(Tac) Thermoplasma acidophilum Functional categories Fun All J A K L B D Y V T M N Z W U O C G E F H I P Q R S COGs 890 134 -  50 55 1 6 -  4 7 14 9 -  -  15 35 77 48 89 47 73 23 36 8 124 100 proteins 1,288 138 -  80 75 1 8 -  17 10 45 13 -  -  20 49 118 123 183 50 85 57 95 31 261 114 Distribution of COGs by number of proteins proteins 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 18 49 COGs 711 106 36 17 5 5 3 1 2 2 1 1

Co-ocurrences in sister taxa 0 1 order Thermoplasmatales 36 854

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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 49 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily
||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---||||||| 18 [E] COG0531 Amino acid transporters
--|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 10 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases)
|-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 10 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component
||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  9 [M] COG0438 Glycosyltransferase
|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  9 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases
-|||||||-|||----||||-|---|-||-------------|||-|-----|---||--------  8 [L] COG0675 Transposase and inactivated derivatives
||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  7 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases
|||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-|  7 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases
---|||--|-||||-----|||----|||||---|-||----|||||-||---|||---|||||--  7 [I] COG1960 Acyl-CoA dehydrogenases
|||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-|||||||||||||||  6 [R] COG0457 FOG: TPR repeat
||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  6 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis
|||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  6 [R] COG0517 FOG: CBS domain
|||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||--  6 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators
|||-|||||||||----|||||-----||-||-----|----|||-|-||------------|---  6 [C] COG1032 Fe-S oxidoreductase
||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-|||||||  5 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase
|||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||--  5 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases
|-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  5 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily
---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---|||||||  5 [I] COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase
---|||--||-||----|||||----||||||--||||----|||||--|-----|---|||||--  5 [MR] COG4948 L-alanine-DL-glutamate epimerase and related enzymes of enolase superfamily
|||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  4 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase]
|-||||--|-|||||||-||-|-----||--|--||||----|||||-||-||--||-||||||--  4 [I] COG0365 Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases
||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  4 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases
--||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-||||||||||||||||||  4 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) 
|||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||--  4 [C] COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins)
|||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||--  4 [R] COG0730 Predicted permeases
--|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||---  4 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component
|-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||--  4 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component
||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-|  4 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases
|||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||--  4 [C] COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit
--|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||--  4 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase
|||||||||||||--------|--------------|-----------------------------  4 [K] COG1378 Predicted transcriptional regulators
|||||||||||||--------|----|||-|-----||----|||||-||||-|||---|||||--  4 [K] COG1522 Transcriptional regulators
|-|||||||-|||----|-|||----||||||||||||----|||||-|------|------||--  4 [K] COG1695 Predicted transcriptional regulators
--|-||||---|-|-----|-|---------------|----------------------|-|---  4 [G] COG3408 Glycogen debranching enzyme
---|||--|-||------------------------------------------------------  4 [R] COG3413 Predicted DNA binding protein
|||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||---  4 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components
||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||-------------  3 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases
||||||||||------||||||--||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  3 [D] COG0206 Cell division GTPase
||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||---  3 [C] COG0247 Fe-S oxidoreductase
|-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--||||||||  3 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II
|||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  3 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase
--|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||--  3 [G] COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase
|||||||||||||---||||-|-----||---|----|----||||---|-|---|---|||||--  3 [R] COG0433 Predicted ATPase
|||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  3 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
|||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--|||||||||||  3 [O] COG0450 Peroxiredoxin
|||||||||||||---||||-|-----||-||--|-||-----------|-----|----|-|---  3 [R] COG0535 Predicted Fe-S oxidoreductases
|||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---|||||||  3 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins
--|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||---  3 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components
-||||||||-|||---------------------------------------|---||-|||||||  3 [NU] COG0630 Type IV secretory pathway, VirB11 components, and related ATPases involved in archaeal flagella biosynthesis
|-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||--  3 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins
|||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||-------  3 [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  3 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1
-|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||--  3 [L] COG0863 DNA modification methylase
|||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||-------  3 [C] COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit
--|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||---  3 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|---||||---  3 [G] COG1175 ABC-type sugar transport systems, permease components
|-|-||||||||-||||-||------|---|||-||||----|||||--|-----|---|||||-|  3 [M] COG1215 Glycosyltransferases, probably involved in cell wall biogenesis
||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  3 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes
---|||--|-|||-------||-----||||---|-||----|||||-||-----|---|||||||  3 [I] COG1250 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase
--|||||||--||----|||-|--||----|---|||||||--------|-----|----||----  3 [R] COG1277 ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component
||||||||||||||||--------------------------------------------------  3 [K] COG1405 Transcription initiation factor TFIIIB, Brf1 subunit/Transcription initiation factor TFIIB
|||||||||||||--------------||----------------------------------|--  3 [R] COG1545 Predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon
|||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||--  3 [K] COG1846 Transcriptional regulators
--||||-||-||----|-||-|-----||-----||||----|||||-||||---|||||||||--  3 [H] COG1977 Molybdopterin converting factor, small subunit
---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||--  3 [C] COG2025 Electron transfer flavoprotein, alpha subunit
---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||--  3 [C] COG2086 Electron transfer flavoprotein, beta subunit
--||||----||--|---||-|----||------|-||----|||||--|--|--|---||-||--  3 [PR] COG2146 Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenases
-||-|||||-|-|-----------------|-----------|||---------------------  3 [C] COG2414 Aldehyde:ferredoxin oxidoreductase
----||--|-|||---------------------|||-----------------------------  3 [S] COG2427 Uncharacterized conserved protein
--|-||-----|------|--------||-||-----||----||||--------|----|-|---  3 [L] COG3328 Transposase and inactivated derivatives
---|||-----|-|||---------|-----|||||------------------------------  3 [I] COG3407 Mevalonate pyrophosphate decarboxylase
----||-----|------------------|-----------------------------------  3 [O] COG4934 Predicted protease
|||-||--||-|-||-||||-|----|||-||--|||||---|||||--|--||||---|||||--  2 [P] COG0004 Ammonia permease
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  2 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases
|||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---|||||||  2 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0073 EMAP domain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit
---|||||---||||-||||--||--|----|||||||-||||||||-||----------------  2 [H] COG0095 Lipoate-protein ligase A
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase
|||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||--  2 [Q] COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway)
|||||||||||||---|-||-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||--  2 [H] COG0303 Molybdopterin biosynthesis enzyme
--|-||----||-|||--||-|----||||-|||--------|||||-||||||||---|||||--  2 [E] COG0308 Aminopeptidase N
|||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||--  2 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs
--|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|--  2 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase
|-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-|||||||||||||||  2 [C] COG0372 Citrate synthase
|||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-|||||||||||||||  2 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases
|-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||--  2 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||-||||||||-||-||--|---||||---  2 [G] COG0395 ABC-type sugar transport system, permease component
||||||||||||||||---|----------------------|||||-||----------------  2 [L] COG0417 DNA polymerase elongation subunit (family B)
||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||--  2 [O] COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation
--|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||---  2 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component
||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||--  2 [R] COG0456 Acetyltransferases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family)
||||||||||||||||--||-|----||||------||-----------|-----|--|||-|---  2 [O] COG0464 ATPases of the AAA+ class
||||||||||||||--||||---------------------------------------||-|---  2 [T] COG0467 RecA-superfamily ATPases implicated in signal transduction
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase
|||||||||||||||||||||||||-||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication
