------------------------|--|-||-|||---|||||--  1 [O] COG0678 Peroxiredoxin
||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--||||||||  1 [R] COG0679 Predicted permeases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0681 Signal peptidase I
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase
|||-----||---|-------|----||||-------|----|||||-||||---|---||-|---  1 [H] COG0684 Demethylmenaquinone methyltransferase
--|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase
||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-||  1 [I] COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase
|---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---|||||||  1 [J] COG0689 RNase PH
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0691 tmRNA-binding protein
-------------|||----||||-|||||-||||||||||||||||||||||||||||||-----  1 [L] COG0692 Uracil DNA glycosylase
-||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||--  1 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase
---|----|----||---||--||----------||||----|||||||||||---||||||||||  1 [O] COG0694 Thioredoxin-like proteins and domains
----------------|||-|-----|||||-|||||||||||--||----|----|||-|||-||  1 [G] COG0698 Ribose 5-phosphate isomerase RpiB
--|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0703 Shikimate kinase
-||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||--  1 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC
--|------|-|----||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase
|-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0708 Exonuclease III
-|-------|||----|-------------------------|||||--|||------|-|-----  1 [E] COG0709 Selenophosphate synthase
--|-------------|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b
-------------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein)
-||-----||---||--|||||||--|---|--||-||----||||--||||---|---|||||--  1 [P] COG0715 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components
|||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-|||||||||||||||||  1 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase
-----------------|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase
----------------|||||||||||||||-----------||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
----------------|---|---------------------|||||-||||||||---|||||--  1 [M] COG0729 Outer membrane protein
||||-|-||----------|-------||--|||||--|||||||-|-|||||---|||-||-|-|  1 [V] COG0732 Restriction endonuclease S subunits
--|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases
-----------------|||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase
----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|--  1 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase
|||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||--  1 [H] COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A
-------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit
-------------||------|----|-------||||----|||||-||||-||||||||||---  1 [P] COG0753 Catalase
--|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [O] COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component
-------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-|||||||  1 [F] COG0756 dUTPase
-----------------|||||----|||||-----||-------|-||||||--|||||||||--  1 [E] COG0757 3-dehydroquinate dehydratase II
----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-|  1 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake
----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||-  1 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein
----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||--  1 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein
-----------------||||-||||||||||||||||----|||||-||||---||||||-||--  1 [S] COG0762 Predicted integral membrane protein
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0763 Lipid A disaccharide synthetase
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  1 [Q] COG0767 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase
|||------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase
--|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||--  1 [F] COG0775 Nucleoside phosphorylase
----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit
----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------|-|---||||-------------||-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0781 Transcription termination factor
---|--------------||||--|||----|||||||-|--|||||-|||||--|||||-|-|||  1 [P] COG0783 DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)
|-|---|||-|-|---||||||--|-||||--||--||------------||----||-||||---  1 [O] COG0785 Cytochrome c biogenesis protein
--------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0787 Alanine racemase
---|------------|-||-|----|||-------||----|||-|-|||||--|||||||-|--  1 [F] COG0788 Formyltetrahydrofolate hydrolase
--|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators
------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||--  1 [M] COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins)
----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||--  1 [L] COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase
----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0793 Periplasmic protease
|||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation
----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||--  1 [M] COG0796 Glutamate racemase
----------------|-||----||----|-----------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0797 Lipoproteins
|-|---|-|----|---|||------|||-|----||--------------|--|----|------  1 [P] COG0798 Arsenite efflux pump ACR3 and related permeases
----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [S] COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein
-----------------|||----|-----||||--||----|||||-||||||||||-|||||--  1 [G] COG0800 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase
----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase
|-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-||  1 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin
--||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC
----------------||||||--||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing
----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II
----------------||||||---|----||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase)
----------------|--||---------------------|||||-||||||||||||||||--  1 [M] COG0810 Periplasmic protein TonB, links inner and outer membranes
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase
-----------|--------||--|------||||||-|||||||||||-||----||----|---  1 [F] COG0813 Purine-nucleoside phosphorylase
----------------||||-|||||||||------------|||||-||||-|||||||||||||  1 [M] COG0815 Apolipoprotein N-acyltransferase
----------------||||||||--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis)
-----------------||||||||-||||------------|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit
-----------------|||-|--------||||||||----|||||-|||||||||||||||---  1 [M] COG0818 Diacylglycerol kinase
----||||--|||||----|------|----|-|||||------------||----|||--|----  1 [K] COG0819 Putative transcription activator
----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||--  1 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme
----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||--  1 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis
--||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||  1 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation
--|-----|---------||--||------------------|||||-|||||--|||||||||||  1 [U] COG0823 Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system
|-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [R] COG0824 Predicted thioesterase
----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit
|||------|-|----|--|||--------||||||||----|||||-||||-|||||||||----  1 [O] COG0826 Collagenase and related proteases
----------------|-||--||||----|||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0828 Ribosomal protein S21
--|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||||  1 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain
--|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump
------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|--  1 [K] COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family
---------|------||--||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [D] COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division
----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||---  1 [D] COG0850 Septum formation inhibitor
---|----|---------||-|-----||-------------||||||||||-||-|||-------  1 [R] COG0857 BioD-like N-terminal domain of phosphotransacetylase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A
----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||--  1 [M] COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase
------------------||-|----|||-|---||||----||||||||||||||||||||||||  1 [P] COG0861 Membrane protein TerC, possibly involved in tellurium resistance
-|||---||--|----|-||------|||---|---||----|||||-||-||--|--||||||||  1 [M] COG1004 Predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase
---|----|-|-|||||-|||---||||||---------------|--||||--------------  1 [I] COG1022 Long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)
----||-----------|-|------|---|-----||----|||||-||||-||-||||-|----  1 [E] COG1027 Aspartate ammonia-lyase
----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase
--||----------|--|||------||||||||||||----||||||||||-|||||||||||--  1 [E] COG1045 Serine acetyltransferase
|||||||||||||-------||--|-----------------|||||-|||||||||||-------  1 [O] COG1047 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2
------------------||----------------------|||||-||-|||||||||------  1 [C] COG1049 Aconitase B
----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||--  1 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases
||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit
|||||||||-|||-----|--|-----||--|----------|||||---||---|----------  1 [H] COG1056 Nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase
----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease
||||||||||-------|------|-----|-----||----|||||-||||--------------  1 [O] COG1067 Predicted ATP-dependent protease
-----|-------||-----------||||-|||-|||----|||||-|-||-------||||---  1 [H] COG1072 Panthothenate kinase
--||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||--  1 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily
--------------------|-||||-||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains)
|---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----|||  1 [D] COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis
--------------------||||-||---||||||||-|||||||||||||||||------||--  1 [G] COG1080 Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria)
--|---------------|-------------------------------||-|--|-|-------  1 [M] COG1083 CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase
--|---|-|-|--||--|--------||--||----------|||||-|-||--------------  1 [C] COG1085 Galactose-1-phosphate uridylyltransferase
|------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||--  1 [M] COG1087 UDP-glucose 4-epimerase
|-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||--  1 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase
----||------------||------||||----||||----|||||--||||-------------  1 [R] COG1090 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase
-|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||---  1 [R] COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases
--|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-|||||||||||||  1 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes
-----------------|--||---||||-||||||||--|||||||-||||---|----------  1 [G] COG1105 Fructose-1-phosphate kinase and related fructose-6-phosphate kinase (PfkB)
--------------------|-|||-|---|-|||-|-----|||||-||||--------------  1 [E] COG1114 Branched-chain amino acid permeases
-||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||--  1 [P] COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component
--|----------||------|----||||-|--||||----|||||----|--------------  1 [P] COG1119 ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  1 [Q] COG1127 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component
--|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-||||||  1 [GM] COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component
------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component
----------------||||||||||----------------|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component
|--|||--|-|||-------||---------|----||----|||------|-||||||-------  1 [C] COG1139 Uncharacterized conserved protein containing a ferredoxin-like domain
