(Cac) Clostridium acetobutylicum Functional categories Fun All J A K L B D Y V T M N Z W U O C G E F H I P Q R S COGs 1,549 133 -  95 95 1 22 -  19 61 90 45 1 -  37 56 74 119 138 60 95 41 73 16 199 209 proteins 3,001 171 -  327 152 1 39 -  113 225 212 117 1 -  43 88 151 279 270 77 133 85 151 53 471 287 Distribution of COGs by number of proteins proteins 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 20 21 25 29 41 COGs 1032 274 101 42 26 26 8 7 4 5 2 1 3 1 1 2 3 3 2 3 2 1

Co-ocurrences in sister taxa No sister genomes in order Clostridiales

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|||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 29 [R] COG0457 FOG: TPR repeat
|-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 29 [K] COG1309 Transcriptional regulator
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 25 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily
|-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 25 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase
|-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---||||||| 25 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators
||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 21 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis
----------------||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 21 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain
|||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 20 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases
||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 20 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
|-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 20 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component
||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 18 [M] COG0438 Glycosyltransferase
|||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||-- 18 [K] COG1846 Transcriptional regulators
------------------------------|----||------||||------------------- 18 [N] COG5492 Bacterial surface proteins containing Ig-like domains
|-||||||||||||||-|||-|----||||||||||||----|||||-||-||--|||-|||||-- 17 [V] COG0842 ABC-type multidrug transport system, permease component
||||----|||||---|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 17 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component
|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 15 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases
||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 14 [K] COG0583 Transcriptional regulator
--||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-|||||||||||||||||| 13 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) 
--|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||-- 13 [G] COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase
--|---------------||-|----|||||-----||----------|------|---||||--- 13 [M] COG3409 Putative peptidoglycan-binding domain-containing protein
|||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 12 [C] COG0778 Nitroreductase
--||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 11 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components
----------------||||-|--|-|||||---||||----|||||-||--|--|---|||||-- 11 [T] COG2199 FOG: GGDEF domain
--|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 10 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators
--|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 10 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases)
|||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|--- 10 [C] COG1145 Ferredoxin
||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||-- 10 [K] COG1733 Predicted transcriptional regulators
--|---------------------------|-|----|---------------------------- 10 [T] COG5585 NAD+--asparagine ADP-ribosyltransferase
|||-----||-|-||-|---||-----||||--|||||----||-||-||--|--|---|||-|-|  9 [R] COG0655 Multimeric flavodoxin WrbA
|-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  9 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  9 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2
--|||||||--||----|||-|--||----|---|||||||--------|-----|----||----  9 [R] COG1277 ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component
||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||--  8 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump
|-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|---  8 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily
||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-|||||||  8 [I] COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase
|-||--|||----|||-|||-|--||-||-|----|||----|||||-|||||--|||||||||--  8 [T] COG0784 FOG: CheY-like receiver
|-|--||||---|-----||-|----|||||-----------|---|--||-|--|---||-||--  8 [R] COG1216 Predicted glycosyltransferases
-----------------|--||----|||-||||||||-|--|||||-|||||--|---|||||--  8 [K] COG1609 Transcriptional regulators
----------------||-|-|--||----|------|----------||-----|---|--|---  8 [T] COG2206 HD-GYP domain
||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  7 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases
||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---|||||||  7 [E] COG0531 Amino acid transporters
|||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  7 [L] COG0582 Integrase
----------------||||--|||--||-|---||||----|||||-||-----||||-------  7 [K] COG1191 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit
----------------||--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---||||---  7 [KG] COG1349 Transcriptional regulators of sugar metabolism
------------------||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||--  7 [TK] COG2197 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain
----||||--||--------------|---||||||||----|||||-|----------||--|--  7 [G] COG2723 Beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/beta-galactosidase
--------------------------|||||---||||----------------------------  7 [S] COG4842 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|----------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  6 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein
|||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  6 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  6 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases
-------------|||--||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  6 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains
|-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  6 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes
|||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  6 [R] COG0517 FOG: CBS domain
|||||||||||||---||||-|-----||-||--|-||-----------|-----|----|-|---  6 [R] COG0535 Predicted Fe-S oxidoreductases
--|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||---  6 [EP] COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components
||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  6 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase
----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-||||||||||||||||||  6 [M] COG0845 Membrane-fusion protein
--|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||---  6 [EP] COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components
|-|-||||||||-||||-||------|---|||-||||----|||||--|-----|---|||||-|  6 [M] COG1215 Glycosyltransferases, probably involved in cell wall biogenesis
--------------------|----||---||||||||-|||||||||||-|---|-------|--  6 [G] COG1263 Phosphotransferase system IIC components, glucose/maltose/N-acetylglucosamine-specific
--------------------|----||---||||||||||||||||||||-|---|-------|--  6 [G] COG1264 Phosphotransferase system IIB components
|-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||--  6 [R] COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||----|||||-||-||--|---||||---  6 [G] COG1653 ABC-type sugar transport system, periplasmic component
-|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-|||||||||||||  6 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins
|-|||||||-|||----|-|||----||||||||||||----|||||-|------|------||--  6 [K] COG1695 Predicted transcriptional regulators
--||||--|--|-||--|-|||----|||-|||-||||-|--|||||-||--|--|---|||||--  6 [C] COG1902 NADH:flavin oxidoreductases, Old Yellow Enzyme family
-----||---|-------||-|----|||-|-||||||----|||||-||--|--|---|||||--  6 [L] COG1961 Site-specific recombinases, DNA invertase Pin homologs
---|--|||-|||-----||-------||-|----|||----|||--------------||-|---  6 [K] COG2002 Regulators of stationary/sporulation gene expression
--------------------|----||---||||||||-|||||||||||||---|-------|--  6 [G] COG2190 Phosphotransferase system IIA components
-----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||--  6 [K] COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins
||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||--  6 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid
------||-----||--|-|----------|-----||--------------|--|----------  6 [G] COG2730 Endoglucanase
------------------||-|----|||-||||||||-----------|-----|---||-||--  6 [T] COG4585 Signal transduction histidine kinase
|||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||--  5 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases
|-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  5 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases
--|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||---  5 [EP] COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component
|||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||--  5 [R] COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases
--|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||--  5 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase
----------------|||-|-----|||||-|||||||||||--||----|----|||-|||-||  5 [G] COG0698 Ribose 5-phosphate isomerase RpiB
|||-----||---||---|||---|-----||||-||-----|||||||||||--||||-------  5 [C] COG0716 Flavodoxins
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  5 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component
------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||--  5 [M] COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins)
--|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||||  5 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain
|||-|||||||||----|||||-----||-||-----|----|||-|-||------------|---  5 [C] COG1032 Fe-S oxidoreductase
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  5 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component
----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||--  5 [N] COG1344 Flagellin and related hook-associated proteins
-----------------|||------|||||-----||----|||-|-||---|||---||||---  5 [S] COG1376 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||||---||----------|-|--------||||||||-----------|-------------|--  5 [K] COG1476 Predicted transcriptional regulators
|--------------------|----||||||||||||----------------------------  5 [S] COG1511 Predicted membrane protein
-----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||--  5 [K] COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog
-------------------|-||||||||||||||||||---|||||-||||||||||||||||||  5 [D] COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins
----------||-||---||-|||--|||||------|--------------|-------------  5 [T] COG1716 FOG: FHA domain
---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||--  5 [KG] COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase
-------------------|||--------||-|--||----|||-|-------------|-----  5 [S] COG2323 Predicted membrane protein
--------------------|-----|---||||||||----|||||-------------------  5 [K] COG3711 Transcriptional antiterminator
------------------------------|-----|----------------------||||---  5 [G] COG4124 Beta-mannanase
--|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||---  5 [E] COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component
--|----------|||---|----------|-|--|------|||||--|-----|----------  5 [S] COG4886 Leucine-rich repeat (LRR) protein
------------------------------|---|-||----------------------------  5 [M] COG5577 Spore coat protein
||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-|  4 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)
|-||------||-||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  4 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain
|||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||--  4 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs
||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  4 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning
|||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||  4 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases
|||||||||||||||--|||-|----||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||--  4 [G] COG0524 Sugar kinases, ribokinase family
|------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||  4 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit
-||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||--  4 [P] COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component
-------------|||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  4 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase
||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  4 [R] COG0628 Predicted permease
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein
-------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||--  4 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases
|-||||||-|||-||-||||-|----|---||||||||----|||||-||-|---|||||||||--  4 [R] COG0673 Predicted dehydrogenases and related proteins
-||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||--  4 [R] COG0693 Putative intracellular protease/amidase
--||--|||--------|||----||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||--  4 [NT] COG0835 Chemotaxis signal transduction protein
|||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||--  4 [C] COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit
--||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||--  4 [R] COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily
||||--|||||||----|||||--|-||||||||||||||||-||-|-|-|----|---|||----  4 [P] COG1122 ABC-type cobalt transport system, ATPase component
|||----|||-------|--|---------|-----------|||||-------------------  4 [C] COG1151 6Fe-6S prismane cluster-containing protein
||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||--  4 [R] COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III
---------|-------|--|-||-|----||||||||||||------|----------|||----  4 [S] COG1284 Uncharacterized conserved protein
-----------------|--||----|||-||||||||||||-------|----------------  4 [S] COG1307 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||--  4 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase
--||--------------||-|--|-|||-||---|||----|||||--|-|-------||-||||  4 [S] COG1357 Uncharacterized low-complexity proteins
||||--|||||-|----|-|||--------||||||||||--|||-|--|----------|-----  4 [G] COG1363 Cellulase M and related proteins
-----------------|------------|||-|||-----|||-|-||||-||-|||||-|---  4 [M] COG1368 Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily
|-|||||||--||||-||--|-----|---||-|||||----|||||-||-|---|---||||---  4 [C] COG1454 Alcohol dehydrogenase, class IV
|||||||||||||--------|----|||-|-----||----|||||-||||-|||---|||||--  4 [K] COG1522 Transcriptional regulators
|||----|||-|-----|-||---------|-----|---------------------|-------  4 [C] COG1592 Rubrerythrin
--------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---|||||||  4 [M] COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase
-----------------|--------|---||||||||-|--|||||-||||-|||---|||||--  4 [K] COG1737 Transcriptional regulators
|||------|---|----|--|-----||||-----|------||||-||------------|---  4 [GC] COG1819 Glycosyl transferases, related to UDP-glucuronosyltransferase
---|--|||-|-|||-|--|------|||-|||-||||----|||||-||-----|------||--  4 [H] COG1893 Ketopantoate reductase
----||-----|-||----|||----||||||-|||||----|||||--|||||||---||||---  4 [P] COG1914 Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family
----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||||  4 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator
-------------------|-|----|||-||||||||||--|||||-||-----|---|||||--  4 [K] COG2188 Transcriptional regulators
----------------|-||-|---||||||----|||----|||||-||--|--|---|||||||  4 [T] COG2200 FOG: EAL domain
------------------|||---------||----|-----|||||----------------|--  4 [G] COG2211 Na+/melibiose symporter and related transporters
------------------------|-----|-------------------------|||-------  4 [S] COG2604 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|||------|--------|||---------|-----------------------------|-|---  4 [C] COG2710 Nitrogenase molybdenum-iron protein, alpha and beta chains
------------------------------||||--------|||-------|------||||---  4 [M] COG3757 Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)
--------------------|-----|---||--|-------------------------------  4 [S] COG5438 Predicted multitransmembrane protein
||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||-------------  3 [J] COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases
||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--||||||||  3 [P] COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters
|||||||||||||||-||||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|||||||||--  3 [HE] COG0111 Phosphoglycerate dehydrogenase and related dehydrogenases
||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  3 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase
-------------|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [F] COG0194 Guanylate kinase
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases
--||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---|||||||  3 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family)
--|----|---|-|||---||-----||||||||||||-----------|-|---|---||-||--  3 [R] COG0300 Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities
-------------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  3 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase
----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  3 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III
|||-----||------||||-|----|||-||---||-----|||||-||||||||---|||||--  3 [E] COG0347 Nitrogen regulatory protein PII
--|-||----|--||--|||-|----|||-||||||||-|--|||||-||-----|---||-||--  3 [G] COG0366 Glycosidases
-------------|||--|-|-----|---|||||||||---|||||--|--||||-------|--  3 [O] COG0386 Glutathione peroxidase
|-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||--  3 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||-|||-||||||||-||-||--|---||||---  3 [G] COG0395 ABC-type sugar transport system, permease component
||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||--  3 [M] COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis
--|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||--  3 [G] COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase
|||---|||-------|||||---------|-----------|||-|--|-----|----------  3 [C] COG0426 Uncharacterized flavoproteins
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [O] COG0443 Molecular chaperone
||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||--  3 [R] COG0456 Acetyltransferases
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases)
||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [O] COG0492 Thioredoxin reductase
||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||---  3 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins
---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|---  3 [RTKL] COG0515 Serine/threonine protein kinase
||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  3 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase
|-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||--  3 [E] COG0520 Selenocysteine lyase
|||||||||||||---|--|-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||--  3 [H] COG0521 Molybdopterin biosynthesis enzymes
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins
|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins
|||-||||||-|-||-||--|---|-|||-||-|-|||----|||||-||---|||---|----||  3 [HC] COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [L] COG0550 Topoisomerase IA
--||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|-----  3 [KL] COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family
|-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  3 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase
-------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific
|||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--||||||||||||||  3 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase
-||-----||-------|||||||--|---|--||-||----||||---|||---|---|||||--  3 [P] COG0600 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component
||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-||||||||||||||||||  3 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease
----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--|||||||||||  3 [R] COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases
-||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||--  3 [P] COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component