|-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0498 Threonine synthase
||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase
|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins
|||||||||-|||||||-||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases
|||-||||||-|-||-||--|---|-|||-||-|-|||----|||||-||---|||---|----||  2 [HC] COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases
|||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||--  2 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase
|||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0582 Integrase
----||-----|------||-|--||||||||--||||----|||||||||||||||||--|||--  2 [S] COG0586 Uncharacterized membrane-associated protein
|-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-||||  2 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase
||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease
-||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||--  2 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component
|||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||--  2 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent)
--||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases
||||||||||||||||-----------|||------------------------------------  2 [O] COG0638 20S proteasome, alpha and beta subunits
||||||||--||||||||----||---||||---|||||||||||||||-----------------  2 [L] COG0648 Endonuclease IV
---|||||--||||||-||-------||||||||||||----|||||--|-----|---|||||--  2 [R] COG0656 Aldo/keto reductases, related to diketogulonate reductase
|||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--||||||||  2 [R] COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily
---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||--  2 [C] COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases)
|||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--||||||||||||||  2 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG0681 Signal peptidase I
|||||||||||||---||||-|---|||||||||||-||-|||||||-||--|--|---|||||--  2 [P] COG0704 Phosphate uptake regulator
|||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||--  2 [O] COG0719 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component
--||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--||||||||||||||  2 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein
|||||||||||||||--||||---------|-------------------------|||-------  2 [C] COG0731 Fe-S oxidoreductases
|||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [C] COG0778 Nitroreductase
--||||--|--||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  2 [C] COG0839 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J)
-|||||----|----------|---||---|-----|-|----||-|---|---|-|||----|--  2 [V] COG1002 Type II restriction enzyme, methylase subunits
||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||-------  2 [HR] COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes
--|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||--  2 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases
||||||||||-------|------|-----|-----||----|||||-||||--------------  2 [O] COG1067 Predicted ATP-dependent protease
|||||||||||||||||-||-|----------------------------------------|---  2 [R] COG1100 GTPase SAR1 and related small G proteins
|||-|----|-|------|||-----||||----|-------|||||-|------|||-||-|---  2 [R] COG1123 ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase
|||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|---  2 [C] COG1145 Ferredoxin
||||||-|||||-----|||-|----|||||-----------|||-|-||--|--|||||||||||  2 [C] COG1146 Ferredoxin
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  2 [C] COG1155 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit A
|||||||||||||------|------|||-------------|||----|-----|---|||||--  2 [R] COG1201 Lhr-like helicases
|||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||--  2 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon)
--||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-|  2 [O] COG1225 Peroxiredoxin
--||||--|-------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--||||||||  2 [C] COG1271 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1
---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--||||||||||||||  2 [C] COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex
|||||||||||||----|---||||-||||||||||||----|||-|-----|---------|---  2 [K] COG1321 Mn-dependent transcriptional regulator
|||-|||||||------|------------|-----------------|-----------------  2 [S] COG1433 Uncharacterized conserved protein
-||-||||--||----|-||----|-----------------------------------------  2 [G] COG1449 Alpha-amylase/alpha-mannosidase
----||||---|-|---------------------|||----|||-|--|-|-||-----------  2 [F] COG1457 Purine-cytosine permease and related proteins
|-|||||||-||||||--------------------------------------------------  2 [LO] COG1474 Cdc6-related protein, AAA superfamily ATPase
||||||||||-|||||--------------------------------------------------  2 [L] COG1599 Single-stranded DNA-binding replication protein A (RPA), large (70 kD) subunit and related ssDNA-binding proteins
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||----|||||-||-||--|---||||---  2 [G] COG1653 ABC-type sugar transport system, periplasmic component
-|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-|||||||||||||  2 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins
-||||||||--||-----------------------------------------------------  2 [N] COG1681 Archaeal flagellins
||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||--  2 [K] COG1733 Predicted transcriptional regulators
--|-|||||-|||---||-|-|------------||||----|||||-||-|---|---||-||--  2 [S] COG1801 Uncharacterized conserved protein
||--|||||||||||--|---||---|----|-----------------|------------||--  2 [S] COG1814 Uncharacterized membrane protein
|-||||||||||||||--------------------------------------------------  2 [K] COG1958 Small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) homolog
----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||--  2 [G] COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes
|||||||||||||-------------||--|--------------|---|-|---|---||-||--  2 [NU] COG2064 Flp pilus assembly protein TadC
-||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||--  2 [U] COG2095 Multiple antibiotic transporter
|-|||||||---------------------------------------------------------  2 [R] COG2150 Predicted regulator of amino acid metabolism, contains ACT domain
--||||--|-||----|---|-------------|-|-----------------------------  2 [S] COG2210 Uncharacterized conserved protein
||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||--  2 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid
----||------------||-|----||||-------|-------|--|-----------------  2 [K] COG2345 Predicted transcriptional regulator
----||---------------|----|||-----||------|||||-||--|||||||||-||--  2 [S] COG2353 Uncharacterized conserved protein
----||--|-|||-----||-|---------------------------|-----|-----|-|--  2 [R] COG2366 Protein related to penicillin acylase
---|||---|||-----|---|------------|-------|||||-||--|--|--|||||---  2 [R] COG2391 Predicted transporter component
||||||||||||||||--------------------------------------------------  2 [R] COG2520 Predicted methyltransferase
----||------------|--------||-|---------------------------|-------  2 [R] COG2605 Predicted kinase related to galactokinase and mevalonate kinase
----|------|------------------|-----||----|||||--------|--||||||--  2 [G] COG2721 Altronate dehydratase
--|-||||--||||---|--||--------|------|----------||-----|---||||---  2 [R] COG2872 Predicted metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase HxxxH domain
----||--|-|||---|--------------------|-----------|------------||--  2 [I] COG3255 Putative sterol carrier protein
----||--|-|||-----------------------------------------------------  2 [S] COG3370 Uncharacterized protein conserved in archaea
----||||--|||-----------------------------------------------------  2 [S] COG3371 Predicted membrane protein
----||--|-||-----|------------------------------------------------  2 [S] COG3374 Predicted membrane protein
-||-||-----|-||----|------|||-|------------------------|---|--||--  2 [G] COG3387 Glucoamylase and related glycosyl hydrolases
--||||--|---------------------------------------------------------  2 [S] COG3430 Uncharacterized protein conserved in archaea
-||-||--|-|||-----------------------------------------------------  2 [K] COG3432 Predicted transcriptional regulator
----||||----------|-----------------------------------------------  2 [S] COG3463 Predicted membrane protein
--|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||---  2 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component
---||-----|-|-------|-------------||-|----|||-|--------|----|||---  2 [I] COG4670 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase
----||---|----------------||||------------------------------------  2 [S] COG5650 Predicted integral membrane protein
||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||--  1 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase
||-|||-|-||-|||-|-|||------|||-----|-|----------------------------  1 [P] COG0003 Oxyanion-translocating ATPase
|||||||||||||||-||||-------||||-||-|||----|--||--|--|------||-|---  1 [F] COG0005 Purine nucleoside phosphorylase
||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||--  1 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---|||||||  1 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5)
|||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||---  1 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family
||-||||||||--|--|||-------|||-|--||-||----------------------------  1 [S] COG0011 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase
|||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase
---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---|||||||  1 [C] COG0022 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit
|||||||||||||||---||----------------------|||||-||||--------------  1 [J] COG0023 Translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1) and related proteins
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase
||||||-|||---|||--||-|----|||--|-||||-----|||||-||-||------|--|---  1 [P] COG0025 NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters
---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||--  1 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)
--||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0031 Cysteine synthase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase
-|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control
-|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||--  1 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC
||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--||||||||  1 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||--  1 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  1 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0048 Ribosomal protein S12
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0049 Ribosomal protein S7
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0051 Ribosomal protein S10
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [G] COG0061 Predicted sugar kinase
|||||||||||||||-||||-|----|||||-----------|||||-||--|--|||||||||--  1 [S] COG0062 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||--  1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  1 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit
||||||||||||||--||||-|--------||--|-||--------|-||------||-||-||--  1 [E] COG0075 Serine-pyruvate aminotransferase/archaeal aspartate aminotransferase