----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||--  1 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase
----------------||--|||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG1158 Transcription termination factor
----------------||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG1159 GTPase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG1160 Predicted GTPases
--|-------------|||||----||||||||||||||||||||||-||||||||------|---  1 [R] COG1162 Predicted GTPases
---|--------------||------||||-|--|||-----|||||-|-||--------------  1 [H] COG1165 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase
------------------||-|--------------------|||||-||-||||-|||-------  1 [E] COG1166 Arginine decarboxylase (spermidine biosynthesis)
----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||--  1 [KE] COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs
---|--------------||------||||-|--|||-----|||||-||||---------|----  1 [HQ] COG1169 Isochorismate synthase
---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [E] COG1171 Threonine dehydratase
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|---||||---  1 [G] COG1175 ABC-type sugar transport systems, permease components
---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||--  1 [E] COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I
---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||--  1 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II
-------------||-----|---------|---|-||----|||||-|||||||||||-------  1 [H] COG1179 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 1
|||-|||||||||---||--|------||-||||||------|||||-||||---|----------  1 [O] COG1180 Pyruvate-formate lyase-activating enzyme
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)
-------------||-|||||||||||||||||-||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG1186 Protein chain release factor B
-----------------|--|-----|---||||||||----|||||-||||-|||||||||||--  1 [J] COG1188 Ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit (S4 paralog)
--|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||-----  1 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II)
|--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase
----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------|||||||  1 [L] COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)
-----------------|||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase
||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|--  1 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases
----------------||||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [LK] COG1200 RecG-like helicase
|||---|||-|||---||--|-----------|----|----|||||----|--------------  1 [R] COG1203 Predicted helicases
----------------||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains)
|||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||--  1 [M] COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase
------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||--  1 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1212 CMP-2-keto-3-deoxyoctulosonic acid synthetase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone
------------------||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [T] COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response
-------------||-|-||--||--||||------------|||||||||||-----||||||||  1 [P] COG1218 3'-Phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase
-------------|--||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit
----------------||-------|--------||||----|||||||||||--|||||||||||  1 [O] COG1220 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), ATPase subunit
--||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-|  1 [O] COG1225 Peroxiredoxin
||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||--  1 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III
--||------------|----|-----|||------||----||||||||-|-|||----------  1 [E] COG1246 N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferases
--||---------||-|||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains
-||-|||||-|||----|-|-|---|--|-||||||||----|||||-||-|---|----|-|---  1 [C] COG1254 Acylphosphatases
--|-----------|---||--||---||-------||----------||-|||||---|||||--  1 [S] COG1262 Uncharacterized conserved protein
|||---||-||-|---|---|-----------|--|||----|||||-||||-||||||-----||  1 [I] COG1267 Phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins
--||||--|-------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--||||||||  1 [C] COG1271 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1
-|--|-|||----||-----------|||--||||-------|||-|-|-||-|------------  1 [P] COG1275 Tellurite resistance protein and related permeases
--------------------|-----|||-|---|-||----|||||-||-|---|||-|-|---|  1 [R] COG1279 Lysine efflux permease
|-|-||--|||||----||--|----|---------||----|||||-|||||--|--||||||--  1 [E] COG1280 Putative threonine efflux protein
----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||--  1 [O] COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family
------------------||-------|||------------|||||-||||-|||---|||||||  1 [C] COG1282 NAD/NADP transhydrogenase beta subunit
----------------|-||||--|--||-||-|-|||----|||||--|||---|---|||----  1 [S] COG1285 Uncharacterized membrane protein
------------------------||-----|||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG1286 Uncharacterized membrane protein, required for colicin V production
------------------|--|------------|||-----|||||-||||||||--|||||---  1 [S] COG1289 Predicted membrane protein
---|--------------------|-|||-----||||----|||||-||||-||-----|-----  1 [M] COG1292 Choline-glycine betaine transporter
--||------------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--||||||||  1 [C] COG1294 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2
--|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1 [S] COG1295 Predicted membrane protein
--|-----|-----------||----|----|-|||||----|||||-||||-|||||-||||---  1 [E] COG1296 Predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)
|||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----|||||||  1 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases
|-|---||||||----||||-|-----||||----|||-----------||||--|---||-||--  1 [E] COG1305 Transglutaminase-like enzymes, putative cysteine proteases
----------------|-|||||||||||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG
----------------------||-------|||-----|--|||||-||||||||---|||||||  1 [S] COG1322 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||--  1 [K] COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains
|||---||-|-------|--|---------||||||------|||||-||||---|----------  1 [F] COG1328 Oxygen-sensitive ribonucleoside-triphosphate reductase
----------------------||-|-||-------------|||||||||||||-----------  1 [L] COG1330 Exonuclease V gamma subunit
--|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|----  1 [M] COG1346 Putative effector of murein hydrolase
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  1 [C] COG1347 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrD
--||--------------||-|--|-|||-||---|||----|||||--|-|-------||-||||  1 [S] COG1357 Uncharacterized low-complexity proteins
--||--------------|-||----|||-||-|-||-----|||||-||-|-|||---||-||--  1 [S] COG1359 Uncharacterized conserved protein
-----------------|------------|||-|||-----|||-|-||||-||-|||||-|---  1 [M] COG1368 Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily
--|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|----  1 [R] COG1380 Putative effector of murein hydrolase LrgA
------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---|||||||  1 [L] COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
----------------||||||--||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  1 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|----|||-||||-||--||||-------|--||||--------------  1 [M] COG1388 FOG: LysM repeat
----------------|---------||||------------|||||-||||-|||---|||||--  1 [OT] COG1391 Glutamine synthetase adenylyltransferase
|||---|||--|-----|---|||------|---|||-----------||||---|---||-|---  1 [P] COG1392 Phosphate transport regulator (distant homolog of PhoU)
|-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||||  1 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators
----------------||||-|----||||||||||||----|||||-||||||||----------  1 [R] COG1399 Predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein
|-|---|||||-|||-|-||--||--||||||--|||-----|||||-||||---|---|||||--  1 [R] COG1409 Predicted phosphohydrolases
---|------------||---|----|||-------||----|||||-||||---|--||||||--  1 [K] COG1414 Transcriptional regulator
-----------------|-|--||||-----|||||||----|||||-|||||--|--------||  1 [S] COG1426 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---|||||||  1 [S] COG1434 Uncharacterized conserved protein
---||-----|----|-|---|---|----|||||||||||||||||-|-||-------||-|---  1 [F] COG1435 Thymidine kinase
-----------------|---|-|--||||||||||||----|||||-|-||--------------  1 [K] COG1438 Arginine repressor
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [H] COG1441 O-succinylbenzoate synthase
---------------------------------|--|-----|||-|---||----||--|---||  1 [M] COG1442 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins, LPS:glycosyltransferases
---|--||||||||||--------------------------|||||-|-||--------------  1 [R] COG1444 Predicted P-loop ATPase fused to an acetyltransferase
--------------------||---||---||||||||-||||||||-||||---|----------  1 [G] COG1445 Phosphotransferase system fructose-specific component IIB
-------------||-----|-||------------------|||||-||||||||----|-|---  1 [E] COG1448 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
----------------|-------||----------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1452 Organic solvent tolerance protein OstA
|-|||||||--||||-||--|-----|---||-|||||----|||||-||-|---|---||||---  1 [C] COG1454 Alcohol dehydrogenase, class IV
----||||---|-|---------------------|||----|||-|--|-|-||-----------  1 [F] COG1457 Purine-cytosine permease and related proteins
----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||--  1 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  1 [Q] COG1463 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, periplasmic component
--------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit
-----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---|||||||  1 [G] COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases
--||||||---|-----|||||----|||-||-|||||----|||----|||---|--||||||--  1 [R] COG1473 Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase
--|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||--  1 [H] COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis
--------|----||--|---|---|||||||||||||-|--|||||-|--|--------------  1 [G] COG1482 Phosphomannose isomerase
--|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||---  1 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase
|---||--|-|||---||||----------|------|----|||||-||||-------|||-|--  1 [R] COG1489 DNA-binding protein, stimulates sugar fermentation
-------------||-||--||----|||-||||||||----|||||-||||-|||----------  1 [J] COG1490 D-Tyr-tRNAtyr deacylase
--|---------------||||----|||||-----||----|||-|-|-||---------|||--  1 [G] COG1494 Fructose-1,6-bisphosphatase/sedoheptulose 1,7-bisphosphatase and related proteins
---------------------|||------------||----|||||-||||||||||||||||||  1 [O] COG1495 Disulfide bond formation protein DsbB
----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--||||||||  1 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein
-||-------------||--||--|-----------||----|||||-|-|||------||-||--  1 [E] COG1509 Lysine 2,3-aminomutase
-----------------|||----|------|----||----|||----|-|---|-----|||--  1 [R] COG1512 Beta-propeller domains of methanol dehydrogenase type
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1519 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase
--|--------|-----||-||||--|||-|-||--||-|--|||||-||||---|---||-|---  1 [G] COG1523 Type II secretory pathway, pullulanase PulA and related glycosidases
||-|--||-|---||-|--|------|-------|-|--|||-------|||-||---|||||---  1 [L] COG1525 Micrococcal nuclease (thermonuclease) homologs
|||-||--|-||--------------|||-----||||----|||||-||||---|--||||||--  1 [C] COG1526 Uncharacterized protein required for formate dehydrogenase activity
||||--||||-||-------|---------||||||||----|||||-||||||||----------  1 [J] COG1534 Predicted RNA-binding protein containing KH domain, possibly ribosomal protein
-------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase
----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||||  1 [J] COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1)
-----------------|------||----|-----||----|||||||||||---|||-------  1 [T] COG1551 Carbon storage regulator (could also regulate swarming and quorum sensing)