||||--||||-||----|||||----||||||||||||||||-||-|---|--------|||----  3 [P] COG0619 ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters
|||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----||||||||||||||||||||||||  3 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase
--||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  3 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases
-----|-------||-|-||-|||--||||||||||||||||-------|--|--||--|--|---  3 [T] COG0631 Serine/threonine protein phosphatase
|||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||--  3 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators
|||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||-------  3 [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit
-||-----||---||--|||||||--|---|--||-||----||||--||||---|---|||||--  3 [P] COG0715 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components
--|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||--  3 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  3 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases
--|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||---  3 [E] COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  3 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  3 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein
-----------------|---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3 [K] COG0782 Transcription elongation factor
|||------|-|----|--|||--------||||||||----|||||-||||-|||||||||----  3 [O] COG0826 Collagenase and related proteases
--||--|||-------||||-|--------|-----------|||||-||--|---||-|||||-|  3 [M] COG0836 Mannose-1-phosphate guanylyltransferase
||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||--  3 [R] COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily)
||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-|  3 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases
|||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||-------  3 [C] COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit
---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---|||||||  3 [I] COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase
----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||--  3 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases
||||||||||-------|------|-----|-----||----|||||-||||--------------  3 [O] COG1067 Predicted ATP-dependent protease
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  3 [G] COG1109 Phosphomannomutase
-||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||--  3 [P] COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component
-||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||--  3 [PH] COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components
--------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|-----|||-||||---  3 [E] COG1174 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, permease component
---|||||--|||----|||-|--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|---||||---  3 [G] COG1175 ABC-type sugar transport systems, permease components
||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--||||||||||||||  3 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning
|-||--|||--------||||||-|-|---||||||||---------------------||||-||  3 [R] COG1268 Uncharacterized conserved protein
-----------------|||-|--||||||||||||||----------------------------  3 [K] COG1316 Transcriptional regulator
--||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|---  3 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases
|-|---|||||-|||-|-||--||--||||||--|||-----|||||-||||---|---|||||--  3 [R] COG1409 Predicted phosphohydrolases
||||||||||------||--||--||----|||||||||-|||||-|---------|||||-----  3 [R] COG1418 Predicted HD superfamily hydrolase
--||||||---|-----|||||----|||-||-|||||----|||----|||---|--||||||--  3 [R] COG1473 Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase
----||----||-||--|-|----------||-|-|-|----|||||--------|---|---|--  3 [G] COG1501 Alpha-glucosidases, family 31 of glycosyl hydrolases
----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-|||||||  3 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes
-||-|-|||||||----||-|------||-|-----||-----------|-----|---|||||-|  3 [L] COG1533 DNA repair photolyase
-------------||--|--------|---|-|||-||-----||---|--|---|---|------  3 [G] COG1621 Beta-fructosidases (levanase/invertase)
|||----|||-------||--|--------||--||------|||||-||--|--|-||----|--  3 [P] COG1918 Fe2+ transport system protein A
|||-----||------||--|---------||---|------|||---------------------  3 [I] COG1924 Activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase (HSP70-class ATPase domain)
|-|-----------------|-----|---|-----||----|||||--|--|||---|-------  3 [S] COG1971 Predicted membrane protein
-----------------|-||---------|----|||----|||||-|--|--------------  3 [C] COG1979 Uncharacterized oxidoreductases, Fe-dependent alcohol dehydrogenase family
|-||||-|||-||----||--|--------|||----------------|------------||--  3 [S] COG2013 Uncharacterized conserved protein
----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||--  3 [G] COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes
---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||--  3 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis
----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||--  3 [NU] COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG
---------------------|----||||||||-|||-----------|---------|------  3 [TQ] COG2508 Regulator of polyketide synthase expression
--||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||----  3 [P] COG2608 Copper chaperone
-----------|-||---||-------|||||||-|||----|||||-||-|-|||--||||||--  3 [E] COG2755 Lysophospholipase L1 and related esterases
--|----------------|----------|---|-|-----------||----------------  3 [E] COG3227 Zinc metalloprotease (elastase)
--------------------|---------||||||||----|||||-||--|--|---|||||--  3 [KT] COG3279 Response regulator of the LytR/AlgR family
-|-------|----------|---------||||||||----------------------|-----  3 [R] COG3481 Predicted HD-superfamily hydrolase
------------------------------||----||----|-----------------|--|--  3 [G] COG3507 Beta-xylosidase
-----------------|---|--------||---|||----------------------------  3 [S] COG3584 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|-----||---------------------|||||--  3 [M] COG3773 Cell wall hydrolyses involved in spore germination
------------------------------||||-|||----------------------------  3 [S] COG3883 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------||----|---||||---|----------|--|----------|---  3 [R] COG3981 Predicted acetyltransferase
-----------------|--|-|||||||-||-||||-||--|||||-||||---|||-||||---  3 [E] COG4166 ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component
------------------------------||--|--|----------------------------  3 [S] COG4495 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------|---||-|-|-|----------------------------  3 [V] COG4767 Glycopeptide antibiotics resistance protein
--|------------------------||-|----|------------------------------  3 [R] COG4908 Uncharacterized protein containing a NRPS condensation (elongation) domain
-------|-|--------------------|-----------------------------------  3 [S] COG5617 Predicted integral membrane protein
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase
||-||||||||--|--|||-------|||-|--||-||----------------------------  2 [S] COG0011 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase
-------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  2 [G] COG0021 Transketolase
|||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  2 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase]
--||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [E] COG0031 Cysteine synthase
||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--||||||||  2 [C] COG0039 Malate/lactate dehydrogenases
||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase
-||---||--||-|--|-||||||--|||-||||--||----|||||-||||-------||-|---  2 [G] COG0058 Glucan phosphorylase
||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---|||||||||||||  2 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog)
|||---||||------|-||----------|-----------|||-|---------|||-------  2 [O] COG0068 Hydrogenase maturation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG0073 EMAP domain
||||||||||||||--||||-|--------||--|-||--------|-||------||-||-||--  2 [E] COG0075 Serine-pyruvate aminotransferase/archaeal aspartate aminotransferase
|||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  2 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase
|||---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0084 Mg-dependent DNase
|||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase
--||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  2 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful)
||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---|||||||||||||  2 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases
--||||||--|||||----|-|----|||||---|-||----|||||-|||----|---||||---  2 [E] COG0160 4-aminobutyrate aminotransferase and related aminotransferases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||--  2 [H] COG0171 NAD synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase
-||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||--  2 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit
||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-|||||||  2 [I] COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit
-------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||--  2 [G] COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase
-------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase
|-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  2 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12
-|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase
-------------|---|--------|---||-||-||-||-||||||||-|---|---|||||--  2 [G] COG0246 Mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenases
---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family
--|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-|  2 [H] COG0262 Dihydrofolate reductase
||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||--  2 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II)
--||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-|||||||||  2 [C] COG0280 Phosphotransacetylase
--|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--||||||||  2 [C] COG0281 Malic enzyme
---|------|-|||--|---|---|-||||||||||||||||||||-|-||-------||-||--  2 [F] COG0295 Cytidine deaminase
|||||||||||||---|-||-|----|||||---||||----|||||-||||---|||||||||--  2 [H] COG0303 Molybdopterin biosynthesis enzyme
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0305 Replicative DNA helicase
||||----||--------||----------|----|----------|---|----------|----  2 [P] COG0310 ABC-type Co2+ transport system, permease component
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex
|||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase
||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase
--|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type)
|||||||||||-||||----------||||||---|||----|||||-||--|-------|-|---  2 [E] COG0367 Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)
|||---|||||-----||||-|--------||--||------|||||-||--|--||||----|--  2 [P] COG0370 Fe2+ transport system protein B
||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----||  2 [M] COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase
|||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-|||||||||||||||  2 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases
|-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||--  2 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase
--||---------||---||------|||-||||||||----|||---|-----------|--|--  2 [S] COG0398 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase
-----------------|||||||--||||||-|--||----|||||-|-||-------||-|---  2 [G] COG0448 ADP-glucose pyrophosphorylase
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  2 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|  2 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase
--|----------||-||--||||||----|-----||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type
-|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||--  2 [G] COG0469 Pyruvate kinase
||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-||  2 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase
|||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||||  2 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase
|||-|--------||||-|||-----||||||||-||||||||||||--|----------|||---  2 [P] COG0474 Cation transport ATPase
--|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||||  2 [ER] COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases
|||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||--  2 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes
-|-----------||----|-|||-|-||-||||||||-|--|||||||||||||---|||||---  2 [L] COG0507 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member
|||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  2 [E] COG0527 Aspartokinases
|||||||||-|||||||-||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases
-------------||-||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG0539 Ribosomal protein S1
|-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||--  2 [R] COG0546 Predicted phosphatases
|||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||-------  2 [L] COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I
|||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||--  2 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase
--||--|||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases
--------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [J] COG0566 rRNA methylases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)
----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||--  2 [R] COG0579 Predicted dehydrogenase
|-------|--|-|||-||-||---|----||||||||-|||||||||-||||--|---|||||--  2 [G] COG0580 Glycerol uptake facilitator and related permeases (Major Intrinsic Protein Family)
---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||--  2 [C] COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit
-||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-|  2 [P] COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters
||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes
|-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-||||  2 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase
||||--|||||||||--|--|---|----|||||||||-||||||||-||----------------  2 [R] COG0622 Predicted phosphoesterase
----------------|||||||||||||-|||||||||---||||||||||||||||||||||||  2 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases
|||-----|--|-----|||----------|-----------|||||---||--------|-----  2 [R] COG0641 Arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)
--||--|||--------|||-|--||----|----|||----|||||-||--|--||||||-||--  2 [NT] COG0643 Chemotaxis protein histidine kinase and related kinases
-----------------|||||----|||||---||||----|||||-||-----|---|||||--  2 [E] COG0646 Methionine synthase I (cobalamin-dependent), methyltransferase domain
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)
----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-||||  2 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat
||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--||||||||  2 [R] COG0679 Predicted permeases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  2 [U] COG0681 Signal peptidase I
||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-||  2 [I] COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase
--|------|-|----||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase
|||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||--  2 [O] COG0719 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component
||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---|||||||||||||  2 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit
|--|----|----||-|||--|--|-|---|||-||||-|--|||||-|-||---|||-||-|---  2 [F] COG0737 5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases
----------------||||----||----||||-|||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains)
-----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2 [M] COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1
-------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-|||||||  2 [F] COG0756 dUTPase
-------------|||||||||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase
--------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG0787 Alanine racemase
-----------------|||----|-----||||--||----|||||-||||||||||-|||||--  2 [G] COG0800 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase
|-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-||  2 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin
----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||--  2 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme
--||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||  2 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation
|-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||--  2 [R] COG0824 Predicted thioesterase
-------------||---------------||--|||-----|||||--|-----|||--------  2 [E] COG0833 Amino acid transporters
---------|------||--||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  2 [D] COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division
------------------||-|----|||-|---||||----||||||||||||||||||||||||  2 [P] COG0861 Membrane protein TerC, possibly involved in tellurium resistance
-|||||----|----------|---||---|-----|-|----||-|---|---|-|||----|--  2 [V] COG1002 Type II restriction enzyme, methylase subunits
-------------||------|||||----|-----------------------------------  2 [R] COG1026 Predicted Zn-dependent peptidases, insulinase-like
----||-----------|-|------|---|-----||----|||||-||||-||-||||-|----  2 [E] COG1027 Aspartate ammonia-lyase
-------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||--  2 [H] COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase
||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||-------  2 [HR] COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes
--------|---|||--|||----|||||-||-|||||----|||||--|||---|---||||---  2 [G] COG1070 Sugar (pentulose and hexulose) kinases
|---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----|||  2 [D] COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis
|||---||||-|-----|||------|||||-|-||||----|||||--|-----|---|||||--  2 [G] COG1082 Sugar phosphate isomerases/epimerases
|------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||--  2 [M] COG1087 UDP-glucose 4-epimerase
|-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-||||  2 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase
--|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-|||||||||||||  2 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes
-----------------|--||---||||-||||||||--|||||||-||||---|----------  2 [G] COG1105 Fructose-1-phosphate kinase and related fructose-6-phosphate kinase (PfkB)
--------------------------|||||||-||||----|||||--|---------|-|----  2 [E] COG1113 Gamma-aminobutyrate permease and related permeases
--------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|------||-||||---  2 [E] COG1125 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, ATPase components
----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||--  2 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG1160 Predicted GTPases
----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||--  2 [KE] COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs
|||-|||||||||---||--|------||-||||||------|||||-||||---|----------  2 [O] COG1180 Pyruvate-formate lyase-activating enzyme
--|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes
-------------------|----------||--||||-||||||||--||----|---||-|---  2 [I] COG1182 Acyl carrier protein phosphodiesterase
||||----||---||-----|-||-|-||||-----||-----------|--|||||||||||-||  2 [I] COG1183 Phosphatidylserine synthase
-------------||-|||||||||||||||||-||||----||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG1186 Protein chain release factor B
----------------||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  2 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases
|-||--||--------||||||---|----||||||||------------------|||-------  2 [L] COG1193 Mismatch repair ATPase (MutS family)
|||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||--  2 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon)
|||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||--  2 [M] COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase
|--||||-|--|-|---|--||-----||-|-|-|-||-------||-||-----|---|||||--  2 [Q] COG1228 Imidazolonepropionase and related amidohydrolases
---|||--|-|||-------||-----||||---|-||----|||||-||-----|---|||||||  2 [I] COG1250 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase
--||---------||-|||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||||||||||||  2 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains
-------------|||----||--|||||-||||||||----|||||-||--|||----|||||--  2 [R] COG1272 Predicted membrane protein, hemolysin III homolog
---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---|||||||  2 [K] COG1278 Cold shock proteins