||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||--  1 [E] COG0077 Prephenate dehydratase
|||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase
|||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0082 Chorismate synthase
-|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||-------  1 [E] COG0083 Homoserine kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11
|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase
|||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase
---|||--|-|||||-|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  1 [O] COG0109 Polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)
|||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||--  1 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase
||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||--  1 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase
||--|-||--||-|----||-------||-------------|||||-||||-|||---||||---  1 [R] COG0121 Predicted glutamine amidotransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0125 Thymidylate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--||||||||  1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase
||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase
||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase
--||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0148 Enolase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase
-|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes
||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain
--||||||--|||||----|-|----|||||---|-||----|||||-|||----|---||||---  1 [E] COG0160 4-aminobutyrate aminotransferase and related aminotransferases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  1 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase
||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0164 Ribonuclease HII
||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase
-|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase
|||-|||||||--||||-||----||--------------------------------------||  1 [I] COG0170 Dolichol kinase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||--  1 [H] COG0171 NAD synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase
|||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [E] COG0174 Glutamine synthetase
-||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||--  1 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes
-|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||--  1 [G] COG0176 Transaldolase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-|||||||||||||||  1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase
|||-|||||||||||-|||||---------------|------------|--|-------|-|---  1 [J] COG0182 Predicted translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit
--||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||  1 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0195 Transcription elongation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY
||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit
|-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases
|||||||||||||||--|--||----|||||--|||||------------||--------------  1 [H] COG0214 Pyridoxine biosynthesis enzyme
--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase
|-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-|||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase
-|--||-------|||--|-|------||-|-----------|||||||||||||||||---||--  1 [E] COG0241 Histidinol phosphatase and related phosphatases
||-||||||||||---|-||-|----|||-------||----|||||-||||---|||||||||--  1 [C] COG0243 Anaerobic dehydrogenases, typically selenocysteine-containing
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10
|||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0250 Transcription antiterminator
|||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|----  1 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)
|--|||----|-|---||||-|--|-|||||||||||||||||||||-|-||-------||-|---  1 [F] COG0274 Deoxyribose-phosphate aldolase
----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase)
--||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||--  1 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases
-|--||----------|-|-|------||-|-----------||||||||||-||-|||---|---  1 [G] COG0279 Phosphoheptose isomerase
--|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [C] COG0281 Malic enzyme
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase
||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase
||||||--||---|||--------||----------------||||||||||||||---|||||||  1 [J] COG0293 23S rRNA methylase
|||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes
--||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN
|||||||||||||----|------|-----|||||||||||||||||-||||--------------  1 [H] COG0301 Thiamine biosynthesis ATP pyrophosphatase
||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|---  1 [P] COG0306 Phosphate/sulphate permeases
|||||||||||||---|-||----------|-----------|||-|---------|||-------  1 [O] COG0309 Hydrogenase maturation factor
|||||||||||||||--|---|----|||||--|||||------------||--------------  1 [H] COG0311 Predicted glutamine amidotransferase involved in pyridoxine biosynthesis
|||||||||-|||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0314 Molybdopterin converting factor, large subunit
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0315 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme
|||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs
----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase
-|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------|  1 [L] COG0338 Site-specific DNA methylase
|||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase
|-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase
-||-||--||-|------||----------|-----------|||-|-||||-|||||||||||--  1 [C] COG0348 Polyferredoxin
||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-|  1 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase
|||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase
--|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1)
--|-||----|--||--|||-|----|||-||||||||-|--|||||-||-----|---||-||--  1 [G] COG0366 Glycosidases
|||||||||||-||||----------||||||---|||----|||||-||--|-------|-|---  1 [E] COG0367 Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)
|||||||||||||-----||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||---  1 [H] COG0368 Cobalamin-5-phosphate synthase
|||||||||||||-|--|||----------||||-|||----|||||-------------|-----  1 [C] COG0371 Glycerol dehydrogenase and related enzymes
||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||-------  1 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases
|---||----|--|||--|-------||||------------|||-|--------|----|-|---  1 [G] COG0380 Trehalose-6-phosphate synthase
|||||||||--|-----|||-------|||-|---|-|----|||-|-|--|-----------|--  1 [S] COG0393 Uncharacterized conserved protein
|||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||--  1 [O] COG0396 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, ATPase component
|||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||--  1 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||--  1 [E] COG0403 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), N-terminal domain
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--||||---|||||--  1 [E] COG0404 Glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)
----||----||||||--||||----|||-----|-||----|||-|-||--||||||-||-||--  1 [E] COG0405 Gamma-glutamyltransferase
--|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase
--|-|------|-||-|-||-------|||------|-----|||||--|-----|---||-||--  1 [Q] COG0412 Dienelactone hydrolase and related enzymes
||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||----------------  1 [L] COG0419 ATPase involved in DNA repair
||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|-----  1 [L] COG0420 DNA repair exonuclease
-|--|||||||||||-||---|----|---|--|--||----||||||-|--||||||----|---  1 [E] COG0421 Spermidine synthase
||||||||||||||||-----|--|||||||---|---||||------------------------  1 [J] COG0423 Glycyl-tRNA synthetase (class II)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0443 Molecular chaperone
||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains
|||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  1 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase
|||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|  1 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase
-|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||--  1 [G] COG0469 Pyruvate kinase
|||-|--------||||-|||-----||||||||-||||||||||||--|----------|||---  1 [P] COG0474 Cation transport ATPase
|||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-||||||||||||||  1 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components
|-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases)
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain
||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning
||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0492 Thioredoxin reductase
--|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||||  1 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||-||||------||||-------------------|--|--|---|||||--  1 [H] COG0499 S-adenosylhomocysteine hydrolase
|||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||--  1 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase)
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  1 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit
---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  1 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes
---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||--  1 [E] COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding)
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II
|||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||  1 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases
---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|---  1 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit
|||||||||||||---|--|-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0521 Molybdopterin biosynthesis enzymes
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins
|||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||--  1 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0527 Aspartokinases
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0528 Uridylate kinase
||||||||||||-||-|||-----||-----------|----|||||-|--|--------|-----  1 [P] COG0530 Ca2+/Na+ antiporter
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity
---|||--|-|||||-||||-|-----||--|--||||----|||||--|-|---|||-|||||--  1 [C] COG0538 Isocitrate dehydrogenases
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||--  1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase
---|||||--|-|-----|------------||||-----|-|||-|--||---------|-----  1 [E] COG0549 Carbamate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0550 Topoisomerase IA
|||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||-------  1 [L] COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase
---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||--  1 [C] COG0554 Glycerol kinase
||||||||||||------||-|-----||-|------|----|||||-||||||||---|||||--  1 [O] COG0555 ABC-type sulfate transport system, permease component
|-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase
|-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|---  1 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily
||||||--||-||-----||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-|  1 [J] COG0565 rRNA methylase
