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| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ ---|----------------------------------------------|--||----------- 18 [L] COG3676 Transposase and inactivated derivatives --||||---------------------||-------------|-----|----|||---||-|--- 15 [L] COG3039 Transposase and inactivated derivatives, IS5 family ----------------|-------------------------|||||-||||||||---------- 10 [NU] COG4969 Tfp pilus assembly protein, major pilin PilA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 9 [GEPR] COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily |||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 9 [OC] COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins |||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 8 [QR] COG0500 SAM-dependent methyltransferases ----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||-- 8 [P] COG1629 Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport ||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 6 [K] COG0583 Transcriptional regulator --------------------------|||--|-|---|-|--|||--------|||---||--|-- 6 [L] COG2826 Transposase and inactivated derivatives, IS30 family ||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 5 [M] COG0438 Glycosyltransferase |-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 5 [LR] COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes |-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---||||||| 5 [K] COG1396 Predicted transcriptional regulators --|--------|-------||-----||||--||---|-------|---|---||----||-||-- 5 [L] COG3547 Transposase and inactivated derivatives ||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||-- 4 [L] COG0270 Site-specific DNA methylase |||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-| 4 [KR] COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [J] COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific --|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||-- 4 [E] COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating) |-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [GER] COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily -------------|||||||||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 4 [O] COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase ----||----------||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4 [L] COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein ----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-|||||||||||||||||| 4 [M] COG0845 Membrane-fusion protein ----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||-- 4 [M] COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase --|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|------- 4 [L] COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins ----------------|-||-------------------------|--||--||||---||-||-- 4 [Q] COG2931 RTX toxins and related Ca2+-binding proteins ------------------------------------|-----------|---|||----------- 4 [L] COG2946 Putative phage replication protein RstA ------------------------------------------|||||---||-||----||||--- 4 [MU] COG3468 Type V secretory pathway, adhesin AidA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases -|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||-- 3 [P] COG0038 Chloride channel protein EriC ||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [J] COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase --||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [C] COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases ||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 3 [M] COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis -------------|||--||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 3 [R] COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains |-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 3 [R] COG0546 Predicted phosphatases |-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 3 [T] COG0642 Signal transduction histidine kinase ---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 3 [E] COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein |||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||-- 3 [R] COG0730 Predicted permeases ----------------||||----||----||||-|||----|||||||||||||||||||||||| 3 [M] COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains) -------------|||-----|--------------------|||||-||||-|||||||||||-- 3 [R] COG0790 FOG: TPR repeat, SEL1 subfamily ||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-| 3 [C] COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases --|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||-- 3 [ER] COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases --|---||------------|||||-|-----|||-||----|||-|-||||-||-|||-||---- 3 [E] COG1115 Na+/alanine symporter ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases ||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 3 [C] COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes --||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||-- 3 [L] COG1943 Transposase and inactivated derivatives -----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||-- 3 [K] COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins --|-||--|----||---||||----|||--|||||-|||--|||||-|||--|||---|||||-- 3 [L] COG2801 Transposase and inactivated derivatives ---|----------------|----------|||||||----|||||-||---||-----||||-- 3 [L] COG2827 Predicted endonuclease containing a URI domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3 [J] COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors ------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|-- 3 [U] COG3210 Large exoproteins involved in heme utilization or adhesion |-|----------------------------------------------|---|||--|------- 3 [R] COG3271 Predicted double-glycine peptidase -----------------------------------||-----|-||----|-|-|----------- 3 [S] COG3299 Uncharacterized homolog of phage Mu protein gp47 --||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||-- 3 [E] COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components --------------------------------------------|-----|--||----------- 3 [S] COG4382 Mu-like prophage protein gp16 ------------------------------------------|||||--|---||----------- 3 [P] COG4773 Outer membrane receptor for ferric coprogen and ferric-rhodotorulic acid ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||| 2 [J] COG0009 Putative translation factor (SUA5) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [D] COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control ---------|---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0050 GTPases - translation elongation factors ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0073 EMAP domain |||---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0084 Mg-dependent DNase ||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-| 2 [R] COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) ||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [EH] COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase |||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EG] COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase -|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [J] COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [EH] COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I -|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-- 2 [G] COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase -||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 2 [EH] COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit --||||--|----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit -------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [I] COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases ||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||--- 2 [C] COG0247 Fe-S oxidoreductase ---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [J] COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0254 Ribosomal protein L31 -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 2 [J] COG0257 Ribosomal protein L36 --|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-|| 2 [C] COG0282 Acetate kinase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [IQ] COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase |||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||-- 2 [R] COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [R] COG0313 Predicted methyltransferases --|----------||-|-||-|----||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 2 [S] COG0316 Uncharacterized conserved protein ----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-| 2 [TK] COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases |-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [IQ] COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II --|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|-- 2 [E] COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase |-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 2 [E] COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases |-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-||||||||||||||| 2 [C] COG0372 Citrate synthase --|----------|--|-||------|--|----|-||----|||||--|---|||---|||||-- 2 [R] COG0385 Predicted Na+-dependent transporter -|--|||||||||||-||---|----|---|--|--||----||||||-|--||||||----|--- 2 [E] COG0421 Spermidine synthase --|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-||||||||||||||| 2 [D] COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation |||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [E] COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [O] COG0443 Molecular chaperone ||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [MG] COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases ||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||---- 2 [P] COG0471 Di- and tricarboxylate transporters ||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--|||||||| 2 [G] COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family ||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [R] COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases |||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||-- 2 [O] COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function ---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---||||||| 2 [C] COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes |||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||| 2 [LKJ] COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases ||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 2 [F] COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase |||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [R] COG0517 FOG: CBS domain |||||||||-|||||||-||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [FGR] COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases |------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||| 2 [O] COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit -------------||---||-||||-|---------------||||||||||||||-------|-- 2 [O] COG0545 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 1 |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-| 2 [E] COG0548 Acetylglutamate kinase ---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 2 [K] COG0557 Exoribonuclease R |||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||-- 2 [E] COG0560 Phosphoserine phosphatase --------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [J] COG0566 rRNA methylases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32) ----||-----|------||-|--||||||||--||||----|||||||||||||||||--|||-- 2 [S] COG0586 Uncharacterized membrane-associated protein ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation --||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-|||||||||||||||||| 2 [R] COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) |-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-|||| 2 [P] COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase |||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----|||||||||||||||||||||||| 2 [OU] COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class) -------------|||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [J] COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase --||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [E] COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases ---|---------||||-||-|||--|---------------||||||||||-|||---||||||| 2 [C] COG0633 Ferredoxin ----------------|||||||||||||-|||||||||---|||||||||||||||||||||||| 2 [H] COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases --|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 2 [R] COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase |-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [O] COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family |||---||||------|||||------||-------||----|||||-||--||||||-|||||-- 2 [G] COG0662 Mannose-6-phosphate isomerase |||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--|||||||||||||| 2 [M] COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel |-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---||||||| 2 [O] COG0695 Glutaredoxin and related proteins |-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-|||||||||||||||||| 2 [L] COG0708 Exonuclease III -|||--|||-------|---|-|||-|------|||||----------|-||-||-|||------- 2 [R] COG0733 Na+-dependent transporters of the SNF family --|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||-- 2 [P] COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins ----------------||||||--||||||||--||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 2 [E] COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [M] COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase |||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [C] COG0778 Nitroreductase -----------------|---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [K] COG0782 Transcription elongation factor ------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||-- 2 [M] COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins) -----------------|||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [R] COG0795 Predicted permeases ----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 2 [H] COG0807 GTP cyclohydrolase II --|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-||||||||||||| 2 [ET] COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain ----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [L] COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases ----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||---||-- 2 [M] COG0859 ADP-heptose:LPS heptosyltransferase ------------------||-|----|||-|---||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [P] COG0861 Membrane protein TerC, possibly involved in tellurium resistance ---|---------||-----||----|||-----|-||----||||||||--||||---|||||-- 2 [C] COG1018 Flavodoxin reductases (ferredoxin-NADPH reductases) family 1 --|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 2 [IQR] COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) ----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 2 [R] COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases ----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||-- 2 [CHR] COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases |------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||-- 2 [M] COG1087 UDP-glucose 4-epimerase |-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||-- 2 [M] COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 2 [G] COG1109 Phosphomannomutase --|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--||||||||||||| 2 [E] COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component --||--||--||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [V] COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components ||||----|||||---|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 [V] COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component ---|--||--|-|-----||||--|-|------|---|----|||||-||||-|||--|||||--- 2 [P] COG1178 ABC-type Fe3+ transport system, permease component |-|||||||--||----|||-|----|||||||---||----|||||--|--||||---||-||-- 2 [M] COG1209 dTDP-glucose pyrophosphorylase ------------------|--|------------|||-----|||||-||||||||--|||||--- 2 [S] COG1289 Predicted membrane protein |-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 2 [K] COG1309 Transcriptional regulator -----------------|------------|||-|||-----|||-|-||||-||-|||||-|--- 2 [M] COG1368 Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily -------------------|||----|--||||||||||-|||||||-||||||||--||||||-- 2 [P] COG1393 Arsenate reductase and related proteins, glutaredoxin family -------------||-----|-||------------------|||||-||||||||----|-|--- 2 [E] COG1448 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase ||||--|||-------|---||----|---|-------||--|||||-||--||||||||||||-| 2 [R] COG1451 Predicted metal-dependent hydrolase --|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||-- 2 [H] COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis |||||||||||||--------|----|||-|-----||----|||||-||||-|||---|||||-- 2 [K] COG1522 Transcriptional regulators ---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---||||||| 2 [J] COG1530 Ribonucleases G and E ----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [MU] COG1538 Outer membrane protein ------|------|-----|-------|||||---||--|--|||--------||----------- 2 [G] COG1554 Trehalose and maltose hydrolases (possible phosphorylases) --------------------|-||--||||------------|||||-|||||||||||||||||| 2 [M] COG1560 Lauroyl/myristoyl acyltransferase |--|-------|-||---||-|----|||-----|-|---------------||||---|||||-- 2 [I] COG1562 Phytoene/squalene synthetase ---|||----|||--------|||--|-------||||----||||||||||-|||||||||||-- 2 [I] COG1607 Acyl-CoA hydrolase ---|----||-|---------|---|--------|-||----|||-|-||||-||||||--|---- 2 [C] COG1620 L-lactate permease -------------|||-----|--|||---------------|||||-||||||||---|||||-- 2 [L] COG1643 HrpA-like helicases -------------------|-||||||||||||||||||---|||||-|||||||||||||||||| 2 [D] COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins --------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 2 [M] COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase |--------|--------||-------||||----|||----------|||--||||||||||||| 2 [S] COG1714 Predicted membrane protein/domain ---|--||----|-------|----|----|---|-||-------||-|-||-||-|||------- 2 [C] COG1757 Na+/H+ antiporter --||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 2 [U] COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components --|----------------|||----||||-||||||------||-|--||-||||---|||||-| 2 [I] COG1835 Predicted acyltransferases |||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||-- 2 [K] COG1846 Transcriptional regulators |-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||-- 2 [M] COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes ----||-----|-||----|||----||||||-|||||----|||||--|||||||---||||--- 2 [P] COG1914 Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family ----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 2 [K] COG1959 Predicted transcriptional regulator ---|||--|-||||-----|||----|||||---|-||----|||||-||---|||---|||||-- 2 [I] COG1960 Acyl-CoA dehydrogenases --|-----|---------||-|----||||------||----------||---|||||||||||-- 2 [C] COG2010 Cytochrome c, mono- and diheme variants -----|--|-----------|-----|------|-|--||------|---|||-|-||-|--|--- 2 [L] COG2189 Adenine specific DNA methylase Mod ------------------||-------|||------------|||||-||--||||---|||||-- 2 [P] COG2193 Bacterioferritin (cytochrome b1) ------------------------------------------|||||-|||||||-||||||--|| 2 [R] COG2194 Predicted membrane-associated, metal-dependent hydrolase ----------------|---|-||||-----------|----|||||-||-||||||||||||||| 2 [T] COG2204 Response regulator containing CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains |-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||-- 2 [P] COG2217 Cation transport ATPase -------|------|--|--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---|||---- 2 [F] COG2233 Xanthine/uracil permeases --|-----------|-----|---------|----||||---|||||-||||-||||||-|-||-- 2 [R] COG2249 Putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B) ---|-------|-||----|-|----||||----|-||----|||||-||||-|||---|||||-- 2 [S] COG2259 Predicted membrane protein -|-------------------|-------------|--------|-----|-|||----------- 2 [S] COG2369 Uncharacterized protein, homolog of phage Mu protein gp30 -----------|-||---||-------|||||||-|||----|||||-||-|-|||--||||||-- 2 [E] COG2755 Lysophospholipase L1 and related esterases -------------------|-|----|||-----|||-----|||||-||-|-|||------|--- 2 [P] COG2837 Predicted iron-dependent peroxidase -------------------|-|------------||--------|-----|--||----------- 2 [R] COG2842 Uncharacterized ATPase, putative transposase -|--------------|---|---------------------||||||-|||-||||||---||-- 2 [M] COG2870 ADP-heptose synthase, bifunctional sugar kinase/adenylyltransferase ------------------------------------------||||||||||||||---||||||| 2 [J] COG2913 Small protein A (tmRNA-binding) --------------------|----------||-|--------|--|--||||||----|||||-- 2 [K] COG2932 Predicted transcriptional regulator ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 2 [S] COG3117 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||------------|--||-----|-----|-||-------|||---|-|-|||||-||-|--| 2 [S] COG3177 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||||||-||-|||---------- 2 [M] COG3203 Outer membrane protein (porin) ------------------------------------------------||---|||---|||---- 2 [P] COG3213 Uncharacterized protein involved in response to NO ---------------------------------------------|----||-||-||-|-||--| 2 [M] COG3306 Glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis --|--|--|--|------||-|----|------|---|-----||-|-------||----|-|--- 2 [L] COG3335 Transposase and inactivated derivatives --|---------------------------------------||||---|-|-||----|-|||-- 2 [S] COG3422 Uncharacterized conserved protein ------------------||----------------------|||---|-----|--|-------- 2 [R] COG3596 Predicted GTPase ------------------------------------------|-||----|--||----------- 2 [S] COG3778 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------------------||----|--||----------- 2 [R] COG4228 Mu-like prophage DNA circulation protein --------------------------------------------||----|--||----------- 2 [R] COG4379 Mu-like prophage tail protein gpP --------------------------------------------||----|--||----------- 2 [S] COG4381 Mu-like prophage protein gp46 --------------------------------------------|-----|--||----------- 2 [S] COG4383 Mu-like prophage protein gp29 --------------------------------------------||----|--||----------- 2 [S] COG4384 Mu-like prophage protein gp45 --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 2 [P] COG4607 ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component ------------------------------------------------||--||||---------- 2 [NU] COG4968 Tfp pilus assembly protein PilE --------------------------------------------|-----|---|----------- 2 [R] COG5005 Mu-like prophage protein gpG ------------------------------------------------||--||||---------- 2 [NU] COG5008 Tfp pilus assembly protein, ATPase PilU ||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||-- 1 [H] COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase |||-||--||-|-||-||||-|----|||-||--|||||---|||||--|--||||---|||||-- 1 [P] COG0004 Ammonia permease |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [E] COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase ||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||-- 1 [H] COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase |||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||--- 1 [E] COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0013 Alanyl-tRNA synthetase --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0015 Adenylosuccinate lyase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0018 Arginyl-tRNA synthetase |||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0019 Diaminopimelate decarboxylase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [I] COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase -------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0021 Transketolase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0024 Methionine aminopeptidase ---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [F] COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase) |||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [EH] COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase] ---|--||---|----|-|||------||||----|||----|||||-||--||||---||-||-- 1 [H] COG0029 Aspartate oxidase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation) --||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0031 Cysteine synthase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase |--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [F] COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase -|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||-- 1 [E] COG0040 ATP phosphoribosyltransferase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 1 [H] COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0048 Ribosomal protein S12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0049 Ribosomal protein S7 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0051 Ribosomal protein S10 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0052 Ribosomal protein S2 ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0054 Riboflavin synthase beta-chain --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit |||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EH] COG0059 Ketol-acid reductoisomerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [G] COG0061 Predicted sugar kinase ||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||-- 1 [G] COG0063 Predicted sugar kinase ||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---||||||||||||| 1 [J] COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog) ||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit |||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit ||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0077 Prephenate dehydratase |||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0078 Ornithine carbamoyltransferase |||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0080 Ribosomal protein L11 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0081 Ribosomal protein L1 ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0082 Chorismate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0087 Ribosomal protein L3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0088 Ribosomal protein L4 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0089 Ribosomal protein L23 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0090 Ribosomal protein L2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0091 Ribosomal protein L22 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0092 Ribosomal protein S3 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0093 Ribosomal protein L14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0094 Ribosomal protein L5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0096 Ribosomal protein S8 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0098 Ribosomal protein S5 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0099 Ribosomal protein S13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0100 Ribosomal protein S11 |||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0101 Pseudouridylate synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0102 Ribosomal protein L13 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0103 Ribosomal protein S9 ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0104 Adenylosuccinate synthase |||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [F] COG0105 Nucleoside diphosphate kinase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase --||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0114 Fumarase -|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||---------- 1 [L] COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase -------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0117 Pyrimidine deaminase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0118 Glutamine amidotransferase |||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases ||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||-- 1 [G] COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase ||--|-||--||-|----||-------||-------------|||||-||||-|||---||||--- 1 [R] COG0121 Predicted glutamine amidotransferase ||||--|||||||||||-||-|------------|-||----------||---|||---|||||-- 1 [BQ] COG0123 Deacetylases, including yeast histone deacetylase and acetoin utilization protein |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0124 Histidyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0125 Thymidylate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0126 3-phosphoglycerate kinase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--|||||||| 1 [J] COG0130 Pseudouridine synthase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase -|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 1 [H] COG0132 Dethiobiotin synthetase ||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0133 Tryptophan synthase beta chain ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase ||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0137 Argininosuccinate synthase --||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [F] COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful) ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase ||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase ||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0141 Histidinol dehydrogenase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0143 Methionyl-tRNA synthetase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0148 Enolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [G] COG0149 Triosephosphate isomerase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase ||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [F] COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase ||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---||||||||||||| 1 [J] COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases --------|-||-||-|-||-|----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||-- 1 [P] COG0155 Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein) -|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes ||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||-- 1 [H] COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase ---|---------||---||----------------------|||||-||||-||||||-||-|-- 1 [G] COG0158 Fructose-1,6-bisphosphatase ||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0159 Tryptophan synthase alpha chain -|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase |||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-||| 1 [H] COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0164 Ribonuclease HII ||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0165 Argininosuccinate lyase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase ||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||---- 1 [P] COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components ||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0171 NAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0172 Seryl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase |||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [E] COG0174 Glutamine synthetase -|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [G] COG0176 Transaldolase ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0178 Excinuclease ATPase subunit |||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 1 [Q] COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase ||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-||||||||||||||| 1 [H] COG0181 Porphobilinogen deaminase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0185 Ribosomal protein S19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0186 Ribosomal protein S17 -|||--|||-|||-----||-|---------------|--||||||||||||||||---|||||-- 1 [HJ] COG0189 Glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase) --||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||| 1 [H] COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase -------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||-- 1 [G] COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase -------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0192 S-adenosylmethionine synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase -------------|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0194 Guanylate kinase |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0195 Transcription elongation factor -------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0196 FAD synthase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0197 