--|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|-------  1 [L] COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins
---|----|-----------||---------|----||----|||------|-||||||-------  1 [S] COG1556 Uncharacterized conserved protein
----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein
----------------||--|----|----|----|||----|||||-||||||||---|||||--  1 [S] COG1561 Uncharacterized stress-induced protein
-----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit
---|-------------||||-----||||-|--|||-----|||||-|-||--------------  1 [H] COG1575 1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase
-----------------|--||--------||||||||||--|||||-||||||||||||||||--  1 [S] COG1576 Uncharacterized conserved protein
|-|-||-----|-||---------------------------|||||-|--|--------------  1 [S] COG1584 Predicted membrane protein
||-|--||-||||----|||||----|||||-----------|||||-||-||------|||||--  1 [OU] COG1585 Membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity
||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||---  1 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase
------------------||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||---|||||||  1 [M] COG1589 Cell division septal protein
---|||----|||--------|||--|-------||||----||||||||||-|||||||||||--  1 [I] COG1607 Acyl-CoA hydrolase
--|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||--  1 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein
---|----||-|---------|---|--------|-||----|||-|-||||-||||||--|----  1 [C] COG1620 L-lactate permease
-------------||--|--------|---|-|||-||-----||---|--|---|---|------  1 [G] COG1621 Beta-fructosidases (levanase/invertase)
----------------||--|---------|||-|---------------|||||-|||-----||  1 [S] COG1636 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------|-----|-||||||-||||--|||--------|||||-||||---|----------  1 [G] COG1640 4-alpha-glucanotransferase
-------------|||-----|--|||---------------|||||-||||||||---|||||--  1 [L] COG1643 HrpA-like helicases
---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-||||||||||||||||||  1 [O] COG1651 Protein-disulfide isomerase
-------------------|-|--||---------||-----|||-|-||-|||||---|||||--  1 [S] COG1652 Uncharacterized protein containing LysM domain
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||----|||||-||-||--|---||||---  1 [G] COG1653 ABC-type sugar transport system, periplasmic component
--||---||------------|--------||||||||----|||||-|||||-------------  1 [K] COG1654 Biotin operon repressor
--------------------||----||||||||||||----|||||-||||||||----------  1 [R] COG1660 Predicted P-loop-containing kinase
--|--------|----|-|-----------------------||||-----|--------------  1 [L] COG1662 Transposase and inactivated derivatives, IS1 family
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG1663 Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase
-------------------|-------||-------||----|||||-||||---|--|-------  1 [S] COG1666 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-|||||||||||||  1 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins
-------------------|-||||||||||||||||||---|||||-||||||||||||||||||  1 [D] COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins
---------------------|||--||||------------|||||-||||||||---|||||||  1 [K] COG1678 Putative transcriptional regulator
--|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-||||||  1 [GM] COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component
--------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---|||||||  1 [M] COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase
--|-----------------|-----|---------|-------------||----||--------  1 [E] COG1687 Predicted branched-chain amino acid permeases (azaleucine resistance)
--|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-|  1 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase
---------||-|---||||-|----||||-|||||||----|||||-||-|||||---|||||--  1 [T] COG1702 Phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase
-||--------------|--|---|-------||-|--||---|||---|-|---|---|||||--  1 [S] COG1704 Uncharacterized conserved protein
||||--|||||||----|------------------------|||||-||||-||-------||--  1 [S] COG1720 Uncharacterized conserved protein
-----------------|-|||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG1722 Exonuclease VII small subunit
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  1 [C] COG1726 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrA
||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||--  1 [K] COG1733 Predicted transcriptional regulators
----------------|-----||||----|-----||----||||||||||||||--||||||||  1 [T] COG1734 DnaK suppressor protein
--||----|-|-|----|--||||-||-------|-|-----|||||-||||-||----||||---  1 [S] COG1738 Uncharacterized conserved protein
--||---------||--|--||---||---||||||||||--|||-|-||||-|||||||||----  1 [S] COG1739 Uncharacterized conserved protein
--|-||----|-------||------|||-|-----------|||||-||-|---|---|||||--  1 [R] COG1741 Pirin-related protein
----|||-|-|-|||---||-|-----------|---|----------|--|----|||||||---  1 [E] COG1748 Saccharopine dehydrogenase and related proteins
---------------------|-----||---|||-||------------||-||-----------  1 [S] COG1755 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---|--||----|-------|----|----|---|-||-------||-|-||-||-|||-------  1 [C] COG1757 Na+/H+ antiporter
||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega
--------------------||----||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||--  1 [E] COG1760 L-serine deaminase
|||||-|||||||---|-----------------||||----|||||-|-||---|--|||||---  1 [H] COG1763 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein
--|-------------|---|---------------------|||||-|||||||||||-------  1 [R] COG1778 Low specificity phosphatase (HAD superfamily)
----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----|||  1 [M] COG1792 Cell shape-determining protein
------|||----------------------|----|-----|||||----|---|--|||-||--  1 [M] COG1794 Aspartate racemase
--|-|||||-|||---||-|-|------------||||----|||||-||-|---|---||-||--  1 [S] COG1801 Uncharacterized conserved protein
-----------------||------|----|----|||----|||||-|-||---|---|||----  1 [G] COG1803 Methylglyoxal synthase
------------------||--||---------------------|--||||-||-------|---  1 [C] COG1805 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrB
-----------|-----|-|||---||||-||||||||-|--|||||-|||||------|||||--  1 [G] COG1820 N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase
-------------------------|--------|-|-----|||||-|-||------|-------  1 [R] COG1823 Predicted Na+/dicarboxylate symporter
----------------||||-|||||||||----||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc)
||||--||||-||---|--|--||------------------|||||----|-------||-|---  1 [G] COG1830 DhnA-type fructose-1,6-bisphosphate aldolase and related enzymes
||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----||||||  1 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E
|-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---|||||||  1 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family
---------------------|---|----||||||||----|||||-|-||-||-|||-------  1 [T] COG1854 LuxS protein involved in autoinducer AI2 synthesis
--|-------------|----|--------------------|||||-||-|---|||||--|---  1 [P] COG1858 Cytochrome c peroxidase
----------------||--|-||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG1862 Preprotein translocase subunit YajC
------------||------||------------|-||----|||||-||||------|||||---  1 [C] COG1866 Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)
-----------------|--------|----|--|-||-|--|||||-|-||--------------  1 [G] COG1869 ABC-type ribose transport system, auxiliary component
|||----|||--|------|--||----|-------------|||||-|--|-------|--||||  1 [S] COG1872 Uncharacterized conserved protein
------------------||----||----||||-|||-------|--|-|||-------------  1 [M] COG1876 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase
|-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--|  1 [R] COG1881 Phospholipid-binding protein
|-------|-----------|---------||||||------|||||-|-||---|----------  1 [C] COG1882 Pyruvate-formate lyase
------|||--------|--|---|-------|-------------|-|--|--------------  1 [C] COG1883 Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit
---|--|||||||||------|------------||------|||||-||-|----||||||||--  1 [R] COG1896 Predicted hydrolases of HD superfamily
|-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||--  1 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes
----||-----|-||----|||----||||||-|||||----|||||--|||||||---||||---  1 [P] COG1914 Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family
||--|----|------|-------------------------|||||--|||----|||||-|---  1 [E] COG1921 Selenocysteine synthase [seryl-tRNASer selenium transferase]
-|--------------||------------|---||||----|||||-||||||||----||||--  1 [R] COG1923 Uncharacterized host factor I protein
------------------|-------|||-||||||||----|||||-||||-||-----------  1 [G] COG1929 Glycerate kinase
--|----------||----|------||||-|---|||----||||||||||||||--||||||--  1 [HE] COG1932 Phosphoserine aminotransferase
----------------|-||----------------------|||||-||||||||||||||||--  1 [S] COG1934 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||||-----|-----------------||-------------|||||--|||-------||-|---  1 [S] COG1944 Uncharacterized conserved protein
-------------|-|----------||||------------|||||-|||||------|||||--  1 [I] COG1946 Acyl-CoA thioesterase
----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||--  1 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase
-------------||-----------||||------------||||||||||||||----------  1 [A] COG1949 Oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)
-|----------------------------------------||||||||||||||---|||||||  1 [U] COG1952 Preprotein translocase subunit SecB
---|||-------|---|------------||||||||----|||||-||-||||-------||--  1 [T] COG1956 GAF domain-containing protein
-----------|-||----|-|----|||-----|--|----|||-|--|-|---|--||||||--  1 [F] COG1957 Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase
----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator
-------------|||--------------------------||||||||||-|||--------||  1 [P] COG1965 Protein implicated in iron transport, frataxin homolog
--|----|--|-|---|---|-----|||-||----||----|||||-||||-||||||-------  1 [T] COG1966 Carbon starvation protein, predicted membrane protein
--|---------------|-||----||||-||||||-----|||||-|||||--|---|||||--  1 [M] COG1970 Large-conductance mechanosensitive channel
-------------------|------------|-|-||----|||||-|-||----||-----|--  1 [F] COG1972 Nucleoside permease
--||||-||-||----|-||-|-----||-----||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG1977 Molybdopterin converting factor, small subunit
-----------------|-||---------|----|||----|||||-|--|--------------  1 [C] COG1979 Uncharacterized oxidoreductases, Fe-dependent alcohol dehydrogenase family
------------------|||------||||--|||||----|||||-||||---|----|-----  1 [E] COG1982 Arginine/lysine/ornithine decarboxylases
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis
|||---||||--|-----------------|---||||----|||||--|-|--------------  1 [R] COG1988 Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolases
||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||--  1 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases
----------------|-|||----------------|----|||||-||-|||||||||||||--  1 [H] COG1995 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein
---------------------|--|-|||||---|||||||||||||--|||||||----|--|||  1 [S] COG2001 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--|  1 [L] COG2003 DNA repair proteins
|-|-----||||------------------------------|||||--|||---|--|||-||--  1 [R] COG2005 N-terminal domain of molybdenum-binding protein
--------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component
----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||--  1 [G] COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes
--|---|||---||||--||-------||-|-----------------|-||---|----|||---  1 [O] COG2020 Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase
|-||---------||------|----||||----||-------------|||||||------||--  1 [E] COG2021 Homoserine acetyltransferase
--|---------------||-|----||||------|-----|||||-||||||||----------  1 [M] COG2027 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein 4)
--|----------||-|----|-----||||-----|-----|||||-|--|-|||----||-|--  1 [P] COG2032 Cu/Zn superoxide dismutase
--||||--|-|||---|--|-|----|||-------|-----|||||--|-|---|--||||||--  1 [R] COG2041 Sulfite oxidase and related enzymes
--|||||||-||--|-|----|----|||--|||||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [Q] COG2050 Uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism
||----||-|----------------|---|-----|-----|||-|--|||-------||||---  1 [C] COG2055 Malate/L-lactate dehydrogenases