----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||--  2 [N] COG1291 Flagellar motor component
--|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  2 [S] COG1295 Predicted membrane protein
-----------------|--||||------||||||||----------------------------  2 [S] COG1302 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|||||||||||||----|---||||-||||||||||||----|||-|-----|---------|---  2 [K] COG1321 Mn-dependent transcriptional regulator
|||---||-|-------|--|---------||||||------|||||-||||---|----------  2 [F] COG1328 Oxygen-sensitive ribonucleoside-triphosphate reductase
--||--|||--------|-|----||----|----|||----|||||-||-----|--|||-||--  2 [NT] COG1352 Methylase of chemotaxis methyl-accepting proteins
||||||||||||||||-|--|---------||||||||----------------------------  2 [J] COG1358 Ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a)
----------------||------||----|----|||----|||||-||-----|||||||||--  2 [N] COG1360 Flagellar motor protein
-------------||--|--|----||||||------------------|----------------  2 [E] COG1362 Aspartyl aminopeptidase
|||-----||---||-||||-|----||||||--||||-----------|---|||---|||||--  2 [E] COG1364 N-acetylglutamate synthase (N-acetylornithine aminotransferase)
|||-||||||---||-||--||-----||-||--||||----|||||-|-----------|-----  2 [ER] COG1387 Histidinol phosphatase and related hydrolases of the PHP family
----------------|----|||-||||-||--||||-------|--||||--------------  2 [M] COG1388 FOG: LysM repeat
|-|-------|-----|--|-|||--||||||---|||----|------------||||-|-|---  2 [R] COG1408 Predicted phosphohydrolases
----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---|||||||  2 [S] COG1434 Uncharacterized conserved protein
-------------------------|----||||||||----|||||-|-----------------  2 [G] COG1447 Phosphotransferase system cellobiose-specific component IIA
|-|--------------|||----------|-----------------------------------  2 [R] COG1453 Predicted oxidoreductases of the aldo/keto reductase family
-------------------------|----||||||||----|||||-|-----------------  2 [G] COG1455 Phosphotransferase system cellobiose-specific component IIC
-----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---|||||||  2 [G] COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases
||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--||||||||||||||  2 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators
--|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||--  2 [H] COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis
--|-------------|----------||-|||||||||---||||||-------|---||-|---  2 [L] COG1484 DNA replication protein
-----------------|------------|----|||----|||||-|----------||-|---  2 [G] COG1486 Alpha-galactosidases/6-phospho-beta-glucosidases, family 4 of glycosyl hydrolases
--|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||---  2 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase
--|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--|||||||||||||  2 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase
----||------------||||--|-----||-|-|||-|--|||-|-||---|||--------||  2 [V] COG1619 Uncharacterized proteins, homologs of microcin C7 resistance protein MccF
|-|---||---|----||------------|-----||---------------------||||---  2 [S] COG1633 Uncharacterized conserved protein
--|---||--|-|-----||-|----||||||||||||----|||||--|--|--|---|||||||  2 [V] COG1680 Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins
-----------------||-||--|-----||||||||||||------------------------  2 [H] COG1713 Predicted HD superfamily hydrolase involved in NAD metabolism
----|------|-----|||------|||-|-||||||----------------------------  2 [K] COG1725 Predicted transcriptional regulators
---|----|----------|||-----||-|||||||-----|||-|--|-----|||-||||---  2 [M] COG1732 Periplasmic glycine betaine/choline-binding (lipo)protein of an ABC-type transport system (osmoprotectant binding protein)
---|--||----|-------|----|----|---|-||-------||-|-||-||-|||-------  2 [C] COG1757 Na+/H+ antiporter
--------------------||----||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||--  2 [E] COG1760 L-serine deaminase
--------------------|-|||||---||||||||-||||||||-||||-|||---|||||--  2 [GT] COG1762 Phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain (Ntr-type)
--||--|||--------|------|-----|----|||----------|-------|||-------  2 [NT] COG1776 Chemotaxis protein CheC, inhibitor of MCP methylation
------|||-------|-|||---------|-----|-----|||||--|--||||---|||||--  2 [M] COG1807 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family
||||||||||--------------------|-----||----------------------------  2 [S] COG1873 Uncharacterized conserved protein
--|--------------|--|---|-|--|||----||----|||||-||||---|---|||||--  2 [G] COG1879 ABC-type sugar transport system, periplasmic component
-|||||--|-|-------------------|-----|------------------|----------  2 [P] COG1910 Periplasmic molybdate-binding protein/domain
--------------------|||||||---||||||||||||||||||||||||||---|||||--  2 [G] COG1925 Phosphotransferase system, HPr-related proteins
------------------||-|----||||||--||||----|||-|--|-----|--|||-----  2 [S] COG1937 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||--  2 [V] COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein
-----------------|||-|----||||||--||||----|||||-|||||--|---|||||--  2 [KT] COG1974 SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidases)
------------------|||------||||--|||||----|||||-||||---|----|-----  2 [E] COG1982 Arginine/lysine/ornithine decarboxylases
|||---||||--|-----------------|---||||----|||||--|-|--------------  2 [R] COG1988 Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolases
||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||--  2 [R] COG1994 Zn-dependent proteases
---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||--  2 [C] COG2025 Electron transfer flavoprotein, alpha subunit
--------|----|--||-|||----|||-||||||||-----------|--||||||||||-|--  2 [R] COG2070 Dioxygenases related to 2-nitropropane dioxygenase
------------------||----------||||||||----|||||-||||---|---|||-|--  2 [R] COG2081 Predicted flavoproteins
---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||--  2 [C] COG2086 Electron transfer flavoprotein, beta subunit
-------------||---||----------|---|-||----|||-|---|||--|----------  2 [H] COG2091 Phosphopantetheinyl transferase
-----------------|------------|-----||----|||||-------------|-----  2 [G] COG2160 L-arabinose isomerase
-------------------|||----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||--  2 [D] COG2177 Cell division protein
---------------------|----|||||----|||----|||||-||||-|||---|||||--  2 [K] COG2186 Transcriptional regulators
|-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||--  2 [P] COG2217 Cation transport ATPase
-------|------|--|--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---|||----  2 [F] COG2233 Xanthine/uracil permeases
|-||--||||---||-|--|-------||-|-----||----|||-|-||--|----------|--  2 [R] COG2234 Predicted aminopeptidases
-|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|--  2 [R] COG2252 Permeases
-------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||--  2 [L] COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase
------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||--  2 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase
-------------||-|---------|||||----|||---------------------|||||--  2 [R] COG2270 Permeases of the major facilitator superfamily
------------------|--|--------|-----|------|||--------------------  2 [T] COG2310 Uncharacterized proteins involved in stress response, homologs of TerZ and putative cAMP-binding protein CABP1
---|---------------|-|--------||||||||----|||||-||||||||----------  2 [R] COG2333 Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)
-------------------|-|-----||-|---||||----|||-------|||----|||---|  2 [T] COG2337 Growth inhibitor
--------------------||----|||-||||||||----------------------------  2 [S] COG2357 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------|---|--------|-----||----------------------------  2 [S] COG2359 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------||||--------|-----||----------------------------  2 [D] COG2385 Sporulation protein and related proteins
----||----|||--------|----|||||---|||-----------------------------  2 [R] COG2409 Predicted drug exporters of the RND superfamily
--|---||||||-----||-|---------||-----|----------|--------------|--  2 [R] COG2509 Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases
--|-----------------|-----|---|-|-|-||----|||||-||||-|||----------  2 [GE] COG2610 H+/gluconate symporter and related permeases
-------------------|-|--|-----|-----------|||||--|-|---|--||||-|--  2 [S] COG2717 Predicted membrane protein
--------------------------|||-|-----------|||-|-----|---------|---  2 [S] COG2733 Predicted membrane protein
-------------------|------|||-||--||-|----|||-|--|-----|----|-||--  2 [S] COG2764 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits
--|----------||------|----|||-|-----------|||||-||||-------|||||--  2 [L] COG2816 NTP pyrophosphohydrolases containing a Zn-finger, probably nucleic-acid-binding
--||---------||--|---|----|||-||---|-|-----------|-|---|--|||||---  2 [E] COG2873 O-acetylhomoserine sulfhydrylase
--------------------|---------||||-||-----|||||----|||||---|||||--  2 [G] COG2893 Phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA
--------------------|---------|-||||||----------||--|--|----------  2 [T] COG2972 Predicted signal transduction protein with a C-terminal ATPase domain
--|---------------------------|----||-----|||||--|-----|------|---  2 [M] COG3209 Rhs family protein
-------------||--|------------|------|----------------------------  2 [R] COG3341 Predicted double-stranded RNA/RNA-DNA hybrid binding protein
--|-|------|-------|-|--||-||-|-----||----|||-|--|-----|----|-|---  2 [S] COG3391 Uncharacterized conserved protein
-----------------|---|--------|----||-----------------------------  2 [C] COG3426 Butyrate kinase
--------------------|---------||||-||-----|||||----|--------------  2 [G] COG3444 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB
-|-----------------|----------|-----|------------|-----|------|---  2 [R] COG3541 Predicted nucleotidyltransferase
----------|--------|----------|-----||-----||-|--|----------------  2 [P] COG3546 Mn-containing catalase
----------------||--|---------||---|------------------------------  2 [S] COG3580 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------||--|---------||---|------------------------------  2 [S] COG3581 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|---------------------------|---|||------------|--|---------|---  2 [G] COG3594 Fucose 4-O-acetylase and related acetyltransferases
-------------------|------|---|-||-|||-----------|-------------|--  2 [K] COG3655 Predicted transcriptional regulator
--|----------------||---------|-|||--|-----------|---------||--|--  2 [L] COG3666 Transposase and inactivated derivatives
--||--||---|------|-----------|-----------|||||--------|----------  2 [L] COG3677 Transposase and inactivated derivatives
-----------------|-|----------|------|---------------------|---|--  2 [G] COG3693 Beta-1,4-xylanase
--------------------|---------|---||||-----------|-|-------||-|---  2 [S] COG3708 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------||||-||-----|||||----|--------------  2 [G] COG3715 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC
--------------------|---------||||-||-----|||||----|--------------  2 [G] COG3716 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IID
----------------|-------------|----|||----|||-|--|-----|----------  2 [KT] COG3829 Transcriptional regulator containing PAS, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains
--|------------------|--------|||-||||----------------------------  2 [P] COG3853 Uncharacterized protein involved in tellurite resistance
------------------------------|-----||--------------|-------------  2 [R] COG3858 Predicted glycosyl hydrolase
-------------------|-|--------|-----|-----------------------------  2 [S] COG3861 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------|---------|--|---------|-----------------------------------  2 [S] COG3862 Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs
|-|---------------------------|-----||----------------------------  2 [S] COG3874 Uncharacterized conserved protein
---------------------------||-|-----||----------------------------  2 [S] COG3879 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|------|--------------------|-|-----  2 [Q] COG3882 Predicted enzyme involved in methoxymalonyl-ACP biosynthesis
--------------------------|---|--||-||----------------------------  2 [M] COG3944 Capsular polysaccharide biosynthesis protein
----------|||-----------------|-----------------|-----------------  2 [S] COG3945 Uncharacterized conserved protein
---------------------|--------|------|----------------------------  2 [T] COG3947 Response regulator containing CheY-like receiver and SARP domains
---------------------------||-||--|-|-----------------------------  2 [R] COG3953 SLT domain proteins
------------------------------|--|----------------|---------------  2 [M] COG3955 Exopolysaccharide biosynthesis protein
---------------------|----|---|-----|-----------------------------  2 [R] COG3973 Superfamily I DNA and RNA helicases
------------------------|-----|-------------------------------|---  2 [S] COG3976 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------|||-|-||||||---------------------|-|----  2 [S] COG4129 Predicted membrane protein
------------------------------|--||-||----------------------------  2 [GM] COG4464 Capsular polysaccharide biosynthesis protein
-------------|||-|------------|-----------------------------------  2 [R] COG4624 Iron only hydrogenase large subunit, C-terminal domain
------------------------------||----|-----------------------------  2 [G] COG4632 Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase
------------------------------|---|-|-----------------------------  2 [S] COG4640 Predicted membrane protein
------------------------------|-----||----------------------|-----  2 [S] COG4641 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------|--------|--------------|-------------|--|---  2 [L] COG4644 Transposase and inactivated derivatives, TnpA family
------------------------------||||--------------------------------  2 [S] COG4684 Predicted membrane protein
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  2 [N] COG4786 Flagellar basal body rod protein
--------------------|---------|----|----------|-------------------  2 [H] COG4822 Cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase
--|---------------|--|--------|-----------------------------------  2 [V] COG4845 Chloramphenicol O-acetyltransferase
-------------||---|-----------|-|---------------------------------  2 [D] COG5279 Uncharacterized protein involved in cytokinesis, contains TGc (transglutaminase/protease-like) domain
-------------|---|------------|------------------------|---|---|--  2 [M] COG5434 Endopolygalacturonase
------------------------------|-----|---------|----------------|--  2 [M] COG5520 O-Glycosyl hydrolase
------------------------------||||-|------------------------------  2 [S] COG5523 Predicted integral membrane protein
------------------------------|----------------------------|--|---  2 [S] COG5620 Uncharacterized conserved protein
||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||--  1 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||--  1 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase
|||-||--||-|-||-||||-|----|||-||--|||||---|||||--|--||||---|||||--  1 [P] COG0004 Ammonia permease
|||||||||||||||-||||-------||||-||-|||----|--||--|--|------||-|---  1 [F] COG0005 Purine nucleoside phosphorylase
||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||--  1 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---|||||||  1 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5)
|||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||---  1 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase
--|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||--  1 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase
|||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase
---|--||---|----|-|||------||||----|||----|||||-||--||||---||-||--  1 [H] COG0029 Aspartate oxidase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase
|--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||--  1 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase
-|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control
-|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||--  1 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||--  1 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||--  1 [F] COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0048 Ribosomal protein S12
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0049 Ribosomal protein S7
---------|---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0051 Ribosomal protein S10
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase
|||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [G] COG0061 Predicted sugar kinase
|||||||||||||||-||||-|----|||||-----------|||||-||--|--|||||||||--  1 [S] COG0062 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||--  1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase
||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit
|||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit
|||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||--  1 [E] COG0067 Glutamate synthase domain 1
|||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||--  1 [E] COG0069 Glutamate synthase domain 2
|||-----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||--  1 [E] COG0070 Glutamate synthase domain 3
|||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---|||||||  1 [O] COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit
||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||--  1 [E] COG0077 Prephenate dehydratase
|||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0082 Chorismate synthase
-|-|||||-||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||||-|||---|||-------  1 [E] COG0083 Homoserine kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11
|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase
|||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase
-|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||----------  1 [L] COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase
-------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase
||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||--  1 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase
|-||--|||---||||--|--|-----||-|-----||-|--|||||-||--|--|---|||||--  1 [L] COG0122 3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--||||||||  1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase
-|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||--  1 [H] COG0132 Dethiobiotin synthetase
||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase
||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase
||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase
||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase
-|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0148 Enolase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||||  1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase
------|---|--||--|--|---|-|||-||-|--||----|||||-|-||--------------  1 [G] COG0153 Galactokinase
--------|-||-||-|-||-|----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||--  1 [P] COG0155 Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)
||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||--  1 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain
-|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase
||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0164 Ribonuclease HII
||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase
-|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase
-|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||--  1 [G] COG0176 Transaldolase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-|||||||||||||||  1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17
--||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||  1 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase
-------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0195 Transcription elongation factor
-------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0196 FAD synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY
||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0203 Ribosomal protein L17
-------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|---  1 [G] COG0205 6-phosphofructokinase
||||||||||------||||||--||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [D] COG0206 Cell division GTPase
|||-----||---|||----||----||||||||||||-|||||||||||||||||---|||||--  1 [F] COG0207 Thymidylate synthase
---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-|||  1 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0211 Ribosomal protein L27
|--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-||||||||||||||||||  1 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase
-||---|||--------|---|-----||-||-||||||||||||-|-|------|---||-|---  1 [F] COG0213 Thymidine phosphorylase