Ribosomal protein L16/L10E |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0198 Ribosomal protein L24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0199 Ribosomal protein S14 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0200 Ribosomal protein L15 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0201 Preprotein translocase subunit SecY ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0203 Ribosomal protein L17 ||||||||||------||||||--||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0206 Cell division GTPase |||-----||---|||----||----||||||||||||-|||||||||||||||||---|||||-- 1 [F] COG0207 Thymidylate synthase ---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-||| 1 [F] COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit |-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0211 Ribosomal protein L27 |--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase --|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0216 Protein chain release factor A -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0217 Uncharacterized conserved protein -|||--||||---|--||--|---------|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0218 Predicted GTPase ------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class) -------------||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase |-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0221 Inorganic pyrophosphatase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0222 Ribosomal protein L7/L12 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit |-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 1 [O] COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase -------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0227 Ribosomal protein L28 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0228 Ribosomal protein S16 |-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||-- 1 [O] COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase -------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0230 Ribosomal protein L34 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0233 Ribosome recycling factor --|----------||-||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10) --|----------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [IQ] COG0236 Acyl carrier protein ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0237 Dephospho-CoA kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0238 Ribosomal protein S18 -|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [D] COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation |-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase -|--||-------|||--|-|------||-|-----------|||||||||||||||||---||-- 1 [E] COG0241 Histidinol phosphatase and related phosphatases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0244 Ribosomal protein L10 ----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase --|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-|||||||||||||||||| 1 [FP] COG0248 Exopolyphosphatase --||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family) |||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0250 Transcription antiterminator |||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|---- 1 [EJ] COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D ||------||------|||||-||--|||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0253 Diaminopimelate epimerase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0255 Ribosomal protein L29 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0256 Ribosomal protein L18 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) -------------||---||-|-----|||------------|||||-|||-||||---|||||-- 1 [H] COG0259 Pyridoxamine-phosphate oxidase ------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-|||||||||||| 1 [E] COG0260 Leucyl aminopeptidase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0261 Ribosomal protein L21 --|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-| 1 [H] COG0262 Dihydrofolate reductase --|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [E] COG0263 Glutamate 5-kinase --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0264 Translation elongation factor Ts |-||------||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain ------------------||-|----||||-||||||||||||||||-||||||||---|||||-| 1 [L] COG0266 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0267 Ribosomal protein L33 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0268 Ribosomal protein S20 ---|---------||---||----------------------||||||||||||||---||||||| 1 [T] COG0271 Stress-induced morphogen (activity unknown) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II) ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis ----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase) ---|---------|||--||----------------------||||||||||||||---||||||| 1 [O] COG0278 Glutaredoxin-related protein -|--||----------|-|-|------||-|-----------||||||||||-||-|||---|--- 1 [G] COG0279 Phosphoheptose isomerase --||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-||||||||| 1 [C] COG0280 Phosphotransacetylase --|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [C] COG0281 Malic enzyme ---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---||||||| 1 [F] COG0283 Cytidylate kinase |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase ---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [H] COG0285 Folylpolyglutamate synthase ||||---||----------|-------||--|||||--|||-|||-|-|||||||||||-||-|-| 1 [V] COG0286 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit ||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0287 Prephenate dehydrogenase |--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG0288 Carbonic anhydrase |||-----||------||||--||--|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0289 Dihydrodipicolinate reductase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3) -------------|--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0291 Ribosomal protein L35 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0292 Ribosomal protein L20 ||||||--||---|||--------||----------------||||||||||||||---||||||| 1 [J] COG0293 23S rRNA methylase |||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes --||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [F] COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0305 Replicative DNA helicase ||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|--- 1 [P] COG0306 Phosphate/sulphate permeases ---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0307 Riboflavin synthase alpha chain --|-||----||-|||--||-|----||||-|||--------|||||-||||||||---|||||-- 1 [E] COG0308 Aminopeptidase N ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase ---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 1 [H] COG0320 Lipoate synthase ----------|--||---||-|----||||------------||||||||||||||---||||||| 1 [H] COG0321 Lipoate-protein ligase B |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex --||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---||||||| 1 [L] COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase) -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase --|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [R] COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold ||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||------- 1 [S] COG0327 Uncharacterized conserved protein ---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0328 Ribonuclease HI |||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [EM] COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase |||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase ----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0333 Ribosomal protein L32 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0335 Ribosomal protein L19 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase ----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0337 3-dehydroquinate synthetase -------------||---||-|----|---------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [E] COG0339 Zn-dependent oligopeptidases ||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0341 Preprotein translocase subunit SecF ||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0342 Preprotein translocase subunit SecD |||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase ----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||-- 1 [S] COG0344 Predicted membrane protein |-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [E] COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase |||-----||------||||-|----|||-||---||-----|||||-||||||||---|||||-- 1 [E] COG0347 Nitrogen regulatory protein PII -||-||--||-|------||----------|-----------|||-|-||||-|||||||||||-- 1 [C] COG0348 Polyferredoxin ||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-| 1 [L] COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase |||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase --|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0352 Thiamine monophosphate synthase ----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) -------------||-|-||-|----||||------------||||||||||||||---||||||| 1 [R] COG0354 Predicted aminomethyltransferase related to GcvT --|----------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit) --|----------|--|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0358 DNA primase (bacterial type) --------------|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0359 Ribosomal protein L9 -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0360 Ribosomal protein S6 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1) -------------|||-|||--||||||||-|-||||-----|||||||-||-||----||||--- 1 [G] COG0362 6-phosphogluconate dehydrogenase -------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase -------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase -------------|||--||--||----------|-||----||||||||--|||----|-|-|-- 1 [P] COG0369 Sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein) ||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||------- 1 [H] COG0373 Glutamyl-tRNA reductase --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases ||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||-- 1 [H] COG0379 Quinolinate synthase ||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----|| 1 [M] COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase |||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases -------------|||--|-|-----|---|||||||||---|||||--|--||||-------|-- 1 [O] COG0386 Glutathione peroxidase |-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||-- 1 [R] COG0388 Predicted amidohydrolase --||-------|-||---|||-----|||-|||||||||||||||||-||-|-|||---|||||-- 1 [L] COG0389 Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair |-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||-- 1 [T] COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase ||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||-- 1 [M] COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG0403 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), N-terminal domain ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--||||---|||||-- 1 [E] COG0404 Glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase) ----||----||||||--||||----|||-----|-||----|||-|-||--||||||-||-||-- 1 [E] COG0405 Gamma-glutamyltransferase --|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase ---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase -------------||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG0414 Panthothenate synthetase |-||-------|-|----||------|-----|-||------||||||||----|----|--||-- 1 [L] COG0415 Deoxyribodipyrimidine photolyase ----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||-- 1 [I] COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme -------------||---|-----------------------||||||||---||||||||----- 1 [F] COG0418 Dihydroorotase ||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||-- 1 [H] COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC ||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||-- 1 [O] COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation ||||--||--||||||||-|-|---||||------|------|||-|--|---|||--|-|----- 1 [P] COG0428 Predicted divalent heavy-metal cations transporter -------------|-|--||----------------------|||||-||---|||---------- 1 [R] COG0429 Predicted hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold ---|---------||---||-|----|||--|||||||--|||||||-||-|-|||---||-||-- 1 [R] COG0431 Predicted flavoprotein |||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0439 Biotin carboxylase |||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||-- 1 [E] COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0441 Threonyl-tRNA synthetase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0442 Prolyl-tRNA synthetase -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division ||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains |||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase ||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||-- 1 [R] COG0456 Acetyltransferases |||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [R] COG0457 FOG: TPR repeat ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ) ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family) |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0460 Homoserine dehydrogenase |||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [F] COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase |||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| 1 [FE] COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0465 ATP-dependent Zn proteases --|----------||-||--||||||----|-----|||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0468 RecA/RadA recombinase -|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||-- 1 [G] COG0469 Pyruvate kinase |||||||||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0470 ATPase involved in DNA replication ||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-|| 1 [M] COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase |||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--|||||||| 1 [CE] COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase |||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-|||||||||||||| 1 [P] COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components |-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2 ||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0480 Translation elongation factors (GTPases) -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0481 Membrane GTPase LepA -------------||-||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain |-||||-------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain -------------||-||||||||||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0486 Predicted GTPase ||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [D] COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning ||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0492 Thioredoxin reductase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0495 Leucyl-tRNA synthetase ||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||-- 1 [R] COG0496 Predicted acid phosphatase ----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0497 ATPase involved in DNA repair |||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0498 Threonine synthase |||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||-- 1 [H] COG0502 Biotin synthase and related enzymes ||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||--- 1 [F] COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase) ||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||-- 1 [EF] COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit ---|---------||---||-|----|||-----|-||----|||||--|-|-|||||||||||-- 1 [E] COG0506 Proline dehydrogenase -|-----------||----|-|||-|-||-||||||||-|--|||||||||||||---|||||--- 1 [L] COG0507 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member ---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||-- 1 [E] COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding) |||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0511 Biotin carboxyl carrier protein ||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [EH] COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II --|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||-- 1 [L] COG0514 Superfamily II DNA helicase |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain |||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [F] COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins --|----------||-|-||||----|||-----|-||----|||||-||--||||||-|||||-- 