|||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--||||||||||||||  1 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)
---|||-----|-|||--|--|---|||||-|||||||----|||||-|||||--|---||||---  1 [C] COG0578 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase
----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||--  1 [R] COG0579 Predicted dehydrogenase
---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||--  1 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
|||||||||||||||||----|--------------------|||||-||||----|||-------  1 [S] COG0585 Uncharacterized conserved protein
|-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-||  1 [ER] COG0591 Na+/proline symporter
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog)
|||-||--||-|-||--||--|----|||--|---|||-------|---||-||||---|||||--  1 [S] COG0599 Uncharacterized homolog of gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit
||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes
|||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase
--||||----||-||-|--|-|----||||-|--||||----|||||-||-||--|---|||||--  1 [CR] COG0604 NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductases
|-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [P] COG0605 Superoxide dismutase
-||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||--  1 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component
|||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|--  1 [H] COG0611 Thiamine monophosphate kinase
|||||||||||||||||--------------|--|||----------------------------|  1 [MI] COG0615 Cytidylyltransferase
|||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----||||||||||||||||||||||||  1 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class)
|||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase
-|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases
||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K
--|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||--  1 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase
-|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||--  1 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7
|-||||-----|-||---||-------||||------|----|||||-||-|||||---|||||||  1 [R] COG0661 Predicted unusual protein kinase
--|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating)
----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-||||  1 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat
--|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase
|---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---|||||||  1 [J] COG0689 RNase PH
-||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||--  1 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase
-||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||--  1 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid)
|-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0708 Exonuclease III
||||||-|||||-||-|-----||-------||||||-----|||-|------||-----------  1 [E] COG0710 3-dehydroquinate dehydratase
--||||------|---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0713 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)
|||||||||||||---||||-|---||||||---||||----|||||-||--|--|---|||||--  1 [R] COG0714 MoxR-like ATPases
|||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-|||||||||||||||||  1 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase
||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [P] COG0725 ABC-type molybdate transport system, periplasmic component
--|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins
|||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||--  1 [H] COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A
----||----------||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein
----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0793 Periplasmic protease
--||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC
----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II
----||||--|||||----|------|----|-|||||------------||----|||--|----  1 [K] COG0819 Putative transcription activator
|-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [R] COG0824 Predicted thioesterase
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0838 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 3 (chain A)
----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit
||||||--|---------------------------------------------------------  1 [F] COG0856 Orotate phosphoribosyltransferase homologs
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||--  1 [E] COG1003 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), C-terminal domain
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG1005 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG1007 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N)
--||||----------|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG1008 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)
--||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--||||||||||||||  1 [CP] COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit
||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG1010 Precorrin-3B methylase
|||||||||||--||---------------------------------------------------  1 [R] COG1019 Predicted nucleotidyltransferase
----||-----------|-|------|---|-----||----|||||-||||-||-||||-|----  1 [E] COG1027 Aspartate ammonia-lyase
--|-|||||-|-|---|-----------------|-||-----------|-----|----|-|---  1 [O] COG1030 Membrane-bound serine protease (ClpP class)
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [L] COG1041 Predicted DNA modification methylase
-|||||||||||-------|----------------------|||||-||---||-----|-|---  1 [C] COG1042 Acyl-CoA synthetase (NDP forming)
|||||||||||||-------||--|-----------------|||||-|||||||||||-------  1 [O] COG1047 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2
--||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---|||||||  1 [C] COG1048 Aconitase A
----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||--  1 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases
||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit
----|||||-|||----||||-||---|||----||||----||||--||---|||--||--|---  1 [P] COG1055 Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases
|||||||||-|||-----|--|-----||--|----------|||||---||---|----------  1 [H] COG1056 Nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase
---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||--  1 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA
-|--||--|--|----||--|---------------------------------------------  1 [L] COG1059 Thermostable 8-oxoguanine DNA glycosylase
--|||||||-||||||---|||--|-|||||-||||------|||||-|-----------------  1 [KL] COG1061 DNA or RNA helicases of superfamily II
--|-||----|||||---||------||||-||||-||----|||-|--|--|||||||||||---  1 [R] COG1064 Zn-dependent alcohol dehydrogenases
---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---|||||||  1 [C] COG1071 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, alpha subunit
|---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----|||  1 [D] COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis
|||||||||||||--|||--|----------||||||||-||------------------------  1 [R] COG1078 HD superfamily phosphohydrolases
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1084 Predicted GTPase
----||------------||------||||----||||----|||||--||||-------------  1 [R] COG1090 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1093 Translation initiation factor 2, alpha subunit (eIF-2alpha)
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1094 Predicted RNA-binding protein (contains KH domains)
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1095 DNA-directed RNA polymerase, subunit E'
|-|-|||||||||||---------------------------------------------------  1 [J] COG1096 Predicted RNA-binding protein (consists of S1 domain and a Zn-ribbon domain)
|-|-||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1097 RNA-binding protein Rrp4 and related proteins (contain S1 domain and KH domain)
|||||||||||||-----------||----------------------------------------  1 [F] COG1102 Cytidylate kinase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [G] COG1109 Phosphomannomutase
||||||||||---||---------------------------------------------------  1 [L] COG1111 ERCC4-like helicases
|||||-||||-|-||||||-|------||||---|---|||||||-|--|--|---|--------|  1 [L] COG1112 Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits
-||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||--  1 [P] COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component
-||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||--  1 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components
|--|||--|-|||-------||---------|----||----|||------|-||||||-------  1 [C] COG1139 Uncharacterized conserved protein containing a ferredoxin-like domain
|||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)
|||-||||||||----||--------------------------------------||--------  1 [C] COG1144 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, delta subunit
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1 [C] COG1156 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit B
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1163 Predicted GTPase
----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||--  1 [KE] COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs
---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [E] COG1171 Threonine dehydratase
|||-|||||||||---||--|------||-||||||------|||||-||||---|----------  1 [O] COG1180 Pyruvate-formate lyase-activating enzyme
-||||||||-|-|||--|------------------------------------------------  1 [J] COG1184 Translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family
-||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||--  1 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases
||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|--  1 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases
|||||||||||||||||-------------------------|----------------||-----  1 [R] COG1204 Superfamily II helicase
|-|||||||--||----|||-|----|||||||---||----|||||--|--||||---||-||--  1 [M] COG1209 dTDP-glucose pyrophosphorylase
||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-||||||||||||||  1 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component
|--||||-|--|-|---|--||-----||-|-|-|-||-------||-||-----|---|||||--  1 [Q] COG1228 Imidazolonepropionase and related amidohydrolases
||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||--  1 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III
||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---|||||||  1 [R] COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I
-||||||-|-||||||--||-|--------------------------||-----|---||-||--  1 [J] COG1236 Predicted exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing
||||||--||--------||-|----|||--------------------|-----|----------  1 [H] COG1239 Mg-chelatase subunit ChlI
||||||---|--------||------|||--------------------|-----|----------  1 [H] COG1240 Mg-chelatase subunit ChlD
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [L] COG1241 Predicted ATPase involved in replication control, Cdc46/Mcm family
||||||||||||-|||-|--|---------|-----------------------------------  1 [KB] COG1243 Histone acetyltransferase
||||||||||--------------------|-----------------------------------  1 [R] COG1244 Predicted Fe-S oxidoreductase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1245 Predicted ATPase, RNase L inhibitor (RLI) homolog
-||-|||||-|||----|-|-|---|--|-||||||||----|||||-||-|---|----|-|---  1 [C] COG1254 Acylphosphatases
||||||||||||||||---------|-----|||||------------|-----------------  1 [I] COG1257 Hydroxymethylglutaryl-CoA reductase