--------------------|-------------|-||----------||||-||-|||-------  1 [R] COG2056 Predicted permease
--------|-|||---|-||------||||------------|||||-|||||--|--||||||--  1 [T] COG2062 Phosphohistidine phosphatase SixA
|||||||||||||-------------||--|--------------|---|-|---|---||-||--  1 [NU] COG2064 Flp pilus assembly protein TadC
------------------||||----|||-||||||||-----------|||---|----------  1 [F] COG2065 Pyrimidine operon attenuation protein/uracil phosphoribosyltransferase
----------------|---|---------------------|||||-|||||||-||-|||||--  1 [I] COG2067 Long-chain fatty acid transport protein
----------------|---------|||-||-|||||-|--|||||-||||---||||-------  1 [O] COG2077 Peroxiredoxin
------------------||----------||||||||----|||||-||||---|---|||-|--  1 [R] COG2081 Predicted flavoproteins
|-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||--  1 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases
-------------||---||----------|---|-||----|||-|---|||--|----------  1 [H] COG2091 Phosphopantetheinyl transferase
------------------||-|--------||--|-||----|||||-|-||--------|-|---  1 [R] COG2103 Predicted sugar phosphate isomerase
---------|---|------|---------|||||||-----|||||-||||--------------  1 [P] COG2116 Formate/nitrite family of transporters
-----------------|--||--|-||||||||||||----|||||-||||-|||---|------  1 [R] COG2137 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|---|||----||-----------|---||-|||||----|||-|---||----||-|------  1 [H] COG2145 Hydroxyethylthiazole kinase, sugar kinase family
---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||--  1 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis
----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||--  1 [NU] COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG
------------------||-|||---||-------------|||||-|||||------|||||--  1 [R] COG2166 SufE protein probably involved in Fe-S center assembly
|----------------|------------------------||||||||||--------------  1 [P] COG2168 Uncharacterized conserved protein involved in oxidation of intracellular sulfur
---------|-------|--------||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG2171 Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase
-------------------|||----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||--  1 [D] COG2177 Cell division protein
-------------|||---||---|-|---|||||||||---|||||-||||||||---||||---  1 [K] COG2183 Transcriptional accessory protein
-----|--|-----------|-----|------|-|--||------|---|||-|-||-|--|---  1 [L] COG2189 Adenine specific DNA methylase Mod
--------------------|----||---||||||||-|||||||||||||---|-------|--  1 [G] COG2190 Phosphotransferase system IIA components
-------------||---||----------------------|||||-||||----------|---  1 [T] COG2198 FOG: HPt domain
----------------|---|-||||-----------|----|||||-||-|||||||||||||||  1 [T] COG2204 Response regulator containing CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains
-----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [K] COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  1 [C] COG2209 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrE
------------------------------|--|||||-||-|||||||--|--------------  1 [G] COG2213 Phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component
-|------------------|---|-----------------|||||---||---|---||||---  1 [R] COG2215 ABC-type uncharacterized transport system, permease component
|-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||--  1 [P] COG2217 Cation transport ATPase
||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--|  1 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold
--|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis
-------------||---||-|--------------------|||||-||-|||||---|||||||  1 [H] COG2227 2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4-benzoquinol methylase
-------|------|--|--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---|||----  1 [F] COG2233 Xanthine/uracil permeases
-------------||------|---||---|-|---------|||||--|||-------|||||--  1 [H] COG2240 Pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase
||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||--  1 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid
--|-----------|-----|---------|----||||---|||||-||||-||||||-|-||--  1 [R] COG2249 Putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit
-------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||--  1 [L] COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase
---|-------|-||----|-|----||||----|-||----|||||-||||-|||---|||||--  1 [S] COG2259 Predicted membrane protein
-|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||--  1 [R] COG2262 GTPases
----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase
-------||----||--|-|||----||||||--||||----|||||-||||---|---|||||--  1 [I] COG2267 Lysophospholipase
----------------|-------|-----------------|||||||-|||------||-||--  1 [J] COG2269 Truncated, possibly inactive, lysyl-tRNA synthetase (class II)
---------------------|----|||---|---------|||||--|-|---|---||||---  1 [R] COG2321 Predicted metalloprotease
--|------------------|--------------------|||||-|||||------|||||||  1 [O] COG2332 Cytochrome c-type biogenesis protein CcmE
---|---------------|-|--------||||||||----|||||-||||||||----------  1 [R] COG2333 Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)
------------------||||----|---|-----|-----|||||-||||-|||---|||||--  1 [S] COG2350 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------||-|----|--|--||--------|||||-||||-|||-------|--  1 [C] COG2352 Phosphoenolpyruvate carboxylase
--------------|----|-|------------||||----|||||-||||-------|||||--  1 [S] COG2363 Uncharacterized small membrane protein
---------------------|----|---|-----||------------||--------------  1 [S] COG2364 Predicted membrane protein
--------|-||---------|--------------||-------||--|-|--------------  1 [Q] COG2368 Aromatic ring hydroxylase
-----------------|-|||--------------------|||||--|-||--|---||-||||  1 [R] COG2373 Large extracellular alpha-helical protein
---------|--------||-|--------------------|||||-||||||||---|||||--  1 [O] COG2377 Predicted molecular chaperone distantly related to HSP70-fold metalloproteases
--|-----|------------|--------------------|||||-|||||------|||||--  1 [O] COG2386 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component
--------|---|-------||----|----|--||------|||---||-|-------|||||--  1 [R] COG2388 Predicted acetyltransferase
------||--|||-------|---------------------|||||-|-||-||-----------  1 [S] COG2431 Predicted membrane protein
--------------------|---|-------||----|---|||||---||--------------  1 [E] COG2502 Asparagine synthetase A
-------------------|------------|-|---|-----------||----||--------  1 [R] COG2503 Predicted secreted acid phosphatase
----------|-|------||-----||-|-||||||-----|||||-||||-|||---|||||--  1 [S] COG2606 Uncharacterized conserved protein
---------------------|----||||------------||||||||||||||------||--  1 [C] COG2609 Pyruvate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component
------------------------------|----|||----|||||---||-||-----------  1 [S] COG2707 Predicted membrane protein
-------------------|-|--|-----|-----------|||||--|-|---|--||||-|--  1 [S] COG2717 Predicted membrane protein
-----------|-||---||-------|||||||-|||----|||||-||-|-|||--||||||--  1 [E] COG2755 Lysophospholipase L1 and related esterases
----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||--  1 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits
-|----||-|-|-----|---|---------|||||||----||||||||||-------|||||--  1 [J] COG2813 16S RNA G1207 methylase RsmC
--------------------------|||--|--||||----|||||--||||--||||||-|---  1 [G] COG2814 Arabinose efflux permease
--|----------||------|----|||-|-----------|||||-||||-------|||||--  1 [L] COG2816 NTP pyrophosphohydrolases containing a Zn-finger, probably nucleic-acid-binding
--------------------------||||-|||||-|----|||||-||||-|||---|||||--  1 [L] COG2818 3-methyladenine DNA glycosylase
---|------|||-----------|----|-||---------|||||-|-||--------------  1 [F] COG2820 Uridine phosphorylase
------------------||----------------------||||||||||-|||---|||||--  1 [M] COG2821 Membrane-bound lytic murein transglycosylase
---------------------|--------|-----------|||||-||||-|||----|---||  1 [R] COG2823 Predicted periplasmic or secreted lipoprotein
--------------------------|----|||-|------|||||-||||-|||||||||||--  1 [P] COG2824 Uncharacterized Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism
----------------||---|||||----------------|||||-||||-|||-------|||  1 [M] COG2825 Outer membrane protein
------------------------------------------|||||----|-||-|||-------  1 [M] COG2829 Outer membrane phospholipase A
--------------------------------------------------||-||---|-------  1 [S] COG2830 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------||-----------||-------|||-|-||||-||----|||----  1 [S] COG2832 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------------------------------||-|||--||||----  1 [S] COG2833 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-|||----|-------|----|--||----|-----||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG2834 Outer membrane lipoprotein-sorting protein
--||------|||-------------||||------------|||||-||-|||||----||||--  1 [S] COG2835 Uncharacterized conserved protein
-------------------|-|----|||-----|||-----|||||-||-|-|||------|---  1 [P] COG2837 Predicted iron-dependent peroxidase
------------------------|-----------------||||||||||||||---|||||--  1 [S] COG2840 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||----|-|-||-|||--|----  1 [S] COG2841 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------|||-------------|||||-||||-|||---|||||--  1 [O] COG2844 UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase
----------|-----|----|----|---------------------||-|-|||--||||||||  1 [S] COG2847 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------|-----|||||--|||||||----------  1 [S] COG2850 Uncharacterized conserved protein
--------------------|---------------------|||||-||||||||--|----|||  1 [M] COG2853 Surface lipoprotein
------------------------------------------|||||-||||||||--|----|||  1 [Q] COG2854 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, auxiliary component
--------|-----------|-----|----|||||------|||||--|||-|||--||||||--  1 [S] COG2855 Predicted membrane protein
---|------||---------|----|----||---||----|||||-||||---|--||||||--  1 [S] COG2860 Predicted membrane protein
-------------------------|-----------|----|||-|--|||------|||-||--  1 [S] COG2861 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-------------|----|--------------------|||-||||||---|||||---|--  1 [S] COG2862 Predicted membrane protein
---------------------|-----------------------|--||-|-||||||-|-----  1 [C] COG2863 Cytochrome c553
--|-----|-------|-------------------------|||||-||||---|--|-|-----  1 [C] COG2864 Cytochrome b subunit of formate dehydrogenase
-------------||---------------------------|||||-||-|||||---|||||||  1 [I] COG2867 Oligoketide cyclase/lipid transport protein
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  1 [C] COG2869 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrC
-|--------------|---|---------------------||||||-|||-||||||---||--  1 [M] COG2870 ADP-heptose synthase, bifunctional sugar kinase/adenylyltransferase
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  1 [C] COG2871 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF
--||---------||--|---|----|||-||---|-|-----------|-|---|--|||||---  1 [E] COG2873 O-acetylhomoserine sulfhydrylase
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG2877 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (KDO) 8-phosphate synthase
--|--------------|--|---------------------||||||||||||||----------  1 [C] COG2878 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB
-------------------|-|----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||--  1 [D] COG2884 Predicted ATPase involved in cell division
-------------------|----|------|-|||||----|||||-|||||--|----------  1 [M] COG2891 Cell shape-determining protein
--------------------|---------||||-||-----|||||----|||||---|||||--  1 [G] COG2893 Phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG2896 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme
------------------------------------------|||||-|||||||----||||---  1 [S] COG2900 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||----------  1 [KL] COG2901 Factor for inversion stimulation Fis, transcriptional activator
------------------------------------------|||||-|||||--|--------||  1 [S] COG2904 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------|------------------------|||||-|||||||||||||-||--  1 [S] COG2908 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||---|||||--  1 [S] COG2911 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|--||------------------|||||||||||--|-------|--  1 [S] COG2912 Uncharacterized conserved protein