|||||||||||||||--|--||----|||||--|||||------------||--------------  1 [H] COG0214 Pyridoxine biosynthesis enzyme
--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0216 Protein chain release factor A
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein
-|||--||||---|--||--|---------||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0218 Predicted GTPase
------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||--  1 [J] COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class)
-------------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase
|-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-|||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit
|-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||--  1 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG0226 ABC-type phosphate transport system, periplasmic component
-------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0227 Ribosomal protein L28
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0228 Ribosomal protein S16
|-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||--  1 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0230 Ribosomal protein L34
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0233 Ribosome recycling factor
--|----------||-||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10)
||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--||||||  1 [G] COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0238 Ribosomal protein S18
|-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase
-|--||-------|||--|-|------||-|-----------|||||||||||||||||---||--  1 [E] COG0241 Histidinol phosphatase and related phosphatases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10
----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||--  1 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase
--|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-||||||||||||||||||  1 [FP] COG0248 Exopolyphosphatase
|||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0250 Transcription antiterminator
|||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|----  1 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D
||------||------|||||-||--|||||---||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0254 Ribosomal protein L31
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0257 Ribosomal protein L36
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0261 Ribosomal protein L21
--|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||--  1 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0267 Ribosomal protein L33
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0268 Ribosomal protein S20
|||---|||||||-----------------|-|||-|--||-|||-|-|-||--------------  1 [G] COG0269 3-hexulose-6-phosphate synthase and related proteins
|--|||----|-|---||||-|--|-|||||||||||||||||||||-|-||-------||-|---  1 [F] COG0274 Deoxyribose-phosphate aldolase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis
--||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||--  1 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases
-|--||----------|-|-|------||-|-----------||||||||||-||-|||---|---  1 [G] COG0279 Phosphoheptose isomerase
--|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-||  1 [C] COG0282 Acetate kinase
---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---|||||||  1 [F] COG0283 Cytidylate kinase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase
||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase
|--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG0288 Carbonic anhydrase
|||-----||------||||--||--|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3)
-------------|--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0291 Ribosomal protein L35
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0292 Ribosomal protein L20
|||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes
-|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|---  1 [G] COG0297 Glycogen synthase
|||---||||--------||----------|-----------|||-|---|-----|||-------  1 [O] COG0298 Hydrogenase maturation factor
--||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN
|||||||||||||----|------|-----|||||||||||||||||-||||--------------  1 [H] COG0301 Thiamine biosynthesis ATP pyrophosphatase
----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--|||||||||||  1 [H] COG0302 GTP cyclohydrolase I
||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|---  1 [P] COG0306 Phosphate/sulphate permeases
---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain
|||||||||||||---|-||----------|-----------|||-|---------|||-------  1 [O] COG0309 Hydrogenase maturation factor
|||||||||||||||--|---|----|||||--|||||------------||--------------  1 [H] COG0311 Predicted glutamine amidotransferase involved in pyridoxine biosynthesis
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0313 Predicted methyltransferases
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG0315 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme
----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-|  1 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase
--||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---|||||||  1 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase)
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase
--|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold
-------------|||--|||---|||||||----|||----|||||||||||--||||-|-|-||  1 [O] COG0326 Molecular chaperone, HSP90 family
||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||-------  1 [S] COG0327 Uncharacterized conserved protein
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0333 Ribosomal protein L32
--|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|--  1 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0335 Ribosomal protein L19
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase
----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase
-|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------|  1 [L] COG0338 Site-specific DNA methylase
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD
|||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase
----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||--  1 [S] COG0344 Predicted membrane protein
|-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase
-||-||--||-|------||----------|-----------|||-|-||||-|||||||||||--  1 [C] COG0348 Polyferredoxin
-------------|----||------|||||-----------|||||-|||||------|||||||  1 [J] COG0349 Ribonuclease D
||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-|  1 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase
|||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase
----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit)
--|----------|--|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a
----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0359 Ribosomal protein L9
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0360 Ribosomal protein S6
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1)
-------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||--  1 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase
|||||||||||||-----||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||---  1 [H] COG0368 Cobalamin-5-phosphate synthase
|||||||||||||-|--|||----------||||-|||----|||||-------------|-----  1 [C] COG0371 Glycerol dehydrogenase and related enzymes
||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||-------  1 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase
--|-----||------|--|----------|-----------|||-|---------|||-------  1 [C] COG0374 Ni,Fe-hydrogenase I large subunit
||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||--  1 [H] COG0379 Quinolinate synthase
--||---------||---||||----|||-|----|||----|||-|-||-|---|---|||||--  1 [R] COG0384 Predicted epimerase, PhzC/PhzF homolog
--||-------|-||---|||-----|||-|||||||||||||||||-||-|-|||---|||||--  1 [L] COG0389 Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair
||||----||---|--||||-|----||||||||||||----|||||-|--|--------------  1 [S] COG0391 Uncharacterized conserved protein
||||--||||------||||------|||||---|||-|||||||-|--|--|--|---||||---  1 [S] COG0392 Predicted integral membrane protein
|||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||--  1 [O] COG0396 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, ATPase component
|||||||||||||||-||||-|----|---|--|---|----|||||--||||--|||||||||--  1 [FR] COG0402 Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolases
|||---||||------|-||----------|-----------|||-|---------|||-------  1 [O] COG0409 Hydrogenase maturation factor
---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||--  1 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase
-------------||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||--  1 [H] COG0414 Panthothenate synthetase
----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||--  1 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme
||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||----------------  1 [L] COG0419 ATPase involved in DNA repair
||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|-----  1 [L] COG0420 DNA repair exonuclease
-|--|||||||||||-||---|----|---|--|--||----||||||-|--||||||----|---  1 [E] COG0421 Spermidine synthase
||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||--  1 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC
||||||||||||||||-----|--|||||||---|---||||------------------------  1 [J] COG0423 Glycyl-tRNA synthetase (class II)
--|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-|||||||||||||||  1 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation
|||---|||||||-|-||||-|-----||-|-----||----|||-|-||---------||-----  1 [S] COG0432 Uncharacterized conserved protein
|||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [I] COG0439 Biotin carboxylase
|||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||--  1 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division
||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains
|||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase
||-|--||||------||-|----||-||||-----||----------||-----||||-------  1 [D] COG0455 ATPases involved in chromosome partitioning
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family)
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase
|||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase
||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||----  1 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters
|||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-||||||||||||||  1 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components
|-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA
-------------||-||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0486 Predicted GTPase
--------|-------|----|-----||||||---|-----------------------------  1 [P] COG0490 Putative regulatory, ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase
----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0498 Threonine synthase
|||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||--  1 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase)
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  1 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II
--|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||--  1 [L] COG0514 Superfamily II DNA helicase
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [F] COG0528 Uridylate kinase
-------||---|||-|-|--|-----||-|-----||----||||||||--|--|--|-||||--  1 [P] COG0529 Adenylylsulfate kinase and related kinases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0536 Predicted GTPase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||--  1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-|  1 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase
---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||--  1 [C] COG0554 Glycerol kinase
||||||||||||------||-|-----||-|------|----|||||-||||||||---|||||--  1 [O] COG0555 ABC-type sulfate transport system, permease component
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex
---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1 [K] COG0557 Exoribonuclease R
|--------------------|----|||||---------|||---|-----------||------  1 [M] COG0562 UDP-galactopyranose mutase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease
---|---------||--|||-|-|||----|||||||||-|||||||-|-||--------------  1 [F] COG0572 Uridine kinase
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|-|||--|--||||||--  1 [P] COG0573 ABC-type phosphate transport system, permease component
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG0581 ABC-type phosphate transport system, permease component
----||-----|------||-|--||||||||--||||----|||||||||||||||||--|||--  1 [S] COG0586 Uncharacterized membrane-associated protein
--|----------||-----|-||||||||||||||------||||||--||||||----||||--  1 [G] COG0588 Phosphoglycerate mutase 1
--|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---|||||||  1 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog)
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1 [J] COG0594 RNase P protein component
||||--||-|-------|||||----||||||||||||||||--------------||||||||||  1 [R] COG0595 Predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase
|||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase
|-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [P] COG0605 Superoxide dismutase
|--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-|  1 [O] COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity
||||----|--||---||||-|--------|------|----|||||-||||-|||----------  1 [R] COG0613 Predicted metal-dependent phosphoesterases (PHP family)
-|||--|||||-|---||||||--|||||-||||||||||||------|-----------------  1 [R] COG0618 Exopolyphosphatase-related proteins
-|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit
----------------||--||----||||||-|||||||||||||||||||||||---|||||--  1 [F] COG0634 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase
||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K
-|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||--  1 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases
|||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||--  1 [C] COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins)
||||||||--||||||||----||---||||---|||||||||||||||-----------------  1 [L] COG0648 Endonuclease IV
|-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family
---|||||--||||||-||-------||||||||||||----|||||--|-----|---|||||--  1 [R] COG0656 Aldo/keto reductases, related to diketogulonate reductase
--|--|--|--|-||--|||-|--|-|||||||-||-|----|||||-||--|--|---||-||--  1 [I] COG0657 Esterase/lipase
----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-|  1 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein
|-||||-----|-||---||-------||||------|----|||||-||-|||||---|||||||  1 [R] COG0661 Predicted unusual protein kinase
|||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--||||||||  1 [R] COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily
--|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||--  1 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating)
|||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--||||||||||||||  1 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel
----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase
-------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-|||||||||||||  1 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH
||----||--|------|------------|---|-------|||||-||-||--|---||-|---  1 [M] COG0677 UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase
|||---||||-|----|-||----------|-----------|||-|---------|||-------  1 [C] COG0680 Ni,Fe-hydrogenase maturation factor
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase
--|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase
---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||--  1 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG0691 tmRNA-binding protein
|-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---|||||||  1 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins
--||-----------|--||----------|---|||||||||||||-||------||||------  1 [G] COG0696 Phosphoglyceromutase
------------------|-----------|-----||----|||-|-||-----|----------  1 [S] COG0700 Uncharacterized membrane protein
|||-----||------||||-------||-|-||-|||----|||-------------|-------  1 [R] COG0701 Predicted permeases
--|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG0703 Shikimate kinase
|||||||||||||---||||-|---|||||||||||-||-|||||||-||--|--|---|||||--  1 [P] COG0704 Phosphate uptake regulator
-||||-|||||||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-|||||--|--||||||--  1 [R] COG0705 Uncharacterized membrane protein (homolog of Drosophila rhomboid)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC
|-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0708 Exonuclease III
--|-------------|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b
-------------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein)
|||||||||||||---||||-|---||||||---||||----|||||-||--|--|---|||||--  1 [R] COG0714 MoxR-like ATPases
|||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-|||||||||||||||||  1 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase
-----------------|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--||||||||||||||  1 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [P] COG0725 ABC-type molybdate transport system, periplasmic component
----------------|||||||||||||||-----------||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
|||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [R] COG0730 Predicted permeases
|||||||||||||||--||||---------|-------------------------|||-------  1 [C] COG0731 Fe-S oxidoreductases
-------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||  1 [I] COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)
----------------||||||--||||||||--||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases
-----------------|||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase
----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|--  1 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase
-------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains
-----------------|||||----|||||-----||-------|-||||||--|||||||||--  1 [E] COG0757 3-dehydroquinate dehydratase II
----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-|  1 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake
----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||-  1 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein
----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||--  1 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein
-----------------||||-||||||||||||||||----|||||-||||---||||||-||--  1 [S] COG0762 Predicted integral membrane protein
----------------||||||||------||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases
|||------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase
--|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||--  1 [F] COG0775 Nucleoside phosphorylase
----||----------||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein
----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit
----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG0781 Transcription termination factor
----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||--  1 [L] COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase
----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0793 Periplasmic protease
|||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation
----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||--  1 [M] COG0796 Glutamate racemase
----------------|-||----||----|-----------|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG0797 Lipoproteins
|-|---|-|----|---|||------|||-|----||--------------|--|----|------  1 [P] COG0798 Arsenite efflux pump ACR3 and related permeases
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase
----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase
----------------||||||--||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing
----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II
----------------||||||---|----||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase)
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase
----------------||||||||--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis)
-----------------|||-|--------||||||||----|||||-|||||||||||||||---  1 [M] COG0818 Diacylglycerol kinase
----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||--  1 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis
----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit
-|-------------------------|||||||||||------------|-----||-|--|---  1 [L] COG0827 Adenine-specific DNA methylase
----------------|-||--||||----|||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0828 Ribosomal protein S21
--|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump
------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|--  1 [K] COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family
----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases
----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||---  1 [D] COG0850 Septum formation inhibitor
----------------||||-|----|||||---||||----|||||--|--||||||||--||--  1 [H] COG0853 Aspartate 1-decarboxylase
--|---------------||-|-----||||------|----|||||-||--||||||||||||--  1 [P] COG0855 Polyphosphate kinase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A