|||||||||||||--|--------------------------------------------------  1 [J] COG1258 Predicted pseudouridylate synthase
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1 [C] COG1269 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit I
|||||||||||||-----||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---||||---  1 [H] COG1270 Cobalamin biosynthesis protein CobD/CbiB
----||||---|----------|||-||||-------------------------|----------  1 [C] COG1274 Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)
-|--|-|||----||-----------|||--||||-------|||-|-|-||-|------------  1 [P] COG1275 Tellurite resistance protein and related permeases
|-|-||--|||||----||--|----|---------||----|||||-|||||--|--||||||--  1 [E] COG1280 Putative threonine efflux protein
|||||||||-||-||-------------------------------------------|-------  1 [R] COG1287 Uncharacterized membrane protein, required for N-linked glycosylation
||||||||||||||||-|||||---|----||||||||------------------|||-------  1 [K] COG1293 Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP
||||||||||-||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1303 Uncharacterized protein conserved in archaea
|||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----|||||||  1 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases
|||||||||||-||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1308 Transcription factor homologous to NACalpha-BTF3
|-|||||||||||||||-||-|-----||--------------||||--|-----|----------  1 [R] COG1310 Predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily
||||||||||---|||--------------------------------------------------  1 [L] COG1311 Archaeal DNA polymerase II, small subunit/DNA polymerase delta, subunit B
----||-----------|------------||----||----|||||---|--------||||---  1 [G] COG1312 D-mannonate dehydratase
|-|-|||||||-|--|||-|-|-|------------------|||||-----|--|--------||  1 [P] COG1324 Uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations
|-||||--|-|||---|--|-|||---||-|-----|------------------------||---  1 [O] COG1331 Highly conserved protein containing a thioredoxin domain
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [KH] COG1339 Transcriptional regulator of a riboflavin/FAD biosynthetic operon
|-|||||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1340 Uncharacterized archaeal coiled-coil protein
|-|-|||||-|||---||------------------------------------------------  1 [R] COG1350 Predicted alternative tryptophan synthase beta-subunit (paralog of TrpB)
---|||||--|||---||||--|||||||||-------------------------|||-----||  1 [F] COG1351 Predicted alternative thymidylate synthase
-||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||--  1 [S] COG1354 Uncharacterized conserved protein
|||-|||||||||||-||--------------------------------------------|---  1 [R] COG1355 Predicted dioxygenase
||||||||||||||||-|--|---------||||||||----------------------------  1 [J] COG1358 Ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a)
-||||||||-||-----|------------------------------------------------  1 [M] COG1361 S-layer domain
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [O] COG1370 Prefoldin, molecular chaperone implicated in de novo protein folding, alpha subunit
|||||||||||||---||---------||-------------------------------------  1 [S] COG1371 Uncharacterized conserved protein
-|--||||-|--||--|-||-|-----|||------|-----------------------------  1 [L] COG1372 Intein/homing endonuclease
-||-|-||--||-----|--|------||----|-|--------------|-----|||---|--|  1 [R] COG1373 Predicted ATPase (AAA+ superfamily)
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [O] COG1382 Prefoldin, chaperonin cofactor
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1383 Ribosomal protein S17E
||||||||||--|-----------||-----------------------------------|||||  1 [J] COG1384 Lysyl-tRNA synthetase (class I)
--|-|||||--------|||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||--  1 [K] COG1386 Predicted transcriptional regulator containing the HTH domain
|||-||||||---||-||--||-----||-||--||||----|||||-|-----------|-----  1 [ER] COG1387 Histidinol phosphatase and related hydrolases of the PHP family
|||||||||||-||||----||||||----------------------------------------  1 [C] COG1390 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit E
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1 [C] COG1394 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit D
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [K] COG1395 Predicted transcriptional regulator
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [U] COG1400 Signal recognition particle 19 kDa protein
|||||||||||||----------------------------------------------|||||--  1 [R] COG1407 Predicted ICC-like phosphoesterases
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1412 Uncharacterized proteins of PilT N-term./Vapc superfamily
|---|||||||||-----------------------------------------------|-|---  1 [S] COG1415 Uncharacterized conserved protein
|--|||--|-------|----|---------------------------------|------|---  1 [S] COG1416 Uncharacterized conserved protein
||||||||||------||--||--||----|||||||||-|||||-|---------|||||-----  1 [R] COG1418 Predicted HD superfamily hydrolase
||||||||||--------------------------------------------------------  1 [S] COG1422 Predicted membrane protein
----||--|-|-|---|----|||-------------|------------------|||-------  1 [R] COG1427 Predicted periplasmic solute-binding protein
---||-----|----|-|---|---|----|||||||||||||||||-|-||-------||-|---  1 [F] COG1435 Thymidine kinase
||||||||||||||||----||--|--------|--------------------------------  1 [C] COG1436 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit F
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1439 Predicted nucleic acid-binding protein, consists of a PIN domain and a Zn-ribbon module
---|||||--||--|---||----------------------|||-|-|------|---|---|--  1 [E] COG1446 Asparaginase
|-|||||||--||||-||--|-----|---||-|||||----|||||-||-|---|---||||---  1 [C] COG1454 Alcohol dehydrogenase, class IV
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1460 DNA-directed RNA polymerase, subunit F
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [L] COG1467 Eukaryotic-type DNA primase, catalytic (small) subunit
||||||||||--|----|----------------|-||-----------|--||||----------  1 [S] COG1469 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1471 Ribosomal protein S4E
--||||||---|-----|||||----|||-||-|||||----|||----|||---|--||||||--  1 [R] COG1473 Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase
--|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||---  1 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase
|---||--|-|||---||||----------|------|----|||||-||||-------|||-|--  1 [R] COG1489 DNA-binding protein, stimulates sugar fermentation
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [J] COG1491 Predicted RNA-binding protein
||||||--||-|------||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---|||||--  1 [H] COG1492 Cobyric acid synthase
||||||--||--------------------------------------------------------  1 [K] COG1497 Predicted transcriptional regulator
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1498 Protein implicated in ribosomal biogenesis, Nop56p homolog
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1499 NMD protein affecting ribosome stability and mRNA decay
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1500 Predicted exosome subunit
----||----||-||--|-|----------||-|-|-|----|||||--------|---|---|--  1 [G] COG1501 Alpha-glucosidases, family 31 of glycosyl hydrolases
----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-|||||||  1 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes
|||||||||||||||||-------------------------------------------------  1 [J] COG1503 Peptide chain release factor 1 (eRF1)
---|||||--|||||---|-||------------|-||-----------|--|------|---|-|  1 [E] COG1506 Dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases
|||-|||||||||---||-|-|----|---|---|-||----|||||--|-----|---|||||--  1 [J] COG1514 2'-5' RNA ligase
---||||||||||-|-||-|-|--------|-----|-----|||||-----|-------------  1 [L] COG1515 Deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V)
|||-|||-|||||---||-||------||---|--|-|----|||||----|--|---|-------  1 [L] COG1518 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
----|||||--|-|||-|-|------|---|----|-|-----------|--|-----|-|-||--  1 [R] COG1524 Uncharacterized proteins of the AP superfamily
|||-||--|-||--------------|||-----||||----|||||-||||---|--||||||--  1 [C] COG1526 Uncharacterized protein required for formate dehydrogenase activity
|||||||||||--|||----||----------||--------------------------------  1 [C] COG1527 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit C
-||-|-|||||||----||-|------||-|-----||-----------|-----|---|||||-|  1 [L] COG1533 DNA repair photolyase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG1537 Predicted RNA-binding proteins
---|||----|||---|-||-|------------|-||----------------------------  1 [S] COG1547 Uncharacterized conserved protein
||||||||||-|------------------------------------------------------  1 [J] COG1549 Queuine tRNA-ribosyltransferases, contain PUA domain
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1552 Ribosomal protein L40E
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1571 Predicted DNA-binding protein containing a Zn-ribbon domain
--|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--|||||||||||||  1 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase
--||||||----|---||--||-----||------|||--------|--|-----|---|||||--  1 [R] COG1574 Predicted metal-dependent hydrolase with the TIM-barrel fold
||--|||||||||-----------------------------------------------------  1 [K] COG1581 Archaeal DNA-binding protein
|-|-||-----|-||---------------------------|||||-|--|--------------  1 [S] COG1584 Predicted membrane protein
-|--|||||-|||---||------------|-----||----||||||-|--|--|----------  1 [E] COG1586 S-adenosylmethionine decarboxylase
||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||---  1 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase
||||||||||--|-----------------------------------------------------  1 [J] COG1588 RNase P/RNase MRP subunit p29
|||||||||-||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1594 DNA-directed RNA polymerase, subunit M/Transcription elongation factor TFIIS
----|--------||--|||-|----|||-||||||||----|||||--|---------||-||--  1 [IR] COG1597 Sphingosine kinase and enzymes related to eukaryotic diacylglycerol kinase
|-|||---|--------|||-------------|--------||||--------|--|--|-||-|  1 [S] COG1598 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1601 Translation initiation factor 2, beta subunit (eIF-2beta)/eIF-5 N-terminal domain
|-|||||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1602 Uncharacterized conserved protein
||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG1605 Chorismate mutase
---|||----|||--------|||--|-------||||----||||||||||-|||||||||||--  1 [I] COG1607 Acyl-CoA hydrolase
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1608 Predicted archaeal kinase
--|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||--  1 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein
|||-|||||||||---||------------------------------------------------  1 [F] COG1618 Predicted nucleotide kinase
----||------------||||--|-----||-|-|||-|--|||-|-||---|||--------||  1 [V] COG1619 Uncharacterized proteins, homologs of microcin C7 resistance protein MccF
|||||||||||||--------|--------------------------------------------  1 [S] COG1628 Uncharacterized conserved protein
||--|||||--||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1630 Uncharacterized protein conserved in archaea