------------------------------------------||||||||||||||----------  1 [S] COG2914 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||||||||-------------  1 [R] COG2915 Uncharacterized protein involved in purine metabolism
------------------------------------------|||||||-|||--|----------  1 [R] COG2916 DNA-binding protein H-NS
------------------------------------------||||||||||-|||----||||||  1 [D] COG2917 Intracellular septation protein A
------------------------------|----|------||||||||-|--------------  1 [H] COG2918 Gamma-glutamylcysteine synthetase
------------------------||||||-|||||||----||||||||||||||---|||||||  1 [D] COG2919 Septum formation initiator
--------|-|-------------------------------||||||||||--------------  1 [P] COG2920 Dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), gamma subunit
------------------------------------------||||||||||||||----------  1 [S] COG2921 Uncharacterized conserved protein
|-|--------------|------------------------||||||||||--------------  1 [P] COG2923 Uncharacterized protein involved in the oxidation of intracellular sulfur
------------------------------------------||||||||||||||----------  1 [CO] COG2924 Fe-S cluster protector protein
------------------------------------------|||||||||||--|----------  1 [L] COG2925 Exonuclease I
--------------------|---------------------|||||||-||--------------  1 [S] COG2926 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||||||---|||||||  1 [L] COG2927 DNA polymerase III, chi subunit
--------------------|----------||-|--------|--|--||||||----|||||--  1 [K] COG2932 Predicted transcriptional regulator
------------------------------------------|||||--||||-------------  1 [R] COG2933 Predicted SAM-dependent methyltransferase
---------------------------|||------------|||||-|||||-------------  1 [I] COG2937 Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase
-------------||---------------------------|||||-||||||||---|||||||  1 [S] COG2938 Uncharacterized conserved protein
-------------------|-|--------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG2949 Uncharacterized membrane protein
--------------------------|||-------------|||||-||-|||||---|||||--  1 [M] COG2951 Membrane-bound lytic murein transglycosylase B
------------------------------------------|||||-|-||||||----------  1 [G] COG2956 Predicted N-acetylglucosaminyl transferase
------------------------------------------|||||-||||-|||----------  1 [H] COG2959 Uncharacterized enzyme of heme biosynthesis
------------------------------------------|||||-||||||||---|||||-|  1 [R] COG2961 Protein involved in catabolism of external DNA
--------------------------|-------||||----|||||-||||---|---|||||--  1 [R] COG2962 Predicted permeases
--------------------|-----------|---------|||||-||||---|--|-|-----  1 [S] COG2964 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|-||-|||----------  1 [L] COG2965 Primosomal replication protein N
|------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|-------  1 [S] COG2966 Uncharacterized conserved protein
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [R] COG2969 Stringent starvation protein B
----------------------|-------------------|||||-|-|||-------------  1 [K] COG2973 Trp operon repressor
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [L] COG2974 DNA recombination-dependent growth factor C
------------------------------------------||||||||||||||----------  1 [S] COG2976 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|-----|-------|--|----||||--|--|-||--------|--  1 [H] COG2978 Putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter
------------------------------------------|||-|-||-|-||----||||---  1 [S] COG2979 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [M] COG2980 Rare lipoprotein B
------------------|-----------------------|||||-||||-------||||---  1 [E] COG2981 Uncharacterized protein involved in cysteine biosynthesis
-|----------------------------------------|||||-||||-------|||||--  1 [S] COG2983 Uncharacterized conserved protein
---|----------------|-----|---------------|||||-|-||--------------  1 [R] COG2985 Predicted permease
------------------------------------------|||||-|-||-------|||||--  1 [S] COG2989 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------------------------|--||||-||-----------  1 [S] COG2991 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|-||-|||----------  1 [S] COG2995 Uncharacterized paraquat-inducible protein A
------------------------------------------|||-|-|--|-||-----------  1 [O] COG2999 Glutaredoxin 2
------------------||------|-------|-------|||||-|--|--------------  1 [G] COG3001 Fructosamine-3-kinase
------------------------------------------|||||-|-||----|||-||||-|  1 [P] COG3004 Na+/H+ antiporter
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [D] COG3006 Uncharacterized protein involved in chromosome partitioning
------------------------------------------|||||-||||-|||----------  1 [R] COG3008 Paraquat-inducible protein B
--------------------|----||----|||||---|--|||||-|-||---------|----  1 [G] COG3010 Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase
---------------------|----|---------------|||||-||||-|-|----------  1 [S] COG3012 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-|----------------------------------------|||||-|--|--------------  1 [S] COG3013 Uncharacterized conserved protein
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [M] COG3017 Outer membrane lipoprotein involved in outer membrane biogenesis
----------|-----|-------------------------------||-|------|-|-----  1 [R] COG3019 Predicted metal-binding protein
-------------------|-|--------------------|||||-|--|-------|-|||--  1 [S] COG3021 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|---|-----|-----||--------|||||-||||-|||--|----|-|  1 [S] COG3022 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------------------|||||-||||||||---|||||-|  1 [V] COG3023 Negative regulator of beta-lactamase expression
------------------------------------------|||||-||||-|||----||||--  1 [S] COG3024 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|---------------------------------------|||||-||||---|------||--  1 [S] COG3025 Uncharacterized conserved protein
------------------------------------------|||||-||||---|----------  1 [T] COG3026 Negative regulator of sigma E activity
-----------------------|------|---||||----|||||-|||||||----|||||||  1 [S] COG3027 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [S] COG3028 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------||-------------|||||-|-||--------------  1 [C] COG3029 Fumarate reductase subunit C
--||----------------------||-------|||----|||||-||-|-||----||||---  1 [R] COG3030 Protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid
------------------------------------------|--||-||||-|------------  1 [S] COG3036 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------|-----||||-|-||-|||||-|--|--------------  1 [S] COG3037 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------|-----------------------|||||-||-||-||---|||||-|  1 [C] COG3038 Cytochrome B561
------------------------------------------|||||-||||------|||-----  1 [C] COG3043 Nitrate reductase cytochrome c-type subunit
------------------------------------------|||||-||-||--|---|-|||||  1 [M] COG3047 Outer membrane protein W
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [L] COG3050 DNA polymerase III, psi subunit
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [R] COG3054 Predicted transcriptional regulator
--------------------|---------------------|||||-|-||---------|----  1 [S] COG3055 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [M] COG3056 Uncharacterized lipoprotein
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [L] COG3057 Negative regulator of replication initiationR
----------------|-------------------------|||||--|||--------|-----  1 [O] COG3058 Uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation
------------------------------------------|||-|-|-||----||--------  1 [S] COG3059 Predicted membrane protein
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [KE] COG3060 Transcriptional regulator of met regulon
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [M] COG3061 Cell envelope opacity-associated protein A
------------------------------------------|||||-||||------|||-----  1 [P] COG3062 Uncharacterized protein involved in formation of periplasmic nitrate reductase
---------------------------------------------|--||||||||----------  1 [NU] COG3063 Tfp pilus assembly protein PilF
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [M] COG3064 Membrane protein involved in colicin uptake
------------------------------------------|||||-|-|||-------------  1 [M] COG3065 Starvation-inducible outer membrane lipoprotein
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [L] COG3066 DNA mismatch repair protein
------------------------------------------|||||-||||--------------  1 [P] COG3067 Na+/H+ antiporter
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3068 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|--|||------|||||-||||-|-|----|-||-|  1 [K] COG3070 Regulator of competence-specific genes
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [H] COG3071 Uncharacterized enzyme of heme biosynthesis
------------------------------------------|||||-||||--------------  1 [F] COG3072 Adenylate cyclase
------------------------------------------|||||-|||||--|----------  1 [T] COG3073 Negative regulator of sigma E activity
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3074 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---|--------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [E] COG3075 Anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3076 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3078 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|||||-------------  1 [S] COG3079 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------||-------------|||||-|-||--------------  1 [C] COG3080 Fumarate reductase subunit D
------------------------------------------|||||-||||--------------  1 [R] COG3081 Nucleoid-associated protein
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3082 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||--------------  1 [R] COG3083 Predicted hydrolase of alkaline phosphatase superfamily
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3084 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3085 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------|--|---------------------|||||-||||--------------  1 [T] COG3086 Positive regulator of sigma E activity
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [D] COG3087 Cell division protein
------------------------------------------|||||-||||--------------  1 [S] COG3089 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------|||||||----|||||-||||--------------  1 [S] COG3091 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3092 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|-||-||-----------  1 [S] COG3094 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [D] COG3095 Uncharacterized protein involved in chromosome partitioning
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [D] COG3096 Uncharacterized protein involved in chromosome partitioning
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3097 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||--------------  1 [S] COG3098 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3099 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||--------------  1 [S] COG3100 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3101 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3102 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------------------------||-----|||||-||||--------------  1 [T] COG3103 SH3 domain protein
------------------------------------------|||||-||||--------------  1 [S] COG3105 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|-||-------||||---  1 [R] COG3106 Predicted ATPase
------------------------------------------|||||-|||||-------------  1 [R] COG3107 Putative lipoprotein
------------------------------------------|||||-|-||-------|||||--  1 [S] COG3108 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||--------------  1 [T] COG3109 Activator of osmoprotectant transporter ProP
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3110 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||--------------  1 [S] COG3111 Uncharacterized conserved protein
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3112 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|-||||||----------  1 [R] COG3113 Predicted NTP binding protein (contains STAS domain)
------------------------------------------|||||-||||--------------  1 [U] COG3114 Heme exporter protein D
------------------------------------------|||||-|||||-------------  1 [D] COG3115 Cell division protein
------------------------------------------|||||||||||--|----------  1 [D] COG3116 Cell division protein
