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| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ |||---||--||-----||||------------------------|------------|------- 15 [R] COG1672 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) -|--||||-|--||--|-||-|-----|||------|----------------------------- 14 [L] COG1372 Intein/homing endonuclease |||||||||||||--------|----|||-|-----||----|||||-||||-|||---|||||-- 14 [K] COG1522 Transcriptional regulators ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 12 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily |||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 10 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases ||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 8 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis |||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 7 [R] COG0517 FOG: CBS domain |||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||-- 7 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators -|||||||||||-------|----------------------|||||-||---||-----|-|--- 7 [C] COG1042 Acyl-CoA synthetase (NDP forming) |-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 7 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component |||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||-- 6 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs |||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 6 [R] COG0457 FOG: TPR repeat ||||||||||||||--||||---------------------------------------||-|--- 6 [T] COG0467 RecA-superfamily ATPases implicated in signal transduction |-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 6 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily ||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||-- 6 [R] COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily) -||-|||||-|-|-----------------|-----------|||--------------------- 6 [C] COG2414 Aldehyde:ferredoxin oxidoreductase |||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||--- 6 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components -|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 5 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||-||||||||-||-||--|---||||--- 5 [G] COG0395 ABC-type sugar transport system, permease component ||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 5 [M] COG0438 Glycosyltransferase |||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||-- 5 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases |||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 5 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||--- 5 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 5 [NT] COG0840 Methyl-accepting chemotaxis protein |||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||-- 5 [C] COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit --|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||--- 5 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|---||||--- 5 [G] COG1175 ABC-type sugar transport systems, permease components -||||||||--||----------------------------------------------------- 5 [N] COG1681 Archaeal flagellins |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control --||||||--|||||----|-|----|||||---|-||----|||||-|||----|---||||--- 4 [E] COG0160 4-aminobutyrate aminotransferase and related aminotransferases ||||||||||------||||||--||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 4 [D] COG0206 Cell division GTPase --|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||--- 4 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component |||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-|||||||||||||| 4 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components |||||||||||||---||||-|-----||-||--|-||-----------|-----|----|-|--- 4 [R] COG0535 Predicted Fe-S oxidoreductases |||-||||||-|-||-||--|---|-|||-||-|-|||----|||||-||---|||---|----|| 4 [HC] COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases -|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases ||||-||||-|||----|||-|----|||-----||||----|||-|-||---------|||--|| 4 [CP] COG0651 Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 4 [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit |-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||-- 4 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component |||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||------- 4 [C] COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit |||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||-- 4 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon) ||||--|||||-|----|-|||--------||||||||||--|||-|--|----------|----- 4 [G] COG1363 Cellulase M and related proteins -||-|-||--||-----|--|------||----|-|--------------|-----|||---|--| 4 [R] COG1373 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) |||-|||||||------|------------|-----------------|----------------- 4 [S] COG1433 Uncharacterized conserved protein ---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||----|||||-||-||--|---||||--- 4 [G] COG1653 ABC-type sugar transport system, periplasmic component ||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--|| 4 [P] COG2111 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhB subunit --|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||--- 4 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase ||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||------------- 3 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [K] COG0195 Transcription elongation factor |||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase ||-|--||||------||-|----||-||||-----||----------||-----||||------- 3 [D] COG0455 ATPases involved in chromosome partitioning ||||||||||||||||--||-|----||||------||-----------|-----|--|||-|--- 3 [O] COG0464 ATPases of the AAA+ class |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase |||||||||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 3 [E] COG0498 Threonine synthase |||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||-- 3 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family ||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 3 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump |||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---||||||| 3 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins -||||||||-|||---------------------------------------|---||-||||||| 3 [NU] COG0630 Type IV secretory pathway, VirB11 components, and related ATPases involved in archaeal flagella biosynthesis ||||||||||||||||-----------|||------------------------------------ 3 [O] COG0638 20S proteasome, alpha and beta subunits |||||||||||||---||||-|---||||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 3 [R] COG0714 MoxR-like ATPases |||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [R] COG0730 Predicted permeases --|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||--- 3 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component ||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--|| 3 [P] COG1006 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit |||-|||||||||----|||||-----||-||-----|----|||-|-||------------|--- 3 [C] COG1032 Fe-S oxidoreductase --|||||||-||||||---|||--|-|||||-||||------|||||-|----------------- 3 [KL] COG1061 DNA or RNA helicases of superfamily II |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 3 [G] COG1109 Phosphomannomutase |||||||||||||------|------|||-------------|||----|-----|---|||||-- 3 [R] COG1201 Lhr-like helicases |||---|||-|||---||--|-----------|----|----|||||----|-------------- 3 [R] COG1203 Predicted helicases |--||||-|--|-|---|--||-----||-|-|-|-||-------||-||-----|---|||||-- 3 [Q] COG1228 Imidazolonepropionase and related amidohydrolases ||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---||||||| 3 [R] COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I |||---||||-------|------------|---------------|------------------- 3 [R] COG1237 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily II ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 3 [L] COG1241 Predicted ATPase involved in replication control, Cdc46/Mcm family --|||||||--||----|||-|--||----|---|||||||--------|-----|----||---- 3 [R] COG1277 ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component ||||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|| 3 [P] COG1320 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhG subunit |||||||||||||--------|--------------|----------------------------- 3 [K] COG1378 Predicted transcriptional regulators |||---|||-|||---||-||-----------|----|---------------------------- 3 [L] COG1468 RecB family exonuclease -||---|||-||------||-|-----||-----------------|---|-|--|---||-||-| 3 [R] COG1487 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain |||--||||-------||------------------------------------------------ 3 [L] COG1583 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily) |-|---||---|----||------------|-----||---------------------||||--- 3 [S] COG1633 Uncharacterized conserved protein |||---|||-|||---||------------------------------------------------ 3 [L] COG1688 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily) |||---|||||||---||------------|---|-----------|---|--------||----| 3 [R] COG1708 Predicted nucleotidyltransferases --|||||||-|-|---||||-|---|-|||-----|||----------||-----|---|||||-- 3 [R] COG1721 Uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain) -||-||||-|-||---||---|----|||-|----|-|--|||||||-||---|||---||-||-- 3 [O] COG1765 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation |||---|||-|||---|---|--------------------------------------------- 3 [L] COG1857 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair ||||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|| 3 [P] COG1863 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit ---|--|||-|||-----||-------||-|----|||----|||--------------||-|--- 3 [K] COG2002 Regulators of stationary/sporulation gene expression -|----||----------------------------|----------------------------- 3 [M] COG2247 Putative cell wall-binding domain --|-|||||-|||----------------------------------------------------- 3 [S] COG2512 Uncharacterized membrane-associated protein/domain ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 3 [R] COG2520 Predicted methyltransferase --|-||||--||||---|--||--------|------|----------||-----|---||||--- 3 [R] COG2872 Predicted metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase HxxxH domain ----||||--|||----------------------------------------------------- 3 [S] COG3371 Predicted membrane protein |||||||||||||||-||||-------||||-||-|||----|--||--|--|------||-|--- 2 [F] COG0005 Purine nucleoside phosphorylase |||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||--- 2 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0073 EMAP domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit ---|||||---||||-||||--||--|----|||||||-||||||||-||---------------- 2 [H] COG0095 Lipoate-protein ligase A ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0148 Enolase -||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 2 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes |-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 2 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase ||-||||||||||---|-||-|----|||-------||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [C] COG0243 Anaerobic dehydrogenases, typically selenocysteine-containing |||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|---- 2 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D |||||||||||||----|------|-----|||||||||||||||||-||||-------------- 2 [H] COG0301 Thiamine biosynthesis ATP pyrophosphatase |||||||||||||---|-||-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [H] COG0303 Molybdopterin biosynthesis enzyme ||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|--- 2 [P] COG0306 Phosphate/sulphate permeases |||||||||||||---|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 2 [O] COG0309 Hydrogenase maturation factor |||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 2 [O] COG0396 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, ATPase component ||||||||||||||||---|----------------------|||||-||---------------- 2 [L] COG0417 DNA polymerase elongation subunit (family B) |||---|||-------|||||---------|-----------|||-|--|-----|---------- 2 [C] COG0426 Uncharacterized flavoproteins |||---|||||||-|-||||-|-----||-|-----||----|||-|-||---------||----- 2 [S] COG0432 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases ||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning ||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases --|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--|||||||| 2 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases |||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||-- 2 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function |||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein ||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase |||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [E] COG0527 Aspartokinases |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase) |||||||||-|||||||-||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases |-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase |-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-|| 2 [ER] COG0591 Na+/proline symporter |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog) ||||--||-|-------|||||----||||||||||||||||--------------|||||||||| 2 [R] COG0595 Predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily -||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||-- 2 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component -||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||-- 2 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component |||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----|||||||||||||||||||||||| 2 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class) -|||--|||||-|---||||||--|||||-||||||||||||------|----------------- 2 [R] COG0618 Exopolyphosphatase-related proteins |||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||-- 2 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent) ||||--|||||||||--|--|---|----|||||||||-||||||||-||---------------- 2 [R] COG0622 Predicted phosphoesterase ||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0628 Predicted permease -|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||-- 2 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases |||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||-- 2 [C] COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins) |||--|||-|-|-----|---------||-------------|||-|------------------- 2 [C] COG0650 Formate hydrogenlyase subunit 4 --|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating) |-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||-- 2 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins -|||||||-|||----||||-|---|-||-------------|||-|-----|---||-------- 2 [L] COG0675 Transposase and inactivated derivatives ||----||--|------|------------|---|-------|||||-||-||--|---||-|--- 2 [M] COG0677 UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase |||---||||-|----|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 2 [C] COG0680 Ni,Fe-hydrogenase maturation factor ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 2 [U] COG0681 Signal peptidase I |||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||-- 2 [O] COG0719 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component ||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase -|||--|||-||------||-|---------||---------|||||-||--|--||||-|-|--- 2 [R] COG0727 Predicted Fe-S-cluster oxidoreductase |||||||||||||||--||||---------|-------------------------|||------- 2 [C] COG0731 Fe-S oxidoreductases |||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||-- 2 [H] COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A |||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1 |-|---|-|----|---|||------|||-|----||--------------|--|----|------ 2 [P] COG0798 Arsenite efflux pump ACR3 and related permeases ----||||--|||||----|------|----|-|||||------------||----|||--|---- 2 [K] COG0819 Putative transcription activator --|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) |||||||||||||||--------------------------------------------------- 2 [L] COG1041 Predicted DNA modification methylase ----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||-- 2 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases ||||||||||-------|------|-----|-----||----|||||-||||-------------- 2 [O] COG1067 Predicted ATP-dependent protease |||||||||||||||||-||-|----------------------------------------|--- 2 [R] COG1100 GTPase SAR1 and related small G proteins -|----|||||||---||------------------------------------------------ 2 [L] COG1110 Reverse gyrase |||||-||||-|-||||||-|------||||---|---|||||||-|--|--|---|--------| 2 [L] COG1112 Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits -||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||-- 2 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components ||||--|||||||----|||||--|-||||||||||||||||-||-|-|-|----|---|||---- 2 [P] COG1122 ABC-type cobalt transport system, ATPase component --||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components |||---||||-------|||----------------------|||||------------------- 2 [C] COG1142 Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2 |||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 2 [C] COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I) |||-||||||||----||--------------------------------------||-------- 2 [C] COG1144 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, delta subunit |||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|--- 2 [C] COG1145 Ferredoxin |||---||||-------|------------------------------------------------ 2 [C] COG1149 MinD superfamily P-loop ATPase containing an inserted ferredoxin domain ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 2 [C] COG1155 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit A |||-|||||||||---||--|------||-||||||------|||||-||||---|---------- 2 [O] COG1180 Pyruvate-formate lyase-activating enzyme -||||||||-|-|||--|------------------------------------------------ 2 [J] COG1184 Translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family ||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-|||||||||||||| 2 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component |||||||||-||-||-------------------------------------------|------- 2 [R] COG1287 Uncharacterized membrane protein, required for N-linked glycosylation ---|--|------|-------------||--------------------||-||||--|----|-- 2 [S] COG1297 Predicted membrane protein |||---||||--|-----||-------||-|---|-||-----------|------------||-- 2 [S] COG1300 Uncharacterized membrane protein |-|||||||||||||||-||-|-----||--------------||||--|-----|---------- 2 [R] COG1310 Predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily |||---|||--|-----|---|||------|---|||-----------||||---|---||-|--- 2 [P] COG1392 Phosphate transport regulator (distant homolog of PhoU) ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [K] COG1405 Transcription initiation factor TFIIIB, Brf1 subunit/Transcription initiation factor TFIIB |||||||||||||----------------------------------------------|||||-- 2 [R] COG1407 Predicted ICC-like phosphoesterases ||||--||||------|-||-|--|-|---------------------||----|-||||||||-- 2 [S] COG1432 Uncharacterized conserved protein ||||--|||||||------------|----|--------------|---------|---------- 2 [F] COG1437 Adenylate cyclase, class 2 (thermophilic) --||||||---|-----|||||----|||-||-|||||----|||----|||---|--||||||-- 2 [R] COG1473 Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase ||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--|||||||||||||| 2 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators ---|||||--|||||---|-||------------|-||-----------|--|------|---|-| 2 [E] COG1506 Dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases -|----||--------------------------|-|------------------|---|-|---- 2 [K] COG1510 Predicted transcriptional regulators |||-|||-|||||---||-||------||---|--|-|----|||||----|--|---|------- 2 [L] COG1518 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair ------||----------||----|--||||------|---------------------------- 2 [S] COG1543 Uncharacterized conserved protein -|----|||---------||--------------------------------|------------- 2 [R] COG1569 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain -|----|||||||||--------------------------------------------------- 2 [S] COG1590 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||--|||-|-|----|||-|------|----|||-|--|-----|---------- 2 [S] COG1690 Uncharacterized conserved protein --|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-| 2 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase |||---||||||------------------------------------------------------ 2 [R] COG1759 ATP-utilizing enzymes of ATP-grasp superfamily (probably carboligases) --||--|||--------|------|-----|----|||----------|-------|||------- 2 [NT] COG1776 Chemotaxis protein CheC, inhibitor of MCP methylation |-|||||||--------------------------------------------------------- 2 [K] COG1777 Predicted transcriptional regulators ------|||----------------------|----|-----|||||----|---|--|||-||-- 2 [M] COG1794 Aspartate racemase -|----|-|--------------------------------------------------------- 2 [R] COG1800 Predicted transglutaminase-like proteases ||----||||||||---------------------------------------------------- 2 [R] COG1818 Predicted RNA-binding protein, contains THUMP domain ||----||---------------------------------------------------------- 2 [S] COG1822 Predicted archaeal membrane protein |||---||||-||----------------------------------------------------- 2 [R] COG1907 Predicted archaeal sugar kinases -|-|--|||||||---|------------------------------------------------- 2 [R] COG1913 Predicted Zn-dependent proteases ||||||||--||----|||||-----||--|||--|||-------||--|-----||||||||--- 2 [S] COG1917 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain ||||||||||-------------------------------------------------------- 2 [L] COG1933 Archaeal DNA polymerase II, large subunit ||||--|||--------------------------------------------------------- 2 [S] COG1967 Predicted membrane protein ||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 2 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases ||||--||-||||----|------------------------------------------------ 2 [S] COG1992 Uncharacterized conserved protein -||---|-|---|-----|||------||----|--------|--||-|------|---||----- 2 [JD] COG2026 Cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system ||||--||||---|||-------------------------------------------------- 2 [B] COG2036 Histones H3 and H4 |||||||||||||-------------||--|--------------|---|-|---|---||-||-- 2 [NU] COG2064 Flp pilus assembly protein TadC -||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||-- 2 [U] COG2095 Multiple antibiotic transporter ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 2 [R] COG2102 Predicted ATPases of PP-loop superfamily |-|||||||--------------------------------------------------------- 2 [R] COG2150 Predicted regulator of amino acid metabolism, contains ACT domain ||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--| 2 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold --|||||||-|||||----|----|||--------------------------||||||------- 2 [R] COG2236 Predicted phosphoribosyltransferases ||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 2 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid -|----|||||||----|------------------------------------------------ 2 [S] COG2250 Uncharacterized conserved protein related to C-terminal domain of eukaryotic chaperone, SACSIN ---|--||-------------------||------------------------------------- 2 [S] COG2253 Uncharacterized conserved protein ------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase ---|--|--|--|---|----|---|-------|||||---------------------||||--- 2 [E] COG2309 Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T) ------||--|||-|------|||-----------|-|-----------|-----|---|||||-- 2 [E] COG2355 Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase homolog ------|||||-|----------------------------------------------------- 2 [S] COG2411 Uncharacterized conserved protein ----||||--||--------------|---||||||||----|||||-|----------||--|-- 2 [G] COG2723 Beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/beta-galactosidase |-||--||||--|----------------------------------------------------- 2 [S] COG3273 Uncharacterized conserved protein ----||||----------|----------------------------------------------- 2 [S] COG3463 Predicted membrane protein ------||---||------------------------------------------|----|-|--- 2 [Q] COG3473 Maleate cis-trans isomerase -||||||||-|||------|-------||--------------||||-----|--|---||-||-- 2 [K] COG3609 Predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain ------||-|---------------------------|---------------------------- 2 [S] COG4043 Uncharacterized conserved protein ------|---||------||-------||-------------------------------|----- 2 [R] COG4113 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain |-|-|||||-||------------------|------------------------|------||-- 2 [C] COG4231 Indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha and beta subunits ------|----||----------------------------------------------------- 2 [S] COG4342 Uncharacterized protein conserved in archaea -||---||---------------------------------------------------------- 2 [G] COG4809 Archaeal ADP-dependent phosphofructokinase/glucokinase ------|||----------------------------------------|---------------- 2 [S] COG5608 Conserved secreted protein |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5) ||-||||||||--|--|||-------|||-|--||-||---------------------------- 1 [S] COG0011 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase |||||||||||||||---||----------------------|||||-||||-------------- 1 [J] COG0023 Translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1) and related proteins ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase -|----||---|------||------|||-------|-----|||||-||-|-------------- 1 [F] COG0027 Formate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase (GAR transformylase) ---|--||---|----|-|||------||||----|||----|||||-||--||||---||-||-- 1 [H] COG0029 Aspartate oxidase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation) ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase -|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||-- 1 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 1 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||-- 1 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0048 Ribosomal protein S12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0049 Ribosomal protein S7 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0051 Ribosomal protein S10 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase -||---||--||-|--|-||||||--|||-||||--||----|||||-||||-------||-|--- 1 [G] COG0058 Glucan phosphorylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [G] COG0061 Predicted sugar kinase |||||||||||||||-||||-|----|||||-----------|||||-||--|--|||||||||-- 1 [S] COG0062 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||-- 1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase ||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit |||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit |||---||||------|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 1 [O] COG0068 Hydrogenase maturation factor |||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---||||||| 1 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit ||||||||||||||--||||-|--------||--|-||--------|-||------||-||-||-- 1 [E] COG0075 Serine-pyruvate aminotransferase/archaeal aspartate aminotransferase ||||--||||--||----||-------||--|---|-|----||||--|-|---------|||--- 1 [E] COG0076 Glutamate decarboxylase and related PLP-dependent proteins |||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase |||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1 -|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||------- 1 [E] COG0083 Homoserine kinase |||---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0084 Mg-dependent DNase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11 |||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9 ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase |||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase |||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||-- 1 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase -|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||---------- 1 [L] COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase |||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases ||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||-- 1 