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1631 Ribosomal protein L44E
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1632 Ribosomal protein L15E
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1634 Uncharacterized Rossmann fold enzyme
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1644 DNA-directed RNA polymerase, subunit N (RpoN/RPB10)
|||||||||||||---------------------||||----------------------------  1 [R] COG1646 Predicted phosphate-binding enzymes, TIM-barrel fold
||||||--|||-|||-|---|------||-|---||||----||||||||--|||----|||||--  1 [H] COG1648 Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain)
-||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1650 Uncharacterized protein conserved in archaea
----|||||||||---||------|--||--------------------------|----------  1 [S] COG1656 Uncharacterized conserved protein
|||-|||||-------|---|----|----|||||||||-||------------------------  1 [L] COG1658 Small primase-like proteins (Toprim domain)
|-||||||||--|---------------------|--------||-|-|----------||-|---  1 [R] COG1661 Predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1676 tRNA splicing endonuclease
||||||-||||||-----------------------------------------------------  1 [EH] COG1685 Archaeal shikimate kinase
|||||||||||||--|||-|-|----|||-|------|----|||-|--|-----|----------  1 [S] COG1690 Uncharacterized conserved protein
|||-||||||-||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1698 Uncharacterized protein conserved in archaea
---||||||--||--------|----||||-------|----|||----------|-------|--  1 [E] COG1703 Putative periplasmic protein kinase ArgK and related GTPases of G3E family
-||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [K] COG1709 Predicted transcriptional regulator
|-|||||||---------------------------------------------------------  1 [S] COG1711 Uncharacterized protein conserved in archaea
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1717 Ribosomal protein L32E
||||||||||||||||-----|-----------------------|---|----------------  1 [TD] COG1718 Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control
--|||||||-|-|---||||-|---|-|||-----|||----------||-----|---|||||--  1 [R] COG1721 Uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)
----|------|-----|||------|||-|-||||||----------------------------  1 [K] COG1725 Predicted transcriptional regulators
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1727 Ribosomal protein L18E
|||||||||||||||-|-------------------------------------------------  1 [O] COG1730 Predicted prefoldin, molecular chaperone implicated in de novo protein folding
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1736 Diphthamide synthase subunit DPH2
--|-||----|-------||------|||-|-----------|||||-||-|---|---|||||--  1 [R] COG1741 Pirin-related protein
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [J] COG1746 tRNA nucleotidyltransferase (CCA-adding enzyme)
----|||-|-|-|||---||-|-----------|---|----------|--|----|||||||---  1 [E] COG1748 Saccharopine dehydrogenase and related proteins
-|--||||||||||||--------------------------------------------------  1 [S] COG1756 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1761 DNA-directed RNA polymerase, subunit L
|||||-|||||||---|-----------------||||----|||||-|-||---|--|||||---  1 [H] COG1763 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein
----||---------------|----|----|--|||---|||||-|-||--|--|---|||||--  1 [O] COG1764 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation
-||-||||-|-||---||---|----|||-|----|-|--|||||||-||---|||---||-||--  1 [O] COG1765 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation
|-|||||||---------------------------------------------------------  1 [K] COG1777 Predicted transcriptional regulators
|||-|||||||||||---------------------------------------------------  1 [R] COG1779 C4-type Zn-finger protein
|||||||||||||----|------------|-----------|||||||----||-----------  1 [F] COG1781 Aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1782 Predicted metal-dependent RNase, consists of a metallo-beta-lactamase domain and an RNA-binding KH domain
|||||||||||||||||----------||-------||----------|||--||---|||-||--  1 [L] COG1793 ATP-dependent DNA ligase
|-|-||-------||-|----|------------||||----------------------------  1 [L] COG1796 DNA polymerase IV (family X)
||||||--||||------||||-----||-|----|-|--------|--|-----|---||||---  1 [H] COG1797 Cobyrinic acid a,c-diamide synthase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1798 Diphthamide biosynthesis methyltransferase
----|------|-----|--||----|||-|||-||||----|||||-||---|||---|||||--  1 [K] COG1802 Transcriptional regulators
|||||||||||||---|---------------|---------------------------------  1 [E] COG1812 Archaeal S-adenosylmethionine synthetase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG1813 Predicted transcription factor, homolog of eukaryotic MBF1
--||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components
||||||||||||----||||-|----||||-|--||||--------------------|-||||--  1 [F] COG1828 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, PurS component
|||||||||||-|-----------------------------------------------------  1 [R] COG1831 Predicted metal-dependent hydrolase (urease superfamily)
---|||||--|||---||---|---------|||-|||----|||||--------|--|||-|---  1 [R] COG1832 Predicted CoA-binding protein
|||||||||-|-------||-----------------|----------------------------  1 [S] COG1836 Predicted membrane protein
|---|||||-|||----|---------||--------------------------|----------  1 [S] COG1839 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----||||||  1 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1849 Uncharacterized protein conserved in archaea
|-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---|||||||  1 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1855 ATPase (PilT family)
--|-|||||||-|||-----||--------------------|||----|---------|------  1 [J] COG1859 RNA:NAD 2'-phosphotransferase
|||||||-|-|-------------------------------------------------------  1 [S] COG1860 Uncharacterized protein conserved in archaea
-||||||||||||-----------------------||----------------------------  1 [S] COG1865 Uncharacterized conserved protein
|||||||||||||||||-------------------------------------------------  1 [J] COG1867 N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase
||||||||||--------------------|-----||----------------------------  1 [S] COG1873 Uncharacterized conserved protein
|---||----|--|||----------||||------------|||-|--------|------|---  1 [G] COG1877 Trehalose-6-phosphatase
||||||-||-||-----|||------|||-----|--|-----------|||---|---||-|---  1 [R] COG1878 Predicted metal-dependent hydrolase
|-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--|  1 [R] COG1881 Phospholipid-binding protein
---||||||--||--------|----||||-------|----|||----------|---|||||--  1 [I] COG1884 Methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit
||--|||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1888 Uncharacterized protein conserved in archaea
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1889 Fibrillarin-like rRNA methylase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1890 Ribosomal protein S3AE
||||||||||||||||---|-------------------------------------------|--  1 [O] COG1899 Deoxyhypusine synthase
--||||--|--|-||--|-|||----|||-|||-||||-|--|||||-||--|--|---|||||--  1 [C] COG1902 NADH:flavin oxidoreductases, Old Yellow Enzyme family
|||-||--||||------|||---------|----|----------|--|-----|---|-|----  1 [H] COG1903 Cobalamin biosynthesis protein CbiD
|||-|||||||||-----------------------------------------------------  1 [S] COG1909 Uncharacterized protein conserved in archaea
-|||||--|-|-------------------|-----|------------------|----------  1 [P] COG1910 Periplasmic molybdate-binding protein/domain
----||-----|-||----|||----||||||-|||||----|||||--|||||||---||||---  1 [P] COG1914 Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family
||||||||--||----|||||-----||--|||--|||-------||--|-----||||||||---  1 [S] COG1917 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain
||--|----|------|-------------------------|||||--|||----|||||-|---  1 [E] COG1921 Selenocysteine synthase [seryl-tRNASer selenium transferase]
--|-||----------|--|-------||--------------------------|||--|-|---  1 [R] COG1926 Predicted phosphoribosyltransferases
||||||||||--------------------------------------------------------  1 [L] COG1933 Archaeal DNA polymerase II, large subunit
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [F] COG1936 Predicted nucleotide kinase (related to CMP and AMP kinases)
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [R] COG1938 Archaeal enzymes of ATP-grasp superfamily
---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||--  1 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase
--||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||--  1 [L] COG1943 Transposase and inactivated derivatives
||||||||||------------||------------------------------------------  1 [S] COG1945 Uncharacterized conserved protein
-||||||||--||-----------------------------------------------------  1 [NU] COG1955 Archaeal flagella assembly protein J
---|||-------|---|------------||||||||----|||||-||-||||-------||--  1 [T] COG1956 GAF domain-containing protein
|||-|||||||||--------------||-------------------------------------  1 [R] COG1964 Predicted Fe-S oxidoreductases
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1976 Translation initiation factor 6 (eIF-6)
||--|||||||||---|-------------------------------------------------  1 [G] COG1980 Archaeal fructose 1,6-bisphosphatase
||--||--|||||------------------------|----|||||-|-----------------  1 [S] COG1986 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||----------|---------------------------------------  1 [S] COG1990 Uncharacterized conserved protein
||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||--  1 [R] COG1994 Zn-dependent proteases
|||||||||||||||---------------|-----------------------------------  1 [K] COG1996 DNA-directed RNA polymerase, subunit RPC10 (contains C4-type Zn-finger)
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG1997 Ribosomal protein L37AE/L43A
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [J] COG1998 Ribosomal protein S27AE
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2004 Ribosomal protein S24E
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2007 Ribosomal protein S8E
---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--||||||||||||||  1 [C] COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG2012 DNA-directed RNA polymerase, subunit H, RpoH/RPB5
|-||||-|||-||----||--|--------|||----------------|------------||--  1 [S] COG2013 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2016 Predicted RNA-binding protein (contains PUA domain)
||--||||-||||------------------------------------------------|----  1 [F] COG2019 Archaeal adenylate kinase
||||||||||-|||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2023 RNase P subunit RPR2
|||-||||||-||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2034 Predicted membrane protein
|||||||||||||-----||||----|||||------|----|||-|-||-----|---|||||--  1 [H] COG2038 NaMN:DMB phosphoribosyltransferase
--||||--|-|||---|--|-|----|||-------|-----|||||--|-|---|--||||||--  1 [R] COG2041 Sulfite oxidase and related enzymes
||||||---|-|-|||--------------------------------------------------  1 [S] COG2042 Uncharacterized conserved protein
||--||---|-------|||-|--------|-----|------------------|----------  1 [HR] COG2045 Phosphosulfolactate phosphohydrolase and related enzymes
||||||||||--------------------------------------------------------  1 [R] COG2047 Uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)