----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||--  1 [M] COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase
||||--|||||||-----------------|----|||----|||-|---------||---|-|--  1 [K] COG0864 Predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain and a metal-binding domain
|||-----||-----------|---|----|----|||----|||--------------||||---  1 [F] COG1001 Adenine deaminase
||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG1010 Precorrin-3B methylase
-----------------|---|--------||||||||-|--|||||||-------||-||-|---  1 [G] COG1015 Phosphopentomutase
----------------||||-|-----||-|-----------||||||-|--||||||||||||||  1 [C] COG1034 NADH dehydrogenase/NADH:ubiquinone oxidoreductase 75 kD subunit (chain G)
-------------||-----------|||-||--||||---------------------||||---  1 [C] COG1038 Pyruvate carboxylase
----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases
--||----------|--|||------||||||||||||----||||||||||-|||||||||||--  1 [E] COG1045 Serine acetyltransferase
--||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---|||||||  1 [C] COG1048 Aconitase A
|||---|||||||---|-||-|----||||||-|-|||-------|--||-----|---|||||-|  1 [F] COG1051 ADP-ribose pyrophosphatase
||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit
---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||--  1 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA
--|||||||-||||||---|||--|-|||||-||||------|||||-|-----------------  1 [KL] COG1061 DNA or RNA helicases of superfamily II
--|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||--  1 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases
----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease
--------------------|-||||-||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains)
--------|----||---||-|----|---|---|-||-|--------||--|--|----------  1 [R] COG1075 Predicted acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold
---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||---  1 [R] COG1079 Uncharacterized ABC-type transport system, permease component
--------------------||||-||---||||||||-|||||||||||||||||------||--  1 [G] COG1080 Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria)
--|---|-|-|--||--|--------||--||----------|||||-|-||--------------  1 [C] COG1085 Galactose-1-phosphate uridylyltransferase
-|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-||||||  1 [MG] COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases
|-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||--  1 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase
|-|-----|-------|-||-------||-|-----------|||-|-||--|---||-|-|||--  1 [M] COG1089 GDP-D-mannose dehydratase
-----------------|---|--------||||||||----------------------------  1 [J] COG1098 Predicted RNA binding protein (contains ribosomal protein S1 domain)
|-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  1 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components
|||||-||||-|-||||||-|------||||---|---|||||||-|--|--|---|--------|  1 [L] COG1112 Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits
--------------------|-|||-|---|-|||-|-----|||||-||||--------------  1 [E] COG1114 Branched-chain amino acid permeases
||||---||||||---||||-|---||||||||||||||-|||||||-|||||--|--||||||--  1 [P] COG1117 ABC-type phosphate transport system, ATPase component
|-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  1 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component
--|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-||||||  1 [GM] COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component
------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component
|--|---||-|-|----|||-------||-||||||||----------------------------  1 [C] COG1141 Ferredoxin
||||||-|||||-----|||-|----|||||-----------|||-|-||--|--|||||||||||  1 [C] COG1146 Ferredoxin
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1157 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase
----------------||--|||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||||  1 [K] COG1158 Transcription termination factor
----------------||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [R] COG1159 GTPase
-||---||-|||||||-||||----|----||||||||||||------|----||-----------  1 [R] COG1161 Predicted GTPases
--|-------------|||||----||||||||||||||||||||||-||||||||------|---  1 [R] COG1162 Predicted GTPases
--------------------||----||||||-|-|||----|||||---|----|----------  1 [E] COG1168 Bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities
---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||--  1 [E] COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I
---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||--  1 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II
-------------||-----|---------|---|-||----|||||-|||||||||||-------  1 [H] COG1179 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 1
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)
-----------------|--|-----|---||||||||----|||||-||||-|||||||||||--  1 [J] COG1188 Ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit (S4 paralog)
--|-----|-------|||||----|||||||||-|||||----------------||||||||||  1 [J] COG1189 Predicted rRNA methylase
--|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||-----  1 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II)
|--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase
----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------|||||||  1 [L] COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)
-||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||--  1 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases
-----------------|||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase
||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|--  1 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases
----------------||||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [LK] COG1200 RecG-like helicase
----------------||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains)
|-|||||||--||----|||-|----|||||||---||----|||||--|--||||---||-||--  1 [M] COG1209 dTDP-glucose pyrophosphorylase
------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||--  1 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone
------------------||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [T] COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response
-------------|--||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit
-----------------|||----------|----||-----|||||-||-----|----------  1 [KT] COG1221 Transcriptional regulators containing an AAA-type ATPase domain and a DNA-binding domain
--||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-|  1 [O] COG1225 Peroxiredoxin
||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-||||||||||||||  1 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component
-|------|----|||-|--||--------|||||||-----------|-----------------  1 [C] COG1227 Inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase
--|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||--  1 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component
||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---|||||||  1 [R] COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I
|||---||||-------|------------|---------------|-------------------  1 [R] COG1237 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily II
-|-------|------||--|---------|||-||||----|||||-|-----------------  1 [R] COG1242 Predicted Fe-S oxidoreductase
||||||||||||-|||-|--|---------|-----------------------------------  1 [KB] COG1243 Histone acetyltransferase
||||||||||--------------------|-----------------------------------  1 [R] COG1244 Predicted Fe-S oxidoreductase
--|-------|-|-----||-|----|---||-|||||----|||-|-||-----|---|||||--  1 [M] COG1247 Sortase and related acyltransferases
--|-------------|----------||-|---|-||----|||||--|-----|---||-||--  1 [C] COG1251 NAD(P)H-nitrite reductase
-||-|||||-|||----|-|-|---|--|-||||||||----|||||-||-|---|----|-|---  1 [C] COG1254 Acylphosphatases
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [N] COG1256 Flagellar hook-associated protein
|||||||||||||-----||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---||||---  1 [H] COG1270 Cobalamin biosynthesis protein CobD/CbiB
--------------------|-----|||-|---|-||----|||||-||-|---|||-|-|---|  1 [R] COG1279 Lysine efflux permease
----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||--  1 [O] COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family
----------------|-||||--|--||-||-|-|||----|||||--|||---|---|||----  1 [S] COG1285 Uncharacterized membrane protein
||||||||||||||||-|||||---|----||||||||------------------|||-------  1 [K] COG1293 Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1298 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhA
--------------------||---||---||||||||-||||||||-|||----|----------  1 [G] COG1299 Phosphotransferase system, fructose-specific IIC component
|||---||||--|-----||-------||-|---|-||-----------|------------||--  1 [S] COG1300 Uncharacterized membrane protein
--||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-||||  1 [C] COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters
|-|---||||||----||||-|-----||||----|||-----------||||--|---||-||--  1 [E] COG1305 Transglutaminase-like enzymes, putative cysteine proteases
----||-----------|------------||----||----|||||---|--------||||---  1 [G] COG1312 D-mannonate dehydratase
|||---|||||-|---||------------|-----------------------------------  1 [R] COG1313 Uncharacterized Fe-S protein PflX, homolog of pyruvate formate lyase activating proteins
----------------|-|||||||||||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG
-----------------|------||----|------|----------|-----------------  1 [L] COG1315 Predicted polymerase, most proteins contain PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain
-----------------|----||||----|-----||----||||||||-----||||---|---  1 [NU] COG1317 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein
||-------|-------|--|---------||||||||-|--------------------------  1 [R] COG1323 Predicted nucleotidyltransferase
-----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||--  1 [K] COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains
|-||||--|-|||---|--|-|||---||-|-----|------------------------||---  1 [O] COG1331 Highly conserved protein containing a thioredoxin domain
----------------||------------|-----||----------||------|||-------  1 [N] COG1334 Uncharacterized flagellar protein FlaG
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1338 Flagellar biosynthesis pathway, component FliP
|||---|||---------------------|-----------------|-----------------  1 [R] COG1342 Predicted DNA-binding proteins
----------------||------||----|----|||----|||||-||-----||||-------  1 [N] COG1345 Flagellar capping protein
--|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|----  1 [M] COG1346 Putative effector of murein hydrolase
|||------|--------|||---------|-----------------------------|-|---  1 [P] COG1348 Nitrogenase subunit NifH (ATPase)
---|||||--|||---||||--|||||||||-------------------------|||-----||  1 [F] COG1351 Predicted alternative thymidylate synthase
-||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||--  1 [S] COG1354 Uncharacterized conserved protein
--||--------------|-||----|||-||-|-||-----|||||-||-|-|||---||-||--  1 [S] COG1359 Uncharacterized conserved protein
-----------------||||||||--||-|---||||----------||---------||--|--  1 [T] COG1366 Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1377 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhB
--|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|----  1 [R] COG1380 Putative effector of murein hydrolase LrgA
------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---|||||||  1 [L] COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
----------------||||||--||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  1 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-|||||--------|||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||--  1 [K] COG1386 Predicted transcriptional regulator containing the HTH domain
|||---|||--|-----|---|||------|---|||-----------||||---|---||-|---  1 [P] COG1392 Phosphate transport regulator (distant homolog of PhoU)
-------------------|||----|--||||||||||-|||||||-||||||||--||||||--  1 [P] COG1393 Arsenate reductase and related proteins, glutaredoxin family
-||-----|-------|--|-|--------|--|--------|||-|---------------|---  1 [O] COG1397 ADP-ribosylglycohydrolase
----------------||||-|----||||||||||||----|||||-||||||||----------  1 [R] COG1399 Predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein
---|--------------||-|-----||||||-|||-----|||---|---|--|---|||||--  1 [V] COG1403 Restriction endonuclease
-----------------|------||----|------|----------|-----------------  1 [N] COG1406 Predicted inhibitor of MCP methylation, homolog of CheC
-----------------|||-|----|||||------|----|||||-|||-|--|---|||||--  1 [E] COG1410 Methionine synthase I, cobalamin-binding domain
----------------||------||----|----|||----------||-----||||-------  1 [N] COG1419 Flagellar GTP-binding protein
-----------------||||-||--||||||||||||||||----------|--|||||||||--  1 [K] COG1420 Transcriptional regulator of heat shock gene
|||-|||||||------|------------|-----------------|-----------------  1 [S] COG1433 Uncharacterized conserved protein
---||-----|----|-|---|---|----|||||||||||||||||-|-||-------||-|---  1 [F] COG1435 Thymidine kinase
||||--|||||||------------|----|--------------|---------|----------  1 [F] COG1437 Adenylate cyclase, class 2 (thermophilic)
-----------------|---|-|--||||||||||||----|||||-|-||--------------  1 [K] COG1438 Arginine repressor
-------------------------|----||||-|||----|||||-|-----------------  1 [G] COG1440 Phosphotransferase system cellobiose-specific component IIB
--------------------||---||---||||||||-||||||||-||||---|----------  1 [G] COG1445 Phosphotransferase system fructose-specific component IIB
||||--|||-------|---||----|---|-------||--|||||-||--||||||||||||-|  1 [R] COG1451 Predicted metal-dependent hydrolase
----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||--  1 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF
-----------------|--||----|||-||||||||||||------------------------  1 [R] COG1461 Predicted kinase related to dihydroxyacetone kinase
--------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit
-|||--|----------|-||-----|---|----|--||---|||--|--|--|-|||-------  1 [S] COG1479 Uncharacterized conserved protein
-----------------||||--||-----|----|||----------------------------  1 [R] COG1480 Predicted membrane-associated HD superfamily hydrolase
-----------------|--|-----||||||||||||||||------------------------  1 [S] COG1481 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------|----||--|---|---|||||||||||||-|--|||||-|--|--------------  1 [G] COG1482 Phosphomannose isomerase
|---||--|-|||---||||----------|------|----|||||-||||-------|||-|--  1 [R] COG1489 DNA-binding protein, stimulates sugar fermentation
-------------||-||--||----|||-||||||||----|||||-||||-|||----------  1 [J] COG1490 D-Tyr-tRNAtyr deacylase
||||||--||-|------||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---|||||--  1 [H] COG1492 Cobyric acid synthase
---------|----------|---|-----||||||||||||----------||||---|||||--  1 [T] COG1493 Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism
--|---------------||||----|||||-----||----|||-|-|-||---------|||--  1 [G] COG1494 Fructose-1,6-bisphosphatase/sedoheptulose 1,7-bisphosphatase and related proteins
----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--||||||||  1 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein
----------------|-----||||----|----|||----|||||-||--||||||||||||--  1 [K] COG1508 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma54 homolog
|||-|||||||||---||-|-|----|---|---|-||----|||||--|-----|---|||||--  1 [J] COG1514 2'-5' RNA ligase
---||||||||||-|-||-|-|--------|-----|-----|||||-----|-------------  1 [L] COG1515 Deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V)
----------------||------||----|----|||----|||||-||-----||||-------  1 [NUO] COG1516 Flagellin-specific chaperone FliS
----------------||||||--||-||||----|||-|---------|--|||||||----|--  1 [K] COG1521 Putative transcriptional regulator, homolog of Bvg accessory factor
--|--------|-----||-||||--|||-|-||--||-|--|||||-||||---|---||-|---  1 [G] COG1523 Type II secretory pathway, pullulanase PulA and related glycosidases
----|||||--|-|||-|-|------|---|----|-|-----------|--|-----|-|-||--  1 [R] COG1524 Uncharacterized proteins of the AP superfamily
|-|-----|------|-|--------|||-|---|--||---|||||-|-||----|||-------  1 [P] COG1528 Ferritin-like protein
---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---|||||||  1 [J] COG1530 Ribonucleases G and E
||||--||||-||-------|---------||||||||----|||||-||||||||----------  1 [J] COG1534 Predicted RNA-binding protein containing KH domain, possibly ribosomal protein
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [N] COG1536 Flagellar motor switch protein
-------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase
------||----------||----|--||||------|----------------------------  1 [S] COG1543 Uncharacterized conserved protein
----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||||  1 [J] COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1)
---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||--  1 [R] COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced)
-----------------|---|-----||||----|||----------------------------  1 [S] COG1550 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------|------||----|-----||----|||||||||||---|||-------  1 [T] COG1551 Carbon storage regulator (could also regulate swarming and quorum sensing)
------|------|-----|-------|||||---||--|--|||--------||-----------  1 [G] COG1554 Trehalose and maltose hydrolases (possible phosphorylases)
--|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|-------  1 [L] COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [N] COG1558 Flagellar basal body rod protein
----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||||  1 [R] COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein
----------------||--|----|----|----|||----|||||-||||||||---|||||--  1 [S] COG1561 Uncharacterized stress-induced protein
-------------||--|--||--|-----|||||||-------------------||-||||---  1 [H] COG1564 Thiamine pyrophosphokinase
-----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit
-----------------|--||--------||||||||||--|||||-||||||||||||||||--  1 [S] COG1576 Uncharacterized conserved protein
----------------|----|||||||-||-------------------------|||-------  1 [R] COG1579 Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding
----------------||------||----|-----||----|||||-||-----||||-------  1 [N] COG1580 Flagellar basal body-associated protein
-----------------|------||----|-----||----------------------------  1 [N] COG1582 Uncharacterized protein, possibly involved in motility
||-|--||-||||----|||||----|||||-----------|||||-||-||------|||||--  1 [OU] COG1585 Membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity
-|--|||||-|||---||------------|-----||----||||||-|--|--|----------  1 [E] COG1586 S-adenosylmethionine decarboxylase
||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||---  1 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase
------------------||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||---|||||||  1 [M] COG1589 Cell division septal protein
----|--------||--|||-|----|||-||||||||----|||||--|---------||-||--  1 [IR] COG1597 Sphingosine kinase and enzymes related to eukaryotic diacylglycerol kinase
|-|-----|---------||-|--------|-|-||||----|||||-||-----|---|||||--  1 [C] COG1600 Uncharacterized Fe-S protein
||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1 [E] COG1605 Chorismate mutase
|||-----||-------|||----------|-----------------------------------  1 [R] COG1606 ATP-utilizing enzymes of the PP-loop superfamily
-------------|---|--------|||-|----|||----------||--||||--|||||---  1 [S] COG1610 Uncharacterized conserved protein
--------|---------||------|||||-----------------------------------  1 [S] COG1615 Uncharacterized conserved protein
-----------------|--|-----|||-|-----||----------------------------  1 [R] COG1623 Predicted nucleic-acid-binding protein (contains the HHH domain)
-|||--||||------|-||-|||||----||||||||-|||------------------------  1 [S] COG1624 Uncharacterized conserved protein
|||---||-|--------||-|--------|-----------------------------------  1 [C] COG1625 Fe-S oxidoreductase, related to NifB/MoaA family
----------------||--|---------|||-|---------------|||||-|||-----||  1 [S] COG1636 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|||-----||-------|||------|---|-----------------------------------  1 [S] COG1641 Uncharacterized conserved protein
||||||--|||-|||-|---|------||-|---||||----||||||||--|||----|||||--  1 [H] COG1648 Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain)
--||---||------------|--------||||||||----|||||-|||||-------------  1 [K] COG1654 Biotin operon repressor
-----------------|------||----|-----------------------------------  1 [S] COG1655 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|||-|||||-------|---|----|----|||||||||-||------------------------  1 [L] COG1658 Small primase-like proteins (Toprim domain)