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase ||--|-||--||-|----||-------||-------------|||||-||||-|||---||||--- 1 [R] COG0121 Predicted glutamine amidotransferase |-||--|||---||||--|--|-----||-|-----||-|--|||||-||--|--|---|||||-- 1 [L] COG0122 3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase ||||--|||||||||||-||-|------------|-||----------||---|||---|||||-- 1 [BQ] COG0123 Deacetylases, including yeast histone deacetylase and acetoin utilization protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0125 Thymidylate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--|||||||| 1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase ------|---|--||--|--|---|-|||-||-|--||----|||||-|-||-------------- 1 [G] COG0153 Galactokinase -|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes ||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||-- 1 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 1 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0164 Ribonuclease HII |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase ||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||---- 1 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components |||-|||||||--||||-||----||--------------------------------------|| 1 [I] COG0170 Dolichol kinase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0171 NAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [E] COG0174 Glutamine synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease |||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 1 [Q] COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase |||-|||||||||||-|||||---------------|------------|--|-------|-|--- 1 [J] COG0182 Predicted translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family ||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-||||||| 1 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17 -|||--|||-|||-----||-|---------------|--||||||||||||||||---|||||-- 1 [HJ] COG0189 Glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit -||---|||--------|---|-----||-||-||||||||||||-|-|------|---||-|--- 1 [F] COG0213 Thymidine phosphorylase |||||||||||||||--|--||----|||||--|||||------------||-------------- 1 [H] COG0214 Pyridoxine biosynthesis enzyme --|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase -|||--||||---|--||--|---------|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0218 Predicted GTPase |-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A) ||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--|||||| 1 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases -|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10 |||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0250 Transcription antiterminator ---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) |||---|||||||-----------------|-|||-|--||-|||-|-|-||-------------- 1 [G] COG0269 3-hexulose-6-phosphate synthase and related proteins ||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||-- 1 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase --|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0281 Malic enzyme |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase |||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes -|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|--- 1 [G] COG0297 Glycogen synthase |||---||||--------||----------|-----------|||-|---|-----|||------- 1 [O] COG0298 Hydrogenase maturation factor |||||||||||||||--|---|----|||||--|||||------------||-------------- 1 [H] COG0311 Predicted glutamine amidotransferase involved in pyridoxine biosynthesis |||||||||-|||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0314 Molybdopterin converting factor, large subunit |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0315 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme ||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||------- 1 [S] COG0327 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase --|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|-- 1 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase -|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------| 1 [L] COG0338 Site-specific DNA methylase ||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD |||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase |-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases ||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-| 1 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase |||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase --|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1) |||||||||||-||||----------||||||---|||----|||||-||--|-------|-|--- 1 [E] COG0367 Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing) |||||||||||||-----||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||--- 1 [H] COG0368 Cobalamin-5-phosphate synthase |||---|||||-----||||-|--------||--||------|||||-||--|--||||----|-- 1 [P] COG0370 Fe2+ transport system protein B |||||||||||||-|--|||----------||||-|||----|||||-------------|----- 1 [C] COG0371 Glycerol dehydrogenase and related enzymes |||---||||------|-||-|--------------------|||-|---------|||------- 1 [R] COG0375 Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression) --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases ||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||-- 1 [H] COG0379 Quinolinate synthase ||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----|| 1 [M] COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase |||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases -----||----|-||--|||-------||--|||-|-|----|----------------------- 1 [G] COG0383 Alpha-mannosidase |-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||-- 1 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase ||||--||||------||||------|||||---|||-|||||||-|--|--|--|---||||--- 1 [S] COG0392 Predicted integral membrane protein |||||||||--|-----|||-------|||-|---|-|----|||-|-|--|-----------|-- 1 [S] COG0393 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||-- 1 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG0403 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), N-terminal domain ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--||||---|||||-- 1 [E] COG0404 Glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase) |||---||||------|-||----------|-----------|||-|---------|||------- 1 [O] COG0409 Hydrogenase maturation factor ---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase ||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||---------------- 1 [L] COG0419 ATPase involved in DNA repair ||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|----- 1 [L] COG0420 DNA repair exonuclease -|--|||||||||||-||---|----|---|--|--||----||||||-|--||||||----|--- 1 [E] COG0421 Spermidine synthase ||||||||||||||||-----|--|||||||---|---||||------------------------ 1 [J] COG0423 Glycyl-tRNA synthetase (class II) --|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation ||||--||--||||||||-|-|---||||------|------|||-|--|---|||--|-|----- 1 [P] COG0428 Predicted divalent heavy-metal cations transporter ||||--|||||||||||--|----------------------|||-|--|-----|---------- 1 [A] COG0430 RNA 3'-terminal phosphate cyclase |||||||||||||---||||-|-----||---|----|----||||---|-|---|---|||||-- 1 [R] COG0433 Predicted ATPase -|-|--|||||-|-----||----------------------|---|------------|--|--- 1 [R] COG0434 Predicted TIM-barrel enzyme |||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||-- 1 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase ||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains |||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--||||||||||| 1 [O] COG0450 Peroxiredoxin |||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase ||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 1 [R] COG0456 Acetyltransferases ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family) |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase |||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| 1 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase -|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||-- 1 [G] COG0469 Pyruvate kinase ||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||---- 1 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters ||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-|| 1 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase |||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--|||||||| 1 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase |-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2 -|||--||||||||||-------------------------------------------------- 1 [T] COG0478 RIO-like serine/threonine protein kinase fused to N-terminal HTH domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases) ||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--|||||||| 1 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family ||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0492 Thioredoxin reductase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||------||||-------------------|--|--|---|||||-- 1 [H] COG0499 S-adenosylhomocysteine hydrolase ||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||--- 1 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase) ---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||-- 1 [E] COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding) |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit |-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||-- 1 [E] COG0520 Selenocysteine lyase |||||||||||||---|--|-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG0521 Molybdopterin biosynthesis enzymes |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0528 Uridylate kinase ||||||||||||-||-|||-----||-----------|----|||||-|--|--------|----- 1 [P] COG0530 Ca2+/Na+ antiporter |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase |-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 1 [R] COG0546 Predicted phosphatases |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-| 1 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase ---|||||--|-|-----|------------||||-----|-|||-|--||---------|----- 1 [E] COG0549 Carbamate kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0550 Topoisomerase IA |||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||------- 1 [L] COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase --||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|----- 1 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family ||||||||||||------||-|-----||-|------|----|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG0555 ABC-type sulfate transport system, permease component |||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase |-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|--- 1 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily --||--|||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases ||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||---- 1 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component |||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--|||||||||||||| 1 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase |||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0582 Integrase |||||||||||||||||----|--------------------|||||-||||----|||------- 1 [S] COG0585 Uncharacterized conserved protein -||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-| 1 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters ||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes |||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase ||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease |||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|-- 1 [H] COG0611 Thiamine monophosphate kinase |||||||||||||||||--------------|--|||----------------------------| 1 [MI] COG0615 Cytidylyltransferase ||||--||||-||----|||||----||||||||||||||||-||-|---|--------|||---- 1 [P] COG0619 ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters |||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase --||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases ||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K --|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 1 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase --||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 1 [NT] COG0643 Chemotaxis protein histidine kinase and related kinases ---|--|||--||||-||--|-----|||--|||||||----|||||--|--------|||||||| 1 [G] COG0647 Predicted sugar phosphatases of the HAD superfamily ||||||||--||||||||----||---||||---|||||||||||||||----------------- 1 [L] COG0648 Endonuclease IV --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7 ---|||||--||||||-||-------||||||||||||----|||||--|-----|---|||||-- 1 [R] COG0656 Aldo/keto reductases, related to diketogulonate reductase |||---||||------|||||------||-------||----|||||-||--||||||-|||||-- 1 [G] COG0662 Mannose-6-phosphate isomerase |||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--|||||||| 1 [R] COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily |||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--|||||||||||||| 1 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel ||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-||||||| 1 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase --|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase |---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---||||||| 1 [J] COG0689 RNase PH -||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||-- 1 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase |||||||||||||---||||-|---|||||||||||-||-|||||||-||--|--|---|||||-- 1 [P] COG0704 Phosphate uptake regulator -||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||-- 1 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid) |||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-||||||||||||||||| 1 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [P] COG0725 ABC-type molybdate transport system, periplasmic component -|||--|||-------|---|-|||-|------|||||----------|-||-||-|||------- 1 [R] COG0733 Na+-dependent transporters of the SNF family |-||--|||----|||-|||-|--||-||-|----|||----|||||-|||||--|||||||||-- 1 [T] COG0784 FOG: CheY-like receiver |-|---|||-|-|---||||||--|-||||--||--||------------||----||-||||--- 1 [O] COG0785 Cytochrome c biogenesis protein |||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation |-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-|| 1 