1 [R] COG0523 Putative GTPases (G3E family) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0525 Valyl-tRNA synthetase |||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0527 Aspartokinases |||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0528 Uridylate kinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase) |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity ||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-- 1 [V] COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0536 Predicted GTPase -------------||-||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0539 Ribosomal protein S1 |||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||-- 1 [F] COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0541 Signal recognition particle GTPase |||-||||||-|-||-||--|---|-|||-||-|-|||----|||||-||---|||---|----|| 1 [HC] COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor) ||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0550 Topoisomerase IA |||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||------- 1 [L] COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0552 Signal recognition particle GTPase ||||||||||||------||-|-----||-|------|----|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG0555 ABC-type sulfate transport system, permease component |-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex |-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase |-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|--- 1 [R] COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily --||--|||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [F] COG0563 Adenylate kinase and related kinases ||||||--||-||-----||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-| 1 [J] COG0565 rRNA methylase -------------||------|||--||||----|-||----||||||||||||||---||||||| 1 [C] COG0567 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, and related enzymes ||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||---- 1 [P] COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0571 dsRNA-specific ribonuclease |||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--|||||||||||||| 1 [G] COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [I] COG0575 CDP-diglyceride synthetase |-||||-------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein) ||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||-- 1 [V] COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component ----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||-- 1 [R] COG0579 Predicted dehydrogenase |||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0582 Integrase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit --|----------||-----|-||||||||||||||------||||||--||||||----||||-- 1 [G] COG0588 Phosphoglycerate mutase 1 |||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---||||||| 1 [T] COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins --|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---||||||| 1 [FJ] COG0590 Cytosine/adenosine deaminases |-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-|| 1 [ER] COG0591 Na+/proline symporter |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog) -----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||| 1 [J] COG0594 RNase P protein component ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [MU] COG0597 Lipoprotein signal peptidase |||-||--||-|-||--||--|----|||--|---|||-------|---||-||||---|||||-- 1 [S] COG0599 Uncharacterized homolog of gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit ||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG0602 Organic radical activating enzymes |||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase |-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [P] COG0605 Superoxide dismutase |--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-| 1 [O] COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity ||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease |||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|-- 1 [H] COG0611 Thiamine monophosphate kinase ||||----|--||---||||-|--------|------|----|||||-||||-|||---------- 1 [R] COG0613 Predicted metal-dependent phosphoesterases (PHP family) |||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||-- 1 [E] COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent) |||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0621 2-methylthioadenine synthetase ----------------|-||-|||---|||-|--||||----|||-||-|||-||||||||||||| 1 [I] COG0623 Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH) -|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases -------------||---||------------||--------|||||-||||||||---||||||| 1 [O] COG0625 Glutathione S-transferase -------------|----||------||||-|||||------|||||--|||-|||---|||||-- 1 [R] COG0627 Predicted esterase ||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0628 Predicted permease -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0629 Single-stranded DNA-binding protein -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit ----------------||--||----||||||-|||||||||||||||||||||||---|||||-- 1 [F] COG0634 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase ||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K -|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||-- 1 [T] COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases |||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||-- 1 [K] COG0640 Predicted transcriptional regulators |||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||-- 1 [C] COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins) --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7 ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase) -------------||---||-|----|||-----|-||----|||||-||-|||||---||||||| 1 [HC] COG0654 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases ----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-| 1 [R] COG0658 Predicted membrane metal-binding protein |-||||-----|-||---||-------||||------|----|||||-||-|||||---||||||| 1 [R] COG0661 Predicted unusual protein kinase |||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--|||||||| 1 [R] COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily -------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [T] COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases ----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-|||| 1 [R] COG0666 FOG: Ankyrin repeat ----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase -------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-||||||||||||| 1 [R] COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH --------|---|||--||||---|---------|||-----||||---|-|-||---|--|--|| 1 [P] COG0672 High-affinity Fe2+/Pb2+ permease -------------||---||-------------------------|--|-||-|||---|||||-- 1 [O] COG0678 Peroxiredoxin ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0681 Signal peptidase I ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase --|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||-- 1 [E] COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase ||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-|| 1 [I] COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase |---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---||||||| 1 [J] COG0689 RNase PH ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0690 Preprotein translocase subunit SecE ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG0691 tmRNA-binding protein -------------|||----||||-|||||-||||||||||||||||||||||||||||||----- 1 [L] COG0692 Uracil DNA glycosylase --|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG0703 Shikimate kinase -------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG0706 Preprotein translocase subunit YidC --|------|-|----||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase ||||||-|||||-||-|-----||-------||||||-----|||-|------||----------- 1 [E] COG0710 3-dehydroquinate dehydratase --|-------------|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b -------------||-|||||-----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [C] COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein) --||||------|---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0713 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K) |||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-||||||||||||||||| 1 [F] COG0717 Deoxycytidine deaminase -----------------|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [H] COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase ||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---||||||||||||| 1 [J] COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit -------------||----|-|----|----|-|--------||||||||||||||------||-- 1 [E] COG0722 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase --||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--|||||||||||||| 1 [C] COG0723 Rieske Fe-S protein ----------------|||||||||||||||-----------|||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor ----------------|---|---------------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [M] COG0729 Outer membrane protein -------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||| 1 [I] COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase) -------------|----------------------|-----|||-|---|-|||-|||--|-|-- 1 [G] COG0738 Fucose permease ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [OU] COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases -----------------|||||||||||||||||||||-|--|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0742 N6-adenine-specific methylase ----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|-- 1 [I] COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase -----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [M] COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein) ----------------||||||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [TK] COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain |||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||-- 1 [H] COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains |||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1 ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit ----------------|||||-||-------|||-|||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit -------------||------|----|-------||||----|||||-||||-||||||||||--- 1 [P] COG0753 Catalase --|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component -------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-||||||| 1 [F] COG0756 dUTPase ----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-| 1 [LU] COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake ----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||- 1 [S] COG0759 Uncharacterized conserved protein ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [IM] COG0761 Penicillin tolerance protein ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0763 Lipid A disaccharide synthetase ----------------||||||||------||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [I] COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [Q] COG0767 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2 |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase |||------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase |--------|------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0772 Bacterial cell division membrane protein ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase --|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||-- 1 [F] COG0775 Nucleoside phosphorylase ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit ----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------|-|---||||-------------||-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG0781 Transcription termination factor ------------------|-|-----|-------|-------|||||-|||--||-||-------- 1 [E] COG0786 Na+/glutamate symporter --------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0787 Alanine racemase --|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [K] COG0789 Predicted transcriptional regulators ----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||-- 1 [L] COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase ----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0793 Periplasmic protease |||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation ----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [M] COG0796 Glutamate racemase ----------------|-||----||----|-----------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG0797 Lipoproteins |-|---|-|----|---|||------|||-|----||--------------|--|----|------ 1 [P] COG0798 Arsenite efflux pump ACR3 and related permeases ----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein -----------------|||----|-----||||--||----|||||-||||||||||-|||||-- 1 [G] COG0800 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase -------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [H] COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase ----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG0802 Predicted ATPase or kinase |-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-|| 1 [P] COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin --||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC ----------------||||||--||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing ----------------||||||---|----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase) ----------------|--||---------------------|||||-||||||||||||||||-- 1 [M] COG0810 Periplasmic protein TonB, links inner and outer membranes |-|------|------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0811 Biopolymer transport proteins ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase -------------|||------||--|---------------|||||-||||-||-|||------- 1 [E] COG0814 Amino acid permeases ----------------||||-|||||||||------------|||||-||||-||||||||||||| 1 [M] COG0815 Apolipoprotein N-acyltransferase ----------------||||||||--|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis) -----------------||||||||-||||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit -----------------|||-|--------||||||||----|||||-|||||||||||||||--- 1 [M] COG0818 Diacylglycerol kinase ----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||-- 1 [R] COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme ----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis --||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||| 1 [C] COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation |-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [R] COG0824 Predicted thioesterase ----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [I] COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit |||------|-|----|--|||--------||||||||----|||||-||||-|||||||||---- 1 [O] COG0826 Collagenase and related proteases ----------------|-||--||||----|||||||||-|||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0828 Ribosomal protein S21 ------------------||----------------------|||||--|--||||||-|||||-- 1 [G] COG0837 Glucokinase --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0838 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 3 (chain A) --||||--|--||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0839 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J) --|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [V] COG0841 Cation/multidrug efflux pump ----------------|-||||||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [U] COG0848 Biopolymer transport protein ---------|------||--||--||----||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [D] COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division ----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||--- 1 [D] COG0850 Septum formation inhibitor ------------------||||--------------------||||||||--||||||-||||--- 1 [D] COG0851 Septum formation topological specificity factor --|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit ----------------||||-|----|||||---||||----|||||--|--||||||||--||-- 1 [H] COG0853 Aspartate 1-decarboxylase ----------------|-||----------------------|||||-||--||||||||||||-- 1 [H] COG0854 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein --|---------------||-|-----||||------|----|||||-||--||||||||||||-- 1 [P] COG0855 Polyphosphate kinase ---|----|---------||-|-----||-------------||||||||||-||-|||------- 1 [R] COG0857 BioD-like N-terminal domain of phosphotransacetylase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG0858 Ribosome-binding factor A -|||||----|----------|---||---|-----|-|----||-|---|---|-|||----|-- 1 [V] COG1002 Type II restriction enzyme, methylase