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [S] COG3117 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------||||------------|||||-|||||--|---|||||--  1 [O] COG3118 Thioredoxin domain-containing protein
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3120 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||--|||---|----------  1 [M] COG3133 Outer membrane lipoprotein
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3140 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|----------|||-|------|||||-|--||------||-||--  1 [P] COG3142 Uncharacterized protein involved in copper resistance
------------------------------------------|||||-||-|---|----------  1 [R] COG3150 Predicted esterase
------------------------------------------|||||-||-||--|-------|--  1 [S] COG3159 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|||-----||-----------------|||------------|||||-||-|-|||----------  1 [H] COG3161 4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)
------------------------------------------|||||-||-|||||----------  1 [S] COG3165 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||--|||-||-----------  1 [S] COG3171 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------||--|----------|||||--|||--------------  1 [H] COG3172 Predicted ATPase/kinase involved in NAD metabolism
--||------------|--||-----|-----|-||-------|||---|-|-|||||-||-|--|  1 [S] COG3177 Uncharacterized conserved protein
--------------------|-----|---------||--------|-||-|---|---||-----  1 [S] COG3181 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------|----|||--------|||||--|||----||--------  1 [H] COG3201 Nicotinamide mononucleotide transporter
----------------||||----------------------|||-|-||-||--|---|||||--  1 [M] COG3206 Uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis
-------------------------------------------------|||-||-----------  1 [S] COG3219 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|------------------|||-|||----|--|--  1 [S] COG3220 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------|-----------------------||-||-|---|-----|----  1 [E] COG3232 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate isomerase
-------------------|-|----|---||--||------|||-|--|-|-------|--|---  1 [S] COG3238 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|--------------------------|-||-||--|----------  1 [IR] COG3240 Phospholipase/lecithinase/hemolysin
------------------|-----------------------|||||--|||---|---|||||--  1 [M] COG3264 Small-conductance mechanosensitive channel
-------------||----|-|----|---------------|||||-||-|-|||---||-|---  1 [G] COG3265 Gluconate kinase
-||-||---|-|----|-------------------------|||-|--|||------|-|-----  1 [J] COG3276 Selenocysteine-specific translation elongation factor
------------------------------------------|||||-||||--------------  1 [KE] COG3283 Transcriptional regulator of aromatic amino acids metabolism
------------------||-------|-|------------|||||-||||-|||---|||||||  1 [C] COG3288 NAD/NADP transhydrogenase alpha subunit
--------|-||------------------------------|||-|---||--------------  1 [P] COG3301 Formate-dependent nitrite reductase, membrane component
----------------|-------------------------|||||---||----------|---  1 [R] COG3302 DMSO reductase anchor subunit
------------------------------------------|||-|---||------|-------  1 [P] COG3303 Formate-dependent nitrite reductase, periplasmic cytochrome c552 subunit
--------------------------|||-------------|||||-|--|-----------|--  1 [S] COG3304 Predicted membrane protein
------------------------------------------|||||-||||-||-----------  1 [C] COG3312 F0F1-type ATP synthase, subunit I
--|----------------||------|||------|-----------||-|--------|-|---  1 [Q] COG3315 O-Methyltransferase involved in polyketide biosynthesis
------------------------------------------|||||-||||-|||----------  1 [M] COG3317 Uncharacterized lipoprotein
--|-----------------------|||--------|--------|-||-|---|---|||||--  1 [R] COG3324 Predicted enzyme related to lactoylglutathione lyase
--------------------|-----|----------|--------|-||-|---|---||-----  1 [S] COG3333 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|---------------|-|----------|--|----||--|-|---  1 [P] COG3338 Carbonic anhydrase
--|-||----|------|-|-------------------------|-----|------|-------  1 [S] COG3350 Uncharacterized conserved protein
--|-|------|--|---------------|-----------|||||--|-|---|-------|--  1 [S] COG3384 Uncharacterized conserved protein
----||-----|-|-------|------------|-|---------|--|-||--|---|||||--  1 [G] COG3386 Gluconolactonase
------------------|||----------------|----|--||---||-------||||---  1 [S] COG3395 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------|---|-||||-|-||-|||-|-|--|--------------  1 [G] COG3414 Phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component
--|---------------------------------------||||---|-|-||----|-|||--  1 [S] COG3422 Uncharacterized conserved protein
------------------------------------------|||||---||--|-----------  1 [K] COG3423 Predicted transcriptional regulator
--------------------|---------||||-||-----|||||----|--------------  1 [G] COG3444 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [R] COG3445 Acid-induced glycyl radical enzyme
------------------------------------------|||||---||-||----||||---  1 [MU] COG3468 Type V secretory pathway, adhesin AidA
--------------------|---|--------------------|-----|------|--|----  1 [P] COG3470 Uncharacterized protein probably involved in high-affinity Fe2+ transport
-------------------------------------------------|-|-|||----------  1 [S] COG3471 Predicted periplasmic/secreted protein
--------------------------------|------------------|--|---|-------  1 [S] COG3512 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------------|--|---------------|--|---|-------  1 [S] COG3513 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------------------------------|-||---|-|-----  1 [M] COG3524 Capsule polysaccharide export protein
---------------------------------------------------|-||---|-|-----  1 [M] COG3562 Capsule polysaccharide export protein
---------------------------------------------------|-||---|-|-----  1 [M] COG3563 Capsule polysaccharide export protein
--|----------------|-----------------------------|||---|------|---  1 [H] COG3585 Molybdopterin-binding protein
--------------------|-------------------------|----|-||-||--------  1 [V] COG3587 Restriction endonuclease
-||---------------|-|---------------------|||||-||-|-------|--|---  1 [L] COG3593 Predicted ATP-dependent endonuclease of the OLD family
|------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|-------  1 [S] COG3610 Uncharacterized conserved protein
---------------------------------|--------|||||---||-||-----------  1 [P] COG3615 Uncharacterized protein/domain, possibly involved in tellurite resistance
--------------------------|---------------|||||--|||---|----|||---  1 [G] COG3622 Hydroxypyruvate isomerase
--------------------------------||-----||-|||||-|-||--------------  1 [G] COG3623 Putative L-xylulose-5-phosphate 3-epimerase
------|||---------------|---------------------|-|--|--------------  1 [C] COG3630 Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, gamma subunit
--------------------------------|---------|||||-||||-||---|-------  1 [E] COG3633 Na+/serine symporter
------------------------------------------|||||---||-||----|||||||  1 [M] COG3637 Opacity protein and related surface antigens
-------------------------------|-|-||------||-----||--------------  1 [S] COG3646 Uncharacterized phage-encoded protein
------------------------------------------|||---|--|--------------  1 [S] COG3647 Predicted membrane protein
--|-----------|------|--------------------|||-|----|-|||--|----|--  1 [L] COG3663 G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase
--------------------|---|--------------------||---||-------||||---  1 [R] COG3683 ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3691 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------|---||||-----------|-|-------||-|---  1 [S] COG3708 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------------------|||||-|--|---|---||-||--  1 [M] COG3713 Outer membrane protein V
--------------------|---------||||-||-----|||||----|--------------  1 [G] COG3715 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC
--------------------|---------||||-||-----|||||----|--------------  1 [G] COG3716 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IID
------------------------------------------|||-|---||-------|||||--  1 [J] COG3719 Ribonuclease I
-------------------------------------------|||--|--|-------|------  1 [P] COG3721 Putative heme iron utilization protein
------------------------------------------|||||-|--|--------------  1 [K] COG3722 Transcriptional regulator
------------------------------------------|||||-||-|--------------  1 [R] COG3726 Uncharacterized membrane protein affecting hemolysin expression
-----------------------------------|-|----|||-|----|----------|---  1 [G] COG3730 Phosphotransferase system sorbitol-specific component IIC
-----------------------------------|-|----|||-|----|----------|---  1 [G] COG3731 Phosphotransferase system sorbitol-specific component IIA
-----------------------------------|-|----||--|----|----------|---  1 [G] COG3732 Phosphotransferase system sorbitol-specific component IIBC
------------------------------------------|||-|--|-|-----------|--  1 [S] COG3738 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------|---|||-------------|-------|---|--  1 [S] COG3739 Uncharacterized integral membrane protein
------------------------|--------------------------|---|-----|||--  1 [S] COG3762 Predicted membrane protein
------------------------------------------|||||--|||--------------  1 [M] COG3765 Chain length determinant protein
-------------------------------------------------|||-||-----------  1 [S] COG3767 Uncharacterized low-complexity protein
------------------------------------------|||||---||-------||||---  1 [S] COG3768 Predicted membrane protein
------------------------------------------|||||---||-------||||---  1 [M] COG3770 Murein endopeptidase
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [S] COG3771 Predicted membrane protein
-------------||-----|---------------------------|--|---|---|------  1 [M] COG3774 Mannosyltransferase OCH1 and related enzymes
------------------------------------------|||||-|--|--------------  1 [C] COG3783 Soluble cytochrome b562
------------------------------------------|||||----|------|-------  1 [S] COG3787 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|--|--------------  1 [S] COG3790 Predicted membrane protein
------------------------------------|------|||-----|---------||---  1 [R] COG3822 ABC-type sugar transport system, auxiliary component
---------------------|------------|-------|||||--|-|---|---||||---  1 [G] COG3836 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase
------------------------------------------|||||-|-||-------||||---  1 [H] COG3840 ABC-type thiamine transport system, ATPase component
-------------------------------------------------|-|---|---||-||--  1 [U] COG3847 Flp pilus assembly protein, pilin Flp
------------------------------------------|||||-||||-|||----------  1 [T] COG3850 Signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific
------------------------------------------|||-|-|--|--------------  1 [T] COG3851 Signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [L] COG3923 Primosomal replication protein N''
------------------------------------------|||||---||--------------  1 [S] COG3924 Predicted membrane protein
------------------------------------------|||||---||--------------  1 [G] COG3925 N-terminal domain of the phosphotransferase system fructose-specific component IIB
---------------------|-----||-------------|||||--|-|---|---|-|-|--  1 [Q] COG3971 2-keto-4-pentenoate hydratase
------------------------------------------|||||-|--||-------------  1 [S] COG3978 Acetolactate synthase (isozyme II), small (regulatory) subunit
--------------------||----|---||||---|----------|--|----------|---  1 [R] COG3981 Predicted acetyltransferase
-----------------|---------------------------|-----|--------|-----  1 [R] COG4099 Predicted peptidase
----------------|-------------------------||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG4105 DNA uptake lipoprotein
------------------||-|----|---||||||------||||||||||||||---|||||--  1 [J] COG4108 Peptide chain release factor RF-3
||--------------|-||-|---|----------------|||||-||||---|--|||--|--  1 [S] COG4121 Uncharacterized conserved protein
----------------||--|---------||||||||||--|||||-|-||----||||||||--  1 [R] COG4123 Predicted O-methyltransferase
------------------------------------------|||||-|||||------|||||||  1 [O] COG4133 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, ATPase component
------------------------------------------|||||-||-|||||----------  1 [R] COG4137 ABC-type uncharacterized transport system, permease component