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin --||--|||--------|||----||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||-- 1 [NT] COG0835 Chemotaxis signal transduction protein --||--|||-------||||-|--------|-----------|||||-||--|---||-|||||-| 1 [M] COG0836 Mannose-1-phosphate guanylyltransferase ------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|-- 1 [K] COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit -|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||-- 1 [L] COG0863 DNA modification methylase ||||--|||||||-----------------|----|||----|||-|---------||---|-|-- 1 [K] COG0864 Predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain and a metal-binding domain ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG1003 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), C-terminal domain |||||||||||--||--------------------------------------------------- 1 [R] COG1019 Predicted nucleotidyltransferase --|-|||||-|-|---|-----------------|-||-----------|-----|----|-|--- 1 [O] COG1030 Membrane-bound serine protease (ClpP class) -|||--|||||-|----|------------------------------------------------ 1 [C] COG1031 Uncharacterized Fe-S oxidoreductase -|||--||||-------|------||-----------|-----------|--------|------- 1 [R] COG1033 Predicted exporters of the RND superfamily |||||||||||||-------||--|-----------------|||||-|||||||||||------- 1 [O] COG1047 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2 |||---|||||||---|-||-|----||||||-|-|||-------|--||-----|---|||||-| 1 [F] COG1051 ADP-ribose pyrophosphatase ----|||||-|||----||||-||---|||----||||----||||--||---|||--||--|--- 1 [P] COG1055 Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases |||||||||-|||-----|--|-----||--|----------|||||---||---|---------- 1 [H] COG1056 Nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase ---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||-- 1 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA --|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||-- 1 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases |||||||||||||--|||--|----------||||||||-||------------------------ 1 [R] COG1078 HD superfamily phosphohydrolases ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG1079 Uncharacterized ABC-type transport system, permease component |||---||||-|-----|||------|||||-|-||||----|||||--|-----|---|||||-- 1 [G] COG1082 Sugar phosphate isomerases/epimerases ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1084 Predicted GTPase --|---|-|-|--||--|--------||--||----------|||||-|-||-------------- 1 [C] COG1085 Galactose-1-phosphate uridylyltransferase |-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||-- 1 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase |-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-|||| 1 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase -|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||--- 1 [R] COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1093 Translation initiation factor 2, alpha subunit (eIF-2alpha) ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1094 Predicted RNA-binding protein (contains KH domains) ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1095 DNA-directed RNA polymerase, subunit E' |-|-|||||||||||--------------------------------------------------- 1 [J] COG1096 Predicted RNA-binding protein (consists of S1 domain and a Zn-ribbon domain) |-|-||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1097 RNA-binding protein Rrp4 and related proteins (contain S1 domain and KH domain) |||||||||||||-----------||---------------------------------------- 1 [F] COG1102 Cytidylate kinase -|----||---|-------||-----------------------------------||-------- 1 [R] COG1106 Predicted ATPases ||||--||||-------------------------------------------------------- 1 [L] COG1107 Archaea-specific RecJ-like exonuclease, contains DnaJ-type Zn finger domain |-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 1 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components ||||||||||---||--------------------------------------------------- 1 [L] COG1111 ERCC4-like helicases --|---||------------|||||-|-----|||-||----|||-|-||||-||-|||-||---- 1 [E] COG1115 Na+/alanine symporter |-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 1 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1156 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit B -||---||-|||||||-||||----|----||||||||||||------|----||----------- 1 [R] COG1161 Predicted GTPases ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1163 Predicted GTPase ----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||-- 1 [KE] COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs ---|--||--|-|-----||||--|-|------|---|----|||||-||||-|||--|||||--- 1 [P] COG1178 ABC-type Fe3+ transport system, permease component ||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--|||||||||||||| 1 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning |-||--||--------||||||---|----||||||||------------------|||------- 1 [L] COG1193 Mismatch repair ATPase (MutS family) -||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||-- 1 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases ||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|-- 1 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases ||||--||-|-------------------------------------------------------- 1 [R] COG1202 Superfamily II helicase, archaea-specific |||||||||||||||||-------------------------|----------------||----- 1 [R] COG1204 Superfamily II helicase |||---||||||-||----|-|----|||-------||-----||---------------|----- 1 [R] COG1205 Distinct helicase family with a unique C-terminal domain including a metal-binding cysteine cluster |-|||||||--||----|||-|----|||||||---||----|||||--|--||||---||-||-- 1 [M] COG1209 dTDP-glucose pyrophosphorylase ------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase |-----|||---|---|---|----------------------------|--------|----|-- 1 [M] COG1213 Predicted sugar nucleotidyltransferases |-|-||||||||-||||-||------|---|||-||||----|||||--|-----|---|||||-| 1 [M] COG1215 Glycosyltransferases, probably involved in cell wall biogenesis |-|--||||---|-----||-|----|||||-----------|---|--||-|--|---||-||-- 1 [R] COG1216 Predicted glycosyltransferases ||||--||||-|||||-------------------------------------------------- 1 [O] COG1222 ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit ------||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1224 DNA helicase TIP49, TBP-interacting protein --|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||-- 1 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component --||--|-|-|--||-|----|||--||||----||||-------|---------|-------|-- 1 [H] COG1232 Protoporphyrinogen oxidase ||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||-- 1 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III -||||||-|-||||||--||-|--------------------------||-----|---||-||-- 1 [J] COG1236 Predicted exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing ||||||||||||-|||-|--|---------|----------------------------------- 1 [KB] COG1243 Histone acetyltransferase ||||||||||--------------------|----------------------------------- 1 [R] COG1244 Predicted Fe-S oxidoreductase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1245 Predicted ATPase, RNase L inhibitor (RLI) homolog -||-|||||-|||----|-|-|---|--|-||||||||----|||||-||-|---|----|-|--- 1 [C] COG1254 Acylphosphatases ||-|--|||--------------------------------------------------------- 1 [S] COG1255 Uncharacterized protein conserved in archaea ||||||||||||||||---------|-----|||||------------|----------------- 1 [I] COG1257 Hydroxymethylglutaryl-CoA reductase |||||||||||||--|-------------------------------------------------- 1 [J] COG1258 Predicted pseudouridylate synthase |-|---|||-||||--||--------||||------------------------------|----- 1 [I] COG1260 Myo-inositol-1-phosphate synthase |-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||-- 1 [R] COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease |||---||-||-|---|---|-----------|--|||----|||||-||||-||||||-----|| 1 [I] COG1267 Phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins |-||--|||--------||||||-|-|---||||||||---------------------||||-|| 1 [R] COG1268 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1269 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit I |||||||||||||-----||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---||||--- 1 [H] COG1270 Cobalamin biosynthesis protein CobD/CbiB ----||||---|----------|||-||||-------------------------|---------- 1 [C] COG1274 Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP) -|--|-|||----||-----------|||--||||-------|||-|-|-||-|------------ 1 [P] COG1275 Tellurite resistance protein and related permeases ||||||||||||||||-|||||---|----||||||||------------------|||------- 1 [K] COG1293 Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP --||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-|||| 1 [C] COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters ||||||||||-||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1303 Uncharacterized protein conserved in archaea |||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----||||||| 1 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases |-|---||||||----||||-|-----||||----|||-----------||||--|---||-||-- 1 [E] COG1305 Transglutaminase-like enzymes, putative cysteine proteases |||||||||||-||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1308 Transcription factor homologous to NACalpha-BTF3 ||||||||||---|||-------------------------------------------------- 1 [L] COG1311 Archaeal DNA polymerase II, small subunit/DNA polymerase delta, subunit B |||---|||||-|---||------------|----------------------------------- 1 [R] COG1313 Uncharacterized Fe-S protein PflX, homolog of pyruvate formate lyase activating proteins -|----|||||-|---||------------------------------------------------ 1 [K] COG1318 Predicted transcriptional regulators |||||||||||||----|---||||-||||||||||||----|||-|-----|---------|--- 1 [K] COG1321 Mn-dependent transcriptional regulator |-|-|||||||-|--|||-|-|-|------------------|||||-----|--|--------|| 1 [P] COG1324 Uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations ||||--|||||||----------------------------------------------------- 1 [J] COG1325 Predicted exosome subunit ||||--||||-------------------------------------------------------- 1 [R] COG1326 Uncharacterized archaeal Zn-finger protein |||---||-|-------|--|---------||||||------|||||-||||---|---------- 1 [F] COG1328 Oxygen-sensitive ribonucleoside-triphosphate reductase |||--||----------|---------||------------------------------------- 1 [L] COG1332 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily) --|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||-- 1 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase |||--||--|||-----|-|-------||------------------------------------- 1 [L] COG1337 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily) |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [KH] COG1339 Transcriptional regulator of a riboflavin/FAD biosynthetic operon |-|||||||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1340 Uncharacterized archaeal coiled-coil protein -|----|||||||||--------------------------------------------------- 1 [R] COG1341 Predicted GTPase or GTP-binding protein |||---|||---------------------|-----------------|----------------- 1 [R] COG1342 Predicted DNA-binding proteins --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 1 [M] COG1346 Putative effector of murein hydrolase |-|-|||||-|||---||------------------------------------------------ 1 [R] COG1350 Predicted alternative tryptophan synthase beta-subunit (paralog of TrpB) ---|||||--|||---||||--|||||||||-------------------------|||-----|| 1 [F] COG1351 Predicted alternative thymidylate synthase --||--|||--------|-|----||----|----|||----|||||-||-----|--|||-||-- 1 [NT] COG1352 Methylase of chemotaxis methyl-accepting proteins |||--||-||||----||---------||--------|---------------------------- 1 [R] COG1353 Predicted hydrolase of the HD superfamily (permuted catalytic motifs) -||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [S] COG1354 Uncharacterized conserved protein |||-|||||||||||-||--------------------------------------------|--- 1 [R] COG1355 Predicted dioxygenase ||-|--||---------------------------------------------------------- 1 [S] COG1356 Uncharacterized protein conserved in archaea ||||||||||||||||-|--|---------||||||||---------------------------- 1 [J] COG1358 Ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a) -||||||||-||-----|------------------------------------------------ 1 [M] COG1361 S-layer domain ||----||-|-------------------------------------------------------- 1 [R] COG1365 Predicted ATPase (PP-loop superfamily) ||||--||||-||||--------------------------------------------------- 1 [J] COG1369 RNase P/RNase MRP subunit POP5 |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [O] COG1370 Prefoldin, molecular chaperone implicated in de novo protein folding, alpha subunit |||||||||||||---||---------||------------------------------------- 1 [S] COG1371 Uncharacterized conserved protein -|----||||--||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1374 Protein involved in ribosomal biogenesis, contains PUA domain |||---||-|--------------------------||---------------------------- 1 [S] COG1379 Uncharacterized conserved protein --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 1 [R] COG1380 Putative effector of murein hydrolase LrgA |||||||||||||||--------------------------------------------------- 1 [O] COG1382 Prefoldin, chaperonin cofactor ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1383 Ribosomal protein S17E ||||||||||--|-----------||-----------------------------------||||| 1 [J] COG1384 Lysyl-tRNA synthetase (class I) --|-|||||--------|||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [K] COG1386 Predicted transcriptional regulator containing the HTH domain |||-||||||---||-||--||-----||-||--||||----|||||-|-----------|----- 1 [ER] COG1387 Histidinol phosphatase and related hydrolases of the PHP family ||||--|||||||----------------------------------------------------- 1 [L] COG1389 DNA topoisomerase VI, subunit B |||||||||||-||||----||||||---------------------------------------- 1 [C] COG1390 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit E ||||||||||||||||----||||||------||-------------------------------- 1 [C] COG1394 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit D |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [K] COG1395 Predicted transcriptional regulator ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [U] COG1400 Signal recognition particle 19 kDa protein |-|---|---||----|-|--|-----------|--|-----|--|----------|||------- 1 [V] COG1401 GTPase subunit of restriction endonuclease |-|---|||||-|||-|-||--||--||||||--|||-----|||||-||||---|---|||||-- 1 [R] COG1409 Predicted phosphohydrolases ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1412 Uncharacterized proteins of PilT N-term./Vapc superfamily |---|||||||||-----------------------------------------------|-|--- 1 [S] COG1415 Uncharacterized conserved protein ||||||||||------||--||--||----|||||||||-|||||-|---------|||||----- 1 [R] COG1418 Predicted HD superfamily hydrolase ||---||--|-------|------------------------------------------------ 1 [L] COG1421 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair ||||||||||-------------------------------------------------------- 1 [S] COG1422 Predicted membrane protein |||---||||--|---|------------------------------------------------- 1 [L] COG1423 ATP-dependent DNA ligase, homolog of eukaryotic ligase III ||-|--||-||------|||----||--------------------------|--|---|||||-- 1 [S] COG1430 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||----||--|--------|-------------------------------- 1 [C] COG1436 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit F ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1439 Predicted nucleic acid-binding protein, consists of a PIN domain and a Zn-ribbon module ---|--||||||||||--------------------------|||||-|-||-------------- 1 [R] COG1444 Predicted P-loop ATPase fused to an acetyltransferase ---|||||--||--|---||----------------------|||-|-|------|---|---|-- 1 [E] COG1446 Asparaginase -||-||||--||----|-||----|----------------------------------------- 1 [G] COG1449 Alpha-amylase/alpha-mannosidase ||||--|||-------|---||----|---|-------||--|||||-||--||||||||||||-| 1 [R] COG1451 Predicted metal-dependent hydrolase |-|||||||--||||-||--|-----|---||-|||||----|||||-||-|---|---||||--- 1 [C] COG1454 Alcohol dehydrogenase, class IV ----||||---|-|---------------------|||----|||-|--|-|-||----------- 1 [F] COG1457 Purine-cytosine permease and related proteins |||---||||--|---|------------------------------------------------- 1 [R] COG1458 Predicted DNA-binding protein containing PIN domain |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1460 DNA-directed RNA polymerase, subunit F ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [L] COG1467 Eukaryotic-type DNA primase, catalytic (small) subunit ||||||||||--|----|----------------|-||-----------|--||||---------- 1 [S] COG1469 Uncharacterized conserved protein --|---|||----------------------------|---------------------------- 1 [S] COG1470 Predicted membrane protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1471 Ribosomal protein S4E |-|||||||-||||||-------------------------------------------------- 1 [LO] COG1474 Cdc6-related protein, AAA superfamily ATPase -|||--|----------|-||-----|---|----|--||---|||--|--|--|-|||------- 1 [S] COG1479 Uncharacterized conserved protein ------||||--|----|------------------------------------------|----- 1 [R] COG1483 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) --|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||--- 1 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [J] COG1491 Predicted RNA-binding protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1498 Protein implicated in ribosomal biogenesis, Nop56p homolog ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1499 NMD protein affecting ribosome stability and mRNA decay ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1500 Predicted exosome subunit |||||||||||||||||------------------------------------------------- 1 [J] COG1503 Peptide chain release factor 1 (eRF1) |-|---||||-------------------------------------------------------- 1 [S] COG1504 Uncharacterized conserved protein ------||-----------|-|----|||------------------------||-------|||| 1 [E] COG1505 Serine proteases of the peptidase family S9A |||-|||||||||---||-|-|----|---|---|-||----|||||--|-----|---|||||-- 1 [J] COG1514 2'-5' RNA ligase ---||||||||||-|-||-|-|--------|-----|-----|||||-----|------------- 1 [L] COG1515 Deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V) -|---||---||----|------------------------------------------------- 1 [L] COG1517 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair ||||--|||--------|---|---|-|||------|-----|||||-||--|--|-------||| 1 [S] COG1520 FOG: WD40-like repeat ----|||||--|-|||-|-|------|---|----|-|-----------|--|-----|-|-||-- 1 [R] COG1524 Uncharacterized proteins of the AP superfamily ||-|--||-|---||-|--|------|-------|-|--|||-------|||-||---|||||--- 1 [L] COG1525 Micrococcal nuclease (thermonuclease) homologs |||||||||||--|||----||----------||-------------------------------- 1 [C] COG1527 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit C ---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG1530 Ribonucleases G and E -||-|-|||||||----||-|------||-|-----||-----------|-----|---|||||-| 1 [L] COG1533 DNA repair photolyase ||||--||||-||-------|---------||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [J] COG1534 Predicted RNA-binding protein containing KH domain, possibly ribosomal protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [R] COG1537 Predicted RNA-binding proteins ------||------------||----|--|----|-||----|||||-|||--|||--||------ 1 [R] COG1540 Uncharacterized proteins, homologs of lactam utilization protein B |||||||||||||--------------||----------------------------------|-- 1 [R] COG1545 Predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon ||||||||||-|------------------------------------------------------ 1 [J] COG1549 Queuine tRNA-ribosyltransferases, contain PUA domain ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1552 Ribosomal protein L40E ------|------|-----|-------|||||---||--|--|||--------||----------- 1 [G] COG1554 Trehalose and maltose hydrolases (possible phosphorylases) ||----|----------|||--------------------------------------------|| 1 [P] COG1563 Predicted subunit of the Multisubunit Na+/H+ antiporter |||--||----------|---------||------------------------------------- 1 [L] COG1567 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily) -|----|||-------|------------------------------------------------- 1 [R] COG1568 Predicted methyltransferases |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [R] COG1571 Predicted DNA-binding protein containing a Zn-ribbon domain |-|---|||----------|---------------------------------------------- 1 [S] COG1572 Uncharacterized conserved protein --|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--||||||||||||| 1 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase --||||||----|---||--||-----||------|||--------|--|-----|---|||||-- 1 [R] COG1574 Predicted metal-dependent hydrolase with the TIM-barrel fold ||||--||||||||||---------|-----|||||------------------------------ 1 [I] COG1577 Mevalonate kinase |||---|||||-----||------------------------------------------------ 1 [S] COG1578 Uncharacterized conserved protein ||--|||||||||----------------------------------------------------- 1 [K] COG1581 Archaeal DNA-binding protein ||-|--||-||||----|||||----|||||-----------|||||-||-||------|||||-- 1 [OU] COG1585 Membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity -|--|||||-|||---||------------|-----||----||||||-|--|--|---------- 1 [E] COG1586 S-adenosylmethionine decarboxylase ||||||||||--|----------------------------------------------------- 1 [J] COG1588 RNase P/RNase MRP subunit p29 ||-|--|||||||----------------------------------------------------- 1 [L] COG1591 Holliday junction resolvase - archaeal type |||||||||-||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1594 DNA-directed RNA polymerase, subunit M/Transcription elongation factor TFIIS ||||||||||-|||||-------------------------------------------------- 1 [L] COG1599 Single-stranded DNA-binding replication protein A (RPA), large (70 kD) subunit and related ssDNA-binding proteins ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1601 Translation initiation factor 2, beta subunit (eIF-2beta)/eIF-5 N-terminal domain |-|||||||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1602 Uncharacterized conserved protein ||||--||||-||||--------------------------------------------------- 1 [J] COG1603 RNase P/RNase MRP subunit p30 |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [R] COG1608 Predicted archaeal kinase --|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||-- 1 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein |||---||||-------------------------------------------------------- 1 [S] COG1617 Uncharacterized conserved protein |||-|||||||||---||------------------------------------------------ 1 [F] COG1618 Predicted nucleotide kinase -|||--||||------|-||-|||||----||||||||-|||------------------------ 1 [S] COG1624 Uncharacterized conserved protein |||---||-|--------||-|--------|----------------------------------- 1 [C] COG1625 Fe-S oxidoreductase, related to NifB/MoaA family ||----||-|-------------------------------------------------------- 1 [S] COG1627 Uncharacterized protein conserved in archaea |||||||||||||--------|-------------------------------------------- 1 [S] COG1628 Uncharacterized conserved protein ||--|||||--||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1630 Uncharacterized protein conserved in archaea ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1631 Ribosomal protein L44E ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1632 Ribosomal protein L15E |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [R] COG1634 Uncharacterized Rossmann fold enzyme ||||--|||||||||--|------------------------------------------------ 1 [H] COG1635 Flavoprotein involved in thiazole biosynthesis ||-|--||-||||------|------||||------------------------------------ 1 [L] COG1637 Predicted nuclease of the RecB family ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1644 DNA-directed RNA polymerase, subunit N (RpoN/RPB10) -|||--|||||||----------------------------------------------------- 1 [R] COG1645 Uncharacterized Zn-finger containing protein |||||||||||||---------------------||||---------------------------- 1 [R] COG1646 Predicted phosphate-binding enzymes, TIM-barrel fold -||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1650 Uncharacterized protein conserved in archaea ----|||||||||---||------|--||--------------------------|---------- 1 [S] COG1656 Uncharacterized conserved protein |||-|||||-------|---|----|----|||||||||-||------------------------ 1 [L] COG1658 Small primase-like proteins (Toprim domain) |-||||||||--|---------------------|--------||-|-|----------||-|--- 1 [R] COG1661 Predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif ||||--|||-|||----|---|--------||-|||||--------------|----------|-- 1 [CP] COG1668 ABC-type Na+ efflux pump, permease component ||----|||-||------------------------------------------------------ 1 [S] COG1673 Uncharacterized protein conserved in archaea ||||--||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1675 Transcription initiation factor IIE, alpha subunit ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1676 tRNA splicing endonuclease |||---|||||-|------------------------------------|---------||-|--- 1 [S] COG1679 Uncharacterized conserved protein --|---||--|-|-----||-|----||||||||||||----|||||--|--|--|---||||||| 1 [V] COG1680 Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins |-----|||--------------------------------------------------------- 1 [S] COG1689 Uncharacterized protein conserved in archaea |-|||||||-|||----|-|||----||||||||||||----|||||-|------|------||-- 1 [K] COG1695 Predicted transcriptional regulators ||||--||||||||||-------------------------------------------------- 1 [L] COG1697 DNA topoisomerase VI, subunit A |||-||||||-||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1698 Uncharacterized protein conserved in archaea |-----|---------|------------------------------------------------- 1 [S] COG1700 Uncharacterized conserved protein ||||--|||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1701 Uncharacterized protein conserved in archaea ---||||||--||--------|----||||-------|----|||----------|-------|-- 1 [E] COG1703 Putative periplasmic protein kinase ArgK and related GTPases of G3E family -||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [K] COG1709 Predicted transcriptional regulator ||----||---------------------------------------------------------- 1 [S] COG1710 Uncharacterized protein conserved in archaea |-|||||||--------------------------------------------------------- 1 [S] COG1711 Uncharacterized protein conserved in archaea ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1717 Ribosomal protein L32E ||||||||||||||||-----|-----------------------|---|---------------- 1 [TD] COG1718 Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control ||||--|||||||----|------------------------|||||-||||-||-------||-- 1 [S] COG1720 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1727 Ribosomal protein L18E |||||||||||||||-|------------------------------------------------- 1 [O] COG1730 Predicted prefoldin, molecular chaperone implicated in de novo protein folding ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1736 Diphthamide synthase subunit DPH2 ------||||--|----|------------------------------------------|----- 1 [L] COG1743 Adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-|||||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG1744 Uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [J] COG1746 tRNA nucleotidyltransferase (CCA-adding enzyme) ----|||-|-|-|||---||-|-----------|---|----------|--|----|||||||--- 1 [E] COG1748 Saccharopine dehydrogenase and related proteins -||---|||-|||----------------------------------------------------- 1 [R] COG1750 Archaeal serine proteases -||---|||--------------------------------------------------------- 1 [S] COG1753 Uncharacterized conserved protein -|--||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [S] COG1756 Uncharacterized conserved protein ---|--||----|-------|----|----|---|-||-------||-|-||-||-|||------- 1 [C] COG1757 Na+/H+ antiporter ||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1761 DNA-directed RNA polymerase, subunit L |||||-|||||||---|-----------------||||----|||||-|-||---|--|||||--- 1 [H] COG1763 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein |||---||||-||-------|-----------|---------|||-|-|||--------------- 1 [H] COG1767 Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthetase ||----||---------------------------------------------------------- 1 [S] COG1771 Uncharacterized protein conserved in archaea -||---||||-------------------------------------------------------- 1 [S] COG1772 Uncharacterized protein conserved in archaea |||-|||||||||||--------------------------------------------------- 1 [R] COG1779 C4-type Zn-finger protein |||||||||||||----|------------|-----------|||||||----||----------- 1 [F] COG1781 Aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [R] COG1782 Predicted metal-dependent RNase, consists of a metallo-beta-lactamase domain and an RNA-binding KH domain ||||--||||-------------------------------------------------------- 1 [S] COG1784 Predicted membrane protein |||---|||||-|------------------------------------|---------||-|--- 1 [S] COG1786 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||||----------||-------||----------|||--||---|||-||-- 1 [L] COG1793 ATP-dependent DNA ligase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1798 Diphthamide biosynthesis methyltransferase --|-|||||-|||---||-|-|------------||||----|||||-||-|---|---||-||-- 1 [S] COG1801 Uncharacterized conserved protein ------|||-------|-|||---------|-----|-----|||||--|--||||---|||||-- 1 [M] COG1807 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family |||||||||||||---|---------------|--------------------------------- 1 [E] COG1812 Archaeal S-adenosylmethionine synthetase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1813 Predicted transcription factor, homolog of eukaryotic MBF1 ||--|||||||||||--|---||---|----|-----------------|------------||-- 1 [S] COG1814 Uncharacterized membrane protein |||---||--|------------------------------------------------------- 1 [S] COG1817 Uncharacterized protein conserved in archaea |-||--||||--|----------------------------------------------------- 1 [P] COG1824 Permease, similar to cation transporters ||||||||||||----||||-|----||||-|--||||--------------------|-||||-- 1 [F] COG1828 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, PurS component ||||--|||||||----------------------------------------------------- 1 [R] COG1829 Predicted archaeal kinase (sugar kinase superfamily) ||||--||||-||---|--|--||------------------|||||----|-------||-|--- 1 [G] COG1830 DhnA-type fructose-1,6-bisphosphate aldolase and related enzymes |||||||||||-|----------------------------------------------------- 1 [R] COG1831 Predicted metal-dependent hydrolase (urease superfamily) ---|||||--|||---||---|---------|||-|||----|||||--------|--|||-|--- 1 [R] COG1832 Predicted CoA-binding protein ||||-|||||||-----|------------------------------------------------ 1 [S] COG1833 Uncharacterized conserved protein |||||||||-|-------||-----------------|---------------------------- 1 [S] COG1836 Predicted membrane protein |||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||--- 1 [C] COG1838 Tartrate dehydratase beta subunit/Fumarate hydratase class I, C-terminal domain |---|||||-|||----|---------||--------------------------|---------- 1 [S] COG1839 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----|||||| 1 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E |||---||-|-------------------------------------------------------- 1 [S] COG1844 Uncharacterized protein conserved in archaea |||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||-- 1 [K] COG1846 Transcriptional regulators -|----|||-|||--------|-----||-------------------------------|----- 1 [R] COG1848 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1849 Uncharacterized protein conserved in archaea -||---|||---------||----------------|-----------------------|-|--- 1 [G] COG1850 Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase, large subunit -|----||--------|------------------------------------------------- 1 [S] COG1851 Uncharacterized conserved protein |-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---||||||| 1 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [R] COG1855 ATPase (PilT family) ------||---|----||------------------------------------------------ 1 [S] COG1856 Uncharacterized homolog of biotin synthetase --|-|||||||-|||-----||--------------------|||----|---------|------ 1 [J] COG1859 RNA:NAD 2'-phosphotransferase |||||||-|-|------------------------------------------------------- 1 [S] COG1860 Uncharacterized protein conserved in archaea -||||||||||||-----------------------||---------------------------- 1 [S] COG1865 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||||------------------------------------------------- 1 [J] COG1867 N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase --||--|||--------|-------|----|-----||----------||-----|---||--|-- 1 [NT] COG1871 Chemotaxis protein; stimulates methylation of MCP proteins ||||||||||--------------------|-----||---------------------------- 1 [S] COG1873 Uncharacterized conserved protein ------||---------|------------|--|--||-------|------|-------|--|-- 1 [G] COG1874 Beta-galactosidase |-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--| 1 [R] COG1881 Phospholipid-binding protein ------|||--------|--|---|-------|-------------|-|--|-------------- 1 [C] COG1883 Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit ---||||||--||--------|----||||-------|----|||----------|---|||||-- 1 [I] COG1884 Methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit -|||--||||-------------------------------------------------------- 1 [S] COG1885 Uncharacterized protein conserved in archaea |-----|------------------------|--|||------------|--|------------- 1 [M] COG1887 Putative glycosyl/glycerophosphate transferases involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC ||--|||||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1888 Uncharacterized protein conserved in archaea ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1889 Fibrillarin-like rRNA methylase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1890 Ribosomal protein S3AE |-||--||||||------------------------------------------------------ 1 [S] COG1892 Uncharacterized protein conserved in archaea ---|--|||-|-|||-|--|------|||-|||-||||----|||||-||-----|------||-- 1 [H] COG1893 Ketopantoate reductase -||---|-|--------|------------------------------------------------ 1 [S] COG1895 Uncharacterized conserved protein related to C-terminal domain of eukaryotic chaperone, SACSIN ---|--|||||||||------|------------||------|||||-||-|----||||||||-- 1 [R] COG1896 Predicted hydrolases of HD superfamily |-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||-- 1 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes ||||||||||||||||---|-------------------------------------------|-- 1 [O] COG1899 Deoxyhypusine synthase -|||--|||||-|-----------------------------------|----------------- 1 [S] COG1901 Uncharacterized conserved protein ------|||-|------|------------------------------------------------ 1 [S] COG1906 Uncharacterized conserved protein |||-|||||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1909 Uncharacterized protein conserved in archaea |||---||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1911 Ribosomal protein L30E -|||--|||||||---||-|-------------|||-------||-----------||-------- 1 [S] COG1912 Uncharacterized conserved protein ||||--||||--------------||--------------------------|------------- 1 [S] COG1916 Uncharacterized homolog of PrgY (pheromone shutdown protein) ||||--|||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG1931 Uncharacterized protein conserved in archaea -||---||||-------------------------------------------------------- 1 [S] COG1935 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [F] COG1936 Predicted nucleotide kinase (related to CMP and AMP kinases) |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [R] COG1938 Archaeal enzymes of ATP-grasp superfamily |||---||||--------||---------------------------------------------- 1 [C] COG1941 Coenzyme F420-reducing hydrogenase, gamma subunit ||||||||||------------||------------------------------------------ 1 [S] COG1945 Uncharacterized conserved protein ||||--||||||||||-------------------------------------------------- 1 [L] COG1948 ERCC4-type nuclease |||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||--- 1 [C] COG1951 Tartrate dehydratase alpha subunit/Fumarate hydratase class I, N-terminal domain -||||||||--||----------------------------------------------------- 1 [NU] COG1955 Archaeal flagella assembly protein J |-||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG1958 Small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) homolog -----||---|-------||-|----|||-|-||||||----|||||-||--|--|---|||||-- 1 [L] COG1961 Site-specific recombinases, DNA invertase Pin homologs |||-|||||||||--------------||------------------------------------- 1 [R] COG1964 Predicted Fe-S oxidoreductases ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1976 Translation initiation factor 6 (eIF-6) ||--|||||||||---|------------------------------------------------- 1 [G] COG1980 Archaeal fructose 1,6-bisphosphatase --|---||---------|--------|---||||-|||----|||||-|----------------- 1 [KT] COG1983 Putative stress-responsive transcriptional regulator ------||-----|------||----||||----|-||----|||||-|||--|||--||---|-- 1 [E] COG1984 Allophanate hydrolase subunit 2 |||---||||--|-----------------|---||||----|||||--|-|-------------- 1 [R] COG1988 Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolases ||||||||||||||||----------|--------------------------------------- 1 [S] COG1990 Uncharacterized conserved protein ||----||-|-------------------------------------------------------- 1 [S] COG1991 Uncharacterized conserved protein -||---||-|------||---------||--------------------------------|-|-- 1 [S] COG1993 Uncharacterized conserved protein |||||||||||||||---------------|----------------------------------- 1 [K] COG1996 DNA-directed RNA polymerase, subunit RPC10 (contains C4-type Zn-finger) ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG1997 Ribosomal protein L37AE/L43A |||||||||||||||--------------------------------------------------- 1 [J] COG1998 Ribosomal protein S27AE ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2004 Ribosomal protein S24E ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2007 Ribosomal protein S8E ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG2012 DNA-directed RNA polymerase, subunit H, RpoH/RPB5 |||---||---------------------------------------------------------- 1 [S] COG2014 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2016 Predicted RNA-binding protein (contains PUA domain) ||--||||-||||------------------------------------------------|---- 1 [F] COG2019 Archaeal adenylate kinase --|---|||---||||--||-------||-|-----------------|-||---|----|||--- 1 [O] COG2020 Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase ||||||||||-|||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2023 RNase P subunit RPR2 -|----|||--------------------------------------------------------- 1 [S] COG2028 Uncharacterized conserved protein |||---||-|-------------------------------------------------------- 1 [S] COG2029 Uncharacterized conserved protein |||---|||--------|------|-----|----------------------------------- 1 [C] COG2033 Desulfoferrodoxin |||-||||||-||----------------------------------------------------- 1 [S] COG2034 Predicted membrane protein |||||||||||||-----||||----|||||------|----|||-|-||-----|---|||||-- 1 [H] COG2038 NaMN:DMB phosphoribosyltransferase ------||---|--------||-----||---|||-||-------|---------|---------- 1 [O] COG2039 Pyrrolidone-carboxylate peptidase (N-terminal pyroglutamyl peptidase) ||||||||||-------------------------------------------------------- 1 [R] COG2047 Uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily) ------||-----|------||----||||----|-||----|||-|-|||--|||--||---|-- 1 [E] COG2049 Allophanate hydrolase subunit 1 --|||||||-||--|-|----|----|||--|||||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [Q] COG2050 Uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2051 Ribosomal protein S27E ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2053 Ribosomal protein S28E/S33 ||----||-|----------------|---|-----|-----|||-|--|||-------||||--- 1 [C] COG2055 Malate/L-lactate dehydrogenases ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2058 Ribosomal protein L12E/L44/L45/RPP1/RPP2 ||--||||-|-----------|-------------------------------------------- 1 [G] COG2074 2-phosphoglycerate kinase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2075 Ribosomal protein L24E |||||||||||||||-||------------|----------------------------------- 1 [S] COG2078 Uncharacterized conserved protein ||----||||-------------------------------------------------------- 1 [S] COG2083 Uncharacterized protein conserved in archaea ||-|--|||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG2090 Uncharacterized protein conserved in archaea |||||||||||||||--------------------------------------------------- 1 [J] COG2092 Translation elongation factor EF-1beta |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [K] COG2093 DNA-directed RNA polymerase, subunit E'' ---||||||-|||-------||----||||-----|||--------|--|-----|---|||||-- 1 [S] COG2096 Uncharacterized conserved protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2097 Ribosomal protein L31E -|----|||||-|----------------------------------------------------- 1 [R] COG2100 Predicted Fe-S oxidoreductase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [K] COG2101 TATA-box binding protein (TBP), component of TFIID and TFIIIB |-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||-- 1 [H] COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis -||---|---||------||-|--------------||----|||||-||-----|---------- 1 [S] COG2105 Uncharacterized conserved protein |--|--|||||||||--------------------------------------------------- 1 [S] COG2106 Uncharacterized conserved protein -|||--|||||||-----------------|----------------------------------- 1 [R] COG2108 Uncharacterized conserved protein related to pyruvate formate-lyase activating enzyme --||||||--|------|||||-----||-------------|||||-||-----|---||||--- 1 [H] COG2109 ATP:corrinoid adenosyltransferase --|-||||||||||--||--||-----||---|-||------|||-|--|-----|------|--- 1 [R] COG2110 Predicted phosphatase homologous to the C-terminal domain of histone macroH2A1 -|----|||-|||---|------------------------------------------------- 1 [T] COG2112 Predicted Ser/Thr