subunits ---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||-- 1 [E] COG1003 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), C-terminal domain --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1005 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 1 (chain H) --||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1007 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N) --||||----------|-||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1008 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M) --||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--|||||||||||||| 1 [CP] COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit ||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||-- 1 [R] COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily) ----||-----------|-|------|---|-----||----|||||-||||-||-||||-|---- 1 [E] COG1027 Aspartate ammonia-lyase ----------------||||-|-----||-|-----------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1034 NADH dehydrogenase/NADH:ubiquinone oxidoreductase 75 kD subunit (chain G) -|||||||||||-------|----------------------|||||-||---||-----|-|--- 1 [C] COG1042 Acyl-CoA synthetase (NDP forming) ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase ----------------|-|||-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase --||----------|--|||------||||||||||||----||||||||||-|||||||||||-- 1 [E] COG1045 Serine acetyltransferase |||||||||||||-------||--|-----------------|||||-|||||||||||------- 1 [O] COG1047 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2 --||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---||||||| 1 [C] COG1048 Aconitase A ------------------||----------------------|||||-||-|||||||||------ 1 [C] COG1049 Aconitase B ||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [C] COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit ----|||||-|||----||||-||---|||----||||----||||--||---|||--||--|--- 1 [P] COG1055 Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases -------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||-- 1 [H] COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase ---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||-- 1 [R] COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA -----------|-||---||------||||-------|----|||||--||--|||---|||||-- 1 [C] COG1062 Zn-dependent alcohol dehydrogenases, class III --|-||----|||||---||------||||-||||-||----|||-|--|--|||||||||||--- 1 [R] COG1064 Zn-dependent alcohol dehydrogenases ----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease --------------------|-||||-||-||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains) -------------|||--|-----------------------||||||||||-|||--|||||||| 1 [O] COG1076 DnaJ-domain-containing proteins 1 --------------------||||-||---||||||||-|||||||||||||||||------||-- 1 [G] COG1080 Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria) -|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-|||||| 1 [MG] COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases |-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-|||| 1 [M] COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase -|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||--- 1 [R] COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases --|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-||||||||||||| 1 [E] COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes |-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 1 [P] COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components ------------------||-------||--------|----|||||-||--||||||||||||-- 1 [P] COG1118 ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component |-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-|| 1 [P] COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [Q] COG1127 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component |-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||-- 1 [V] COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 1 [GM] COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component ------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component ----------------||||||||||----------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component |--|||--|-|||-------||---------|----||----|||------|-||||||------- 1 [C] COG1139 Uncharacterized conserved protein containing a ferredoxin-like domain |||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--|||||||||||||| 1 [C] COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I) |||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|--- 1 [C] COG1145 Ferredoxin ----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||-- 1 [HI] COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase ----------------||--|||||||||||---||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [K] COG1158 Transcription termination factor ----------------||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1159 GTPase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1160 Predicted GTPases -||---||-|||||||-||||----|----||||||||||||------|----||----------- 1 [R] COG1161 Predicted GTPases --|-------------|||||----||||||||||||||||||||||-||||||||------|--- 1 [R] COG1162 Predicted GTPases ------------------||-|--------------------|||||-||-||||-|||------- 1 [E] COG1166 Arginine decarboxylase (spermidine biosynthesis) ---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [E] COG1171 Threonine dehydratase ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||-- 1 [E] COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I ---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||-- 1 [E] COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II -------------||-----|---------|---|-||----|||||-|||||||||||------- 1 [H] COG1179 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 1 --|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes ||||----||---||-----|-||-|-||||-----||-----------|--|||||||||||-|| 1 [I] COG1183 Phosphatidylserine synthase -------------||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase) -------------||-|||||||||||||||||-||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1186 Protein chain release factor B -----------------|--|-----|---||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 1 [J] COG1188 Ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit (S4 paralog) --|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||----- 1 [J] COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II) ||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--|||||||||||||| 1 [D] COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning |--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [L] COG1194 A/G-specific DNA glycosylase -||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||-- 1 [D] COG1196 Chromosome segregation ATPases -----------------|||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [LK] COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) ----------------||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase ||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|-- 1 [KL] COG1199 Rad3-related DNA helicases ----------------||||||--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [LK] COG1200 RecG-like helicase ----------------||||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains) |||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||-- 1 [MJ] COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon) |||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||-- 1 [M] COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase ------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1212 CMP-2-keto-3-deoxyoctulosonic acid synthetase ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone ------------------||||----||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [T] COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response -------------|--||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [O] COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit --||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-| 1 [O] COG1225 Peroxiredoxin ||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-|||||||||||||| 1 [P] COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component --|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||-- 1 [P] COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component -||------|------|-------------------------|||||-||||||||--|||||||| 1 [S] COG1238 Predicted membrane protein --||------------|----|-----|||------||----||||||||-|-|||---------- 1 [E] COG1246 N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferases --||---------||-|||||||||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains --|-----------|---||--||---||-------||----------||-|||||---|||||-- 1 [S] COG1262 Uncharacterized conserved protein |||---||-||-|---|---|-----------|--|||----|||||-||||-||||||-----|| 1 [I] COG1267 Phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins -------------|||----||--|||||-||||||||----|||||-||--|||----|||||-- 1 [R] COG1272 Predicted membrane protein, hemolysin III homolog ---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---||||||| 1 [K] COG1278 Cold shock proteins ----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family ------------------||-------|||------------|||||-||||-|||---||||||| 1 [C] COG1282 NAD/NADP transhydrogenase beta subunit ------------------------||-----|||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG1286 Uncharacterized membrane protein, required for colicin V production ---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--|||||||||||||| 1 [C] COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex ---|--------------------|-|||-----||||----|||||-||||-||-----|----- 1 [M] COG1292 Choline-glycine betaine transporter --|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-|||||||||||||||||| 1 [S] COG1295 Predicted membrane protein --|-----|-----------||----|----|-|||||----|||||-||||-|||||-||||--- 1 [E] COG1296 Predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance) ---|--|------|-------------||--------------------||-||||--|----|-- 1 [S] COG1297 Predicted membrane protein |||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----||||||| 1 [C] COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases ----------------|-|||||||||||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG1314 Preprotein translocase subunit SecG ----------------------||-------|||-----|--|||||-||||||||---||||||| 1 [S] COG1322 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [K] COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains ----------------------||-|-||-------------|||||||||||||----------- 1 [L] COG1330 Exonuclease V gamma subunit ----------------|-||------||||------||---------------|||---------- 1 [O] COG1333 ResB protein required for cytochrome c biosynthesis --|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||-- 1 [Q] COG1335 Amidases related to nicotinamidase --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 1 [M] COG1346 Putative effector of murein hydrolase ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 1 [C] COG1347 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrD ----------------||--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---||||--- 1 [KG] COG1349 Transcriptional regulators of sugar metabolism -||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [S] COG1354 Uncharacterized conserved protein --||--------------|-||----|||-||-|-||-----|||||-||-|-|||---||-||-- 1 [S] COG1359 Uncharacterized conserved protein |||-----||---||-||||-|----||||||--||||-----------|---|||---|||||-- 1 [E] COG1364 N-acetylglutamate synthase (N-acetylornithine aminotransferase) -----------------|||------|||||-----||----|||-|-||---|||---||||--- 1 [S] COG1376 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|---- 1 [R] COG1380 Putative effector of murein hydrolase LrgA ------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---||||||| 1 [L] COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway) ----------------||||||--||||||||||||||||--|||||||||||||||||||||||| 1 [S] COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-|||||--------|||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||-- 1 [K] COG1386 Predicted transcriptional regulator containing the HTH domain ----------------|---------||||------------|||||-||||-|||---|||||-- 1 [OT] COG1391 Glutamine synthetase adenylyltransferase ----------------||||-|----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [R] COG1399 Predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein --||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|--- 1 [O] COG1404 Subtilisin-like serine proteases ||||--||||------|-||-|--|-|---------------------||----|-||||||||-- 1 [S] COG1432 Uncharacterized conserved protein ----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---||||||| 1 [S] COG1434 Uncharacterized conserved protein ----------------|-------||----------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1452 Organic solvent tolerance protein OstA ----||||---|-|---------------------|||----|||-|--|-|-||----------- 1 [F] COG1457 Purine-cytosine permease and related proteins ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||-- 1 [NU] COG1459 Type II secretory pathway, component PulF ----------------|-||-|--------------------|||||--|---|||-------|-- 1 [M] COG1462 Uncharacterized protein involved in formation of curli polymers ----------------|-||-------|||------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [Q] COG1463 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, periplasmic component --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen ----------------||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG1466 DNA polymerase III, delta subunit ||||||||||--|----|----------------|-||-----------|--||||---------- 1 [S] COG1469 Uncharacterized conserved protein -----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---||||||| 1 [G] COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases ||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--|||||||||||||| 1 [K] COG1475 Predicted transcriptional regulators -|||--|----------|-||-----|---|----|--||---|||--|--|--|-|||------- 1 [S] COG1479 Uncharacterized conserved protein -------------||------|-----||-------------|||||-||--||||---||||||| 1 [R] COG1485 Predicted ATPase --|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||--- 1 [H] COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase -------------||-||--||----|||-||||||||----|||||-||||-|||---------- 1 [J] COG1490 D-Tyr-tRNAtyr deacylase ---------|----------|---|-----||||||||||||----------||||---|||||-- 1 [T] COG1493 Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism ---------------------|||------------||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG1495 Disulfide bond formation protein DsbB ----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--|||||||| 1 [S] COG1496 Uncharacterized conserved protein ----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-||||||| 1 [I] COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes ------||-----------|-|----|||------------------------||-------|||| 1 [E] COG1505 Serine proteases of the peptidase family S9A ----------------|-----||||----|----|||----|||||-||--||||||||||||-- 1 [K] COG1508 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma54 homolog |||-|||-|||||---||-||------||---|--|-|----|||||----|--|---|------- 1 [L] COG1518 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1519 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase ----------------||||||--||-||||----|||-|---------|--|||||||----|-- 1 [K] COG1521 Putative transcriptional regulator, homolog of Bvg accessory factor ||-|--||-|---||-|--|------|-------|-|--|||-------|||-||---|||||--- 1 [L] COG1525 Micrococcal nuclease (thermonuclease) homologs ||||--||||-||-------|---------||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [J] COG1534 Predicted RNA-binding protein containing KH domain, possibly ribosomal protein -------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [H] COG1539 Dihydroneopterin aldolase ------||------------||----|--|----|-||----|||||-|||--|||--||------ 1 [R] COG1540 Uncharacterized proteins, homologs of lactam utilization protein B ---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||-- 1 [R] COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced) ---|----|-----------||---------|----||----|||------|-||||||------- 1 [S] COG1556 Uncharacterized conserved protein ----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [R] COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein ----------------||--|----|----|----|||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [S] COG1561 