---|--||--|----------|--|-----------------|||||-|-||-||----||||---  1 [H] COG4143 ABC-type thiamine transport system, periplasmic component
--------|-----------|----|----------------|||||---||--------------  1 [H] COG4145 Na+/panthothenate symporter
-------------------------------------|----|||-----||--------------  1 [R] COG4146 Predicted symporter
----------------------------------|-------|||||-||||-------||||---  1 [P] COG4148 ABC-type molybdate transport system, ATPase component
--|---------|---|-||------|||-----||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [P] COG4149 ABC-type molybdate transport system, permease component
-------------------------------------------|||-----|----------|---  1 [R] COG4158 Predicted ABC-type sugar transport system, permease component
------------------------------------------|||||-||||-------||-|---  1 [E] COG4160 ABC-type arginine/histidine transport system, permease component
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [E] COG4161 ABC-type arginine transport system, ATPase component
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [V] COG4167 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [V] COG4168 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [V] COG4170 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [V] COG4171 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
----------------------------------------------|-|--|--------------  1 [T] COG4192 Signal transduction histidine kinase regulating phosphoglycerate transport system
--------------------|---|-----------------|||||-|-||--------------  1 [G] COG4211 ABC-type glucose/galactose transport system, permease component
------------------------------------------|||||-||||-------||-|---  1 [E] COG4215 ABC-type arginine transport system, permease component
---|---------||---||||----|||--|-|||------|||-|-||||||||||||||----  1 [R] COG4221 Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity
------------------------------------------|||||--|-|-|||---|||||--  1 [C] COG4230 Delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase
----------------------||------------------|||||-||||||||--|----|--  1 [OC] COG4232 Thiol:disulfide interchange protein
-------------|------|----------|-|-|---------------|--------------  1 [S] COG4283 Uncharacterized conserved protein
-------------------|------|||----------------------|--------------  1 [S] COG4325 Predicted membrane protein
------------------------------------|--------------|-------|------  1 [L] COG4335 DNA alkylation repair enzyme
---------------------------------------------------|-|||----------  1 [L] COG4389 Site-specific recombinase
---------------------------------------------------|-|||----------  1 [S] COG4390 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|------------------------|-----|------|-------  1 [S] COG4393 Predicted membrane protein
---------------------------------------------||----|----------|---  1 [S] COG4457 Uncharacterized protein conserved in bacteria, putative virulence factor
---------------------------------------------||----|----------|---  1 [S] COG4458 Uncharacterized protein conserved in bacteria, putative virulence factor
------------------------------------------|||||-||||-------|||----  1 [P] COG4531 ABC-type Zn2+ transport system, periplasmic component/surface adhesin
------------------------------------------||||||||||||||----------  1 [P] COG4535 Putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC
----------------------------------|-------|||||-||||---|----||||||  1 [P] COG4536 Putative Mg2+ and Co2+ transporter CorB
--------------------|---|-------------------------||--------------  1 [O] COG4545 Glutaredoxin-related protein
---------------------|----|----------------|||--||-|-------||-|---  1 [P] COG4558 ABC-type hemin transport system, periplasmic component
----------------------------------------------|--|-|---|---|||||--  1 [T] COG4566 Response regulator
------------------------------------------|||||--|-|---|----------  1 [S] COG4575 Uncharacterized conserved protein
--------------------------||||-------|----|||-|----|----------|---  1 [K] COG4578 Glucitol operon activator
--------------------|---------------------||||--||-|--------|-----  1 [R] COG4589 Predicted CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase
----------------------------------|-|-----|--------|--------------  1 [P] COG4594 ABC-type Fe3+-citrate transport system, periplasmic component
------------------------------------------|||||-||||--------------  1 [M] COG4623 Predicted soluble lytic transglycosylase fused to an ABC-type amino acid-binding protein
--|----------------------------|----------|||||-|--|----------|---  1 [CH] COG4635 Flavodoxin
--|--------------|--|---||---------|------||||||||||--------------  1 [C] COG4656 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC
--|--------------|--|---------------------||||||||||--------------  1 [C] COG4657 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfA
--|--------------|--|---|-----------------||||||||||--------------  1 [C] COG4658 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfD
--|--------------|--|---------------------||||||||||--------------  1 [C] COG4659 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfG
--|--------------|--|---------------------||||||||||--------------  1 [C] COG4660 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfE
--------------------|-----|---|-----------|||||-|--|--------------  1 [R] COG4667 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily
-------------------------------------------||------|---|----------  1 [S] COG4688 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------------------------|--|-||--------------  1 [S] COG4701 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------------------------------------|----|---|----------  1 [S] COG4714 Uncharacterized membrane-anchored protein conserved in bacteria
---|----|----------------------------|-----------|-|--------------  1 [S] COG4729 Uncharacterized conserved protein
-------------||-||||||||||----------------||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87
------------------------------------------|||||||-||--------------  1 [K] COG4776 Exoribonuclease II
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [R] COG4785 Lipoprotein NlpI, contains TPR repeats
------------------------------------------|||||-|||||--|-------|--  1 [U] COG4795 Type II secretory pathway, component PulJ
----------------||||----------------------|||||-||||||||----------  1 [U] COG4796 Type II secretory pathway, component HofQ
--------------------|------------------------------|-||---------||  1 [R] COG4797 Predicted regulatory domain of a methyltransferase
-----------------------------------|------|||||----|--------------  1 [S] COG4811 Predicted membrane protein
--|----------------||------------------------|-----|---------|----  1 [S] COG4929 Uncharacterized membrane-anchored protein
--------------------|---------------------|||||-|||||||----|||||--  1 [D] COG4942 Membrane-bound metallopeptidase
-------------------||---------------------|||-|----||------||-||-|  1 [M] COG4953 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC
---------------------------------------------|---|-|---|---||-||--  1 [OU] COG4960 Flp pilus assembly protein, protease CpaA
---------------------------------------------|---|-|---|---||-||--  1 [U] COG4961 Flp pilus assembly protein TadG
||----||-|----------------|||-|--------------|---|-||--|---||-||--  1 [U] COG4962 Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF
---------------------------------------------|---|-|---|---||-||--  1 [U] COG4963 Flp pilus assembly protein, ATPase CpaE
---------------------|---------------------------|-|---|---||-||--  1 [U] COG4964 Flp pilus assembly protein, secretin CpaC
--------------------------|||----------------|---|-|---|---||-||--  1 [U] COG4965 Flp pilus assembly protein TadB
----------------|-------------------------|||||-||||||||----------  1 [NU] COG4969 Tfp pilus assembly protein, major pilin PilA
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1 [L] COG4973 Site-specific recombinase XerC
--------------------|---|-|||||---||||----|||||-||||||||---|||||||  1 [L] COG4974 Site-specific recombinase XerD
--------------------|------------------------|-----|--------------  1 [S] COG4984 Predicted membrane protein
-------------------------------|--||||----|||||-|-||-------|-|-|--  1 [CO] COG4987 ABC-type transport system involved in cytochrome bd biosynthesis, fused ATPase and permease components
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||--  1 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase
------------------------------------------||||||||||||||----------  1 [K] COG5007 Predicted transcriptional regulator, BolA superfamily
----------------|-------||----------------|||||-||||||||---|||||||  1 [M] COG5009 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein
---------------------------------------------|---|-|---|---||-||--  1 [U] COG5010 Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeats
|||---|-|-------||--|---|-------|-------------|-||-|------|-------  1 [C] COG5016 Pyruvate/oxaloacetate carboxyltransferase
---------------------|--------------------|||||-|-||-||-----------  1 [S] COG5339 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------||-------|--------||||----|||||||||||--|||||||||||  1 [O] COG5405 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), peptidase subunit
------------------||------------------------------||--------------  1 [S] COG5413 Uncharacterized integral membrane protein
--|-------------------------------|--------||||----|--------------  1 [L] COG5519 Superfamily II helicase and inactivated derivatives
------------------------------------------|||-|--|-||-------------  1 [N] COG5571 Autotransporter protein or domain, integral membrane beta-barrel involved in protein secretion
------------------------------------------------|-||-------------|  1 [R] COG5595 Zn-ribbon-containing, possibly nucleic-acid-binding protein
------------------------------------------|||||-|-||--------------  1 [R] COG5633 Predicted periplasmic lipoprotein
------------------------------------------|||||--|||--------------  1 [R] COG5645 Predicted periplasmic lipoprotein
||||--||||--||----||-------||--|---|-|----||||--|-|---------|||---  0 [E] COG0076 Glutamate decarboxylase and related PLP-dependent proteins
--||||||--|||||----|-|----|||||---|-||----|||||-|||----|---||||---  0 [E] COG0160 4-aminobutyrate aminotransferase and related aminotransferases
||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-|||||||  0 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase
|||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|----  0 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D
-------------||---||-|-----|||------------|||||-|||-||||---|||||--  0 [H] COG0259 Pyridoxamine-phosphate oxidase
||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||--  0 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase
|||---||||--------||----------|-----------|||-|---|-----|||-------  0 [O] COG0298 Hydrogenase maturation factor
||||----||--------||----------|----|----------|---|----------|----  0 [P] COG0310 ABC-type Co2+ transport system, permease component
|||-----||----|-|-||||----|||-----|--||---|||||--||----||||||||---  0 [OK] COG0378 Ni2+-binding GTPase involved in regulation of expression and maturation of urease and hydrogenase
|||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-||||||||||||||  0 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components
-------------||-----|---|------|||||||-||||||||-|-|-----------|---  0 [M] COG0510 Predicted choline kinase involved in LPS biosynthesis
---|||||--|-|-----|------------||||-----|-|||-|--||---------|-----  0 [E] COG0549 Carbamate kinase
|||-||--||-|-||--||--|----|||--|---|||-------|---||-||||---|||||--  0 [S] COG0599 Uncharacterized homolog of gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit
||||--||||-||----|||||----||||||||||||||||-||-|---|--------|||----  0 [P] COG0619 ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters
---|---------||-|-||-|----|----|--||||----|||||-|||-|--|---|||||--  0 [MG] COG0702 Predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerases
-------------|----------------------|-----|||-|---|-|||-|||--|-|--  0 [G] COG0738 Fucose permease
------------------|-----------------------|||||---|-----||||---|--  0 [E] COG0754 Glutathionylspermidine synthase
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  0 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component
------------------|-|-----|-------|-------|||||-|||--||-||--------  0 [E] COG0786 Na+/glutamate symporter
--------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||-||||---  0 [E] COG0804 Urea amidohydrolase (urease) alpha subunit
-|-------------------------|||||||||||------------|-----||-|--|---  0 [L] COG0827 Adenine-specific DNA methylase