--------------------||----||||||||||||----|||||-||||||||----------  1 [R] COG1660 Predicted P-loop-containing kinase
----------------------||||----|-----|--------|--||--|--||||----|--  1 [M] COG1664 Integral membrane protein CcmA involved in cell shape determination
||||--|||-|||----|---|--------||-|||||--------------|----------|--  1 [CP] COG1668 ABC-type Na+ efflux pump, permease component
------------------------||----|---||||----|||||-||---------|||||--  1 [S] COG1671 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1677 Flagellar hook-basal body protein
--|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-||||||  1 [GM] COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component
|-|-------------||--|---------|----|||--------|-||-----|---||-|---  1 [S] COG1683 Uncharacterized conserved protein
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1684 Flagellar biosynthesis pathway, component FliR
|||||||||||||--|||-|-|----|||-|------|----|||-|--|-----|----------  1 [S] COG1690 Uncharacterized conserved protein
|||-----||-------|||------|---|-----------------------------------  1 [R] COG1691 NCAIR mutase (PurE)-related proteins
--|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-|  1 [R] COG1694 Predicted pyrophosphatase
-------------||----||---|-----|||||||------------|---||-|-|-|-----  1 [M] COG1696 Predicted membrane protein involved in D-alanine export
-----------------|------||----|-----||------------------|||-------  1 [S] COG1699 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|||---|||||||---||------------|---|-----------|---|--------||----|  1 [R] COG1708 Predicted nucleotidyltransferases
|--------|--------||-------||||----|||----------|||--|||||||||||||  1 [S] COG1714 Predicted membrane protein/domain
-----------------|-|||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG1722 Exonuclease VII small subunit
-----------------|------||----|-----||----------------------------  1 [S] COG1728 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|-----||||----|-----||----||||||||||||||--||||||||  1 [T] COG1734 DnaK suppressor protein
--||---------||--|--||---||---||||||||||--|||-|-||||-|||||||||----  1 [S] COG1739 Uncharacterized conserved protein
--|-----|-------|--|----------|-----------|||-|---------|||-------  1 [C] COG1740 Ni,Fe-hydrogenase I small subunit
--|-||----|-------||------|||-|-----------|||||-||-|---|---|||||--  1 [R] COG1741 Pirin-related protein
---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-|||||||-------|-----|---||||---  1 [R] COG1744 Uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein
----------------|-------||----|----|------||||||||-----|||||||||--  1 [N] COG1749 Flagellar hook protein FlgE
||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega
-||-||||-|-||---||---|----|||-|----|-|--|||||||-||---|||---||-||--  1 [O] COG1765 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1766 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway lipoprotein
---------------------|||------|-----------------------------------  1 [R] COG1768 Predicted phosphohydrolase
||-----||--------||||---|--||-|-----------|||-|--|--||||-------|--  1 [C] COG1773 Rubredoxin
-------------|||||--||--|-----||--||||----------------------------  1 [S] COG1774 Uncharacterized homolog of PSP1
-|------||----------|---------|-----------|||---------------------  1 [E] COG1775 Benzoyl-CoA reductase/2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase subunit, BcrC/BadD/HgdB
|||||||||||||----|------------|-----------|||||||----||-----------  1 [F] COG1781 Aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit
--------|--|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-|  1 [I] COG1788 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit
----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----|||  1 [M] COG1792 Cell shape-determining protein
||||||--||||------||||-----||-|----|-|--------|--|-----|---||||---  1 [H] COG1797 Cobyrinic acid a,c-diamide synthase
------------------|||-----||||||||||||----------------------------  1 [S] COG1799 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----|------|-----|--||----|||-|||-||||----|||||-||---|||---|||||--  1 [K] COG1802 Transcriptional regulators
-----------------||------|----|----|||----|||||-|-||---|---|||----  1 [G] COG1803 Methylglyoxal synthase
--------|--------|--||--------|----|||----|||-|-------------------  1 [R] COG1811 Uncharacterized membrane protein, possible Na+ channel or pump
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [N] COG1815 Flagellar basal body protein
-------------||----|----|--|-|||----------|||-|-||-----|---||-||--  1 [F] COG1816 Adenosine deaminase
-----------|-----|-|||---||||-||||||||-|--|||||-|||||------|||||--  1 [G] COG1820 N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase
|--------|-------|--|---------|-||-|||----------------------------  1 [R] COG1827 Predicted small molecule binding protein (contains 3H domain)
--|---------|-----||-------||-|-----||-----------|----------|-|---  1 [E] COG1834 N-Dimethylarginine dimethylaminohydrolase
----------------||||||||||-|||||||-|||------------------|||-------  1 [R] COG1837 Predicted RNA-binding protein (contains KH domain)
|||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||---  1 [C] COG1838 Tartrate dehydratase beta subunit/Fumarate hydratase class I, C-terminal domain
||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----||||||  1 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E
--|-------------|-||-|----|||-|----|||----|||||-||------------||--  1 [KT] COG1842 Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [N] COG1843 Flagellar hook capping protein
-----------------|||||--||-|||||||-|||----------------------------  1 [R] COG1847 Predicted RNA-binding protein
|-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---|||||||  1 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family
---------------------|---|----||||||||----|||||-|-||-||-|||-------  1 [T] COG1854 LuxS protein involved in autoinducer AI2 synthesis
-|------------------|---|-----|-----|--------------------------|--  1 [M] COG1861 Spore coat polysaccharide biosynthesis protein F, CMP-KDO synthetase homolog
----------------||--|-||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1 [U] COG1862 Preprotein translocase subunit YajC
----------------||------||----|----|||----||||||||-----||||||||---  1 [N] COG1868 Flagellar motor switch protein
--||--|||--------|-------|----|-----||----------||-----|---||--|--  1 [NT] COG1871 Chemotaxis protein; stimulates methylation of MCP proteins
------||---------|------------|--|--||-------|------|-------|--|--  1 [G] COG1874 Beta-galactosidase
------------------||----||----||||-|||-------|--|-|||-------------  1 [M] COG1876 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase
|-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--|  1 [R] COG1881 Phospholipid-binding protein
|-------|-----------|---------||||||------|||||-|-||---|----------  1 [C] COG1882 Pyruvate-formate lyase
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1886 Flagellar motor switch/type III secretory pathway protein
-----------------|------------||-|--||----|||||-|---------||||----  1 [E] COG1897 Homoserine trans-succinylase
|-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||--  1 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes
|||-||--||||------|||---------|----|----------|--|-----|---|-|----  1 [H] COG1903 Cobalamin biosynthesis protein CbiD
-----------------|--------|---||----||----|||||-------------||||--  1 [G] COG1904 Glucuronate isomerase
||||||||--||----|||||-----||--|||--|||-------||--|-----||||||||---  1 [S] COG1917 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain
-----------------|||-|--|-----|---|||-----|||||-|---|------|-|||--  1 [M] COG1922 Teichoic acid biosynthesis proteins
-|--------------||------------|---||||----|||||-||||||||----||||--  1 [R] COG1923 Uncharacterized host factor I protein
------------------|-------|||-||||||||----|||||-||||-||-----------  1 [G] COG1929 Glycerate kinase
-----------------||||---------||||||||----------------------------  1 [S] COG1939 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||--  1 [L] COG1943 Transposase and inactivated derivatives
----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||--  1 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase
|||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||---  1 [C] COG1951 Tartrate dehydratase alpha subunit/Fumarate hydratase class I, N-terminal domain
-----------------|--|---------|---||||----|||---------------------  1 [K] COG1954 Glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (mRNA-binding)
---|||-------|---|------------||||||||----|||||-||-||||-------||--  1 [T] COG1956 GAF domain-containing protein
---|||--|-||||-----|||----|||||---|-||----|||||-||---|||---|||||--  1 [I] COG1960 Acyl-CoA dehydrogenases
--|----|--|-|---|---|-----|||-||----||----|||||-||||-||||||-------  1 [T] COG1966 Carbon starvation protein, predicted membrane protein
----------------||------------|-----|-----------------------------  1 [S] COG1978 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|---||---------|--------|---||||-|||----|||||-|-----------------  1 [KT] COG1983 Putative stress-responsive transcriptional regulator
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis
----------------||------||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1 [NU] COG1987 Flagellar biosynthesis pathway, component FliQ
||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||--  1 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases
|||||||||||||||---------------|-----------------------------------  1 [K] COG1996 DNA-directed RNA polymerase, subunit RPC10 (contains C4-type Zn-finger)
---------------------|--|-|||||---|||||||||||||--|||||||----|--|||  1 [S] COG2001 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--|  1 [L] COG2003 DNA repair proteins
---|---------||--|-|||--------|---||-|----|||||-||-----|---|||||--  1 [E] COG2008 Threonine aldolase
--------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [P] COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component
--|---|||---||||--||-------||-|-----------------|-||---|----|||---  1 [O] COG2020 Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase
----------------|-||||----|||||-----||----|||||-||--||||--||||||--  1 [H] COG2022 Uncharacterized enzyme of thiazole biosynthesis
--|----------||-|----|-----||||-----|-----|||||-|--|-|||----||-|--  1 [P] COG2032 Cu/Zn superoxide dismutase
|||---|||--------|------|-----|-----------------------------------  1 [C] COG2033 Desulfoferrodoxin
|||||||||||||-----||||----|||||------|----|||-|-||-----|---|||||--  1 [H] COG2038 NaMN:DMB phosphoribosyltransferase
-------------||---|--------||||-----|-----|----------------|--|---  1 [E] COG2040 Homocysteine/selenocysteine methylase (S-methylmethionine-dependent)
||--||---|-------|||-|--------|-----|------------------|----------  1 [HR] COG2045 Phosphosulfolactate phosphohydrolase and related enzymes
-----------------|||----------|-----||----------------------------  1 [S] COG2052 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||----||-|----------------|---|-----|-----|||-|--|||-------||||---  1 [C] COG2055 Malate/L-lactate dehydrogenases
-----------|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-|  1 [I] COG2057 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit
---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||--  1 [P] COG2060 K+-transporting ATPase, A chain
|||||||||||||-------------||--|--------------|---|-|---|---||-||--  1 [NU] COG2064 Flp pilus assembly protein TadC
------------------||||----|||-||||||||-----------|||---|----------  1 [F] COG2065 Pyrimidine operon attenuation protein/uracil phosphoribosyltransferase
--------------|-----|------|||||||-|------|||----|--------||||||||  1 [R] COG2071 Predicted glutamine amidotransferases
||-|||--||||------|||---------|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG2073 Cobalamin biosynthesis protein CbiG
--||---------------|-|-----|||||---|||----|||||-||---||---||||||--  1 [P] COG2076 Membrane transporters of cations and cationic drugs
----------------|---------|||-||-|||||-|--|||||-||||---||||-------  1 [O] COG2077 Peroxiredoxin
|||||||||||||||-||------------|-----------------------------------  1 [S] COG2078 Uncharacterized conserved protein
||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG2082 Precorrin isomerase
|-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||--  1 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases
------------------||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||---  1 [H] COG2087 Adenosyl cobinamide kinase/adenosyl cobinamide phosphate guanylyltransferase
--------|-----------|----|----|---||||----------------------------  1 [M] COG2088 Uncharacterized protein, involved in the regulation of septum location
-||-----------------|---|-----|-----|----------------|--|||----|--  1 [M] COG2089 Sialic acid synthase
------------|--|-----|-|-|-||||---|||------------|---------||-|-||  1 [L] COG2094 3-methyladenine DNA glycosylase
||----------------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG2099 Precorrin-6x reductase
------------------||-|--------||--|-||----|||||-|-||--------|-|---  1 [R] COG2103 Predicted sugar phosphate isomerase
|-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||--  1 [H] COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis
-|||--|||||||-----------------|-----------------------------------  1 [R] COG2108 Uncharacterized conserved protein related to pyruvate formate-lyase activating enzyme
---------|---|------|---------|||||||-----|||||-||||--------------  1 [P] COG2116 Formate/nitrite family of transporters
---|---------||---||-|----|||||-----||-----------|--|--|--||||||--  1 [Q] COG2124 Cytochrome P450
------------------||-|----|||||-----------|||||-||--||||||||||||--  1 [S] COG2127 Uncharacterized conserved protein
--|-----|----------|-|----|||||--||-||----|||||--|---|||---|||||--  1 [S] COG2128 Uncharacterized conserved protein
--|-||||||---||--|--||--|-----||||||||-|--------|-----------------  1 [F] COG2131 Deoxycytidylate deaminase
-----------------|--||--|-||||||||||||----|||||-||||-|||---|------  1 [R] COG2137 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|---|||----||-----------|---||-|||||----|||-|---||----||-|------  1 [H] COG2145 Hydroxyethylthiazole kinase, sugar kinase family
--|-------------------||------|-----||----------------------|-|-|-  1 [S] COG2155 Uncharacterized conserved protein
---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|---||-||--  1 [P] COG2156 K+-transporting ATPase, c chain
|||-----||--------------------|-----------------------------------  1 [R] COG2158 Uncharacterized protein containing a Zn-finger-like domain
---|--||-|-||-----|-------|||-|---||-----------------------||-||--  1 [R] COG2159 Predicted metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold
||----||-|||||||--------------|------|----------------------------  1 [J] COG2163 Ribosomal protein L14E/L6E/L27E
---------|-------|--------||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1 [E] COG2171 Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase
-----------------|||-|||---||-|---||||----------------------------  1 [T] COG2172 Anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)
-----------------|--|---------||||||||||||------------------------  1 [L] COG2176 DNA polymerase III, alpha subunit (gram-positive type)
-------------|||---||---|-|---|||||||||---|||||-||||||||---||||---  1 [K] COG2183 Transcriptional accessory protein
--|-----------------||---|----||||||||----|||||-|-||------|-|--|--  1 [E] COG2195 Di- and tripeptidases
--||--|||--------|-|----||----|-----||----|||||-||--|--|--|||-||--  1 [NT] COG2201 Chemotaxis response regulator containing a CheY-like receiver domain and a methylesterase domain
|-||----|-----|-||||-|||-||||||----|||----|||||-||--|--|--||||||--  1 [T] COG2202 FOG: PAS/PAC domain
|-||----|-----|-||||-|-----||||---|-||----|||---||-----|---|||||--  1 [T] COG2203 FOG: GAF domain
------------------||-|-----||-|---||------|||||-||-----|--|||-||--  1 [T] COG2205 Osmosensitive K+ channel histidine kinase
-----------------||||-|||--||-|---||||----------||----------|-|---  1 [TK] COG2208 Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit
------------------------------|--|||||-||-|||||||--|--------------  1 [G] COG2213 Phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component
---|---------|||-|||-|--||----|---------|||||-|-||--|||-||||||||--  1 [O] COG2214 DnaJ-class molecular chaperone
---|||------------||-|-----||-|---||------|||||--|-----|--|||-||--  1 [P] COG2216 High-affinity K+ transport system, ATPase chain B
||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--|  1 [R] COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold
|||-----|||-------------------|---------------|-------------------  1 [C] COG2221 Dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha and beta subunits
|-----||-|-------|--||--------|-||-||-----|||||--|--|------|||||--  1 [M] COG2222 Predicted phosphosugar isomerases
--|-------------|----|----|||||-----------|||||-||-----|||||||||--  1 [M] COG2230 Cyclopropane fatty acid synthase and related methyltransferases
|----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----|||||||  1 [P] COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)
-------------||------|---||---|-|---------|||||--|||-------|||||--  1 [H] COG2240 Pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase
||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG2241 Precorrin-6B methylase 1
||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|---------||||---  1 [H] COG2242 Precorrin-6B methylase 2
||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG2243 Precorrin-2 methylase
---||||||||||-----||------||||||-||||-----|---|--|-----|------||--  1 [S] COG2246 Predicted membrane protein
--|-----------|-----|---------|----||||---|||||-||||-||||||-|-||--  1 [R] COG2249 Putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit
-----------------|------|-----|-----||-----------|------|||----|--  1 [S] COG2257 Uncharacterized homolog of the cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB
---------------------|----|||-|---||||----|||-|--||----|--||-|----  1 [S] COG2258 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||--  1 [R] COG2262 GTPases
----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase
-------||----||--|-|||----||||||--||||----|||||-||||---|---|||||--  1 [I] COG2267 Lysophospholipase
--------------|------|----|||-|---|-|---------|--------|-------|--  1 [I] COG2272 Carboxylesterase type B
-------------||--|---------||-|-----||---------------------||-||--  1 [G] COG2273 Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase
------------------||----------||-|--||||||-||||-||--||||----|-||--  1 [V] COG2274 ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain
|----------------|||-|--------|-----------|||-|------------|-|----  1 [S] COG2327 Uncharacterized conserved protein
--------|----|-|---|||---||---|---||||-----------|---------|||||--  1 [S] COG2340 Uncharacterized protein with SCP/PR1 domains
-----------------|---|--------||||||||----------------------------  1 [R] COG2344 AT-rich DNA-binding protein
------------------||||----|---|-----|-----|||||-||||-|||---|||||--  1 [S] COG2350 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------|----|---|-----||------------||--------------  1 [S] COG2364 Predicted membrane protein
------------------||||-----||||||||||----------------------||-----  1 [V] COG2367 Beta-lactamase class A
--------------------||----|||||---||||----|---|-||--|-||--||||||--  1 [K] COG2378 Predicted transcriptional regulator
---------------------|----|---|---||||----|||-|--|----------------  1 [P] COG2382 Enterochelin esterase and related enzymes
---------------------|--------|||||||||-||------|-----------------  1 [R] COG2384 Predicted SAM-dependent methyltransferase
---------------------|--------||||||||----|||||-|--|---|---||||---  1 [K] COG2390 Transcriptional regulator, contains sigma factor-related N-terminal domain
------||--|-|----|------------|--|--------|||||---|---------------  1 [G] COG2407 L-fucose isomerase and related proteins
-||-|||||-|-|-----------------|-----------|||---------------------  1 [C] COG2414 Aldehyde:ferredoxin oxidoreductase
|||---||-|-|------------------|-----------------------------------  1 [S] COG2454 Uncharacterized conserved protein
-------||--------|--|---------||-|---|----------------------------  1 [S] COG2461 Uncharacterized conserved protein
-------------------|||----|---||||||||||--|||||-|----|||----------  1 [S] COG2501 Uncharacterized conserved protein
----||------------|--------||-|---------------------------|-------  1 [R] COG2605 Predicted kinase related to galactokinase and mevalonate kinase
----------------|-||----------|------------------|---|||--||||||--  1 [R] COG2607 Predicted ATPase (AAA+ superfamily)
-|--------------|-------------|-----------------||-----|--|-------  1 [P] COG2703 Hemerythrin
------------------------------|-----------|||||-|-||----|||-------  1 [R] COG2704 Anaerobic C4-dicarboxylate transporter
--------------|---------------||-||||-----||||||-|-----|----------  1 [G] COG2706 3-carboxymuconate cyclase
------------------------------|----|||----|||||---||-||-----------  1 [S] COG2707 Predicted membrane protein
------------------|-----------|-----||-----------|-----|----------  1 [R] COG2715 Uncharacterized membrane protein, required for spore maturation in B.subtilis.