Uncharacterized stress-induced protein ----------------|-||--------------------------------|||||||||||||| 1 [S] COG1565 Uncharacterized conserved protein ----------------|-----------------|-|-----|||||-|||--|||---||||||| 1 [V] COG1566 Multidrug resistance efflux pump -----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG1570 Exonuclease VII, large subunit --|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--||||||||||||| 1 [L] COG1573 Uracil-DNA glycosylase -----------------|--||--------||||||||||--|||||-||||||||||||||||-- 1 [S] COG1576 Uncharacterized conserved protein ||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||--- 1 [H] COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase ------------------||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||---||||||| 1 [M] COG1589 Cell division septal protein -----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [K] COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog ----------------||||----------------------|||-|-||-|||||--||||||-- 1 [M] COG1596 Periplasmic protein involved in polysaccharide export |-|||---|--------|||-------------|--------||||--------|--|--|-||-| 1 [S] COG1598 Uncharacterized conserved protein ||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||-- 1 [E] COG1605 Chorismate mutase -------------|---|--------|||-|----|||----------||--||||--|||||--- 1 [S] COG1610 Uncharacterized conserved protein --|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||-- 1 [R] COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein ------------------||-------|||-------|----|||||--|--||||---|||||-- 1 [P] COG1613 ABC-type sulfate transport system, periplasmic component ----||------------||||--|-----||-|-|||-|--|||-|-||---|||--------|| 1 [V] COG1619 Uncharacterized proteins, homologs of microcin C7 resistance protein MccF ----------------||--|---------|||-|---------------|||||-|||-----|| 1 [S] COG1636 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||||--|||-|||-|---|------||-|---||||----||||||||--|||----|||||-- 1 [H] COG1648 Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain) ---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-|||||||||||||||||| 1 [O] COG1651 Protein-disulfide isomerase -------------------|-|--||---------||-----|||-|-||-|||||---|||||-- 1 [S] COG1652 Uncharacterized protein containing LysM domain --------------------||----||||||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [R] COG1660 Predicted P-loop-containing kinase ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG1663 Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase -|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-||||||||||||| 1 [J] COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins ---------------------|||--||||------------|||||-||||||||---||||||| 1 [K] COG1678 Putative transcriptional regulator --|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-|||||| 1 [GM] COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component -------------||----||---|-----|||||||------------|---||-|-|-|----- 1 [M] COG1696 Predicted membrane protein involved in D-alanine export ---------||-|---||||-|----||||-|||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [T] COG1702 Phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase ||||--|||||||----|------------------------|||||-||||-||-------||-- 1 [S] COG1720 Uncharacterized conserved protein -----------------|-|||----||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG1722 Exonuclease VII small subunit ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 1 [C] COG1726 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrA ----------------|-------------------------|||||-||--||||---||||||| 1 [S] COG1729 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------|-----||||----|-----||----||||||||||||||--|||||||| 1 [T] COG1734 DnaK suppressor protein -----------------|--------|---||||||||-|--|||||-||||-|||---|||||-- 1 [K] COG1737 Transcriptional regulators --||----|-|-|----|--||||-||-------|-|-----|||||-||||-||----||||--- 1 [S] COG1738 Uncharacterized conserved protein --||---------||--|--||---||---||||||||||--|||-|-||||-|||||||||---- 1 [S] COG1739 Uncharacterized conserved protein -------------||||||-|---|--|||-|----||----|||-|-||--||||---||||||| 1 [R] COG1752 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily ---------------------|-----||---|||-||------------||-||----------- 1 [S] COG1755 Uncharacterized protein conserved in bacteria ||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [K] COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega --------------------||----||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||-- 1 [E] COG1760 L-serine deaminase --------------------|-|||||---||||||||-||||||||-||||-|||---|||||-- 1 [GT] COG1762 Phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain (Ntr-type) -||-||||-|-||---||---|----|||-|----|-|--|||||||-||---|||---||-||-- 1 [O] COG1765 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation ||-----||--------||||---|--||-|-----------|||-|--|--||||-------|-- 1 [C] COG1773 Rubredoxin --|-------------|---|---------------------|||||-|||||||||||------- 1 [R] COG1778 Low specificity phosphatase (HAD superfamily) |||||||||||||----|------------|-----------|||||||----||----------- 1 [F] COG1781 Aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit |||||||||||||||||----------||-------||----------|||--||---|||-||-- 1 [L] COG1793 ATP-dependent DNA ligase ----|------|-----|--||----|||-|||-||||----|||||-||---|||---|||||-- 1 [K] COG1802 Transcriptional regulators ------------------||--||---------------------|--||||-||-------|--- 1 [C] COG1805 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrB ---------------------|------------||||----|||||-||--||||---||||||| 1 [S] COG1806 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------|||-------|-|||---------|-----|-----|||||--|--||||---|||||-- 1 [M] COG1807 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family ----------------||||-|||||||||----||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [J] COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc) |||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||--- 1 [C] COG1838 Tartrate dehydratase beta subunit/Fumarate hydratase class I, C-terminal domain --||------|-|-----|||-----|-----|||--|-----||||-||||||||--|||||--- 1 [P] COG1840 ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component ||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----|||||| 1 [J] COG1841 Ribosomal protein L30/L7E |-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---||||||| 1 [R] COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family ---------------------|---|----||||||||----|||||-|-||-||-|||------- 1 [T] COG1854 LuxS protein involved in autoinducer AI2 synthesis ----------------||--|-||-|||||||||||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [U] COG1862 Preprotein translocase subunit YajC |-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--| 1 [R] COG1881 Phospholipid-binding protein |-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---||||||| 1 [C] COG1894 NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit |-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---||||||| 1 [C] COG1905 NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit -|--------------||------------|---||||----|||||-||||||||----||||-- 1 [R] COG1923 Uncharacterized host factor I protein --------------------|||||||---||||||||||||||||||||||||||---|||||-- 1 [G] COG1925 Phosphotransferase system, HPr-related proteins ------------------|-------|||-||||||||----|||||-||||-||----------- 1 [G] COG1929 Glycerate kinase --|----------||----|------||||-|---|||----||||||||||||||--||||||-- 1 [HE] COG1932 Phosphoserine aminotransferase ----------------|-||----------------------|||||-||||||||||||||||-- 1 [S] COG1934 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-------|----------|------|----|||||||----||||------|||||||||-||-- 1 [R] COG1942 Uncharacterized protein, 4-oxalocrotonate tautomerase homolog ----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||-- 1 [I] COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase -------------||-----------||||------------||||||||||||||---------- 1 [A] COG1949 Oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease) |||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||--- 1 [C] COG1951 Tartrate dehydratase alpha subunit/Fumarate hydratase class I, N-terminal domain -|----------------------------------------||||||||||||||---||||||| 1 [U] COG1952 Preprotein translocase subunit SecB ---|||-------|---|------------||||||||----|||||-||-||||-------||-- 1 [T] COG1956 GAF domain-containing protein -------------|||--------------------------||||||||||-|||--------|| 1 [P] COG1965 Protein implicated in iron transport, frataxin homolog --|----|--|-|---|---|-----|||-||----||----|||||-||||-||||||------- 1 [T] COG1966 Carbon starvation protein, predicted membrane protein |--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||-- 1 [V] COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein |-|-----------------|-----|---|-----||----|||||--|--|||---|------- 1 [S] COG1971 Predicted membrane protein ------------------||-----------------------------|--|||||||||||||| 1 [S] COG1981 Predicted membrane protein ------||-----|------||----||||----|-||----|||||-|||--|||--||---|-- 1 [E] COG1984 Allophanate hydrolase subunit 2 ||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||-- 1 [H] COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis ||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 1 [NOU] COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases ||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||-- 1 [R] COG1994 Zn-dependent proteases ----------------|-|||----------------|----|||||-||-|||||||||||||-- 1 [H] COG1995 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein ---|------|-|||-|----|--------------||----------||--||||--|||||||| 1 [R] COG1999 Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC, involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems ---------------------|--|-|||||---|||||||||||||--|||||||----|--||| 1 [S] COG2001 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--| 1 [L] COG2003 DNA repair proteins ---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--|||||||||||||| 1 [C] COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit --------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [P] COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component ----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||-- 1 [G] COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes ||------||------|----|-----||------------------------||----------- 1 [R] COG2018 Uncharacterized distant relative of homeotic protein bithoraxoid |-||---------||------|----||||----||-------------|||||||------||-- 1 [E] COG2021 Homoserine acetyltransferase ----------------|-||||----|||||-----||----|||||-||--||||--||||||-- 1 [H] COG2022 Uncharacterized enzyme of thiazole biosynthesis ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 1 [C] COG2025 Electron transfer flavoprotein, alpha subunit --|---------------||-|----||||------|-----|||||-||||||||---------- 1 [M] COG2027 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein 4) --|----------||-|----|-----||||-----|-----|||||-|--|-|||----||-|-- 1 [P] COG2032 Cu/Zn superoxide dismutase ------||-----|------||----||||----|-||----|||-|-|||--|||--||---|-- 1 [E] COG2049 Allophanate hydrolase subunit 1 --------------------|-------------|-||----------||||-||-|||------- 1 [R] COG2056 Predicted permease ----------------|---|---------------------|||||-|||||||-||-|||||-- 1 [I] COG2067 Long-chain fatty acid transport protein --------|----|--||-|||----|||-||||||||-----------|--||||||||||-|-- 1 [R] COG2070 Dioxygenases related to 2-nitropropane dioxygenase --||---------------|-|-----|||||---|||----|||||-||---||---||||||-- 1 [P] COG2076 Membrane transporters of cations and cationic drugs |-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||-- 1 [I] COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases ---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||-- 1 [C] COG2086 Electron transfer flavoprotein, beta subunit -||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||-- 1 [U] COG2095 Multiple antibiotic transporter |-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||-- 1 [H] COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis ------------------||-|----|||||-----------|||||-||--||||||||||||-- 1 [S] COG2127 Uncharacterized conserved protein --|-----|----------|-|----|||||--||-||----|||||--|---|||---|||||-- 1 [S] COG2128 Uncharacterized conserved protein ---|------|--||-|--|------|||-------||----|||||--|||||||--||||||-- 1 [Q] COG2132 Putative multicopper oxidases -----------------|--||--|-||||||||||||----|||||-||||-|||---|------ 1 [R] COG2137 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----||--|---|--------|-----|||------------|||||-||--||||---||||||| 1 [C] COG2142 Succinate dehydrogenase, hydrophobic anchor subunit ---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||-- 1 [M] COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis ---------|-------|--------||||||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 1 [E] COG2171 Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase -------------------|||----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 1 [D] COG2177 Cell division protein -------------|||---||---|-|---|||||||||---|||||-||||||||---||||--- 1 [K] COG2183 Transcriptional accessory protein ---------------------------||----|--------|||-|--||-|||-||-||-|--- 1 [D] COG2184 Protein involved in cell division ---------------------|----|||||----|||----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [K] COG2186 Transcriptional regulators ------------------||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [TK] COG2197 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 1 [C] COG2209 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrE ---|---------|||-|||-|--||----|---------|||||-|-||--|||-||||||||-- 1 [O] COG2214 DnaJ-class molecular chaperone --|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-||||||||||||||| 1 [H] COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis -------------||---||-|--------------------|||||-||-|||||---||||||| 1 [H] COG2227 2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4-benzoquinol methylase ||-------|---||-|----|-----||------------------------||----------- 1 [R] COG2229 Predicted GTPase --|||||||-|||||----|----|||--------------------------||||||------- 1 [R] COG2236 Predicted phosphoribosyltransferases |----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----||||||| 1 [P] COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain) ||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||-- 1 [R] COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid -|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|-- 1 [R] COG2252 Permeases -----------------||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||| 1 [L] COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit -------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-- 1 [L] COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase -|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||-- 1 [R] COG2262 GTPases ----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||-- 1 [J] COG2264 Ribosomal protein L11 methylase ------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||-- 1 [J] COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase ------------------||----------||-|--||||||-||||-||--||||----|-||-- 1 [V] COG2274 ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain ---|---------------|-|--------||||||||----|||||-||||||||---------- 1 [R] COG2333 Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily) --|---------------|-||--------------||----|||||-||---|||---|||||-- 1 [R] COG2334 Putative homoserine kinase type II (protein kinase fold) -------------------|-|---------------|----|||--------|||---|------ 1 [T] COG2336 Growth regulator -------------------|-|-----||-|---||||----|||-------|||----|||---| 1 [T] COG2337 Growth inhibitor ------------------||||----|---|-----|-----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [S] COG2350 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-|----|--|--||--------|||||-||||-|||-------|-- 1 [C] COG2352 Phosphoenolpyruvate carboxylase ----||---------------|----|||-----||------|||||-||--|||||||||-||-- 1 [S] COG2353 Uncharacterized conserved protein ------------------||-|--------------------|||||-||--||||--||||||-- 1 [O] COG2360 Leu/Phe-tRNA-protein transferase ---------|--------||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-- 1 [O] COG2377 