--------------|---||-|----|-------|--||----||----||----|||-||||---  0 [O] COG0829 Urease accessory protein UreH
--------------|---||-|----|||-----|--||----|||---||----|||-||||---  0 [O] COG0830 Urease accessory protein UreF
--------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||-||||---  0 [E] COG0831 Urea amidohydrolase (urease) gamma subunit
--------------|---||-|----|||-----|-|||----|||---||----|||--|||---  0 [E] COG0832 Urea amidohydrolase (urease) beta subunit
-|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||--  0 [L] COG0863 DNA modification methylase
-|||||----|----------|---||---|-----|-|----||-|---|---|-|||----|--  0 [V] COG1002 Type II restriction enzyme, methylase subunits
-----------|-||---||------||||-------|----|||||--||--|||---|||||--  0 [C] COG1062 Zn-dependent alcohol dehydrogenases, class III
--|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||--  0 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases
||||--|||||||----|||||--|-||||||||||||||||-||-|-|-|----|---|||----  0 [P] COG1122 ABC-type cobalt transport system, ATPase component
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  0 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component
--------------------||----||||||-|-|||----|||||---|----|----------  0 [E] COG1168 Bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities
-------------------|----------||--||||-||||||||--||----|---||-|---  0 [I] COG1182 Acyl carrier protein phosphodiesterase
|-|--||||---|-----||-|----|||||-----------|---|--||-|--|---||-||--  0 [R] COG1216 Predicted glycosyltransferases
||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-||||||||||||||  0 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component
---|-------|-||---||-|----||||-|--||||----|||||-|||----|---||||---  0 [C] COG1252 NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit
--------------------|----|------|||-||----|||-|---|------------|--  0 [S] COG1288 Predicted membrane protein
---|--|------|-------------||--------------------||-||||--|----|--  0 [S] COG1297 Predicted membrane protein
--------------------||---||---||||||||-||||||||-|||----|----------  0 [G] COG1299 Phosphotransferase system, fructose-specific IIC component
----||-----------|------------||----||----|||||---|--------||||---  0 [G] COG1312 D-mannonate dehydratase
-||-|-||--||-----|--|------||----|-|--------------|-----|||---|--|  0 [R] COG1373 Predicted ATPase (AAA+ superfamily)
-----------------|||-|----|||||------|----|||||-|||-|--|---|||||--  0 [E] COG1410 Methionine synthase I, cobalamin-binding domain
-||---|||-||------||-|-----||-----------------|---|-|--|---||-||-|  0 [R] COG1487 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain
------||------------||----|--|----|-||----|||||-|||--|||--||------  0 [R] COG1540 Uncharacterized proteins, homologs of lactam utilization protein B
----------------|-----------------|-|-----|||||-|||--|||---|||||||  0 [V] COG1566 Multidrug resistance efflux pump
--|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--|||||||||||||  0 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase
|||---|||||||---||------------|---|-----------|---|--------||----|  0 [R] COG1708 Predicted nucleotidyltransferases
|--------|--------||-------||||----|||----------|||--|||||||||||||  0 [S] COG1714 Predicted membrane protein/domain
|||---||||-||-------|-----------|---------|||-|-|||---------------  0 [H] COG1767 Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthetase
-------------------------|------|--||-------------|---------------  0 [R] COG1783 Phage terminase large subunit
--------|--|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-|  0 [I] COG1788 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit
|||||||||||||||||----------||-------||----------|||--||---|||-||--  0 [L] COG1793 ATP-dependent DNA ligase
--|----------------|||----||||-||||||------||-|--||-||||---|||||-|  0 [I] COG1835 Predicted acyltransferases
--||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||--  0 [L] COG1943 Transposase and inactivated derivatives
------||-----|------||----||||----|-||----|||||-|||--|||--||---|--  0 [E] COG1984 Allophanate hydrolase subunit 2
--------|---|-------|-----|-----|----|----|------||-----||--------  0 [I] COG2031 Short chain fatty acids transporter
------||-----|------||----||||----|-||----|||-|-|||--|||--||---|--  0 [E] COG2049 Allophanate hydrolase subunit 1
-----------|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-|  0 [I] COG2057 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit
-----------------|-------------|----||----|||||---|--------||||---  0 [G] COG2115 Xylose isomerase
---------------------------||----|--------|||-|--||-|||-||-||-|---  0 [D] COG2184 Protein involved in cell division
---------------------|----|||-|---||||----|||-|--||----|--||-|----  0 [S] COG2258 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---|-------||-------||----|||--||---------|||||-|||----|---|||||--  0 [G] COG2301 Citrate lyase beta subunit
-|-------------------|-------------|--------|-----|-|||-----------  0 [S] COG2369 Uncharacterized protein, homolog of phage Mu protein gp30
------------------||-|----|-------|--||----|||---||----|||-||||---  0 [O] COG2371 Urease accessory protein UreE
------||--|-|----|------------|--|--------|||||---|---------------  0 [G] COG2407 L-fucose isomerase and related proteins
--|-||--|----||---||||----|||--|||||-|||--|||||-|||--|||---|||||--  0 [L] COG2801 Transposase and inactivated derivatives
-------------------|-|------------||--------|-----|--||-----------  0 [R] COG2842 Uncharacterized ATPase, putative transposase
------------------------------|---|-------|||||---|--|||----|-----  0 [D] COG2846 Regulator of cell morphogenesis and NO signaling
-------------------|-|-------------|------|-------|--||-----|--|--  0 [S] COG2852 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----|--------------||----|||--|||||-|----|||||-|||----|---|||||--  0 [L] COG2963 Transposase and inactivated derivatives
------------------------------------------|||||-|||--|||----------  0 [S] COG2975 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|-------------|--------|||-|-|-|-|---||-|------  0 [S] COG3041 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|----------||---------|||-|-|-|---------------  0 [C] COG3051 Citrate lyase, alpha subunit
--------------------|----------||---------|||-|-|-|---------------  0 [C] COG3052 Citrate lyase, gamma subunit
--------------------|----------||---------|||-|-|-|---------------  0 [C] COG3053 Citrate lyase synthetase
--------------------|-----------||--------|||||-|-|-|------||----|  0 [L] COG3077 DNA-damage-inducible protein J
-------------------||-----|---------------|||---|||-|-------|-||--  0 [R] COG3093 Plasmid maintenance system antidote protein
---------------------|------------------------|--||---------|-----  0 [R] COG3179 Predicted chitinase
-------------------------------|---||-----|||||--||---------------  0 [S] COG3223 Predicted membrane protein
-----------------------------------||-----|-||----|-|-|-----------  0 [S] COG3299 Uncharacterized homolog of phage Mu protein gp47
--------------------------------------------------|-||--||--------  0 [S] COG3309 Uncharacterized virulence-associated protein D
---------------------------------------|----------|---|--|--------  0 [S] COG3421 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|----------|-|----------------|-------------||  0 [M] COG3475 LPS biosynthesis protein
-------------------|----------------------------|-|-|-------|-|---  0 [R] COG3549 Plasmid maintenance system killer protein
--------------------|-----|---------------|||---|-|--|-|---||-||--  0 [R] COG3550 Uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzymes
------------------------------|||-|--------||-----|---|-----------  0 [K] COG3561 Phage anti-repressor protein
-----------------------------------|--------------|-|---------|---  0 [S] COG3566 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------------------------|--------------|-|---------|---  0 [S] COG3567 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|----------------------------------------||-----|-----||---|----  0 [S] COG3586 Uncharacterized conserved protein
-------------------------------||--|-------|||---||-|--------|----  0 [K] COG3617 Prophage antirepressor
---------------------------------------------|----|-|--|----|--|--  0 [K] COG3636 Predicted transcriptional regulator
-------------------|-------------------------|----|-|--|----|--|--  0 [S] COG3657 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---|----------------------------------------------|--||-----------  0 [L] COG3676 Transposase and inactivated derivatives
-|------------------|---------------------|||-|---|---------------  0 [S] COG3681 Uncharacterized conserved protein
------------------------------------------|||-----|--|---------|--  0 [S] COG3692 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|-----------|---------|||-|-|-|---------------  0 [HI] COG3697 Phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase (holo-ACP synthetase)
--------------------------------|---------|||-|---|---------------  0 [R] COG3700 Acid phosphatase (class B)
--------------------------|----|-|||--------------|--|||---|--|---  0 [S] COG3759 Predicted membrane protein
------------------------------------------|-||----|--||-----------  0 [S] COG3778 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|-----||----|||||-|||---------------  0 [KT] COG3835 Sugar diacid utilization regulator
--------------------------------------------||--|||---------------  0 [R] COG3941 Mu-like prophage protein
------------------------------|--|----------------|---------------  0 [M] COG3955 Exopolysaccharide biosynthesis protein
---------------------------------|--------|||-|---|--------||||---  0 [G] COG4154 Fucose dissimilation pathway protein FucU
-------------------|-------||-|-------------------|--------|------  0 [S] COG4185 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------------|-|--||||----|----|---||||---  0 [G] COG4213 ABC-type xylose transport system, periplasmic component
-------------------------------------|-|--||||----|----|---||||---  0 [G] COG4214 ABC-type xylose transport system, permease component
--------------------------------------------||----|--||-----------  0 [R] COG4228 Mu-like prophage DNA circulation protein
--------------------------------------------------|--||-------|---  0 [S] COG4316 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------|----------------------|-----|---------------  0 [R] COG4373 Mu-like prophage FluMu protein gp28
--------------------------------------------||----|--||-----------  0 [R] COG4379 Mu-like prophage tail protein gpP
--------------------------------------------||----|--||-----------  0 [S] COG4381 Mu-like prophage protein gp46
--------------------------------------------|-----|--||-----------  0 [S] COG4382 Mu-like prophage protein gp16
--------------------------------------------|-----|--||-----------  0 [S] COG4383 Mu-like prophage protein gp29
--------------------------------------------||----|--||-----------  0 [S] COG4384 Mu-like prophage protein gp45
--------------------------------------------||----|--||-----------  0 [R] COG4386 Mu-like prophage tail sheath protein gpL
--------------------------------------------|-----|--||-----------  0 [S] COG4387 Mu-like prophage protein gp36
--------------------------------------------|-----|--||-----------  0 [R] COG4388 Mu-like prophage I protein
--------------------------------------------|-----|---|-----------  0 [R] COG4396 Mu-like prophage host-nuclease inhibitor protein Gam
--------------------------------------------|-----|---|-----------  0 [R] COG4397 Mu-like prophage major head subunit gpT
------------------------------|-------------|-----|---------------  0 [R] COG4416 Mu-like prophage protein Com
---------------------------||--------------||-|-|-|-|--|----|-----  0 [S] COG4453 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------|---------------------------|---|-|-------|-||--  0 [S] COG4456 Virulence-associated protein and related proteins
--------------------------------------------|---|-|---------------  0 [S] COG4518 Mu-like prophage FluMu protein gp41
-------------------|-------------|---------||||---|-|-------------  0 [S] COG4679 Phage-related protein
--------------------|---|--------|----------------|---------------  0 [M] COG4750 CTP:phosphocholine cytidylyltransferase involved in choline phosphorylation for cell surface LPS epitopes
--------------------------------------------|-----|--||-----------  0 [R] COG5003 Mu-like prophage protein gp37
--------------------------------------------|-----|---|-----------  0 [R] COG5005 Mu-like prophage protein gpG
--|-----------------|-----------------------------|--||------|----  0 [P] COG5266 ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component
--------------------------------------------|-|-|-|---------------  0 [S] COG5566 Uncharacterized conserved protein