--|||||||-||--|-|----|----|||--|||||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [Q] COG2050 Uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2051 Ribosomal protein S27E
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2053 Ribosomal protein S28E/S33
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2058 Ribosomal protein L12E/L44/L45/RPP1/RPP2
---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||--  1 [P] COG2060 K+-transporting ATPase, A chain
||-|||--||||------|||---------|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG2073 Cobalamin biosynthesis protein CbiG
||--||||-|-----------|--------------------------------------------  1 [G] COG2074 2-phosphoglycerate kinase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2075 Ribosomal protein L24E
|||||||||||||||-||------------|-----------------------------------  1 [S] COG2078 Uncharacterized conserved protein
|---||----||||------------|||-------||----|||-|--|-----|---||-|---  1 [R] COG2079 Uncharacterized protein involved in propionate catabolism
||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG2082 Precorrin isomerase
|-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||--  1 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [J] COG2092 Translation elongation factor EF-1beta
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [K] COG2093 DNA-directed RNA polymerase, subunit E''
---||||||-|||-------||----||||-----|||--------|--|-----|---|||||--  1 [S] COG2096 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2097 Ribosomal protein L31E
||||||--||--------------------------------------------------------  1 [S] COG2098 Uncharacterized protein conserved in archaea
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [K] COG2101 TATA-box binding protein (TBP), component of TFIID and TFIIIB
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [R] COG2102 Predicted ATPases of PP-loop superfamily
|-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||--  1 [H] COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis
----||--|-|||---|----|||-------------|------------------|||-------  1 [R] COG2107 Predicted periplasmic solute-binding protein
--||||||--|------|||||-----||-------------|||||-||-----|---||||---  1 [H] COG2109 ATP:corrinoid adenosyltransferase
--|-||||||||||--||--||-----||---|-||------|||-|--|-----|------|---  1 [R] COG2110 Predicted phosphatase homologous to the C-terminal domain of histone macroH2A1
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [R] COG2118 DNA-binding protein
|-|-||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2123 RNase PH-related exoribonuclease
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2125 Ribosomal protein S6E (S10)
||||||||||-|||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2126 Ribosomal protein L37E
--|-||||||---||--|--||--|-----||||||||-|--------|-----------------  1 [F] COG2131 Deoxycytidylate deaminase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2139 Ribosomal protein L21E
----||--|---|--------|-----|||------------|||||-||--||||---|||||||  1 [C] COG2142 Succinate dehydrogenase, hydrophobic anchor subunit
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2147 Ribosomal protein L19E
|||-||||-||||----|---|----||||-|||||||----|---------|--|---|||||--  1 [R] COG2151 Predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme
---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||--  1 [P] COG2156 K+-transporting ATPase, c chain
||||||||||-|||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2167 Ribosomal protein L39E
----|-||--|||----|---|---------|||||||----|||||-|----------|------  1 [G] COG2182 Maltose-binding periplasmic proteins/domains
---||||||--||-------||----||||-------|----|||----------|---|||||--  1 [I] COG2185 Methylmalonyl-CoA mutase, C-terminal domain/subunit (cobalamin-binding)
|-|-|||||------------|--------------------------------------------  1 [C] COG2191 Formylmethanofuran dehydrogenase subunit E
---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|--|||-||--  1 [P] COG2216 High-affinity K+ transport system, ATPase chain B
|-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||--  1 [P] COG2217 Cation transport ATPase
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [L] COG2219 Eukaryotic-type DNA primase, large subunit
||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--|  1 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold
--|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis
|||-||-----|----||----------------||--------------------|||-------  1 [L] COG2231 Uncharacterized protein related to Endonuclease III
---|||-----|-------------|-||--|||||----|-----|-||----------|-|---  1 [E] COG2235 Arginine deiminase
--|||||||-|||||----|----|||--------------------------||||||-------  1 [R] COG2236 Predicted phosphoribosyltransferases
-||||||||-|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2237 Predicted membrane protein
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG2238 Ribosomal protein S19E (S16A)
||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG2241 Precorrin-6B methylase 1
||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|---------||||---  1 [H] COG2242 Precorrin-6B methylase 2
||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG2243 Precorrin-2 methylase
---||||||||||-----||------||||||-||||-----|---|--|-----|------||--  1 [S] COG2246 Predicted membrane protein
|||||||||||||||---------------------------------------------------  1 [J] COG2260 Predicted Zn-ribbon RNA-binding protein
|||||||||||||--|--------------------------------------------------  1 [J] COG2263 Predicted RNA methylase
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [H] COG2266 GTP:adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase
---|||-----||--------|----||||----||||-----------|-----|---||||---  1 [R] COG2329 Conserved protein involved in polyketide biosynthesis related to monooxygenase
----||||--|||----|---|---------------------------|-----|---||||---  1 [G] COG2379 Putative glycerate kinase
----||----|||--------|----|||||---|||-----------------------------  1 [R] COG2409 Predicted drug exporters of the RND superfamily
--||||||||-||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2412 Uncharacterized conserved protein
|-||||--|||||||-----------|-------|----------|---|-----|---||||---  1 [E] COG2423 Predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin homolog
----||----|||----|--|---------------------|||-|-------------|-|---  1 [C] COG2440 Ferredoxin-like protein
||||||||||--||||--------------------------------------------------  1 [U] COG2443 Preprotein translocase subunit Sss1
||||||||||--------------------------------------------------------  1 [S] COG2450 Uncharacterized conserved protein
-|--||-|---|-------|-------||-----------------------|-------------  1 [L] COG2452 Predicted site-specific integrase-resolvase
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [J] COG2511 Archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit E (contains GAD domain)
--|-|||||-|||-----------------------------------------------------  1 [S] COG2512 Uncharacterized membrane-associated protein/domain
----||----|||------|------|||------|||----|||-|-||--||||----|-||--  1 [G] COG2513 PEP phosphonomutase and related enzymes
||-||||||||||||-||--------||||------------------------------------  1 [J] COG2519 tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase and related methyltransferases
--||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||----  1 [P] COG2608 Copper chaperone
----||||--||--------------|---||||||||----|||||-|----------||--|--  1 [G] COG2723 Beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/beta-galactosidase
----||-------||--|--|---------||||||--|---------|----||-----|-|---  1 [F] COG2759 Formyltetrahydrofolate synthetase
--|-||--|----||---||||----|||--|||||-|||--|||||-|||--|||---|||||--  1 [L] COG2801 Transposase and inactivated derivatives
|||||||||------------|--------------------------------------------  1 [C] COG2811 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit H
-||||||||--||-----------------------------------------------------  1 [NU] COG2874 Predicted ATPases involved in biogenesis of archaeal flagella
||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG2875 Precorrin-4 methylase
----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------  1 [E] COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase
|||||||||||||-----------------------------------------------------  1 [J] COG2888 Predicted Zn-ribbon RNA-binding protein with a function in translation
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG2896 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme
----||-----|-----|-|-|--------|-----------------|-----------|||---  1 [G] COG2971 Predicted N-acetylglucosamine kinase
---|||--------------||----------|-|-||-------||-||-----|---|||||--  1 [E] COG2986 Histidine ammonia-lyase
---|||--------------||----------|-|-||-------|--||-----|---|||||--  1 [E] COG2987 Urocanate hydratase
--||||---------------------||-------------|-----|----|||---||-|---  1 [L] COG3039 Transposase and inactivated derivatives, IS5 family
----||-----|--------------|||-----|-------|||-|--|-----|---||||---  1 [S] COG3189 Uncharacterized conserved protein
---||||||--||------------------------------------|----------------  1 [S] COG3199 Uncharacterized conserved protein
---|||-----||--------|----||||----||||----------------------------  1 [S] COG3253 Uncharacterized conserved protein
----||-----------------------------|||----|||||-----------|||||---  1 [S] COG3254 Uncharacterized conserved protein
||||||--|||-------------------------------------------------------  1 [R] COG3269 Predicted RNA-binding protein, contains TRAM domain
-||-||---|-|----|-------------------------|||-|--|||------|-|-----  1 [J] COG3276 Selenocysteine-specific translation elongation factor
|||||||||||-||||--------------------------------------------------  1 [J] COG3277 RNA-binding protein involved in rRNA processing
----|-------------|-----------------||-------|-------------||-|---  1 [S] COG3347 Uncharacterized conserved protein
--|-||----|------|-|-------------------------|-----|------|-------  1 [S] COG3350 Uncharacterized conserved protein
-|-|||||----------------------------------------------------------  1 [N] COG3351 Putative archaeal flagellar protein D/E
-|-|||||----------------------------------------------------------  1 [N] COG3352 Putative archaeal flagellar protein C
-|-|||-|----------------------------------------------------------  1 [N] COG3353 Putative archaeal flagellar protein F
-|-|||||----------------------------------------------------------  1 [N] COG3354 Putative archaeal flagellar protein G
|--|||--||||------------------------------------------------------  1 [S] COG3356 Predicted membrane protein
|--|||---|-------|-|----------------------------------------|-----  1 [S] COG3367 Uncharacterized conserved protein
----|||||--|------------------------------------------------------  1 [R] COG3368 Predicted permease
|-|-||------|------------------------------------------|------|---  1 [S] COG3369 Uncharacterized conserved protein
--|||||||-||-------|----------------------------------------------  1 [S] COG3372 Uncharacterized conserved protein
-|--||||----------------------------------------------------------  1 [S] COG3373 Uncharacterized protein conserved in archaea
----||------|--------|--------------------------------------------  1 [S] COG3375 Uncharacterized conserved protein
----|------|--|------------||-----|----------||--------|||--------  1 [P] COG3376 High-affinity nickel permease
--|-||--|---------------------------||----------------------------  1 [S] COG3377 Uncharacterized conserved protein