Predicted molecular chaperone distantly related to HSP70-fold metalloproteases --------------------||----|||||---||||----|---|-||--|-||--||||||-- 1 [K] COG2378 Predicted transcriptional regulator ------||--|||-------|---------------------|||||-|-||-||----------- 1 [S] COG2431 Predicted membrane protein -------------------|||----|---||||||||||--|||||-|----|||---------- 1 [S] COG2501 Uncharacterized conserved protein ||----||-|---------|-------------------------|---|---||----|-|---- 1 [S] COG2510 Predicted membrane protein ----||----|||------|------|||------|||----|||-|-||--||||----|-||-- 1 [G] COG2513 PEP phosphonomutase and related enzymes ||||--|||||||-|--|------------------------|||||-||--||||||||||||-- 1 [O] COG2518 Protein-L-isoaspartate carboxylmethyltransferase ----------|-|------||-----||-|-||||||-----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [S] COG2606 Uncharacterized conserved protein ----------------|-||----------|------------------|---|||--||||||-- 1 [R] COG2607 Predicted ATPase (AAA+ superfamily) --||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||---- 1 [P] COG2608 Copper chaperone ---------------------|----||||------------||||||||||||||------||-- 1 [C] COG2609 Pyruvate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component --|-----------------|-----|---|-|-|-||----|||||-||||-|||---------- 1 [GE] COG2610 H+/gluconate symporter and related permeases ------------------------------|----|||----|||||---||-||----------- 1 [S] COG2707 Predicted membrane protein ----||-------||--|--|---------||||||--|---------|----||-----|-|--- 1 [F] COG2759 Formyltetrahydrofolate synthetase ----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||-- 1 [NU] COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB ----------------||||||--------|-----------|||||-||--||||---------- 1 [NU] COG2805 Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT ----------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 [L] COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits --------------------------||||-|||||-|----|||||-||||-|||---|||||-- 1 [L] COG2818 3-methyladenine DNA glycosylase ------------------||----------------------||||||||||-|||---|||||-- 1 [M] COG2821 Membrane-bound lytic murein transglycosylase ----------------------------------|||-----||||-------||----------- 1 [P] COG2822 Predicted periplasmic lipoprotein involved in iron transport ---------------------|--------|-----------|||||-||||-|||----|---|| 1 [R] COG2823 Predicted periplasmic or secreted lipoprotein --------------------------|----|||-|------|||||-||||-|||||||||||-- 1 [P] COG2824 Uncharacterized Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism ----------------||---|||||----------------|||||-||||-|||-------||| 1 [M] COG2825 Outer membrane protein ------------------------------------|-----|||---||--||||---||-|--- 1 [S] COG2828 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||----|-||-|||------- 1 [M] COG2829 Outer membrane phospholipase A --------------------------------------------------||-||---|------- 1 [S] COG2830 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|-- 1 [U] COG2831 Hemolysin activation/secretion protein --------------------||-----------||-------|||-|-||||-||----|||---- 1 [S] COG2832 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------------------------||-|||--||||---- 1 [S] COG2833 Uncharacterized protein conserved in bacteria -|||----|-------|----|--||----|-----||----|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG2834 Outer membrane lipoprotein-sorting protein --||------|||-------------||||------------|||||-||-|||||----||||-- 1 [S] COG2835 Uncharacterized conserved protein ---|---------------|----------|-----------------||---||||||------- 1 [S] COG2836 Uncharacterized conserved protein --------------------------||||------------------||--|||---|------- 1 [C] COG2838 Monomeric isocitrate dehydrogenase -------------------|-|------------|-||---------------||----------- 1 [S] COG2839 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------|-----------------||||||||||||||---|||||-- 1 [S] COG2840 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||----|-|-||-|||--|---- 1 [S] COG2841 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|------------------|-----||---||-||----------------||-----|-||-- 1 [M] COG2843 Putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation) --------------------------|||-------------|||||-||||-|||---|||||-- 1 [O] COG2844 UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase ------------------------|----------------------------||---|||||--- 1 [S] COG2845 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|---|-------|||||---|--|||----|----- 1 [D] COG2846 Regulator of cell morphogenesis and NO signaling ----------|-----|----|----|---------------------||-|-|||--|||||||| 1 [S] COG2847 Uncharacterized protein conserved in bacteria -||------||||-------------|---||-|-|-----------------||----------- 1 [S] COG2848 Uncharacterized conserved protein --------------------|-||------------|--------||--|---||---|------- 1 [S] COG2849 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------|-----|||||--|||||||---------- 1 [S] COG2850 Uncharacterized conserved protein --------------------------|-----|-|-||-----------|--|||---|------- 1 [C] COG2851 H+/citrate symporter -------------------|-|-------------|------|-------|--||-----|--|-- 1 [S] COG2852 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------------------|||||-||||||||--|----||| 1 [M] COG2853 Surface lipoprotein ------------------------------------------|||||-||||||||--|----||| 1 [Q] COG2854 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, auxiliary component --------|-----------|-----|----|||||------|||||--|||-|||--||||||-- 1 [S] COG2855 Predicted membrane protein -------------||-|-------------------||----------||--|||||||||||||| 1 [C] COG2857 Cytochrome c1 ---------------------|-----------------------|--||-|-||||||-|----- 1 [C] COG2863 Cytochrome c553 --|----------||---|-----------------||----|||||--|---|||-------|-- 1 [E] COG2866 Predicted carboxypeptidase -------------||---------------------------|||||-||-|||||---||||||| 1 [I] COG2867 Oligoketide cyclase/lipid transport protein ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 1 [C] COG2869 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrC ----------------------||---------------------|--||||-||----------- 1 [C] COG2871 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF ----------------|---|-||------------------|||||-|||||||||||||||||| 1 [M] COG2877 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (KDO) 8-phosphate synthase --|--------------|--|---------------------||||||||||||||---------- 1 [C] COG2878 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB ------------------------------------------|||||--|---|||--|------- 1 [S] COG2879 Uncharacterized small protein -------------------|-|----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||-- 1 [D] COG2884 Predicted ATPase involved in cell division ----------------|--||-||||-||-------------|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG2885 Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins --------------------|---------||||-||-----|||||----|||||---|||||-- 1 [G] COG2893 Phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA ----------------||||||--------|----|||----||||||||--||||||-||||--- 1 [D] COG2894 Septum formation inhibitor-activating ATPase --------------------------|||-|-----------||||||||--||||---|||||-- 1 [P] COG2895 GTPases - Sulfate adenylate transferase subunit 1 ------------------------------------------|||||-|||||||----||||--- 1 [S] COG2900 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------||||||||||||||---------- 1 [KL] COG2901 Factor for inversion stimulation Fis, transcriptional activator ------------------|---------|-------------||-||-||--||||-------|-- 1 [P] COG2906 Bacterioferritin-associated ferredoxin ---------------------------||-------------------|----||----|--||-- 1 [R] COG2907 Predicted NAD/FAD-binding protein -----------------|------------------------|||||-|||||||||||||-||-- 1 [S] COG2908 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------||||||||||||||---|||||-- 1 [S] COG2911 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------||||||||||||||---------- 1 [S] COG2914 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------||||||||||-|||----|||||| 1 [D] COG2917 Intracellular septation protein A ------------------------||||||-|||||||----||||||||||||||---||||||| 1 [D] COG2919 Septum formation initiator ------------------------------------------||||||||||||||---------- 1 [S] COG2921 Uncharacterized conserved protein ------------------------------------------|||||||---|||----------- 1 [S] COG2922 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------||||||||||||||---------- 1 [CO] COG2924 Fe-S cluster protector protein ------------------------------------------|||||-||||||||---||||||| 1 [L] COG2927 DNA polymerase III, chi subunit ---|---------------||-||-------------|-----------|--||||---||-|--- 1 [S] COG2928 Uncharacterized conserved protein ------------------||--------------------------|-|---|||-----||-|-- 1 [S] COG2929 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------||---------------------------|||||-||||||||---||||||| 1 [S] COG2938 Uncharacterized conserved protein -------------------|----------------------|||-|-|---||||---||----| 1 [K] COG2944 Predicted transcriptional regulator ---|----|----------------------------------------|--||||---||||||| 1 [R] COG2945 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily --------------------------|||-------------|||||-||-|||||---|||||-- 1 [M] COG2951 Membrane-bound lytic murein transglycosylase B ------------------||--------------------------------|||----||-|--- 1 [S] COG2954 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-|-||||||---------- 1 [G] COG2956 Predicted N-acetylglucosaminyl transferase ------------------------------------------|||||-||||-|||---------- 1 [H] COG2959 Uncharacterized enzyme of heme biosynthesis ------------------------------------------|||||-||--||||---||||--- 1 [S] COG2960 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||||||---|||||-| 1 [R] COG2961 Protein involved in catabolism of external DNA ------------------------------------------|||||-|-||-|||---------- 1 [L] COG2965 Primosomal replication protein N ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 1 [R] COG2969 Stringent starvation protein B ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 1 [L] COG2974 DNA recombination-dependent growth factor C ------------------------------------------|||||-|||--|||---------- 1 [S] COG2975 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------||||||||||||||---------- 1 [S] COG2976 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|-----|-------|--|----||||--|--|-||--------|-- 1 [H] COG2978 Putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter ------------------------------------------|||-|-||-|-||----||||--- 1 [S] COG2979 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 1 [M] COG2980 Rare lipoprotein B ------------------------------------------|||||-||---|||----|||-|| 1 [M] COG2982 Uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis ------------------------------------------|||||-|-||-||---|---|--- 1 [S] COG2990 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------------------|--||||-||----------- 1 [S] COG2991 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------------||---|||||||||||-- 1 [C] COG2993 Cbb3-type cytochrome oxidase, cytochrome c subunit ------------------------------------------|||||-|-||-|||---------- 1 [S] COG2995 Uncharacterized paraquat-inducible protein A ------------------------------------------|||-|-|--|-||----------- 1 [O] COG2999 Glutaredoxin 2 ------------------------------------------|||||-||||-|||---------- 1 [R] COG3008 Paraquat-inducible protein B ------------------------------------------|||||-||---|||---------- 1 [S] COG3009 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 1 [M] COG3017 Outer membrane lipoprotein involved in outer membrane biogenesis ----------------|---|-----|-----||--------|||||-||||-|||--|----|-| 1 [S] COG3022 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------------------|||||-||||||||---|||||-| 1 [V] COG3023 Negative regulator of beta-lactamase expression ------------------------------------------|||||-||||-|||----||||-- 1 [S] COG3024 Uncharacterized protein conserved in bacteria -----------------------|------|---||||----|||||-|||||||----||||||| 1 [S] COG3027 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 1 [S] COG3028 Uncharacterized protein conserved in bacteria --||----------------------||-------|||----|||||-||-|-||----||||--- 1 [R] COG3030 Protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid ------------------|-----------------------|||||-||-||-||---|||||-| 1 [C] COG3038 Cytochrome B561 --------|---------------------------------|||||-|----|||------|--- 1 [R] COG3042 Putative hemolysin ------------------------------------------|||||-||---|||---||||--- 1 [S] COG3045 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------------------|--||||||||---------- 1 [NU] COG3063 Tfp pilus assembly protein PilF ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 1 [H] COG3071 Uncharacterized enzyme of heme biosynthesis ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 1 [D] COG3087 Cell division protein ------------------------------------------|||||-|-||-||----------- 1 [S] COG3094 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------|||----------|---||--|||-----|||||-|---|||--------|-- 1 [E] COG3104 Dipeptide/tripeptide permease ------------------------------------------|||||-|-||||||---------- 1 [R] COG3113 Predicted NTP binding protein (contains STAS domain) |||-----||-----------------|||------------|||||-||-|-|||---------- 1 [H] COG3161 4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase) ------------------------------------------|||||-||-|||||---------- 1 [S] COG3165 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||----------------------|||||-||--||||------|--- 1 [NU] COG3166 Tfp pilus assembly protein PilN ------------------------------------------------||--||||---------- 1 [NU] COG3167 Tfp pilus assembly protein PilO ------------------------------------------------||--||||---------- 1 [NU] COG3168 Tfp pilus assembly protein PilP ------------------------------------------------||--||||---------- 1 [NU] COG3170 Tfp pilus assembly protein FimV ------------------------------------------|||||--|||-||----------- 1 [S] COG3171 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------------|--||||---|||||-- 1 [R] COG3178 Predicted phosphotransferase related to Ser/Thr protein kinases --------------------------|-------|--|----------||---|||---|---|-- 1 [S] COG3182 Uncharacterized iron-regulated membrane protein -------------------------------------------------|--|||----||||--- 1 [S] COG3184 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------------||---||||||-|-||-- 1 [P] COG3197 Uncharacterized protein, possibly involved in nitrogen fixation ------------------------------------------------||---||----------- 1 [S] COG3198 Uncharacterized protein conserved in bacteria --|-----------------|-----------|-||||----------||---||-------||-- 1 [S] COG3212 Predicted membrane protein -------------------------------------------------|--||||---------- 1 [NU] COG3215 Tfp pilus assembly protein PilZ -------------------------------------------------|||-||----------- 1 [S] COG3219 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|------------------|||-|||----|--|-- 1 [S] COG3220 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------|---------------------------|---||----|------ 1 [P] COG3230 Heme oxygenase ------------------------------------------------||---||----------- 1 [S] COG3235 Predicted membrane protein -------------------------------------------------|--|||----------- 1 [C] COG3241 Azurin ------------------------------------------------||---|||-------|-- 1 [C] COG3245 Cytochrome c5 ----------||------|------------------------------|---|||---|||---- 1 [P] COG3256 Nitric oxide reductase large subunit -------------||----|-|----|---------------|||||-||-|-|||---||-|--- 1 [G] COG3265 Gluconate kinase ------------------------------------------------||---|||||||||||-- 1 [O] COG3278 Cbb3-type cytochrome oxidase, subunit 1 ------------------||-------|-|------------|||||-||||-|||---||||||| 1 [C] COG3288 NAD/NADP transhydrogenase alpha subunit -----------------------------------------------------||-|||------- 1 [L] COG3298 Predicted 3'-5' exonuclease related to the exonuclease domain of PolB -----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-||||||| 