---|--------------------------|-----||----|||||-||----------|-|---  1 [S] COG2718 Uncharacterized conserved protein
---|--------------------------|-----||----|||||-||----------|-|---  1 [S] COG2719 Uncharacterized conserved protein
---------------------|----|---|-----||-----------|----------------  1 [V] COG2720 Uncharacterized vancomycin resistance protein
----|------|------------------|-----||----|||||--------|--||||||--  1 [G] COG2721 Altronate dehydratase
--------------------|---------|--|-----|--|||||-|-||----||--------  1 [G] COG2731 Beta-galactosidase, beta subunit
------------------------------|-----|-----|||||------|------------  1 [K] COG2732 Barstar, RNAse (barnase) inhibitor
-----------------|---|--------|---||||----------------------------  1 [R] COG2738 Predicted Zn-dependent protease
--------------------|---------|||||||||||-------------------------  1 [S] COG2739 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|||----||||||||||||||----------------||||||||--  1 [K] COG2740 Predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination
-------------------|-|--------|----||---------------------|-|-|---  1 [V] COG2746 Aminoglycoside N3'-acetyltransferase
----------------||------------|-----||----|||||-||-----|----------  1 [KNU] COG2747 Negative regulator of flagellin synthesis (anti-sigma28 factor)
----||-------||--|--|---------||||||--|---------|----||-----|-|---  1 [F] COG2759 Formyltetrahydrofolate synthetase
---|-------|---------|----|---|---||||----------|---|--|---|||||--  1 [Q] COG2761 Predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis
---|--------------------------|-----||----|||||-||----------|-|---  1 [T] COG2766 Putative Ser protein kinase
|-|-----|--------|------------|-----------------------------------  1 [R] COG2768 Uncharacterized Fe-S center protein
---------||-------||-|----||||||--||||----|||||-||-----|---|||||--  1 [K] COG2771 DNA-binding HTH domain-containing proteins
----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||--  1 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB
----------------||||||--------|-----------|||||-||--||||----------  1 [NU] COG2805 Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT
---------------------|----|---|--|-||-----|||-|--|-----|--|--|----  1 [P] COG2807 Cyanate permease
-----------------|--||--||||||||||||||----------------------------  1 [S] COG2815 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------|--------|--|--|------||-|--|---|----||---|--  1 [R] COG2819 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily
---------------------|--------|-----------|||||-||||-|||----|---||  1 [R] COG2823 Predicted periplasmic or secreted lipoprotein
-|||----|-------|----|--||----|-----||----|||||-||||||||||||||||||  1 [M] COG2834 Outer membrane lipoprotein-sorting protein
---|---------------|----------|-----------------||---||||||-------  1 [S] COG2836 Uncharacterized conserved protein
------------------------------|---|-------|||||---|--|||----|-----  1 [D] COG2846 Regulator of cell morphogenesis and NO signaling
-||------||||-------------|---||-|-|-----------------||-----------  1 [S] COG2848 Uncharacterized conserved protein
-------------------|||---|-||-|--|||||--------------||-|-----|----  1 [E] COG2856 Predicted Zn peptidase
--------------------|---||----|||||||||-||------------------------  1 [J] COG2868 Predicted ribosomal protein
--|-||||--||||---|--||--------|------|----------||-----|---||||---  1 [R] COG2872 Predicted metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase HxxxH domain
||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1 [H] COG2875 Precorrin-4 methylase
----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------  1 [E] COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase
-----------------|------|-----|-----||----||||||||-----|----------  1 [NUO] COG2882 Flagellar biosynthesis chaperone
-------------------|-|----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||--  1 [D] COG2884 Predicted ATPase involved in cell division
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors
----------------||||||--------|----|||----||||||||--||||||-||||---  1 [D] COG2894 Septum formation inhibitor-activating ATPase
--------------------------|||-|-----------||||||||--||||---|||||--  1 [P] COG2895 GTPases - Sulfate adenylate transferase subunit 1
|||||||||||||---|-||-|----|||-|---||||----|||||-||||---|||||||||--  1 [H] COG2896 Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme
---------------------------||-|-----------|||||-||----------------  1 [K] COG2909 ATP-dependent transcriptional regulator
------------------------------|----|------||||||||-|--------------  1 [H] COG2918 Gamma-glutamylcysteine synthetase
|------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|-------  1 [S] COG2966 Uncharacterized conserved protein
----||-----|-----|-|-|--------|-----------------|-----------|||---  1 [G] COG2971 Predicted N-acetylglucosamine kinase
--------------------|---------||||||||----------||----------------  1 [S] COG2996 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|--------------|--||--|-------------  1 [S] COG3007 Uncharacterized paraquat-inducible protein B
-----------------------|------|---||||----|||||-|||||||----|||||||  1 [S] COG3027 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|--|||------|||||-||||-|-|----|-||-|  1 [K] COG3070 Regulator of competence-specific genes
-------------|||----------|---||--|||-----|||||-|---|||--------|--  1 [E] COG3104 Dipeptide/tripeptide permease
-----------------|------------|-----||----||||||||-----|----------  1 [N] COG3144 Flagellar hook-length control protein
-------------------|-------||||-----||-------|---|-----|---|--|---  1 [Q] COG3208 Predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis
------------------------------|------------------|||-|||----|--|--  1 [S] COG3220 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|-|----|---||--||------|||-|--|-|-------|--|---  1 [S] COG3238 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|----------|-----||----|-----||-----|---|||||--  1 [QK] COG3284 Transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism
-----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-|||||||  1 [M] COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes
--------------------|---------|---|-||----|||-|-|-----------|-----  1 [S] COG3314 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|------|||||-----|--------|---------|---||-|---  1 [Q] COG3321 Polyketide synthase modules and related proteins
--------------------|-----||-||---||||-----------|----------------  1 [S] COG3323 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-||-----|------|--------||-||-----||----||||--------|----|-|---  1 [L] COG3328 Transposase and inactivated derivatives
-----------------|||----------|------|----------------------------  1 [S] COG3330 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|-|---------------||----------|-----||-----------------|---|||||--  1 [S] COG3339 Uncharacterized conserved protein
--|----------|----|||------||-|---|--|----|--||-||----------|-----  1 [L] COG3344 Retron-type reverse transcriptase
|-||--------------------------|-----||----------------------------  1 [L] COG3359 Predicted exonuclease
---------||||-----------------|||---||--------|--|-----|------|---  1 [S] COG3382 Uncharacterized conserved protein
--|-|------|--|---------------|-----------|||||--|-|---|-------|--  1 [S] COG3384 Uncharacterized conserved protein
-||-||-----|-||----|------|||-|------------------------|---|--||--  1 [G] COG3387 Glucoamylase and related glycosyl hydrolases
----||-----------|--||--------|-|---------------------------------  1 [E] COG3404 Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase
--------------------------|---|-||||-|-||-|||-|-|--|--------------  1 [G] COG3414 Phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component
-----------------|||-|--|-----|-----------------||--|-------------  1 [KT] COG3437 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HD-GYP domain
------------------||------|||||||||-------------------------------  1 [R] COG3442 Predicted glutamine amidotransferase
------------------------------|----|||----|||-|--------|------||--  1 [L] COG3449 DNA gyrase inhibitor
---|--------------------------|--------|------|-----|--|||-|||||||  1 [U] COG3451 Type IV secretory pathway, VirB4 components
-----------------|------------|----|---------|--|----------||||---  1 [G] COG3459 Cellobiose phosphorylase
|-|||--------------|||--------||-----|--------|------|||----|||---  1 [R] COG3467 Predicted flavin-nucleotide-binding protein
--|-----|-----|---||----------||----|----------------------||-----  1 [T] COG3476 Tryptophan-rich sensory protein (mitochondrial benzodiazepine receptor homolog)
-------------------|----------|---------------|-----|--|||-||-|-||  1 [U] COG3505 Type IV secretory pathway, VirD4 components
--|---------------------------||-||||-----------|-----------------  1 [Q] COG3527 Alpha-acetolactate decarboxylase
-----------------|------------|-----||---------------------||-||--  1 [G] COG3534 Alpha-L-arabinofuranosidase
|-|-----|---------------------|----------------------------|-||---  1 [S] COG3543 Uncharacterized conserved protein
-------------|----------------||--||-------------|---||----|-|----  1 [R] COG3560 Predicted oxidoreductase related to nitroreductase
------------------------------|||-|--------||-----|---|-----------  1 [K] COG3561 Phage anti-repressor protein
--------------------------|||||----|||----------------------------  1 [S] COG3583 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------|--|-|---------|---|-----------------|------||-|---  1 [G] COG3588 Fructose-1,6-bisphosphate aldolase
------||----------------------||---|||-------|--------------------  1 [S] COG3595 Uncharacterized conserved protein
------------------||-|----||||||||||||-|--------------------------  1 [D] COG3599 Cell division initiation protein
------||---------|------------|||||||-----------------------------  1 [S] COG3601 Predicted membrane protein
|------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|-------  1 [S] COG3610 Uncharacterized conserved protein
--|---------------|-|------||-||||-||------------|-----|---||||---  1 [S] COG3619 Predicted membrane protein
------||----------||------|||||||||----------------------------|--  1 [K] COG3682 Predicted transcriptional regulator
------------------||----------|-|-||||----------------------------  1 [R] COG3688 Predicted RNA-binding protein containing a PIN domain
------------------||----------|-||-|||----------------------------  1 [S] COG3689 Predicted membrane protein
----------------|-||-|--------||---|||-----------|---|||---|||||--  1 [E] COG3705 ATP phosphoribosyltransferase involved in histidine biosynthesis
--------------------|------||||----|-------------|-----|---||-||--  1 [T] COG3707 Response regulator with putative antiterminator output domain
------------------------|-----|-----------|||||-|----------|||||--  1 [S] COG3735 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------||-||-----------||---------------------  1 [L] COG3747 Phage terminase, small subunit
|--------|----------------|---||||||||----------------------------  1 [M] COG3764 Sortase (surface protein transpeptidase)
-------------------|----------|-----------|||||-----|--|------||-|  1 [R] COG3772 Phage-related lysozyme (muraminidase)
------------------------------|-||||-|----|||-|-------------------  1 [G] COG3775 Phosphotransferase system, galactitol-specific IIC component
---------------------------||||----|-----------------------|||||--  1 [S] COG3786 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-||-----|||---------------||||||-|-|-------------|---||-----------  1 [T] COG3830 ACT domain-containing protein
--|--------------|--------|||-|---||||-----------|-----|---||-||--  1 [S] COG3832 Uncharacterized conserved protein
------------------------------|-----||----|||||-|||---------------  1 [KT] COG3835 Sugar diacid utilization regulator
-------------------|----------|-----------------|------|----|-||--  1 [S] COG3837 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain
|||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||---  1 [G] COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components
--||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||--  1 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components
---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||---  1 [R] COG3845 ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase components
------------------||----------|-----||----------------------------  1 [S] COG3854 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------||--|||-----------------------------  1 [G] COG3855 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------||-|-----||----------------------------  1 [S] COG3856 Uncharacterized conserved protein (small basic protein)
------------------------------||||||||----------------------------  1 [L] COG3857 ATP-dependent nuclease, subunit B
------------------------------|||--|||----------------------------  1 [S] COG3859 Predicted membrane protein
-------------------|-|--------|------|----------------------------  1 [S] COG3860 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------|---------------------|-----|-----------------------------  1 [S] COG3863 Uncharacterized distant relative of cell wall-associated hydrolases
-----------------|---|--------|-----------------------------------  1 [S] COG3864 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------|---||--||-------------|-----|---||-|---  1 [S] COG3865 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------|------------|-----||----------------------------  1 [G] COG3866 Pectate lyase
-----------------|------------|-----||-------|--------------------  1 [G] COG3867 Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase
----------------|----|--------|------------------|-----|----------  1 [S] COG3868 Uncharacterized conserved protein
----------------------||------|---||||----------------------------  1 [E] COG3869 Arginine kinase
---------------------|--------|---||||----------------------------  1 [S] COG3870 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|-|--------|---|||----------------------|------  1 [R] COG3871 Uncharacterized stress protein (general stress protein 26)
-----------------|--|---------|----|||----------------------------  1 [R] COG3872 Predicted metal-dependent enzyme
--|-----|--------|------------|-----------------------------------  1 [S] COG3875 Uncharacterized conserved protein
----------------------||------|-----||----------------------------  1 [S] COG3876 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------|---|--------|-----------------------------------  1 [S] COG3877 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------||--------|---|||-----------------------------  1 [S] COG3878 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------------||------|---||||----------------------------  1 [S] COG3880 Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs
---------------------|--------|-----||----------------------------  1 [S] COG3881 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------|||||||--------------------------------  1 [I] COG3884 Acyl-ACP thioesterase
----||||---|------------------|-----------------------------------  1 [S] COG3885 Uncharacterized conserved protein
--|-----------------|-----|---|---|-------------|-------||--------  1 [L] COG3886 Predicted HKD family nuclease