|---||-----|----------------------|||----------------------||-|---  1 [R] COG3383 Uncharacterized anaerobic dehydrogenase
--|-|------|--|---------------|-----------|||||--|-|---|-------|--  1 [S] COG3384 Uncharacterized conserved protein
----||-----|-|-------|------------|-|---------|--|-||--|---|||||--  1 [G] COG3386 Gluconolactonase
--||||--||--------------------------------------------------------  1 [S] COG3388 Uncharacterized protein conserved in archaea
--||||--|---------------------------------------------------------  1 [S] COG3389 Uncharacterized protein conserved in archaea
--|||||||---------------------------------------------------------  1 [S] COG3390 Uncharacterized protein conserved in archaea
--|-|------|-------|-|--||-||-|-----||----|||-|--|-----|----|-|---  1 [S] COG3391 Uncharacterized conserved protein
----||-----------|--||--------|-|---------------------------------  1 [E] COG3404 Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase
----|------|-|-----------------------|----------------------------  1 [S] COG3410 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||---------|-----||||||--------|-----------------|--  1 [I] COG3425 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase
---|||----|||--------|-----||--------------------------|----|||---  1 [S] COG3427 Uncharacterized conserved protein
--||||||-|||----|-||----------------------------------------------  1 [S] COG3431 Predicted membrane protein
--||||-----|----|-------|---------------------|------||------|----  1 [S] COG3439 Uncharacterized conserved protein
----||-----------|--------------------------------------------|---  1 [S] COG3461 Uncharacterized conserved protein
---|||-----------|------------------------------------------------  1 [S] COG3462 Predicted membrane protein
----||--|---------------------------||----------------------------  1 [S] COG3465 Uncharacterized conserved protein
|-|||--------------|||--------||-----|--------|------|||----|||---  1 [R] COG3467 Predicted flavin-nucleotide-binding protein
-||||||||-|||------|-------||--------------||||-----|--|---||-||--  1 [K] COG3609 Predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain
--||||--|---------------------------------------------------------  1 [S] COG3612 Uncharacterized protein conserved in archaea
--|||||||---------------------------------------------------------  1 [K] COG3620 Predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains
|||-|||||||||---||---|--------------------------------------------  1 [G] COG3635 Predicted phosphoglycerate mutase, AP superfamily
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [T] COG3642 Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase
----||-----------|--|-----------|---------------------------------  1 [E] COG3643 Glutamate formiminotransferase
----|--|--||-----|---|---------|||||||-|--|||||-|-----------------  1 [G] COG3833 ABC-type maltose transport systems, permease component
----||||---|------------------|-----------------------------------  1 [S] COG3885 Uncharacterized conserved protein
----||--|--|------------------------------------------------------  1 [K] COG3888 Predicted transcriptional regulator
-|--||-|--|||----|--|------------|-----------||------------||-|---  1 [G] COG3958 Transketolase, C-terminal subunit
-|--||-|--|||----|--|------------|-----------||------------||-|---  1 [G] COG3959 Transketolase, N-terminal subunit
--|-||--||--------------------------------------------------------  1 [S] COG4004 Uncharacterized protein conserved in archaea
---|||---||-|-----------------------------------------------------  1 [U] COG4023 Preprotein translocase subunit Sec61beta
----|------|--------------|---|----|------------------------------  1 [R] COG4194 Predicted membrane protein
----||-----------|------------|----|------------------------------  1 [S] COG4198 Uncharacterized conserved protein
|-|-|||||-||------------------|------------------------|------||--  1 [C] COG4231 Indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha and beta subunits
----||-----|-------------------|---|------------------------------  1 [S] COG4272 Predicted membrane protein
----|||----|------------------------------------------------------  1 [S] COG4344 Uncharacterized protein conserved in archaea
--|-||--|---------------------------------------------------------  1 [K] COG4738 Predicted transcriptional regulator
--|-||----|------|------------------------------------------------  1 [F] COG4741 Predicted secreted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase
----||----||----------------------------------------|--|----------  1 [S] COG4754 Uncharacterized conserved protein
----||----|-|-----------------------------------------------------  1 [S] COG4847 Uncharacterized protein conserved in archaea
--|-||--|---------------------------------------------------------  1 [S] COG4860 Uncharacterized protein conserved in archaea
----|--|--|-------------------------------------------------------  1 [G] COG4945 Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase
----||----||------------------------------------------------------  1 [S] COG4946 Uncharacterized protein related to the periplasmic component of the Tol biopolymer transport system
----||----||----------------------------------------|--|----------  1 [P] COG4986 ABC-type anion transport system, duplicated permease component
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG5256 Translation elongation factor EF-1alpha (GTPase)
||||||||||||||||--------------------------------------------------  1 [J] COG5257 Translation initiation factor 2, gamma subunit (eIF-2gamma; GTPase)
----|------|----------||-------------------------|----------|----|  1 [H] COG5424 Pyrroloquinoline quinone (Coenzyme PQQ) biosynthesis protein C
--|-||-----|-----------------------------------------------||-|---  1 [S] COG5466 Predicted small metal-binding protein
----||------|------------------------------------|----------------  1 [S] COG5615 Predicted integral membrane protein
----||--|--|------------------------------------------------------  1 [S] COG5666 Uncharacterized conserved protein
|||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||--  0 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases
-||--|--|||||||-|-||-------|-------|-|------------------||-|||||--  0 [EQ] COG0145 N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit
-||--|---||||||-|-||-------|----------------------------||-|||||--  0 [EQ] COG0146 N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit
||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--||||||  0 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases
--||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---|||||||  0 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family)
-----||----|-||--|||-------||--|||-|-|----|-----------------------  0 [G] COG0383 Alpha-mannosidase
--||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|-----  0 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family
-----|-------||-|-||-|||--||||||||||||||||-------|--|--||--|--|---  0 [T] COG0631 Serine/threonine protein phosphatase
|||--|||-|-|-----|---------||-------------|||-|-------------------  0 [C] COG0650 Formate hydrogenlyase subunit 4
||||-||||-|||----|||-|----|||-----||||----|||-|-||---------|||--||  0 [CP] COG0651 Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit
--|--|--|--|-||--|||-|--|-|||||||-||-|----|||||-||--|--|---||-||--  0 [I] COG0657 Esterase/lipase
--|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||--  0 [G] COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase
||||-|-||----------|-------||--|||||--|||||||-|-|||||---|||-||-|-|  0 [V] COG0732 Restriction endonuclease S subunits
-----|-------||-----------||||-|||-|||----|||||-|-||-------||||---  0 [H] COG1072 Panthothenate kinase
|-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||--  0 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase
|-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-||||  0 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase
--|--|--------------|-||--------|-|--|||--|||||------------||||---  0 [EP] COG1124 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component
||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--||||||||||||||  0 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning
|-|--||||---|-----||-|----|||||-----------|---|--||-|--|---||-||--  0 [R] COG1216 Predicted glycosyltransferases
|||--||----------|---------||-------------------------------------  0 [L] COG1332 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily)
|||--||--|||-----|-|-------||-------------------------------------  0 [L] COG1337 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily)
|||--|--||||-----|-||------||---|----|----------------------------  0 [L] COG1343 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
|||--||-||||----||---------||--------|----------------------------  0 [R] COG1353 Predicted hydrolase of the HD superfamily (permuted catalytic motifs)
||---||--|-------|------------------------------------------------  0 [L] COG1421 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
-|---||---||----|-------------------------------------------------  0 [L] COG1517 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
|||--||----------|---------||-------------------------------------  0 [L] COG1567 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily)
|||--||||-------||------------------------------------------------  0 [L] COG1583 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair (RAMP superfamily)
-----|--|-||---------|-----||-------------|||-|--|-----|---|||||--  0 [C] COG1804 Predicted acyl-CoA transferases/carnitine dehydratase
||||-|||||||-----|------------------------------------------------  0 [S] COG1833 Uncharacterized conserved protein
|-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||--  0 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes
-----||---|-------||-|----|||-|-||||||----|||||-||--|--|---|||||--  0 [L] COG1961 Site-specific recombinases, DNA invertase Pin homologs
-----|--|-----------|-----|------|-|--||------|---|||-|-||-|--|---  0 [L] COG2189 Adenine specific DNA methylase Mod
-----|--------------||----|||--|||||-|----|||||-|||----|---|||||--  0 [L] COG2963 Transposase and inactivated derivatives
|||--|||-|-|---------------||-------------|||-|-------------------  0 [C] COG3260 Ni,Fe-hydrogenase III small subunit
|||--|||-|-|---------------|--------------|||-|-------------------  0 [C] COG3261 Ni,Fe-hydrogenase III large subunit
--|--|--|--|------||-|----|------|---|-----||-|-------||----|-|---  0 [L] COG3335 Transposase and inactivated derivatives
--||-|-----|------||-|---------------|----|------------|----|-----  0 [L] COG3385 FOG: Transposase and inactivated derivatives
--||-|---------------|----------||---------|||-------------||||---  0 [L] COG3436 Transposase and inactivated derivatives
-----|-------------|-|---------------------||--------||-----------  0 [V] COG3440 Predicted restriction endonuclease
--|--|-------------||-----|||----||--|-----------------|---||-|---  0 [L] COG3464 Transposase and inactivated derivatives
-|---|--|---------------------------------------------------------  0 [S] COG3466 Putative transposon-encoded protein
-----|-----|-----|---------------------------------------------|--  0 [G] COG3934 Endo-beta-mannanase
-----|-----|---------------||-------------|||---------------------  0 [C] COG4237 Hydrogenase 4 membrane component (E)
-----|-------------------------------------------------|----|-|---  0 [S] COG4275 Uncharacterized conserved protein
--|--|-------------|----------------------------------------------  0 [L] COG5421 Transposase
-----|--|--|------------------------------------------------------  0 [L] COG5558 Transposase