1 [M] COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes ------------------------------------------------||---|||---------- 1 [S] COG3308 Predicted membrane protein ------------------------------------------------|---||||---------- 1 [S] COG3310 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||-||||-||----------- 1 [C] COG3312 F0F1-type ATP synthase, subunit I ------------------------------------------|||||-||||-|||---------- 1 [M] COG3317 Uncharacterized lipoprotein ----------------------||------------|-----|||-|-||---||----------- 1 [R] COG3318 Predicted metal-binding protein related to the C-terminal domain of SecA --|----------------------------|||-|||--------|--|---||-|--|------ 1 [S] COG3326 Predicted membrane protein -----------------------------------------------------||-|||------- 1 [S] COG3399 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------------|--|-||---------- 1 [NU] COG3419 Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1 ----------|--------------------------------------|---|||----||---- 1 [P] COG3420 Nitrous oxidase accessory protein ---------------------------------------|----------|---|--|-------- 1 [S] COG3421 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|||||---||--|----------- 1 [K] COG3423 Predicted transcriptional regulator --||||-----|----|-------|---------------------|------||------|---- 1 [S] COG3439 Uncharacterized conserved protein -----|-------------|-|---------------------||--------||----------- 1 [V] COG3440 Predicted restriction endonuclease ----------------------------------------------------|||----|||||-- 1 [S] COG3453 Uncharacterized protein conserved in bacteria |-|||--------------|||--------||-----|--------|------|||----|||--- 1 [R] COG3467 Predicted flavin-nucleotide-binding protein -------------------------------------------------|-|-|||---------- 1 [S] COG3471 Predicted periplasmic/secreted protein --------------------------------|------------------|--|---|------- 1 [S] COG3512 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------|--|---------------|--|---|------- 1 [S] COG3513 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------------------||-----|||----||-|--- 1 [S] COG3514 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------------------------|-||---|-|----- 1 [M] COG3524 Capsule polysaccharide export protein -------------------------------------------------|---|||---||||--- 1 [S] COG3536 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------|----------------||--||-------------|---||----|-|---- 1 [R] COG3560 Predicted oxidoreductase related to nitroreductase ------------------------------|||-|--------||-----|---|----------- 1 [K] COG3561 Phage anti-repressor protein ---------------------------------------------------|-||---|-|----- 1 [M] COG3562 Capsule polysaccharide export protein ---------------------------------------------------|-||---|-|----- 1 [M] COG3563 Capsule polysaccharide export protein --------------------|-------------------------|----|-||-||-------- 1 [V] COG3587 Restriction endonuclease ---------------------------------|--------|||||---||-||----------- 1 [P] COG3615 Uncharacterized protein/domain, possibly involved in tellurite resistance --------------------------------|---------|||||-||||-||---|------- 1 [E] COG3633 Na+/serine symporter ------------------------------------------|||||---||-||----||||||| 1 [M] COG3637 Opacity protein and related surface antigens ------------------------------------------------|----|||-------|-- 1 [C] COG3658 Cytochrome b --|-----------|------|--------------------|||-|----|-|||--|----|-- 1 [L] COG3663 G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase -----------------------------------------------------|||-------||| 1 [S] COG3671 Predicted membrane protein ------------------||----------------------|||||-||----||----|----- 1 [UNTP] COG3678 P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc-resistance associated protein ---------------------|---------------------||--------||----------- 1 [S] COG3680 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|-----------------------------|---|||---|-|-|-- 1 [S] COG3686 Predicted membrane protein ----------------|-||-|--------||---|||-----------|---|||---|||||-- 1 [E] COG3705 ATP phosphoribosyltransferase involved in histidine biosynthesis ------------------------------------------|||-|-------||----|--|-- 1 [L] COG3727 DNA G:T-mismatch repair endonuclease ----------------------------------------------------||||---|||||-- 1 [S] COG3737 Uncharacterized conserved protein --------------------------|----|-|||--------------|--|||---|--|--- 1 [S] COG3759 Predicted membrane protein -------------------------------------------------|||-||----------- 1 [S] COG3767 Uncharacterized low-complexity protein ------------------------------------------|----------||-------|--- 1 [S] COG3779 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------------||---||----------- 1 [S] COG3782 Uncharacterized protein conserved in bacteria -||-----|||---------------||||||-|-|-------------|---||----------- 1 [T] COG3830 ACT domain-containing protein ------------------------------------------|||||-||||-|||---------- 1 [T] COG3850 Signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific -------------------------------------------------|---|||----||---- 1 [K] COG3901 Regulator of nitric oxide reductase transcription -------------------------------------------------|---||----||-|--- 1 [C] COG3909 Cytochrome c556 ----------------------------------------------|------||-----|||--- 1 [R] COG3926 Putative secretion activating protein ---------------------------------------------||--|---||----------- 1 [R] COG3943 Virulence protein -----------|------||---------------------------------|||-------|-| 1 [R] COG3975 Predicted protease with the C-terminal PDZ domain -------------------|----------------------|||||-|----||----------- 1 [E] COG3977 Alanine-alpha-ketoisovalerate (or valine-pyruvate) aminotransferase ------------------------------------------------------|---|-|----- 1 [M] COG4092 Predicted glycosyltransferase involved in capsule biosynthesis ----------------|-------------------------|||||||||||||||||||||||| 1 [R] COG4105 DNA uptake lipoprotein ------------------||-|----|---||||||------||||||||||||||---|||||-- 1 [J] COG4108 Peptide chain release factor RF-3 -----------------------------------------------------||----||-||-- 1 [R] COG4111 Uncharacterized conserved protein --||--------|-|-|-||||----||||||||||||-----------|---||-------|--- 1 [R] COG4122 Predicted O-methyltransferase ------------------------------------------|||||-||-|||||---------- 1 [R] COG4137 ABC-type uncharacterized transport system, permease component ---|--||--|----------|--|-----------------|||||-|-||-||----||||--- 1 [H] COG4143 ABC-type thiamine transport system, periplasmic component ------------------||-------||--------|----|||||-||--||||---|||||-- 1 [P] COG4208 ABC-type sulfate transport system, permease component ---|---------||---||||----|||--|-|||------|||-|-||||||||||||||---- 1 [R] COG4221 Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity ------------------------------------------|||||--|-|-|||---|||||-- 1 [C] COG4230 Delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase ----------------------||------------------|||||-||||||||--|----|-- 1 [OC] COG4232 Thiol:disulfide interchange protein ----------------------------------------------------||||---------- 1 [S] COG4255 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------------------|---|---|||---------- 1 [S] COG4259 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|------|----||||------------------||----------- 1 [P] COG4300 Predicted permease, cadmium resistance protein ------------------------------|--------------|-------||----------- 1 [S] COG4304 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------------|---|||----||---- 1 [C] COG4314 Predicted lipoprotein involved in nitrous oxide reduction --------------------------------------------------|--||-------|--- 1 [S] COG4316 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------------------|---|---|||---------- 1 [S] COG4380 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------------------||----|--||----------- 1 [R] COG4386 Mu-like prophage tail sheath protein gpL --------------------------------------------|-----|--||----------- 1 [S] COG4387 Mu-like prophage protein gp36 --------------------------------------------|-----|--||----------- 1 [R] COG4388 Mu-like prophage I protein ---------------------------------------------------|-|||---------- 1 [L] COG4389 Site-specific recombinase ---------------------------------------------------|-|||---------- 1 [S] COG4390 Uncharacterized protein conserved in bacteria ----------------------------------------------------||||---|||-|-| 1 [S] COG4391 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|----------------------------|----||---------- 1 [S] COG4394 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------------------------|-----|---|----------- 1 [R] COG4396 Mu-like prophage host-nuclease inhibitor protein Gam --------------------------------------------|-----|---|----------- 1 [R] COG4397 Mu-like prophage major head subunit gpT ------------------------------------------||||||||||||||---------- 1 [P] COG4535 Putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC --|-------------|---||--||----|-----------|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG4591 ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 1 [P] COG4604 ABC-type enterochelin transport system, ATPase component --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 1 [P] COG4605 ABC-type enterochelin transport system, permease component --------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|---- 1 [P] COG4606 ABC-type enterochelin transport system, permease component ------------------|-------------||---------------|---||-------|--- 1 [S] COG4642 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------------------------------||---------||---------- 1 [S] COG4648 Predicted membrane protein -------------------------------------------------|--||||---------- 1 [NU] COG4726 Tfp pilus assembly protein PilX ------------------------------------------------|-----|||||-|-||-- 1 [O] COG4736 Cbb3-type cytochrome oxidase, subunit 3 -------------------|-----------------------||-|------|||----|----- 1 [S] COG4737 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------||-||||||||||----------------|||||||||||||||||||||||| 1 [M] COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87 ----------------||||----------------------|||||-||||||||---------- 1 [U] COG4796 Type II secretory pathway, component HofQ --------------------|------------------------------|-||---------|| 1 [R] COG4797 Predicted regulatory domain of a methyltransferase --------------------|----------------------------|---||----------- 1 [S] COG4859 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------------|---------------------------|--------|-- 1 [S] COG4899 Uncharacterized protein conserved in bacteria --------------------|---------------------|||||-|||||||----|||||-- 1 [D] COG4942 Membrane-bound metallopeptidase -------------------------------------------------|--||||---------- 1 [NU] COG4966 Tfp pilus assembly protein PilW ------------------------------------------|||||-||--||||---------- 1 [NU] COG4967 Tfp pilus assembly protein PilV ------------------------------------------------||--||||------|--- 1 [NU] COG4970 Tfp pilus assembly protein FimT ------------------||-|--------------------------||--||||---------- 1 [NU] COG4972 Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM ------------------------------------------|||||-||||||||---------- 1 [L] COG4973 Site-specific recombinase XerC --------------------|---|-|||||---||||----|||||-||||||||---||||||| 1 [L] COG4974 Site-specific recombinase XerD |||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-- 1 [E] COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase ----------------|------------------------------------|||---||||||| 1 [T] COG5000 Signal transduction histidine kinase involved in nitrogen fixation and metabolism regulation --------------------------------------------|-----|--||----------- 1 [R] COG5003 Mu-like prophage protein gp37 ------------------------------------------||||||||||||||---------- 1 [K] COG5007 Predicted transcriptional regulator, BolA superfamily ----------------|-------||----------------|||||-||||||||---||||||| 1 [M] COG5009 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein --|-----------------|-----------------------------|--||------|---- 1 [P] COG5266 ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component --|-----------------|----------------|-----||||---||||||----|||--- 1 [UW] COG5295 Autotransporter adhesin ---------------------|--------------------|||||-|-||-||----------- 1 [S] COG5339 Uncharacterized protein conserved in bacteria -------------------|---------------------------------||---------|| 1 [S] COG5346 Predicted membrane protein --------------------------||||-----|||---------------|||---------- 1 [S] COG5416 Uncharacterized integral membrane protein -|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------| 0 [L] COG0338 Site-specific DNA methylase ||||---||----------|-----------||-||--|||-------||||||--|||-||-|-| 0 [V] COG0610 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases -|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||-- 0 [L] COG0863 DNA modification methylase --|---------------|-------------------------------||-|--|-|------- 0 [M] COG1083 CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase -|--|-|||----||-----------|||--||||-------|||-|-|-||-|------------ 0 [P] COG1275 Tellurite resistance protein and related permeases -||-----|--------||--|-------------------------------|-----|---|-- 0 [R] COG1669 Predicted nucleotidyltransferases -||-----------------|---|-----|-----|----------------|--|||----|-- 0 [M] COG2089 Sialic acid synthase ---------------------|----|||-------------|||-|-||---|-------|-|-- 0 [S] COG2354 Uncharacterized protein conserved in bacteria -||---------------|--|-------------------------------|-----|---|-- 0 [S] COG2361 Uncharacterized conserved protein ------------------------------|-----|-----|||||------|------------ 0 [K] COG2732 Barstar, RNAse (barnase) inhibitor ---------------------|--------|--|--|------||-|--|---|----||---|-- 0 [R] COG2819 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily -------------------|||---|-||-|--|||||--------------||-|-----|---- 0 [E] COG2856 Predicted Zn peptidase ----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------ 0 [E] COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase ------------------|-----------------------------|----|-|----|----- 0 [O] COG2994 ACP:hemolysin acyltransferase (hemolysin-activating protein) ---------------------|----|---------------|||||-||||-|-|---------- 0 [S] COG3012 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------------------|--||-||||-|------------ 0 [S] COG3036 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------------------|--|||------|||||-||||-|-|----|-||-| 0 [K] COG3070 Regulator of competence-specific genes ---|--------------------------------------------||---|---------|-- 0 [S] COG3205 Predicted membrane protein --------------------------------------------------|-||--||-------- 0 [S] COG3309 Uncharacterized virulence-associated protein D --------------------|-----|---------------|||---|-|--|-|---||-||-- 0 [R] COG3550 Uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzymes -------------------|-------------|-----|-----||-||---|-------|-|-- 0 [R] COG3654 Prophage maintenance system killer protein ------------------------------------------|||-----|--|---------|-- 0 [S] COG3692 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-------||------------------------|-----||----- 0 [S] COG3744 Uncharacterized protein conserved in bacteria ---------------------------------------------------|||------------ 0 [S] COG3792 Uncharacterized protein conserved in bacteria ------------------||-------||------------------------|------|----| 0 [D] COG4118 Antitoxin of toxin-antitoxin stability system -------------|----||-------|||------------|||-----||-|-|---||||--- 0 [R] COG4178 ABC-type uncharacterized transport system, permease and ATPase components -------------------------------------------||--------|-|---------- 0 [I] COG4706 Predicted 3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase ------------------------------|---||-----------------|------------ 0 [L] COG5527 Protein involved in initiation of plasmid replication ------------------------------------------|---------||------------ 0 [S] COG5532 Uncharacterized conserved protein