------------------------------||||||||-|--------------------------  1 [T] COG3887 Predicted signaling protein consisting of a modified GGDEF domain and a DHH domain
--------------|----||--------||-|---------------------------|-|---  1 [R] COG3899 Predicted ATPase
-----------------|------------||||||||----------------------------  1 [S] COG3906 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|-|---------------|||------||||----|-----------------------|||||--  1 [T] COG3920 Signal transduction histidine kinase
------------------------------|----||---------|-------------------  1 [K] COG3933 Transcriptional antiterminator
------------------------------||||||||----------------------------  1 [L] COG3935 Putative primosome component and related proteins
------------------------------|---|-|-----------------------------  1 [G] COG3936 Protein involved in polysaccharide intercellular adhesin (PIA) synthesis/biofilm formation
--|---------------||----------|------|----------------------------  1 [S] COG3937 Uncharacterized conserved protein
------------------------------|------|--------|-------------------  1 [R] COG3940 Predicted beta-xylosidase
------||------------------|---|---|-||----------------------------  1 [S] COG3949 Uncharacterized membrane protein
------------------------------|---|-||----------------------------  1 [R] COG3956 Protein containing tetrapyrrole methyltransferase domain and MazG-like (predicted pyrophosphatase) domain
--------------|---||----------||-----------------|----------|||---  1 [G] COG3957 Phosphoketolase
--|----------||------------|||||--|-----------|-------------------  1 [GHR] COG3961 Pyruvate decarboxylase and related thiamine pyrophosphate-requiring enzymes
-------------------|----------||----|------------------|---||-----  1 [M] COG3967 Short-chain dehydrogenase involved in D-alanine esterification of lipoteichoic acid and wall teichoic acid (D-alanine transfer protein)
------------------|--|--------|-----------------------------------  1 [R] COG3968 Uncharacterized protein related to glutamine synthetase
-|----------------------------|-----|-------------------|-|----|--  1 [M] COG3980 Spore coat polysaccharide biosynthesis protein, predicted glycosyltransferase
|--------|--------------------|--|--||----------------------------  1 [S] COG4086 Predicted secreted protein
-------------------|----------|--|--------------||----------------  1 [P] COG4097 Predicted ferric reductase
------------------||----------|---||||----------------------------  1 [P] COG4100 Cystathionine beta-lyase family protein involved in aluminum resistance
------------------||-|----|---||||||------||||||||||||||---|||||--  1 [J] COG4108 Peptide chain release factor RF-3
------------------------------||||||||----------------------------  1 [K] COG4109 Predicted transcriptional regulator containing CBS domains
---------------------|--------|------------|||--------------------  1 [R] COG4110 Uncharacterized protein involved in stress response
--||--------|-|-|-||||----||||||||||||-----------|---||-------|---  1 [R] COG4122 Predicted O-methyltransferase
----------------||--|---------||||||||||--|||||-|-||----||||||||--  1 [R] COG4123 Predicted O-methyltransferase
--|---------------------------|---------------|----------------|--  1 [S] COG4127 Uncharacterized conserved protein
-------------------|-------||-|-------------------|--------|------  1 [S] COG4185 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------|--------|-----|-----------------------|-----  1 [E] COG4187 Arginine degradation protein (predicted deacylase)
------------------------------|--||-|-----------------------------  1 [G] COG4193 Beta- N-acetylglucosaminidase
----|------|--------------|---|----|------------------------------  1 [R] COG4194 Predicted membrane protein
----||-----------|------------|----|------------------------------  1 [S] COG4198 Uncharacterized conserved protein
------------------------------|------|-------------------------|--  1 [S] COG4200 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|---|----------------------------|--  1 [KT] COG4219 Antirepressor regulating drug resistance, predicted signal transduction N-terminal membrane component
--------------------|---------||||||||----------------------------  1 [S] COG4224 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|-----||-------||------------|------  1 [R] COG4225 Predicted unsaturated glucuronyl hydrolase involved in regulation of bacterial surface properties, and related proteins
|-|-|||||-||------------------|------------------------|------||--  1 [C] COG4231 Indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha and beta subunits
------------------||----------|---|-||----------------------------  1 [S] COG4241 Predicted membrane protein
-----------------|--|---------|------------------|-----|----------  1 [S] COG4267 Predicted membrane protein
|-------------------|---------|----------------------------|---|--  1 [R] COG4277 Predicted DNA-binding protein with the Helix-hairpin-helix motif
-------------------|-|--------|-----------------------------------  1 [S] COG4295 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|-|--------|-----------------------------------  1 [S] COG4296 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------|----|------|||-|--|-----|----------  1 [E] COG4302 Ethanolamine ammonia-lyase, small subunit
--------------------|---------|----|------|||-|--|-----|----------  1 [E] COG4303 Ethanolamine ammonia-lyase, large subunit
------------------------------|--------------|-------||-----------  1 [S] COG4304 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|---------------------|--|----------  1 [S] COG4306 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------|------------------|------------------------|---|||----  1 [S] COG4309 Uncharacterized conserved protein
------------------------------|---------------------------||-|----  1 [R] COG4310 Uncharacterized protein conserved in bacteria with an aminopeptidase-like domain
------------------------------||-------------|----------------|---  1 [S] COG4331 Predicted membrane protein
------------------------------|---------------|------------|--|---  1 [S] COG4332 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------||---------------|-----|-----------------------------  1 [E] COG4359 Uncharacterized conserved protein, possibly involved in methylthioadenosine recycling
------------------------------|------|--------------------|-------  1 [S] COG4378 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|----------|-||---|----------------------------  1 [V] COG4403 Lantibiotic modifying enzyme
------------------------------||-|-|||-----|-||-------------------  1 [S] COG4405 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|-----|-----------|-----------------  1 [S] COG4412 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|-------------|-----|---------------  1 [R] COG4416 Mu-like prophage protein Com
------------------------|-----||||-|------------------------------  1 [S] COG4443 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------||||||||----------------------------  1 [K] COG4463 Transcriptional repressor of class III stress genes
------------------------------||||||||----------------------------  1 [K] COG4465 Pleiotropic transcriptional repressor
------------------------------||||||||----------------------------  1 [S] COG4466 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------||-|--||----------------------------  1 [G] COG4468 Galactose-1-phosphate uridyltransferase
------------------------------||||||-|----------------------------  1 [S] COG4472 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------||||-----|--------------------------  1 [S] COG4478 Predicted membrane protein
------------------------------|-||||-|----------------------------  1 [S] COG4481 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------|---|-||----------------------------  1 [R] COG4492 ACT domain-containing protein
------------------------------|---||||--------------|-------------  1 [S] COG4496 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|---||||----------------------------  1 [S] COG4499 Predicted membrane protein
------------------------------|---|-|-----------------------------  1 [S] COG4502 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|---||||----------------------------  1 [S] COG4506 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|------|-|--------------------------  1 [S] COG4508 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|---||-|----------------------------  1 [OTK] COG4512 Membrane protein putatively involved in post-translational modification of the autoinducing quorum-sensing peptide
------------------------------|----|----------|---------------|---  1 [Q] COG4542 Protein involved in propanediol utilization, and related proteins (includes coumermycin biosynthetic protein), possible kinase
-----------------|---|--|-----|-----|---------------|-------------  1 [CP] COG4555 ABC-type Na+ transport system, ATPase component
--|-------------|---||--||----|-----------||||||||||||||||||||||||  1 [M] COG4591 ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component
---|--|||-|-|----|-|-|--||----||||-||-||||-------|-----|---||||---  1 [R] COG4603 ABC-type uncharacterized transport system, permease component
------------------------------||--||------|||-----------------|---  1 [R] COG4626 Phage terminase-like protein, large subunit
-------------------|----------|--|--------------------------------  1 [S] COG4633 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|||--------|---------------------------|-------  1 [R] COG4639 Predicted kinase
--------------------|-----|---|-----------|||||-|--|--------------  1 [R] COG4667 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily
---------------------|--------||-|||||--|-||||||||||---|----------  1 [G] COG4668 Mannitol/fructose-specific phosphotransferase system, IIA domain
------------------------------|-----------|||||--------|----------  1 [G] COG4677 Pectin methylesterase
------------------------------||||-|------------------------------  1 [S] COG4687 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|------------------------|------|---  1 [Q] COG4689 Acetoacetate decarboxylase
------------------------------|||---------|||----------|---|-|||--  1 [S] COG4695 Phage-related protein
------------------------------||||-|------------------------------  1 [S] COG4708 Predicted membrane protein
------------------------------|-||||---------------------------|--  1 [S] COG4709 Predicted membrane protein
---------------------|--------||----------------------------------  1 [S] COG4712 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|||---------------------------------  1 [S] COG4713 Predicted membrane protein
------||----------------------|||||-------------------------------  1 [S] COG4720 Predicted membrane protein
------------------------------|||--|||----------------------------  1 [S] COG4722 Phage-related protein
------------------------------|------------------|-----|----------  1 [S] COG4728 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|----|||----------------------------  1 [R] COG4824 Phage-related holin (Lysis protein)
------------------------------|-||||||----------------------------  1 [S] COG4856 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-----|-----------|---------|---------------------|-------------  1 [O] COG4870 Cysteine protease
-----------------|--|---------|-----------------------------------  1 [S] COG4878 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|-|---------------------------|-----------------------------------  1 [R] COG4892 Predicted heme/steroid binding protein
------------------------------||---|------------------------------  1 [S] COG4905 Predicted membrane protein
------------------------------|||--|------------------------------  1 [S] COG4926 Phage-related protein
----||-----|------------------|-----------------------------------  1 [O] COG4934 Predicted protease
------------------------------|----|----------|-------------------  1 [TK] COG4936 Predicted sensor domain
---|||--||-||----|||||----||||||--||||----|||||--|-----|---|||||--  1 [MR] COG4948 L-alanine-DL-glutamate epimerase and related enzymes of enolase superfamily
------------------||-|--------||--||||----------------------------  1 [R] COG4956 Integral membrane protein (PIN domain superfamily)
||----||-|----------------|||-|--------------|---|-||--|---||-||--  1 [U] COG4962 Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF
--------------------|---|-|||||---||||----|||||-||||||||---|||||||  1 [L] COG4974 Site-specific recombinase XerD
|-|-------|--------|------|---|-----||----------------------------  1 [KT] COG4978 Transcriptional regulator, effector-binding domain/component
------------------||----------|---||||----------------------------  1 [R] COG4980 Gas vesicle protein
------------------------------|--|||||----|||||-|----------|--|---  1 [R] COG4989 Predicted oxidoreductase
------------------------------|-----|----------------------||||---  1 [S] COG4991 Uncharacterized protein with a bacterial SH3 domain homologue
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||--  1 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase
------------------------------|----|-------------------|----------  1 [S] COG4994 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-----------------|---------|----------------------------------|  1 [S] COG4997 Uncharacterized conserved protein
-----------------|||----------|-----------------------------------  1 [S] COG5011 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-----------------|---------|---------------------------|-------  1 [S] COG5015 Uncharacterized conserved protein
-------------|||--------------|-----------------------------------  1 [R] COG5083 Uncharacterized protein involved in plasmid maintenance
-------------|||--------------|-----------------------------------  1 [DZ] COG5184 Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins
------------------------------||-|--------------------------------  1 [R] COG5263 FOG: Glucan-binding domain (YG repeat)
------------------------------||---|-------||-|-----|-------------  1 [S] COG5283 Phage-related tail protein
------------------------------|----------------------------||-|---  1 [S] COG5482 Uncharacterized conserved protein
--|---------------------------|------------------|----------------  1 [S] COG5513 Predicted secreted protein
------------------------------|-----------------------------|||---  1 [S] COG5515 Uncharacterized conserved small protein
------------------------------|---||-----------------|------------  1 [L] COG5527 Protein involved in initiation of plasmid replication
-------------|||---|----------|-----------------------------------  1 [S] COG5542 Predicted integral membrane protein
-----------------|------------|-----||----|||||--|----------------  1 [M] COG5581 Predicted glycosyltransferase
------------------------------|-----||-----------|----------------  1 [S] COG5583 Uncharacterized small protein
------------------------------|------------||----------|---|------  1 [R] COG5614 Bacteriophage head-tail adaptor
--||-------------|---|--------|----|-|-----------------|----------  1 [S] COG5652 Predicted integral membrane protein
------------------------------|---||-|----------------------------  1 [L] COG5655 Plasmid rolling circle replication initiator protein and truncated derivatives
------------------------------|-----||------------------------|---  1 [S] COG5663 Uncharacterized conserved protein