protein kinase ||||--||---------------------------------------------------------- 1 [J] COG2117 Predicted subunit of tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain |||||||||||||||--------------------------------------------------- 1 [R] COG2118 DNA-binding protein --|---||-|-|-|||-----|----||||----|-||----|--|-------------||||--- 1 [S] COG2120 Uncharacterized proteins, LmbE homologs |-|-||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2123 RNase PH-related exoribonuclease ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2125 Ribosomal protein S6E (S10) ||||||||||-|||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2126 Ribosomal protein L37E |||---|||||||---|-------------------------------------------|----- 1 [R] COG2129 Predicted phosphoesterases, related to the Icc protein --|-||||||---||--|--||--|-----||||||||-|--------|----------------- 1 [F] COG2131 Deoxycytidylate deaminase |||---||||||||||-------------------------------------------------- 1 [JA] COG2136 Predicted exosome subunit/U3 small nucleolar ribonucleoprotein (snoRNP) component, contains IMP4 domain ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2139 Ribosomal protein L21E --|---|||---------|-----------------|---------|--------|---||-|--- 1 [GR] COG2140 Thermophilic glucose-6-phosphate isomerase and related metalloenzymes --|---|||----||-----------|---||-|||||----|||-|---||----||-|------ 1 [H] COG2145 Hydroxyethylthiazole kinase, sugar kinase family ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2147 Ribosomal protein L19E |||-||||-||||----|---|----||||-|||||||----|---------|--|---|||||-- 1 [R] COG2151 Predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme --|---||----|---||-----------------|---------|-------------------- 1 [G] COG2152 Predicted glycosylase |||---||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2157 Ribosomal protein L20A (L18A) ---|--||-|-||-----|-------|||-|---||-----------------------||-||-- 1 [R] COG2159 Predicted metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold ||----||-|||||||--------------|------|---------------------------- 1 [J] COG2163 Ribosomal protein L14E/L6E/L27E ||||||||||-|||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2167 Ribosomal protein L39E ||----||-|||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2174 Ribosomal protein L34E -||---|||||||-|--------------------------------------------------- 1 [J] COG2178 Predicted RNA-binding protein of the translin family ----|-||--|||----|---|---------|||||||----|||||-|----------|------ 1 [G] COG2182 Maltose-binding periplasmic proteins/domains ---||||||--||-------||----||||-------|----|||----------|---|||||-- 1 [I] COG2185 Methylmalonyl-CoA mutase, C-terminal domain/subunit (cobalamin-binding) |-|-|||||------------|-------------------------------------------- 1 [C] COG2191 Formylmethanofuran dehydrogenase subunit E -|----||-|--------|--|---------------------------|-----|----|-|--- 1 [O] COG2192 Predicted carbamoyl transferase, NodU family --||--|||--------|-|----||----|-----||----|||||-||--|--|--|||-||-- 1 [NT] COG2201 Chemotaxis response regulator containing a CheY-like receiver domain and a methylesterase domain |-||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|- 1 [P] COG2212 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [L] COG2219 Eukaryotic-type DNA primase, large subunit |-----||-|-------|--||--------|-||-||-----|||||--|--|------|||||-- 1 [M] COG2222 Predicted phosphosugar isomerases |-||--||||---||-|--|-------||-|-----||----|||-|-||--|----------|-- 1 [R] COG2234 Predicted aminopeptidases -||||||||-|||----------------------------------------------------- 1 [S] COG2237 Predicted membrane protein ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2238 Ribosomal protein S19E (S16A) -|----||--|-|----|------------------------------------------------ 1 [S] COG2245 Predicted membrane protein ---||||||||||-----||------||||||-||||-----|---|--|-----|------||-- 1 [S] COG2246 Predicted membrane protein -|----|||||||----------------------------------------------------- 1 [R] COG2248 Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily) ------||---------|||------||||------------------------------------ 1 [R] COG2251 Predicted nuclease (RecB family) -|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|-- 1 [R] COG2252 Permeases -|----|||-|||----------------------------------------------------- 1 [L] COG2254 Predicted HD superfamily hydrolase, possibly a nuclease |||||||||||||||--------------------------------------------------- 1 [J] COG2260 Predicted Zn-ribbon RNA-binding protein -|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [R] COG2262 GTPases |||||||||||||--|-------------------------------------------------- 1 [J] COG2263 Predicted RNA methylase |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [H] COG2266 GTP:adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase ------||-------------|----|||-----|------------------------------- 1 [S] COG2306 Uncharacterized conserved protein ---|--||--|||-------||-------------|||-------|--|-------------|--| 1 [E] COG2317 Zn-dependent carboxypeptidase ---|--||-----------|-|----|-----||||||---------------------------- 1 [S] COG2339 Predicted membrane protein ------||----|--------|-------------||------------------|------|--- 1 [E] COG2362 D-aminopeptidase ----||||--|||----|---|---------------------------|-----|---||||--- 1 [G] COG2379 Putative glycerate kinase -|----||----|--------|-------------------------------------------- 1 [S] COG2383 Uncharacterized conserved protein ------||||--|--------------------------------|-------------------- 1 [R] COG2401 ABC-type ATPase fused to a predicted acetyltransferase domain |-----||-||-|-----|----------------------------------------------- 1 [R] COG2403 Predicted GTPase ------||--|-|----|------------|--|--------|||||---|--------------- 1 [G] COG2407 L-fucose isomerase and related proteins --||||||||-||----------------------------------------------------- 1 [S] COG2412 Uncharacterized conserved protein ------||||-||----------------------------------------------------- 1 [R] COG2413 Predicted nucleotidyltransferase ------|||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG2419 Uncharacterized conserved protein ------||---||-|--|-|---------------|-|----------------------|--|-- 1 [C] COG2421 Predicted acetamidase/formamidase ------|||---|------------------------|---------------------------- 1 [S] COG2426 Predicted membrane protein ------||-|--||---------------------------------------------------- 1 [S] COG2428 Uncharacterized conserved protein --|---|||-|-|----------------------------------------------------- 1 [S] COG2430 Uncharacterized conserved protein ------||--|||-------|---------------------|||||-|-||-||----------- 1 [S] COG2431 Predicted membrane protein |-||--|||||||----------------------------------------------------- 1 [S] COG2433 Uncharacterized conserved protein ------|||--||----------------------------------------------------- 1 [C] COG2441 Predicted butyrate kinase ------|----||-----||-------||-----------------------|------------- 1 [S] COG2442 Uncharacterized conserved protein ||||||||||--||||-------------------------------------------------- 1 [U] COG2443 Preprotein translocase subunit Sss1 ||||||||||-------------------------------------------------------- 1 [S] COG2450 Uncharacterized conserved protein ------||-|--||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG2451 Ribosomal protein L35AE/L33A -||---||--||-||----|-|----|---------------||||--||---------------- 1 [T] COG2453 Predicted protein-tyrosine phosphatase |||---||-|-|------------------|----------------------------------- 1 [S] COG2454 Uncharacterized conserved protein ||----||---------------------------------------------------------- 1 [S] COG2456 Uncharacterized conserved protein |||---||||-|------------------------------------------------------ 1 [S] COG2457 Uncharacterized conserved protein -|||--|||--------------------------------------------------------- 1 [S] COG2469 Uncharacterized conserved protein --|---||||||-----||-|---------||-----|----------|--------------|-- 1 [R] COG2509 Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases ||----||-|---------|-------------------------|---|---||----|-|---- 1 [S] COG2510 Predicted membrane protein |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [J] COG2511 Archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit E (contains GAD domain) ------||------|--|-|----------------------|||||-|------|--|---||-- 1 [E] COG2515 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase --|---||---|----|||----------------------------------------------- 1 [R] COG2516 Biotin synthase-related enzyme |-----||||-------------------------------------------------------- 1 [R] COG2517 Predicted RNA-binding protein containing a C-terminal EMAP domain ||||--|||||||-|--|------------------------|||||-||--||||||||||||-- 1 [O] COG2518 Protein-L-isoaspartate carboxylmethyltransferase ||-||||||||||||-||--------||||------------------------------------ 1 [J] COG2519 tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase and related methyltransferases -|----||-||-|---------------------------------------|------------- 1 [R] COG2521 Predicted archaeal methyltransferase --||--|||-|||----------------------------------------------------- 1 [R] COG2522 Predicted transcriptional regulator ------||-----||--|-|----------|-----||--------------|--|---------- 1 [G] COG2730 Endoglucanase ------||----|--------|-------------------------------------------- 1 [V] COG2810 Predicted type IV restriction endonuclease |||||||||------------|-------------------------------------------- 1 [C] COG2811 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit H -|----||-|-|-----|---|---------|||||||----||||||||||-------|||||-- 1 [J] COG2813 16S RNA G1207 methylase RsmC -||||||||--||----------------------------------------------------- 1 [NU] COG2874 Predicted ATPases involved in biogenesis of archaeal flagella ---|--|||-|-|-----||---------------------------------------------- 1 [S] COG2886 Uncharacterized small protein |||||||||||||----------------------------------------------------- 1 [J] COG2888 Predicted Zn-ribbon RNA-binding protein with a function in translation |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors |||---||||--|----------------------------------------------------- 1 [S] COG2892 Uncharacterized protein conserved in archaea |||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||-- 1 [H] COG2896 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme ------||---|---------|----||||-------------------|-----|---|||||-- 1 [EQ] COG3191 L-aminopeptidase/D-esterase ---||||||--||------------------------------------|---------------- 1 [S] COG3199 Uncharacterized conserved protein -|----||------------------|||--------------------|-----|---------- 1 [R] COG3233 Predicted deacetylase |||---||||--------||---------------------------------------------- 1 [C] COG3259 Coenzyme F420-reducing hydrogenase, alpha subunit |||--|||-|-|---------------||-------------|||-|------------------- 1 [C] COG3260 Ni,Fe-hydrogenase III small subunit |||--|||-|-|---------------|--------------|||-|------------------- 1 [C] COG3261 Ni,Fe-hydrogenase III large subunit --|---||-------------------|--------------|||-|------------------- 1 [C] COG3262 Ni,Fe-hydrogenase III component G ------|||-----------------------||--------|||-|-|----------------- 1 [S] COG3270 Uncharacterized conserved protein |||||||||||-||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG3277 RNA-binding protein involved in rRNA processing -|----||-||-|----------------------------------------------------- 1 [S] COG3286 Uncharacterized protein conserved in archaea |||---|-|---|------------------|-----|----------|----------------- 1 [R] COG3291 FOG: PKD repeat -|-|||||---------------------------------------------------------- 1 [N] COG3351 Putative archaeal flagellar protein D/E -|-|||||---------------------------------------------------------- 1 [N] COG3352 Putative archaeal flagellar protein C -|-|||||---------------------------------------------------------- 1 [N] COG3354 Putative archaeal flagellar protein G ----|||||--|------------------------------------------------------ 1 [R] COG3368 Predicted permease --|||||||-||-------|---------------------------------------------- 1 [S] COG3372 Uncharacterized conserved protein -|--||||---------------------------------------------------------- 1 [S] COG3373 Uncharacterized protein conserved in archaea --|||||||--------------------------------------------------------- 1 [S] COG3390 Uncharacterized protein conserved in archaea --|-||||---|-|-----|-|---------------|----------------------|-|--- 1 [G] COG3408 Glycogen debranching enzyme ||||||||||||||||---------|-----||||||--------|-----------------|-- 1 [I] COG3425 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase --||||||-|||----|-||---------------------------------------------- 1 [S] COG3431 Predicted membrane protein ------|----|-----------------------|-|---------------------|--|--- 1 [S] COG3535 Uncharacterized conserved protein ------||----------------------||---|||-------|-------------------- 1 [S] COG3595 Uncharacterized conserved protein ------||---------|------------|||||||----------------------------- 1 [S] COG3601 Predicted membrane protein --|||||||--------------------------------------------------------- 1 [K] COG3620 Predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains ------|||---------------|---------------------|-|--|-------------- 1 [C] COG3630 Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, gamma subunit |||-|||||||||---||---|-------------------------------------------- 1 [G] COG3635 Predicted phosphoglycerate mutase, AP superfamily ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [T] COG3642 Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase --||--||---|------|-----------|-----------|||||--------|---------- 1 [L] COG3677 Transposase and inactivated derivatives ------||----------||------|||||||||----------------------------|-- 1 [K] COG3682 Predicted transcriptional regulator ------||----|-----------------------------|||-|------------------- 1 [R] COG3769 Predicted hydrolase (HAD superfamily) -|----||-|--|----------------------------------------------------- 1 [L] COG3780 DNA endonuclease related to intein-encoded endonucleases ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG3845 ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase components ----||||---|------------------|----------------------------------- 1 [S] COG3885 Uncharacterized conserved protein ------||--|||----------------------------------------------------- 1 [R] COG3889 Predicted solute binding protein ------||------------------|---|---|-||---------------------------- 1 [S] COG3949 Uncharacterized membrane protein ------||||-------------------------------------------------------- 1 [S] COG4003 Uncharacterized protein conserved in archaea |-----||-|-------------------------------------------------------- 1 [S] COG4025 Predicted membrane protein ------||-|--|----------------------------------------------------- 1 [S] COG4027 Uncharacterized protein conserved in archaea ------||-|-||----------------------------------------------------- 1 [R] COG4028 Predicted P-loop ATPase/GTPase --||--||-|-------------------------------------------------------- 1 [S] COG4044 Uncharacterized protein conserved in archaea ------||-||-|----------------------------------------------------- 1 [S] COG4047 Uncharacterized protein conserved in archaea -|----||-|-------------------------------------------------------- 1 [R] COG4049 Uncharacterized protein containing archaeal-type C2H2 Zn-finger -|----||-|-------------------------------------------------------- 1 [S] COG4072 Uncharacterized protein conserved in archaea ------|------||--------------------------------------------||-|--- 1 [E] COG4126 Hydantoin racemase ---|--||--|----------|--|-----------------|||||-|-||-||----||||--- 1 [H] COG4143 ABC-type thiamine transport system, periplasmic component --|---|------------------------------------------|-----|---------- 1 [S] COG4273 Uncharacterized conserved protein ----|||----|------------------------------------------------------ 1 [S] COG4344 Uncharacterized protein conserved in archaea ------||--|||----------------------------------------------------- 1 [S] COG4345 Uncharacterized protein conserved in archaea ------||--|||----------------------------------------------------- 1 [O] COG4346 Predicted membrane-bound dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase ---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||--- 1 [R] COG4603 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ------||---||----------------------------------------------------- 1 [S] COG4697 Uncharacterized protein conserved in archaea ------||----------------------|||||------------------------------- 1 [S] COG4720 Predicted membrane protein |-|---||---------------------------------------------------------- 1 [S] COG4743 Predicted membrane protein ---|--|||--|-||--|--||----||||------||-----------|-----|---||||||| 1 [I] COG4799 Acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta) ||----||-|----------------|||-|--------------|---|-||--|---||-||-- 1 [U] COG4962 Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase |||---|-|-------||--|---|-------|-------------|-||-|------|------- 1 [C] COG5016 Pyruvate/oxaloacetate carboxyltransferase ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG5256 Translation elongation factor EF-1alpha (GTPase) ||||||||||||||||-------------------------------------------------- 1 [J] COG5257 Translation initiation factor 2, gamma subunit (eIF-2gamma; GTPase) -||---||-||------------------------------------------------------- 1 [J] COG5270 PUA domain (predicted RNA-binding domain) ------||----------||-------|||----------------|------------------- 1 [S] COG5305 Predicted membrane protein -||---||-----------------------------------------|---------------- 1 [S] COG5306 Uncharacterized conserved protein ---|--||-------------------||------------------------------------- 1 [K] COG5340 Predicted transcriptional regulator -||---||---------------------------------------------------------- 1 [S] COG5418 Predicted secreted protein --|---|||--------------------------------------------------------- 1 [S] COG5423 Predicted metal-binding protein ------|-|-|-------|-------|---------|----------------------------- 1 [S] COG5428 Uncharacterized conserved small protein ------|||-|-|----------------------------------------------------- 1 [K] COG5625 Predicted transcription regulator containing HTH domain ||-|||-|-||-|||-|-|||------|||-----|-|---------------------------- 0 [P] COG0003 Oxyanion-translocating ATPase ||||||-|||---|||--||-|----|||--|-||||-----|||||-||-||------|--|--- 0 [P] COG0025 NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters |||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 0 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase] --||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 0 [E] COG0031 Cysteine synthase |--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||-- 0 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase ||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--|||||||| 0 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters |||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 0 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 0 [E] COG0082 Chorismate synthase ||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-| 0 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 0 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase |||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 0 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase ||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 0 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 0 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase ||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 0 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 0 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I ||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 0 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 0 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 0 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component ||||---||----------|-------||--|||||--|||-|||-|-|||||||||||-||-|-| 0 [V] COG0286 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit --|----|---|-|||---||-----||||||||||||-----------|-|---|---||-||-- 0 [R] COG0300 Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities ----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 0 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase ||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||-- 0 [M] COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis ||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||-- 0 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC --||---||-|||---|-------------------------|||||-||||---|--|-|-|--- 0 [C] COG0437 Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1 ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 0 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II -------||---|||-|-|--|-----||-|-----||----||||||||--|--|--|-||||-- 0 [P] COG0529 Adenylylsulfate kinase and related kinases ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 0 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase ---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||-- 0 [C] COG0554 Glycerol kinase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||-- 0 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component ----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||-- 0 [R] COG0579 Predicted dehydrogenase ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 0 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component ---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||-- 0 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase ||||---||----------|-----------||-||--|||-------||||||--|||-||-|-| 0 [V] COG0610 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases ||||||-|||||-||-|-----||-------||||||-----|||-|------||----------- 0 [E] COG0710 3-dehydroquinate dehydratase --|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||-- 0 [G] COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase ||||-|-||----------|-------||--|||||--|||||||-|-|||||---|||-||-|-| 0 [V] COG0732 Restriction endonuclease S subunits |||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 0 [C] COG0778 Nitroreductase -|||---||--|----|-||------|||---|---||----|||||-||-||--|--|||||||| 0 [M] COG1004 Predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase --||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--|||||||||||||| 0 [CP] COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit --||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||-- 0 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily ||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||-- 0 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component |--|---||-|-|----|||-------||-||||||||---------------------------- 0 [C] COG1141 Ferredoxin ||||||-|||||-----|||-|----|||||-----------|||-|-||--|--||||||||||| 0 [C] COG1146 Ferredoxin |||----|||-------|--|---------|-----------|||||------------------- 0 [C] COG1151 6Fe-6S prismane cluster-containing protein |||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||-- 0 [M] COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase |-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 0 [K] COG1309 Transcriptional regulator ||||---||----------|-|--------||||||||-----------|-------------|-- 0 [K] COG1476 Predicted transcriptional regulators ||-----||||||----------------------------------------------------- 0 [S] COG1531 Uncharacterized protein conserved in archaea |||----|||-|-----|-||---------|-----|---------------------|------- 0 [C] COG1592 Rubrerythrin --||---||------------|--------||||||||----|||||-|||||------------- 0 [K] COG1654 Biotin operon repressor -|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-||||||||||||| 0 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins ||||||-||||||----------------------------------------------------- 0 [EH] COG1685 Archaeal shikimate kinase ||-----||--------||||---|--||-|-----------|||-|--|--||||-------|-- 0 [C] COG1773 Rubredoxin --||---|-----||--|-|-|----|-------|-||----||||---|--|--|-----|---- 0 [P] COG1785 Alkaline phosphatase |||----||-----------|--------------------------------------------- 0 [S] COG1852 Uncharacterized conserved protein |||----|||--|------|--||----|-------------|||||-|--|-------|--|||| 0 [S] COG1872 Uncharacterized conserved protein ||||||-||-||-----|||------|||-----|--|-----------|||---|---||-|--- 0 [R] COG1878 Predicted metal-dependent hydrolase |||----|||-------||--|--------||--||------|||||-||--|--|-||----|-- 0 [P] COG1918 Fe2+ transport system protein A --|----|--|-|---|---|-----|||-||----||----|||||-||||-||||||------- 0 [T] COG1966 Carbon starvation protein, predicted membrane protein --||||-||-||----|-||-|-----||-----||||----|||||-||||---|||||||||-- 0 [H] COG1977 Molybdopterin converting factor, small subunit ||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||-- 0 [R] COG1994 Zn-dependent proteases |-||||-|||-||----||--|--------|||----------------|------------||-- 0 [S] COG2013 Uncharacterized conserved protein -------||-|||||-|-||-|--------------||--------------------|------- 0 [P] COG2046 ATP sulfurylase (sulfate adenylyltransferase) |-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||-- 0 [P] COG2217 Cation transport ATPase -------|------|--|--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---|||---- 0 [F] COG2233 Xanthine/uracil permeases -------||----||--|-|||----||||||--||||----|||||-||||---|---|||||-- 0 [I] COG2267 Lysophospholipase ---|---||-|-----|-||-------|-------------------------------------- 0 [R] COG2402 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain |||----||-|-----|-----------------|-||---------------------------- 0 [S] COG2445 Uncharacterized conserved protein -|--||-|---|-------|-------||-----------------------|------------- 0 [L] COG2452 Predicted site-specific integrase-resolvase -------||--------|--|---------||-|---|---------------------------- 0 [S] COG2461 Uncharacterized conserved protein --|----|------------||----|-----------|-------------------|------- 0 [K] COG2865 Predicted transcriptional regulator containing an HTH domain and an uncharacterized domain shared with the mammalian protein Schlafen ----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------ 0 [E] COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase -|-----||---|----------------------------------------------------- 0 [S] COG2880 Uncharacterized protein conserved in archaea --||---|------|------------||-------------|||||--|||-------|||||-- 0 [P] COG3119 Arylsulfatase A and related enzymes -|-|||-|---------------------------------------------------------- 0 [N] COG3353 Putative archaeal flagellar protein F ---|---|||||------------------------------------------------------ 0 [K] COG3357 Predicted transcriptional regulator containing an HTH domain fused to a Zn-ribbon ---|---|---||----------------------------------------------------- 0 [S] COG3379 Uncharacterized conserved protein -------|-------------------||--------------------------|-------|-- 0 [Q] COG3653 N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase ----|--|--||-----|---|---------|||||||-|--|||||-|----------------- 0 [G] COG3833 ABC-type maltose transport systems, permease component -------|---------|--|---------|----------------------------------- 0 [S] COG3862 Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs -|--||-|--|||----|--|------------|-----------||------------||-|--- 0 [G] COG3958 Transketolase, C-terminal subunit -|--||-|--|||----|--|------------|-----------||------------||-|--- 0 [G] COG3959 Transketolase, N-terminal subunit |------|-|-------------------------------------------------------- 0 [R] COG4026 Uncharacterized protein containing TOPRIM domain, potential nuclease --|----||--------------------------------------------------------- 0 [S] COG4854 Predicted membrane protein -||----|---------------------------------------------------------- 0 [S] COG4902 Uncharacterized protein conserved in archaea |-|----|---------------------------------------------------------- 0 [S] COG4906 Predicted membrane protein ----|--|--|------------------------------------------------------- 0 [G] COG4945 Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase -|-----|----|----------------------------------------------------- 0 [R] COG5378 Predicted nucleotide-binding protein -------|------------|---------------||---------------------------- 0 [S] COG5505 Predicted integral membrane protein -------||---------|----------------------------------------------- 0 [S] COG5559 Uncharacterized conserved small protein -------|-|--------------------|----------------------------------- 0 [S] COG5617 Predicted integral membrane protein
